Chemika Examenwiki - Gebruikersbijdragen [nl]

Comparative Endocrinology

2022-01-18T14:52:52Z

DevlinVanAssche: /* Examenvragen */

[[Categorie: Mabb]]

== Vakinformatie ==
Comparative Endocrinology wordt gedoceerd door Veerle Darras, buiten één les over ''C. elegans'' die gegeven wordt door Liesbet Temmerman. 33% van de punten staan op practica, 67% op het mondeling examen. Op het examen krijg je een inhoudelijke vraag, een vraag waarin je een endocrinologisch probleem moet bespreken, en een paper over een nieuwe functie van een hormoon die je zelf moet mee brengen en bespreken.

Sinds 2017-2018 wordt het vak gedoceerd door Eve Seuntjens.

Sinds 2020-2021 wordt het gegeven door William Schafer, buiten één les die gegeven wordt door Jozef Vanden Broeck over hormonen in insecten.

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0G49AE.htm

== Examenvragen ==

===17 januari 2022===
choose 2 out of the 3 questions
#Explain the hormones involved in homeostasis of glucose and insulin in detail. (similarities and contrasts)
#Compare food sensing in nematodes and humans. give a detailed pathway of one of each...
#What is a steroid? explain a steroid hormone system in detail + recptor(s) and role(s) in physiology

===11 januari 2021===
choose 2 out of the 3 questions
#Explain the hormones involved in homeostasis of glucose and water in detail. (similarities and contrasts)
#What is a nuclear receptor? Explain one hormone system involved with this kind of receptor.
#Explain the functions of insuline and insuline-like-peptides in humans and nematodes. Why are nematodes interesting for research in humans?

===6 januari 2021===
choose 2 out of the 3 questions
#Compare and contrast the roles of the different hormones involved with calcium vs sodium/potassium homeostasis. Explain the intracellulair mechanism of some of those hormones.
#Explain Tgf beta in nematodes and humans and how helped the nematode to understand human biology.
#Explain pheromones. Discuss one example of pheromones in animals in detail, provide evidence for a pheromone system and the role(s) on animal behavior.

===23 januari 2020===
#Discuss the stress related hormones in mammals. Give an example seen in fish.
#A dog in the shelter has been chronically overfed and cannot stop urinating. What could the underlying cause of his symptoms be? Which hormonal axes are distrubed? Which test would you do confirm your thoughts? What hormones would you use to treat him?

===17 januari 2020===
#Discuss the working mechanism and functions of Thyroid hormones in mammals, then briefly compare with the function of MCT8 in chicken and DIO2 KO in zebrafish (papers seen in the course).
#Describe the phenotype in detail of a loss-of-function mutation in POMC genes. What treatment would you use? (A: agonist of hormones that can also bind to receptor)
#Paper

===23 januari 2019===
#Discuss the working mechanism and functions of Thyroid hormones in mammals, then briefly compare to the function of TH in amphibians
#You want to make a species specific pesticide that blocks female reproduction. Give 3 examples and explain how you would apply them.
#paper

===18 januari 2019===
#bespreek de hormonen die de Ca homeostasis reguleren.
#sommige vrouwen doen een liposuctie, wat is het gevolg op korte en lange termijn op vlak van hormonen en gewicht? Wat zijn mogelijke hormonale behandelingen als alternatief, geef de voor en nadelen van deze hormonen.
#Paper

=== 14 januari 2019 ===

#Bespreek de hormonen die de natrium/kalium en waterbalans regelen bij zoogdieren en vergelijk met reptielen.
#Paper
#Sommige vrouwen kunnen niet zwanger worden en sommige hebben herhaaldelijke miskramen. Wat zou de endocrinologische oorzaak kunnen zijn? Hoe onderzoek je dit en hoe kan je de vrouwen helpen?

===24 januari 2018===
#Hormonen die verantwoordelijk zijn voor de Kalium/natrium en waterbalans bij zoogdieren en vergelijk met amfibieën.
#Paper
#Mogelijke endocriene oorzaken van ondergewicht en mogelijke hormoontherapieën

===19 januari 2018===
#bespreek de hormonen die de Ca homeostasis reguleren.
#sommige vrouwen doen een liposuctie, wat is het gevolg op korte en lange termijn op vlak van hormonen en gewicht? Wat zijn mogelijke hormonale behandelingen als alternatief, geef de voor en nadelen van deze hormonen.
#Paper

=== 15 januari 2018 ===
# Bespreek de hormonen van de adrenale cortex en vergelijk met amfibieën
# Paper
# Indien je insecticide zou baseren op ecdysis, waar precies tijdens ecdysis zou je deze dan laten inwerken. En zijn deze dan soortspecifiek. Bespreek 3 soorten insecticiden mogelijk.

Het examen is in het engels!

=== 20 januari 2016 ===

Bespreek de hormonen die de natrium/kalium en waterbalans regelen bij zoogdieren en vergelijk met reptielen.

Sommige vrouwen kunnen niet zwanger worden en sommige hebben herhaaldelijke miskramen. Wat zou de endocrinologische oorzaak kunnen zijn? Hoe onderzoek je dit en hoe kan je de vrouwen helpen?

=== 18 januari 2016 ===

Bespreek de hormonen van de adrenale cortex en vergelijk met amfibieën

Indien je insecticide zou baseren op ecdysis, waar precies tijdens ecdysis zou je deze dan laten inwerken. En zijn deze dan soortspecifiek. Bespreek 3 soorten insecticiden mogelijk.

=== 11 januari 2016 ===

Bespreek de steroid hormonen die belangrijk zijn voor de vrouwelijke vruchtbaarheid bij zoogdieren. En vergelijk met de steroid hormonen bij insecten.

Welke hormonen zou je toedienen om de prestaties van een marathonloper te verbeteren. Wanneer dien je ze toe en hoe, zijn er bijwerkingen?

=== 11 januari 2016 ===

Discuss the working mechanism and functions of Thyroid hormones in mammals, then briefly compare to the function of TH in amphibians

You want to make a species specific pesticide that blocks female reproduction. Give 3 examples and explain how you would apply them.

=== 12 januari 2014 ===

Bespreek de hormonen van de adrenale cortex. En vergelijk met de amfibieën.

Indien je insectisiden zou baseren op ecdysis, waar precies tijdens ecdysis zou je deze dan laten inwerken. En zijn deze dan soortspecifiek. Bespreek 3 soorten insectisiden mogelijk. (ze wou hier vooral weten op welke manier je zou kunnen ingrijpen op de hormonen van ecdysis)

=== 18 januari 2013 ===

Bespreek de hormonen van de hypofyse bij zoogdieren. Zijn er vergelijkbare hormonen te vinden bij insecten?

Vele mensen in de Westerse wereld leiden aan obesitas, maar er zijn ook mensen die net niet aan het goede gewicht geraken (ondergewicht). Welke hormonen zijn hiermee betrokken en welke experimenten zou je moeten uitvoeren om je hypotheses te staven. (Enkel onderzoeksmethodes geven die bij mensen toepasbaar zijn, dus ELISA wordt al moeilijk)

=== 18 januari 2013 ===

Bespreek alle hormonen die te maken hebben met de ion-waterbalans. Hebben insecten hier ook hormonen voor?

Vele mensen in de Westerse wereld leiden aan obesitas, maar er zijn ook mensen die net niet aan het goede gewicht geraken (ondergewicht). Welke hormonen zijn hiermee betrokken en welke experimenten zou je moeten uitvoeren om je hypotheses te staven.

=== 16 januari 2012 ===

Bespreek de hormonen van de adrenale cortex. En vergelijk met de situatie bij amfibieën.

Door selectie zijn er verschillende strengen van kippen. Ze hebben een verschillende groei. Welke hormonen komen hier aan te pas? Hoe zou je het onderzoeken. (bio-assay, ELISA,...)

=== 17 januari 2011 ===

Leg de functie uit van de hormonen betrokken bij de Calcium homeostase.

Indien je insectisiden zou baseren op ecdysis, waar precies tijdens ecdysis zou je deze dan laten inwerken. En zijn deze dan soortspecifiek. Bespreek 3 soorten insectisiden mogelijk.

=== Andere vragen ===

- Geen neotenie in amfibieën? Hoe onderzoeken, hoe oplossen?

- Bespreek de pancreas.

- Geen normale groei in kip? Hoe onderzoeken, hoe oplossen?

- Bespreek de rol van glucocorticoïden in mammals en non mammalia vertebraten?

- Discuss the action mechanism and the functions of thyroid hormones in mammals. Compare briefly with thyroid hormone functions in amphibians.

- A rat was born and raised in the animal facility of a university and is suddenly released outside the building in a sand desert. What changes do you expect in the endocrine system and why?

- Bespreek de hormonen die betrokken zijn in het energie metabolisme van zoogdieren. Hebben insecten hormonen die hun energie metabolisme reguleren?

- Door selectie verschillende strengen van kippen. Groeien niet allemaal even goed. Waarom? Hoe onderzoek je waaraan dat ligt?Hoe los je het op?

- Welke rol speelt de pancreas in energie metabolisme? Hebben insecten hormonen voor energie metabolisme?

- Neotenie bij Urodela, mogelijke oorzaken? Hoe zou je dat onderzoeken?

- Geef een overzicht van alle hormonen die betrokken zijn bij de reproductie in vrouwelijke mammalia en bespreek hun functie (negeer geboorte en lactatie). Vergelijk kort met de situatie in Teleostei.

- Terwijl vele mensen lijden aan overgewicht hebben anderen problemen om hun gewicht te behouden. Bij deze laatste kan het probleem een endocriene basis hebben. Welke hormonen zouden volgens jou betrokken kunnen zijn in deze gevallen en bespreek hoe je je hypothese zou testen.

- Biosynthese van cortisol

- Werking van MSH: de epifyse

- Oestrale cyclus van het schaap

- GTP en G-proteïnen

- Gene knockout

- Hypothalamische controle van het groeihormoon

- Het ontstaan en evolutie van de bijnierschors

- Prolactine bij de vogels

Immunological Biotechnology

2020-01-17T13:46:05Z

DevlinVanAssche: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Vak van derde bachelor biochemie. Ook gevolgd door zij die willen van chemie en biologie. Het wordt gegeven door Prof. Liliane Schoofs en is een mondeling examen met schriftelijke voorbereiding. Ze leest je antwoord en stelt dan bijvragen.
Er wordt een volledige en verplichte practicum week gehouden, je mag zelf je groepje kiezen (3personen max). Van het practicum wordt ook een schriftelijk examen gehouden, waarbij je enkel vragen krijgt over de proefjes die jij hebt uitgevoerd.

==Examenvragen==
=== 17 januari 2020 ===
# Figuur: differentiatie van naive T-cell naar actieve T-cellen en memory T-cellen
# Figuur Gelelektroforese van Germaine DNA en B-cell DNA
# Figuur DJ recombinatie met RAG en Artemis
# True/false vragen (+ 2 multiple choice):

=== 13 januari 2020 ===
# Figuur van extravasation waarbij neutrofiel aankomt op plaats van infectie, slowing down door selectines en uiteindelijk full stop door integrins. Waarna deze in het geïnfecteerde weefsel binnendringt.
# Figuur waarbij je VDJ recombinatie moest uitleggen met elke stap. (vb bijvraag: Waarom heeft de light chain geen D segment)
# Figuur van MHC-restrictie (deze term moet je geven) + uitleggen
# True/false vragen (+ één multiple choice):
#* Eosinophils worden vooral tegen parasieten ingeschakeld
#* Progenitor Myeloids zijn voorgangers van T, B en NK cellen.
#* Lipopolysacchariden zijn proteïnen die worden gesecreteerd.
#* (Heel simpel) Nog iets over VDJ recombinatie waarbij je de zin moest aanvullen (je kon kiezen uit 4 termen), waarbij het ging over de DNA-segmenten, maar was heel makkelijk af te leiden welke term de juiste is zelfs al studeer je geen Biochemie.

=== 28 januari 2019 ===
voor en namiddag hadden dezelfde vragen

# Figuur van B cell die geactiveerd werd door Helper T cell en door een bacterie met Ab. Dit ging verder naar de 3 technieken die Ab gebruiken in het humoral immunity (neutralisation, opsonization en complement activation)
# Figuur waarbij je moest uitleggen hoe MHC class 1 molecules worden geladen met Ag-peptiden in het ER.
# Figuur van een MHC class 1 molcule die een peptide gebonden had, je zag dus de bèta-sheets en het peptide met zijn aminozuren.
# Figuur van B cellen die in het been merg matureren tot plasma en memory cellen. Je moest zeggen dat er VDJ rearrangement komt, selectie van de B cellen o.b.v. self Ag, dit moest ook allemaal geplaatst worden in het lichaam.

===18/01/2019 NM===
# Figuur van het maturatie process van T cellen in de thymus. Vraag: In welk orgaan speelt dit zich af en leg uit hoe dit gebeurt.
# Figuur experiment van gel waarop germline DNA was geladen van C en V regio en van B cell DNA van C en V regio. Vraag: wat gebeurt er in dit experiment en wat kan je er uit afleiden (antwoord enkel op voorkant onder foto)
# Figuur van verloop recombinatie DNA tussen D en J regio. Vraag: een aantal koppen waren weggelaten en moesten worden aangevuld en elke stap in 1 zin uitleggen
# MC en juist fout vragen:
#* Wat gebeurt er niet tijdens inflammation? (mogelijke anwtoorden: expressie cytokines, expressie chemokines, innate en adaptive immunity activeren, vernouwen van bloedvaten)
#* Gebruiken NK cellen MHC class I? (mogelijke antwoorden: true or false)
#* Wat gebeurde er niet in de evolutie van adaptieve immuniteit? (een aantal antwoorden die ik niet meer weet)
#* Zorgen adaptieve immuniteitscellen voor specificiteit? (mogelijke antwoorden: true or false)
#* Hematopoietic cellen kunnen nog in elke cel van het lichaam veranderen (mogelijke antwoorden: antwoorden true or false)

===17/01/2019 NM===
# Figuur, opname bacterie, alles uitleggen, MF, dendritische cel, lymfe knopen, maturatie, ... Heel het immuunsysteem
# Figuur, muizen SCID en Nude (alles staat op de afbeelding)
# Figuur, Recombinatie T-cel (zelf aanvullen)
# MP choice/ juist fout, 3 vraagjes eerste was over iemand die een ziekte had gekregen door het eten van fruit dat ze ingeblikt had. En dan moest ik zeggen welk mechanisme er het meest op ging reageren... Het ging om toxines dus had neutralisation gepakt, dat was juist. 2e snapte ik niets van, ging over bindingen tussen B- en T- cellen, het was complete nonsens, en dus fout. 3e was over recombinatie

===14 januari 2019 NM===
# figuur uitleggen: virale infectie en laden van virale peptiden op MHC moleculen + wat daarna?
# figuur uitleggen: experiment waarin beenmerg wordt getransfereerd naar bestraalde muizen met verschillend MHC genotype
# figuur uitleggen: 3 manieren waarop Igs met rearranged V-region gewijzigd kunnen worden
# 5 (gemakkelijke) korte vraagjes: 4 meerkeuze en 1 juist/fout

===23 augustus 2018 VM===
# costimulus op immuuncellen, welke receptor, waarom?
# class switching uitleggen: wat, wanneer,...
# NK cellen, waneer, hoe mechanisme, hoe virus MHC-I tegehoudt

===29 januari 2018 VM===
# Belang MHCI bij een niet geïnfecteerde cel
# Activatie van naïve T-cel
# geeft een verandering in de genen van een BCR uniek voor een b-cel
===18 januari 2018 VM===
# Vergelijk folliculaire dendritische cel met een gewone dendritische cel.
# Leg linked recognition uit en geef een medische toepassing.
# Leg de werking van interferon gamma uit bij T cel differentiatie.

===16 januari 2018 VM===
#Belang van Th1 cellen bij immuunrespons tegen intracellulaire bacterien
#Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.
#Bespreek en verklaar de invloed van meerdere immunizaties bij hetzelfde antigen bij humorale respons

=== 15 januari 2018 ===
#costimulus op immuuncellen, welke receptor, waarom?
#class switching uitleggen: wat, wanneer,...
#NK cellen, waneer, hoe mechanisme, hoe virus MHC-I tegehoudt

=== 25 augustus 2017 VM ===
# Bespreek de immuunrespons tegen extracellulaire parasieten.
# Bespreek activatie van naïve B-cellen
# Bespreek 3 fundamenteel verschillende mechanismen die auto-immuniteit voorkomen op verschillende plaatsen in het lichaam.

=== 31 januari 2017 ===
#immuunrespons tegen extracellulaire parasieten
#activatie van naïve B-cellen
#3 verdedigingsmechanisme om autoimmuniteit tegen te gaan

=== 30 januari 2017 VM ===
#Belang van Th1 cellen bij immuunrespons tegen intracellulaire bacterien
#Affinieteitmaturatie van B cellen
#Bespreek de cellen die belangrijk zijn bij negatieve selectie van T cellen

=== 19 januari 2017 VM===
#Immuunrespons endotheel
#Thymus onafhankelijke B cel activatie
#Centrale en perifere tolerantie T cellen a.d.h.v. voorbeeld

=== 17 januari 2017 NM===
#belang van MHC1 complex en gezonde lichaamscellen
#Iets van bcr en gentransformatie
#Activatie van Tcellen

=== 17 januari 2017 VM===
#Bespreek de rol van IFN-alfa en beta bij een virale infectie
#Bespreek centrale en perifere tolerantie bij B CELLEN
#Bespreek waarom CD8 T cellen meer stimulatie nodig hebben ivm CD4 T cellen

=== 16 januari 2017 NM ===
#Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten (wormen dus)
#Bespreek activatie van naïeve B-cellen
#Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.

=== 25 januari 2016 VM===
# Geef de verschillen tussen folliculaire en normale dendritische cellen
# Wat is linked recognition en geef een medische toepassing
# Welke rol speelt IFN-Î³ bij de T-cel differentiatie?

=== 12 januari 2016 VM ===
#Bespreek de immuunrespons op extracellulaire parasieten
#Hoe worden naïve B-cellen geactiveerd?
#Bespreek 3 fundamenteel verschillende mechanismen die autoimmuniteit voorkomen op verschillende plaatsen in het lichaam.

=== 11 januari 2016 NM ===
#Bespreek het belang en mechanisme van activatie van het vasculair endotheel in de immuunrespons
# Hoe kunnen B cellen geactiveerd worden als er geen T cellen aanwezig zijn
# Centrale en perifere tolerantie van T cellen

===13 Jan 2015 (VM)===
#Functie van interferon alfa en beta in virusinfectie
#Bespreek aan de hand van een voorbeeld de centrale en perifere tolerantie van B cellen
#Verklaar waarom CD8 meer costimulus nodig heeft dan CD4

===29 Jan 2014 (VM)===
#Bespreek de vasculaire immunorespons van endotheelcellen
#Bespreek thymus independent activation of B-cells
#Bespreek aan de hand van een voorbeeld de centrale en perifere tolerantie van B cellen (ze zegt voorbeeld, maar als je gewoon uitlegt hoe de tolerantie tot stand komt is het goed)

===Jan 2014===
#Functie van interferon alfa en beta in virusinfectie
#Leg aan de hand van 1 voorbeeld de centrale en periferele tolerant van B cellen uit
#Verklaar wrm CD8 meer costimulus nodig heeft dan CD4
===28 Jan 2014 (VM)===
#Bespreek de expressie van een MHCI op een gezonde lichaamscel
#Bespreek een verandering in de genen van de BCR die de B-cellen uniek maakt
#Bespreek T cel priming.

===16 jan 2013 NM===
(cfr 27 aug 2012)
#Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten
#Bespreek activatie van naÃ¯eve B-cellen
#Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.
===27 aug 2012===
#Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten
#Bespreek activatie van naÃ¯eve B-cellen
#Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.
=== 27 jan 2012 NM===
# Sommige micro-organismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het micro-organisme?
# Bewijs dat thymus-stromacellen essentieel zijn voor de ontwikkeling van T-cellen
# Bespreek hoe Th1-cellen de reactie tegen intracellulaire pathogenen via de macrofagen coÃ¶rdineren.
=== 27 jan 2012 VM===
# Macrofagen zijn zowel in het aangeboren als het adaptief immuunsysteem belangrijk. Verklaar
# Bespreek de primaire en secundaire antistof reactie
# Vergelijk NK en CTL cel. Belangrijkste gelijkenissen en verschillen
=== 22 aug 2011 NM ===
# Bespreek de rol van macrofagen in zowel de aangeboren en als de adaptieve immuunrespons.
# Vergelijk de primaire en de secundaire immuunrespons.
# Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.

=== 28 jan 2011 VM ===
# Sommige microorganismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het microorganisme?
# Bespreek het hapten-carrier effect en geef een medische toepassing.
# Hoe kan een T cel aangezet worden tot clonale expansie?
=== 29 jan 2010 NM ===
# Bespreek de rol van macrofagen in zowel de aangeboren en als de adaptieve immuunrespons.
# Vergelijk de primaire en de secundaire immuunrespons.
# Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.
=== 22 jan 2010 NM ===
# Sommige microorganismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het microorganisme?
# Bespreek het hapten-carrier effect en geef een medische toepassing.
# Hoe kan een T cel aangezet worden tot clonale expansie?
=== 12 jan 2009 ===
# Sommige organismen kunnen Fc fragmenten afbreken. waarom zou dit een hogere graad van overlevering opleveren?
# Bewijs dat thymus stroma cellen essentieel zijn voor de ontwikkeling van T-cellen
# Bespreek de interactie van Th1 cellen met macrofagen.
=== 12 jan 2009 ===
# Bespreek de immunologische respons tegen een bacteriele infectie
# Bespreek activatie van naive B-cel
# 3 manieren om auto-immuniteit te omzeilen
=== 29 jan 2008 ===
# Sommige pathogenen bevatten enzymen die die Fc fragmenten kunnen degraderen. Hoe kan dit een grotere overlevingskans opleveren voor dit pathogeen
# Leg het hapteen-carrier effect uit en geef een toepassing
# Hoe wordt een naÃ¯eve T-cel geactiveerd.

=== 28 jan 2008 ===
# Activatie naive B cel
# Immuunrespons tegen bacteriÃ«le infectie
# 3 vbn. hoe er gezorgd wordt dat er geen autoimmuniteit is
=== 24 jan 2008 ===
# Macrofagen hebben een rol in zowel innate als adaptive immunity, leg uit.
# Leg de primaire en de secundaire antistofrespons uit.
# leg gelijkenissen en verschillen uit van NK en CTL cells
=== 14 jan 2008 ===
# Bespreek de immuunrespons tegen bacteriÃ«le infectie (neen niet tegen intracellulaire, gewoon baceteriÃ«n int algemeen)
# Bespreek activatie van naÃ¯eve B cel (neen niet T cel, goed lezen en vooral niet beginnen knallen van T cellen omdagu de voorbeeldvraag nog herinnert)
# Bespreek de drie mechanismen die het lichaam beschermt tegen autoimmuniteit (of voorkomt of gebruikt ofzo)

Practica:
# Teken en leg uit. Kan je ook doen me een antigen me maar 1 epitoop
# Wat leer je erdoor van de pI? Teken.
# Wat is passieve en actieve hemagluttinatie + tekenen. Bewijs dat de interactie reversibel is
# Leg het precipitatiemechanisme uit. Wat doet een PD10 kolom, naam + uitleg
# Welke PAP concentratie verkies je (paar vb getalletjes, je kiest natuurlijk de beste). Verschil passieve en competitieve ELISA

=== 24 jan 2007 ===
# bespreek de naieve Tcel en clonale expansie
# Fc fragment: sommige organismen kunnen het afbreken. Hoe levert dit een hogere overleving op voor het organisme?
# wat is het hapteen carrier-effect en geef toepasssingen.
=== 23 jan 2007 ===
# bespreek de rol van macrofagen in aangeboren en adaptief immuunrespons
# vergelijk: Primair vs Secundair immuunrespons
# bespreek de gelijkenissen en verschillen NK - CTL.

Moleculaire Architectuur

2020-01-13T12:24:15Z

DevlinVanAssche: /* 13 januari 2020 */

[[Categorie:Bachelor Chemie]]
[[Categorie:Bachelor Biochemie]]

==Vakinformatie==

Verplicht vak voor chemie.

Dit vak wordt gegeven door professor Van Meervelt, hij is de aangenaamheid zelve op het examen!
Zijn bijvragen zijn wel aan de moeilijke kant. Maar hij zal je altijd helpen de bijvragen beetje bij beetje op te lossen. Het examen duurt 4u.

Kristallografie is het vak Moleculaire Architectuur, maar dan zonder NMR (het laatste hoofdstuk). Dit is eigenlijk de voorloper van moleculaire architectuur. Het wordt ook nu nog aan de geologen gegeven.

==Examenvragen==
===13 januari 2020===
#Theorie: Hoe wordt het principe van Fourier synthese toegepast in de kristalstructuurbepaling?
#Theorie: NOE, NOESY en COSY
#Puntgroep Pmcb met gebruikelijke bijvragen
#Oefening: Puntgroepen van vier structuren
#Oefening: CdI2: Bravaisrooster bepalen, voor structuurfactor fase bepalen en afbuigingshoek als CuK(alfa) straling gebruikt wordt, geldt wet van Friedel?
#Begrippen: ATR-IR + ESI uitleggen

===26 augustus 2019===
#Theorie: Hoe wordt het principe van Fourier synthese toegepast in de kristalstructuurbepaling?
#NMR-vraag: 3 verschillende H-NMR spectra van isomeren met brutoformule C6H8N2O2. Teken ook de opsplitsingspatronen.
#Puntgroep Pcnb met gebruikelijke bijvragen
#Oefening: Vlakgroep vlak 110 NaCl. Geef alle symmetrie-elementen.
#Oefening: Bepaal de fase en intensiteit van PoCl2 in de reflectie (110). Gegeven zijn de atoomposities en de karakteristieke straling.
#Begrippen: ESI + CuKalfa uitleggen

===28 januari 2019===
#Hoe kan je een model verbeteren na het oplossen van het faseprobleem?
#H-NMR van C5H8O2 bijvragen over IR.
#Pmcn met bijvragen.
#puntgroep van 4 isomeren van dioxine.
#AgI posities van de atomen gegeven (breuken) a=6.50 A. tabel met sin(theta)/lambda gegeven voor fAg en fI. Bravais rooster geven, fase, hoek en intensiteit berekenen.
#ATR-IR en ESI.
===17 januari 2019===
#Geef de afleiding van de structuurfactor. Is deze experimenteel te bepalen?
#H1-NMR van C10H13NO2 (Bijvragen over IR: wat als we van dit molecule een IR spectrum zouden opnemen? Waar zien we dan pieken? Welke zijn sterk? Welke niet?)
#Ruimtegroep Pnam met bijgvragen
#Puntgroep bepalen van de isomeren van tetrachloorkubaan (molecuulmodelletje gegeven)
#Rood loodoxide PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel
a=3,975 A en c=5,023 Atomen liggen op de posities:
Pb(1): 0 ½ 0.2385
Pb(2): ½ 0 -0.2385
O(1): 0 0 0
O(2): ½ ½ 0
Wat is het Bravaisrooster? Welke symmetrie-elementen gaan door O2? Construeer de pattersonfunctie. Waar vinden we de sterkste pieken? Toon aan dat de intenstiteit van reflectie 200 en 020 gelijk is.
#Mclafferty omlegging en kubische en hexagonale dichtste bolstapeling.
===14 januari 2019===
# Hoe kan men met de Pattersonfunctie het faseprobleem oplossen? (mondeling)
# NOE en NOESY, COSY (mondeling)
# Ruimtegroep Pman met bijvragen
# Puntgroepen van 4 verschillende aromaten
# CdI2: Bravaisrooster bepalen, voor structuurfactor fase bepalen en afbuigingshoek als CuK(alfa) straling gebruikt wordt, maxima van de Pattersonfunctie geven
# MALDI-TOF uitleggen en golfgetallen vergelijken bij IR spectroscopie

=== 4 september 2018===
# Geef de contructie van Ewald
# H-NMR van C10H12O3
# Ruimtegroep Pcnb
# Geef de puntgroep van 4 isomeren van tetrachloornaftaleen die aanleiding geven tot een andere puntgroep.
# PbO kristaliseert uit in eenheidscel met gegeven dimensies en atoomposities. Gevraagd: Construeer de pattersonfunctie, waar zijn de sterkste pieken? Tot welk Bravais rooster behoort dit? Wat is de afbuighoek van het 110 vlak met CuKalfa?
# Begrippen: Kubisch en hexagonale dichtste bolstapeling + McLafferty omlegging

===27 augustus 2018===
# Hoe kan men het faseprobleem oplossen met behulp van de Pattersonfunctie? (dus ook uitleggen wat faseprobleem is, formule van pattersonfunctie geven,...) (mondeling)
# Gegeven drie H-NMR spectra, alle drie C6H6N2O2, bepaal structuren, en verklaar de verschillende spectra (mondeling)
# Ruimtegroep Pcmn met alle gebruikelijke vragen
# Bepaal tot welke puntgroepen de isomeren van trichloorbenzeen behoren, teken alle symmetrie-elementen
# Oefening met CdI2, bepaal fasehoek van de reflectie op (110) en afbuighoek theta, tot welk bravais rooster behoort dit? Waar bevinden zich de maxima bij de Pattersonfunctie?
# Begrippen: MALDI-TOF, Laue groep

===15 juni 2018===
# Leid de structuurfactor af. Kan deze ook experimenteel bepaald worden? (mondeling)
# Gegeven een H-NMR spectrum, bepaal de structuur van de chemische stof die dit spectrum geeft. (mondeling)
# Ruimtegroep Pmca, gebruikelijke bijvragen.
# Oefening met intensiteit enzo berekenen. Structuur was op eerste zicht niet centrosymmetrisch, maar was het wel met andere oorsprong.
# Wat is de vlakgroep van het (110) vlak van NaCl? Teken en geef alle symmetrie-elementen.
# Begrippen: MALDI-TOF, kubisch dichtste bolstapeling

===11 juni 2018===
# Waarom Pattersonfunctie belangrijk bij het faseprobleem?
# NMR: C10H1202
# Ruimtegroep Pbab met alle bijhorende vragen
# Puntgroepen geven van 4 verschillende aromatische verbindingen + symmetrie elementen aanduiden
# Oefening waarbij celparameters en 2 atomen gegeven zijn. Intensiteit en afbuighoek berekenen voor (001) en (002). Tot welk Bravais rooster gehoord deze kristalstructuur?
# Begrippen: CuKalfa en ESI

===27 juni 2017===
# Stappen van kristalstructuurbepaling
# NMR, een piek waar bij stond deze verdwijnt bij schudden met D2O, bijvraag waarom deze piek verdwijnt, ook bijvragen over C13 NMR en IR
# Ruimtegroep Pcmm en bijvragen
# Vlakgroep vlak 110 NaCl
# Bepalen van intensiteit reflectie van vlak 200, lengte en fractionele coördinaten gegeven
# Beschrijf MALDI-TOF en kubisch dichtste bolstapeling

===22 juni 2017 NM===
# Structuurverfijning van kristalstructuurbepaling
# Leg uit: NOE en NOESY
# Ruimtegroep Pcan met alle bijhorende vragen
# Oefening waar 4 moleculen stonden waarvan je de puntgroep moest bepalen
# Oefening met tabel Sintheta/golflengte- intensiteit en hoek 2theta bepalen
# begrippen: CuKalfa en Resolutie

=== 16 juni 2017 NM===
#Hoe Faseprobleem oplossen met Patterson functie
#1H- Nmr ( bijvragen : welke piek is het belangrijkst bij IR-spectra , hoeveel pieken zullen er zijn bij C13,..)
#Ruimtegroep ( ik dacht Pbmn )
#Intensiteit bepalen en afbuighoek bepalen
#Puntgroep van tetrachloornaftaleen ( eerst isomeren geven en van elk isomeer puntgroep bepalen)
#Mc-lafferty omlegging
#chemische ionisatie
===16 juni 2017 VM===
#leid de formule voor de structuurfactor af en vertel hoe je deze experimenteel kan bepalen.
#Geef alle ionisatie technieken gebruikt in MS.
#Puntgroep Pbcm met gebruikelijke bijvragen
#Geef de puntgroepen van alle isomeren van tetrachloor kubaan en teken de symmetrie elementen
#verklaar chemische shift, koppelingsconstante en shift reagens
===12 juni 2017===
#leg constructie van Ewald uit
#nmr spectra (geef structuur molecule ) C10H12O3
#ruimtegroep Pncm met alle bijhorende vraagjes (asymmetrische eenheid, multipliciteit, equivaltente posities, patterson, puntgroep, systematische afwezigheden)
#Vlakgroep van (110) vlak van ijzer. Geef alle symmetrie elementen
#oefening ivm fase berekenen en intensiteit (CdI2, sin(theta)/golflengte is gegeven, bepaal fCd, fI en zo de rest)
#begrippen: ESI & Wet van Friedel

===21 augustus 2015===
# stappen van de kristalstructuur bepaling
# Welke methode voor ionisatie worden er gebruikt bij massaspectroscopie
# Pcan (met alle gebruikelijke bijvraagjes)
# Vlakgroep van (110) vlak van ijzer. Geef alle symmetrie elementen
# PoCL2: ge krijgt Sin theta/lambda en uw celafmetingen, geef Fhkl, Ihkl en uw hoek
# Bespreek de termen chemische shift, (vul hier in want ik kom er nie op) en shiftreagens
=== 18 augustus 2015 vm ===
# leg het principe van uit van verfijning van een kristalstructuur
# leg volgende begrippen uit: NOE en NOESY
# ruimtegroep Pbmn en alle vraagjes zoals altijd
# puntgroepen geven 4 isomeren van een of ander molecule
# voor een bepaalde reflectie de fase van de structuurfactor berekenen en de intensiteit
# 2 stellingen (juist of fout):
#* Bij een ESI spectrum zijn er geen fragmentaties
#* Bij kubische dichtste bolstapeling liggen alle atomen op speciale posities
=== 24 juni 2015 ===
# Nmr spectra
# verfijning van kristalstructuur
# Vlak groep van ijzer
# Ruimte groep Pcan + al die bijvragen
# Oefening sin theta/lambda. ..
# 2 stellingen:
#* esi heeft geen fragmentaties
#* In ccp liggen alle atomen op speciale posities

=== 18 juni 2015 ===
# Hoe kunnen we met behulp van de pattersonfunctie het faseprobleem oplossen?
# Leg uit NOE en NOESY
# puntgroep Pbmn
# Bepaal de puntgroep van de isomeren van tetrachloorkubaan en duid alle symmetrie-elementen aan
# Bereken de fase van de structuurfactor en de intensiteit voor CdI2 met
#* Eenheidscel a=4,24 A, c=6,86 A, gamma=120Â°
#* Posities: Cd 0 0 0, I(1) 2/3 1/3 1/4, I(2) 1/3 2/3 3/4
#* sin theta/lamba 0,0 0,1 0,2 0,3 fCd 48 44,58 38,44 33,22 fI 53 49,36 42,79 37,14
# Verklaar de begrippen CuKalfa en resolutie

=== 9 juni 2015 vm ===
# Leid de uitdrukking van de structuurfactor af. Hoe kan je de structuurfactor experimenteel bepalen?
# H-NMR spectra van 3 isomeren C6H6N2O2
# Ruimtegroep Pncm
#* Equivalente posities
#* multipliciteit
#* asymmetrische eenheid
#* Geef 2 speciale posities (waarom speciaal?)
#* van welke puntgroep afgeleid?
#* Pattersongroep?
#*Systematische afwezigheden
# Bepaal de puntgroep van verschillende isomeren van tetrachloornaftaleen. Duid de symmetrie elementen aan.
# Rood Loodoxide PbO kristalliseert in tetragonale eenheidscel a= 3.975 c= 5.023
#* Waar vind je in Pattersonfunctie sterkste pieken?
# Leg uit : ESI en ATR-IR

===25 juni 2014===
#Geef de stappen voor kristalstructuurbepaling (mondeling)
#Wat is NOE? (mondeling)
#Ruimtegroep Pcnb
#Geef puntgroep van alle isomeren van tetrachloorkubaan
#Intensiteit van In en afbuighoek: vormfactor, atoomposities zijn gegeven
#Stellingen
#*Bij ESI is geen fragmentatie
#*Bij kubisch dichtste bolstapeling liggen de atomen op speciale posities

===13 juni 2014===
# Hoe kunnen we met behulp van de pattersonfunctie het faseprobleem oplossen? (mondeling)
# NMR spectrum met gesubstitueerde benzeenring (mondeling)
# Ruimtegroep Pbnm met alle typische bijvragen (asymmetrische eenheid, speciale posities + waarom ze speciaal zijn, pattersongroep, puntgroep en systematische afwezigheden)
# Geef de vlakgroep van (110) van ijzer
# Oefening op structuurfactor. Vormfactoren met bijhorende sin(Î¸)/Î» zijn gegeven, net als de fractionele coÃ¶rdinaten en de grootte van de eenheidscel
# Wat is ESI?

===13 juni 2013===
# Ruimtegroep Pbmb.
# Wat is de vlakgroep van het vlak (110) in de ijzerstructuur?
# NMR-spectrum gegeven. Stelling: Bevat dit spectrum een AX6 systeem?
# Leg volgende begrippen uit: Laue groep, resolutie, temperatuursfactor.
# Gegeven: posities van In en celparameters (a en c). Teken een a,b-projectie van de eenheidscel. Welk Bravais-rooster heeft de cel? Bepaal de afbuighoek 2theta en de intensiteit van de reflecties (001) en (002). Wat is de puntgroep rond de middelste In? Waar bevinden zich de hoogste Pattersonpieken?

===10 juni 2013===
# Teken ruimtegroep Pbnb (ab-projectie) en geef equivalente posities, speciale posities, systematische afwezigheden, puntgroep waarvan de ruimtegroep is afgeleid en asymetrische eenheid. (Schriftelijk, na 1 uur af te geven.)
# Wat is de vlakgroep van het vlak (110) in de platina-strucuur? (Structuur is dus van buiten te kennen!) Bijvraag: is dit vlak de eenheidscel van de vlakgroep? (Mondeling)
# Bespreek: voor ethylisobutyraat (spectrum en structuur gegeven) is een ontkoppelingsexperiment niet mogelijk. Bijvragen: hoe bepalen we de frequentie die we moeten gebruiken voor het ontkoppelingsexperiment? Link de verschillende pieken aan de verschillende groepen. (Mondeling)
# Leg de Ewald-constructie uit. Bijvraag: wat gebeurt er als we het kristal draaien? (Mondeling)
# Gegeven: posities van Mo en Ni in een MoNi4-legering en parameters a en c. Teken een a,b-projectie van de eenheidscel. Welk Bravais-rooster heeft de cel? Bepaal de 2-theta en de intensiteit van de reflectie (002). Wat is de puntgroep rond Mo? Geef de hoogste pattersonpieken.

===16 juni 2011===
# Teken ruimtegroep Pmcn (ab-projectie) en geef equivalente posities, puntgroep waar deze ruimtegroep van is afgeleid, asymmetrische eenheid, 2 speciale posities en bijhorende Pattersongroep. Zijn er systematische afwezigheden?
# Stellingen:
#* Het vlak (110) wordt bij Fe en bij NaCl beschreven door dezelfde vlakgroep
#* Bij een goed verfijnde structuur zijn de pieken op de verschilfourier te verwaarlozen
#* Voor de waterstofatomen met delta 6,8 is een ontkoppelingsexperiment niet mogelijk (NMR-spectrum van ethyl-4-methoxybenzoaat gegeven, het gaat om de waterstoffen op C3 en C5 van de benzeenring).
# Oefening: PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel, a en c gegeven. Twee posities voor Pb en voor O gegeven. Teken de ab-projectie. Door welke puntgroep wordt de geometrie rond de Pb-atomen beschreven? Door welk Bravaisrooster wordt het kristal beschreven? Bepaal de fase van de intensiteit van afgebogen stralingsbundel voor het vlak (110) voor CuK-alpha (tabel met enkele waarden gegeven voor f van Pb en O ifv sin(theta)/lambda). Teken het vlak (110) en de invallende en afgebogen stralingsbundel op de tekening.

===10 juni 2010 (NM)===
# Teken ruimtegroep Pmnb en klassieke vragen: equivalente posities, 2 speciale posities, systematische afwezigheden, asymmetrische eenheid, puntgroep,..
# Stellingen:
#* De temperatuur heeft geen invloed op de kristalstructuurbepaling.
#* Het is niet mogelijk om P2 en Pm van elkaar te onderscheiden met behulp van intensiteitsmetingen.
# NMR-spectrum en bepalen of het overeenkomt met het gegeven molecule.
# Oefening: AgI kristal, a= 6,50 Angstrom, coordinaten van atomen zijn gegeven, en tabel van f ifv sin/lambda.
#* Geef a,b-projectie + Bravaisrooster
#* Bereken Intensiteit en bereken afbuighoek van vlak 004
#* Geef puntsymmetrie rond Ag en rond I
#* Waar verwacht je de hoogste Pattersonpieken?

===23 juni 2009===
# teken ruimtegroep (Pnca dacht ik) & geef eq. posities, 2 speciale posities, syst. afwezigheden, puntgroep, ...
# Stellingen:
#* rotatiesymmetrie kan bepaald worden via rotatiediffractie(dat een ding waar ge een kristal draait, ik ben niet meer zeker of dat zo heet)
#* bij verschilelektronendichtheidsmap gaat de hoogte van de pieken verloren bij verfijning (ofzoiets toch)
# NMR van 1,1-dimethoxyethaan
# Oefening: alfa-uranium heeft volgende coordinaten op speciale posities: +-(0,y,1/4) +-(1/2,1/2-y,-1/4) a b en c gegeven(3 verschillende waarden) 2 groottes van structuurfactoren gegeven en de fu in functie van sin(theta).
#* y is 0.10 of 0.15, bepaal dit met bhv de gegevens.
#* Teken een a,b-projectie.
#* Beschrijf de omringing van het U-atoom via de puntgroep van het atoom.
#* Teken de pattersongroep.
===17 juni 2009===
# Ruimtegroep Pcan: equivalente posities, multipliciteit, asymmetrische eenheid, 2 speciale posities, puntgroep, systematische afwezigheden
# Stellingen
#* De temperatuurfactoren van Pt in een Pt-kristal zijn isotroop (Antwoord: Waar want ze liggen op speciale posities)
#* De symmetrie van een diffractiepatroon van een kristal wordt bepaald door de ruimtegroep
#* NMR: aspirine
# Oefening: Nikkelarsenide (a, c en gamma=120Â° is gegeven) De posities van Nikkel en van arseen zijn ook gegeven.
#* Geef de ab-projectie, bravais rooster, wat is de stapeling van Arseen, puntgroep rond Arseen en rond nikkel
#* Bij reflecties (200), (300) en (030) en Cu K-alfa straling
#** Voorspel de hoogste intensiteit
#** Voorspel de grootste afbuighoeken
#* Wat is de resolutie bij een afbuighoek van 100Â° en bij Cu K-alfa straling

=== 15 juni 2009 ===
# Ruimtegroep (ik denk Pbmn) met klassieke vragen
# Stellingen
#* Pm en Cm hebben dezelfde Harkersecties
#* Cobalt kan geÃ¯oniseerd worden met Cu K alfa straling
#* NMR
# Oefening: HgS met coÃ¶rdinaten Hg en S gegeven. Alle elementen geven van 11 juni op uitzondering van de afbuighoek en dit voor de vlakken 200 en 400.

=== 11 juni 2009 ===
# Ruimtegroep + asymmetrische eenheid + 2 speciale posities + iets met systematische afwezigheden
# Stellingen
#* Het 110 vlak van Fe vertoont C4v (Bijvragen: aantonen op modellekes)
#* De atomen bij hexagonale dichtste bolstapeling liggen allemaal op speciale posities (Bijvraag: Hij vraagt om de kubische bolstapeling te laten zien, met die pingpongballetjes en hoe heten de ruimtes tussen die pingpongballekes)
#* NMR: een benzeen met een chloor op en op para positie iets me een ethyl en een keton (Bijvraag: hoe zie je dat het een spectrum van de 1ste orde of 2de orde is)
# Oefening: ik kreeg een tabel met fractionele coÃ¶rdinaten van ReO3 en zo'n tabel met sin (theta) / lamda en vormfactoren. Ik moest een ab projectie tekenen, bravais rooster geven, intensiteit berekenen, afbuighoek bepalen, hoogste pattersonpieken voorspellen.

=== 24 juni 2008 ===
# Pmca met klassieke vragen
# Stellingen
#* Alle atomen van sfaleriet bezetten speciale posities
#* Een kristalrooster kan ondubbelzinnig bepaald worden adhv systematische afwezigheden
#* isopropyltolueen
# Wolfraam-rooster en CuKa straling, vlakken (211) en (310)
#* teken 3D-rooster en duidt [sic] vlakken aan
#* Welke intensiteit is sterkst, bij (221) of bij (310)
#* Welke reflectiehoek is grootst, bij (221) of bij (310)
#* Welke zijn de sterkste Pattersonpieken?

=== 19 juni 2008 ===
# Pbmn tekenen + assym. eenheid + equi. pos. + multipliciteit + 2 speciale pos. + Systematische afwezigheden + van welke puntgroep
# Stellingen
#* De temp. heeft geen invloed op het diffractiepatroon
#* De vlakken 001 en 110 van Fe hebben dezelfde vlakgroep (ook zeggen welke vlakgroep(en))
#* NMR
#De structuur van LiF en NaCl is dezelfde, a = ...., kristalafmeting 0,2mmx0,2mmx0,2mm en wordt bestraald met Cu kalfa. Bereken F003 en F004. Welke intensiteit is het hoogst? Wat gebeurt er met de diffractiehoek en de intensiteit als je:
#*F vervangt door I
#*de cel verdubbeld
#*Waar verwacht je de sterkste Pattersonpieken

=== 19 juni 2008 ===
# P nmb tekenen + puntgroep + asymetrische eenheid + equi posities
# stellingen ( waar of niet waar )
#* Pm en Cm hebben dezelfde harkersecties
#* R staat voor de resolutie van een structuurbepaling
#* spectrum en molecule gegeven, horen ze bij elkaar?
# oefening : NH4HgCl3 heeft eenheidscel a = ... c =... en atoomposities N, Hg en 3 Cl-en gegeven: (ook alpha-Cu straling zoda je uw lambda ook kent) (tabel sin(theta)/lambda en f waarden van Cl, Hg en N gegeven)
#* geef (a,b) projectie van eenheidscel
#* bepaal Bravais rooster
#* bepaal intensiteit en afbuigrichting 2theta van de reflectie (004)
#* Hg door welke puntgroep omringt

===23 juni 2008===
#Ruimtegroep tekenen. In dit geval Pman. Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?
#Bespreek volgende stellingen. Geef telkens ook een korte motivatie:
#*Op basis van systematische afwezigheden kan geen verschil gemaakt worden tussen de ruimtegroepen P2 en P2/m.
#*De temperatuurfactoren van <math>\alpha</math>-Fe zijn isotroop.
#*NMR-spectrum en molecule. Kunnen die bij elkaar horen?
#kristal met Li2O met Ã©Ã©n lengte gegeven (kubisch dus)
#*teken ab projectie gegeven zijn de posities van de atomen
#*geef puntgroep rond Li en O
#*geef bravais rooster
#*twee vlakken gegeven welke grootste hoek en welke grootste intensiteit
#*waar bevinden zich de grootste patterson pieken

===27 juni 2007===
#Ruimtegroep tekenen. Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?
#Bespreek volgende stellingen. Geef telkens ook een korte motivatie:
#*Op basis van systematische afwezigheden kan geen verschil gemaakt worden tussen de ruimtegroepen P2 en P2/m.
#*De temperatuurfactoren van <math>\alpha</math>-Fe zijn isotroop.
#*NMR-spectrum en molecule. Kunnen die bij elkaar horen?
#Typische gecombineerde oefening. Diffractiemeting op wolfraam met Cu-<math>\alpha</math> straling. Beschouw vlakken (211) en (310). Een tabel met <math>\frac{\sin \theta}{\lambda}</math> waarden is gegeven.
#*Teken het reÃ«le rooster en duidt de vlakken aan.
#*Teken ab-projectie van het reciproke rooster, en duidt hier ook de vlakken aan.
#*Voor welk vlak verwacht je de grootste reflectiehoek.
#*Voor welk vlak verwacht je de grootste intensiteit.

===Vragen eerste zit vrijdag 30 juni 2006 (Fysica)===
#Teken Pbna (ab-projectie). Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?
#Zijn volgende stellingen waar of vals?
#*Omgeving van een bol in hexagonaal dichtste bolstapeling is C3h.
#*<math>P2_1</math> en <math>P2_1/m</math> zijn niet te onderscheiden met behulp van de speciale posities.
#*Dit is het NMR-spectrum van... (iets ingewikkeld)
#LiF kristalliseert zoals NaCl in kubische cel met parameter a = 0,4026 nm. We gebruiken CuKa straling en een kristal met dimensie 0,2x0,2x0,2.
#*Geef de ab-projectie van de structuur.
#*Geef de reciproke parameters.
#*netvlakken 003 en 004: welke heeft grootste intensiteit van de gereflecteerde straal?
#*Wat gebeurt met deze reflecties (dus hoek, intensiteit, fase) als we F vervangen door I. Wat gebeurt er als we de afmetingen van het kristal verdubbelen?
#*Welke zijn de grootste pieken in de Pattersonfunctie?

=== Vragen eerste zit dinsdag 27 juni 2006 (Geologie) ===
(dit waren vragen van geologie, zij hebben ook een deel poederdiffractie dat voor fysici niet gekend hoeft te zijn)

*teken de ruimtegroep Pncm (a,b-projectie)
Geef equivalente posities, multipliciteit en assymmetrische eenheid

Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid?

Geef twee speciale posities

*stellingen:
De atomen in perovskiet liggen allemaal op speciale posities

De ruimtegroepen P2/c en Pc behoren tot zelfde pattersongroep

*loodoxide PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel
a=3,975 A en c=5,023 A
atomen liggen op de posities:
Pb(1): 0 Â½ 0.2385
Pb(2): Â½ 0 -0.2385
O(1): 0 0 0
O(2): Â½ Â½ 0
Teken een a,b-projectie van de eenheidscel en beschrijf de omringing van de loodatomen met behulp van een puntgroep

Welk Bravaisrooster?

Bepaal voor de reflectie (110) de fase van de structuurfactor en intensiteit
Teken het vlak (110) en de invallende en afgebogen bundel bij op de a,b-projectie bij gebruik van CuKÎ±

Bereken de positie van de diffractielijn op een Debye-Scherrer film
(camerastraal=28,7mm en CuKÎ±)

Teken schematisch de film

=== Vragen eerste zit donderdag 22 juni 2006 (Fysica) ===
*eerste vraag:
Teken een ab-projectie van de ruimtegroep Pmcb
en alles der op en der aan, puntgroep, patterson, equivalente posities...

*Tweede vraag:
Zijn volgende stellingen waar, verklaar:
1. kan men uit een diffractie patroon de aanwezigheid opmaken van een S4 as?
2. Is de R-waarde een maat voor de resolutie van een diffractie?
3. Is dit het NMR spectrum van ... (een onuitspreekbare naam)

*Derde vraag:
Oefeningen op een hexagonaal stelsel CadmiumdiJood met straling bepalen en uittekenen.</text>

Moleculaire Architectuur

2020-01-13T12:23:17Z

DevlinVanAssche: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Chemie]]
[[Categorie:Bachelor Biochemie]]

==Vakinformatie==

Verplicht vak voor chemie.

Dit vak wordt gegeven door professor Van Meervelt, hij is de aangenaamheid zelve op het examen!
Zijn bijvragen zijn wel aan de moeilijke kant. Maar hij zal je altijd helpen de bijvragen beetje bij beetje op te lossen. Het examen duurt 4u.

Kristallografie is het vak Moleculaire Architectuur, maar dan zonder NMR (het laatste hoofdstuk). Dit is eigenlijk de voorloper van moleculaire architectuur. Het wordt ook nu nog aan de geologen gegeven.

==Examenvragen==
===13 januari 2020===
#Theorie: Hoe wordt het principe van Fourier synthese toegepast in de kristalstructuurbepaling?
#Theorie: NOE, NOESY en COSY
#Puntgroep Pmcb met gebruikelijke bijvragen
#Oefening: Puntgroepen van vier structuren
#Oefening: CdI2: Bravaisrooster bepalen, voor structuurfactor fase bepalen en afbuigingshoek als CuK(alfa) straling gebruikt wordt, maxima van de Pattersonfunctie geven
#Begrippen: ATR-IR + ESI uitleggen

===26 augustus 2019===
#Theorie: Hoe wordt het principe van Fourier synthese toegepast in de kristalstructuurbepaling?
#NMR-vraag: 3 verschillende H-NMR spectra van isomeren met brutoformule C6H8N2O2. Teken ook de opsplitsingspatronen.
#Puntgroep Pcnb met gebruikelijke bijvragen
#Oefening: Vlakgroep vlak 110 NaCl. Geef alle symmetrie-elementen.
#Oefening: Bepaal de fase en intensiteit van PoCl2 in de reflectie (110). Gegeven zijn de atoomposities en de karakteristieke straling.
#Begrippen: ESI + CuKalfa uitleggen

===28 januari 2019===
#Hoe kan je een model verbeteren na het oplossen van het faseprobleem?
#H-NMR van C5H8O2 bijvragen over IR.
#Pmcn met bijvragen.
#puntgroep van 4 isomeren van dioxine.
#AgI posities van de atomen gegeven (breuken) a=6.50 A. tabel met sin(theta)/lambda gegeven voor fAg en fI. Bravais rooster geven, fase, hoek en intensiteit berekenen.
#ATR-IR en ESI.
===17 januari 2019===
#Geef de afleiding van de structuurfactor. Is deze experimenteel te bepalen?
#H1-NMR van C10H13NO2 (Bijvragen over IR: wat als we van dit molecule een IR spectrum zouden opnemen? Waar zien we dan pieken? Welke zijn sterk? Welke niet?)
#Ruimtegroep Pnam met bijgvragen
#Puntgroep bepalen van de isomeren van tetrachloorkubaan (molecuulmodelletje gegeven)
#Rood loodoxide PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel
a=3,975 A en c=5,023 Atomen liggen op de posities:
Pb(1): 0 ½ 0.2385
Pb(2): ½ 0 -0.2385
O(1): 0 0 0
O(2): ½ ½ 0
Wat is het Bravaisrooster? Welke symmetrie-elementen gaan door O2? Construeer de pattersonfunctie. Waar vinden we de sterkste pieken? Toon aan dat de intenstiteit van reflectie 200 en 020 gelijk is.
#Mclafferty omlegging en kubische en hexagonale dichtste bolstapeling.
===14 januari 2019===
# Hoe kan men met de Pattersonfunctie het faseprobleem oplossen? (mondeling)
# NOE en NOESY, COSY (mondeling)
# Ruimtegroep Pman met bijvragen
# Puntgroepen van 4 verschillende aromaten
# CdI2: Bravaisrooster bepalen, voor structuurfactor fase bepalen en afbuigingshoek als CuK(alfa) straling gebruikt wordt, maxima van de Pattersonfunctie geven
# MALDI-TOF uitleggen en golfgetallen vergelijken bij IR spectroscopie

=== 4 september 2018===
# Geef de contructie van Ewald
# H-NMR van C10H12O3
# Ruimtegroep Pcnb
# Geef de puntgroep van 4 isomeren van tetrachloornaftaleen die aanleiding geven tot een andere puntgroep.
# PbO kristaliseert uit in eenheidscel met gegeven dimensies en atoomposities. Gevraagd: Construeer de pattersonfunctie, waar zijn de sterkste pieken? Tot welk Bravais rooster behoort dit? Wat is de afbuighoek van het 110 vlak met CuKalfa?
# Begrippen: Kubisch en hexagonale dichtste bolstapeling + McLafferty omlegging

===27 augustus 2018===
# Hoe kan men het faseprobleem oplossen met behulp van de Pattersonfunctie? (dus ook uitleggen wat faseprobleem is, formule van pattersonfunctie geven,...) (mondeling)
# Gegeven drie H-NMR spectra, alle drie C6H6N2O2, bepaal structuren, en verklaar de verschillende spectra (mondeling)
# Ruimtegroep Pcmn met alle gebruikelijke vragen
# Bepaal tot welke puntgroepen de isomeren van trichloorbenzeen behoren, teken alle symmetrie-elementen
# Oefening met CdI2, bepaal fasehoek van de reflectie op (110) en afbuighoek theta, tot welk bravais rooster behoort dit? Waar bevinden zich de maxima bij de Pattersonfunctie?
# Begrippen: MALDI-TOF, Laue groep

===15 juni 2018===
# Leid de structuurfactor af. Kan deze ook experimenteel bepaald worden? (mondeling)
# Gegeven een H-NMR spectrum, bepaal de structuur van de chemische stof die dit spectrum geeft. (mondeling)
# Ruimtegroep Pmca, gebruikelijke bijvragen.
# Oefening met intensiteit enzo berekenen. Structuur was op eerste zicht niet centrosymmetrisch, maar was het wel met andere oorsprong.
# Wat is de vlakgroep van het (110) vlak van NaCl? Teken en geef alle symmetrie-elementen.
# Begrippen: MALDI-TOF, kubisch dichtste bolstapeling

===11 juni 2018===
# Waarom Pattersonfunctie belangrijk bij het faseprobleem?
# NMR: C10H1202
# Ruimtegroep Pbab met alle bijhorende vragen
# Puntgroepen geven van 4 verschillende aromatische verbindingen + symmetrie elementen aanduiden
# Oefening waarbij celparameters en 2 atomen gegeven zijn. Intensiteit en afbuighoek berekenen voor (001) en (002). Tot welk Bravais rooster gehoord deze kristalstructuur?
# Begrippen: CuKalfa en ESI

===27 juni 2017===
# Stappen van kristalstructuurbepaling
# NMR, een piek waar bij stond deze verdwijnt bij schudden met D2O, bijvraag waarom deze piek verdwijnt, ook bijvragen over C13 NMR en IR
# Ruimtegroep Pcmm en bijvragen
# Vlakgroep vlak 110 NaCl
# Bepalen van intensiteit reflectie van vlak 200, lengte en fractionele coördinaten gegeven
# Beschrijf MALDI-TOF en kubisch dichtste bolstapeling

===22 juni 2017 NM===
# Structuurverfijning van kristalstructuurbepaling
# Leg uit: NOE en NOESY
# Ruimtegroep Pcan met alle bijhorende vragen
# Oefening waar 4 moleculen stonden waarvan je de puntgroep moest bepalen
# Oefening met tabel Sintheta/golflengte- intensiteit en hoek 2theta bepalen
# begrippen: CuKalfa en Resolutie

=== 16 juni 2017 NM===
#Hoe Faseprobleem oplossen met Patterson functie
#1H- Nmr ( bijvragen : welke piek is het belangrijkst bij IR-spectra , hoeveel pieken zullen er zijn bij C13,..)
#Ruimtegroep ( ik dacht Pbmn )
#Intensiteit bepalen en afbuighoek bepalen
#Puntgroep van tetrachloornaftaleen ( eerst isomeren geven en van elk isomeer puntgroep bepalen)
#Mc-lafferty omlegging
#chemische ionisatie
===16 juni 2017 VM===
#leid de formule voor de structuurfactor af en vertel hoe je deze experimenteel kan bepalen.
#Geef alle ionisatie technieken gebruikt in MS.
#Puntgroep Pbcm met gebruikelijke bijvragen
#Geef de puntgroepen van alle isomeren van tetrachloor kubaan en teken de symmetrie elementen
#verklaar chemische shift, koppelingsconstante en shift reagens
===12 juni 2017===
#leg constructie van Ewald uit
#nmr spectra (geef structuur molecule ) C10H12O3
#ruimtegroep Pncm met alle bijhorende vraagjes (asymmetrische eenheid, multipliciteit, equivaltente posities, patterson, puntgroep, systematische afwezigheden)
#Vlakgroep van (110) vlak van ijzer. Geef alle symmetrie elementen
#oefening ivm fase berekenen en intensiteit (CdI2, sin(theta)/golflengte is gegeven, bepaal fCd, fI en zo de rest)
#begrippen: ESI & Wet van Friedel

===21 augustus 2015===
# stappen van de kristalstructuur bepaling
# Welke methode voor ionisatie worden er gebruikt bij massaspectroscopie
# Pcan (met alle gebruikelijke bijvraagjes)
# Vlakgroep van (110) vlak van ijzer. Geef alle symmetrie elementen
# PoCL2: ge krijgt Sin theta/lambda en uw celafmetingen, geef Fhkl, Ihkl en uw hoek
# Bespreek de termen chemische shift, (vul hier in want ik kom er nie op) en shiftreagens
=== 18 augustus 2015 vm ===
# leg het principe van uit van verfijning van een kristalstructuur
# leg volgende begrippen uit: NOE en NOESY
# ruimtegroep Pbmn en alle vraagjes zoals altijd
# puntgroepen geven 4 isomeren van een of ander molecule
# voor een bepaalde reflectie de fase van de structuurfactor berekenen en de intensiteit
# 2 stellingen (juist of fout):
#* Bij een ESI spectrum zijn er geen fragmentaties
#* Bij kubische dichtste bolstapeling liggen alle atomen op speciale posities
=== 24 juni 2015 ===
# Nmr spectra
# verfijning van kristalstructuur
# Vlak groep van ijzer
# Ruimte groep Pcan + al die bijvragen
# Oefening sin theta/lambda. ..
# 2 stellingen:
#* esi heeft geen fragmentaties
#* In ccp liggen alle atomen op speciale posities

=== 18 juni 2015 ===
# Hoe kunnen we met behulp van de pattersonfunctie het faseprobleem oplossen?
# Leg uit NOE en NOESY
# puntgroep Pbmn
# Bepaal de puntgroep van de isomeren van tetrachloorkubaan en duid alle symmetrie-elementen aan
# Bereken de fase van de structuurfactor en de intensiteit voor CdI2 met
#* Eenheidscel a=4,24 A, c=6,86 A, gamma=120Â°
#* Posities: Cd 0 0 0, I(1) 2/3 1/3 1/4, I(2) 1/3 2/3 3/4
#* sin theta/lamba 0,0 0,1 0,2 0,3 fCd 48 44,58 38,44 33,22 fI 53 49,36 42,79 37,14
# Verklaar de begrippen CuKalfa en resolutie

=== 9 juni 2015 vm ===
# Leid de uitdrukking van de structuurfactor af. Hoe kan je de structuurfactor experimenteel bepalen?
# H-NMR spectra van 3 isomeren C6H6N2O2
# Ruimtegroep Pncm
#* Equivalente posities
#* multipliciteit
#* asymmetrische eenheid
#* Geef 2 speciale posities (waarom speciaal?)
#* van welke puntgroep afgeleid?
#* Pattersongroep?
#*Systematische afwezigheden
# Bepaal de puntgroep van verschillende isomeren van tetrachloornaftaleen. Duid de symmetrie elementen aan.
# Rood Loodoxide PbO kristalliseert in tetragonale eenheidscel a= 3.975 c= 5.023
#* Waar vind je in Pattersonfunctie sterkste pieken?
# Leg uit : ESI en ATR-IR

===25 juni 2014===
#Geef de stappen voor kristalstructuurbepaling (mondeling)
#Wat is NOE? (mondeling)
#Ruimtegroep Pcnb
#Geef puntgroep van alle isomeren van tetrachloorkubaan
#Intensiteit van In en afbuighoek: vormfactor, atoomposities zijn gegeven
#Stellingen
#*Bij ESI is geen fragmentatie
#*Bij kubisch dichtste bolstapeling liggen de atomen op speciale posities

===13 juni 2014===
# Hoe kunnen we met behulp van de pattersonfunctie het faseprobleem oplossen? (mondeling)
# NMR spectrum met gesubstitueerde benzeenring (mondeling)
# Ruimtegroep Pbnm met alle typische bijvragen (asymmetrische eenheid, speciale posities + waarom ze speciaal zijn, pattersongroep, puntgroep en systematische afwezigheden)
# Geef de vlakgroep van (110) van ijzer
# Oefening op structuurfactor. Vormfactoren met bijhorende sin(Î¸)/Î» zijn gegeven, net als de fractionele coÃ¶rdinaten en de grootte van de eenheidscel
# Wat is ESI?

===13 juni 2013===
# Ruimtegroep Pbmb.
# Wat is de vlakgroep van het vlak (110) in de ijzerstructuur?
# NMR-spectrum gegeven. Stelling: Bevat dit spectrum een AX6 systeem?
# Leg volgende begrippen uit: Laue groep, resolutie, temperatuursfactor.
# Gegeven: posities van In en celparameters (a en c). Teken een a,b-projectie van de eenheidscel. Welk Bravais-rooster heeft de cel? Bepaal de afbuighoek 2theta en de intensiteit van de reflecties (001) en (002). Wat is de puntgroep rond de middelste In? Waar bevinden zich de hoogste Pattersonpieken?

===10 juni 2013===
# Teken ruimtegroep Pbnb (ab-projectie) en geef equivalente posities, speciale posities, systematische afwezigheden, puntgroep waarvan de ruimtegroep is afgeleid en asymetrische eenheid. (Schriftelijk, na 1 uur af te geven.)
# Wat is de vlakgroep van het vlak (110) in de platina-strucuur? (Structuur is dus van buiten te kennen!) Bijvraag: is dit vlak de eenheidscel van de vlakgroep? (Mondeling)
# Bespreek: voor ethylisobutyraat (spectrum en structuur gegeven) is een ontkoppelingsexperiment niet mogelijk. Bijvragen: hoe bepalen we de frequentie die we moeten gebruiken voor het ontkoppelingsexperiment? Link de verschillende pieken aan de verschillende groepen. (Mondeling)
# Leg de Ewald-constructie uit. Bijvraag: wat gebeurt er als we het kristal draaien? (Mondeling)
# Gegeven: posities van Mo en Ni in een MoNi4-legering en parameters a en c. Teken een a,b-projectie van de eenheidscel. Welk Bravais-rooster heeft de cel? Bepaal de 2-theta en de intensiteit van de reflectie (002). Wat is de puntgroep rond Mo? Geef de hoogste pattersonpieken.

===16 juni 2011===
# Teken ruimtegroep Pmcn (ab-projectie) en geef equivalente posities, puntgroep waar deze ruimtegroep van is afgeleid, asymmetrische eenheid, 2 speciale posities en bijhorende Pattersongroep. Zijn er systematische afwezigheden?
# Stellingen:
#* Het vlak (110) wordt bij Fe en bij NaCl beschreven door dezelfde vlakgroep
#* Bij een goed verfijnde structuur zijn de pieken op de verschilfourier te verwaarlozen
#* Voor de waterstofatomen met delta 6,8 is een ontkoppelingsexperiment niet mogelijk (NMR-spectrum van ethyl-4-methoxybenzoaat gegeven, het gaat om de waterstoffen op C3 en C5 van de benzeenring).
# Oefening: PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel, a en c gegeven. Twee posities voor Pb en voor O gegeven. Teken de ab-projectie. Door welke puntgroep wordt de geometrie rond de Pb-atomen beschreven? Door welk Bravaisrooster wordt het kristal beschreven? Bepaal de fase van de intensiteit van afgebogen stralingsbundel voor het vlak (110) voor CuK-alpha (tabel met enkele waarden gegeven voor f van Pb en O ifv sin(theta)/lambda). Teken het vlak (110) en de invallende en afgebogen stralingsbundel op de tekening.

===10 juni 2010 (NM)===
# Teken ruimtegroep Pmnb en klassieke vragen: equivalente posities, 2 speciale posities, systematische afwezigheden, asymmetrische eenheid, puntgroep,..
# Stellingen:
#* De temperatuur heeft geen invloed op de kristalstructuurbepaling.
#* Het is niet mogelijk om P2 en Pm van elkaar te onderscheiden met behulp van intensiteitsmetingen.
# NMR-spectrum en bepalen of het overeenkomt met het gegeven molecule.
# Oefening: AgI kristal, a= 6,50 Angstrom, coordinaten van atomen zijn gegeven, en tabel van f ifv sin/lambda.
#* Geef a,b-projectie + Bravaisrooster
#* Bereken Intensiteit en bereken afbuighoek van vlak 004
#* Geef puntsymmetrie rond Ag en rond I
#* Waar verwacht je de hoogste Pattersonpieken?

===23 juni 2009===
# teken ruimtegroep (Pnca dacht ik) & geef eq. posities, 2 speciale posities, syst. afwezigheden, puntgroep, ...
# Stellingen:
#* rotatiesymmetrie kan bepaald worden via rotatiediffractie(dat een ding waar ge een kristal draait, ik ben niet meer zeker of dat zo heet)
#* bij verschilelektronendichtheidsmap gaat de hoogte van de pieken verloren bij verfijning (ofzoiets toch)
# NMR van 1,1-dimethoxyethaan
# Oefening: alfa-uranium heeft volgende coordinaten op speciale posities: +-(0,y,1/4) +-(1/2,1/2-y,-1/4) a b en c gegeven(3 verschillende waarden) 2 groottes van structuurfactoren gegeven en de fu in functie van sin(theta).
#* y is 0.10 of 0.15, bepaal dit met bhv de gegevens.
#* Teken een a,b-projectie.
#* Beschrijf de omringing van het U-atoom via de puntgroep van het atoom.
#* Teken de pattersongroep.
===17 juni 2009===
# Ruimtegroep Pcan: equivalente posities, multipliciteit, asymmetrische eenheid, 2 speciale posities, puntgroep, systematische afwezigheden
# Stellingen
#* De temperatuurfactoren van Pt in een Pt-kristal zijn isotroop (Antwoord: Waar want ze liggen op speciale posities)
#* De symmetrie van een diffractiepatroon van een kristal wordt bepaald door de ruimtegroep
#* NMR: aspirine
# Oefening: Nikkelarsenide (a, c en gamma=120Â° is gegeven) De posities van Nikkel en van arseen zijn ook gegeven.
#* Geef de ab-projectie, bravais rooster, wat is de stapeling van Arseen, puntgroep rond Arseen en rond nikkel
#* Bij reflecties (200), (300) en (030) en Cu K-alfa straling
#** Voorspel de hoogste intensiteit
#** Voorspel de grootste afbuighoeken
#* Wat is de resolutie bij een afbuighoek van 100Â° en bij Cu K-alfa straling

=== 15 juni 2009 ===
# Ruimtegroep (ik denk Pbmn) met klassieke vragen
# Stellingen
#* Pm en Cm hebben dezelfde Harkersecties
#* Cobalt kan geÃ¯oniseerd worden met Cu K alfa straling
#* NMR
# Oefening: HgS met coÃ¶rdinaten Hg en S gegeven. Alle elementen geven van 11 juni op uitzondering van de afbuighoek en dit voor de vlakken 200 en 400.

=== 11 juni 2009 ===
# Ruimtegroep + asymmetrische eenheid + 2 speciale posities + iets met systematische afwezigheden
# Stellingen
#* Het 110 vlak van Fe vertoont C4v (Bijvragen: aantonen op modellekes)
#* De atomen bij hexagonale dichtste bolstapeling liggen allemaal op speciale posities (Bijvraag: Hij vraagt om de kubische bolstapeling te laten zien, met die pingpongballetjes en hoe heten de ruimtes tussen die pingpongballekes)
#* NMR: een benzeen met een chloor op en op para positie iets me een ethyl en een keton (Bijvraag: hoe zie je dat het een spectrum van de 1ste orde of 2de orde is)
# Oefening: ik kreeg een tabel met fractionele coÃ¶rdinaten van ReO3 en zo'n tabel met sin (theta) / lamda en vormfactoren. Ik moest een ab projectie tekenen, bravais rooster geven, intensiteit berekenen, afbuighoek bepalen, hoogste pattersonpieken voorspellen.

=== 24 juni 2008 ===
# Pmca met klassieke vragen
# Stellingen
#* Alle atomen van sfaleriet bezetten speciale posities
#* Een kristalrooster kan ondubbelzinnig bepaald worden adhv systematische afwezigheden
#* isopropyltolueen
# Wolfraam-rooster en CuKa straling, vlakken (211) en (310)
#* teken 3D-rooster en duidt [sic] vlakken aan
#* Welke intensiteit is sterkst, bij (221) of bij (310)
#* Welke reflectiehoek is grootst, bij (221) of bij (310)
#* Welke zijn de sterkste Pattersonpieken?

=== 19 juni 2008 ===
# Pbmn tekenen + assym. eenheid + equi. pos. + multipliciteit + 2 speciale pos. + Systematische afwezigheden + van welke puntgroep
# Stellingen
#* De temp. heeft geen invloed op het diffractiepatroon
#* De vlakken 001 en 110 van Fe hebben dezelfde vlakgroep (ook zeggen welke vlakgroep(en))
#* NMR
#De structuur van LiF en NaCl is dezelfde, a = ...., kristalafmeting 0,2mmx0,2mmx0,2mm en wordt bestraald met Cu kalfa. Bereken F003 en F004. Welke intensiteit is het hoogst? Wat gebeurt er met de diffractiehoek en de intensiteit als je:
#*F vervangt door I
#*de cel verdubbeld
#*Waar verwacht je de sterkste Pattersonpieken

=== 19 juni 2008 ===
# P nmb tekenen + puntgroep + asymetrische eenheid + equi posities
# stellingen ( waar of niet waar )
#* Pm en Cm hebben dezelfde harkersecties
#* R staat voor de resolutie van een structuurbepaling
#* spectrum en molecule gegeven, horen ze bij elkaar?
# oefening : NH4HgCl3 heeft eenheidscel a = ... c =... en atoomposities N, Hg en 3 Cl-en gegeven: (ook alpha-Cu straling zoda je uw lambda ook kent) (tabel sin(theta)/lambda en f waarden van Cl, Hg en N gegeven)
#* geef (a,b) projectie van eenheidscel
#* bepaal Bravais rooster
#* bepaal intensiteit en afbuigrichting 2theta van de reflectie (004)
#* Hg door welke puntgroep omringt

===23 juni 2008===
#Ruimtegroep tekenen. In dit geval Pman. Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?
#Bespreek volgende stellingen. Geef telkens ook een korte motivatie:
#*Op basis van systematische afwezigheden kan geen verschil gemaakt worden tussen de ruimtegroepen P2 en P2/m.
#*De temperatuurfactoren van <math>\alpha</math>-Fe zijn isotroop.
#*NMR-spectrum en molecule. Kunnen die bij elkaar horen?
#kristal met Li2O met Ã©Ã©n lengte gegeven (kubisch dus)
#*teken ab projectie gegeven zijn de posities van de atomen
#*geef puntgroep rond Li en O
#*geef bravais rooster
#*twee vlakken gegeven welke grootste hoek en welke grootste intensiteit
#*waar bevinden zich de grootste patterson pieken

===27 juni 2007===
#Ruimtegroep tekenen. Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?
#Bespreek volgende stellingen. Geef telkens ook een korte motivatie:
#*Op basis van systematische afwezigheden kan geen verschil gemaakt worden tussen de ruimtegroepen P2 en P2/m.
#*De temperatuurfactoren van <math>\alpha</math>-Fe zijn isotroop.
#*NMR-spectrum en molecule. Kunnen die bij elkaar horen?
#Typische gecombineerde oefening. Diffractiemeting op wolfraam met Cu-<math>\alpha</math> straling. Beschouw vlakken (211) en (310). Een tabel met <math>\frac{\sin \theta}{\lambda}</math> waarden is gegeven.
#*Teken het reÃ«le rooster en duidt de vlakken aan.
#*Teken ab-projectie van het reciproke rooster, en duidt hier ook de vlakken aan.
#*Voor welk vlak verwacht je de grootste reflectiehoek.
#*Voor welk vlak verwacht je de grootste intensiteit.

===Vragen eerste zit vrijdag 30 juni 2006 (Fysica)===
#Teken Pbna (ab-projectie). Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?
#Zijn volgende stellingen waar of vals?
#*Omgeving van een bol in hexagonaal dichtste bolstapeling is C3h.
#*<math>P2_1</math> en <math>P2_1/m</math> zijn niet te onderscheiden met behulp van de speciale posities.
#*Dit is het NMR-spectrum van... (iets ingewikkeld)
#LiF kristalliseert zoals NaCl in kubische cel met parameter a = 0,4026 nm. We gebruiken CuKa straling en een kristal met dimensie 0,2x0,2x0,2.
#*Geef de ab-projectie van de structuur.
#*Geef de reciproke parameters.
#*netvlakken 003 en 004: welke heeft grootste intensiteit van de gereflecteerde straal?
#*Wat gebeurt met deze reflecties (dus hoek, intensiteit, fase) als we F vervangen door I. Wat gebeurt er als we de afmetingen van het kristal verdubbelen?
#*Welke zijn de grootste pieken in de Pattersonfunctie?

=== Vragen eerste zit dinsdag 27 juni 2006 (Geologie) ===
(dit waren vragen van geologie, zij hebben ook een deel poederdiffractie dat voor fysici niet gekend hoeft te zijn)

*teken de ruimtegroep Pncm (a,b-projectie)
Geef equivalente posities, multipliciteit en assymmetrische eenheid

Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid?

Geef twee speciale posities

*stellingen:
De atomen in perovskiet liggen allemaal op speciale posities

De ruimtegroepen P2/c en Pc behoren tot zelfde pattersongroep

*loodoxide PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel
a=3,975 A en c=5,023 A
atomen liggen op de posities:
Pb(1): 0 Â½ 0.2385
Pb(2): Â½ 0 -0.2385
O(1): 0 0 0
O(2): Â½ Â½ 0
Teken een a,b-projectie van de eenheidscel en beschrijf de omringing van de loodatomen met behulp van een puntgroep

Welk Bravaisrooster?

Bepaal voor de reflectie (110) de fase van de structuurfactor en intensiteit
Teken het vlak (110) en de invallende en afgebogen bundel bij op de a,b-projectie bij gebruik van CuKÎ±

Bereken de positie van de diffractielijn op een Debye-Scherrer film
(camerastraal=28,7mm en CuKÎ±)

Teken schematisch de film

=== Vragen eerste zit donderdag 22 juni 2006 (Fysica) ===
*eerste vraag:
Teken een ab-projectie van de ruimtegroep Pmcb
en alles der op en der aan, puntgroep, patterson, equivalente posities...

*Tweede vraag:
Zijn volgende stellingen waar, verklaar:
1. kan men uit een diffractie patroon de aanwezigheid opmaken van een S4 as?
2. Is de R-waarde een maat voor de resolutie van een diffractie?
3. Is dit het NMR spectrum van ... (een onuitspreekbare naam)

*Derde vraag:
Oefeningen op een hexagonaal stelsel CadmiumdiJood met straling bepalen en uittekenen.</text>

Vergelijkende Ontwikkelingsbiologie

2019-06-17T08:44:12Z

DevlinVanAssche: /* Examenvragen juni */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
Vergelijkende ontwikkelingsbiologie behoort tot de opleiding Biologie en behoort tot de minoren biologie en verbreding (sinds 2018-2019). Het wordt gedoceerd door prof. E. Seuntjes.
Het vak behandelt de ontwikkeling van verschillende embryo's van verschillende organismen (muis, kip, kikker en mens). Er worden practica sessies gegeven, met een eindexamen voor de quotering (5/20). Om te slagen voor het vak moet minstens de helft worden behaalt op het practicumexamen. Een paperopdracht met vragenlijst telt mee voor 1/20. Het theoretisch examen telt dus mee voor 14/20.

==Examenvragen juni==

=== 17/06/2019 VM ===
# Epibolie, capacitatie, morfogen
# De hele ontwikkeling van de hersenschors uitleggen + legende aanvullen op algemeen schema.
# Experiment amputatie salamander en nAG uitleggen.
# Op welke drie organen hebben de mesenchymale cellen van het hart een invloed tijdens de ontwikkeling van het embryo.

=== 14/06/2019 NM ===
# Meroblastische klieving, spermiogenese, pluripotent
# Leg de eigenschappen van een organizer uit aan de hand van de experimenten van Spemann en Manngolg.
# Experiment bij nierontwikkeling, wat hebben Ret en GNDF met de nierontwikkeling te maken?
# Wat zijn de mogelijke moleculaire en morfologische eigenschappen van anencephalie (het ontbreken van hersenen).

=== 11/06/2019 NM ===
# Termen: Resact, angiogenese, neoblasten.
# Leg de gastrulatie bij de kip uit en vergelijk met de mens.
# Leg inducer en competentie uit adhv de oogontwikkeling en onderstaand experiment (dat waarbij ze optische vesikel wegnamen en transplanteerde). (oogontwikkeling moet niet volledig worden uitgetekend, gewoon algemeen).
# Wat is het verschil tussen een eeneiïge en Siamese tweeling? Leg dit uit adhv de ontstaansmechanismen.

=== 11/06/2019 VM ===
# Termen: morphallaxis, pronefros, midblastula transitie.
# Hoe zorgt de zee-egel voor soort-specifieke fertilisatie?
# Experiment BMP en medial hinge point, neurulatie en BMP signaling uitleggen.
# Experiment Gurdon + vervolg experiment ivm iPS. Wat is het verband tussen de 2, leg beide experimenten uit, wat zijn toepassingen van iPS?