https://wiki.chemika.be/api.php?action=feedcontributions&feedformat=atom&user=Cynthia.R 2026-07-28T11:00:34Z Gebruikersbijdragen MediaWiki 1.43.0 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Laboratory_Animal_Sciences&diff=2091 2020-01-30T14:19:02Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie: Mabb]]<br /> == Vakinformatie ==<br /> <br /> Keuzevak, gedoceerd door Prof. Erna Dewil, dat vaak gevolgd wordt door master biochemie en mensen die met een doctoraat bezig zijn (alsook biologie, farmacie, BMW, bio-ingenieurs studenten). <br /> Door voor dit vak te slagen, krijg je een certificaat (=FELASA B) waardoor je experimenten mag uitvoeren op proefdieren. Schriftelijk voorbereiden, examen zelf was mondeling (dit was vroeger zo, dat zie je aan de oudere examenvragen). Nu is het examen volledig schriftelijk. De vragen staan in Nederlands en Engels geschreven. Er wordt verwacht dat de antwoorden in het Engels geformuleerd worden.<br /> <br /> Het examen vindt plaats in een grote aula en sinds het schriftelijk wordt afgenomen, zijn er per examenmoment twee verschillende examenversies. Elke even rij krijgt dezelfde vragen en elke oneven rij krijgt dezelfde vragenreeks.<br /> <br /> ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/E05E6AE.htm<br /> <br /> == Examenvragen ==<br /> <br /> ===30 Januari 2020 NM versie A===<br /> #define:<br /> #*bruce effect<br /> #*gavage<br /> #*reverse? orbital punction<br /> #*Harderian gland<br /> #Explain local anaesthesia<br /> #Give 3 factors that can influence the severity score<br /> #What is environmental enrichment and why is it important? <br /> #Explain everything about natural feed<br /> <br /> ===24 januari 2020 (NM, versie B)===<br /> #Define:<br /> #*Whitten effect<br /> #*Animal welfare body<br /> #*Humane endpoints<br /> #*IVC<br /> #Gasanaesthesia<br /> #How is healthmonitoring done and why is this important?<br /> #List all environmental factors that influence an animal's wellbeing and explain 2 in detail.<br /> #Which formalities need to be in order before cunducting animal experiments?<br /> <br /> === 24 januari 2020 (NM, versie &quot;&quot;) ===<br /> #What are the factors which determine the needed nutrients in animal food?<br /> #How can you check if an animal is under enough anaesthesia for a chirurgic procedure?<br /> #Given: code for a kind of stem. Explain this type.<br /> #Why are ventilation and odor important for the housing of lab animals?<br /> #What can decrease blood loss during a chirurgic procedure? How can you provide good post-operative care for a lab animal?<br /> <br /> === 25 januari 2019 (NM) ===<br /> Schriftelijk<br /> Leg uit:<br /> #*Harderian gland<br /> #*Orbitapuncture<br /> #*Bruce effect<br /> #*Gavage<br /> #Leg uit in detail: F1-hybride<br /> #Leg uit in detail lokale anesthesie<br /> #Leg uit in detail: Natuurlijk voeder<br /> #Wat zijn mogelijke vormen van kooiverrijking, leg ze elk kort uit<br /> <br /> === 25 januari 2019 ===<br /> Begrippen:<br /> #*isolator<br /> #*3 R’s<br /> #*zoonose<br /> #*lee-boot effect<br /> <br /> Grote vragen<br /> #Consomic strain<br /> #Geef alle mogelijke analgesia en bespreek hun neveneffecten<br /> #Welke infectie oorzaken zijn er? Hoe kan je deze vermijden?<br /> #Effect van stress op behaviour<br /> <br /> === 31 januari 2018 versie A ===<br /> Schriftelijk<br /> #Welke factoren bepalen de nutriënten behoeften van proefdieren?<br /> #Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?<br /> #Welke invloed heeft licht en geluid op het welzijn van de proefdieren? <br /> #Leg uit: premedicatie en sedatie<br /> #Hoe kan bloedverlies bij chirurgische ingrepen vermeden worden? Wat zijn de belangrijkste postoperatieve zorgen?<br /> <br /> ===31 januari 2018 versie B===<br /> Schriftelijk<br /> #Leg uit:<br /> #*Whitten effect<br /> #*3 R's<br /> #*isolator<br /> #*Zoonose<br /> #Welke effecten kan stress hebben op gedrag?<br /> #Leg uit (in detail): F1 hybride<br /> #Hoe kan een ziekte ontstaan in een animal facility en hoe kun je dit voorkomen?<br /> #Wat zijn mogelijke vormen van analgie, en wat zijn de bijwerkingen?<br /> <br /> ===16 januari 2018===<br /> Schriftelijk<br /> #Leg uit:<br /> #*Harderian gland<br /> #*Orbitapuncture<br /> #*Bruce effect<br /> #*Gavage<br /> #Leg uit in detail: congene stam<br /> #Uitleggen lokale anesthesie<br /> #Uitleggen natuurlijk voeder<br /> #Wat zijn mogelijke vormen van kooiverrijking, leg kort uit.<br /> <br /> === 1 februari 2017 (versie A)===<br /> #Welke factoren bepalen de nutriënten behoeften van proefdieren?<br /> #Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?<br /> #Welke invloed heeft licht en geluid op het welzijn van de proefdieren? <br /> #Leg uit: premedicatie en sedatie en geef een voorbeeld<br /> #Hoe kan bloedverlies bij chirurgische ingrepen vermeden worden? Wat zijn de belangrijkste postoperatieve zorgen?<br /> <br /> <br /> ===1 februari 2017 (versie B)===<br /> #Leg uit:<br /> #*Whitten effect<br /> #*3 R's<br /> #*isolator<br /> #*Zoonose<br /> #Welke effecten kan stress hebben op gedrag?<br /> #Leg uit (in detail): Congene stam<br /> #Hoe kan een ziekte ontstaan in een animal facility en hoe kun je dit voorkomen?<br /> #Wat zijn mogelijke vormen van analgie, en wat zijn de bijwerkingen?<br /> <br /> ===17 januari 2017===<br /> #Leg uit:<br /> #*Harderian gland<br /> #*Orbitapuncture<br /> #*Bruce effect<br /> #*?<br /> #Leg uit F1 hybriden in muizen<br /> #Uitleggen Lokale anesthesie<br /> #Uitleggen natuurlijk voeder<br /> #Wat zijn mogelijke vormen van kooiverrijking, hoe toepassen?<br /> <br /> ===13 januari 2016===<br /> #Leg uit:<br /> #*whittin effect<br /> #*co isogene stam<br /> #*isolator<br /> #*zoonose en voorbeeld<br /> #bespreek gasanesthesie<br /> #welke infexties kunnen optreden en hoe voorkomen?<br /> #effect van stress op gedrag<br /> #de 3R's en telkens 1 voorbeeld<br /> <br /> ===12 januari 2016===<br /> #Geef definitie proefdier en dierproef<br /> #Hoe controleer je de gezondheidstoestand van een dier? Waarom is dit belangrijk? <br /> #Leg uit: congene stam =&amp;gt; Bijvraag: hoe geef je de naam hiervan weer (schrijfwijze)<br /> #Waarom zijn correcte temperatuur en vochtigheid belangrijk voor proefdieren?<br /> #Wat is kooiverrijking en waarom doet men dit?<br /> #Extra bijvraag: Geef de 3 R's.<br /> <br /> === 22 jan 2015 (nm)===<br /> # Leg uit<br /> #* Bruce effect<br /> #* Gavage<br /> #* IVC<br /> # Wat zijn de eigenschappen van hypnotische stoffen? (bijvraag: waarom zou je urethaan gebruiken in plaats van thiopental/pentobarbital?)<br /> # Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?<br /> # Welke omgevingsfactoren spelen een rol voor het welzijn van proefdieren? Bespreek er 2 in detail.<br /> # Hoe doet men een gezondheidsscreening? Waarom is dit belangrijk?<br /> <br /> === 14 jan 2015 (nm)===<br /> # Definitie proefdier, definitie dierproef<br /> # Wat is het belang van gezondheidsscreenings? Wat is het belang van quarantaine? Hoe wordt dit in de praktijk uitgevoerd? Wat zijn de opties/mogelijkheden bij een besmetting?<br /> # Bespreek outbred stam.<br /> # Wat is het belang van geur en ventilatie bij het huishouden van proefdieren? Wat kunnen de gevolgen zijn als er iets misgaat?<br /> # Bespreek alpha-adrenergic agonists.<br /> <br /> === 13 jan 2014 (vm) ===<br /> # Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?<br /> # Welke invloed heeft licht en geluid op het welzijn van de proefdieren?<br /> # Wat is het belang en risico van bloedverlies bij chirurgische ingrepen en hoe kan dit vermeden worden?<br /> # Welke factoren bepalen de nutriëntenbehoeften behoefte van proefdieren?<br /> # Bespreek: hypnotische stoffen <br /> # Bijvraag 1: Stel je proefdier wilt een bepaalde stof niet innemen omdat het een slechte smaak heeft, wat kan je hieraan doen?<br /> # Bijvraag 2: Wat is zoocentrisme?<br /> <br /> === 17 jan 2013 (nm) ===<br /> ==== reeks 1====<br /> <br /> # Bespreek inteeltstam<br /> # Hoe infecties in de dierenfaciliteit vermijden?<br /> # Hoe preventief allergieen vermijden?<br /> # Wat is enrichment?<br /> # Geef voorbeelden en stress bij een dier. <br /> <br /> Nog meer vragen te vinden in dit bestand: [[Media:Extra_vragen_proefdierkunde.pdf]]<br /> <br /> ==== reeks 2 ====<br /> <br /> # Leg uit:<br /> #*IVC<br /> #*chimeer<br /> #*zoocentrisme<br /> #*...<br /> #Bespreek de eigenschappen van hypnotische stoffen<br /> #Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?<br /> #Welke omgevingsfactoren spelen een rol voor het welzijn van proefdieren? Bespreek er 2 in detail.<br /> #Hoe doet men gezondheidsscreening? Waarom is dit belangrijk?<br /> #Bijvraag: Bespreek housing van zebravis.<br /> <br /> ==== reeks 3 ====<br /> <br /> #Leg uit:<br /> #*Bruce effect<br /> #*Isolator<br /> #*Isogene stam<br /> #*Antropocentrisme<br /> #Stress kan bij proefdieren zorgen voor een verandering in gedrag. Leg uit.<br /> #Leg uit: Lokale anaesthesie<br /> #Leg uit: A2-Faciliteit<br /> #Welke maatregelen moeten er getroffen worden om allergieën tegen te gaan.<br /> <br /> === 17 jan 2012 (vm) ===<br /> <br /> # Geef de definitie van een &amp;quot;proefdier&amp;quot; en een &amp;quot;dierproef&amp;quot;<br /> # Wat is het belang van gezondheidsscreeningen en quarantaine? <br /> # Bespreek: congene stam<br /> # Wat zijn de invloeden van temperatuur en vochtigheid op een proefdier?<br /> # Wat is kooiverrijking en welke vormen zijn er?<br /> <br /> === 18 jan 2011 ===<br /> <br /> # leg uit: <br /> #* Co-isogenic strain<br /> #* Whitten effect<br /> #* Isolator<br /> #* zoönose<br /> # Welke producten kunnen allemaal gebruikt worden voor volledige Anaesthesie. Bespreek kort. (Bijvraag: Hoe kan je weten hoe diep het dier in de verdoving is gebracht?)<br /> # Wat is de invloed van stress op laboratorium dieren? (Bijvraag: Hoe kan je abnormaal gedrag onderscheiden van normaal gedrag?)<br /> # Hoe kan een infectie in een proefdierverblijf binnen gebracht worden? Wat kan je doen om dit te voorkomen?<br /> # Geef de 3 R's en geef per R twee voorbeelden.<br /> <br /> === 19 jan 2010 ===<br /> <br /> # leg uit: <br /> #* de 3R's<br /> #* Whitten effect<br /> #* gaveren<br /> #* zoönose<br /> # bespreek lokale anaesthesie<br /> # bespreek F1 hybride<br /> # Waarom zijn temperatuur en relatieve vochtigheid belangrijk in huisvesting?<br /> # de mogelijke contaminanten van natuurlijke voeders.<br /> <br /> <br /> === 12 jan 2010 ===<br /> <br /> # Factoren die nutriëntenbehoeften bepalen?<br /> # Verschillende producten voor anesthesie en hun werking?<br /> # Invloed van licht en geluid op proefdieren?<br /> # Welke formaliteiten moeten in orde zijn voor een experiment van start kan gaan?<br /> # Belang van bloedverlies tegengaan bij chirurgische ingrepen en methodes?<br /> # Bijvraag: 3 R's</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Laboratory_Animal_Sciences&diff=2082 2020-01-29T13:27:44Z

<p>Cynthia.R: /* 25 januari 2019 */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie: Mabb]]<br /> == Vakinformatie ==<br /> <br /> Keuzevak, gedoceerd door Prof. Erna Dewil, dat vaak gevolgd wordt door master biochemie en mensen die met een doctoraat bezig zijn (alsook biologie, farmacie, BMW, bio-ingenieurs studenten). <br /> Door voor dit vak te slagen, krijg je een certificaat (=FELASA B) waardoor je experimenten mag uitvoeren op proefdieren. Schriftelijk voorbereiden, examen zelf was mondeling (dit was vroeger zo, dat zie je aan de oudere examenvragen). Nu is het examen volledig schriftelijk. De vragen staan in Nederlands en Engels geschreven. Er wordt verwacht dat de antwoorden in het Engels geformuleerd worden.<br /> <br /> Het examen vindt plaats in een grote aula en sinds het schriftelijk wordt afgenomen, zijn er per examenmoment twee verschillende examenversies. Elke even rij krijgt dezelfde vragen en elke oneven rij krijgt dezelfde vragenreeks.<br /> <br /> ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/E05E6AE.htm<br /> <br /> == Examenvragen ==<br /> ===24 januari 2020 (NM, versie B)===<br /> #Define:<br /> #*Whitten effect<br /> #*Animal welfare body<br /> #*Humane endpoints<br /> #*IVC<br /> #Gasanaesthesia<br /> #How is healthmonitoring done and why is this important?<br /> #List all environmental factors that influence an animal's wellbeing and explain 2 in detail.<br /> #Which formalities need to be in order before cunducting animal experiments?<br /> <br /> === 24 januari 2020 (NM, versie &quot;&quot;) ===<br /> #What are the factors which determine the needed nutrients in animal food?<br /> #How can you check if an animal is under enough anaesthesia for a chirurgic procedure?<br /> #Given: code for a kind of stem. Explain this type.<br /> #Why are ventilation and odor important for the housing of lab animals?<br /> #What can decrease blood loss during a chirurgic procedure? How can you provide good post-operative care for a lab animal?<br /> <br /> === 25 januari 2019 (NM) ===<br /> Schriftelijk<br /> Leg uit:<br /> #*Harderian gland<br /> #*Orbitapuncture<br /> #*Bruce effect<br /> #*Gavage<br /> #Leg uit in detail: F1-hybride<br /> #Leg uit in detail lokale anesthesie<br /> #Leg uit in detail: Natuurlijk voeder<br /> #Wat zijn mogelijke vormen van kooiverrijking, leg ze elk kort uit<br /> <br /> === 25 januari 2019 ===<br /> Begrippen:<br /> #*isolator<br /> #*3 R’s<br /> #*zoonose<br /> #*lee-boot effect<br /> <br /> Grote vragen<br /> #Consomic strain<br /> #Geef alle mogelijke analgesia en bespreek hun neveneffecten<br /> #Welke infectie oorzaken zijn er? Hoe kan je deze vermijden?<br /> #Effect van stress op behaviour<br /> <br /> === 31 januari 2018 versie A ===<br /> Schriftelijk<br /> #Welke factoren bepalen de nutriënten behoeften van proefdieren?<br /> #Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?<br /> #Welke invloed heeft licht en geluid op het welzijn van de proefdieren? <br /> #Leg uit: premedicatie en sedatie<br /> #Hoe kan bloedverlies bij chirurgische ingrepen vermeden worden? Wat zijn de belangrijkste postoperatieve zorgen?<br /> <br /> ===31 januari 2018 versie B===<br /> Schriftelijk<br /> #Leg uit:<br /> #*Whitten effect<br /> #*3 R's<br /> #*isolator<br /> #*Zoonose<br /> #Welke effecten kan stress hebben op gedrag?<br /> #Leg uit (in detail): F1 hybride<br /> #Hoe kan een ziekte ontstaan in een animal facility en hoe kun je dit voorkomen?<br /> #Wat zijn mogelijke vormen van analgie, en wat zijn de bijwerkingen?<br /> <br /> ===16 januari 2018===<br /> Schriftelijk<br /> #Leg uit:<br /> #*Harderian gland<br /> #*Orbitapuncture<br /> #*Bruce effect<br /> #*Gavage<br /> #Leg uit in detail: congene stam<br /> #Uitleggen lokale anesthesie<br /> #Uitleggen natuurlijk voeder<br /> #Wat zijn mogelijke vormen van kooiverrijking, leg kort uit.<br /> <br /> === 1 februari 2017 (versie A)===<br /> #Welke factoren bepalen de nutriënten behoeften van proefdieren?<br /> #Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?<br /> #Welke invloed heeft licht en geluid op het welzijn van de proefdieren? <br /> #Leg uit: premedicatie en sedatie en geef een voorbeeld<br /> #Hoe kan bloedverlies bij chirurgische ingrepen vermeden worden? Wat zijn de belangrijkste postoperatieve zorgen?<br /> <br /> <br /> ===1 februari 2017 (versie B)===<br /> #Leg uit:<br /> #*Whitten effect<br /> #*3 R's<br /> #*isolator<br /> #*Zoonose<br /> #Welke effecten kan stress hebben op gedrag?<br /> #Leg uit (in detail): Congene stam<br /> #Hoe kan een ziekte ontstaan in een animal facility en hoe kun je dit voorkomen?<br /> #Wat zijn mogelijke vormen van analgie, en wat zijn de bijwerkingen?<br /> <br /> ===17 januari 2017===<br /> #Leg uit:<br /> #*Harderian gland<br /> #*Orbitapuncture<br /> #*Bruce effect<br /> #*?<br /> #Leg uit F1 hybriden in muizen<br /> #Uitleggen Lokale anesthesie<br /> #Uitleggen natuurlijk voeder<br /> #Wat zijn mogelijke vormen van kooiverrijking, hoe toepassen?<br /> <br /> ===13 januari 2016===<br /> #Leg uit:<br /> #*whittin effect<br /> #*co isogene stam<br /> #*isolator<br /> #*zoonose en voorbeeld<br /> #bespreek gasanesthesie<br /> #welke infexties kunnen optreden en hoe voorkomen?<br /> #effect van stress op gedrag<br /> #de 3R's en telkens 1 voorbeeld<br /> <br /> ===12 januari 2016===<br /> #Geef definitie proefdier en dierproef<br /> #Hoe controleer je de gezondheidstoestand van een dier? Waarom is dit belangrijk? <br /> #Leg uit: congene stam =&amp;gt; Bijvraag: hoe geef je de naam hiervan weer (schrijfwijze)<br /> #Waarom zijn correcte temperatuur en vochtigheid belangrijk voor proefdieren?<br /> #Wat is kooiverrijking en waarom doet men dit?<br /> #Extra bijvraag: Geef de 3 R's.<br /> <br /> === 22 jan 2015 (nm)===<br /> # Leg uit<br /> #* Bruce effect<br /> #* Gavage<br /> #* IVC<br /> # Wat zijn de eigenschappen van hypnotische stoffen? (bijvraag: waarom zou je urethaan gebruiken in plaats van thiopental/pentobarbital?)<br /> # Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?<br /> # Welke omgevingsfactoren spelen een rol voor het welzijn van proefdieren? Bespreek er 2 in detail.<br /> # Hoe doet men een gezondheidsscreening? Waarom is dit belangrijk?<br /> <br /> === 14 jan 2015 (nm)===<br /> # Definitie proefdier, definitie dierproef<br /> # Wat is het belang van gezondheidsscreenings? Wat is het belang van quarantaine? Hoe wordt dit in de praktijk uitgevoerd? Wat zijn de opties/mogelijkheden bij een besmetting?<br /> # Bespreek outbred stam.<br /> # Wat is het belang van geur en ventilatie bij het huishouden van proefdieren? Wat kunnen de gevolgen zijn als er iets misgaat?<br /> # Bespreek alpha-adrenergic agonists.<br /> <br /> === 13 jan 2014 (vm) ===<br /> # Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?<br /> # Welke invloed heeft licht en geluid op het welzijn van de proefdieren?<br /> # Wat is het belang en risico van bloedverlies bij chirurgische ingrepen en hoe kan dit vermeden worden?<br /> # Welke factoren bepalen de nutriëntenbehoeften behoefte van proefdieren?<br /> # Bespreek: hypnotische stoffen <br /> # Bijvraag 1: Stel je proefdier wilt een bepaalde stof niet innemen omdat het een slechte smaak heeft, wat kan je hieraan doen?<br /> # Bijvraag 2: Wat is zoocentrisme?<br /> <br /> === 17 jan 2013 (nm) ===<br /> ==== reeks 1====<br /> <br /> # Bespreek inteeltstam<br /> # Hoe infecties in de dierenfaciliteit vermijden?<br /> # Hoe preventief allergieen vermijden?<br /> # Wat is enrichment?<br /> # Geef voorbeelden en stress bij een dier. <br /> <br /> Nog meer vragen te vinden in dit bestand: [[Media:Extra_vragen_proefdierkunde.pdf]]<br /> <br /> ==== reeks 2 ====<br /> <br /> # Leg uit:<br /> #*IVC<br /> #*chimeer<br /> #*zoocentrisme<br /> #*...<br /> #Bespreek de eigenschappen van hypnotische stoffen<br /> #Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?<br /> #Welke omgevingsfactoren spelen een rol voor het welzijn van proefdieren? Bespreek er 2 in detail.<br /> #Hoe doet men gezondheidsscreening? Waarom is dit belangrijk?<br /> #Bijvraag: Bespreek housing van zebravis.<br /> <br /> ==== reeks 3 ====<br /> <br /> #Leg uit:<br /> #*Bruce effect<br /> #*Isolator<br /> #*Isogene stam<br /> #*Antropocentrisme<br /> #Stress kan bij proefdieren zorgen voor een verandering in gedrag. Leg uit.<br /> #Leg uit: Lokale anaesthesie<br /> #Leg uit: A2-Faciliteit<br /> #Welke maatregelen moeten er getroffen worden om allergieën tegen te gaan.<br /> <br /> === 17 jan 2012 (vm) ===<br /> <br /> # Geef de definitie van een &amp;quot;proefdier&amp;quot; en een &amp;quot;dierproef&amp;quot;<br /> # Wat is het belang van gezondheidsscreeningen en quarantaine? <br /> # Bespreek: congene stam<br /> # Wat zijn de invloeden van temperatuur en vochtigheid op een proefdier?<br /> # Wat is kooiverrijking en welke vormen zijn er?<br /> <br /> === 18 jan 2011 ===<br /> <br /> # leg uit: <br /> #* Co-isogenic strain<br /> #* Whitten effect<br /> #* Isolator<br /> #* zoönose<br /> # Welke producten kunnen allemaal gebruikt worden voor volledige Anaesthesie. Bespreek kort. (Bijvraag: Hoe kan je weten hoe diep het dier in de verdoving is gebracht?)<br /> # Wat is de invloed van stress op laboratorium dieren? (Bijvraag: Hoe kan je abnormaal gedrag onderscheiden van normaal gedrag?)<br /> # Hoe kan een infectie in een proefdierverblijf binnen gebracht worden? Wat kan je doen om dit te voorkomen?<br /> # Geef de 3 R's en geef per R twee voorbeelden.<br /> <br /> === 19 jan 2010 ===<br /> <br /> # leg uit: <br /> #* de 3R's<br /> #* Whitten effect<br /> #* gaveren<br /> #* zoönose<br /> # bespreek lokale anaesthesie<br /> # bespreek F1 hybride<br /> # Waarom zijn temperatuur en relatieve vochtigheid belangrijk in huisvesting?<br /> # de mogelijke contaminanten van natuurlijke voeders.<br /> <br /> <br /> === 12 jan 2010 ===<br /> <br /> # Factoren die nutriëntenbehoeften bepalen?<br /> # Verschillende producten voor anesthesie en hun werking?<br /> # Invloed van licht en geluid op proefdieren?<br /> # Welke formaliteiten moeten in orde zijn voor een experiment van start kan gaan?<br /> # Belang van bloedverlies tegengaan bij chirurgische ingrepen en methodes?<br /> # Bijvraag: 3 R's</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=2078 2020-01-28T15:54:10Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===28 Januari 2020 NM===<br /> ====Dier====<br /> #In Togo heb je een bedrijf voor geitenmelk. Hoe zou je via genetica dit optimaliseren.<br /> #...<br /> #Een bedrijf wordt ervan verdacht paardenvlees in de lasagne te gebruiken en dit niet te vermelden op het etiket. Stel een genetische test op om dit te achterhalen, hoe werkt de test?<br /> <br /> ====Plant====<br /> #Wat zijn doubled haploids? Hoe worden ze algemeen gemaakt en geef een voorbeeld? Waarvoor zouden DH's gebruikt kunnen worden in veredeling?<br /> #Geef het Solonaceae type zelf incompatibiliteit, moleculair en cellulair. Is dit gametofytisch of sporofytisch? is dit self recognition based of non-self? Wat zijn de complicaties in veredeling voor gewassen met dit soort ZI. <br /> #Wat is bulked segregant analysis?<br /> <br /> === 17 januari 2019 VM===<br /> ====DIER====<br /> #Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?<br /> #Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?<br /> <br /> ====PLANT====<br /> Mondeling<br /> #Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?<br /> Schriftelijk<br /> #Dominantie epistasie<br /> #Triploid block <br /> #Simple QTL<br /> <br /> ===17 januari 2019 NM===<br /> ====DIER====<br /> #Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen<br /> #Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren<br /> ====PLANT====<br /> #Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen<br /> #Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan<br /> #Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL<br /> #Leg solanaceae-type self incompatibility uit<br /> <br /> ===30 januari 2019 NM===<br /> ====DIER====<br /> #konijnen kweken; voor welke eigenschappen en hoe ga je te werk?<br /> #Je wil dezelfde spiergroei kenmerkend voor Belgisch Wit-Blauw in geiten, hoe ga je te werk?<br /> ====PLANT====<br /> Mondeling<br /> #Leg uit Backcrossing, hoe kunnen moleculaire merkers het proces versnellen?<br /> Schriftelijk<br /> #Brassicaceae type zelf incompatibiliteit<br /> #Heterosis en transgenese<br /> #Leg uit apomixie<br /> <br /> ===23 augustus 2019 VM===<br /> ====DIER====<br /> #kwaliteitsvol vlees, welke dieren en waarom?<br /> #schaap met goede vruchtbaarheid naar een ander schaap overbrengen, hoe ga je te werk?<br /> <br /> ====PLANT====<br /> #Dubbele haploiden<br /> #BSA<br /> #F1 steriliteit<br /> #overerfbaarheid (enge, brede zin)<br /> <br /> ===4 september 2019 NM===<br /> ====DIER====<br /> #Wat is heterosis? Hoe ga je dit gebruiken bij het selecteren van varkens?<br /> #Dood schaap gevonden met een bijwoonde. Hond of wolf? Wat ga je doen, leg elke stap uit?<br /> <br /> ====PLANT====<br /> #Backcrossing, wat is het, hoe doe je het en welke moleculaire merkers kunnen BC versnellen?<br /> #CGMS<br /> #SPA (QTL) mapping<br /> #Zaadloze vruchten, hoe ga je dit bekomen?<br /> <br /> === 17 januari 2018 ===<br /> ====Plant====<br /> # Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)<br /> # Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?<br /> # Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.<br /> # Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?<br /> <br /> ====Dier====<br /> # Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.<br /> # Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?<br /> <br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ====PLANT (Reeks 8) ====<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ====DIER====<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ====PLANT ====<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ====DIER====<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=2077 2020-01-28T15:45:47Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 17 januari 2018 ===<br /> ====Plant====<br /> # Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)<br /> # Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?<br /> # Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.<br /> # Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?<br /> <br /> ====Dier====<br /> # Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.<br /> # Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?<br /> <br /> === 17 januari 2019 VM===<br /> ====DIER====<br /> #Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?<br /> #Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?<br /> <br /> ====PLANT====<br /> Mondeling<br /> #Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?<br /> Schriftelijk<br /> #Dominantie epistasie<br /> #Triploid block <br /> #Simple QTL<br /> <br /> ===17 januari 2019 NM===<br /> ====DIER====<br /> #Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen<br /> #Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren<br /> ====PLANT====<br /> #Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen<br /> #Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan<br /> #Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL<br /> #Leg solanaceae-type self incompatibility uit<br /> <br /> ===30 januari 2019 NM===<br /> ====DIER====<br /> #konijnen kweken; voor welke eigenschappen en hoe ga je te werk?<br /> #Je wil dezelfde spiergroei kenmerkend voor Belgisch Wit-Blauw in geiten, hoe ga je te werk?<br /> ====PLANT====<br /> Mondeling<br /> #Leg uit Backcrossing, hoe kunnen moleculaire merkers het proces versnellen?<br /> Schriftelijk<br /> #Brassicaceae type zelf incompatibiliteit<br /> #Heterosis en transgenese<br /> #Leg uit apomixie<br /> <br /> ===23 augustus 2019 VM===<br /> ====DIER====<br /> #kwaliteitsvol vlees, welke dieren en waarom?<br /> #schaap met goede vruchtbaarheid naar een ander schaap overbrengen, hoe ga je te werk?<br /> <br /> ====PLANT====<br /> #Dubbele haploiden<br /> #BSA<br /> #F1 steriliteit<br /> #overerfbaarheid (enge, brede zin)<br /> <br /> ===4 september 2019 NM===<br /> ====DIER====<br /> #Wat is heterosis? Hoe ga je dit gebruiken bij het selecteren van varkens?<br /> #Dood schaap gevonden met een bijwoonde. Hond of wolf? Wat ga je doen, leg elke stap uit?<br /> <br /> ====PLANT====<br /> #Backcrossing, wat is het, hoe doe je het en welke moleculaire merkers kunnen BC versnellen?<br /> #CGMS<br /> #SPA (QTL) mapping<br /> #Zaadloze vruchten, hoe ga je dit bekomen?<br /> <br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ====PLANT (Reeks 8) ====<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ====DIER====<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ====PLANT ====<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ====DIER====<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Molecular_Genetics_and_Biotechnology_of_Microorganisms&diff=2030 2020-01-25T12:05:34Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie: Mabb]]<br /> == Vakinformatie==<br /> Cellulaire orientatie. Molecular Genetics and Biotechnology of Yeast. Gedoceerd door Prof. Thevelein.<br /> <br /> Het examen bestaat uit 8 vragen: 4 hoofdvragen en 4 'bijvragen', bereid je dus voor op gigantisch veel schrijven. Wanneer je niets kan antwoorden op één van de hoofdvragen ben je er hoe dan ook niet door. Gegarandeerd één vraag over het practicum. Alle vragen zijn met mondelinge toelichting: hij leest je voorbereiding en vraagt bij indien nodig. <br /> <br /> Maak tekeningen en schema's. Wees beknopt, maar volledig.<br /> Aan het begin van het examen wordt gevraagd of je Nederlandse of Engelse vragen wilt.<br /> <br /> ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0F77AE.htm<br /> <br /> == Examenvragen==<br /> ===24 Janurari 2020 VM===<br /> Hoofdvragen:<br /> #In welke signaalweg komt Grp1 voor en hoe hebben ze de werking ervan gevonden?<br /> #Geef argumenten die aangeven dat Pho84 een transceptor is. <br /> #Bespreek de analyse van een complex kenmerk met lage glycerol productie als voorbeeld.<br /> #practicum: bespreek de belangrijkste stappen om een deletie strain te maken en te verifieren. <br /> <br /> Bijvragen:<br /> #Leg uit hoe activatie van Cdc25/Ras door Fru1,6bP werd ontdekt + belang<br /> #Hoe komt het dat bio-ethanol productie beter gaat en dus goedkoper is voor suiker riet dan voor graan?<br /> #Er is nog niet helemaal geweten hoe Gap1 en PKA interageren. Stel: Je denkt van een aantal G-proteïnen dat ze werken in de pathway, de sequenties en genen van de G-proteïnen zijn gekend. Hoe ga je te werk om te achterhalen als ze effectief tussen komen in de pathway?<br /> #Wanneer bij Pooled Segregant WGS analysis de SNP variant frequentie van de pool van geselecteerde segreganten wordt uitgezet tegen de chromosomale positie van de SNP. <br /> #* A) wat is dan het algemeen beeld dat wordt bekomen in geval van 2 onverwante ouders? <br /> #* B) in geval van een segregant die teruggekruist wordt met 1 van zijn ouders? <br /> #* C) dezelfde segregant die wordt teruggekruist met de andere ouder? <br /> #* D) in geval van 2 verwante ouders. <br /> #* E) in geval je onverwante ouders hebt en de slechtste segreganten (met het zwakste fenotype) poolt? <br /> #* F) in geval van onverwante ouders en je alle segregaten poolt? Maak voor elk geval een duidelijke tekening met het verwachte resultaat.<br /> <br /> ===15 januari 2020 voormiddag===<br /> Hoofdvragen:<br /> #In welke signaalweg komt Gpa2 voor en met behulp van welke experimenten werd dit opgehelderd?<br /> #Geef argumenten die voor Gap1 aangeven dat het een transceptor is. <br /> #Bespreek de analyse van een complex kenmerk met ethanol tolerantie als voorbeeld.<br /> #Leg alle stappen van het practicum uit.<br /> Bijvragen:<br /> #Leg uit hoe je AZ residues kan identificeren waarvan de zijketen zich in de bindingsholte of transportweg bevinden.<br /> #Hebben de glucose transporters effect op de glucose signaling pathway in een gist cel?<br /> #cAMP deficiente cellen vertonen geen snelle activatie van PKA na stikstof activatie desondanks cAMP geen secundaire messenger is? Geef een mogelijke verklaring.<br /> #Hoe Gap1 aan de PKA pathway gelinked is, is niet helemaal geweten. Stel dat er een deel G-proteïne achtige eiwitten gevonden worden, die mogelijk tussenkomen en wiens gen gekend is. Hoe zou je dit onderzoeken?<br /> <br /> ===13 januari 2020 namiddag===<br /> Hoofdvragen:<br /> #Geef de regulatie en werking van de Gpr1 suiker receptor + welke experimenten men heeft gedaan om de regulatie te ontrafelen<br /> #Waarom is gist een goed model voor andere eukaryoten?<br /> #Bespreek de analyse van een complex kenmerk met azijnzuurtolerantie als voorbeeld<br /> #Bespreek de grote stappen van het practicum <br /> Bijvragen:<br /> #Welke niet getransporteerde agonisten van de nutriënt-sensing pathways hebben we gezien en hoe zijn deze ontdekt? Waarom zijn ze nuttig?<br /> #Welke benaderingen kunnen gebruikt worden om een strain te verbeteren? Geef voor-en nadelen<br /> #Hoe kun je aantonen dat Pho84 een transceptor is? Wat is de rol van glycerol-3-fosfaat hierin?<br /> # Twee enkelvoudige deletiestammen (substitutie met antibioticum resistentie) worden gekruist om dubbeldeletiestammen te maken. Kan dit voor alle genen in het gistgenoom? Welke problemen kunnen zich voordoen?<br /> <br /> ===13 januari 2020 VM===<br /> Hoofdvragen:<br /> #Bespreek de mechanismen om cAMP te reguleren<br /> #Bespreek technieken en moleculaire instrumenten voor gen modificatie van gist<br /> #Leg uit hoe je bij gist de genetische basis van een complexe eigenschap kan analyseren, lage glycerolproductie als voorbeeld<br /> #Leg alle belangrijke experimentele stappen uit + bevestiging voor GAP1 deletie<br /> Bijvragen:<br /> #Leg uit hoe activatie van Cdc25/Ras door Fru1,6bP werd ontdekt + belang<br /> #Leg uit hoe je AZ residues waarvan de zijketen in de bindingsholte of transportweg uitsteekt werden geïdentificeerd (SCAM)<br /> #Adaptieve evolutie zorgt ervoor dat een gemodificeerde giststam telkens beter xylose fermenteerd. Welke genetische veranderingen kunnen daarvoor verantwoordelijk zijn?<br /> #Wanneer bij Pooled Segregant WGS analysis de SNP variant frequentie van de pool van geselecteerde segreganten wordt uitgezet tegen de chromosomale positie van de SNP. <br /> #* A) wat is dan het algemeen beeld dat wordt bekomen in geval van 2 onverwante ouders? <br /> #* B) in geval van een segregant die teruggekruist wordt met 1 van zijn ouders? <br /> #* C) dezelfde segregant die wordt teruggekruist met de andere ouder? <br /> #* D) in geval van 2 verwante ouders. <br /> #* E) in geval je onverwante ouders hebt en de slechtste segreganten (met het zwakste fenotype) poolt? <br /> #* F) in geval van onverwante ouders en je alle segregaten poolt? Maak voor elk geval een duidelijke tekening met het verwachte resultaat.<br /> <br /> ===30 januari 2019===<br /> Hoofdvragen:<br /> #Effect van nutrienten + regulatie van PKA<br /> #Tools voor genetische modificatie<br /> #Hoe bewijs je dat een residue belangrijk is voor signalisatie en transport?<br /> #Practicum<br /> <br /> Bijvragen:<br /> #Hoe weten we dat cAMP wordt opgenomen?<br /> #Voor- en nadelen van first en second generation bioethanol production<br /> #...<br /> #Welke mutaties kunnen optreden bij forced adaptive evolution en bespreek de stabiliteit<br /> <br /> ===25 januari 2019, VM===<br /> Hoofdvragen: <br /> #Bespreek alle mechanismen die cAMP verhogen<br /> #Bespreek de ontdekking van de fysieke interactie tussen nutrient transceptors en eIF2B/eIF2 en de bredere betekenis ervan. <br /> #Bespreek de analyse van een complex kenmerk met ethanol tolerantie als voorbeeld<br /> #Bespreek alle stappen van het practicum<br /> <br /> Bijvragen:<br /> #Geef de nieuwe benadering voor het analyseren van QTLs en causatieve genen bij bvb azijnzuur tolerantie en wat zijn de consequenties van deze methode?<br /> #Hoe kunnen nieuwe industriële giststammen gemaakt worden? Bespreek de voor- en nadelen. <br /> #Hoe bepalen dat transport en signaling zelfde bindingsplaats hebben? (antwoord = SCAM) En hoe bepalen dat signaling gebeurt zonder transport? (antwoord = non-transported agonist)<br /> #Dubbele deletie stammen zijn gemakkelijk te maken met twee geneticine resistentie genen en selectie m.b.v. tetrad analysis. Kan je voor alle genen dubbele deleties maken? Welke problemen kunnen zich voordoen?<br /> <br /> ===14 Januari 2019, NM===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Wat is het effect van het metabolisme van glucose op de Ras cAMP PKA pathway?<br /> # Bespreek de analyse van een complex kenmerk zoals ethanol tolerantie.<br /> # Waarom is gist het eerste en belangrijk modelorganisme voor eukaryote celprocessen?<br /> # Bespreek al de stappen van het practicum.<br /> <br /> Bijvragen:<br /> # Geef argumenten die voor zowel Pho 84 als GAP1 aangeven dat het transceptors zijn. (dus geef dingen die ze bij zowel gap1 analyse als Pho84 hebben gedaan, bv SCAM, non transporter agonists, etc.)<br /> # Hebben de glucose transporters effect op de glucose signaling pathway in een gist cel.<br /> # Bespreek de voor en nadelen van first en second generation bioethanol production.<br /> # Deletie stammen kan je makkelijk maken met een geneticine resistentie gen, om een dubbele mutant te maken kan dit door de mutatnen te kruisen en in de tetrad analysis te zoeken naar 2 cellen die geneticine resitent zijn en 2 die gevoelig zijn. Kan zo'n dubbele mutant gemaakt worden voor alle genen? wat kan er zoal mislopen?<br /> <br /> ===20 Augustus 2018, NM===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Welke tools en genetische instrumenten, die gebruikt worden tijdens het onderzoeken van de functie van het gen, kunnen we gebruiken om de activiteit van het proteine te beinvloeden? (interessante zinsconstructie)<br /> # Geef argumenten die bewijzen dat Pho84 een fosfaat transceptor is<br /> # Hoe werd de RAS, glycolytische pathway opgehelderd? Geef de brede relevantie hiervan.<br /> # Bespreek al de stappen van het practicum<br /> <br /> Bijvragen:<br /> # Hoe weten we dat cAMP opgenomen kan worden?<br /> # Met welke bendaderende techniekenkunnen we causatieve identificeren voor azijnzuurtolerantie? Welke gevolgen had dit?<br /> # Waarom werd gebruik makende van Y2H-assay geen interactie gevonden tussen Gpa2-Alpha en Gpa2-Beta? Geef alle mogelijke verklaringen.<br /> # Kunnen we voor alle genen een dubbele deletie stam aanmaken? Welke mogelijke problemen kunnen zich voordoen?<br /> <br /> ===17 januari 2018, VM===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Geef de link tussen de aard van nutriënten en de PKA signaalweg. Geef ook de regulatie van de PKA pathway.<br /> # Practicum<br /> # Geef argumenten waarom Pho84 een fosfaat transceptor is<br /> # Manier beschrijven om genetische achtergrond van complexe eigenschappen te onderzoeken met azijnzuurtolerantie als voorbeeld<br /> Bijvragen:<br /> # Hoe kan aangetoond worden dat gist cAMP kan opnemen<br /> # Waarom is bio ethanol uit rietsuiker goedkoper dan uit tarwe?<br /> # Twee enkelvoudige deletiestammen (substitutie met Kandamycine resistentie) worden gekruist om dubbeldeletiestammen te maken. Kan dit voor alle genen in het gistgenoom? Welke problemen kunnen zich voordoen?<br /> # Op welke manier werden QTLs en hun causatieve genen gevonden die verantwoordelijk zijn voor verlaagde glycerolproductie?<br /> <br /> ===16 januari 2018, NM===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Sul 1 en 2, hoe bepaald dat dit sensoren kunnen zijn.<br /> # Bespreek de ontdekking van het mechanisme waarlangs suikerafbraak in de glycolyse de Ras proteïnen activeert en de brede relevantie hiervan.<br /> # Bekomen van een industriele belangrijke trait, bv ethanol tolerantie<br /> # Practicum<br /> #* bijvraagje: waarom toch groei op D-histidine medium bij degene zonder GAP1? (= er zit L-proline in)<br /> Bijvragen:<br /> # Geef de collecties die gebruikt worden bij gistonderzoek. Waarbij worden ze gebruikt? (= temperatuursensitieve, GFP...)<br /> # Geef de methodes en technieken om een superieure giststam voor tweede generatie bioethanol-productie te ontwikkelen.<br /> # Welke benaderingen zijn er om minor QTLs te identificeren? (= inteelt, strengere selectie, terug kruisen met ouder...)<br /> # Een wetenschapper wil de endocytotische internalisatie volgen van een transmembraan proteïne. Het gen van dit proteïne is essentieel maar heeft een zwakke expressie. Hoe zou hij dit doen/wat gebruikt hij? (= bv sterke induceerbare promotors, ADH...)<br /> <br /> ===16 januari 2018, VM===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Geef de link tussen de aard van nutrienten en de PKA signaalweg. Geef ook de regulatie van dezen. (maw geef de link tussen suikers, N-houdende, P-houdende en S-houdende stoffen en PKA)<br /> # Bespreek de verschillende argumenten dat Pho84 een fosfaat transceptor zou kunnen zijn. <br /> # Hoe analyseer je de genetische basis van complexe eigenschappen vb. azijnzuurtolerantie<br /> # Practicum: Leg de voornaamste experimentele stappen uit om de Gap1 deletiestam te genereren en verifiëren.<br /> Bijvragen<br /> # Hoe weten we dat cAMP wordt opgenomen door de gistcel.<br /> # Waarom is bioethanolproductie uit suikerriet goedkoper.<br /> # Op welke manier werden QTLs en hun causatieve genen gevonden die verantwoordelijk zijn voor verlaagde glycerolproductie? <br /> # Wat zijn de problemen bij het genereren van dubbele deletielijnen. (dubbele deletie is lethaal, gekoppelde genen kunnen niet recombineren)<br /> <br /> ===15 januari 2018, VM===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Welke mechanismen verhogen cAMP?<br /> # Waarom is Gap1 een aminozuursensor<br /> # Hoe analyseer je complexe eigenschappen vb. azijnzuurtolerantie<br /> # Practicum<br /> Bijvragen<br /> # Kelch repeat bybass pathway<br /> # SCAM analysis<br /> # Superieure stam maken voor 2nd gen bioethanol<br /> # Dubbeldeletie die toch leefbaar is. Hoe komt het? hoe onderzoeken?<br /> <br /> ===18 januari 2017, VM===<br /> Hoofdvragen:<br /> #Sul 1 en 2, hoe bepaald dat dit sensoren kunnen zijn<br /> #Waarom gist uitgegroeid is tot een belangrijk modelorganisme voor eukaryote cellen en geef voorbeeld uit celbiologie waar gist een pionier functie had.<br /> #Bekomen van een industriele belangrijke trait, bv ethanol tolerantie<br /> #Practicum: geef de voornaamste stappen om de Gap1 deletiestam te genereren en verifiëren <br /> <br /> Bijvragen<br /> #Hoe werd de Kelch bypass pathway ontdekt en opgehelderd?<br /> #Leg transport, metabolisme en sensing van sucrose in gist uit<br /> #Welke problemen bestaan er bij de genetische verbetering van industriele giststammen?<br /> #Wanneer bij Pooled Segregant WGS analysis de SNP variant frequentie van de pool van geselecteerde segreganten wordt uitgezet tegen de chromosomale positie van de SNP. <br /> #* A) wat is dan het algemeen beeld dat wordt bekomen in geval van 2 onverwante ouders? <br /> #* B) in geval van een segregant die teruggekruist wordt met 1 van zijn ouders? <br /> #* C) dezelfde segregant die wordt teruggekruist met de andere ouder? <br /> #* D) in geval van 2 verwante ouders. <br /> #* E) in geval je onverwante ouders hebt en de slechtste segreganten (met het zwakste fenotype) poolt? <br /> #* F) in geval van onverwante ouders en je alle segregaten poolt? Maak voor elk geval een duidelijke tekening met het verwachte resultaat.<br /> <br /> ===16 januari 2017, NM===<br /> Hoofdvragen:<br /> #In welke signaalweg komt Gpa2 voor en hoe werd dit opgehelderd?<br /> #Methode om polygene eigenschappen te ontdekken<br /> #Hoe is aangetoond dat eIF2 en eIF2B interageert met transceptors en wat is de bredere betekenis hiervan?<br /> #Practicum: beschrijf alle stappen qua principes<br /> <br /> Bijvragen<br /> #Hoe is ontdekt en aangetoond dat glycerol-3P een non-transported agonist is voor Pho84?<br /> #Hoe werd een betere azijnzuurtolerante streng bekomen?<br /> #Welke problemen zijn er bij het verbeteren van industriële giststammen?<br /> #Een wetenschapper brengt een dubbeldeletie aan in een essentieel gen, toch overleeft de streng. Kan dit, of is er iets misgegaan, of het gen niet echt essentieel, ...<br /> <br /> ===16 januari 2017, VM===<br /> Hoofdvragen:<br /> #Leg uit op welke verschillende manieren gistcellen genetisch kunnen gemodificeerd worden voor het onderzoek op gist als modelsysteem voor eukaryote cel. <br /> #Bespreek de verschillende argumenten dat Pho84 een fosfaat transceptor zou kunnen zijn. <br /> #Bespreek de ontdekking van het mechanisme waarlangs suikerafbraak in de glycolyse de Ras proteïnen activeert en de brede relevantie hiervan. <br /> #Practicum: Leg de voornaamste experimentele stappen uit om de Gap1 deletiestam te genereren en verifiëren.<br /> <br /> Bijvragen:<br /> #Leg uit hoe de Kelch repeat protein bypass signaalweg van adenylate cyclase bij gist werd ontdekt en opgehelderd. <br /> #Op welke manier werden QTLs en hun causatieve genen gevonden die verantwoordelijk zijn voor verlaagde glycerolproductie? <br /> #Leg uit hoe je in een receptor of transporter aminozuurresidu's kunt identificeren waarvan zijketen in de bindingsholte van het ligand of in transportweg van het substraat uitsteekt. <br /> #Wanneer bij Pooled Segregant WGS analysis de SNP variant frequentie van de pool van geslecteerde segreganten wordt uitgezet tegen de chromosomale positie van de SNP<br /> ## wat is dan het algemeen beeld dat wordt bekomen in geval van 2 onverwante ouders?<br /> ## in geval van een segregant die teruggekruist wordt met 1 van zijn ouders?<br /> ## dezelfde segregant die wordt teruggekruist met de andere ouder?<br /> ## in geval van 2 verwante ouders<br /> ## in geval je onverwante ouders hebt en de slechtste segreganten (met het zwakste fenotype)poolt?<br /> ## in geval van onverwante ouders en je alle segregaten poolt?<br /> :: Maak voor elk geval een duidelijke tekening met het verwachte resultaat.<br /> <br /> ===12 januari 2016===<br /> Hoofdvragen:<br /> #Gpr1, functies, regulatie en hoe ontdekt<br /> #Sul 1 en 2, hoe bepaald dat dit sensoren kunnen zijn<br /> #Moleculaire technieken en methoden voor modificatie van gist<br /> #Practicum: beschrijf alle stappen qua principes<br /> <br /> Bijvragen<br /> #Leg de experimenten uit waarmee de krh1 bypass pathway ontdekd wert<br /> #Hoe werd de een betere azinzuur tolerante streng bekomen (methodologie + QTL principe)<br /> #Hoe werd een betere xylose fermenterende stam bekomen (methodologie)<br /> #Een wetenschapper brengt een dubbeldeletie aan in een essentieel gen, toch overleeft de streng. Kan dit, of is er iets misgegaan, of het gen niet echt essentieel, ...<br /> <br /> ===11 januari 2016===<br /> Hoofdvragen:<br /> #Geef alle regulatie mechanismen van cAMP synthese in gist waarbij cAMP verhoogd wordt.<br /> #Geef verschillende argumenten waarom Gap1 een aminozuur sensor zou kunnen zijn.<br /> #Waarom gist uitgeroeid is tot een belangrijk modelorganisme voor eukaryote cellen.<br /> #Practicum uitleggen<br /> <br /> Kleine vragen:<br /> #Hoe ze QTL's gevonden hebben bij de gist met lage glycerol productie.<br /> #Benaderingen voor het maken van een industriële giststam + voor- en nadelen ervan.<br /> #Hoe de FGM pathway als concept is ontstaan.<br /> #Twee enkelvoudige deletiestammen (substitutie met Kanamycine resistentie) worden gekruist om dubbeldeletiestammen te maken. Kan dit voor alle genen in het gistgenoom? Welke problemen kunnen zich voordoen?<br /> <br /> === 28 jan 2015 nm===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Leg uit welke verschillende technieken en tools er zijn voor de genetische modificatie van gist<br /> # Geef verschillende argumenten waarom Gap1 een aminozuur sensor zou kunnen zijn<br /> # Hoe werd de Kelch bypass pathway ontdekt en opgehelderd?<br /> # Practicum: geef de voornaamste stappen om de Gap1 deletiestam te genereren en verifiëren<br /> <br /> Bijvragen:<br /> # Leg transport, metabolisme en sensing van sucrose in gist uit<br /> # Welke problemen bestaan er bij de genetische verbetering van industriële giststammen?<br /> # Met welke methodologieën hebben we een industriële giststam kunnen bekomen voor 2e generatie bioethanol productie met een hoge performantie?<br /> # Wanneer bij Pooled Segregant WGS analysis de SNP variant frequentie van de pool van geslecteerde segreganten wordt uitgezet tegen de chromosomale positie van de SNP<br /> ## wat is dan het algemeen beeld dat wordt bekomen in geval van 2 onverwante ouders?<br /> ## in geval van een segregant die teruggekruist wordt met 1 van zijn ouders?<br /> ## dezelfde segregant die wordt teruggekruist met de andere ouder?<br /> ## in geval van 2 verwante ouders<br /> ## in geval je onverwante ouders hebt en de slechtste segreganten (met het zwakste fenotype)poolt?<br /> ## in geval van onverwante ouders en je alle segregaten poolt?<br /> :: Maak voor elk geval een duidelijke tekening met het verwachte resultaat.<br /> <br /> ===jan 2015===<br /> Hoofdvragen:<br /> # genetische modificatie van gist <br /> # cAMP regulatie waarbij cAMP verhoogd wordt <br /> # Pooled Segregant Whole Genome Analysis <br /> # Practicum uitleggen<br /> Bijvragen:<br /> # scam analysis<br /> # hoe ze die stam voor 2nd generation bio-ethanol gevonden hebben<br /> # een vraag over dubbeldeleties met behulp van tetrad analysis, en bij welke genen dat een probleem kan opleveren<br /> # begrip transceptor uitleggen en het belang van moleculen te vinden die niet getransporteerd worden maar wel sensen + van elke een voorbeeld geven (voor stikstof, fosfor en sulfaat)<br /> <br /> === 12 jan 2015 vm===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Geef de link tussen de aard van nutrienten en de PKA signaalweg. Geef ook de regulatie van dezen. (maw geef de link tussen suikers, N-houdende, P-houdende en S-houdende stoffen en PKA)<br /> # Methoden om functie van een proteïne te achterhalen.<br /> # Waarom gist uitgeroeid is tot een belangrijk modelorganisme voor eukaryote cellen<br /> # Practicum: Bespreek hoe we de deletiestam gegenereerd hebben en hoe we dit geverifieerd hebben.<br /> Bijvragen:<br /> # Manier beschrijven om genetische achtergrond van complexe eigenschappen te onderzoeken <br /> # Waarom is bioetchanol uit rietsuiker goedkoper dan uit tarwe?<br /> # Met welke techniek kan je bindingsresidu's in transceptors onderzoeken? <br /> # met tekeningen van SNP frequentie tov chromosoompositie moesten aangeven hoe dat eruit zou zien voor verschillende situaties (dus voor bijvoorbeeld twee verwante ouders, twee niet verwante ouders, een geselecteerde pool voor niet verwante ouders, een geselecteerde pool voor een terugkruising met een ouder, een geselecteerde pool voor terugkruising met de andere ouder etc)<br /> <br /> === 13 jan 2014 nm===<br /> Hoofdvragen:<br /> #Geef alle regulatie mechanismen van cAMP synthese in gist<br /> #Geef de manieren om gist genetisch te manipuleren.<br /> #Manier beschrijven om genetische achtergrond van complexe eigenschappen te onderzoeken.<br /> #Practicum: Bespreek hoe we de deletiestam gegenereerd hebben en hoe we dit geverifieerd hebben.<br /> <br /> Bijvragen:<br /> #Hoe is de FGM pathway als concept ontstaan?<br /> #Leg uit hoe men heeft ontdekt wat de rol van PHO84 is in de PKA pathway.<br /> #Geef de methodes en technieken om een superieure giststam voor tweede generatie bioethanol-productie te ontwikkelen.<br /> #Iets van een wetenschapper die 2 deleties van eenzelfde gen wil aanbrengen in een natuurlijke diploïde gist. Hij gebruikt hiervoor 2 verschillende antibioticumresistentiemerkers. Volgens de gist database is het gen dat hij deleteert essentieel maar hij bekomt toch een leefbare gist. Wat kan er verkeerd gegaan zijn? Hoe kan hij aantonen dat het toch juist gegaan is? Hoe kan aantonen dat het gen toch essentieel is indien er geen invloed zou zijn van de genetische achtergrond van de gebruikte gist (supressor mutatie aanwezig)?<br /> <br /> === 30 jan 2013 nm===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Geef de link tussen de aard van nutrienten en de PKA signaalweg. Geef ook de regulatie van dezen. (maw geef de link tussen suikers, N-houdende, P-houdende en S-houdende stoffen en PKA)<br /> # Methoden om functie van een proteïne te achterhalen.<br /> # Manier beschrijven om genetische achtergrond van complexe eigenschappen te onderzoeken (Pooled Segregant Whole Genome Analysis)<br /> # Practicum: Bespreek hoe we de deletiestam gegenereerd hebben en hoe we dit geverifieerd hebben.<br /> <br /> Bijvragen:<br /> # Met welke techniek kan je bindingsresidu's in transceptors onderzoeken? (SCAM)<br /> # Welke problemen kunnen er optreden bij het ontwikkeling van verbeterde industriële giststammen.<br /> # Twee enkelvoudige deletiestammen (substitutie met Kanamycine resistentie) worden gekruist om dubbeldeletiestammen te maken. Kan die voor alle genen? Welke problemen kunnen zich voordoen?<br /> # ...<br /> <br /> === 14 jan 2013 nm===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Geef alle regulatie mechanismen van cAMP synthese in gist<br /> # Bespreek de verschillende manieren waarop gist genetisch gemanipuleerd kan worden<br /> # Geef argumenten die bewijzen dat SUL1 en SUL2 sulfaatsensors zijn<br /> <br /> Bijvragen:<br /> # Met welke techniek kan je bindingsresidu's in transceptors onderzoeken? (SCAM)<br /> # cAMP deficiente cellen vertonen geen snelle stikstof activatie desondanks cAMP geen secundaire messenger is? (similair mechanisme als by pass pathway)<br /> # ...<br /> # Hoe Gap1 aan de PKA pathway gelinked is, is niet helemaal geweten. Stel dat er een deel G-proteïne achtige eiwitten gevonden worden, die mogelijk tussenkomen en wiens gen gekend is. Hoe zou je dit onderzoeken?<br /> <br /> === 17 jan 2012 vm===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Wat zijn de argumenten om aan te nemen dat Gap1 een aminozuursensor is?<br /> # Methoden om functie van een proteïne te achterhalen. <br /> # Verschillende argumenten voor bestaan van bypass pathway <br /> <br /> Bijvragen:<br /> # Methoden om industriële giststammen te verbeteren. Voor- en nadelen van de methoden.<br /> # Welke problemen kunnen er optreden bij het ontwikkeling van verbeterde industriële giststammen.<br /> # Welke glucose transporters zijn er en wat is hun rol in de cAMP-PKA pathway (ofoziets)? <br /> # Geen snelle stikstof activatie van PKA in cAMP deficiente cellen, cAMP is toch geen 2nd boodschapper. Verklaar.<br /> <br /> === 16 jan 2012 vm===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Regulatie en werking van Gpr1 receptor en experimenten gebruikt om dit op te helderen.<br /> # Waarom gist uitgeroeid is tot een belangrijk modelorganisme voor eukaryote cellen<br /> # Manier beschrijven om genetische achtergrond van complexe eigenschappen te onderzoeken<br /> <br /> Bijvragen:<br /> # Argumenten die aantonen dat Pho84 en Gap1 transceptors zijn en die voor beiden geldig zijn<br /> # Manieren om industriele giststammen te verbeteren en hun voor en nadelen geven<br /> # Verschillende plasmiden voor gist uitleggen en hoe ze gebruikt worden voor genenbanken en andere toepassingen<br /> # Iets van een wetenschapper die 2 deleties van eenzelfde gen wil aanbrengen in een natuurlijke diploïde gist. Hij gebruikt hiervoor 2 verschillende antibioticumresistentiemerkers. Volgens de gist database is het gen dat hij deleteert essentieel maar hij bekomt toch een leefbare gist. Wat kan er verkeerd gegaan zijn? Hoe kan hij aantonen dat het toch juist gegaan is? Hoe kan aantonen dat het gen toch essentieel is indien er geen invloed zou zijn van de genetische achtergrond van de gebruikte gist (supressor mutatie aanwezig)?<br /> <br /> === 11 jan 2010===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Leg uit waarom gist uitgegeroeid is tot zo een belangrijk modelorganisme<br /> # Hoe kan je cAMP verhogen in de cel en dit regelen. <br /> # Hoe kan je de zijketen van AZ detecteren van receptor in bindingsplaats ( SCAM)<br /> <br /> Bijvragen:<br /> # Verschillende argumenten voor bestaan van bypass pathway <br /> # Geef de problemen voor er de ontwikkeling van de verbeterde industriële giststammen<br /> # Welke gist plasmiden zijn er en wat zijn hun doeleinden? <br /> # Geef alle theoretische mogelijkheden waarop glucose gesensed kan worden in een cel en geef experimenten om dit te testen<br /> <br /> === 11 jan 2010===<br /> Hoofdvragen:<br /> # genetische manipulatie van gist<br /> # structuur en functie van de cAMP-PKA pathway<br /> # wat zijn de argumenten om aan te nemen dat Gap1 een aminozuursensor is?<br /> <br /> Bijvragen:<br /> # de rol van Pho84 als fosfaatsensor voor activatie van de PKA pathway<br /> # de moeilijkheden bij het verbeteren van industriële giststammen<br /> # Gap1 met korte C-terminale trunkatie veroorzaakt overactivatie van PKA. Hoe zou je dit allel gebruiken om de stroomafwaartse signaalweg te onderzoeken<br /> # Wat zijn alle theoretische manieren waarop een cel sulfaat kan sensen voor de activatie van een signaalweg? Geef voor elke mogelijkheid een experiment om dit aan te tonen.<br /> <br /> === 19 jan 2009 ===<br /> Hoofdvragen:<br /> # Bespreek waarom gist uitgegroeid is tot het belangrijkste modelorganisme voor het bestuderen van het moleculair functioneren van eukaryote cellen (of zoiets).<br /> # Bespreek alle argumenten die aantonen dat Gap1 een aminozuur sensor is.<br /> # Deze vraag was heel raar geformuleerd vind ik, maar het kwam er op neer dat je alle proteinen moest geven die het cAMP level in de cel kunnen doen stijgen.<br /> <br /> Bijvragen:<br /> # Wat heeft aanleiding gegeven tot het concept van de 'fermentable growth medium' induced pathway.<br /> # Bespreek transport, metabolisme en sensing van sucrose.<br /> # De glucose geïnduceerde cAMP stijging treedt enkel op wanneer glucose wordt toegediend aan glucose gederepresseerde cellen. Zoek en bespreek zoveel mogelijke oorzaken hiervan en geef aan met de uitgevoerde experimenten.<br /> # Het depriveren van Pi geeft aanleiding tot de expressie van een gesecreteerd fosfatase. Geef aan hoe je het werkingsmechanisme systematisch zou onderzoeken.<br /> <br /> === 12 jan 2009 nm ===<br /> <br /> Hoofdvragen:<br /> <br /> # Bespreek de redenen waarom gist is geëvolueerd tot het belangrijkste modelsysteem voor het moleculair functioneren van de eukaryoten (ofziets).<br /> # Bespreek de techniek die je in staat stelt om aminozuurresidu's wiens R-groep doorheen de transportweg van een substraat steekt bij een transporter/receptor (iets in die aard in ieder geval, antwoord was SCAM)<br /> # Bespreek aminozuursensing door Gap1<br /> <br /> Bijvragen:<br /> # Geef argumenten voor het bestaan van een bypass pathway van adenylaat cyclase<br /> # Welke plasmiden bestaan er voor gist en hoe worden deze gebruikt voor genenbanken en andere toepassingen.<br /> # Hoe Pho84 aan de PKA pathway gelinked is, is niet helemaal geweten. Stel dat er een deel G-proteïne achtige eiwitten gevonden worden, die mogelijk tussenkomen en wiens gen gekend is. Hoe zou je dit onderzoeken?<br /> # In zoogdiercellen is opgemerkt dat het toevoegen van leucine lijdt tot de inductie van een leucine carrier. Hoe zou je dit werkingsmechanisme schematisch onderzoeken?<br /> <br /> === 12 jan 2009 vm ===<br /> <br /> Hoofdvragen:<br /> <br /> # levenscyclus van gist en implicaties voor genetica<br /> # structuur en functie cAMP-PKA weg<br /> # fosfaatsensing via Pho84 transceptor<br /> <br /> Bijvragen:<br /> <br /> # AMTEM en de uitdagingen van de technologie<br /> # Aquaporines en rol in vriestolerantie<br /> # Geef alle theoretische mogelijkheden waarop een cel glucose kan sensen en experimenten om dit aan te tonen<br /> # Gap 1 met C terminale truncaties activeert constitutief PKA. Geef een mogelijke pathway en experimenten om je theorie te bewijzen</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Molecular_Interactions_between_Fungi_and_their_Hosts&diff=1907 2020-01-17T09:48:33Z

<p>Cynthia.R: /* 17 januari 2020 VM */</p> <hr /> <div>[[Categorie: Mabb]]<br /> <br /> == Vakinformatie ==<br /> Molecular Interactions between fungi and their hosts<br /> <br /> ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0B98AE.htm<br /> <br /> == Examenvragen ==<br /> ===17 januari 2020 VM===<br /> #Where is PAL important, which reaction does in catalyse? <br /> #A. fumigatus is an important human pathogen. What are its virulence factors? Why are healthy people not infected? What is important in basic azole resistance of the pathogen in the environment? (Last question: agriculture uses a lot of drugs resembling azoles which results in resistent strains before they even infect hosts)<br /> #What are the differences and similarities between ascomycetes and basidiomycetes? What are important plant and human fungal pathogens in both phyla?<br /> #What are Paldoxins and how does it work?<br /> #You used an deletion collection and found a strain with gene X deleted. In vitro it does not produce a biofilm. What is the first thing you do, how will you find its function? Can it be a target for a antifungal drug? what are the criteria for this? What screen will you set up to test for an antifungal drug?<br /> <br /> === 30 januari 2019 VM ===<br /> # Explain opaque-white phenotypic switch in C. Albicans and its relevance in virulence. <br /> #* Bijvraag: de rol van white cellen in biofilm<br /> # Elicitor uitleggen origin and role in plant defence (hij vroeg ook of een compatible interaction een incompatible reaction kan worden --&gt; dus het zigzag model van clostridium tomato als vb)<br /> # PR5 osmotin: How discoverd and role (explain everything)<br /> # Fluconasole working and resistance mechanisms against it (leg alles uit incl. alles van azolen)<br /> #* Bijvraag: Hoe komt het dat fluconasole resistentie vaak voorkomt in ziekenhuizen (antw: biofilm vorming)<br /> # Er is een nieuw gen in C.glabrata ontdekt dat sterk tot expressie komt in anaerobe omstandigheden. How investigating if it plays a role in virulence and what it targets are.<br /> <br /> === 21 januari 2019 ===<br /> #Explain the role of SA in plant defense. Which signalling pathways are important?<br /> #Explain which classes of toxins exist and give an example of which class. Which type of fungi uses this. (He also asked why specific toxins are specific)<br /> #Discuss different ways of fungal immune evasion of the human immune system. Which pathogen uses which strategy?<br /> #Cryptococcus neoformans: biology and virulence factors<br /> #Gene for adhesion in C. glabrata (!) is discovered, how would you investigate its importance in adhesion, virulence, biofimls etc. Which techniques would you use. (He also asked how I would isolate compounds to treat it - via GUS!)<br /> <br /> === 18 januari 2019 ===<br /> # wat is PAL, functie, welke reactie katalyseert het, waarbij is het van belang? welke pathways betrokken? <br /> # wat is een appresorium en betrokken pathways<br /> # ALS zijn belangrijk, wat zijn het? waarin is ALS3 belangrijk? is het een goede target voor antifungale drugs? <br /> # aspergillus fumigatus virulence factors, wat ligt aan basis van resistentie in de natuur tegen azolen? <br /> # TF gevonden die in overexpressie zorgt voor geen vorming van filamenten in C albicans. Hoe zou je verder onderzoeken wat de moleculaire basis is, is het een goede drug target? Hoe design je een screen om een drug te vinden?<br /> <br /> === 31 januari 2018 voormiddag===<br /> #An essential, volatile oil derivative illustrates an antifungal activity in vitro. How would you try to reveal the mode of action of this compound? And how would you validate your results in vitro?<br /> #Explain Aspergillus fumigatus and what happens if this fungus is recognized by the host immune system<br /> #Explain ALS3 and its functions for Candida albicans. Would this compound be an interesting antifungal drug target? How would you investigate this? What research is still necessary?<br /> # Explain the most important signal transduction pathways that occur when a plant succesfully manages to recognize a pathogen.<br /> # Explain Fusicoccin and victorin, what are the differences. Explain their mode of action.<br /> # What are symbiotic interactions? Explain in detail the most important symbiotic interactions.<br /> <br /> === 29 januari 2018 voormiddag===<br /> #Explain Avr-R system with Cladosporium fulvum - tomato as an example + link with the zigzag-model<br /> #What is Victorine? How is its function investigated?<br /> #Explain different types of Mycorrhiza + how they exchange nutrients<br /> #Describe the molecular mechanism of morphogenesis in C. albicans<br /> #What are the major classes of antifungal drugs? Describe mechanism of action and resistance<br /> #Explain the virulence factors of Aspergillus fumigatus? Why are healthy people not infected by A. fumigatus? How would you investigate whether a protein is important in virulence or not? How would you search for a drug against this a protein (if it is involved in virulence)?<br /> <br /> === 21 januari 2018 voormiddag===<br /> #Explain all types of Mycorrhiza<br /> #Explain toxin types and give 1 example of both<br /> #Fully explain SA signalling<br /> #Simmilarities and differences of Histoplasma and Coccidioides<br /> #A new gene in Candida glabrata has been found in gene expression that plays a large roll in biofilms. How would you research this?<br /> #Candida albicans recognition at endothelial cells and immunity<br /> <br /> ===31 januari 2017 voormiddag===<br /> #histoplasma capsulatum and coccudioides immitis. What have these two pathogens in common? What are the known virulence factors? How can you treat such an infection? <br /> #Explain Immune response against a Candida albicans ephitilial invasion. How would you study this? Can this specific host-pathogen interaction be targeted by compounds? How would you identify these compounds? <br /> #How is morphogenesis regulated in Candida Albicans?<br /> #What are the different types of toxins that a plant uses? Give an example of each and explain their function.<br /> #What is an appressorium? Explain its function.<br /> #Explain how carbon is translocated in plant-mycorrhiza. How would you investigate this?<br /> <br /> ===30 januari 2017 voormiddag===<br /> #The first technique that was used to delete a gene in C. albicans was the URA-blaster cassette. How does that work. What are the problems with this method (position effect)? What are the currently used methods?<br /> #Biofilm formation by C. albicans is a major problem in hospitals. What are the different stages of biofilm developtment? Which molecules are omportant during biofilm formation? How can this be investigated? What are the available methods to study biofilm formation? What would you do if you were asked to develop a novel antibiofilm molecule?<br /> #What is Cryptococcus neoformans and what are the most important virulence factors?<br /> #Describe the processes that can occur after initial contact between a fungus and a plant. How is the fungus able to penetrate the plant? Discuss the several forms of parasitism and pathogenesis that can occur and gice a schematic overview.<br /> #Discuss the possible outcomes of a host-pathogen interaction, comment on the immune system of the plant and give a schematic overview. What is gene for gene resistance? And how can we exploit this for resistance breeding?</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Molecular_Interactions_between_Fungi_and_their_Hosts&diff=1906 2020-01-17T09:48:02Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie: Mabb]]<br /> <br /> == Vakinformatie ==<br /> Molecular Interactions between fungi and their hosts<br /> <br /> ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0B98AE.htm<br /> <br /> == Examenvragen ==<br /> ===17 januari 2020 VM===<br /> #Where is PAL important, which reaction does in catalyse? <br /> #A. fumigatus is an important human pathogen. What are its virulence factors? Why are healthy people not infected? What is important in basic azole resistant of the pathogen in the environment? (Last question: agriculture uses a lot of drugs resembling azoles which results in resistent strains before they even infect hosts)<br /> #What are the differences and similarities between ascomycetes and basidiomycetes? What are important plant and human fungal pathogens in both phyla?<br /> #What are Paldoxins and how does it work?<br /> #You used an deletion collection and found a strain with gene X deleted. In vitro it does not produce a biofilm. What is the first thing you do, how will you find its function? Can it be a target for a antifungal drug? what are the criteria for this? What screen will you set up to test for an antifungal drug?<br /> <br /> === 30 januari 2019 VM ===<br /> # Explain opaque-white phenotypic switch in C. Albicans and its relevance in virulence. <br /> #* Bijvraag: de rol van white cellen in biofilm<br /> # Elicitor uitleggen origin and role in plant defence (hij vroeg ook of een compatible interaction een incompatible reaction kan worden --&gt; dus het zigzag model van clostridium tomato als vb)<br /> # PR5 osmotin: How discoverd and role (explain everything)<br /> # Fluconasole working and resistance mechanisms against it (leg alles uit incl. alles van azolen)<br /> #* Bijvraag: Hoe komt het dat fluconasole resistentie vaak voorkomt in ziekenhuizen (antw: biofilm vorming)<br /> # Er is een nieuw gen in C.glabrata ontdekt dat sterk tot expressie komt in anaerobe omstandigheden. How investigating if it plays a role in virulence and what it targets are.<br /> <br /> === 21 januari 2019 ===<br /> #Explain the role of SA in plant defense. Which signalling pathways are important?<br /> #Explain which classes of toxins exist and give an example of which class. Which type of fungi uses this. (He also asked why specific toxins are specific)<br /> #Discuss different ways of fungal immune evasion of the human immune system. Which pathogen uses which strategy?<br /> #Cryptococcus neoformans: biology and virulence factors<br /> #Gene for adhesion in C. glabrata (!) is discovered, how would you investigate its importance in adhesion, virulence, biofimls etc. Which techniques would you use. (He also asked how I would isolate compounds to treat it - via GUS!)<br /> <br /> === 18 januari 2019 ===<br /> # wat is PAL, functie, welke reactie katalyseert het, waarbij is het van belang? welke pathways betrokken? <br /> # wat is een appresorium en betrokken pathways<br /> # ALS zijn belangrijk, wat zijn het? waarin is ALS3 belangrijk? is het een goede target voor antifungale drugs? <br /> # aspergillus fumigatus virulence factors, wat ligt aan basis van resistentie in de natuur tegen azolen? <br /> # TF gevonden die in overexpressie zorgt voor geen vorming van filamenten in C albicans. Hoe zou je verder onderzoeken wat de moleculaire basis is, is het een goede drug target? Hoe design je een screen om een drug te vinden?<br /> <br /> === 31 januari 2018 voormiddag===<br /> #An essential, volatile oil derivative illustrates an antifungal activity in vitro. How would you try to reveal the mode of action of this compound? And how would you validate your results in vitro?<br /> #Explain Aspergillus fumigatus and what happens if this fungus is recognized by the host immune system<br /> #Explain ALS3 and its functions for Candida albicans. Would this compound be an interesting antifungal drug target? How would you investigate this? What research is still necessary?<br /> # Explain the most important signal transduction pathways that occur when a plant succesfully manages to recognize a pathogen.<br /> # Explain Fusicoccin and victorin, what are the differences. Explain their mode of action.<br /> # What are symbiotic interactions? Explain in detail the most important symbiotic interactions.<br /> <br /> === 29 januari 2018 voormiddag===<br /> #Explain Avr-R system with Cladosporium fulvum - tomato as an example + link with the zigzag-model<br /> #What is Victorine? How is its function investigated?<br /> #Explain different types of Mycorrhiza + how they exchange nutrients<br /> #Describe the molecular mechanism of morphogenesis in C. albicans<br /> #What are the major classes of antifungal drugs? Describe mechanism of action and resistance<br /> #Explain the virulence factors of Aspergillus fumigatus? Why are healthy people not infected by A. fumigatus? How would you investigate whether a protein is important in virulence or not? How would you search for a drug against this a protein (if it is involved in virulence)?<br /> <br /> === 21 januari 2018 voormiddag===<br /> #Explain all types of Mycorrhiza<br /> #Explain toxin types and give 1 example of both<br /> #Fully explain SA signalling<br /> #Simmilarities and differences of Histoplasma and Coccidioides<br /> #A new gene in Candida glabrata has been found in gene expression that plays a large roll in biofilms. How would you research this?<br /> #Candida albicans recognition at endothelial cells and immunity<br /> <br /> ===31 januari 2017 voormiddag===<br /> #histoplasma capsulatum and coccudioides immitis. What have these two pathogens in common? What are the known virulence factors? How can you treat such an infection? <br /> #Explain Immune response against a Candida albicans ephitilial invasion. How would you study this? Can this specific host-pathogen interaction be targeted by compounds? How would you identify these compounds? <br /> #How is morphogenesis regulated in Candida Albicans?<br /> #What are the different types of toxins that a plant uses? Give an example of each and explain their function.<br /> #What is an appressorium? Explain its function.<br /> #Explain how carbon is translocated in plant-mycorrhiza. How would you investigate this?<br /> <br /> ===30 januari 2017 voormiddag===<br /> #The first technique that was used to delete a gene in C. albicans was the URA-blaster cassette. How does that work. What are the problems with this method (position effect)? What are the currently used methods?<br /> #Biofilm formation by C. albicans is a major problem in hospitals. What are the different stages of biofilm developtment? Which molecules are omportant during biofilm formation? How can this be investigated? What are the available methods to study biofilm formation? What would you do if you were asked to develop a novel antibiofilm molecule?<br /> #What is Cryptococcus neoformans and what are the most important virulence factors?<br /> #Describe the processes that can occur after initial contact between a fungus and a plant. How is the fungus able to penetrate the plant? Discuss the several forms of parasitism and pathogenesis that can occur and gice a schematic overview.<br /> #Discuss the possible outcomes of a host-pathogen interaction, comment on the immune system of the plant and give a schematic overview. What is gene for gene resistance? And how can we exploit this for resistance breeding?</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Physical_Chemistry_of_Biological_Systems&diff=1841 2020-01-13T15:09:53Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie: Mabb]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Sinds academiejaar 2014-2015 enkel nog door Hideaki Mizuno gedoceerd. Examen bestaat uit 2 vragen, schriftelijk voor te bereiden en mondeling te verdedigen.<br /> In academiejaar 2011-2012 tot 2013-2014 werd het vak gedoceerd door Prof. Yves Engelborghs en Prof. Hideaki Mizuno. Daarvoor enkel Prof. Yves Engelborghs. Staat in de basisopleiding.<br /> <br /> ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0G71AE.htm<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===13 Januari 2020===<br /> #Bespreek de kinetische afleiding voor de massa en nummer concentratie. Aan de hand van deze formules bespreek de grafiek voor polymerisatie, bespreek nucleation, approach to plateau en reaching to the plateau. <br /> #Bespreek hoe DNA binding proteïnen specifieke bindingen kunnen maken met DNA. Gebruik hiervoor onderstaande structuren van de basen. <br /> <br /> ===14 januari 2019===<br /> # Bespreek de informatie die je uit een Hill plot en een Schatchard plot kunt halen (grafieken en vergelijkingen niet gegeven). Bespreek de Hill plot en Schatchard plot van O2 binding aan hemoglobine (grafieken gegeven). (Mondeling)<br /> # Hoe binden proteïnen aan de buitenkant van DNA streng? Is de major of de minor groove hiervoor belangrijker? (schriftelijk)<br /> <br /> ===15 januari 2018===<br /> <br /> # Leg uit hoe je de rate constants kan bepalen wanneer je te maken hebt met de volgende reactie: fast binding followed by slow conformational change. <br /> # Bespreek FCS. Wat kunnen we ermee doen. Hoe kan je FCS uitbreiden om proteine interacties na te gaan.<br /> <br /> ===11 januari 2016===<br /> # Bespreek de binding equation, binding partition function en degree of association. Bespreek hierbij de Hill plot en de Scatchard plot. Leg dit ook uit voor multiple binding sites. Hoe is het voor 'echte' situaties? Gebruik O2 en hemoglobine. <br /> # De kinetica van self assembling van actine uitleggen. Hierbij gebruik maken van Mass Concentration, Number Concentration en Critical Concentration. Wat is treadmilling? Geef grafieken weer.<br /> <br /> ===12 januari 2015===<br /> # Discuss Treadmilling in the formation of Actin Filaments. In your defense, include and explain the terms 'Mass Concentration', 'Number Concentration' and 'Critical Concentration'<br /> # Discuss Fluorescent Correlation Spectroscopy, what information can we deduce with this technique. What adapation can we use to study the interactions of molecules?<br /> <br /> ===17 januari 2013===<br /> Mizuno(mondeling)<br /> # Bespreek de analyse self-assembling van myosine aan de hand van druk. Gebruik in je bespreking massaconcentratie, nummerconcentratie en kritische concentratie. Waarom kan 'pressure jump' gebruikt worden voor de analyse van de self-assembly?<br /> # Bespreek MD(mean displacement), MSD(mean square displacement) en D(diffusion coefficient)bij random walk. Bespreek het verband tussen MSD en D. Waarom word meestal MSD gebruikt in plaats van MD?<br /> Engelborghs (schriftelijk)<br /> # Bespreek de binding van een restrictie-enzyme aan DNA. Hoe beïnvloeden de zoutconcentratie en de lengte van het DNA de kinetica? Geef de gepaste vergelijkingen en grafieken en bespreek.<br /> # Hoe kan je, gebruik makend van de linked function theorie de denaturatie van DNA door ureum beschrijven?<br /> <br /> ===14 januari 2013===<br /> Mizuno(mondeling)<br /> # Bespreek de kinetica van actine polymerisatie. Gebruik de gepaste figuren en formules. Gebruik zeker massaconcentratie, nummerconcentratie en critica concentration<br /> # Bespreek MD(mean displacement), MSD(mean square displacement) en D(diffusion coefficient). Bespreek het verband tussen MSD en D. Waarom word meestal MSD gebruikt in plaats van MD?<br /> Engelborghs (schriftelijk)<br /> # Hoe kan je, gebruik makend van de linked function theorie, ion condensation op DNA kwantitatief bespreken?<br /> # Geef en bespreek 2 manieren om de dissociation rate(stond in vet) constant te bepalen voor een ligand L in een EL complex.<br /> ===18 januari 2011===<br /> Enkel 1 en 2 mondeling.<br /> # Bespreek hoe je de diffusieconstantie bepaalt met FCS. <br /> # Hoe hangt de bindingssnelheid van een restrictie-enzyme af van de zoutconcentratie en lengte van DNA. <br /> # Microtubuli-oscillaties bij hoge concentratie microtubuli.<br /> # Linked function concept toepassen op denaturatie van proteïne door ureum.<br /> <br /> ===29 januari 2010===<br /> Enkel 1 en 2 mondeling.<br /> # Sigmoidale bindingscurve: haal maximum informatie uit grafiek.<br /> # Counter ion condensation: ontwerp een experiment om exact de hoeveelheid counter-ionen te bepalen.<br /> # Microtubulus-oscillaties<br /> # Artikel over Random walk op DNA (rad51). (artikel voor te bereiden voor het examen, ter vervanging van de presentaties).<br /> ===12 januari 2009===<br /> # Microtubulus-oscillaties en effect van tubuline-GMPPNP<br /> # welke info haal je uit kinetische studies?<br /> # counter ion condensation<br /> # linked function concept in proteïne stabiliteit<br /> <br /> ===26 augustus 2008===<br /> # In een oplossing met microtubuli wordt het GTP vervangen door een niet hydrolyseerbaar analoog GMPNPP (of zoiets). Wat gebeurt er?<br /> # Hoe wordt de lengte van de myosine polymeren gereguleerd in vitro (in oplossing dus).<br /> # Hoe kan er experimenteel aangetoond worden dat DNA omgeven worden door tegenionen.<br /> # Een farmaco product bindt met proteïne, tijdens de bindingskineticastudies wordt er een lineare grafiek verkregen, maar het afgesneden stuk op de Y as is echter te klein om concludeerbare resultaten uit af te leiden. Welke informatie ontbreekt? Hoe zou je die wel kunnen bepalen?<br /> <br /> ===14 januari 2008===<br /> # Proteïnen kunnen ontvouwen worden door het toedienen van ureum. Stel een model op via het 'linked function' concept om de invloed van ureum kwantitatief te beschrijven. (Of zoiets, ...).<br /> # Wat beïnvloed de snelheidsconstante voor de specifieke binding van een restrictieenzyme aan DNA?<br /> # Je hebt een ligand dat een signaal uitzend bij binding. Wanneer je de grafiek van de geobserveerde snelheidsconstante extrapoleert (naar L=0) bekom je een waarde die kleiner is dan de experimentele fout op de meettechniek. Hoe kun je de dissociatie-snelheidsconstante van L bepalen?<br /> # Stel de partitiefunctie op voor één stuk DNA met een gap van 9 en een gap van 11 roosterpunten met een ligand dat bindt op 5 roosterpunten.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Vergelijkende_Ontwikkelingsbiologie&diff=1818 2019-09-05T09:36:29Z

<p>Cynthia.R: /* Vakinformatie */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> Vergelijkende ontwikkelingsbiologie behoort tot de opleiding Biologie en behoort tot de minoren biologie en verbreding (sinds 2018-2019). Het wordt gedoceerd door prof. E. Seuntjes. <br /> Het vak behandelt de ontwikkeling van verschillende embryo's van verschillende organismen (muis, kip, kikker en mens). Er worden practica sessies gegeven, met een eindexamen voor de quotering (5/20). Om te slagen voor het vak moet minstens de helft worden behaalt op het practicumexamen, wanneer niet de helft behaalt is moet ook het practicum examen opnieuw gemaakt worden tijdens de herexamens. Een paperopdracht met vragenlijst telt mee voor 1/20. Het theoretisch examen telt dus mee voor 14/20.<br /> <br /> ==Examenvragen juni==<br /> === 01/07/2019 NM ===<br /> #fate map, organoïde, vasculogenese <br /> #Bespreek hoe de regeneratie van een platworm die in 7 gelijke stukken gesneden is gebeurd. <br /> #ontwikkeling van een kikker. Bespreek figuur (handboek) 11.2: corticale rotatie (termen worden weggelaten) + wat gebeurd er als de klievingsdeling via de rode lijn gebeurd (antwoord: geen ' gray crescent' zie experiment van Spemann) <br /> #ZEB2 is belangrijk voor EMT. Een defect in dit gen leidt tot intellectuele achterstand, Hirschsprung's disease, hartafwijkingen, puntige kin, lang voorhoofd. Leg uit hoe het defect in ZEB2 dit veroorzaakt. Bijvraag: Lose it experiment uitwerken --&gt; eerst de plaats van ZEB2 expressie achterhalen, hoe kan je dit specifiek op deze plaats verwijderen (zoals lineage trace) <br /> === 21/06/2019 NM ===<br /> # Compactie, Smad, hemangioblast<br /> # Leg alle facetten uit van de ontwikkeling van de nier (figuur gegeven van ureterknop en mesenchym tot nier). <br /> # Figuur gegeven van stamcelniche van V-SVZ van de hersenen. Wat zijn de kenmerken van een stamcelniche? Welke type stamcellen zien we hier? (antwoord is adult). Kunnen deze stamcellen bloed aanmaken of niet. Zo ja, wat is het proces. Zo niet, waarom niet en wat moet je doen om dat toch mogelijk te maken? (Antwoord, nee want deze stamcellen zijn niet pluripotent. Je kan het toch doen dankzij reprogramming (iPSC) en dus epigenetica.)<br /> # Experiment bij Hydra toont aan dat transplantatie hypostoom ervoor zorgt dat ook de omgeving verandert. Wat voor iets is de hypostoom dan? Welk gelijkaardig experiment hebben ze ook gedaan bij amfibieën? Leg uit.<br /> <br /> === 17/06/2019 VM ===<br /> # Epibolie, capacitatie, morfogen<br /> # De hele ontwikkeling van de hersenschors uitleggen + legende aanvullen op algemeen schema.<br /> # Experiment amputatie salamander en nAG uitleggen.<br /> # Op welke drie organen hebben de mesenchymale cellen van het hart een invloed tijdens de ontwikkeling van het embryo.<br /> <br /> === 14/06/2019 NM ===<br /> # Meroblastische klieving, spermiogenese, pluripotent<br /> # Leg de eigenschappen van een organizer uit aan de hand van de experimenten van Spemann en Manngolg.<br /> # Experiment bij nierontwikkeling, wat hebben Ret en GNDF met de nierontwikkeling te maken?<br /> # Wat zijn de mogelijke moleculaire en morfologische eigenschappen van anencephalie (het ontbreken van hersenen).<br /> <br /> === 11/06/2019 NM ===<br /> # Termen: Resact, angiogenese, neoblasten.<br /> # Leg de gastrulatie bij de kip uit en vergelijk met de mens.<br /> # Leg inducer en competentie uit adhv de oogontwikkeling en onderstaand experiment (dat waarbij ze optische vesikel wegnamen en transplanteerde). (oogontwikkeling moet niet volledig worden uitgetekend, gewoon algemeen).<br /> # Wat is het verschil tussen een eeneiïge en Siamese tweeling? Leg dit uit adhv de ontstaansmechanismen.<br /> <br /> === 11/06/2019 VM === <br /> # Termen: morphallaxis, pronefros, midblastula transitie.<br /> # Hoe zorgt de zee-egel voor soort-specifieke fertilisatie? <br /> # Experiment BMP en medial hinge point, neurulatie en BMP signaling uitleggen.<br /> # Experiment Gurdon + vervolg experiment ivm iPS. Wat is het verband tussen de 2, leg beide experimenten uit, wat zijn toepassingen van iPS?</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Gentechnologie&diff=1807 2019-08-30T14:38:12Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Prof Lavigne. Biochemie volgt het samen met bio-ingenieurs. Oefenzittingen verplicht.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ==== 30 augustus 2019 ====<br /> #Bespreek de factoren van een PCR die de gevoeligheid kunnen verhogen. Ook de PCR afgeleidde technieken die de gevoeligheid voor nucleïnezuurdetectie kunnen verhogen. <br /> #Bespreek het PET expressie systeem in E. coli, geef ook de voor en nadelen van expressie in deze bacterie.<br /> #(Paashuyse) Je wil Anti-IgE produceren in CHO cellen m.b.v. een eukaryoot expressie systeem (geen gist of schimmel).<br /> #* welk expressie systeem gebruik je? beargumenteer.<br /> #* Teken de vector en verklaar alle factoren die je gebruikt.<br /> #* Wat moet je veranderen aan de CHO cellen om de SV40 ori te kunnen gebruiken? wat is het voordeel van deze ori op replicatie.<br /> #* Als je anti-IgE in planten cellen zou willen produceren, hoe ziet de vector er dan uit? leg alle factoren uit.<br /> #Leg uit:<br /> #* Definieer alles van BAC's<br /> #* Gateway klonering<br /> #* Capture techniek voor full length cDNA klonering<br /> #Oefening: 2 exonen met sequentie waren gegeven, ook een tag met sequentie was gegeven. De bedoeling was om tag-exon1-exon2 te kloneren in een TOPO-T/A vector. Bespreek alle stappen van de klonering en beargumenteer. <br /> <br /> ==== 23 Januari 2019 ====<br /> # Welke parameters hebben een negatieve invloed op PCR in verband met mutagenese (geef hierbij ook PCR-gebaseerde technieken van random/directe mutagenese zoals mismatch priming, error-prone PCR..) <br /> # Vergelijk cosmide en BAC klonering en hoe bepaal je de complexiteit van genoombank (carbon clark)<br /> # (Paashuyse): Klonering van een bepaald eiwit in rat cellen<br /> #* A. Leg expressiesysteem uit<br /> #* B. Teken vector en benoem/verklaar alle factoren die je gebruikt<br /> #* c. Wat moet je veranderen aan de rat cellen om SV40 ori te kunnen gebruiken? en bespreek het effect op de replicatie<br /> #* d. Doe hetzelfde maar dan in een planten cel, wat moet je veranderen? En teken de vector opnieuw met alle componenten <br /> # Geef uitleg over<br /> #* Taqman probe<br /> #* CTAB methode<br /> #* PET<br /> # Oefening waarbij je een ori moest insereren in DNA, dit moest in frame zitten, de RE sites waren gegeven, bespreek je techniek en teken PCR primers die je hiervoor zou gebruiken<br /> <br /> ==== 31 Augustus 2018 ====<br /> # Leg PET en pPIC expressiesystemen uit.Vergelijk ze en wat zijn de voor en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)<br /> #<br /> #* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)<br /> #* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Hoe bereken je het minimum aantal klonen met de formule van Carbon en Clarke en welke voorwaarden moeten voldoen zijn? (1 bladzijde)<br /> # Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip): <br /> #* A. Alkalische Lyse<br /> #* B. Wat is de definitie van Hybrid Selected Translation?<br /> #* C. Leg uit hoe men gisten transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.<br /> # Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)<br /> #* a. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.<br /> #* b. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.<br /> <br /> <br /> ==== 24 januari 2018 ====<br /> # Leg PET en pBAD expressiesystemen uit. Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)<br /> #<br /> #* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)<br /> #* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Geef ook uitleg bij Carbon &amp; Clarke. (1 bladzijde)<br /> # Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip): <br /> #* A. CAPture techniek bij cDNA aanmaak<br /> #* B. Taqman RT-PCR<br /> #* C. Nodige elementen voor een episomaal shuttle-plasmide voor ''E. Coli'' en ''S. cerevesiae''<br /> # Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)<br /> #* A. Geef strategie (maak primers, staarten, restrictie) om uw insert in de entry-vector te krijgen.<br /> #* B. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.<br /> #* C. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.<br /> <br /> ==== 1 september 2017 VM====<br /> # Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef PCR afgeleide technieken voor nucleïnezuren.<br /> # Bespreek in detail en vergelijk het mechanisme van P1 en cosmide vectoren.<br /> # Bespreek de werking en schets het principe van PET-expressie systeem. Wat zijn de voor- en nadelen?<br /> # Kort omschrijven <br /> #* Definieer en bespreek CAPture techniek werking<br /> #* Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?<br /> #* Bespreek het principe van Gateway klonering.<br /> # Vraag Paeshuyse (oefening in verwerkt): allerlei gegevens (cDNA, knipplaatsen e.d.) <br /> #* Welke eukaryoot expressies systeem (geen schimmel of gist) zou jij gebruiken (voor dit humaan recombinant eiwit)? Beargumenteer.<br /> #* Teken de vector enzo.. (?)<br /> <br /> ==== 25 januari 2017 VM====<br /> # Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid<br /> # Bespreek de BAC clonering voor de aanmaak van banken.<br /> # Wat zijn de voordelen van recombinante expressie in gist? Vector pPIC wordt veel gebruikt in de industrie. Bespreek pPIC.<br /> # Kort omschrijven<br /> #*DNA shuffeling<br /> #*CAPture techniek werking<br /> #*Principe van TOPO-gemedieerde klonering<br /> #oefening: Gegevens over enzymen, genoom van 1,6*^10-4, enzym knipt in 1 à 2 kb fragmenten, foto van gelleke. Hoeveel recombinante moet je hebben om met 99% zekerheid te zeggen dat je sequentie aanwezig is? Nog een vraag. (Rekenmachine nodig!)<br /> #Vraag Paeshuyse: Creëer een humaan, recombinant faag lambda ding (?) Welk expressiesysteem zou je gebruiken? Teken de vector die je gebruikt. Nog iets...<br /> <br /> ====januari 2016====<br /> # Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid<br /> # Voordelen van recombinante expressie in gist, leg die ene gistvector uit (pPIC heette die dacht ik?)<br /> #Strategie voor het opstellen van een cosmidebank<br /> # Termen: CTAB DNA extractie, Taqman, manieren van transformatie van gist<br /> # Oefening met inverse PCR: vinden van primers en uittekenen van de techniek<br /> Volckaert: <br /> # Relatie Tm/zoutconcentratie (monovalente kationen)<br /> # De factoren die de renaturatie beinvloeden + verschil in gebruik van PNA, LNA en DNA als proben<br /> # Geef structuur van guanidinium isothiocyanaat en guanidinium thiocyanaat, waarvoor wordt dit molecule gebruikt<br /> # structuur van merker gegeven, leg uit waar onderdelen voor bedoeld zijn en benoem ze<br /> <br /> ===20 januari 2015===<br /> #Bespreek en vergelijk de verschillende PCR technieken voor zowel gerichte als random mutagenese.<br /> #Bespreek in detail het mechanisme van P1 faag en een cosmide en vergelijk.<br /> #Bespreek en schematiseer het principe van de capillaire Sanger sequentie.<br /> #Kleine vraagjes:<br /> ##Belang van humanisering bij Philia pastoris<br /> ##Definieer de CAPture techniek<br /> ##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?<br /> #Oefening: Je moet 2 exons (sequenties gegeven) van een bepaald gen aan elkaar ligeren (zonder een linker tussen). En deze C-terminaal aan een ‘Strep’-tag hangen (sequentie gegeven) en deze inbrengen in een vector die T-overhang heeft door TOPO. (verschillende stappen bespreken + primers geven!) (praktisch dezelfde oefening als de voorbije 2 jaar in januari)<br /> Volckaert 1. Geef de structuurformule van guanidinium (iso)thiocyanaat en waar het voor wordt gebruikt. 2. Leg chemische synthese van oligonucleotiden met een 5’ fosfaat uit (of teken) + geef voordeel hiervan. 3. Leg uit hoe DNA probes niet-radioactief gelabeld (en eventueel onder welke voorwaarden) kunnen worden met behulp van een streptavidine-alkalisch fosfatase fusie-eiwit 4a. T4 polynucleotide kinase werd vroeger gebruikt om uiteinden te fosforyleren zodat fragmenten geligeerd kunnen worden. Nu kan dit direct gebeuren bij de oligonucleotide synthese. Hoe doen ze dit? Bespreek (en of teken) dit. 4b. Wat is het voordeel hiervan? 5. Bespreek de relatieve Tm van DNA en LNA met betrekking tot hun gebruik in hybridisatie en mismatchgevoeligheid.<br /> <br /> === 21 januari 2014 ===<br /> #Bespreek algemeen principe van PCR en de reactiecomponenten. Bespreek afgeleide technieken die gebruikt worden om de specificiteit van de PCR-reactie te verhogen. (onbeperkte antwoordruimte) <br /> #Bespreek achtergrond en werking van cosmide (1pag)<br /> ##Bespreek en vergelijk pET en pBAD (1pag)<br /> #Korte vraagjes: Lavigne<br /> ##Bespreek CAPture techniek <br /> ##Bespreek de elementen die een YAC-kloneringsvector bevat. Bespreek Gateway klonering <br /> <br /> === 22 januari 2013 ===<br /> #Bespreek vectorsystemen voor het insereren van grote (&amp;gt;30kb) DNA-sequenties. Bespreek de formule van Carbon &amp;amp; Clarke. <br /> #Technieken: Okayama &amp;amp; Berg SAGE <br /> #Kleine vragen (Lavigne): <br /> ##Wat is error-prone PCR en hoe kan je het gebruiken in &amp;quot;directed evolution&amp;quot;? <br /> ##Bespreek en schets het PET-expressie systeem. <br /> ##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie? <br /> #Situeer ???, ??? en ??? in de historiek van de gentechnologie. Het rspL gen was één van de eerste genen die gebruikt werd voor positieve selectie. Leg uit waarvoor dit gen codeert en hoe de selectie gebeurt. Oefening: Sequentie met exons en introns gegeven. Ontwerp een techniek om de eerste twee exons aan elkaar te ligeren en in te bouwen in de gegeven vector (TOPO T/A vector), met een N-terminale STREP-tag (sequentie voor de STREP-tag was gegeven). Beschrijf en verantwoord elke stap.<br /> <br /> ===6 augustus 2012===<br />  #Kunkel tot in detail bespreken Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli. Is dit hetzelfde bij de afgeleide vectors van ColE1? (pBR322,...) <br /> #twee vraagjes Carbon en Clarke RAcE schetsen en uitleggen (beide)<br /> #kleine vraagjes:<br /> ##Bespreek COS-cellen URA3 (waarom belangrijke merker) <br /> ##Inclusion bodies (wat, wanneer, gewenst?) <br /> ##Duid het juiste aan: de zoutconcentratie doet Tm stijgen/dalen/beïnvloedt Tm niet + uitleggen waarom. <br /> ##synthesevraag: biotine-merking bij nucleïnezuurhybridisatie, alles uitleggen (hoe probe maken, hybridisatie, detectie)<br /> <br /> ===23 Jan 2012 NM===<br /> #Kunkel Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli <br /> #Bespreek de mogelijke kloneringsvectoren in gist <br /> #Kleine vragen:<br /> ##Co-transformatie bij dieren <br /> ##Bespreek doel van de technieken: oligocapping en capture <br /> ##Hot-start PCR Chromosome jumping<br /> <br /> ===31 Jan 2011 NM===<br /> #Bespreek de filamentaire fagen(M13, F1,...), hun eigenschappen, hun replicatie in E.coli en hoe zijn ze aangepast voor het gebruik als vectoren. <br /> #Bespreek het pMAL expressiesysteem voor de synthese van eiwitten via recombinanten. <br /> #Bijvragen:<br /> ##Hoe kan je het nodige aantal klonen bepalen voor een goede genoombank <br /> ##Bespreek die PiAN vectoren Kleine vragen: <br /> ##Wat is de N-regel van Varshavsky COSvectoren <br /> ##Wat is Spi-selectie Waarvoor dient Capping bij de synthese van oligonucleotiden? <br /> #Mondeling: cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman Methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese Hoe wordt de smelttemperatuur bepaalt SAGE<br /> <br /> ===17 Jan 2011 VM===<br /> #Fosforamidietcyclus (cyclus, beschermgroepen, capping,...) <br /> #Welke problemen bij aanmaken van cosmide vectoren en welke oplossingen hiervoor?<br /> #Bijvragen: <br /> ##Okayama &amp;amp; Berg <br /> ##cDNA klonering in een vector Methode van Henikoff voor systematische deleties <br /> #Kleine vragen<br /> ##IPTG sacB <br /> ##Carbon &amp;amp; Clarke vgl. (aantal klonen in een cDNA bank) <br /> ##Guanidiniumzouten<br /> #Mondeling: pMal expressiesystemen Kunkel Eckstein Pyrosequencing SOE<br /> <br /> ===17 Jan 2011 VM===<br /> #Aanmaak genoombanken soorten gistvectoren <br /> #Bijvragen: <br /> ##fotolithografische DNA synthese alkalische fosfatasen + toepassingen <br /> #Kleine vragen<br /> ##'hotstart' PCR Guanidinium thiocyanide biotine merking bij hybridisatie <br /> ##URA3 Modeling: pyrosequencing <br /> ##Methode van Eckstein CAPture SOE pMAL<br /> <br /> ===23 aug 2010 VM===<br /> #pyrosequencing soorten faag lambda vectoren Bijvragen: methode van Gubler en Hoffman chromosoomwalking <br /> #Kleine vragen: <br /> ##nested PCR capping in fosforamidietcyclus hoe het aantal klonen in een cDNA bank benaderen <br /> ##PNA Modeling: methode van Okyama en Berg <br /> ##biotine merking bij hybridisatie alkalische hydrolyse van RNA Spi selectie pMAL<br /> <br /> ===26 jan 2010 VM===<br /> #Bespreek cosmide vectoren en hoe ze efficient te gebruiken zijn. <br /> #Leg de methode van Hoffman en Gubler voor cDNA synthese uit. <br /> #Bijvragen: <br /> ##Welke vectorsystemen voor gist zijn er beschikbaar? <br /> ##Leg de pSC101 ori uit. <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Oclusion body's: wat, wanneer, nut? <br /> ##CI gen: wat en waarvoor gebruikt in de gentechnologie? <br /> ##Universele splicing van ssDNA met fokI. <br /> ##Modeling: Fosforamidiet versus fosfonaat methode. <br /> ##EtBr en SYBR. <br /> ##Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese. <br /> ##Biotine merking. <br /> ##ZOO blot.<br /> <br /> ===25 jan 2010 VM===<br /> #Bespreek de aanmaak van genoombanken (vectoren, inbouwmechanismen, enz.) <br /> #Bespreek de methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese. <br /> #Bijvragen: <br /> ##Welke vectoren voor klonering in gist? <br /> ##Wat zijn positieve en negatieve selectie voor klonering en geef voorbeelden. <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Nested PCR uitleggen. <br /> ##T4 en T7 zijn beide bacteriofaag polymerasen. <br /> ##Bespreek hun activiteit(en) en toepassingen. <br /> ##Type1, type2, type3, type2s, iso en neochizomeren, waarin verschillen deze restrictie enzymen? <br /> ##Hoeveel kloonen nodig in een genoom bank? <br /> #Mondeling: Okyama en berg Spi selectie Alkalische hydrolyse van RNA pMAL <br /> #Hoe wordt biotine gebruikt bij hybridisatie<br /> <br /> ===25 jan 2010 VM===<br /> #Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering, detailleer elke reactiestap.<br /> #Bijvragen: <br /> ##Fosforamidiet synthesecyclus <br /> ##Welke soorten alkalische fosfatase gebruiken we in de gentechnologie? <br /> ##Schets hun gebruik. <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Lamba ZAP vector <br /> ##Aan- en afwezigheid van rop in colE1-afgeleide plasmide en de invloed ervan op aantal plasmide in E.coli. <br /> ##Aantal kloons in een genoombank. <br /> ##Nested PCR Mondeling: pMAL expressiesysteem <br /> ##Pyrosequencing RDA Ligatiemechanisme Eckstein<br /> <br /> ===14 jan 2010===<br /> #Geef de belangrijkste biologische functies van de filamentaire faag vectoren en hoe deze gebruikt werden om vectoren mee te maken.Welke soorten faag lambda vectoren zijn er en schets kort hun gebruik <br /> #Bijvragen: <br /> ##cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman. <br /> ##Detailleer elke reactiestap. <br /> ##Wat is chromosome walking en hoe werkt het. <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Wat is en waarvoor dient de capping bij de synthese van oligonucleotiden. <br /> ##Exonuclease III <br /> ##Hoe bepalen we het aantal kloons dat nodig is bij het opstellen van een genoombank. <br /> ##Inverse PCR Mondeling: pMal <br /> ##LCR Puntmutaties volgens Eckstein Mu-2 gistvector <br /> ##Pyrosequencing<br /> <br /> ===30 jan 2009===<br /> #fosforamidiet synthesecyclus geven problemen klonering met cosmidevectoren + oplossingen<br /> #Bijvragen: <br /> ##okyama en berg progressieve deleties met exonuclease III <br /> #Kleine vragen : <br /> ##IPTG sacB carbon en clarke vgl rol guanidinimun zouten + structuur <br /> #Mondeling: RDA pyrosequencing eckstein pMal lambda zap<br /> <br /> ===30 jan 2009===<br /> #Soorten Bacteriofaag lamda vectoren pET expressie vector systeem<br /> #Bijvragen<br /> ##Pyrosequencing Gubler-Hoffman cDNA synthese<br /> # Kleine vragen<br /> ##Tm voor oligonucleotiden sacB en toepassing in Gentechnolgie Statistische benadering genoom insertie PNA + structuur <br /> #Mondeling: inverse PCR Eckstein RDA SOE CAPture<br /> <br /> ===27 jan 2009 ===<br /> #replicatiemechanisme, regulatie en aantal kopieën ColE1-afgeleide vectoren Soorten bacteriofaag lambda vectoren en hun werking schetsen <br /> #Bijvragen: <br /> ##cDNA klonering (Gubler &amp;amp; Hoffman, Okayama &amp;amp; Berg) <br /> ##chromosoom walking <br /> #Kleine vragen:<br /> ##inverse PCR Tth DNA polymerase (wat speciaal en welke extra mogelijkheden daardoor) <br /> ##capping in fosforamidiet, wat en waarom <br /> ##hoe bereken je aantal kloons in genomische DNA bank exonuclease III <br /> #Mondeling: SOE SAGE pMAL plaatsgerichte mutagenese volgens Kunkel pyrosequencing<br /> <br /> ===24 jan 2008===<br /> #Bespreek het replicatiemechanisme van ColE1- en afgeleide vectoren, de regulatie en het aantal plasmiden <br /> #Bespreek methoden om gen-gericht een genomische bank te screenen aan de hand van 'informatie' <br /> #Geef twee technieken voor positieve selectie van plasmiden <br /> #Geef de methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese <br /> #Kleine vragen<br /> ##Hoe kan de het cI gen voor positieve selectie zorgen?<br /> ##Wat is een moleculair baken ('molecular beacon')?<br /> ##Bespreek de twee soorten SV40 vectoren en het verschil Touch-down PCR <br /> ##Hoe kunnen we er voor zorgen dat er geselecteerd wordt op de mogelijkheid om te transformeren (of zo)?<br /> #Technieken: Pyrosequencing pET SOE Okyama-Berg ligatiemechanisme<br /> <br /> ===23 jan 2008===<br /> #Fotolithografische DNA synhtese: bescrhijf en verklaar. <br /> #Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering: wat zijn de voor/ nadelen? <br /> #Middelgrote vragen: <br /> ##Welke problemen zijn er bij het kloneren in cosmidevectoren en hoe hebben ze dit opgelost? <br /> ##Pyrosequencing: beschrijf, wat zijn voor/nadelen tov dideoxymethode <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Wat is IPTG: structuur, gebruik <br /> ##Wat is de par locus <br /> ##Wat is PNA: structuur <br /> ##Wat is T4 polynucleotide kinase, waarom is dit belangrijk in gentechnologie, reactiemechanisme? <br /> #Technieken: SOE CAPture EtBr pMAL Eckstein<br /> <br /> ===14 jan 2008===<br /> #Welke mogelijkheden zijn er om plaatsgerichte mutagenese te doen? <br /> #Vertel alles over LITMUS vectoren (Waarom in godsnaam is dit een hoofdvraag?) <br /> #Bijvragen: <br /> ##Welke problemen kunnen er zijn bij het kloneren in cosmidevectoren?<br /> ##Hoe hebben ze die omzeild? Schets de Okyama-Berg procedure. <br /> ##Wat zijn de voor- en nadelen? <br /> #Bij-bijvragen: <br /> ##Hoe is sacB een positief selectiekenmerk? <br /> ##Waarvoor staat spi selectie? <br /> ##Geef de 2 soorten SV40 vectoren + leg het verschil uit waarom worden er andere Tm-uitdrukkingen gebruikt voor oligonucleotiden en hele strengen? <br /> #Mondeling: RDA Pyrosequencing inteïne verwerking inverse PCR cap selectie<br /> <br /> ===31 jan 2007===<br /> #alles van cosmiden bespreken. alles van SV40 bespreken. <br /> #Middelgrote vragen: <br /> ##pyrosequencing <br /> ##cassettemutagenese <br /> #Kleine vragen: <br /> ##verschil southern en western blotting <br /> ##ethidiumbromide, structuur, problemen, <br /> ##gebruik Spi selectie inverse PCR<br /> ##wat is shearing <br /> #Technieken: Formule om het aantal klones te berekenen voor gDNA bank Oligocapping SOE ligatiemechanisme Eckstein Okayama en Berg<br /> <br /> ===23 jan 2007===<br /> #bespreek belangrijkste methoden voor site directed mutagenese bespreek replicatiemechanisme in pBR322 <br /> #welke verschillende strategien worden gebruikt met op lambda gebaseerde vectoren technieken met Ti vectoren <br /> #Mondeling: nested PCR quenching hoe beinvloed de DNA concentratie het werken met cosmiden en verklaar <br /> <br /> ===19 jan 2007===<br /> #Geef en bespreek enkele voorbeelden van het gebruik van alkalische fosfatasen.<br /> #Bespreek de eigenchappen en kenmerken van de pUC vectoren. <br /> #Vectoren afgeleid van bacteriofaag lambda. <br /> #SV40 vectoren. <br /> #Kleine vragen:<br /> ##Genotype van een E.Coli stam opdat deze geïnfecteerd kan worden door M13. <br /> ##Bespreek incompatibiliteit van plasmiden. <br /> #Mondeling voor te stellen technieken: SOE Pyrosequencing Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese Nick translatie&lt;</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Spectroscopie_van_biomoleculen&diff=1805 2019-08-28T09:30:00Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Dit vak wordt gegeven door Johan Hofkens en Tatjana Vogt. Het deel van Vogt is mondeling, Hofkens is schriftelijk. Je moet op beide delen minstens 4/10 halen om te slagen. Bij het herexamen kan je een vrijstelling aanvragen voor het deel dat je geslaagd bent.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===28 augustus 2019===<br /> ====Deel Vogt====<br /> #NMR spectrum C8H19N, ook gezien in de oefeningen (CH3-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-CH2-CH3)<br /> #Wat is NOE, waarom wordt het gebruikt in NMR en waarbij kan het nog van toepassing zijn? Wat is de maximale vergroting voor een P kern wanneer een H kern in nabijheid wordt bestraald (formule invullen).<br /> #Geef de 2de en 3de fase voor de proteïne stuctuur bepaling. Welke technieken worden nog gebruikt?<br /> <br /> ====Deel hofkens====<br /> #Membraan fusie wordt onderzocht door een mengsel te maken van vesikels met een kleurstof (pyreen) en gewone membraan partikels. Het absorptiespectrum van pyreen is gegeven. Hoe zal het absorptiespectrum en emissiespectrum evolueren? Wat kan men hieruit leren over membraanfusie. Maak tekeningen, benoem en beschrijf ze. <br /> #concentraties gegeven fluoresceine en IgG en de polarisatie P. Ook de dissociatieconstante formule werd gegeven. bereken de dissociatieconstante wanneer het fluorescentie kwantumrendement en de extinctiecoëfficiënt niet veranderen. Wanneer het fluorescentie kwantumrendement halveert bij binding, wat gebeurd er dan met de dissociatieconstante? Wat gebeurd er met de fractie fluoresceine in het complex? Hoe kan men achterhalen als de extinctiecoëfficiënt en het fluorescentie kwantumrendement veranderen bij binding?<br /> #begrippen:<br /> ##Foto-elektrisch effect<br /> ##Emissiespectrum<br /> ##anti-Stokes Raman scattering<br /> ##Statische quenching<br /> <br /> ===27 augustus 2019===<br /> Geen vragen van Vogt door vrijstelling.<br /> ====Deel Hofkens====<br /> # theorievraag: 2 spectra van 2 fluoroforen gegeven, deze bespreken en alles dat in de les gezien was en op toepassing van deze spectra aanduiden<br /> # oefening anisotropie waarbij 20% verminderd werd<br /> # woordjes<br /> ##foto-elektrisch effect<br /> ##cotton-effect<br /> ##extinctiecoëfficiënt<br /> ##TRES<br /> <br /> === 25 Juni 2019 NM===<br /> ====Voght====<br /> #NMR C11H14O2<br /> #COSY gegeven van een peptide. Wat word er weergeven, wat is de fysische theorie erachter, wat is het verschil met NOESY en wat gebeurd er als er D2O wordt gebruikt als solvent<br /> #Wat is metabolomics, hoe kan NMR hier bij helpen, geef een voorbeeld.<br /> <br /> ====Hofkens==== <br /> #Geef het Frank-Cordon energie diagram, Duid een vibrationele transitie aan en in welke tijdseenheid verloopt fluorescentie en duid dit aan.<br /> #Emissie en absoptie gegeven van SPQ, en zijn quencher bij verschillende concentraties (collisional). Bereken de Stern-Volmer consrante, de levensduur en wat gebeurd er met de levensduur als de quencherconcentratie daalt.<br /> #Extinctie coefficient, foto-elektrisch effect, Cotton-effect, TRES<br /> ===25 juni 2019 VM===<br /> <br /> ====Vogt====<br /> #NMR-spectrum(C9H10O3)<br /> #Zeeman effect + frequentie berekenen met gegevens<br /> #Fase 1 spectrum -&gt;structuur proteinen<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> Zie examen 27 juni 2018<br /> <br /> ===11 juni 2019===<br /> <br /> ====Voght====<br /> #NMR-spectrum met 1H, 13C, DEPT, IR, COSY en HETCOR gegeven (4 punten)<br /> #Verschillende types relaxatie uitleggen, waarom dit belangrijk is in 13C NMR en waarom dit belangrijk is bij structuurbepaling van proteïnen (laatste heeft te maken met de grootte, tumbling en bandverbreding) (3 punten)<br /> #Uitleggen waarom in vivo 1H en 13C NMR niet handig zijn + uitleggen waarom het wel handig is met 31P + voorbeeld geven van 31P NMR (3 punten)<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> <br /> #Je hebt een kit om een enzyme op te sporen, als het enzyme aanwezig is hydroliseert het een proteïne en zal het fluoresceren. Leg de werking van de kit en het spectrum uit. (4 punten)<br /> #Simpele oefening over FRET, fluorescentieleeftijd en afstand tussen donor en acceptor. Je had maar 2 formules uit het formularium nodig en moest die de hele tijd anders invullen. (2 punten)<br /> #4 begrippen: (4 punten)<br /> #*limiting anisotropy<br /> #*inner filter effect<br /> #*auxochrome shift<br /> #*anti-Stokes Raman<br /> <br /> ===27 juni 2018===<br /> ====Vogt====<br /> # Oefening NMR (C8H19N) IOU = 0, symmetrisch molecule met NH groep in het midden<br /> # wat is relaxatie bij cnmr spectroscopie, welke soorten en wat is het verband van relaxatie en bandverbreding<br /> # 1D en 2D spectroscopie en proteïn ligand binding uitleggen (zowel fast als slow), uitleggen hoe je bepaald waar de binding van het ligand plaatsvind en hoe je de bindingsconstanten kan bepalen adv NMR<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # 3 molecules met vibraties gegeven. zeggen wat de voorwaarde zijn voor IR en raman spectroscopie. zeggen welke structuren IR actief zijn. zeggen welke structuren raman actief zijn en raman en Ir aanduiden op een jablonski diagram<br /> #* oefening over fret, gegeven zijn intensiteit gebonden en ongebonden en R0. bepalen van efficientie FRET, bepaal R, wat is de intensiteit van het molecule indien de afstand kleiner is.<br /> # Begrippen: excitatie spectrum, perrin vgl, balmer reeks, transitiedipoolmoment<br /> <br /> ===26 juni 2018===<br /> ====Vogt====<br /> # Oefening NMR (C11H14O2) - benzeenring met para 2 substituenten: eerste substituent COOH en tweede substituent C met 3 gebonden CH3<br /> # Figuur van slow en fast exchange limit uitleggen + waarom zijn spectra temperatuursafhankelijk + wat is de coalescentie temperatuur + bereken de exchange rate (k) voor de coalescentie temperatuur<br /> # Fase 1 van spectrum naar structuur uitleggen, welke NMR worden daar gebruikt en wat kom je te weten + wat is het grootste probleem bij grote proteinen om een NMR te bekomen<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Je hebt een hypothetisch lineair molecule AB2 gegeven, maar de Lewisstructuur hiervan is onbekend. M.a.w. je weet niet of het ABB is of BAB. <br /> #* Hoeveel vibratiemodes zijn er voor elke structuur?<br /> #* Op het IR-spectrum zijn pieken te zien die overeenkomen met drie normale vibratiesmodes. Welke structuur is het (BAB of ABB) en waarom? <br /> #* In IR ligt de piek voor H2O op 3560 cm-1, veronderstel dat de krachtconstante gelijk is. Bereken de frequentie van de rekking van D2O (zwaar water)? <br /> # Oefening 5 van oefenzitting 4 met volgende gegevens: IgG bindt aan de kleurstof Fluorescein. Concentraties zijn 0, 1*10^(-5), overmaat voor IgG; drie keer 4*10^(-7) voor Fluorescein en P = 0.03, 0.1450 en 0.3913. De formule voor Kd is gegeven. <br /> #* bereken Kd als de extinctiecoëfficiënt en het kwantumrendement niet verstoord worden door de binding.<br /> #* het kwantumrendement halveert bij de binding, wat gaat er gebeuren met de fractie Fluorescein in complex.<br /> #* hoe bepaalt men of de extinctiecoëfficiënt en/of het kwantumrendement verandert bij de binding?<br /> # Begrippen: inner filter effect, limiting anisotropy, auxochroom effect, TCSPC<br /> <br /> ===18 juni 2018===<br /> ====Vogt====<br /> # Oefening met NMR (C9H10O3 - benzeenring met aldehyde en 2 keer O-CH3 gesubsidieerd) + verklaar plaats van substitutie<br /> # 31P NMR vergelijken met 1H NMR en 13C NMR. <br /> #*Waarom gebruik je P-NMR hier. <br /> #*Hoe is de sensitiviteit van de 3 NMR's en welke is hier het beste + wat zijn de algemene factoren die sensitiviteit bepalen<br /> #* Welke NMR gebruik je om deze reactie te bestuderen en waarom? <br /> #* Hoe zou je de aanwezige concentratie water berekenen in deze vergelijking<br /> #* Hoe zou je de omzettingsratio van de producten naar reagentia berekenen<br /> #Leg uit waarom SAR by NMR een veelgebruikte techniek is voor de ontwikkelen van medicatie en leg werking uit<br /> #* Leg uit wat de vereiste zijn van SAR<br /> #* Leg uit wat voor-en nadelen zijn van SAR<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Teken een Frank-Condon energiediagram van een hypothetisch molecule in grondtoestand en geëxciteerde toestand. Benoem S0 en S1 op de figuur.<br /> #* Teken een vibratiobele overgang<br /> #* Teken een vibrationele excitatie in de elektrisch aangeslagen toestand<br /> #* Wat is de tijdschaal van fluorescerende en teken dit<br /> <br /> # Oefening over Stern-Volmer en quenchen instantende met volgende gegevens: unquenched lifetime is 26.3 ns. Concentratie Cl- (in mM) bedraagt 0-5-15-50 met bijhorende Intensiteiten 1-0.6-0.35 .15.Ook nog een grafiek gegeven van het molecule SPQ dat gequenched wordt met Cl- (grafiek toont intensiteit over golflengte bij verschillende (bovenstaande) concentraties<br /> #* Bereken de quenchingconstante en teken de Stern-Volmer plot<br /> #* In bloed bedraagt de concentratie van het aanwezige Cl- 103mM. Wat is de fluorescente leeftijd en fluorescerente intensiteit van het SPQ in het bloed.<br /> #* Wat gebeurt er met de leeftijd als de concentratie Cl- daalt?<br /> # Woordjes - max 1/2 blad uitleg per woord + verduidelijk eventueel met een figuur<br /> #* TRES<br /> #* Foto-elektrisch effect<br /> #* Cotton- effect<br /> #* Extinctie coëfficiënt<br /> <br /> ===6 september 2017===<br /> ====Vogt====<br /> # oefening met NMR (C9H10O3)<br /> # spin spin coupeling, uitleggen aan de hand van voorbeeldmolecule en beschrijven hoe het signaal van ieder proton gesplits zal worden.<br /> # SAR methode bij het ontwikkelen van medicijnen. interactie ligand-proteine enzo uitleggen.<br /> ====Hofkens====<br /> # (4pt) Spectra gegeven van Chryseen. Duid aan welk spectrum absorptie, fluorescentie en fosforescentie toont. De vervaltijd in regio 360-400nm is 10x kleiner dan die in de regio 500-600nm, leg uit waarom.Beschrijf alle waarnemingen van de spectra aan de hand van de geziene leerstof.<br /> # (2pt) L-opstelling voor meting anisotropie, in propyleenglycol bij 233K ofzoiets. Gegeven Ivh, Ivv, Ihh en Ihv. Bereken de werkelijke anisotropie bij verticale excitatie. Hoe groot is de fout die je maakt als je niet corrigeert? Wat is de hoek tussen de excitatie en het emissie dipoolmoment? Stel dat we bij 293K werken en in ethanol, kunnen we de hoek dan nog steeds bepalen? wat gebeurt er met de anisotropie?<br /> # (4pt) Woordjes<br /> #* Foto-elektrisch effect<br /> #* FRET<br /> #* Single Photon Timing<br /> #* Cottoneffect<br /> <br /> === 28 juni 2017===<br /> ====Vogt====<br /> # oefening spectrum NMR<br /> # COSY spectrum gegeven van molecule. Wijs elke functionele groep toe in het spectrum en leg uit waarom. Vertel de werking van COSY.<br /> # Bespreek de drie fasen voor de structuurbepaling van proteïnen via NMR<br /> ==== Hofkens ====<br /> # Gegeven is een simpele tekening van een hairpinstuctuur met donor en acceptor, deze is in evenwicht met zijn twee conformaties. De leeftijd van de donor in vrije oplossing is 10ns en acceptor is 2ns. Als de donor aan de hairpin hangt zien we een bi-exponentieel verval van 5ns en 1ns mer respectievelijk 95% en 5%. verklaar waarnemingen, bespreek de leeftijd van de acceptor in beide conformaties.<br /> # Gegeven is die tekening vanuit de cursus over FMN en YMN en tabel met hoek teta. In tabel ook nog anisotropiewaarde van complex en zonder complex, alfa en de concentraie van FMN is niet gegeven. Bereken dissociatieconstante en verklaar de grafiek van die anisotropie. <br /> # Woordjes:<br /> #* Transitiedipoolmoment<br /> #* Balmerreeks<br /> #* Excitatiespectrum<br /> #* Perrin vergelijking<br /> <br /> ===27 juni 2017===<br /> ====Vogt====<br /> # H en C spectrum<br /> # NOE<br /> # fase 1 uitleggen van die fase 3 shit + probleem grote moleculen <br /> ====Hofkens====<br /> # grafiek zoals in cursus van Eosin en Erytrosin (maar andere kleurstoffen). Alles bespreken wat je ziet. Tau en Q gegeven, bereken radioactieve en niet radiatieve snelheidsconstante. Als R= een of andere groep, waarom is dan de Tau en Q groter? En zou dit koppel een goed FRET paar zijn?<br /> # anisotropie is 0,3 maar door scattering laat de filter 20% door, wat is de gemeten anisotropie<br /> # woordjes: <br /> #* foto-elektrisch effect<br /> #* extinctie coefficient<br /> #* TRES<br /> #* cotton effect<br /> <br /> ===19 juni 2017===<br /> ====Vogt:====<br /> # zeeman effect<br /> # H/C spectrum<br /> # in vivo nmr<br /> ====Hofkens====<br /> # da van die even en oneven aantal dubbele bindingen en het effect daarvan op de golflengte, met cyanine en azocyanine.<br /> # oef 5 van oefenzitting 4 denk ik (zoals vorig examen)<br /> # woordjes: <br /> #* Ro<br /> #* Dynamic quenching<br /> #* fluorescence quantum yield<br /> #* resonance <br /> #* Raman scattering<br /> <br /> ===13 juni 2017===<br /> ====Vogt====<br /> # H- en IR spectrum gegeven van C11H14O2<br /> # vraag2 <br /> #* 2 soorten relaxatie, leg uit<br /> #* hoe beinvloeden deze het C-NMR<br /> #* weet ik ook niet meer<br /> # 1D en 2D NMR spectra: <br /> #* verschillen, voor - en nadelen geven. <br /> #* Kan je er ligand proteine bindingen mee onderzoeken? <br /> #* hoe ziet men dit? <br /> #* kan men zien aan met welk aminozuur de binding gebeurt? (Alles zowel voor slow- als fast exchange)<br /> ====Hofkens====<br /> # membraanfusie experiment: gegeven structuur lipide met pyreen aan, fuseert met zelfde lipide zonder pyreen, absorptie spectra pyreen gegeven (voor de fusie). Hoe verandert het absorptie- en emissiespectra doorheen het experiment? Leg uit adhv zelf gemaakte tekeningen (grafieken).<br /> # Oefening: zoals oefening 5 van oefenzitting 4<br /> # 4 termen: <br /> #* anti stokes <br /> #* ramanscattering<br /> #* emissiespectra<br /> #* statische quencher<br /> #* laatste weet ik niet meer<br /> <br /> ===7 juni 2016===<br /> ====Vogt====<br /> # H- en C-spectrum, structuur afleiden.<br /> # Je krijgt spintoestanden<br /> #* Geef het aantal mogelijke spin oriëntaties en geef het weer op een grafische manier. <br /> #* Hoe wordt dit effect genoemd? Is de electronen verdeling gelijk tussen 2 toestanden? <br /> #* Welke factoren beïnvloeden deze indeling? <br /> #* Wat kun je hieraan doen om NMR spectroscopie efficiënter te maken?<br /> # Leg in vivo H- en C-NMR spectroscopie uit, integreer een voorbeeld in je uitleg. <br /> #* Waarom wordt dit niet veel gebruikt? <br /> #* P-NMR is wel nuttig in vivo, waarom? <br /> #* Geef een voorbeeld waarin deze techniek gebruikt kan worden.<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Tekening met DNA-hairpin in open- en gesloten vorm. Aan uiteinde hangt een donor en acceptor. Donor vrij heeft leeftijd van 10 ns, acceptor vrij een leeftijd van 2 ns. Wanneer de leeftijd van de donor wordt gemeten (in de gesloten vorm) bekomen ze een bi-exponentiele verdeling voor de leeftijd: 5 ns 95% en 1 ns 5%. <br /> #* Verklaar de resultaten. <br /> #* Geef de leeftijd van de gesloten- en de open DNA-hairpin vorm. <br /> #* Wat zal de leeftijd van de acceptor zijn in de open vorm, en wat in de gesloten DNA-hairpin vorm?<br /> # Tekening van anisotropie gegeven (uit cursus met 2x10-2M en 2x10^-5M). Verklaar de tekening aan de hand van de gezienen leerstof.<br /> # Bespreek kort maar juist (1/2bladzijde max) <br /> #* foto-effect <br /> #* Balmer-reeks <br /> #* ... <br /> #* transitiedipoolmoment.<br /> <br /> ===23 juni 2015===<br /> ====Vogt====<br /> # H- en C-spectrum<br /> # Slow en fast exchange uitleggen (waarom een spectrum bij hoge T slechts 1 signaal meer geeft i.p.v. 2) en de exchange constant berekenen.<br /> # Hoe kan IR-Spectroscopy gebruikt worden om:<br /> #* kwantitatief de concentratie van een staal te bepalen.<br /> #* kwalitatief proteine structuur te bepalen.<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Gegeven een absorptiespectrum van verschillende kleurstoffen (steeds met een groter geconjungeerd systeem) verklaar alle waarnemingen, teken het fluorescentie spectrum van 2 van de stoffen, de quantumyield van kleurstof 1 is 0.9 hoe zal deze evolueren naarmate het molecule groter wordt?<br /> # Atoommodel van Bohr uitleggen en op het belang voor de spectroscopie wijzen.<br /> # Begrippen: <br /> #* Cotton-effect<br /> #* Inner filter effect<br /> #* R0 <br /> #* Excimeer<br /> <br /> ===15 juni 2015===<br /> ====Vogt====<br /> # H-spectrum+ IR-spectrum<br /> # uitleg verdeling tussen de 2 spintoestanden. hoe onstaat deze verdeling en hoe kan je ze beïnvloeden.<br /> # Leg uit de voor- en nadelen van 1D en 2D spectra en kan men aan de hand hiervan de ligand-proteïne interactie volgen. b. Kan je de snelheidsconstante K berekenen aan de hand van deze spectra? (zowel slow als fast exchange) c. kan je zien waar het ligand bind aan het proteïne? (zowel slow als fastexchange)<br /> ====Hofkens====<br /> # twee prentjes van twee membranen. Eerst een eximeer daarna niet meer. Het gaat over membraanfusie. Geef de absorptie-en emissiespectra van beide toestanden. Wat leert men hieruit over membraanfusie?(af te leiden uit prentjes)<br /> # hoe kan men de transitieconstante berekenen?<br /> # woordjes: <br /> #* limiterende anisotropie<br /> #* cotton effect<br /> #* inner filter effect<br /> #* statische quenching<br /> <br /> ===17 juni 2013===<br /> ====Vogt====<br /> # simpele oefening over een C9H10O3 spectrum, bij mondeling vroeg ze waarom dat een doublet of triplet of multiplet was.<br /> # verschillende COSY spectra matchen met verschillende aminozuren<br /> # welke NMR-technieken kunnen worden gebruikt om ligand-proteïne interacties te onderzoeken. Bijvraag ging over SAR, welke stappen enzo.. ook uitleggen dat die interactie snel of traag kan gebeuren.<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # oefening; gegeven tau-waarden en p waarden. Hieruit P0, de rotationele correlatietijd en nog iets berekenen.<br /> # het atoommodel van bohr uit de doeken doen, postulaten, formules,.. en de link leggen met de spectroscopy van vandaag.<br /> # begrippen uitleggen: <br /> #* R0<br /> #* cotton effect<br /> #* inner filter effect<br /> #* excimeer<br /> <br /> ===10 juni 2013===<br /> ====Tatjana====<br /> # Oefening waarbij H en C spectrum gegeven werden<br /> # IR spectroscopie:<br /> #* is de amide band I de enige bruikbare band voor het bepalen van de secundaire structuur van eiwitten of zijn er nog?<br /> #* Verklaring geven voor de verschillende waarde van de amide piek bij alfa helix of b sheet.<br /> #* Vaak ziet men 1 grote band en niet de verschillende pieken binnen de amide I band, hoe lost men dit op?<br /> #* Is IR zo ook een kwantitatieve methode voor de bepaling van de secundaire structuur?<br /> # Bespreek HSQC in verband met studies van proteïnen.<br /> ====Hofkens====<br /> # oefening met 2 spectra gegeven van anisotropie-verval in de tijd van hetzelfde FP molecule. Het ene spectrum was bij lage concentratie FP, het andere bij hoge concentratie FP. Bij beiden werd het verval gemeten bij verschillende viscositeit en weergegeven in het spectrum (dus 5 vervalcurves in elk spectrum).<br /> #* Verklaar de resultaten.<br /> #* Wat kom je hierdoor te weten over het FP?<br /> #* Bespreek in detail de meettechniek hoe men aan deze spectra komt. (4punten)<br /> # Bespreek het foto-elektrisch effect van Einstein. Waarom is dit belangrijk voor spectroscopie? (2punten)<br /> # Leg de volgende begrippen uit (max 1 blz per begrip) (4 punten):<br /> #* circulair dichroïsme<br /> #* magic angle<br /> #* fosforescentie <br /> #* J-aggregaat<br /> <br /> ===30 jun 2011===<br /> ====Tatjana====<br /> # H-NMR en IR spectrum van C14H14 gegeven. (Het was 1,2-difenylethaan als structuur)<br /> # Wat is NOE? Bereken de maximum signaalversterking bij 1H en 15N wanneer 15N de onderzochte kern is (gamma's gegeven).<br /> # Bespreek kort de 3 fasen waarin men m.b.v. NMR de structuur van proteinen kan bepalen.<br /> ====Hofkens====<br /> # Bij het meten van lifetimes zijn er vaak problemen met depolarisatie. Hoe los je dit anisotropieprobleem op. Verwerk de formule van anisotropie in je antwoord (6 punten).<br /> # Gegeven zijn gegevens van een quenching experiment. Je moest een Stern-volmer ervan maken. Verschillende quenchingconstanten berekenen. (Super moeilijke oefening !)<br /> # Oefening over Raman (Stokes en anti-Stokes): (2 punten)<br /> #* exciterende laserfrequenties en een paar spectrumwaarden gegeven<br /> #* en dan een paar vraagjes waar je frequenties of golflengtes moest berekenen.<br /> <br /> ===21 jun 2011===<br /> ====Tatjana====<br /> # H-NMR en IR spectrum van C11H14O2 gegeven.<br /> # Vijf kernen (12C, 14N, 17O, 31P en 51V) met hun I-waarde (totale spin van de kern) gegeven.<br /> #* Geef het aantal mogelijke spinoriëntaties van elke kern en stel grafisch voor.<br /> #* Wat is de frequentie van een signaal van een 31P-kern bij een magneetveld van 1 Tesla? (gamma, constante van Planck, pi en abundantie gegeven)<br /> #* Zelfde vraag en zelfde gegevens, maar dan voor 51V.<br /> #* Bij welk van beide kernen (31P en 51V) verwacht je onder dezelfde condities (concentratie, magneetveldsterkte) de hoogste S/N ratio?<br /> # Welke NMR methoden kan je gebruiken om de binding van een klein ligand aan een proteïne te bestuderen? Hou rekening met het verschil tussen trage en snelle uitwisseling ten opzichte van de NMR-tijdschaal.<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Gegeven was een structuur (twee naftaleenmoleculen gekoppeld via een linker) en het bijhorende emissiespectrum met 3 pieken (opgenomen bij -60°C). De eerste piek had een fluorescentieverval van 2 ns, de middelste een bi-exponentieel verval en de laatste een verval van 12000 ns. Een concentratieverhoging heeft geen invloed op de vorm van het spectrum, maar wel op de intensiteit. Verklaar alle waarnemingen mbv Jablonski-energiediagram. Schat ook de golflengte bij max. absorptie mbv van de Woodward-Fieser-Scott regels en teken het absorptiespectrum. (6 punten)<br /> # Gegeven zijn twee structuren met als enige verschil de plaats van één dubbele binding (waardoor die binding bij de ene structuur geconjugeerd is en bij de andere niet). Je mag geen gebruik maken van de Woodward-Fieser-Scott regels om lambda max te bepalen, maar je hebt wel een UV-VIS absorptiemeter ter beschikking. Hoe kan je die gebruiken om beide stoffen te onderscheiden? (2 punten)<br /> # Oefening over Raman (Stokes en anti-Stokes): exciterende laserfrequenties en een paar spectrumwaarden gegeven, en dan een paar vraagjes waar je frequenties of golflengtes moest berekenen. (2 punten)<br /> <br /> ===17 jun 2011===<br /> ====Tatjana====<br /> # H- en C- NMRspectrum geven, C9H10O3. Mondelinge bijvragen:<br /> #* Waarom is die piek bv een triplet?<br /> #* Wat is er belangrijk voor het solvent voor NMR?<br /> # Bij een NMR meting met een toestel van 60MHz is het ligt de piek van CH3NO2 op 259.8 Hz van de referentiestof.<br /> #* bereken de chemische shift bij 60MHz<br /> #* op welke afstand zou de piek liggen bij 500MHz<br /> #* bereken de chemische shift bij 500MHz<br /> #* bijvraag: Waarom is de chemische shift belangrijk<br /> # Hoe kan je IR-spectrometrie gebruiken om info over de secundaire structuur van een proteïne te bekomen? Voor welk type van proteïnen is deze methode vooral bruikbaar?<br /> ====Hofkens:====<br /> # Gegeven was een schema van een natriumlamp. De lamp werkt als volgt: als er spanning gezet wordt over de lamp, wordt het ontspanningsgas(neon) geioniseerd. Bij botsing van dit geioniseerd gas met het natrium-kwik amalgaam komt natrium vrij. Zo wordt een lage natrium druk gecreeerd. Typisch voor zo'n lamp is de oranje kleur(zoals op de autosnelweg). Die kleur wordt veroorzaakt door het natrium. Verklaar dit aan de hand van concepten uit de cursus. Als de lamp net aangestoken is, is kleur niet oranje, maar roodachtig, verklaar. Een andere versie van zo'n lamp werkt met een hoge natrium druk, dit soort lampen geeft een wit-gele kleur. Verklaar dit aan de hand van concepten uit de cursus.(6 punten)<br /> # Geef een bondige uitleg voor volgend begrippen(5 zinnen) met indien nodig een wiskundige uitdrukking(2 punten)<br /> #* Extinctiecoefficient<br /> #* Woodward-Fieser-Scott-regels<br /> #* Lambert-Beer<br /> #* Fluorescentie quenching<br /> # oef(2 punten) Gegeven is dat HBr een band geeft bij 2558 cm^-1.<br /> #* bereken de golflengte<br /> #* je krijgt de uitdrukking van een veer(die met Mred) en gevraagt: bereken welke band DBr zal geven.(gegeven zijn m van H, D en Br en getal van Avogadro)<br /> <br /> ===15 jun 2010===<br /> ====Tatjana====<br /> # H- en IR- spectrum geven, C4H9Br. Mondelinge bijvragen:<br /> #* Wat moet normaal de opsplitsing zijn van dit multiplet?<br /> #* Is het IR-spectrum hier nuttig?<br /> # Wat is NOE? Bereken de maximum signaalversterking bij 1H en 31P wanneer 31P de onderzochte kern is (gamma's gegeven).<br /> # Welke NMR methode kan je gebruiken om een KWANTITATIEVE analyse te maken van protein-ligand binding? Hou rekening met snelle en trage uitwisseling.<br /> <br /> ===18 jun 2009===<br /> ====Tatjana====<br /> # H en C - NMR gegeven. Structuur? C14H14.<br /> # Gegeven: 12C (I=0), 14N (I=1), 17O (I=5/2), 31P (I=1/2).<br /> #* Hoeveel spinoriëntaties zijn er in een magnetisch veld? Stel grafisch voor.<br /> #* 31P in magneetveld van 1 Tesla. Bij welke frequentie moet je 31P meten? h, gamma en pi gegeven.<br /> # Hoe kan je IR-spectrometrie gebruiken om info over de secundaire structuur van een proteïne te bekomen? Voor welk type van proteïnen is deze methode vooral bruikbaar?<br /> <br /> ===16 jun 2008===<br /> ====Tatjana====<br /> # Bespreek de drie fasen voor de structuurbepaling van proteïnen via NMR<br /> # 3 COSY's gegeven, 6 AZ. Ken de 3 COSY's toe en leg uit waarom<br /> # H-NMR en IR-spectrum gegeven. Geef structuur (butylethanoaat (en geen methylpentanoaat!))<br /> <br /> ===13 jun 2008===<br /> ====Tatjana====<br /> # H en C spectrum van een molecule<br /> # Je krijgt lysine en zijn H en C chemische shift waarden, teken DEPT, H-H COSY en C-H HSQC<br /> # hoe kan je de binding van een ligand aan een proteïne bestuderen? Hou rekening met snelle en trage uitwisseling<br /> <br /> ===11 jun 2008===<br /> ====Tatjana====<br /> # Je hebt een oplossing vitamine C (structuur gegeven). Bespreek hoe je met IR-spectroscopie de concentratie van de oplossing kunt bepalen.<br /> # Geef het aantal verschillende spintoestanden van 12C (I=0),31P (I=1/2), 14N (I=1), 17O (I=5/2) en stel grafisch voor.<br /> # Bereken frequentie (B0, gamma, h en pi gegeven) voor 31P<br /> <br /> ===27 jun 2007===<br /> ====Tatjana====<br /> # Oefening, aromatische ring, twee O-CH3 en een keton erop<br /> # Je kreeg een molecule en ge moest daar de zo'n dynamische interactie bespreken, van draaiing rond een binding (met slow exchange, coalescentie en fast exchange) en dan moest je de uitwisselingssnelheid bij coalescentie berekenen.<br /> # Toepassing van IR op biomoleculen<br /> <br /> ===23 jun 2007===<br /> ====Tatjana====<br /> # Basic oefeningske<br /> # De NH2 groep stretcht permanent bij een frequentie van 1013 Hz. hierdoor heeft deze N-H verschillende bindingslengtes. Ga na of de individuele bindingslengtes kunnen gedetecteerd worden op een NMR-instrument van a) 250 MHZ en b) 900 MHz.<br /> # Wat is HSQC en hoe kan deze techniek bijdragen bij het onderzoek van eiwitten<br /> <br /> ===21 jun 2007===<br /> ====Tatjana====<br /> # Je kreeg een tekening van een benzeenring met daar een groep boven en ge moest de upfield en downfield effecten bespreken van die groep en die van de benzeenring.<br /> # Hoe is NMR belangrijk voor SAR en ook SAR bespreken<br /> # Een oefening met een symmetrische aromatische ring en een carboonzuur en een ester daar ergens in.<br /> <br /> ===18 jun 2007===<br /> ====Tatjana====<br /> # Oefening: Nen C4H9Br, gewoon, H spectrum en (nutteloos) IR gegeven, en ge moet de structuur geven (twas gewoon lineair, dus best wel 'makkelijk&quot;)<br /> # Theorie:<br /> #* H @ 60MHz, zelfde toestel P @ ? MHz??? De 'gamma' van H en P was gegeven<br /> # In vivo NMR, bespreek, leg uit,...</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Spectroscopie_van_biomoleculen&diff=1804 2019-08-28T09:19:54Z

<p>Cynthia.R: /* 27 augustus 2019 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Dit vak wordt gegeven door Johan Hofkens en Tatjana Vogt. Het deel van Vogt is mondeling, Hofkens is schriftelijk. Je moet op beide delen minstens 4/10 halen om te slagen. Bij het herexamen kan je een vrijstelling aanvragen voor het deel dat je geslaagd bent.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===27 augustus 2019===<br /> Geen vragen van Vogt door vrijstelling.<br /> ====Deel Hofkens====<br /> # theorievraag: 2 spectra van 2 fluoroforen gegeven, deze bespreken en alles dat in de les gezien was en op toepassing van deze spectra aanduiden<br /> # oefening anisotropie waarbij 20% verminderd werd<br /> # woordjes<br /> ##foto-elektrisch effect<br /> ##cotton-effect<br /> ##extinctiecoëfficiënt<br /> ##TRES<br /> <br /> === 25 Juni 2019 NM===<br /> ====Voght====<br /> #NMR C11H14O2<br /> #COSY gegeven van een peptide. Wat word er weergeven, wat is de fysische theorie erachter, wat is het verschil met NOESY en wat gebeurd er als er D2O wordt gebruikt als solvent<br /> #Wat is metabolomics, hoe kan NMR hier bij helpen, geef een voorbeeld.<br /> <br /> ====Hofkens==== <br /> #Geef het Frank-Cordon energie diagram, Duid een vibrationele transitie aan en in welke tijdseenheid verloopt fluorescentie en duid dit aan.<br /> #Emissie en absoptie gegeven van SPQ, en zijn quencher bij verschillende concentraties (collisional). Bereken de Stern-Volmer consrante, de levensduur en wat gebeurd er met de levensduur als de quencherconcentratie daalt.<br /> #Extinctie coefficient, foto-elektrisch effect, Cotton-effect, TRES<br /> ===25 juni 2019 VM===<br /> <br /> ====Vogt====<br /> #NMR-spectrum(C9H10O3)<br /> #Zeeman effect + frequentie berekenen met gegevens<br /> #Fase 1 spectrum -&gt;structuur proteinen<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> Zie examen 27 juni 2018<br /> <br /> ===11 juni 2019===<br /> <br /> ====Voght====<br /> #NMR-spectrum met 1H, 13C, DEPT, IR, COSY en HETCOR gegeven (4 punten)<br /> #Verschillende types relaxatie uitleggen, waarom dit belangrijk is in 13C NMR en waarom dit belangrijk is bij structuurbepaling van proteïnen (laatste heeft te maken met de grootte, tumbling en bandverbreding) (3 punten)<br /> #Uitleggen waarom in vivo 1H en 13C NMR niet handig zijn + uitleggen waarom het wel handig is met 31P + voorbeeld geven van 31P NMR (3 punten)<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> <br /> #Je hebt een kit om een enzyme op te sporen, als het enzyme aanwezig is hydroliseert het een proteïne en zal het fluoresceren. Leg de werking van de kit en het spectrum uit. (4 punten)<br /> #Simpele oefening over FRET, fluorescentieleeftijd en afstand tussen donor en acceptor. Je had maar 2 formules uit het formularium nodig en moest die de hele tijd anders invullen. (2 punten)<br /> #4 begrippen: (4 punten)<br /> #*limiting anisotropy<br /> #*inner filter effect<br /> #*auxochrome shift<br /> #*anti-Stokes Raman<br /> <br /> ===27 juni 2018===<br /> ====Vogt====<br /> # Oefening NMR (C8H19N) IOU = 0, symmetrisch molecule met NH groep in het midden<br /> # wat is relaxatie bij cnmr spectroscopie, welke soorten en wat is het verband van relaxatie en bandverbreding<br /> # 1D en 2D spectroscopie en proteïn ligand binding uitleggen (zowel fast als slow), uitleggen hoe je bepaald waar de binding van het ligand plaatsvind en hoe je de bindingsconstanten kan bepalen adv NMR<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # 3 molecules met vibraties gegeven. zeggen wat de voorwaarde zijn voor IR en raman spectroscopie. zeggen welke structuren IR actief zijn. zeggen welke structuren raman actief zijn en raman en Ir aanduiden op een jablonski diagram<br /> #* oefening over fret, gegeven zijn intensiteit gebonden en ongebonden en R0. bepalen van efficientie FRET, bepaal R, wat is de intensiteit van het molecule indien de afstand kleiner is.<br /> # Begrippen: excitatie spectrum, perrin vgl, balmer reeks, transitiedipoolmoment<br /> <br /> ===26 juni 2018===<br /> ====Vogt====<br /> # Oefening NMR (C11H14O2) - benzeenring met para 2 substituenten: eerste substituent COOH en tweede substituent C met 3 gebonden CH3<br /> # Figuur van slow en fast exchange limit uitleggen + waarom zijn spectra temperatuursafhankelijk + wat is de coalescentie temperatuur + bereken de exchange rate (k) voor de coalescentie temperatuur<br /> # Fase 1 van spectrum naar structuur uitleggen, welke NMR worden daar gebruikt en wat kom je te weten + wat is het grootste probleem bij grote proteinen om een NMR te bekomen<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Je hebt een hypothetisch lineair molecule AB2 gegeven, maar de Lewisstructuur hiervan is onbekend. M.a.w. je weet niet of het ABB is of BAB. <br /> #* Hoeveel vibratiemodes zijn er voor elke structuur?<br /> #* Op het IR-spectrum zijn pieken te zien die overeenkomen met drie normale vibratiesmodes. Welke structuur is het (BAB of ABB) en waarom? <br /> #* In IR ligt de piek voor H2O op 3560 cm-1, veronderstel dat de krachtconstante gelijk is. Bereken de frequentie van de rekking van D2O (zwaar water)? <br /> # Oefening 5 van oefenzitting 4 met volgende gegevens: IgG bindt aan de kleurstof Fluorescein. Concentraties zijn 0, 1*10^(-5), overmaat voor IgG; drie keer 4*10^(-7) voor Fluorescein en P = 0.03, 0.1450 en 0.3913. De formule voor Kd is gegeven. <br /> #* bereken Kd als de extinctiecoëfficiënt en het kwantumrendement niet verstoord worden door de binding.<br /> #* het kwantumrendement halveert bij de binding, wat gaat er gebeuren met de fractie Fluorescein in complex.<br /> #* hoe bepaalt men of de extinctiecoëfficiënt en/of het kwantumrendement verandert bij de binding?<br /> # Begrippen: inner filter effect, limiting anisotropy, auxochroom effect, TCSPC<br /> <br /> ===18 juni 2018===<br /> ====Vogt====<br /> # Oefening met NMR (C9H10O3 - benzeenring met aldehyde en 2 keer O-CH3 gesubsidieerd) + verklaar plaats van substitutie<br /> # 31P NMR vergelijken met 1H NMR en 13C NMR. <br /> #*Waarom gebruik je P-NMR hier. <br /> #*Hoe is de sensitiviteit van de 3 NMR's en welke is hier het beste + wat zijn de algemene factoren die sensitiviteit bepalen<br /> #* Welke NMR gebruik je om deze reactie te bestuderen en waarom? <br /> #* Hoe zou je de aanwezige concentratie water berekenen in deze vergelijking<br /> #* Hoe zou je de omzettingsratio van de producten naar reagentia berekenen<br /> #Leg uit waarom SAR by NMR een veelgebruikte techniek is voor de ontwikkelen van medicatie en leg werking uit<br /> #* Leg uit wat de vereiste zijn van SAR<br /> #* Leg uit wat voor-en nadelen zijn van SAR<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Teken een Frank-Condon energiediagram van een hypothetisch molecule in grondtoestand en geëxciteerde toestand. Benoem S0 en S1 op de figuur.<br /> #* Teken een vibratiobele overgang<br /> #* Teken een vibrationele excitatie in de elektrisch aangeslagen toestand<br /> #* Wat is de tijdschaal van fluorescerende en teken dit<br /> <br /> # Oefening over Stern-Volmer en quenchen instantende met volgende gegevens: unquenched lifetime is 26.3 ns. Concentratie Cl- (in mM) bedraagt 0-5-15-50 met bijhorende Intensiteiten 1-0.6-0.35 .15.Ook nog een grafiek gegeven van het molecule SPQ dat gequenched wordt met Cl- (grafiek toont intensiteit over golflengte bij verschillende (bovenstaande) concentraties<br /> #* Bereken de quenchingconstante en teken de Stern-Volmer plot<br /> #* In bloed bedraagt de concentratie van het aanwezige Cl- 103mM. Wat is de fluorescente leeftijd en fluorescerente intensiteit van het SPQ in het bloed.<br /> #* Wat gebeurt er met de leeftijd als de concentratie Cl- daalt?<br /> # Woordjes - max 1/2 blad uitleg per woord + verduidelijk eventueel met een figuur<br /> #* TRES<br /> #* Foto-elektrisch effect<br /> #* Cotton- effect<br /> #* Extinctie coëfficiënt<br /> <br /> ===6 september 2017===<br /> ====Vogt====<br /> # oefening met NMR (C9H10O3)<br /> # spin spin coupeling, uitleggen aan de hand van voorbeeldmolecule en beschrijven hoe het signaal van ieder proton gesplits zal worden.<br /> # SAR methode bij het ontwikkelen van medicijnen. interactie ligand-proteine enzo uitleggen.<br /> ====Hofkens====<br /> # (4pt) Spectra gegeven van Chryseen. Duid aan welk spectrum absorptie, fluorescentie en fosforescentie toont. De vervaltijd in regio 360-400nm is 10x kleiner dan die in de regio 500-600nm, leg uit waarom.Beschrijf alle waarnemingen van de spectra aan de hand van de geziene leerstof.<br /> # (2pt) L-opstelling voor meting anisotropie, in propyleenglycol bij 233K ofzoiets. Gegeven Ivh, Ivv, Ihh en Ihv. Bereken de werkelijke anisotropie bij verticale excitatie. Hoe groot is de fout die je maakt als je niet corrigeert? Wat is de hoek tussen de excitatie en het emissie dipoolmoment? Stel dat we bij 293K werken en in ethanol, kunnen we de hoek dan nog steeds bepalen? wat gebeurt er met de anisotropie?<br /> # (4pt) Woordjes<br /> #* Foto-elektrisch effect<br /> #* FRET<br /> #* Single Photon Timing<br /> #* Cottoneffect<br /> <br /> === 28 juni 2017===<br /> ====Vogt====<br /> # oefening spectrum NMR<br /> # COSY spectrum gegeven van molecule. Wijs elke functionele groep toe in het spectrum en leg uit waarom. Vertel de werking van COSY.<br /> # Bespreek de drie fasen voor de structuurbepaling van proteïnen via NMR<br /> ==== Hofkens ====<br /> # Gegeven is een simpele tekening van een hairpinstuctuur met donor en acceptor, deze is in evenwicht met zijn twee conformaties. De leeftijd van de donor in vrije oplossing is 10ns en acceptor is 2ns. Als de donor aan de hairpin hangt zien we een bi-exponentieel verval van 5ns en 1ns mer respectievelijk 95% en 5%. verklaar waarnemingen, bespreek de leeftijd van de acceptor in beide conformaties.<br /> # Gegeven is die tekening vanuit de cursus over FMN en YMN en tabel met hoek teta. In tabel ook nog anisotropiewaarde van complex en zonder complex, alfa en de concentraie van FMN is niet gegeven. Bereken dissociatieconstante en verklaar de grafiek van die anisotropie. <br /> # Woordjes:<br /> #* Transitiedipoolmoment<br /> #* Balmerreeks<br /> #* Excitatiespectrum<br /> #* Perrin vergelijking<br /> <br /> ===27 juni 2017===<br /> ====Vogt====<br /> # H en C spectrum<br /> # NOE<br /> # fase 1 uitleggen van die fase 3 shit + probleem grote moleculen <br /> ====Hofkens====<br /> # grafiek zoals in cursus van Eosin en Erytrosin (maar andere kleurstoffen). Alles bespreken wat je ziet. Tau en Q gegeven, bereken radioactieve en niet radiatieve snelheidsconstante. Als R= een of andere groep, waarom is dan de Tau en Q groter? En zou dit koppel een goed FRET paar zijn?<br /> # anisotropie is 0,3 maar door scattering laat de filter 20% door, wat is de gemeten anisotropie<br /> # woordjes: <br /> #* foto-elektrisch effect<br /> #* extinctie coefficient<br /> #* TRES<br /> #* cotton effect<br /> <br /> ===19 juni 2017===<br /> ====Vogt:====<br /> # zeeman effect<br /> # H/C spectrum<br /> # in vivo nmr<br /> ====Hofkens====<br /> # da van die even en oneven aantal dubbele bindingen en het effect daarvan op de golflengte, met cyanine en azocyanine.<br /> # oef 5 van oefenzitting 4 denk ik (zoals vorig examen)<br /> # woordjes: <br /> #* Ro<br /> #* Dynamic quenching<br /> #* fluorescence quantum yield<br /> #* resonance <br /> #* Raman scattering<br /> <br /> ===13 juni 2017===<br /> ====Vogt====<br /> # H- en IR spectrum gegeven van C11H14O2<br /> # vraag2 <br /> #* 2 soorten relaxatie, leg uit<br /> #* hoe beinvloeden deze het C-NMR<br /> #* weet ik ook niet meer<br /> # 1D en 2D NMR spectra: <br /> #* verschillen, voor - en nadelen geven. <br /> #* Kan je er ligand proteine bindingen mee onderzoeken? <br /> #* hoe ziet men dit? <br /> #* kan men zien aan met welk aminozuur de binding gebeurt? (Alles zowel voor slow- als fast exchange)<br /> ====Hofkens====<br /> # membraanfusie experiment: gegeven structuur lipide met pyreen aan, fuseert met zelfde lipide zonder pyreen, absorptie spectra pyreen gegeven (voor de fusie). Hoe verandert het absorptie- en emissiespectra doorheen het experiment? Leg uit adhv zelf gemaakte tekeningen (grafieken).<br /> # Oefening: zoals oefening 5 van oefenzitting 4<br /> # 4 termen: <br /> #* anti stokes <br /> #* ramanscattering<br /> #* emissiespectra<br /> #* statische quencher<br /> #* laatste weet ik niet meer<br /> <br /> ===7 juni 2016===<br /> ====Vogt====<br /> # H- en C-spectrum, structuur afleiden.<br /> # Je krijgt spintoestanden<br /> #* Geef het aantal mogelijke spin oriëntaties en geef het weer op een grafische manier. <br /> #* Hoe wordt dit effect genoemd? Is de electronen verdeling gelijk tussen 2 toestanden? <br /> #* Welke factoren beïnvloeden deze indeling? <br /> #* Wat kun je hieraan doen om NMR spectroscopie efficiënter te maken?<br /> # Leg in vivo H- en C-NMR spectroscopie uit, integreer een voorbeeld in je uitleg. <br /> #* Waarom wordt dit niet veel gebruikt? <br /> #* P-NMR is wel nuttig in vivo, waarom? <br /> #* Geef een voorbeeld waarin deze techniek gebruikt kan worden.<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Tekening met DNA-hairpin in open- en gesloten vorm. Aan uiteinde hangt een donor en acceptor. Donor vrij heeft leeftijd van 10 ns, acceptor vrij een leeftijd van 2 ns. Wanneer de leeftijd van de donor wordt gemeten (in de gesloten vorm) bekomen ze een bi-exponentiele verdeling voor de leeftijd: 5 ns 95% en 1 ns 5%. <br /> #* Verklaar de resultaten. <br /> #* Geef de leeftijd van de gesloten- en de open DNA-hairpin vorm. <br /> #* Wat zal de leeftijd van de acceptor zijn in de open vorm, en wat in de gesloten DNA-hairpin vorm?<br /> # Tekening van anisotropie gegeven (uit cursus met 2x10-2M en 2x10^-5M). Verklaar de tekening aan de hand van de gezienen leerstof.<br /> # Bespreek kort maar juist (1/2bladzijde max) <br /> #* foto-effect <br /> #* Balmer-reeks <br /> #* ... <br /> #* transitiedipoolmoment.<br /> <br /> ===23 juni 2015===<br /> ====Vogt====<br /> # H- en C-spectrum<br /> # Slow en fast exchange uitleggen (waarom een spectrum bij hoge T slechts 1 signaal meer geeft i.p.v. 2) en de exchange constant berekenen.<br /> # Hoe kan IR-Spectroscopy gebruikt worden om:<br /> #* kwantitatief de concentratie van een staal te bepalen.<br /> #* kwalitatief proteine structuur te bepalen.<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Gegeven een absorptiespectrum van verschillende kleurstoffen (steeds met een groter geconjungeerd systeem) verklaar alle waarnemingen, teken het fluorescentie spectrum van 2 van de stoffen, de quantumyield van kleurstof 1 is 0.9 hoe zal deze evolueren naarmate het molecule groter wordt?<br /> # Atoommodel van Bohr uitleggen en op het belang voor de spectroscopie wijzen.<br /> # Begrippen: <br /> #* Cotton-effect<br /> #* Inner filter effect<br /> #* R0 <br /> #* Excimeer<br /> <br /> ===15 juni 2015===<br /> ====Vogt====<br /> # H-spectrum+ IR-spectrum<br /> # uitleg verdeling tussen de 2 spintoestanden. hoe onstaat deze verdeling en hoe kan je ze beïnvloeden.<br /> # Leg uit de voor- en nadelen van 1D en 2D spectra en kan men aan de hand hiervan de ligand-proteïne interactie volgen. b. Kan je de snelheidsconstante K berekenen aan de hand van deze spectra? (zowel slow als fast exchange) c. kan je zien waar het ligand bind aan het proteïne? (zowel slow als fastexchange)<br /> ====Hofkens====<br /> # twee prentjes van twee membranen. Eerst een eximeer daarna niet meer. Het gaat over membraanfusie. Geef de absorptie-en emissiespectra van beide toestanden. Wat leert men hieruit over membraanfusie?(af te leiden uit prentjes)<br /> # hoe kan men de transitieconstante berekenen?<br /> # woordjes: <br /> #* limiterende anisotropie<br /> #* cotton effect<br /> #* inner filter effect<br /> #* statische quenching<br /> <br /> ===17 juni 2013===<br /> ====Vogt====<br /> # simpele oefening over een C9H10O3 spectrum, bij mondeling vroeg ze waarom dat een doublet of triplet of multiplet was.<br /> # verschillende COSY spectra matchen met verschillende aminozuren<br /> # welke NMR-technieken kunnen worden gebruikt om ligand-proteïne interacties te onderzoeken. Bijvraag ging over SAR, welke stappen enzo.. ook uitleggen dat die interactie snel of traag kan gebeuren.<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # oefening; gegeven tau-waarden en p waarden. Hieruit P0, de rotationele correlatietijd en nog iets berekenen.<br /> # het atoommodel van bohr uit de doeken doen, postulaten, formules,.. en de link leggen met de spectroscopy van vandaag.<br /> # begrippen uitleggen: <br /> #* R0<br /> #* cotton effect<br /> #* inner filter effect<br /> #* excimeer<br /> <br /> ===10 juni 2013===<br /> ====Tatjana====<br /> # Oefening waarbij H en C spectrum gegeven werden<br /> # IR spectroscopie:<br /> #* is de amide band I de enige bruikbare band voor het bepalen van de secundaire structuur van eiwitten of zijn er nog?<br /> #* Verklaring geven voor de verschillende waarde van de amide piek bij alfa helix of b sheet.<br /> #* Vaak ziet men 1 grote band en niet de verschillende pieken binnen de amide I band, hoe lost men dit op?<br /> #* Is IR zo ook een kwantitatieve methode voor de bepaling van de secundaire structuur?<br /> # Bespreek HSQC in verband met studies van proteïnen.<br /> ====Hofkens====<br /> # oefening met 2 spectra gegeven van anisotropie-verval in de tijd van hetzelfde FP molecule. Het ene spectrum was bij lage concentratie FP, het andere bij hoge concentratie FP. Bij beiden werd het verval gemeten bij verschillende viscositeit en weergegeven in het spectrum (dus 5 vervalcurves in elk spectrum).<br /> #* Verklaar de resultaten.<br /> #* Wat kom je hierdoor te weten over het FP?<br /> #* Bespreek in detail de meettechniek hoe men aan deze spectra komt. (4punten)<br /> # Bespreek het foto-elektrisch effect van Einstein. Waarom is dit belangrijk voor spectroscopie? (2punten)<br /> # Leg de volgende begrippen uit (max 1 blz per begrip) (4 punten):<br /> #* circulair dichroïsme<br /> #* magic angle<br /> #* fosforescentie <br /> #* J-aggregaat<br /> <br /> ===30 jun 2011===<br /> ====Tatjana====<br /> # H-NMR en IR spectrum van C14H14 gegeven. (Het was 1,2-difenylethaan als structuur)<br /> # Wat is NOE? Bereken de maximum signaalversterking bij 1H en 15N wanneer 15N de onderzochte kern is (gamma's gegeven).<br /> # Bespreek kort de 3 fasen waarin men m.b.v. NMR de structuur van proteinen kan bepalen.<br /> ====Hofkens====<br /> # Bij het meten van lifetimes zijn er vaak problemen met depolarisatie. Hoe los je dit anisotropieprobleem op. Verwerk de formule van anisotropie in je antwoord (6 punten).<br /> # Gegeven zijn gegevens van een quenching experiment. Je moest een Stern-volmer ervan maken. Verschillende quenchingconstanten berekenen. (Super moeilijke oefening !)<br /> # Oefening over Raman (Stokes en anti-Stokes): (2 punten)<br /> #* exciterende laserfrequenties en een paar spectrumwaarden gegeven<br /> #* en dan een paar vraagjes waar je frequenties of golflengtes moest berekenen.<br /> <br /> ===21 jun 2011===<br /> ====Tatjana====<br /> # H-NMR en IR spectrum van C11H14O2 gegeven.<br /> # Vijf kernen (12C, 14N, 17O, 31P en 51V) met hun I-waarde (totale spin van de kern) gegeven.<br /> #* Geef het aantal mogelijke spinoriëntaties van elke kern en stel grafisch voor.<br /> #* Wat is de frequentie van een signaal van een 31P-kern bij een magneetveld van 1 Tesla? (gamma, constante van Planck, pi en abundantie gegeven)<br /> #* Zelfde vraag en zelfde gegevens, maar dan voor 51V.<br /> #* Bij welk van beide kernen (31P en 51V) verwacht je onder dezelfde condities (concentratie, magneetveldsterkte) de hoogste S/N ratio?<br /> # Welke NMR methoden kan je gebruiken om de binding van een klein ligand aan een proteïne te bestuderen? Hou rekening met het verschil tussen trage en snelle uitwisseling ten opzichte van de NMR-tijdschaal.<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Gegeven was een structuur (twee naftaleenmoleculen gekoppeld via een linker) en het bijhorende emissiespectrum met 3 pieken (opgenomen bij -60°C). De eerste piek had een fluorescentieverval van 2 ns, de middelste een bi-exponentieel verval en de laatste een verval van 12000 ns. Een concentratieverhoging heeft geen invloed op de vorm van het spectrum, maar wel op de intensiteit. Verklaar alle waarnemingen mbv Jablonski-energiediagram. Schat ook de golflengte bij max. absorptie mbv van de Woodward-Fieser-Scott regels en teken het absorptiespectrum. (6 punten)<br /> # Gegeven zijn twee structuren met als enige verschil de plaats van één dubbele binding (waardoor die binding bij de ene structuur geconjugeerd is en bij de andere niet). Je mag geen gebruik maken van de Woodward-Fieser-Scott regels om lambda max te bepalen, maar je hebt wel een UV-VIS absorptiemeter ter beschikking. Hoe kan je die gebruiken om beide stoffen te onderscheiden? (2 punten)<br /> # Oefening over Raman (Stokes en anti-Stokes): exciterende laserfrequenties en een paar spectrumwaarden gegeven, en dan een paar vraagjes waar je frequenties of golflengtes moest berekenen. (2 punten)<br /> <br /> ===17 jun 2011===<br /> ====Tatjana====<br /> # H- en C- NMRspectrum geven, C9H10O3. Mondelinge bijvragen:<br /> #* Waarom is die piek bv een triplet?<br /> #* Wat is er belangrijk voor het solvent voor NMR?<br /> # Bij een NMR meting met een toestel van 60MHz is het ligt de piek van CH3NO2 op 259.8 Hz van de referentiestof.<br /> #* bereken de chemische shift bij 60MHz<br /> #* op welke afstand zou de piek liggen bij 500MHz<br /> #* bereken de chemische shift bij 500MHz<br /> #* bijvraag: Waarom is de chemische shift belangrijk<br /> # Hoe kan je IR-spectrometrie gebruiken om info over de secundaire structuur van een proteïne te bekomen? Voor welk type van proteïnen is deze methode vooral bruikbaar?<br /> ====Hofkens:====<br /> # Gegeven was een schema van een natriumlamp. De lamp werkt als volgt: als er spanning gezet wordt over de lamp, wordt het ontspanningsgas(neon) geioniseerd. Bij botsing van dit geioniseerd gas met het natrium-kwik amalgaam komt natrium vrij. Zo wordt een lage natrium druk gecreeerd. Typisch voor zo'n lamp is de oranje kleur(zoals op de autosnelweg). Die kleur wordt veroorzaakt door het natrium. Verklaar dit aan de hand van concepten uit de cursus. Als de lamp net aangestoken is, is kleur niet oranje, maar roodachtig, verklaar. Een andere versie van zo'n lamp werkt met een hoge natrium druk, dit soort lampen geeft een wit-gele kleur. Verklaar dit aan de hand van concepten uit de cursus.(6 punten)<br /> # Geef een bondige uitleg voor volgend begrippen(5 zinnen) met indien nodig een wiskundige uitdrukking(2 punten)<br /> #* Extinctiecoefficient<br /> #* Woodward-Fieser-Scott-regels<br /> #* Lambert-Beer<br /> #* Fluorescentie quenching<br /> # oef(2 punten) Gegeven is dat HBr een band geeft bij 2558 cm^-1.<br /> #* bereken de golflengte<br /> #* je krijgt de uitdrukking van een veer(die met Mred) en gevraagt: bereken welke band DBr zal geven.(gegeven zijn m van H, D en Br en getal van Avogadro)<br /> <br /> ===15 jun 2010===<br /> ====Tatjana====<br /> # H- en IR- spectrum geven, C4H9Br. Mondelinge bijvragen:<br /> #* Wat moet normaal de opsplitsing zijn van dit multiplet?<br /> #* Is het IR-spectrum hier nuttig?<br /> # Wat is NOE? Bereken de maximum signaalversterking bij 1H en 31P wanneer 31P de onderzochte kern is (gamma's gegeven).<br /> # Welke NMR methode kan je gebruiken om een KWANTITATIEVE analyse te maken van protein-ligand binding? Hou rekening met snelle en trage uitwisseling.<br /> <br /> ===18 jun 2009===<br /> ====Tatjana====<br /> # H en C - NMR gegeven. Structuur? C14H14.<br /> # Gegeven: 12C (I=0), 14N (I=1), 17O (I=5/2), 31P (I=1/2).<br /> #* Hoeveel spinoriëntaties zijn er in een magnetisch veld? Stel grafisch voor.<br /> #* 31P in magneetveld van 1 Tesla. Bij welke frequentie moet je 31P meten? h, gamma en pi gegeven.<br /> # Hoe kan je IR-spectrometrie gebruiken om info over de secundaire structuur van een proteïne te bekomen? Voor welk type van proteïnen is deze methode vooral bruikbaar?<br /> <br /> ===16 jun 2008===<br /> ====Tatjana====<br /> # Bespreek de drie fasen voor de structuurbepaling van proteïnen via NMR<br /> # 3 COSY's gegeven, 6 AZ. Ken de 3 COSY's toe en leg uit waarom<br /> # H-NMR en IR-spectrum gegeven. Geef structuur (butylethanoaat (en geen methylpentanoaat!))<br /> <br /> ===13 jun 2008===<br /> ====Tatjana====<br /> # H en C spectrum van een molecule<br /> # Je krijgt lysine en zijn H en C chemische shift waarden, teken DEPT, H-H COSY en C-H HSQC<br /> # hoe kan je de binding van een ligand aan een proteïne bestuderen? Hou rekening met snelle en trage uitwisseling<br /> <br /> ===11 jun 2008===<br /> ====Tatjana====<br /> # Je hebt een oplossing vitamine C (structuur gegeven). Bespreek hoe je met IR-spectroscopie de concentratie van de oplossing kunt bepalen.<br /> # Geef het aantal verschillende spintoestanden van 12C (I=0),31P (I=1/2), 14N (I=1), 17O (I=5/2) en stel grafisch voor.<br /> # Bereken frequentie (B0, gamma, h en pi gegeven) voor 31P<br /> <br /> ===27 jun 2007===<br /> ====Tatjana====<br /> # Oefening, aromatische ring, twee O-CH3 en een keton erop<br /> # Je kreeg een molecule en ge moest daar de zo'n dynamische interactie bespreken, van draaiing rond een binding (met slow exchange, coalescentie en fast exchange) en dan moest je de uitwisselingssnelheid bij coalescentie berekenen.<br /> # Toepassing van IR op biomoleculen<br /> <br /> ===23 jun 2007===<br /> ====Tatjana====<br /> # Basic oefeningske<br /> # De NH2 groep stretcht permanent bij een frequentie van 1013 Hz. hierdoor heeft deze N-H verschillende bindingslengtes. Ga na of de individuele bindingslengtes kunnen gedetecteerd worden op een NMR-instrument van a) 250 MHZ en b) 900 MHz.<br /> # Wat is HSQC en hoe kan deze techniek bijdragen bij het onderzoek van eiwitten<br /> <br /> ===21 jun 2007===<br /> ====Tatjana====<br /> # Je kreeg een tekening van een benzeenring met daar een groep boven en ge moest de upfield en downfield effecten bespreken van die groep en die van de benzeenring.<br /> # Hoe is NMR belangrijk voor SAR en ook SAR bespreken<br /> # Een oefening met een symmetrische aromatische ring en een carboonzuur en een ester daar ergens in.<br /> <br /> ===18 jun 2007===<br /> ====Tatjana====<br /> # Oefening: Nen C4H9Br, gewoon, H spectrum en (nutteloos) IR gegeven, en ge moet de structuur geven (twas gewoon lineair, dus best wel 'makkelijk&quot;)<br /> # Theorie:<br /> #* H @ 60MHz, zelfde toestel P @ ? MHz??? De 'gamma' van H en P was gegeven<br /> # In vivo NMR, bespreek, leg uit,...</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Industri%C3%ABle_Chemie&diff=1768 2019-06-25T15:20:19Z

<p>Cynthia.R: /* 25 Juni 2019 VM */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Machemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak op 6 stp gedoceerd door Jan Remeysen (werkt bij BASF, maar dat zal vanzelf wel duidelijk worden). Het examen is mondeling met schriftelijke voorbereiding. Het mondeling zelf duurt wel lang, omdat Remeysen veel bijvragen stelt en graag over andere dingen praat (het mondeling is echt wel chill). Wat wel belangrijk is, is dat LETTERLIJK elk woord, concept of zin die in de cursus staat of in de les gezegd wordt (!!) een mogelijke vraag is op het examen. Opletten en zeer goed notities bijhouden is dus een must tijdens de lessen (en zeker niet te veel aan je thesis werken tijdens de lessen ;) ). De examenvragen worden vrijwel gerecycleerd, maar gaan dus vaak verder dan de vragen zelf op papier. In eenzelfde jaar stelt hij normaal niet dezelfde vragen op verschillende dagen (tenzij over energie en innovatie, zie verder), maar de reeks van de namiddag heeft wel steeds dezelfde vragen als die van de voormiddag (let wel, dit is tot nu toe zo geweest en kan mogelijks veranderen. Verantwoordelijkheid ligt uiteraard bij jezelf). Elk examen bevat minstens 3 vragen van een bepaalde soort: Rentabiliteit, Energie en Innovatie. De rentabiliteitsoefening is steeds gelijkaardig, maar wel een ander vraagstuk. De energie-vraag is vaak een artikel lezen en bespreken (soms wordt hetzelfde artikel gevraagd bij verschillende reeksen). De vraag over innovatie is de opdracht uit het hoorcollege waarbij je zelf een voorbeeld van innovatie meebrengt naar het examen en het bespreekt. <br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 25 Juni 2019 VM ===<br /> alain<br /> <br /> #vraag 1: uitleggen online (bijvraag verschil off line, in line)<br /> <br /> NIR als meetinstrument on line (waar staat de IR zelf, waarom (trillingen installatie enzo))<br /> <br /> #vraag 2: Talent management, waarom is het nuttig voor bedrijf en werknemer.<br /> <br /> verschil talent en competence<br /> <br /> #vraag 3: wat is een sustainable company, waar houdt deze rekening mee, hoe doet deze dat (people profit planet etc)<br /> <br /> jan<br /> <br /> #vraag 1: rent analyse<br /> <br /> #vraag 2: procesveiligheid. je krijgt een schema van die tank met veiligheidsmaatregelen (quenching tank enzo)<br /> <br /> waaruit komen de maatregelen voort, wat zijn de soorten maatregelen (primair, secundair)<br /> <br /> #vraag 3: energiebeleid, hoe in een bedrijf. wat zijn de pijlers van energiebeleid in europa. (geen getallen, algemeen) Artikel over benchmarking. waarom is er een limiet aan co2 vermindering? (thermodynamisch optimum)<br /> <br /> === 24 Juni 2019 VM === <br /> Deel Jan<br /> #Bespreking rentabiliteit van je businessplan: vraagt vooral hoe je NPV etc hebt berekend.<br /> #ammoniak synthese: 2 grafieken gegeven uit de slides en hiermee het effect van de temperatuur en druk uitleggen op de synthese.<br /> Uitleggen hoe de Fe katalysator wordt gereduceerd en de rol van water hierin bespreken.<br /> Uitleggen waarom de Fe katalysator zo belangrijk is voor je ammoniak synthese.<br /> #Je krijgt een artikel over energiebeleid + Waarom is energiebeleid belangrijk en bespreek de algemene pijlers voor energiebeleid in Europa in de toekomst. (Zelfde als 21/06 VM)<br /> <br /> Deel Alain<br /> #Wat is circulaire economie en wat is het verschil met recycling economie. Geef de opportunities en threats die het oplost.<br /> #Vraag over EHSQ over energiemanagement, waarom je het moet doen en hoe, ISO 50001 uitleggen enzo, people planet profit.<br /> #Wat is het verschil tussen talentmanagement en kijken naar competenties in HR. Welke voordelen geeft het voor het bedrijf en voor de werknemer.<br /> <br /> ===21 juni 2019 voormiddag ===<br /> ALAIN: <br /> - een geïntegreerd zorgsysteem werkt volgens het principe van PDCA, leg dit uit. (EHSQ)<br /> - near IR kan gebruikt worden als online techniek voor de kwaliteit van het staal te bepalen. Alles uitleggen, online, near IR, in welke toepassing we da gezien hebben (tekening best geven) (EHSQ)<br /> - Waarom heeft een bedrijf een visie en hoe zorgen ze ervoor dat hun arbeiders dit naleven. (Strategie, visie en missie)<br /> <br /> JAN<br /> - rentabiliteit van businessplan (payback time, NPV, NPI, Depreciation en Discount rate)<br /> - wat is het verschil tussen gevaar en risico? Wat is een risicoanalyse en hoe zorgen ze ervoor dat deze correct uitgevoerd wordt? Efficiëntie van de mogelijke risico vermindering. (Occupational safety)<br /> - een artikel rond energie: bespreek de zin die aangeduid is (energie), hoe wordt er in de chemische industrie gewerkt aan energie-efficiëntie (hoofdstukken gecombineerd), bespreek de pijlers waar men in Europa in de toekomst op richt (klimaat)<br /> <br /> Apart bij een van hen: <br /> businessplan bespreken: random vragen<br /> <br /> <br /> ===25 juni 2018 namiddag===<br /> zie examen 27 juni 2017<br /> <br /> ===25 juni 2018 voormiddag===<br /> zie examen 24 juni 2017<br /> <br /> ===22 juni 2018 voormiddag===<br /> zie examen 23 juni 2017<br /> <br /> ===27 juni 2017 namiddag===<br /> #Geef de pijlers van talent management en geef enkele voorbeelden/concepten om deze pijlers te illustreren. <br /> #Ethyleenoxide<br /> ##Uit welke 4 componenten bestaat de katalysator? Hoe wordt deze katalysator gemaakt en waarom op deze manier? Wat is het effect op de samenstelling van de katalysator? <br /> ##Bespreek het mechanisme voor de vorming van ethyleenoxide (TPR-massaspectrum gegeven).<br /> ##Waarom wordt een ethyleenoxide installatie vaak gecombineerd met een ethyleenglycol installatie?<br /> #Procesveiligheid<br /> ##Bespreek de veiligheidsmaatregelen die genomen worden bij de ammoniumnitraat tank (afbeelding van de AN tank gegeven met ALLE veiligheidsmaatregelen al op getekend: primaire voor proces, primaire voor fouten en secundaire). <br /> ##Welk aanpak schuilt er achter deze maatregelen? <br /> #Rentabiliteit (ingevulde tabel gegeven)<br /> ##Hoe komt men aan de kosten/baten?<br /> ##Bespreek de afschrijvingswaarden. <br /> ##Hoe gaat men van de netto cash flow naar de geactualiseerde netto cash flow in jaar 5?<br /> ##Is het project rendabel?<br /> #Energie (heel kort artikel gegeven)<br /> ##Waarom is het verantwoord om van een veilingsysteem naar een benchmarksysteem over te schakelen?<br /> ##Wat is het energiebeleid in de chemie (staat los van het artikel)?<br /> #Innovatie: eigen voorbeeld uit het hoorcollege.<br /> <br /> ===24 juni 2017 voormiddag en namiddag===<br /> #Visie (zie andere jaren)<br /> #NH3 synthese (zie andere jaren)<br /> #Historische evolutie in arbeidsveiligheid, procesveiligheid en milieu (zie andere jaren)<br /> #Artikel over energie (zie andere jaren)<br /> #Rentabiliteit (zie andere jaren)<br /> #Innovatie (zie andere jaren)<br /> <br /> ===23 juni 2017 voormiddag en namiddag===<br /> #Wat is een zorgsysteem en wat is het nut voor een onderneming?<br /> #Risicoanalyse<br /> ##Wat is het verschil tussen risico en gevaar?<br /> ##Hoe neem je juiste risico reductie maatregelen en de kosten efficiëntie?<br /> ##Wat is een risicoanalyse en hoe wordt er gezorgd dat deze juist gemaakt wordt?<br /> #Kraken <br /> ##Waarom wordt kraken toegepast?<br /> ##Wat zijn gelijkenissen en verschillen tussen thermisch en stoomkraken?<br /> ##Waarom wordt katalytisch kraken toegepast?<br /> ##Beschrijf kraakscherpte a.h.v. figuur<br /> #Rentabiliteitsanalyse<br /> ##Hoe kom je aan kosten/baten?<br /> ##Hoe ga je van cashflow naar actuele cashflow?<br /> ##Is de onderneming rendabel?<br /> ##Leg de afschrijvingen uit<br /> #Artikel over energie-efficiëntie: <br /> ##zin in aangeduid en uitleggen<br /> ##Hoe werken chemische bedrijven mee aan energie-efficiëntie<br /> #Innovatie: oefening uit hoorcollege, breng je eigen voorbeeld mee<br /> <br /> ===23 juni 2014 voormiddag en namiddag===<br /> #Wat is een zorgsysteem? Wat is het nut ervan voor de onderneming?<br /> #Synthese van ammoniak (2 grafieken uit cursus gegeven)<br /> ##Bespreek de invloed van temperatuur, druk en reactievoering op de keuze van de omstandigheden voor de ammoniaksynthesereactie. <br /> ##Hoe wordt de katalysator geactiveerd? Wat is de rol van waterdamp hierin?<br /> ##Bespreek volgende stelling &quot;De katalysator is het hart van de ammoniakfabriek&quot;. <br /> #Bespreek de historische evolutie in het aanpakken van volgende problematieken:<br /> ##procesveiligheid<br /> ##arbeidsveiligheid<br /> ##milieu<br /> #Rentabiliteitsanalyse: Een bedrijf wil het vullen van vaten automatiseren. Hierbij komt kijken een investeringskost, een negatieve kost vanwege verminderen van energieverbruik en ontslaan van 2 werknemers, en een positieve kost vanwege sociale bijdrage. Tabel gegeven.<br /> ##Is deze investering rendabel?<br /> ##Wat is het verschil tussen de waarden in de rij 'Totale cashflow' en 'Verdisconteerde cashflow'?<br /> ##Nog een paar kleine vraagjes<br /> #Vraag over innovatie (die zelf naar het examen meegebracht moest worden)<br /> <br /> ===22 juni 2014 voormiddag en namiddag===<br /> #Waarom definieert een onderneming een visie? En hoe wordt deze nagestreefd?<br /> #kraken<br /> ##Waarom wordt er gekraakt?<br /> ##Geef de gelijkenissen en verschillen tussen thermisch kraken en stoomkraken<br /> ##Waarom werd katalytisch kraken ontwikkeld?<br /> ##Geef aan de hand van de figuur weer wat er bedoeld wordt met kraakscherpte (figuur over kraakscherpte gegeven)<br /> #Veiligheid<br /> ##Wat is een risico-analyse?<br /> ##Bespreek efficiëntie (kosten-effeciëntie/verhaal van kat en muis)<br /> #Rentabiliteit (schema en opgave gegeven)<br /> ##Hoe kom je aan de kosten/baten?<br /> ##Bespreek wettelijke afschrijvingen<br /> ##Bespreek hoe je in jaar 5 aan de actuele waarde komt.<br /> ##Is het rendabel?<br /> #energie-efficiëntie<br /> ##Artikel gegeven, bespreek daar een zin uit.<br /> ##Hoe wordt er in de chemische industrie zuinig omgegaan met energie?<br /> #innovatie: oefening uit hoorcollege.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Industri%C3%ABle_Chemie&diff=1767 2019-06-25T15:20:11Z

<p>Cynthia.R: /* 24 Juni 2019 VM */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Machemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak op 6 stp gedoceerd door Jan Remeysen (werkt bij BASF, maar dat zal vanzelf wel duidelijk worden). Het examen is mondeling met schriftelijke voorbereiding. Het mondeling zelf duurt wel lang, omdat Remeysen veel bijvragen stelt en graag over andere dingen praat (het mondeling is echt wel chill). Wat wel belangrijk is, is dat LETTERLIJK elk woord, concept of zin die in de cursus staat of in de les gezegd wordt (!!) een mogelijke vraag is op het examen. Opletten en zeer goed notities bijhouden is dus een must tijdens de lessen (en zeker niet te veel aan je thesis werken tijdens de lessen ;) ). De examenvragen worden vrijwel gerecycleerd, maar gaan dus vaak verder dan de vragen zelf op papier. In eenzelfde jaar stelt hij normaal niet dezelfde vragen op verschillende dagen (tenzij over energie en innovatie, zie verder), maar de reeks van de namiddag heeft wel steeds dezelfde vragen als die van de voormiddag (let wel, dit is tot nu toe zo geweest en kan mogelijks veranderen. Verantwoordelijkheid ligt uiteraard bij jezelf). Elk examen bevat minstens 3 vragen van een bepaalde soort: Rentabiliteit, Energie en Innovatie. De rentabiliteitsoefening is steeds gelijkaardig, maar wel een ander vraagstuk. De energie-vraag is vaak een artikel lezen en bespreken (soms wordt hetzelfde artikel gevraagd bij verschillende reeksen). De vraag over innovatie is de opdracht uit het hoorcollege waarbij je zelf een voorbeeld van innovatie meebrengt naar het examen en het bespreekt. <br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 25 Juni 2019 VM ===<br /> alain<br /> <br /> #vraag 1: uitleggen online (bijvraag verschil off line, in line)<br /> <br /> NIR als meetinstrument on line (waar staat de IR zelf, waarom (trillingen installatie enzo))<br /> <br /> #vraag 2: Talent management, waarom is het nuttig voor bedrijf en werknemer.<br /> <br /> verschil talent en competence<br /> <br /> #vraag 3: wat is een sustainable company, waar houdt deze rekening mee, hoe doet deze dat (people profit planet etc)<br /> <br /> jan<br /> <br /> #vraag 1: rent analyse<br /> <br /> #vraag 2: procesveiligheid. je krijgt een schema van die tank met veiligheidsmaatregelen (quenching tank enzo)<br /> <br /> waaruit komen de maatregelen voort, wat zijn de soorten maatregelen (primair, secundair)<br /> <br /> #vraag 3: energiebeleid, hoe in een bedrijf. wat zijn de pijlers van energiebeleid in europa. (geen getallen, algemeen) Artikel over benchmarking. waarom is er een limiet aan co2 vermindering? (thermodynamisch optimum)<br /> <br /> === 24 Juni 2019 VM === <br /> Deel Jan<br /> #Bespreking rentabiliteit van je businessplan: vraagt vooral hoe je NPV etc hebt berekend.<br /> #ammoniak synthese: 2 grafieken gegeven uit de slides en hiermee het effect van de temperatuur en druk uitleggen op de synthese.<br /> Uitleggen hoe de Fe katalysator wordt gereduceerd en de rol van water hierin bespreken.<br /> Uitleggen waarom de Fe katalysator zo belangrijk is voor je ammoniak synthese.<br /> #Je krijgt een artikel over energiebeleid + Waarom is energiebeleid belangrijk en bespreek de algemene pijlers voor energiebeleid in Europa in de toekomst. (Zelfde als 21/06 VM)<br /> <br /> Deel Alain<br /> #Wat is circulaire economie en wat is het verschil met recycling economie. Geef de opportunities en threats die het oplost.<br /> #Vraag over EHSQ over energiemanagement, waarom je het moet doen en hoe, ISO 50001 uitleggen enzo, people planet profit.<br /> #Wat is het verschil tussen talentmanagement en kijken naar competenties in HR. Welke voordelen geeft het voor het bedrijf en voor de werknemer.<br /> <br /> ===21 juni 2019 voormiddag ===<br /> ALAIN: <br /> - een geïntegreerd zorgsysteem werkt volgens het principe van PDCA, leg dit uit. (EHSQ)<br /> - near IR kan gebruikt worden als online techniek voor de kwaliteit van het staal te bepalen. Alles uitleggen, online, near IR, in welke toepassing we da gezien hebben (tekening best geven) (EHSQ)<br /> - Waarom heeft een bedrijf een visie en hoe zorgen ze ervoor dat hun arbeiders dit naleven. (Strategie, visie en missie)<br /> <br /> JAN<br /> - rentabiliteit van businessplan (payback time, NPV, NPI, Depreciation en Discount rate)<br /> - wat is het verschil tussen gevaar en risico? Wat is een risicoanalyse en hoe zorgen ze ervoor dat deze correct uitgevoerd wordt? Efficiëntie van de mogelijke risico vermindering. (Occupational safety)<br /> - een artikel rond energie: bespreek de zin die aangeduid is (energie), hoe wordt er in de chemische industrie gewerkt aan energie-efficiëntie (hoofdstukken gecombineerd), bespreek de pijlers waar men in Europa in de toekomst op richt (klimaat)<br /> <br /> Apart bij een van hen: <br /> businessplan bespreken: random vragen<br /> <br /> <br /> ===25 juni 2018 namiddag===<br /> zie examen 27 juni 2017<br /> <br /> ===25 juni 2018 voormiddag===<br /> zie examen 24 juni 2017<br /> <br /> ===22 juni 2018 voormiddag===<br /> zie examen 23 juni 2017<br /> <br /> ===27 juni 2017 namiddag===<br /> #Geef de pijlers van talent management en geef enkele voorbeelden/concepten om deze pijlers te illustreren. <br /> #Ethyleenoxide<br /> ##Uit welke 4 componenten bestaat de katalysator? Hoe wordt deze katalysator gemaakt en waarom op deze manier? Wat is het effect op de samenstelling van de katalysator? <br /> ##Bespreek het mechanisme voor de vorming van ethyleenoxide (TPR-massaspectrum gegeven).<br /> ##Waarom wordt een ethyleenoxide installatie vaak gecombineerd met een ethyleenglycol installatie?<br /> #Procesveiligheid<br /> ##Bespreek de veiligheidsmaatregelen die genomen worden bij de ammoniumnitraat tank (afbeelding van de AN tank gegeven met ALLE veiligheidsmaatregelen al op getekend: primaire voor proces, primaire voor fouten en secundaire). <br /> ##Welk aanpak schuilt er achter deze maatregelen? <br /> #Rentabiliteit (ingevulde tabel gegeven)<br /> ##Hoe komt men aan de kosten/baten?<br /> ##Bespreek de afschrijvingswaarden. <br /> ##Hoe gaat men van de netto cash flow naar de geactualiseerde netto cash flow in jaar 5?<br /> ##Is het project rendabel?<br /> #Energie (heel kort artikel gegeven)<br /> ##Waarom is het verantwoord om van een veilingsysteem naar een benchmarksysteem over te schakelen?<br /> ##Wat is het energiebeleid in de chemie (staat los van het artikel)?<br /> #Innovatie: eigen voorbeeld uit het hoorcollege.<br /> <br /> ===24 juni 2017 voormiddag en namiddag===<br /> #Visie (zie andere jaren)<br /> #NH3 synthese (zie andere jaren)<br /> #Historische evolutie in arbeidsveiligheid, procesveiligheid en milieu (zie andere jaren)<br /> #Artikel over energie (zie andere jaren)<br /> #Rentabiliteit (zie andere jaren)<br /> #Innovatie (zie andere jaren)<br /> <br /> ===23 juni 2017 voormiddag en namiddag===<br /> #Wat is een zorgsysteem en wat is het nut voor een onderneming?<br /> #Risicoanalyse<br /> ##Wat is het verschil tussen risico en gevaar?<br /> ##Hoe neem je juiste risico reductie maatregelen en de kosten efficiëntie?<br /> ##Wat is een risicoanalyse en hoe wordt er gezorgd dat deze juist gemaakt wordt?<br /> #Kraken <br /> ##Waarom wordt kraken toegepast?<br /> ##Wat zijn gelijkenissen en verschillen tussen thermisch en stoomkraken?<br /> ##Waarom wordt katalytisch kraken toegepast?<br /> ##Beschrijf kraakscherpte a.h.v. figuur<br /> #Rentabiliteitsanalyse<br /> ##Hoe kom je aan kosten/baten?<br /> ##Hoe ga je van cashflow naar actuele cashflow?<br /> ##Is de onderneming rendabel?<br /> ##Leg de afschrijvingen uit<br /> #Artikel over energie-efficiëntie: <br /> ##zin in aangeduid en uitleggen<br /> ##Hoe werken chemische bedrijven mee aan energie-efficiëntie<br /> #Innovatie: oefening uit hoorcollege, breng je eigen voorbeeld mee<br /> <br /> ===23 juni 2014 voormiddag en namiddag===<br /> #Wat is een zorgsysteem? Wat is het nut ervan voor de onderneming?<br /> #Synthese van ammoniak (2 grafieken uit cursus gegeven)<br /> ##Bespreek de invloed van temperatuur, druk en reactievoering op de keuze van de omstandigheden voor de ammoniaksynthesereactie. <br /> ##Hoe wordt de katalysator geactiveerd? Wat is de rol van waterdamp hierin?<br /> ##Bespreek volgende stelling &quot;De katalysator is het hart van de ammoniakfabriek&quot;. <br /> #Bespreek de historische evolutie in het aanpakken van volgende problematieken:<br /> ##procesveiligheid<br /> ##arbeidsveiligheid<br /> ##milieu<br /> #Rentabiliteitsanalyse: Een bedrijf wil het vullen van vaten automatiseren. Hierbij komt kijken een investeringskost, een negatieve kost vanwege verminderen van energieverbruik en ontslaan van 2 werknemers, en een positieve kost vanwege sociale bijdrage. Tabel gegeven.<br /> ##Is deze investering rendabel?<br /> ##Wat is het verschil tussen de waarden in de rij 'Totale cashflow' en 'Verdisconteerde cashflow'?<br /> ##Nog een paar kleine vraagjes<br /> #Vraag over innovatie (die zelf naar het examen meegebracht moest worden)<br /> <br /> ===22 juni 2014 voormiddag en namiddag===<br /> #Waarom definieert een onderneming een visie? En hoe wordt deze nagestreefd?<br /> #kraken<br /> ##Waarom wordt er gekraakt?<br /> ##Geef de gelijkenissen en verschillen tussen thermisch kraken en stoomkraken<br /> ##Waarom werd katalytisch kraken ontwikkeld?<br /> ##Geef aan de hand van de figuur weer wat er bedoeld wordt met kraakscherpte (figuur over kraakscherpte gegeven)<br /> #Veiligheid<br /> ##Wat is een risico-analyse?<br /> ##Bespreek efficiëntie (kosten-effeciëntie/verhaal van kat en muis)<br /> #Rentabiliteit (schema en opgave gegeven)<br /> ##Hoe kom je aan de kosten/baten?<br /> ##Bespreek wettelijke afschrijvingen<br /> ##Bespreek hoe je in jaar 5 aan de actuele waarde komt.<br /> ##Is het rendabel?<br /> #energie-efficiëntie<br /> ##Artikel gegeven, bespreek daar een zin uit.<br /> ##Hoe wordt er in de chemische industrie zuinig omgegaan met energie?<br /> #innovatie: oefening uit hoorcollege.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Industri%C3%ABle_Chemie&diff=1766 2019-06-25T15:19:35Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Machemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak op 6 stp gedoceerd door Jan Remeysen (werkt bij BASF, maar dat zal vanzelf wel duidelijk worden). Het examen is mondeling met schriftelijke voorbereiding. Het mondeling zelf duurt wel lang, omdat Remeysen veel bijvragen stelt en graag over andere dingen praat (het mondeling is echt wel chill). Wat wel belangrijk is, is dat LETTERLIJK elk woord, concept of zin die in de cursus staat of in de les gezegd wordt (!!) een mogelijke vraag is op het examen. Opletten en zeer goed notities bijhouden is dus een must tijdens de lessen (en zeker niet te veel aan je thesis werken tijdens de lessen ;) ). De examenvragen worden vrijwel gerecycleerd, maar gaan dus vaak verder dan de vragen zelf op papier. In eenzelfde jaar stelt hij normaal niet dezelfde vragen op verschillende dagen (tenzij over energie en innovatie, zie verder), maar de reeks van de namiddag heeft wel steeds dezelfde vragen als die van de voormiddag (let wel, dit is tot nu toe zo geweest en kan mogelijks veranderen. Verantwoordelijkheid ligt uiteraard bij jezelf). Elk examen bevat minstens 3 vragen van een bepaalde soort: Rentabiliteit, Energie en Innovatie. De rentabiliteitsoefening is steeds gelijkaardig, maar wel een ander vraagstuk. De energie-vraag is vaak een artikel lezen en bespreken (soms wordt hetzelfde artikel gevraagd bij verschillende reeksen). De vraag over innovatie is de opdracht uit het hoorcollege waarbij je zelf een voorbeeld van innovatie meebrengt naar het examen en het bespreekt. <br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 25 Juni 2019 VM ===<br /> alain<br /> <br /> #vraag 1: uitleggen online (bijvraag verschil off line, in line)<br /> <br /> NIR als meetinstrument on line (waar staat de IR zelf, waarom (trillingen installatie enzo))<br /> <br /> #vraag 2: Talent management, waarom is het nuttig voor bedrijf en werknemer.<br /> <br /> verschil talent en competence<br /> <br /> #vraag 3: wat is een sustainable company, waar houdt deze rekening mee, hoe doet deze dat (people profit planet etc)<br /> <br /> jan<br /> <br /> #vraag 1: rent analyse<br /> <br /> #vraag 2: procesveiligheid. je krijgt een schema van die tank met veiligheidsmaatregelen (quenching tank enzo)<br /> <br /> waaruit komen de maatregelen voort, wat zijn de soorten maatregelen (primair, secundair)<br /> <br /> #vraag 3: energiebeleid, hoe in een bedrijf. wat zijn de pijlers van energiebeleid in europa. (geen getallen, algemeen) Artikel over benchmarking. waarom is er een limiet aan co2 vermindering? (thermodynamisch optimum)<br /> <br /> === 24 Juni 2019 VM === <br /> Deel Jan<br /> #Bespreking rentabiliteit van je businessplan: vraagt vooral hoe je NPV etc hebt berekend.<br /> #ammoniak synthese: 2 grafieken gegeven uit de slides en hiermee het effect van de temperatuur en druk uitleggen op de synthese.<br /> Uitleggen hoe de Fe katalysator wordt gereduceerd en de rol van water hierin bespreken.<br /> Uitleggen waarom de Fe katalysator zo belangrijk is voor je ammoniak synthese.<br /> #Je krijgt een artikel over energiebeleid + Waarom is energiebeleid belangrijk en bespreek de algemene pijlers voor energiebeleid in Europa in de toekomst. (Zelfde als 21/06 VM, zie bij Lauren)<br /> <br /> Deel Alain<br /> #Wat is circulaire economie en wat is het verschil met recycling economie. Geef de opportunities en threats die het oplost.<br /> #Vraag over EHSQ over energiemanagement, waarom je het moet doen en hoe, ISO 50001 uitleggen enzo, people planet profit.<br /> #Wat is het verschil tussen talentmanagement en kijken naar competenties in HR. Welke voordelen geeft het voor het bedrijf en voor de werknemer.<br /> <br /> ===21 juni 2019 voormiddag ===<br /> ALAIN: <br /> - een geïntegreerd zorgsysteem werkt volgens het principe van PDCA, leg dit uit. (EHSQ)<br /> - near IR kan gebruikt worden als online techniek voor de kwaliteit van het staal te bepalen. Alles uitleggen, online, near IR, in welke toepassing we da gezien hebben (tekening best geven) (EHSQ)<br /> - Waarom heeft een bedrijf een visie en hoe zorgen ze ervoor dat hun arbeiders dit naleven. (Strategie, visie en missie)<br /> <br /> JAN<br /> - rentabiliteit van businessplan (payback time, NPV, NPI, Depreciation en Discount rate)<br /> - wat is het verschil tussen gevaar en risico? Wat is een risicoanalyse en hoe zorgen ze ervoor dat deze correct uitgevoerd wordt? Efficiëntie van de mogelijke risico vermindering. (Occupational safety)<br /> - een artikel rond energie: bespreek de zin die aangeduid is (energie), hoe wordt er in de chemische industrie gewerkt aan energie-efficiëntie (hoofdstukken gecombineerd), bespreek de pijlers waar men in Europa in de toekomst op richt (klimaat)<br /> <br /> Apart bij een van hen: <br /> businessplan bespreken: random vragen<br /> <br /> <br /> ===25 juni 2018 namiddag===<br /> zie examen 27 juni 2017<br /> <br /> ===25 juni 2018 voormiddag===<br /> zie examen 24 juni 2017<br /> <br /> ===22 juni 2018 voormiddag===<br /> zie examen 23 juni 2017<br /> <br /> ===27 juni 2017 namiddag===<br /> #Geef de pijlers van talent management en geef enkele voorbeelden/concepten om deze pijlers te illustreren. <br /> #Ethyleenoxide<br /> ##Uit welke 4 componenten bestaat de katalysator? Hoe wordt deze katalysator gemaakt en waarom op deze manier? Wat is het effect op de samenstelling van de katalysator? <br /> ##Bespreek het mechanisme voor de vorming van ethyleenoxide (TPR-massaspectrum gegeven).<br /> ##Waarom wordt een ethyleenoxide installatie vaak gecombineerd met een ethyleenglycol installatie?<br /> #Procesveiligheid<br /> ##Bespreek de veiligheidsmaatregelen die genomen worden bij de ammoniumnitraat tank (afbeelding van de AN tank gegeven met ALLE veiligheidsmaatregelen al op getekend: primaire voor proces, primaire voor fouten en secundaire). <br /> ##Welk aanpak schuilt er achter deze maatregelen? <br /> #Rentabiliteit (ingevulde tabel gegeven)<br /> ##Hoe komt men aan de kosten/baten?<br /> ##Bespreek de afschrijvingswaarden. <br /> ##Hoe gaat men van de netto cash flow naar de geactualiseerde netto cash flow in jaar 5?<br /> ##Is het project rendabel?<br /> #Energie (heel kort artikel gegeven)<br /> ##Waarom is het verantwoord om van een veilingsysteem naar een benchmarksysteem over te schakelen?<br /> ##Wat is het energiebeleid in de chemie (staat los van het artikel)?<br /> #Innovatie: eigen voorbeeld uit het hoorcollege.<br /> <br /> ===24 juni 2017 voormiddag en namiddag===<br /> #Visie (zie andere jaren)<br /> #NH3 synthese (zie andere jaren)<br /> #Historische evolutie in arbeidsveiligheid, procesveiligheid en milieu (zie andere jaren)<br /> #Artikel over energie (zie andere jaren)<br /> #Rentabiliteit (zie andere jaren)<br /> #Innovatie (zie andere jaren)<br /> <br /> ===23 juni 2017 voormiddag en namiddag===<br /> #Wat is een zorgsysteem en wat is het nut voor een onderneming?<br /> #Risicoanalyse<br /> ##Wat is het verschil tussen risico en gevaar?<br /> ##Hoe neem je juiste risico reductie maatregelen en de kosten efficiëntie?<br /> ##Wat is een risicoanalyse en hoe wordt er gezorgd dat deze juist gemaakt wordt?<br /> #Kraken <br /> ##Waarom wordt kraken toegepast?<br /> ##Wat zijn gelijkenissen en verschillen tussen thermisch en stoomkraken?<br /> ##Waarom wordt katalytisch kraken toegepast?<br /> ##Beschrijf kraakscherpte a.h.v. figuur<br /> #Rentabiliteitsanalyse<br /> ##Hoe kom je aan kosten/baten?<br /> ##Hoe ga je van cashflow naar actuele cashflow?<br /> ##Is de onderneming rendabel?<br /> ##Leg de afschrijvingen uit<br /> #Artikel over energie-efficiëntie: <br /> ##zin in aangeduid en uitleggen<br /> ##Hoe werken chemische bedrijven mee aan energie-efficiëntie<br /> #Innovatie: oefening uit hoorcollege, breng je eigen voorbeeld mee<br /> <br /> ===23 juni 2014 voormiddag en namiddag===<br /> #Wat is een zorgsysteem? Wat is het nut ervan voor de onderneming?<br /> #Synthese van ammoniak (2 grafieken uit cursus gegeven)<br /> ##Bespreek de invloed van temperatuur, druk en reactievoering op de keuze van de omstandigheden voor de ammoniaksynthesereactie. <br /> ##Hoe wordt de katalysator geactiveerd? Wat is de rol van waterdamp hierin?<br /> ##Bespreek volgende stelling &quot;De katalysator is het hart van de ammoniakfabriek&quot;. <br /> #Bespreek de historische evolutie in het aanpakken van volgende problematieken:<br /> ##procesveiligheid<br /> ##arbeidsveiligheid<br /> ##milieu<br /> #Rentabiliteitsanalyse: Een bedrijf wil het vullen van vaten automatiseren. Hierbij komt kijken een investeringskost, een negatieve kost vanwege verminderen van energieverbruik en ontslaan van 2 werknemers, en een positieve kost vanwege sociale bijdrage. Tabel gegeven.<br /> ##Is deze investering rendabel?<br /> ##Wat is het verschil tussen de waarden in de rij 'Totale cashflow' en 'Verdisconteerde cashflow'?<br /> ##Nog een paar kleine vraagjes<br /> #Vraag over innovatie (die zelf naar het examen meegebracht moest worden)<br /> <br /> ===22 juni 2014 voormiddag en namiddag===<br /> #Waarom definieert een onderneming een visie? En hoe wordt deze nagestreefd?<br /> #kraken<br /> ##Waarom wordt er gekraakt?<br /> ##Geef de gelijkenissen en verschillen tussen thermisch kraken en stoomkraken<br /> ##Waarom werd katalytisch kraken ontwikkeld?<br /> ##Geef aan de hand van de figuur weer wat er bedoeld wordt met kraakscherpte (figuur over kraakscherpte gegeven)<br /> #Veiligheid<br /> ##Wat is een risico-analyse?<br /> ##Bespreek efficiëntie (kosten-effeciëntie/verhaal van kat en muis)<br /> #Rentabiliteit (schema en opgave gegeven)<br /> ##Hoe kom je aan de kosten/baten?<br /> ##Bespreek wettelijke afschrijvingen<br /> ##Bespreek hoe je in jaar 5 aan de actuele waarde komt.<br /> ##Is het rendabel?<br /> #energie-efficiëntie<br /> ##Artikel gegeven, bespreek daar een zin uit.<br /> ##Hoe wordt er in de chemische industrie zuinig omgegaan met energie?<br /> #innovatie: oefening uit hoorcollege.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Spectroscopie_van_biomoleculen&diff=1765 2019-06-25T15:15:06Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Dit vak wordt gegeven door Johan Hofkens en Tatjana Vogt. Het deel van Vogt is mondeling, Hofkens is schriftelijk. Je moet op beide delen minstens 4/10 halen om te slagen. Bij het herexamen kan je een vrijstelling aanvragen voor het deel dat je geslaagd bent.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 25 Juni 2019 NM===<br /> ====Voght====<br /> #NMR C11H14O2<br /> #COSY gegeven van een peptide. Wat word er weergeven, wat is de fysische theorie erachter, wat is het verschil met NOESY en wat gebeurd er als er D2O wordt gebruikt als solvent<br /> #Wat is metabolomics, hoe kan NMR hier bij helpen, geef een voorbeeld.<br /> <br /> ====Hofkens==== <br /> #Geef het Frank-Cordon energie diagram, Duid een vibrationele transitie aan en in welke tijdseenheid verloopt fluorescentie en duid dit aan.<br /> #Emissie en absoptie gegeven van SPQ, en zijn quencher bij verschillende concentraties (collisional). Bereken de Stern-Volmer consrante, de levensduur en wat gebeurd er met de levensduur als de quencherconcentratie daalt.<br /> #Extinctie coefficient, foto-elektrisch effect, Cotton-effect, TRES<br /> ===25 juni 2019 VM===<br /> <br /> ====Vogt====<br /> #NMR-spectrum(C9H10O3)<br /> #Zeeman effect + frequentie berekenen met gegevens<br /> #Fase 1 spectrum -&gt;structuur proteinen<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> Zie examen 27 juni 2018<br /> <br /> ===11 juni 2019===<br /> <br /> ====Voght====<br /> #NMR-spectrum met 1H, 13C, DEPT, IR, COSY en HETCOR gegeven (4 punten)<br /> #Verschillende types relaxatie uitleggen, waarom dit belangrijk is in 13C NMR en waarom dit belangrijk is bij structuurbepaling van proteïnen (laatste heeft te maken met de grootte, tumbling en bandverbreding) (3 punten)<br /> #Uitleggen waarom in vivo 1H en 13C NMR niet handig zijn + uitleggen waarom het wel handig is met 31P + voorbeeld geven van 31P NMR (3 punten)<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> <br /> #Je hebt een kit om een enzyme op te sporen, als het enzyme aanwezig is hydroliseert het een proteïne en zal het fluoresceren. Leg de werking van de kit en het spectrum uit. (4 punten)<br /> #Simpele oefening over FRET, fluorescentieleeftijd en afstand tussen donor en acceptor. Je had maar 2 formules uit het formularium nodig en moest die de hele tijd anders invullen. (2 punten)<br /> #4 begrippen: (4 punten)<br /> #*limiting anisotropy<br /> #*inner filter effect<br /> #*auxochrome shift<br /> #*anti-Stokes Raman<br /> <br /> ===27 juni 2018===<br /> ====Vogt====<br /> # Oefening NMR (C8H19N) IOU = 0, symmetrisch molecule met NH groep in het midden<br /> # wat is relaxatie bij cnmr spectroscopie, welke soorten en wat is het verband van relaxatie en bandverbreding<br /> # 1D en 2D spectroscopie en proteïn ligand binding uitleggen (zowel fast als slow), uitleggen hoe je bepaald waar de binding van het ligand plaatsvind en hoe je de bindingsconstanten kan bepalen adv NMR<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # 3 molecules met vibraties gegeven. zeggen wat de voorwaarde zijn voor IR en raman spectroscopie. zeggen welke structuren IR actief zijn. zeggen welke structuren raman actief zijn en raman en Ir aanduiden op een jablonski diagram<br /> #* oefening over fret, gegeven zijn intensiteit gebonden en ongebonden en R0. bepalen van efficientie FRET, bepaal R, wat is de intensiteit van het molecule indien de afstand kleiner is.<br /> # Begrippen: excitatie spectrum, perrin vgl, balmer reeks, transitiedipoolmoment<br /> <br /> ===26 juni 2018===<br /> ====Vogt====<br /> # Oefening NMR (C11H14O2) - benzeenring met para 2 substituenten: eerste substituent COOH en tweede substituent C met 3 gebonden CH3<br /> # Figuur van slow en fast exchange limit uitleggen + waarom zijn spectra temperatuursafhankelijk + wat is de coalescentie temperatuur + bereken de exchange rate (k) voor de coalescentie temperatuur<br /> # Fase 1 van spectrum naar structuur uitleggen, welke NMR worden daar gebruikt en wat kom je te weten + wat is het grootste probleem bij grote proteinen om een NMR te bekomen<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Je hebt een hypothetisch lineair molecule AB2 gegeven, maar de Lewisstructuur hiervan is onbekend. M.a.w. je weet niet of het ABB is of BAB. <br /> #* Hoeveel vibratiemodes zijn er voor elke structuur?<br /> #* Op het IR-spectrum zijn pieken te zien die overeenkomen met drie normale vibratiesmodes. Welke structuur is het (BAB of ABB) en waarom? <br /> #* In IR ligt de piek voor H2O op 3560 cm-1, veronderstel dat de krachtconstante gelijk is. Bereken de frequentie van de rekking van D2O (zwaar water)? <br /> # Oefening 5 van oefenzitting 4 met volgende gegevens: IgG bindt aan de kleurstof Fluorescein. Concentraties zijn 0, 1*10^(-5), overmaat voor IgG; drie keer 4*10^(-7) voor Fluorescein en P = 0.03, 0.1450 en 0.3913. De formule voor Kd is gegeven. <br /> #* bereken Kd als de extinctiecoëfficiënt en het kwantumrendement niet verstoord worden door de binding.<br /> #* het kwantumrendement halveert bij de binding, wat gaat er gebeuren met de fractie Fluorescein in complex.<br /> #* hoe bepaalt men of de extinctiecoëfficiënt en/of het kwantumrendement verandert bij de binding?<br /> # Begrippen: inner filter effect, limiting anisotropy, auxochroom effect, TCSPC<br /> <br /> ===18 juni 2018===<br /> ====Vogt====<br /> # Oefening met NMR (C9H10O3 - benzeenring met aldehyde en 2 keer O-CH3 gesubsidieerd) + verklaar plaats van substitutie<br /> # 31P NMR vergelijken met 1H NMR en 13C NMR. <br /> #*Waarom gebruik je P-NMR hier. <br /> #*Hoe is de sensitiviteit van de 3 NMR's en welke is hier het beste + wat zijn de algemene factoren die sensitiviteit bepalen<br /> #* Welke NMR gebruik je om deze reactie te bestuderen en waarom? <br /> #* Hoe zou je de aanwezige concentratie water berekenen in deze vergelijking<br /> #* Hoe zou je de omzettingsratio van de producten naar reagentia berekenen<br /> #Leg uit waarom SAR by NMR een veelgebruikte techniek is voor de ontwikkelen van medicatie en leg werking uit<br /> #* Leg uit wat de vereiste zijn van SAR<br /> #* Leg uit wat voor-en nadelen zijn van SAR<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Teken een Frank-Condon energiediagram van een hypothetisch molecule in grondtoestand en geëxciteerde toestand. Benoem S0 en S1 op de figuur.<br /> #* Teken een vibratiobele overgang<br /> #* Teken een vibrationele excitatie in de elektrisch aangeslagen toestand<br /> #* Wat is de tijdschaal van fluorescerende en teken dit<br /> <br /> # Oefening over Stern-Volmer en quenchen instantende met volgende gegevens: unquenched lifetime is 26.3 ns. Concentratie Cl- (in mM) bedraagt 0-5-15-50 met bijhorende Intensiteiten 1-0.6-0.35 .15.Ook nog een grafiek gegeven van het molecule SPQ dat gequenched wordt met Cl- (grafiek toont intensiteit over golflengte bij verschillende (bovenstaande) concentraties<br /> #* Bereken de quenchingconstante en teken de Stern-Volmer plot<br /> #* In bloed bedraagt de concentratie van het aanwezige Cl- 103mM. Wat is de fluorescente leeftijd en fluorescerente intensiteit van het SPQ in het bloed.<br /> #* Wat gebeurt er met de leeftijd als de concentratie Cl- daalt?<br /> # Woordjes - max 1/2 blad uitleg per woord + verduidelijk eventueel met een figuur<br /> #* TRES<br /> #* Foto-elektrisch effect<br /> #* Cotton- effect<br /> #* Extinctie coëfficiënt<br /> <br /> ===6 september 2017===<br /> ====Vogt====<br /> # oefening met NMR (C9H10O3)<br /> # spin spin coupeling, uitleggen aan de hand van voorbeeldmolecule en beschrijven hoe het signaal van ieder proton gesplits zal worden.<br /> # SAR methode bij het ontwikkelen van medicijnen. interactie ligand-proteine enzo uitleggen.<br /> ====Hofkens====<br /> # (4pt) Spectra gegeven van Chryseen. Duid aan welk spectrum absorptie, fluorescentie en fosforescentie toont. De vervaltijd in regio 360-400nm is 10x kleiner dan die in de regio 500-600nm, leg uit waarom.Beschrijf alle waarnemingen van de spectra aan de hand van de geziene leerstof.<br /> # (2pt) L-opstelling voor meting anisotropie, in propyleenglycol bij 233K ofzoiets. Gegeven Ivh, Ivv, Ihh en Ihv. Bereken de werkelijke anisotropie bij verticale excitatie. Hoe groot is de fout die je maakt als je niet corrigeert? Wat is de hoek tussen de excitatie en het emissie dipoolmoment? Stel dat we bij 293K werken en in ethanol, kunnen we de hoek dan nog steeds bepalen? wat gebeurt er met de anisotropie?<br /> # (4pt) Woordjes<br /> #* Foto-elektrisch effect<br /> #* FRET<br /> #* Single Photon Timing<br /> #* Cottoneffect<br /> <br /> === 28 juni 2017===<br /> ====Vogt====<br /> # oefening spectrum NMR<br /> # COSY spectrum gegeven van molecule. Wijs elke functionele groep toe in het spectrum en leg uit waarom. Vertel de werking van COSY.<br /> # Bespreek de drie fasen voor de structuurbepaling van proteïnen via NMR<br /> ==== Hofkens ====<br /> # Gegeven is een simpele tekening van een hairpinstuctuur met donor en acceptor, deze is in evenwicht met zijn twee conformaties. De leeftijd van de donor in vrije oplossing is 10ns en acceptor is 2ns. Als de donor aan de hairpin hangt zien we een bi-exponentieel verval van 5ns en 1ns mer respectievelijk 95% en 5%. verklaar waarnemingen, bespreek de leeftijd van de acceptor in beide conformaties.<br /> # Gegeven is die tekening vanuit de cursus over FMN en YMN en tabel met hoek teta. In tabel ook nog anisotropiewaarde van complex en zonder complex, alfa en de concentraie van FMN is niet gegeven. Bereken dissociatieconstante en verklaar de grafiek van die anisotropie. <br /> # Woordjes:<br /> #* Transitiedipoolmoment<br /> #* Balmerreeks<br /> #* Excitatiespectrum<br /> #* Perrin vergelijking<br /> <br /> ===27 juni 2017===<br /> ====Vogt====<br /> # H en C spectrum<br /> # NOE<br /> # fase 1 uitleggen van die fase 3 shit + probleem grote moleculen <br /> ====Hofkens====<br /> # grafiek zoals in cursus van Eosin en Erytrosin (maar andere kleurstoffen). Alles bespreken wat je ziet. Tau en Q gegeven, bereken radioactieve en niet radiatieve snelheidsconstante. Als R= een of andere groep, waarom is dan de Tau en Q groter? En zou dit koppel een goed FRET paar zijn?<br /> # anisotropie is 0,3 maar door scattering laat de filter 20% door, wat is de gemeten anisotropie<br /> # woordjes: <br /> #* foto-elektrisch effect<br /> #* extinctie coefficient<br /> #* TRES<br /> #* cotton effect<br /> <br /> ===19 juni 2017===<br /> ====Vogt:====<br /> # zeeman effect<br /> # H/C spectrum<br /> # in vivo nmr<br /> ====Hofkens====<br /> # da van die even en oneven aantal dubbele bindingen en het effect daarvan op de golflengte, met cyanine en azocyanine.<br /> # oef 5 van oefenzitting 4 denk ik (zoals vorig examen)<br /> # woordjes: <br /> #* Ro<br /> #* Dynamic quenching<br /> #* fluorescence quantum yield<br /> #* resonance <br /> #* Raman scattering<br /> <br /> ===13 juni 2017===<br /> ====Vogt====<br /> # H- en IR spectrum gegeven van C11H14O2<br /> # vraag2 <br /> #* 2 soorten relaxatie, leg uit<br /> #* hoe beinvloeden deze het C-NMR<br /> #* weet ik ook niet meer<br /> # 1D en 2D NMR spectra: <br /> #* verschillen, voor - en nadelen geven. <br /> #* Kan je er ligand proteine bindingen mee onderzoeken? <br /> #* hoe ziet men dit? <br /> #* kan men zien aan met welk aminozuur de binding gebeurt? (Alles zowel voor slow- als fast exchange)<br /> ====Hofkens====<br /> # membraanfusie experiment: gegeven structuur lipide met pyreen aan, fuseert met zelfde lipide zonder pyreen, absorptie spectra pyreen gegeven (voor de fusie). Hoe verandert het absorptie- en emissiespectra doorheen het experiment? Leg uit adhv zelf gemaakte tekeningen (grafieken).<br /> # Oefening: zoals oefening 5 van oefenzitting 4<br /> # 4 termen: <br /> #* anti stokes <br /> #* ramanscattering<br /> #* emissiespectra<br /> #* statische quencher<br /> #* laatste weet ik niet meer<br /> <br /> ===7 juni 2016===<br /> ====Vogt====<br /> # H- en C-spectrum, structuur afleiden.<br /> # Je krijgt spintoestanden<br /> #* Geef het aantal mogelijke spin oriëntaties en geef het weer op een grafische manier. <br /> #* Hoe wordt dit effect genoemd? Is de electronen verdeling gelijk tussen 2 toestanden? <br /> #* Welke factoren beïnvloeden deze indeling? <br /> #* Wat kun je hieraan doen om NMR spectroscopie efficiënter te maken?<br /> # Leg in vivo H- en C-NMR spectroscopie uit, integreer een voorbeeld in je uitleg. <br /> #* Waarom wordt dit niet veel gebruikt? <br /> #* P-NMR is wel nuttig in vivo, waarom? <br /> #* Geef een voorbeeld waarin deze techniek gebruikt kan worden.<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Tekening met DNA-hairpin in open- en gesloten vorm. Aan uiteinde hangt een donor en acceptor. Donor vrij heeft leeftijd van 10 ns, acceptor vrij een leeftijd van 2 ns. Wanneer de leeftijd van de donor wordt gemeten (in de gesloten vorm) bekomen ze een bi-exponentiele verdeling voor de leeftijd: 5 ns 95% en 1 ns 5%. <br /> #* Verklaar de resultaten. <br /> #* Geef de leeftijd van de gesloten- en de open DNA-hairpin vorm. <br /> #* Wat zal de leeftijd van de acceptor zijn in de open vorm, en wat in de gesloten DNA-hairpin vorm?<br /> # Tekening van anisotropie gegeven (uit cursus met 2x10-2M en 2x10^-5M). Verklaar de tekening aan de hand van de gezienen leerstof.<br /> # Bespreek kort maar juist (1/2bladzijde max) <br /> #* foto-effect <br /> #* Balmer-reeks <br /> #* ... <br /> #* transitiedipoolmoment.<br /> <br /> ===23 juni 2015===<br /> ====Vogt====<br /> # H- en C-spectrum<br /> # Slow en fast exchange uitleggen (waarom een spectrum bij hoge T slechts 1 signaal meer geeft i.p.v. 2) en de exchange constant berekenen.<br /> # Hoe kan IR-Spectroscopy gebruikt worden om:<br /> #* kwantitatief de concentratie van een staal te bepalen.<br /> #* kwalitatief proteine structuur te bepalen.<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Gegeven een absorptiespectrum van verschillende kleurstoffen (steeds met een groter geconjungeerd systeem) verklaar alle waarnemingen, teken het fluorescentie spectrum van 2 van de stoffen, de quantumyield van kleurstof 1 is 0.9 hoe zal deze evolueren naarmate het molecule groter wordt?<br /> # Atoommodel van Bohr uitleggen en op het belang voor de spectroscopie wijzen.<br /> # Begrippen: <br /> #* Cotton-effect<br /> #* Inner filter effect<br /> #* R0 <br /> #* Excimeer<br /> <br /> ===15 juni 2015===<br /> ====Vogt====<br /> # H-spectrum+ IR-spectrum<br /> # uitleg verdeling tussen de 2 spintoestanden. hoe onstaat deze verdeling en hoe kan je ze beïnvloeden.<br /> # Leg uit de voor- en nadelen van 1D en 2D spectra en kan men aan de hand hiervan de ligand-proteïne interactie volgen. b. Kan je de snelheidsconstante K berekenen aan de hand van deze spectra? (zowel slow als fast exchange) c. kan je zien waar het ligand bind aan het proteïne? (zowel slow als fastexchange)<br /> ====Hofkens====<br /> # twee prentjes van twee membranen. Eerst een eximeer daarna niet meer. Het gaat over membraanfusie. Geef de absorptie-en emissiespectra van beide toestanden. Wat leert men hieruit over membraanfusie?(af te leiden uit prentjes)<br /> # hoe kan men de transitieconstante berekenen?<br /> # woordjes: <br /> #* limiterende anisotropie<br /> #* cotton effect<br /> #* inner filter effect<br /> #* statische quenching<br /> <br /> ===17 juni 2013===<br /> ====Vogt====<br /> # simpele oefening over een C9H10O3 spectrum, bij mondeling vroeg ze waarom dat een doublet of triplet of multiplet was.<br /> # verschillende COSY spectra matchen met verschillende aminozuren<br /> # welke NMR-technieken kunnen worden gebruikt om ligand-proteïne interacties te onderzoeken. Bijvraag ging over SAR, welke stappen enzo.. ook uitleggen dat die interactie snel of traag kan gebeuren.<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # oefening; gegeven tau-waarden en p waarden. Hieruit P0, de rotationele correlatietijd en nog iets berekenen.<br /> # het atoommodel van bohr uit de doeken doen, postulaten, formules,.. en de link leggen met de spectroscopy van vandaag.<br /> # begrippen uitleggen: <br /> #* R0<br /> #* cotton effect<br /> #* inner filter effect<br /> #* excimeer<br /> <br /> ===10 juni 2013===<br /> ====Tatjana====<br /> # Oefening waarbij H en C spectrum gegeven werden<br /> # IR spectroscopie:<br /> #* is de amide band I de enige bruikbare band voor het bepalen van de secundaire structuur van eiwitten of zijn er nog?<br /> #* Verklaring geven voor de verschillende waarde van de amide piek bij alfa helix of b sheet.<br /> #* Vaak ziet men 1 grote band en niet de verschillende pieken binnen de amide I band, hoe lost men dit op?<br /> #* Is IR zo ook een kwantitatieve methode voor de bepaling van de secundaire structuur?<br /> # Bespreek HSQC in verband met studies van proteïnen.<br /> ====Hofkens====<br /> # oefening met 2 spectra gegeven van anisotropie-verval in de tijd van hetzelfde FP molecule. Het ene spectrum was bij lage concentratie FP, het andere bij hoge concentratie FP. Bij beiden werd het verval gemeten bij verschillende viscositeit en weergegeven in het spectrum (dus 5 vervalcurves in elk spectrum).<br /> #* Verklaar de resultaten.<br /> #* Wat kom je hierdoor te weten over het FP?<br /> #* Bespreek in detail de meettechniek hoe men aan deze spectra komt. (4punten)<br /> # Bespreek het foto-elektrisch effect van Einstein. Waarom is dit belangrijk voor spectroscopie? (2punten)<br /> # Leg de volgende begrippen uit (max 1 blz per begrip) (4 punten):<br /> #* circulair dichroïsme<br /> #* magic angle<br /> #* fosforescentie <br /> #* J-aggregaat<br /> <br /> ===30 jun 2011===<br /> ====Tatjana====<br /> # H-NMR en IR spectrum van C14H14 gegeven. (Het was 1,2-difenylethaan als structuur)<br /> # Wat is NOE? Bereken de maximum signaalversterking bij 1H en 15N wanneer 15N de onderzochte kern is (gamma's gegeven).<br /> # Bespreek kort de 3 fasen waarin men m.b.v. NMR de structuur van proteinen kan bepalen.<br /> ====Hofkens====<br /> # Bij het meten van lifetimes zijn er vaak problemen met depolarisatie. Hoe los je dit anisotropieprobleem op. Verwerk de formule van anisotropie in je antwoord (6 punten).<br /> # Gegeven zijn gegevens van een quenching experiment. Je moest een Stern-volmer ervan maken. Verschillende quenchingconstanten berekenen. (Super moeilijke oefening !)<br /> # Oefening over Raman (Stokes en anti-Stokes): (2 punten)<br /> #* exciterende laserfrequenties en een paar spectrumwaarden gegeven<br /> #* en dan een paar vraagjes waar je frequenties of golflengtes moest berekenen.<br /> <br /> ===21 jun 2011===<br /> ====Tatjana====<br /> # H-NMR en IR spectrum van C11H14O2 gegeven.<br /> # Vijf kernen (12C, 14N, 17O, 31P en 51V) met hun I-waarde (totale spin van de kern) gegeven.<br /> #* Geef het aantal mogelijke spinoriëntaties van elke kern en stel grafisch voor.<br /> #* Wat is de frequentie van een signaal van een 31P-kern bij een magneetveld van 1 Tesla? (gamma, constante van Planck, pi en abundantie gegeven)<br /> #* Zelfde vraag en zelfde gegevens, maar dan voor 51V.<br /> #* Bij welk van beide kernen (31P en 51V) verwacht je onder dezelfde condities (concentratie, magneetveldsterkte) de hoogste S/N ratio?<br /> # Welke NMR methoden kan je gebruiken om de binding van een klein ligand aan een proteïne te bestuderen? Hou rekening met het verschil tussen trage en snelle uitwisseling ten opzichte van de NMR-tijdschaal.<br /> <br /> ====Hofkens====<br /> # Gegeven was een structuur (twee naftaleenmoleculen gekoppeld via een linker) en het bijhorende emissiespectrum met 3 pieken (opgenomen bij -60°C). De eerste piek had een fluorescentieverval van 2 ns, de middelste een bi-exponentieel verval en de laatste een verval van 12000 ns. Een concentratieverhoging heeft geen invloed op de vorm van het spectrum, maar wel op de intensiteit. Verklaar alle waarnemingen mbv Jablonski-energiediagram. Schat ook de golflengte bij max. absorptie mbv van de Woodward-Fieser-Scott regels en teken het absorptiespectrum. (6 punten)<br /> # Gegeven zijn twee structuren met als enige verschil de plaats van één dubbele binding (waardoor die binding bij de ene structuur geconjugeerd is en bij de andere niet). Je mag geen gebruik maken van de Woodward-Fieser-Scott regels om lambda max te bepalen, maar je hebt wel een UV-VIS absorptiemeter ter beschikking. Hoe kan je die gebruiken om beide stoffen te onderscheiden? (2 punten)<br /> # Oefening over Raman (Stokes en anti-Stokes): exciterende laserfrequenties en een paar spectrumwaarden gegeven, en dan een paar vraagjes waar je frequenties of golflengtes moest berekenen. (2 punten)<br /> <br /> ===17 jun 2011===<br /> ====Tatjana====<br /> # H- en C- NMRspectrum geven, C9H10O3. Mondelinge bijvragen:<br /> #* Waarom is die piek bv een triplet?<br /> #* Wat is er belangrijk voor het solvent voor NMR?<br /> # Bij een NMR meting met een toestel van 60MHz is het ligt de piek van CH3NO2 op 259.8 Hz van de referentiestof.<br /> #* bereken de chemische shift bij 60MHz<br /> #* op welke afstand zou de piek liggen bij 500MHz<br /> #* bereken de chemische shift bij 500MHz<br /> #* bijvraag: Waarom is de chemische shift belangrijk<br /> # Hoe kan je IR-spectrometrie gebruiken om info over de secundaire structuur van een proteïne te bekomen? Voor welk type van proteïnen is deze methode vooral bruikbaar?<br /> ====Hofkens:====<br /> # Gegeven was een schema van een natriumlamp. De lamp werkt als volgt: als er spanning gezet wordt over de lamp, wordt het ontspanningsgas(neon) geioniseerd. Bij botsing van dit geioniseerd gas met het natrium-kwik amalgaam komt natrium vrij. Zo wordt een lage natrium druk gecreeerd. Typisch voor zo'n lamp is de oranje kleur(zoals op de autosnelweg). Die kleur wordt veroorzaakt door het natrium. Verklaar dit aan de hand van concepten uit de cursus. Als de lamp net aangestoken is, is kleur niet oranje, maar roodachtig, verklaar. Een andere versie van zo'n lamp werkt met een hoge natrium druk, dit soort lampen geeft een wit-gele kleur. Verklaar dit aan de hand van concepten uit de cursus.(6 punten)<br /> # Geef een bondige uitleg voor volgend begrippen(5 zinnen) met indien nodig een wiskundige uitdrukking(2 punten)<br /> #* Extinctiecoefficient<br /> #* Woodward-Fieser-Scott-regels<br /> #* Lambert-Beer<br /> #* Fluorescentie quenching<br /> # oef(2 punten) Gegeven is dat HBr een band geeft bij 2558 cm^-1.<br /> #* bereken de golflengte<br /> #* je krijgt de uitdrukking van een veer(die met Mred) en gevraagt: bereken welke band DBr zal geven.(gegeven zijn m van H, D en Br en getal van Avogadro)<br /> <br /> ===15 jun 2010===<br /> ====Tatjana====<br /> # H- en IR- spectrum geven, C4H9Br. Mondelinge bijvragen:<br /> #* Wat moet normaal de opsplitsing zijn van dit multiplet?<br /> #* Is het IR-spectrum hier nuttig?<br /> # Wat is NOE? Bereken de maximum signaalversterking bij 1H en 31P wanneer 31P de onderzochte kern is (gamma's gegeven).<br /> # Welke NMR methode kan je gebruiken om een KWANTITATIEVE analyse te maken van protein-ligand binding? Hou rekening met snelle en trage uitwisseling.<br /> <br /> ===18 jun 2009===<br /> ====Tatjana====<br /> # H en C - NMR gegeven. Structuur? C14H14.<br /> # Gegeven: 12C (I=0), 14N (I=1), 17O (I=5/2), 31P (I=1/2).<br /> #* Hoeveel spinoriëntaties zijn er in een magnetisch veld? Stel grafisch voor.<br /> #* 31P in magneetveld van 1 Tesla. Bij welke frequentie moet je 31P meten? h, gamma en pi gegeven.<br /> # Hoe kan je IR-spectrometrie gebruiken om info over de secundaire structuur van een proteïne te bekomen? Voor welk type van proteïnen is deze methode vooral bruikbaar?<br /> <br /> ===16 jun 2008===<br /> ====Tatjana====<br /> # Bespreek de drie fasen voor de structuurbepaling van proteïnen via NMR<br /> # 3 COSY's gegeven, 6 AZ. Ken de 3 COSY's toe en leg uit waarom<br /> # H-NMR en IR-spectrum gegeven. Geef structuur (butylethanoaat (en geen methylpentanoaat!))<br /> <br /> ===13 jun 2008===<br /> ====Tatjana====<br /> # H en C spectrum van een molecule<br /> # Je krijgt lysine en zijn H en C chemische shift waarden, teken DEPT, H-H COSY en C-H HSQC<br /> # hoe kan je de binding van een ligand aan een proteïne bestuderen? Hou rekening met snelle en trage uitwisseling<br /> <br /> ===11 jun 2008===<br /> ====Tatjana====<br /> # Je hebt een oplossing vitamine C (structuur gegeven). Bespreek hoe je met IR-spectroscopie de concentratie van de oplossing kunt bepalen.<br /> # Geef het aantal verschillende spintoestanden van 12C (I=0),31P (I=1/2), 14N (I=1), 17O (I=5/2) en stel grafisch voor.<br /> # Bereken frequentie (B0, gamma, h en pi gegeven) voor 31P<br /> <br /> ===27 jun 2007===<br /> ====Tatjana====<br /> # Oefening, aromatische ring, twee O-CH3 en een keton erop<br /> # Je kreeg een molecule en ge moest daar de zo'n dynamische interactie bespreken, van draaiing rond een binding (met slow exchange, coalescentie en fast exchange) en dan moest je de uitwisselingssnelheid bij coalescentie berekenen.<br /> # Toepassing van IR op biomoleculen<br /> <br /> ===23 jun 2007===<br /> ====Tatjana====<br /> # Basic oefeningske<br /> # De NH2 groep stretcht permanent bij een frequentie van 1013 Hz. hierdoor heeft deze N-H verschillende bindingslengtes. Ga na of de individuele bindingslengtes kunnen gedetecteerd worden op een NMR-instrument van a) 250 MHZ en b) 900 MHz.<br /> # Wat is HSQC en hoe kan deze techniek bijdragen bij het onderzoek van eiwitten<br /> <br /> ===21 jun 2007===<br /> ====Tatjana====<br /> # Je kreeg een tekening van een benzeenring met daar een groep boven en ge moest de upfield en downfield effecten bespreken van die groep en die van de benzeenring.<br /> # Hoe is NMR belangrijk voor SAR en ook SAR bespreken<br /> # Een oefening met een symmetrische aromatische ring en een carboonzuur en een ester daar ergens in.<br /> <br /> ===18 jun 2007===<br /> ====Tatjana====<br /> # Oefening: Nen C4H9Br, gewoon, H spectrum en (nutteloos) IR gegeven, en ge moet de structuur geven (twas gewoon lineair, dus best wel 'makkelijk&quot;)<br /> # Theorie:<br /> #* H @ 60MHz, zelfde toestel P @ ? MHz??? De 'gamma' van H en P was gegeven<br /> # In vivo NMR, bespreek, leg uit,...</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Oncobiologie&diff=1748 2019-06-21T13:21:18Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Samen met biologie, minor verbreding<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===21 juni 2019 NM===<br /> #Geef de 10 hallmarks en geef een voorbeeld van een geneesmiddel (niet perse merknamen gewoon algemeen)<br /> #Wat is metastase en welke factoren spelen er een rol?<br /> #Hoe kunnen tumorcellen het immuunsysteem ontsnappen?<br /> #Stellingen, waar of niet waar:<br /> #* Kankercellen kunnen resistent worden tegen CAR Tcellen<br /> #* BCL2 overexpressie is gunstig voor de kankercellen<br /> #* Kankercellen kunnen geen dubble strand DNA breaks herstellen<br /> #* De VEGF receptor kan worden uitgeschakeld met antibodies<br /> <br /> ===21 juni 2019 VM===<br /> # A) Geef de 10 hallmarks; B) Geef aan welke hallmarks belangrijk zijn voor initiatie van kanker (max 1 blz)<br /> # Leg genomic instability uit en geef de link met kanker (max 2 blz)<br /> # A) Leg apoptose uit en geef de link met kanker; B) Welke hallmarks kun je nog linken aan apoptose (max 2 blz)<br /> # Stellingen:<br /> #* VEGF zorgt voor generatie van stalk cellen<br /> #* kankercellen kunnen resistent worden t.o.v. tyrosine kinase inhibitors<br /> #* CAR T-cells kunnen de groei van kankercellen stimuleren<br /> #* Nog 2 andere <br /> <br /> ===22 juni 2018 NM===<br /> Schriftelijk:<br /> # Geef de 10 hallmarks + geef een voorbeeld bij elke hallmark (met één regel plaats per voorbeeld)<br /> # 5 stelling: waar of niet waar + verklaar:<br /> #* BCL2 inactivatie is nodig voor een kankercel<br /> #* Tyrosine kinase kan geactiveerd worden door een deletie van enkele aminozuren<br /> #* Chromosomale translocatie kan een verandering in genexpressie meegeven<br /> #* F notch beïnvloedt de richting van angiogenese<br /> #* Glutamine wordt gebruikt om energie te maken<br /> Mondeling (met schriftelijke voorbereiding):<br /> # VEGF behandelingen uitleggen (leg 3 therapies uit + wat zijn de gevolgen).<br /> # Hoe gaat een kankercel het immuunsysteem ontwijken?<br /> <br /> ===22 juni 2018 VM===<br /> Schriftelijk:<br /> # Geef de 10 hallmarks + geef een voorbeeld bij elke hallmark (met voorbeeld bedoelt hij hoe je kan zien dat een kankercel aan deze hallmark voldoet (bv. bij apoptose: p53 mutatie of bij deregulering energie metabolisme: aerobe glycolyse))<br /> # 5 stelling: waar of niet waar + verklaar:<br /> #* Deletion of BAX is beneficial to cancer cells.<br /> #* All cells can become cancer cells.<br /> #* Chromosomal translocation can inactivate genes.<br /> #* Cancer cells can induce apoptosis of immune cells.<br /> #* VEGF assists metastasis.<br /> Mondeling (met schriftelijke voorbereiding):<br /> # Wat is target cancer therapy en geef hier drie voorbeelden van.<br /> # Wat is genomic instability en wat is de relatie met kankerontwikkeling.<br /> <br /> ===16/06/2016 NM===<br /> Mondeling:<br /> #4 stellingen:<br /> #*De inactivatie van BCL2 is belangrijk voor kankercellen<br /> #*Voor kankerstamcelonderzoek is het essentieel te werken op immunodeficiente muizen<br /> #*Het Wahrung effect geeft aan dat er meer cytokine wordt geproduceerd<br /> #*PARP-inhibitoren kunnen gebruikt worden tegen alle kankers<br /> #Wat zijn de mogelijke therapieën voor het omzeilde immuunsysteem bij kankers?<br /> Schriftelijk:<br /> # Leg angiogenese uit, wat doet kanker hiermee? Wat zijn de mogelijke therapieën?<br /> # Geef de 10 hallmarks + voorbeeld van een mogelijke therapie<br /> <br /> ===16/06/2016 VM===<br /> Mondeling:<br /> #Leg de link tss apoptose en cellen die het imuunsysteem ontwijken.<br /> #J/F vragen + verklaren<br /> #*Tyrosine kinasen zijn belangrijk voor angiogenese<br /> #*CAR-T-cellen zijn belangrijk voor inflammation<br /> #*Kanker wordt veroorzaakt door mutaties in stamcellen<br /> #*Een IDH1 mutatie heeft een effect op het genoom<br /> Schirftelijk:<br /> #Leg genome instability volledig uit.<br /> #Geef de '10 hallmarks of cancer' met telkens een kort VB<br /> ===22/06/2015===<br /> #Geef de '10 hallmarks of cancer' met telkens een specifiek voorbeeld (heel kort, voorbeeld in 1 zin)<br /> #Wat weet je over het metabolisme van de cel? Leg de link met kanker.<br /> #Leg uit (in max een halve pagina): BAX, VEGF, hoe kunnen kankercellen het aan het immuunsysteem ontsnappen?<br /> ===18/06/2015===<br /> #Geef de 10 hallmarks van kanker en illustreer met een kort voorbeeld.<br /> #Leg hallmark angiogenese uit en hoe kan men dit behandelen in kankers.<br /> #woordjes: p53, FASS, exome sequencing, double stranded breaks<br /> <br /> ===05/06/2015===<br /> #Geef de 10 hallmarks van kanker, en illustreer met een kort voorbeeld<br /> #Leg uit: Tyrosine-kinase en hoe dit meehelpt bij de ontwikkeling van kanker. Geef 2 voorbeelden om tyrosine kinasen te inhiberen<br /> #Deel van de afbeelding van DNA Damage Repair: Leg uit, en hoe kan dit leiden tot de ontwikkeling van kanker<br /> #Verrassingsvraag over een research article op het mondeling zelf: Afbeelding van Collecting Lymphatic Vessels. Leg deze figuur kort uit, hoe hebben we dit besproken in de les, wat heeft het te maken met kankerontwikkeling etc.<br /> ===16/06/2014===<br /> #Geef de 10 hallmarks van kanker, illustreer aan de hand van een voorbeeld<br /> #Leg een hallmark volledig uit<br /> #korte bijvraagjes: p53, VEGF, wat is fullgenome secquencing, hoe repareert het dna een dubbelstrengsbreuk (homologe en niet homologe end-repair, weten da als homologie wegvalt der door niet-homologe dus veel mutaties ontstaan), 5e bennek ff kwijt. hij vroeg mij bij p53 en VEGF specifiek wat voor soort eiwitten en voor VEGF wat voor soort receptor (transcriptiefactor van pro-apoptotische genen dus, en een tyrosinekinase receptor)<br /> ===16/06/2014===<br /> #Geef de 10 hallmarks van kanker, illustreer aan de hand van een voorbeeld<br /> #Leg een hallmark volledig uit (vb. wat is angiogenese en breng het in verband met kankerontwikkeling)<br /> #Figuur of meer gerichte vraag die je moet uitleggen/beantwoorden<br /> Alle aanwezigen op het examen kregen andere hallmarks en figuren om uit te leggen. Er waren geen twee examens exact hetzelfde.<br /> ===17/06/2013===<br /> #Geef de 10 hallmarks van kanker, illustreer elke hallmark met een voorbeeld<br /> #juist of fout:<br /> #*Door RNA sequencing kan je mutaties in genen en fusiegenen ontdekken<br /> #*In een tumor zijn slechts weinig stamcellen aanwezig<br /> #*nog2<br /> #tekening van metastase gegeven, uitleggen en gevolgen voor de progressie van de tumor uitleggen.<br /> #Geef de oorzaken van kanker. Illustreer met voorbeelden en geef 2 mogelijke therapieën (proliferatie, angiogenese, apoptose, mutatie-repair systeem beschadigen, ...)<br /> #Leg second generation sequencing uit. Hoe kunnen de resultaten gecontroleerd worden?</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Vergelijkende_Ontwikkelingsbiologie&diff=1701 2019-06-14T15:12:20Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen juni */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> Vergelijkende ontwikkelingsbiologie behoort tot de opleiding Biologie en behoort tot de minoren biologie en verbreding (sinds 2018-2019). Het wordt gedoceerd door prof. E. Seuntjes. <br /> Het vak behandelt de ontwikkeling van verschillende embryo's van verschillende organismen (muis, kip, kikker en mens). Er worden practica sessies gegeven, met een eindexamen voor de quotering (5/20). Om te slagen voor het vak moet minstens de helft worden behaalt op het practicumexamen. Een paperopdracht met vragenlijst telt mee voor 1/20. Het theoretisch examen telt dus mee voor 14/20.<br /> <br /> ==Examenvragen juni==<br /> <br /> === 14/06/2019 NM ===<br /> # Meroblastische klieving, spermiogenese, nog een waar ik niet op kom.<br /> # Leg de eigenschappen van een organizer uit aan de hand van de experimenten van Spemann en Manngolg.<br /> # Experiment bij nierontwikkeling, wat hebben Ret en GNDF met de nierontwikkeling te maken?<br /> # Wat zijn de mogelijke moleculaire en morfologische eigenschappen van anencephalie (het ontbreken van hersenen).<br /> <br /> === 11/06/2019 NM ===<br /> # Termen: Resact, angiogenese, neoblasten.<br /> # Leg de gastrulatie bij de kip uit en vergelijk met de mens.<br /> # Leg inducer en competentie uit adhv de oogontwikkeling en onderstaand experiment (dat waarbij ze optische vesikel wegnamen en transplanteerde). (oogontwikkeling moet niet volledig worden uitgetekend, gewoon algemeen).<br /> # Wat is het verschil tussen een eeneiïge en Siamese tweeling? Leg dit uit adhv de ontstaansmechanismen.<br /> <br /> === 11/06/2019 VM === <br /> # Termen: morphallaxis, pronefros, midblastula transitie.<br /> # Hoe zorgt de zee-egel voor soort-specifieke fertilisatie? <br /> # Experiment BMP en medial hinge point, neurulatie en BMP signaling uitleggen.<br /> # Experiment Gurdon + vervolg experiment ivm iPS. Wat is het verband tussen de 2, leg beide experimenten uit, wat zijn toepassingen van iPS?</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Vergelijkende_Ontwikkelingsbiologie&diff=1694 2019-06-13T17:53:59Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen juni */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> Vergelijkende ontwikkelingsbiologie behoort tot de opleiding Biologie en behoort tot de minoren biologie en verbreding (sinds 2018-2019). Het wordt gedoceerd door prof. E. Seuntjes. <br /> Het vak behandelt de ontwikkeling van verschillende embryo's van verschillende organismen (muis, kip, kikker en mens). Er worden practica sessies gegeven, met een eindexamen voor de quotering (5/20). Om te slagen voor het vak moet minstens de helft worden behaalt op het practicumexamen. Een paperopdracht met vragenlijst telt mee voor 1/20. Het theoretisch examen telt dus mee voor 14/20.<br /> <br /> ==Examenvragen juni==<br /> <br /> === 11/06/2019 NM ===<br /> # Termen: Resact, angiogenese, neoblasten.<br /> # Leg de gastrulatie bij de kip uit en vergelijk met de mens.<br /> # Leg inducer en competentie uit adhv de oogontwikkeling en onderstaand experiment (dat waarbij ze optische vesikel wegnamen en transplanteerde). (oogontwikkeling moet niet volledig worden uitgetekend, gewoon algemeen).<br /> # Wat is het verschil tussen een eeneiïge en Siamese tweeling? Leg dit uit adhv de ontstaansmechanismen.<br /> <br /> === 11/06/2019 VM === <br /> # Termen: morphallaxis, pronefros, midblastula transitie.<br /> # Hoe zorgt de zee-egel voor soort-specifieke fertilisatie? <br /> # Experiment BMP en medial hinge point, neurulatie en BMP signaling uitleggen.<br /> # Experiment Gurdon + vervolg experiment ivm iPS. Wat is het verband tussen de 2, leg beide experimenten uit, wat zijn toepassingen van iPS?</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Vergelijkende_Ontwikkelingsbiologie&diff=1693 2019-06-13T17:50:22Z

<p>Cynthia.R: Versie 1692 van Cynthia.R (overleg) ongedaan gemaakt</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> Vergelijkende ontwikkelingsbiologie behoort tot de opleiding Biologie en behoort tot de minoren biologie en verbreding (sinds 2018-2019). Het wordt gedoceerd door prof. E. Seuntjes. <br /> Het vak behandelt de ontwikkeling van verschillende embryo's van verschillende organismen (muis, kip, kikker en mens). Er worden practica sessies gegeven, met een eindexamen voor de quotering (5/20). Om te slagen voor het vak moet minstens de helft worden behaalt op het practicumexamen. Een paperopdracht met vragenlijst telt mee voor 1/20. Het theoretisch examen telt dus mee voor 14/20.<br /> <br /> ==Examenvragen juni==<br /> 11/06/2019 VM<br /> <br /> Eerst 3 termen (niet mondeling)<br /> <br /> Neoblast, Angiogenese en Resact<br /> <br /> 3 mondeling vragen<br /> <br /> - Bespreek gastrulatie kip en vergelijk met mens<br /> <br /> - Leg competentie en inductie uit adhv transplantatie experimenten van lens preplacode en optisch vesikel<br /> <br /> - geef de verschillen van een een-eiïge tweeling en een Siamese tweeling adhv hun ontstaan<br /> <br /> 11/06/2019 VOORMIDDAG<br /> <br /> Drie termen schriftelijk<br /> 1, midblastula transitie, pronefros, morfillax (of zoiets)<br /> <br /> 2, Specificiteit bij zee-egel bevruchting <br /> <br /> -Resact proteine reseptoren<br /> -Samenstelling jelly coat en enzymen van acrosomale vesikel <br /> -Binding proteïne en de microvilli van de eicel met specifieke receptoren voor binding proteïne<br /> <br /> 3, Leg de werking van BPM receptoren tijdens neurulatie<br /> <br /> 4, Wat zijn de verschillen tussen iPS (induced pluripotente stem cells) cellen en een andere stam cel experimenten nl. Dolly de schaap.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Vergelijkende_Ontwikkelingsbiologie&diff=1692 2019-06-13T17:49:50Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen juni */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> Vergelijkende ontwikkelingsbiologie behoort tot de opleiding Biologie en behoort tot de minoren biologie en verbreding (sinds 2018-2019). Het wordt gedoceerd door prof. E. Seuntjes. <br /> Het vak behandelt de ontwikkeling van verschillende embryo's van verschillende organismen (muis, kip, kikker en mens). Er worden practica sessies gegeven, met een eindexamen voor de quotering (5/20). Om te slagen voor het vak moet minstens de helft worden behaalt op het practicumexamen. Een paperopdracht met vragenlijst telt mee voor 1/20. Het theoretisch examen telt dus mee voor 14/20.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Algemene_Ziekteleer&diff=1687 2019-06-13T12:47:31Z

<p>Cynthia.R: /* 13 juni 2018 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Pieter Gillard doceert het vak Algemene Ziekteleer. Biochemie optie verbreding volgt dit op gasthuisberg samen met farmacie. Het examen is schriftelijk.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 12 juni 2019 ===<br /> # Bespreek chemokines, histidine en het inflammasoom in context van de ontstekingsreactie.<br /> # Wat is de pathogenese en de oorzaak van hyperkalemie.<br /> # Bespreek endotheelschade en endotheel dysfuntie bij:<br /> #* obesitas<br /> #* type 3 overgevoeligheidsreacties<br /> #* transpant rejectie<br /> #* oedeem<br /> # Meerkeuze vragen (meerdere antwoorden kunnen juist zijn)<br /> ## Over de zelfstudieles (depressie)<br /> ## Wat hoort er bij oedeemvorming bij leverschade<br /> <br /> === 13 juni 2018 ===<br /> # Bespreek de stressrespons en het verband met hyperglycemie, metabool syndroom en hart- en vaatziekten <br /> # Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypokalemie.<br /> # Bespreek het verband tussen inflammatie en: <br /> #* koorts<br /> #* overgevoeligheidsreactie type 2<br /> #* atherosclerose<br /> #* kanker<br /> #* pijnfacilitatie<br /> # Meerkeuze<br /> ## Volgende zaken hebben te maken met oedeem behalve:<br /> ##* hartdecompensatie<br /> ##* veneuze insufficiëntie<br /> ##* nierfalen<br /> ##* levercirrose<br /> ##* neuroleptica<br /> ## Volgende zaken hebben te maken met migraine behalve:<br /> ##* activatie hypothalamus en limbisch systeem<br /> ##* inhibitie n. trigemius<br /> ##* centrale sensitisatie<br /> ##* CSD<br /> ##* CGRP<br /> <br /> === 22 augustus VM 2017 ===<br /> # Bespreek de stressreactie en breng de parthenogenese in verband mer hyperglycemie, hartdecompensatie en maagulcer<br /> # Definieer dehydratatie en bespreek de pathenogenese.<br /> # In levensbedreigende situaties reageert het lichaam soms heel extreem op enkele situaties (visieuze cirkel). Bespreek dit kort in verband met: <br /> #*Hartdecompensatie<br /> #*Ketoacidose<br /> #*SIRS<br /> #*Anafylactische shock<br /> #*Hitteslag<br /> # 3 ptn Meerkeuze:<br /> #* Volgende zaken maken komen voor bij magaline neuroleptische syndroom BEHALVE: <br /> ## Dehydratatie<br /> ## Hyperthermie<br /> ## Spierrigiditeit<br /> ## Oedeem<br /> ## Dopamineantagonisten<br /> #* Volgende inhibitoren zijn voorhanden bij de virale cyclus van HIV BEHALVE: <br /> ## Glucoinhibitoren<br /> ## ...<br /> <br /> === 14 juni VM 2017 ===<br /> #6pt Wat is het verband met kanker en inflammatie, kanker en obesitas inflammatie en obesitas.<br /> #6pt Hoe ontstaat koorts, geef enkele voorbeelden en moet koorts behandeld worden?<br /> #5pt De nieren zijn belangrijk bij verschillende pathologieën. Geef het verband met de nieren en acidose, dehydratatie, hypocalcemie, oedeem en hyperkalemie.<br /> #3pt Meerkeuze: <br /> #* Wat is niet belangrijk bij auto-immuunziekten?<br /> ## ... <br /> #* Volgende zaken helpen mee bij de pijnsensatie behalve: <br /> ## beta A vezels (= antwoord)<br /> ## nocebo <br /> ## iets van neuronen <br /> ## inflammatie<br /> <br /> ===Vragen afkomstig van Farmacie:===<br /> Examenvragen (prof. Gillard)<br /> <br /> Open vragen<br /> <br /> #Leg uit wat dehydratie is met de bijbehorende pathologieën.<br /> #Leg het verband uit tussen de stress reactie met maagulcus, hyperglycemie en hartischemie.<br /> #Bespreek de extreme reactie die optreed of de vicieuze cirkel die plaatsvindt bij anafylactische shock, SIRS, hyperthermie en hartdecompensatie.<br /> #Wat is verouderen, welk effect heeft dit op de lichaamsfuncties en hoe is dit verbonden aan frailty.<br /> #Metabole acidose high anion gap, leg de pathogenese en oorzaken uit.<br /> #Geneesmiddelen kunnen de oorzaak zijn van pathologische toestanden maar kunnen ook gebruikt worden om ze te bestrijden. Geef voor ieder onderdeel een geneesmiddelengroep die hierop inwerkt.<br /> #Hyperthermie<br /> #Hypokaliëmie<br /> #Migraine<br /> #Hyponatremie<br /> #Inflammatie<br /> #Bespreek type I en type III overgevoeligheidsreacties.<br /> #Bespreek 3 recessieve overerfbare aandoeningen.<br /> #Bespreek pathologie ivm PTH.<br /> #Bespreek migraine.<br /> #Bespreek klaring en negatieve vrij water klaring en geef klinische voorbeelden bij stoornissen.<br /> #Bespreek de gevolgen van hypokalemie die een invloed kan hebben op homeostasemechanismen.<br /> #Bespreek ontstaan en behandeling van koorts.<br /> #Wat gebeurt er met alle homeostasemechanismen bij acute nierinsufficiëntie?<br /> #Hoe ontstaat aneuploïdie.<br /> #Bespreek de acute ontstekingsreactie en hoe kunnen farmaca de reactie blokkeren?<br /> #Bespreek congenitale bijnierschorshyperplasie.<br /> #Wat weet u over de behandeling en kenmerken van dominantie overerving?<br /> #Bespreek RIA en Rlogieën die gepaard gaan met chronische nierinsufficiëntie.<br /> #Wat zijn de nadelige gevolgen van een stressreactie.<br /> #Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypocalcemie.<br /> #Bespreek oedeem in de context van leverpathologie.<br /> #Geef de mogelijke oorzaken van polyurie.<br /> #Welke homeostase mechanismen kunnen ontregeld geraken door een ontregelde diabetes mellitus en hoe?<br /> #Bespreek de acute fase reactie.<br /> #Bespreek hoofdpijn.<br /> #Wat weet u over auto-immuniteit?<br /> #Bespreek respiratoire alkalose.<br /> #Vitamine D aandoeningen. Leg uit.<br /> #Congenitale bijnierschorshyperplasie. Leg uit.<br /> #Bespreek de behandeling van hypothermie.<br /> #Bespreek de rol van glucocorticoïden bij de stressreactie.<br /> #Hitteslag:<br /> ##wat is de functie van de acute fase eiwitten?<br /> ##wat doen heat shock proteïnen, wat zijn dat?<br /> ##Verhoogde vaatpermeabiliteit, welke gevolgen?<br /> #Wat is het verband tussen de temperatuur en coagulatie vs fibrinolyse?<br /> #Bespreek hyperosmolaire dehydratie.<br /> #Wat weet je over maligne hyperthermie?<br /> #Hoe ontstaat leukocytose en wat is de basis van een verhoogde sedimentatiesnelheid van RBC.<br /> #Bespreek metabole alkalose.<br /> #Bespreek het verband tussen ziekte, veroudering en dood.<br /> #Bespreek de neurofysiologische basis van de pijnsensatie.<br /> #Bespreek het ontstaan en de gevolgen van hyperkaliëmie.<br /> #Bespreek tertiaire hyperparathyroïdie.<br /> #Wat is ouderdom, verandering van ouderdom, evolutie van doodsoorzaken en levensverwachting.<br /> #Geef 3 voorbeelden van aangeboren ongevoeligheid aan een of ander hormoon.<br /> #Hoe bereken je de vrij-water klaring en geef 2 voorbeelden van wanneer deze verhoogd is.<br /> #Leg RAST uit.<br /> #Geef de klinische gevolgen van hypercalciëmie.​<br /> #Wat is de link tussen centraal zenuwstelsel en:<br /> ##Stressreactie<br /> ##Frailty (artikel)<br /> ##Metabole alkalose<br /> ##Koorts<br /> ##Pijnsensitisatie<br /> #Bespreek de cellulaire fase van de acute ontstekingsreactie.<br /> #Bespreek alle homeostasemechanismen die een invloed hebben op de neuromusculaire excitabiliteit.<br /> #Geef de oorzaken van een gestegen plasma-calcium met een normaal of verlaagd PTH.<br /> #Bespreek oedeem bij overvulling.<br /> #Bespreek metabole acidose.<br /> #Bespreek pathogenese en oorzaken van oedeem.<br /> #Bespreek het verband tussen diabetes (type 1 of 2) en:<br /> ##dehydratatie<br /> ##auto-immuniteit<br /> ##kalium homeostase<br /> ##obesitas<br /> ##metabole acidose<br /> #Meerkeuzevragen<br /> <br /> #Wat vindt niet plaats tijdens een stress respons<br /> ##Aldosterone daling<br /> ##Stimulatie ADH secretie<br /> ##Catecholamine vrijzetting<br /> ##Stimulatie bijniercortex<br /> …<br /> #Wat is geen oorzaak van migraine?<br /> ##Centrale sensitisatie<br /> ##Activatie van trigemino<br /> ##Inflammatie<br /> ##Auto-immuun ziekte<br /> …<br /> #Welke is geen overgevoeligheidsziekte?<br /> ##Reumatoïde artritis<br /> ##Pernicieuze anemie<br /> ##Mucoviscidose<br /> …<br /> #Wat is geen factor in de oedeemvorming bij levercirrose/leverfalen<br /> ##hoog renine<br /> ##splanchnische hypotensie<br /> ##toename ECF<br /> ##laag albumine<br /> ##vasoconstrictie splanchnische vaten<br /> #Wat is geen inhiberende factor voor de pijntransmissie<br /> ##niet-nociceptieve<br /> ##µ-agonisten<br /> ##NMDA-antagonisten<br /> …<br /> #Wat is niet betrokken bij maligne syndroom (hyperthermie, oedeem, deshydratatie D2 antagonist)</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Algemene_Ziekteleer&diff=1686 2019-06-13T12:46:43Z

<p>Cynthia.R: /* 12 juni 2019 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Pieter Gillard doceert het vak Algemene Ziekteleer. Biochemie optie verbreding volgt dit op gasthuisberg samen met farmacie. Het examen is schriftelijk.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 12 juni 2019 ===<br /> # Bespreek chemokines, histidine en het inflammasoom in context van de ontstekingsreactie.<br /> # Wat is de pathogenese en de oorzaak van hyperkalemie.<br /> # Bespreek endotheelschade en endotheel dysfuntie bij:<br /> #* obesitas<br /> #* type 3 overgevoeligheidsreacties<br /> #* transpant rejectie<br /> #* oedeem<br /> # Meerkeuze vragen (meerdere antwoorden kunnen juist zijn)<br /> ## Over de zelfstudieles (depressie)<br /> ## Wat hoort er bij oedeemvorming bij leverschade<br /> <br /> === 13 juni 2018 ===<br /> # Bespreek de stressrespons en het verband met hyperglycemie, metabool syndroom en hart- en vaatziekten <br /> # Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypokalemie.<br /> # Bespreek het verband tussen inflammatie en: <br /> #* koorts<br /> #* overgevoeligheidsreactie type 2<br /> #* atherosclerose<br /> #* kanker<br /> #* pijnfacilitatie<br /> # Meerkeuze<br /> ## Volgende zaken hebben te maken met oedeem behalve:<br /> #* hartdecompensatie<br /> #* veneuze insufficiëntie<br /> #* nierfalen<br /> #* levercirrose<br /> #* neuroleptica<br /> ## Volgende zaken hebben te maken met migraine behalve:<br /> #* activatie hypothalamus en limbisch systeem<br /> #* inhibitie n. trigemius<br /> #* centrale sensitisatie<br /> #* CSD<br /> #* CGRP<br /> <br /> === 22 augustus VM 2017 ===<br /> # Bespreek de stressreactie en breng de parthenogenese in verband mer hyperglycemie, hartdecompensatie en maagulcer<br /> # Definieer dehydratatie en bespreek de pathenogenese.<br /> # In levensbedreigende situaties reageert het lichaam soms heel extreem op enkele situaties (visieuze cirkel). Bespreek dit kort in verband met: <br /> #*Hartdecompensatie<br /> #*Ketoacidose<br /> #*SIRS<br /> #*Anafylactische shock<br /> #*Hitteslag<br /> # 3 ptn Meerkeuze:<br /> #* Volgende zaken maken komen voor bij magaline neuroleptische syndroom BEHALVE: <br /> ## Dehydratatie<br /> ## Hyperthermie<br /> ## Spierrigiditeit<br /> ## Oedeem<br /> ## Dopamineantagonisten<br /> #* Volgende inhibitoren zijn voorhanden bij de virale cyclus van HIV BEHALVE: <br /> ## Glucoinhibitoren<br /> ## ...<br /> <br /> === 14 juni VM 2017 ===<br /> #6pt Wat is het verband met kanker en inflammatie, kanker en obesitas inflammatie en obesitas.<br /> #6pt Hoe ontstaat koorts, geef enkele voorbeelden en moet koorts behandeld worden?<br /> #5pt De nieren zijn belangrijk bij verschillende pathologieën. Geef het verband met de nieren en acidose, dehydratatie, hypocalcemie, oedeem en hyperkalemie.<br /> #3pt Meerkeuze: <br /> #* Wat is niet belangrijk bij auto-immuunziekten?<br /> ## ... <br /> #* Volgende zaken helpen mee bij de pijnsensatie behalve: <br /> ## beta A vezels (= antwoord)<br /> ## nocebo <br /> ## iets van neuronen <br /> ## inflammatie<br /> <br /> ===Vragen afkomstig van Farmacie:===<br /> Examenvragen (prof. Gillard)<br /> <br /> Open vragen<br /> <br /> #Leg uit wat dehydratie is met de bijbehorende pathologieën.<br /> #Leg het verband uit tussen de stress reactie met maagulcus, hyperglycemie en hartischemie.<br /> #Bespreek de extreme reactie die optreed of de vicieuze cirkel die plaatsvindt bij anafylactische shock, SIRS, hyperthermie en hartdecompensatie.<br /> #Wat is verouderen, welk effect heeft dit op de lichaamsfuncties en hoe is dit verbonden aan frailty.<br /> #Metabole acidose high anion gap, leg de pathogenese en oorzaken uit.<br /> #Geneesmiddelen kunnen de oorzaak zijn van pathologische toestanden maar kunnen ook gebruikt worden om ze te bestrijden. Geef voor ieder onderdeel een geneesmiddelengroep die hierop inwerkt.<br /> #Hyperthermie<br /> #Hypokaliëmie<br /> #Migraine<br /> #Hyponatremie<br /> #Inflammatie<br /> #Bespreek type I en type III overgevoeligheidsreacties.<br /> #Bespreek 3 recessieve overerfbare aandoeningen.<br /> #Bespreek pathologie ivm PTH.<br /> #Bespreek migraine.<br /> #Bespreek klaring en negatieve vrij water klaring en geef klinische voorbeelden bij stoornissen.<br /> #Bespreek de gevolgen van hypokalemie die een invloed kan hebben op homeostasemechanismen.<br /> #Bespreek ontstaan en behandeling van koorts.<br /> #Wat gebeurt er met alle homeostasemechanismen bij acute nierinsufficiëntie?<br /> #Hoe ontstaat aneuploïdie.<br /> #Bespreek de acute ontstekingsreactie en hoe kunnen farmaca de reactie blokkeren?<br /> #Bespreek congenitale bijnierschorshyperplasie.<br /> #Wat weet u over de behandeling en kenmerken van dominantie overerving?<br /> #Bespreek RIA en Rlogieën die gepaard gaan met chronische nierinsufficiëntie.<br /> #Wat zijn de nadelige gevolgen van een stressreactie.<br /> #Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypocalcemie.<br /> #Bespreek oedeem in de context van leverpathologie.<br /> #Geef de mogelijke oorzaken van polyurie.<br /> #Welke homeostase mechanismen kunnen ontregeld geraken door een ontregelde diabetes mellitus en hoe?<br /> #Bespreek de acute fase reactie.<br /> #Bespreek hoofdpijn.<br /> #Wat weet u over auto-immuniteit?<br /> #Bespreek respiratoire alkalose.<br /> #Vitamine D aandoeningen. Leg uit.<br /> #Congenitale bijnierschorshyperplasie. Leg uit.<br /> #Bespreek de behandeling van hypothermie.<br /> #Bespreek de rol van glucocorticoïden bij de stressreactie.<br /> #Hitteslag:<br /> ##wat is de functie van de acute fase eiwitten?<br /> ##wat doen heat shock proteïnen, wat zijn dat?<br /> ##Verhoogde vaatpermeabiliteit, welke gevolgen?<br /> #Wat is het verband tussen de temperatuur en coagulatie vs fibrinolyse?<br /> #Bespreek hyperosmolaire dehydratie.<br /> #Wat weet je over maligne hyperthermie?<br /> #Hoe ontstaat leukocytose en wat is de basis van een verhoogde sedimentatiesnelheid van RBC.<br /> #Bespreek metabole alkalose.<br /> #Bespreek het verband tussen ziekte, veroudering en dood.<br /> #Bespreek de neurofysiologische basis van de pijnsensatie.<br /> #Bespreek het ontstaan en de gevolgen van hyperkaliëmie.<br /> #Bespreek tertiaire hyperparathyroïdie.<br /> #Wat is ouderdom, verandering van ouderdom, evolutie van doodsoorzaken en levensverwachting.<br /> #Geef 3 voorbeelden van aangeboren ongevoeligheid aan een of ander hormoon.<br /> #Hoe bereken je de vrij-water klaring en geef 2 voorbeelden van wanneer deze verhoogd is.<br /> #Leg RAST uit.<br /> #Geef de klinische gevolgen van hypercalciëmie.​<br /> #Wat is de link tussen centraal zenuwstelsel en:<br /> ##Stressreactie<br /> ##Frailty (artikel)<br /> ##Metabole alkalose<br /> ##Koorts<br /> ##Pijnsensitisatie<br /> #Bespreek de cellulaire fase van de acute ontstekingsreactie.<br /> #Bespreek alle homeostasemechanismen die een invloed hebben op de neuromusculaire excitabiliteit.<br /> #Geef de oorzaken van een gestegen plasma-calcium met een normaal of verlaagd PTH.<br /> #Bespreek oedeem bij overvulling.<br /> #Bespreek metabole acidose.<br /> #Bespreek pathogenese en oorzaken van oedeem.<br /> #Bespreek het verband tussen diabetes (type 1 of 2) en:<br /> ##dehydratatie<br /> ##auto-immuniteit<br /> ##kalium homeostase<br /> ##obesitas<br /> ##metabole acidose<br /> #Meerkeuzevragen<br /> <br /> #Wat vindt niet plaats tijdens een stress respons<br /> ##Aldosterone daling<br /> ##Stimulatie ADH secretie<br /> ##Catecholamine vrijzetting<br /> ##Stimulatie bijniercortex<br /> …<br /> #Wat is geen oorzaak van migraine?<br /> ##Centrale sensitisatie<br /> ##Activatie van trigemino<br /> ##Inflammatie<br /> ##Auto-immuun ziekte<br /> …<br /> #Welke is geen overgevoeligheidsziekte?<br /> ##Reumatoïde artritis<br /> ##Pernicieuze anemie<br /> ##Mucoviscidose<br /> …<br /> #Wat is geen factor in de oedeemvorming bij levercirrose/leverfalen<br /> ##hoog renine<br /> ##splanchnische hypotensie<br /> ##toename ECF<br /> ##laag albumine<br /> ##vasoconstrictie splanchnische vaten<br /> #Wat is geen inhiberende factor voor de pijntransmissie<br /> ##niet-nociceptieve<br /> ##µ-agonisten<br /> ##NMDA-antagonisten<br /> …<br /> #Wat is niet betrokken bij maligne syndroom (hyperthermie, oedeem, deshydratatie D2 antagonist)</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Algemene_Ziekteleer&diff=1685 2019-06-13T12:46:34Z

<p>Cynthia.R: /* 12 juni 2019 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Pieter Gillard doceert het vak Algemene Ziekteleer. Biochemie optie verbreding volgt dit op gasthuisberg samen met farmacie. Het examen is schriftelijk.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 12 juni 2019 ===<br /> # Bespreek chemokines, histidine en het inflammasoom in context van de ontstekingsreactie.<br /> # Wat is de pathogenese en de oorzaak van hyperkalemie.<br /> # Bespreek endotheelschade en endotheel dysfuntie bij:<br /> #* obesitas<br /> #* type 3 overgevoeligheidsreacties<br /> #* transpant rejectie<br /> #* oedeem<br /> # Meerkeuze vragen (meerdere antwoorden kunnen juist zijn)<br /> ## Over de zelfstudieles (depressie)<br /> ## Wat hoort er bij oedeemvorming bij leverschade<br /> ##* fz<br /> <br /> === 13 juni 2018 ===<br /> # Bespreek de stressrespons en het verband met hyperglycemie, metabool syndroom en hart- en vaatziekten <br /> # Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypokalemie.<br /> # Bespreek het verband tussen inflammatie en: <br /> #* koorts<br /> #* overgevoeligheidsreactie type 2<br /> #* atherosclerose<br /> #* kanker<br /> #* pijnfacilitatie<br /> # Meerkeuze<br /> ## Volgende zaken hebben te maken met oedeem behalve:<br /> #* hartdecompensatie<br /> #* veneuze insufficiëntie<br /> #* nierfalen<br /> #* levercirrose<br /> #* neuroleptica<br /> ## Volgende zaken hebben te maken met migraine behalve:<br /> #* activatie hypothalamus en limbisch systeem<br /> #* inhibitie n. trigemius<br /> #* centrale sensitisatie<br /> #* CSD<br /> #* CGRP<br /> <br /> === 22 augustus VM 2017 ===<br /> # Bespreek de stressreactie en breng de parthenogenese in verband mer hyperglycemie, hartdecompensatie en maagulcer<br /> # Definieer dehydratatie en bespreek de pathenogenese.<br /> # In levensbedreigende situaties reageert het lichaam soms heel extreem op enkele situaties (visieuze cirkel). Bespreek dit kort in verband met: <br /> #*Hartdecompensatie<br /> #*Ketoacidose<br /> #*SIRS<br /> #*Anafylactische shock<br /> #*Hitteslag<br /> # 3 ptn Meerkeuze:<br /> #* Volgende zaken maken komen voor bij magaline neuroleptische syndroom BEHALVE: <br /> ## Dehydratatie<br /> ## Hyperthermie<br /> ## Spierrigiditeit<br /> ## Oedeem<br /> ## Dopamineantagonisten<br /> #* Volgende inhibitoren zijn voorhanden bij de virale cyclus van HIV BEHALVE: <br /> ## Glucoinhibitoren<br /> ## ...<br /> <br /> === 14 juni VM 2017 ===<br /> #6pt Wat is het verband met kanker en inflammatie, kanker en obesitas inflammatie en obesitas.<br /> #6pt Hoe ontstaat koorts, geef enkele voorbeelden en moet koorts behandeld worden?<br /> #5pt De nieren zijn belangrijk bij verschillende pathologieën. Geef het verband met de nieren en acidose, dehydratatie, hypocalcemie, oedeem en hyperkalemie.<br /> #3pt Meerkeuze: <br /> #* Wat is niet belangrijk bij auto-immuunziekten?<br /> ## ... <br /> #* Volgende zaken helpen mee bij de pijnsensatie behalve: <br /> ## beta A vezels (= antwoord)<br /> ## nocebo <br /> ## iets van neuronen <br /> ## inflammatie<br /> <br /> ===Vragen afkomstig van Farmacie:===<br /> Examenvragen (prof. Gillard)<br /> <br /> Open vragen<br /> <br /> #Leg uit wat dehydratie is met de bijbehorende pathologieën.<br /> #Leg het verband uit tussen de stress reactie met maagulcus, hyperglycemie en hartischemie.<br /> #Bespreek de extreme reactie die optreed of de vicieuze cirkel die plaatsvindt bij anafylactische shock, SIRS, hyperthermie en hartdecompensatie.<br /> #Wat is verouderen, welk effect heeft dit op de lichaamsfuncties en hoe is dit verbonden aan frailty.<br /> #Metabole acidose high anion gap, leg de pathogenese en oorzaken uit.<br /> #Geneesmiddelen kunnen de oorzaak zijn van pathologische toestanden maar kunnen ook gebruikt worden om ze te bestrijden. Geef voor ieder onderdeel een geneesmiddelengroep die hierop inwerkt.<br /> #Hyperthermie<br /> #Hypokaliëmie<br /> #Migraine<br /> #Hyponatremie<br /> #Inflammatie<br /> #Bespreek type I en type III overgevoeligheidsreacties.<br /> #Bespreek 3 recessieve overerfbare aandoeningen.<br /> #Bespreek pathologie ivm PTH.<br /> #Bespreek migraine.<br /> #Bespreek klaring en negatieve vrij water klaring en geef klinische voorbeelden bij stoornissen.<br /> #Bespreek de gevolgen van hypokalemie die een invloed kan hebben op homeostasemechanismen.<br /> #Bespreek ontstaan en behandeling van koorts.<br /> #Wat gebeurt er met alle homeostasemechanismen bij acute nierinsufficiëntie?<br /> #Hoe ontstaat aneuploïdie.<br /> #Bespreek de acute ontstekingsreactie en hoe kunnen farmaca de reactie blokkeren?<br /> #Bespreek congenitale bijnierschorshyperplasie.<br /> #Wat weet u over de behandeling en kenmerken van dominantie overerving?<br /> #Bespreek RIA en Rlogieën die gepaard gaan met chronische nierinsufficiëntie.<br /> #Wat zijn de nadelige gevolgen van een stressreactie.<br /> #Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypocalcemie.<br /> #Bespreek oedeem in de context van leverpathologie.<br /> #Geef de mogelijke oorzaken van polyurie.<br /> #Welke homeostase mechanismen kunnen ontregeld geraken door een ontregelde diabetes mellitus en hoe?<br /> #Bespreek de acute fase reactie.<br /> #Bespreek hoofdpijn.<br /> #Wat weet u over auto-immuniteit?<br /> #Bespreek respiratoire alkalose.<br /> #Vitamine D aandoeningen. Leg uit.<br /> #Congenitale bijnierschorshyperplasie. Leg uit.<br /> #Bespreek de behandeling van hypothermie.<br /> #Bespreek de rol van glucocorticoïden bij de stressreactie.<br /> #Hitteslag:<br /> ##wat is de functie van de acute fase eiwitten?<br /> ##wat doen heat shock proteïnen, wat zijn dat?<br /> ##Verhoogde vaatpermeabiliteit, welke gevolgen?<br /> #Wat is het verband tussen de temperatuur en coagulatie vs fibrinolyse?<br /> #Bespreek hyperosmolaire dehydratie.<br /> #Wat weet je over maligne hyperthermie?<br /> #Hoe ontstaat leukocytose en wat is de basis van een verhoogde sedimentatiesnelheid van RBC.<br /> #Bespreek metabole alkalose.<br /> #Bespreek het verband tussen ziekte, veroudering en dood.<br /> #Bespreek de neurofysiologische basis van de pijnsensatie.<br /> #Bespreek het ontstaan en de gevolgen van hyperkaliëmie.<br /> #Bespreek tertiaire hyperparathyroïdie.<br /> #Wat is ouderdom, verandering van ouderdom, evolutie van doodsoorzaken en levensverwachting.<br /> #Geef 3 voorbeelden van aangeboren ongevoeligheid aan een of ander hormoon.<br /> #Hoe bereken je de vrij-water klaring en geef 2 voorbeelden van wanneer deze verhoogd is.<br /> #Leg RAST uit.<br /> #Geef de klinische gevolgen van hypercalciëmie.​<br /> #Wat is de link tussen centraal zenuwstelsel en:<br /> ##Stressreactie<br /> ##Frailty (artikel)<br /> ##Metabole alkalose<br /> ##Koorts<br /> ##Pijnsensitisatie<br /> #Bespreek de cellulaire fase van de acute ontstekingsreactie.<br /> #Bespreek alle homeostasemechanismen die een invloed hebben op de neuromusculaire excitabiliteit.<br /> #Geef de oorzaken van een gestegen plasma-calcium met een normaal of verlaagd PTH.<br /> #Bespreek oedeem bij overvulling.<br /> #Bespreek metabole acidose.<br /> #Bespreek pathogenese en oorzaken van oedeem.<br /> #Bespreek het verband tussen diabetes (type 1 of 2) en:<br /> ##dehydratatie<br /> ##auto-immuniteit<br /> ##kalium homeostase<br /> ##obesitas<br /> ##metabole acidose<br /> #Meerkeuzevragen<br /> <br /> #Wat vindt niet plaats tijdens een stress respons<br /> ##Aldosterone daling<br /> ##Stimulatie ADH secretie<br /> ##Catecholamine vrijzetting<br /> ##Stimulatie bijniercortex<br /> …<br /> #Wat is geen oorzaak van migraine?<br /> ##Centrale sensitisatie<br /> ##Activatie van trigemino<br /> ##Inflammatie<br /> ##Auto-immuun ziekte<br /> …<br /> #Welke is geen overgevoeligheidsziekte?<br /> ##Reumatoïde artritis<br /> ##Pernicieuze anemie<br /> ##Mucoviscidose<br /> …<br /> #Wat is geen factor in de oedeemvorming bij levercirrose/leverfalen<br /> ##hoog renine<br /> ##splanchnische hypotensie<br /> ##toename ECF<br /> ##laag albumine<br /> ##vasoconstrictie splanchnische vaten<br /> #Wat is geen inhiberende factor voor de pijntransmissie<br /> ##niet-nociceptieve<br /> ##µ-agonisten<br /> ##NMDA-antagonisten<br /> …<br /> #Wat is niet betrokken bij maligne syndroom (hyperthermie, oedeem, deshydratatie D2 antagonist)</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Algemene_Ziekteleer&diff=1684 2019-06-13T12:45:55Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Pieter Gillard doceert het vak Algemene Ziekteleer. Biochemie optie verbreding volgt dit op gasthuisberg samen met farmacie. Het examen is schriftelijk.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 12 juni 2019 ===<br /> # Bespreek chemokines, histidine en het inflammasoom in context van de ontstekingsreactie.<br /> # Wat is de pathogenese en de oorzaak van hyperkalemie.<br /> # Bespreek endotheelschade en endotheel dysfuntie bij:<br /> #* obesitas<br /> #* type 3 overgevoeligheidsreacties<br /> #* transpant rejectie<br /> #* oedeem<br /> # Meerkeuze vragen (meerdere antwoorden kunnen juist zijn)<br /> ## Over de zelfstudieles (depressie)<br /> ## Wat hoort er bij oedeemvorming bij leverschade<br /> === 13 juni 2018 ===<br /> # Bespreek de stressrespons en het verband met hyperglycemie, metabool syndroom en hart- en vaatziekten <br /> # Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypokalemie.<br /> # Bespreek het verband tussen inflammatie en: <br /> #* koorts<br /> #* overgevoeligheidsreactie type 2<br /> #* atherosclerose<br /> #* kanker<br /> #* pijnfacilitatie<br /> # Meerkeuze<br /> ## Volgende zaken hebben te maken met oedeem behalve:<br /> #* hartdecompensatie<br /> #* veneuze insufficiëntie<br /> #* nierfalen<br /> #* levercirrose<br /> #* neuroleptica<br /> ## Volgende zaken hebben te maken met migraine behalve:<br /> #* activatie hypothalamus en limbisch systeem<br /> #* inhibitie n. trigemius<br /> #* centrale sensitisatie<br /> #* CSD<br /> #* CGRP<br /> <br /> === 22 augustus VM 2017 ===<br /> # Bespreek de stressreactie en breng de parthenogenese in verband mer hyperglycemie, hartdecompensatie en maagulcer<br /> # Definieer dehydratatie en bespreek de pathenogenese.<br /> # In levensbedreigende situaties reageert het lichaam soms heel extreem op enkele situaties (visieuze cirkel). Bespreek dit kort in verband met: <br /> #*Hartdecompensatie<br /> #*Ketoacidose<br /> #*SIRS<br /> #*Anafylactische shock<br /> #*Hitteslag<br /> # 3 ptn Meerkeuze:<br /> #* Volgende zaken maken komen voor bij magaline neuroleptische syndroom BEHALVE: <br /> ## Dehydratatie<br /> ## Hyperthermie<br /> ## Spierrigiditeit<br /> ## Oedeem<br /> ## Dopamineantagonisten<br /> #* Volgende inhibitoren zijn voorhanden bij de virale cyclus van HIV BEHALVE: <br /> ## Glucoinhibitoren<br /> ## ...<br /> <br /> === 14 juni VM 2017 ===<br /> #6pt Wat is het verband met kanker en inflammatie, kanker en obesitas inflammatie en obesitas.<br /> #6pt Hoe ontstaat koorts, geef enkele voorbeelden en moet koorts behandeld worden?<br /> #5pt De nieren zijn belangrijk bij verschillende pathologieën. Geef het verband met de nieren en acidose, dehydratatie, hypocalcemie, oedeem en hyperkalemie.<br /> #3pt Meerkeuze: <br /> #* Wat is niet belangrijk bij auto-immuunziekten?<br /> ## ... <br /> #* Volgende zaken helpen mee bij de pijnsensatie behalve: <br /> ## beta A vezels (= antwoord)<br /> ## nocebo <br /> ## iets van neuronen <br /> ## inflammatie<br /> <br /> ===Vragen afkomstig van Farmacie:===<br /> Examenvragen (prof. Gillard)<br /> <br /> Open vragen<br /> <br /> #Leg uit wat dehydratie is met de bijbehorende pathologieën.<br /> #Leg het verband uit tussen de stress reactie met maagulcus, hyperglycemie en hartischemie.<br /> #Bespreek de extreme reactie die optreed of de vicieuze cirkel die plaatsvindt bij anafylactische shock, SIRS, hyperthermie en hartdecompensatie.<br /> #Wat is verouderen, welk effect heeft dit op de lichaamsfuncties en hoe is dit verbonden aan frailty.<br /> #Metabole acidose high anion gap, leg de pathogenese en oorzaken uit.<br /> #Geneesmiddelen kunnen de oorzaak zijn van pathologische toestanden maar kunnen ook gebruikt worden om ze te bestrijden. Geef voor ieder onderdeel een geneesmiddelengroep die hierop inwerkt.<br /> #Hyperthermie<br /> #Hypokaliëmie<br /> #Migraine<br /> #Hyponatremie<br /> #Inflammatie<br /> #Bespreek type I en type III overgevoeligheidsreacties.<br /> #Bespreek 3 recessieve overerfbare aandoeningen.<br /> #Bespreek pathologie ivm PTH.<br /> #Bespreek migraine.<br /> #Bespreek klaring en negatieve vrij water klaring en geef klinische voorbeelden bij stoornissen.<br /> #Bespreek de gevolgen van hypokalemie die een invloed kan hebben op homeostasemechanismen.<br /> #Bespreek ontstaan en behandeling van koorts.<br /> #Wat gebeurt er met alle homeostasemechanismen bij acute nierinsufficiëntie?<br /> #Hoe ontstaat aneuploïdie.<br /> #Bespreek de acute ontstekingsreactie en hoe kunnen farmaca de reactie blokkeren?<br /> #Bespreek congenitale bijnierschorshyperplasie.<br /> #Wat weet u over de behandeling en kenmerken van dominantie overerving?<br /> #Bespreek RIA en Rlogieën die gepaard gaan met chronische nierinsufficiëntie.<br /> #Wat zijn de nadelige gevolgen van een stressreactie.<br /> #Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypocalcemie.<br /> #Bespreek oedeem in de context van leverpathologie.<br /> #Geef de mogelijke oorzaken van polyurie.<br /> #Welke homeostase mechanismen kunnen ontregeld geraken door een ontregelde diabetes mellitus en hoe?<br /> #Bespreek de acute fase reactie.<br /> #Bespreek hoofdpijn.<br /> #Wat weet u over auto-immuniteit?<br /> #Bespreek respiratoire alkalose.<br /> #Vitamine D aandoeningen. Leg uit.<br /> #Congenitale bijnierschorshyperplasie. Leg uit.<br /> #Bespreek de behandeling van hypothermie.<br /> #Bespreek de rol van glucocorticoïden bij de stressreactie.<br /> #Hitteslag:<br /> ##wat is de functie van de acute fase eiwitten?<br /> ##wat doen heat shock proteïnen, wat zijn dat?<br /> ##Verhoogde vaatpermeabiliteit, welke gevolgen?<br /> #Wat is het verband tussen de temperatuur en coagulatie vs fibrinolyse?<br /> #Bespreek hyperosmolaire dehydratie.<br /> #Wat weet je over maligne hyperthermie?<br /> #Hoe ontstaat leukocytose en wat is de basis van een verhoogde sedimentatiesnelheid van RBC.<br /> #Bespreek metabole alkalose.<br /> #Bespreek het verband tussen ziekte, veroudering en dood.<br /> #Bespreek de neurofysiologische basis van de pijnsensatie.<br /> #Bespreek het ontstaan en de gevolgen van hyperkaliëmie.<br /> #Bespreek tertiaire hyperparathyroïdie.<br /> #Wat is ouderdom, verandering van ouderdom, evolutie van doodsoorzaken en levensverwachting.<br /> #Geef 3 voorbeelden van aangeboren ongevoeligheid aan een of ander hormoon.<br /> #Hoe bereken je de vrij-water klaring en geef 2 voorbeelden van wanneer deze verhoogd is.<br /> #Leg RAST uit.<br /> #Geef de klinische gevolgen van hypercalciëmie.​<br /> #Wat is de link tussen centraal zenuwstelsel en:<br /> ##Stressreactie<br /> ##Frailty (artikel)<br /> ##Metabole alkalose<br /> ##Koorts<br /> ##Pijnsensitisatie<br /> #Bespreek de cellulaire fase van de acute ontstekingsreactie.<br /> #Bespreek alle homeostasemechanismen die een invloed hebben op de neuromusculaire excitabiliteit.<br /> #Geef de oorzaken van een gestegen plasma-calcium met een normaal of verlaagd PTH.<br /> #Bespreek oedeem bij overvulling.<br /> #Bespreek metabole acidose.<br /> #Bespreek pathogenese en oorzaken van oedeem.<br /> #Bespreek het verband tussen diabetes (type 1 of 2) en:<br /> ##dehydratatie<br /> ##auto-immuniteit<br /> ##kalium homeostase<br /> ##obesitas<br /> ##metabole acidose<br /> #Meerkeuzevragen<br /> <br /> #Wat vindt niet plaats tijdens een stress respons<br /> ##Aldosterone daling<br /> ##Stimulatie ADH secretie<br /> ##Catecholamine vrijzetting<br /> ##Stimulatie bijniercortex<br /> …<br /> #Wat is geen oorzaak van migraine?<br /> ##Centrale sensitisatie<br /> ##Activatie van trigemino<br /> ##Inflammatie<br /> ##Auto-immuun ziekte<br /> …<br /> #Welke is geen overgevoeligheidsziekte?<br /> ##Reumatoïde artritis<br /> ##Pernicieuze anemie<br /> ##Mucoviscidose<br /> …<br /> #Wat is geen factor in de oedeemvorming bij levercirrose/leverfalen<br /> ##hoog renine<br /> ##splanchnische hypotensie<br /> ##toename ECF<br /> ##laag albumine<br /> ##vasoconstrictie splanchnische vaten<br /> #Wat is geen inhiberende factor voor de pijntransmissie<br /> ##niet-nociceptieve<br /> ##µ-agonisten<br /> ##NMDA-antagonisten<br /> …<br /> #Wat is niet betrokken bij maligne syndroom (hyperthermie, oedeem, deshydratatie D2 antagonist)</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Vergelijkende_Ontwikkelingsbiologie&diff=1648 2019-06-08T19:27:20Z

<p>Cynthia.R: /* Vakinformatie */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> Vergelijkende ontwikkelingsbiologie behoort tot de opleiding Biologie en behoort tot de minoren biologie en verbreding (sinds 2018-2019). Het wordt gedoceerd door prof. E. Seuntjes. <br /> Het vak behandelt de ontwikkeling van verschillende embryo's van verschillende organismen (muis, kip, kikker en mens). Er worden practica sessies gegeven, met een eindexamen voor de quotering (5/20). Om te slagen voor het vak moet minstens de helft worden behaalt op het practicumexamen. Een paperopdracht met vragenlijst telt mee voor 1/20. Het theoretisch examen telt dus mee voor 14/20.<br /> <br /> ==Examenvragen juni==</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Immunological_Biotechnology&diff=1571 2019-01-28T15:42:52Z

<p>Cynthia.R: /* 28 januari 2019 */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak van derde bachelor biochemie. Ook gevolgd door zij die willen van chemie en biologie. Het wordt gegeven door Prof. Liliane Schoofs en is een mondeling examen met schriftelijke voorbereiding. Ze leest je antwoord en stelt dan bijvragen. <br /> Er wordt een volledige en verplichte practicum week gehouden, je mag zelf je groepje kiezen (3personen max). Van het practicum wordt ook een schriftelijk examen gehouden, waarbij je enkel vragen krijgt over de proefjes die jij hebt uitgevoerd.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 28 januari 2019 ===<br /> voor en namiddag hadden dezelfde vragen<br /> <br /> # Figuur van B cell die geactiveerd werd door Helper T cell en door een bacterie met Ab. Dit ging verder naar de 3 technieken die Ab gebruiken in het humoral immunity (neutralisation, opsonization en complement activation)<br /> # Figuur waarbij je moest uitleggen hoe MHC class 1 molecules worden geladen met Ag-peptiden in het ER.<br /> # Figuur van een MHC class 1 molcule die een peptide gebonden had, je zag dus de bèta-sheets en het peptide met zijn aminozuren. <br /> # Figuur van B cellen die in het been merg matureren tot plasma en memory cellen. Je moest zeggen dat er VDJ rearrangement komt, selectie van de B cellen o.b.v. self Ag, dit moest ook allemaal geplaatst worden in het lichaam.<br /> <br /> ===18/01/2019 NM===<br /> # Figuur van het maturatie process van T cellen in de thymus. Vraag: In welk orgaan speelt dit zich af en leg uit hoe dit gebeurt.<br /> # Figuur experiment van gel waarop germline DNA was geladen van C en V regio en van B cell DNA van C en V regio. Vraag: wat gebeurt er in dit experiment en wat kan je er uit afleiden (antwoord enkel op voorkant onder foto)<br /> # Figuur van verloop recombinatie DNA tussen D en J regio. Vraag: een aantal koppen waren weggelaten en moesten worden aangevuld en elke stap in 1 zin uitleggen<br /> # MC en juist fout vragen:<br /> #* Wat gebeurt er niet tijdens inflammation? (mogelijke anwtoorden: expressie cytokines, expressie chemokines, innate en adaptive immunity activeren, vernouwen van bloedvaten)<br /> #* Gebruiken NK cellen MHC class I? (mogelijke antwoorden: true or false)<br /> #* Wat gebeurde er niet in de evolutie van adaptieve immuniteit? (een aantal antwoorden die ik niet meer weet)<br /> #* Zorgen adaptieve immuniteitscellen voor specificiteit? (mogelijke antwoorden: true or false) <br /> #* Hematopoietic cellen kunnen nog in elke cel van het lichaam veranderen (mogelijke antwoorden: antwoorden true or false)<br /> <br /> ===17/01/2019 NM===<br /> # Figuur, opname bacterie, alles uitleggen, MF, dendritische cel, lymfe knopen, maturatie, ... Heel het immuunsysteem<br /> # Figuur, muizen SCID en Nude (alles staat op de afbeelding)<br /> # Figuur, Recombinatie T-cel (zelf aanvullen)<br /> # MP choice/ juist fout, 3 vraagjes eerste was over iemand die een ziekte had gekregen door het eten van fruit dat ze ingeblikt had. En dan moest ik zeggen welk mechanisme er het meest op ging reageren... Het ging om toxines dus had neutralisation gepakt, dat was juist. 2e snapte ik niets van, ging over bindingen tussen B- en T- cellen, het was complete nonsens, en dus fout. 3e was over recombinatie<br /> <br /> ===14 januari 2019 NM===<br /> # figuur uitleggen: virale infectie en laden van virale peptiden op MHC moleculen + wat daarna?<br /> # figuur uitleggen: experiment waarin beenmerg wordt getransfereerd naar bestraalde muizen met verschillend MHC genotype <br /> # figuur uitleggen: 3 manieren waarop Igs met rearranged V-region gewijzigd kunnen worden<br /> # 5 (gemakkelijke) korte vraagjes: 4 meerkeuze en 1 juist/fout<br /> <br /> ===23 augustus 2018 VM===<br /> # costimulus op immuuncellen, welke receptor, waarom?<br /> # class switching uitleggen: wat, wanneer,...<br /> # NK cellen, waneer, hoe mechanisme, hoe virus MHC-I tegehoudt<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> # Belang MHCI bij een niet geïnfecteerde cel<br /> # Activatie van naïve T-cel<br /> # geeft een verandering in de genen van een BCR uniek voor een b-cel<br /> ===18 januari 2018 VM===<br /> # Vergelijk folliculaire dendritische cel met een gewone dendritische cel.<br /> # Leg linked recognition uit en geef een medische toepassing.<br /> # Leg de werking van interferon gamma uit bij T cel differentiatie.<br /> <br /> ===16 januari 2018 VM===<br /> #Belang van Th1 cellen bij immuunrespons tegen intracellulaire bacterien<br /> #Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> #Bespreek en verklaar de invloed van meerdere immunizaties bij hetzelfde antigen bij humorale respons<br /> <br /> === 15 januari 2018 ===<br /> #costimulus op immuuncellen, welke receptor, waarom?<br /> #class switching uitleggen: wat, wanneer,...<br /> #NK cellen, waneer, hoe mechanisme, hoe virus MHC-I tegehoudt<br /> <br /> === 25 augustus 2017 VM ===<br /> # Bespreek de immuunrespons tegen extracellulaire parasieten.<br /> # Bespreek activatie van naïve B-cellen<br /> # Bespreek 3 fundamenteel verschillende mechanismen die auto-immuniteit voorkomen op verschillende plaatsen in het lichaam.<br /> <br /> === 31 januari 2017 ===<br /> #immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #activatie van naïve B-cellen<br /> #3 verdedigingsmechanisme om autoimmuniteit tegen te gaan<br /> <br /> === 30 januari 2017 VM ===<br /> #Belang van Th1 cellen bij immuunrespons tegen intracellulaire bacterien<br /> #Affinieteitmaturatie van B cellen<br /> #Bespreek de cellen die belangrijk zijn bij negatieve selectie van T cellen<br /> <br /> === 19 januari 2017 VM===<br /> #Immuunrespons endotheel<br /> #Thymus onafhankelijke B cel activatie<br /> #Centrale en perifere tolerantie T cellen a.d.h.v. voorbeeld<br /> <br /> === 17 januari 2017 NM=== <br /> #belang van MHC1 complex en gezonde lichaamscellen <br /> #Iets van bcr en gentransformatie <br /> #Activatie van Tcellen <br /> <br /> === 17 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek de rol van IFN-alfa en beta bij een virale infectie <br /> #Bespreek centrale en perifere tolerantie bij B CELLEN<br /> #Bespreek waarom CD8 T cellen meer stimulatie nodig hebben ivm CD4 T cellen <br /> <br /> === 16 januari 2017 NM ===<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten (wormen dus)<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.<br /> <br /> === 25 januari 2016 VM===<br /> # Geef de verschillen tussen folliculaire en normale dendritische cellen<br /> # Wat is linked recognition en geef een medische toepassing<br /> # Welke rol speelt IFN-γ bij de T-cel differentiatie?<br /> <br /> === 12 januari 2016 VM ===<br /> #Bespreek de immuunrespons op extracellulaire parasieten<br /> #Hoe worden naïve B-cellen geactiveerd?<br /> #Bespreek 3 fundamenteel verschillende mechanismen die autoimmuniteit voorkomen op verschillende plaatsen in het lichaam.<br /> <br /> === 11 januari 2016 NM ===<br /> #Bespreek het belang en mechanisme van activatie van het vasculair endotheel in de immuunrespons<br /> # Hoe kunnen B cellen geactiveerd worden als er geen T cellen aanwezig zijn<br /> # Centrale en perifere tolerantie van T cellen<br /> <br /> ===13 Jan 2015 (VM)===<br /> #Functie van interferon alfa en beta in virusinfectie<br /> #Bespreek aan de hand van een voorbeeld de centrale en perifere tolerantie van B cellen<br /> #Verklaar waarom CD8 meer costimulus nodig heeft dan CD4<br /> <br /> ===29 Jan 2014 (VM)===<br /> #Bespreek de vasculaire immunorespons van endotheelcellen<br /> #Bespreek thymus independent activation of B-cells<br /> #Bespreek aan de hand van een voorbeeld de centrale en perifere tolerantie van B cellen (ze zegt voorbeeld, maar als je gewoon uitlegt hoe de tolerantie tot stand komt is het goed)<br /> <br /> ===Jan 2014===<br /> #Functie van interferon alfa en beta in virusinfectie <br /> #Leg aan de hand van 1 voorbeeld de centrale en periferele tolerant van B cellen uit <br /> #Verklaar wrm CD8 meer costimulus nodig heeft dan CD4<br /> ===28 Jan 2014 (VM)===<br /> #Bespreek de expressie van een MHCI op een gezonde lichaamscel<br /> #Bespreek een verandering in de genen van de BCR die de B-cellen uniek maakt<br /> #Bespreek T cel priming.<br /> <br /> ===16 jan 2013 NM===<br /> (cfr 27 aug 2012)<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.<br /> ===27 aug 2012===<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit. <br /> === 27 jan 2012 NM===<br /> # Sommige micro-organismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het micro-organisme?<br /> # Bewijs dat thymus-stromacellen essentieel zijn voor de ontwikkeling van T-cellen<br /> # Bespreek hoe Th1-cellen de reactie tegen intracellulaire pathogenen via de macrofagen coördineren.<br /> === 27 jan 2012 VM===<br /> # Macrofagen zijn zowel in het aangeboren als het adaptief immuunsysteem belangrijk. Verklaar<br /> # Bespreek de primaire en secundaire antistof reactie<br /> # Vergelijk NK en CTL cel. Belangrijkste gelijkenissen en verschillen<br /> === 22 aug 2011 NM ===<br /> # Bespreek de rol van macrofagen in zowel de aangeboren en als de adaptieve immuunrespons. <br /> # Vergelijk de primaire en de secundaire immuunrespons.<br /> # Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> <br /> === 28 jan 2011 VM ===<br /> # Sommige microorganismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het microorganisme?<br /> # Bespreek het hapten-carrier effect en geef een medische toepassing. <br /> # Hoe kan een T cel aangezet worden tot clonale expansie?<br /> === 29 jan 2010 NM ===<br /> # Bespreek de rol van macrofagen in zowel de aangeboren en als de adaptieve immuunrespons. <br /> # Vergelijk de primaire en de secundaire immuunrespons.<br /> # Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> === 22 jan 2010 NM ===<br /> # Sommige microorganismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het microorganisme?<br /> # Bespreek het hapten-carrier effect en geef een medische toepassing. <br /> # Hoe kan een T cel aangezet worden tot clonale expansie?<br /> === 12 jan 2009 ===<br /> # Sommige organismen kunnen Fc fragmenten afbreken. waarom zou dit een hogere graad van overlevering opleveren?<br /> # Bewijs dat thymus stroma cellen essentieel zijn voor de ontwikkeling van T-cellen<br /> # Bespreek de interactie van Th1 cellen met macrofagen.<br /> === 12 jan 2009 ===<br /> # Bespreek de immunologische respons tegen een bacteriele infectie<br /> # Bespreek activatie van naive B-cel<br /> # 3 manieren om auto-immuniteit te omzeilen<br /> === 29 jan 2008 ===<br /> # Sommige pathogenen bevatten enzymen die die Fc fragmenten kunnen degraderen. Hoe kan dit een grotere overlevingskans opleveren voor dit pathogeen<br /> # Leg het hapteen-carrier effect uit en geef een toepassing<br /> # Hoe wordt een naïeve T-cel geactiveerd.<br /> <br /> === 28 jan 2008 ===<br /> # Activatie naive B cel<br /> # Immuunrespons tegen bacteriële infectie<br /> # 3 vbn. hoe er gezorgd wordt dat er geen autoimmuniteit is<br /> === 24 jan 2008 ===<br /> # Macrofagen hebben een rol in zowel innate als adaptive immunity, leg uit.<br /> # Leg de primaire en de secundaire antistofrespons uit.<br /> # leg gelijkenissen en verschillen uit van NK en CTL cells<br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # Bespreek de immuunrespons tegen bacteriële infectie (neen niet tegen intracellulaire, gewoon baceteriën int algemeen)<br /> # Bespreek activatie van naïeve B cel (neen niet T cel, goed lezen en vooral niet beginnen knallen van T cellen omdagu de voorbeeldvraag nog herinnert)<br /> # Bespreek de drie mechanismen die het lichaam beschermt tegen autoimmuniteit (of voorkomt of gebruikt ofzo)<br /> <br /> Practica:<br /> # Teken en leg uit. Kan je ook doen me een antigen me maar 1 epitoop<br /> # Wat leer je erdoor van de pI? Teken.<br /> # Wat is passieve en actieve hemagluttinatie + tekenen. Bewijs dat de interactie reversibel is<br /> # Leg het precipitatiemechanisme uit. Wat doet een PD10 kolom, naam + uitleg<br /> # Welke PAP concentratie verkies je (paar vb getalletjes, je kiest natuurlijk de beste). Verschil passieve en competitieve ELISA<br /> <br /> === 24 jan 2007 ===<br /> # bespreek de naieve Tcel en clonale expansie<br /> # Fc fragment: sommige organismen kunnen het afbreken. Hoe levert dit een hogere overleving op voor het organisme?<br /> # wat is het hapteen carrier-effect en geef toepasssingen.<br /> === 23 jan 2007 ===<br /> # bespreek de rol van macrofagen in aangeboren en adaptief immuunrespons<br /> # vergelijk: Primair vs Secundair immuunrespons<br /> # bespreek de gelijkenissen en verschillen NK - CTL.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Immunological_Biotechnology&diff=1570 2019-01-28T15:41:35Z

<p>Cynthia.R: /* Vakinformatie */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak van derde bachelor biochemie. Ook gevolgd door zij die willen van chemie en biologie. Het wordt gegeven door Prof. Liliane Schoofs en is een mondeling examen met schriftelijke voorbereiding. Ze leest je antwoord en stelt dan bijvragen. <br /> Er wordt een volledige en verplichte practicum week gehouden, je mag zelf je groepje kiezen (3personen max). Van het practicum wordt ook een schriftelijk examen gehouden, waarbij je enkel vragen krijgt over de proefjes die jij hebt uitgevoerd.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 28 januari 2019 ===<br /> voor en namiddag hadden dezelfde vragen<br /> <br /> # figuur van B cell die geactiveerd werd door Helper T cell en door een bacterie met Ab. Dit ging verder naar de 3 technieken die Ab gebruiken in het humoral immunity (neutralisation, opsonization en complement activation)<br /> # Figuur waarbij je moest uitleggen hoe MHC class 1 molecules worden geladen met Ag-peptiden in het ER.<br /> # Figuur van een MHC class 1 molcule die een peptide gebonden had, je zag dus de bèta-sheets en het peptide met zijn aminozuren. <br /> # Figuur van B cellen die in het been merg matureren tot plasma en memory cellen. Je moest zeggen dat er VDJ rearrangement komt, selectie van de B cellen o.b.v. self Ag, dit moest ook allemaal geplaatst worden in het lichaam.<br /> <br /> ===18/01/2019 NM===<br /> # Figuur van het maturatie process van T cellen in de thymus. Vraag: In welk orgaan speelt dit zich af en leg uit hoe dit gebeurt.<br /> # Figuur experiment van gel waarop germline DNA was geladen van C en V regio en van B cell DNA van C en V regio. Vraag: wat gebeurt er in dit experiment en wat kan je er uit afleiden (antwoord enkel op voorkant onder foto)<br /> # Figuur van verloop recombinatie DNA tussen D en J regio. Vraag: een aantal koppen waren weggelaten en moesten worden aangevuld en elke stap in 1 zin uitleggen<br /> # MC en juist fout vragen:<br /> #* Wat gebeurt er niet tijdens inflammation? (mogelijke anwtoorden: expressie cytokines, expressie chemokines, innate en adaptive immunity activeren, vernouwen van bloedvaten)<br /> #* Gebruiken NK cellen MHC class I? (mogelijke antwoorden: true or false)<br /> #* Wat gebeurde er niet in de evolutie van adaptieve immuniteit? (een aantal antwoorden die ik niet meer weet)<br /> #* Zorgen adaptieve immuniteitscellen voor specificiteit? (mogelijke antwoorden: true or false) <br /> #* Hematopoietic cellen kunnen nog in elke cel van het lichaam veranderen (mogelijke antwoorden: antwoorden true or false)<br /> <br /> ===17/01/2019 NM===<br /> # Figuur, opname bacterie, alles uitleggen, MF, dendritische cel, lymfe knopen, maturatie, ... Heel het immuunsysteem<br /> # Figuur, muizen SCID en Nude (alles staat op de afbeelding)<br /> # Figuur, Recombinatie T-cel (zelf aanvullen)<br /> # MP choice/ juist fout, 3 vraagjes eerste was over iemand die een ziekte had gekregen door het eten van fruit dat ze ingeblikt had. En dan moest ik zeggen welk mechanisme er het meest op ging reageren... Het ging om toxines dus had neutralisation gepakt, dat was juist. 2e snapte ik niets van, ging over bindingen tussen B- en T- cellen, het was complete nonsens, en dus fout. 3e was over recombinatie<br /> <br /> ===14 januari 2019 NM===<br /> # figuur uitleggen: virale infectie en laden van virale peptiden op MHC moleculen + wat daarna?<br /> # figuur uitleggen: experiment waarin beenmerg wordt getransfereerd naar bestraalde muizen met verschillend MHC genotype <br /> # figuur uitleggen: 3 manieren waarop Igs met rearranged V-region gewijzigd kunnen worden<br /> # 5 (gemakkelijke) korte vraagjes: 4 meerkeuze en 1 juist/fout<br /> <br /> ===23 augustus 2018 VM===<br /> # costimulus op immuuncellen, welke receptor, waarom?<br /> # class switching uitleggen: wat, wanneer,...<br /> # NK cellen, waneer, hoe mechanisme, hoe virus MHC-I tegehoudt<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> # Belang MHCI bij een niet geïnfecteerde cel<br /> # Activatie van naïve T-cel<br /> # geeft een verandering in de genen van een BCR uniek voor een b-cel<br /> ===18 januari 2018 VM===<br /> # Vergelijk folliculaire dendritische cel met een gewone dendritische cel.<br /> # Leg linked recognition uit en geef een medische toepassing.<br /> # Leg de werking van interferon gamma uit bij T cel differentiatie.<br /> <br /> ===16 januari 2018 VM===<br /> #Belang van Th1 cellen bij immuunrespons tegen intracellulaire bacterien<br /> #Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> #Bespreek en verklaar de invloed van meerdere immunizaties bij hetzelfde antigen bij humorale respons<br /> <br /> === 15 januari 2018 ===<br /> #costimulus op immuuncellen, welke receptor, waarom?<br /> #class switching uitleggen: wat, wanneer,...<br /> #NK cellen, waneer, hoe mechanisme, hoe virus MHC-I tegehoudt<br /> <br /> === 25 augustus 2017 VM ===<br /> # Bespreek de immuunrespons tegen extracellulaire parasieten.<br /> # Bespreek activatie van naïve B-cellen<br /> # Bespreek 3 fundamenteel verschillende mechanismen die auto-immuniteit voorkomen op verschillende plaatsen in het lichaam.<br /> <br /> === 31 januari 2017 ===<br /> #immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #activatie van naïve B-cellen<br /> #3 verdedigingsmechanisme om autoimmuniteit tegen te gaan<br /> <br /> === 30 januari 2017 VM ===<br /> #Belang van Th1 cellen bij immuunrespons tegen intracellulaire bacterien<br /> #Affinieteitmaturatie van B cellen<br /> #Bespreek de cellen die belangrijk zijn bij negatieve selectie van T cellen<br /> <br /> === 19 januari 2017 VM===<br /> #Immuunrespons endotheel<br /> #Thymus onafhankelijke B cel activatie<br /> #Centrale en perifere tolerantie T cellen a.d.h.v. voorbeeld<br /> <br /> === 17 januari 2017 NM=== <br /> #belang van MHC1 complex en gezonde lichaamscellen <br /> #Iets van bcr en gentransformatie <br /> #Activatie van Tcellen <br /> <br /> === 17 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek de rol van IFN-alfa en beta bij een virale infectie <br /> #Bespreek centrale en perifere tolerantie bij B CELLEN<br /> #Bespreek waarom CD8 T cellen meer stimulatie nodig hebben ivm CD4 T cellen <br /> <br /> === 16 januari 2017 NM ===<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten (wormen dus)<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.<br /> <br /> === 25 januari 2016 VM===<br /> # Geef de verschillen tussen folliculaire en normale dendritische cellen<br /> # Wat is linked recognition en geef een medische toepassing<br /> # Welke rol speelt IFN-γ bij de T-cel differentiatie?<br /> <br /> === 12 januari 2016 VM ===<br /> #Bespreek de immuunrespons op extracellulaire parasieten<br /> #Hoe worden naïve B-cellen geactiveerd?<br /> #Bespreek 3 fundamenteel verschillende mechanismen die autoimmuniteit voorkomen op verschillende plaatsen in het lichaam.<br /> <br /> === 11 januari 2016 NM ===<br /> #Bespreek het belang en mechanisme van activatie van het vasculair endotheel in de immuunrespons<br /> # Hoe kunnen B cellen geactiveerd worden als er geen T cellen aanwezig zijn<br /> # Centrale en perifere tolerantie van T cellen<br /> <br /> ===13 Jan 2015 (VM)===<br /> #Functie van interferon alfa en beta in virusinfectie<br /> #Bespreek aan de hand van een voorbeeld de centrale en perifere tolerantie van B cellen<br /> #Verklaar waarom CD8 meer costimulus nodig heeft dan CD4<br /> <br /> ===29 Jan 2014 (VM)===<br /> #Bespreek de vasculaire immunorespons van endotheelcellen<br /> #Bespreek thymus independent activation of B-cells<br /> #Bespreek aan de hand van een voorbeeld de centrale en perifere tolerantie van B cellen (ze zegt voorbeeld, maar als je gewoon uitlegt hoe de tolerantie tot stand komt is het goed)<br /> <br /> ===Jan 2014===<br /> #Functie van interferon alfa en beta in virusinfectie <br /> #Leg aan de hand van 1 voorbeeld de centrale en periferele tolerant van B cellen uit <br /> #Verklaar wrm CD8 meer costimulus nodig heeft dan CD4<br /> ===28 Jan 2014 (VM)===<br /> #Bespreek de expressie van een MHCI op een gezonde lichaamscel<br /> #Bespreek een verandering in de genen van de BCR die de B-cellen uniek maakt<br /> #Bespreek T cel priming.<br /> <br /> ===16 jan 2013 NM===<br /> (cfr 27 aug 2012)<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.<br /> ===27 aug 2012===<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit. <br /> === 27 jan 2012 NM===<br /> # Sommige micro-organismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het micro-organisme?<br /> # Bewijs dat thymus-stromacellen essentieel zijn voor de ontwikkeling van T-cellen<br /> # Bespreek hoe Th1-cellen de reactie tegen intracellulaire pathogenen via de macrofagen coördineren.<br /> === 27 jan 2012 VM===<br /> # Macrofagen zijn zowel in het aangeboren als het adaptief immuunsysteem belangrijk. Verklaar<br /> # Bespreek de primaire en secundaire antistof reactie<br /> # Vergelijk NK en CTL cel. Belangrijkste gelijkenissen en verschillen<br /> === 22 aug 2011 NM ===<br /> # Bespreek de rol van macrofagen in zowel de aangeboren en als de adaptieve immuunrespons. <br /> # Vergelijk de primaire en de secundaire immuunrespons.<br /> # Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> <br /> === 28 jan 2011 VM ===<br /> # Sommige microorganismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het microorganisme?<br /> # Bespreek het hapten-carrier effect en geef een medische toepassing. <br /> # Hoe kan een T cel aangezet worden tot clonale expansie?<br /> === 29 jan 2010 NM ===<br /> # Bespreek de rol van macrofagen in zowel de aangeboren en als de adaptieve immuunrespons. <br /> # Vergelijk de primaire en de secundaire immuunrespons.<br /> # Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> === 22 jan 2010 NM ===<br /> # Sommige microorganismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het microorganisme?<br /> # Bespreek het hapten-carrier effect en geef een medische toepassing. <br /> # Hoe kan een T cel aangezet worden tot clonale expansie?<br /> === 12 jan 2009 ===<br /> # Sommige organismen kunnen Fc fragmenten afbreken. waarom zou dit een hogere graad van overlevering opleveren?<br /> # Bewijs dat thymus stroma cellen essentieel zijn voor de ontwikkeling van T-cellen<br /> # Bespreek de interactie van Th1 cellen met macrofagen.<br /> === 12 jan 2009 ===<br /> # Bespreek de immunologische respons tegen een bacteriele infectie<br /> # Bespreek activatie van naive B-cel<br /> # 3 manieren om auto-immuniteit te omzeilen<br /> === 29 jan 2008 ===<br /> # Sommige pathogenen bevatten enzymen die die Fc fragmenten kunnen degraderen. Hoe kan dit een grotere overlevingskans opleveren voor dit pathogeen<br /> # Leg het hapteen-carrier effect uit en geef een toepassing<br /> # Hoe wordt een naïeve T-cel geactiveerd.<br /> <br /> === 28 jan 2008 ===<br /> # Activatie naive B cel<br /> # Immuunrespons tegen bacteriële infectie<br /> # 3 vbn. hoe er gezorgd wordt dat er geen autoimmuniteit is<br /> === 24 jan 2008 ===<br /> # Macrofagen hebben een rol in zowel innate als adaptive immunity, leg uit.<br /> # Leg de primaire en de secundaire antistofrespons uit.<br /> # leg gelijkenissen en verschillen uit van NK en CTL cells<br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # Bespreek de immuunrespons tegen bacteriële infectie (neen niet tegen intracellulaire, gewoon baceteriën int algemeen)<br /> # Bespreek activatie van naïeve B cel (neen niet T cel, goed lezen en vooral niet beginnen knallen van T cellen omdagu de voorbeeldvraag nog herinnert)<br /> # Bespreek de drie mechanismen die het lichaam beschermt tegen autoimmuniteit (of voorkomt of gebruikt ofzo)<br /> <br /> Practica:<br /> # Teken en leg uit. Kan je ook doen me een antigen me maar 1 epitoop<br /> # Wat leer je erdoor van de pI? Teken.<br /> # Wat is passieve en actieve hemagluttinatie + tekenen. Bewijs dat de interactie reversibel is<br /> # Leg het precipitatiemechanisme uit. Wat doet een PD10 kolom, naam + uitleg<br /> # Welke PAP concentratie verkies je (paar vb getalletjes, je kiest natuurlijk de beste). Verschil passieve en competitieve ELISA<br /> <br /> === 24 jan 2007 ===<br /> # bespreek de naieve Tcel en clonale expansie<br /> # Fc fragment: sommige organismen kunnen het afbreken. Hoe levert dit een hogere overleving op voor het organisme?<br /> # wat is het hapteen carrier-effect en geef toepasssingen.<br /> === 23 jan 2007 ===<br /> # bespreek de rol van macrofagen in aangeboren en adaptief immuunrespons<br /> # vergelijk: Primair vs Secundair immuunrespons<br /> # bespreek de gelijkenissen en verschillen NK - CTL.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Immunological_Biotechnology&diff=1569 2019-01-28T15:38:54Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak van derde bachelor biochemie. Ook gevolgd door zij die willen van chemie en biologie. Gedoceerd door Prof. Lut Arckens, mondeling examen. Ze leest je blad en stelt dan bijvragen. Voorbeelden zijn belangrijk! Er wordt een volle verplichte practicumweek gehouden (je kiest met je groep wanneer je komt en vertrekt) en het examen ervoor is sinds 2008-09 apart en schriftelijk (vragen verschillen van persoon tot persoon daar niet iedereen dezelfde proeven had uitgevoerd tijdens het practicum).<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 28 januari 2019 ===<br /> voor en namiddag hadden dezelfde vragen<br /> <br /> # figuur van B cell die geactiveerd werd door Helper T cell en door een bacterie met Ab. Dit ging verder naar de 3 technieken die Ab gebruiken in het humoral immunity (neutralisation, opsonization en complement activation)<br /> # Figuur waarbij je moest uitleggen hoe MHC class 1 molecules worden geladen met Ag-peptiden in het ER.<br /> # Figuur van een MHC class 1 molcule die een peptide gebonden had, je zag dus de bèta-sheets en het peptide met zijn aminozuren. <br /> # Figuur van B cellen die in het been merg matureren tot plasma en memory cellen. Je moest zeggen dat er VDJ rearrangement komt, selectie van de B cellen o.b.v. self Ag, dit moest ook allemaal geplaatst worden in het lichaam.<br /> <br /> ===18/01/2019 NM===<br /> # Figuur van het maturatie process van T cellen in de thymus. Vraag: In welk orgaan speelt dit zich af en leg uit hoe dit gebeurt.<br /> # Figuur experiment van gel waarop germline DNA was geladen van C en V regio en van B cell DNA van C en V regio. Vraag: wat gebeurt er in dit experiment en wat kan je er uit afleiden (antwoord enkel op voorkant onder foto)<br /> # Figuur van verloop recombinatie DNA tussen D en J regio. Vraag: een aantal koppen waren weggelaten en moesten worden aangevuld en elke stap in 1 zin uitleggen<br /> # MC en juist fout vragen:<br /> #* Wat gebeurt er niet tijdens inflammation? (mogelijke anwtoorden: expressie cytokines, expressie chemokines, innate en adaptive immunity activeren, vernouwen van bloedvaten)<br /> #* Gebruiken NK cellen MHC class I? (mogelijke antwoorden: true or false)<br /> #* Wat gebeurde er niet in de evolutie van adaptieve immuniteit? (een aantal antwoorden die ik niet meer weet)<br /> #* Zorgen adaptieve immuniteitscellen voor specificiteit? (mogelijke antwoorden: true or false) <br /> #* Hematopoietic cellen kunnen nog in elke cel van het lichaam veranderen (mogelijke antwoorden: antwoorden true or false)<br /> <br /> ===17/01/2019 NM===<br /> # Figuur, opname bacterie, alles uitleggen, MF, dendritische cel, lymfe knopen, maturatie, ... Heel het immuunsysteem<br /> # Figuur, muizen SCID en Nude (alles staat op de afbeelding)<br /> # Figuur, Recombinatie T-cel (zelf aanvullen)<br /> # MP choice/ juist fout, 3 vraagjes eerste was over iemand die een ziekte had gekregen door het eten van fruit dat ze ingeblikt had. En dan moest ik zeggen welk mechanisme er het meest op ging reageren... Het ging om toxines dus had neutralisation gepakt, dat was juist. 2e snapte ik niets van, ging over bindingen tussen B- en T- cellen, het was complete nonsens, en dus fout. 3e was over recombinatie<br /> <br /> ===14 januari 2019 NM===<br /> # figuur uitleggen: virale infectie en laden van virale peptiden op MHC moleculen + wat daarna?<br /> # figuur uitleggen: experiment waarin beenmerg wordt getransfereerd naar bestraalde muizen met verschillend MHC genotype <br /> # figuur uitleggen: 3 manieren waarop Igs met rearranged V-region gewijzigd kunnen worden<br /> # 5 (gemakkelijke) korte vraagjes: 4 meerkeuze en 1 juist/fout<br /> <br /> ===23 augustus 2018 VM===<br /> # costimulus op immuuncellen, welke receptor, waarom?<br /> # class switching uitleggen: wat, wanneer,...<br /> # NK cellen, waneer, hoe mechanisme, hoe virus MHC-I tegehoudt<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> # Belang MHCI bij een niet geïnfecteerde cel<br /> # Activatie van naïve T-cel<br /> # geeft een verandering in de genen van een BCR uniek voor een b-cel<br /> ===18 januari 2018 VM===<br /> # Vergelijk folliculaire dendritische cel met een gewone dendritische cel.<br /> # Leg linked recognition uit en geef een medische toepassing.<br /> # Leg de werking van interferon gamma uit bij T cel differentiatie.<br /> <br /> ===16 januari 2018 VM===<br /> #Belang van Th1 cellen bij immuunrespons tegen intracellulaire bacterien<br /> #Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> #Bespreek en verklaar de invloed van meerdere immunizaties bij hetzelfde antigen bij humorale respons<br /> <br /> === 15 januari 2018 ===<br /> #costimulus op immuuncellen, welke receptor, waarom?<br /> #class switching uitleggen: wat, wanneer,...<br /> #NK cellen, waneer, hoe mechanisme, hoe virus MHC-I tegehoudt<br /> <br /> === 25 augustus 2017 VM ===<br /> # Bespreek de immuunrespons tegen extracellulaire parasieten.<br /> # Bespreek activatie van naïve B-cellen<br /> # Bespreek 3 fundamenteel verschillende mechanismen die auto-immuniteit voorkomen op verschillende plaatsen in het lichaam.<br /> <br /> === 31 januari 2017 ===<br /> #immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #activatie van naïve B-cellen<br /> #3 verdedigingsmechanisme om autoimmuniteit tegen te gaan<br /> <br /> === 30 januari 2017 VM ===<br /> #Belang van Th1 cellen bij immuunrespons tegen intracellulaire bacterien<br /> #Affinieteitmaturatie van B cellen<br /> #Bespreek de cellen die belangrijk zijn bij negatieve selectie van T cellen<br /> <br /> === 19 januari 2017 VM===<br /> #Immuunrespons endotheel<br /> #Thymus onafhankelijke B cel activatie<br /> #Centrale en perifere tolerantie T cellen a.d.h.v. voorbeeld<br /> <br /> === 17 januari 2017 NM=== <br /> #belang van MHC1 complex en gezonde lichaamscellen <br /> #Iets van bcr en gentransformatie <br /> #Activatie van Tcellen <br /> <br /> === 17 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek de rol van IFN-alfa en beta bij een virale infectie <br /> #Bespreek centrale en perifere tolerantie bij B CELLEN<br /> #Bespreek waarom CD8 T cellen meer stimulatie nodig hebben ivm CD4 T cellen <br /> <br /> === 16 januari 2017 NM ===<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten (wormen dus)<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.<br /> <br /> === 25 januari 2016 VM===<br /> # Geef de verschillen tussen folliculaire en normale dendritische cellen<br /> # Wat is linked recognition en geef een medische toepassing<br /> # Welke rol speelt IFN-γ bij de T-cel differentiatie?<br /> <br /> === 12 januari 2016 VM ===<br /> #Bespreek de immuunrespons op extracellulaire parasieten<br /> #Hoe worden naïve B-cellen geactiveerd?<br /> #Bespreek 3 fundamenteel verschillende mechanismen die autoimmuniteit voorkomen op verschillende plaatsen in het lichaam.<br /> <br /> === 11 januari 2016 NM ===<br /> #Bespreek het belang en mechanisme van activatie van het vasculair endotheel in de immuunrespons<br /> # Hoe kunnen B cellen geactiveerd worden als er geen T cellen aanwezig zijn<br /> # Centrale en perifere tolerantie van T cellen<br /> <br /> ===13 Jan 2015 (VM)===<br /> #Functie van interferon alfa en beta in virusinfectie<br /> #Bespreek aan de hand van een voorbeeld de centrale en perifere tolerantie van B cellen<br /> #Verklaar waarom CD8 meer costimulus nodig heeft dan CD4<br /> <br /> ===29 Jan 2014 (VM)===<br /> #Bespreek de vasculaire immunorespons van endotheelcellen<br /> #Bespreek thymus independent activation of B-cells<br /> #Bespreek aan de hand van een voorbeeld de centrale en perifere tolerantie van B cellen (ze zegt voorbeeld, maar als je gewoon uitlegt hoe de tolerantie tot stand komt is het goed)<br /> <br /> ===Jan 2014===<br /> #Functie van interferon alfa en beta in virusinfectie <br /> #Leg aan de hand van 1 voorbeeld de centrale en periferele tolerant van B cellen uit <br /> #Verklaar wrm CD8 meer costimulus nodig heeft dan CD4<br /> ===28 Jan 2014 (VM)===<br /> #Bespreek de expressie van een MHCI op een gezonde lichaamscel<br /> #Bespreek een verandering in de genen van de BCR die de B-cellen uniek maakt<br /> #Bespreek T cel priming.<br /> <br /> ===16 jan 2013 NM===<br /> (cfr 27 aug 2012)<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.<br /> ===27 aug 2012===<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit. <br /> === 27 jan 2012 NM===<br /> # Sommige micro-organismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het micro-organisme?<br /> # Bewijs dat thymus-stromacellen essentieel zijn voor de ontwikkeling van T-cellen<br /> # Bespreek hoe Th1-cellen de reactie tegen intracellulaire pathogenen via de macrofagen coördineren.<br /> === 27 jan 2012 VM===<br /> # Macrofagen zijn zowel in het aangeboren als het adaptief immuunsysteem belangrijk. Verklaar<br /> # Bespreek de primaire en secundaire antistof reactie<br /> # Vergelijk NK en CTL cel. Belangrijkste gelijkenissen en verschillen<br /> === 22 aug 2011 NM ===<br /> # Bespreek de rol van macrofagen in zowel de aangeboren en als de adaptieve immuunrespons. <br /> # Vergelijk de primaire en de secundaire immuunrespons.<br /> # Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> <br /> === 28 jan 2011 VM ===<br /> # Sommige microorganismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het microorganisme?<br /> # Bespreek het hapten-carrier effect en geef een medische toepassing. <br /> # Hoe kan een T cel aangezet worden tot clonale expansie?<br /> === 29 jan 2010 NM ===<br /> # Bespreek de rol van macrofagen in zowel de aangeboren en als de adaptieve immuunrespons. <br /> # Vergelijk de primaire en de secundaire immuunrespons.<br /> # Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> === 22 jan 2010 NM ===<br /> # Sommige microorganismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het microorganisme?<br /> # Bespreek het hapten-carrier effect en geef een medische toepassing. <br /> # Hoe kan een T cel aangezet worden tot clonale expansie?<br /> === 12 jan 2009 ===<br /> # Sommige organismen kunnen Fc fragmenten afbreken. waarom zou dit een hogere graad van overlevering opleveren?<br /> # Bewijs dat thymus stroma cellen essentieel zijn voor de ontwikkeling van T-cellen<br /> # Bespreek de interactie van Th1 cellen met macrofagen.<br /> === 12 jan 2009 ===<br /> # Bespreek de immunologische respons tegen een bacteriele infectie<br /> # Bespreek activatie van naive B-cel<br /> # 3 manieren om auto-immuniteit te omzeilen<br /> === 29 jan 2008 ===<br /> # Sommige pathogenen bevatten enzymen die die Fc fragmenten kunnen degraderen. Hoe kan dit een grotere overlevingskans opleveren voor dit pathogeen<br /> # Leg het hapteen-carrier effect uit en geef een toepassing<br /> # Hoe wordt een naïeve T-cel geactiveerd.<br /> <br /> === 28 jan 2008 ===<br /> # Activatie naive B cel<br /> # Immuunrespons tegen bacteriële infectie<br /> # 3 vbn. hoe er gezorgd wordt dat er geen autoimmuniteit is<br /> === 24 jan 2008 ===<br /> # Macrofagen hebben een rol in zowel innate als adaptive immunity, leg uit.<br /> # Leg de primaire en de secundaire antistofrespons uit.<br /> # leg gelijkenissen en verschillen uit van NK en CTL cells<br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # Bespreek de immuunrespons tegen bacteriële infectie (neen niet tegen intracellulaire, gewoon baceteriën int algemeen)<br /> # Bespreek activatie van naïeve B cel (neen niet T cel, goed lezen en vooral niet beginnen knallen van T cellen omdagu de voorbeeldvraag nog herinnert)<br /> # Bespreek de drie mechanismen die het lichaam beschermt tegen autoimmuniteit (of voorkomt of gebruikt ofzo)<br /> <br /> Practica:<br /> # Teken en leg uit. Kan je ook doen me een antigen me maar 1 epitoop<br /> # Wat leer je erdoor van de pI? Teken.<br /> # Wat is passieve en actieve hemagluttinatie + tekenen. Bewijs dat de interactie reversibel is<br /> # Leg het precipitatiemechanisme uit. Wat doet een PD10 kolom, naam + uitleg<br /> # Welke PAP concentratie verkies je (paar vb getalletjes, je kiest natuurlijk de beste). Verschil passieve en competitieve ELISA<br /> <br /> === 24 jan 2007 ===<br /> # bespreek de naieve Tcel en clonale expansie<br /> # Fc fragment: sommige organismen kunnen het afbreken. Hoe levert dit een hogere overleving op voor het organisme?<br /> # wat is het hapteen carrier-effect en geef toepasssingen.<br /> === 23 jan 2007 ===<br /> # bespreek de rol van macrofagen in aangeboren en adaptief immuunrespons<br /> # vergelijk: Primair vs Secundair immuunrespons<br /> # bespreek de gelijkenissen en verschillen NK - CTL.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=1390 2019-01-17T15:24:18Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ====PLANT (Reeks 8) ====<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ====DIER====<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ====PLANT ====<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ====DIER====<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 17 januari 2018 ===<br /> ====Plant====<br /> # Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)<br /> # Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?<br /> # Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.<br /> # Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?<br /> <br /> ====Dier====<br /> # Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.<br /> # Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=1389 2019-01-17T15:23:25Z

<p>Cynthia.R: /* Dier */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ===PLANT (Reeks 8) ===<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ===PLANT ===<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> === 17 januari 2018 ===<br /> <br /> ====Plant====<br /> # Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)<br /> # Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?<br /> # Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.<br /> # Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?<br /> <br /> ====Dier====<br /> # Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.<br /> # Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=1388 2019-01-17T15:23:11Z

<p>Cynthia.R: /* Plant */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ===PLANT (Reeks 8) ===<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ===PLANT ===<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> === 17 januari 2018 ===<br /> <br /> ====Plant====<br /> # Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)<br /> # Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?<br /> # Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.<br /> # Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?<br /> <br /> ==Dier==<br /> # Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.<br /> # Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=1387 2019-01-17T15:23:01Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ===PLANT (Reeks 8) ===<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ===PLANT ===<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> === 17 januari 2018 ===<br /> <br /> ==Plant==<br /> # Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)<br /> # Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?<br /> # Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.<br /> # Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?<br /> <br /> ==Dier==<br /> # Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.<br /> # Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=1386 2019-01-17T15:22:23Z

<p>Cynthia.R: /* Plant */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ===PLANT (Reeks 8) ===<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ===PLANT ===<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> === 17 januari 2018 ===<br /> ==Plant==<br /> # Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)<br /> # Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?<br /> # Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.<br /> # Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?<br /> <br /> ==Dier==<br /> # Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.<br /> # Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=1385 2019-01-17T15:22:10Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ===PLANT (Reeks 8) ===<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ===PLANT ===<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> === 17 januari 2018 ===<br /> ==Plant==<br /> # Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)<br /> # Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?<br /> # Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.<br /> # Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?<br /> <br /> ==Dier==<br /> # Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.<br /> # Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?<br /> <br /> ==Plant==</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=1384 2019-01-17T15:17:11Z

<p>Cynthia.R: /* 17 januari 2018 */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ===PLANT (Reeks 8) ===<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ===PLANT ===<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> === 17 januari 2018 ===<br /> <br /> ==Plant==</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=1383 2019-01-17T15:16:59Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ===PLANT (Reeks 8) ===<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ===PLANT ===<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> === 17 januari 2018 ===<br /> ==Plant==</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=1382 2019-01-17T15:15:55Z

<p>Cynthia.R: /* Vakinformatie */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ===PLANT (Reeks 8) ===<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ===PLANT ===<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=1381 2019-01-17T15:13:27Z

<p>Cynthia.R: /* Vakinformatie */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Beide delen zijn mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ===PLANT (Reeks 8) ===<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ===PLANT ===<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=1380 2019-01-17T15:12:20Z

<p>Cynthia.R: /* Vakinformatie */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Beide delen zijn mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ===PLANT (Reeks 8) ===<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ===PLANT ===<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ===DIER===<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Chemische_Thermodynamica&diff=1334 2019-01-14T15:04:05Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Zowel gevolgd door chemie als biochemie, tegenwoordig in het derde jaar voor biochemie en tweede jaar chemie. Een 'mondeling' examen met schriftelijke voorbereiding. In theorie want in praktijk verloopt het examen zonder veel woorden. De examenstructuur is altijd dezelfde: 2 theorievragen en 2 oefeningen, waarvan één altijd gaat over entropieverandering. Sinds 2012-2013 komt één van de theorievragen uit één van de artikels die je vooraf moest lezen.<br /> Het vak wordt gedoceerd door professor Thierry Verbiest, oefenzittingen werden vroeger gegeven door de zo mogelijk nog sympathiekere Maarten Vanbel.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===14 januari 2019 NM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oefening over een monoatomisch gas dat isotherm wordt samengedrukt, waardoor de entropie daalt. <br /> #* Wat is de einddruk?<br /> #* Wat is de delta G?<br /> # Oefening over mengsels (zoals gezien in de les). Moleculaire massas en dichtheden gegeven.<br /> #* Hoeveel volume water en methanol moet men mengen om een bepaalde samenstelling te krijgen<br /> # Toon aan dat de entropie gelijk is aan 0 voor een reversibel proces bij fasetransities (bv smelten). Toon ook aan dat dit verschillend is van 0 voor een irreversibel proces<br /> # Leid de formule van Clapeyron af en toon dit aan voor smelten en verdampen<br /> <br /> ===14 januari 2019 VM===<br /> #Vuurpomp<br /> #Oefening over een ideaal gas dat reversibel isotherm wordt geëxpandeerd. T, V1, V2 gegeven. Bereken deltaH, deltaU, deltaG, deltaA, q en W. <br /> #Oefening over een ideaal gas dat isotherm wordt geëxpandeerd. Bereken deltaS van universum, systeem en omgeving in reversibele en irreversibele omstandigheden. V1, V2 en temperatuur gegeven. Voor irreversibele voorwaarden bij een constante externe druk van 0.1 atm. <br /> #Colligatieve eigenschappen <br /> #*Uitleggen en grafiek geven, wat doet de opgeloste stof met het chemisch potentiaal van de vloeistof? <br /> #*Bespreek kookpuntsverhoging<br /> #*Bespreek osmose<br /> #Mengsels van vloeistoffen <br /> #*Leidt een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van mengsels van ideale oplossingen <br /> #*Hoe zit dit voor reële vloeistoffen? (+grafiek)<br /> <br /> ===1 februari 2018===<br /> #vuurpomp<br /> #vraag over donnanpotentiaal<br /> #vraag over mengsels<br /> <br /> ===26 januari 2018===<br /> #Proteinevouwing<br /> #Carnot cyclus<br /> #Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom da oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.<br /> #entropie oef<br /> #verdampingsenthalpie, kookpunt, verdampingsentropie en ebullioscopische cte.<br /> <br /> === 19 januari 2018 ===<br /> <br /> #Vuurpomp uitleggen<br /> # 1 mol gas word isotherm ontspannen, bepaal q, W, delta U, entropie van omgeving en systeem voor een reversibel en irreversibel geval<br /> # gas wordt opgewarmd, bepaal molaire entropie verandering<br /> # chemische potentiaal van vloeistoffen: ideale en reële mengsels, wet van Raoult en wet van Henry<br /> # denaturatie van proteïnen: formule voor delta G in functie van temperatuur afleiden, curve schetsen en grondig bespreken<br /> <br /> === 19 januari 2018===<br /> # Vuurpomp<br /> # 1 mol ideaal gas: expansie van 20L tot 200L bij 300K. Gevraagd: entropieverandering van systeem, omgeving en universum voor: <br /> #* a. Reversibel<br /> #* b. Irreversibel bij 0.1 atm buitendruk<br /> # Gevraagd: de verandering in molaire entropie bij verwarming van stikstofgas van 25°C tot 1000°C bij constante druk. ( Gegeven: Cp = 26.9835 + 5.9622*10(^-3) T – 377*10(^-7) T(^2) )<br /> # Beschouw de reactie 3A+2B &lt;=&gt; C+2D. <br /> #* Leid het verband van de standaard Gibbsfunctie en de evenwichtsconstante af. En wat met reële gassen? (1.5p)<br /> #* Toon de drukonafhankelijkheid aan (1p)<br /> #* Toon de temperatuursafhankelijkheid aan (1.5p)<br /> # Beschouw F(folded) &lt;=&gt; U(unfolded). <br /> #* Leid deltaG in functie van de temperatuur af (1.5p)<br /> #* schets de stabiliteitscurve en bespreek gronding (2.5p)<br /> <br /> === 15 januari 2018 ===<br /> <br /> # Vuurpomp uitleggen<br /> # Oefening op entropie met isotherme compressie ---&gt; bepaal einddruk en delta G<br /> # Oefening partieel molaire volumes<br /> # Entropie voor fasetransities afleiden<br /> # Clausius-Clapeyronvgl. afleiden en toepassen voor smelten en verdampen<br /> <br /> === 3 februari 2017 NM ===<br /> <br /> # Artikel over proteïne (4 ptn): Welke interacties spelen een rol bij de opvouwing van een bêta-hairpin? Hoe dragen deze interacties bij aan de enthalpieverandering van het opvouwingsproces? Gebruik tabel 1. (gegeven)<br /> #*Bijvragen: hij heeft een klokcurve op zijn blad getekend: hoe beïnvloed Cp de curve? (breder). Draagt water meer bij aan de opvouwing van de hairpin dan methanol? De opvouwing van de hydrofobe zijketens, hoe noemen we dit effect? (hij doelt op hydrofoob effect).<br /> # Oefening (2 ptn): gegeven: 1 mol, temperatuur 767°C verhogen naar 1027°C, druk gaat van 1 atm naar 6 atm, molaire Cv = 3/2 R. Bereken de enthalpieverandering en de entropieverandering. <br /> # Oefening (2 ptn): gegeven: 3 mol, temperatuur 27°C, de reactie is isotherm, druk gaat van 1 atm naar 5 atm. Bereken de verandering in vrije energie.<br /> # Carnot-cyclus:<br /> #* Teken het p-V en S-T diagram. (1,5 ptn)<br /> #* Bereken voor elke stap w, q, U en entropieverandering. (1,5 ptn)<br /> #* Toon aan dat de totale U en totale entropieverandering nul is. (1ptn)<br /> # Chemisch potentiaal mengsels (gas en vloeistof)<br /> #* Bespreek de verandering in Gibbs en entropie bij het mengen van ideale gassen. (1,6 ptn)<br /> #* Doe dit ook voor ideale vloeistoffen. (1,2 ptn)<br /> #* Kan je hetzelfde besluiten voor vloeistoffen en gassen? Bespreek dit. (1,2 ptn)<br /> <br /> === 27 januari 2017 NM ===<br /> <br /> # Artikel over proteïne<br /> # Oefening tripelpunt en kooktemperatuur<br /> # Oefening entropie berkenen<br /> # Chemisch potentiaal mengsel vloeistoffen, uitdrukking G en aantonen dat het entropie gedreven is<br /> # Kinetisch gasmodel en fotongas<br /> <br /> === 27 januari 2017 VM ===<br /> <br /> # Artikel over proteïnen<br /> # Geef q, U en W voor volgende processen met ideale gassen<br /> #* isotherme expansie in vacuum<br /> #* adiabatische expansie in vacuum<br /> #* isotherme expansie tegen constante druk<br /> #* adiabatische expansie tegen constante druk<br /> #* reversibele isotherme expansie<br /> #* reversibele adiabatische expansie<br /> #* isochoor proces (weet niet meer exact)<br /> # Chemische potentiaal kort uitleggen, geef afleiding metaal/metaalion electrode<br /> # Oefening triplepunt en kooktemperatuur<br /> # Oefening entropie berekening<br /> <br /> === 20 januari 2017 NM ===<br /> <br /> #Vuurpomp vertrekkende van de eerste hoofdwet van de thermodynamica<br /> #entropie (van systeem, universum en omgeving) als je een gas opwarmt van 768 tot 1028 K en samendrukt door het veranderen van de druk van 1 atm tot 6 atm. je mocht dit beschouwen als een reversibel proces. Wat is de entropie?<br /> #een mol gas (argon) ontspant zich bij 273K adiabatisch van 1L naar 10L, wat is de eindtemperatuur? gebruik voor warmtecapaciteit C(v)= 3/2R<br /> #leidt een formule af voor chemische potentiaal bij het mengen van twee stoffen. leidt dan ook de gibbsfunctie af en toon aan dat dit entropisch gedreven is.<br /> #Toon aan dat stoffen aan de oppervlakte van een stof de oppervlaktespanning doen dalen. Leidt de formule van Young-Laplace af.<br /> <br /> === 16 januari 2017 VM ===<br /> #Werking van de vuurpomp beschrijven m.b.v. de eerste hoofdwet van de thermodynamica.<br /> #Bereken een reactie-enthalpie bij 1000K (de reactie en de reactie-enthalpie bij 298K is gegeven).<br /> #Een gas bij 25°C wordt verwarmd bij constante druk tot het verdubbeld is in volume. Bereken de verandering in enthalpie, entropie en vrije energie.<br /> #Mengen van ideale gassen, formule afleiden. (en nog dingen maar die ben ik vergeten omda ik ze nie kon :'( )<br /> #Leid de Clapeyron af en pas toe op Vast-Vloeistof en Vloeistof-Damp.<br /> <br /> === 22 januari 2016 NM ===<br /> #vuurpomp<br /> #colligatieve eigenschappen, kookpuntsverhoging, osmose<br /> #clapeyron afleiden en toepassen op smelten en verdampen<br /> #entropie (sys, omg, univ) berekenen reversibel, irreversibel en enthalpie van systeem berekenen met T1, T2, Cp gegeven<br /> #entropie, enthalpie en inwendige energie berekenen waarbij een systeem verwarmd word tot het volume verdubbelt is met P constant en Ti, P en n gegeven<br /> <br /> === 15 januari 2016 (VM) ===<br /> #Het artikel over het vouwen van eiwitten bespreken.<br /> #De dampspanning van een zuivere stof op twee verschillende temperaturen krijg je. Bereken de verdampingsenthalpie, ebullioscopische constante (molaire massa gegeven.), de temperatuur waarop de vloeistof verdampt en de entropie van dit proces. <br /> #Een (zeer eenvoudige) oefening waarin de entropie moet berekend worden van een expansie.<br /> #Bespreek de carnot cyclus.<br /> #De laplace vergelijking uitleggen en verklaren waarom stoffen die aan het oppervlakte opstapelen de oppervlaktespanning verlagen.<br /> <br /> === 11 januari 2016 NM ===<br /> Hetzelfde als 11 januari VM<br /> <br /> === 11 januari 2016 VM ===<br /> #vuurpomp (opdracht)<br /> #tripelpunt oefening: gegeven temperatuur bij tripelpunt, Pvap(T1), Pvap(T2) te berekenen enthalpie(vap), kooktemp. bij normaaldruk en druk op tripelpunt.<br /> #entropie en enthalpie bij reversibel en irreversibel oefening: gegeven T1, T2, Cp<br /> #colligatieve eigenschappen bespreken (wat is het + invloed van de opgeloste stof op de chemische potentiaal van de vloeistof) en kookpuntsverhoging en osmose<br /> #elektrochemische potentiaal en metaal/metaalionelectrode + Nernstvergelijking (kort) afleiden + (heel kort) bespreken hoe enthalpie en entropie bepaald kan worden uit elektrochemie<br /> <br /> === 12 januari 2015 (NM) ===<br /> <br /> # 1. Dat vuur pomp stuff.<br /> # 2. Bereken tripel punt shit.<br /> # 3. Wat met entropie spelen n stuff.<br /> # 4. Een of ander carnot cyclus... komt dat iemand bekend voor?<br /> # 5. Wat shit met oppervlakte spanning en Young en een van zijn Franse maatjes afleiden<br /> <br /> === 17 januari 2014 ===<br /> <br /> # vraag over enthalpie bij peptide vouwen, vraag 1 van da document<br /> # Oefening om enthalpie te bereken bij 1000K terwijl de enthalpie is gegeven bij 298K van een reactievgl<br /> # Entropie berekening voor irreversibel en reversibel proces <br /> # leidt de formule van de oppervlaktespanning af, bewijs dat stoffen die de oppervlaktespanning verlagen de nijging hebben om zich aan de oppervlakte op te stapelen, Leidt de vergelijking van Young-dupre af<br /> # leg te elektrochemische potentiaal uit( gewoon de vergelijking uitleggen), leg membraanpotentiaal uit, leg metaal/metaan-ion elektrode uit<br /> <br /> === 28 januari 2013 ===<br /> <br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en pas dit toe op een metaal/metaalionelektrode.<br /> # Toon aan dat een adiabatische expansie kan leiden tot mistvorming in een erlenmeyer (artikel).<br /> # Oefening: bepaling van de molaire entropieverandering bij verwarmen en compresseren. Warmtecapaciteit bij constant volume is geggeven.<br /> # Oefening: bereken delta H bij 1000 K van de reactie: CO + H2O -&amp;gt; CO2 + H2. delta H bij 298 K is gegeven, als ook de Cp's van de stoffen.<br /> <br /> === 25 januari 2013 ===<br /> <br /> # bewijs: bij adiabatisch proces is p1V1^(lambda)=p2V2^(lambda)<br /> # bespreek de rol van enthalpie en entropie bij het hydrofoob effect<br /> # bepaling van de tempperatuursverandering bij adiabatische compressie (begin- en einddruk, begintemp gegeven)<br /> # bepaling van delta U en delta H bij een opwarming bij constante druk (cv, massa, molaire massa en begin- en eindtemp gegeven)<br /> <br /> === 18 januari 2013 ===<br /> <br /> # Toon aan dat de gemiddelde kinetische energie van een mol gas gelijk is aan 3/2 RT<br /> # Leg uit hoe een adiabatische expansie kan leiden tot mistvorming in een erlenmeyer (vraag uit artikel).<br /> # Oefening: entropieverandering van 298 K en 2 atm naar 233 K en 0.4 atm. Warmtecapaciteit bij constant volume is gegeven.<br /> # Oefening: geef temperatuur en druk bij het tripelpunt van een bepaalde stof, twee vergelijkingen met p en T zijn al gegeven, je moet alleen nog maar het stelsel van twee vergelijkingen en twee onbekenden oplossen.<br /> <br /> === 3 feb 2012 ===<br /> <br /> # Geef het verschil tussen een isotherme en een adiabatische expansie. <br /> # Toon aan dat de gemiddelde kinetische energie van een mol gas gelijk is aan 3/2 RT<br /> # Oefening: entropieverandering van 298 K en 2 atm naar 233 K en 0.4 atm<br /> # Oefening: geef temperatuur en druk bij het tripelpunt van een bepaalde stof, twee vergelijkingen met p en T zijn al gegeven, je moet alleen nog maar het stelsel van twee vergelijkingen en twee onbekenden oplossen.<br /> <br /> === 27 jan 2012 ===<br /> <br /> # Toon aan dat stoffen die de oppervlaktespanning verlagen, de neiging hebben om zich aan het oppervlak op te stapelen.<br /> # Leg uit, elektrochemische potentiaal en pas toe op de membraanpotentiaal.<br /> # Oefening op entropieverandering<br /> # Bereken q, U en H bij verwarming bij constante druk.<br /> === 20 jan 2012 VM ===<br /> <br /> # Bespreek osmose (bijvragen: geldt deze formule altijd, hoe aanpassen voor grotere C, hoe noem je dit?)<br /> # Geef de formules voor de warmte, arbeid en verandering in inwendige energie voor volgende processen met ideale gassen:<br /> #* isotherme expansie in vacuüm<br /> #* adiabatische expansie in vacuüm<br /> #* isotherme expansie tegen constante druk<br /> #* adiabatisch expansie tegen constante druk<br /> #* reversibele isotherme expansie<br /> #* reversibele adiabatische expansie<br /> #* (bijvraag: een stok met aan het uiteinde een stuk katoen in een omhulsel duwen (past perfect): hierna brandt het katoen, hoe verklaar je dit?)<br /> # Oef: zie oef 3 bij oude examenvragen<br /> # Oef: zie oef 7 bij oude examenvragen<br /> <br /> === 16 jan 2012 VM ===<br /> <br /> # Geef de carnotcyclus en bespreek U, w &amp;amp; q bij elk proces<br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.<br /> # Oefening over verandering Gibbs van reactie bij 1298K als Cp, H &amp;amp; S van alle reagentia en producten gegeven bij 298K <br /> # Oefening over entropieverandering van expansie (systeem, omgeving, universum) zowel a) reversibel b) irreversibel bij uitwendige druk van 0,1Atm<br /> <br /> === 28 jan 2011 ===<br /> <br /> #Bespreek osmose en hoe kan je hieruit molecuulgewicht bepalen (3de keer!!!)<br /> #Bespreek membraanpotentiaal<br /> #IJs wordt van -10°C tot +10°C verwarmd: wat is de entropietoename &amp;lt;u&amp;gt;van het systeem&amp;lt;/u&amp;gt;? (enthalpie en warmtecapaciteiten gegeven)<br /> #Bereken eindtemperatuur, q, W en U van een reversibele adiabatische compressie van 28l naar 10l. (C&amp;lt;sub&amp;gt;v&amp;lt;/sub&amp;gt; = 5/2R)<br /> <br /> <br /> === 21 jan 2011 VM ===<br /> # Geef de carnotcyclus en bespreek U, w &amp;amp; q bij elk proces<br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.<br /> # Oefening over verandering inwendige energie (delta U)<br /> # Oefening over entropieverandering<br /> <br /> === 17 jan 2011 ===<br /> <br /> # Bespreek osmose en leg uit hoe je hieruit molecuulgewichten kunt bekomen <br /> # Clapeyron afleiden + toepassen op fasediagramma (m.a.w. vgl vast-&amp;gt; vl., vl. -&amp;gt; gas en vast -&amp;gt; gas berekenen)<br /> # Oefening over entropieverandering <br /> # Oefening over verandering in gibbsfunctie<br /> <br /> === 15 jan 2010 ===<br /> <br /> # bespreek de adiabatische expansie <br /> # bespreek osmose en geef een toepassing <br /> # oefening over entropieverandering <br /> # oefening over verandering in gibbsfunctie<br /> <br /> === 11 jan 2010 VM ===<br /> # Bespreek het kinetischgasmodel en de gemiddelde Etr.<br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.<br /> # ?<br /> # ?<br /> <br /> === 11 jan 2010 NM ===<br /> # Toon aan met formules dat een stof die de oppervlaktespanning verlaagt de neiging heeft om zich aan het oppervlak op te stapelen.<br /> # Bewijs dat de totale entropie voor een Carnotcyclus gelijk is aan nul.<br /> # Entropieverandering berekenen van gas bij bepaalde gebeurtenis.<br /> # Veranderingen in U en H berekenen bij de opwarming van een ideaal gas bij constante druk.<br /> <br /> === 30 jan 2009 ===<br /> # Clapeyron afleiden+toepassen op vloeibaar-gas.<br /> # Kookpuntverhoging.<br /> # Adiabatische compressie van een gas met de volumes en de begin T en de Cv gegeven.<br /> # Entropieverandering van 25 C naar 1000 C met Cv gegeven.<br /> === 16 jan 2009 ===<br /> # bij mengen verandering in gibbs, entropie, enthalpie en volume<br /> # carnot bespreken, q, W en U bij elk proces, en efficientie berekenen<br /> # verandering in entropie berekenen wanneer een ideaal gas expandeert van 1l bij 12K naar 2l bij 24K <br /> # verandering in enthalpie en inwendige energie berekenen van een reactie, enkele vormingsenthalpieën gegeven en een verbrandingsenthalpie, en we mochten veronderstellen dat de gassen ideaal waren<br /> === 21 jan 2008 ===<br /> # clayperon+ toep. op verdampen<br /> # kookpuntsverhoging bespreken<br /> # adiabatische expansie 1L naar 10L, Ti = 273K, bereken eindtem Cv gegeven<br /> # compresie van 1atm naar 2atm en verwarmen van 300k naar 1000k. Cp gegeven. bereken entropieverandering.<br /> === 21 jan 2008 ===<br /> # geef de carnotcyclus en bespreek U, w &amp;amp; q bij elk proces<br /> # Bespreek de membraam potentiaal<br /> # adiabtische compressie gas (1 mol) van 48,4l naar 44,4 l en begin temp = 0°C. Eindtemperatuur berekenen<br /> # entropieverandering van verwarmen gas 25°C--&amp;gt;1000°C. Cp gegeven<br /> === 18 jan 2008 ===<br /> # druk en temperatuursafhankelijkheid van evenwichtsconstante<br /> # isotherme en adiabatische expansie van een ideaal gas bespreken<br /> # inwendige energie berekenen, vormingsenthalpie en temperatuur gegeven<br /> # enthalpie en entropie berekenen van faseovergang van water bij T = 263K, H(273K) gegeven en Cp's gegeven<br /> <br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # clapeyron afleiden en toepassen op vast/vloeistof<br /> # osmose bespreken<br /> # vormingsenthalpie berekenen bij 125°C van HBr uit H2 en Br2. met de Hf°bij 25°C gegeven. bereken ook de inwendige energieverandering. (Cp ook gegeven dacht ik (iemand die nog exact weet?) )<br /> # entropieverandering bij 1 mol ideaal gas met T1= 12K, T2= 24K en V1=1L en V2=2L. en Cv = 3/2 R<br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # twee ideale gassen, bepaal deltaG, S, H, V na mengen<br /> # kookpuntsverhoging bespreken<br /> # CO(g) + H20 (g) =&amp;gt; CO2(g) + H2(g) delta H (298K) = -10 kcal. zoek delta H (1000K) Cp's gegeven<br /> # bespreek de carnotcyclus in een STdiagramma<br /> <br /> === 30 aug 2008 ===<br /> # mengen van ideale gassen, bespreek delta G, delta H, delta S, delta U en delta V<br /> # geef q, U en W voor volgende processen met ideale gassen<br /> #* isotherme expansie in vacuum<br /> #* adiabatische expansie in vacuum<br /> #* isotherme exp tegen constante druk<br /> #* adiab exp cte P<br /> #* reversibele isoth exp<br /> #* rev adiab exp<br /> # ideaal gas bij 12K en 1L, bereken delta S bij het omzetten naar 24K en 2L. C=2/3R <br /> === 29 jan 2007 ===<br /> # bespreek de druk- en temperatuursafh van de evenwichtsconstante<br /> # de henryconstante van CO2 in H2O is 1,...*10^6, die in benzeen 8,...*10^4. In welke stof is CO2 het best oplosbaar?<br /> # Een oefening waarbij een ideaal gas van T en V veranderd. Bereken DeltaS.<br /> === 23 jan 2007 ===<br /> # bespreek osmose<br /> # oefening waar ge bij reversibele isotherme compressie U, q, H en W moet berekenen<br /> # een ideaal gas gaat van T1-&amp;gt;T2 en V1-&amp;gt; V2. Laat zien dat geldt: Delta S= Cv. ln(T2/T1)+n.R. ln(V2/V1) Cv mag onafhankelijk van de temperatuur genomen worden. <br /> === 20 jan 2007 ===<br /> # Geef de afleiding voor de vergelijking van clapeyron en pas dit toe op smelten<br /> # Geef een S-T diagramma van de Carnotcyclus<br /> # Bereken deltaH bij 1000K, je kreeg deltaH(298), de reactie en alle Cp's<br /> <br /> === 19 jan 2007 ===<br /> # het mengen van ideale gassen. Bespreek de gibs functie de entalpie, entropie, en volume verandering.<br /> # de carnot cyclus wordt meestal weergeven in een pv-diagrama, geef hem nu weer in een TS-diagramma<br /> === 18 jan 2007 ===<br /> # bewijs dat de evenwichtsconstante niet drukafhankelijk is, maar wel temperatuursafhankelijk<br /> # bewijs volgende uitdrukking voor de entropieverandering van een gas dat van temperatuur en volume verandert:<br /> #: deltaS = Cv*ln(T2/T1) + nR*ln(V2/V1)<br /> Oefening:<br /> # bereken molecuulmassa van een proteïne<br /> # oplossing en osmotische druk gegeven, bereken ??</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Levensmiddelenchemie_en_-technologie&diff=1310 2018-09-06T19:38:36Z

<p>Cynthia.R: /* 1 februari 2018 VM */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===1 februari 2018 VM===<br /> #Op welke manier zijn enzymen belangrijk in de levensmiddelenproductie?<br /> #Geef de stabiliteit van lipiden.<br /> #korte vragen:<br /> ##wat is de belangrijkste enzymatische reactie in levensmiddelenproductie?<br /> ##wat is anandimide?<br /> ##wat is het belangrijkste om verhoogde welvaart te hebben?<br /> ##wat is het verschil tussen sojaproteïne bloem en sojaproteïneconcentraat? <br /> #productbesprekeking<br /> <br /> ===26 januari 2018 VM===<br /> #Geef de directe en indirecte criteria van kwaliteit van een levensmiddel.Bespreek hoe verpakking en verpakkingstechnologie kan ingrijpen op genoemde aspecten van kwaliteit.&lt;br /&gt;Zie cursus/dropbox<br /> #Bespreek de solventextractie van sojaolie&lt;br /&gt;Zie cursus<br /> #Kleine vragen<br /> ##Wat betekent retronasaal?&lt;br /&gt;''Vluchtige geurstoffen (aroma's) die door de keelholte naar de neusholte migreren | tegenhanger van orthonasaal met resp geuren.''<br /> ##Wat is postgrandiale verzadiging?&lt;br /&gt;''Verzadigingsgevoel door gevulde maag.''<br /> ##Wat is chaplisatie?&lt;br /&gt;''Suiker of druivenconcentraat toevoegen aan de most ter verhoging van suikergehalte | Mag enkel in noordelijke streken, verboden in zuidelijke gebieden.''<br /> ##Waarom is vermouting zo belangrijk? &lt;br /&gt;''Kiemen van de gerst zorgt voor '''aanmaak''' enzymen (amylasen en proteasen) die resp. zetmeel en proteïnen afbreken tijdens het maischen. tot resp. maltose (+ glucose) en aminozuren om deze beschikbaar te maken voor de gisten.''<br /> ##Hoe zorgt fermentatie van melk voor een betere bewaarbaarheid?&lt;br /&gt;''Afbraak van lactose tot lactaat: suikers niet meer beschikbaar voor andere MO en verlaging pH -&gt; inhibitie van groei.''<br /> #Productbespreking<br /> <br /> ===23 januari 2017 VM===<br /> #Geef de directe en indirecte criteria van kwaliteit van een levensmiddel.Bespreek hoe verpakking en verpakkingstechnologie kan ingrijpen op genoemde aspecten van kwaliteit.<br /> #Geef en bespreek 4 soorten van fermentatie die kunnen optreden bij de productie van wijn.<br /> #Bespreek invloed van temperatuur en watergehalte op bederf. wat besluit je hieruit.<br /> #Kleine vragen (max. 20 woorden per antwoord):<br /> ##Wat is meso?<br /> ##Hoeveel graan wordt er jaarlijks geproduceerd?<br /> ##Waarom wordt benzoëzuur gebruikt in levensmiddelen?<br /> ##Wat zijn polyolen?<br /> ##Wat verstaan we onder netto metaboliseerbare energie?<br /> <br /> ===17 januari 2017 VM===<br /> #bespreek zo volledig mogelijk hoe de voedingsindustrie de vraag van de consument naar een constante en hoge organoleptische kwaliteit tegemoet gaat. <br /> #bespreek de productie van kaas<br /> #Juist of fout? Analytisch sensorisch onderzoek is belangrijker dan affectief sensorisch onderzoek bij het produceren van een nieuw levensmiddel. Bespreek<br /> #begrippen:<br /> ##sorbinezuur<br /> ##oorsprong Bt-toxine<br /> ##heterolactische fermentatie<br /> ##polyolen<br /> ##netto metabolariseerbaarde energie<br /> <br /> ===24 augustus 2016===<br /> #Wat zijn de criteria van een kwalitatief product? Hoe werkt de verpakking hieraan mee?<br /> #Bier, wijn en Sake party<br /> #Je koelt sojaolie, wat komt eruit?<br /> #begrippen:<br /> ##Suiker bij de wijn doen<br /> ##Eesten<br /> ##Melk+bacterie blijft lang goed, why?<br /> ##Dem maag signals of geen honger<br /> ##Restronasaal<br /> <br /> ===17/6 namiddag===<br /> #De smaak van een levensmiddel verandert van gisteren op vandaag op morgen. Bespreek en geef voorbeelden vanuit de cursus. (alles dus van bederf tot toestand van de proever van vluchtige geurstoffen van stoffen in uw verpakking)<br /> #Transvetzuren kom in de natuur niet voor. Juist of fout? verklaar<br /> #Rijstwijn proces uitleggen<br /> #Begrippen:<br /> ##Wanneer ben je zwaarlijvig?<br /> ##Verklaar BRC<br /> ##Gelijkenis tussen roken en zouten<br /> ##Wat is ontgommen van olie?<br /> ##Wat zijn PCB's?<br /> #Productbespreking<br /> <br /> ===Examen vragen===<br /> #geef de directe en indirecte criteria voor kwaliteit van producten en leg uit hoe verpakking en verpakkingsprocedure hier toe kan bijdragen (allee of zoiets toch) <br /> #classificatie van koolhydraten en waar ze voorkomen<br /> #winterisatie <br /> #woordjes :<br /> ##chaptalisatie<br /> ##postgrandiaal <br /> ##retronasaal<br /> ##hoe fermentatie van melk bijdraagt tot bewaring<br /> ##ik denk nog een maar weet ik niet meer<br /> <br /> ===20 januari 2015===<br /> #Bespreek de hoe de afstand tussen de landbouwer en de consument groter is geworden. Welke ontwikkelingen hebben hiertoe bijgedragen?<br /> #GM voeder en voedsel <br /> #Leg de fermentatie van groenten uit<br /> #Begrippen <br /> ##homigeniseren als eenheidsbewerking <br /> ##ME <br /> ##pH van wijn <br /> ##halo-effect <br /> ##in welk proces worden PAK’s gevormd?<br /> <br /> ===19 januari 2015 (nm)===<br /> #Hoe kan men het probleem van lactose intolerantie oplossen in levensmiddelen? <br /> #Transvetten zijn slecht? Leg uit.<br /> #Bespreek het hele productieproces van soja-olie<br /> #Korte vragen, korte antwoorden:<br /> ##Stimulusfout<br /> ##malolactische fermentatie<br /> ##vermouten<br /> <br /> ===19 januari 2015 (vm)===<br /> #Bespreek veranderingen die optreden bij bewaring en geed drie mogelijke (liefst beste) oplossingen voor problemen die daardoor veroorzaakt kunnen worden. /react-text <br /> #Bespreek Pringles als voorbeeld van hyperindustrialisatie. /react-text <br /> #Geef een overzicht (schema/tabel) van de verschillende koolhydraten en hun voorkomen. /react-text <br /> #Verklaar kort: <br /> ##soutirage <br /> ##ligase /react-text <br /> ##fermentatietechnieken met melk<br /> ##basisprinpice enzymwerking <br /> <br /> ===15 januari 2015===<br /> #Bespreek chocoladeproductie van cacaopod tot product, refereer over de hele cursus. <br /> #Welke risico's zijn verbonden aan GM op vlak van voedsel? <br /> #Bespreek de voor- en nadelen van het verwerken van levensmiddelen. <br /> #Verklaar kort: <br /> ##inleggen <br /> ##waarom bepaalde delen van de plant van van industrieel belang zijn <br /> ##post-ontgommen <br /> ##chaptalisatie <br /> <br /> ===24 januari 2014 (VM)===<br /> #Bespreek Pringles als voorbeeld van hyperindustrialisatie<br /> #Vergelijk de Dioxine crisis en Coca Cola Crisis in tabelvorm <br /> #Bespreek de extractiestap in de productie van Sojaolie in detail <br /> #Korte vragen, korte antwoorden: <br /> ##Waarom worden groenten ingelegd? <br /> ##Wat is flavour? <br /> ##Wat is tristearine? <br /> ##Wat is Nuruk? <br /> ##Product<br /> <br /> ===20 januari 2014 (VM)===<br /> #Waarom is houdbaarheid belangrijk? Wat zijn de mogelijke manieren om houdbaarheid te bekomen? <br /> #Bespreek het verband tussen vleesconsumptie en een duurzame voedselproductie.<br /> #Winterisatie bij sojaolie <br /> #Korte vragen, korte antwoorden:<br /> ##Wat is postabsorptieve verzadiging? <br /> ##Wat is daidzeine? <br /> ##Wat is het doel van tempereren? <br /> ##waaruit is inuline opgebouwd? <br /> <br /> ===17 januari 2014 (NM)===<br /> #Welke middelen heeft de levensmiddelenindustrie tot haar beschikking om te zorgen dat een levensmiddel de consument veilig bereikt? <br /> #Vergelijk de essentiele elementen in de productie van bier, wijn en rijstwijn in tabelvorm.<br /> #Bespreek de voor- en nadelen van verwerking van levensmiddelen.<br /> #Korte vragen, korte antwoorden: <br /> ##Welk soort chemische reactie is de meest gekatalyseerde door enzymen in de levensmiddelenproductie? <br /> ##Wat is daidzeine?<br /> ##Welke doel heeft blancheren?<br /> ##Wat verstaan we onder het 'halo'-effect? <br /> ##Geef de criteria van kwalilteit van een levensmiddel in dalende volgorde van belangrijkheid.<br /> <br /> ===16 januari 2014 (VM)===<br /> #Waarom is houdbaarheid zo belangrijk en wat doet de mens om voor langere houdbaarheid te zorgen + voorbeelden<br /> #Technologische oplossingen voor lactose-intolerantie <br /> #Bespreek fermentatie bij cacaobonen <br /> #Woordjes: <br /> ##postabsorptieve verzadiging, <br /> ##maischen, <br /> ##belangrijkste bestanddeel verzerkt kaas, <br /> ##doel maceration carbonique,<br /> ## duo/trio test (korte uitleg)<br /> <br /> <br /> ===13 januari 2014===<br /> #ranzigheid komt veel voor in voeding. welke technologische oplossingen bestaan er voor dit probleem? <br /> #wat is de werking van rennet? <br /> #wat zijn de voor- en nadelen van de Atwaterfactoren? <br /> #vijf termen:<br /> ##hoe is inuline opgebouwd? <br /> ##wat is de quetelet-index <br /> ##welke zijn de twee belangrijkste natuurlijke bronnen van sucrose? <br /> ##wat is melamine<br /> <br /> ===29 januari 2013=== <br /> #Waarom is houdbaarheid belangrijk? Wat doet de mens om voor langere houdbaarheid te zorgen en geef hierbij voorbeelden. We geven steeds minder uit aan voeding. Dit lijkt onlogisch. Bediscussieer. Geef de voor- en nadelen van verwerking. <br /> #Korte vragen, korte antwoorden <br /> ##Hoeveel van het voedsel in ons land is geïmporteerd <br /> ##Wat is de dierlijke variant van zetmeel <br /> ##Wat betekent hedonisch</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Levensmiddelenchemie_en_-technologie&diff=1309 2018-09-06T19:38:22Z

<p>Cynthia.R: /* 1 februari 2018 VM */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===1 februari 2018 VM===<br /> #Op welke manier zijn enzymen belangrijk in de levensmiddelenproductie?<br /> #Geef de stabiliteit van lipiden.<br /> #korte vragen:<br /> ##wat is de belangrijkste enzymatische reactie in levensmiddelenproductie?<br /> ##wat is anandimide?<br /> ##wat is het belangrijkste om verhoogde welvaart te hebben?<br /> ##wat is het verschil tussen sojaproteïne bloem en sojaproteïneconcentraat? (op puntjes staat zelfde woord dat ik niet meer weet)<br /> #productbesprekeking<br /> <br /> ===26 januari 2018 VM===<br /> #Geef de directe en indirecte criteria van kwaliteit van een levensmiddel.Bespreek hoe verpakking en verpakkingstechnologie kan ingrijpen op genoemde aspecten van kwaliteit.&lt;br /&gt;Zie cursus/dropbox<br /> #Bespreek de solventextractie van sojaolie&lt;br /&gt;Zie cursus<br /> #Kleine vragen<br /> ##Wat betekent retronasaal?&lt;br /&gt;''Vluchtige geurstoffen (aroma's) die door de keelholte naar de neusholte migreren | tegenhanger van orthonasaal met resp geuren.''<br /> ##Wat is postgrandiale verzadiging?&lt;br /&gt;''Verzadigingsgevoel door gevulde maag.''<br /> ##Wat is chaplisatie?&lt;br /&gt;''Suiker of druivenconcentraat toevoegen aan de most ter verhoging van suikergehalte | Mag enkel in noordelijke streken, verboden in zuidelijke gebieden.''<br /> ##Waarom is vermouting zo belangrijk? &lt;br /&gt;''Kiemen van de gerst zorgt voor '''aanmaak''' enzymen (amylasen en proteasen) die resp. zetmeel en proteïnen afbreken tijdens het maischen. tot resp. maltose (+ glucose) en aminozuren om deze beschikbaar te maken voor de gisten.''<br /> ##Hoe zorgt fermentatie van melk voor een betere bewaarbaarheid?&lt;br /&gt;''Afbraak van lactose tot lactaat: suikers niet meer beschikbaar voor andere MO en verlaging pH -&gt; inhibitie van groei.''<br /> #Productbespreking<br /> <br /> ===23 januari 2017 VM===<br /> #Geef de directe en indirecte criteria van kwaliteit van een levensmiddel.Bespreek hoe verpakking en verpakkingstechnologie kan ingrijpen op genoemde aspecten van kwaliteit.<br /> #Geef en bespreek 4 soorten van fermentatie die kunnen optreden bij de productie van wijn.<br /> #Bespreek invloed van temperatuur en watergehalte op bederf. wat besluit je hieruit.<br /> #Kleine vragen (max. 20 woorden per antwoord):<br /> ##Wat is meso?<br /> ##Hoeveel graan wordt er jaarlijks geproduceerd?<br /> ##Waarom wordt benzoëzuur gebruikt in levensmiddelen?<br /> ##Wat zijn polyolen?<br /> ##Wat verstaan we onder netto metaboliseerbare energie?<br /> <br /> ===17 januari 2017 VM===<br /> #bespreek zo volledig mogelijk hoe de voedingsindustrie de vraag van de consument naar een constante en hoge organoleptische kwaliteit tegemoet gaat. <br /> #bespreek de productie van kaas<br /> #Juist of fout? Analytisch sensorisch onderzoek is belangrijker dan affectief sensorisch onderzoek bij het produceren van een nieuw levensmiddel. Bespreek<br /> #begrippen:<br /> ##sorbinezuur<br /> ##oorsprong Bt-toxine<br /> ##heterolactische fermentatie<br /> ##polyolen<br /> ##netto metabolariseerbaarde energie<br /> <br /> ===24 augustus 2016===<br /> #Wat zijn de criteria van een kwalitatief product? Hoe werkt de verpakking hieraan mee?<br /> #Bier, wijn en Sake party<br /> #Je koelt sojaolie, wat komt eruit?<br /> #begrippen:<br /> ##Suiker bij de wijn doen<br /> ##Eesten<br /> ##Melk+bacterie blijft lang goed, why?<br /> ##Dem maag signals of geen honger<br /> ##Restronasaal<br /> <br /> ===17/6 namiddag===<br /> #De smaak van een levensmiddel verandert van gisteren op vandaag op morgen. Bespreek en geef voorbeelden vanuit de cursus. (alles dus van bederf tot toestand van de proever van vluchtige geurstoffen van stoffen in uw verpakking)<br /> #Transvetzuren kom in de natuur niet voor. Juist of fout? verklaar<br /> #Rijstwijn proces uitleggen<br /> #Begrippen:<br /> ##Wanneer ben je zwaarlijvig?<br /> ##Verklaar BRC<br /> ##Gelijkenis tussen roken en zouten<br /> ##Wat is ontgommen van olie?<br /> ##Wat zijn PCB's?<br /> #Productbespreking<br /> <br /> ===Examen vragen===<br /> #geef de directe en indirecte criteria voor kwaliteit van producten en leg uit hoe verpakking en verpakkingsprocedure hier toe kan bijdragen (allee of zoiets toch) <br /> #classificatie van koolhydraten en waar ze voorkomen<br /> #winterisatie <br /> #woordjes :<br /> ##chaptalisatie<br /> ##postgrandiaal <br /> ##retronasaal<br /> ##hoe fermentatie van melk bijdraagt tot bewaring<br /> ##ik denk nog een maar weet ik niet meer<br /> <br /> ===20 januari 2015===<br /> #Bespreek de hoe de afstand tussen de landbouwer en de consument groter is geworden. Welke ontwikkelingen hebben hiertoe bijgedragen?<br /> #GM voeder en voedsel <br /> #Leg de fermentatie van groenten uit<br /> #Begrippen <br /> ##homigeniseren als eenheidsbewerking <br /> ##ME <br /> ##pH van wijn <br /> ##halo-effect <br /> ##in welk proces worden PAK’s gevormd?<br /> <br /> ===19 januari 2015 (nm)===<br /> #Hoe kan men het probleem van lactose intolerantie oplossen in levensmiddelen? <br /> #Transvetten zijn slecht? Leg uit.<br /> #Bespreek het hele productieproces van soja-olie<br /> #Korte vragen, korte antwoorden:<br /> ##Stimulusfout<br /> ##malolactische fermentatie<br /> ##vermouten<br /> <br /> ===19 januari 2015 (vm)===<br /> #Bespreek veranderingen die optreden bij bewaring en geed drie mogelijke (liefst beste) oplossingen voor problemen die daardoor veroorzaakt kunnen worden. /react-text <br /> #Bespreek Pringles als voorbeeld van hyperindustrialisatie. /react-text <br /> #Geef een overzicht (schema/tabel) van de verschillende koolhydraten en hun voorkomen. /react-text <br /> #Verklaar kort: <br /> ##soutirage <br /> ##ligase /react-text <br /> ##fermentatietechnieken met melk<br /> ##basisprinpice enzymwerking <br /> <br /> ===15 januari 2015===<br /> #Bespreek chocoladeproductie van cacaopod tot product, refereer over de hele cursus. <br /> #Welke risico's zijn verbonden aan GM op vlak van voedsel? <br /> #Bespreek de voor- en nadelen van het verwerken van levensmiddelen. <br /> #Verklaar kort: <br /> ##inleggen <br /> ##waarom bepaalde delen van de plant van van industrieel belang zijn <br /> ##post-ontgommen <br /> ##chaptalisatie <br /> <br /> ===24 januari 2014 (VM)===<br /> #Bespreek Pringles als voorbeeld van hyperindustrialisatie<br /> #Vergelijk de Dioxine crisis en Coca Cola Crisis in tabelvorm <br /> #Bespreek de extractiestap in de productie van Sojaolie in detail <br /> #Korte vragen, korte antwoorden: <br /> ##Waarom worden groenten ingelegd? <br /> ##Wat is flavour? <br /> ##Wat is tristearine? <br /> ##Wat is Nuruk? <br /> ##Product<br /> <br /> ===20 januari 2014 (VM)===<br /> #Waarom is houdbaarheid belangrijk? Wat zijn de mogelijke manieren om houdbaarheid te bekomen? <br /> #Bespreek het verband tussen vleesconsumptie en een duurzame voedselproductie.<br /> #Winterisatie bij sojaolie <br /> #Korte vragen, korte antwoorden:<br /> ##Wat is postabsorptieve verzadiging? <br /> ##Wat is daidzeine? <br /> ##Wat is het doel van tempereren? <br /> ##waaruit is inuline opgebouwd? <br /> <br /> ===17 januari 2014 (NM)===<br /> #Welke middelen heeft de levensmiddelenindustrie tot haar beschikking om te zorgen dat een levensmiddel de consument veilig bereikt? <br /> #Vergelijk de essentiele elementen in de productie van bier, wijn en rijstwijn in tabelvorm.<br /> #Bespreek de voor- en nadelen van verwerking van levensmiddelen.<br /> #Korte vragen, korte antwoorden: <br /> ##Welk soort chemische reactie is de meest gekatalyseerde door enzymen in de levensmiddelenproductie? <br /> ##Wat is daidzeine?<br /> ##Welke doel heeft blancheren?<br /> ##Wat verstaan we onder het 'halo'-effect? <br /> ##Geef de criteria van kwalilteit van een levensmiddel in dalende volgorde van belangrijkheid.<br /> <br /> ===16 januari 2014 (VM)===<br /> #Waarom is houdbaarheid zo belangrijk en wat doet de mens om voor langere houdbaarheid te zorgen + voorbeelden<br /> #Technologische oplossingen voor lactose-intolerantie <br /> #Bespreek fermentatie bij cacaobonen <br /> #Woordjes: <br /> ##postabsorptieve verzadiging, <br /> ##maischen, <br /> ##belangrijkste bestanddeel verzerkt kaas, <br /> ##doel maceration carbonique,<br /> ## duo/trio test (korte uitleg)<br /> <br /> <br /> ===13 januari 2014===<br /> #ranzigheid komt veel voor in voeding. welke technologische oplossingen bestaan er voor dit probleem? <br /> #wat is de werking van rennet? <br /> #wat zijn de voor- en nadelen van de Atwaterfactoren? <br /> #vijf termen:<br /> ##hoe is inuline opgebouwd? <br /> ##wat is de quetelet-index <br /> ##welke zijn de twee belangrijkste natuurlijke bronnen van sucrose? <br /> ##wat is melamine<br /> <br /> ===29 januari 2013=== <br /> #Waarom is houdbaarheid belangrijk? Wat doet de mens om voor langere houdbaarheid te zorgen en geef hierbij voorbeelden. We geven steeds minder uit aan voeding. Dit lijkt onlogisch. Bediscussieer. Geef de voor- en nadelen van verwerking. <br /> #Korte vragen, korte antwoorden <br /> ##Hoeveel van het voedsel in ons land is geïmporteerd <br /> ##Wat is de dierlijke variant van zetmeel <br /> ##Wat betekent hedonisch</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Moleculaire_Architectuur&diff=1307 2018-09-04T15:40:26Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> Verplicht vak voor chemie. <br /> <br /> Dit vak wordt gegeven door professor Van Meervelt, hij is de aangenaamheid zelve op het examen!<br /> Zijn bijvragen zijn wel aan de moeilijke kant. Maar hij zal je altijd helpen de bijvragen beetje bij beetje op te lossen. Het examen duurt 4u.<br /> <br /> Kristallografie is het vak Moleculaire Architectuur, maar dan zonder NMR (het laatste hoofdstuk). Dit is eigenlijk de voorloper van moleculaire architectuur. Het wordt ook nu nog aan de geologen gegeven.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> === 4 september 2018===<br /> # Geef de contructie van Ewald<br /> # H-NMR van C10H12O3<br /> # Ruimtegroep Pcnb<br /> # Geef de puntgroep van 4 isomeren van tetrachloornaftaleen die aanleiding geven tot een andere puntgroep. <br /> # PbO kristaliseert uit in eenheidscel met gegeven dimensies en atoomposities. Gevraagd: Construeer de pattersonfunctie, waar zijn de sterkste pieken? Tot welk Bravais rooster behoort dit? Wat is de afbuighoek van het 110 vlak met CuKalfa? <br /> # Begrippen: Kubisch en hexagonale dichtste bolstapeling + McLafferty omlegging<br /> <br /> ===27 augustus 2018===<br /> # Hoe kan men het faseprobleem oplossen met behulp van de Pattersonfunctie? (dus ook uitleggen wat faseprobleem is, formule van pattersonfunctie geven,...) (mondeling)<br /> # Gegeven drie H-NMR spectra, alle drie C6H6N2O2, bepaal structuren, en verklaar de verschillende spectra (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pcmn met alle gebruikelijke vragen<br /> # Bepaal tot welke puntgroepen de isomeren van trichloorbenzeen behoren, teken alle symmetrie-elementen<br /> # Oefening met CdI2, bepaal fasehoek van de reflectie op (110) en afbuighoek theta, tot welk bravais rooster behoort dit? Waar bevinden zich de maxima bij de Pattersonfunctie?<br /> # Begrippen: MALDI-TOF, Laue groep<br /> <br /> ===15 juni 2018===<br /> # Leid de structuurfactor af. Kan deze ook experimenteel bepaald worden? (mondeling)<br /> # Gegeven een H-NMR spectrum, bepaal de structuur van de chemische stof die dit spectrum geeft. (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pmca, gebruikelijke bijvragen.<br /> # Oefening met intensiteit enzo berekenen. Structuur was op eerste zicht niet centrosymmetrisch, maar was het wel met andere oorsprong.<br /> # Wat is de vlakgroep van het (110) vlak van NaCl? Teken en geef alle symmetrie-elementen.<br /> # Begrippen: MALDI-TOF, kubisch dichtste bolstapeling<br /> <br /> ===11 juni 2018===<br /> # Waarom Pattersonfunctie belangrijk bij het faseprobleem?<br /> # NMR: C10H1202<br /> # Ruimtegroep Pbab met alle bijhorende vragen<br /> # Puntgroepen geven van 4 verschillende aromatische verbindingen + symmetrie elementen aanduiden<br /> # Oefening waarbij celparameters en 2 atomen gegeven zijn. Intensiteit en afbuighoek berekenen voor (001) en (002). Tot welk Bravais rooster gehoord deze kristalstructuur? <br /> # Begrippen: CuKalfa en ESI<br /> <br /> ===27 juni 2017===<br /> # Stappen van kristalstructuurbepaling<br /> # NMR, een piek waar bij stond deze verdwijnt bij schudden met D2O, bijvraag waarom deze piek verdwijnt, ook bijvragen over C13 NMR en IR<br /> # Ruimtegroep Pcmm en bijvragen<br /> # Vlakgroep vlak 110 NaCl<br /> # Bepalen van intensiteit reflectie van vlak 200, lengte en fractionele coördinaten gegeven<br /> # Beschrijf MALDI-TOF en kubisch dichtste bolstapeling<br /> <br /> ===22 juni 2017 NM===<br /> # Structuurverfijning van kristalstructuurbepaling<br /> # Leg uit: NOE en NOESY<br /> # Ruimtegroep Pcan met alle bijhorende vragen<br /> # Oefening waar 4 moleculen stonden waarvan je de puntgroep moest bepalen<br /> # Oefening met tabel Sintheta/golflengte- intensiteit en hoek 2theta bepalen<br /> # begrippen: CuKalfa en Resolutie <br /> <br /> === 16 juni 2017 NM===<br /> #Hoe Faseprobleem oplossen met Patterson functie <br /> #1H- Nmr ( bijvragen : welke piek is het belangrijkst bij IR-spectra , hoeveel pieken zullen er zijn bij C13,..) <br /> #Ruimtegroep ( ik dacht Pbmn )<br /> #Intensiteit bepalen en afbuighoek bepalen <br /> #Puntgroep van tetrachloornaftaleen ( eerst isomeren geven en van elk isomeer puntgroep bepalen) <br /> #Mc-lafferty omlegging<br /> #chemische ionisatie<br /> ===16 juni 2017 VM===<br /> #leid de formule voor de structuurfactor af en vertel hoe je deze experimenteel kan bepalen.<br /> #Geef alle ionisatie technieken gebruikt in MS.<br /> #Puntgroep Pbcm met gebruikelijke bijvragen<br /> #Geef de puntgroepen van alle isomeren van tetrachloor kubaan en teken de symmetrie elementen<br /> #verklaar chemische shift, koppelingsconstante en shift reagens<br /> ===12 juni 2017===<br /> #leg constructie van Ewald uit<br /> #nmr spectra (geef structuur molecule ) C10H12O3<br /> #ruimtegroep Pncm met alle bijhorende vraagjes (asymmetrische eenheid, multipliciteit, equivaltente posities, patterson, puntgroep, systematische afwezigheden)<br /> #Vlakgroep van (110) vlak van ijzer. Geef alle symmetrie elementen<br /> #oefening ivm fase berekenen en intensiteit (CdI2, sin(theta)/golflengte is gegeven, bepaal fCd, fI en zo de rest)<br /> #begrippen: ESI &amp; Wet van Friedel<br /> <br /> ===21 augustus 2015===<br /> # stappen van de kristalstructuur bepaling<br /> # Welke methode voor ionisatie worden er gebruikt bij massaspectroscopie<br /> # Pcan (met alle gebruikelijke bijvraagjes)<br /> # Vlakgroep van (110) vlak van ijzer. Geef alle symmetrie elementen<br /> # PoCL2: ge krijgt Sin theta/lambda en uw celafmetingen, geef Fhkl, Ihkl en uw hoek<br /> # Bespreek de termen chemische shift, (vul hier in want ik kom er nie op) en shiftreagens<br /> === 18 augustus 2015 vm ===<br /> # leg het principe van uit van verfijning van een kristalstructuur<br /> # leg volgende begrippen uit: NOE en NOESY<br /> # ruimtegroep Pbmn en alle vraagjes zoals altijd<br /> # puntgroepen geven 4 isomeren van een of ander molecule<br /> # voor een bepaalde reflectie de fase van de structuurfactor berekenen en de intensiteit<br /> # 2 stellingen (juist of fout):<br /> #* Bij een ESI spectrum zijn er geen fragmentaties<br /> #* Bij kubische dichtste bolstapeling liggen alle atomen op speciale posities<br /> === 24 juni 2015 ===<br /> # Nmr spectra<br /> # verfijning van kristalstructuur<br /> # Vlak groep van ijzer<br /> # Ruimte groep Pcan + al die bijvragen<br /> # Oefening sin theta/lambda. ..<br /> # 2 stellingen: <br /> #* esi heeft geen fragmentaties<br /> #* In ccp liggen alle atomen op speciale posities<br /> <br /> === 18 juni 2015 ===<br /> # Hoe kunnen we met behulp van de pattersonfunctie het faseprobleem oplossen?<br /> # Leg uit NOE en NOESY<br /> # puntgroep Pbmn<br /> # Bepaal de puntgroep van de isomeren van tetrachloorkubaan en duid alle symmetrie-elementen aan<br /> # Bereken de fase van de structuurfactor en de intensiteit voor CdI2 met <br /> #* Eenheidscel a=4,24 A, c=6,86 A, gamma=120°<br /> #* Posities: Cd 0 0 0, I(1) 2/3 1/3 1/4, I(2) 1/3 2/3 3/4<br /> #* sin theta/lamba 0,0 0,1 0,2 0,3 fCd 48 44,58 38,44 33,22 fI 53 49,36 42,79 37,14<br /> # Verklaar de begrippen CuKalfa en resolutie<br /> <br /> === 9 juni 2015 vm ===<br /> # Leid de uitdrukking van de structuurfactor af. Hoe kan je de structuurfactor experimenteel bepalen?<br /> # H-NMR spectra van 3 isomeren C6H6N2O2<br /> # Ruimtegroep Pncm<br /> #* Equivalente posities<br /> #* multipliciteit<br /> #* asymmetrische eenheid<br /> #* Geef 2 speciale posities (waarom speciaal?)<br /> #* van welke puntgroep afgeleid?<br /> #* Pattersongroep?<br /> #*Systematische afwezigheden<br /> # Bepaal de puntgroep van verschillende isomeren van tetrachloornaftaleen. Duid de symmetrie elementen aan.<br /> # Rood Loodoxide PbO kristalliseert in tetragonale eenheidscel a= 3.975 c= 5.023<br /> #* Waar vind je in Pattersonfunctie sterkste pieken?<br /> # Leg uit : ESI en ATR-IR<br /> <br /> ===25 juni 2014===<br /> #Geef de stappen voor kristalstructuurbepaling (mondeling)<br /> #Wat is NOE? (mondeling)<br /> #Ruimtegroep Pcnb<br /> #Geef puntgroep van alle isomeren van tetrachloorkubaan<br /> #Intensiteit van In en afbuighoek: vormfactor, atoomposities zijn gegeven<br /> #Stellingen<br /> #*Bij ESI is geen fragmentatie<br /> #*Bij kubisch dichtste bolstapeling liggen de atomen op speciale posities<br /> <br /> ===13 juni 2014===<br /> # Hoe kunnen we met behulp van de pattersonfunctie het faseprobleem oplossen? (mondeling)<br /> # NMR spectrum met gesubstitueerde benzeenring (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pbnm met alle typische bijvragen (asymmetrische eenheid, speciale posities + waarom ze speciaal zijn, pattersongroep, puntgroep en systematische afwezigheden)<br /> # Geef de vlakgroep van (110) van ijzer<br /> # Oefening op structuurfactor. Vormfactoren met bijhorende sin(θ)/λ zijn gegeven, net als de fractionele coördinaten en de grootte van de eenheidscel<br /> # Wat is ESI?<br /> <br /> ===13 juni 2013===<br /> # Ruimtegroep Pbmb.<br /> # Wat is de vlakgroep van het vlak (110) in de ijzerstructuur?<br /> # NMR-spectrum gegeven. Stelling: Bevat dit spectrum een AX6 systeem?<br /> # Leg volgende begrippen uit: Laue groep, resolutie, temperatuursfactor.<br /> # Gegeven: posities van In en celparameters (a en c). Teken een a,b-projectie van de eenheidscel. Welk Bravais-rooster heeft de cel? Bepaal de afbuighoek 2theta en de intensiteit van de reflecties (001) en (002). Wat is de puntgroep rond de middelste In? Waar bevinden zich de hoogste Pattersonpieken?<br /> <br /> ===10 juni 2013===<br /> # Teken ruimtegroep Pbnb (ab-projectie) en geef equivalente posities, speciale posities, systematische afwezigheden, puntgroep waarvan de ruimtegroep is afgeleid en asymetrische eenheid. (Schriftelijk, na 1 uur af te geven.)<br /> # Wat is de vlakgroep van het vlak (110) in de platina-strucuur? (Structuur is dus van buiten te kennen!) Bijvraag: is dit vlak de eenheidscel van de vlakgroep? (Mondeling)<br /> # Bespreek: voor ethylisobutyraat (spectrum en structuur gegeven) is een ontkoppelingsexperiment niet mogelijk. Bijvragen: hoe bepalen we de frequentie die we moeten gebruiken voor het ontkoppelingsexperiment? Link de verschillende pieken aan de verschillende groepen. (Mondeling)<br /> # Leg de Ewald-constructie uit. Bijvraag: wat gebeurt er als we het kristal draaien? (Mondeling)<br /> # Gegeven: posities van Mo en Ni in een MoNi4-legering en parameters a en c. Teken een a,b-projectie van de eenheidscel. Welk Bravais-rooster heeft de cel? Bepaal de 2-theta en de intensiteit van de reflectie (002). Wat is de puntgroep rond Mo? Geef de hoogste pattersonpieken.<br /> <br /> ===16 juni 2011===<br /> # Teken ruimtegroep Pmcn (ab-projectie) en geef equivalente posities, puntgroep waar deze ruimtegroep van is afgeleid, asymmetrische eenheid, 2 speciale posities en bijhorende Pattersongroep. Zijn er systematische afwezigheden?<br /> # Stellingen:<br /> #* Het vlak (110) wordt bij Fe en bij NaCl beschreven door dezelfde vlakgroep<br /> #* Bij een goed verfijnde structuur zijn de pieken op de verschilfourier te verwaarlozen<br /> #* Voor de waterstofatomen met delta 6,8 is een ontkoppelingsexperiment niet mogelijk (NMR-spectrum van ethyl-4-methoxybenzoaat gegeven, het gaat om de waterstoffen op C3 en C5 van de benzeenring). <br /> # Oefening: PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel, a en c gegeven. Twee posities voor Pb en voor O gegeven. Teken de ab-projectie. Door welke puntgroep wordt de geometrie rond de Pb-atomen beschreven? Door welk Bravaisrooster wordt het kristal beschreven? Bepaal de fase van de intensiteit van afgebogen stralingsbundel voor het vlak (110) voor CuK-alpha (tabel met enkele waarden gegeven voor f van Pb en O ifv sin(theta)/lambda). Teken het vlak (110) en de invallende en afgebogen stralingsbundel op de tekening.<br /> <br /> ===10 juni 2010 (NM)===<br /> # Teken ruimtegroep Pmnb en klassieke vragen: equivalente posities, 2 speciale posities, systematische afwezigheden, asymmetrische eenheid, puntgroep,..<br /> # Stellingen:<br /> #* De temperatuur heeft geen invloed op de kristalstructuurbepaling.<br /> #* Het is niet mogelijk om P2 en Pm van elkaar te onderscheiden met behulp van intensiteitsmetingen.<br /> # NMR-spectrum en bepalen of het overeenkomt met het gegeven molecule.<br /> # Oefening: AgI kristal, a= 6,50 Angstrom, coordinaten van atomen zijn gegeven, en tabel van f ifv sin/lambda.<br /> #* Geef a,b-projectie + Bravaisrooster<br /> #* Bereken Intensiteit en bereken afbuighoek van vlak 004<br /> #* Geef puntsymmetrie rond Ag en rond I<br /> #* Waar verwacht je de hoogste Pattersonpieken?<br /> <br /> ===23 juni 2009===<br /> # teken ruimtegroep (Pnca dacht ik) &amp;amp; geef eq. posities, 2 speciale posities, syst. afwezigheden, puntgroep, ...<br /> # Stellingen:<br /> #* rotatiesymmetrie kan bepaald worden via rotatiediffractie(dat een ding waar ge een kristal draait, ik ben niet meer zeker of dat zo heet)<br /> #* bij verschilelektronendichtheidsmap gaat de hoogte van de pieken verloren bij verfijning (ofzoiets toch)<br /> # NMR van 1,1-dimethoxyethaan<br /> # Oefening: alfa-uranium heeft volgende coordinaten op speciale posities: +-(0,y,1/4) +-(1/2,1/2-y,-1/4) a b en c gegeven(3 verschillende waarden) 2 groottes van structuurfactoren gegeven en de fu in functie van sin(theta).<br /> #* y is 0.10 of 0.15, bepaal dit met bhv de gegevens. <br /> #* Teken een a,b-projectie. <br /> #* Beschrijf de omringing van het U-atoom via de puntgroep van het atoom. <br /> #* Teken de pattersongroep.<br /> ===17 juni 2009===<br /> # Ruimtegroep Pcan: equivalente posities, multipliciteit, asymmetrische eenheid, 2 speciale posities, puntgroep, systematische afwezigheden<br /> # Stellingen<br /> #* De temperatuurfactoren van Pt in een Pt-kristal zijn isotroop (Antwoord: Waar want ze liggen op speciale posities)<br /> #* De symmetrie van een diffractiepatroon van een kristal wordt bepaald door de ruimtegroep<br /> #* NMR: aspirine<br /> # Oefening: Nikkelarsenide (a, c en gamma=120° is gegeven) De posities van Nikkel en van arseen zijn ook gegeven. <br /> #* Geef de ab-projectie, bravais rooster, wat is de stapeling van Arseen, puntgroep rond Arseen en rond nikkel <br /> #* Bij reflecties (200), (300) en (030) en Cu K-alfa straling<br /> #** Voorspel de hoogste intensiteit<br /> #** Voorspel de grootste afbuighoeken<br /> #* Wat is de resolutie bij een afbuighoek van 100° en bij Cu K-alfa straling<br /> <br /> === 15 juni 2009 ===<br /> # Ruimtegroep (ik denk Pbmn) met klassieke vragen<br /> # Stellingen<br /> #* Pm en Cm hebben dezelfde Harkersecties<br /> #* Cobalt kan geïoniseerd worden met Cu K alfa straling<br /> #* NMR<br /> # Oefening: HgS met coördinaten Hg en S gegeven. Alle elementen geven van 11 juni op uitzondering van de afbuighoek en dit voor de vlakken 200 en 400. <br /> <br /> === 11 juni 2009 ===<br /> # Ruimtegroep + asymmetrische eenheid + 2 speciale posities + iets met systematische afwezigheden<br /> # Stellingen<br /> #* Het 110 vlak van Fe vertoont C4v (Bijvragen: aantonen op modellekes)<br /> #* De atomen bij hexagonale dichtste bolstapeling liggen allemaal op speciale posities (Bijvraag: Hij vraagt om de kubische bolstapeling te laten zien, met die pingpongballetjes en hoe heten de ruimtes tussen die pingpongballekes) <br /> #* NMR: een benzeen met een chloor op en op para positie iets me een ethyl en een keton (Bijvraag: hoe zie je dat het een spectrum van de 1ste orde of 2de orde is)<br /> # Oefening: ik kreeg een tabel met fractionele coördinaten van ReO3 en zo'n tabel met sin (theta) / lamda en vormfactoren. Ik moest een ab projectie tekenen, bravais rooster geven, intensiteit berekenen, afbuighoek bepalen, hoogste pattersonpieken voorspellen.<br /> <br /> === 24 juni 2008 ===<br /> # Pmca met klassieke vragen<br /> # Stellingen<br /> #* Alle atomen van sfaleriet bezetten speciale posities<br /> #* Een kristalrooster kan ondubbelzinnig bepaald worden adhv systematische afwezigheden<br /> #* isopropyltolueen<br /> # Wolfraam-rooster en CuKa straling, vlakken (211) en (310)<br /> #* teken 3D-rooster en duidt [sic] vlakken aan<br /> #* Welke intensiteit is sterkst, bij (221) of bij (310)<br /> #* Welke reflectiehoek is grootst, bij (221) of bij (310)<br /> #* Welke zijn de sterkste Pattersonpieken?<br /> <br /> === 19 juni 2008 ===<br /> # Pbmn tekenen + assym. eenheid + equi. pos. + multipliciteit + 2 speciale pos. + Systematische afwezigheden + van welke puntgroep<br /> # Stellingen<br /> #* De temp. heeft geen invloed op het diffractiepatroon<br /> #* De vlakken 001 en 110 van Fe hebben dezelfde vlakgroep (ook zeggen welke vlakgroep(en))<br /> #* NMR<br /> #De structuur van LiF en NaCl is dezelfde, a = ...., kristalafmeting 0,2mmx0,2mmx0,2mm en wordt bestraald met Cu kalfa. Bereken F003 en F004. Welke intensiteit is het hoogst? Wat gebeurt er met de diffractiehoek en de intensiteit als je:<br /> #*F vervangt door I<br /> #*de cel verdubbeld<br /> #*Waar verwacht je de sterkste Pattersonpieken<br /> <br /> === 19 juni 2008 ===<br /> # P nmb tekenen + puntgroep + asymetrische eenheid + equi posities<br /> # stellingen ( waar of niet waar )<br /> #* Pm en Cm hebben dezelfde harkersecties<br /> #* R staat voor de resolutie van een structuurbepaling<br /> #* spectrum en molecule gegeven, horen ze bij elkaar?<br /> # oefening : NH4HgCl3 heeft eenheidscel a = ... c =... en atoomposities N, Hg en 3 Cl-en gegeven: (ook alpha-Cu straling zoda je uw lambda ook kent) (tabel sin(theta)/lambda en f waarden van Cl, Hg en N gegeven)<br /> #* geef (a,b) projectie van eenheidscel<br /> #* bepaal Bravais rooster<br /> #* bepaal intensiteit en afbuigrichting 2theta van de reflectie (004)<br /> #* Hg door welke puntgroep omringt<br /> <br /> ===23 juni 2008===<br /> #Ruimtegroep tekenen. In dit geval Pman. Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?<br /> #Bespreek volgende stellingen. Geef telkens ook een korte motivatie:<br /> #*Op basis van systematische afwezigheden kan geen verschil gemaakt worden tussen de ruimtegroepen P2 en P2/m.<br /> #*De temperatuurfactoren van &amp;lt;math&amp;gt;\alpha&amp;lt;/math&amp;gt;-Fe zijn isotroop.<br /> #*NMR-spectrum en molecule. Kunnen die bij elkaar horen?<br /> #kristal met Li2O met één lengte gegeven (kubisch dus) <br /> #*teken ab projectie gegeven zijn de posities van de atomen<br /> #*geef puntgroep rond Li en O<br /> #*geef bravais rooster<br /> #*twee vlakken gegeven welke grootste hoek en welke grootste intensiteit<br /> #*waar bevinden zich de grootste patterson pieken<br /> <br /> ===27 juni 2007===<br /> #Ruimtegroep tekenen. Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?<br /> #Bespreek volgende stellingen. Geef telkens ook een korte motivatie:<br /> #*Op basis van systematische afwezigheden kan geen verschil gemaakt worden tussen de ruimtegroepen P2 en P2/m.<br /> #*De temperatuurfactoren van &amp;lt;math&amp;gt;\alpha&amp;lt;/math&amp;gt;-Fe zijn isotroop.<br /> #*NMR-spectrum en molecule. Kunnen die bij elkaar horen?<br /> #Typische gecombineerde oefening. Diffractiemeting op wolfraam met Cu-&amp;lt;math&amp;gt;\alpha&amp;lt;/math&amp;gt; straling. Beschouw vlakken (211) en (310). Een tabel met &amp;lt;math&amp;gt;\frac{\sin \theta}{\lambda}&amp;lt;/math&amp;gt; waarden is gegeven.<br /> #*Teken het reële rooster en duidt de vlakken aan.<br /> #*Teken ab-projectie van het reciproke rooster, en duidt hier ook de vlakken aan.<br /> #*Voor welk vlak verwacht je de grootste reflectiehoek.<br /> #*Voor welk vlak verwacht je de grootste intensiteit.<br /> <br /> ===Vragen eerste zit vrijdag 30 juni 2006 (Fysica)===<br /> #Teken Pbna (ab-projectie). Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?<br /> #Zijn volgende stellingen waar of vals?<br /> #*Omgeving van een bol in hexagonaal dichtste bolstapeling is C3h.<br /> #*&amp;lt;math&amp;gt;P2_1&amp;lt;/math&amp;gt; en &amp;lt;math&amp;gt;P2_1/m&amp;lt;/math&amp;gt; zijn niet te onderscheiden met behulp van de speciale posities.<br /> #*Dit is het NMR-spectrum van... (iets ingewikkeld)<br /> #LiF kristalliseert zoals NaCl in kubische cel met parameter a = 0,4026 nm. We gebruiken CuKa straling en een kristal met dimensie 0,2x0,2x0,2.<br /> #*Geef de ab-projectie van de structuur.<br /> #*Geef de reciproke parameters.<br /> #*netvlakken 003 en 004: welke heeft grootste intensiteit van de gereflecteerde straal?<br /> #*Wat gebeurt met deze reflecties (dus hoek, intensiteit, fase) als we F vervangen door I. Wat gebeurt er als we de afmetingen van het kristal verdubbelen?<br /> #*Welke zijn de grootste pieken in de Pattersonfunctie?<br /> <br /> === Vragen eerste zit dinsdag 27 juni 2006 (Geologie) ===<br /> (dit waren vragen van geologie, zij hebben ook een deel poederdiffractie dat voor fysici niet gekend hoeft te zijn)<br /> <br /> *teken de ruimtegroep Pncm (a,b-projectie)<br /> Geef equivalente posities, multipliciteit en assymmetrische eenheid<br /> <br /> Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid?<br /> <br /> Geef twee speciale posities<br /> <br /> *stellingen:<br /> De atomen in perovskiet liggen allemaal op speciale posities<br /> <br /> De ruimtegroepen P2/c en Pc behoren tot zelfde pattersongroep<br /> <br /> *loodoxide PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel<br /> a=3,975 A en c=5,023 A<br /> atomen liggen op de posities:<br /> Pb(1): 0 ½ 0.2385<br /> Pb(2): ½ 0 -0.2385<br /> O(1): 0 0 0<br /> O(2): ½ ½ 0<br /> Teken een a,b-projectie van de eenheidscel en beschrijf de omringing van de loodatomen met behulp van een puntgroep<br /> <br /> Welk Bravaisrooster?<br /> <br /> Bepaal voor de reflectie (110) de fase van de structuurfactor en intensiteit<br /> Teken het vlak (110) en de invallende en afgebogen bundel bij op de a,b-projectie bij gebruik van CuKα <br /> <br /> Bereken de positie van de diffractielijn op een Debye-Scherrer film<br /> (camerastraal=28,7mm en CuKα)<br /> <br /> Teken schematisch de film<br /> <br /> === Vragen eerste zit donderdag 22 juni 2006 (Fysica) ===<br /> *eerste vraag:<br /> Teken een ab-projectie van de ruimtegroep Pmcb<br /> en alles der op en der aan, puntgroep, patterson, equivalente posities...<br /> <br /> *Tweede vraag:<br /> Zijn volgende stellingen waar, verklaar:<br /> 1. kan men uit een diffractie patroon de aanwezigheid opmaken van een S4 as?<br /> 2. Is de R-waarde een maat voor de resolutie van een diffractie?<br /> 3. Is dit het NMR spectrum van ... (een onuitspreekbare naam)<br /> <br /> *Derde vraag:<br /> Oefeningen op een hexagonaal stelsel CadmiumdiJood met straling bepalen en uittekenen.&lt;/text&gt;</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Moleculaire_Architectuur&diff=1306 2018-09-04T15:17:43Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> Verplicht vak voor chemie. <br /> <br /> Dit vak wordt gegeven door professor Van Meervelt, hij is de aangenaamheid zelve op het examen!<br /> Zijn bijvragen zijn wel aan de moeilijke kant. Maar hij zal je altijd helpen de bijvragen beetje bij beetje op te lossen. Het examen duurt 4u.<br /> <br /> Kristallografie is het vak Moleculaire Architectuur, maar dan zonder NMR (het laatste hoofdstuk). Dit is eigenlijk de voorloper van moleculaire architectuur. Het wordt ook nu nog aan de geologen gegeven.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> # Geef de contructie van Ewald<br /> # H-NMR van C10H12O3<br /> # Ruimtegroep Pcnb<br /> # Geef de puntgroep van 4 isomeren van tetrachloornaftaleen die aanleiding geven tot een andere puntgroep. <br /> # PbO kristaliseert uit in eenheidscel met gegeven dimensies en atoomposities. Gevraagd: Construeer de pattersonfunctie, waar zijn de sterkste pieken? Tot welk Bravais rooster behoort dit? Wat is de afbuighoek van het 110 vlak met CuKalfa? <br /> # Begrippen: Kubisch en hexagonale dichtste bolstapeling + McLafferty omlegging<br /> <br /> ===27 augustus 2018===<br /> # Hoe kan men het faseprobleem oplossen met behulp van de Pattersonfunctie? (dus ook uitleggen wat faseprobleem is, formule van pattersonfunctie geven,...) (mondeling)<br /> # Gegeven drie H-NMR spectra, alle drie C6H6N2O2, bepaal structuren, en verklaar de verschillende spectra (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pcmn met alle gebruikelijke vragen<br /> # Bepaal tot welke puntgroepen de isomeren van trichloorbenzeen behoren, teken alle symmetrie-elementen<br /> # Oefening met CdI2, bepaal fasehoek van de reflectie op (110) en afbuighoek theta, tot welk bravais rooster behoort dit? Waar bevinden zich de maxima bij de Pattersonfunctie?<br /> # Begrippen: MALDI-TOF, Laue groep<br /> <br /> ===15 juni 2018===<br /> # Leid de structuurfactor af. Kan deze ook experimenteel bepaald worden? (mondeling)<br /> # Gegeven een H-NMR spectrum, bepaal de structuur van de chemische stof die dit spectrum geeft. (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pmca, gebruikelijke bijvragen.<br /> # Oefening met intensiteit enzo berekenen. Structuur was op eerste zicht niet centrosymmetrisch, maar was het wel met andere oorsprong.<br /> # Wat is de vlakgroep van het (110) vlak van NaCl? Teken en geef alle symmetrie-elementen.<br /> # Begrippen: MALDI-TOF, kubisch dichtste bolstapeling<br /> <br /> ===11 juni 2018===<br /> # Waarom Pattersonfunctie belangrijk bij het faseprobleem?<br /> # NMR: C10H1202<br /> # Ruimtegroep Pbab met alle bijhorende vragen<br /> # Puntgroepen geven van 4 verschillende aromatische verbindingen + symmetrie elementen aanduiden<br /> # Oefening waarbij celparameters en 2 atomen gegeven zijn. Intensiteit en afbuighoek berekenen voor (001) en (002). Tot welk Bravais rooster gehoord deze kristalstructuur? <br /> # Begrippen: CuKalfa en ESI<br /> <br /> ===27 juni 2017===<br /> # Stappen van kristalstructuurbepaling<br /> # NMR, een piek waar bij stond deze verdwijnt bij schudden met D2O, bijvraag waarom deze piek verdwijnt, ook bijvragen over C13 NMR en IR<br /> # Ruimtegroep Pcmm en bijvragen<br /> # Vlakgroep vlak 110 NaCl<br /> # Bepalen van intensiteit reflectie van vlak 200, lengte en fractionele coördinaten gegeven<br /> # Beschrijf MALDI-TOF en kubisch dichtste bolstapeling<br /> <br /> ===22 juni 2017 NM===<br /> # Structuurverfijning van kristalstructuurbepaling<br /> # Leg uit: NOE en NOESY<br /> # Ruimtegroep Pcan met alle bijhorende vragen<br /> # Oefening waar 4 moleculen stonden waarvan je de puntgroep moest bepalen<br /> # Oefening met tabel Sintheta/golflengte- intensiteit en hoek 2theta bepalen<br /> # begrippen: CuKalfa en Resolutie <br /> <br /> === 16 juni 2017 NM===<br /> #Hoe Faseprobleem oplossen met Patterson functie <br /> #1H- Nmr ( bijvragen : welke piek is het belangrijkst bij IR-spectra , hoeveel pieken zullen er zijn bij C13,..) <br /> #Ruimtegroep ( ik dacht Pbmn )<br /> #Intensiteit bepalen en afbuighoek bepalen <br /> #Puntgroep van tetrachloornaftaleen ( eerst isomeren geven en van elk isomeer puntgroep bepalen) <br /> #Mc-lafferty omlegging<br /> #chemische ionisatie<br /> ===16 juni 2017 VM===<br /> #leid de formule voor de structuurfactor af en vertel hoe je deze experimenteel kan bepalen.<br /> #Geef alle ionisatie technieken gebruikt in MS.<br /> #Puntgroep Pbcm met gebruikelijke bijvragen<br /> #Geef de puntgroepen van alle isomeren van tetrachloor kubaan en teken de symmetrie elementen<br /> #verklaar chemische shift, koppelingsconstante en shift reagens<br /> ===12 juni 2017===<br /> #leg constructie van Ewald uit<br /> #nmr spectra (geef structuur molecule ) C10H12O3<br /> #ruimtegroep Pncm met alle bijhorende vraagjes (asymmetrische eenheid, multipliciteit, equivaltente posities, patterson, puntgroep, systematische afwezigheden)<br /> #Vlakgroep van (110) vlak van ijzer. Geef alle symmetrie elementen<br /> #oefening ivm fase berekenen en intensiteit (CdI2, sin(theta)/golflengte is gegeven, bepaal fCd, fI en zo de rest)<br /> #begrippen: ESI &amp; Wet van Friedel<br /> <br /> ===21 augustus 2015===<br /> # stappen van de kristalstructuur bepaling<br /> # Welke methode voor ionisatie worden er gebruikt bij massaspectroscopie<br /> # Pcan (met alle gebruikelijke bijvraagjes)<br /> # Vlakgroep van (110) vlak van ijzer. Geef alle symmetrie elementen<br /> # PoCL2: ge krijgt Sin theta/lambda en uw celafmetingen, geef Fhkl, Ihkl en uw hoek<br /> # Bespreek de termen chemische shift, (vul hier in want ik kom er nie op) en shiftreagens<br /> === 18 augustus 2015 vm ===<br /> # leg het principe van uit van verfijning van een kristalstructuur<br /> # leg volgende begrippen uit: NOE en NOESY<br /> # ruimtegroep Pbmn en alle vraagjes zoals altijd<br /> # puntgroepen geven 4 isomeren van een of ander molecule<br /> # voor een bepaalde reflectie de fase van de structuurfactor berekenen en de intensiteit<br /> # 2 stellingen (juist of fout):<br /> #* Bij een ESI spectrum zijn er geen fragmentaties<br /> #* Bij kubische dichtste bolstapeling liggen alle atomen op speciale posities<br /> === 24 juni 2015 ===<br /> # Nmr spectra<br /> # verfijning van kristalstructuur<br /> # Vlak groep van ijzer<br /> # Ruimte groep Pcan + al die bijvragen<br /> # Oefening sin theta/lambda. ..<br /> # 2 stellingen: <br /> #* esi heeft geen fragmentaties<br /> #* In ccp liggen alle atomen op speciale posities<br /> <br /> === 18 juni 2015 ===<br /> # Hoe kunnen we met behulp van de pattersonfunctie het faseprobleem oplossen?<br /> # Leg uit NOE en NOESY<br /> # puntgroep Pbmn<br /> # Bepaal de puntgroep van de isomeren van tetrachloorkubaan en duid alle symmetrie-elementen aan<br /> # Bereken de fase van de structuurfactor en de intensiteit voor CdI2 met <br /> #* Eenheidscel a=4,24 A, c=6,86 A, gamma=120°<br /> #* Posities: Cd 0 0 0, I(1) 2/3 1/3 1/4, I(2) 1/3 2/3 3/4<br /> #* sin theta/lamba 0,0 0,1 0,2 0,3 fCd 48 44,58 38,44 33,22 fI 53 49,36 42,79 37,14<br /> # Verklaar de begrippen CuKalfa en resolutie<br /> <br /> === 9 juni 2015 vm ===<br /> # Leid de uitdrukking van de structuurfactor af. Hoe kan je de structuurfactor experimenteel bepalen?<br /> # H-NMR spectra van 3 isomeren C6H6N2O2<br /> # Ruimtegroep Pncm<br /> #* Equivalente posities<br /> #* multipliciteit<br /> #* asymmetrische eenheid<br /> #* Geef 2 speciale posities (waarom speciaal?)<br /> #* van welke puntgroep afgeleid?<br /> #* Pattersongroep?<br /> #*Systematische afwezigheden<br /> # Bepaal de puntgroep van verschillende isomeren van tetrachloornaftaleen. Duid de symmetrie elementen aan.<br /> # Rood Loodoxide PbO kristalliseert in tetragonale eenheidscel a= 3.975 c= 5.023<br /> #* Waar vind je in Pattersonfunctie sterkste pieken?<br /> # Leg uit : ESI en ATR-IR<br /> <br /> ===25 juni 2014===<br /> #Geef de stappen voor kristalstructuurbepaling (mondeling)<br /> #Wat is NOE? (mondeling)<br /> #Ruimtegroep Pcnb<br /> #Geef puntgroep van alle isomeren van tetrachloorkubaan<br /> #Intensiteit van In en afbuighoek: vormfactor, atoomposities zijn gegeven<br /> #Stellingen<br /> #*Bij ESI is geen fragmentatie<br /> #*Bij kubisch dichtste bolstapeling liggen de atomen op speciale posities<br /> <br /> ===13 juni 2014===<br /> # Hoe kunnen we met behulp van de pattersonfunctie het faseprobleem oplossen? (mondeling)<br /> # NMR spectrum met gesubstitueerde benzeenring (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pbnm met alle typische bijvragen (asymmetrische eenheid, speciale posities + waarom ze speciaal zijn, pattersongroep, puntgroep en systematische afwezigheden)<br /> # Geef de vlakgroep van (110) van ijzer<br /> # Oefening op structuurfactor. Vormfactoren met bijhorende sin(θ)/λ zijn gegeven, net als de fractionele coördinaten en de grootte van de eenheidscel<br /> # Wat is ESI?<br /> <br /> ===13 juni 2013===<br /> # Ruimtegroep Pbmb.<br /> # Wat is de vlakgroep van het vlak (110) in de ijzerstructuur?<br /> # NMR-spectrum gegeven. Stelling: Bevat dit spectrum een AX6 systeem?<br /> # Leg volgende begrippen uit: Laue groep, resolutie, temperatuursfactor.<br /> # Gegeven: posities van In en celparameters (a en c). Teken een a,b-projectie van de eenheidscel. Welk Bravais-rooster heeft de cel? Bepaal de afbuighoek 2theta en de intensiteit van de reflecties (001) en (002). Wat is de puntgroep rond de middelste In? Waar bevinden zich de hoogste Pattersonpieken?<br /> <br /> ===10 juni 2013===<br /> # Teken ruimtegroep Pbnb (ab-projectie) en geef equivalente posities, speciale posities, systematische afwezigheden, puntgroep waarvan de ruimtegroep is afgeleid en asymetrische eenheid. (Schriftelijk, na 1 uur af te geven.)<br /> # Wat is de vlakgroep van het vlak (110) in de platina-strucuur? (Structuur is dus van buiten te kennen!) Bijvraag: is dit vlak de eenheidscel van de vlakgroep? (Mondeling)<br /> # Bespreek: voor ethylisobutyraat (spectrum en structuur gegeven) is een ontkoppelingsexperiment niet mogelijk. Bijvragen: hoe bepalen we de frequentie die we moeten gebruiken voor het ontkoppelingsexperiment? Link de verschillende pieken aan de verschillende groepen. (Mondeling)<br /> # Leg de Ewald-constructie uit. Bijvraag: wat gebeurt er als we het kristal draaien? (Mondeling)<br /> # Gegeven: posities van Mo en Ni in een MoNi4-legering en parameters a en c. Teken een a,b-projectie van de eenheidscel. Welk Bravais-rooster heeft de cel? Bepaal de 2-theta en de intensiteit van de reflectie (002). Wat is de puntgroep rond Mo? Geef de hoogste pattersonpieken.<br /> <br /> ===16 juni 2011===<br /> # Teken ruimtegroep Pmcn (ab-projectie) en geef equivalente posities, puntgroep waar deze ruimtegroep van is afgeleid, asymmetrische eenheid, 2 speciale posities en bijhorende Pattersongroep. Zijn er systematische afwezigheden?<br /> # Stellingen:<br /> #* Het vlak (110) wordt bij Fe en bij NaCl beschreven door dezelfde vlakgroep<br /> #* Bij een goed verfijnde structuur zijn de pieken op de verschilfourier te verwaarlozen<br /> #* Voor de waterstofatomen met delta 6,8 is een ontkoppelingsexperiment niet mogelijk (NMR-spectrum van ethyl-4-methoxybenzoaat gegeven, het gaat om de waterstoffen op C3 en C5 van de benzeenring). <br /> # Oefening: PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel, a en c gegeven. Twee posities voor Pb en voor O gegeven. Teken de ab-projectie. Door welke puntgroep wordt de geometrie rond de Pb-atomen beschreven? Door welk Bravaisrooster wordt het kristal beschreven? Bepaal de fase van de intensiteit van afgebogen stralingsbundel voor het vlak (110) voor CuK-alpha (tabel met enkele waarden gegeven voor f van Pb en O ifv sin(theta)/lambda). Teken het vlak (110) en de invallende en afgebogen stralingsbundel op de tekening.<br /> <br /> ===10 juni 2010 (NM)===<br /> # Teken ruimtegroep Pmnb en klassieke vragen: equivalente posities, 2 speciale posities, systematische afwezigheden, asymmetrische eenheid, puntgroep,..<br /> # Stellingen:<br /> #* De temperatuur heeft geen invloed op de kristalstructuurbepaling.<br /> #* Het is niet mogelijk om P2 en Pm van elkaar te onderscheiden met behulp van intensiteitsmetingen.<br /> # NMR-spectrum en bepalen of het overeenkomt met het gegeven molecule.<br /> # Oefening: AgI kristal, a= 6,50 Angstrom, coordinaten van atomen zijn gegeven, en tabel van f ifv sin/lambda.<br /> #* Geef a,b-projectie + Bravaisrooster<br /> #* Bereken Intensiteit en bereken afbuighoek van vlak 004<br /> #* Geef puntsymmetrie rond Ag en rond I<br /> #* Waar verwacht je de hoogste Pattersonpieken?<br /> <br /> ===23 juni 2009===<br /> # teken ruimtegroep (Pnca dacht ik) &amp;amp; geef eq. posities, 2 speciale posities, syst. afwezigheden, puntgroep, ...<br /> # Stellingen:<br /> #* rotatiesymmetrie kan bepaald worden via rotatiediffractie(dat een ding waar ge een kristal draait, ik ben niet meer zeker of dat zo heet)<br /> #* bij verschilelektronendichtheidsmap gaat de hoogte van de pieken verloren bij verfijning (ofzoiets toch)<br /> # NMR van 1,1-dimethoxyethaan<br /> # Oefening: alfa-uranium heeft volgende coordinaten op speciale posities: +-(0,y,1/4) +-(1/2,1/2-y,-1/4) a b en c gegeven(3 verschillende waarden) 2 groottes van structuurfactoren gegeven en de fu in functie van sin(theta).<br /> #* y is 0.10 of 0.15, bepaal dit met bhv de gegevens. <br /> #* Teken een a,b-projectie. <br /> #* Beschrijf de omringing van het U-atoom via de puntgroep van het atoom. <br /> #* Teken de pattersongroep.<br /> ===17 juni 2009===<br /> # Ruimtegroep Pcan: equivalente posities, multipliciteit, asymmetrische eenheid, 2 speciale posities, puntgroep, systematische afwezigheden<br /> # Stellingen<br /> #* De temperatuurfactoren van Pt in een Pt-kristal zijn isotroop (Antwoord: Waar want ze liggen op speciale posities)<br /> #* De symmetrie van een diffractiepatroon van een kristal wordt bepaald door de ruimtegroep<br /> #* NMR: aspirine<br /> # Oefening: Nikkelarsenide (a, c en gamma=120° is gegeven) De posities van Nikkel en van arseen zijn ook gegeven. <br /> #* Geef de ab-projectie, bravais rooster, wat is de stapeling van Arseen, puntgroep rond Arseen en rond nikkel <br /> #* Bij reflecties (200), (300) en (030) en Cu K-alfa straling<br /> #** Voorspel de hoogste intensiteit<br /> #** Voorspel de grootste afbuighoeken<br /> #* Wat is de resolutie bij een afbuighoek van 100° en bij Cu K-alfa straling<br /> <br /> === 15 juni 2009 ===<br /> # Ruimtegroep (ik denk Pbmn) met klassieke vragen<br /> # Stellingen<br /> #* Pm en Cm hebben dezelfde Harkersecties<br /> #* Cobalt kan geïoniseerd worden met Cu K alfa straling<br /> #* NMR<br /> # Oefening: HgS met coördinaten Hg en S gegeven. Alle elementen geven van 11 juni op uitzondering van de afbuighoek en dit voor de vlakken 200 en 400. <br /> <br /> === 11 juni 2009 ===<br /> # Ruimtegroep + asymmetrische eenheid + 2 speciale posities + iets met systematische afwezigheden<br /> # Stellingen<br /> #* Het 110 vlak van Fe vertoont C4v (Bijvragen: aantonen op modellekes)<br /> #* De atomen bij hexagonale dichtste bolstapeling liggen allemaal op speciale posities (Bijvraag: Hij vraagt om de kubische bolstapeling te laten zien, met die pingpongballetjes en hoe heten de ruimtes tussen die pingpongballekes) <br /> #* NMR: een benzeen met een chloor op en op para positie iets me een ethyl en een keton (Bijvraag: hoe zie je dat het een spectrum van de 1ste orde of 2de orde is)<br /> # Oefening: ik kreeg een tabel met fractionele coördinaten van ReO3 en zo'n tabel met sin (theta) / lamda en vormfactoren. Ik moest een ab projectie tekenen, bravais rooster geven, intensiteit berekenen, afbuighoek bepalen, hoogste pattersonpieken voorspellen.<br /> <br /> === 24 juni 2008 ===<br /> # Pmca met klassieke vragen<br /> # Stellingen<br /> #* Alle atomen van sfaleriet bezetten speciale posities<br /> #* Een kristalrooster kan ondubbelzinnig bepaald worden adhv systematische afwezigheden<br /> #* isopropyltolueen<br /> # Wolfraam-rooster en CuKa straling, vlakken (211) en (310)<br /> #* teken 3D-rooster en duidt [sic] vlakken aan<br /> #* Welke intensiteit is sterkst, bij (221) of bij (310)<br /> #* Welke reflectiehoek is grootst, bij (221) of bij (310)<br /> #* Welke zijn de sterkste Pattersonpieken?<br /> <br /> === 19 juni 2008 ===<br /> # Pbmn tekenen + assym. eenheid + equi. pos. + multipliciteit + 2 speciale pos. + Systematische afwezigheden + van welke puntgroep<br /> # Stellingen<br /> #* De temp. heeft geen invloed op het diffractiepatroon<br /> #* De vlakken 001 en 110 van Fe hebben dezelfde vlakgroep (ook zeggen welke vlakgroep(en))<br /> #* NMR<br /> #De structuur van LiF en NaCl is dezelfde, a = ...., kristalafmeting 0,2mmx0,2mmx0,2mm en wordt bestraald met Cu kalfa. Bereken F003 en F004. Welke intensiteit is het hoogst? Wat gebeurt er met de diffractiehoek en de intensiteit als je:<br /> #*F vervangt door I<br /> #*de cel verdubbeld<br /> #*Waar verwacht je de sterkste Pattersonpieken<br /> <br /> === 19 juni 2008 ===<br /> # P nmb tekenen + puntgroep + asymetrische eenheid + equi posities<br /> # stellingen ( waar of niet waar )<br /> #* Pm en Cm hebben dezelfde harkersecties<br /> #* R staat voor de resolutie van een structuurbepaling<br /> #* spectrum en molecule gegeven, horen ze bij elkaar?<br /> # oefening : NH4HgCl3 heeft eenheidscel a = ... c =... en atoomposities N, Hg en 3 Cl-en gegeven: (ook alpha-Cu straling zoda je uw lambda ook kent) (tabel sin(theta)/lambda en f waarden van Cl, Hg en N gegeven)<br /> #* geef (a,b) projectie van eenheidscel<br /> #* bepaal Bravais rooster<br /> #* bepaal intensiteit en afbuigrichting 2theta van de reflectie (004)<br /> #* Hg door welke puntgroep omringt<br /> <br /> ===23 juni 2008===<br /> #Ruimtegroep tekenen. In dit geval Pman. Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?<br /> #Bespreek volgende stellingen. Geef telkens ook een korte motivatie:<br /> #*Op basis van systematische afwezigheden kan geen verschil gemaakt worden tussen de ruimtegroepen P2 en P2/m.<br /> #*De temperatuurfactoren van &amp;lt;math&amp;gt;\alpha&amp;lt;/math&amp;gt;-Fe zijn isotroop.<br /> #*NMR-spectrum en molecule. Kunnen die bij elkaar horen?<br /> #kristal met Li2O met één lengte gegeven (kubisch dus) <br /> #*teken ab projectie gegeven zijn de posities van de atomen<br /> #*geef puntgroep rond Li en O<br /> #*geef bravais rooster<br /> #*twee vlakken gegeven welke grootste hoek en welke grootste intensiteit<br /> #*waar bevinden zich de grootste patterson pieken<br /> <br /> ===27 juni 2007===<br /> #Ruimtegroep tekenen. Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?<br /> #Bespreek volgende stellingen. Geef telkens ook een korte motivatie:<br /> #*Op basis van systematische afwezigheden kan geen verschil gemaakt worden tussen de ruimtegroepen P2 en P2/m.<br /> #*De temperatuurfactoren van &amp;lt;math&amp;gt;\alpha&amp;lt;/math&amp;gt;-Fe zijn isotroop.<br /> #*NMR-spectrum en molecule. Kunnen die bij elkaar horen?<br /> #Typische gecombineerde oefening. Diffractiemeting op wolfraam met Cu-&amp;lt;math&amp;gt;\alpha&amp;lt;/math&amp;gt; straling. Beschouw vlakken (211) en (310). Een tabel met &amp;lt;math&amp;gt;\frac{\sin \theta}{\lambda}&amp;lt;/math&amp;gt; waarden is gegeven.<br /> #*Teken het reële rooster en duidt de vlakken aan.<br /> #*Teken ab-projectie van het reciproke rooster, en duidt hier ook de vlakken aan.<br /> #*Voor welk vlak verwacht je de grootste reflectiehoek.<br /> #*Voor welk vlak verwacht je de grootste intensiteit.<br /> <br /> ===Vragen eerste zit vrijdag 30 juni 2006 (Fysica)===<br /> #Teken Pbna (ab-projectie). Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?<br /> #Zijn volgende stellingen waar of vals?<br /> #*Omgeving van een bol in hexagonaal dichtste bolstapeling is C3h.<br /> #*&amp;lt;math&amp;gt;P2_1&amp;lt;/math&amp;gt; en &amp;lt;math&amp;gt;P2_1/m&amp;lt;/math&amp;gt; zijn niet te onderscheiden met behulp van de speciale posities.<br /> #*Dit is het NMR-spectrum van... (iets ingewikkeld)<br /> #LiF kristalliseert zoals NaCl in kubische cel met parameter a = 0,4026 nm. We gebruiken CuKa straling en een kristal met dimensie 0,2x0,2x0,2.<br /> #*Geef de ab-projectie van de structuur.<br /> #*Geef de reciproke parameters.<br /> #*netvlakken 003 en 004: welke heeft grootste intensiteit van de gereflecteerde straal?<br /> #*Wat gebeurt met deze reflecties (dus hoek, intensiteit, fase) als we F vervangen door I. Wat gebeurt er als we de afmetingen van het kristal verdubbelen?<br /> #*Welke zijn de grootste pieken in de Pattersonfunctie?<br /> <br /> === Vragen eerste zit dinsdag 27 juni 2006 (Geologie) ===<br /> (dit waren vragen van geologie, zij hebben ook een deel poederdiffractie dat voor fysici niet gekend hoeft te zijn)<br /> <br /> *teken de ruimtegroep Pncm (a,b-projectie)<br /> Geef equivalente posities, multipliciteit en assymmetrische eenheid<br /> <br /> Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid?<br /> <br /> Geef twee speciale posities<br /> <br /> *stellingen:<br /> De atomen in perovskiet liggen allemaal op speciale posities<br /> <br /> De ruimtegroepen P2/c en Pc behoren tot zelfde pattersongroep<br /> <br /> *loodoxide PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel<br /> a=3,975 A en c=5,023 A<br /> atomen liggen op de posities:<br /> Pb(1): 0 ½ 0.2385<br /> Pb(2): ½ 0 -0.2385<br /> O(1): 0 0 0<br /> O(2): ½ ½ 0<br /> Teken een a,b-projectie van de eenheidscel en beschrijf de omringing van de loodatomen met behulp van een puntgroep<br /> <br /> Welk Bravaisrooster?<br /> <br /> Bepaal voor de reflectie (110) de fase van de structuurfactor en intensiteit<br /> Teken het vlak (110) en de invallende en afgebogen bundel bij op de a,b-projectie bij gebruik van CuKα <br /> <br /> Bereken de positie van de diffractielijn op een Debye-Scherrer film<br /> (camerastraal=28,7mm en CuKα)<br /> <br /> Teken schematisch de film<br /> <br /> === Vragen eerste zit donderdag 22 juni 2006 (Fysica) ===<br /> *eerste vraag:<br /> Teken een ab-projectie van de ruimtegroep Pmcb<br /> en alles der op en der aan, puntgroep, patterson, equivalente posities...<br /> <br /> *Tweede vraag:<br /> Zijn volgende stellingen waar, verklaar:<br /> 1. kan men uit een diffractie patroon de aanwezigheid opmaken van een S4 as?<br /> 2. Is de R-waarde een maat voor de resolutie van een diffractie?<br /> 3. Is dit het NMR spectrum van ... (een onuitspreekbare naam)<br /> <br /> *Derde vraag:<br /> Oefeningen op een hexagonaal stelsel CadmiumdiJood met straling bepalen en uittekenen.&lt;/text&gt;</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Moleculaire_Biologie&diff=1290 2018-08-24T08:42:12Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak gedoceerd door Prof. J.Robben sinds september 2009, vroeger gedoceerd door Prof. M. De Ley. Mondeling examen. Sinds 2013 3 grote vragen en de vierde vraag is kort enkele woordjes of een tekening bespreken.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===24 augustus 2018===<br /> #Bespreek de gelijkenissen en verschillen bij prokaryote en eukaryote promotors die betrekking hebben op eiwit genen. (dus alleen Class 2 voor eukaryoten) <br /> #Bespreek RNA-splicing. intron-herkenning, mechanisme, factoren, enzymen,... <br /> #Wat is homologe recombinatie? Wat is het werkingsmechanisme? Welke eiwitten zijn erbij betrokken?<br /> #begrippen: Riboswitch, tekining Kozak sequentie, telomerase en cDNA-cloning (dit is vanaf mRNA naar DNA gaan om het in een vector in te bouwen, staat voor complementair DNA)<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> #Welke rol spelen prokaryote sigma-factor(en) bij de transcriptie? Bespreek hun structuur en functie. (mondeling)<br /> #Hoe kan men experimenteel de transcriptie-start van een gen bepalen voor een bepaalde promoter?<br /> #Replicatie van lineair DNA (niet-circulair) met DNA polymerase vormt een probleem voor de cel. Wat is dit probleem? Hoe lost de cel dit probleem op?<br /> #Begrippen: Riboschakelaar (riboswitch), cDNA-kloning, tekening van kozaksequentie, RecBCD reactieweg (mondeling)<br /> <br /> ===22 januari 2018 VM===<br /> #Wat zijn histonen? Hoe zijn ze betrokken in de genexpressie? Bespreek het moleculaire niveau.<br /> #Structuur en functie van catabolic activatior protein (cap)<br /> #Waaorom past immunoglobine bij het hoofdstuk over transpositie?<br /> #Begrippen: mRNA cap, tekening van backtracking, oriC, sanger-methode<br /> <br /> ===18 januari 2018 NM===<br /> #Met welke methode kun je op experimentele wijze de relatieve hoeveelheid van mRNA aantonen? <br /> #Wat is alternative splicing? Wat is de functie voor de cel? Geef een concreet voorbeeld.<br /> #Geef het mechanisme van translatie elongatie bij prokaryoten.<br /> #Begrippen: Lacoperon met 3operatoren en CAPsite, Leu-zipper, peptidyltransfer en retrotransposon<br /> <br /> ===15 januari 2018 NM===<br /> #Geef de verschillen bij transcriptie initiatie tussen prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Geef de verschillende mogelijkheden voor transcriptie terminatie bij prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Wat is de functie van RuvC bij de Holliday Junction? Maak een schets en beschrijf het mechanisme.<br /> #Begrippen: Sanger Sequencing, Zn-vingers, U2 (SNRNP), stopcoconsupressie. <br /> <br /> ===15 januari 2018 VM===<br /> #Wat is alternatieve splicing? Hoe werkt het en wat is de functie ervan. Geef een concreet voorbeeld. (Mondeling)<br /> #Leg op moleculair niveau translatie-elongatie cyclus uit bij prokaryoten. (Schriftelijk)<br /> #Welke transposons komen voor bij zoogdieren. Leg bondig uit hoe die eruit zien. Hoe frequent komt dit voor bij mensen?(Schriftelijk)<br /> #Begrippen: DNA-footprinting, figuur zink vinger, polysoom, Holliday junctie (Mondeling)<br /> <br /> ===6 september 2017 NM===<br /> #Bespreek de effecten van arabinose en glucose op de expressie van het ara-operon. Verduidelijk de onderliggende mechanismen.<br /> #Bespreek de opvouwing van nucleair DNA bij eukaryoten en bespreek de effecten op de genexpressie. <br /> #Het Ds en Ac mechanisme bij maïs uitleggen. Waarom was deze wetenschappelijke ontdekking zo belangrijk?<br /> #Begrippen: figuur Zn-vinger, polysoom, Shine-Dalgarno box, klem lader (clamp loader)<br /> <br /> ===28 augustus 2017 VM===<br /> #Structuur, biosynthese en functie van cap bij mRNA van eukaroyten. Hoe zit het bij 5'-uiteinde van prokaroyten?<br /> #Welke methode(n) worden gebruikt voor het bepalen van de relatieve hoeveelheid van specifiek mRNA? Leg de werkwijzen uit.<br /> #Wat is homologe recombinatie? Welke moleculaire processen vinden plaats en welke eiwitten zijn betrokken?<br /> #Begrippen: Leu-zipper, nucleosoom, startcodon met kozak sequentie, dubbelstrengbreuk<br /> <br /> <br /> ===30 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek alternatieve splicing. Hoe werkt het en geef een concreet voorbeeld.<br /> #Tabel van codons. Leg uit: dit wijzigt nooit maar toch is er sprake van evolutie. <br /> #Het Ds en Ac mechanisme bij maïs uitleggen. Waarom was deze wetenschappelijke ontdekking zo belangrijk?<br /> #Begrippen: DNA footprint, resolvase, Zink finger (op de tekening staan 3 zink fingers), polysoom<br /> <br /> <br /> ===23 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek aan de hand van een figuur het trombonemodel van DNA-replicatie. Welke moleculaire structuren en processen van de DNA-replicatie komen in dit model naar voor.<br /> #Bespreek de structuur, functie en regulatie van de prokaryote sigma-factor(en).<br /> #Op welke experimentele manier kun je de transcriptiestart met een gegeven promotor bepalen. <br /> #Begrippen:<br /> #*enhancer<br /> #*cDNA kloning<br /> #*figuur van heatshock gen<br /> #*RecBCD-reactieweg<br /> <br /> ===20 januari 2017===<br /> #transcriptie terminatie bij pro en eukaryoten uitleggen<br /> #bespreek mRNA Cap-structuur bij eukaryoten (biosynthese, structuur, functie) en vergelijk met prokaryoten<br /> #welke moleculaire processen helpen bij de start van translatie bij eukaryoten. (start van matuur mRNA)<br /> #begrippen<br /> #*enhancer<br /> #*yeast two hybrid method<br /> #*tRNA mimicry<br /> #*herschikking van immunoglobinegenen<br /> <br /> === 19 januari 2017 NM===<br /> #Hoe wordt het ara operon gereguleerd?<br /> #Hoe beinvloeden histonen de genexpressie?<br /> #Wat heeft immunoglobuline met transpositie te maken?<br /> #begrippen<br /> #*Sanger sequencing<br /> #*zinkvinger (afbeelding)<br /> #*polysoom<br /> #*beta-klemlader<br /> <br /> === 16 januari 2017 NM===<br /> #Scanningscomplex van translatie initiatie bij eukaryoten<br /> #Methoden om binding van eiwitten aan DNA te bestuderen<br /> #recA welke functies en werking<br /> #begrippen<br /> #*sanger sequencing<br /> #*tekening zink vingers<br /> #*U2 snRNP<br /> #*stopcodonsuppressie<br /> <br /> ===16 januari 2017 VM===<br /> #telomeren<br /> #transcriptie bij eukaryoten<br /> #intron/extron splicing<br /> #begrippen<br /> #*cDNA<br /> #*enhancer<br /> #*tekening RNA mimicry<br /> #*recombinatie bij hemoglobine<br /> <br /> ===16 aug 2016 NM===<br /> #Bespreek de regulatie van het Trp operon. Wat wordt er bedoelt met attenuatie?<br /> #Genetische code is onveranderlijk, maar evolutie laat wel sporen na. Verklaar. (tabel met DNA codons gegeven)<br /> #Wat is homologe recombinatie? Wat zijn de moleculaire stappen in dit proces? Welke zijn de belangrijkste eiwitten?<br /> #Woordjes: <br /> #*Sanger methode<br /> #*Tekening Zinkvinger<br /> #*histonacetyltransferase HAT<br /> #*DNA-mismatch repair<br /> <br /> ===27 januari 2016===<br /> #Bespreek opvouwing bij eukaryoot DNA en de invloed op de genexpressie<br /> #Vergelijk translatie-intitiatie bij prokaryoten en eukaryoten<br /> #Er is een probleem bij de replicatie van lineair DNA. Bespreek en wat kunnen we hieraan doen.<br /> #Woordjes: Figuur 8.18, epitoop tagging, mRNA-cap, suppressor-tRNA<br /> <br /> ===25 januari 2016===<br /> #trp en attenuatie<br /> #chromatinestructuur<br /> #translatie initiatie eukaryoten + regulatie<br /> #Woordjes: <br /> #*foto footprinting<br /> #*cap mRNA<br /> #*base-excinsieherstel<br /> #*retrotransposons<br /> <br /> ===18 januari 2016 VM===<br /> #Geef de structuur, functie, biosynthese van de 5' cap en vergelijk dit met het 5' einde van de prokaryoten.<br /> #Bespreek de gelijkenissen en verschillen tussen pro- en eukaryoot RNA-polymerases.<br /> #Wat is homologe recombinatie, welke moleculaire stappen vinden hierbij plaats en wat zijn de belangrijkste eiwitten die hierin meespelen.<br /> #Woordjes: <br /> #*Sanger-sequencing<br /> #*Foto van antiterminatie – terminatie<br /> #*Nucleosoom<br /> #*DNA-mismatch repair<br /> <br /> ===15 januari 2016 NM===<br /> #Leg aan de hand van een tekening uit wat het trombone effect is en welke moleculaire structuren en functies worden hier in dit mechanisme samen getrokken.<br /> #Verklaar met een schema hoe de lysogene cyclus ontstaat bij faag lamba infectie van een E.Coli. Hoe behoud men dee lysogene cyclus en hoe kan deze worden verbroken.<br /> #Geef de structuur, functie, biosynthese van de 5' cap en vergelijk dit met het 5' einde van de prokaryoten;<br /> #Kleine vraagjes: <br /> #*Tekening van lac operon met O1 O2, O3 en CAP en RNAP bindingsplaatsen.<br /> #*Leu-zipper<br /> #*Peptidyltransferase<br /> #*Retrotransposons<br /> <br /> ===14 januari 2016 NM===<br /> #Welke experimentele methoden ken je om de interactie tussen dna en eiwit te bestuderen en hoe werken ze.<br /> #Bespreek transcriptie van eukaryote rna polymerase 2 en de factoren die hierin meespelen. <br /> #Bacteriële transposons, hoe werken ze en wat zijn voor- en nadelen.<br /> #Woordjes: <br /> #*Northern blotting<br /> #*wobble base paring<br /> #*u6<br /> #*en zo die haarspeld van heatshok<br /> <br /> ===13 januari 2016===<br /> #Terminatie van transcriptie bij prokaryoten<br /> #Functie en structuur van de C-terminaal van eukaryoot RNA pol II<br /> #Terminatie en hervatting bij eukaryoten ribosomen<br /> #Woordjes: <br /> #*S1 mapping<br /> #*RNA-DNA hybride met intron<br /> #*eIF2 alfa<br /> #*Holliday junctie<br /> <br /> ===26 januari 2015===<br /> #5'cap structuur, biosynthese en functie en vergelijken met 5' van prokaryote mRna<br /> #catabolic activator protein structuur en functie<br /> #wat is het probleem bij replicatie van lineair dna en hoe lost de cel dit op <br /> #tekening van lac operon (met de 3 operonen, structuur repressor uitleggen); enhanceosoom; peptidyl transfer; en v(d)j-recombination <br /> <br /> ===14 januari 2015===<br /> #verschillen en gelijkenissen tussen rna polymerase van prokaryoten en eukaryoten<br /> #alternatieve splitsing, ook een voorbeeld ervan geven<br /> #genconversie uitleggen aan de hand van een figuur<br /> #woordjes: abortieve transcriptie, tekening van het trombone model, aminoacyl trna synthetase en cdna kloning<br /> <br /> ===12 januari 2015 (NM)===<br /> #Hoe kun je de binding tussen dna en eiwitten bestuderen <br /> #Splicing <br /> #RecBCD <br /> #begrippen: sanger sequencing, zinkvingers afbeelding, histonmodelering, eif4e<br /> <br /> ===12 januari 2015 (VM)===<br /> #transcriptie-initiatie<br /> #translate-elongatie<br /> #transposons bacterie<br /> #woordjes: anti-sigmafactor, epitoop tagging, splicingfiguur en genvonversie<br /> <br /> ===16 jan 2015===<br /> #Bespreek de Trp operon regulatie. Wat is attenuatie?<br /> #Geef de histonen en hun modificaties + het gevolg van deze modificaties op de genexpressie.<br /> #Wat is V(D)J recombinatie en wat is het biologisch nut ervan?<br /> #Kleine vragen:<br /> #*Afbeelding van een Zn-Vinger<br /> #*Wat is een replisoom?<br /> #*Wat is stopcodon supressie.<br /> #*Bespreek de beta klemlader.<br /> <br /> ===3 september 2014===<br /> # Bespreek de effecten van arabinose en glucose op de expressie van het ara-operon. Verduidelijk de onderliggende mechanismen.<br /> # Bespreek de moleculaire processen die leiden tot het starten van de translatie bij eukaryoten (vertrekkende van matuur mRNA in het cytosol).<br /> #* Op welke wijze(n) kan de cel deze translatie-initiatie regelen?<br /> # Wat is homologe recombinatie? Wat zijn de moleculaire stappen in dit proces? Welke zijn de belangrijkste eiwitten?<br /> # Termen:<br /> #* Northern Blotting<br /> #* topoisomerase<br /> #* alternatieve splicing<br /> #* RNA splicing afbeelding uitleggen (halverwege de splicing met de lariaat reeds gevormd.)<br /> <br /> ===28 Augustus 2014===<br /> # Bespreek de regulatie van het trp operon. Wat wordt er bedoeld met attenuatie?<br /> # Bespreek op moleculair niveau de translatie elongatie cyclus bij prokaryoten.<br /> #* Hoe wordt deze cyclus afgebroken? (terminatie)<br /> # Wat is genconversie? Hoe algemeen komt dit voor?<br /> # Termen:<br /> #* DNA footprinting<br /> #* telomerase<br /> #* Rollende cirkel replicatie<br /> #* RNA splicing afbeelding uitleggen (halverwege de splicing met de lariaat reeds gevormd.)<br /> <br /> ===27 januari 2014 (voormiddag)===<br /> # hoe eiwitten ontdekken op DNA? meerder manieren (footprinting en nucleosoompositionering en hij vroeg dan nog naar CAP)<br /> # waar zorgen histonen voor bij DNA en aanpassingen?<br /> # translatie initiatie bij eukaryoten en geef de dingen die daarbij kunnen <br /> # woordjes:<br /> #*antiterminatie<br /> #*ticketing hypothese ofzoiets<br /> #*BER<br /> #*van die eiwitten iets met die herschikkingen<br /> <br /> ===17 jan 2014 (namiddag)===<br /> #bespreek de terminatie mechanismen bij prokaryoten<br /> #bespreek de translatie elongatie cyclus<br /> #bespreek RNA splicing<br /> #woordjes: S1 mapping, enhancer, amino acetyl tRNA syntethase, genconversie<br /> <br /> ===16 jan 2014 (namiddag)===<br /> # Bespreek de structuur en functie van kataboliet activerend proteïne (CAP)<br /> # Bespreek de invloed van histonen en hun modificaties op genexpressie<br /> # Tijdens de replicatie van lineair DNA is er een probleem. Hoe lost de cel dit op?<br /> # Leg uit: <br /> #* nucleaire receptoren<br /> #* polyadenylatiesignalen<br /> #* stopcodonsuppressors<br /> #* bacteriële transposons<br /> <br /> === 15 jan 2014 (voormiddag) ===<br /> # Geef de structuur en functies van de sigma(factoren) bij RNA polymerase van prokaryoten.<br /> # Leg uit wat de structuur en functies zijn van het C terminale domein van eukaryotisch RNA polymerase II.<br /> # De genetische code kan niet gewijzigd worden, toch zijn er sporen van evolutie. Bespreek deze stelling adhv de figuur. Gegeven figuur : tabel van alle mogelijke codons voor de verschillende aminozuren<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte:<br /> #* Epitoop tagging<br /> #* Type II introns<br /> #* Kozak sequentie <br /> #* Holliday-verbinding<br /> <br /> ===13 jan 2014 (namiddag) ===<br /> # Transcriptie initiatie bij prokaryoten<br /> # Splicing<br /> # Leg uit: <br /> #*A-DNA <br /> #*Southern blotting <br /> #*HAT <br /> #*eIF4E<br /> # Homologe recombinatie (enkel schriftelijk)<br /> <br /> ===13 jan 2014 (voormiddag)=== <br /> # bespreek invloed glucose en arabinose op ara-operon + onderligende moleculaire mechanismen<br /> # mRNA cap: bespreek de biosynthese, functie, vergelijk met 5' prokaryoot<br /> # wat hebben transposons en antilichamen gemeen? licht toe<br /> # leg uit: <br /> #*rho<br /> #*zinkvinger<br /> #*peptidyltransferase<br /> #*splicingsignalen<br /> <br /> === 28 jan 2013(voormiddag) ===<br /> <br /> # Geef de verschillen en gelijkenissen tussen de regulaire van lac- en trp-operon.<br /> # Bespreek hoe eukaryote ribosomen transcriptie temineren en hervatten.<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte:<br /> #* cDNA kloning<br /> #* Figuur van polyadenyleringscomplex<br /> #* Heat shock response<br /> #* Rolling circle replicatie<br /> <br /> === 16 jan 2012(voormiddag) ===<br /> <br /> # Structuur en functie van de CTD bij eukaryoot RNA-polymerase II beschrijven.<br /> # Sanger-methode voor sequentie-analyse bespreken.<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte:<br /> #* Zinkvinger<br /> #* Ribozyme<br /> #* Tekening van tRNA-mimicry<br /> #* Telomerase<br /> <br /> <br /> === 24 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> idem 18 januari 2010<br /> <br /> === 17 jan 2011 (namiddag) ===<br /> <br /> # Leg uit hoe lactose en glucose het lac operon beïnvloeden<br /> # Gen activiteit bij eukaryoten kan geanalyseerd worden aan de hand van DNase activiteit. <br /> #* Leg uit <br /> #* hoe doet men dit experimenteel<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte <br /> #* lariat <br /> #* eIF2 alfa <br /> #* wobble <br /> #* tekening van rolling circle replicatie (tekening van faag lamda)<br /> <br /> === 17 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Bespreek structuur en functie van prokaryoot RNA-polymerase (holoënzym)<br /> # Maak een vergelijking tussen translatie-initiatie bij prokaryoten en eukaryoten<br /> # Verklaar:<br /> #* Lysogenie<br /> #* Histon H1<br /> #* RT-PCR<br /> #* Fig. 21.34 (onderste deel alleen)<br /> <br /> <br /> === 29 jan 2010 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Bespreek transcriptie-initiatie bij prokaryoten.<br /> # Fig 21.18<br /> # Bespreek kort:<br /> #* C-waardeparadox<br /> #* Kozak-sequentie<br /> #* Epitope tagging<br /> #* EF-Tu<br /> <br /> === 19 jan 2010 ===<br /> <br /> # Bespreek het scanning-model bij eukaryote translatie-initiatie.<br /> # Welke methode(s) ken je om de transcriptiestartplaats / het 5' einde te bepalen?<br /> # Bespreek kort:<br /> #* Riboswitch<br /> #* TATA<br /> #* Zinkvinger<br /> #* Figuur met vorming thèta-structuur<br /> <br /> === 18 jan 2010 ===<br /> # Geef de overeenkomsten en verschillen tussen pro- en eukaryote promoters.<br /> # Bespreek fig. 14.27<br /> # bespreek kort:<br /> #* Ribosoombindingsplaats<br /> #* Moleculaire mimicrie<br /> #* RACE<br /> #* beta-clamp<br /> <br /> === 11 jan 2010 ===<br /> # Bespreek de structuur en functie van prokaryoot RNA-polymerase(holoënzyme)<br /> # Maak een vergelijking tussen translatie-initiatie bij pro-en eukaryoten.<br /> # bespreek kort:<br /> #* lysogenie<br /> #* H1 histonen<br /> #* RT-PCR<br /> #* Fig 21.34<br /> <br /> === 19 jan 2009 (De Ley)===<br /> # Bespreek terminatie bij prokaryote transcriptie.<br /> # RNA-editing<br /> # fig 4.11<br /> Kaartjes:<br /> # Zink-vinger<br /> # Nick-translatie<br /> <br /> === 16 jan 2009 (De Ley)===<br /> # Bespreek de methode van S1 mapping (5' en 3' einde) en primer extension.<br /> # Structuur prokaryotisch RNA polymerase en bespreking sigma als specificiteitsfactor.<br /> # fig. 14.1<br /> Kaartjes:<br /> # Bespreek MCS, valspositieven en directioneel klonen.<br /> # Plaatsgerichte mutagenese.<br /> <br /> === 15 jan 2009 (De Ley)===<br /> # DNA:<br /> #* Bespreek A, B en Z DNA (ook helemaal hoe DNA wordt opgebouwd).<br /> #* Hoe kan het G-C gehalte van DNA bepaald worden.<br /> # Bespreek de eukaryotische polymerases.<br /> # Figuur van pBR322 bespreken.<br /> Kaartjes:<br /> # Zink-vinger<br /> # fig 9.7<br /> <br /> === 25 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Plaats gerichte mutagenese.<br /> # Trp operon.<br /> # Stom figuur van dnase hypergevoeligheid bij actief/inactief dna.<br /> <br /> === 21 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Bespreek DNA fingerprinting en typing (+toepassingen en detectie)<br /> # Bespreek de lytische reproductiecyclus van faag lambda.<br /> # Foto van RNA editing.<br /> Kaartjes: <br /> # Figuurke van 30nm vezel van chromatine en dan zo verwijderen van histonen om dubbelstreng DNA te krijgen en dan nick van DNA.<br /> # Verschil tussen DNase en DMS footprinting.<br /> <br /> === 21 jan 2008 (De Ley)===<br /> # S1 mapping ( 3' en 5') + primer extension (verschillen, voor-en nadelen)<br /> # Alles over prokaryotisch RNApol (subeenheden, functies, experimenten met sigmafactor + virussentranscriptie, ...)<br /> # figuur: Intron-exon met die lus-structuur (vraagt ook hoe ge da beeld bekomt via EM)<br /> Kaartjes:<br /> # Merodiploid: constitutieve operator.<br /> # Proteïne - dna interactie figuur (met die helix-turn-helix).<br /> <br /> === 17 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Expressievectoren.<br /> # Acetylatie en deacetylatie (+Histone acetyltransferase cloning of zoiets).<br /> # fig 9.14 (vierde editie)<br /> Kaartjes:<br /> # Epitope tagging<br /> # fig 13.10<br /> <br /> === 14 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Bespreek het trp operon.<br /> # Bespreek site-directed mutagenesis.<br /> # vul tekening van DNAse hypersensitivity verder aan. Bespreek de gebruikte technieken.<br /> Kaartjes:<br /> # Zo'n schematje van een merodiploid van het lac operon.<br /> # De C-waarde paradox.<br /> <br /> === 26 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Prokaryoot RNApolymerase en sigma.<br /> # Figuur van RNAlooping.<br /> # S1mapping en primer extension.<br /> <br /> === 25 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Transcriptieterminatie bij prokaryoten.<br /> # RNAediting.<br /> # Figuur van pBluescript.<br /> <br /> === 25 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Reassociatie kinetica.<br /> # Alles over chromatine en H1.<br /> # Foto: P22 en 434 (lambda operator/repressor interacties).<br /> Kaartjes:<br /> # Bespreek de sigmacyclus.<br /> # DNA transcriptie.<br /> <br /> === 24 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Bespreek S1 mapping(zowel 3'als 5'einde) en primer extension.<br /> # Bespreek de structuur van de prokarytische RNApolymerase en ook sigma als specifiteitsfactor.<br /> # Foto van R-looping experiment.<br /> Kaartjes: <br /> # Plaque hybridisatie.<br /> # Dnase(1)-hypergevoeligheid.<br /> <br /> === 16 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Geef de verschillende methoden voor expressie van gekloonde genen(inbegrepen fusieproteïnen en hun zuivering).<br /> # Bespreek de acetylering en deacetylering van histonen (bespreek ook het kloneringsexperiment van histon-acetyl-transferase).<br /> # Figuur 9.17 pag. 258 bespreken.<br /> Kaartjes:<br /> # Vergelijk DNase footprinting met gel mobility shift. Zijn er specifieke voordelen van de ene techniek tov. de andere.<br /> # Figuur 9.18a pag 259 bespreken.</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Wijsbegeerte&diff=1258 2018-06-23T18:29:52Z

<p>Cynthia.R: /* 13 juni 2018 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Sinds 2017 wordt dit vak gegeven door professor Jan Heylen.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===13 juni 2018===<br /> meerkeuze:<br /> #belgië speelt tegen duitsland, ze kunnen winnen of verliezen, dit laatste kunnen ze doen door gelijk te spelen of te verliezen. Wat is de kans dat ze winnen?<br /> #*1/2<br /> #*1/3<br /> #*1/2 of 1/3<br /> #*1/2 en 1/3<br /> #Wat was volgens Thales de oorzaak van aardbevingen<br /> #*een schip door de woeste zee<br /> #*het heel hard terecht komen van een drietand op de aarde<br /> #*het waaien van de wind door de bomen<br /> #*het open en toe gaan van een stoomklep<br /> #Stel jij bent de natuur, hoe zou Bacon iets over jou te weten willen komen?<br /> #*het 1 keer lief vragen<br /> #*het meerdere keren lief vragen<br /> #*je opsluiten in een kamer en het 1 keer vragen<br /> #*je opsluiten in een kamer en het meerdere keren vragen<br /> #De studenten die de les filosofie hebben gevolgd hebben last van een onvoelbaar, onruikbaar, onzichtbaar kriebelend beestje. Deze uitspraak is:<br /> #*verifieerbaar en falsifieerbaar<br /> #*verifieerbaar maar niet falsifieerbaar<br /> #*niet verifieerbaar wel faslifieerbaar<br /> #*niet verifieerbaar en neit falsifieerbaar<br /> #Er zijn 170 miljoen nederlanders waarvan 60 duizend groter zijn dan 2 meter. Wat is de kans (volgens 1 of ander model) dat een nederlands kind groter dan 2 meter is?<br /> #*1<br /> #*3/850<br /> #*0<br /> #*onbepaald<br /> #Hoe verwoorde Osiander het wereldbeeld van Copernicus voor de kerk?<br /> #*instumenteel gebruikt<br /> #* nog 3 antwoorden maar het bovenste is het juiste ;)<br /> #Tot nu toe is altijd deductief waargenomen dat Natriumcarbonaat oplost. Waarom kunnen niet bewijzen dat natriumcarbonaat in 2100 ook zal oplossen?<br /> #*Er bestaan geen axioma's in de chemie<br /> #*het is mogelijk dat natriumcarbonaat oplost<br /> #*in de toekomst gaat natriumcarbonaat niet oplossen<br /> #*en nog eentje<br /> <br /> Op elke vraag kon ook &quot;weet niet&quot; worden geantwoord!<br /> <br /> Open vragen:<br /> #modules, 1 van die vragen<br /> #Wat was volgens Popper het probleem met de uitspraak dat wetenschap werkte volgens inductie<br /> <br /> ===14 juni 2017===<br /> #leg uit hoe de opvattingen van Pythagoras en descartes hebben bijgedragen tot de huidige moderne natuurwetenschappen<br /> #Leg het Quine-Duhem probleem uit aan de hand van een casus (een experiment in Cern gaf aan dat deeltjes sneller bewogen als licht, dit zou niet kunnen volgens Einsteins hypothese, uiteindelijk leek de fout te liggen aan het verkeerd verbonden zijn een kabel). Hierbij moet je ook ad hoc hypothese uitleggen, want dit wijst op het feit dat ze de fout steken op de kabel om de hoofdhyptose af te schermen<br /> #Schijf van Pointcaré waarbij je dit moet reflecteren aan de Bayensiaanse confirmatietheorie; eigenlijk dus gewoon bayensiaanse confirmatietheorie uitleggen<br /> #Hume en het probleeem van symmetrie + oplossing; ook nog iets met regulatriteit en causale afhankelijkheid<br /> #leg uit: ceteris paribus wet + Ruse's 5 kenmerken van wetenschap<br /> #beantwoord één van de volgende vragen:<br /> #* -<br /> #* - <br /> #*Leg het biologisch soortenconcept uit en evalueer het kritisch<br /> #*Wat is het verschil tussen enerzijds elementen als ‘eenvoudige substanties’ en anderzijds'reele elementen’ of fundamentele substanties? Wat is de relatie met de periodieke tabel van Mendelejev?<br /> <br /> ===voorbeeldexamen 2017===<br /> #Leg uit: de mechanisering van het wereldbeeld ondersteunde de opgang van de experimentele methode.<br /> #Leg het Quine-Duhem probleem uit.<br /> #Wat is het nieuwe raadsel van Goodman en hoe verhoudt het zich tot Humes probleem van inductie?<br /> #Hoe lost Lewis’ theorie van causale afhankelijkheid het probleem van symmetrie op? Leg kort uit wat het probleem van symmetrie is en wat de theorie van Lewis inhoudt.<br /> #Beoordeel het volgende criterium: wetenschap is tentatief.<br /> #Beantwoord één van de volgende vragen:<br /> #*Wat zegt de eerste onvolledigheidsstelling van Godel?<br /> #*In welke zin zijn observaties van oceaantemperatuur theoriegeladen?<br /> #*Bespreek de relatie tussen de keuze voor een bepaald soortconcept en het aantal soorten lemuren op Madagascar.<br /> #*Wat werd gezien als een belangrijke graadmeter van het succes van Mendelejev? Plaats hierbij kanttekeningen</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Dynamische_Biochemie&diff=1251 2018-06-22T14:42:37Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===22 juni 2018 namiddag===<br /> #Geef het enzymmechanisme van serine proteasen. (ook reactiemechanisme tekenen)<br /> #Geef de metabolisatie van glucose en vetzuren in de lever. Verduidelijk met een figuur/schema.<br /> #Geef het C1 metabolisme en de link met aminozuren en nucleotiden. Verduidelijk met een figuur/schema<br /> #Begrippen:<br /> ##tripeptide WIS bij pH6<br /> ##carnitine shuttle<br /> ##2,3bisfosfaatglyceraat<br /> ##Grafiek van ramachandran plot werd gegeven.<br /> <br /> ===22 juni 2018 voormiddag===<br /> #Glycogeen metabolisme (synthese, afbraak, regulatie en fysiologische context)<br /> #Op welke manieren kunnen eiwitten met het membraan kunnen verbonden zijn? (verduidelijk met figuur/schema)<br /> #Geef het C1 metabolisme en de link met aminozuren en nucleotiden (verduidelijk met figuur/schema)<br /> #Begrippen<br /> ##tripeptide DHS <br /> ##alaninetransaminase<br /> ##anapleurotische reactie<br /> ##grafiek van hemoglobine<br /> <br /> ===1 september 2017 namiddag===<br /> #Bespreek met een duidelijke figuur hoe N het lichaam verlaat (krebs bicycle)<br /> #Op welke manieren kunnen eiwitten met het membraan connecteren?<br /> #Glycogeen fosforylase: welke reactie katalyseert het? Locatie? Fysiologische functie? regulatie?<br /> #Begrippen<br /> ##tripeptide RIP<br /> ##kinesine<br /> ##alfa-oxidatie<br /> ##grafiek van ATP homeostasis.<br /> <br /> ===28 juni 2017 voormiddag=== <br /> #Bespreek de motorproteïnen<br /> #Geef C1 metabolisme en link met nucleotiden synthese<br /> #Geef een schema van de opname, vertering, omzetting van lipiden in het lichaam<br /> #Begrippen<br /> ##tripeptide<br /> ##grafiek van ATP homeostasis<br /> ##acetyl-CoA carboxylase<br /> ##?<br /> <br /> ===27 juni 2017 voormiddag===<br /> #mondeling: geef de stabiliserende krachten van de vouwing en de structuur van eiwitten. Licht dit thermodynamisch toe.<br /> #Bespreek met een overzichtelijke figuur de pentosefosfaatweg en geef die zijn functies. (We moesten niet de volledige pentosefosfaatweg geven, enkel de belangrijkste stappen)<br /> #Bespreek met een figuur wat het verband is tussen eens suikerrijk dieet en zwaarlijvigheid.<br /> #4 begrippen:<br /> ##Tripeptide CRF bij pH 6<br /> ## carnitineshuttle<br /> ##de structuur van carbamoyl fosfaat<br /> ## serine protease<br /> <br /> ===23 juni 2017 namiddag===<br /> #mondeling: manieren waarop eiwitten met het membraan kunnen verbonden zijn.<br /> #cholesterol synthese + regulatie<br /> #C1 metabolisme bij nucleotiden<br /> #4 begrippen<br /> ##tripeptide KYV bij pH8<br /> ##actine<br /> ##citraat-pyruvaat-malaat shuttle<br /> ##structuur van creatinefosfaat<br /> <br /> ===23 juni 2017===<br /> #Glycogeen fosforylase: werking, lokalisatie, regulatie, fysiologische omstandigheden<br /> #Experimenteel type inhibitor bepalen + niet-competitieve inhibitor mathematisch uitwerken.<br /> #Omzetting glucose tot aminozuren: voorbeelden en fysiologische omstandigheden<br /> #4 begrippen<br /> ##MGD bij pH 6<br /> ## HMG-CoA<br /> ## ATP-homeostase<br /> ##Afbeelding ribonucleotide reductase<br /> ===17 juni 2017===<br /> #Allosterie en cooperativiteit hemoglobine (Bijvraag: grafiek allosterie zuurstof+Hb, hoe bindt Hb met zuurstof, haem-ring, Hill-coëfficiënt (+grafiek)) (mondeling)<br /> #Afbraak vertakt vetzuur adhv fytaanzuur (molecule gegeven) (schriftelijk)<br /> #N-Flow afbraak aminozuren, wat met koolstofskelet? (schriftelijk)<br /> #4 termen (mondeling)<br /> ##Tripeptide FYD (bij pH = 7)<br /> ##ribunocleotidereductase<br /> ##katalytische efficiëntie<br /> ##Afbeelding Ramachandran plot<br /> ===28 augustus 2015===<br /> #Bespreek allosterie en cooperativiteit aan de hand van Hemoglobine.<br /> #Bespreek de regulatie van de afbraak en synthese van glycogeen<br /> #Hoe worden aminozuren omgezet in glucose en in welke fysiologische omstandigheden kan dit gebeuren.<br /> #kleine vraagjes:<br /> ##DIK<br /> ##algemene zuurbase catalase<br /> ##AcetylCoenzymeA carbocylase (ACC)<br /> ===23 juni 2015===<br /> #bespreek schematisch de synthese en het export van lipiden in de lever.<br /> #wat is 1c metabolisme en welke rol speelt het in de nucleotide synthese.<br /> #Een vraagstuk waarin je formules over MM kinetiek moet toepassen (niet zo moeilijk. )<br /> #bespreek:<br /> ##willekeurig tripeptide<br /> ##pepck<br /> ##foto met membraamverankerde proteines<br /> ##transaminatie<br /> ===19 juni 2015===<br /> #Bespreek de glucose homeostase in het menselijk lichaam.<br /> #Bespreek schematisch de N-flow bij afbraak van aminozuren, vertel ook wat er gebeurd met het koolstofgedeelte.<br /> #Aspirine is een inhibitor voor het cyclo-oxygenase. Hoe kan je experimenteel te werk gaan om na te gaan of aspirine (I) op dezelfde plaats op het enzyume (E) bindt als het natuurlijke substraat arachidonzuur (S) dan wel op een plaats ver weg van de active site. Ondersteun je redenering met een vergelijking.<br /> #bespreek:<br /> ##tripeptide TAK bij pH 7 (K is dus ook geprotoneerd)<br /> ##Serine protease<br /> ##Glycerolfosfaat-shuttle<br /> ===12 Juni 2015===<br /> #Bespreek de enzymatische regulatie van glycogeenfosforylase en geef de fysiologische context (mondeling).<br /> #Geef schematisch de N-flux die voorkomt bij de afbraak van aminozuren. Wat gebeurt er met de koolstof? (schriftelijk)<br /> #Geef schematisch het metabolisme van de hersenen in goed gevoede staat en bij vasten. Welke rol spelen de lever en het vetweefsel? (schriftelijk)<br /> #Verklaar:<br /> ##ATP synthase<br /> ##Aminozurensequentie DIP bij pH 7<br /> ##Hill Coëfficiënt<br /> ===1 september 2014===<br /> #Glycogeen fosfatase: enzymatische regulering en metabolische condities<br /> #Wat zijn Ketone aminozuren en wanneer zijn ze van belang<br /> #Metabolisme lever en spieren bij rust en langdurige (aerobe)inspanning. Wat is de functie van de lever?<br /> #Bespreek:<br /> ##tripeptide: KAT<br /> ##Bohr effect<br /> ##Malonyl-Coa<br /> ##nucleotide dehydrogenase afbeelding<br /> ===24 Juni 2014===<br /> #Het kan je experimenteel de kinetische factoren van inhibitors bepalen?<br /> #Geef het C1 metabolisme van nucleotiden<br /> #Vergelijk het metabolisme van de lever en de spier. Zowel in rust als bij langdurige (maar aerobe) inspanning<br /> #verklaar de volgende termen:<br /> ##ATP synthase<br /> ##aminozuursequentie RAT<br /> ##het enzyme glycogeen fosforylase<br /> ##Bohr effect<br /> ===19 augustus 2013===<br /> #Bespreek de concepten allosterie en coöperativiteit a.h.v hemoglobine en myoglobine<br /> #Geef schematisch de stikstofflow bij afbraak aminozuren + wat gebeurt er met het koolstofgedeelte<br /> ##een lipideanker<br /> ##Glycogeenfosforylase<br /> ##Malaat-aspartaat shuttle<br /> ##Ramachandran plot<br /> ===21 juni 2013===<br /> #Bespreek de regulatie van glycogeen fosforylase. Geef telkens de fysiologische context.<br /> #Bespreek de omzetting van aminozuren in glucose. Geef de fysiologische context (bij de mens).<br /> #Geef uitleg:<br /> ##Hill-coëfficiënt<br /> ##Dyneine<br /> ##Afbeelding van structuur van S-adenosyl homocysteine<br /> ##Carnithine-shuttle<br /> ===25 juni 2012===<br /> #Bespreek het belang van motorproteïnen bij de spiercontractie.<br /> #Bespreek de rol van de lever in het triacylglyceridemetabolisme.<br /> #Geef uitleg:<br /> ##Hill-coëfficiënt<br /> ##Glutamine synthetase<br /> ##Sfingolipide<br /> ===25 juni 2011===<br /> #Bespreek hoe je de Km van een enzymatische reactie in theorie en in de praktijk bepaalt.<br /> #Leg uit hoe de concentratie van cholesterol in het cytosol wordt gereguleerd.<br /> #Bespreek de volgende begrippen:<br /> ##Tekening van Ramachandronplot<br /> ##Structuur van PEP<br /> ##Propionyl-CoA<br /> ##Glycogeen phosphorylase<br /> ===27 augustus 2010===<br /> #Bespreek van triacylglycerolen de vertering, opname, transport en metabolisme in het menselijk lichaam.<br /> #Bespreek volgende begrippen:<br /> ##glucose-alaninecyclus<br /> ##structuur<br /> ##glycogeenfosforylase<br /> ##Stiksoffixatie<br /> ===18 juni 2010 (NM Chemie minor B&amp;amp;B)===<br /> #Bespreek de relatie tussen het suiker- en vetzuurmetabolisme.<br /> #Bespreek volgende begrippen:<br /> ##Carbamoylfosfaat synthase<br /> ##Structuur van sfingomyeline was gegeven.<br /> ##Ornithine<br /> ##HDL<br /> ##Stiksoffixatie<br /> ===18 juni 2010 (VM)===<br /> #Bespreek de reciproke regulatie van de gluconeogenese en glycolyse.<br /> #Bespreek volgende begrippen:<br /> ##Acetyl-Coa-carboxylase<br /> ##Structuur van methionine is gegeven<br /> ##Fosfatidinezuur<br /> ##Alpha-oxidatie<br /> ##Energielading<br /> ===23 juni 2009===<br /> #Glycogeenmetabolisme (synthese, afbraak en regulering)<br /> #Bespreek de lipidebiosynthese in de lever<br /> #Leg volgende begrippen uit:<br /> ##Ornithine-transcarbomylase<br /> ##Ceramide<br /> ##carnithine-shuttle<br /> ===19 juni 2009===<br /> #Bespreek de homeostatische regulering van cholesterol in de levercel.<br /> #Vergelijk aan de hand van een figuur of tekening de energiestatus van een levercel na een maaltijd en na langdurig vasten. Wat is de rol van de lever?<br /> #Leg de volgende dingen uit:<br /> ##Pyruvaatcarboxylase<br /> ##Malonyl-CoA<br /> ##Ketonlichamen<br /> ===15 juni 2009===<br /> #Synthese palmitinezuur geven en de regulering ervan.<br /> #De ureumcyclus aanvullen (cofactoren, enzymen,...)<br /> #Verklaar de volgende 4 termen:<br /> ##Propionyl CoA<br /> ##Vitamine B<br /> ## ?<br /> ##?<br /> ===27 juni 2008===<br /> #Gluconeogenese en glycolyse met elkaar vergelijken qua regulatie etc.<br /> #VLDL metabolisme bespreken.<br /> #Korte vraagjes:<br /> ##Fosfatidine zuur<br /> ##Glutamaatdehydrogenase<br /> ##Nonsens repressie<br /> ##tructuur van propionyl-S-CoA<br /> ===26 juni 2008===<br /> #Palmitinezuur: synthese + regulatie (relatie vetzuur/suikermetabolisme).<br /> #Ureumcyclus/N-flow in de cel: zowat helft gegeven, hoop gaten in te vullen (producten, enzymes, structuren, cofactoren...).<br /> #Korte vraagjes:<br /> ##Coricyclus<br /> ##Chilomicronen<br /> ##Sphingomyeline<br /> ##Amino-acyl-tRNAsynthase</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Chemie_Van_Natuurproducten&diff=1159 2018-06-15T09:23:28Z

<p>Cynthia.R: /* 15 juni 2018 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===15 juni 2018===<br /> #Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units')<br /> #Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)<br /> #Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+.<br /> <br /> ===11 juni 2018 voormiddag===<br /> #Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)<br /> #Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring<br /> #Bespreek antioxiderende werking van vitamine C<br /> <br /> ===21 juni 2017 namiddag===<br /> #hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme<br /> #reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --&gt; ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)<br /> #bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen<br /> <br /> ===21 juni 2017 voormiddag===<br /> #bespreek synthese humuleen<br /> #bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2<br /> #oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring<br /> <br /> ===20 juni 2017 namiddag===<br /> # Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat<br /> # een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)<br /> # geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)<br /> <br /> ===20 juni 2017 voormiddag===<br /> # oefening van polyketiden<br /> # gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat<br /> # oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).<br /> <br /> ===16 juni 2017===<br /> # Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat<br /> # Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)<br /> # Antioxidante werking van vitamine C<br /> <br /> ===13 juni 2017===<br /> # Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)<br /> # Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring. <br /> # Stetteroefening.<br /> <br /> ===12 juni 2017===<br /> # een oefening &quot;met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie&quot; da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter<br /> # tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie<br /> # theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit<br /> <br /> ===12 juni 2015===<br /> #leg de werking van vitamine C uit als antioxidans<br /> #Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat<br /> #Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.<br /> <br /> ===20 agustus 2013===<br /> #Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme<br /> #Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+<br /> #Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken<br /> <br /> ===19 juni 2013===<br /> #Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit<br /> #Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule<br /> #Bespreek de synthese van vitamine C<br /> <br /> ===17 juni 2013===<br /> #In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)<br /> #Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)<br /> #Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C<br /> <br /> ===14 juni 2013===<br /> #Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert<br /> #2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen<br /> #Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.<br /> <br /> ===15 juni 2012 (namiddag)===<br /> #Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.<br /> #Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.<br /> #Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.<br /> <br /> ===15 juni 2012 (voormiddag)===<br /> #Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat<br /> #Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?<br /> #Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA<br /> <br /> ===20 juni 2011 (namiddag)===<br /> #Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)<br /> #Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.<br /> #Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetrisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion<br /> <br /> ===14 juni 2010===<br /> #Omzetting van histidine naar histidine zonder CO2 (structuren gegeven)<br /> #Welk biomimetrisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)<br /> #Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit<br /> <br /> ===11 juni 2010===<br /> #Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat<br /> #Vetzuursynthese<br /> #Radicale ortho-para-koppeling<br /> <br /> ===September 2009===<br /> #DOPA en DOPAMINE<br /> #Synthese inositolen<br /> #Stereospecificiteit LADH<br /> <br /> ===12 juni 2009===<br /> #Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?<br /> #Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie<br /> #Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan<br /> <br /> ===4 september 2008===<br /> #De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.<br /> #De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep<br /> <br /> ===17 juni 2008===<br /> #Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt<br /> #Fructose: fisher =&gt; hawordth omzetting<br /> #Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD<br /> <br /> ===19 juni 2007===<br /> #Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)<br /> #Fructose fisher gegeven, geef haworth<br /> #R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD =&gt; FADH2) leg uit + geef structuur van FAD<br /> <br /> ===12 juni 2006===<br /> #Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties<br /> #Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?<br /> #Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg<br /> <br /> ===12 juni 2006===<br /> #Decarboxylatie van een aminozuur<br /> #R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD =&gt; FADH2): leg uit + geef structuur van FAD<br /> #Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit</div>

Cynthia.R https://wiki.chemika.be/index.php?title=Chemie_Van_Natuurproducten&diff=1158 2018-06-15T09:23:08Z

<p>Cynthia.R: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===15 juni 2018===<br /> #Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units)<br /> #Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)<br /> #Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+. <br /> <br /> ===11 juni 2018 voormiddag===<br /> #Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)<br /> #Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring<br /> #Bespreek antioxiderende werking van vitamine C<br /> <br /> ===21 juni 2017 namiddag===<br /> #hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme<br /> #reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --&gt; ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)<br /> #bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen<br /> <br /> ===21 juni 2017 voormiddag===<br /> #bespreek synthese humuleen<br /> #bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2<br /> #oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring<br /> <br /> ===20 juni 2017 namiddag===<br /> # Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat<br /> # een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)<br /> # geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)<br /> <br /> ===20 juni 2017 voormiddag===<br /> # oefening van polyketiden<br /> # gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat<br /> # oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).<br /> <br /> ===16 juni 2017===<br /> # Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat<br /> # Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)<br /> # Antioxidante werking van vitamine C<br /> <br /> ===13 juni 2017===<br /> # Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)<br /> # Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring. <br /> # Stetteroefening.<br /> <br /> ===12 juni 2017===<br /> # een oefening &quot;met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie&quot; da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter<br /> # tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie<br /> # theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit<br /> <br /> ===12 juni 2015===<br /> #leg de werking van vitamine C uit als antioxidans<br /> #Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat<br /> #Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.<br /> <br /> ===20 agustus 2013===<br /> #Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme<br /> #Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+<br /> #Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken<br /> <br /> ===19 juni 2013===<br /> #Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit<br /> #Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule<br /> #Bespreek de synthese van vitamine C<br /> <br /> ===17 juni 2013===<br /> #In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)<br /> #Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)<br /> #Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C<br /> <br /> ===14 juni 2013===<br /> #Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert<br /> #2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen<br /> #Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.<br /> <br /> ===15 juni 2012 (namiddag)===<br /> #Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.<br /> #Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.<br /> #Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.<br /> <br /> ===15 juni 2012 (voormiddag)===<br /> #Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat<br /> #Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?<br /> #Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA<br /> <br /> ===20 juni 2011 (namiddag)===<br /> #Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)<br /> #Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.<br /> #Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetrisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion<br /> <br /> ===14 juni 2010===<br /> #Omzetting van histidine naar histidine zonder CO2 (structuren gegeven)<br /> #Welk biomimetrisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)<br /> #Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit<br /> <br /> ===11 juni 2010===<br /> #Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat<br /> #Vetzuursynthese<br /> #Radicale ortho-para-koppeling<br /> <br /> ===September 2009===<br /> #DOPA en DOPAMINE<br /> #Synthese inositolen<br /> #Stereospecificiteit LADH<br /> <br /> ===12 juni 2009===<br /> #Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?<br /> #Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie<br /> #Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan<br /> <br /> ===4 september 2008===<br /> #De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.<br /> #De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep<br /> <br /> ===17 juni 2008===<br /> #Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt<br /> #Fructose: fisher =&gt; hawordth omzetting<br /> #Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD<br /> <br /> ===19 juni 2007===<br /> #Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)<br /> #Fructose fisher gegeven, geef haworth<br /> #R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD =&gt; FADH2) leg uit + geef structuur van FAD<br /> <br /> ===12 juni 2006===<br /> #Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties<br /> #Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?<br /> #Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg<br /> <br /> ===12 juni 2006===<br /> #Decarboxylatie van een aminozuur<br /> #R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD =&gt; FADH2): leg uit + geef structuur van FAD<br /> #Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit</div>

Cynthia.R