https://wiki.chemika.be/api.php?action=feedcontributions&feedformat=atom&user=0653300 2026-07-28T09:15:53Z Gebruikersbijdragen MediaWiki 1.43.0 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Genoom-,_proteoom-_en_metaboloomanalyse&diff=1882 2020-01-14T20:00:23Z

<p>0653300: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Mabb]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Genoom-, proteoom- en metaboloomanalyse<br /> Het vak wordt gegeven door prof. Landuyt en prof. Robben. Landuyt zijn deel is open boek en open computer. Alles mag gebruikt worden behalve communicatie middelen of ppt's van Robben als het mondeling nog niet is afgelegd. Robben zijn deel is mondeling en gesloten boek. Robben maakt elk examen nieuwe vragen<br /> <br /> ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/n/G0G57AN.htm<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===14/01/2020===<br /> Robben:<br /> # je wil het genoom van amandel en peach vergelijken want blijkbaar is dit verandert door transposons<br /> ## welke techniek gebruik je om te sequencen<br /> ## welk(e) next generation platform(s) gebruik je om dit te testen<br /> ## waarom gebruik je dit platform(s)<br /> # begrippen<br /> ## ribosome profiling<br /> ## (transcriptomics) microarray analysis<br /> ## scale free<br /> <br /> Landuyt:<br /> # je krijg een proteine gegeven (placental growth factor)<br /> ## geef een beknopte beschrijving van dit proteine<br /> ## als je 2D gel zou doen en het dan door een MS stuurt, geef minstens 5 exacte gewichten van peptiden<br /> ## hoe zou je het staal voorbereiden<br /> ## wat zijn voor en nadelen van gel based<br /> # curcumine heeft een helende werking maar wordt slecht opgenomen<br /> ## hoe bereid je het staal voor<br /> ## je gebruikt een oude machine voor MS met 30 ppm, wat is het MW (...,... Da + / - ...,... Da)<br /> ## hoe kan je de bioavailability verhogen <br /> <br /> ===29/01/2019===<br /> Robben:<br /> #je hebt een genoom van een axolotl dat je wil analyseren. Het heeft een genoom meer dan dubbel zo groot als dat van de mens. Welke next generation sequencing techniek ga je gebruiken + verdedig waarom<br /> #woordjes: <br /> ##Ribsome profiling<br /> ##Array protein targetting<br /> ##protein-protein interaction map is scale free<br /> <br /> Landuyt:<br /> # you receive a peak list: 148.07574, 175.11900, 219.11285, 322.18741, 334.13979, 423.23509, 447.22386, 480.25655, 504.24532, 593.34062, 605.29300, 708.36756, 752.36141, 779.40467, 908.46252, 926.47309 <br /> ##Which type of proteomic analysis has been used? (explain thoroughly)<br /> ##What is the identity of the protein (explain your strategy for interpretation and the certainty regarding your identification)<br /> ##How would the spectrum look like if the other proteomics method would have been used? <br /> ##Search for a recent article concerning the protein of interest and give a brief discussion (if you are not sure about your identification (question 2), please use human epidermal growth factor as a substitute (not both! or you pick your identified protein, or the substitute)<br /> #Verhaaltje rond onderzoekers die de bioavailability willen onderzoeken van de stof curcumin, deze stof bevindt zich in het bloed. via MS zul je curcumin kunnen analyseren.<br /> ##How would you prepare the patient blood plasma samples to extract the drug? 3p<br /> ##Which mass will you be looking for? 4p<br /> ##bonus punt: describe a innovative preparation of curcumin for improved oral bioavailability. 1p<br /> <br /> ===22/01/2019===<br /> Robben:<br /> #verhaal rond een proteïne dat kan instaan voor vele zaken via interacties met een bepaald domein. Hoe kan je deze interacties best bestuderen?<br /> ##bespreek welke methode je het best kan gebruiken en vergelijk met andere technieken.<br /> ##bespreek kort de manier van werking van de methode die je gekozen hebt.<br /> #begrippen<br /> ##paired end sequencing<br /> ##nanopore sequencing<br /> ##affimetrix chip<br /> <br /> Landuyt:<br /> #A proteomics researcher working on a major human disease discovers a significantly expressed protein in a set of biopsies taken from patients, compared with a set of biopsies from healthy individuals. Below you can find the peak list that can be used to identify this protein. peak list :920.48 902.47 791.43 774.37 720.40 661.29 607.31 532.24 476.27 445.21 389.24 314.17 260.20 201.09 147.11 130.05<br /> ##Which type of proteomics approach has been used? Explain briefly 3p<br /> ##What is the identity of the protein? 4p<br /> ##What would the spectrum look like if the other proteomics approach would have been used? Give 5 examples masses that could appear in this spectrum. If you do not feel confident about your protein ID, use human epidermal growth factor (EGF) as an alternative for this assignment. 4p<br /> ##Briefly explain the biological role of this protein. What type of disease is being studied? 1p<br /> #Some patients are selected for treatment with imatinib mesylate. In order to check the pharmacology of the drug, you are offered an old single quadrupole MS with a mass accuracy of 100ppm.<br /> ##How would you prepare the patient blood plasma samples to extract the drug? 3p<br /> ##Which mass will you be looking for? 4p<br /> ##Bonus question: Can you explain the mode of action of this drug in relation to the drug target (= the protein from question 1)? 1p<br /> <br /> ===16/01/2019===<br /> <br /> Deel Robben:<br /> # je stuurt een bacterie naar de ruimte en laat deze daar groeien, je laat dezelfde bacterie op aarde groeien. Hoe zou jij het transcriptoom onderzoeken? welke techniek gebruik je + verdedig waarom deze en niet de andere. Leg deze techniek uit.<br /> # woordjes: <br /> ##SMRT,<br /> ##gene altering,<br /> ##genetic interactomics<br /> #<br /> Deel Landuyt<br /> #Je hebt een pieklijst, welke methode van proteomics is hier gebruikt om het proteïnen te onderzoeken. er was een verhaaltje bij dat het ging over een meneer met plotse diarree en je neemt een stoelsample om te onderzoeken. Pieklijst: 997.49 979.49 868.46 851.31 754.34 705.39 640.30 592.31 505.28 493.23 406.20 358.21 293.11 244.17 147.11 130.05<br /> Het is volgens de prof : EYI/LSFNPK<br /> # welk protein is het? <br /> # wat zou een 2e mogelijkheid zijn om dit proteïnen te onderzoeken en wat zou je verkrijgen?<br /> # geef meer info over de werking van het proteïnen<br /> <br /> Deel 2: Je wilt het actief component van motilium onderzoeken, wat is je strategie? <br /> # De accuraatheid van je ms machine is 10 ppm, waar ga je de piek zien van het actief component?<br /> # Geef meer info over dit component<br /> <br /> ===15 januari 2019===<br /> Robben<br /> #Solexa sequencing en SMRT vergelijken. <br /> #Begrippen: <br /> ##Polyploidie en genomic evolution,<br /> ##Nanostring nCounter technologie<br /> ##Rosetta stone method<br /> <br /> Landuyt<br /> #Proteomics<br /> #* Piekenlijst : 1425.63 1407.62 1297.57 1279.53 1168.53 1165.48 1078.48 1069.46 981.4 968.41 853.39 818.34 722.35 704.29 608.3 573.25 458.23 445.24 357.18 348.19 261.16 258.11 147.11 129.07<br /> #* Welk proteïne is dit? <br /> #* Wat zou het resultaat zijn als er een andere proteomics techniek wordt gebruikt? <br /> #* Geef meer info over de werking van het proteïne<br /> <br /> #Metabolomics<br /> #* Je hebt een metaboliet resveratrol dat in rode wijn voorkomt en efficiënt hieruit geëxtraheerd kan worden. <br /> #* Hoe zou je resveratrol opzuiveren? (HPLC-MS)<br /> #* Wat is de monoisotopische massa bij 2ppm <br /> #* Kan je uit deze opgaven een link tussen proteomics en metabolomics vinden?<br /> <br /> ===23/08/2018===<br /> <br /> * proteomics :A clinician working on a major disease discovers a significantly up-regulated protein in a large number of patient samples. The conclusion is simple: this protein could be a major breakthrough! However, the medical doctor leading the study learned how to use a mass spectrometer, but was not yet trained in the interpretation of the data. Can you help our desperate clinician in identifying the protein based on the peak list below?<br /> 148.07574<br /> 175.11900 <br /> 219.11285<br /> 322.18741 <br /> 334.13979<br /> 423.23509 <br /> 447.22386<br /> 480.25655 <br /> 504.24532<br /> 593.34062 <br /> 605.29300<br /> 708.36756 <br /> 752.36141<br /> 779.40467 <br /> 908.46252<br /> 926.47309 <br /> #Questions:<br /> #* Which type of proteomic analysis has been used? (explain thoroughly) …/2<br /> #* What is the identity of the protein (explain your strategy for interpretation and the certainty regarding your identification) …/3<br /> #* Which disease is studied? …/1<br /> #* How would the spectrum look like if the other proteomics method would have been used? (if you are not sure about your identification (question 2), please use human epidermal growth factor as a substitute (not both! or you pick your identified protein, or the substitute) …/3<br /> #*Search for a recent article concerning the protein of interest and give a brief discussion (again, same principle as for question 4)<br /> <br /> Metabolomics<br /> accuraatheid berekenen, je krijgt de M/Z van het toestel. De exacte massa moet je opzoeken<br /> is dit een goede accuraatheid, leg uit?<br /> <br /> ===23/01/2018 NM===<br /> Robben:<br /> # Ze willen het genoom van een rendier achterhalen. de dichtst verwante soort waarvan ze het genoom kennen is een rund. <br /> #* Hoe ga je te werk? welk next generation sequencing platform kies je (je kan er maar 1 kopen) en waarom? <br /> #* Leg de sample prep en voornaamste principes uit. <br /> #* Woordjes<br /> ## Scaffold sequentie<br /> ## Genetic interactomics<br /> ## PMAGE<br /> Landuyt: <br /> # PROTEOMICS <br /> #* Na 2D gel kiest researcher een spot en behandelt die met trypsine en krijgt bij MS een lijst pieken (die je dus krijgt). De researcher herkent 'familiar' masses en kiest 1 peptide om te fragmenteren omdat het het enige 'non-suspicious' fragment is. (je weet welke massa dat is). Na fragmentatie krijg je een volgende piekenlijst. <br /> ## Wat ging er verkeerd in het experiment? <br /> ## Welke MS methoden of componenten werden er gebruikt? <br /> ## Welk proteine analyseert hij en wat is de functie ervan.<br /> # METABOLOMICS<br /> #* Een researcher in colombia krijgt een ms toestel ter beschikking, analyseert koffiebonen (denk ik) en krijgt een dominante piek op 195,xx m/z. <br /> ## Wat is da accuraatheid van het machien op ca 200 Da? Is dit oke voor metabolomics? <br /> ## BONUS er was nog een tweede dominante piek xxx m/z, welk molecule is dit?<br /> <br /> ===23/01/2018 VM===<br /> Robben:<br /> #Je wilt met behulp van next generation sequencing mutaties en rearrangments onderzoeken in kanker. <br /> #* Wat is je sequencing strategy? <br /> #* Welk platform zou je gebruiken? (Je mag er maar 1 geven). <br /> #* Geef uitgebreid de sample prep en de werking van het platform.<br /> #Woordjes:<br /> #* Endogenous Retrovirus<br /> #* Affrimex Genechip<br /> #*nCounter technology<br /> <br /> Landuyt: <br /> #PROTEOMICS <br /> #* A lab technician in a proteomics core facility receives samples for identification, one from a lab working with human cancer tissues and one from a lab working on neuro degenerating deseases. One of the proteins was cut from a 2D gel and the other protein was found to be up-regulated in a gel-free proteomics experiment. Both analysis yielded nice mass spectra, the respective peak lists can be found below. However, due to some solvent spilling, the ink on the tubes was ruined and the origin of the samples got lost. The lab technician is very concerned with this issue because he is afraid to lose his job. <br /> #** Peak list 1: 1743,83; 1716,82; 1605,79; 1560,72; 1474,75; 1473,69; 1417,73; 1360,61; 1303,69; 1259,56; 1174,64; 1172,53; 1073,46; 1060,6; 972,41; 947,52; 885,38; 850,46; 788,32; 763,43; 675,24; 662,38; 563,32; 561,2; 476,28; 432,16; 375,24; 318,11; 262,15; 261,09; 175,12; 130,05<br /> #** Peak list 2: 4356,00; 4435,97; 3243,61; 3563,47; 2709,32; 2622,32; 2391,03; 2550,96; 2356,24; 2270,15; 2165,90; 2245,87; 2053,89; 2133,86; 1980,09; 2064,11; 2008,12; 2060,06; 1954,96; 2114,89; 1916,98; 1958,99; 1996,94; 1697,83; 1681,90; 1578,82; 1620,83; 1658,79; 1522,77; 1487,65; 1393,63; 1596,71; 1873,43; 1387,60; 1326,64; 1309,72; 1292,60; 1132,56; 1212,53; 1114,53; 1101,55; 1304,63; 1421,42; 1066,59; 1306,49; 1003,54; 1045,55; 1163,48;<br /> ## Which peak list was generated from the gel-based and which was generated with gel-free proteomic analysis. Please comment on how you come to you conclusion. <br /> ## What is the identity of the two proteins? Give a brief summary of the biological significance of both proteins. (= eerste lijst De novo en BLASTEN &amp; tweede lijst in MASCOT steken --&gt; neem taxonomy homo sapience!)<br /> ## By now, you should be able to transferrin the identity of proteins to the correct lab. Which comes from the cancer lab and which from neuro degeneration lab?<br /> #METABOLOMICS<br /> #* The popular cocktail mojito was initially created as a medicine to treat various conditions such as bad digestion. Therefore, it is nowadays consumed to stimulate appetite before a meal or to stimulate digestion after a heavy meal. The core ingredient is mint, which undergoes a successful extraction with rum an lime juice. <br /> ## If you would like to purify the metabolites from mint in a lab setting, how would you do this knowing the above. <br /> ## In case the extraction is successful and you have a mass spectrometer with a mass accuracy of 2 ppm, then what would be the mono-isotopic mass would you record for the most dominant metabolite from the mint? <br /> ## BONUS: If mint would be an illegal substance and you were asked to make a test to detect it in blood of suspected users, which metabolite would you go afer? (multi answers possible).<br /> <br /> ===16/01/2018 (NM)===<br /> Robben<br /> #Sequencing platform (welk en waarom) + uitleggen hoe. voor een transcriptomics studie van de gifklier van een schorpioen, hoe ge u staalvoorbereiding zou doen. <br /> #woordjes: Massive parallel signature sequencing, proteome array en genetic interactomics.<br /> <br /> Landuyt, <br /> # Proteomics. Onderzoek(st)er vind interresant proteine bij een zieke persoon gegeven onderstaand massa spectrum (piekenlijst van een peptide).<br /> #* Welke proteomics aanpak is er gebruikt en leg deze kort uit <br /> #* Van welk proteine is dit peptiede <br /> #* Als je de andere proteomics aanpak gebruikt wat voor pieken bekom je dan bij je massaspectrum, geef 5 voorbeelden van massa's die hierbij voorkomen <br /> #*wat is de biologische relevantie van dit proteine aka in welke ziekte speelt dit proteine een rol <br /> <br /> # Metabolomics gegeven een drug-metaboliet met een piekhalfwaardebreedte 0.0001en een monoisotopische massa 480.2531 <br /> #* Wat is de resolutie van dit spectrum en is dit nodig? <br /> #* Waarom zien we typisch 2 pieken of meer van hetzelfde ion op een massa spectrum <br /> #* Over welke drug gaat het hier in dit geval<br /> #* Bonus vraag: Wat is de exacte mode of action van deze drug met betrekking tot het proteïne uit vraag 1<br /> <br /> ===16/01/2018 (VM)===<br /> <br /> Robben<br /> # RNA-seq uitleggen + 1 sequencing platform + voor en nadelen van RNAseq en andere analyse platvormen (kader met PCR, microarrays, SAGE en RNAseq<br /> # woordjes: polyploidie en genoom evolutie, gene ontology, Rosetta stone method<br /> Landuyt<br /> # MS pieken gegeven: welk proteïne, welk proteomics methode, wat als ze de andere methode gebruikte (geef 5 massa's), mode of action van dat proteine<br /> # massa en half height gegeven: wat is de resolutie en is het een goede resolutie, over welk metaboliet zijn we bezig, soms zijn er meerdere pieken voor hetzelfde metaboliet en waarom <br /> #Bonus vraag: wat is de link tussen het proteïne en het metaboliet volgens recente studies<br /> <br /> ===10/06/2014=== <br /> ====prof. Robben (gesloten boek)==== <br /> #Wat doet RNA-seq? <br /> #Geef 1 van de ontwikkelde technieken vrij te kiezen (454/solid/...) (commercieel platform) <br /> #Vergelijk RNA-seq met andere technieken (voordelen/nadelen) (concurrerende methoden)<br /> ====prof. Landuyt (open boek/open pc)==== <br /> #Krijgt waarden van MS moet eiwit geven <br /> #Waarom kan je een vertekend beeld krijgen en geef de statistische realiteit <br /> #Welke ziekte zou er hier onderzocht zijn? <br /> #Als er een fout is opgetreden bij de MS kan je een andere methode gebruiken? <br /> #Moest ge zelf onderzoek willen doen op dit eiwit met welke dingen zou je dan rekening willen houden en hoe los je dit op? <br /> <br /> ====Johan Robben====<br /> #In het kader van een onderzoeksproject krijg je de opdracht om bij een industriële giststam de transcriptoom verschillen bij het brouwen van Westmalle en Duvel in kaart te brengen. Stel een methode voor en bespreek een concreet analyseplatform voor waarvoor je zou kiezen. Beargumenteer je keuze.<br /> #Bespreek bondig de belangrijkste 'second generation' sequencing methoden. Vergelijk en evalueer kritisch. <br /> #Bespreek drie experimentele methoden om interacties te ontdekken. Geef voor- en nadelen.<br /> #Sequencing. Bespreek de Solexa-methode (Illumina) vanaf de bereiding van het DNA tot het sequeneren zelf. Welke toepassingen heeft Solexa? Wanneer is de Sanger-methode te verkiezen?<br /> #Interactomics. Bespreek kort drie methoden om te onderzoeken. Geef sterktes/zwaktes van elke techniek. Hoe ga je met gegevens uit deze technieken (in essentie) interactienetwerken opbouwen.<br /> #Bespreek de Affymetrix GeneChip en de Illumina random BeadArrays. En maak een kwalitatieve vergelijking.<br /> #Bespreek Illumina Sequencing van DNA-preparatie tot uitlezing. Vergelijk kwalitatief met Sanger sequencing.<br /> #Bespreek 454 sequencing (van DNA library construction tot sequentie analyse). Vergelijk kwantitatief 454 met Sanger. <br /> #De hoge druk sequencers van de nieuwe generatie vormen een bedreiging voor de traditionele micro-arrays. Leg uit.<br /> #Bespreek oligonucleotide arrays en random beads in transcriptoomanalyse en vergelijk. Bespreek targetlabelling en uitlezing.<br /> #Leg volgende begrippen kort uit: <br /> #*whole shotgun sequencing <br /> #*paired end ditags <br /> #*gene ontology <br /> #*scale free network<br /> <br /> ====Bart Landuyt====<br /> #Hoe zijn massaspectrometers over het algemeen opgebouwd? Geef enkele vb van veel gebruikte opstellingen.<br /> #Waarin verschilt peptidomics fundamenteel van proteomics? <br /> #Bespreek de uitdagingen van het metaboloom en de gevolgen ervan op de analyse<br /> <br /> ====Baggerman====<br /> #Hoe bepaal je de sequentie van een peptide met MS? <br /> #Bespreek ESI-Q-TOF massa spectrometrie<br /> #Vergelijk MALDI en ESI. Geef voor- en nadelen.<br /> #Bespreek resolutie in MS, geef relevantie bij analyse.<br /> #Leg het principe van een time-of-flight analysator uit<br /> <br /> ====Filip Roland====<br /> #chemische uitdagingen van het metaboloom + relevantie voor staalname en staalbereiding<br /> #Bespreek de belangrijkste verschillen tussen metaboloom - gen/transcr/proteoom. Hoe uit zich dat in de analyse.<br /> #Bespreek de klassieke workflow van een metabolomics-analyse. Welke keuzes moeten gemaakt worden en wat zijn de mogelijke technieken die gebruikt kunnen worden</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Bioinformatica_en_Modelering&diff=1719 2019-06-17T10:50:32Z

<p>0653300: /* 11 juni 2019 NM */</p> <hr /> <div><br /> <br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Derde bachelor biochemie. <br /> Sinds 2016-2017 wordt het vak gedoceerd door A. Voet. De algemene puntenverdeling: 35ptn examen en 15ptn verslagen. De eerste vraag is steeds mondeling, de tweede vraag is een trekvraag. Bij de trekvraag is er geen voorbereiding, direct mondeling te beantwoorden. 20% van de totale eindscore staat op de verslagen van de oefenzitting, je moet hiervoor slagen anders faal je sowieso in eerste zit. Bij het examen wordt een formularium gegeven met (bijna) alle formules.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===11 juni 2019 NM ===<br /> # PAM-matrix, wat is het, waarvoor te gebruiken &amp; hoe te construeren<br /> # Trekvraag: Anfinsen dogma &amp; Levinthal paradox (5pt)<br /> # Schrifteijke vraag (6pt)<br /> #*A: Alle kolommen van PDB-file toelichten<br /> #*B: residu tekenen (ILE) en alle hoeken aanduiden (omega, phi, psi, chi1 &amp; chi2)<br /> #*C: waarvoor gebruiken we phi &amp; psi? <br /> # Juist/fout (9pt)<br /> #* UPGMA &amp; NJ maken beiden gebruik van sequence similarity.<br /> #* Er is slechts 1 oplossing mogelijk voor SW en meerdere mogelijkheden voor NW.<br /> #* Vergeten<br /> # Je hebt een nieuwe virus gevonden en kent het volledige genoom. Van welk programma maak je gebruik (wees specifiek) om homologen virussen te vinden? (3pt)<br /> <br /> ===11 juni 2019 VM ===<br /> # Leg forcefield uit en geef voor elke term ook de fysische achtergrond. Wat is het verband met potential energy surface? (10pt)<br /> #* Bijvragen: de grafiek die voor elke term staat, waarom is cos in die term, waarom is alles tot de tweede, de formule stelt de energie voor terwijl het een 'force'field is, <br /> # Trekvraag: Leg CryoEM uit (wist ik niet, dus mocht ik een andere trekvraag nemen voor minder punten), leg alle kolommen uit van PDB file (5 pt)<br /> # Teken GWG en duid phi, psy, omega en chi hoeken aan.<br /> # Juist/fout (8pt)<br /> #* TBlastX is de ideale methode om genoom naar proteïne te blasten als je een nieuwe virus ontdekt.<br /> #* Er is slechts 1 oplossing mogelijk voor SW en meerdere mogelijkheden voor NW.<br /> #* Een cladogram bevat nooit de tijdstip van divergentie of evolutionaire afstand.<br /> #* Iets met als je een megablast hebt gedaan, wordt deze opgeslagen in een deltablast zodat andere onderzoekers het kunnen vinden.<br /> # Je hebt een nieuwe proteïne gevonden met een nieuwe loop en je wilt dus de 3D structuur bepalen. Er zijn geen andere gelijke proteïnen tot nu toe gevonden. Dat wil zeggen dat je geen homologie modeling kan toepassen. Hoe kan je toch de 3D structuur bepalen als je enkel de sequentie kent? Welke stappen/algoritmes gebruik je? (7pt)<br /> <br /> === 26 juni 2018 NM ===<br /> # Waarvoor wordt PAM gebruikt en hoe is deze opgebouwd? (12pt)<br /> #* Bijvragen: wie heeft PAM ontwikkeld, wat is lambda in formule, vragen over BLOSUM, grafiek tekenen van logaritmisch verval en twilight zone<br /> # Trekvraag (verschillend van persoon tot persoon): Chou-Fasman algoritme/moleculaire klok/... (5pt)<br /> # PDB-file van 3 aminozuren gegeven en je moet kolommen benoemen. Teken residu 559 (isoleucine) en benoem psi, phi, omega, chi 1, chi 2. Waarvoor worden de psi en phi hoeken gebruikt? (6pt)<br /> # Juist/fout (9pt)<br /> #* Bij een fylogenetische boom maken NJ en UPGMA steeds gebruik van sequentie similariteit. <br /> #* Bij FF-berekeningen is er altijd een extra term voor H-bruggen<br /> #* Er is slechts 1 oplossing mogelijk bij NW en SW<br /> # Ik heb een nieuw virus ontdekt en heb de volledige genomische sequentie. Welke methode (wees specifiek) gebruik ik om het nieuwe virus te vergelijken van andere virussen? (3pt)<br /> <br /> === 19 juni 2018 VM ===<br /> # Waarvoor wordt PAM gebruikt en hoe is deze opgebouwd? (12pt)<br /> #* Bijvragen: wie heeft PAM ontwikkeld, wat is lambda in formule, vragen over BLOSUM, grafiek tekenen van logaritmisch verval en twilight zone<br /> # Trekvraag: Chou-Fasman algoritme (5pt)<br /> # PDB-file van 3 aminozuren gegeven en je moet kolommen benoemen. Teken residu 559 (isoleucine) en benoem psi, phi, omega, chi 1, chi 2. Waarvoor worden de psi en phi hoeken gebruikt? (6pt)<br /> # Juist/fout (9pt)<br /> #* Bij een fylogenetische boom maken NJ en UPGMA steeds gebruik van sequentie similariteit. <br /> #* Bij FF-berekeningen is er altijd een extra term voor H-bruggen<br /> #* Er is slechts 1 oplossing mogelijk bij NW en SW<br /> # Ik heb een nieuw virus ontdekt en heb de volledige genomische sequentie. Welke methode (wees specifiek) gebruik ik om het nieuwe virus te vergelijken van andere virussen? (3pt)<br /> # Oefeningen USB stick 12<br /> #* Op welk chromosoom ligt bepaalde receptor<br /> #* Wat is de pdb code van de oudst uitgegeven ferritin proteinen<br /> #* Nucleotide sequentie translateren naar AZ (langste leesraam kiezen) en MW, pI, extinctie coefficient geven. Ook number of cleavages geven van trypsine, caspase5 en pepsin (pH&gt;2). <br /> #* Is gegeven nuclaotide sequentie bruikbaar om te clonen? Geef het gen/de genen die hieruit worden getranslateerd. <br /> #* Nieuw virus ontdekt (FASTA file gegeven), aligneren via CLUSTAL en boom van maken. Van welke voorouder stamt dit virus af?<br /> <br /> === 18 juni 2018 NM ===<br /> # Leg PAM uit<br /> #* Bijvragen: wie heeft PAM ontwikkeld?; ken je nog zo'n matrices?; wat is de lambda in de formule; welke BLOSUM gebruik je voor sterk convergente proteïnes<br /> # (Trekvraag) Leg contactplot uit [andere trekvragen waren o.a. rotameerplot, dotplot, fylogenetische boom]<br /> # Gegeven is een PDB-file (van 3 aminozuren). Benoem de kolommen en bespreek bondig. Teken één residue (bv. residu 558) en geef psi, phi, omega, xhi1 en xhi2 hoeken aan.<br /> # Juist of fout<br /> #* Bij FF-berekeningen is er altijd een extra term voor H-bruggen<br /> #* Bomen worden standaard opgesteld a.d.h.v. similariteit<br /> #* Er zijn meerdere traceback-paden mogelijk bij N-W en S-W<br /> # Ik heb een nieuwe DNA sequentie van een virus ontdekt (dat codeert in meerdere leesramen). <br /> #* Hoe ga ik tewerk om homologe proteïnes te vinden tussen dit virus en andere organismen? Wees specifiek.<br /> #* Je vermoedt sequentiehomologie met een voorouder, hoe kan je nagaan of er insertie of deleties plaatsvonden? Welk programma?<br /> <br /> === 18 juni 2018 VM ===<br /> #Leg uit welk programma er gebruikt wordt om homologe sequenties te zoeken (12 pt):<br /> #* Leg het algoritme uit.<br /> #* Hoe/met welke waarde worden de resultaten geëvalueerd?<br /> #* Bijvragen: &quot;waarom doe je dit&quot; bij verschillende stappen in het algoritme bv. bij stap 7: S-W alignement: &quot;waarom nog eens local alignement, we hebben toch al HSPs gematched?&quot;<br /> # (Trekvraag) Leg het Chou Fasman-algoritme uit (5 pt)<br /> # Leg volgende tekeningen uit: wat is het, hoe wordt het bekomen, waarvoor wordt het gebruikt (6 pt)<br /> #* Tekening van dot-plot<br /> #* Tekening van contact map<br /> # Juist of fout (9 pt)<br /> #* Cys en Trp hebben altijd de laagste score in een BLOSUM/PAM (log-odds) scoring matrix<br /> #* De beste manier op een gewortelde boom te maken is met NJ<br /> #* De laatste kolom van de pdb file is altijd de B factor<br /> # Geef de verschillende oppervlakken die geanalyseerd kunnen worden en hoe worden deze bekomen? (3 pt)<br /> # Oefeningen (USB-stick 4):<br /> #* Which chromosome of the domestic chicken is the smallest <br /> #* What is the pdb code of the oldest released X-ray structure containing a manganese(II) ion?<br /> #* Translate the nucleotide sequence and determine following parameters for the largest open reading frame (DNA seq gegeven). (MW, pI, extincitiecoëfficiënt, number of digestion (cutting) sites for following enzymes: trypsin, pepsin (pH &gt; 2), caspase1<br /> #* What is the name of the protein corresponding to the following amino acid sequence? Which Organism does it come from? Is it complete or just a fragment? (AZ seq gegeven)<br /> #* A new virus targeting humans has been discovered that is potentially dangerous to human health. It belongs to a family of well known viruses targeting a variety of animals. Researchers want to trace the origin of the virus in order to prevent further spreading. They use the amino acid sequence of the matrix protein that determines host specificity. Using newhumanvirus3.fasta file (gegeven) which contains the unaligned sequences of the matrix protein create a tree and show to which host animal the new human virus is most likely related and could be dangerous to spread the virus further.<br /> <br /> === 11 Juni 2018 ===<br /> # Leg de algoritmes uit voor zowel een globale als lokale alignment en wat is het verschil(BLOSUM ook vermelden). Bijvragen:<br /> #* Waarom introduceren we m+1 en n+1?<br /> #* Wat is de score van het geheel?<br /> #* Waarom is dit een dynamisch process? <br /> #* Is de score bij meerdere paden dezelfde? <br /> # (Trekvraag) Formule om similariteitsscore naar distancescore om te zetten is gegeven. Leg uit waarom deze wordt gebruikt en leg de termen die in de formule (werd gegeven) gebruikt worden uit + geef hun functie binnen de formule. <br /> # Gegeven is een PDB-file (van 3 aminozuren). Benoem de kolommen en bespreek bondig. Is deze PDB-file bekomen door een NMR of een X-ray expermiment? Teken het tripeptide uit.<br /> # Waar of onwaar? <br /> #* Neighbour Joining is altijd de beste manier om een boom te maken. <br /> #* In de formule van de totale energie is de bijdrage van de waterstof-bindingen niet persé nodig omdat deze toch al verwerkt is in de term van de vdW-kracht.<br /> #* (vergeten)<br /> # Ik heb een nieuwe DNA sequentie van een virus ontdekt (dat codeert in meerdere leesramen).Hoe ga ik tewerk om homologe proteïnes te vinden tussen dit virus en andere organismen? Wees specifiek.<br /> <br /> === 28 Juni 2017 (VM) ===<br /> # (mondeling) Bespreek CLUSTAL algoritme dat wordt gebruikt voor MSA. Wat kan je doen als er fouten opgetreden zijn in de eerste sequentie (zoeits, maar hij doelde op iteratieve procedure dus) (12 ptn)<br /> # (mondeling) Trekvraag 1 vraag pp.: (5 ptn)<br /> #* tripeptide GIG teken plus phi, psi, omega en Chi 1 en 2 aanduiden plus waarvoor worden ze gebruikt.<br /> #* Afbeelding van een phylogenetische boom: Wat voor boom is dit en wat zijn de cijfertjes bij de knooppunten.<br /> #* Contactmap<br /> # Bespreek de gebonden en niet-gebonden termen in de energie uitdrukking (FF). Waarvoor staan deze? (6ptn)<br /> # Juist of fout (9 ptn)<br /> #* Maximum parsimony is de enige methode die de relatie met de ancestrals reflecteert<br /> #* PDB database bevat enkel experimentele structuren. Dus enkel structuren verkregen via Xray/Kristallografie of NMR.<br /> #* Wanneer we een BLAST uitvoeren met een database met minder sequenties zal de E-waarde kleinzer zijn dan wanneer we een BLAST uitvoeren t.o.v. een database met veel sequenties<br /> # Bespreek de verschillen tussen PAM en BLOSSUM matrices (3ptn)<br /> <br /> === 19 juni 2017 (NM) ===<br /> # (mondeling) Bespreek homology modelling<br /> # (mondeling) Trekvraag: <br /> #* Contact map<br /> # Ramachandran en rotameerplot. <br /> ## Teken het tripeptide SYT <br /> ## Duid de belangrijke hoeken aan op het peptide<br /> ## Waarvoor worden deze plots gebruikt?<br /> # Juist of fout:<br /> #* BLOSUM250 kan gebruikt worden voor zeer similaire sequenties<br /> #* TBLASTN wordt gebruikt om homologie te zoeken tussen non-coding regions in DNA <br /> #* N-W kan gebruikt worden om multidomeinproteïnen te aligneren waarvan 1 domein evolutionair verwant is<br /> # Hoe kan je een boom wortelen? Bij welke methode gebeurt dit automatisch?<br /> <br /> === 19 juni 2017 (VM) ===<br /> # (mondeling) Hoe phylogenetische boom maken. Leg ook schematisch uit de methode die de voorkeur draagt afhankelijk van de sequentie-informatie<br /> # (mondeling) Trekvraag: (verschillende bij iedereen hier zijn een paar vb.) <br /> #* hamiltoiaan<br /> #* moleculaire klok hypothese<br /> #* Protein Surface Representation<br /> # C en W (cys en trp)--&gt; lage of hoge waarden in vergelijking met de andere residuen in PAM of BLOSUM?<br /> ## Verklaar biochemisch<br /> ## Duid de hoeken aan (omega, chi 1 chi 2, psi, phi) aan de dipeptide CW<br /> ## Waarvoor zijn deze hoeken belangrijk? (Ramanchandran plot dus)<br /> # Juist en Fout<br /> #* hoogste bitscore gelijk aan 4<br /> #* met een FF kan de energie van de conformatie niet berekend worden voor kleine molecule<br /> #* PSI-Blast (sorry ik weet niet meer wat die juist erover vroeg)<br /> # Hoe kan je met behulp van MSA info krijgen over tertiaire en quaternaire structuur van een familie van proteïnen<br /> <br /> === 12 juni 2017 (NM) ===<br /> # (mondeling) Globale en locale alignering van twee sequenties. Bespreek de algoritmen.<br /> # (mondeling) Trekkaart<br /> #* Kaartje 1: Benoem de verschillende surfaces van een proteinen in Pymol.<br /> #* Kaartje 2: Bespreek de Hamiltoniaan.<br /> # Benoem pdb kolommen. Gaat het om een kristalstructuur of NMR? Tekening peptide.<br /> # Juist of fout:<br /> #* H bruggen hoeven in een Force field niet weergegeven te worden omdat ze al vervat zitten in de Lennard Jones term van de VdW stralen.<br /> #* Is Neighbor joining altijd de meest nauwkeurige methode bij een phylogenetische analyse.<br /> #* Klopt het dat PAM 250 en BLOSUM92 samenhoren zoals PAM120 en BLOSUM62.<br /> # Nieuw virus ontdekt. De genomische sequentie is gekend. Virussen coderen proteinen in meerdere leesramen. Met welk programma (wees precies!) kan je opzoek gaan naar een homoloog?<br /> <br /> === 12 juni 2017 (VM) ===<br /> # (15ptn) mondeling: Bespreek PAM matrices, wat is het, hoe kom je eraan en waarvoor gebruikt men het?<br /> # (5ptn) mondeling: Trekvraag (er liggen zeker 9 kaartjes)<br /> #* Kaartje 1: Foto van contact map (bijvraag: zijn er nog andere manieren om tot deze map te komen? (doelt op correlated mutations)<br /> #* Kaartje 2: een rotameerplot<br /> # (6ptn schriftelijk) Foto van PDB-file <br /> ## Bespreek alle kolommen<br /> ## Teken residu 559 (was isoleucine). Duid volgende hoeken aan: phi, psi, omega, chi1 en chi2<br /> ## Waarvoor worden hoeken phi en psi gebruikt?<br /> # (9ptn, schriftelijk) Juist of fout? Verklaar ook waarom <br /> #* Bij het maken van een polygenetic tree (met DNA of proteinen) via NJ of UPGMA wordt er gebruikt gemaakt van sequence similarity.<br /> #* In de formule van Force Fields is de term van de waterstofbruggen altijd aanwezig.<br /> #* Bij de sequentie alignering via Needleman-Wunch of Smith-Waterman is er steeds één uitkomst mogelijk.<br /> # (3ptn, schriftelijk) Ik wil onderzoeken of mijn nieuw ontdekte virusgenoom homologie vertoont met een ander virusgenoom. Welk programma gebruikt ik best (wees specifiek!)?<br /> <br /> === 6 juni 2016 (VM) ===<br /> # (mondeling)Het berekenen van een krachtveld kan veel pc-tijd innemen omwille van de vele interacties die moeten worden beschouwd, welke termen in de vgl van het ff hangen het meest af van het aantal atomen (en hoe?) hoe wordt de pc tijd onder controle gehouden.<br /> # je krijgt van een collega een model, hoe evalueer je de kwaliteit? <br /> # Wat is het meest belangrijke gegeven dat je nodig hebt wanneer je een katalytisch centrum wil inbouwen door gerichte mutaties? <br /> # Is de DEE methode een minimisatiemethode of niet? Waarom wel/niet?<br /> # Bespreek de wiskundige vergelijking die de interactie van de waterstofbruggen weergeeft. <br /> # Wat is het essentiële verschil tussen de steepest descent minimisatie en de conjugated gradient minimisatie. <br /> # Wat is het verschil tussen een Force Field en een Scoringsfunctie?<br /> <br /> extra) tijdens mondeling krijgt ge nog een papier met drie AZ op (lange naam). Ge moet de 1lettercode en 3 lettercode geven en het peptide tekenen. Daarna hoe ge één van de AZ getekend hebt (cis of trans -&amp;gt; kijken naar omega hoek)<br /> <br /> === 24 juni 2015 ===<br /> # Bespreek de verschillende dihedrale hoeken die een proteïne kenmerken. Wat kun je hieruit besluiten? Geef mogelijke toepassingen waarbij deze hoeken gebruikt worden.<br /> # Bespreek minimaal 3 veel voorkomende 3-dimensionale organisaties in eiwitstructuren en geef eventuele uitzonderingen hierop.<br /> # Hoe kan men de 3D-structuur van loops voorspellen?<br /> # Waarom heeft een alfa-helix een dipoolmoment?<br /> # Hoe kun je de locatie van een beta-plaat bepalen zonder de 3D-structuur te kennen?<br /> # Hoe bekomt of bepaalt men de 'angle bending' parameters?<br /> # Bespreek het onderliggende principe van de steepest descent minimisatiemethode.<br /> <br /> === 6 juni 2014 (nm) ===<br /> # (mondeling)De waterstofbrug is een belangrijke energie die kan gebruikt worden bij de ontwikkeling van biologische actieve stoffen. Bespreek de eigenschappen. Bespreek ook hoe we deze via berekeningen kunnen kwantificeren.<br /> # (mondeling) Teken een tripeptide van volgende drie aminozuren: X,Y,Z (verschilt per persoon). Geef ook de drie-letter en de één-letter code. Bijvraag: Staan deze trans of cis?<br /> # Hoe kan je de 3D structuur voorspellen van een eiwit sequentie die weinig sequentie homologie vertoont in vergelijking met gekende 3D structuren?<br /> # Wat is een &amp;quot;nulde-orde&amp;quot; minimisatie methode? Verklaar m.b.v. voorbeelden.<br /> # Bespreek hoe je een goede inschatting van de diëlektrische constanten kon maken bij de berekening van de potentiële energie in een chemische structuur.<br /> # Wat heb je nodig om een Force Field (FF) te kunnen definiëren?<br /> # Wat is de 'Molecular Surface' en hoe bereken je deze?<br /> # Hoe kan je de locatie van een alfa-helix in een eiwit bepalen zonder de 3D structuur te kennen?<br /> <br /> === 6 juni 2014 (vm) ===<br /> # (mondeling)Het berekenen van een krachtveld kan veel pc-tijd innemen omwille van de vele interacties die moeten worden beschouwd, welke termen in de vgl van het ff hangen het meest af van het aantal atomen (en hoe?) hoe wordt de pc tijd onder controle gehouden.<br /> # Je krijgt van een collega student een model. Hoe kan je en ga je na of dit een goed model is voor de 3D structuur van je echt eiwit?<br /> # Bespreek de wiskundige vergelijking die de interactie van de waterstofbruggen weergeeft.<br /> # Wat is het verschil tussen een Force Field en een Scoringsfunctie?<br /> # Wat is het essentiële verschil tussen de steepest descent minimisatie en de conjugated gradient minimisatie.<br /> # Wat is het meest belangrijke gegeven dat je nodig hebt wanneer je een katalytisch centrum wil inbouwen door gerichte mutaties?<br /> # Is de DEE methode een minimisatiemethode of niet? Waarom wel/niet?<br /> <br /> === 17 juni 2013 ===<br /> #(mondeling) Hoe kun je een proteïne thermostabiliseren door mutaties in te voeren? Wat bereken je hiervoor?<br /> #Fragment uit een pdb-file: 11 kolommen benoemen + uitleggen; en identificeren wat de bron was<br /> #Rotameerconcept + toepassingen<br /> #Ramachandramplot: tekenen + functie + gebruik en toepassingen.<br /> <br /> <br /> === 12 juni 2013 ===<br /> # (mondeling) 3 aminozuren + bijvragen over de hoeken: aanduiden op de getekende structuur<br /> # (mondeling) je krijgt van een collega een model, hoe evalueer je de kwaliteit?<br /> # welke termen zorgen voor veel rekenwerk in je krachtveldmethode, waarom en hoe kan je dat rekenwerk toch beperken<br /> # bespreek de elektrostatische term<br /> # je hebt een fold en je wil de beste sequentie hiervoor, wat moet je doen?<br /> <br /> === 10 juni 2013 (nm) ===<br /> # (mondeling) Hoe kunnen we het oppervlak van een molecule karakteriseren. Wat kunnen we hiermee doen?<br /> # Hoe kan je een 3D model van een sequentie maken wanneer er weinig homologie is.<br /> # Wat zijn de eigenschappen van de H-brug en hoe wordt de energie ervan gekwantiseerd?<br /> # Welke gegevens heb je nodig wanneer je een katalytisch centrum wil inbouwen door gerichte mutaties?<br /> <br /> === 10 juni 2013 (vm) ===<br /> # (mondeling)Het berekenen van een krachtveld kan veel pc-tijd innemen omwille van de vele interacties die moeten worden beschouwd, welke termen in de vgl van het ff hangen het meest af van het aantal atomen (en hoe?) hoe wordt de pc tijd onder controle gehouden.<br /> # Je krijg van een collega student een model. Hoe kan je en ga je na of dit een goed model is voor de 3D structuur van je echt eiwit?<br /> # bespreek de elektrostatische interacties van een krachtveld, de methoden om deze te bereken en voor- en nadelen.<br /> # Hoe kan je de optimale sequentie bepalen uit een gegeven vouwing?<br /> <br /> <br /> === 11 juni 2012 (nm) ===<br /> # (mondeling) Hoe kunnen we het oppervlak van een molecule karakteriseren. Wat kunnen we hiermee doen?<br /> # Hoe kan je de 3D structuur voorspellen van een eiwit sequentie die weinig sequentie homologie toont in vergelijking met gekende 3D structuren?<br /> # Wat is het rotameer concept en waarvoor kunnen we dit gebruiken?<br /> <br /> === 20 juni 2011 (nm) ===<br /> # Hoe kan je een proteïne thermostabiliseren? <br /> # Bespreek de onderstaande PDB file (een stukje met ATOMS en dan moest je alle kolommen benoemen)<br /> # Bespreek het rotameerconcept, waar kan je dit op toepassen? <br /> # Kaartje: arginine, threonine en tryptofaan<br /> <br /> === 10 juni 2011 (vm) ===<br /> # Voor energie van eiwit maken we gebruik van krachtvelden. Welke termen (en hoe? =&amp;gt; formules !) zijn gevoelig voor het aantal atomen? Welke stappen kunnen we ondernemen om het rekenwerk toch onder -controle te houden?<br /> # Je krijg van een collega student een model. Hoe kan je en ga je na of dit een goed model is voor de 3D structuur van je echt eiwit?<br /> # Je slaagt er in het labo in om een proteïne op te zuiveren. Je stuurt je proteïne naar een bevriend labo om het te laten kristalliseren. Maar je vraagt al reeds de ruwe coördinaten op van haar proteïne. Er waren ook nog geen kwantummechanische gegevens verkrijgbaar, dus nog geen elektronendensiteiten om de coördinaten juist in te situeren. Welke methode moet je gebruiken om de energie van haar proteïne te minimaliseren. + leg uit hoe de methode werkt.<br /> # Kaartje: arginine, histidine en aspargine<br /> <br /> === 7 juni 2010 (nm) ===<br /> # bouw zoutbrug in, thermostabiliteit blijft gelijk. Waarom? ( + formules )<br /> # bespreek alles van alpha-helix<br /> # bespreek belangrijkste stappen homologie modellering<br /> # kaartje : tryptofaan, isoleucine, asparagine, methionine ( structuur, 1-lettercode en 3-lettercode )<br /> === 7 juni 2010 (vm) ===<br /> #hoe kan je een proteïne thermostabiliseren?<br /> #bespreek de onderstaande PDB file (een stukje met ATOMS en dan moest je alle kolommen benoemen)<br /> #energieminimalisatie van een organisch molecule, welke methodes zou je gebruiken en bespreek.<br /> -aminozuren: tryptofaan, histidine, glutamine en proline<br /> === 15 juni 2009 ===<br /> # hoe kan je het oppervlak van een molecule karakteriseren?<br /> #bespreek de onderstaande PDB file (een stukje met ATOMS en dan moest je alle kolommen benoemen)<br /> #bespreek het rotameer concept, waar kan je dit op toepassen?<br /> -Bijvraagje: welke residu's komen het meest voor in B-strands?<br /> === 15 juni 2009 ===<br /> # Om een de energie van een proteïne te bepalen moeten we een krachtveld toepassen. Wanneer we echter proteïnes hebben met veel atomen zal er meer rekenwerk zijn dan bij proteines met minder atomen. Welke termen zijn vooral (en hoe) afhankelijk van het aantal atomen? Waarom is dit zo en wat kunnen we doen het rekenwerk toch vlugger te laten gaan? (Mondeling)<br /> # Bijvraagje mondeling: bespreek in 2 zinnen verschil tussen PAM en BLOSUM<br /> # Kaartje 3 AZ <br /> Schriftelijk:<br /> # Bespreek en geef eigenschappen van de alfa-helix als dipool.<br /> # Je hebt je proteïne naar een bevriend labo gestuurd om te kristaliseren... enz. Welke minimisatietechniek gebruikje en bespreek deze.<br /> === 8 juni 2009 ===<br /> # bouw zoutbrug in, thermostabiliteit blijft gelijk. Waarom? ( + formules )<br /> # bespreek alles van alpha-helix<br /> # bespreek belangrijkste stappen homologie modellering<br /> # kaartje : histidine, isoleucine, asparaginezuur ( structuur, 1-lettercode en 3-lettercode )<br /> === 18 jan 2008 ===<br /> # Je wil een proteïne thermostabiliseren en voert daarom een zoutbrug in. Dit blijkt echter geen effect te hebben. Leg de mogelijke oorzaken uit. Gebruik de formules.<br /> # Leg de belangrijkste stappen in homologie modellering uit.<br /> # Je hebt een proteïne opgezuiverd en stuurt het naar een bevriend labo. Blablabla, zie vorig jaar.<br /> === 18 jan 2008 ===<br /> # Hoe kan je het oppervlak van een proteine karakteriseren, en wat kan je daarmee doen?<br /> # Wat is het concept rotameren, en hoe kan je dit toepassen?<br /> # Hoe voorspel je 2D structuur elementen, en als je een helix sequentie kent hoe kan je bepalen waar het zich zal bevinden in 3D structuur? <br /> === 1 feb 2007 ===<br /> # Bespreek de verschillende torsiehoeken die in een proteïne kunnen voorkomen en zeg waar ze een toepassing hebben<br /> # Bespreek secundaire structuurvoorspelling en zeg hoe je meer informatie kan krijgen over de positie van een (voorspelde) helix in het proteïne.<br /> # Je hebt je proteïne naar een bevriend labo gestuurd om te kristaliseren... enz. Welke minimisatietechniek gebruikje en bespreek deze.<br /> === 1 feb 2007 ===<br /> # Bespreek de elektostatisch term van het krachtveld<br /> # Bespreek beta sheet and beta strands<br /> # van 2D naar 3D: welke minimisatiemethode? <br /> === 22 jan 2007 ===<br /> # Hoe kunnen we een proteine thermostabiliseren<br /> # tabellen van pdb bespreken<br /> # van 2D naar 3D: welke minimisatiemethode? <br /> === 22 jan 2007 ===<br /> # Hoe kan een oppervlak van een proteïne gekarakteriseerd worden en hoe kan het worden toegepast <br /> # Ge kreeg een PDB-file en daarvan moest ge al de kolommen bespreken, zeggen wat er in stond.<br /> # Bespreek het rotameer-concept en waar wordt het gebruikt? <br /> === 19 jan 2007 ===<br /> # Om een de energie van een proteïne te bepalen moeten we een krachtveld toepassen. Wanneer we echter proteïnes hebben met veel atomen zal er meer rekenwerk zijn dan bij proteines met minder atomen. Waarom is dit zo en wat kunnen we doen het rekenwerk toch vlugger te laten gaan?<br /> # Bespreek en geef eigenschappen van de alfa-helix als dipool.<br /> # Je slaagt er in het labo in om een proteïne op te zuiveren. Je stuurt je proteïne naar een bevriend labo om het te laten kristalliseren. Maar je vraagt al reeds de ruwe coördinaten op van haar proteïne. Er waren ook nog geen kwantummechanische gegevens verkrijgbaar, dus nog geen elektronendensiteiten om de coördinaten juist in te situeren. Welke methode moet je gebruiken om de energie van haar proteïne te minimaliseren. + leg uit hoe de methode werkt.&lt;/text&gt;</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Immunological_Biotechnology&diff=1408 2019-01-18T15:27:53Z

<p>0653300: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak van derde bachelor biochemie. Ook gevolgd door zij die willen van chemie en biologie. Gedoceerd door Prof. Lut Arckens, mondeling examen. Ze leest je blad en stelt dan bijvragen. Voorbeelden zijn belangrijk! Er wordt een volle verplichte practicumweek gehouden (je kiest met je groep wanneer je komt en vertrekt) en het examen ervoor is sinds 2008-09 apart en schriftelijk (vragen verschillen van persoon tot persoon daar niet iedereen dezelfde proeven had uitgevoerd tijdens het practicum).<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===18/01/2019 NM===<br /> # Figuur van het maturatie process van T cellen in de thymus. Vraag: In welk orgaan speelt dit zich af en leg uit hoe dit gebeurt.<br /> # Figuur experiment van gel waarop germline DNA was geladen van C en V regio en van B cell DNA van C en V regio. Vraag: wat gebeurt er in dit experiment en wat kan je er uit afleiden (antwoord enkel op voorkant onder foto)<br /> # Figuur van verloop recombinatie DNA tussen D en J regio. Vraag: een aantal koppen waren weggelaten en moesten worden aangevuld en elke stap in 1 zin uitleggen<br /> # MC en juist fout vragen:<br /> #* Wat gebeurt er niet tijdens inflammation? (mogelijke anwtoorden: expressie cytokines, expressie chemokines, innate en adaptive immunity activeren, vernouwen van bloedvaten)<br /> #* Gebruiken NK cellen MHC class I? (mogelijke antwoorden: true or false)<br /> #* Wat gebeurde er niet in de evolutie van adaptieve immuniteit? (een aantal antwoorden die ik niet meer weet)<br /> #* Zorgen adaptieve immuniteitscellen voor specificiteit? (mogelijke antwoorden: true or false) <br /> #* Hematopoietic cellen kunnen nog in elke cel van het lichaam veranderen (mogelijke antwoorden: antwoorden true or false)<br /> <br /> ===17/01/2019 NM===<br /> # Figuur, opname bacterie, alles uitleggen, MF, dendritische cel, lymfe knopen, maturatie, ... Heel het immuunsysteem<br /> # Figuur, muizen SCID en Nude (alles staat op de afbeelding)<br /> # Figuur, Recombinatie T-cel (zelf aanvullen)<br /> # MP choice/ juist fout, 3 vraagjes eerste was over iemand die een ziekte had gekregen door het eten van fruit dat ze ingeblikt had. En dan moest ik zeggen welk mechanisme er het meest op ging reageren... Het ging om toxines dus had neutralisation gepakt, dat was juist. 2e snapte ik niets van, ging over bindingen tussen B- en T- cellen, het was complete nonsens, en dus fout. 3e was over recombinatie<br /> <br /> ===14 januari 2019 NM===<br /> # figuur uitleggen: virale infectie en laden van virale peptiden op MHC moleculen + wat daarna?<br /> # figuur uitleggen: experiment waarin beenmerg wordt getransfereerd naar bestraalde muizen met verschillend MHC genotype <br /> # figuur uitleggen: 3 manieren waarop Igs met rearranged V-region gewijzigd kunnen worden<br /> # 5 (gemakkelijke) korte vraagjes: 4 meerkeuze en 1 juist/fout<br /> <br /> ===23 augustus 2018 VM===<br /> # costimulus op immuuncellen, welke receptor, waarom?<br /> # class switching uitleggen: wat, wanneer,...<br /> # NK cellen, waneer, hoe mechanisme, hoe virus MHC-I tegehoudt<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> # Belang MHCI bij een niet geïnfecteerde cel<br /> # Activatie van naïve T-cel<br /> # geeft een verandering in de genen van een BCR uniek voor een b-cel<br /> ===18 januari 2018 VM===<br /> # Vergelijk folliculaire dendritische cel met een gewone dendritische cel.<br /> # Leg linked recognition uit en geef een medische toepassing.<br /> # Leg de werking van interferon gamma uit bij T cel differentiatie.<br /> <br /> ===16 januari 2018 VM===<br /> #Belang van Th1 cellen bij immuunrespons tegen intracellulaire bacterien<br /> #Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> #Bespreek en verklaar de invloed van meerdere immunizaties bij hetzelfde antigen bij humorale respons<br /> <br /> === 15 januari 2018 ===<br /> #costimulus op immuuncellen, welke receptor, waarom?<br /> #class switching uitleggen: wat, wanneer,...<br /> #NK cellen, waneer, hoe mechanisme, hoe virus MHC-I tegehoudt<br /> <br /> === 25 augustus 2017 VM ===<br /> # Bespreek de immuunrespons tegen extracellulaire parasieten.<br /> # Bespreek activatie van naïve B-cellen<br /> # Bespreek 3 fundamenteel verschillende mechanismen die auto-immuniteit voorkomen op verschillende plaatsen in het lichaam.<br /> <br /> === 31 januari 2017 ===<br /> #immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #activatie van naïve B-cellen<br /> #3 verdedigingsmechanisme om autoimmuniteit tegen te gaan<br /> <br /> === 30 januari 2017 VM ===<br /> #Belang van Th1 cellen bij immuunrespons tegen intracellulaire bacterien<br /> #Affinieteitmaturatie van B cellen<br /> #Bespreek de cellen die belangrijk zijn bij negatieve selectie van T cellen<br /> <br /> === 19 januari 2017 VM===<br /> #Immuunrespons endotheel<br /> #Thymus onafhankelijke B cel activatie<br /> #Centrale en perifere tolerantie T cellen a.d.h.v. voorbeeld<br /> <br /> === 17 januari 2017 NM=== <br /> #belang van MHC1 complex en gezonde lichaamscellen <br /> #Iets van bcr en gentransformatie <br /> #Activatie van Tcellen <br /> <br /> === 17 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek de rol van IFN-alfa en beta bij een virale infectie <br /> #Bespreek centrale en perifere tolerantie bij B CELLEN<br /> #Bespreek waarom CD8 T cellen meer stimulatie nodig hebben ivm CD4 T cellen <br /> <br /> === 16 januari 2017 NM ===<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten (wormen dus)<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.<br /> <br /> === 25 januari 2016 VM===<br /> # Geef de verschillen tussen folliculaire en normale dendritische cellen<br /> # Wat is linked recognition en geef een medische toepassing<br /> # Welke rol speelt IFN-γ bij de T-cel differentiatie?<br /> <br /> === 12 januari 2016 VM ===<br /> #Bespreek de immuunrespons op extracellulaire parasieten<br /> #Hoe worden naïve B-cellen geactiveerd?<br /> #Bespreek 3 fundamenteel verschillende mechanismen die autoimmuniteit voorkomen op verschillende plaatsen in het lichaam.<br /> <br /> === 11 januari 2016 NM ===<br /> #Bespreek het belang en mechanisme van activatie van het vasculair endotheel in de immuunrespons<br /> # Hoe kunnen B cellen geactiveerd worden als er geen T cellen aanwezig zijn<br /> # Centrale en perifere tolerantie van T cellen<br /> <br /> ===13 Jan 2015 (VM)===<br /> #Functie van interferon alfa en beta in virusinfectie<br /> #Bespreek aan de hand van een voorbeeld de centrale en perifere tolerantie van B cellen<br /> #Verklaar waarom CD8 meer costimulus nodig heeft dan CD4<br /> <br /> ===29 Jan 2014 (VM)===<br /> #Bespreek de vasculaire immunorespons van endotheelcellen<br /> #Bespreek thymus independent activation of B-cells<br /> #Bespreek aan de hand van een voorbeeld de centrale en perifere tolerantie van B cellen (ze zegt voorbeeld, maar als je gewoon uitlegt hoe de tolerantie tot stand komt is het goed)<br /> <br /> ===Jan 2014===<br /> #Functie van interferon alfa en beta in virusinfectie <br /> #Leg aan de hand van 1 voorbeeld de centrale en periferele tolerant van B cellen uit <br /> #Verklaar wrm CD8 meer costimulus nodig heeft dan CD4<br /> ===28 Jan 2014 (VM)===<br /> #Bespreek de expressie van een MHCI op een gezonde lichaamscel<br /> #Bespreek een verandering in de genen van de BCR die de B-cellen uniek maakt<br /> #Bespreek T cel priming.<br /> <br /> ===16 jan 2013 NM===<br /> (cfr 27 aug 2012)<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.<br /> ===27 aug 2012===<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit. <br /> === 27 jan 2012 NM===<br /> # Sommige micro-organismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het micro-organisme?<br /> # Bewijs dat thymus-stromacellen essentieel zijn voor de ontwikkeling van T-cellen<br /> # Bespreek hoe Th1-cellen de reactie tegen intracellulaire pathogenen via de macrofagen coördineren.<br /> === 27 jan 2012 VM===<br /> # Macrofagen zijn zowel in het aangeboren als het adaptief immuunsysteem belangrijk. Verklaar<br /> # Bespreek de primaire en secundaire antistof reactie<br /> # Vergelijk NK en CTL cel. Belangrijkste gelijkenissen en verschillen<br /> === 22 aug 2011 NM ===<br /> # Bespreek de rol van macrofagen in zowel de aangeboren en als de adaptieve immuunrespons. <br /> # Vergelijk de primaire en de secundaire immuunrespons.<br /> # Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> <br /> === 28 jan 2011 VM ===<br /> # Sommige microorganismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het microorganisme?<br /> # Bespreek het hapten-carrier effect en geef een medische toepassing. <br /> # Hoe kan een T cel aangezet worden tot clonale expansie?<br /> === 29 jan 2010 NM ===<br /> # Bespreek de rol van macrofagen in zowel de aangeboren en als de adaptieve immuunrespons. <br /> # Vergelijk de primaire en de secundaire immuunrespons.<br /> # Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> === 22 jan 2010 NM ===<br /> # Sommige microorganismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het microorganisme?<br /> # Bespreek het hapten-carrier effect en geef een medische toepassing. <br /> # Hoe kan een T cel aangezet worden tot clonale expansie?<br /> === 12 jan 2009 ===<br /> # Sommige organismen kunnen Fc fragmenten afbreken. waarom zou dit een hogere graad van overlevering opleveren?<br /> # Bewijs dat thymus stroma cellen essentieel zijn voor de ontwikkeling van T-cellen<br /> # Bespreek de interactie van Th1 cellen met macrofagen.<br /> === 12 jan 2009 ===<br /> # Bespreek de immunologische respons tegen een bacteriele infectie<br /> # Bespreek activatie van naive B-cel<br /> # 3 manieren om auto-immuniteit te omzeilen<br /> === 29 jan 2008 ===<br /> # Sommige pathogenen bevatten enzymen die die Fc fragmenten kunnen degraderen. Hoe kan dit een grotere overlevingskans opleveren voor dit pathogeen<br /> # Leg het hapteen-carrier effect uit en geef een toepassing<br /> # Hoe wordt een naïeve T-cel geactiveerd.<br /> <br /> === 28 jan 2008 ===<br /> # Activatie naive B cel<br /> # Immuunrespons tegen bacteriële infectie<br /> # 3 vbn. hoe er gezorgd wordt dat er geen autoimmuniteit is<br /> === 24 jan 2008 ===<br /> # Macrofagen hebben een rol in zowel innate als adaptive immunity, leg uit.<br /> # Leg de primaire en de secundaire antistofrespons uit.<br /> # leg gelijkenissen en verschillen uit van NK en CTL cells<br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # Bespreek de immuunrespons tegen bacteriële infectie (neen niet tegen intracellulaire, gewoon baceteriën int algemeen)<br /> # Bespreek activatie van naïeve B cel (neen niet T cel, goed lezen en vooral niet beginnen knallen van T cellen omdagu de voorbeeldvraag nog herinnert)<br /> # Bespreek de drie mechanismen die het lichaam beschermt tegen autoimmuniteit (of voorkomt of gebruikt ofzo)<br /> <br /> Practica:<br /> # Teken en leg uit. Kan je ook doen me een antigen me maar 1 epitoop<br /> # Wat leer je erdoor van de pI? Teken.<br /> # Wat is passieve en actieve hemagluttinatie + tekenen. Bewijs dat de interactie reversibel is<br /> # Leg het precipitatiemechanisme uit. Wat doet een PD10 kolom, naam + uitleg<br /> # Welke PAP concentratie verkies je (paar vb getalletjes, je kiest natuurlijk de beste). Verschil passieve en competitieve ELISA<br /> <br /> === 24 jan 2007 ===<br /> # bespreek de naieve Tcel en clonale expansie<br /> # Fc fragment: sommige organismen kunnen het afbreken. Hoe levert dit een hogere overleving op voor het organisme?<br /> # wat is het hapteen carrier-effect en geef toepasssingen.<br /> === 23 jan 2007 ===<br /> # bespreek de rol van macrofagen in aangeboren en adaptief immuunrespons<br /> # vergelijk: Primair vs Secundair immuunrespons<br /> # bespreek de gelijkenissen en verschillen NK - CTL.</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Microbiologie&diff=1285 2018-08-22T14:24:28Z

<p>0653300: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Microbiologie wordt tegenwoordig in het tweede jaar gegeven. Vroeger was dit het derde jaar. Ook verhuisd van tweede naar eerste semester. Wordt gevolgd door studenten biologie en biochemie. Gedoceerd door Prof. Joris Winderickx. Mondeling examen. Practicum wordt geëvalueerd via een examen practicumsessie.<br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===21 augustus 2018===<br /> #Je krijgt een waterstaal, hoe weet je welke GEKENDE micro-organismen hier inzitten waarvan je een metabool product wil onderzoeken. Hoe kan je testen dat dit een fungicide is?<br /> #Bespreek flagellen bij pro- en eukaryoten en leg chemotaxis uit<br /> #begrippen<br /> #*Surfactant<br /> #*tegument<br /> #*bacilli<br /> #*hydrogenosoom<br /> #*wateractiviteit<br /> #*phycobillisoom<br /> #*hopanoïde<br /> #*nog eentje maar ben ik vergeten<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> #Wat is een biogeochemische cycli? Geef schematisch de stikstofcyclus en beschrijf de voornaamste processen.<br /> #Bespreek de structuur, inplanting en werking van prokaryote flagellen en aanverwante structuren als ook het mechanisme van chemotaxis. Welke verschillen zijn er met een eukaryote flagel?<br /> #Begrippen: axiaal filament, griseofulin, peplomeren, quinolones, evolutionaire chronometers, mechanisme voor CO2 fixatie door de acetyl CoA pathway, viroïde, hopanoïde<br /> <br /> ===22 januari 2018 VM===<br /> #Leg uit: biogeochemische cycli. Geef schematisch de stikstofcyclus weer en bespreek de belangrijkste reacties. <br /> #Je krijgt een bodemstaal waaruit je onbekende micro-organismen moet identificeren, hierin zit een organisme dat metabole producten maakt die antifungicidaal werken, deze kunnen dienen voor een nieuw middel. Hoe ga je (zo efficiënt mogelijk) te werk?<br /> #begrippen: PFU en CFU, MIC en fenolcoëfficiënt, latente en persistente infectie, cirri, Aw, cycloheximide, commensalisme en ammensalisme en teichoïnezuur<br /> <br /> ===19 januari 2018===<br /> #Bespreek de structuur, werking en inplanting van bacteriële flagellen (met tekening). Wat is het mechanisme van chemotaxis? Wat zijn de verschillen met eukaryote flagellen.<br /> #Welke detoxificatiemechanismen zijn er van toxische zuurstof. Geef de enzymen en hun reacties. Hij wilt ook dat je een extra voorbeeld geeft. Wat is het belang van zuurstof in een microbiële ecosysteem.<br /> #8 termen: cycloheximide, sulfonilamide, aw, lysozymen, amensalisme, phycobiline, acetyl-CoA pathway en hepadnavirus<br /> <br /> ===15 januari 2018===<br /> #Bespreek kort de oxygene en anoxygene fotosynthese van micro-organismen en hun reducerend vermogen. Leg fermentaties van micro-organismen uit, hoe wordt hiermee energie gewonnen? /5<br /> #A)Waarvoor staat HxNx? B) Leg de Baltimore-classificatie uit. Welke types virussen hebben eigen polymerasen? C) weet ik niet meer, maar ook iets met virussen /5<br /> #8 stellingen, per juist antwoord 0,5 1)cyloheximine werkt niet op gramnnegatieve bacteriën 2)antibiotica-resistentie wordt aspecies-specifiek doorgegeven en voornamelijk via transductie 3)een guilde is een groep van klonaal verwante cellen 4)bij een peristenta infectie komen viruspartikels niet vrij en blijft de gastheer leven 5)bij amensalisme hebben beide partners altijd een voordeel 6)bij een hydrogenosoom wordt ATP geproduceerd via hydrolyse en H+ 7)een virion reffereert naar de extrcellulaire vorm van een virus 8)ben ik vergeten /4<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM===<br /> #bespreek de structuur en werking van de flagel bij bacteriële cellen + bespreek chemotaxis<br /> #detoxificatie van zuurstof<br /> #8 stelling juist/fout + verklaar<br /> #*gramnegatieve bachteriën zijn niet gevoelig voor beta-lactam ring <br /> #*antibiotica-resistentie is species-specifiek<br /> #*decimale reductietijd neemt af bij toenemende verhittingstemperatuur<br /> #*hydrogenosomen bij prokaryoten halen hun energie uit de oxidatie van pyruvaat<br /> #*stikstoffixatie komt vooral voor in anoxygene condities<br /> #*persistentie infectie van viruspartikels vernietigd de gastheercel<br /> #*geen enkele bacterie (Bacteria + Archaea) kan leven zonder celwand<br /> #*energiewinst bij fermentatie komt altijd van substraatfosforylatie<br /> <br /> ===23 januari 2017 NM===<br /> #bespreek hoe het kleine virale genoom toch een volledige functie qua replicatie en assemblage van een virus kan veroorzaken. geef voorbeelden en leg uit<br /> #virussen zijn niet altijd negatief. Bespreek en geef een voorbeeld ivm humaan microbioom<br /> #je hebt een bodemstaal met micro-organismen, hoe ga je na dat deze micro-organismen een fungistatische werking hebben? + leg uit micro-organismen die groeien in het labo en micro-organismen laten groeien die niet in het labo kunnen groeien.<br /> #vancomycine slaat niet aan, welke combinatie is het beste? keuze uit: vancomycine + cycloheximide/amphotericini/isoniazide/sulfanilamide<br /> #leg verschil en gelijkenis uit + bespreek<br /> #*mesofiel-pathogeen<br /> #*antiseptica-desinfectans<br /> #*fermentatie-chemoorganotroof anaeroobe respiratie<br /> #*chemoorganotroof-chemolithotroof<br /> #*generatietijd-delingscoefficient<br /> #*sporecortex-bacteriele celwand<br /> #*guilde-gemeenschap<br /> #*commensalisme-amensalisme<br /> <br /> ===23 januari 2017 VM===<br /> #bespreek de celwand bij gram - en gram + bacteriën en archaea. geef een manier om bacteria, archaea en eukaryoten te scheiden. geef minstens 3 manieren hoe je gram + en gram - bacteriën kan onderscheiden (zonder gram kleuring) <br /> #afbeelding cel met onderdelen aangeduid (celwand, 50S,...) geef voorbeelden van antibiotica die hier op inwerken en leg hun werking uit.<br /> #8 juist of fout vragen<br /> <br /> ===26 januari 2016===<br /> #Gegeven een tekening van een virtuele cel van een micro-organisme (aangeduid: DNA synthese, RNA synthese, mitotische spoelfiguur en microtubuli, celwand, plasmamembraan, translatie, foliumzuursynthese). Geef alle antimicrobiële middelen die erbij horen. Bespreek de mechanismen van de antimicrobiële middelen bij een verschillende manier van inwerking. <br /> #Flagellen pro-en eukaryoten (ook tekenen!). Welke andere bewegingsvormen ken je nog? Leg taxis uit. <br /> #Leg uit en bespreek de gelijkenissen en/of verschillen:<br /> #*halofielen - osmiofielen<br /> #*autotroof - heterotroof<br /> #*bacteriële celwand - sporeprotoplast<br /> #*chemoorganotroof - ...<br /> #*chemoorganofiel - ...<br /> #*chemooragnofiel anaeroobe respiratie - ...<br /> #* ...<br /> <br /> ===22 januari 2015===<br /> #Flagellen en cirri bij pro- en eukaryoten, bespreek chemo- en fototaxis.<br /> #Detoxificatiemechanismen<br /> #Acht stellingen, juist/niet juist en waarom (ieder op 0,5 punt)<br /> #*B-lactam werkt alleen op gram +<br /> #*Resistentie is species-specifiek<br /> #*Decimale reductietijd daalt altijd bij hogere T<br /> #*Bij fermentatie vindt de energiewinning altijd plaats door substraatfosforylatie<br /> #*Bacteria en Archaea kunnen nooit leven zonder celwand<br /> #*Stikstoffixatie is vooral anoxisch<br /> #*Hydrogenosomen komen voor bij prokaryoten waar ze pyruvaat oxideren tot -<br /> #*en nog een die ik me niet meer herinner.<br /> <br /> ===27 januari 2015===<br /> #verschil oxygene en anoxygene fototrofie + energie bij fermentatie<br /> #welke manieren van voortbeweging, verschil in pro en eukaryoten, (sex)pili, welk competitief voordeel?<br /> #juist/fout vragen<br /> <br /> ===19 januari 2015 (NM)===<br /> #Mechanismen van restentie en resistentie overdracht. Is resistentie speciesspecifiek? Methoden voor het post-antibioticatijdperk.<br /> #Photosynthese bij purperbacterien, groenzwavelbacteren en cyanobacterien schematisch tekenen en verschillen uitleggen. Linken met morfologie en ecologie. <br /> #8 juist-fout vraagjes<br /> #*Gram-negatieve bactierien zijn vatbaar voor ampicilline en amoxicilline.<br /> #*Ergosterolsynthese is geen goede target voor antifungale drugs.<br /> #*Bij een latente infectie komen er geen virusgenen tot expressie en komen er geen virussen vrij.<br /> #*Het nitrogenasecomplex werkt vooral in anoxische omstandigheden<br /> #*Een hydrogenosoom komt voor bij prokaryoten en oxideert pyruvaat tot AcCoA.<br /> #*...<br /> <br /> <br /> ===19 januari 2015 (VM)===<br /> #koolstofcyclus schematisch tekenen en alle metabole processen uitleggen (reacties zijn niet zo belangrijk)<br /> #Wat is de beste combinatie en slechtste combinatie? flucytosine + polyeen, griseofuline en polyeen, vancomycine en polyeen, en er was dan nog eentje maar die weet ik niet meer <br /> #woordjes uitleggen: <br /> #*exosporium <br /> #*evolutionaire chronometers <br /> #*omgekeerde citroencyclus<br /> #*...<br /> <br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> #Virussen zijn gekenmerkt door een klein genoom. Toch hebben ze alles om te voorzien in hun replicatie. Verklaar aan de hand van enkele voorbeelden. Sommige virussen hebben echter ook eigen polymerase enzymes nodig, identificeer hen aan de hand van de baltimore classificatie.<br /> #Je wordt gevraagd onbekende micro-organismen uit een staal water te identificeren; welke technieken gebruik je en hoe ga je te werk om te kijken of sommigen de mogelijkheid bezitten tot de productie van een fungistatisch middel om het te commercialiseren.<br /> #O2 kan giftig zijn; geef de detoxificatiemechanismen die micro-organismen bezitten om dit te bestrijden<br /> <br /> ===21 januari 2014===<br /> #de koolstofcyclus en metabole processen <br /> #detoxificatie mechanisme van zuurstofderivaten die door metabole processen geproduceerd worden en dan ne fungus bestrijden met een combinatie. <br /> #combinaties werden gegeven allemaal met myconazol: uitleggen welk het beste werkte en welk het minst.<br /> <br /> === 20 jan 2014 (namiddag) ===<br /> #koolstofcyclus<br /> #mechanismen van detoxificatie<br /> #patient is besmet met Candida, een syntetische azool werkt niet goed. Welke antibiotica mengeling is de beste? Gegeven = telkens een syntetische azool in combinatie met flucytosine, griseofulin, vancomycine, en nog 1 dat ik niet meer weet<br /> <br /> ===20 januari 2014 voormiddag===<br /> #antibioticaresistentie: hoe, verschillende mechanisme, hoe krijgen we dat in het lichaam<br /> #fungistatische drugs in natuurlijke bodem, hoe herkennen en er uit halen<br /> #virussen: verklaar HxNx, antigendrift en antigenenschift en waarom gaat antigenenschift zo gemakkelijk en baltimoreklassen van influenza + verklaren<br /> #woordjes<br /> #*hopanoide (hier moet ge dat dan vergelijken met sterol in eukaryoten enzo)<br /> #*hydrosoom<br /> #*viroiden<br /> #*endotoxine<br /> <br /> === 31 jan 2012 (voormiddag) ===<br /> # Geef de koolstofcyclus en leg kort alle processen uit die hierin voorkomen. (mondeling)<br /> # Een schema van een cel waarop verschillende delen aangeduid stonden (celwand, membraan, DNA+RNA-synthese, 50S ribosoon-subunit, 30 S ribosoom-subunit). Geef bij elk deel de antibiotica die hierop inwerken en leg, als er meerdere antibiotica bij bij één passen, hun actiemechanismen uit.<br /> # Verklaar:<br /> #* Fenol-coëfficiënt methode<br /> #* Virion<br /> #* Rolling-circle replicatie<br /> #* O-anitgen<br /> #* Fermentatiebalans<br /> #* Anamoxosoom<br /> #* Decimale Reductietijd<br /> #* Hopanoïde<br /> <br /> === 26 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Anoxigene fotosynthese bij purperbacterien en oxygene bij cyanobacteriën: Een schets geven en vergelijken.<br /> # Celwandstructuur bij bacteria(grampos en gram negatief)en archaea bespreken en vergelijken. En met welke techniek zou je deze kunnen onderscheiden<br /> # Een patiënt met een bacteriële infectie werd behandeld met chloramphenicol maar dit was niet erg werkzaam. Men zou kunnen combineren met vancomycine, tetracycline en cephalosporine. Wat gaat het minst werkzaam zijn? en welk het meeste?<br /> <br /> === 25 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Wat is metagenomics, wat kun je met deze techniek doen en beschrijf de voordelen aan de hand van een creatief (zelfverzonnen)voorbeeld<br /> # Stikstoffixatie: Bespreek en wat heeft zuurstof hiermee te maken?<br /> # Geef de biochemische werkingsmechanismen van: quinolones, aminoglycosiden, synthetische azolen en sulfonamides<br /> <br /> === 17 jan 2011 (namiddag) ===<br /> <br /> # Wat is metagenomics, wat kun je met deze techniek doen en beschrijf de voordelen aan de hand van een creatief (zelfverzonnen)voorbeeld<br /> # nitrificatie, denitrificatie en stikstoffixatie zijn belangrijke processen. Bespreek bondig de reacties en plaats in de stikstofcyclus. Wat heeft zuurstof hiermee te maken?<br /> # vergelijk de opbouw van de celwand van gram positieve en negatieve bacteriën met behulp van een schema, hoe zou je eenvoudig een onderscheid kunnen maken?<br /> <br /> === 21 jan 2010 ===<br /> # Geef de schematische voorstelling van de anoxigene fotosynthese bij purperbacteriën en de oxigene fotosynthese bij cyanobacteriën. Bespreek verschillen, incl. morfologische kenmerken en plaats dit in een algemeen microbiële context.<br /> # Hoe weet je of een medicijn bacteriostatisch, bacteriolytisch, bacteriocide, fungistatisch, fungicide is. (bijvraag: hoe zou jij dat bepalen als biochemist?) Wat is MIC en hoe bepaal je dat, fenolcoëfficient bespreken. De criteria bespreken voor een medicijn, antiseptica, desinfectans.<br /> # Mexicaanse griep is van het type H1N1. Leg uit wat HxNx is en leg antigene shift en antigene drift uit. Tot welke baltimore klasse behoort influenza.(bijvraag: middelen tegen influenza)<br /> <br /> === 11 jan 2010 ===<br /> # zuurstof kan toxisch zijn voor micro-organisme. Welke reactie zorgen voor de omzetting van deze toxische zuurstof?<br /> # bespreek de biochemische werkingsmechanisme van ampiciline en cephalosporine<br /> # geef alle pathways voor C02 fixatie? (het zijn er btw 8 en geen 5 zoals de meeste denken)<br /> === 27 jan 2009 ===<br /> <br /> # Verklaar:<br /> #* Baltimore classificatie<br /> #* tegument<br /> #* psychrotolerante mesofiel<br /> #* peritrieche flagelaat<br /> # Methanotrofen en methylotrofen, geef energiewinning en koolstof assimilatie<br /> # antifungale drugs; waarom moeilijker te maken dan antibacterieel en bespreek de reactiemechanismen van <br /> === 23 jan 2009 ===<br /> # C02 fixatie<br /> # hoe ga je te werk om uit een bodemstaal 1) alle micro-organismen te identificeren 2) een fungistatisch metaboliet te zoeken<br /> # Termpjes:<br /> #* aw<br /> #* serine pathway<br /> === 23 jan 2009 ===<br /> # Een gistcultuur is geïnfecteerd met cyanobacteriën. Geef een aantal manieren om weer een zuivere gistcultuur te verkrijgen.<br /> # Juist of fout vragen:<br /> #* S-lagen<br /> #* iets over pseudopeptidoglycaan van Archaea<br /> #* phycobilines<br /> #* de manier van vrijstelling van naakte vs 'enveloped' virussen<br /> #* cephalosporine<br /> # Nitraatreductie. En bespreek deze bij E.coli en Pseudomonas stutzeri.<br /> === 16 jan 2009 ===<br /> # 5 woorden verklaren:<br /> #* cephalosporine<br /> #* phycobilisoom<br /> #* hepadnavirussen<br /> #* serine pathway<br /> #* wateractiviteit aw<br /> # Waarom is het moeilijker om antiviraal middel te vinden dan een antibacterieel?<br /> # Biogeochemische cycli en stikstof-cyclus<br /> === 15 jun 2008 ===<br /> # bespreek de acetyl coA pathway en welke organisme gebruiken deze...<br /> # glycocalyx, hydrogenosoom, wateractiviteit, mutualisme, protocooperatie uitleggen<br /> # wat zijn fylogenetische merkers, wat doen ze en geef meerdere voorbeelden en leg uit<br /> === 13 jun 2008 ===<br /> # Denitrificatie en nitrificatie + waterzuivering<br /> # Hou zou je ALLE organismen in een bodemstaal classificeren en metabolisme nagaan?<br /> # wateractiviteit + welke organismen kunnen tegen lage + oplossing<br /> # Termen:<br /> #* amensalisme<br /> #* protocoöperatie<br /> #* S.cerevisiae geïnfecteerd met groen zwavel bacteriën... hoe los je dit op<br /> #* Verschil groenzwavel- en purperbacteriën op vlak van productie reducerend vermogen<br /> #* Antibioticaresistentiemechanismen<br /> #* fermentatie...hoe energie en reducerend vermogen verzorgen<br /> #* mutualisme<br /> #* syntrofie<br /> #* verschil antiseptica en desinfectantia<br /> === 13 jun 2008 ===<br /> # acetyl coA cyclus en welke organismen deze gebruiken<br /> # voorwaarden voor goede fylogenetische merkers en enkele voorbeelden<br /> # begrippen: pleiomorfie,monomorfie,chemostaat,....<br /> === 10 jun 2008 ===<br /> # penicillines hebben geen effect op Archaea en Gram negatieve bacterien. Juist of fout, leg uit ahv biochemische werking penicilline<br /> # wat is metagenomics, voordelen en toekomstperspectieven in toegepaste microbiologie<br /> # manieren van C02 fixatie<br /> === 27 aug 2007 ===<br /> # Stel men vraagt je om een antifungaal middel te ontwikkelen tegen gistinfecties bij mensen. Op welke principes zou je dit kunnen baseren en staaf met een voorbeeld. Hoe ga je te werk om te bepalen of je product een bacteriostatische of bacteriocide werking heeft? <br /> # Bespreek bondig de anoxische fotosynthese bij purperbacterieën<br /> # Wat zijn psychrofiele organismen? Hoe zijn ze aangepast aan hun milieu? Waarin verschillen ze met psychrotolerante organismen?<br /> # Practicumvraag: Geef met behulp van een schema het verschil tussen gram-positieve en gram-negatieve bacteriën. Met welke technieken kun je beide groepen onderscheiden?<br /> === 18 jun 2007 ===<br /> # De toxische producten die vanuit zuurstof gevormd worden en hoe de cel die onschadelijk maakt.<br /> # Geef alle manieren om CO2 te fixeren.<br /> # Termen: <br /> #* chemostaat<br /> #* glycocalyx<br /> #* micronutrienten<br /> #* macronutrienten<br /> #* hydrogenosoom<br /> #* monomorfisch<br /> #* pleiomorfisch<br /> === 15 jun 2007 ===<br /> # Leg de structuur en de werking van de bacteriële flagel uit en bespreek chemotaxis.<br /> # Hoe gaat u te werk om te bepalen of een stof een bacteriostatische of bactericide werking heeft?<br /> # Vergelijk de energie en reducerend vermogen vorming bij fototrofen en fermentatie.<br /> <br /> === 11 jun Z007 ===<br /> # bespreek de vorming en structuur van endosporen, welke zijn de voordelen hiervan voor de overleving van de bacterie en hoe moeten we daar mee omgaan als we de groei van zulde organismen willen onder controle houden<br /> # ken je manieren voor incorporatie van C02, zoja welke en beschrijf bondig de pathways <br /> # stel je hebt een bodemstaal met daarin nieuwe 'ongekende' organismen, beschrijf hoe je te werk zou gaan om deze te identificeren en welke manieren je zou gebruiken voor de classificatie<br /> <br /> === 11 jun 2007 ===<br /> # Hoe onstaat resistentie tegen antibiotica bij micro-organismen? Bespreek de verschillende mechanismen van resistentie. In een post-antibiotica tijdperk, welke methoden zou je gebruiken om bacteriele infecties tegen te gaan?<br /> # Bespreek de verschillende methodes die micro-organismen hebben om zich te beschermen tegen toxische zuurstof producten (door fotochemische reacties ontstaan).<br /> # Wat zijn biogeochemische cycli? Bespreek aan de hand van een schematische voorstelling van de koolstof cyclus.</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Chemie_Van_Natuurproducten&diff=1240 2018-06-21T19:24:00Z

<p>0653300: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===21 juni 2018 NM===<br /> #Stetter-reagens<br /> #NAD+/NADH reductie<br /> #biosynthese insitol<br /> [[Bestand:Knipsel.jpg]]<br /> <br /> ===21 juni 2018 VM===<br /> #vorming 8 ring met pyridoxaal fosfaat<br /> #ringsluiting van polyketide en de synthese van een polyketide geven<br /> #stereospecifieke aanval bij reductie met NADH<br /> <br /> ===19 juni 2018===<br /> #bespreek synthese humuleen<br /> #Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring<br /> #bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2<br /> <br /> ===15 juni 2018===<br /> #Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units')<br /> #Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)<br /> #Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+.<br /> <br /> ===11 juni 2018 voormiddag===<br /> #Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)<br /> #Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring<br /> #Bespreek antioxiderende werking van vitamine C<br /> <br /> ===21 juni 2017 namiddag===<br /> #hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme<br /> #reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --&gt; ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)<br /> #bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen<br /> <br /> ===21 juni 2017 voormiddag===<br /> #bespreek synthese humuleen<br /> #bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2<br /> #oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring<br /> <br /> ===20 juni 2017 namiddag===<br /> # Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat<br /> # een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)<br /> # geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)<br /> <br /> ===20 juni 2017 voormiddag===<br /> # oefening van polyketiden<br /> # gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat<br /> # oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).<br /> <br /> ===16 juni 2017===<br /> # Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat<br /> # Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)<br /> # Antioxidante werking van vitamine C<br /> <br /> ===13 juni 2017===<br /> # Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)<br /> # Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring. <br /> # Stetteroefening.<br /> <br /> ===12 juni 2017===<br /> # een oefening &quot;met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie&quot; da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter<br /> # tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie<br /> # theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit<br /> <br /> ===12 juni 2015===<br /> #leg de werking van vitamine C uit als antioxidans<br /> #Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat<br /> #Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.<br /> <br /> ===20 agustus 2013===<br /> #Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme<br /> #Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+<br /> #Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken<br /> <br /> ===19 juni 2013===<br /> #Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit<br /> #Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule<br /> #Bespreek de synthese van vitamine C<br /> <br /> ===17 juni 2013===<br /> #In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)<br /> #Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)<br /> #Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C<br /> <br /> ===14 juni 2013===<br /> #Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert<br /> #2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen<br /> #Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.<br /> <br /> ===15 juni 2012 (namiddag)===<br /> #Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.<br /> #Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.<br /> #Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.<br /> <br /> ===15 juni 2012 (voormiddag)===<br /> #Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat<br /> #Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?<br /> #Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA<br /> <br /> ===20 juni 2011 (namiddag)===<br /> #Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)<br /> #Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.<br /> #Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetrisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion<br /> <br /> ===14 juni 2010===<br /> #Omzetting van histidine naar histidine zonder CO2 (structuren gegeven)<br /> #Welk biomimetrisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)<br /> #Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit<br /> <br /> ===11 juni 2010===<br /> #Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat<br /> #Vetzuursynthese<br /> #Radicale ortho-para-koppeling<br /> <br /> ===September 2009===<br /> #DOPA en DOPAMINE<br /> #Synthese inositolen<br /> #Stereospecificiteit LADH<br /> <br /> ===12 juni 2009===<br /> #Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?<br /> #Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie<br /> #Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan<br /> <br /> ===4 september 2008===<br /> #De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.<br /> #De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep<br /> <br /> ===17 juni 2008===<br /> #Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt<br /> #Fructose: fisher =&gt; hawordth omzetting<br /> #Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD<br /> <br /> ===19 juni 2007===<br /> #Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)<br /> #Fructose fisher gegeven, geef haworth<br /> #R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD =&gt; FADH2) leg uit + geef structuur van FAD<br /> <br /> ===12 juni 2006===<br /> #Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties<br /> #Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?<br /> #Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg<br /> <br /> ===12 juni 2006===<br /> #Decarboxylatie van een aminozuur<br /> #R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD =&gt; FADH2): leg uit + geef structuur van FAD<br /> #Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Wijsbegeerte&diff=1176 2018-06-16T13:03:29Z

<p>0653300: /* 13 juni 2018 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Sinds 2017 wordt dit vak gegeven door professor Jan Heylen.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===13 juni 2018===<br /> meerkeuze:<br /> #belgië speelt tegen duitsland, ze kunnen winnen of verliezen, dit laatste kunnen ze doen door gelijk te spelen of te verliezen. Wat is de kans dat ze winnen?<br /> #*1/2<br /> #*1/3<br /> #*1/2 of 1/3<br /> #*1/2 en 1/3<br /> #Wat was volgens Thales de oorzaak van aardbevingen<br /> #*een schip door de woeste zee<br /> #*het heel hard terecht komen van een drietand op de aarde<br /> #*het waaien van de wind door de bomen<br /> #*het open en toe gaan van een stoomklep<br /> #Stel jij bent de natuur, hoe zou Bacon iets over jou te weten willen komen?<br /> #*het 1 keer lief vragen<br /> #*het meerdere keren lief vragen<br /> #*je opsluiten in een kamer en het 1 keer vragen<br /> #*je opsluiten in een kamer en het meerdere keren vragen<br /> #De studenten die de les filosofie hebben gevolgd hebben last van een onvoelbaar, onruikbaar, onzichtbaar kriebelend beestje. Deze uitspraak is:<br /> #*verifieerbaar en falsifieerbaar<br /> #*verifieerbaar maar niet falsifieerbaar<br /> #*niet verifieerbaar wel faslifieerbaar<br /> #*niet verifieerbaar en neit falsifieerbaar<br /> #Er zijn 170 miljoen nederlanders waarvan 60 duizend groter zijn dan 2 meter. Wat is de kans (volgens 1 of ander model) dat een nederlands kind groter dan 2 meter is?<br /> #*1<br /> #*3/850<br /> #*0<br /> #*onbepaald<br /> #Hoe verwoorde Osiander het wereldbeeld van Kepler voor de kerk?<br /> #*instumenteel gebruikt<br /> #* nog 3 antwoorden maar het bovenste is het juiste ;)<br /> #Tot nu toe is altijd deductief waargenomen dat Natriumcarbonaat oplost. Waarom kunnen niet bewijzen dat natriumcarbonaat in 2100 ook zal oplossen?<br /> #*Er bestaan geen axioma's in de chemie<br /> #*het is mogelijk dat natriumcarbonaat oplost<br /> #*in de toekomst gaat natriumcarbonaat niet oplossen<br /> #*en nog eentje<br /> <br /> Op elke vraag kon ook &quot;weet niet&quot; worden geantwoord!<br /> <br /> Open vragen:<br /> #modules, 1 van die vragen<br /> #Wat was volgens Popper het probleem met de uitspraak dat wetenschap werkte volgens inductie<br /> <br /> ===14 juni 2017===<br /> #leg uit hoe de opvattingen van Pythagoras en descartes hebben bijgedragen tot de huidige moderne natuurwetenschappen<br /> #Leg het Quine-Duhem probleem uit aan de hand van een casus (een experiment in Cern gaf aan dat deeltjes sneller bewogen als licht, dit zou niet kunnen volgens Einsteins hypothese, uiteindelijk leek de fout te liggen aan het verkeerd verbonden zijn een kabel). Hierbij moet je ook ad hoc hypothese uitleggen, want dit wijst op het feit dat ze de fout steken op de kabel om de hoofdhyptose af te schermen<br /> #Schijf van Pointcaré waarbij je dit moet reflecteren aan de Bayensiaanse confirmatietheorie; eigenlijk dus gewoon bayensiaanse confirmatietheorie uitleggen<br /> #Hume en het probleeem van symmetrie + oplossing; ook nog iets met regulatriteit en causale afhankelijkheid<br /> #leg uit: ceteris paribus wet + Ruse's 5 kenmerken van wetenschap<br /> #beantwoord één van de volgende vragen:<br /> #* -<br /> #* - <br /> #*Leg het biologisch soortenconcept uit en evalueer het kritisch<br /> #*Wat is het verschil tussen enerzijds elementen als ‘eenvoudige substanties’ en anderzijds'reele elementen’ of fundamentele substanties? Wat is de relatie met de periodieke tabel van Mendelejev?<br /> <br /> ===voorbeeldexamen 2017===<br /> #Leg uit: de mechanisering van het wereldbeeld ondersteunde de opgang van de experimentele methode.<br /> #Leg het Quine-Duhem probleem uit.<br /> #Wat is het nieuwe raadsel van Goodman en hoe verhoudt het zich tot Humes probleem van inductie?<br /> #Hoe lost Lewis’ theorie van causale afhankelijkheid het probleem van symmetrie op? Leg kort uit wat het probleem van symmetrie is en wat de theorie van Lewis inhoudt.<br /> #Beoordeel het volgende criterium: wetenschap is tentatief.<br /> #Beantwoord één van de volgende vragen:<br /> #*Wat zegt de eerste onvolledigheidsstelling van Godel?<br /> #*In welke zin zijn observaties van oceaantemperatuur theoriegeladen?<br /> #*Bespreek de relatie tussen de keuze voor een bepaald soortconcept en het aantal soorten lemuren op Madagascar.<br /> #*Wat werd gezien als een belangrijke graadmeter van het succes van Mendelejev? Plaats hierbij kanttekeningen</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Wijsbegeerte&diff=1175 2018-06-16T12:51:03Z

<p>0653300: /* 13 juni 2018 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Sinds 2017 wordt dit vak gegeven door professor Jan Heylen.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===13 juni 2018===<br /> meerkeuze:<br /> #belgië speelt tegen duitsland, ze kunnen winnen of verliezen, dit laatste kunnen ze doen door gelijk te spelen of te verliezen. Wat is de kans dat ze winnen?<br /> #*1/2<br /> #*1/3<br /> #*1/2 of 1/3<br /> #*1/2 en 1/3<br /> #Wat was volgens Thales de oorzaak van aardbevingen<br /> #*een schip door de woeste zee<br /> #*het heel hard terecht komen van een drietand op de aarde<br /> #*het waaien van de wind door de bomen<br /> #*het open en toe gaan van een stoomklep<br /> #Stel jij bent de natuur, hoe zou Bacon iets over jou te weten willen komen?<br /> #*het 1 keer lief vragen<br /> #*het meerdere keren lief vragen<br /> #*je opsluiten in een kamer en het 1 keer vragen<br /> #*je opsluiten in een kamer en het meerdere keren vragen<br /> #De studenten die de les filosofie hebben gevolgd hebben last van een onvoelbaar, onruikbaar, onzichtbaar kriebelend beestje. Deze uitspraak is:<br /> #*verifieerbaar en falsifieerbaar<br /> #*verifieerbaar maar niet falsifieerbaar<br /> #*niet verifieerbaar wel faslifieerbaar<br /> #*niet verifieerbaar en neit falsifieerbaar<br /> #Er zijn 170 miljoen nederlanders waarvan 60 duizend groter zijn dan 2 meter. Wat is de kans (volgens 1 of ander model) dat een nederlands kind groter dan 2 meter is?<br /> #*1<br /> #*3/850<br /> #*0<br /> #*onbepaald<br /> #Hoe verwoorde Osiander het wereldbeeld van Kepler voor de kerk?<br /> #*instumenteel gebruikt<br /> #* nog 3 antwoorden maar het bovenste is het juiste ;)<br /> #Tot nu toe is altijd deductief waargenomen dat Natriumcarbonaat oplost. Waarom kunnen niet bewijzen dat natriumcarbonaat in 2100 ook zal oplossen?<br /> #*Er bestaan geen axioma's in de chemie<br /> #*nog een paar antwoorden, ik weet niet of het bovenste het juiste is<br /> <br /> Op elke vraag kon ook &quot;weet niet&quot; worden geantwoord!<br /> <br /> Open vragen:<br /> #modules, 1 van die vragen<br /> #Wat was volgens Popper het probleem met de uitspraak dat wetenschap werkte volgens inductie<br /> <br /> ===14 juni 2017===<br /> #leg uit hoe de opvattingen van Pythagoras en descartes hebben bijgedragen tot de huidige moderne natuurwetenschappen<br /> #Leg het Quine-Duhem probleem uit aan de hand van een casus (een experiment in Cern gaf aan dat deeltjes sneller bewogen als licht, dit zou niet kunnen volgens Einsteins hypothese, uiteindelijk leek de fout te liggen aan het verkeerd verbonden zijn een kabel). Hierbij moet je ook ad hoc hypothese uitleggen, want dit wijst op het feit dat ze de fout steken op de kabel om de hoofdhyptose af te schermen<br /> #Schijf van Pointcaré waarbij je dit moet reflecteren aan de Bayensiaanse confirmatietheorie; eigenlijk dus gewoon bayensiaanse confirmatietheorie uitleggen<br /> #Hume en het probleeem van symmetrie + oplossing; ook nog iets met regulatriteit en causale afhankelijkheid<br /> #leg uit: ceteris paribus wet + Ruse's 5 kenmerken van wetenschap<br /> #beantwoord één van de volgende vragen:<br /> #* -<br /> #* - <br /> #*Leg het biologisch soortenconcept uit en evalueer het kritisch<br /> #*Wat is het verschil tussen enerzijds elementen als ‘eenvoudige substanties’ en anderzijds'reele elementen’ of fundamentele substanties? Wat is de relatie met de periodieke tabel van Mendelejev?<br /> <br /> ===voorbeeldexamen 2017===<br /> #Leg uit: de mechanisering van het wereldbeeld ondersteunde de opgang van de experimentele methode.<br /> #Leg het Quine-Duhem probleem uit.<br /> #Wat is het nieuwe raadsel van Goodman en hoe verhoudt het zich tot Humes probleem van inductie?<br /> #Hoe lost Lewis’ theorie van causale afhankelijkheid het probleem van symmetrie op? Leg kort uit wat het probleem van symmetrie is en wat de theorie van Lewis inhoudt.<br /> #Beoordeel het volgende criterium: wetenschap is tentatief.<br /> #Beantwoord één van de volgende vragen:<br /> #*Wat zegt de eerste onvolledigheidsstelling van Godel?<br /> #*In welke zin zijn observaties van oceaantemperatuur theoriegeladen?<br /> #*Bespreek de relatie tussen de keuze voor een bepaald soortconcept en het aantal soorten lemuren op Madagascar.<br /> #*Wat werd gezien als een belangrijke graadmeter van het succes van Mendelejev? Plaats hierbij kanttekeningen</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Wijsbegeerte&diff=1174 2018-06-16T12:43:49Z

<p>0653300: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Sinds 2017 wordt dit vak gegeven door professor Jan Heylen.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===13 juni 2018===<br /> meerkeuze:<br /> #belgië speelt tegen duitsland, ze kunnen winnen of verliezen, dit laatste kunnen ze doen door gelijk te spelen of te verliezen. Wat is de kans dat ze winnen?<br /> #*1/2<br /> #*1/3<br /> #*1/2 of 1/3<br /> #*1/2 en 1/3<br /> #Wat was volgens Thales de oorzaak van aardbevingen<br /> #*een schip door de woeste zee<br /> #*het heel hard terecht komen van een drietand op de aarde<br /> #*het waaien van de wind door de bomen<br /> #*het open en toe gaan van een stoomklep<br /> #Stel jij bent de natuur, hoe zou Bacon iets over jou te weten willen komen?<br /> #*het 1 keer lief vragen<br /> #*het meerdere keren lief vragen<br /> #*je opsluiten in een kamer en het 1 keer vragen<br /> #*je opsluiten in een kamer en het meerdere keren vragen<br /> #De studenten die de les filosofie hebben gevolgd hebben last van een onvoelbaar, onruikbaar, onzichtbaar kriebelend beestje. Deze uitspraak is:<br /> #*verifieerbaar en falsifieerbaar<br /> #*verifieerbaar maar niet falsifieerbaar<br /> #*niet verifieerbaar wel faslifieerbaar<br /> #*niet verifieerbaar en neit falsifieerbaar<br /> #Er zijn 170 miljoen nederlanders waarvan 60 duizend groter zijn dan 2 meter. Wat is de kans (volgens 1 of ander model) dat een nederlands kind groter dan 2 meter is?<br /> #*1<br /> #*3/850<br /> #*0<br /> #*onbepaald<br /> <br /> Open vragen:<br /> #modules, 1 van die vragen<br /> #Wat was volgens Popper het probleem met de uitspraak dat wetenschap werkte volgens inductie<br /> <br /> ===14 juni 2017===<br /> #leg uit hoe de opvattingen van Pythagoras en descartes hebben bijgedragen tot de huidige moderne natuurwetenschappen<br /> #Leg het Quine-Duhem probleem uit aan de hand van een casus (een experiment in Cern gaf aan dat deeltjes sneller bewogen als licht, dit zou niet kunnen volgens Einsteins hypothese, uiteindelijk leek de fout te liggen aan het verkeerd verbonden zijn een kabel). Hierbij moet je ook ad hoc hypothese uitleggen, want dit wijst op het feit dat ze de fout steken op de kabel om de hoofdhyptose af te schermen<br /> #Schijf van Pointcaré waarbij je dit moet reflecteren aan de Bayensiaanse confirmatietheorie; eigenlijk dus gewoon bayensiaanse confirmatietheorie uitleggen<br /> #Hume en het probleeem van symmetrie + oplossing; ook nog iets met regulatriteit en causale afhankelijkheid<br /> #leg uit: ceteris paribus wet + Ruse's 5 kenmerken van wetenschap<br /> #beantwoord één van de volgende vragen:<br /> #* -<br /> #* - <br /> #*Leg het biologisch soortenconcept uit en evalueer het kritisch<br /> #*Wat is het verschil tussen enerzijds elementen als ‘eenvoudige substanties’ en anderzijds'reele elementen’ of fundamentele substanties? Wat is de relatie met de periodieke tabel van Mendelejev?<br /> <br /> ===voorbeeldexamen 2017===<br /> #Leg uit: de mechanisering van het wereldbeeld ondersteunde de opgang van de experimentele methode.<br /> #Leg het Quine-Duhem probleem uit.<br /> #Wat is het nieuwe raadsel van Goodman en hoe verhoudt het zich tot Humes probleem van inductie?<br /> #Hoe lost Lewis’ theorie van causale afhankelijkheid het probleem van symmetrie op? Leg kort uit wat het probleem van symmetrie is en wat de theorie van Lewis inhoudt.<br /> #Beoordeel het volgende criterium: wetenschap is tentatief.<br /> #Beantwoord één van de volgende vragen:<br /> #*Wat zegt de eerste onvolledigheidsstelling van Godel?<br /> #*In welke zin zijn observaties van oceaantemperatuur theoriegeladen?<br /> #*Bespreek de relatie tussen de keuze voor een bepaald soortconcept en het aantal soorten lemuren op Madagascar.<br /> #*Wat werd gezien als een belangrijke graadmeter van het succes van Mendelejev? Plaats hierbij kanttekeningen</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Marketing_Engeneering&diff=1173 2018-06-16T12:26:22Z

<p>0653300: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===16 juni 2018===<br /> #Perceptuele map met 1 voorkeursvector van sofie:<br /> #*Assen benoemen en uitleggen hoe je hier aan komt<br /> #*uitleggen wat het verband was tussen 2 vectoren die 180° op elkaar stonden<br /> #*welk product zou sofie kiezen en hoe je hier aan komt<br /> #*welk attribuut was het belangrijkste voor sofie en hoe je hier aan komt<br /> #*wat kan je doen om ervoor te zorgen da sofie we sprite kocht<br /> #conjoint analyse gegeven met een aantal attributen en niveaus, in een tabel waren de scores gegeven<br /> #*stel het ideale model op voor de consumenten en hoe je hier aan komt<br /> #*deze combinatie is niet realistisch, hoe zou je het realistisch doen als je er van uit gaat dat dit goede attributen en niveaus zijn<br /> #*kan je best een conjoint analyse doen of beter een oplijsting van attributen die dan op een schaal van 1 op 7 beoordeeld moeten worden op belangrijkheid<br /> #*wat zijn 2 nadelen van conjoint analyse<br /> #een logistische regressie met de output van stata<br /> #*leg uit welke invloed prijs en prijs*inkomen heeft, kijk niet naar de grootte van de coëfficient maar enkel naar het teken<br /> #*stel de winkel heeft informatie of een merk jouw favoriet is of niet (met output 1 als het je favoriet is, 0 als het dat niet is). Welke variabele(n) moet je toevoegen om te kijken of de korting aanslaat bij mensen waarvan het product favoriet is (of ze korting gebruiken of niet is al een bestaande variabele)<br /> #*output gegeven van een voorspellingstabel (hoevel mensen zijn positief ingeschat en kopen het daadwerkelijk of net niet, en zijn negatief ingeschat en kopen het ook niet of net wel), zeggen of dit een goed model was en 3 redenen geven waarom<br /> <br /> ===17 juni 2017===<br /> #een oefening van logistische regressie<br /> #Een oefening met de Huff coëfficiënt en een paar theorie vragen over winkellocatie<br /> #Een perceptuele map en toegepaste vragen daarover</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Analytische_Biochemie&diff=1064 2018-01-26T15:41:44Z

<p>0653300: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===25 januari 2018===<br /> ====Mondeling====<br /> #Een nieuw gesneesmiddel is gevonden, dit werkt in op een eiwit, je wil testen op welk eiwit dit inspeelt. Stel dat de binding tussen eiwit en molecule stabiel is (dus komt niet los tijdens de experimenten). Hoe ga je dit eiwit vinden en hoe kan je vinden welk eiwit dit is? Schrijf uit welke stappen je onderneemt.<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> #Eeen peptide werd onderzocht met massaspectrometrie. MALDI-TOF leverde twee signalen (zie figuur A). De waargenomen ionen zijn ontstaan ten gevolge van protenering (in verschillende graad) van het peptide. Na trypsine behandeling ontstonden 2 fragmenten. Met [M+H]+ moleculion van één van deze twee fragmenten is gekenmerkt door m/z-waarde van 611 (zie figuur B). MS/MS van deze component leverde 4 Y+ c-terminale dochterionen (zie figuur C)<br /> #*Leid de Mr-waarde af van het peptide. Geef de waarde bekomen voor iedere piek en de gemiddelde waarde (5 significantie cijfers).<br /> #*Bepaal de Mr-waarde voor de 2 trypsine-fragmenten en vergelijk de som van deze waarden met de Mr-waarde van het intacte polypeptide. Hoe is het verschil in massa te verklaren?<br /> #*Leid de aminozuursequentie van de '611' component wetende dat de aangegeven ionen, die onstaant bij MS/MS, Y+ splitsingsproducten zijn (zie figuur). Gebruik voor identificatie van de aminozuurresidu's de molmassa's zijn gegeven. Komt dit fragment aan de N- of C-terminaal? <br /> <br /> ===25 januari 2018===<br /> ====Mondeling====<br /> #Een team van chemici heeft een organisch geneesmiddel gemaakt en ingebracht in een proefdier. Hoe ga je te werk om te achterhalen in welke vormen (moleculaire structuren) het geneesmiddel voorkomt? Bespreek de techniek(en) die je gebruikt en maak er een schema van.<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> #Een IEF curve van 2 peptiden zijn gegeven en de 1letter codes van de peptiden (SCHEPEN en PRACHT). Bepaal welke curve bij welk peptide hoort. (Een tabel met alle pKa's zijn gegeven).<br /> #De peptiden worden onderworpen aan een anionenwisselaar die geijkt is met een buffer met pH 7.5. Wat zijn de bindings- en elutiecondities en maak een schematische voorstelling van het chromatogram.<br /> #De buffer is een Na-fosfaatbuffer (pKa'=6.7) met pH7.5 en I=0.1mol/dm^3. Er wordt Na2HPO4*7H2O (Mr=268) en NaH2PO4*2H2O (Mr=156) gebruikt. We willen 1L buffer maken. Laat je denkwijze zien en voer alle berekeningen uit.<br /> <br /> ===24 januari 2018===<br /> <br /> ====mondeling====<br /> #Een collega heeft een eiwitopzuivering uitgevoerd in het labo en wilt dit verder experimenteel gebruiken, je bent echter niet zeker van de zuiverheid van het staal. Hoe ga je te werk om deze zuiverheid te controleren? Hoe ga je te werk als je zeer grote zekerheid wilt over de zuiverheid? Bespreek hoe je te werk gaat, teken de meetopstelling(en) en benoem de onderdelen, en leg uit.<br /> #Stel dat het eiwit uit meerdere peptideketens bestaat, hoe beïnvloed dit het resultaat bekomen uit voorgaande methode vergeleken met als het slechts uit één peptideketen bestaat?<br /> #Je beslist om een preparatieve scheiding uit te voeren van het eiwit op basis van IEP, leg uit welke methode je kiest, hoe deze werkt, en teken de opstelling en benoem alle onderdelen. (hierbij bijvragen over resolutie en theoretische platen: van deemter vergelijking uitleggen en grafieken kunnen maken)<br /> <br /> ====oefeningen====<br /> #Je wilt een ATP oplossing maken met radioactief gelabelde P, gegeven info over gewenste oplossing, de scintillatieteller, de hot stock, de cold stock, en Mr van ATP. Maak deze oplossing (dus letterlijk zoals in de oefenzitting)<br /> #Van de gemaakte oplossing gebruik je 25ml direct, en 25ml pas 7 dagen later. Halfwaardetijd van 32P is 14.3 dagen. Hoe radioactief is de gemaakte oplossing nog na deze 7 dagen?<br /> #Als buffer hierbij gebruiken we een natriumacetaat buffer. We wensen 100ml met een ionische sterkte van 0.1M. Verder nog info over Mr en dichtheid van HOAc gegeven. Bereid deze buffer.<br /> <br /> ===5 september 2017===<br /> <br /> ====mondeling====<br /> #Hoe kan je uitzoeken waar en in welke moleculaire vorm een geneesmiddel, toegediend aan een proefdier, aanwezig is. (verschillende technieken zijn nodig: radiolabeling, HPLC en massaspectometrie (zie &amp;quot;toepassing&amp;quot; bij slide analyse van biomoleculen))<br /> <br /> ====schriftelijk====<br /> #capillaire elektroforese uitleggen + theoretische platen + goede preparatieve methode? + verschil met klassieke gel elektroforese<br /> #begrippen: PET, absorptiespectrum, scintillatieteller <br /> <br /> ====oefeningen====<br /> #8 proteïnen in een mengsel scheiden met gegeven technieken <br /> #hoe zie je dat eiwitopzuivering gelukt is<br /> #oef met wet van lambert-beer<br /> <br /> ===27 januari 2017 VM===<br /> ====mondeling====<br /> #ELISE je hebt zika antigenen, deze kan je ook modificeren (fuseren met eiwit enzo)<br /> #leg uit hoe je een test maakt tegen zika virus; hoe werkt je test; hoe wordt meetsignaal opgewekt; detectie + tekening<br /> <br /> ====schriftelijk====<br /> #eiwitten uit cel + eiwit X gebonden aan Hist-tag<br /> #* leg uit hoe je deze tag kan gebruiken om eiwit X te zuiveren<br /> #*wat als eiwit X complexen vormt met andere eiwitten en na de opzuivering (vorige vraag) de eiwitten nog steeds complexen vormen, hoe zou je dan de identiteit van de gebonden eiwitten achterhalen? Schets opstelling + leg onderdelen uit<br /> #begrippen<br /> #*vlam ionisatie detectie<br /> #*isocratische elutie<br /> #*brekingsindex detector<br /> <br /> ====oefeningen====<br /> #biureet tabel aanvullen<br /> #absorptie oefening (bepaal c) met l=1cm, A=0.2, E=10.0dl/gcm<br /> #standaardcurve en dan C bepalen van de onbekende eiwit<br /> #*Na-fosfaatbuffer met pKa=6.9, pH=7.5, I=0.1mol dm^-3<br /> #*Na2HPO4.7H20 met Mr=268.00 en NaH2PO4.2H20 met Mr=156.00<br /> #* hoe maak ik een 1l buffer?<br /> <br /> === 26 januari 2017===<br /> ====mondeling====<br /> #nagaan of er contaminatie is in een eiwitopzuivering van een collega (methode a), hoe kan je dit extra controleren? wat is het effect op de methode a als je proteïne complex uit meerder eenheden bestaat?<br /> #voeg zelf een een nieuwe preparatieve eiwitzuivering uit op basis van iso-elektrisch punt.<br /> <br /> ====schriftelijk====<br /> #absorbantie uitleggen en een tekening + uitleg geven van apparaat dat dit kan meten. <br /> #3 begrippen<br /> ##activiteitscoëfficiënt<br /> ##quadrupole mass analyzer<br /> ##...<br /> ====oefening====<br /> #massa spectrometrie (bereken de molaire massa's, geef aminozuur volgorde, n-/c-terminus,...)<br /> <br /> ===25/01/2017 nm===<br /> ====Mondeling:====<br /> - 3 manieren uitleggen om Mr van eiwit te bepalen (+ tekeningen)<br /> ====Schriftelijk: ====<br /> - grafiek gegeven, hierover vanalles van de van deemter vergelijking uitleggen + een (chromatografische) techniek tekenen en uitleggen waarbij van deemter toepasbaar is<br /> - begrippen: osmotische shock, fotonverminigvuldiger, ionische sterkte<br /> ====Oefening:====<br /> - radioactieve oplossing maken<br /> - radioactief verval berekenen <br /> - borax buffer maken<br /> <br /> ===22 augustus NM===<br /> ====Mondeling====<br /> #je wilt een eiwit opzuiveren uit een cellysaat en je doet dit met Western blotting. <br /> ##leg uit hoe western blotting werkt <br /> ##hoe kan je de aanwezigheid aantonen en hoe meet je dit? <br /> ##hoe zorg je voor een goede controle voor je kan aantonen dat dit kwantitatief een goede techniek is? <br /> ##je wilt enkel de eiwitten uit 1 specifiek celorganel (bv mitochondriën), hoe ga je hiervoor te werk?<br /> ====Schriftelijk====<br /> #grafiek van theoretische plaathoogte met 3 verschillende korrelgroottes (stationaire fase): uitleggen + waarbij gebruikt + teken een voorbeeld waarbij dit van toepassing is.<br /> #retentietijd bij chromatografie, radiografie, potentiometrie<br /> ====oefening====<br /> #op strategie: 6 proteïnen opzuiveren. Daarna ook nog absorbantie berekenen.<br /> <br /> ===16 augustus 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Cocaïne werd opgespoord door de politie via een colorimetrische test, waarom is dit een goede methode? (How a $2 Roadside Drug Test Sends InnocentPeople to Jail) <br /> #Hoe ga je te werk om cocaïne aan te tonen in een complex mengsel? (stel je hebt alle apparatuur beschikbaar) + Structuur van cocaïne is gegeven!<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #Geef 3 technieken om de Mr van proteïnen te bepalen. (geen quaternaire structuur)<br /> #Leg volgende begrippen uit: standaard additie, de wet van Lambert-Beer, nauwkeurigheid vs precisie<br /> #Oefening: 4 proteïnen in 2D gel-elekroforese<br /> ##Wat kan je zeggen over de proteïnen op basis van deze gegevens? Hoe zouden deze elueren bij SEC + tekening? <br /> ##Hoe zouden deze elueren bij IEC + tekening, en hoe zou je te werk gaan?<br /> <br /> ====Oefening ====<br /> #over buffer maken<br /> <br /> ===29 januari 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Maak een ELISA test om antilichamen tegen een virus op te sporen in een bloedstaal. Je krijgt antigenen tegen dit antilichaam, en je hebt ook de mogelijkheid om aan deze antigenen een proteïne te fuseren. Een eigenschap van het antilichaam is dat het 5 antigenen kan binden. Hoe werkt je test? Hoe wek je de detectie van de antilichamen op?<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #ICP-AES: waarvoor staat de afkorting? Schets opstelling en leg werking uit. Als er andere elementen aanwezig zijn dan het element dat je wil detecteren, is dit dan een probleem? Standaardadditie uitleggen en uitleggen hoe je hiermee een meettoestel kan ijken.<br /> #Begrippen: <br /> ##Theoretische plaat<br /> ##Referentie-elektrode<br /> ##Positron Emissie Tomografie<br /> ====Oefening====<br /> #3 proteïnen zijn gegeven<br /> #uitleg geven over IEC-kationenwisselaar en SEC<br /> #Chromatogram van kationenwisselaar geven<br /> #chromatogram van SEC geven,...<br /> <br /> ===28 januari 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Hoe kan je uitzoeken waar en in welke moleculaire vorm een geneesmiddel, toegediend aan een proefdier, aanwezig is. (verschillende technieken zijn nodig: radiolabeling, HPLC en massaspectometrie (zie &amp;quot;toepassing&amp;quot; bij slide analyse van biomoleculen))<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #hoe werkt de pH-elektrode en leg uit. Wat moet je hieraan veranderen om deze werkzaam te maken voor stof X en wat moeten we aannemen over deze stof. Als stof X de lading n+ heeft wat is dan de relatie tussen de concentratie van stof X en het potentiaalverschil.<br /> #Begrippen<br /> ##relatieve centrifugaalkracht<br /> ##osmotische shock<br /> ##activatiecoëfficiënt<br /> ====Oefening====<br /> #concentratie van eiwit berekenen uit absorptievergelijking<br /> #tabel over biureet assay aanvullen<br /> #curve opstellen waaruit je de concentratie van een onbekend eiwit kunt halen als je weet dat A= 0.44<br /> #Na-acetaat-azijnzuur buffer maken<br /> <br /> ===22 januari 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Stel zelf een massaspectrometer samen om eiwitten te identificeren. Alle onderdelen uitleggen en analysestappen uitleggen hoe je een eiwit gaat identificeren. (eigenlijk heel het hoofdstuk van massaspectrometrie)<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #Hoeveelheid metaalionen bepalen via Coulometrie, Potentiometrie en Voltammetrie + verschil uitleggen<br /> #Begrippen:<br /> ##Positieve en negatieve controle<br /> ##Holle kathode lamp<br /> ##surface plasmon resonance<br /> ====Oefening====<br /> #radioactieve oplossing maken<br /> #radioactief verval<br /> #na-acetaat-azijnzuur buffer maken<br /> <br /> ===21 januari 2016 namiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Geef 2 manieren om een eiwit op te zuiveren (je moet nagaan bij je collega of er geen contaminaties zijn van andere eiwitten). 1 manier moet heel simpel zijn en de andere wat nauwkeuriger en complex. Leg ook uit hoe IEF werkt.<br /> ====Schriftelijk====<br /> #een grafiek van theoretische plaathoogte; uitleggen en formules geven.<br /> <br /> ====schriftelijk====<br /> #definities<br /> ##extinctiecoëfficiënt<br /> ##osmotische shock<br /> ##retentietijd bij chromatografie<br /> <br /> ====oefening====<br /> #massaspectrometrie: Mr waarden zoeken (individuele pieken + gemiddelde) en dan nog eens bij de dochterionen en het bijhorende eiwit eruit halen. (mbv de 3 letterige afkortingen van de aminozuren, je krijgt enkel alfabetische letters gegeven en de massa van de aminozuren (zonder water)).<br /> <br /> ===20 januari 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Geef minstens 3 technieken om Mr van een eiwit te bepalen. Leg uit en maak een schets.<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #vraag over redoxreactie met stof A, en spectroscopie. <br /> #Hoe je potentiaal kon vinden (Wet van Nernst). <br /> #Hoe concentratie berekenen (stelsel oplossen). <br /> #Schets van opstelling die dit kan meten.<br /> #begrippen uitleggen in voorziene ruimte: <br /> ##surface plasmon resonance<br /> ##target vinden met affiniteits chromatografie en interne/externe standaard.<br /> <br /> ====Oefening====<br /> 2 proteïne zijn gegeven (DENK en SCHRYF) en een gel van IEF (4 en 8.9 waren pI ongeveer). Welk proteïne is welke curve en waarom? (Tabel met pka's is gegeven met lettercode en afkorting van aminozuren.) Je wilt die proteïnen scheiden met anionenwisselaar bij pH 7,5. Teken bijhorende chromatogram en condities. Je wilt dit doen met 1L Na-fosfaatbuffer van pH 7,5 met pKa=6.9 en I=0,3 mol/dm. Hoe maak je deze beginnend met Na2HPO4.7H2O (Mr=...) en NaH2PO4.2H2O (Mr=...)?<br /> <br /> OPGELET: dit vak is volledig aangepast sinds academiejaar 2015-2016!</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Analytische_Biochemie&diff=1063 2018-01-26T15:40:40Z

<p>0653300: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===25 januari 2018===<br /> ====Mondeling====<br /> #Een nieuw gesneesmiddel is gevonden, dit werkt in op een eiwit, je wil testen op welk eiwit dit inspeelt. Stel dat de binding tussen eiwit en molecule stabiel is (dus komt niet los tijdens de experimenten). Hoe ga je dit eiwit vinden en hoe kan je vinden welk eiwit dit is? Schrijf uit welke stappen je onderneemt.<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> #Eeen peptide werd onderzocht met massaspectrometrie. MALDI-TOF leverde twee signalen (zie figuur A). De waargenomen ionen zijn ontstaan ten gevolge van protenering (in verschillende graad) van het peptide. Na trypsine behandeling ontstonden 2 fragmenten. Met [M+H]+ moleculion van één van deze twee fragmenten is gekenmerkt door m/z-waarde van 611 (zie figuur B). MS/MS van deze component leverde 4 Y+ c-terminale dochterionen (zie figuur C)<br /> a) Leid de Mr-waarde af van het peptide. Geef de waarde bekomen voor iedere piek en de gemiddelde waarde (5 significantie cijfers).<br /> b) Bepaal de Mr-waarde voor de 2 trypsine-fragmenten en vergelijk de som van deze waarden met de Mr-waarde van het intacte polypeptide. Hoe is het verschil in massa te verklaren?<br /> c) Leid de aminozuursequentie van de '611' component wetende dat de aangegeven ionen, die onstaant bij MS/MS, Y+ splitsingsproducten zijn (zie figuur). Gebruik voor identificatie van de aminozuurresidu's de molmassa's zijn gegeven. Komt dit fragment aan de N- of C-terminaal? <br /> <br /> ===25 januari 2018===<br /> ====Mondeling====<br /> #Een team van chemici heeft een organisch geneesmiddel gemaakt en ingebracht in een proefdier. Hoe ga je te werk om te achterhalen in welke vormen (moleculaire structuren) het geneesmiddel voorkomt? Bespreek de techniek(en) die je gebruikt en maak er een schema van.<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> #Een IEF curve van 2 peptiden zijn gegeven en de 1letter codes van de peptiden (SCHEPEN en PRACHT). Bepaal welke curve bij welk peptide hoort. (Een tabel met alle pKa's zijn gegeven).<br /> #De peptiden worden onderworpen aan een anionenwisselaar die geijkt is met een buffer met pH 7.5. Wat zijn de bindings- en elutiecondities en maak een schematische voorstelling van het chromatogram.<br /> #De buffer is een Na-fosfaatbuffer (pKa'=6.7) met pH7.5 en I=0.1mol/dm^3. Er wordt Na2HPO4*7H2O (Mr=268) en NaH2PO4*2H2O (Mr=156) gebruikt. We willen 1L buffer maken. Laat je denkwijze zien en voer alle berekeningen uit.<br /> <br /> ===24 januari 2018===<br /> <br /> ====mondeling====<br /> #Een collega heeft een eiwitopzuivering uitgevoerd in het labo en wilt dit verder experimenteel gebruiken, je bent echter niet zeker van de zuiverheid van het staal. Hoe ga je te werk om deze zuiverheid te controleren? Hoe ga je te werk als je zeer grote zekerheid wilt over de zuiverheid? Bespreek hoe je te werk gaat, teken de meetopstelling(en) en benoem de onderdelen, en leg uit.<br /> #Stel dat het eiwit uit meerdere peptideketens bestaat, hoe beïnvloed dit het resultaat bekomen uit voorgaande methode vergeleken met als het slechts uit één peptideketen bestaat?<br /> #Je beslist om een preparatieve scheiding uit te voeren van het eiwit op basis van IEP, leg uit welke methode je kiest, hoe deze werkt, en teken de opstelling en benoem alle onderdelen. (hierbij bijvragen over resolutie en theoretische platen: van deemter vergelijking uitleggen en grafieken kunnen maken)<br /> <br /> ====oefeningen====<br /> #Je wilt een ATP oplossing maken met radioactief gelabelde P, gegeven info over gewenste oplossing, de scintillatieteller, de hot stock, de cold stock, en Mr van ATP. Maak deze oplossing (dus letterlijk zoals in de oefenzitting)<br /> #Van de gemaakte oplossing gebruik je 25ml direct, en 25ml pas 7 dagen later. Halfwaardetijd van 32P is 14.3 dagen. Hoe radioactief is de gemaakte oplossing nog na deze 7 dagen?<br /> #Als buffer hierbij gebruiken we een natriumacetaat buffer. We wensen 100ml met een ionische sterkte van 0.1M. Verder nog info over Mr en dichtheid van HOAc gegeven. Bereid deze buffer.<br /> <br /> ===5 september 2017===<br /> <br /> ====mondeling====<br /> #Hoe kan je uitzoeken waar en in welke moleculaire vorm een geneesmiddel, toegediend aan een proefdier, aanwezig is. (verschillende technieken zijn nodig: radiolabeling, HPLC en massaspectometrie (zie &amp;quot;toepassing&amp;quot; bij slide analyse van biomoleculen))<br /> <br /> ====schriftelijk====<br /> #capillaire elektroforese uitleggen + theoretische platen + goede preparatieve methode? + verschil met klassieke gel elektroforese<br /> #begrippen: PET, absorptiespectrum, scintillatieteller <br /> <br /> ====oefeningen====<br /> #8 proteïnen in een mengsel scheiden met gegeven technieken <br /> #hoe zie je dat eiwitopzuivering gelukt is<br /> #oef met wet van lambert-beer<br /> <br /> ===27 januari 2017 VM===<br /> ====mondeling====<br /> #ELISE je hebt zika antigenen, deze kan je ook modificeren (fuseren met eiwit enzo)<br /> #leg uit hoe je een test maakt tegen zika virus; hoe werkt je test; hoe wordt meetsignaal opgewekt; detectie + tekening<br /> <br /> ====schriftelijk====<br /> #eiwitten uit cel + eiwit X gebonden aan Hist-tag<br /> #* leg uit hoe je deze tag kan gebruiken om eiwit X te zuiveren<br /> #*wat als eiwit X complexen vormt met andere eiwitten en na de opzuivering (vorige vraag) de eiwitten nog steeds complexen vormen, hoe zou je dan de identiteit van de gebonden eiwitten achterhalen? Schets opstelling + leg onderdelen uit<br /> #begrippen<br /> #*vlam ionisatie detectie<br /> #*isocratische elutie<br /> #*brekingsindex detector<br /> <br /> ====oefeningen====<br /> #biureet tabel aanvullen<br /> #absorptie oefening (bepaal c) met l=1cm, A=0.2, E=10.0dl/gcm<br /> #standaardcurve en dan C bepalen van de onbekende eiwit<br /> #*Na-fosfaatbuffer met pKa=6.9, pH=7.5, I=0.1mol dm^-3<br /> #*Na2HPO4.7H20 met Mr=268.00 en NaH2PO4.2H20 met Mr=156.00<br /> #* hoe maak ik een 1l buffer?<br /> <br /> === 26 januari 2017===<br /> ====mondeling====<br /> #nagaan of er contaminatie is in een eiwitopzuivering van een collega (methode a), hoe kan je dit extra controleren? wat is het effect op de methode a als je proteïne complex uit meerder eenheden bestaat?<br /> #voeg zelf een een nieuwe preparatieve eiwitzuivering uit op basis van iso-elektrisch punt.<br /> <br /> ====schriftelijk====<br /> #absorbantie uitleggen en een tekening + uitleg geven van apparaat dat dit kan meten. <br /> #3 begrippen<br /> ##activiteitscoëfficiënt<br /> ##quadrupole mass analyzer<br /> ##...<br /> ====oefening====<br /> #massa spectrometrie (bereken de molaire massa's, geef aminozuur volgorde, n-/c-terminus,...)<br /> <br /> ===25/01/2017 nm===<br /> ====Mondeling:====<br /> - 3 manieren uitleggen om Mr van eiwit te bepalen (+ tekeningen)<br /> ====Schriftelijk: ====<br /> - grafiek gegeven, hierover vanalles van de van deemter vergelijking uitleggen + een (chromatografische) techniek tekenen en uitleggen waarbij van deemter toepasbaar is<br /> - begrippen: osmotische shock, fotonverminigvuldiger, ionische sterkte<br /> ====Oefening:====<br /> - radioactieve oplossing maken<br /> - radioactief verval berekenen <br /> - borax buffer maken<br /> <br /> ===22 augustus NM===<br /> ====Mondeling====<br /> #je wilt een eiwit opzuiveren uit een cellysaat en je doet dit met Western blotting. <br /> ##leg uit hoe western blotting werkt <br /> ##hoe kan je de aanwezigheid aantonen en hoe meet je dit? <br /> ##hoe zorg je voor een goede controle voor je kan aantonen dat dit kwantitatief een goede techniek is? <br /> ##je wilt enkel de eiwitten uit 1 specifiek celorganel (bv mitochondriën), hoe ga je hiervoor te werk?<br /> ====Schriftelijk====<br /> #grafiek van theoretische plaathoogte met 3 verschillende korrelgroottes (stationaire fase): uitleggen + waarbij gebruikt + teken een voorbeeld waarbij dit van toepassing is.<br /> #retentietijd bij chromatografie, radiografie, potentiometrie<br /> ====oefening====<br /> #op strategie: 6 proteïnen opzuiveren. Daarna ook nog absorbantie berekenen.<br /> <br /> ===16 augustus 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Cocaïne werd opgespoord door de politie via een colorimetrische test, waarom is dit een goede methode? (How a $2 Roadside Drug Test Sends InnocentPeople to Jail) <br /> #Hoe ga je te werk om cocaïne aan te tonen in een complex mengsel? (stel je hebt alle apparatuur beschikbaar) + Structuur van cocaïne is gegeven!<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #Geef 3 technieken om de Mr van proteïnen te bepalen. (geen quaternaire structuur)<br /> #Leg volgende begrippen uit: standaard additie, de wet van Lambert-Beer, nauwkeurigheid vs precisie<br /> #Oefening: 4 proteïnen in 2D gel-elekroforese<br /> ##Wat kan je zeggen over de proteïnen op basis van deze gegevens? Hoe zouden deze elueren bij SEC + tekening? <br /> ##Hoe zouden deze elueren bij IEC + tekening, en hoe zou je te werk gaan?<br /> <br /> ====Oefening ====<br /> #over buffer maken<br /> <br /> ===29 januari 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Maak een ELISA test om antilichamen tegen een virus op te sporen in een bloedstaal. Je krijgt antigenen tegen dit antilichaam, en je hebt ook de mogelijkheid om aan deze antigenen een proteïne te fuseren. Een eigenschap van het antilichaam is dat het 5 antigenen kan binden. Hoe werkt je test? Hoe wek je de detectie van de antilichamen op?<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #ICP-AES: waarvoor staat de afkorting? Schets opstelling en leg werking uit. Als er andere elementen aanwezig zijn dan het element dat je wil detecteren, is dit dan een probleem? Standaardadditie uitleggen en uitleggen hoe je hiermee een meettoestel kan ijken.<br /> #Begrippen: <br /> ##Theoretische plaat<br /> ##Referentie-elektrode<br /> ##Positron Emissie Tomografie<br /> ====Oefening====<br /> #3 proteïnen zijn gegeven<br /> #uitleg geven over IEC-kationenwisselaar en SEC<br /> #Chromatogram van kationenwisselaar geven<br /> #chromatogram van SEC geven,...<br /> <br /> ===28 januari 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Hoe kan je uitzoeken waar en in welke moleculaire vorm een geneesmiddel, toegediend aan een proefdier, aanwezig is. (verschillende technieken zijn nodig: radiolabeling, HPLC en massaspectometrie (zie &amp;quot;toepassing&amp;quot; bij slide analyse van biomoleculen))<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #hoe werkt de pH-elektrode en leg uit. Wat moet je hieraan veranderen om deze werkzaam te maken voor stof X en wat moeten we aannemen over deze stof. Als stof X de lading n+ heeft wat is dan de relatie tussen de concentratie van stof X en het potentiaalverschil.<br /> #Begrippen<br /> ##relatieve centrifugaalkracht<br /> ##osmotische shock<br /> ##activatiecoëfficiënt<br /> ====Oefening====<br /> #concentratie van eiwit berekenen uit absorptievergelijking<br /> #tabel over biureet assay aanvullen<br /> #curve opstellen waaruit je de concentratie van een onbekend eiwit kunt halen als je weet dat A= 0.44<br /> #Na-acetaat-azijnzuur buffer maken<br /> <br /> ===22 januari 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Stel zelf een massaspectrometer samen om eiwitten te identificeren. Alle onderdelen uitleggen en analysestappen uitleggen hoe je een eiwit gaat identificeren. (eigenlijk heel het hoofdstuk van massaspectrometrie)<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #Hoeveelheid metaalionen bepalen via Coulometrie, Potentiometrie en Voltammetrie + verschil uitleggen<br /> #Begrippen:<br /> ##Positieve en negatieve controle<br /> ##Holle kathode lamp<br /> ##surface plasmon resonance<br /> ====Oefening====<br /> #radioactieve oplossing maken<br /> #radioactief verval<br /> #na-acetaat-azijnzuur buffer maken<br /> <br /> ===21 januari 2016 namiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Geef 2 manieren om een eiwit op te zuiveren (je moet nagaan bij je collega of er geen contaminaties zijn van andere eiwitten). 1 manier moet heel simpel zijn en de andere wat nauwkeuriger en complex. Leg ook uit hoe IEF werkt.<br /> ====Schriftelijk====<br /> #een grafiek van theoretische plaathoogte; uitleggen en formules geven.<br /> <br /> ====schriftelijk====<br /> #definities<br /> ##extinctiecoëfficiënt<br /> ##osmotische shock<br /> ##retentietijd bij chromatografie<br /> <br /> ====oefening====<br /> #massaspectrometrie: Mr waarden zoeken (individuele pieken + gemiddelde) en dan nog eens bij de dochterionen en het bijhorende eiwit eruit halen. (mbv de 3 letterige afkortingen van de aminozuren, je krijgt enkel alfabetische letters gegeven en de massa van de aminozuren (zonder water)).<br /> <br /> ===20 januari 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Geef minstens 3 technieken om Mr van een eiwit te bepalen. Leg uit en maak een schets.<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #vraag over redoxreactie met stof A, en spectroscopie. <br /> #Hoe je potentiaal kon vinden (Wet van Nernst). <br /> #Hoe concentratie berekenen (stelsel oplossen). <br /> #Schets van opstelling die dit kan meten.<br /> #begrippen uitleggen in voorziene ruimte: <br /> ##surface plasmon resonance<br /> ##target vinden met affiniteits chromatografie en interne/externe standaard.<br /> <br /> ====Oefening====<br /> 2 proteïne zijn gegeven (DENK en SCHRYF) en een gel van IEF (4 en 8.9 waren pI ongeveer). Welk proteïne is welke curve en waarom? (Tabel met pka's is gegeven met lettercode en afkorting van aminozuren.) Je wilt die proteïnen scheiden met anionenwisselaar bij pH 7,5. Teken bijhorende chromatogram en condities. Je wilt dit doen met 1L Na-fosfaatbuffer van pH 7,5 met pKa=6.9 en I=0,3 mol/dm. Hoe maak je deze beginnend met Na2HPO4.7H2O (Mr=...) en NaH2PO4.2H2O (Mr=...)?<br /> <br /> OPGELET: dit vak is volledig aangepast sinds academiejaar 2015-2016!</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Moleculaire_Biologie&diff=956 2018-01-22T13:40:09Z

<p>0653300: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak gedoceerd door Prof. J.Robben sinds september 2009, vroeger gedoceerd door Prof. M. De Ley. Mondeling examen. Sinds 2013 3 grote vragen en de vierde vraag is kort enkele woordjes of een tekening bespreken.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===22 januari 2018 VM===<br /> #Wat zijn histonen? Hoe zijn ze betrokken in de genexpressie? Bespreek het moleculaire niveau.<br /> #Structuur en functie van catabolic activatior protein (cap)<br /> #Waaorom past immunoglobine bij het hoofdstuk over transpositie?<br /> #Begrippen: mRNA cap, tekening van backtracking, oriC, sanger-methode<br /> <br /> ===18 januari 2018 NM===<br /> #Met welke methode kun je op experimentele wijze de relatieve hoeveelheid van mRNA aantonen? <br /> #Wat is alternative splicing? Wat is de functie voor de cel? Geef een concreet voorbeeld.<br /> #Geef het mechanisme van translatie elongatie bij prokaryoten.<br /> #Begrippen: Lacoperon met 3operatoren en CAPsite, Leu-zipper, peptidyltransfer en retrotransposon<br /> <br /> ===15 januari 2018 NM===<br /> #Geef de verschillen bij transcriptie initiatie tussen prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Geef de verschillende mogelijkheden voor transcriptie terminatie bij prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Wat is de functie van RuvC bij de Holliday Junction? Maak een schets en beschrijf het mechanisme.<br /> #Begrippen: Sanger Sequencing, Zn-vingers, U2 (SNRNP), stopcoconsupressie. <br /> <br /> ===15 januari 2018 VM===<br /> #Wat is alternatieve splicing? Hoe werkt het en wat is de functie ervan. Geef een concreet voorbeeld. (Mondeling)<br /> #Leg op moleculair niveau translatie-elongatie cyclus uit bij prokaryoten. (Schriftelijk)<br /> #Welke transposons komen voor bij zoogdieren. Leg bondig uit hoe die eruit zien. Hoe frequent komt dit voor bij mensen?(Schriftelijk)<br /> #Begrippen: DNA-footprinting, figuur zink vinger, polysoom, Holliday junctie (Mondeling)<br /> <br /> ===6 september 2017 NM===<br /> #Bespreek de effecten van arabinose en glucose op de expressie van het ara-operon. Verduidelijk de onderliggende mechanismen.<br /> #Bespreek de opvouwing van nucleair DNA bij eukaryoten en bespreek de effecten op de genexpressie. <br /> #Het Ds en Ac mechanisme bij maïs uitleggen. Waarom was deze wetenschappelijke ontdekking zo belangrijk?<br /> #Begrippen: figuur Zn-vinger, polysoom, Shine-Dalgarno box, klem lader (clamp loader)<br /> <br /> ===28 augustus 2017 VM===<br /> #Structuur, biosynthese en functie van cap bij mRNA van eukaroyten. Hoe zit het bij 5'-uiteinde van prokaroyten?<br /> #Welke methode(n) worden gebruikt voor het bepalen van de relatieve hoeveelheid van specifiek mRNA? Leg de werkwijzen uit.<br /> #Wat is homologe recombinatie? Welke moleculaire processen vinden plaats en welke eiwitten zijn betrokken?<br /> #Begrippen: Leu-zipper, nucleosoom, startcodon met kozak sequentie, dubbelstrengbreuk<br /> <br /> <br /> ===30 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek alternatieve splicing. Hoe werkt het en geef een concreet voorbeeld.<br /> #Tabel van codons. Leg uit: dit wijzigt nooit maar toch is er sprake van evolutie. <br /> #Het Ds en Ac mechanisme bij maïs uitleggen. Waarom was deze wetenschappelijke ontdekking zo belangrijk?<br /> #Begrippen: DNA footprint, resolvase, Zink finger (op de tekening staan 3 zink fingers), polysoom<br /> <br /> <br /> ===23 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek aan de hand van een figuur het trombonemodel van DNA-replicatie. Welke moleculaire structuren en processen van de DNA-replicatie komen in dit model naar voor.<br /> #Bespreek de structuur, functie en regulatie van de prokaryote sigma-factor(en).<br /> #Op welke experimentele manier kun je de transcriptiestart met een gegeven promotor bepalen. <br /> #Begrippen:<br /> #*enhancer<br /> #*cDNA kloning<br /> #*figuur van heatshock gen<br /> #*RecBCD-reactieweg<br /> <br /> ===20 januari 2017===<br /> #transcriptie terminatie bij pro en eukaryoten uitleggen<br /> #bespreek mRNA Cap-structuur bij eukaryoten (biosynthese, structuur, functie) en vergelijk met prokaryoten<br /> #welke moleculaire processen helpen bij de start van translatie bij eukaryoten. (start van matuur mRNA)<br /> #begrippen<br /> #*enhancer<br /> #*yeast two hybrid method<br /> #*tRNA mimicry<br /> #*herschikking van immunoglobinegenen<br /> <br /> === 19 januari 2017 NM===<br /> #Hoe wordt het ara operon gereguleerd?<br /> #Hoe beinvloeden histonen de genexpressie?<br /> #Wat heeft immunoglobuline met transpositie te maken?<br /> #begrippen<br /> #*Sanger sequencing<br /> #*zinkvinger (afbeelding)<br /> #*polysoom<br /> #*beta-klemlader<br /> <br /> === 16 januari 2017 NM===<br /> #Scanningscomplex van translatie initiatie bij eukaryoten<br /> #Methoden om binding van eiwitten aan DNA te bestuderen<br /> #recA welke functies en werking<br /> #begrippen<br /> #*sanger sequencing<br /> #*tekening zink vingers<br /> #*U2 snRNP<br /> #*stopcodonsuppressie<br /> <br /> ===16 januari 2017 VM===<br /> #telomeren<br /> #transcriptie bij eukaryoten<br /> #intron/extron splicing<br /> #begrippen<br /> #*cDNA<br /> #*enhancer<br /> #*tekening RNA mimicry<br /> #*recombinatie bij hemoglobine<br /> <br /> ===16 aug 2016 NM===<br /> #Bespreek de regulatie van het Trp operon. Wat wordt er bedoelt met attenuatie?<br /> #Genetische code is onveranderlijk, maar evolutie laat wel sporen na. Verklaar. (tabel met DNA codons gegeven)<br /> #Wat is homologe recombinatie? Wat zijn de moleculaire stappen in dit proces? Welke zijn de belangrijkste eiwitten?<br /> #Woordjes: <br /> #*Sanger methode<br /> #*Tekening Zinkvinger<br /> #*histonacetyltransferase HAT<br /> #*DNA-mismatch repair<br /> <br /> ===27 januari 2016===<br /> #Bespreek opvouwing bij eukaryoot DNA en de invloed op de genexpressie<br /> #Vergelijk translatie-intitiatie bij prokaryoten en eukaryoten<br /> #Er is een probleem bij de replicatie van lineair DNA. Bespreek en wat kunnen we hieraan doen.<br /> #Woordjes: Figuur 8.18, epitoop tagging, mRNA-cap, suppressor-tRNA<br /> <br /> ===25 januari 2016===<br /> #trp en attenuatie<br /> #chromatinestructuur<br /> #translatie initiatie eukaryoten + regulatie<br /> #Woordjes: <br /> #*foto footprinting<br /> #*cap mRNA<br /> #*base-excinsieherstel<br /> #*retrotransposons<br /> <br /> ===18 januari 2016 VM===<br /> #Geef de structuur, functie, biosynthese van de 5' cap en vergelijk dit met het 5' einde van de prokaryoten.<br /> #Bespreek de gelijkenissen en verschillen tussen pro- en eukaryoot RNA-polymerases.<br /> #Wat is homologe recombinatie, welke moleculaire stappen vinden hierbij plaats en wat zijn de belangrijkste eiwitten die hierin meespelen.<br /> #Woordjes: <br /> #*Sanger-sequencing<br /> #*Foto van antiterminatie – terminatie<br /> #*Nucleosoom<br /> #*DNA-mismatch repair<br /> <br /> ===15 januari 2016 NM===<br /> #Leg aan de hand van een tekening uit wat het trombone effect is en welke moleculaire structuren en functies worden hier in dit mechanisme samen getrokken.<br /> #Verklaar met een schema hoe de lysogene cyclus ontstaat bij faag lamba infectie van een E.Coli. Hoe behoud men dee lysogene cyclus en hoe kan deze worden verbroken.<br /> #Geef de structuur, functie, biosynthese van de 5' cap en vergelijk dit met het 5' einde van de prokaryoten;<br /> #Kleine vraagjes: <br /> #*Tekening van lac operon met O1 O2, O3 en CAP en RNAP bindingsplaatsen.<br /> #*Leu-zipper<br /> #*Peptidyltransferase<br /> #*Retrotransposons<br /> <br /> ===14 januari 2016 NM===<br /> #Welke experimentele methoden ken je om de interactie tussen dna en eiwit te bestuderen en hoe werken ze.<br /> #Bespreek transcriptie van eukaryote rna polymerase 2 en de factoren die hierin meespelen. <br /> #Bacteriële transposons, hoe werken ze en wat zijn voor- en nadelen.<br /> #Woordjes: <br /> #*Northern blotting<br /> #*wobble base paring<br /> #*u6<br /> #*en zo die haarspeld van heatshok<br /> <br /> ===13 januari 2016===<br /> #Terminatie van transcriptie bij prokaryoten<br /> #Functie en structuur van de C-terminaal van eukaryoot RNA pol II<br /> #Terminatie en hervatting bij eukaryoten ribosomen<br /> #Woordjes: <br /> #*S1 mapping<br /> #*RNA-DNA hybride met intron<br /> #*eIF2 alfa<br /> #*Holliday junctie<br /> <br /> ===26 januari 2015===<br /> #5'cap structuur, biosynthese en functie en vergelijken met 5' van prokaryote mRna<br /> #catabolic activator protein structuur en functie<br /> #wat is het probleem bij replicatie van lineair dna en hoe lost de cel dit op <br /> #tekening van lac operon (met de 3 operonen, structuur repressor uitleggen); enhanceosoom; peptidyl transfer; en v(d)j-recombination <br /> <br /> ===14 januari 2015===<br /> #verschillen en gelijkenissen tussen rna polymerase van prokaryoten en eukaryoten<br /> #alternatieve splitsing, ook een voorbeeld ervan geven<br /> #genconversie uitleggen aan de hand van een figuur<br /> #woordjes: abortieve transcriptie, tekening van het trombone model, aminoacyl trna synthetase en cdna kloning<br /> <br /> ===12 januari 2015 (NM)===<br /> #Hoe kun je de binding tussen dna en eiwitten bestuderen <br /> #Splicing <br /> #RecBCD <br /> #begrippen: sanger sequencing, zinkvingers afbeelding, histonmodelering, eif4e<br /> <br /> ===12 januari 2015 (VM)===<br /> #transcriptie-initiatie<br /> #translate-elongatie<br /> #transposons bacterie<br /> #woordjes: anti-sigmafactor, epitoop tagging, splicingfiguur en genvonversie<br /> <br /> ===16 jan 2015===<br /> #Bespreek de Trp operon regulatie. Wat is attenuatie?<br /> #Geef de histonen en hun modificaties + het gevolg van deze modificaties op de genexpressie.<br /> #Wat is V(D)J recombinatie en wat is het biologisch nut ervan?<br /> #Kleine vragen:<br /> #*Afbeelding van een Zn-Vinger<br /> #*Wat is een replisoom?<br /> #*Wat is stopcodon supressie.<br /> #*Bespreek de beta klemlader.<br /> <br /> ===3 september 2014===<br /> # Bespreek de effecten van arabinose en glucose op de expressie van het ara-operon. Verduidelijk de onderliggende mechanismen.<br /> # Bespreek de moleculaire processen die leiden tot het starten van de translatie bij eukaryoten (vertrekkende van matuur mRNA in het cytosol).<br /> #* Op welke wijze(n) kan de cel deze translatie-initiatie regelen?<br /> # Wat is homologe recombinatie? Wat zijn de moleculaire stappen in dit proces? Welke zijn de belangrijkste eiwitten?<br /> # Termen:<br /> #* Northern Blotting<br /> #* topoisomerase<br /> #* alternatieve splicing<br /> #* RNA splicing afbeelding uitleggen (halverwege de splicing met de lariaat reeds gevormd.)<br /> <br /> ===28 Augustus 2014===<br /> # Bespreek de regulatie van het trp operon. Wat wordt er bedoeld met attenuatie?<br /> # Bespreek op moleculair niveau de translatie elongatie cyclus bij prokaryoten.<br /> #* Hoe wordt deze cyclus afgebroken? (terminatie)<br /> # Wat is genconversie? Hoe algemeen komt dit voor?<br /> # Termen:<br /> #* DNA footprinting<br /> #* telomerase<br /> #* Rollende cirkel replicatie<br /> #* RNA splicing afbeelding uitleggen (halverwege de splicing met de lariaat reeds gevormd.)<br /> <br /> ===27 januari 2014 (voormiddag)===<br /> # hoe eiwitten ontdekken op DNA? meerder manieren (footprinting en nucleosoompositionering en hij vroeg dan nog naar CAP)<br /> # waar zorgen histonen voor bij DNA en aanpassingen?<br /> # translatie initiatie bij eukaryoten en geef de dingen die daarbij kunnen <br /> # woordjes:<br /> #*antiterminatie<br /> #*ticketing hypothese ofzoiets<br /> #*BER<br /> #*van die eiwitten iets met die herschikkingen<br /> <br /> ===17 jan 2014 (namiddag)===<br /> #bespreek de terminatie mechanismen bij prokaryoten<br /> #bespreek de translatie elongatie cyclus<br /> #bespreek RNA splicing<br /> #woordjes: S1 mapping, enhancer, amino acetyl tRNA syntethase, genconversie<br /> <br /> ===16 jan 2014 (namiddag)===<br /> # Bespreek de structuur en functie van kataboliet activerend proteïne (CAP)<br /> # Bespreek de invloed van histonen en hun modificaties op genexpressie<br /> # Tijdens de replicatie van lineair DNA is er een probleem. Hoe lost de cel dit op?<br /> # Leg uit: <br /> #* nucleaire receptoren<br /> #* polyadenylatiesignalen<br /> #* stopcodonsuppressors<br /> #* bacteriële transposons<br /> <br /> === 15 jan 2014 (voormiddag) ===<br /> # Geef de structuur en functies van de sigma(factoren) bij RNA polymerase van prokaryoten.<br /> # Leg uit wat de structuur en functies zijn van het C terminale domein van eukaryotisch RNA polymerase II.<br /> # De genetische code kan niet gewijzigd worden, toch zijn er sporen van evolutie. Bespreek deze stelling adhv de figuur. Gegeven figuur : tabel van alle mogelijke codons voor de verschillende aminozuren<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte:<br /> #* Epitoop tagging<br /> #* Type II introns<br /> #* Kozak sequentie <br /> #* Holliday-verbinding<br /> <br /> ===13 jan 2014 (namiddag) ===<br /> # Transcriptie initiatie bij prokaryoten<br /> # Splicing<br /> # Leg uit: <br /> #*A-DNA <br /> #*Southern blotting <br /> #*HAT <br /> #*eIF4E<br /> # Homologe recombinatie (enkel schriftelijk)<br /> <br /> ===13 jan 2014 (voormiddag)=== <br /> # bespreek invloed glucose en arabinose op ara-operon + onderligende moleculaire mechanismen<br /> # mRNA cap: bespreek de biosynthese, functie, vergelijk met 5' prokaryoot<br /> # wat hebben transposons en antilichamen gemeen? licht toe<br /> # leg uit: <br /> #*rho<br /> #*zinkvinger<br /> #*peptidyltransferase<br /> #*splicingsignalen<br /> <br /> === 28 jan 2013(voormiddag) ===<br /> <br /> # Geef de verschillen en gelijkenissen tussen de regulaire van lac- en trp-operon.<br /> # Bespreek hoe eukaryote ribosomen transcriptie temineren en hervatten.<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte:<br /> #* cDNA kloning<br /> #* Figuur van polyadenyleringscomplex<br /> #* Heat shock response<br /> #* Rolling circle replicatie<br /> <br /> === 16 jan 2012(voormiddag) ===<br /> <br /> # Structuur en functie van de CTD bij eukaryoot RNA-polymerase II beschrijven.<br /> # Sanger-methode voor sequentie-analyse bespreken.<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte:<br /> #* Zinkvinger<br /> #* Ribozyme<br /> #* Tekening van tRNA-mimicry<br /> #* Telomerase<br /> <br /> <br /> === 24 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> idem 18 januari 2010<br /> <br /> === 17 jan 2011 (namiddag) ===<br /> <br /> # Leg uit hoe lactose en glucose het lac operon beïnvloeden<br /> # Gen activiteit bij eukaryoten kan geanalyseerd worden aan de hand van DNase activiteit. <br /> #* Leg uit <br /> #* hoe doet men dit experimenteel<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte <br /> #* lariat <br /> #* eIF2 alfa <br /> #* wobble <br /> #* tekening van rolling circle replicatie (tekening van faag lamda)<br /> <br /> === 17 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Bespreek structuur en functie van prokaryoot RNA-polymerase (holoënzym)<br /> # Maak een vergelijking tussen translatie-initiatie bij prokaryoten en eukaryoten<br /> # Verklaar:<br /> #* Lysogenie<br /> #* Histon H1<br /> #* RT-PCR<br /> #* Fig. 21.34 (onderste deel alleen)<br /> <br /> <br /> === 29 jan 2010 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Bespreek transcriptie-initiatie bij prokaryoten.<br /> # Fig 21.18<br /> # Bespreek kort:<br /> #* C-waardeparadox<br /> #* Kozak-sequentie<br /> #* Epitope tagging<br /> #* EF-Tu<br /> <br /> === 19 jan 2010 ===<br /> <br /> # Bespreek het scanning-model bij eukaryote translatie-initiatie.<br /> # Welke methode(s) ken je om de transcriptiestartplaats / het 5' einde te bepalen?<br /> # Bespreek kort:<br /> #* Riboswitch<br /> #* TATA<br /> #* Zinkvinger<br /> #* Figuur met vorming thèta-structuur<br /> <br /> === 18 jan 2010 ===<br /> # Geef de overeenkomsten en verschillen tussen pro- en eukaryote promoters.<br /> # Bespreek fig. 14.27<br /> # bespreek kort:<br /> #* Ribosoombindingsplaats<br /> #* Moleculaire mimicrie<br /> #* RACE<br /> #* beta-clamp<br /> <br /> === 11 jan 2010 ===<br /> # Bespreek de structuur en functie van prokaryoot RNA-polymerase(holoënzyme)<br /> # Maak een vergelijking tussen translatie-initiatie bij pro-en eukaryoten.<br /> # bespreek kort:<br /> #* lysogenie<br /> #* H1 histonen<br /> #* RT-PCR<br /> #* Fig 21.34<br /> <br /> === 19 jan 2009 (De Ley)===<br /> # Bespreek terminatie bij prokaryote transcriptie.<br /> # RNA-editing<br /> # fig 4.11<br /> Kaartjes:<br /> # Zink-vinger<br /> # Nick-translatie<br /> <br /> === 16 jan 2009 (De Ley)===<br /> # Bespreek de methode van S1 mapping (5' en 3' einde) en primer extension.<br /> # Structuur prokaryotisch RNA polymerase en bespreking sigma als specificiteitsfactor.<br /> # fig. 14.1<br /> Kaartjes:<br /> # Bespreek MCS, valspositieven en directioneel klonen.<br /> # Plaatsgerichte mutagenese.<br /> <br /> === 15 jan 2009 (De Ley)===<br /> # DNA:<br /> #* Bespreek A, B en Z DNA (ook helemaal hoe DNA wordt opgebouwd).<br /> #* Hoe kan het G-C gehalte van DNA bepaald worden.<br /> # Bespreek de eukaryotische polymerases.<br /> # Figuur van pBR322 bespreken.<br /> Kaartjes:<br /> # Zink-vinger<br /> # fig 9.7<br /> <br /> === 25 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Plaats gerichte mutagenese.<br /> # Trp operon.<br /> # Stom figuur van dnase hypergevoeligheid bij actief/inactief dna.<br /> <br /> === 21 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Bespreek DNA fingerprinting en typing (+toepassingen en detectie)<br /> # Bespreek de lytische reproductiecyclus van faag lambda.<br /> # Foto van RNA editing.<br /> Kaartjes: <br /> # Figuurke van 30nm vezel van chromatine en dan zo verwijderen van histonen om dubbelstreng DNA te krijgen en dan nick van DNA.<br /> # Verschil tussen DNase en DMS footprinting.<br /> <br /> === 21 jan 2008 (De Ley)===<br /> # S1 mapping ( 3' en 5') + primer extension (verschillen, voor-en nadelen)<br /> # Alles over prokaryotisch RNApol (subeenheden, functies, experimenten met sigmafactor + virussentranscriptie, ...)<br /> # figuur: Intron-exon met die lus-structuur (vraagt ook hoe ge da beeld bekomt via EM)<br /> Kaartjes:<br /> # Merodiploid: constitutieve operator.<br /> # Proteïne - dna interactie figuur (met die helix-turn-helix).<br /> <br /> === 17 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Expressievectoren.<br /> # Acetylatie en deacetylatie (+Histone acetyltransferase cloning of zoiets).<br /> # fig 9.14 (vierde editie)<br /> Kaartjes:<br /> # Epitope tagging<br /> # fig 13.10<br /> <br /> === 14 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Bespreek het trp operon.<br /> # Bespreek site-directed mutagenesis.<br /> # vul tekening van DNAse hypersensitivity verder aan. Bespreek de gebruikte technieken.<br /> Kaartjes:<br /> # Zo'n schematje van een merodiploid van het lac operon.<br /> # De C-waarde paradox.<br /> <br /> === 26 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Prokaryoot RNApolymerase en sigma.<br /> # Figuur van RNAlooping.<br /> # S1mapping en primer extension.<br /> <br /> === 25 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Transcriptieterminatie bij prokaryoten.<br /> # RNAediting.<br /> # Figuur van pBluescript.<br /> <br /> === 25 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Reassociatie kinetica.<br /> # Alles over chromatine en H1.<br /> # Foto: P22 en 434 (lambda operator/repressor interacties).<br /> Kaartjes:<br /> # Bespreek de sigmacyclus.<br /> # DNA transcriptie.<br /> <br /> === 24 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Bespreek S1 mapping(zowel 3'als 5'einde) en primer extension.<br /> # Bespreek de structuur van de prokarytische RNApolymerase en ook sigma als specifiteitsfactor.<br /> # Foto van R-looping experiment.<br /> Kaartjes: <br /> # Plaque hybridisatie.<br /> # Dnase(1)-hypergevoeligheid.<br /> <br /> === 16 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Geef de verschillende methoden voor expressie van gekloonde genen(inbegrepen fusieproteïnen en hun zuivering).<br /> # Bespreek de acetylering en deacetylering van histonen (bespreek ook het kloneringsexperiment van histon-acetyl-transferase).<br /> # Figuur 9.17 pag. 258 bespreken.<br /> Kaartjes:<br /> # Vergelijk DNase footprinting met gel mobility shift. Zijn er specifieke voordelen van de ene techniek tov. de andere.<br /> # Figuur 9.18a pag 259 bespreken.</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Algemene_Natuurkunde_II&diff=888 2018-01-19T13:28:56Z

<p>0653300: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Vervolgvak op Algemene natuurkunde I. Vanaf het academiejaar 2009-2010 gedoceerd door prof Wübbenhorst.('''Let dus op, de oudere vragen komen van prof. Janssen''') Het is geen jaarvak meer, enkel examen in januari dus. Het betreft een mondeling examen met schriftelijke voorbereiding.<br /> <br /> [[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===19 januari 2018 vm===<br /> <br /> Theorie:<br /> #De wet van Biot-Savart<br /> #Verschil tussen intrinsieke en gedopeerde halfgeleider + pn-junctie<br /> Oefeningen:<br /> #2 bolschillen met lading q en -q, straal r1 en r2, bereken het potentiaalverschil en capaciteit.<br /> #er zijn twee verschillende stukken glas, met lengte l1 = 4 micrometer, l2 = 3,5 micrometer, n1 = 1,4, n2 = 1,6. Je stuurt er een lichtstraal door met golflengte lambda = 600 nm. Ze komen in dezelfde fase toe op de stukken glas, loodrecht, en gaan dan door naar een scherm. Wat is het faseverschil tussen de twee golven wanneer ze op het scherm komen?<br /> <br /> ===18 januari 2018 vm===<br /> <br /> Zie examen 17 januari 2017<br /> <br /> Er werd ook nog gevraagd naar ferromagnetisme bij vraag 1<br /> <br /> ===15 januari 2018 nm===<br /> Theorie:<br /> #Beweging van een geladen deeltje in een magneetveld + massaspectrometer en cyclotron uitleggen<br /> #RLC-keten uitleggen <br /> Oefeningen:<br /> #We weten van een micaplaatje dat het tussen de 6 en de 7 µm dik is. Om de dikte exact te bepalen gebruiken we de proef van Young, waarbij we het micaplaatje voor één van de spleten zetten (n=1,582). Er verschijnt een centraal maximum wanneer we golflengte 539 nm gebruiken. Wat is dus de precieze dikte van het micaplaatje?<br /> #De ruimte tussen de platen tussen een condensator wordt helemaal opgevuld met zuiver water. Het dipoolmoment van een watermolecule is 6.10x10^-30Cm. Water heeft een dichtheid van 1.00g/cm³ en een molaire massa van 18g. De diëlektrische constante van water is 80. Het getal van Avogadro is 6.02x10^23. <br /> #* Veronderstel dat de condensator zodanig opgeladen zou kunnen worden dat alle elektrische dipolen perfect uitgelijnd zijn met het elektrisch veld. Wat zou dan de geïnduceerde oppervlakteladingsdichtheid aan het wateroppervlak zijn? <br /> #* Veronderstel dat de condensator zodanig opgeladen wordt, dat die geïnduceerde oppervlakteladingsdichtheid één duizendste bedraagt van de hierboven berekende waarde. Hoe groot is dan het elektrisch veld in de condensator?<br /> <br /> ===20 januari 2017 nm===<br /> Theorie:<br /> #Polarisatie toestanden<br /> #Gedopeerde halfgeleiders vs zuivere halfgeleiders en de PN-junctie<br /> Oefeningen:<br /> #2 bolschillen. Potentiaal verschil en Electrisch veld berekenen van R naar oneindig.<br /> #Solenoïde: magnetisch kracht na lange tijd en wanneer is deze half zo groot? (vermogen berekenen en hoeveel procent van het vermogen heeft het de 2e dan verbruikt)<br /> <br /> ===20 januari 2017 vm===<br /> Theorie:<br /> #Rlc keten uitleggen<br /> #Wet van ampere (tijdsafhankelijk en onafhankelijk)<br /> Oefeningen: <br /> #een bol met 2 stralen en een elektrisch veld waarvan de lading en de potentiaal berekend moeten worden <br /> #de oefening met licht dat door een gat moet op een hoogte van 50mm, gat zelf is 10mm groot en staat op 30 cm van de bron, wat zijn de golflengtes die aankomen bij het gat?<br /> <br /> ===19 januari 2017 nm===<br /> helemaal hetzelfde als de voormiddag<br /> <br /> ===19 januari 2017 vm===<br /> Theorie: <br /> #Halfgeleiders (+grafieken temperatuursafhankelijkheid van n-en p-types)<br /> #Biot-savart (eindig en oneindig)<br /> <br /> Oefeningen:<br /> #2 bolschillen: potentiaalverschil en capaciteit berekenen<br /> #2 stukjes glas met lichtstraal (zelfde golflengte) erdoor: faseverschil berekenen<br /> <br /> === 17 januari 2017===<br /> Zie examen 18 januari 2016. <br /> #Magnetisatie en magnetische suceptibiliteit<br /> #LASER<br /> Bijvragen bij de werking van de LASER: wat zijn de eigenschappen van laserlicht? Wat zorgt voor de overgang van niveau 2 naar niveau1?<br /> <br /> oefeningen<br /> #oefening van condensator waarvan afstand tussen de platen met 20% verminderd wordt<br /> #micaplaatje<br /> <br /> === 16 januari 2017===<br /> Theorie: <br /> #RLC-keten<br /> #Beschrijf de beweging van een geladen deeltje in een magnetisch veld, cyclotron en massaspectrometer<br /> Oefeningen:<br /> #mica<br /> #water in condensator<br /> <br /> === 18 januari 2016===<br /> Theorie:<br /> #Magnetisatie en magnetische suceptibiliteit<br /> #LASER<br /> Oefeningen:<br /> #oef van condensator waarvan afstand tussen de platen met 20% verminderd wordt<br /> #oef van het mica plaatje met dikte tussen 6 en 7 micro meter<br /> <br /> === 15 januari 2016 NM===<br /> Theorie:<br /> #Magnetisatie en magnetische suceptibiliteit<br /> #LASER<br /> Oefeningen:<br /> #oef van condensator waarvan afstand tussen de platen met 20% verminderd wordt<br /> #oef van het mica plaatje met dikte tussen 6 en 7 micro meter<br /> <br /> === 15 januari 2016 VM===<br /> Theorie:<br /> #laser<br /> #magnetisatie en magnetische susceptibiliteit<br /> <br /> Oefeningen:<br /> #mica plaatje<br /> #RC keten V1, V2 en V3 bepalen plus tijd waarop V het gemiddelde is van 2&amp;amp;3<br /> <br /> === 14 januari 2016 ===<br /> Theorie:<br /> #zuivere vs gedopeerde halfgeleiders (nog iets extra, we moesten nog een grafiek geven die in de slides staan maar niet in het boek: elektrische geleiding ifv temperatuur, maja dat was gewoon een bijvraag) + pn-junctie<br /> #Geef de wet van Biot Savart en pas dit toe op een oneindig lange stroomvoerende draad<br /> <br /> Oefeningen: <br /> #2 geleidende bolschillen met zelfde middelpunt, verschillende stralen (R1, R2, respectievelijk kleinste en grootste). Op de kleinste zit een lading q, op de grootste een lading -q. Bepaal het potentiaalverschil tussen R2 en R1. Bepaal ook de capaciteit van deze condensator.<br /> #er zijn twee verschillende stukken glas, met lengte l1 = 4 micrometer, l2 = 3,5 micrometer, n1 = 1,4, n2 = 1,6. Je stuurt er een lichtstraal door met golflengte lambda = 600 nm. Ze komen in dezelfde fase toe op de stukken glas, loodrecht, en gaan dan door naar een scherm. Wat is het faseverschil tussen de twee golven wanneer ze op het scherm komen?<br /> (check oefeningen van examen 10 juni 2011)<br /> <br /> ===11 januari 2016===<br /> Theorie:<br /> #Wet van Ampère (uitbreiding) en daarbij ook de B rond een gesloten kromme.<br /> #RLC uitleggen<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # Bol met bolschil errond en zo diffractie, door da scherm met 200 lijnen / mm en dan een vierkantje op het waarnemingsscherm. (welke golflengten gaan door da vierkantje?)<br /> ===16 januari 2015===<br /> Theorie:<br /> #magnetisatie<br /> #LASER<br /> Oefeningen:<br /> #RC-keten en V1,V2,V3 bepalen<br /> #mica<br /> <br /> ===15 januari 2015===<br /> Theorie:<br /> #Wet van Ampère<br /> #RLC in serie<br /> Oefeningen:<br /> #een bol en een bolschil, elektrisch veld en stralen gegeven en dan moest je de lading en de potentiaal aan het opp van de bol berekenen<br /> #spleet, berekenen welke golflengtes er in het vierkant vallen<br /> <br /> ===12 januari 2015===<br /> Theorie: <br /> #zuivere vs gedopeerde halfgeleiders + pn-junctie <br /> #de wet van Biot-Savart en de oneindige rechte geleider afleiden.<br /> Oefeningen: <br /> #bolvormige condensator (V + C berekenen)<br /> #lichtstralen van dezelfde golflengte die door 2 glasblokjes gaan, faseverschil berekenen.<br /> <br /> ===26 januari 2015===<br /> Theorie:<br /> #Beschrijf de beweging van een geladen deeltje in een magnetisch veld, cyclotron en massaspectrometer<br /> #LRC-kring<br /> Oefeningen:<br /> #Water in condensator<br /> #Micaplaatje<br /> <br /> <br /> ===20 januari 2014 voormiddag===<br /> Theorie:<br /> # Magnetisatie en magnetische susceptibiliteit.<br /> #LASER<br /> <br /> Oefeningen: exact zoals 10 juni 2013 (voormiddag)<br /> <br /> === 14 januari 2014 voormiddag ===<br /> Exact hetzelfde examen als 14 juni 2013. Zelfs de oefeningen waren dezelfde.<br /> <br /> === 19 juni 2013 namiddag ===<br /> Exact hetzelfde examen als 10 juni 2013 namiddag. Zelfs de oefeningen waren dezelfde<br /> <br /> === 14 juni 2013 (zowel voor- als namiddag!)===<br /> Theorie:<br /> #Bespreek de beweging van een geladen deeltje in een magneetveld, plus uitleg cyclotron en massaspectrometer.<br /> #Bespreek de RLC kring<br /> <br /> Oefeningen:<br /> #We weten van een micaplaatje dat het tussen de 6 en de 7 µm dik is. Om de dikte exact te bepalen gebruiken we de proef van Young, waarbij we het micaplaatje voor één van de spleten zetten (n=1,582). Er verschijnt een centraal maximum wanneer we golflengte 539 nm gebruiken. Wat is dus de precieze dikte van het micaplaatje?<br /> #De ruimte tussen de platen tussen een condensator wordt helemaal opgevuld met zuiver water. Het dipoolmoment van een watermolecule is 6.10x10-30Cm. Water heeft een dichtheid van 1.00g/cm³ en een molaire massa van 18g. De diëlektrische constante van water is 80. Het getal van Avogadro is 6.02x1023. <br /> #* Veronderstel dat de condensator zodanig opgeladen zou kunnen worden dat alle elektrische dipolen perfect uitgelijnd zijn met het elektrisch veld. Wat zou dan de geïnduceerde oppervlakteladingsdichtheid aan het wateroppervlak zijn? <br /> #* Veronderstel dat de condensator zodanig opgeladen wordt, dat die geïnduceerde oppervlakteladingsdichtheid één duizendste bedraagt van de hierboven berekende waarde. Hoe groot is dan het elektrisch veld in de condensator?<br /> <br /> === 11 juni 2013 (zowel voor- als namiddag!)===<br /> Theorie:<br /> # Leg uit, wet van Ampère zowel tijds als niet tijdsafhankelijk.<br /> # Leg RLC kring uit<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # Gegeven een bol met een lading en daar rond een bolschil, samen zijn ze ongeladen maar elk apart bezitten ze een lading. Geef hiervoor de lading van de bol en zijn potentiaal aan zijn oppervlak. Gegeven zijn de stralen van de bollen en de grootte van het elektrische veld.<br /> # Golflengten tussen 400 en 700nm worden op een diffractierooster gestuurd met 200 lijnen/mm. Waarnemingsscherm staat op 0.3m. Op dit scherm is op een afstand van 0.05m een gat geknipt, een vierkant met zijden 0.01m. Welke golflengten zullen door dit gat vallen?<br /> <br /> === 10 juni 2013 (namiddag)===<br /> Theorie:<br /> #Geef de wet van Biot Savart en pas dit toe op een oneindig lange stroomvoerende draad<br /> #Wat is een virtueel beeld? Kan je dat vormen met een vlakken spiegel? Holle spiegel? Bolle spiegel? Welke omstandigheden? <br /> <br /> Oefeningen:<br /> #Dieje kubus (zie oude examenvragen)<br /> #Iets met een RLC kring met uitzonderlijke omstandigheden, R gegeven, wat is de capaciteit en de inductie in de kring. Uitzondelijke omstandighede dus da de amplitude van uw weerstand = amplitude zelfinductie = amplitude condensator = amplitude van de bron, en ge had ook een frequentie gegeven<br /> <br /> === 10 juni 2013 (voormiddag)===<br /> Theorie:<br /> # Bespreek polarisatietechnieken (verstrooiing, dichroïsme etc...)<br /> # Magnetisatie &amp;amp; magnetische susceptibiliteit<br /> <br /> Oefeningen:<br /> #Gegeven is een RC-kring met R=100 kOhm; C=9,40 µF; en V(bron)=15,0 V. Na lang wachten (de condensator eerst helemaal laten opladen) verminderen we de afstand tussen condensatorplaten met 20%, in verwaarloosbaar tijdsinterval. <br /> #*Bereken potentiaalverschil over de condensator vlak voor (V1) en vlak na die verandering (V2)<br /> #*Bereken het potentiaalverschil over de condensator op lange tijd na de verandering (V3). <br /> #*Op welk tijdstip na de verandering zal de spanning over de weerstand gelijk zijn aan het gemiddelde van V2 en V3?<br /> #We weten van een micaplaatje dat het tussen de 6 en de 7 µm dik is. Om de dikte exact te bepalen gebruiken we de proef van Young, waarbij we het micaplaatje voor één van de spleten zetten (n=1,582). Er verschijnt een centraal maximum wanneer we golflengte 539 nm gebruiken. Wat is dus de precieze dikte van het micaplaatje?<br /> <br /> === 12 juni 2012===<br /> Theorie: <br /> # Wet van Ampere bespreken voor stationaire en niet stationaire stromen<br /> # RLC kring bespreken<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # Er is een kubus gegeven met zijde a die in de oorsprong ligt van het xyz assenstelsel. Er is een elektrisch veld E_(=vector) = c*x*y*i_(i_ is de eenheidsvector) en c=844 N/(C*m^2). dit elektrisch veld is evenwijdig met de x-as. hoe groot moet zijde a zijn zodat de kubus 7nC bevat?<br /> # ?<br /> <br /> === 11 juni 2012===<br /> Exact dezelfde vragen als 27 juni 2011. Zelfs de waarden bij de oefeningen waren hetzelfde.<br /> <br /> === 27 juni 2011===<br /> Theorie:<br /> # Leg uit: magnetisatie en magnetische susceptibiliteit<br /> # Bespreek de werking van een LASER<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # Gegeven is een RC-kring met R=100 kOhm; C=9,40 µF; en V(bron)=15,0 V. Na lang wachten (de condensator eerst helemaal laten opladen) verminderen we de afstand tussen condensatorplaten met 20%, in verwaarloosbaar tijdsinterval. a) Bereken potentiaalverschil over de condensator vlak voor (V1) en vlak na die verandering (V2). b) Bereken het potentiaalverschil over de condensator op lange tijd na de verandering (V3). c) Op welk tijdstip na de verandering zal de spanning over de weerstand gelijk zijn aan het gemiddelde van V2 en V3?<br /> # We weten van een micaplaatje dat het tussen de 6 en de 7 µm dik is. Om de dikte exact te bepalen gebruiken we de proef van Young, waarbij we het micaplaatje voor één van de spleten zetten (n=1,582). Er verschijnt een centraal maximum wanneer we golflengte 539 nm gebruiken. Wat is dus de precieze dikte van het micaplaatje?<br /> <br /> === 17 juni 2011 ===<br /> Theorie:<br /> # Bespreek de beweging van een geladen deeltje in een magneetveld, plus uitleg cyclotron en massaspectrometer.<br /> # Effectiefspanning uitleggen<br /> <br /> === 14 juni 2011 ===<br /> Theorie:<br /> # Geef wet van Biot-Savart en leid af voor een oneindig lange stroomvoerende draad<br /> # Wat zijn mogelijke polarisatietoestanden van EM-straling? (geen polarisatietechnieken)<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # Een kring met een solenoïde met 35mH en een weerstand van 0,35 Ohm, aangesloten op een batterij van 12V. Wat is de magnetische energie die de batterij heeft na een lange tijd? Hoeveel vermogen moet het batterij dan nog leveren? Na hoeveel tijd is de energie half zo groot? Wa is dan het vermogen v.d. batterij en hoeveel procent vraagt het opwekken van magnetische arbeid dan?<br /> # Een tweespleten systeem met lambda = 500nm, d = 0,150mm en a = 30,0µm. Hoe vaak komen maxima voor? (enzovoort)<br /> === 10 juni 2011 (voormiddag) ===<br /> Theorie:<br /> # Wat is het verschil tussen een zuivere halfgeleider en een gedopeerde halfgeleider? geef uitleg over de pn-junctie.<br /> # Leg uit wat een virtueel beeld is. Is het mogelijk om dit van een reëel voorwerp te bekomen bij een vlakke/holle/bolle spiegel. Onder welke omstandigheden?<br /> <br /> oefeningen:<br /> # Er is een kubus gegeven met zijde a die in de oorsprong ligt van het xyz assenstelsel. Er is een elektrisch veld E_(=vector) = c*x*y*i_(i_ is de eenheidsvector) en c=844 N/(C*m^2). dit elektrisch veld is evenwijdig met de x-as. hoe groot moet zijde a zijn zodat de kubus 7nC bevat?<br /> # Je hebt een wisselspanningskring gegeven met V0 = 30,0V; omega = 314rad/s; I0=620mA ;en v=V0sin(omega*t-pi/4) en i=-I0cos(omega*t-pi/4). In de kring zit alleen nog een element X.<br /> * identificeer dit element volledig<br /> * door welk ander element kan je dit vervangen zodat de stroomamplitude gelijk blijft(de fase mag verschillen) en identificeer dat element. Je moet er maar 1 geven maar er zijn er 2 mogelijk.<br /> <br /> === 10 juni 2011 (namiddag) ===<br /> Theorie:<br /> # Bespreek de RLC-keten waarop een wisselspanning is aangesloten<br /> # Wet van Ampère uitleggen (stationair en niet-stationair) Hij zegt er ook bij dat het gaat om het magneetveld rond een gesloten kromme, dus juiste formule vinden niet moeilijk<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # 2 geleidende bolschillen met zelfde middelpunt, verschillende stralen (R1, R2, respectievelijk kleinste en grootste). Op de kleinste zit een lading q, op de grootste een lading -q. Bepaal het potentiaalverschil tussen R2 en R1. Bepaal ook de capaciteit van deze condensator.<br /> # er zijn twee verschillende stukken glas, met lengte l1 = 4 micrometer, l2 = 3,5 micrometer, n1 = 1,4, n2 = 1,6. Je stuurt er een lichtstraal door met golflengte lambda = 600 nm. Ze komen in dezelfde fase toe op de stukken glas, loodrecht, en gaan dan door naar een scherm. Wat is het faseverschil tussen de twee golven wanneer ze op het scherm komen?<br /> <br /> === 11 juni 2010 ===<br /> Theorie:<br /> #Bespreek de beweging van een geladen deeltje in een magneetveld, plus uitleg cyclotron en massaspectrometer.<br /> #Bespreek alle mogelijke polarisatie-toestanden van een EM-golf, manieren om polarisatie te bekomen niet beschrijven.<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # Men laadt een condensator met een capaciteit 17mF volledig op en men koppelt hem dan los van de bron. Hierna is er een arbeid van 18,5 joule nodig om een extra lading van 13 mC van de ene plaat van de condensator naar de andere over te brengen. Wat was de EMK van de bron?<br /> # Een spoel van 100 windingen wordt rond een cilinder gewikkeld met een doorsnede van 12 cm². De cilinder is van een middenstof met µr = 1. Er wordt een magneetveld aangelegd van 1,6 T dat in de tijd omwisselt van de ene naar de andere richting maar altijd evenwijdig loopt met de symmetrieas van de spoel. Een weerstand van 13 Ohm wordt op de spoel aangesloten. Geef de lading die door deze weerstand stroomt.<br /> <br /> === 7 juni 2010 (Wübbenhorst dus) ===<br /> Theorie:<br /> # RLC-keten met wisselspanning uitleggen<br /> # Wat is het verschil tussen een zuivere halfgeleider en een gedopeerde halfgeleider? geef uitleg over de pn-junctie.<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # over een solenoïde met een L en een R die verbonden zijn aan een batterij. L, R en V waren gegeven en men vroeg de energie van de spoel op t= oneindig en vermogen dat de batterij moest leven<br /> # ging over 2 stralen door glas met 2 verschillende n, met uiteindelijk de vraag: wat is het faseverschil van de 2 stralen aan het scherm achter het doorlopen van het glas?<br /> <br /> ===22 augustus 2009===<br /> Theorie:<br /> #Bespreek Foucaultstromen<br /> #Effectiefspanning en effectiefstroom uitleggen<br /> <br /> Oefeningen:<br /> (Iemand aub?)<br /> <br /> ===17 augustus 2009===<br /> Theorie:<br /> #Leid een formule af voor de capaciteit van een vlakke en een cilindrische condensator<br /> #Bespreek ferromagnetisme<br /> <br /> Oefeningen:<br /> #Een lading zit vast op een gegeven positie (x,y,z). Een andere lading beweegt van positie 1 (X1,Y1,Z1) naar 2 (X2,Y2,Z2). De ladingen zijn gegeven, de coordinaten ook. Hoeveel energie kost het om deze lading van positie 1 naar 2 te verplaatsen?<br /> #Een oefening analoog aan weerkaatsing aan een zeepbel, of iets dergelijks. Opgave weet ik niet meer goed. (Iemand?)<br /> <br /> ===19 juni 2009===<br /> Theorie: <br /> # Vergelijk de gelijkstroom RC- en LR-kring.<br /> # Bespreek alle mogelijke polarisatietoestanden van EM-straling. Methoden om dit te bereiken hoeven niet besproken te worden.<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # We beschouwen een niet geleidende plaat van grote afmetingen. Op de ene zijde staat een positieve oppervlaktelading, op de andere zijde een negatieve (getallen gegeven uiteraard). Een proton wordt op 1mm afstand van de plaat vanuit rust losgelaten. Wat is de snelheid op 2 mm van de plaat?<br /> # Effectiefspanning berekenen adhv. een gegeven v(t)-curve.<br /> :[[Bestand:driehoekspanning.gif]]<br /> <br /> ===12 juni 2009===<br /> Theorie: <br /> # LASER.<br /> # Wederzijdse inductie en zelfinductie.<br /> Oefeningen:<br /> # ?<br /> # ?<br /> <br /> ===12 juni 2009===<br /> Theorie:<br /> # Geef de wet van Ampère voor stationaire stromen + voorbeeld. Leg uit welke aanpassing gedaan moet worden zodat deze wet ook geldig is voor tijdsafhankelijke stromen.<br /> # Leg uit hoe men oscillerende .. kunt krijgen in een LC-kring.<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # Een puntlading q bevindt zich op een afstand x op de middelloodlijn van een niet geleidende draad (2l) waar een homogeen verdeelde lading Q op zit. Wat is de kracht dat deze puntlading ondervindt?<br /> # Zender op hoogte 70m, lengte van 1km en een ontvanger op hoogte x. Wat is kleinste x waar een maximum van straling invalt. Houd rekening met de rechtstreekse stralen en de gereflecteerde stralen op water.<br /> <br /> ===8 jun 2009===<br /> Theorie:<br /> # Leidt een formule af voor de capaciteit van een vlakke en een cilindrische condensator.<br /> # Wat wordt er bedoeld met magnetisatie? Leg uit: relatieve permeabileit en magnetische susceptibiteit.<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # Twee spoelen staan of vaste afstand van elkaar. Door de ene spoel loopt een stroom van 1A en de flux erdoor is 0.010Wb. Indien men nu een stroom van 2A door de tweede spoel stuurt, bedraagt de flux door de eerste spoel 0.012Wb.<br /> #* Bereken de magnetische flux door de 2de spoel, gegeven dat de zelfinductie ervan gelijk is aan 0.003 (iets in die aard).<br /> #* Bereken de wederzijdse inductiecoefficient.<br /> #* Bereken de zelfinductie van de eerste spoel.<br /> # Een radiogolf zendmast in punt B staat op 20km afstand van huis H. De intensiteit in H wordt gegeven door een gekende I[sup]0[/sup]. Op 100m afstand van mast B bouwt men een 2de mast A, die een hoek &amp;lt;math&amp;gt;&amp;amp;\X\theta \widehat{B A H}&amp;lt;/math&amp;gt; is 30° (geen idee hoeveel het juist was).<br /> #* Bereken de intensiteit in H.<br /> #:[[Bestand:ANII-8.6.2009-oef2.png]]<br /> <br /> ===8 jun 2009===<br /> Theorie:<br /> # Bespreek RC-filters.<br /> # Bespreek diffractie bij een oneindig lange spleet en (beknopt) bij een rechthoekige spleet.<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # Twee RC-kringen gegeven, constructie van vanalle condensatoren in serie en parallel; V en R gegeven bij de ene kring; stroom door beide spanningsbronnen is gelijk; bereken Vx en R van de andere kring.<br /> # Oneindig lange draad en in hetzelfde vlak evenwijdig ermee een vierkant. Bereken de wederzijdse inductiecoëfficiënt (afstand draad tot vierkant gegeven + lengte zijde vierkant).<br /> <br /> ===16 jun 2008===<br /> Theorie:<br /> # Bespreek de beweging van een geladen deeltje in een magneetveld. Leg, bij wijze van voorbeeld, de werking uit van een massaspectrometer of van een cyclotron.<br /> # Bespreek de mogelijke polarisatietoestanden van em-straling (niet de methodes om tot polarisatie te komen)<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # Condensator ( C= 17 microF) wordt een een onbekende batterij geschakeld en volledig opgeladen. Dan losgekoppeld. Er is aan arbeid 18,5J nodig om een bijkomende lading van 13,0 mC van de ene plaat naar de andere te verplaatsen. Bepaal emk van de batterij.<br /> # spoel met 100 windingen wordt rond een metalen cilinder gewikkeld met een doorsnede van 12 cm² en mu r = 1. Er wordt een weerstand over de spoel geplaatste van 13 ohm. Er is een magneet veld die door de spoel loopt (parallel met de as). Dit magneetveld varieert gedurende een bepaalde tijd van 1,6T in de ene richting naar 1,6T in de andere richting. Hoeveel lading loopt er in die tijd door de weerstand.<br /> <br /> ===16 jun 2008===<br /> Theorie:<br /> # Bespreek een geleider in elektrostatisch evenwicht.<br /> # Bespreek hoe men een oscillerende ... kan maken in een LC-kring. (LC-kring uitleggen dus)<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # 2 draden in tegengestelde stroomzin, stroom neemt lineair toe van 0 naar 100A in 7s, bereken emk in de lus tussen die draden <br /> # een ongepolariseerd licht kan worden opgedeeld in een deel gepolariseerd en een deel ongepolariseerd, intensiteiten mag je optellen, een polarisator wordt 360° gedraaid, men merkt dat op een bepaald punt de intensiteit 5 keer groter is, hoeveel procent is maakt de gepolariseerde golf uit?<br /> <br /> ===13 jun 2008===<br /> Theorie:<br /> # Bespreek de begrippen magnetisatie en magnetische susceptibiliteit.<br /> # Bespreek de proef van Young.<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # iets met een geleidende bol en daarrond een geleidende bolschil en dan een elektrisch veld gegeven en zo de lading op de bol berekenen. <br /> #een kring gegeven met een X waarvan ge moet zeggen of het een condensator of weerstand of zelfinductie moet zijn, vergelijkingen van i en v gegeven. En dan ook nog zeggen of je de X kan vervangen door iets anders waardoor de amplitude hetzelfde blijft maar de i en v niet in fase zijn.<br /> <br /> ===13 jun 2008===<br /> Theorie:<br /> # Wat is het verschil in elektrische geleiding bij zuivere halfgeleiders en gedopeerde halfgeleiders. Leg uit de werking van pn-junctie<br /> # Bespreek de LRC-keten<br /> <br /> Oefeningen<br /> # LC keten<br /> # Fase verschil berekenen 2 gelijke golven die elk door een blokje gaan met andere lengte en brekingsindex<br /> <br /> ===9 jun 2008===<br /> Theorie:<br /> # Bespreek wet Biot-Savart en gebruik om magneetveld rond oneindig lange draad met stroom af te leiden.<br /> # Leg uit wat een virtueel beeld is. Is het mogelijk om dit van een reëel voorwerp te bekomen bij een vlakke/holle/bolle spiegel. Onder welke omstandigheden?<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # De ruimte tussen een condensator is helemaal gevuld met water. Water heeft een dipoolmoment 6.10*10^-30 Cm. De molaire massa van water is 18. De dichtheid is 1g/cm^3. Water heeft een di-elektrische constante van 80.<br /> #* bepaal de geïnduceerde oppervlakteladingsdichtheid wanneer alle dipolen zich volgens E uitlijnen.<br /> #* stel dat de geïnduceerde oppervlakteladingsdichtheid 1/1000 is van die hierboven, wat is dan het elektrisch veld?<br /> # In een RLC-kring is de frequentie 1.73kHz. De amplitude van de spanning over de weerstand, de amplitude van de spanning over de condensator, de amplitude van de inductie en de amplitude van de bronspanning zijn allen gelijk. R = 700 ohm. Bepaal L en C.<br /> <br /> ===15 jun 2007===<br /> Theorie:<br /> # Bespreek magnetisch moment + richting van magnetisch moment in magneetveld<br /> # Serie RLC keten bespreken<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # Stroom van 27A in begin, straal eerste cirkel R, straal tweede cirkel 2r, r = 0.1m, en bereken magnetische inductie in punt P. Draad overal even dik en overal even grote soortelijke weerstand<br /> # Tweede is kurkje drijft op water, hoe lang moet de naald zijn opdat het zichtbaar is boven water. Brekingsindex water=1.33, lucht=1 Afmetingen staan erbij.<br /> <br /> ===12 jun 2007===<br /> Theorie:<br /> # Leg uit: elektrische stroom, stroomdichtheid en leid de wet van Ohm af.<br /> # De wet van Ampère afleiden voor stationaire stromen en vertellen wat ge aan de basisformule moet veranderen als de stromen tijdsafhankelijk worden.<br /> <br /> Oefeningen<br /> # Berekenen hoeveel lading er door een weerstand gaat die aangesloten is op een geleidende lus die altijd maar kleiner en kleiner wordt. Loodrecht op de lus heerst er een magnetische inductie.<br /> # Een typisch optica-vraagstukje: je hebt een schilderijtje en wil dat vastleggen op een gevoelige plaat, met een bolle lens met brandpunt= + 5 cm. Hoe ver moet het schilderijtje van de lens en hoe ver moet de lens van de gevoelige plaat.</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Structurele_en_Fysiologische_Biologie&diff=584 2017-08-21T14:17:19Z

<p>0653300: /* 21 aug 2017 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> ==Examenvragen PLANT==<br /> ===21 aug 2017 VM===<br /> #meerkeuzevragen<br /> #plantenhormonen met werking geven + uitleggen hoe hormoonsysteem in planten werkt<br /> #guttatie en waterpotentiaal bondig uitleggen<br /> #cyclus bedektzadigen aanvullen<br /> <br /> ===31 jan 2017===<br /> #Meerkeuzevragen<br /> #Waterpotentiaal met zijn 2 componenten uitleggen. Wat gebeurt er als je opgeloste stoffen toevoegt aan het omgevings water?<br /> #Massastroming en SAR uitleggen.<br /> #Cyclus van bedektzadigen aanvullen.<br /> <br /> ===26 jan 2016===<br /> #8 meerkeuze vragen<br /> #Mondelinge hoofdvraag: hoe wordt sucrose gevormd, hoe komt het in cortexe cellen van de wortels en wat is de bijdrage voor de accumulatie van K+ <br /> #Bijvraag: leg chemiosmose en fotorespiratie uit<br /> #Bijvraag: cyclus aanvullen van de bedektzadigen<br /> <br /> ===30 jan 2014 nm===<br /> #Meerkeuze<br /> #Welke hormonen zijn er bij planten, welke staan in voor apicale dominantie en hoe werkt dit.<br /> #Leg uit hoe herbicide resistentie werkt en leg het mechanisme van glyphosfaat uit. Levenscyclus.<br /> ===29 jan 2014 nm===<br /> #Meerkeuze<br /> #Bespreek de diversiteit van fungi en geef de levenscyclus van een ascomyceet.<br /> #Bespreek de rol van mieren in commensalisme en de overdracht van parasieten.<br /> #Levenscyclus van varens.<br /> ===28 jan 2014 nm===<br /> #8 meerkeuzevragen (4 punten)<br /> #Bespreek de huidige wereldproblemen en geef aan hoe plantenbiotechnologie/biologie zou kunnen bijdragen tot het aanreiken van van oplossingen (8 punten)<br /> #Vul aan en verklaar dit ecologisch model (Bottom-up effect). Hoe kon dit model op experimentele wijze geverifieerd worden? (3 punten) <br /> #Levenscyclus bedektzadige aanvullen (5 punten)<br /> ===28 jan 2014 vm===<br /> #Meerkeuze<br /> #Plantenhormonen welke types? regulatie? welke komen voor bij apicale dominantie? Regulatie? Werking?<br /> #Levenscyclus bladmossen<br /> #Tekening van de muis, mier, plant, zaad (interacties verklaren)<br /> ===27 jan 2014===<br /> # 8 meerkeuzevragen.<br /> #Bespreek de diversiteit en evolutie van prokaryoten en het onstaan van eukaryoten.<br /> # Figuur uitleggen over bottom-upeffecten en ontbrekende termen aanvllen. <br /> #Foto van doorsnede monocotyl blad: wat is het + delen benoemen.<br /> ===13 jan 2014===<br /> # 5 meerkeuzevragen.<br /> #Aanvullen van termen en processen (mitose/meiose) bij de levenscyvlus van gymnospermen. (Letterlijk uit het handboek fig. 31.12 p609)<br /> #Een plantencel in zuiver water en geleidelijk aan zout toevoegen, wat gebeurt er? Leg uit a.d.h.v. een duidelijke grafiek.<br /> #Wat is een preprofaseband? (en nog een term ?? uitleggen)<br /> ===23 jan 2012===<br /> #Leg uit wat er zal gebeuren bij een plantencel in zuiver water en wat als je opgeloste stoffen toevoegt aan de omgeving. Maak een schema aan de hand van de waterpotentiaal en zijn 2 subcomponenten en leg uit hoe deze veranderen.<br /> #Leg uit fotorespiratie: hoe wat waarom waar. <br /> #Situeer:<br /> ##glyphosaat<br /> ##methanogeen<br /> ##guttatie<br /> ##Mycorrhiza<br /> #Levenscyclus. Aangeven om welke levenscyclus het ging (bladmossen) en beargumenteren. Structuren en processen aanvullen op tekening. Aangeven of het een haplonte, diplonte of haplodiplonte levenscyclys was.<br /> ===1 feb 2011 VM===<br /> #Volledige weg beschrijven die een C-atoom aflegt als CO2 indien ingebouwd in pectine in de celwand van rhizodermiscellen. Waaruit bestaat de celwand en wat is de functie?<br /> #Bespreek in detail de signaalgeving en metabolische wegen van Rhizobium in symbiose met een plant.<br /> #. Figuur: levenscyclus bedektzadigen <br /> #Situeer:<br /> ##hexaploïdie by tarwe<br /> ##cavitatie<br /> ##gespvorming by Basidiomyceten  induceerbare mutaties<br /> ===27 jan 2011 NM===<br /> #Volledige weg beschrijven die een N-atoom aflegt van de bodem tot inbouw als glycoproteïne in een bladepidermiscel<br /> #Vgl mossen en angiospermen. Zeggen hoe deze zijn aangepast aan leven op het land<br /> #Figuur: <br /> ##structuur van een blad met huidmondjes <br /> ##hetzelfde -.- <br /> #Situeer:<br /> ##allotetraploïdie<br /> ##guttatie<br /> ##sterke vs zwakke sinks<br /> ##bespreek metabolisme Archaea<br /> <br /> ===24 jan 2011 NM===<br /> #De waterpotentiaal en de 2 componenten ervan bespreken als we een cel in zuiver water hebben en daar geleidelijk aan zout aan toevoegen. Schematisch weergeven en stap voor stap bespreken wat er met de cel gebeurt.<br /> #Het verschil tussen gametofytische en sporofytische incompatibiliteit uitleggen. En een model geven voor gametofytische incompatibiliteit.<br /> #Figuur: <br /> ##Doorsnede monocotyle stengel <br /> ##Vaatbundel en daarop floeem,<br /> ##xyleem en vezelschede benoemen<br /> #Situeer:<br /> ##Endosymbiose<br /> ##Viroïden<br /> ##Soortkruisingen<br /> ##Lenticel<br /> ===24 jan 2011 VM===<br /> #Bespreek structuur, samenstelling, functie en oorsprong van de plantencelwand.<br /> #Bespreek de verschillen tussen C3, C4 en CAM<br /> #Figuur: monokotyle stengel met vaatbundel<br /> #Situeer:<br /> ##hydrogenosoom<br /> ##Agrobacterium tumefaciens<br /> ##massastroming (Munch hypothese) <br /> ##terminatortechnologie<br /> ===25 jan 2010 VM===<br /> #Teken een dwarsdoorsnede van een wortel van een monokotyle plant. Wat is het verschil met een dikotyle plant?<br /> #Bespreek (fysiologisch en chemisch) de weg die een CO2 molecule aflegt vanuit de lucht om ingebouwd de worden in de celwand van een<br /> rhizodermiscel.<br /> #Vergelijk CO2 fixatie bij C3 en C4 planten. Wat zijn de ethiologische implicaties?<br /> #ABC van de bloemetjes<br /> #Situeer:<br /> #Soortkruising<br /> #Isospore haplodiplont <br /> #Worteldruk<br /> #Basidiomyceten<br /> #Archebacteria<br /> ===18 jan 2010 NM===<br /> #Bespreek de mogelijkheden voor overdracht van genetische informatie tussen individuen die tot een andere soort behoren.<br /> #Vul volgende figuur aan en bespreek (die van potentiaal, niet met de kleurtjes, degene die ook in de cursus staat).<br /> #Vergelijk CO2 fixatie bij CAM en C4 planten. 4. ABC van de bloemen.<br /> #Situeer en bespreek:<br /> ##ascomyceten,<br /> ##heterospore haplodiplonten<br /> ##3 figuren: (een stengel ==&amp;gt; figuur helemaal onderaan rechts in voorbeeldvragen, een blad ==&amp;gt; die gele figuur zo :p en een wortel ==&amp;gt; laatste blz, rechts bovenaan)<br /> ===18 jan 2010 VM===<br /> #Bespreek autotrofie bij prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Gametofytische incompatibiliteit.<br /> #Fotorespiratie: wat, waar, hoe, waarom?<br /> #Vul aan en bespreek zodat duidelijk wordt of het om een haplont, diplont of haplodiplont organisme gaat. Is dit type organisme al goed aangepast aan het landleven? (figuur van varens, zie voorbeeldvragen) <br /> #Situeer en bespreek:<br /> ##3 figuren (monokotyl blad, dikotyle verdikte stengel, monokotyle vaatbundel),<br /> ##agrobacterium tumefaciens<br /> ##basidiomyceten.<br /> ===26 jan 2009===<br /> #Plantencelwand: Samenstelling? Structuur? Functie? Oorsprong?<br /> #Transport in planten: Hoe? Waar? Waarom?<br /> #C4 en CAM planten: Wat? Waarom? Hoe? Verschil?<br /> #Afbeelding van een diplohaplonte cyclus, en zeggen of deze plant al goed<br /> is aangepast aan het leven op het land. <br /> #Termen:<br /> ##Soortkruising<br /> ##Agrobacterium Tumefaciens<br /> ##Zelfincompatibiliteit<br /> ##Het ABC van de bloemetjes<br /> ##Fotoke van dwarse doorsnede van een plantenstengel, zeggen wa ge ziet en van die dinge..<br /> ===19 jan 2009===<br /> #voortplantingscyclus (mos)<br /> #bespreek zo goed mogelijk de opnamen van N uit nitraat (chemisch/fysisch) en inbouw in celwandprotëine epidermiscel 3. teken primaire stengel dikotyle plant + verschil monokotyle<br /> #fotorespiratie: zin of onzin.<br /> #Termen:<br /> ##gametofytische zelfincompabiliteit <br /> ##ABC van bloemen<br /> ##worteldruk<br /> ##retrovirussen<br /> ===28 jan 2008===<br /> #vergelijk autotrofie bij eukaryoten en prokaryoten<br /> #fotorespiratie<br /> #zelf-incompabiliteit<br /> #cyclus van varen aanvullen + aangepassingen aan het land <br /> #Situeer:<br /> ##drie foto's <br /> ##Agrobacterium tumefaciens <br /> ##Basidiomyceet<br /> ===28 jan 2008===<br /> #primaire dikotyle wortel tekenen en bespreken, vergelijken met monokotyle <br /> #Welke fysische en chemische weg moet het N-atoom van NH4+ afleggen<br /> om ingebouwd te kunnen worden in een celwandproteïne van een blad<br /> #Grafieken van CO2-opname van C3 en C4 planten. Zelf assen invullen en c3 en c4 aanduiden + uitleggen waarom<br /> #Welke aanpassingen moet een landplant hebben ten opzichte van een wier<br /> om te kunnen overleven op het land en is dit bij alle zo <br /> #Bespreek:<br /> ##ascomyceten <br /> ##retrotransposons<br /> ##archeaebacteriën<br /> ##zelfincomptabiliteit<br /> ===21 jan 2008===<br /> #Hoe genetische informatie overbrengen tussen individuen van verschillende soorten denk ik<br /> #Bespreek en vul aan die figuur van de waterpotentiaal in een cel<br /> #leg uit hoe CO2 wordt gefixeerd bij C4 planten en CAM planten en vergelijk <br /> #geef een schematische voorstelling en een voorbeeld van een heterospore haplodiplont cyclus <br /> #Situeer:<br /> ##Ascomyceten<br /> ##zelfincompatibiliteit<br /> ## 3 foto'kes ( stengel, wortel en blad)<br /> ===18 jan 2008===<br /> #teken structuur monocotyle wortel, vgl met dicotyle<br /> #bespreek fixatie co2 bij C4-C3 planten, ahv voor en nadelen<br /> #voortplantingscyclus (van ascomyceten, was wel niet gegeven da het over asco ging ) aanvullen en uitleggen waarom het haplont/diplont/diplohaplont is<br /> #bespreek hoe C via co2 kan ingebouwd worden in de rizodhermiscellen (<br /> zowel fysich als chemisch ) <br /> #Situeer en bespreek:<br /> ##worteldruk<br /> ##basidiomyceten <br /> ##archeaebacteriën<br /> ##soortbestuiving<br /> ##retrovirussen<br /> ===14 jan 2008===<br /> #Celwand: Samenstelling? Functie? Oorsprong? Structuur?<br /> #Vergelijk het transport van mineralen en het transport van<br /> fotosyntheseproducten<br /> #Je gaat op excursie om C3/C4/CAM planten te inventariseren. Wat voor<br /> materiaal neem je mee en leg uit.<br /> #Tekening van een voortplantingscyclus: Is dit haplont/diplont/haplodiplont? Leg uit en geef aan of en hoe deze plant aan het landleven aangepast is. <br /> #Situeer en bespreek:<br /> ##Zelfincopatibiliteit<br /> ##Agrobacterium tumefaciens<br /> ##3 tekeningen (doorsneden van stengel/wortel)<br /> ===2 feb 2007===<br /> #twee grafieken zonder aanduidingen &amp;quot;vul aan en verklaar&amp;quot;<br /> #genetische overdracht tussen individuen van dezelfde soort en verschillende soorten, leg uit<br /> ===15 jan 2007===<br /> #Vul volgende grafiek aan en bespreek (die van de waterpotentiaal van de omgeving t o v die in de plantencel) en hoe zit dit in 't xyleem? <br /> #Fotorespiratie: wat? waar? hoe? waarom?<br /> #Situeer:<br /> ##lenticellen<br /> ##heterospore<br /> ##haplodiplonten<br /> ##zygomyceten<br /> ##endodermis<br /> ##gametofytische incompatibiliteit<br /> ##agrobacterium tumefaciens<br /> <br /> ==Examenvragen DIER== <br /> ===21 aug 2017 VM===<br /> #verklaar: blastula, monocyt, convergete evolutie<br /> #verbind, ongeveer zelfde begrippen als vorige jaren + zweetklier (mammalia), zijlijn (osteichthyes)<br /> #Samenstelling van een spier + werking contractie<br /> #hoe wordt het glucose gehalte in het bloed gereguleerd, welke hormonen werken hierbij en waar worden ze gemaakt<br /> ===31 jan 2017===<br /> #Verklaar: dauer, ecdysis en filariasis.<br /> #Verbind, zelfde begrippen als voorgaande jaren.<br /> #Vergelijk zuurstof opname bij zoogdieren en insecten.<br /> #Hoe werkt het doorgeven van zenuwimpulsen?<br /> <br /> ===26 januarie 2016===<br /> #Termen: RNA interferentie, epifyse, prothorax<br /> #Verbinden<br /> #Uitleggen: 3 voorbeelden van tegenstroomprincipe en impulsgeleiding<br /> <br /> ===20 aug 2014===<br /> #Begrippen:<br /> ##adaptieve radiatie<br /> ##gremmula<br /> ##eutelie<br /> #Verbind:<br /> ##preenklier - spiraalplooi - pedipalpen - mesogloea - corpus alata - ambulacra - radula - citellum <br /> ##cnidaria - insecta - echinodermata - gestropoda - chondrichtys - hirunae - aves - chelicerata<br /> #Geef het mechanisme van de bioluminescentie bij aquora victoria<br /> #Bespreek de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.<br /> ===30 jan 2014===<br /> #Begrippen :<br /> ##Metanefridium<br /> ##Regeneratie<br /> ##Clitellum<br /> #Verbinden: mesogloea, speenklier, kieuwdeksel, pedipalp, ambulacra, corpora allata, spiraalplooi, radula<br /> #Leg de menstruatiecyclus uit en geef 3 voorbeelden van tegenstrooomprincipe<br /> ===29 jan 2014 NM===<br /> #Begrippen:<br /> ##Filiarsis<br /> ##Mimicry <br /> ##Corpora cardiaca<br /> #Verbinden: termen van de vorig jaren.<br /> #Leg de werking van longen en tracheën uit en vergelijk. Vergelijk<br /> osmoregulatie bij zoet-en zoutwatervissen.<br /> ===28 jan 2014 NM===<br /> #Termen:<br /> ##Lofofoor<br /> ##Adaptieve radiatie <br /> ##Protonefridium<br /> #Verbind: parapodia(polychaeta), radula(Gastropoda), Antennae(Arthropoda), Mesogloea(cnidaria), clitellum(Oligochaeta), Cleidoïsche ei(Reptilia), Ambulacra(Echinodermata), Gemmulae(Porifera)<br /> #Illustreer aan de hand van drie voorbeelden het belang van het tegenstroomprincipe en leg uit.<br /> #Leg het mechanisme uit van de elektrische impulsgeleiding door zenuwcellen.<br /> ===28 jan 2014 VM===<br /> #Begrippen:<br /> ##Gemmula<br /> ##Radula<br /> ##Corpora allata<br /> #Verbinden: termen van de vorig jaren.<br /> #Bespreken en vergelijken het mechanisme van gasuitwisseling bij longen zoogdieren en vogels<br /> #Welke hormonen worden gevormd in de gonaden bij de mens en regulatie.<br /> ===27 jan 2014===<br /> #Termen:<br /> ##Planula<br /> ##RNA interference<br /> ##Eutelie<br /> #Verbinden, opnieuw combinaite die hieronder al staat<br /> #Bespreek de structuur en het contractiemechanisme van skeletspieren. <br /> #Wat zijn de belangrijkste hormonen die door de schildklier geproduceerd worden en hoe worden ze gereguleerd?<br /> ===13 jan 2012===<br /> #Leg uit:<br /> ##Gremule<br /> ##Eutelie <br /> ##Amnion<br /> #Verbindt Latijnse namen met Latijnse namen. (letterlijk als in het voorbeeld examen)<br /> #Leg bondig uit: Skeletspier (structuur, werking en regulatie)<br /> #Welke hormonen spelen welke rol in de vrouwelijke voortplantingscycus?<br /> ===25 juni 2012===<br /> #Termen:<br /> ##Nematocyst ?<br /> ##Metamorfose  Lolofoo<br /> ##Amnion<br /> #Verbinden (Combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)<br /> #Bespreek en vergelijk drie types spierweefsel bij dieren.<br /> #Bespreek rol van gal en pancreas in de spijsvertering (in invertebraten). 5. Bespreek de regulatie van hartcyclus en bloeddruk (in zoogdieren).<br /> ===22 juni 2012===<br /> #Termen:<br /> ##Protonefridia<br /> ##Ecdysis<br /> ##Parthenogenese<br /> ##Mimicry<br /> ##Filariasis<br /> #Verbinden ( was combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)<br /> #bestrijding van plaagsoorten uitleggen<br /> #beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeën en longen<br /> #Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel<br /> ===19 juni 2012===<br /> #Termen:<br /> ##Feromoon<br /> ##Dauer<br /> ##Regressieve evolutie<br /> ##Endostyl <br /> #Verbinden. Allemaal termen uit de vragen van vorige jaren.<br /> #Geef de levenscyclus van de runderlintworm en bespreek.<br /> #Leg het tegenstroomprincipe uit aan de hand van drie voorbeelden.<br /> #Bespreek structuur en werking van de hypofyse. Welke hormonen zijn aanwezig in de hypofyse?<br /> ===24 juni 2011===<br /> #Termen:<br /> ##Protonefridia<br /> ##regressieve evolutie<br /> ##Pseudocoeloom <br /> ##Dauer <br /> ##oncosfeer<br /> #Verbinden:<br /> ##spicula, proglottiden, Clitellum, lofofoor, endocuticula, choanen, lijmcellen, rhopalia<br /> ##Ctenophora, Cestoda, Ectoprocta, Arthropoda, porifera, Sarcopterygii, Cnidaria, oligochaeta<br /> #bestrijding van plaagsoorten uitleggen<br /> #beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeën en longen<br /> #welke hormonen reguleren het mannelijk voortplantingsstelsel (bij de mens)?<br /> ===23 juni 2011===<br /> #Termen:<br /> ##Planula<br /> ##Cephalisatie<br /> ##Enterocoel<br /> ##Ecdysis<br /> ##RNA interference<br /> #Verbinden: Parapodia, Spiraalplooi, antennae, scolex, choanen, lofofoor, lijmcellen,osculum<br /> #Bespreek de evolutie van de mens (bondig)<br /> #Bespreek de structuur van een lichaamsspier en de contractie er van 5. Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel<br /> ===21 juni 2011===<br /> #Termen:<br /> ##Gemmula<br /> ##Adaptieve radiatie<br /> ##Eutelie <br /> ##Rhopalia <br /> #Verbinden:<br /> ##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum<br /> ##Aves, Osteichthyes, Chelicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea<br /> #Bespreek bioluminiscentie.<br /> #Hoe wordt de glucoseconcentratie in het plasma gereguleerd. 5. Bespreek de hormonen bij de menselijke voortplantingscyclus.<br /> ===21 juni 2010 NM===<br /> #Termen:<br /> ##Regeneratie<br /> ##Protonefridia<br /> ##Scolex<br /> ##Corpora allata<br /> #Verbinden:<br /> ##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum<br /> ##Aves, Osteichthyes, Chicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea<br /> #Wat weet je over de evolutie van de mens. Bespreek bondig.<br /> #Bespreek hartcyclus en bloedsomloop (bij zoogdieren) en de regulatie daarvan.<br /> #Illustreer aan de hand van een voorbeeld het belang van het tegenstroomprincipe bij uitwisselingsprocessen.<br /> ===21 juni 2010 VM===<br /> #Termen:<br /> ##Pseudocoeloom <br /> ##Clitellum <br /> ##Dauer<br /> ##Endostyl<br /> ##Corpora cardiata<br /> #Verbinden:<br /> ##Antennae, Osculum, Spiraalplooi, Choanen, Parapodia, Scolex, Lijmcellen, Lofofoor<br /> ##Ctenophora, Ectoprocta, Cestoda, Porifera, Sarcopterygii, Condrichtyes, Crustacea, Polychaeta<br /> #Schets de levenscyclus van Schistosoma.<br /> #Vergelijk 3 types spierweefsel en leg het mechanisme van contractie uit. 5. Bespreek de hormonale regulatie van de menstruele cyclus.<br /> ===18 juni 2010===<br /> #woordjes:<br /> ##adaptieve radiatie  ascon<br /> ##nematocyst<br /> ##eutelie<br /> ##lofofoor<br /> #verbinden: spicula (porifera), ambulacra (echinodermata), antennae (insecta), melkklieren (mammalia), rhopalia (cnidaria), proglottiden (cestoda), pseudocoel (nematoda), clitellum (huridinae)<br /> #bestrijding van plaagsoorten uitleggen<br /> #vergelijken van osmoregulatie bij zout- en zoetwatervissen 5. principe van impulsgeleiding in zenuwcellen<br /> ===15 juni 2006===<br /> #woordjes:<br /> ##regressieve evolutie <br /> ##mimicry<br /> ##filariasis<br /> ##ecdysis<br /> ##parthenogenese<br /> #verbinden: radula (gastropoda), ambulacra (echinodermata), antennae (arthropoda), cloeidisch ei (reptilia), gemmulae (porifera), mesogloea (cnidaria), parapodium (polychaeta), lofofoor (brachiopoda)<br /> #principe van bioluminiscentie in victoria aequorine uitleggen<br /> #beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeën en longen<br /> #geef functie, structuur en regulatie van de hypofyse + welke hormonen komen erbij voor</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Structurele_en_Fysiologische_Biologie&diff=583 2017-08-21T14:17:02Z

<p>0653300: /* Examenvragen DIER */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> ==Examenvragen PLANT==<br /> ===21 aug 2017===<br /> #meerkeuzevragen<br /> #plantenhormonen met werking geven + uitleggen hoe hormoonsysteem in planten werkt<br /> #guttatie en waterpotentiaal bondig uitleggen<br /> #cyclus bedektzadigen aanvullen<br /> <br /> ===31 jan 2017===<br /> #Meerkeuzevragen<br /> #Waterpotentiaal met zijn 2 componenten uitleggen. Wat gebeurt er als je opgeloste stoffen toevoegt aan het omgevings water?<br /> #Massastroming en SAR uitleggen.<br /> #Cyclus van bedektzadigen aanvullen.<br /> <br /> ===26 jan 2016===<br /> #8 meerkeuze vragen<br /> #Mondelinge hoofdvraag: hoe wordt sucrose gevormd, hoe komt het in cortexe cellen van de wortels en wat is de bijdrage voor de accumulatie van K+ <br /> #Bijvraag: leg chemiosmose en fotorespiratie uit<br /> #Bijvraag: cyclus aanvullen van de bedektzadigen<br /> <br /> ===30 jan 2014 nm===<br /> #Meerkeuze<br /> #Welke hormonen zijn er bij planten, welke staan in voor apicale dominantie en hoe werkt dit.<br /> #Leg uit hoe herbicide resistentie werkt en leg het mechanisme van glyphosfaat uit. Levenscyclus.<br /> ===29 jan 2014 nm===<br /> #Meerkeuze<br /> #Bespreek de diversiteit van fungi en geef de levenscyclus van een ascomyceet.<br /> #Bespreek de rol van mieren in commensalisme en de overdracht van parasieten.<br /> #Levenscyclus van varens.<br /> ===28 jan 2014 nm===<br /> #8 meerkeuzevragen (4 punten)<br /> #Bespreek de huidige wereldproblemen en geef aan hoe plantenbiotechnologie/biologie zou kunnen bijdragen tot het aanreiken van van oplossingen (8 punten)<br /> #Vul aan en verklaar dit ecologisch model (Bottom-up effect). Hoe kon dit model op experimentele wijze geverifieerd worden? (3 punten) <br /> #Levenscyclus bedektzadige aanvullen (5 punten)<br /> ===28 jan 2014 vm===<br /> #Meerkeuze<br /> #Plantenhormonen welke types? regulatie? welke komen voor bij apicale dominantie? Regulatie? Werking?<br /> #Levenscyclus bladmossen<br /> #Tekening van de muis, mier, plant, zaad (interacties verklaren)<br /> ===27 jan 2014===<br /> # 8 meerkeuzevragen.<br /> #Bespreek de diversiteit en evolutie van prokaryoten en het onstaan van eukaryoten.<br /> # Figuur uitleggen over bottom-upeffecten en ontbrekende termen aanvllen. <br /> #Foto van doorsnede monocotyl blad: wat is het + delen benoemen.<br /> ===13 jan 2014===<br /> # 5 meerkeuzevragen.<br /> #Aanvullen van termen en processen (mitose/meiose) bij de levenscyvlus van gymnospermen. (Letterlijk uit het handboek fig. 31.12 p609)<br /> #Een plantencel in zuiver water en geleidelijk aan zout toevoegen, wat gebeurt er? Leg uit a.d.h.v. een duidelijke grafiek.<br /> #Wat is een preprofaseband? (en nog een term ?? uitleggen)<br /> ===23 jan 2012===<br /> #Leg uit wat er zal gebeuren bij een plantencel in zuiver water en wat als je opgeloste stoffen toevoegt aan de omgeving. Maak een schema aan de hand van de waterpotentiaal en zijn 2 subcomponenten en leg uit hoe deze veranderen.<br /> #Leg uit fotorespiratie: hoe wat waarom waar. <br /> #Situeer:<br /> ##glyphosaat<br /> ##methanogeen<br /> ##guttatie<br /> ##Mycorrhiza<br /> #Levenscyclus. Aangeven om welke levenscyclus het ging (bladmossen) en beargumenteren. Structuren en processen aanvullen op tekening. Aangeven of het een haplonte, diplonte of haplodiplonte levenscyclys was.<br /> ===1 feb 2011 VM===<br /> #Volledige weg beschrijven die een C-atoom aflegt als CO2 indien ingebouwd in pectine in de celwand van rhizodermiscellen. Waaruit bestaat de celwand en wat is de functie?<br /> #Bespreek in detail de signaalgeving en metabolische wegen van Rhizobium in symbiose met een plant.<br /> #. Figuur: levenscyclus bedektzadigen <br /> #Situeer:<br /> ##hexaploïdie by tarwe<br /> ##cavitatie<br /> ##gespvorming by Basidiomyceten  induceerbare mutaties<br /> ===27 jan 2011 NM===<br /> #Volledige weg beschrijven die een N-atoom aflegt van de bodem tot inbouw als glycoproteïne in een bladepidermiscel<br /> #Vgl mossen en angiospermen. Zeggen hoe deze zijn aangepast aan leven op het land<br /> #Figuur: <br /> ##structuur van een blad met huidmondjes <br /> ##hetzelfde -.- <br /> #Situeer:<br /> ##allotetraploïdie<br /> ##guttatie<br /> ##sterke vs zwakke sinks<br /> ##bespreek metabolisme Archaea<br /> <br /> ===24 jan 2011 NM===<br /> #De waterpotentiaal en de 2 componenten ervan bespreken als we een cel in zuiver water hebben en daar geleidelijk aan zout aan toevoegen. Schematisch weergeven en stap voor stap bespreken wat er met de cel gebeurt.<br /> #Het verschil tussen gametofytische en sporofytische incompatibiliteit uitleggen. En een model geven voor gametofytische incompatibiliteit.<br /> #Figuur: <br /> ##Doorsnede monocotyle stengel <br /> ##Vaatbundel en daarop floeem,<br /> ##xyleem en vezelschede benoemen<br /> #Situeer:<br /> ##Endosymbiose<br /> ##Viroïden<br /> ##Soortkruisingen<br /> ##Lenticel<br /> ===24 jan 2011 VM===<br /> #Bespreek structuur, samenstelling, functie en oorsprong van de plantencelwand.<br /> #Bespreek de verschillen tussen C3, C4 en CAM<br /> #Figuur: monokotyle stengel met vaatbundel<br /> #Situeer:<br /> ##hydrogenosoom<br /> ##Agrobacterium tumefaciens<br /> ##massastroming (Munch hypothese) <br /> ##terminatortechnologie<br /> ===25 jan 2010 VM===<br /> #Teken een dwarsdoorsnede van een wortel van een monokotyle plant. Wat is het verschil met een dikotyle plant?<br /> #Bespreek (fysiologisch en chemisch) de weg die een CO2 molecule aflegt vanuit de lucht om ingebouwd de worden in de celwand van een<br /> rhizodermiscel.<br /> #Vergelijk CO2 fixatie bij C3 en C4 planten. Wat zijn de ethiologische implicaties?<br /> #ABC van de bloemetjes<br /> #Situeer:<br /> #Soortkruising<br /> #Isospore haplodiplont <br /> #Worteldruk<br /> #Basidiomyceten<br /> #Archebacteria<br /> ===18 jan 2010 NM===<br /> #Bespreek de mogelijkheden voor overdracht van genetische informatie tussen individuen die tot een andere soort behoren.<br /> #Vul volgende figuur aan en bespreek (die van potentiaal, niet met de kleurtjes, degene die ook in de cursus staat).<br /> #Vergelijk CO2 fixatie bij CAM en C4 planten. 4. ABC van de bloemen.<br /> #Situeer en bespreek:<br /> ##ascomyceten,<br /> ##heterospore haplodiplonten<br /> ##3 figuren: (een stengel ==&amp;gt; figuur helemaal onderaan rechts in voorbeeldvragen, een blad ==&amp;gt; die gele figuur zo :p en een wortel ==&amp;gt; laatste blz, rechts bovenaan)<br /> ===18 jan 2010 VM===<br /> #Bespreek autotrofie bij prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Gametofytische incompatibiliteit.<br /> #Fotorespiratie: wat, waar, hoe, waarom?<br /> #Vul aan en bespreek zodat duidelijk wordt of het om een haplont, diplont of haplodiplont organisme gaat. Is dit type organisme al goed aangepast aan het landleven? (figuur van varens, zie voorbeeldvragen) <br /> #Situeer en bespreek:<br /> ##3 figuren (monokotyl blad, dikotyle verdikte stengel, monokotyle vaatbundel),<br /> ##agrobacterium tumefaciens<br /> ##basidiomyceten.<br /> ===26 jan 2009===<br /> #Plantencelwand: Samenstelling? Structuur? Functie? Oorsprong?<br /> #Transport in planten: Hoe? Waar? Waarom?<br /> #C4 en CAM planten: Wat? Waarom? Hoe? Verschil?<br /> #Afbeelding van een diplohaplonte cyclus, en zeggen of deze plant al goed<br /> is aangepast aan het leven op het land. <br /> #Termen:<br /> ##Soortkruising<br /> ##Agrobacterium Tumefaciens<br /> ##Zelfincompatibiliteit<br /> ##Het ABC van de bloemetjes<br /> ##Fotoke van dwarse doorsnede van een plantenstengel, zeggen wa ge ziet en van die dinge..<br /> ===19 jan 2009===<br /> #voortplantingscyclus (mos)<br /> #bespreek zo goed mogelijk de opnamen van N uit nitraat (chemisch/fysisch) en inbouw in celwandprotëine epidermiscel 3. teken primaire stengel dikotyle plant + verschil monokotyle<br /> #fotorespiratie: zin of onzin.<br /> #Termen:<br /> ##gametofytische zelfincompabiliteit <br /> ##ABC van bloemen<br /> ##worteldruk<br /> ##retrovirussen<br /> ===28 jan 2008===<br /> #vergelijk autotrofie bij eukaryoten en prokaryoten<br /> #fotorespiratie<br /> #zelf-incompabiliteit<br /> #cyclus van varen aanvullen + aangepassingen aan het land <br /> #Situeer:<br /> ##drie foto's <br /> ##Agrobacterium tumefaciens <br /> ##Basidiomyceet<br /> ===28 jan 2008===<br /> #primaire dikotyle wortel tekenen en bespreken, vergelijken met monokotyle <br /> #Welke fysische en chemische weg moet het N-atoom van NH4+ afleggen<br /> om ingebouwd te kunnen worden in een celwandproteïne van een blad<br /> #Grafieken van CO2-opname van C3 en C4 planten. Zelf assen invullen en c3 en c4 aanduiden + uitleggen waarom<br /> #Welke aanpassingen moet een landplant hebben ten opzichte van een wier<br /> om te kunnen overleven op het land en is dit bij alle zo <br /> #Bespreek:<br /> ##ascomyceten <br /> ##retrotransposons<br /> ##archeaebacteriën<br /> ##zelfincomptabiliteit<br /> ===21 jan 2008===<br /> #Hoe genetische informatie overbrengen tussen individuen van verschillende soorten denk ik<br /> #Bespreek en vul aan die figuur van de waterpotentiaal in een cel<br /> #leg uit hoe CO2 wordt gefixeerd bij C4 planten en CAM planten en vergelijk <br /> #geef een schematische voorstelling en een voorbeeld van een heterospore haplodiplont cyclus <br /> #Situeer:<br /> ##Ascomyceten<br /> ##zelfincompatibiliteit<br /> ## 3 foto'kes ( stengel, wortel en blad)<br /> ===18 jan 2008===<br /> #teken structuur monocotyle wortel, vgl met dicotyle<br /> #bespreek fixatie co2 bij C4-C3 planten, ahv voor en nadelen<br /> #voortplantingscyclus (van ascomyceten, was wel niet gegeven da het over asco ging ) aanvullen en uitleggen waarom het haplont/diplont/diplohaplont is<br /> #bespreek hoe C via co2 kan ingebouwd worden in de rizodhermiscellen (<br /> zowel fysich als chemisch ) <br /> #Situeer en bespreek:<br /> ##worteldruk<br /> ##basidiomyceten <br /> ##archeaebacteriën<br /> ##soortbestuiving<br /> ##retrovirussen<br /> ===14 jan 2008===<br /> #Celwand: Samenstelling? Functie? Oorsprong? Structuur?<br /> #Vergelijk het transport van mineralen en het transport van<br /> fotosyntheseproducten<br /> #Je gaat op excursie om C3/C4/CAM planten te inventariseren. Wat voor<br /> materiaal neem je mee en leg uit.<br /> #Tekening van een voortplantingscyclus: Is dit haplont/diplont/haplodiplont? Leg uit en geef aan of en hoe deze plant aan het landleven aangepast is. <br /> #Situeer en bespreek:<br /> ##Zelfincopatibiliteit<br /> ##Agrobacterium tumefaciens<br /> ##3 tekeningen (doorsneden van stengel/wortel)<br /> ===2 feb 2007===<br /> #twee grafieken zonder aanduidingen &amp;quot;vul aan en verklaar&amp;quot;<br /> #genetische overdracht tussen individuen van dezelfde soort en verschillende soorten, leg uit<br /> ===15 jan 2007===<br /> #Vul volgende grafiek aan en bespreek (die van de waterpotentiaal van de omgeving t o v die in de plantencel) en hoe zit dit in 't xyleem? <br /> #Fotorespiratie: wat? waar? hoe? waarom?<br /> #Situeer:<br /> ##lenticellen<br /> ##heterospore<br /> ##haplodiplonten<br /> ##zygomyceten<br /> ##endodermis<br /> ##gametofytische incompatibiliteit<br /> ##agrobacterium tumefaciens<br /> <br /> ==Examenvragen DIER== <br /> ===21 aug 2017 VM===<br /> #verklaar: blastula, monocyt, convergete evolutie<br /> #verbind, ongeveer zelfde begrippen als vorige jaren + zweetklier (mammalia), zijlijn (osteichthyes)<br /> #Samenstelling van een spier + werking contractie<br /> #hoe wordt het glucose gehalte in het bloed gereguleerd, welke hormonen werken hierbij en waar worden ze gemaakt<br /> ===31 jan 2017===<br /> #Verklaar: dauer, ecdysis en filariasis.<br /> #Verbind, zelfde begrippen als voorgaande jaren.<br /> #Vergelijk zuurstof opname bij zoogdieren en insecten.<br /> #Hoe werkt het doorgeven van zenuwimpulsen?<br /> <br /> ===26 januarie 2016===<br /> #Termen: RNA interferentie, epifyse, prothorax<br /> #Verbinden<br /> #Uitleggen: 3 voorbeelden van tegenstroomprincipe en impulsgeleiding<br /> <br /> ===20 aug 2014===<br /> #Begrippen:<br /> ##adaptieve radiatie<br /> ##gremmula<br /> ##eutelie<br /> #Verbind:<br /> ##preenklier - spiraalplooi - pedipalpen - mesogloea - corpus alata - ambulacra - radula - citellum <br /> ##cnidaria - insecta - echinodermata - gestropoda - chondrichtys - hirunae - aves - chelicerata<br /> #Geef het mechanisme van de bioluminescentie bij aquora victoria<br /> #Bespreek de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.<br /> ===30 jan 2014===<br /> #Begrippen :<br /> ##Metanefridium<br /> ##Regeneratie<br /> ##Clitellum<br /> #Verbinden: mesogloea, speenklier, kieuwdeksel, pedipalp, ambulacra, corpora allata, spiraalplooi, radula<br /> #Leg de menstruatiecyclus uit en geef 3 voorbeelden van tegenstrooomprincipe<br /> ===29 jan 2014 NM===<br /> #Begrippen:<br /> ##Filiarsis<br /> ##Mimicry <br /> ##Corpora cardiaca<br /> #Verbinden: termen van de vorig jaren.<br /> #Leg de werking van longen en tracheën uit en vergelijk. Vergelijk<br /> osmoregulatie bij zoet-en zoutwatervissen.<br /> ===28 jan 2014 NM===<br /> #Termen:<br /> ##Lofofoor<br /> ##Adaptieve radiatie <br /> ##Protonefridium<br /> #Verbind: parapodia(polychaeta), radula(Gastropoda), Antennae(Arthropoda), Mesogloea(cnidaria), clitellum(Oligochaeta), Cleidoïsche ei(Reptilia), Ambulacra(Echinodermata), Gemmulae(Porifera)<br /> #Illustreer aan de hand van drie voorbeelden het belang van het tegenstroomprincipe en leg uit.<br /> #Leg het mechanisme uit van de elektrische impulsgeleiding door zenuwcellen.<br /> ===28 jan 2014 VM===<br /> #Begrippen:<br /> ##Gemmula<br /> ##Radula<br /> ##Corpora allata<br /> #Verbinden: termen van de vorig jaren.<br /> #Bespreken en vergelijken het mechanisme van gasuitwisseling bij longen zoogdieren en vogels<br /> #Welke hormonen worden gevormd in de gonaden bij de mens en regulatie.<br /> ===27 jan 2014===<br /> #Termen:<br /> ##Planula<br /> ##RNA interference<br /> ##Eutelie<br /> #Verbinden, opnieuw combinaite die hieronder al staat<br /> #Bespreek de structuur en het contractiemechanisme van skeletspieren. <br /> #Wat zijn de belangrijkste hormonen die door de schildklier geproduceerd worden en hoe worden ze gereguleerd?<br /> ===13 jan 2012===<br /> #Leg uit:<br /> ##Gremule<br /> ##Eutelie <br /> ##Amnion<br /> #Verbindt Latijnse namen met Latijnse namen. (letterlijk als in het voorbeeld examen)<br /> #Leg bondig uit: Skeletspier (structuur, werking en regulatie)<br /> #Welke hormonen spelen welke rol in de vrouwelijke voortplantingscycus?<br /> ===25 juni 2012===<br /> #Termen:<br /> ##Nematocyst ?<br /> ##Metamorfose  Lolofoo<br /> ##Amnion<br /> #Verbinden (Combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)<br /> #Bespreek en vergelijk drie types spierweefsel bij dieren.<br /> #Bespreek rol van gal en pancreas in de spijsvertering (in invertebraten). 5. Bespreek de regulatie van hartcyclus en bloeddruk (in zoogdieren).<br /> ===22 juni 2012===<br /> #Termen:<br /> ##Protonefridia<br /> ##Ecdysis<br /> ##Parthenogenese<br /> ##Mimicry<br /> ##Filariasis<br /> #Verbinden ( was combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)<br /> #bestrijding van plaagsoorten uitleggen<br /> #beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeën en longen<br /> #Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel<br /> ===19 juni 2012===<br /> #Termen:<br /> ##Feromoon<br /> ##Dauer<br /> ##Regressieve evolutie<br /> ##Endostyl <br /> #Verbinden. Allemaal termen uit de vragen van vorige jaren.<br /> #Geef de levenscyclus van de runderlintworm en bespreek.<br /> #Leg het tegenstroomprincipe uit aan de hand van drie voorbeelden.<br /> #Bespreek structuur en werking van de hypofyse. Welke hormonen zijn aanwezig in de hypofyse?<br /> ===24 juni 2011===<br /> #Termen:<br /> ##Protonefridia<br /> ##regressieve evolutie<br /> ##Pseudocoeloom <br /> ##Dauer <br /> ##oncosfeer<br /> #Verbinden:<br /> ##spicula, proglottiden, Clitellum, lofofoor, endocuticula, choanen, lijmcellen, rhopalia<br /> ##Ctenophora, Cestoda, Ectoprocta, Arthropoda, porifera, Sarcopterygii, Cnidaria, oligochaeta<br /> #bestrijding van plaagsoorten uitleggen<br /> #beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeën en longen<br /> #welke hormonen reguleren het mannelijk voortplantingsstelsel (bij de mens)?<br /> ===23 juni 2011===<br /> #Termen:<br /> ##Planula<br /> ##Cephalisatie<br /> ##Enterocoel<br /> ##Ecdysis<br /> ##RNA interference<br /> #Verbinden: Parapodia, Spiraalplooi, antennae, scolex, choanen, lofofoor, lijmcellen,osculum<br /> #Bespreek de evolutie van de mens (bondig)<br /> #Bespreek de structuur van een lichaamsspier en de contractie er van 5. Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel<br /> ===21 juni 2011===<br /> #Termen:<br /> ##Gemmula<br /> ##Adaptieve radiatie<br /> ##Eutelie <br /> ##Rhopalia <br /> #Verbinden:<br /> ##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum<br /> ##Aves, Osteichthyes, Chelicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea<br /> #Bespreek bioluminiscentie.<br /> #Hoe wordt de glucoseconcentratie in het plasma gereguleerd. 5. Bespreek de hormonen bij de menselijke voortplantingscyclus.<br /> ===21 juni 2010 NM===<br /> #Termen:<br /> ##Regeneratie<br /> ##Protonefridia<br /> ##Scolex<br /> ##Corpora allata<br /> #Verbinden:<br /> ##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum<br /> ##Aves, Osteichthyes, Chicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea<br /> #Wat weet je over de evolutie van de mens. Bespreek bondig.<br /> #Bespreek hartcyclus en bloedsomloop (bij zoogdieren) en de regulatie daarvan.<br /> #Illustreer aan de hand van een voorbeeld het belang van het tegenstroomprincipe bij uitwisselingsprocessen.<br /> ===21 juni 2010 VM===<br /> #Termen:<br /> ##Pseudocoeloom <br /> ##Clitellum <br /> ##Dauer<br /> ##Endostyl<br /> ##Corpora cardiata<br /> #Verbinden:<br /> ##Antennae, Osculum, Spiraalplooi, Choanen, Parapodia, Scolex, Lijmcellen, Lofofoor<br /> ##Ctenophora, Ectoprocta, Cestoda, Porifera, Sarcopterygii, Condrichtyes, Crustacea, Polychaeta<br /> #Schets de levenscyclus van Schistosoma.<br /> #Vergelijk 3 types spierweefsel en leg het mechanisme van contractie uit. 5. Bespreek de hormonale regulatie van de menstruele cyclus.<br /> ===18 juni 2010===<br /> #woordjes:<br /> ##adaptieve radiatie  ascon<br /> ##nematocyst<br /> ##eutelie<br /> ##lofofoor<br /> #verbinden: spicula (porifera), ambulacra (echinodermata), antennae (insecta), melkklieren (mammalia), rhopalia (cnidaria), proglottiden (cestoda), pseudocoel (nematoda), clitellum (huridinae)<br /> #bestrijding van plaagsoorten uitleggen<br /> #vergelijken van osmoregulatie bij zout- en zoetwatervissen 5. principe van impulsgeleiding in zenuwcellen<br /> ===15 juni 2006===<br /> #woordjes:<br /> ##regressieve evolutie <br /> ##mimicry<br /> ##filariasis<br /> ##ecdysis<br /> ##parthenogenese<br /> #verbinden: radula (gastropoda), ambulacra (echinodermata), antennae (arthropoda), cloeidisch ei (reptilia), gemmulae (porifera), mesogloea (cnidaria), parapodium (polychaeta), lofofoor (brachiopoda)<br /> #principe van bioluminiscentie in victoria aequorine uitleggen<br /> #beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeën en longen<br /> #geef functie, structuur en regulatie van de hypofyse + welke hormonen komen erbij voor</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Structurele_en_Fysiologische_Biologie&diff=582 2017-08-21T13:31:04Z

<p>0653300: /* Examenvragen PLANT */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> ==Examenvragen PLANT==<br /> ===21 aug 2017===<br /> #meerkeuzevragen<br /> #plantenhormonen met werking geven + uitleggen hoe hormoonsysteem in planten werkt<br /> #guttatie en waterpotentiaal bondig uitleggen<br /> #cyclus bedektzadigen aanvullen<br /> <br /> ===31 jan 2017===<br /> #Meerkeuzevragen<br /> #Waterpotentiaal met zijn 2 componenten uitleggen. Wat gebeurt er als je opgeloste stoffen toevoegt aan het omgevings water?<br /> #Massastroming en SAR uitleggen.<br /> #Cyclus van bedektzadigen aanvullen.<br /> <br /> ===26 jan 2016===<br /> #8 meerkeuze vragen<br /> #Mondelinge hoofdvraag: hoe wordt sucrose gevormd, hoe komt het in cortexe cellen van de wortels en wat is de bijdrage voor de accumulatie van K+ <br /> #Bijvraag: leg chemiosmose en fotorespiratie uit<br /> #Bijvraag: cyclus aanvullen van de bedektzadigen<br /> <br /> ===30 jan 2014 nm===<br /> #Meerkeuze<br /> #Welke hormonen zijn er bij planten, welke staan in voor apicale dominantie en hoe werkt dit.<br /> #Leg uit hoe herbicide resistentie werkt en leg het mechanisme van glyphosfaat uit. Levenscyclus.<br /> ===29 jan 2014 nm===<br /> #Meerkeuze<br /> #Bespreek de diversiteit van fungi en geef de levenscyclus van een ascomyceet.<br /> #Bespreek de rol van mieren in commensalisme en de overdracht van parasieten.<br /> #Levenscyclus van varens.<br /> ===28 jan 2014 nm===<br /> #8 meerkeuzevragen (4 punten)<br /> #Bespreek de huidige wereldproblemen en geef aan hoe plantenbiotechnologie/biologie zou kunnen bijdragen tot het aanreiken van van oplossingen (8 punten)<br /> #Vul aan en verklaar dit ecologisch model (Bottom-up effect). Hoe kon dit model op experimentele wijze geverifieerd worden? (3 punten) <br /> #Levenscyclus bedektzadige aanvullen (5 punten)<br /> ===28 jan 2014 vm===<br /> #Meerkeuze<br /> #Plantenhormonen welke types? regulatie? welke komen voor bij apicale dominantie? Regulatie? Werking?<br /> #Levenscyclus bladmossen<br /> #Tekening van de muis, mier, plant, zaad (interacties verklaren)<br /> ===27 jan 2014===<br /> # 8 meerkeuzevragen.<br /> #Bespreek de diversiteit en evolutie van prokaryoten en het onstaan van eukaryoten.<br /> # Figuur uitleggen over bottom-upeffecten en ontbrekende termen aanvllen. <br /> #Foto van doorsnede monocotyl blad: wat is het + delen benoemen.<br /> ===13 jan 2014===<br /> # 5 meerkeuzevragen.<br /> #Aanvullen van termen en processen (mitose/meiose) bij de levenscyvlus van gymnospermen. (Letterlijk uit het handboek fig. 31.12 p609)<br /> #Een plantencel in zuiver water en geleidelijk aan zout toevoegen, wat gebeurt er? Leg uit a.d.h.v. een duidelijke grafiek.<br /> #Wat is een preprofaseband? (en nog een term ?? uitleggen)<br /> ===23 jan 2012===<br /> #Leg uit wat er zal gebeuren bij een plantencel in zuiver water en wat als je opgeloste stoffen toevoegt aan de omgeving. Maak een schema aan de hand van de waterpotentiaal en zijn 2 subcomponenten en leg uit hoe deze veranderen.<br /> #Leg uit fotorespiratie: hoe wat waarom waar. <br /> #Situeer:<br /> ##glyphosaat<br /> ##methanogeen<br /> ##guttatie<br /> ##Mycorrhiza<br /> #Levenscyclus. Aangeven om welke levenscyclus het ging (bladmossen) en beargumenteren. Structuren en processen aanvullen op tekening. Aangeven of het een haplonte, diplonte of haplodiplonte levenscyclys was.<br /> ===1 feb 2011 VM===<br /> #Volledige weg beschrijven die een C-atoom aflegt als CO2 indien ingebouwd in pectine in de celwand van rhizodermiscellen. Waaruit bestaat de celwand en wat is de functie?<br /> #Bespreek in detail de signaalgeving en metabolische wegen van Rhizobium in symbiose met een plant.<br /> #. Figuur: levenscyclus bedektzadigen <br /> #Situeer:<br /> ##hexaploïdie by tarwe<br /> ##cavitatie<br /> ##gespvorming by Basidiomyceten  induceerbare mutaties<br /> ===27 jan 2011 NM===<br /> #Volledige weg beschrijven die een N-atoom aflegt van de bodem tot inbouw als glycoproteïne in een bladepidermiscel<br /> #Vgl mossen en angiospermen. Zeggen hoe deze zijn aangepast aan leven op het land<br /> #Figuur: <br /> ##structuur van een blad met huidmondjes <br /> ##hetzelfde -.- <br /> #Situeer:<br /> ##allotetraploïdie<br /> ##guttatie<br /> ##sterke vs zwakke sinks<br /> ##bespreek metabolisme Archaea<br /> <br /> ===24 jan 2011 NM===<br /> #De waterpotentiaal en de 2 componenten ervan bespreken als we een cel in zuiver water hebben en daar geleidelijk aan zout aan toevoegen. Schematisch weergeven en stap voor stap bespreken wat er met de cel gebeurt.<br /> #Het verschil tussen gametofytische en sporofytische incompatibiliteit uitleggen. En een model geven voor gametofytische incompatibiliteit.<br /> #Figuur: <br /> ##Doorsnede monocotyle stengel <br /> ##Vaatbundel en daarop floeem,<br /> ##xyleem en vezelschede benoemen<br /> #Situeer:<br /> ##Endosymbiose<br /> ##Viroïden<br /> ##Soortkruisingen<br /> ##Lenticel<br /> ===24 jan 2011 VM===<br /> #Bespreek structuur, samenstelling, functie en oorsprong van de plantencelwand.<br /> #Bespreek de verschillen tussen C3, C4 en CAM<br /> #Figuur: monokotyle stengel met vaatbundel<br /> #Situeer:<br /> ##hydrogenosoom<br /> ##Agrobacterium tumefaciens<br /> ##massastroming (Munch hypothese) <br /> ##terminatortechnologie<br /> ===25 jan 2010 VM===<br /> #Teken een dwarsdoorsnede van een wortel van een monokotyle plant. Wat is het verschil met een dikotyle plant?<br /> #Bespreek (fysiologisch en chemisch) de weg die een CO2 molecule aflegt vanuit de lucht om ingebouwd de worden in de celwand van een<br /> rhizodermiscel.<br /> #Vergelijk CO2 fixatie bij C3 en C4 planten. Wat zijn de ethiologische implicaties?<br /> #ABC van de bloemetjes<br /> #Situeer:<br /> #Soortkruising<br /> #Isospore haplodiplont <br /> #Worteldruk<br /> #Basidiomyceten<br /> #Archebacteria<br /> ===18 jan 2010 NM===<br /> #Bespreek de mogelijkheden voor overdracht van genetische informatie tussen individuen die tot een andere soort behoren.<br /> #Vul volgende figuur aan en bespreek (die van potentiaal, niet met de kleurtjes, degene die ook in de cursus staat).<br /> #Vergelijk CO2 fixatie bij CAM en C4 planten. 4. ABC van de bloemen.<br /> #Situeer en bespreek:<br /> ##ascomyceten,<br /> ##heterospore haplodiplonten<br /> ##3 figuren: (een stengel ==&amp;gt; figuur helemaal onderaan rechts in voorbeeldvragen, een blad ==&amp;gt; die gele figuur zo :p en een wortel ==&amp;gt; laatste blz, rechts bovenaan)<br /> ===18 jan 2010 VM===<br /> #Bespreek autotrofie bij prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Gametofytische incompatibiliteit.<br /> #Fotorespiratie: wat, waar, hoe, waarom?<br /> #Vul aan en bespreek zodat duidelijk wordt of het om een haplont, diplont of haplodiplont organisme gaat. Is dit type organisme al goed aangepast aan het landleven? (figuur van varens, zie voorbeeldvragen) <br /> #Situeer en bespreek:<br /> ##3 figuren (monokotyl blad, dikotyle verdikte stengel, monokotyle vaatbundel),<br /> ##agrobacterium tumefaciens<br /> ##basidiomyceten.<br /> ===26 jan 2009===<br /> #Plantencelwand: Samenstelling? Structuur? Functie? Oorsprong?<br /> #Transport in planten: Hoe? Waar? Waarom?<br /> #C4 en CAM planten: Wat? Waarom? Hoe? Verschil?<br /> #Afbeelding van een diplohaplonte cyclus, en zeggen of deze plant al goed<br /> is aangepast aan het leven op het land. <br /> #Termen:<br /> ##Soortkruising<br /> ##Agrobacterium Tumefaciens<br /> ##Zelfincompatibiliteit<br /> ##Het ABC van de bloemetjes<br /> ##Fotoke van dwarse doorsnede van een plantenstengel, zeggen wa ge ziet en van die dinge..<br /> ===19 jan 2009===<br /> #voortplantingscyclus (mos)<br /> #bespreek zo goed mogelijk de opnamen van N uit nitraat (chemisch/fysisch) en inbouw in celwandprotëine epidermiscel 3. teken primaire stengel dikotyle plant + verschil monokotyle<br /> #fotorespiratie: zin of onzin.<br /> #Termen:<br /> ##gametofytische zelfincompabiliteit <br /> ##ABC van bloemen<br /> ##worteldruk<br /> ##retrovirussen<br /> ===28 jan 2008===<br /> #vergelijk autotrofie bij eukaryoten en prokaryoten<br /> #fotorespiratie<br /> #zelf-incompabiliteit<br /> #cyclus van varen aanvullen + aangepassingen aan het land <br /> #Situeer:<br /> ##drie foto's <br /> ##Agrobacterium tumefaciens <br /> ##Basidiomyceet<br /> ===28 jan 2008===<br /> #primaire dikotyle wortel tekenen en bespreken, vergelijken met monokotyle <br /> #Welke fysische en chemische weg moet het N-atoom van NH4+ afleggen<br /> om ingebouwd te kunnen worden in een celwandproteïne van een blad<br /> #Grafieken van CO2-opname van C3 en C4 planten. Zelf assen invullen en c3 en c4 aanduiden + uitleggen waarom<br /> #Welke aanpassingen moet een landplant hebben ten opzichte van een wier<br /> om te kunnen overleven op het land en is dit bij alle zo <br /> #Bespreek:<br /> ##ascomyceten <br /> ##retrotransposons<br /> ##archeaebacteriën<br /> ##zelfincomptabiliteit<br /> ===21 jan 2008===<br /> #Hoe genetische informatie overbrengen tussen individuen van verschillende soorten denk ik<br /> #Bespreek en vul aan die figuur van de waterpotentiaal in een cel<br /> #leg uit hoe CO2 wordt gefixeerd bij C4 planten en CAM planten en vergelijk <br /> #geef een schematische voorstelling en een voorbeeld van een heterospore haplodiplont cyclus <br /> #Situeer:<br /> ##Ascomyceten<br /> ##zelfincompatibiliteit<br /> ## 3 foto'kes ( stengel, wortel en blad)<br /> ===18 jan 2008===<br /> #teken structuur monocotyle wortel, vgl met dicotyle<br /> #bespreek fixatie co2 bij C4-C3 planten, ahv voor en nadelen<br /> #voortplantingscyclus (van ascomyceten, was wel niet gegeven da het over asco ging ) aanvullen en uitleggen waarom het haplont/diplont/diplohaplont is<br /> #bespreek hoe C via co2 kan ingebouwd worden in de rizodhermiscellen (<br /> zowel fysich als chemisch ) <br /> #Situeer en bespreek:<br /> ##worteldruk<br /> ##basidiomyceten <br /> ##archeaebacteriën<br /> ##soortbestuiving<br /> ##retrovirussen<br /> ===14 jan 2008===<br /> #Celwand: Samenstelling? Functie? Oorsprong? Structuur?<br /> #Vergelijk het transport van mineralen en het transport van<br /> fotosyntheseproducten<br /> #Je gaat op excursie om C3/C4/CAM planten te inventariseren. Wat voor<br /> materiaal neem je mee en leg uit.<br /> #Tekening van een voortplantingscyclus: Is dit haplont/diplont/haplodiplont? Leg uit en geef aan of en hoe deze plant aan het landleven aangepast is. <br /> #Situeer en bespreek:<br /> ##Zelfincopatibiliteit<br /> ##Agrobacterium tumefaciens<br /> ##3 tekeningen (doorsneden van stengel/wortel)<br /> ===2 feb 2007===<br /> #twee grafieken zonder aanduidingen &amp;quot;vul aan en verklaar&amp;quot;<br /> #genetische overdracht tussen individuen van dezelfde soort en verschillende soorten, leg uit<br /> ===15 jan 2007===<br /> #Vul volgende grafiek aan en bespreek (die van de waterpotentiaal van de omgeving t o v die in de plantencel) en hoe zit dit in 't xyleem? <br /> #Fotorespiratie: wat? waar? hoe? waarom?<br /> #Situeer:<br /> ##lenticellen<br /> ##heterospore<br /> ##haplodiplonten<br /> ##zygomyceten<br /> ##endodermis<br /> ##gametofytische incompatibiliteit<br /> ##agrobacterium tumefaciens<br /> <br /> ==Examenvragen DIER== <br /> ===31 jan 2017===<br /> #Verklaar: dauer, ecdysis en filariasis.<br /> #Verbind, zelfde begrippen als voorgaande jaren.<br /> #Vergelijk zuurstof opname bij zoogdieren en insecten.<br /> #Hoe werkt het doorgeven van zenuwimpulsen?<br /> <br /> ===26 januarie 2016===<br /> #Termen: RNA interferentie, epifyse, prothorax<br /> #Verbinden<br /> #Uitleggen: 3 voorbeelden van tegenstroomprincipe en impulsgeleiding<br /> <br /> ===20 aug 2014===<br /> #Begrippen:<br /> ##adaptieve radiatie<br /> ##gremmula<br /> ##eutelie<br /> #Verbind:<br /> ##preenklier - spiraalplooi - pedipalpen - mesogloea - corpus alata - ambulacra - radula - citellum <br /> ##cnidaria - insecta - echinodermata - gestropoda - chondrichtys - hirunae - aves - chelicerata<br /> #Geef het mechanisme van de bioluminescentie bij aquora victoria<br /> #Bespreek de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.<br /> ===30 jan 2014===<br /> #Begrippen :<br /> ##Metanefridium<br /> ##Regeneratie<br /> ##Clitellum<br /> #Verbinden: mesogloea, speenklier, kieuwdeksel, pedipalp, ambulacra, corpora allata, spiraalplooi, radula<br /> #Leg de menstruatiecyclus uit en geef 3 voorbeelden van tegenstrooomprincipe<br /> ===29 jan 2014 NM===<br /> #Begrippen:<br /> ##Filiarsis<br /> ##Mimicry <br /> ##Corpora cardiaca<br /> #Verbinden: termen van de vorig jaren.<br /> #Leg de werking van longen en tracheën uit en vergelijk. Vergelijk<br /> osmoregulatie bij zoet-en zoutwatervissen.<br /> ===28 jan 2014 NM===<br /> #Termen:<br /> ##Lofofoor<br /> ##Adaptieve radiatie <br /> ##Protonefridium<br /> #Verbind: parapodia(polychaeta), radula(Gastropoda), Antennae(Arthropoda), Mesogloea(cnidaria), clitellum(Oligochaeta), Cleidoïsche ei(Reptilia), Ambulacra(Echinodermata), Gemmulae(Porifera)<br /> #Illustreer aan de hand van drie voorbeelden het belang van het tegenstroomprincipe en leg uit.<br /> #Leg het mechanisme uit van de elektrische impulsgeleiding door zenuwcellen.<br /> ===28 jan 2014 VM===<br /> #Begrippen:<br /> ##Gemmula<br /> ##Radula<br /> ##Corpora allata<br /> #Verbinden: termen van de vorig jaren.<br /> #Bespreken en vergelijken het mechanisme van gasuitwisseling bij longen zoogdieren en vogels<br /> #Welke hormonen worden gevormd in de gonaden bij de mens en regulatie.<br /> ===27 jan 2014===<br /> #Termen:<br /> ##Planula<br /> ##RNA interference<br /> ##Eutelie<br /> #Verbinden, opnieuw combinaite die hieronder al staat<br /> #Bespreek de structuur en het contractiemechanisme van skeletspieren. <br /> #Wat zijn de belangrijkste hormonen die door de schildklier geproduceerd worden en hoe worden ze gereguleerd?<br /> ===13 jan 2012===<br /> #Leg uit:<br /> ##Gremule<br /> ##Eutelie <br /> ##Amnion<br /> #Verbindt Latijnse namen met Latijnse namen. (letterlijk als in het voorbeeld examen)<br /> #Leg bondig uit: Skeletspier (structuur, werking en regulatie)<br /> #Welke hormonen spelen welke rol in de vrouwelijke voortplantingscycus?<br /> ===25 juni 2012===<br /> #Termen:<br /> ##Nematocyst ?<br /> ##Metamorfose  Lolofoo<br /> ##Amnion<br /> #Verbinden (Combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)<br /> #Bespreek en vergelijk drie types spierweefsel bij dieren.<br /> #Bespreek rol van gal en pancreas in de spijsvertering (in invertebraten). 5. Bespreek de regulatie van hartcyclus en bloeddruk (in zoogdieren).<br /> ===22 juni 2012===<br /> #Termen:<br /> ##Protonefridia<br /> ##Ecdysis<br /> ##Parthenogenese<br /> ##Mimicry<br /> ##Filariasis<br /> #Verbinden ( was combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)<br /> #bestrijding van plaagsoorten uitleggen<br /> #beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeën en longen<br /> #Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel<br /> ===19 juni 2012===<br /> #Termen:<br /> ##Feromoon<br /> ##Dauer<br /> ##Regressieve evolutie<br /> ##Endostyl <br /> #Verbinden. Allemaal termen uit de vragen van vorige jaren.<br /> #Geef de levenscyclus van de runderlintworm en bespreek.<br /> #Leg het tegenstroomprincipe uit aan de hand van drie voorbeelden.<br /> #Bespreek structuur en werking van de hypofyse. Welke hormonen zijn aanwezig in de hypofyse?<br /> ===24 juni 2011===<br /> #Termen:<br /> ##Protonefridia<br /> ##regressieve evolutie<br /> ##Pseudocoeloom <br /> ##Dauer <br /> ##oncosfeer<br /> #Verbinden:<br /> ##spicula, proglottiden, Clitellum, lofofoor, endocuticula, choanen, lijmcellen, rhopalia<br /> ##Ctenophora, Cestoda, Ectoprocta, Arthropoda, porifera, Sarcopterygii, Cnidaria, oligochaeta<br /> #bestrijding van plaagsoorten uitleggen<br /> #beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeën en longen<br /> #welke hormonen reguleren het mannelijk voortplantingsstelsel (bij de mens)?<br /> ===23 juni 2011===<br /> #Termen:<br /> ##Planula<br /> ##Cephalisatie<br /> ##Enterocoel<br /> ##Ecdysis<br /> ##RNA interference<br /> #Verbinden: Parapodia, Spiraalplooi, antennae, scolex, choanen, lofofoor, lijmcellen,osculum<br /> #Bespreek de evolutie van de mens (bondig)<br /> #Bespreek de structuur van een lichaamsspier en de contractie er van 5. Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel<br /> ===21 juni 2011===<br /> #Termen:<br /> ##Gemmula<br /> ##Adaptieve radiatie<br /> ##Eutelie <br /> ##Rhopalia <br /> #Verbinden:<br /> ##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum<br /> ##Aves, Osteichthyes, Chelicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea<br /> #Bespreek bioluminiscentie.<br /> #Hoe wordt de glucoseconcentratie in het plasma gereguleerd. 5. Bespreek de hormonen bij de menselijke voortplantingscyclus.<br /> ===21 juni 2010 NM===<br /> #Termen:<br /> ##Regeneratie<br /> ##Protonefridia<br /> ##Scolex<br /> ##Corpora allata<br /> #Verbinden:<br /> ##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum<br /> ##Aves, Osteichthyes, Chicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea<br /> #Wat weet je over de evolutie van de mens. Bespreek bondig.<br /> #Bespreek hartcyclus en bloedsomloop (bij zoogdieren) en de regulatie daarvan.<br /> #Illustreer aan de hand van een voorbeeld het belang van het tegenstroomprincipe bij uitwisselingsprocessen.<br /> ===21 juni 2010 VM===<br /> #Termen:<br /> ##Pseudocoeloom <br /> ##Clitellum <br /> ##Dauer<br /> ##Endostyl<br /> ##Corpora cardiata<br /> #Verbinden:<br /> ##Antennae, Osculum, Spiraalplooi, Choanen, Parapodia, Scolex, Lijmcellen, Lofofoor<br /> ##Ctenophora, Ectoprocta, Cestoda, Porifera, Sarcopterygii, Condrichtyes, Crustacea, Polychaeta<br /> #Schets de levenscyclus van Schistosoma.<br /> #Vergelijk 3 types spierweefsel en leg het mechanisme van contractie uit. 5. Bespreek de hormonale regulatie van de menstruele cyclus.<br /> ===18 juni 2010===<br /> #woordjes:<br /> ##adaptieve radiatie  ascon<br /> ##nematocyst<br /> ##eutelie<br /> ##lofofoor<br /> #verbinden: spicula (porifera), ambulacra (echinodermata), antennae (insecta), melkklieren (mammalia), rhopalia (cnidaria), proglottiden (cestoda), pseudocoel (nematoda), clitellum (huridinae)<br /> #bestrijding van plaagsoorten uitleggen<br /> #vergelijken van osmoregulatie bij zout- en zoetwatervissen 5. principe van impulsgeleiding in zenuwcellen<br /> ===15 juni 2006===<br /> #woordjes:<br /> ##regressieve evolutie <br /> ##mimicry<br /> ##filariasis<br /> ##ecdysis<br /> ##parthenogenese<br /> #verbinden: radula (gastropoda), ambulacra (echinodermata), antennae (arthropoda), cloeidisch ei (reptilia), gemmulae (porifera), mesogloea (cnidaria), parapodium (polychaeta), lofofoor (brachiopoda)<br /> #principe van bioluminiscentie in victoria aequorine uitleggen<br /> #beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeën en longen<br /> #geef functie, structuur en regulatie van de hypofyse + welke hormonen komen erbij voor</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Celbiologie_en_biochemie&diff=505 2017-06-20T11:00:42Z

<p>0653300: /* Examenvragen vanaf 2013 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> Vanaf 2012-2013: Jaarvak voor zowel chemie als biochemie. Volledig gedoceerd door Patrick Van Dijck.<br /> Vanaf 2009-2010: Voor de chemisten zijn het twee vakken, voor de biochemisten 1 jaarvak. <br /> De chemisten hebben dus examen in januari en juni, de biochemisten enkel in juni.<br /> Tussen 2007-2009: Voor de chemisten zijn het twee vakken, voor de biochemisten 1 jaarvak.<br /> Voor 2006-2007: Semestervak, gedoceerd door Johan Thevelein.<br /> <br /> =Examenvragen vanaf 2013=<br /> ===20 juni 2017===<br /> #Een tekening maken van de secretieweg van DNA tot enzyme dat aan celwand werkt uitleggen<br /> #Actief transport bij bacteriën, schimmels en dieren uitleggen, met glucose als voorbeeld<br /> #Je wil 6 proteïnen scheiden door een anionuitwisselingschromatografie uit te voeren, welke stappen zijn hierbij? Plus tekening<br /> #Hoeveel glycerol heb je nodig ter vorming van 4 moleculen tripalmitine? Hoeveel ATP is er over na volledige verademing van uw restproducten en reducerend vermogen? + reactie geven hoe je eraan komt<br /> #2 foto's aanduiden alles dat je herkent en de functie ervan geven<br /> #5 termen verklaren: apoptosoom, DNA primase, N-acetylglucosamine, proplastide en Km <br /> <br /> ===21 juni 2016===<br /> #cytokinese dier &amp; plant<br /> #donkerracties en verschil C3,C4 en CAM <br /> #adrenaline<br /> #vriesbreuk en vriezers<br /> #ato berekenen in cyclus<br /> #fotokes van vet en golgi app<br /> <br /> ===20 juni 2016 ===<br /> #bespreek celwand van bacterien en schimmels op vlak van structuur, functie en chemische samenstelling<br /> #inductie en repressie uitleggen adhv lac-operon en trp-operon<br /> #oef: hoeveel mol ribose-5-P kan je maken uit glutaminezuur? bereken hoeveel ATP je over hebt en schrijf de volledige cycli uit (antwoord 3 mol ribose-5-P) <br /> #fotos over juncties en chloroplast<br /> #gelfiltratie uitleggen + hoe daaruit molecuulgewicht proteinen bepalen<br /> #structuur en werking van een spiercel uitleggen<br /> <br /> ===20 juni 2016 ===<br /> #bespreek celwand van schimmels en bacterie (moleculair, structuur, functie)<br /> #bespreek gelfiltratie + hoe kan men de moleculaire massa berekenen van een proteine<br /> #bespreek de spiercel (werking, structuur)<br /> #Bespreek genrepressie en geninductie aan de hand van beta galactosidase en tryptofaan<br /> #metabolisme: hoeveel ribulose 5 fosfaat uit 5 glutaminezuur (geef namen gebruikte wegen + theoretische ATP opbrengst)<br /> #Structuren desmosoom/dichte junctie en chloroplas<br /> <br /> ===14 juni 2016===<br /> #bespreek de onderzoeken naar de regulatie van de celcyclus (MPF enzo...). Wat kan er misgaan wanneer de regulatie niet goed verloopt? (tumor, p53, oncogenen).. <br /> #Bespreek oorsprong structuur en functie van glyoxisomen en peroxisomen (bijvraag: waar vind je vb glyoxisomen: noten,zaden) <br /> # kationuitwisselingschromatografie uitleggen +methode om 4 peptiden te scheiden hiermee uitleggen<br /> # bespreek: Gs proteine (algemeen, niet adrenaline), Km(enzyme),Prion<br /> # Hoeveel ATP moeten de lichtreacties maken voor de synthese van 6 mol sucrose via donkerrracties (UDPG niet vergeten)<br /> # 2 fotos: chloroplast, 10 structuren aanduiden, darmepitheelcel met glycocalix en veel mucus blijkbaar geen lysosomen dus<br /> <br /> ===13 juni 2016 NM===<br /> #bespreek microtubuli en de structuren aan die in de cel voorkomen.<br /> # Welk peptide wordt er gevormd (DNA gegeven)<br /> # waaruit bestaat een spiercel en bespreek de werking ervan<br /> # Bespreek de calvin-cyclus. Wat zijn de inputs en wat zijn de outputs? <br /> #Hoeveel moleculen glycerol hebt je nodig om 9 moleculen ribose-5- fosfaat te maken? ( pentosefosfaat weg omkeren)<br /> #em foto's <br /> #*was een plantencel blaasjes golgi-apparaat aant afzetten was op de fragmoplast<br /> #*De tweede foto was een slijmbekercel<br /> <br /> ===13 juni 2016 VM===<br /> # Structuur glycogeen? Biosynthese er van en afbraak ervan? (Moest blijkbaar adrenaline bij betrekken)<br /> # aminozuren uitleggen en de structuur van proteine<br /> #structuur en functie van de celwand bij bacteriën<br /> #de stappen nodig om een zuivere fractie van polysomen te verkrijgen. Das zo met differentiële centrifugatie <br /> # hoeveel mol ethanol nodig om 6 mol ribos-6-fosfaat te vormen. <br /> # 2 foto's ene was met peroxisoom (kristal in), mitochondrie en chloroplast. 2e was ook vormen van fragmoplast<br /> <br /> === 23 juni 2015 VM ===<br /> # Bespreek de lichtreacties<br /> # Belangrijkste cel differentiaties bij Planten.<br /> # Hoe kan men cellen in een oplossing tellen? Hoe gebeurd dit bij bacteriofagen?<br /> #Teken en bespreek de structuur en functie van de glycocalix bij dieren<br /> #hoeveel maltose moleculen zijn er nodig bij de synthese van alanine in een cel met een tekort aan energie<br /> # 2 foto's: een prokaryoot en een spiercel<br /> <br /> === 24 juni 2015 VM ===<br /> # Bespreek de enkelvoudige en meervoudige suikers en teken de belangrijkste.<br /> # apoptose<br /> # Penicilline en chloramfenicol <br /> # Opbouw en afbraak van vetten<br /> # 2 foto's eentje van een floeemcel de andere van een vetdruppels met glyoxisomen<br /> <br /> === 23 juni 2015 VM ===<br /> # Geef alle soorten lipiden, uitleg, tekening<br /> # wat is een sarcomeer en leg werking uit,<br /> # vier woorden: microsoom, beta-mercapto-ethanol, tonofilamenten en dna primase, <br /> # Geef heel calvincyclus<br /> # Oefening met al die metabolisme en ATP enzo. Iets mat stearinezuur afbreken tot pyrodruivenzuur ofzo tongue-emoticon<br /> # 2 fotos : celkern met kristallen en dan blijkbaar een zeefvat<br /> <br /> === 22 juni 2015 NM ===<br /> # Alles van de plantencelwand<br /> # Oef met DNA sequentie en translatie<br /> # Oxidatieve fosforylatie vs foto fosforylatie<br /> # Hoe kan je polysomen en ribosomen scheiden<br /> # Hoeveel mol glycerol heeft een gistcel, die in de G0-fase zit, nodig om met ademhaling 110 Mol ATP te synthetiseren<br /> # Foto van openbarstende darmepitheelcel (met mucus) en van een plantencel<br /> <br /> === 22 juni 2015 VM ===<br /> # Structuur en functie van endoplasmatisch reticulum<br /> # Hoe wordt de activiteit van fosfofructokinase geregeld?<br /> # Cytoskelet bij planten en dieren<br /> # Bespreek de lichtreacties<br /> # hoeveel mol ethanol nodig opdat gistcellen 4 mol ribose-5-P kunnen maken. Welke metabolische weg komen hierbij tussen? Hoeveel ATP blijft er over? <br /> # 2 foto's: de eerste was een zenuwcel met microtubuli en de tweede met een peroxisoom.<br /> <br /> === 16 juni 2015 ===<br /> # bespreek suikers en polysacchariden en teken de belangrijkste<br /> # welke reacties vinden plaats op het thelakoïdmembraan en wat zijn de inputs en outputs<br /> # geef uitleg; middenlichaampje, callus, mitosis-promoting factor MPF, blefaroblast<br /> # hoeveel mol glutaminezuur moet omgezet worden in oxaalazijnzuur om voldoende ATP te maken voor de afbraak van 5 mol stearinezuur<br /> # bespreek SDS-page en waarvoor dient het<br /> # foto van floëemcellen en foto van kern met kristallen p p295<br /> <br /> === 26 juni 2014 ===<br /> #IEP uitleggen en peptiden rangschikken op IEP<br /> #Transport van voedingsstoffen over de celmembraan bespreken<br /> #Methoden om de volgorde van enzymen in een metabolische pathway te bepalen<br /> #Glyoxylzuurcyclus bespreken<br /> #Hoevel mol glycerol nodig voor 2 mol palimitinezuur<br /> #Foto van jonge plantencel en van peroxisoom<br /> <br /> ===23 juni 2014===<br /> #Transport van voeding door de membraan<br /> #Plantencelwand bespreken<br /> #Bespreek de pentosefosfaatweg (alles)<br /> #Tellen van bacteriofagen<br /> #1 mol tripalmitine (vergeet glycerol niet!)<br /> #Foto van plantencel (chloroplast volledig en ook vacuole enzo) + floeemcel (gedifferentieerde plantencel)<br /> <br /> === 19 juni 2014 ===<br /> #Leg de rol van enzymen als katalysatoren uit in de metabolische reactie wegen<br /> #Wat doe adrenaline in de levercellen als je schrikhebt?<br /> #Leg de weg uit die katalase aflegt in de cel beginnende bij DNA.<br /> #Leg ionenuitwisselingschromatografie uit.<br /> #Hoeveel mol maltose heb je nodig voor de aanmaak van 2 mol stearine? Welke metabolische reactiewegen komen hier bij te pas? Welke zijn de energieleverende/ energie verbruikende stappen?<br /> #Prent van cel met glycogeenkorrels, RER, SER, mitochondrien etc<br /> #Prent van plant cel in cytokinese --&amp;gt; aanmaak van middenlamel door fragmoplast etc<br /> <br /> === 12 juni 2014 (namiddag) ===<br /> #Transport over celmembraan<br /> #Kern met rer tekenen en functie uitleggen <br /> #Wat doet adrenaline in levercellen<br /> #Confocale fluorescentie microscopie uitleggen<br /> #Hoeveel acetaat je nodig hebt voor 3 mol glycerol en waar wordt energie geproduceerd <br /> #Foto van glycogeenkorrels en van kristallen in kern<br /> <br /> === 12 juni 2014 (voormiddag) ===<br /> #fosfofructokinase van dna tot enzyme de weg die het moet doen en regulatie<br /> #plantencelwand opbouw componenten en functie<br /> #tellen van cellen en bacteriofagen<br /> #hoeveel glucose nodig voor 4 alanine te maken<br /> #foto van zenuwuitlopers en vorming nieuwe celwand bij planten: fragmoplast<br /> <br /> === 17 juni 2013 (namiddag) ===<br /> #Bespreek de eenvoudige suikers en polysacchariden.<br /> #Bespreek de biosynthese en afbraak van vetzuren.<br /> #Wat is de functie van glyoxisomen? Hoe kan je deze zichtbaar maken bij fluorescentie microscopie?<br /> #Een gistcel kan groeien op ethanol. Om te groeien moet de celwand groeien, deze is opgebouwd uit polymeren van suikers. <br /> #*Hoeveel mol ethanol is er nodig om 10 mol glucose te maken? <br /> #*Kan de gistcel groeien op ethanol in anaëroob milieu? (antwoord: p469 laatste 5 regels in middelste stuk)<br /> #prent aanduiden: <br /> #*desmosoom <br /> #*peroxisoom met kristalstructuur<br /> <br /> === 17 juni 2013 (voormiddag) ===<br /> #Teken de overgang van kernmembraan naar R.E.R. Wat is de functie van dit laatste?<br /> #Bespreek geprogrammeerde celdood. Is er een link met kanker?<br /> #Geef de methode(n) hoe je proteïnen kan splitsen op basis van hun lading.<br /> #Hoe werkt het B-galactosidase operon bij E. Coli?<br /> #Hoeveel mol glucose kan je maken met 3 mol palmitinezuur? Welke metabolische wegen worden er gevolgd? Hoeveel ATP kan er eventueel gevormd worden?<br /> #Foto's:<br /> #* p254<br /> #*p218 (ongeveer)<br /> <br /> ===13 JUN 2013 NM===<br /> # Bespreek de secretieweg in een cel van gen tot gesecreteerd eiwit.<br /> # Als een mens schrik heeft komt er adrenaline vrij. Wat gebeurt er dan in de lever?<br /> # Hoe werkt SDS-PAGE?<br /> # Een uitgehongerde zoogdiercel maakt 4 glutaminezuurmoleculen en 2 asparaginezuurmoleculen. Hoeveel fructose is hier voor nodig en hoeveel CO2 wordt er door het organisme geproduceerd bij deze omzetting?<br /> # 2 foto's: chloroplast tegen celwand aangedrukt door vacuole en celkern met kristallen.<br /> <br /> <br /> === 13 jun 2013 (voormiddag) ===<br /> #Bespreek de celwand vn de bacterie<br /> #Uitleggen wat MFP met celcyclus te maken heeft en welke drie onderzoeken er toe geleid hebben<br /> #Confocale fluorecentiemmicroscopie uitleggen<br /> #Een oefening met hoeveel mol<br /> #2 prentjes:<br /> #*floëmcellen<br /> #*gewoon RER, SER, Peroxisoom, mitochondrïen aanduiden (kan zijn nog iets)<br /> <br /> =Examenvragen vanaf 2009=<br /> == Biochemie ==<br /> <br /> === 27 jun 2011 ===<br /> #elektronentransportketen uitleggen.<br /> #Met welke methodes kan je glyoxisomen bestuderen (door microscopische analyse) in de cel?<br /> #Vetzuren en lipiden bespreken<br /> #Differentiaties in plantencellen<br /> #Foto van spiercel + kern delen benoemen.<br /> #C1 van een glucosemolecule wordt radioactief gemerkt. We zien dat C6 van een 1,6-bisfosfaatfructosemolecule ook radioactieve sporen vertoond. Verklaar dit.<br /> <br /> === 16 jun 2010 ===<br /> #Bespreek de lichtreactie van de fotosynthese.<br /> #Bespreek hoe je aminozuren en suikers kan scheiden en deze onderling kan scheiden.<br /> #Bespreek: de weg die wordt afgelegd van DNA tot glycocalyx van een proteïne.<br /> #Hoeveel ribose 5-P kunnen gevormd worden uit 5 moleculen glutaminezuur. Hoeveel ATP komt hierbij vrij?<br /> #Twee foto's waarbij alle structuren moeten aangeduid worden (chloroplast en jonge plantencel)<br /> <br /> === 8 jun 2010 ===<br /> Mondeling met schriftelijke voorbereiding<br /> #Bespreek de suikers<br /> #Bespreek de pentosefosfaatweg (PPP)<br /> #Bespreek SDS-PAGE<br /> #Hoeveel molecule alpha-ketoglutaarzuur moeten er in de cel omgezet worden naar fumaarzuur om voldoende ATP te maken voor de synthese van 6 moleculen palmitinezuur (vertrekkende van Acetyl-Coa en uitgaand van het feit dat alle cofactoren aanwezig zijn) ? [Antwoord: 7]<br /> #Twee foto's waarbij alle structuren moeten aangeduid worden (levercel en prokaryote cel)<br /> <br /> == Chemie == <br /> <br /> <br /> ===3 JUN 2012 VM===<br /> # celdifferentiatie in ene plantencel<br /> # transport voeding cel<br /> # geef de verschillen tussen de glycolyse en de gluconeogenese daar waar de enzymen verschillend zijn<br /> # 2 stearinezuur omvorme na ribose, er is geen NAD+, geef de cusclussen die je gebruikt, is er atp genoeg, kan het volledig worden omgezet?<br /> # 2 tekeningen (darmwand en spiercel)<br /> <br /> <br /> ===3 FEB 2012 NM===<br /> # Bespreek enkelvoudige en meervoudige suikers<br /> # Welke soorten juncties zijn er en wat is hun functie?<br /> # Bespreek ionenuitwisselingschromatogafie<br /> # 2 foto's<br /> <br /> <br /> ===30 JAN 2012 VM===<br /> # Bespreek aminozuren en ruimtelijke opbouw van proteïnen <br /> # Rangschik 5 proteïnen volgens hun isoelektrisch punt, van hoog naar laag (je krijgt hier dan 5 aminozuursequenties) <br /> # Teken de overgang tussen kernmembraan en het RER en bespreek de functie van het RER. <br /> # Bespreek de verschillende centrifugatietechnieken.<br /> <br /> <br /> ===23 JAN 2012 NM===<br /> # bespreek de enkelvoudige en meervoudige suikers<br /> # bespreek de celwand bij bacterien en schimmels<br /> # leg uit ionenuitwisselingschromotografie<br /> # 2 foto's waar ge alles op moet aanduiden<br /> <br /> <br /> ===23 JAN 2012 VM===<br /> # Bespreek de celwand bij planten<br /> # Bespreek microtubuli en hun structuren<br /> # SDS-page (blijkbaar moest ge u practicumboek ook kennen :s)<br /> # foto van kern me kristallen en een bacterie<br /> <br /> <br /> ===20 JAN 2012 NM===<br /> # Bespreek vetzuren en lipiden<br /> # Bespreek wat er allemaal gebeurd en hoe het transport gebeurd van een specifiek proteïne vertrekkende van het genome DNA tot aan de glycocalyx (mss iets ander geformuleerd)<br /> # Bespreek de technieken om een basaalkorrel zichtbaar te maken in de cel. -&amp;gt; ECHT IN FUNCTIE VAN DE BASAALKORREL DOEN DUS adh van het proteïne tubuline!!!<br /> # 2 foto's 1 van die rozetstructuren van glycogeenpartikels en dieje andere was met gwn een celkern met kristalijne kristallen (2 foto's die hem duidelijk in de les heeft vermeld da ge daar moet op lette)<br /> <br /> <br /> === 20 JAN 2012 VM ===<br /> #Bespreek de nucleinezuren, als monomeer en macromolecule, en hun ruimtelijke structuur bij eukaryoten en prokaryoten.<br /> #Bespreek het endoplasmatisch reticulum.<br /> #Bespreek gelfiltratie en leg uit hoe het ka ngebruikt worden om het moleculaire gewicht van een proteine te bepalen.<br /> #2 EM-fotos, alle structuren aanduiden en de functie ervan geven.<br /> <br /> <br /> ===21 JUN 2011 NM===<br /> #bespreek de vermenigvuldiging van virussen<br /> #Bespreek de bio-synthese en afbraak van vetzuren<br /> #Bespreek de vrijzetting van adrenaline in het bloed<br /> #Hoeveel mol ATP wordt er geproduceerd uit 5 mol glucose en 3 mol glycerol? Hoeveel mol glutaminezuur kan worden geproduceerd uit 5 mol glucose en 3 mol glycerol wanneer er genoeg ammoniak in de cel aanwezig is?<br /> #twee foto's<br /> <br /> <br /> ===21 JUN 2011 VM===<br /> #Bespreek de cytokinese bij planten.<br /> #Bespreek het transport van voedingsstoffen naar binnen in de cel.<br /> #Bespreek de lichtreacties van de fotosynthese.<br /> #Hoeveel mol fructose is er nodig voor de synthese van 3 mol palmitinezuur?<br /> #twee foto's<br /> <br /> <br /> ===21 JAN 2011===<br /> #Bespreek de celwand bij planten.<br /> #Bespreek de proteïnen en hoe ze zijn opgebouwd in een ruimtelijke structuur.<br /> #Geef de belangrijkste verschillen tussen gram positieve en gram negatieve bacteriën en hoe kan je die van elkaar onderscheiden?<br /> #Bespreek moleculaire exclusiechromatografie en hoe kan je hiermee het MW van een eiwit bepalen?<br /> #Twee foto's<br /> <br /> <br /> ===22 JUN 2010===<br /> # Bespreek de structuur en werking van spiercellen.<br /> # Bespreek de lichtreacties van de fotosynthese.<br /> # Hoeveel ATP wordt er geproduceerd bij afbraak van 5 mol glycerol en 2 mol glucose? stel: Glutaminezuur tekort in de cel, hoeveel mol glutaminezuur kan geproduceerd worden met 5 mol glycerol en 2 mol glucose?<br /> # Hoe werkt adrenaline?<br /> # Hoe werkt het tryptofaan operon bij aanwezigheid en afwezigheid van tryptofaan?<br /> <br /> <br /> ===15 JUN 2010===<br /> # Bespreek differentiatie van plantaardige cellen<br /> # Bespreek gemedieerd transport<br /> # Bespreek de glyoxyzuurcyclus (waar, in- en outputs en waar de producten verder naartoe gaan...)<br /> # Hoeveel fructosemoleculen heb je nodig om 4 moleculen glutaminezuur en 2 moleculen asparaginezuur te maken. Hoeveel CO2 wordt hierbij gemaakt? Leg uit a.d.h.v. metabolische wegen.<br /> # Bespreek hoe de enzymes elkaar opvolgen (niet in deze woorden, maar 't komt erop neer)<br /> <br /> <br /> ===25 JAN 2010===<br /> Mondeling met schriftelijke voorbereiding<br /> #Bespreek de structuur en de functie van microtubuli en de verschillende structuren die hieruit zijn opgebouwd. (p. 240-261)<br /> #Bespreek de ruimtelijke structuur van eiwitten. (p. 53-60)<br /> #Bespreek de verschillende centrifugatie methoden. (p. 285-290)<br /> #Twee foto's<br /> <br /> <br /> ===18 JAN 2010===<br /> Mondeling met schriftelijke voorbereiding<br /> #Bespreek de celwand bij planten. (bijvragen over de chemische opbouw van (hemi)cellulose, extensises,...)<br /> #Bespreek RNA transcriptie en DNA duplicatie.<br /> #Bespreek de moleculaire exclusiechromatografie.<br /> #2 foto's van cel(onderdelen). Alles benoemen, ook vanzelfsprekendheden (cytoplasma,...)<br /> <br /> <br /> === 15 JAN 2010 ===<br /> Mondeling met schriftelijke voorbereiding<br /> # Bespreek de enkelvoudige en de meervoudige sacchariden (bijvraag: hoe heeft men de L en D suikers bepaald, met welk suiker hebben ze dit gedaan)<br /> # Bespreek de overgang van het kernmembraan en het RER en geef de functie van het RER<br /> # Bespreek SDS PAGE<br /> # Duid op de volgende 2 foto's de delen aan (ALLES aanduiden, cytoplasma en alles wat ook 'normaal' lijkt!)<br /> <br /> <br /> leer ALLE details!<br /> <br /> =Examenvragen van 2007 - 2009=<br /> === 2 sept 2009 - Biochemie ===<br /> Van Dijck<br /> # Bespreek de enkelvoudige en meervoudige suikers.<br /> # Bespreek de verschillende plastiden.<br /> # Welke techniek kan men gebruiken om celmembranen te bestuderen onder de EM? Bespreek de twee varianten.<br /> # Twee foto's<br /> <br /> Thevelein<br /> * Hoofdvraag<br /> *# Bespreek het verband tussen de elektrontransportketen en oxidatieve fotofosforylatie.<br /> * Bijvragen<br /> *# Glyoxylzuurcyclus<br /> *# Hoeveel glucosemoleculen heeft een schimmelcel nodig om 2 glutaminezuur en 4 asparaginezuur te maken? Wordt er hierbij ook CO2 geproduceerd en indien ja, hoeveel?<br /> <br /> === 24 Juni 2009 - Chemie - Thevelein ===<br /> * hoofdvragen<br /> *# Bespreek de Krebscyclus.<br /> *# Bespreek de lichtreactie vd fotosynthese.<br /> *# Leg genrepressie en geninductie uit aan de hand van klassieke voorbeelden.<br /> * bijvragen<br /> *# Wat is groepstranslocatie?<br /> *# Bereken hoeveel mol ATP er wordt vrijgezet bij de volledige oxidatie van 1 mol tristearine.<br /> *# Nog een oefening zoals hierboven maar nu met aminozuren enzo...<br /> <br /> === 19 Juni 2009 - Biochemie ===<br /> Van Dijck <br /> # bespreek de structuur van microtubuli en de structuren die eruit bestaan.<br /> # Bespreek de nucleïnezuren en nucleotiden en hun ruimtelijke structuren.<br /> # Leg gelchromatografie (??) (da met gelbollekes sorteren) uit en hoe je het molecuulgewicht v eiwitten hiermee kan berekenen.<br /> # 2 foto's uit oefenzittingen<br /> <br /> Thevelein<br /> * hoofdvraag<br /> *# Vergelijk gluconeogenese en glycolyse (startproducten, plaats id cel,..)<br /> * bijvragen<br /> *# bespreek glyoxylzuurcyclus<br /> *# Bereken hoeveel moleculen glucose een schimmelcel nodig heeft om 2 moleculen glutaminezuur en 4 moleculen asparaginezuur te produceren. Wordt hierbij CO2 gevormd en zo ja hoeveel? Leg uit adhv de gebruikte cycli.<br /> <br /> === 15 Juni 2009 - Biochemie ===<br /> Van Dijck <br /> # bespreek de celwand bij planten<br /> # bespreek peroxisomen en glyoxisomen<br /> # rankschik de volgende peptiden volgens iso-elektrisch punt. en wat is iso-elektrisch punt. vb.COOH-cysteïne-proline-histidine-cysteïne-lysine-methionine-asparaginezuur-NH2<br /> # 2 fotos: 1 van een chloroplast, en 1 van een zenuwcel<br /> Thevelein<br /> *hoofdvraag<br /> *# bespreek de lichtreacties van de fotosynthese<br /> *bijvragen<br /> *#geef volledige metabolische weg om asparaginezuur te vormen uit glycerol en NH3<br /> *#Kan een cel in anaërobe omstandigheden het meest ATP halen uit glucose via de Glycolyse of eerst via PP(pentosfosfaatweg).en toon aan.-<br /> <br /> === 26 jan 2009 - Chemie - Van Dijck ===<br /> # Bespreek nucleotiden en nucleïnezuren<br /> # Welke soorten juncties zijn er en wat is hun functie?<br /> # Hoe kan je aminozuren van suikers scheiden en hoe kan je ze verder opzuiveren?<br /> # Teken het celmembraan (of was de vraag nu glycocalyx?) van een dierlijke cel en duidt de onderdelen aan.<br /> # Wat is het iso-elektrisch punt van een proteïne en wat ben je ermee?<br /> # 2 fotos: 1 van een prokaryote cel, en 1 van een plantencel<br /> <br /> === 15 jan 2009 - Chemie - Van Dijck ===<br /> Mondeling met schriftelijke voorbereiding<br /> # bespreek de enkelvoudige en de meervoudige sacchariden (bijvraag: hoe heeft men de L en D suikers bepaald, met welk suiker hebben ze dit gedaan)<br /> # bespreek de overgang van het kernmembraan en het RER en geef de functie van het RER<br /> # bespreek SDS PAGE<br /> # duid op de volgende 2 foto's de delen aan (ALLES aanduiden, cytoplasma en alles wat ook 'normaal' lijkt!)<br /> leer ALLE details!<br /> <br /> === 22 aug 2008 - Biochemie ===<br /> Thevelein:<br /> <br /> * Hoofdvraag:<br /> *# Bespreek de samenstelling en mechanisme van elektronentransportketen<br /> <br /> *Bijvragen:<br /> *# Welke reacties worden gekatalyseerd door volgende enzymes:<br /> *#* pyruvaat decarboxylase<br /> *#* pyruvaat dehydrogenase<br /> *#* pyruvaat kinase<br /> *#* pyruvaat carboxylase<br /> *# een cel zet oxaalazijnzuur, citroenzuur en NH3 om in asparaginezuur en glutaminezuur, geef de reactie.<br /> <br /> Van Dijck:<br /> <br /> # bespreek structuur en functies van de microtubuli en bespreek de structure waar ze voorkome (/3)<br /> # bespreek structuur van de proteïnen en waar komen deze voor (/3)<br /> # hoe kan je het molecuulgewicht van een proteïne bepalen met exclusiechromatografie (/2)<br /> # wat is hemicellulose? (/1)<br /> # duid celorganellen aan op de prent (/1) --&amp;gt; twas een levercel met veel secretiepartikels<br /> <br /> === 26 jun 2008 - Chemie - Thevelein ===<br /> Hoofdvragen:<br /> # e-transport<br /> # pentosefosfaatweg<br /> # regulatie van het metabolisme<br /> <br /> Bijvragen:<br /> # glyoxylzuurcyclus<br /> # glucose+NH3--&amp;gt;glutaminezuur+CO2 hoeveel ATP wordt er geproduceerd (aeroob organisme)<br /> # synthese van trehalose uit glucose dat via symport in de cel komt. Hoeveel ATP moet er via melkzuurgisting gewonnen worden om 2 trehalose moleculen te vervaardigen.<br /> <br /> === 26 jun 2008 - Chemie - Thevelein === <br /> Hoofdvragen<br /> # Bespreek de Krebscyclus<br /> # Bespreek het membraantransport en de membraanpotentiaal<br /> # Bespreek de lichtreacties van de fotosynthese<br /> <br /> Bijvragen<br /> # Adrenaline als glucosevrijzetter<br /> # Bespreek in detail de biosynthese en afbraak van vetzuren<br /> # Een bacteriële cel in aërobe omstandigheden zet glucose om in pyrodruivenzuur. Waar wordt het meeste ATP geproduceerd, via de glycolyse of via de pentosefosfaatweg?<br /> <br /> === 20 jun 2008 - Chemie - Thevelein===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Bespreek de calvincyclus.<br /> # Bespreek membraantransport en bespreek hoe membraanpotentiaal hierbij tussenkomt.<br /> # Bespreek de regulatie van het metabolisme.<br /> <br /> Bijvragen:<br /> # Glyoxylzuurcyclus.<br /> # Adrenaline als glucose vrijzetter.<br /> # Een denkvraag ivm proton-motive en dinitrofenol.<br /> <br /> === 20 jun 2008 - Biochemie ===<br /> <br /> Thevelein:<br /> # lichtreacties<br /> # oefeningen:<br /> #* tristearaat, hoeveel ATP wordt er gevormd<br /> #* vorming van asparaginezuur en glyoxylzuur uit citroenzuur en NH3<br /> <br /> Van Dijck:<br /> <br /> * schriftelijk<br /> *# soorten bindingen in macromolecules, tekenen +bespreken<br /> *# wat is threhalose, mesozoom<br /> <br /> * mondeling<br /> *# endoplasmatisch riticulum bespreken<br /> *# microtubuli bespreken<br /> *# plaatsbepaling van moleculen in de cel, methoden bespreken<br /> *# 2 foto's herkennen+organellen benoemen: lever en oliehoudende zaden<br /> <br /> === 19 jun 2008 - Biochemie ===<br /> Thevelein:<br /> * Grote vraag: <br /> *# membraantransport bespreken<br /> * Bijvragen: <br /> *# ge hebt 24 glucosemoleculen, die ge via PP en dán pas de glycolyse gaat afbreken tot acetyl-CoA, waarna ge X aantal palmitinemoleculen gaat opbouwen. Hoeveel ATP wordt er gevormd? En hoeveel NADPH hebt ge tekort?<br /> <br /> Van Dijck:<br /> <br /> *Schriftelijk:<br /> *# bespreek RNA en DNA<br /> *# leg uit: <br /> *#* isopycnische centrifugatie <br /> *#* mycoplasma<br /> <br /> *Mondeling:<br /> *# bespreek mono- en polysachariden<br /> *# celwand bij bacterien + Gram positieve en Gram negatieve bacterien<br /> *# ionenuitwisselingschromatografie<br /> <br /> === 13 jun 2008 - Biochemie ===<br /> Thevelein:<br /> * hoofdvraag:<br /> *# Bespreek de lichtreacties van de fotosynthese<br /> * Bijvragen:<br /> *# Bespreek hoe er geninductie en genexpressie bij Escheria coli plaatsvindt<br /> *# Oefening ivm de metabolische wegen<br /> <br /> Van dijck:<br /> <br /> *Schriftelijk<br /> *# teken (cyclisch) alfa-D-glucose, beta-D-Fructose, sucrose en nummer de koolstoffen<br /> *# Leg uit: <br /> *#* mesosoom <br /> *#* connexon<br /> <br /> * Mondeling<br /> *# Teken hoe het kernmembraan in het RER overgaat, en geef de functie van dit RER<br /> *# Bespreek de ruimtelijke structuur van proteïnen<br /> *# Leg uit hoe men plasmiden kan identificeren met behulp van restrictie-enzymen aan de hand van een voorbeeld<br /> *# Duid de organellen aan op de cel (chloroplast en bacteriofaag)<br /> <br /> === 28 jan 2008 - Chemie - Van Dijck ===<br /> Mondeling:<br /> # geef de structuur en de functies van de mitochondrieën<br /> # beschrijf de weg die een proteine X aflegt beginnend in de kern die voor de glycocalyx bestemd is.<br /> # beschrijf de verschillende centrifugatietechnieken.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # wat is het iso-elektrisch punt van proteïnen en rangschik de volgende proteïnen volgens stijgende theoretische waarde van het iso-elektrisch punt. De proteïnen werden gegeven door telkens een keten van 11 aminozuren.<br /> # Beschrijf en teken schematisch de componenten van de glycocalyx<br /> # verklaar: <br /> #* mesosoom<br /> #* connexon<br /> <br /> <br /> === 28 jan 2008 - Chemie - Van Dijck ===<br /> Schriftelijk deel<br /> # rangschik van polair naar apolair (aceton, 1-propanol, diethylether, fenol, benzylalcohol) [in de vraag werden prentjes van de moleculen gegeven, en niet de namen], en zeg wat apolariteit bepaalt.<br /> # teken (cyclisch) alfa-D-glucose, beta-D-Fructose, sucrose.<br /> # Leg uit:<br /> #* Dictyosoom <br /> #* Blefaroplast<br /> <br /> Mondeling met schriftelijke voorbereiding<br /> # Teken hoe het kernmembraan in het RER overgaat, en geef de functie van dit RER<br /> # Bespreek de ruimtelijke structuur van proteïnen<br /> # Leg uit hoe men plasmiden kan identificeren met behulp van restrictie-enzymen aan de hand van een voorbeeld<br /> # Duid de organellen aan op de cel (de twee cellen waren een zenuwcel en een chloroplast)<br /> <br /> =Examenvragen tot en met 2006=<br /> === 15 jan 2007 ===<br /> Hoofdvragen: theorie<br /> # bespreek hoe een cel aan zijn membraanpotentiaal komt + hoe deze aangewend wordt bij het membraantransport<br /> # bespreek de Calvin Cyclus (functie, intermedairen, ...)<br /> <br /> Hoofdvragen oefeningen<br /> # practicum: bespreek PAGE bij proteïnen en hoe we de molecuulgroote ervan kunnen afleiden<br /> # duid zo veel mogelijk celstructuren aan<br /> # duid de volgende processen aan waar ze voorkomen in de cel aan op de tekening: NADPH productie, energieproductie, chromatine en integrale proteïnen<br /> <br /> Bijvragen<br /> # bespreek hoe adrenaline de glucoseproductie in de cel regelt<br /> # Een cel maakt uit oxaalazijnzuur, citroenzuur en NH3 de aminozuren glutaminezuur en asparaginezuur. Geef een reactievergelijking en houd rekening met ATP, NAD, FAD, H2O en CO2.</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Bio-Organische_Chemie&diff=476 2017-06-15T14:46:41Z

<p>0653300: /* 15 juni 2017 (voormiddag) */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Basisvak organische chemie voor eerstejaars chemie, biochemie en biologie.<br /> Gedoceerd door Professor Luc van Meervelt.<br /> Het examen volgt al jaren dezelfde structuur.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===15 juni 2017 (voormiddag) prof Mario Smet===<br /> Mondeling<br /> #halogeenalkaan ondergaat een E1 + toelichten zaitsev<br /> #vier moleculen ondergaan een E; welke is het reactiefst? Leg uit mbhv substituenteffecten + resonantievormen tekenen (indien nuttig)<br /> #Waarom kan op een alcohol NIET goed een Sn uitgevoerd worden? (OH- is niet stabiel)<br /> #2 voorbeelden geven hoe dat wel kan + werkt dit ook voor fenol? (protoneren of fosfaatgroep toevoegen)<br /> #Voorbeeld geven van een nucleofiele substitutie van een alcohol in biologische systemen (acetaalvorming v/e reducerende suiker met methanol)<br /> <br /> Schriftelijk<br /> #oefeningen op koolhydraten (R/S; anomeer, epimeer, haworth en newman projecties<br /> #oefeningen op reactiemechanismen (fiederlkraftsacylering, nucleofiele acylsubstietutie)<br /> #oefening op AZ (2 tekenen, titratie-oef, pKa vergelijken)<br /> <br /> ===14 Juni 2017 (namiddag) prof Mario Smet===<br /> Mondeling:<br /> #Elektrofiele additie reactiemechanisme schrijven (regel markovnikov)<br /> #4 moleculen bepalen welke het snelst aan een Ae doet (grensstructuren, inductieve effecten)<br /> #naamgeving van enkele producten na de Ae<br /> #isomerisatie in glycolyse van glucose-6-fosfaat naar fructose-6-fosfaat en uitleggen waarom dit base gekatalyseerd is<br /> #verband uitleggen met Fehling's/ Tollen en Barfoed<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #gegeven moleculen Menthol aantal stereochemische oefeningen oplossen (R/S, diasteromeren, enantiomeren, newman...)<br /> #oefening op AZ op papierelektroforese (waar komt elk AZ bij bepaalde ph)<br /> #aceton+ methylanime wordt imine bij ph=7 laat zien<br /> #enkele reactiemechanisme aanvullen of tekenen ( Nitrering, estercondensatie)<br /> <br /> ===9 juni 2016===<br /> #beckman omlegging<br /> #edman degradatie<br /> #biosynthese geraniol en limoleen<br /> #structuren = S.A.M &amp; biotione<br /> #naamgeving + 2 mechanismes<br /> #oefening ivm stereochemie<br /> <br /> ===8 juni 2016===<br /> #synthese vn peptiden<br /> #hydrolyse, omestering en reductie van esters<br /> #cannizaro reactie<br /> #structuren: -2-isopentenylpyrofosfaat<br /> #Trans decaline<br /> #oef over suikers(suiker bepalen, chirale C's, newman projectie..)<br /> #reactiemechanismen en naamgeving<br /> <br /> ===6 juni 2016===<br /> #Aldolcondensatie en waardat deze terugkomt in de glycolyse<br /> #reactiviteit bij de substitutie reacties van benzeen, tolueen en pyridine vergelijken<br /> #-verschil tussen reducerende suikers en nietreducerende suikers<br /> #structuur van acetyl-choline en palitine<br /> #pH van aminozuren bij een titratie<br /> #reactimechanisme<br /> <br /> === 15 juni 2015 ===<br /> # Claisen condensatie + verband met afbraak van vetzuren<br /> # Bespreek de reactie van geconcentreerd zwavelzuur met:<br /> #* Alkeen<br /> #* Alcohol<br /> #* Aromaat<br /> # acetylcholine en fructose 6 fosfaat tekenen, optische zuiverheid uitleggen. <br /> #Oefeningen over aminozuren (of glutamine en threonine te scheiden waren met elektroforese) fischer, newmann, stereo isomeren erover. <br /> #En dan twee reacties natuurlijk<br /> <br /> ===12 juni 2015 ( namiddag ) ===<br /> <br /> mondeling:<br /> # Leg de reacties met benzeen uit en ook die van purine en fenol.<br /> # Bespreek de hydrolyse en omestering van vetzuren in zuur en basisch milieu. Leg hierbij ook het broomgetal en verzepingsgetal uit.<br /> Schriftelijk:<br /> # Naamgeving ( c-AMP en mannose)<br /> # Leg uit si en re<br /> # Een hele lang oefening vergelijkbaar met de oefeningen van de oefenzitting ( verschil tussen D en L, chirale C, reacties, ...)<br /> <br /> ===12 juni 2015 ( voormiddag ) ===<br /> <br /> mondeling:<br /> #Aminen en halogeenalkanen <br /> #Aminen en salpeterigzuur<br /> #Laboratorium peptidesynthese<br /> <br /> schriftelijk:<br /> #structuren<br /> #*Limoneen<br /> #*Sorbitol<br /> #stereochemie+ reactiemechanisme<br /> #*aldolcondensatie<br /> #leg uit:<br /> #*reducerende en niet-reducerende suikers<br /> <br /> ===11 juni 2015===<br /> <br /> mondeling:<br /> #Wat is ''mutarotatie''? Leg dit uit a.h.v glucose en fructose.<br /> #Leg uit:<br /> #* Fisher-verestering<br /> #* Beckmann-omslag. Je moet ook weten hoe H2O addeert. Hij vraagt hoe je aan een oximen kunt komen. <br /> schriftelijk:<br /> #IUPAC <br /> #structuren<br /> #*citroenzuur<br /> #*ninhydrine<br /> #structuur observeren<br /> #* chirale C-atomen aanduiden<br /> #* OG van aangeduid atoom geven<br /> #* vermelden welke N in de molecule het stabielste is.<br /> #* vermelden hoeveel stereo-isomeren er gevormd kunnen worden.<br /> #* één stereomeer tekenen dat geen enantiomeer is.<br /> #* oefening op pH-waarden binnen titraties. ( ''deze bij 200 mL als de molecule volledig geprotoneerd is'' )<br /> #wat is ''fosforyleringspotentiaal''? Leg uit.<br /> #2 structuren gegeven. <br /> #*Van elk de/het reactieproduct(en) geven en hiervan de juiste skeletnotatie. <br /> #*Geef van één van de 2 tructuren het reactiemechanisme.<br /> <br /> ===16 juni 2014===<br /> #Bespreek de reacties met alkenen (waterstof halogenen en perzuren)<br /> #Iupac<br /> #Bespreek reducerende suikers<br /> #Peridoxalfosfaat en acetylcholine<br /> #Stereochemie<br /> #Reactiemechanismen<br /> <br /> ===20 augustus 2013===<br /> Mondeling:<br /> # Welke reactie kan D-mannose in een basisch milieu ondergaan?<br /> # Leg de biosynthese van vetzuren uit.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC<br /> # Structuren: tBOC en ninhydrine<br /> # Fosforylerings-potentiaal<br /> # Random oefening<br /> # Reacties: Ester+Amide en Alcohol+Zuur<br /> <br /> ===25 juni 2013 (namiddag)===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de elektrofiele en nucleofiele substitutie bij benzeen en pyridine.<br /> # Bespreek eliminatiereacties bij halogeenalkanen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC.<br /> # Structuur van glucaarzuur en tosylchloride.<br /> # Leg optische zuiverheid uit.<br /> # Tryptofaan: chirale koolstoffen, alle stereo-isomeren tekenen in Fischer en Newman, R/S bepalen.<br /> # Reacties: Nucleofiele substitutie halogeenalkaan en Fischer estersynthese.<br /> <br /> ===25 juni 2013 (voormiddag)===<br /> #decarboxylatie alpha-aminozuur en decarboxylatie alpha-ketocarbonzuur<br /> # amine + halogeenalkaan/salpeterigzuur<br /> # iupac<br /> # structuur beta-maltose en geranylpyrofosfaat<br /> # dean-stark<br /> # molecule: chirale centra, R/S, enantiomere/diastereomere/epimeren/anomeren, oxidatie, welke OH zuurste?<br /> # reactie aldehyd + OH/H2o, tetrahydropyraan met HI<br /> <br /> ===17 juni 2013 (namiddag)===<br /> Mondeling:<br /> # Leg de methoden uit om de volgorde van aminozuren in een peptide te achterhalen<br /> # Leg uit: Halfacetaal- en acetaalvorming en pas toe op de vorming van beta-D-glucopyranose en methyl-beta-D-glucopyranoside<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Leg biodiesel uit<br /> # Geef de structuur van limoneen en citroenzuur<br /> # IUPAC-naamgeving<br /> # Molecule gegeven: <br /> #* Geef alle chirale C-atomen + R/S nomenclatuur<br /> #* Newman projectie geven van bepaalde as<br /> #* Is de stikstof erin basisch (verklaar met substituenteffecten)<br /> #* Teken een stereomeer die geen epimeer is<br /> # Reacties waarvan 1 uitwerken:<br /> #* Sn1 van een alkaan met een broom erin<br /> #* Claisen condensatie van een ester<br /> <br /> ===17 juni 2013 (voormiddag)===<br /> Mondeling:<br /> #bespreek reactie alkenen met perzuren, halogenen en H2.<br /> #bespreek decarboxylatie van carbonzuren, pas toe op vb uit citroenzuurcyclus<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #bespreek: reducerend/niet reducerend suiker<br /> #molecules tekenen: biotine en SAM<br /> #iupac naam<br /> #chirale C: OT, R of S aangeven, diasteromeren van een AZ en fisher+newman<br /> #oefening met ph berekening met titratie<br /> #uitleggen waarom pka van 1 lager is dan een ander AZ<br /> #2 ractiemechanismen geven, één ervan uitschrijven<br /> <br /> ===14 juni 2013 (voormiddag)===<br /> Mondeling:<br /> # mutarotatie volledig uitleggen en illustreren voor D-fructose en D-glucose<br /> # Joodgetal, verzepingsgetal, Hydrolyse en omestering (zuur en basisch) voor olie en vetten. (met TEKENINGEN van ELK mechanisme)<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # fosforyleringspotentaal<br /> # 2 mechanismes waarvan ge het mechanisme en het eindproduct moet geven en eentje moet ge tekenen (naar keuze).<br /> # structuur gegeven: <br /> #* geef alle chirale C-atomen <br /> #* Stereo isomeren <br /> #* R en S geven van de chirale C-atomen in de stereo isomeren <br /> #* Zeggen of de dubbele bindingen E of Z zijn <br /> #* bepaal oxidatiegetal van het aangeduide punt <br /> #* verklaar waarom een stof hogere pka heeft als die gegeven is<br /> # er is nog eentje maar die weet ik niet meer.<br /> <br /> === 13 juni 2013 (voormiddag)===<br /> Mondeling: <br /> #synthese van peptiden in het labo<br /> #de hydrolysereactie van esters en fosfaatesters<br /> <br /> schriftelijk: <br /> #iupac naam<br /> #structuur van : cAMP en alpha keto glutaarzuur<br /> #leg de Beckman omlegging uit<br /> #suikers (ge krijgt een blad me alle suikers op) wij hadden xylulose<br /> #* bepaal de absolute configuratie van alle chirale C-atomen<br /> #*teken de meest stabiele open ketenvorm in een speciale projectie, kweet nimeer welke, volgens de C3-C4 as<br /> #*bepaal het oxidatiegetal van C2<br /> #*teken de overgang van L - xylulose naar L alpha xylulopentose<br /> #*teken het anomeer van L alpha xylulopentose<br /> #*welke soort reactie treed op bij een ringsluiting en welk soort katalysator bevordert dit proces<br /> #dan nog twee reacties, waarvan ge een volledig moet uitwerken en van beide reacties moet ge het reactietype geven en reactieproduct(en)<br /> <br /> <br /> === 13 juni 2013 ===<br /> Mondeling:<br /> #bespreek de claisencondensatie en bespreek het verband met de afbraak van vetzuren<br /> #beschrijf de biosynthese van geraniol en limoneen(monoterpenen)<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #Bespreek de regel van Huckel<br /> <br /> <br /> ===15 juni 2012 (voormiddag)===<br /> Mondeling: <br /> # Bespreek de biosynthese van monoterpenen: geraniol (molecule krijg je) en limoneen (structuur wel kennen)<br /> # Bespreek de aldolcondensatie en geef het verband met de glycolyse<br /> <br /> Schriftelijk: <br /> # IUPAC naam geven<br /> # structuren van acetylcholine en citroenzuur<br /> # uitleggen wat reducerende en niet reducerende suikers zijn<br /> # oefening met molecule met fenolen enz aan: fisherprojecties geven van de isomeren en ook de R/S en newmanprojecties van de stabielste moleculen.<br /> # reactiemechanismes aanvullen: nucleofiele additie van H2SO4 aan alkeen en zuurgekatalyseerde claisencondensatie<br /> <br /> ===14 juni 2012 (voormiddag)===<br /> Mondeling:<br /> # bespreek de nucleofiele reacties van carbonylgroep en additie met H20 en alcohol<br /> # Bespreek ninhydrine reactie<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # ne iupac<br /> # Limoneen en fosfoënolpyruvaat tekenen<br /> # Bespreek optische zuiverheid<br /> # oefening met suiker ( bij ons was die suiker L-tagatose dachtek) ma ge krijgt een blad om hem te herkennen (naam geven, fisher tekenen, R/S, een diastereomeer geven dat geen epimeer en geen anomeer is, + waarom suikercyclisatie zuur gekatalyseerd, en dan nog iets ma da wetek ni meer)<br /> # 2 structuren ( 1 was zo cyclisch ether da met HI reageert )<br /> <br /> ===30 juni 2011===<br /> Mondeling:<br /> #Labosynthese van peptiden<br /> #Eliminatiereacties bij halogeenalkanen<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #IUPD-naam<br /> #structuren:<br /> #*Nylon-66<br /> #*Palmitinezuur<br /> #Leg uit: Dean Stark opstelling<br /> #stereochemie<br /> #reactiemechanismen<br /> ===24 Juni 2011 (namiddag)===<br /> Mondeling:<br /> #Ninhydrinereactie<br /> #bespreek reacties van amiden met halogeenalkanen en salpeterigzuur<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #IUPAC-naam<br /> #Structuren:<br /> #*c-AMP<br /> #*Sorbitol<br /> #Leg uit: Cannizzaro-reactie<br /> #stereochemie<br /> #2 reactiemechanismen<br /> ===24 Juni 2011 (voormiddag)===<br /> Mondeling:<br /> #Bio-synthese van vetzuren en het verband met de Claisencondensatie<br /> #reacties van alkenen met waterstof, halogenen en perzuren.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #IUPAC-naam<br /> #structuren:<br /> #*ATP<br /> #*citroenzuur<br /> #Leg uit: Diazokoppelingsreactie<br /> #stereochemie<br /> #2 reactiemechanismen<br /> ===16 Juni 2011===<br /> Mondeling:<br /> #Leg uit: acetaal- en halfacetaalvorming.<br /> #Reacties van anorganische zuren met alkenen en alkynen<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #IUPAC-naam<br /> #structuren:<br /> #*limoneen<br /> #*D-mannose<br /> #leg uit: Kolbe-Schmitt reactie<br /> #stereochemie<br /> #2 reactiemechanismen<br /> ===23 augustus 2010===<br /> Mondeling:<br /> # Ninhydrinereactie<br /> # Welke reacties kan D-fructose in base ondergaan?<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # structuren:<br /> #* Pyridoxalfosfaat<br /> #* SAM<br /> # leg uit: Biodiesel<br /> # stereochemie<br /> # twee reactiemechanismen:<br /> #* keton met alcohol<br /> #* amide in water (zuurgekatalyseerd)<br /> ===18 juni 2010===<br /> Mondeling:<br /> # Reactie van anorganische zuren met alkenen en alkynen.<br /> # Alkylering, sulfonering en acylering van aromaten.<br /> <br /> schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # structuren<br /> #* (delta2)isopentenylpyrofosfaat<br /> #* cellobiose<br /> # leg uit: epoxyharsen en -lijmen<br /> # stereochemie aminozuur met R = -CHOH-CH3<br /> #* duid chirale koolstoffen aan<br /> #* hoeveel conformaties zijn er? en teken deze<br /> #* benoem (R,S)<br /> #* welke zijn enantiomeren? diastereomeren?<br /> #* bepaal het oxidatiegetal van de C-atomen<br /> #* welk is het meest basisch en zeg waarom...<br /> # twee reactiemechanismen waarvan 1 helemaal uitschrijven<br /> ===14 juni 2010===<br /> Mondeling:<br /> # Welke reacties gebeuren er met suikers in basisch milieu? (en dan bedoelt hij specifiek in basisch milieu)<br /> # Bespreek de oxidatie van alcoholen in het labo met K2Cr2O7 en in de natuur met NAD+ en illustreer met een voorbeeld in de citroenzuurcyclus<br /> <br /> schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # structuren<br /> #* Dansylchloride<br /> #* Biotine<br /> # leg uit: reactie van Chichibabin<br /> # stereochemie<br /> #* duid chirale koolstoffen aan<br /> #* hoeveel conformaties zijn er? en teken deze<br /> #* benoem (R,S)<br /> #* welke zijn enantiomeren? diastereomeren?<br /> #* is er een mesovorm?<br /> #* welk is het meest basisch: CH3CH2COO- of CH3CH2C=-C- (driedubbele binding) en zeg waarom<br /> # twee reactiemechanismen waarvan 1 helemaal uitschrijven<br /> <br /> ===11 juni 2010===<br /> Mondeling:<br /> # Wat geven alkenen met <br /> #* Anorganische zuren; <br /> #* Perzuren (ook energieschema's kennen, effecten van concentraties enzo)<br /> # Bespreek de biosynthese van vetzuren (Claisen-condensatiestap belangrijkst)<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # structuren<br /> #*SAM (S-adenosylmethionine)<br /> #*PET<br /> # Leg uit: Kolbe-Schmidt-reactie (aspirine dus)<br /> # Stereo-chemie:<br /> #* teken (beta)-L-gulopyranose (lineaire vorm gegeven)<br /> #* teken gunstigste Newman-projectie volgens C2-C3-as<br /> #* wat is de oxidatietrap van C6?<br /> #* geef de anomeer en een epimeer van L-gulose<br /> # 2 reactiemechanismen (1 uitschrijven)<br /> #* oxidatie van een alcohol en aldehyde met K2Cr2O7, H2SO4, koud<br /> #* Friedel-Crafts-acylering<br /> -<br /> ===22 juni 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de aldolcondensatie. Bespreek ook de stap van de glycolyse die verband houdt met de aldolcondensatie.<br /> # Bespreek de hydrolyse en omestering van vetten. Leg ook uit wat het verzepingsgetal en het joodgetal is.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam geven.<br /> # Structuren:<br /> #* dansylchloride<br /> #* cellobiose<br /> # Leg uit: De Beckmann-omlegging<br /> # Je krijgt een molecule gegeven <br /> #* Duid alle assymetrische koolstofatomen aan met een &amp;quot;*&amp;quot; en zeg of ze een R of S-configuratie hebben<br /> #* Teken het enantiomeer en 2 epimeren<br /> #* Van een N-atoom zeggen dat het basischer of zuurder is in vergelijking met ammoniak<br /> #* 2 mesomeren vormen geven (buiten die van benzeenring)<br /> # Twee reactiemechanismen (producten + soort reactie geven + één mechanisme helemaal uitschrijven)<br /> #* tertair alcohol + zuurchloride<br /> #* alkeen + zuur<br /> <br /> <br /> ===19 juni 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # bespreek de nucleofiele additie aan de carbonylgroep. Bespreek de factoren die de reactiviteit van aldehyden en ketonen beinvloed. geef de reactie met water en alcoholen<br /> # bespreek de reactie van alkenen met waterstof, halogenen en perzuren<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam geven.<br /> # Structuren:<br /> #* maltose<br /> #* fosfoënolpyruvaat<br /> # Leg uit: epoxyharsen en -lijmen<br /> # gegeven: aminozuur met zijgroep: R=CH2-SH<br /> #* Hoeveel stereoisomeren bestaan er van dit molecule+ welk aminozuur is dit<br /> #* geef de fischerprojectie en de Newmanprojectie( volgens C2-C3 as) van stabielste conformatie van elk stereoisomeer.Geef van elke chirale C of het R of S is.<br /> #* titratie: je begint met 100ml van O,2M oplossing van aminozuur(volledig geprotoneerd) en je titreert met 0,2M NaOH.(Pk1=1,9 Pk2=10,7 Pkr=8,4<br /> #*# bereken PH als je 150ml NaOH toegevoegd hebt<br /> #*# Bereken PH als je 300ml NaOH toegevoegd hebt<br /> #*# wat is(zijn) de voornaamste vorm(en) van het aminozuur bij PH=8,4<br /> # reactiemechanismen<br /> <br /> === 15 juni 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # Leg de decarboxylering van carbonzuren uit en pas toe in een stap uit de citroenzuurcyclus<br /> # Welke technieken ken je voor het bepalen van de aminozuurvolgorde in een peptideketen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam geven.<br /> # Structuren:<br /> #* Biotine<br /> #* (delta)³ - isopentenylpyrofosfaat<br /> # Leg uit: de reactie van chichibabin<br /> # Cyclische L-suiker gegeven:<br /> #* Geef de naam en de lineaire structuur. (lijst met ongekende suikers gegeven)<br /> #* Bepaal van C² of het R of S - configuratie heeft<br /> #* Duidt niet-chirale C-atomen in lineaire en cyclische structuur aan<br /> #* Hoeveel 1,3-diaxiale interacties zijn er?<br /> <br /> === 8 juni 2008===<br /> # Leg uit: de reactie van een zuur met een alkeen/alkyn.<br /> # Leg uit: de Claisen-condensatie en breng dit in verband met de biosynthese van lipiden/vetten.<br /> # Teken de structuur van S-adenosyl-methionine en van sacharose.<br /> # Leg uit: optische zuiverheid.<br /> # Oefeningen:<br /> #* Stereochemie, invloed van substituenten op de zuurtegraad etc. <br /> #* Reactiemechanismen<br /> <br /> === 18 aug 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Geef de biosynthese van monoterpenen voor de vorming van geraniol en limoneen.<br /> # Bespreek sulfonering, alkylering en acylering aan aromaten.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Structuren:<br /> #* cyclisch AMP<br /> #* Glucaarzuur<br /> <br /> === 25 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de hydrolyse, omestering, aminolyse en reductie van esters.<br /> # Welke methoden ken je om de volgorde van aminozuren in peptiden te bepalen?<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Moleculen:<br /> #* Nerylpyrofosfaat<br /> #* Cellobiose<br /> # Wat zijn epoxylijmen?<br /> <br /> === 25 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Licht toe wat acetalen en hemiacetalen zijn en pas dit toe op de vorming van beta-D-glucopyranose uit D-glucose en de vorming van methyl-beta-D-glucopyranoside.<br /> # Bespreek de labosynthese van peptiden.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Structuren:<br /> #* Trans-decaline<br /> #* Histamine<br /> <br /> === 24 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek reactie alkenen met H2, halogenen en perzuren.<br /> # Bespreek zure en base hydrolyse en omestering van vetten.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Structuren: <br /> #* ADP<br /> #* Maltose<br /> <br /> === 21 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de eleminatiereacties bij halogeenalkanen.<br /> # Bespreek de testreactie van ninhydrine.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Geef de IUPAC-naam.<br /> # Teken de volgende structuren:<br /> #* Dansylchloride<br /> #* Thymidine<br /> # Bespreek nylon 66.<br /> # Cyclisch suiker: <br /> #* Geef de naam.<br /> #* Welk is het zuurste proton ?<br /> #* Geef de configuratie (R/S).<br /> #* Fisher<br /> #* Welke zijn de niet chirale C's ?<br /> # Twee reactiemechanismen.<br /> <br /> === 20 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de additie van zuren op alkenen.<br /> # Bespreek de biosynthese van vetzuren.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam geven.<br /> # Geef de structuur van:<br /> #* Geranylpyrofosfaat<br /> #* Ninhydrine<br /> # Bespreek de Beckmann omlegging.<br /> # Aspartaam gegeven:<br /> #* Welke zijn de verschillende stereoisomeren ?<br /> #* Welke zijn de chirale koolstofatomen en duid aan of R/S zijn.<br /> #* Schrijf de fisherprojectie van L-fenylalanine.<br /> #* Vraag over elektroforese: aantonen waar fenylalanine en asparaginezuur zich bevinden.<br /> # Twee reactiemechanismen.<br /> <br /> === 9 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de reactiemechanisme bij ketonen en aldehyden en vermeld hierbij de factoren die deze reacties beinvloeden. Geef een voorbeeld van additie van alcohol en additie van water. <br /> # Bespreek de isomerisatie van D-glucose oiv van een base en geef een vb in de glycolyse cyclus.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # Structuren:<br /> #* Pyridoxalfosfaat<br /> #* Tosylchloride<br /> # Leg uit wat een kroonether is.<br /> # Structuur asparagine gegeven:<br /> #* Teken alle stereoisomeren (fisher en newman).<br /> #* R/S configuratie<br /> #* Waarom heeft de amine-groep in de structuur geen basische eigenschappen ?<br /> #* Bereken het eerste equivalentiepunt en leg je methode uit.<br /> # Twee reactiemechanismen.<br /> <br /> === 19 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # Nucleofiele additie aan de carbonylgroep bespreken/factoren reactiviteit/aantonen met additie van water en alcohol.<br /> # Manieren om de AZ volgorde te bepalen uitleggen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC naam<br /> # Structuren:<br /> #* Pyridoxalfosfaat<br /> #* Tosylchloride<br /> # Leg Nylon 66 uit.<br /> # Structuur Cysteïne gegeven:<br /> #* Fisher<br /> #* Newman<br /> #* R-S<br /> #* Enantiomeren...<br /> #* Welk molecule <br /> #* Welke vorm komt in de natuur het meeste voor ?<br /> #* Welke is de mesovorm?<br /> # Twee reactiemechanismen<br /> <br /> === 18 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # Aminolyse/omestering/hydrolyse esters.<br /> # Leg de decarboxylatie van carbonzuren uit en breng deze in verband met de Krebscyclus.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Regel van Zaitsev kort bespreken.<br /> # IUPAC-naam<br /> # Structuren: <br /> #* Biotine<br /> #* Cellobiose<br /> # Suikers: <br /> #* Open-ketenstructuur<br /> #* R en S<br /> #* Chirale atomen.<br /> #* 1,3-diaxiale interactie<br /> # Reacties: <br /> #* Alkeen + HCl =&amp;gt; ... <br /> #* Oxidatie van een alcohol.<br /> <br /> <br /> === 18 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # De additie van zuren aan alkenen.<br /> # Mutarotatie uitleggen en illustreren met glucose.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # Structuren: <br /> #* Acetylcholine <br /> #* cAMP<br /> # Omega-3 en omega-6 vetzuren uitleggen.<br /> # Een bepaald aminozuur:<br /> #* Fisher<br /> #* Newman<br /> #* pH-berekeningen<br /> # Reacties: Reactieproducten en soort reactie geven en uitwerken voor een van de twee.<br /> #* Carbonylgroep met H2 en Pt<br /> #* 2 ketonen met OH-<br /> <br /> === 15 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # Eliminatiereacties uitleggen.<br /> # Beta-oxidatie + claisencondensatie.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam (carbonzuurgroep keton, 2 dubbele binden, methyl, en alkynbinding)<br /> # Een suiker omzetten naar een ringstructuur, epimeren aanduiden op bijhorende tabel.<br /> # Biodiesel uitleggen<br /> # Structuren:<br /> #* Dansylchloride<br /> #* Thymidine structuur geven<br /> # Twee reactiemechanismen.<br /> <br /> === 14 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de aldolcondensatie van aldehyden en ketonen.<br /> # Bespreek de reactie van waterstof/halogenen/perzuren aan alkenen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren<br /> #* Oliezuur<br /> #* Adrenaline<br /> # Leg kort uit: kroonethers.<br /> # R-groep van lysine gegeven:<br /> #* Stereoisomeren, R/S, L aanduiden.<br /> #* Newman/fischer projecties.<br /> #* Naam van het aminozuur.<br /> #* Voorkomen bij pH 10 (welke vorm: geprotoneerd of niet?)<br /> # Twee reacties: (je moet maar van 1 het hele mechanisme geven, ander gewoon zeggen welk type reactie en eindproduct)<br /> #* Een keton reageert met HNO3 en H2SO4.<br /> #* Reactie van tertiar alcohol met zuurchloride.<br /> <br /> === 28 aug 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek peptidesynthese in het labo en vergelijk met die ter hoogte van de ribosomen.<br /> # Bespreek additie van zuren aan alkenen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuurformule van adrenaline en gluconzuur.<br /> # Bespreek optische zuiverheid.<br /> # Gegeven: structuurformule threonine.<br /> #* Aantal stereo-isomeren<br /> #* De chirale C-en<br /> #* Fisher- en newman-projectie van elk.<br /> #* Duidt R/S aan.<br /> #* Naam van aminozuur.<br /> #* Bij pH = 7: naar welke pool migreert dit AZ (pk1 en pk2 gegeven) ?<br /> # Beschrijven van reactie: 2 esters (dezelfde) boven de pijl (H3O+ en OC3H7), boven de 2e pijl (H3O+ en NaBH4).<br /> <br /> === 26 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Hemiacetaal en acetaal, pas toe op de vorming van beta-D-glucopyranosyl uit D glucose en de vorming van methyl - beta - D - glucopyranoside.<br /> # Oxidatie, hydrolyse ( in zuur en in basisch milieu) en omestering van olie en vet.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Cystine en adipinezuur structuur geven.<br /> # Regel van Zaitsev uitleggen en illustreren met een voorbeeld.<br /> # Oefening met stereo-isomeren, Fischer, Newman en R en S configuratie.<br /> # Furan + HNO3 + H2SO4 reactie geven.<br /> #* Stoffen geven die ge aan furan moet toevoegen om een ethylgroep op positie 2 (alfa) te induceren.<br /> <br /> === 23 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de laboratoriumsynthese van peptideverbindingen en vergelijk met de manier waarop aminzuren binden met ribosomen.<br /> # Bespreek de reactie van alkenen met waterstof, halogenen en perzuren. <br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuurformule van oliezuur en adrenaline.<br /> # Bespreek cannizaro reacties.<br /> # Structuurformule van een suiker:<br /> #* Geef de fisherprojectie van de ringstructuur.<br /> #* R-S van de C2 bepalen<br /> #* Leidt de naam af.<br /> #* Geef het aantal chirale C's in de haworth aan.<br /> # Reactiemechanisme<br /> <br /> === 23 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de isomerisatie van D-glucose onder invloed van base en breng in verband met een stap uit de glycolyse (alleen deze stap opschrijven).<br /> # Bespreek de afbraak van vetzuren en breng in verband met de Claisencondensatie.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren:<br /> #* Thymidine<br /> #* Dansylchloride<br /> # Verklaar kort het begrip &amp;quot;optische zuiverheid&amp;quot;.<br /> # Een hepteen is gegeven:<br /> #* Geef de verschillende stereovormen in Fisherprojectie.<br /> #* Geef de Newman-projectie van het meest stabiele conformeer.<br /> #* Noteer ook R- en S-conformatie.<br /> # Reactie waarbij de producten, tussenstappen en mechanismen moeten worden aangevuld.<br /> <br /> === 21 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de elektrofiele aromatische substitutie met als voorbeeld nitreerzuur, benzeen en gesubstitueerde benzeenderivaten.<br /> # Bespreek hydrolyse, reductie, omestering en aminolyse van esters.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren:<br /> #* Sacharose <br /> #* SAM<br /> # Bespreek omega-3-vetzuren en omega-6-vetzuren.<br /> # Gegeven: structuurformule arginine <br /> #* Geef het aantal stereo-isomeren.<br /> #* Duidt de cirale C's aan.<br /> #* Fisher- en Newman-projectie van elk.<br /> #* Duid R/S aan.<br /> #* Geef de naam van het aminozuur.<br /> #* Duid aan welke N het meest basisch is.<br /> #* Welk stereo-isomeer is het L-aminozuur ?<br /> # Beschrijven van reactie: 2 keer cyclopenteen met daaraan 2-hexanol (of pentanol ben het vergeten) keten op de pijl staat K2Cr2O7, H+ en koud, boven tweede pijl staat 1 OH- <br /> <br /> === 20 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de additie van zuren aan alkenen (geen carbonzuren bedoeld).<br /> # Bespreek de biosynthese van vetzuren.<br /> <br /> Schriftelijk<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren: <br /> #* Kaneelzuur<br /> #* Cellobiose<br /> # 3-broom-4-cloorhexaan:<br /> #* Stereo-isomeren: Fisher- en Newman-projectie.<br /> #* R,S-configuratie<br /> #* Diastereomeren/enantiomeren?<br /> # Het reactietype en naam en mechanisme van benzeenring met OH aan, bij de pijl staan dibroom en ijzertribroom.<br /> <br /> === 13 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Aldolcondensatie + glycolyse stap die met aldolcondensatie te maken heeft. <br /> # Geef de verschillende methoden om de volgorde van AZ in peptide te vinden. <br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren<br /> #* Stearinezuur<br /> #* Pyridine<br /> # Leg uit: gauche en anti (bij alkanen).<br /> # 2,3,4-hydroxybutanal:<br /> #* Hoeveel stereoisomeren ?<br /> #* Geef Fisher projectie en de Newmann projectie van de meest stabiele conformatie.<br /> #* Geef R,S conformatie. <br /> #* En zeg welke enantiomeren zijn, welke diastereoisomeren zijn, mesovormen.<br /> # Geef reactiemechanisme, reactieproduct (ook in skeletnotatie--&amp;gt; reactieproduct) van:<br /> #* Trans-1-fenyl-1-buteen met verdund zwavelzuur.</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Bio-Organische_Chemie&diff=475 2017-06-15T14:46:28Z

<p>0653300: /* 15 juni 2017 (voormiddag) */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Basisvak organische chemie voor eerstejaars chemie, biochemie en biologie.<br /> Gedoceerd door Professor Luc van Meervelt.<br /> Het examen volgt al jaren dezelfde structuur.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===15 juni 2017 (voormiddag)===<br /> Mondeling<br /> #halogeenalkaan ondergaat een E1 + toelichten zaitsev<br /> #vier moleculen ondergaan een E; welke is het reactiefst? Leg uit mbhv substituenteffecten + resonantievormen tekenen (indien nuttig)<br /> #Waarom kan op een alcohol NIET goed een Sn uitgevoerd worden? (OH- is niet stabiel)<br /> #2 voorbeelden geven hoe dat wel kan + werkt dit ook voor fenol? (protoneren of fosfaatgroep toevoegen)<br /> #Voorbeeld geven van een nucleofiele substitutie van een alcohol in biologische systemen (acetaalvorming v/e reducerende suiker met methanol)<br /> <br /> Schriftelijk<br /> #oefeningen op koolhydraten (R/S; anomeer, epimeer, haworth en newman projecties<br /> #oefeningen op reactiemechanismen (fiederlkraftsacylering, nucleofiele acylsubstietutie)<br /> #oefening op AZ (2 tekenen, titratie-oef, pKa vergelijken)<br /> <br /> ===14 Juni 2017 (namiddag) prof Mario Smet===<br /> Mondeling:<br /> #Elektrofiele additie reactiemechanisme schrijven (regel markovnikov)<br /> #4 moleculen bepalen welke het snelst aan een Ae doet (grensstructuren, inductieve effecten)<br /> #naamgeving van enkele producten na de Ae<br /> #isomerisatie in glycolyse van glucose-6-fosfaat naar fructose-6-fosfaat en uitleggen waarom dit base gekatalyseerd is<br /> #verband uitleggen met Fehling's/ Tollen en Barfoed<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #gegeven moleculen Menthol aantal stereochemische oefeningen oplossen (R/S, diasteromeren, enantiomeren, newman...)<br /> #oefening op AZ op papierelektroforese (waar komt elk AZ bij bepaalde ph)<br /> #aceton+ methylanime wordt imine bij ph=7 laat zien<br /> #enkele reactiemechanisme aanvullen of tekenen ( Nitrering, estercondensatie)<br /> <br /> ===9 juni 2016===<br /> #beckman omlegging<br /> #edman degradatie<br /> #biosynthese geraniol en limoleen<br /> #structuren = S.A.M &amp; biotione<br /> #naamgeving + 2 mechanismes<br /> #oefening ivm stereochemie<br /> <br /> ===8 juni 2016===<br /> #synthese vn peptiden<br /> #hydrolyse, omestering en reductie van esters<br /> #cannizaro reactie<br /> #structuren: -2-isopentenylpyrofosfaat<br /> #Trans decaline<br /> #oef over suikers(suiker bepalen, chirale C's, newman projectie..)<br /> #reactiemechanismen en naamgeving<br /> <br /> ===6 juni 2016===<br /> #Aldolcondensatie en waardat deze terugkomt in de glycolyse<br /> #reactiviteit bij de substitutie reacties van benzeen, tolueen en pyridine vergelijken<br /> #-verschil tussen reducerende suikers en nietreducerende suikers<br /> #structuur van acetyl-choline en palitine<br /> #pH van aminozuren bij een titratie<br /> #reactimechanisme<br /> <br /> === 15 juni 2015 ===<br /> # Claisen condensatie + verband met afbraak van vetzuren<br /> # Bespreek de reactie van geconcentreerd zwavelzuur met:<br /> #* Alkeen<br /> #* Alcohol<br /> #* Aromaat<br /> # acetylcholine en fructose 6 fosfaat tekenen, optische zuiverheid uitleggen. <br /> #Oefeningen over aminozuren (of glutamine en threonine te scheiden waren met elektroforese) fischer, newmann, stereo isomeren erover. <br /> #En dan twee reacties natuurlijk<br /> <br /> ===12 juni 2015 ( namiddag ) ===<br /> <br /> mondeling:<br /> # Leg de reacties met benzeen uit en ook die van purine en fenol.<br /> # Bespreek de hydrolyse en omestering van vetzuren in zuur en basisch milieu. Leg hierbij ook het broomgetal en verzepingsgetal uit.<br /> Schriftelijk:<br /> # Naamgeving ( c-AMP en mannose)<br /> # Leg uit si en re<br /> # Een hele lang oefening vergelijkbaar met de oefeningen van de oefenzitting ( verschil tussen D en L, chirale C, reacties, ...)<br /> <br /> ===12 juni 2015 ( voormiddag ) ===<br /> <br /> mondeling:<br /> #Aminen en halogeenalkanen <br /> #Aminen en salpeterigzuur<br /> #Laboratorium peptidesynthese<br /> <br /> schriftelijk:<br /> #structuren<br /> #*Limoneen<br /> #*Sorbitol<br /> #stereochemie+ reactiemechanisme<br /> #*aldolcondensatie<br /> #leg uit:<br /> #*reducerende en niet-reducerende suikers<br /> <br /> ===11 juni 2015===<br /> <br /> mondeling:<br /> #Wat is ''mutarotatie''? Leg dit uit a.h.v glucose en fructose.<br /> #Leg uit:<br /> #* Fisher-verestering<br /> #* Beckmann-omslag. Je moet ook weten hoe H2O addeert. Hij vraagt hoe je aan een oximen kunt komen. <br /> schriftelijk:<br /> #IUPAC <br /> #structuren<br /> #*citroenzuur<br /> #*ninhydrine<br /> #structuur observeren<br /> #* chirale C-atomen aanduiden<br /> #* OG van aangeduid atoom geven<br /> #* vermelden welke N in de molecule het stabielste is.<br /> #* vermelden hoeveel stereo-isomeren er gevormd kunnen worden.<br /> #* één stereomeer tekenen dat geen enantiomeer is.<br /> #* oefening op pH-waarden binnen titraties. ( ''deze bij 200 mL als de molecule volledig geprotoneerd is'' )<br /> #wat is ''fosforyleringspotentiaal''? Leg uit.<br /> #2 structuren gegeven. <br /> #*Van elk de/het reactieproduct(en) geven en hiervan de juiste skeletnotatie. <br /> #*Geef van één van de 2 tructuren het reactiemechanisme.<br /> <br /> ===16 juni 2014===<br /> #Bespreek de reacties met alkenen (waterstof halogenen en perzuren)<br /> #Iupac<br /> #Bespreek reducerende suikers<br /> #Peridoxalfosfaat en acetylcholine<br /> #Stereochemie<br /> #Reactiemechanismen<br /> <br /> ===20 augustus 2013===<br /> Mondeling:<br /> # Welke reactie kan D-mannose in een basisch milieu ondergaan?<br /> # Leg de biosynthese van vetzuren uit.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC<br /> # Structuren: tBOC en ninhydrine<br /> # Fosforylerings-potentiaal<br /> # Random oefening<br /> # Reacties: Ester+Amide en Alcohol+Zuur<br /> <br /> ===25 juni 2013 (namiddag)===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de elektrofiele en nucleofiele substitutie bij benzeen en pyridine.<br /> # Bespreek eliminatiereacties bij halogeenalkanen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC.<br /> # Structuur van glucaarzuur en tosylchloride.<br /> # Leg optische zuiverheid uit.<br /> # Tryptofaan: chirale koolstoffen, alle stereo-isomeren tekenen in Fischer en Newman, R/S bepalen.<br /> # Reacties: Nucleofiele substitutie halogeenalkaan en Fischer estersynthese.<br /> <br /> ===25 juni 2013 (voormiddag)===<br /> #decarboxylatie alpha-aminozuur en decarboxylatie alpha-ketocarbonzuur<br /> # amine + halogeenalkaan/salpeterigzuur<br /> # iupac<br /> # structuur beta-maltose en geranylpyrofosfaat<br /> # dean-stark<br /> # molecule: chirale centra, R/S, enantiomere/diastereomere/epimeren/anomeren, oxidatie, welke OH zuurste?<br /> # reactie aldehyd + OH/H2o, tetrahydropyraan met HI<br /> <br /> ===17 juni 2013 (namiddag)===<br /> Mondeling:<br /> # Leg de methoden uit om de volgorde van aminozuren in een peptide te achterhalen<br /> # Leg uit: Halfacetaal- en acetaalvorming en pas toe op de vorming van beta-D-glucopyranose en methyl-beta-D-glucopyranoside<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Leg biodiesel uit<br /> # Geef de structuur van limoneen en citroenzuur<br /> # IUPAC-naamgeving<br /> # Molecule gegeven: <br /> #* Geef alle chirale C-atomen + R/S nomenclatuur<br /> #* Newman projectie geven van bepaalde as<br /> #* Is de stikstof erin basisch (verklaar met substituenteffecten)<br /> #* Teken een stereomeer die geen epimeer is<br /> # Reacties waarvan 1 uitwerken:<br /> #* Sn1 van een alkaan met een broom erin<br /> #* Claisen condensatie van een ester<br /> <br /> ===17 juni 2013 (voormiddag)===<br /> Mondeling:<br /> #bespreek reactie alkenen met perzuren, halogenen en H2.<br /> #bespreek decarboxylatie van carbonzuren, pas toe op vb uit citroenzuurcyclus<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #bespreek: reducerend/niet reducerend suiker<br /> #molecules tekenen: biotine en SAM<br /> #iupac naam<br /> #chirale C: OT, R of S aangeven, diasteromeren van een AZ en fisher+newman<br /> #oefening met ph berekening met titratie<br /> #uitleggen waarom pka van 1 lager is dan een ander AZ<br /> #2 ractiemechanismen geven, één ervan uitschrijven<br /> <br /> ===14 juni 2013 (voormiddag)===<br /> Mondeling:<br /> # mutarotatie volledig uitleggen en illustreren voor D-fructose en D-glucose<br /> # Joodgetal, verzepingsgetal, Hydrolyse en omestering (zuur en basisch) voor olie en vetten. (met TEKENINGEN van ELK mechanisme)<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # fosforyleringspotentaal<br /> # 2 mechanismes waarvan ge het mechanisme en het eindproduct moet geven en eentje moet ge tekenen (naar keuze).<br /> # structuur gegeven: <br /> #* geef alle chirale C-atomen <br /> #* Stereo isomeren <br /> #* R en S geven van de chirale C-atomen in de stereo isomeren <br /> #* Zeggen of de dubbele bindingen E of Z zijn <br /> #* bepaal oxidatiegetal van het aangeduide punt <br /> #* verklaar waarom een stof hogere pka heeft als die gegeven is<br /> # er is nog eentje maar die weet ik niet meer.<br /> <br /> === 13 juni 2013 (voormiddag)===<br /> Mondeling: <br /> #synthese van peptiden in het labo<br /> #de hydrolysereactie van esters en fosfaatesters<br /> <br /> schriftelijk: <br /> #iupac naam<br /> #structuur van : cAMP en alpha keto glutaarzuur<br /> #leg de Beckman omlegging uit<br /> #suikers (ge krijgt een blad me alle suikers op) wij hadden xylulose<br /> #* bepaal de absolute configuratie van alle chirale C-atomen<br /> #*teken de meest stabiele open ketenvorm in een speciale projectie, kweet nimeer welke, volgens de C3-C4 as<br /> #*bepaal het oxidatiegetal van C2<br /> #*teken de overgang van L - xylulose naar L alpha xylulopentose<br /> #*teken het anomeer van L alpha xylulopentose<br /> #*welke soort reactie treed op bij een ringsluiting en welk soort katalysator bevordert dit proces<br /> #dan nog twee reacties, waarvan ge een volledig moet uitwerken en van beide reacties moet ge het reactietype geven en reactieproduct(en)<br /> <br /> <br /> === 13 juni 2013 ===<br /> Mondeling:<br /> #bespreek de claisencondensatie en bespreek het verband met de afbraak van vetzuren<br /> #beschrijf de biosynthese van geraniol en limoneen(monoterpenen)<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #Bespreek de regel van Huckel<br /> <br /> <br /> ===15 juni 2012 (voormiddag)===<br /> Mondeling: <br /> # Bespreek de biosynthese van monoterpenen: geraniol (molecule krijg je) en limoneen (structuur wel kennen)<br /> # Bespreek de aldolcondensatie en geef het verband met de glycolyse<br /> <br /> Schriftelijk: <br /> # IUPAC naam geven<br /> # structuren van acetylcholine en citroenzuur<br /> # uitleggen wat reducerende en niet reducerende suikers zijn<br /> # oefening met molecule met fenolen enz aan: fisherprojecties geven van de isomeren en ook de R/S en newmanprojecties van de stabielste moleculen.<br /> # reactiemechanismes aanvullen: nucleofiele additie van H2SO4 aan alkeen en zuurgekatalyseerde claisencondensatie<br /> <br /> ===14 juni 2012 (voormiddag)===<br /> Mondeling:<br /> # bespreek de nucleofiele reacties van carbonylgroep en additie met H20 en alcohol<br /> # Bespreek ninhydrine reactie<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # ne iupac<br /> # Limoneen en fosfoënolpyruvaat tekenen<br /> # Bespreek optische zuiverheid<br /> # oefening met suiker ( bij ons was die suiker L-tagatose dachtek) ma ge krijgt een blad om hem te herkennen (naam geven, fisher tekenen, R/S, een diastereomeer geven dat geen epimeer en geen anomeer is, + waarom suikercyclisatie zuur gekatalyseerd, en dan nog iets ma da wetek ni meer)<br /> # 2 structuren ( 1 was zo cyclisch ether da met HI reageert )<br /> <br /> ===30 juni 2011===<br /> Mondeling:<br /> #Labosynthese van peptiden<br /> #Eliminatiereacties bij halogeenalkanen<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #IUPD-naam<br /> #structuren:<br /> #*Nylon-66<br /> #*Palmitinezuur<br /> #Leg uit: Dean Stark opstelling<br /> #stereochemie<br /> #reactiemechanismen<br /> ===24 Juni 2011 (namiddag)===<br /> Mondeling:<br /> #Ninhydrinereactie<br /> #bespreek reacties van amiden met halogeenalkanen en salpeterigzuur<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #IUPAC-naam<br /> #Structuren:<br /> #*c-AMP<br /> #*Sorbitol<br /> #Leg uit: Cannizzaro-reactie<br /> #stereochemie<br /> #2 reactiemechanismen<br /> ===24 Juni 2011 (voormiddag)===<br /> Mondeling:<br /> #Bio-synthese van vetzuren en het verband met de Claisencondensatie<br /> #reacties van alkenen met waterstof, halogenen en perzuren.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #IUPAC-naam<br /> #structuren:<br /> #*ATP<br /> #*citroenzuur<br /> #Leg uit: Diazokoppelingsreactie<br /> #stereochemie<br /> #2 reactiemechanismen<br /> ===16 Juni 2011===<br /> Mondeling:<br /> #Leg uit: acetaal- en halfacetaalvorming.<br /> #Reacties van anorganische zuren met alkenen en alkynen<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #IUPAC-naam<br /> #structuren:<br /> #*limoneen<br /> #*D-mannose<br /> #leg uit: Kolbe-Schmitt reactie<br /> #stereochemie<br /> #2 reactiemechanismen<br /> ===23 augustus 2010===<br /> Mondeling:<br /> # Ninhydrinereactie<br /> # Welke reacties kan D-fructose in base ondergaan?<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # structuren:<br /> #* Pyridoxalfosfaat<br /> #* SAM<br /> # leg uit: Biodiesel<br /> # stereochemie<br /> # twee reactiemechanismen:<br /> #* keton met alcohol<br /> #* amide in water (zuurgekatalyseerd)<br /> ===18 juni 2010===<br /> Mondeling:<br /> # Reactie van anorganische zuren met alkenen en alkynen.<br /> # Alkylering, sulfonering en acylering van aromaten.<br /> <br /> schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # structuren<br /> #* (delta2)isopentenylpyrofosfaat<br /> #* cellobiose<br /> # leg uit: epoxyharsen en -lijmen<br /> # stereochemie aminozuur met R = -CHOH-CH3<br /> #* duid chirale koolstoffen aan<br /> #* hoeveel conformaties zijn er? en teken deze<br /> #* benoem (R,S)<br /> #* welke zijn enantiomeren? diastereomeren?<br /> #* bepaal het oxidatiegetal van de C-atomen<br /> #* welk is het meest basisch en zeg waarom...<br /> # twee reactiemechanismen waarvan 1 helemaal uitschrijven<br /> ===14 juni 2010===<br /> Mondeling:<br /> # Welke reacties gebeuren er met suikers in basisch milieu? (en dan bedoelt hij specifiek in basisch milieu)<br /> # Bespreek de oxidatie van alcoholen in het labo met K2Cr2O7 en in de natuur met NAD+ en illustreer met een voorbeeld in de citroenzuurcyclus<br /> <br /> schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # structuren<br /> #* Dansylchloride<br /> #* Biotine<br /> # leg uit: reactie van Chichibabin<br /> # stereochemie<br /> #* duid chirale koolstoffen aan<br /> #* hoeveel conformaties zijn er? en teken deze<br /> #* benoem (R,S)<br /> #* welke zijn enantiomeren? diastereomeren?<br /> #* is er een mesovorm?<br /> #* welk is het meest basisch: CH3CH2COO- of CH3CH2C=-C- (driedubbele binding) en zeg waarom<br /> # twee reactiemechanismen waarvan 1 helemaal uitschrijven<br /> <br /> ===11 juni 2010===<br /> Mondeling:<br /> # Wat geven alkenen met <br /> #* Anorganische zuren; <br /> #* Perzuren (ook energieschema's kennen, effecten van concentraties enzo)<br /> # Bespreek de biosynthese van vetzuren (Claisen-condensatiestap belangrijkst)<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # structuren<br /> #*SAM (S-adenosylmethionine)<br /> #*PET<br /> # Leg uit: Kolbe-Schmidt-reactie (aspirine dus)<br /> # Stereo-chemie:<br /> #* teken (beta)-L-gulopyranose (lineaire vorm gegeven)<br /> #* teken gunstigste Newman-projectie volgens C2-C3-as<br /> #* wat is de oxidatietrap van C6?<br /> #* geef de anomeer en een epimeer van L-gulose<br /> # 2 reactiemechanismen (1 uitschrijven)<br /> #* oxidatie van een alcohol en aldehyde met K2Cr2O7, H2SO4, koud<br /> #* Friedel-Crafts-acylering<br /> -<br /> ===22 juni 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de aldolcondensatie. Bespreek ook de stap van de glycolyse die verband houdt met de aldolcondensatie.<br /> # Bespreek de hydrolyse en omestering van vetten. Leg ook uit wat het verzepingsgetal en het joodgetal is.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam geven.<br /> # Structuren:<br /> #* dansylchloride<br /> #* cellobiose<br /> # Leg uit: De Beckmann-omlegging<br /> # Je krijgt een molecule gegeven <br /> #* Duid alle assymetrische koolstofatomen aan met een &amp;quot;*&amp;quot; en zeg of ze een R of S-configuratie hebben<br /> #* Teken het enantiomeer en 2 epimeren<br /> #* Van een N-atoom zeggen dat het basischer of zuurder is in vergelijking met ammoniak<br /> #* 2 mesomeren vormen geven (buiten die van benzeenring)<br /> # Twee reactiemechanismen (producten + soort reactie geven + één mechanisme helemaal uitschrijven)<br /> #* tertair alcohol + zuurchloride<br /> #* alkeen + zuur<br /> <br /> <br /> ===19 juni 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # bespreek de nucleofiele additie aan de carbonylgroep. Bespreek de factoren die de reactiviteit van aldehyden en ketonen beinvloed. geef de reactie met water en alcoholen<br /> # bespreek de reactie van alkenen met waterstof, halogenen en perzuren<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam geven.<br /> # Structuren:<br /> #* maltose<br /> #* fosfoënolpyruvaat<br /> # Leg uit: epoxyharsen en -lijmen<br /> # gegeven: aminozuur met zijgroep: R=CH2-SH<br /> #* Hoeveel stereoisomeren bestaan er van dit molecule+ welk aminozuur is dit<br /> #* geef de fischerprojectie en de Newmanprojectie( volgens C2-C3 as) van stabielste conformatie van elk stereoisomeer.Geef van elke chirale C of het R of S is.<br /> #* titratie: je begint met 100ml van O,2M oplossing van aminozuur(volledig geprotoneerd) en je titreert met 0,2M NaOH.(Pk1=1,9 Pk2=10,7 Pkr=8,4<br /> #*# bereken PH als je 150ml NaOH toegevoegd hebt<br /> #*# Bereken PH als je 300ml NaOH toegevoegd hebt<br /> #*# wat is(zijn) de voornaamste vorm(en) van het aminozuur bij PH=8,4<br /> # reactiemechanismen<br /> <br /> === 15 juni 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # Leg de decarboxylering van carbonzuren uit en pas toe in een stap uit de citroenzuurcyclus<br /> # Welke technieken ken je voor het bepalen van de aminozuurvolgorde in een peptideketen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam geven.<br /> # Structuren:<br /> #* Biotine<br /> #* (delta)³ - isopentenylpyrofosfaat<br /> # Leg uit: de reactie van chichibabin<br /> # Cyclische L-suiker gegeven:<br /> #* Geef de naam en de lineaire structuur. (lijst met ongekende suikers gegeven)<br /> #* Bepaal van C² of het R of S - configuratie heeft<br /> #* Duidt niet-chirale C-atomen in lineaire en cyclische structuur aan<br /> #* Hoeveel 1,3-diaxiale interacties zijn er?<br /> <br /> === 8 juni 2008===<br /> # Leg uit: de reactie van een zuur met een alkeen/alkyn.<br /> # Leg uit: de Claisen-condensatie en breng dit in verband met de biosynthese van lipiden/vetten.<br /> # Teken de structuur van S-adenosyl-methionine en van sacharose.<br /> # Leg uit: optische zuiverheid.<br /> # Oefeningen:<br /> #* Stereochemie, invloed van substituenten op de zuurtegraad etc. <br /> #* Reactiemechanismen<br /> <br /> === 18 aug 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Geef de biosynthese van monoterpenen voor de vorming van geraniol en limoneen.<br /> # Bespreek sulfonering, alkylering en acylering aan aromaten.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Structuren:<br /> #* cyclisch AMP<br /> #* Glucaarzuur<br /> <br /> === 25 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de hydrolyse, omestering, aminolyse en reductie van esters.<br /> # Welke methoden ken je om de volgorde van aminozuren in peptiden te bepalen?<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Moleculen:<br /> #* Nerylpyrofosfaat<br /> #* Cellobiose<br /> # Wat zijn epoxylijmen?<br /> <br /> === 25 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Licht toe wat acetalen en hemiacetalen zijn en pas dit toe op de vorming van beta-D-glucopyranose uit D-glucose en de vorming van methyl-beta-D-glucopyranoside.<br /> # Bespreek de labosynthese van peptiden.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Structuren:<br /> #* Trans-decaline<br /> #* Histamine<br /> <br /> === 24 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek reactie alkenen met H2, halogenen en perzuren.<br /> # Bespreek zure en base hydrolyse en omestering van vetten.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Structuren: <br /> #* ADP<br /> #* Maltose<br /> <br /> === 21 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de eleminatiereacties bij halogeenalkanen.<br /> # Bespreek de testreactie van ninhydrine.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Geef de IUPAC-naam.<br /> # Teken de volgende structuren:<br /> #* Dansylchloride<br /> #* Thymidine<br /> # Bespreek nylon 66.<br /> # Cyclisch suiker: <br /> #* Geef de naam.<br /> #* Welk is het zuurste proton ?<br /> #* Geef de configuratie (R/S).<br /> #* Fisher<br /> #* Welke zijn de niet chirale C's ?<br /> # Twee reactiemechanismen.<br /> <br /> === 20 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de additie van zuren op alkenen.<br /> # Bespreek de biosynthese van vetzuren.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam geven.<br /> # Geef de structuur van:<br /> #* Geranylpyrofosfaat<br /> #* Ninhydrine<br /> # Bespreek de Beckmann omlegging.<br /> # Aspartaam gegeven:<br /> #* Welke zijn de verschillende stereoisomeren ?<br /> #* Welke zijn de chirale koolstofatomen en duid aan of R/S zijn.<br /> #* Schrijf de fisherprojectie van L-fenylalanine.<br /> #* Vraag over elektroforese: aantonen waar fenylalanine en asparaginezuur zich bevinden.<br /> # Twee reactiemechanismen.<br /> <br /> === 9 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de reactiemechanisme bij ketonen en aldehyden en vermeld hierbij de factoren die deze reacties beinvloeden. Geef een voorbeeld van additie van alcohol en additie van water. <br /> # Bespreek de isomerisatie van D-glucose oiv van een base en geef een vb in de glycolyse cyclus.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # Structuren:<br /> #* Pyridoxalfosfaat<br /> #* Tosylchloride<br /> # Leg uit wat een kroonether is.<br /> # Structuur asparagine gegeven:<br /> #* Teken alle stereoisomeren (fisher en newman).<br /> #* R/S configuratie<br /> #* Waarom heeft de amine-groep in de structuur geen basische eigenschappen ?<br /> #* Bereken het eerste equivalentiepunt en leg je methode uit.<br /> # Twee reactiemechanismen.<br /> <br /> === 19 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # Nucleofiele additie aan de carbonylgroep bespreken/factoren reactiviteit/aantonen met additie van water en alcohol.<br /> # Manieren om de AZ volgorde te bepalen uitleggen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC naam<br /> # Structuren:<br /> #* Pyridoxalfosfaat<br /> #* Tosylchloride<br /> # Leg Nylon 66 uit.<br /> # Structuur Cysteïne gegeven:<br /> #* Fisher<br /> #* Newman<br /> #* R-S<br /> #* Enantiomeren...<br /> #* Welk molecule <br /> #* Welke vorm komt in de natuur het meeste voor ?<br /> #* Welke is de mesovorm?<br /> # Twee reactiemechanismen<br /> <br /> === 18 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # Aminolyse/omestering/hydrolyse esters.<br /> # Leg de decarboxylatie van carbonzuren uit en breng deze in verband met de Krebscyclus.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Regel van Zaitsev kort bespreken.<br /> # IUPAC-naam<br /> # Structuren: <br /> #* Biotine<br /> #* Cellobiose<br /> # Suikers: <br /> #* Open-ketenstructuur<br /> #* R en S<br /> #* Chirale atomen.<br /> #* 1,3-diaxiale interactie<br /> # Reacties: <br /> #* Alkeen + HCl =&amp;gt; ... <br /> #* Oxidatie van een alcohol.<br /> <br /> <br /> === 18 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # De additie van zuren aan alkenen.<br /> # Mutarotatie uitleggen en illustreren met glucose.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # Structuren: <br /> #* Acetylcholine <br /> #* cAMP<br /> # Omega-3 en omega-6 vetzuren uitleggen.<br /> # Een bepaald aminozuur:<br /> #* Fisher<br /> #* Newman<br /> #* pH-berekeningen<br /> # Reacties: Reactieproducten en soort reactie geven en uitwerken voor een van de twee.<br /> #* Carbonylgroep met H2 en Pt<br /> #* 2 ketonen met OH-<br /> <br /> === 15 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # Eliminatiereacties uitleggen.<br /> # Beta-oxidatie + claisencondensatie.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam (carbonzuurgroep keton, 2 dubbele binden, methyl, en alkynbinding)<br /> # Een suiker omzetten naar een ringstructuur, epimeren aanduiden op bijhorende tabel.<br /> # Biodiesel uitleggen<br /> # Structuren:<br /> #* Dansylchloride<br /> #* Thymidine structuur geven<br /> # Twee reactiemechanismen.<br /> <br /> === 14 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de aldolcondensatie van aldehyden en ketonen.<br /> # Bespreek de reactie van waterstof/halogenen/perzuren aan alkenen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren<br /> #* Oliezuur<br /> #* Adrenaline<br /> # Leg kort uit: kroonethers.<br /> # R-groep van lysine gegeven:<br /> #* Stereoisomeren, R/S, L aanduiden.<br /> #* Newman/fischer projecties.<br /> #* Naam van het aminozuur.<br /> #* Voorkomen bij pH 10 (welke vorm: geprotoneerd of niet?)<br /> # Twee reacties: (je moet maar van 1 het hele mechanisme geven, ander gewoon zeggen welk type reactie en eindproduct)<br /> #* Een keton reageert met HNO3 en H2SO4.<br /> #* Reactie van tertiar alcohol met zuurchloride.<br /> <br /> === 28 aug 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek peptidesynthese in het labo en vergelijk met die ter hoogte van de ribosomen.<br /> # Bespreek additie van zuren aan alkenen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuurformule van adrenaline en gluconzuur.<br /> # Bespreek optische zuiverheid.<br /> # Gegeven: structuurformule threonine.<br /> #* Aantal stereo-isomeren<br /> #* De chirale C-en<br /> #* Fisher- en newman-projectie van elk.<br /> #* Duidt R/S aan.<br /> #* Naam van aminozuur.<br /> #* Bij pH = 7: naar welke pool migreert dit AZ (pk1 en pk2 gegeven) ?<br /> # Beschrijven van reactie: 2 esters (dezelfde) boven de pijl (H3O+ en OC3H7), boven de 2e pijl (H3O+ en NaBH4).<br /> <br /> === 26 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Hemiacetaal en acetaal, pas toe op de vorming van beta-D-glucopyranosyl uit D glucose en de vorming van methyl - beta - D - glucopyranoside.<br /> # Oxidatie, hydrolyse ( in zuur en in basisch milieu) en omestering van olie en vet.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Cystine en adipinezuur structuur geven.<br /> # Regel van Zaitsev uitleggen en illustreren met een voorbeeld.<br /> # Oefening met stereo-isomeren, Fischer, Newman en R en S configuratie.<br /> # Furan + HNO3 + H2SO4 reactie geven.<br /> #* Stoffen geven die ge aan furan moet toevoegen om een ethylgroep op positie 2 (alfa) te induceren.<br /> <br /> === 23 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de laboratoriumsynthese van peptideverbindingen en vergelijk met de manier waarop aminzuren binden met ribosomen.<br /> # Bespreek de reactie van alkenen met waterstof, halogenen en perzuren. <br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuurformule van oliezuur en adrenaline.<br /> # Bespreek cannizaro reacties.<br /> # Structuurformule van een suiker:<br /> #* Geef de fisherprojectie van de ringstructuur.<br /> #* R-S van de C2 bepalen<br /> #* Leidt de naam af.<br /> #* Geef het aantal chirale C's in de haworth aan.<br /> # Reactiemechanisme<br /> <br /> === 23 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de isomerisatie van D-glucose onder invloed van base en breng in verband met een stap uit de glycolyse (alleen deze stap opschrijven).<br /> # Bespreek de afbraak van vetzuren en breng in verband met de Claisencondensatie.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren:<br /> #* Thymidine<br /> #* Dansylchloride<br /> # Verklaar kort het begrip &amp;quot;optische zuiverheid&amp;quot;.<br /> # Een hepteen is gegeven:<br /> #* Geef de verschillende stereovormen in Fisherprojectie.<br /> #* Geef de Newman-projectie van het meest stabiele conformeer.<br /> #* Noteer ook R- en S-conformatie.<br /> # Reactie waarbij de producten, tussenstappen en mechanismen moeten worden aangevuld.<br /> <br /> === 21 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de elektrofiele aromatische substitutie met als voorbeeld nitreerzuur, benzeen en gesubstitueerde benzeenderivaten.<br /> # Bespreek hydrolyse, reductie, omestering en aminolyse van esters.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren:<br /> #* Sacharose <br /> #* SAM<br /> # Bespreek omega-3-vetzuren en omega-6-vetzuren.<br /> # Gegeven: structuurformule arginine <br /> #* Geef het aantal stereo-isomeren.<br /> #* Duidt de cirale C's aan.<br /> #* Fisher- en Newman-projectie van elk.<br /> #* Duid R/S aan.<br /> #* Geef de naam van het aminozuur.<br /> #* Duid aan welke N het meest basisch is.<br /> #* Welk stereo-isomeer is het L-aminozuur ?<br /> # Beschrijven van reactie: 2 keer cyclopenteen met daaraan 2-hexanol (of pentanol ben het vergeten) keten op de pijl staat K2Cr2O7, H+ en koud, boven tweede pijl staat 1 OH- <br /> <br /> === 20 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de additie van zuren aan alkenen (geen carbonzuren bedoeld).<br /> # Bespreek de biosynthese van vetzuren.<br /> <br /> Schriftelijk<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren: <br /> #* Kaneelzuur<br /> #* Cellobiose<br /> # 3-broom-4-cloorhexaan:<br /> #* Stereo-isomeren: Fisher- en Newman-projectie.<br /> #* R,S-configuratie<br /> #* Diastereomeren/enantiomeren?<br /> # Het reactietype en naam en mechanisme van benzeenring met OH aan, bij de pijl staan dibroom en ijzertribroom.<br /> <br /> === 13 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Aldolcondensatie + glycolyse stap die met aldolcondensatie te maken heeft. <br /> # Geef de verschillende methoden om de volgorde van AZ in peptide te vinden. <br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren<br /> #* Stearinezuur<br /> #* Pyridine<br /> # Leg uit: gauche en anti (bij alkanen).<br /> # 2,3,4-hydroxybutanal:<br /> #* Hoeveel stereoisomeren ?<br /> #* Geef Fisher projectie en de Newmann projectie van de meest stabiele conformatie.<br /> #* Geef R,S conformatie. <br /> #* En zeg welke enantiomeren zijn, welke diastereoisomeren zijn, mesovormen.<br /> # Geef reactiemechanisme, reactieproduct (ook in skeletnotatie--&amp;gt; reactieproduct) van:<br /> #* Trans-1-fenyl-1-buteen met verdund zwavelzuur.</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Bio-Organische_Chemie&diff=474 2017-06-15T14:45:57Z

<p>0653300: /* 14 Juni 2017 (namiddag) */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Basisvak organische chemie voor eerstejaars chemie, biochemie en biologie.<br /> Gedoceerd door Professor Luc van Meervelt.<br /> Het examen volgt al jaren dezelfde structuur.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===15 juni 2017 (voormiddag)===<br /> Mondeling<br /> #halogeenalkaan ondergaat een E1 + toelichten zaitsev<br /> #vier moleculen ondergaan een E; welke is het reactiefst? Leg uit mbhv substituenteffecten + resonantievormen tekenen (indien nuttig)<br /> #Waarom kan op een alcohol NIET goed een Sn uitgevoerd worden? (OH- is niet stabiel)<br /> #2 voorbeelden geven hoe dat wel kan + werkt dit ook voor fenol? (protoneren of fosfaatgroep toevoegen)<br /> #Voorbeeld geven van een nucleofiele substitutie van een alcohol in biologische systemen (acetaalvorming v/e reducerende suiker met methanol)<br /> <br /> Schriftelijk<br /> #oefeningen op koolhydraten (R/S; anomeer, epimeer, haworth en newman projecties<br /> #oefeningen op reactiemechanismen (fiederlkraftsacylering, nucleofiele acylsubstietutie)<br /> #oefening op AZ (2 tekenen, titratie-oef, pKa vergelijken)<br /> <br /> ===14 Juni 2017 (namiddag)=== (prof Mario Smet)<br /> Mondeling:<br /> #Elektrofiele additie reactiemechanisme schrijven (regel markovnikov)<br /> #4 moleculen bepalen welke het snelst aan een Ae doet (grensstructuren, inductieve effecten)<br /> #naamgeving van enkele producten na de Ae<br /> #isomerisatie in glycolyse van glucose-6-fosfaat naar fructose-6-fosfaat en uitleggen waarom dit base gekatalyseerd is<br /> #verband uitleggen met Fehling's/ Tollen en Barfoed<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #gegeven moleculen Menthol aantal stereochemische oefeningen oplossen (R/S, diasteromeren, enantiomeren, newman...)<br /> #oefening op AZ op papierelektroforese (waar komt elk AZ bij bepaalde ph)<br /> #aceton+ methylanime wordt imine bij ph=7 laat zien<br /> #enkele reactiemechanisme aanvullen of tekenen ( Nitrering, estercondensatie)<br /> <br /> ===9 juni 2016===<br /> #beckman omlegging<br /> #edman degradatie<br /> #biosynthese geraniol en limoleen<br /> #structuren = S.A.M &amp; biotione<br /> #naamgeving + 2 mechanismes<br /> #oefening ivm stereochemie<br /> <br /> ===8 juni 2016===<br /> #synthese vn peptiden<br /> #hydrolyse, omestering en reductie van esters<br /> #cannizaro reactie<br /> #structuren: -2-isopentenylpyrofosfaat<br /> #Trans decaline<br /> #oef over suikers(suiker bepalen, chirale C's, newman projectie..)<br /> #reactiemechanismen en naamgeving<br /> <br /> ===6 juni 2016===<br /> #Aldolcondensatie en waardat deze terugkomt in de glycolyse<br /> #reactiviteit bij de substitutie reacties van benzeen, tolueen en pyridine vergelijken<br /> #-verschil tussen reducerende suikers en nietreducerende suikers<br /> #structuur van acetyl-choline en palitine<br /> #pH van aminozuren bij een titratie<br /> #reactimechanisme<br /> <br /> === 15 juni 2015 ===<br /> # Claisen condensatie + verband met afbraak van vetzuren<br /> # Bespreek de reactie van geconcentreerd zwavelzuur met:<br /> #* Alkeen<br /> #* Alcohol<br /> #* Aromaat<br /> # acetylcholine en fructose 6 fosfaat tekenen, optische zuiverheid uitleggen. <br /> #Oefeningen over aminozuren (of glutamine en threonine te scheiden waren met elektroforese) fischer, newmann, stereo isomeren erover. <br /> #En dan twee reacties natuurlijk<br /> <br /> ===12 juni 2015 ( namiddag ) ===<br /> <br /> mondeling:<br /> # Leg de reacties met benzeen uit en ook die van purine en fenol.<br /> # Bespreek de hydrolyse en omestering van vetzuren in zuur en basisch milieu. Leg hierbij ook het broomgetal en verzepingsgetal uit.<br /> Schriftelijk:<br /> # Naamgeving ( c-AMP en mannose)<br /> # Leg uit si en re<br /> # Een hele lang oefening vergelijkbaar met de oefeningen van de oefenzitting ( verschil tussen D en L, chirale C, reacties, ...)<br /> <br /> ===12 juni 2015 ( voormiddag ) ===<br /> <br /> mondeling:<br /> #Aminen en halogeenalkanen <br /> #Aminen en salpeterigzuur<br /> #Laboratorium peptidesynthese<br /> <br /> schriftelijk:<br /> #structuren<br /> #*Limoneen<br /> #*Sorbitol<br /> #stereochemie+ reactiemechanisme<br /> #*aldolcondensatie<br /> #leg uit:<br /> #*reducerende en niet-reducerende suikers<br /> <br /> ===11 juni 2015===<br /> <br /> mondeling:<br /> #Wat is ''mutarotatie''? Leg dit uit a.h.v glucose en fructose.<br /> #Leg uit:<br /> #* Fisher-verestering<br /> #* Beckmann-omslag. Je moet ook weten hoe H2O addeert. Hij vraagt hoe je aan een oximen kunt komen. <br /> schriftelijk:<br /> #IUPAC <br /> #structuren<br /> #*citroenzuur<br /> #*ninhydrine<br /> #structuur observeren<br /> #* chirale C-atomen aanduiden<br /> #* OG van aangeduid atoom geven<br /> #* vermelden welke N in de molecule het stabielste is.<br /> #* vermelden hoeveel stereo-isomeren er gevormd kunnen worden.<br /> #* één stereomeer tekenen dat geen enantiomeer is.<br /> #* oefening op pH-waarden binnen titraties. ( ''deze bij 200 mL als de molecule volledig geprotoneerd is'' )<br /> #wat is ''fosforyleringspotentiaal''? Leg uit.<br /> #2 structuren gegeven. <br /> #*Van elk de/het reactieproduct(en) geven en hiervan de juiste skeletnotatie. <br /> #*Geef van één van de 2 tructuren het reactiemechanisme.<br /> <br /> ===16 juni 2014===<br /> #Bespreek de reacties met alkenen (waterstof halogenen en perzuren)<br /> #Iupac<br /> #Bespreek reducerende suikers<br /> #Peridoxalfosfaat en acetylcholine<br /> #Stereochemie<br /> #Reactiemechanismen<br /> <br /> ===20 augustus 2013===<br /> Mondeling:<br /> # Welke reactie kan D-mannose in een basisch milieu ondergaan?<br /> # Leg de biosynthese van vetzuren uit.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC<br /> # Structuren: tBOC en ninhydrine<br /> # Fosforylerings-potentiaal<br /> # Random oefening<br /> # Reacties: Ester+Amide en Alcohol+Zuur<br /> <br /> ===25 juni 2013 (namiddag)===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de elektrofiele en nucleofiele substitutie bij benzeen en pyridine.<br /> # Bespreek eliminatiereacties bij halogeenalkanen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC.<br /> # Structuur van glucaarzuur en tosylchloride.<br /> # Leg optische zuiverheid uit.<br /> # Tryptofaan: chirale koolstoffen, alle stereo-isomeren tekenen in Fischer en Newman, R/S bepalen.<br /> # Reacties: Nucleofiele substitutie halogeenalkaan en Fischer estersynthese.<br /> <br /> ===25 juni 2013 (voormiddag)===<br /> #decarboxylatie alpha-aminozuur en decarboxylatie alpha-ketocarbonzuur<br /> # amine + halogeenalkaan/salpeterigzuur<br /> # iupac<br /> # structuur beta-maltose en geranylpyrofosfaat<br /> # dean-stark<br /> # molecule: chirale centra, R/S, enantiomere/diastereomere/epimeren/anomeren, oxidatie, welke OH zuurste?<br /> # reactie aldehyd + OH/H2o, tetrahydropyraan met HI<br /> <br /> ===17 juni 2013 (namiddag)===<br /> Mondeling:<br /> # Leg de methoden uit om de volgorde van aminozuren in een peptide te achterhalen<br /> # Leg uit: Halfacetaal- en acetaalvorming en pas toe op de vorming van beta-D-glucopyranose en methyl-beta-D-glucopyranoside<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Leg biodiesel uit<br /> # Geef de structuur van limoneen en citroenzuur<br /> # IUPAC-naamgeving<br /> # Molecule gegeven: <br /> #* Geef alle chirale C-atomen + R/S nomenclatuur<br /> #* Newman projectie geven van bepaalde as<br /> #* Is de stikstof erin basisch (verklaar met substituenteffecten)<br /> #* Teken een stereomeer die geen epimeer is<br /> # Reacties waarvan 1 uitwerken:<br /> #* Sn1 van een alkaan met een broom erin<br /> #* Claisen condensatie van een ester<br /> <br /> ===17 juni 2013 (voormiddag)===<br /> Mondeling:<br /> #bespreek reactie alkenen met perzuren, halogenen en H2.<br /> #bespreek decarboxylatie van carbonzuren, pas toe op vb uit citroenzuurcyclus<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #bespreek: reducerend/niet reducerend suiker<br /> #molecules tekenen: biotine en SAM<br /> #iupac naam<br /> #chirale C: OT, R of S aangeven, diasteromeren van een AZ en fisher+newman<br /> #oefening met ph berekening met titratie<br /> #uitleggen waarom pka van 1 lager is dan een ander AZ<br /> #2 ractiemechanismen geven, één ervan uitschrijven<br /> <br /> ===14 juni 2013 (voormiddag)===<br /> Mondeling:<br /> # mutarotatie volledig uitleggen en illustreren voor D-fructose en D-glucose<br /> # Joodgetal, verzepingsgetal, Hydrolyse en omestering (zuur en basisch) voor olie en vetten. (met TEKENINGEN van ELK mechanisme)<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # fosforyleringspotentaal<br /> # 2 mechanismes waarvan ge het mechanisme en het eindproduct moet geven en eentje moet ge tekenen (naar keuze).<br /> # structuur gegeven: <br /> #* geef alle chirale C-atomen <br /> #* Stereo isomeren <br /> #* R en S geven van de chirale C-atomen in de stereo isomeren <br /> #* Zeggen of de dubbele bindingen E of Z zijn <br /> #* bepaal oxidatiegetal van het aangeduide punt <br /> #* verklaar waarom een stof hogere pka heeft als die gegeven is<br /> # er is nog eentje maar die weet ik niet meer.<br /> <br /> === 13 juni 2013 (voormiddag)===<br /> Mondeling: <br /> #synthese van peptiden in het labo<br /> #de hydrolysereactie van esters en fosfaatesters<br /> <br /> schriftelijk: <br /> #iupac naam<br /> #structuur van : cAMP en alpha keto glutaarzuur<br /> #leg de Beckman omlegging uit<br /> #suikers (ge krijgt een blad me alle suikers op) wij hadden xylulose<br /> #* bepaal de absolute configuratie van alle chirale C-atomen<br /> #*teken de meest stabiele open ketenvorm in een speciale projectie, kweet nimeer welke, volgens de C3-C4 as<br /> #*bepaal het oxidatiegetal van C2<br /> #*teken de overgang van L - xylulose naar L alpha xylulopentose<br /> #*teken het anomeer van L alpha xylulopentose<br /> #*welke soort reactie treed op bij een ringsluiting en welk soort katalysator bevordert dit proces<br /> #dan nog twee reacties, waarvan ge een volledig moet uitwerken en van beide reacties moet ge het reactietype geven en reactieproduct(en)<br /> <br /> <br /> === 13 juni 2013 ===<br /> Mondeling:<br /> #bespreek de claisencondensatie en bespreek het verband met de afbraak van vetzuren<br /> #beschrijf de biosynthese van geraniol en limoneen(monoterpenen)<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #Bespreek de regel van Huckel<br /> <br /> <br /> ===15 juni 2012 (voormiddag)===<br /> Mondeling: <br /> # Bespreek de biosynthese van monoterpenen: geraniol (molecule krijg je) en limoneen (structuur wel kennen)<br /> # Bespreek de aldolcondensatie en geef het verband met de glycolyse<br /> <br /> Schriftelijk: <br /> # IUPAC naam geven<br /> # structuren van acetylcholine en citroenzuur<br /> # uitleggen wat reducerende en niet reducerende suikers zijn<br /> # oefening met molecule met fenolen enz aan: fisherprojecties geven van de isomeren en ook de R/S en newmanprojecties van de stabielste moleculen.<br /> # reactiemechanismes aanvullen: nucleofiele additie van H2SO4 aan alkeen en zuurgekatalyseerde claisencondensatie<br /> <br /> ===14 juni 2012 (voormiddag)===<br /> Mondeling:<br /> # bespreek de nucleofiele reacties van carbonylgroep en additie met H20 en alcohol<br /> # Bespreek ninhydrine reactie<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # ne iupac<br /> # Limoneen en fosfoënolpyruvaat tekenen<br /> # Bespreek optische zuiverheid<br /> # oefening met suiker ( bij ons was die suiker L-tagatose dachtek) ma ge krijgt een blad om hem te herkennen (naam geven, fisher tekenen, R/S, een diastereomeer geven dat geen epimeer en geen anomeer is, + waarom suikercyclisatie zuur gekatalyseerd, en dan nog iets ma da wetek ni meer)<br /> # 2 structuren ( 1 was zo cyclisch ether da met HI reageert )<br /> <br /> ===30 juni 2011===<br /> Mondeling:<br /> #Labosynthese van peptiden<br /> #Eliminatiereacties bij halogeenalkanen<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #IUPD-naam<br /> #structuren:<br /> #*Nylon-66<br /> #*Palmitinezuur<br /> #Leg uit: Dean Stark opstelling<br /> #stereochemie<br /> #reactiemechanismen<br /> ===24 Juni 2011 (namiddag)===<br /> Mondeling:<br /> #Ninhydrinereactie<br /> #bespreek reacties van amiden met halogeenalkanen en salpeterigzuur<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #IUPAC-naam<br /> #Structuren:<br /> #*c-AMP<br /> #*Sorbitol<br /> #Leg uit: Cannizzaro-reactie<br /> #stereochemie<br /> #2 reactiemechanismen<br /> ===24 Juni 2011 (voormiddag)===<br /> Mondeling:<br /> #Bio-synthese van vetzuren en het verband met de Claisencondensatie<br /> #reacties van alkenen met waterstof, halogenen en perzuren.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #IUPAC-naam<br /> #structuren:<br /> #*ATP<br /> #*citroenzuur<br /> #Leg uit: Diazokoppelingsreactie<br /> #stereochemie<br /> #2 reactiemechanismen<br /> ===16 Juni 2011===<br /> Mondeling:<br /> #Leg uit: acetaal- en halfacetaalvorming.<br /> #Reacties van anorganische zuren met alkenen en alkynen<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> #IUPAC-naam<br /> #structuren:<br /> #*limoneen<br /> #*D-mannose<br /> #leg uit: Kolbe-Schmitt reactie<br /> #stereochemie<br /> #2 reactiemechanismen<br /> ===23 augustus 2010===<br /> Mondeling:<br /> # Ninhydrinereactie<br /> # Welke reacties kan D-fructose in base ondergaan?<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # structuren:<br /> #* Pyridoxalfosfaat<br /> #* SAM<br /> # leg uit: Biodiesel<br /> # stereochemie<br /> # twee reactiemechanismen:<br /> #* keton met alcohol<br /> #* amide in water (zuurgekatalyseerd)<br /> ===18 juni 2010===<br /> Mondeling:<br /> # Reactie van anorganische zuren met alkenen en alkynen.<br /> # Alkylering, sulfonering en acylering van aromaten.<br /> <br /> schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # structuren<br /> #* (delta2)isopentenylpyrofosfaat<br /> #* cellobiose<br /> # leg uit: epoxyharsen en -lijmen<br /> # stereochemie aminozuur met R = -CHOH-CH3<br /> #* duid chirale koolstoffen aan<br /> #* hoeveel conformaties zijn er? en teken deze<br /> #* benoem (R,S)<br /> #* welke zijn enantiomeren? diastereomeren?<br /> #* bepaal het oxidatiegetal van de C-atomen<br /> #* welk is het meest basisch en zeg waarom...<br /> # twee reactiemechanismen waarvan 1 helemaal uitschrijven<br /> ===14 juni 2010===<br /> Mondeling:<br /> # Welke reacties gebeuren er met suikers in basisch milieu? (en dan bedoelt hij specifiek in basisch milieu)<br /> # Bespreek de oxidatie van alcoholen in het labo met K2Cr2O7 en in de natuur met NAD+ en illustreer met een voorbeeld in de citroenzuurcyclus<br /> <br /> schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # structuren<br /> #* Dansylchloride<br /> #* Biotine<br /> # leg uit: reactie van Chichibabin<br /> # stereochemie<br /> #* duid chirale koolstoffen aan<br /> #* hoeveel conformaties zijn er? en teken deze<br /> #* benoem (R,S)<br /> #* welke zijn enantiomeren? diastereomeren?<br /> #* is er een mesovorm?<br /> #* welk is het meest basisch: CH3CH2COO- of CH3CH2C=-C- (driedubbele binding) en zeg waarom<br /> # twee reactiemechanismen waarvan 1 helemaal uitschrijven<br /> <br /> ===11 juni 2010===<br /> Mondeling:<br /> # Wat geven alkenen met <br /> #* Anorganische zuren; <br /> #* Perzuren (ook energieschema's kennen, effecten van concentraties enzo)<br /> # Bespreek de biosynthese van vetzuren (Claisen-condensatiestap belangrijkst)<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # structuren<br /> #*SAM (S-adenosylmethionine)<br /> #*PET<br /> # Leg uit: Kolbe-Schmidt-reactie (aspirine dus)<br /> # Stereo-chemie:<br /> #* teken (beta)-L-gulopyranose (lineaire vorm gegeven)<br /> #* teken gunstigste Newman-projectie volgens C2-C3-as<br /> #* wat is de oxidatietrap van C6?<br /> #* geef de anomeer en een epimeer van L-gulose<br /> # 2 reactiemechanismen (1 uitschrijven)<br /> #* oxidatie van een alcohol en aldehyde met K2Cr2O7, H2SO4, koud<br /> #* Friedel-Crafts-acylering<br /> -<br /> ===22 juni 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de aldolcondensatie. Bespreek ook de stap van de glycolyse die verband houdt met de aldolcondensatie.<br /> # Bespreek de hydrolyse en omestering van vetten. Leg ook uit wat het verzepingsgetal en het joodgetal is.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam geven.<br /> # Structuren:<br /> #* dansylchloride<br /> #* cellobiose<br /> # Leg uit: De Beckmann-omlegging<br /> # Je krijgt een molecule gegeven <br /> #* Duid alle assymetrische koolstofatomen aan met een &amp;quot;*&amp;quot; en zeg of ze een R of S-configuratie hebben<br /> #* Teken het enantiomeer en 2 epimeren<br /> #* Van een N-atoom zeggen dat het basischer of zuurder is in vergelijking met ammoniak<br /> #* 2 mesomeren vormen geven (buiten die van benzeenring)<br /> # Twee reactiemechanismen (producten + soort reactie geven + één mechanisme helemaal uitschrijven)<br /> #* tertair alcohol + zuurchloride<br /> #* alkeen + zuur<br /> <br /> <br /> ===19 juni 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # bespreek de nucleofiele additie aan de carbonylgroep. Bespreek de factoren die de reactiviteit van aldehyden en ketonen beinvloed. geef de reactie met water en alcoholen<br /> # bespreek de reactie van alkenen met waterstof, halogenen en perzuren<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam geven.<br /> # Structuren:<br /> #* maltose<br /> #* fosfoënolpyruvaat<br /> # Leg uit: epoxyharsen en -lijmen<br /> # gegeven: aminozuur met zijgroep: R=CH2-SH<br /> #* Hoeveel stereoisomeren bestaan er van dit molecule+ welk aminozuur is dit<br /> #* geef de fischerprojectie en de Newmanprojectie( volgens C2-C3 as) van stabielste conformatie van elk stereoisomeer.Geef van elke chirale C of het R of S is.<br /> #* titratie: je begint met 100ml van O,2M oplossing van aminozuur(volledig geprotoneerd) en je titreert met 0,2M NaOH.(Pk1=1,9 Pk2=10,7 Pkr=8,4<br /> #*# bereken PH als je 150ml NaOH toegevoegd hebt<br /> #*# Bereken PH als je 300ml NaOH toegevoegd hebt<br /> #*# wat is(zijn) de voornaamste vorm(en) van het aminozuur bij PH=8,4<br /> # reactiemechanismen<br /> <br /> === 15 juni 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # Leg de decarboxylering van carbonzuren uit en pas toe in een stap uit de citroenzuurcyclus<br /> # Welke technieken ken je voor het bepalen van de aminozuurvolgorde in een peptideketen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam geven.<br /> # Structuren:<br /> #* Biotine<br /> #* (delta)³ - isopentenylpyrofosfaat<br /> # Leg uit: de reactie van chichibabin<br /> # Cyclische L-suiker gegeven:<br /> #* Geef de naam en de lineaire structuur. (lijst met ongekende suikers gegeven)<br /> #* Bepaal van C² of het R of S - configuratie heeft<br /> #* Duidt niet-chirale C-atomen in lineaire en cyclische structuur aan<br /> #* Hoeveel 1,3-diaxiale interacties zijn er?<br /> <br /> === 8 juni 2008===<br /> # Leg uit: de reactie van een zuur met een alkeen/alkyn.<br /> # Leg uit: de Claisen-condensatie en breng dit in verband met de biosynthese van lipiden/vetten.<br /> # Teken de structuur van S-adenosyl-methionine en van sacharose.<br /> # Leg uit: optische zuiverheid.<br /> # Oefeningen:<br /> #* Stereochemie, invloed van substituenten op de zuurtegraad etc. <br /> #* Reactiemechanismen<br /> <br /> === 18 aug 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Geef de biosynthese van monoterpenen voor de vorming van geraniol en limoneen.<br /> # Bespreek sulfonering, alkylering en acylering aan aromaten.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Structuren:<br /> #* cyclisch AMP<br /> #* Glucaarzuur<br /> <br /> === 25 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de hydrolyse, omestering, aminolyse en reductie van esters.<br /> # Welke methoden ken je om de volgorde van aminozuren in peptiden te bepalen?<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Moleculen:<br /> #* Nerylpyrofosfaat<br /> #* Cellobiose<br /> # Wat zijn epoxylijmen?<br /> <br /> === 25 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Licht toe wat acetalen en hemiacetalen zijn en pas dit toe op de vorming van beta-D-glucopyranose uit D-glucose en de vorming van methyl-beta-D-glucopyranoside.<br /> # Bespreek de labosynthese van peptiden.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Structuren:<br /> #* Trans-decaline<br /> #* Histamine<br /> <br /> === 24 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek reactie alkenen met H2, halogenen en perzuren.<br /> # Bespreek zure en base hydrolyse en omestering van vetten.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Structuren: <br /> #* ADP<br /> #* Maltose<br /> <br /> === 21 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de eleminatiereacties bij halogeenalkanen.<br /> # Bespreek de testreactie van ninhydrine.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Geef de IUPAC-naam.<br /> # Teken de volgende structuren:<br /> #* Dansylchloride<br /> #* Thymidine<br /> # Bespreek nylon 66.<br /> # Cyclisch suiker: <br /> #* Geef de naam.<br /> #* Welk is het zuurste proton ?<br /> #* Geef de configuratie (R/S).<br /> #* Fisher<br /> #* Welke zijn de niet chirale C's ?<br /> # Twee reactiemechanismen.<br /> <br /> === 20 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de additie van zuren op alkenen.<br /> # Bespreek de biosynthese van vetzuren.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam geven.<br /> # Geef de structuur van:<br /> #* Geranylpyrofosfaat<br /> #* Ninhydrine<br /> # Bespreek de Beckmann omlegging.<br /> # Aspartaam gegeven:<br /> #* Welke zijn de verschillende stereoisomeren ?<br /> #* Welke zijn de chirale koolstofatomen en duid aan of R/S zijn.<br /> #* Schrijf de fisherprojectie van L-fenylalanine.<br /> #* Vraag over elektroforese: aantonen waar fenylalanine en asparaginezuur zich bevinden.<br /> # Twee reactiemechanismen.<br /> <br /> === 9 jun 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de reactiemechanisme bij ketonen en aldehyden en vermeld hierbij de factoren die deze reacties beinvloeden. Geef een voorbeeld van additie van alcohol en additie van water. <br /> # Bespreek de isomerisatie van D-glucose oiv van een base en geef een vb in de glycolyse cyclus.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # Structuren:<br /> #* Pyridoxalfosfaat<br /> #* Tosylchloride<br /> # Leg uit wat een kroonether is.<br /> # Structuur asparagine gegeven:<br /> #* Teken alle stereoisomeren (fisher en newman).<br /> #* R/S configuratie<br /> #* Waarom heeft de amine-groep in de structuur geen basische eigenschappen ?<br /> #* Bereken het eerste equivalentiepunt en leg je methode uit.<br /> # Twee reactiemechanismen.<br /> <br /> === 19 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # Nucleofiele additie aan de carbonylgroep bespreken/factoren reactiviteit/aantonen met additie van water en alcohol.<br /> # Manieren om de AZ volgorde te bepalen uitleggen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC naam<br /> # Structuren:<br /> #* Pyridoxalfosfaat<br /> #* Tosylchloride<br /> # Leg Nylon 66 uit.<br /> # Structuur Cysteïne gegeven:<br /> #* Fisher<br /> #* Newman<br /> #* R-S<br /> #* Enantiomeren...<br /> #* Welk molecule <br /> #* Welke vorm komt in de natuur het meeste voor ?<br /> #* Welke is de mesovorm?<br /> # Twee reactiemechanismen<br /> <br /> === 18 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # Aminolyse/omestering/hydrolyse esters.<br /> # Leg de decarboxylatie van carbonzuren uit en breng deze in verband met de Krebscyclus.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # Regel van Zaitsev kort bespreken.<br /> # IUPAC-naam<br /> # Structuren: <br /> #* Biotine<br /> #* Cellobiose<br /> # Suikers: <br /> #* Open-ketenstructuur<br /> #* R en S<br /> #* Chirale atomen.<br /> #* 1,3-diaxiale interactie<br /> # Reacties: <br /> #* Alkeen + HCl =&amp;gt; ... <br /> #* Oxidatie van een alcohol.<br /> <br /> <br /> === 18 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # De additie van zuren aan alkenen.<br /> # Mutarotatie uitleggen en illustreren met glucose.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam<br /> # Structuren: <br /> #* Acetylcholine <br /> #* cAMP<br /> # Omega-3 en omega-6 vetzuren uitleggen.<br /> # Een bepaald aminozuur:<br /> #* Fisher<br /> #* Newman<br /> #* pH-berekeningen<br /> # Reacties: Reactieproducten en soort reactie geven en uitwerken voor een van de twee.<br /> #* Carbonylgroep met H2 en Pt<br /> #* 2 ketonen met OH-<br /> <br /> === 15 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # Eliminatiereacties uitleggen.<br /> # Beta-oxidatie + claisencondensatie.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam (carbonzuurgroep keton, 2 dubbele binden, methyl, en alkynbinding)<br /> # Een suiker omzetten naar een ringstructuur, epimeren aanduiden op bijhorende tabel.<br /> # Biodiesel uitleggen<br /> # Structuren:<br /> #* Dansylchloride<br /> #* Thymidine structuur geven<br /> # Twee reactiemechanismen.<br /> <br /> === 14 jun 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de aldolcondensatie van aldehyden en ketonen.<br /> # Bespreek de reactie van waterstof/halogenen/perzuren aan alkenen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren<br /> #* Oliezuur<br /> #* Adrenaline<br /> # Leg kort uit: kroonethers.<br /> # R-groep van lysine gegeven:<br /> #* Stereoisomeren, R/S, L aanduiden.<br /> #* Newman/fischer projecties.<br /> #* Naam van het aminozuur.<br /> #* Voorkomen bij pH 10 (welke vorm: geprotoneerd of niet?)<br /> # Twee reacties: (je moet maar van 1 het hele mechanisme geven, ander gewoon zeggen welk type reactie en eindproduct)<br /> #* Een keton reageert met HNO3 en H2SO4.<br /> #* Reactie van tertiar alcohol met zuurchloride.<br /> <br /> === 28 aug 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek peptidesynthese in het labo en vergelijk met die ter hoogte van de ribosomen.<br /> # Bespreek additie van zuren aan alkenen.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuurformule van adrenaline en gluconzuur.<br /> # Bespreek optische zuiverheid.<br /> # Gegeven: structuurformule threonine.<br /> #* Aantal stereo-isomeren<br /> #* De chirale C-en<br /> #* Fisher- en newman-projectie van elk.<br /> #* Duidt R/S aan.<br /> #* Naam van aminozuur.<br /> #* Bij pH = 7: naar welke pool migreert dit AZ (pk1 en pk2 gegeven) ?<br /> # Beschrijven van reactie: 2 esters (dezelfde) boven de pijl (H3O+ en OC3H7), boven de 2e pijl (H3O+ en NaBH4).<br /> <br /> === 26 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Hemiacetaal en acetaal, pas toe op de vorming van beta-D-glucopyranosyl uit D glucose en de vorming van methyl - beta - D - glucopyranoside.<br /> # Oxidatie, hydrolyse ( in zuur en in basisch milieu) en omestering van olie en vet.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Cystine en adipinezuur structuur geven.<br /> # Regel van Zaitsev uitleggen en illustreren met een voorbeeld.<br /> # Oefening met stereo-isomeren, Fischer, Newman en R en S configuratie.<br /> # Furan + HNO3 + H2SO4 reactie geven.<br /> #* Stoffen geven die ge aan furan moet toevoegen om een ethylgroep op positie 2 (alfa) te induceren.<br /> <br /> === 23 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de laboratoriumsynthese van peptideverbindingen en vergelijk met de manier waarop aminzuren binden met ribosomen.<br /> # Bespreek de reactie van alkenen met waterstof, halogenen en perzuren. <br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuurformule van oliezuur en adrenaline.<br /> # Bespreek cannizaro reacties.<br /> # Structuurformule van een suiker:<br /> #* Geef de fisherprojectie van de ringstructuur.<br /> #* R-S van de C2 bepalen<br /> #* Leidt de naam af.<br /> #* Geef het aantal chirale C's in de haworth aan.<br /> # Reactiemechanisme<br /> <br /> === 23 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de isomerisatie van D-glucose onder invloed van base en breng in verband met een stap uit de glycolyse (alleen deze stap opschrijven).<br /> # Bespreek de afbraak van vetzuren en breng in verband met de Claisencondensatie.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren:<br /> #* Thymidine<br /> #* Dansylchloride<br /> # Verklaar kort het begrip &amp;quot;optische zuiverheid&amp;quot;.<br /> # Een hepteen is gegeven:<br /> #* Geef de verschillende stereovormen in Fisherprojectie.<br /> #* Geef de Newman-projectie van het meest stabiele conformeer.<br /> #* Noteer ook R- en S-conformatie.<br /> # Reactie waarbij de producten, tussenstappen en mechanismen moeten worden aangevuld.<br /> <br /> === 21 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de elektrofiele aromatische substitutie met als voorbeeld nitreerzuur, benzeen en gesubstitueerde benzeenderivaten.<br /> # Bespreek hydrolyse, reductie, omestering en aminolyse van esters.<br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren:<br /> #* Sacharose <br /> #* SAM<br /> # Bespreek omega-3-vetzuren en omega-6-vetzuren.<br /> # Gegeven: structuurformule arginine <br /> #* Geef het aantal stereo-isomeren.<br /> #* Duidt de cirale C's aan.<br /> #* Fisher- en Newman-projectie van elk.<br /> #* Duid R/S aan.<br /> #* Geef de naam van het aminozuur.<br /> #* Duid aan welke N het meest basisch is.<br /> #* Welk stereo-isomeer is het L-aminozuur ?<br /> # Beschrijven van reactie: 2 keer cyclopenteen met daaraan 2-hexanol (of pentanol ben het vergeten) keten op de pijl staat K2Cr2O7, H+ en koud, boven tweede pijl staat 1 OH- <br /> <br /> === 20 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Bespreek de additie van zuren aan alkenen (geen carbonzuren bedoeld).<br /> # Bespreek de biosynthese van vetzuren.<br /> <br /> Schriftelijk<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren: <br /> #* Kaneelzuur<br /> #* Cellobiose<br /> # 3-broom-4-cloorhexaan:<br /> #* Stereo-isomeren: Fisher- en Newman-projectie.<br /> #* R,S-configuratie<br /> #* Diastereomeren/enantiomeren?<br /> # Het reactietype en naam en mechanisme van benzeenring met OH aan, bij de pijl staan dibroom en ijzertribroom.<br /> <br /> === 13 jun 2006 ===<br /> Mondeling:<br /> # Aldolcondensatie + glycolyse stap die met aldolcondensatie te maken heeft. <br /> # Geef de verschillende methoden om de volgorde van AZ in peptide te vinden. <br /> <br /> Schriftelijk:<br /> # IUPAC-naam.<br /> # Structuren<br /> #* Stearinezuur<br /> #* Pyridine<br /> # Leg uit: gauche en anti (bij alkanen).<br /> # 2,3,4-hydroxybutanal:<br /> #* Hoeveel stereoisomeren ?<br /> #* Geef Fisher projectie en de Newmann projectie van de meest stabiele conformatie.<br /> #* Geef R,S conformatie. <br /> #* En zeg welke enantiomeren zijn, welke diastereoisomeren zijn, mesovormen.<br /> # Geef reactiemechanisme, reactieproduct (ook in skeletnotatie--&amp;gt; reactieproduct) van:<br /> #* Trans-1-fenyl-1-buteen met verdund zwavelzuur.</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Grondslagen_van_de_Chemie&diff=171 2017-01-18T13:40:20Z

<p>0653300: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Basisvak chemie voor 1e bachelor chemie, biochemie en biologie.<br /> Gedoceerd door professor &amp;lt;s&amp;gt;Koen Clays&amp;lt;/s&amp;gt; &amp;lt;s&amp;gt;Bart Goderis (sinds academiejaar 2013-2014)&amp;lt;/s&amp;gt; Koen Clays<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 17 januari 2017 ===<br /> Theorie<br /> #Hoe kan je het evenwicht naar de kant van de producten brengen? Heeft dit een invloed op de snelheid?<br /> #Geef het verband tussen protontransferreacties en elektrontransferreacties. Geef voorbeelden die dit verduidelijken.<br /> <br /> Oefeningen<br /> #Berekenen of een reactie neerslaat of niet ondanks complexvorming.<br /> #Bepaal de hybridisatie en geometrie van PCl3 en SF4. Teken de atoomstructuur en zijn deze moleculen polair of apolair en een uitleg waarom.<br /> <br /> === 16 januari 2017 ===<br /> Theorie<br /> #Vuistregels met afleiding van buffers geven, dit ook toepassen op pH titraties, bloed als buffer bespreken<br /> #Hebben kationen basische of zure eigenschappen, zijn dit dan zwakke of sterke zuren of basen (voorbeelden kunnen helpen en verduidelijkend zijn)<br /> <br /> Oefeningen <br /> #Aantal ml en molair NiSO4-oplossing samenvoegen met een aantal ml en molair NH3, toon aan dat ondanks het gevormde complex nikkel (II) ammoniak er toch nog neerslag gevormd wordt<br /> #Een tabel gegeven van temperatuur en snelheidsconstante, de opdracht is grafisch de activeringsenergie te berekenen en k te berekenen bij 250°C<br /> <br /> === XX Augustus 2016 ===<br /> Theorie:<br /> #Leg de verschillende soorten isomerie uit + wat is tautomerie?<br /> #Leg uit waarom fluoride in tandpasta zit (alle 6 puntjes geven, dus ook vorming CaF uitleggen)<br /> <br /> Oefeningen<br /> #Random oefening uit oefenzitting<br /> #Berekend de Kw vertrekkende vanuit de standaardreductiepotentialen voor water in zuur/basisch milieu<br /> <br /> ===XX januari 2016===<br /> Theorie:<br /> #Leg de elementaire reactiestappen uit adhv voorbeelden (mono,bi,termoleculair, stationariteitsprincipe, vorming ozon)<br /> #Geef de '''essentie''' van een titratie + grafieken<br /> <br /> oefeningen:<br /> #Oplosbaarheid van AgNO3 berekenen na toevoegen van een of ander zuur/base<br /> #nog een oefening<br /> === 11 januari 2016 ===<br /> #Hoe bepaal je de geometrische structuur bij covalent gebonden atomen en geef 3 voorbeelden <br /> #bij welke reactie is quenching van toepassing?<br /> <br /> ===XX januari 2016===<br /> Theorie:<br /> #heterogene en homogene en enzymatische katalysator + alles uitleggen hiervan<br /> #loodbatterij<br /> <br /> ===12 januarie 2016===<br /> #Verschillen tussen Co en Fe en zeggen waarom Fe gebruikt wordt voor zuurstof transport <br /> #het verschil tussen c dubbel gebonden en enkel gebonden <br /> #bij de oefeningen was eentje E0 bepalen ahv Ka en een andere E0 <br /> #andere grafisch de orde enzo bepalen <br /> <br /> ===10 JAN 2014===<br /> Theorie:<br /> #Roosterenergie van 2 roosters (NaCl en MgO) berekenen met de formule, zeggen of er nog een andere manier was om die te vinden (Hess) en of er een verschil in uitkomst te verwachten was tussen de twee manieren. Vergelijken van de pH van de twee oplossingen.<br /> #Uitleggen waarom termoleculaire reactiestappen omwaarschijnlijk zijn. Reactiemechanisme van 2HI + H&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt;O&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt; -&amp;gt; I&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt; + H&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt;O geven. Stationariteitsprincipe uitleggen en zeggen of het op die reactie van toepassing was. <br /> #Waar/soms waar/niet waar: Een proces is spontaan als de entropie in het systeem toeneemt. <br /> #Uitleggen wat een buffer is en de vuistregels voor een goede buffer uitleggen zonder de hele wiskundige berekening te doen.<br /> <br /> Oefeningen.<br /> #Oplosbaarheid van AgBr, complexatie met thiosulfaat en alternatieve manier geven om oplosbaarheid te verhogen. Uitleggen waarom die laatste manier weinig effect zou hebben.<br /> #Celpotentiaal berekenen van een gegeven schematische voorstelling.<br /> <br /> ===11 JAN 2013===<br /> Theorie:<br /> # Vergelijk de elektronenstructuur van de atomen N en O met die van de moleculen N2 en O2. Licht de hierbij essentiële principes toe.<br /> # Geef de chemische functies van water. Geef bij iedere functie een voorbeeld in de vorm van een reactievergelijking. Is water sterk of zwak in deze functie?<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # CuSO4 oplossing met NH3 oplossing (grootheden gegeven). Laat zien dat er ondanks de complexatie toch nog neerslagvorming optreedt.<br /> # Gegeven concentraties (van reactieproduct) in functie van de tijd. Bepaal grafisch de orde en de halfwaardetijd.<br /> <br /> ===3 FEB 2012 NM===<br /> # Geef twee vuistregels voor een goede buffer en toon ze aan aan de hand van de neutralisatiegraad en de buffer capaciteit. <br /> #* Geef het verband hiervan met pH- titratie <br /> #* Is bloed een goede buffer ? Verklaar. <br /> # Verklaar waarom men tandpasta fluorideert.<br /> <br /> <br /> ===30 JAN 2012 NM===<br /> # Beschrijf en vergelijk de kinematica en thermodynamica van de methatesereactie en de liganduitwisselingsreactie.<br /> # Broom in base.<br /> <br /> <br /> ===30 JAN 2012 VM===<br /> # Welke reacties kunnen optreden als katalysator bij redoxreacties?<br /> # Leidt de halfreacties van een zwavelzure loodbatterij af<br /> <br /> <br /> ===24 JAN 2012 VM===<br /> # hoe bepaal je de elektronenconfiguratie van diatomaire moleculen en geef twee duidelijk verschillende voorbeelden<br /> # vergelijk Al en Li voor batterijen, geef voor en nadelen en verklaar waarom er Li batterijen zijn en geen Al<br /> <br /> <br /> ===23 JAN 2012 NM===<br /> # staaf met enkele goed gekoze voorbeelden het belang van de ladingsdichtheid in de chemie<br /> # welke reacties hebben er baat bij quenching toe te passen<br /> <br /> <br /> ===23 JAN 2012 VM===<br /> Theorie:<br /> # Beschrijf en vergelijk de kinematica en thermodynamica van de methatesereactie en de liganduitwisselingsreactie. <br /> # Leg de elektrolyse van water uit in de volgende omstandigheden:1. zonder zout, 2. met een beetje zout en 3. met oplossing van veel zeezout. <br /> <br /> <br /> ===20 JAN 2012 NM===<br /> Theorie :<br /> # geef de vuistregels vr bufferopl + afleiden buffercapaciteit en neutralisatiegraad. link met pHtitratie. vertellen over bloed als buffer, goede/slechte buffer?<br /> # iets van Fe complexatie, waarom de natuur is aangepast aan ademhaling door complexvorming van Fe met zuurstof<br /> Oefeningen :<br /> # van deel C met een tabel met waarden, orde van reactie afleiden + grafisch k en t1/2 bepalen<br /> # berekenen of PbOH2 neerslaat, uit een mengsel van PbSO4 met NaOH geloof ik<br /> <br /> <br /> ===20 JAN 2012 VM===<br /> Theorie:<br /> # Vergelijk de bindingssterkte en reactiviteit van C=C en C - C (enkelvoudige binding) op 4 ptn<br /> # Vergelijk de afhankelijkheid van de temperatuur voor de snelheidsconstante en de evenwichtsconstante<br /> <br /> <br /> ===1 FEB 2011=== <br /> Theorie:<br /> # Bespreek: Chroomvocht, Piranhazuur , koningswater en cyanide in base en hun werking op (edel)metalen. (/6)<br /> # Wat is een indicator en hoe werkt het? (/4)<br /> Oefeningen:<br /> # P4 + BR2 =&amp;gt; PBR3 vul aan met coefficienten en bereken de temperatuur waarvoor deze reactie spontaan zal verlopen. (/2.5)<br /> # en een oefening over de combinatie van complexvorming van Al(OH4)- en de neerslag van Al(OH)3. (/3.5)<br /> <br /> === 1 sep 2010 ===<br /> Theorie:<br /> # Verschillen en gelijkenissen tussen homogene, heterogene en enzymatische katalyse geven. Verduidelijken met vb.<br /> # Bindingssterkte en reactiviteit vergelijken tussen C-C en C=C. Welke reacties ondergaan ze.<br /> Oefingen:<br /> # Oplosbaarheid<br /> # Enthalpie &amp;amp; Entropie<br /> <br /> <br /> ===28 jan 2010===<br /> # bespreek de oplosbaarheid van metalen in zuur en basisch milieu (/6) <br /> # bespreek &amp;quot;quenching&amp;quot; en voor welke reacties is dit toepasbaar? (/4) <br /> <br /> oefeningen: <br /> # bepaal de oplosbaarheid van AgBr in een molaire NH3 oplossing (complexvorming) <br /> # een reactie difluor en diwaterstof -&amp;gt; 2HF. Gaat deze reactie op bij 500K ?<br /> <br /> <br /> ===26 jan 2010===<br /> # vergelijk piranhazuur, koningswater, dichromaat en cyanide voor het oplossen van edelmetalen. (.../6)<br /> # welke reacties kunnen als katalysator optreden bij een redoxreactie? (.../4)<br /> oefeningen:<br /> # Een oplossing van Ti(II)-ionen wordt in zuur midden getitreerd met een dichromaatoplossing (K2Cr2O7-oplossing). Hierbij worden het Cr(III)-ion en het Ti(III)-ion gevormd. Toon aan dat het gaat om een aflopende reactie.Het verloop van de titratie wordt potentiometrisch gevolgd en ook de pH wordt constant gemeten. In de oplossing zit nog een kalomelelektrode (E°=0.25V) die aan de anode gekoppeld is en een platina-elektrode. Op zeker ogenblik - na het passeren van het equivalentiepunt - wordt een celpotentiaal van 0.95V gemeten en een pH van 1.2. Bereken de concentratie aan Cr3+ ionen, als je weet dat deze concentratie vier maal hoger ligt dan die van de dichromaationen. (.../3)<br /> # Aan een oplossing van 70 ml 0.20 M nikkelsulfaat wordt 30 ml 0.60 M ammoniak toegevoegd. Toon aan dat er - ondanks de complexvorming - toch hydroxideneerslag gevormd zal worden. (.../3)<br /> <br /> <br /> === jan 2010 ===<br /> Mondeling:<br /> # Toon het belang aan van ladingsdichtheid in de scheikunde. Geef telkens duidelijk verschillende voorbeelden als het over verschillende soorten reacties gaat.<br /> # Bespreek de reactie van broom in base. Geef een relevante toepassing.<br /> Schriftelijk:<br /> # Bij 298 K gaat onderstaande reactie op. Men maakt een oplossing van 35,5 g van Cl2 en 0,1 g van H2 in een totaal volume van 200 ml. Wat zijn de evenwichtsconcentraties van H2, Cl2 en HCl ?<br /> #*H2(g) + Cl2(g) &amp;lt;=&amp;gt; 2HCl(g) <br /> # Bereken de Kb van IO-, uitgaande van<br /> #*IO3-(aq) / HIO(l) E° = 1,13V<br /> #*IO3-(aq) / IO-(aq) E° = 0,15V<br /> <br /> <br /> === jan 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # Wat is een dipoolmoment?<br /> # Vroeger werd kaliumpermanganaat e.a. veel gebruikt als goede oxidator. Tegenwoordig wordt pirhanazuur (mengsel waterstofperoxide/zwavelzuur) gebruikt. Waarom?<br /> Schriftelijk:<br /> # Temperatuurverandering berekenen van ijs (faseverandering,...)<br /> # Nog zo'n oefening in die aard.<br /> <br /> <br /> === jan 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # Vergelijk de temperatuursafhankelijkheid van de evenwichtsconstante en de snelheidsconstante.<br /> # Waarom is een stof goed of slecht oplosbaar in water? En hoe kan je een slecht oplosbare stof beter oplosbaar maken?<br /> # Maak een vergelijking tussen thermodinamica en kinetica van metathesereacties versus complexatiereacties.<br /> # Geef de 2 hoofdregels voor het maken van een buffer en leid ze wiskundig af.<br /> Schriftelijk:<br /> #* Evenwichtsconstante berekenen bij 45°C (je krijgt de reactie)<br /> #* Evenwichtsdruk berekenen als druk in het begin gegeven is<br /> # Kb geven als je redoxkoppel krijgt (in zuur en in basisch midden)<br /> <br /> <br /> === 1 feb 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Welke reacties kunnen een redoxreactie katalyseren?<br /> # Geef het verband tussen neerslagreacties en complexatiereacties en geef een goed gevonden voorbeeld.<br /> Schriftelijk:<br /> #* Evenwichtsconstante berekenen bij 45°C (je krijgt de reactie)<br /> #* Evenwichtsdruk berekenen als druk in het begin gegeven is<br /> # Kb geven als je redoxkoppel krijgt (in zuur en in basisch midden)<br /> <br /> <br /> === 25 jan 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Leg uit wat tautomerie is + vb.<br /> # Voor het oxideren werden vroeger vaak de klassieke sterke oxidanten permanaat of dichromaat in zwavelzuur gebruikt, waarom is het gebruik van &amp;quot;piranaha-zuur&amp;quot; (waterstofperoxide in zwavelzuur) aan een opmars bezig?<br /> Schriftelijk:<br /> # men wil 200 ml maken van een oplossing die 3,81g magnesiumcloride en 0,8g natriumhydroxide bevat. Hoeveel gram ammoniumbromide moet er ook in deze oplossing zitter, opdat er geen neerslag is?<br /> # Boven/onder welke temperatuur gaat deze reactie spontaan op? <br /> #* N2 (g) + O2(g) = 2NO (g)<br /> #* Bereken ook de evenwichtsconstante bij 68°C.<br /> <br /> <br /> === 15 jan 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # geef verband van de ionbinding en de covalente binding + verklaar<br /> # geef verband pH en redoxpotentiaal<br /> Schriftelijk:<br /> # bereken kb van een stof aan hand van 2 redoxpotentialen <br /> # oefenening waar je een eind temperatuur moest berekenen met warmtecapaciteit en latente verdampingswarmte (aangezien er een faseovergang is)</div>

0653300 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Grondslagen_van_de_Chemie&diff=121 2017-01-16T19:30:42Z

<p>0653300: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Basisvak chemie voor 1e bachelor chemie, biochemie en biologie.<br /> Gedoceerd door professor &amp;lt;s&amp;gt;Koen Clays&amp;lt;/s&amp;gt; &amp;lt;s&amp;gt;Bart Goderis (sinds academiejaar 2013-2014)&amp;lt;/s&amp;gt; Koen Clays<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === januari 2017===<br /> Theorie<br /> #Vuistregels met afleiding van buffers geven, dit ook toepassen op pH titraties, bloed als buffer bespreken<br /> #Hebben kationen basische of zure eigenschappen, zijn dit dan zwakke of sterke zuren of basen (voorbeelden kunnen helpen en verduidelijkend zijn)<br /> <br /> Oefeningen <br /> #Aantal ml en molair NiSO4-oplossing samenvoegen met een aantal ml en molair NH3, toon aan dat ondanks het gevormde complex nikkel (II) ammoniak er toch nog neerslag gevormd wordt<br /> #Een tabel gegeven van temperatuur en snelheidsconstante, de opdracht is grafisch de activeringsenergie te berekenen en k te berekenen bij 250°C<br /> <br /> === XX Augustus 2016 ===<br /> Theorie:<br /> #Leg de verschillende soorten isomerie uit + wat is tautomerie?<br /> #Leg uit waarom fluoride in tandpasta zit (alle 6 puntjes geven, dus ook vorming CaF uitleggen)<br /> <br /> Oefeningen<br /> #Random oefening uit oefenzitting<br /> #Berekend de Kw vertrekkende vanuit de standaardreductiepotentialen voor water in zuur/basisch milieu<br /> <br /> ===XX januari 2016===<br /> Theorie:<br /> #Leg de elementaire reactiestappen uit adhv voorbeelden (mono,bi,termoleculair, stationariteitsprincipe, vorming ozon)<br /> #Geef de '''essentie''' van een titratie + grafieken<br /> <br /> oefeningen:<br /> #Oplosbaarheid van AgNO3 berekenen na toevoegen van een of ander zuur/base<br /> #nog een oefening<br /> === 11 januari 2016 ===<br /> #Hoe bepaal je de geometrische structuur bij covalent gebonden atomen en geef 3 voorbeelden <br /> #bij welke reactie is quenching van toepassing?<br /> <br /> ===10 JAN 2014===<br /> Theorie:<br /> #Roosterenergie van 2 roosters (NaCl en MgO) berekenen met de formule, zeggen of er nog een andere manier was om die te vinden (Hess) en of er een verschil in uitkomst te verwachten was tussen de twee manieren. Vergelijken van de pH van de twee oplossingen.<br /> #Uitleggen waarom termoleculaire reactiestappen omwaarschijnlijk zijn. Reactiemechanisme van 2HI + H&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt;O&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt; -&amp;gt; I&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt; + H&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt;O geven. Stationariteitsprincipe uitleggen en zeggen of het op die reactie van toepassing was. <br /> #Waar/soms waar/niet waar: Een proces is spontaan als de entropie in het systeem toeneemt. <br /> #Uitleggen wat een buffer is en de vuistregels voor een goede buffer uitleggen zonder de hele wiskundige berekening te doen.<br /> <br /> Oefeningen.<br /> #Oplosbaarheid van AgBr, complexatie met thiosulfaat en alternatieve manier geven om oplosbaarheid te verhogen. Uitleggen waarom die laatste manier weinig effect zou hebben.<br /> #Celpotentiaal berekenen van een gegeven schematische voorstelling.<br /> <br /> ===11 JAN 2013===<br /> Theorie:<br /> # Vergelijk de elektronenstructuur van de atomen N en O met die van de moleculen N2 en O2. Licht de hierbij essentiële principes toe.<br /> # Geef de chemische functies van water. Geef bij iedere functie een voorbeeld in de vorm van een reactievergelijking. Is water sterk of zwak in deze functie?<br /> <br /> Oefeningen:<br /> # CuSO4 oplossing met NH3 oplossing (grootheden gegeven). Laat zien dat er ondanks de complexatie toch nog neerslagvorming optreedt.<br /> # Gegeven concentraties (van reactieproduct) in functie van de tijd. Bepaal grafisch de orde en de halfwaardetijd.<br /> <br /> ===3 FEB 2012 NM===<br /> # Geef twee vuistregels voor een goede buffer en toon ze aan aan de hand van de neutralisatiegraad en de buffer capaciteit. <br /> #* Geef het verband hiervan met pH- titratie <br /> #* Is bloed een goede buffer ? Verklaar. <br /> # Verklaar waarom men tandpasta fluorideert.<br /> <br /> <br /> ===30 JAN 2012 NM===<br /> # Beschrijf en vergelijk de kinematica en thermodynamica van de methatesereactie en de liganduitwisselingsreactie.<br /> # Broom in base.<br /> <br /> <br /> ===30 JAN 2012 VM===<br /> # Welke reacties kunnen optreden als katalysator bij redoxreacties?<br /> # Leidt de halfreacties van een zwavelzure loodbatterij af<br /> <br /> <br /> ===24 JAN 2012 VM===<br /> # hoe bepaal je de elektronenconfiguratie van diatomaire moleculen en geef twee duidelijk verschillende voorbeelden<br /> # vergelijk Al en Li voor batterijen, geef voor en nadelen en verklaar waarom er Li batterijen zijn en geen Al<br /> <br /> <br /> ===23 JAN 2012 NM===<br /> # staaf met enkele goed gekoze voorbeelden het belang van de ladingsdichtheid in de chemie<br /> # welke reacties hebben er baat bij quenching toe te passen<br /> <br /> <br /> ===23 JAN 2012 VM===<br /> Theorie:<br /> # Beschrijf en vergelijk de kinematica en thermodynamica van de methatesereactie en de liganduitwisselingsreactie. <br /> # Leg de elektrolyse van water uit in de volgende omstandigheden:1. zonder zout, 2. met een beetje zout en 3. met oplossing van veel zeezout. <br /> <br /> <br /> ===20 JAN 2012 NM===<br /> Theorie :<br /> # geef de vuistregels vr bufferopl + afleiden buffercapaciteit en neutralisatiegraad. link met pHtitratie. vertellen over bloed als buffer, goede/slechte buffer?<br /> # iets van Fe complexatie, waarom de natuur is aangepast aan ademhaling door complexvorming van Fe met zuurstof<br /> Oefeningen :<br /> # van deel C met een tabel met waarden, orde van reactie afleiden + grafisch k en t1/2 bepalen<br /> # berekenen of PbOH2 neerslaat, uit een mengsel van PbSO4 met NaOH geloof ik<br /> <br /> <br /> ===20 JAN 2012 VM===<br /> Theorie:<br /> # Vergelijk de bindingssterkte en reactiviteit van C=C en C - C (enkelvoudige binding) op 4 ptn<br /> # Vergelijk de afhankelijkheid van de temperatuur voor de snelheidsconstante en de evenwichtsconstante<br /> <br /> <br /> ===1 FEB 2011=== <br /> Theorie:<br /> # Bespreek: Chroomvocht, Piranhazuur , koningswater en cyanide in base en hun werking op (edel)metalen. (/6)<br /> # Wat is een indicator en hoe werkt het? (/4)<br /> Oefeningen:<br /> # P4 + BR2 =&amp;gt; PBR3 vul aan met coefficienten en bereken de temperatuur waarvoor deze reactie spontaan zal verlopen. (/2.5)<br /> # en een oefening over de combinatie van complexvorming van Al(OH4)- en de neerslag van Al(OH)3. (/3.5)<br /> <br /> === 1 sep 2010 ===<br /> Theorie:<br /> # Verschillen en gelijkenissen tussen homogene, heterogene en enzymatische katalyse geven. Verduidelijken met vb.<br /> # Bindingssterkte en reactiviteit vergelijken tussen C-C en C=C. Welke reacties ondergaan ze.<br /> Oefingen:<br /> # Oplosbaarheid<br /> # Enthalpie &amp;amp; Entropie<br /> <br /> <br /> ===28 jan 2010===<br /> # bespreek de oplosbaarheid van metalen in zuur en basisch milieu (/6) <br /> # bespreek &amp;quot;quenching&amp;quot; en voor welke reacties is dit toepasbaar? (/4) <br /> <br /> oefeningen: <br /> # bepaal de oplosbaarheid van AgBr in een molaire NH3 oplossing (complexvorming) <br /> # een reactie difluor en diwaterstof -&amp;gt; 2HF. Gaat deze reactie op bij 500K ?<br /> <br /> <br /> ===26 jan 2010===<br /> # vergelijk piranhazuur, koningswater, dichromaat en cyanide voor het oplossen van edelmetalen. (.../6)<br /> # welke reacties kunnen als katalysator optreden bij een redoxreactie? (.../4)<br /> oefeningen:<br /> # Een oplossing van Ti(II)-ionen wordt in zuur midden getitreerd met een dichromaatoplossing (K2Cr2O7-oplossing). Hierbij worden het Cr(III)-ion en het Ti(III)-ion gevormd. Toon aan dat het gaat om een aflopende reactie.Het verloop van de titratie wordt potentiometrisch gevolgd en ook de pH wordt constant gemeten. In de oplossing zit nog een kalomelelektrode (E°=0.25V) die aan de anode gekoppeld is en een platina-elektrode. Op zeker ogenblik - na het passeren van het equivalentiepunt - wordt een celpotentiaal van 0.95V gemeten en een pH van 1.2. Bereken de concentratie aan Cr3+ ionen, als je weet dat deze concentratie vier maal hoger ligt dan die van de dichromaationen. (.../3)<br /> # Aan een oplossing van 70 ml 0.20 M nikkelsulfaat wordt 30 ml 0.60 M ammoniak toegevoegd. Toon aan dat er - ondanks de complexvorming - toch hydroxideneerslag gevormd zal worden. (.../3)<br /> <br /> <br /> === jan 2010 ===<br /> Mondeling:<br /> # Toon het belang aan van ladingsdichtheid in de scheikunde. Geef telkens duidelijk verschillende voorbeelden als het over verschillende soorten reacties gaat.<br /> # Bespreek de reactie van broom in base. Geef een relevante toepassing.<br /> Schriftelijk:<br /> # Bij 298 K gaat onderstaande reactie op. Men maakt een oplossing van 35,5 g van Cl2 en 0,1 g van H2 in een totaal volume van 200 ml. Wat zijn de evenwichtsconcentraties van H2, Cl2 en HCl ?<br /> #*H2(g) + Cl2(g) &amp;lt;=&amp;gt; 2HCl(g) <br /> # Bereken de Kb van IO-, uitgaande van<br /> #*IO3-(aq) / HIO(l) E° = 1,13V<br /> #*IO3-(aq) / IO-(aq) E° = 0,15V<br /> <br /> <br /> === jan 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # Wat is een dipoolmoment?<br /> # Vroeger werd kaliumpermanganaat e.a. veel gebruikt als goede oxidator. Tegenwoordig wordt pirhanazuur (mengsel waterstofperoxide/zwavelzuur) gebruikt. Waarom?<br /> Schriftelijk:<br /> # Temperatuurverandering berekenen van ijs (faseverandering,...)<br /> # Nog zo'n oefening in die aard.<br /> <br /> <br /> === jan 2009 ===<br /> Mondeling:<br /> # Vergelijk de temperatuursafhankelijkheid van de evenwichtsconstante en de snelheidsconstante.<br /> # Waarom is een stof goed of slecht oplosbaar in water? En hoe kan je een slecht oplosbare stof beter oplosbaar maken?<br /> # Maak een vergelijking tussen thermodinamica en kinetica van metathesereacties versus complexatiereacties.<br /> # Geef de 2 hoofdregels voor het maken van een buffer en leid ze wiskundig af.<br /> Schriftelijk:<br /> #* Evenwichtsconstante berekenen bij 45°C (je krijgt de reactie)<br /> #* Evenwichtsdruk berekenen als druk in het begin gegeven is<br /> # Kb geven als je redoxkoppel krijgt (in zuur en in basisch midden)<br /> <br /> <br /> === 1 feb 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Welke reacties kunnen een redoxreactie katalyseren?<br /> # Geef het verband tussen neerslagreacties en complexatiereacties en geef een goed gevonden voorbeeld.<br /> Schriftelijk:<br /> #* Evenwichtsconstante berekenen bij 45°C (je krijgt de reactie)<br /> #* Evenwichtsdruk berekenen als druk in het begin gegeven is<br /> # Kb geven als je redoxkoppel krijgt (in zuur en in basisch midden)<br /> <br /> <br /> === 25 jan 2008 ===<br /> Mondeling:<br /> # Leg uit wat tautomerie is + vb.<br /> # Voor het oxideren werden vroeger vaak de klassieke sterke oxidanten permanaat of dichromaat in zwavelzuur gebruikt, waarom is het gebruik van &amp;quot;piranaha-zuur&amp;quot; (waterstofperoxide in zwavelzuur) aan een opmars bezig?<br /> Schriftelijk:<br /> # men wil 200 ml maken van een oplossing die 3,81g magnesiumcloride en 0,8g natriumhydroxide bevat. Hoeveel gram ammoniumbromide moet er ook in deze oplossing zitter, opdat er geen neerslag is?<br /> # Boven/onder welke temperatuur gaat deze reactie spontaan op? <br /> #* N2 (g) + O2(g) = 2NO (g)<br /> #* Bereken ook de evenwichtsconstante bij 68°C.<br /> <br /> <br /> === 15 jan 2007 ===<br /> Mondeling:<br /> # geef verband van de ionbinding en de covalente binding + verklaar<br /> # geef verband pH en redoxpotentiaal<br /> Schriftelijk:<br /> # bereken kb van een stof aan hand van 2 redoxpotentialen <br /> # oefenening waar je een eind temperatuur moest berekenen met warmtecapaciteit en latente verdampingswarmte (aangezien er een faseovergang is)</div>

0653300