Chemika Examenwiki - Gebruikersbijdragen [nl]

Gentechnologie

2020-08-28T15:26:29Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Prof Lavigne. Biochemie volgt het samen met bio-ingenieurs. Oefenzittingen verplicht. Als Lavigne een vraag stelt verwacht hij dat je elk deel van de vraag uitlegt ook al wordt het niet expliciet gevraagd. Bijvoorbeeld; geef de voor- en nadelen van PET en pPIC, dan moet je PET en pPIC volledig uitleggen.

==Examenvragen==

===28 augustus 2020===
# Leg PET en pBAD expressiesystemen uit. Vergelijk ze en wat zijn de voor- en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (Geen paginalimiet)
# Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)
#* Leg cosmide vectoren uit en hoe kloonbanken worden gemaakt.
#* CTAB methode
#* Chemische ‘heat shock’ transformatie van S. cerevisiae uitleggen
# Paeshuyse: ongeveer zoals in januari maar met SARS-Co2.

===22 januari 2020 ===
# Leg PET en pPIC expressiesystemen uit. Vergelijk ze en wat zijn de voor- en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
# Leg BAC vectoren in detail uit en hoe maak je een kloonbank aan de hand van deze vectoren. Hoe bereken je het minimum aantal klonen die nodig zijn om een representatieve genoombank te hebben met de formule van Carbon en Clarke, welke voorwaarden moeten hiervoor voldaan zijn? (1 pagina + eventueel achterkant)
# Geef de PCR parameters en PCR varianten die de specificiteit van PCR amplificatie verhogen. Leg telkens kort uit. (1 pagina + eventueel achterkant)
# Definities (1/3e pagina voor elk)
#* Leg gatewayclonering uit, werking en principe geven.
#* Transposonmutagenese uitleggen en hoe dit gescreend wordt?
#* Leg uit hoe men gisten chemisch transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.
# paeshuyse: humaan interferon lambda wil je produceren in een eukaryoot systeem. RNA sequentie is gegeven.
#* Welke gebruik je en beargumenteer.
#* Hoe ziet je vector en expressiecassette eruit? Benoem elke component + korte uitleg.
#* Teken primers met gegeven RE sites (Bamh1 & EcoR1) om de CDS in een vector te kloneren. Kozak sequentie ook gegeven.
#* Welke wijzigingen zijn nodig om dit gen in een plantenvector te kloneren? Teken de vector en de expressiecassette.

===30 augustus 2019 ===
#Bespreek de factoren van een PCR die de gevoeligheid kunnen verhogen. Ook de PCR afgeleidde technieken die de gevoeligheid voor nucleïnezuurdetectie kunnen verhogen.
#Bespreek het PET expressie systeem in E. coli, geef ook de voor en nadelen van expressie in deze bacterie.
#(Paashuyse) Je wil Anti-IgE produceren in CHO cellen m.b.v. een eukaryoot expressie systeem (geen gist of schimmel).
#* welk expressie systeem gebruik je? beargumenteer.
#* Teken de vector en verklaar alle factoren die je gebruikt.
#* Wat moet je veranderen aan de CHO cellen om de SV40 ori te kunnen gebruiken? wat is het voordeel van deze ori op replicatie.
#* Als je anti-IgE in planten cellen zou willen produceren, hoe ziet de vector er dan uit? leg alle factoren uit.
#Leg uit:
#* Definieer alles van BAC's
#* Gateway klonering
#* Capture techniek voor full length cDNA klonering
#Oefening: 2 exonen met sequentie waren gegeven, ook een tag met sequentie was gegeven. De bedoeling was om tag-exon1-exon2 te kloneren in een TOPO-T/A vector. Bespreek alle stappen van de klonering en beargumenteer.

===23 Januari 2019 ===
# Welke parameters hebben een negatieve invloed op PCR in verband met mutagenese (geef hierbij ook PCR-gebaseerde technieken van random/directe mutagenese zoals mismatch priming, error-prone PCR..)
# Vergelijk cosmide en BAC klonering en hoe bepaal je de complexiteit van genoombank (carbon clark)
# (Paashuyse): Klonering van een bepaald eiwit in rat cellen
#* A. Leg expressiesysteem uit
#* B. Teken vector en benoem/verklaar alle factoren die je gebruikt
#* c. Wat moet je veranderen aan de rat cellen om SV40 ori te kunnen gebruiken? en bespreek het effect op de replicatie
#* d. Doe hetzelfde maar dan in een planten cel, wat moet je veranderen? En teken de vector opnieuw met alle componenten
# Geef uitleg over
#* Taqman probe
#* CTAB methode
#* PET
# Oefening waarbij je een ori moest insereren in DNA, dit moest in frame zitten, de RE sites waren gegeven, bespreek je techniek en teken PCR primers die je hiervoor zou gebruiken

===31 Augustus 2018 ===
# Leg PET en pPIC expressiesystemen uit.Vergelijk ze en wat zijn de voor en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
#
#* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)
#* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Hoe bereken je het minimum aantal klonen met de formule van Carbon en Clarke en welke voorwaarden moeten voldoen zijn? (1 bladzijde)
# Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip):
#* A. Alkalische Lyse
#* B. Wat is de definitie van Hybrid Selected Translation?
#* C. Leg uit hoe men gisten transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.
# Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)
#* a. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.
#* b. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.

===24 januari 2018 ===
# Leg PET en pBAD expressiesystemen uit. Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
#
#* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)
#* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Geef ook uitleg bij Carbon & Clarke. (1 bladzijde)
# Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip):
#* A. CAPture techniek bij cDNA aanmaak
#* B. Taqman RT-PCR
#* C. Nodige elementen voor een episomaal shuttle-plasmide voor ''E. Coli'' en ''S. cerevesiae''
# Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)
#* A. Geef strategie (maak primers, staarten, restrictie) om uw insert in de entry-vector te krijgen.
#* B. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.
#* C. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.

===1 september 2017 VM===
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef PCR afgeleide technieken voor nucleïnezuren.
# Bespreek in detail en vergelijk het mechanisme van P1 en cosmide vectoren.
# Bespreek de werking en schets het principe van PET-expressie systeem. Wat zijn de voor- en nadelen?
# Kort omschrijven
#* Definieer en bespreek CAPture techniek werking
#* Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#* Bespreek het principe van Gateway klonering.
# Vraag Paeshuyse (oefening in verwerkt): allerlei gegevens (cDNA, knipplaatsen e.d.)
#* Welke eukaryoot expressies systeem (geen schimmel of gist) zou jij gebruiken (voor dit humaan recombinant eiwit)? Beargumenteer.
#* Teken de vector enzo.. (?)

===25 januari 2017 VM===
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid
# Bespreek de BAC clonering voor de aanmaak van banken.
# Wat zijn de voordelen van recombinante expressie in gist? Vector pPIC wordt veel gebruikt in de industrie. Bespreek pPIC.
# Kort omschrijven
#*DNA shuffeling
#*CAPture techniek werking
#*Principe van TOPO-gemedieerde klonering
#oefening: Gegevens over enzymen, genoom van 1,6*^10-4, enzym knipt in 1 à 2 kb fragmenten, foto van gelleke. Hoeveel recombinante moet je hebben om met 99% zekerheid te zeggen dat je sequentie aanwezig is? Nog een vraag. (Rekenmachine nodig!)
#Vraag Paeshuyse: Creëer een humaan, recombinant faag lambda ding (?) Welk expressiesysteem zou je gebruiken? Teken de vector die je gebruikt. Nog iets...

===januari 2016===
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid
# Voordelen van recombinante expressie in gist, leg die ene gistvector uit (pPIC heette die dacht ik?)
#Strategie voor het opstellen van een cosmidebank
# Termen: CTAB DNA extractie, Taqman, manieren van transformatie van gist
# Oefening met inverse PCR: vinden van primers en uittekenen van de techniek
Volckaert:
# Relatie Tm/zoutconcentratie (monovalente kationen)
# De factoren die de renaturatie beinvloeden + verschil in gebruik van PNA, LNA en DNA als proben
# Geef structuur van guanidinium isothiocyanaat en guanidinium thiocyanaat, waarvoor wordt dit molecule gebruikt
# structuur van merker gegeven, leg uit waar onderdelen voor bedoeld zijn en benoem ze

===20 januari 2015===
#Bespreek en vergelijk de verschillende PCR technieken voor zowel gerichte als random mutagenese.
#Bespreek in detail het mechanisme van P1 faag en een cosmide en vergelijk.
#Bespreek en schematiseer het principe van de capillaire Sanger sequentie.
#Kleine vraagjes:
##Belang van humanisering bijÂ Philia pastoris
##Definieer de CAPture techniek
##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#Oefening: Je moet 2 exons (sequenties gegeven) van een bepaald gen aan elkaar ligeren (zonder een linker tussen). En deze C-terminaal aan een â€˜Strepâ€™-tag hangen (sequentie gegeven) en deze inbrengen in een vector die T-overhang heeft door TOPO. (verschillende stappen bespreken + primers geven!) (praktisch dezelfde oefening als de voorbije 2 jaar in januari)
Volckaert 1. Geef de structuurformule van guanidinium (iso)thiocyanaat en waar het voor wordt gebruikt. 2. Leg chemische synthese van oligonucleotiden met een 5â€™ fosfaat uit (of teken) + geef voordeel hiervan. 3. Leg uit hoe DNA probes niet-radioactief gelabeld (en eventueel onder welke voorwaarden) kunnen worden met behulp van een streptavidine-alkalisch fosfatase fusie-eiwit 4a. T4 polynucleotide kinase werd vroeger gebruikt om uiteinden te fosforyleren zodat fragmenten geligeerd kunnen worden. Nu kan dit direct gebeuren bij de oligonucleotide synthese. Hoe doen ze dit? Bespreek (en of teken) dit. 4b. Wat is het voordeel hiervan? 5. Bespreek de relatieve Tm van DNA en LNA met betrekking tot hun gebruik in hybridisatie en mismatchgevoeligheid.

=== 21 januari 2014 ===
#Bespreek algemeen principe van PCR en de reactiecomponenten. Bespreek afgeleide technieken die gebruikt worden om de specificiteit van de PCR-reactie te verhogen. (onbeperkte antwoordruimte)
#Bespreek achtergrond en werking van cosmide (1pag)
##Bespreek en vergelijk pET en pBAD (1pag)
#Korte vraagjes: Lavigne
##Bespreek CAPture techniek
##Bespreek de elementen die een YAC-kloneringsvector bevat. Bespreek Gateway klonering

=== 22 januari 2013 ===
#Bespreek vectorsystemen voor het insereren van grote (>30kb) DNA-sequenties. Bespreek de formule van Carbon & Clarke.
#Technieken: Okayama & Berg SAGE
#Kleine vragen (Lavigne):
##Wat is error-prone PCR en hoe kan je het gebruiken in "directed evolution"?
##Bespreek en schets het PET-expressie systeem.
##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#SitueerÂ ???,Â ??? enÂ ??? in de historiek van de gentechnologie. Het rspL gen was Ã©Ã©n van de eerste genen die gebruikt werd voor positieve selectie. Leg uit waarvoor dit gen codeert en hoe de selectie gebeurt. Oefening: Sequentie met exons en introns gegeven. Ontwerp een techniek om de eerste twee exons aan elkaar te ligeren en in te bouwen in de gegeven vector (TOPO T/A vector), met een N-terminale STREP-tag (sequentie voor de STREP-tag was gegeven). Beschrijf en verantwoord elke stap.

===6 augustus 2012===
Â #Kunkel tot in detail bespreken Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli. Is dit hetzelfde bij de afgeleide vectors van ColE1? (pBR322,...)
#twee vraagjes Carbon en Clarke RAcE schetsen en uitleggen (beide)
#kleine vraagjes:
##Bespreek COS-cellen URA3 (waarom belangrijke merker)
##Inclusion bodies (wat, wanneer, gewenst?)
##Duid het juiste aan: de zoutconcentratie doet Tm stijgen/dalen/beÃ¯nvloedt Tm niet + uitleggen waarom.
##synthesevraag: biotine-merking bij nucleÃ¯nezuurhybridisatie, alles uitleggen (hoe probe maken, hybridisatie, detectie)

===23 Jan 2012 NM===
#Kunkel Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli
#Bespreek de mogelijke kloneringsvectoren in gist
#Kleine vragen:
##Co-transformatie bij dieren
##Bespreek doel van de technieken: oligocapping en capture
##Hot-start PCR Chromosome jumping

===31 Jan 2011 NM===
#Bespreek de filamentaire fagen(M13, F1,...), hun eigenschappen, hun replicatie in E.coli en hoe zijn ze aangepast voor het gebruik als vectoren.
#Bespreek het pMAL expressiesysteem voor de synthese van eiwitten via recombinanten.
#Bijvragen:
##Hoe kan je het nodige aantal klonen bepalen voor een goede genoombank
##Bespreek die PiAN vectoren Kleine vragen:
##Wat is de N-regel van Varshavsky COSvectoren
##Wat is Spi-selectie Waarvoor dient Capping bij de synthese van oligonucleotiden?
#Mondeling: cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman Methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese Hoe wordt de smelttemperatuur bepaalt SAGE

===17 Jan 2011 VM===
#Fosforamidietcyclus (cyclus, beschermgroepen, capping,...)
#Welke problemen bij aanmaken van cosmide vectoren en welke oplossingen hiervoor?
#Bijvragen:
##Okayama & Berg
##cDNA klonering in een vector Methode van Henikoff voor systematische deleties
#Kleine vragen
##IPTG sacB
##Carbon & Clarke vgl. (aantal klonen in een cDNA bank)
##Guanidiniumzouten
#Mondeling: pMal expressiesystemen Kunkel Eckstein Pyrosequencing SOE

===17 Jan 2011 VM===
#Aanmaak genoombanken soorten gistvectoren
#Bijvragen:
##fotolithografische DNA synthese alkalische fosfatasen + toepassingen
#Kleine vragen
##'hotstart' PCR Guanidinium thiocyanide biotine merking bij hybridisatie
##URA3 Modeling: pyrosequencing
##Methode van Eckstein CAPture SOE pMAL

===23 aug 2010 VM===
#pyrosequencing soorten faag lambda vectoren Bijvragen: methode van Gubler en Hoffman chromosoomwalking
#Kleine vragen:
##nested PCR capping in fosforamidietcyclus hoe het aantal klonen in een cDNA bank benaderen
##PNA Modeling: methode van Okyama en Berg
##biotine merking bij hybridisatie alkalische hydrolyse van RNA Spi selectie pMAL

===26 jan 2010 VM===
#Bespreek cosmide vectoren en hoe ze efficient te gebruiken zijn.
#Leg de methode van Hoffman en Gubler voor cDNA synthese uit.
#Bijvragen:
##Welke vectorsystemen voor gist zijn er beschikbaar?
##Leg de pSC101 ori uit.
#Kleine vragen:
##Oclusion body's: wat, wanneer, nut?
##CI gen: wat en waarvoor gebruikt in de gentechnologie?
##Universele splicing van ssDNA met fokI.
##Modeling: Fosforamidiet versus fosfonaat methode.
##EtBr en SYBR.
##Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese.
##Biotine merking.
##ZOO blot.

===25 jan 2010 VM===
#Bespreek de aanmaak van genoombanken (vectoren, inbouwmechanismen, enz.)
#Bespreek de methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese.
#Bijvragen:
##Welke vectoren voor klonering in gist?
##Wat zijn positieve en negatieve selectie voor klonering en geef voorbeelden.
#Kleine vragen:
##Nested PCR uitleggen.
##T4 en T7 zijn beide bacteriofaag polymerasen.
##Bespreek hun activiteit(en) en toepassingen.
##Type1, type2, type3, type2s, iso en neochizomeren, waarin verschillen deze restrictie enzymen?
##Hoeveel kloonen nodig in een genoom bank?
#Mondeling: Okyama en berg Spi selectie Alkalische hydrolyse van RNA pMAL
#Hoe wordt biotine gebruikt bij hybridisatie

===25 jan 2010 VM===
#Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering, detailleer elke reactiestap.
#Bijvragen:
##Fosforamidiet synthesecyclus
##Welke soorten alkalische fosfatase gebruiken we in de gentechnologie?
##Schets hun gebruik.
#Kleine vragen:
##Lamba ZAP vector
##Aan- en afwezigheid van rop in colE1-afgeleide plasmide en de invloed ervan op aantal plasmide in E.coli.
##Aantal kloons in een genoombank.
##Nested PCR Mondeling: pMAL expressiesysteem
##Pyrosequencing RDA Ligatiemechanisme Eckstein

===14 jan 2010===
#Geef de belangrijkste biologische functies van de filamentaire faag vectoren en hoe deze gebruikt werden om vectoren mee te maken.Welke soorten faag lambda vectoren zijn er en schets kort hun gebruik
#Bijvragen:
##cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman.
##Detailleer elke reactiestap.
##Wat is chromosome walking en hoe werkt het.
#Kleine vragen:
##Wat is en waarvoor dient de capping bij de synthese van oligonucleotiden.
##Exonuclease III
##Hoe bepalen we het aantal kloons dat nodig is bij het opstellen van een genoombank.
##Inverse PCR Mondeling: pMal
##LCR Puntmutaties volgens Eckstein Mu-2 gistvector
##Pyrosequencing

===30 jan 2009===
#fosforamidiet synthesecyclus geven problemen klonering met cosmidevectoren + oplossingen
#Bijvragen:
##okyama en berg progressieve deleties met exonuclease III
#Kleine vragenÂ :
##IPTG sacB carbon en clarke vgl rol guanidinimun zouten + structuur
#Mondeling: RDA pyrosequencing eckstein pMal lambda zap

===30 jan 2009===
#Soorten Bacteriofaag lamda vectoren pET expressie vector systeem
#Bijvragen
##Pyrosequencing Gubler-Hoffman cDNA synthese
# Kleine vragen
##Tm voor oligonucleotiden sacB en toepassing in Gentechnolgie Statistische benadering genoom insertie PNA + structuur
#Mondeling: inverse PCR Eckstein RDA SOE CAPture

===27 jan 2009Â ===
#replicatiemechanisme, regulatie en aantal kopieÃ«n ColE1-afgeleide vectoren Soorten bacteriofaag lambda vectoren en hun werking schetsen
#Bijvragen:
##cDNA klonering (Gubler & Hoffman, Okayama & Berg)
##chromosoom walking
#Kleine vragen:
##inverse PCR Tth DNA polymerase (wat speciaal en welke extra mogelijkheden daardoor)
##capping in fosforamidiet, wat en waarom
##hoe bereken je aantal kloons in genomische DNA bank exonuclease III
#Mondeling: SOE SAGE pMAL plaatsgerichte mutagenese volgens Kunkel pyrosequencing

===24 jan 2008===
#Bespreek het replicatiemechanisme van ColE1- en afgeleide vectoren, de regulatie en het aantal plasmiden
#Bespreek methoden om gen-gericht een genomische bank te screenen aan de hand van 'informatie'
#Geef twee technieken voor positieve selectie van plasmiden
#Geef de methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese
#Kleine vragen
##Hoe kan de het cI gen voor positieve selectie zorgen?
##Wat is een moleculair baken ('molecular beacon')?
##Bespreek de twee soorten SV40 vectoren en het verschil Touch-down PCR
##Hoe kunnen we er voor zorgen dat er geselecteerd wordt op de mogelijkheid om te transformeren (of zo)?
#Technieken: Pyrosequencing pET SOE Okyama-Berg ligatiemechanisme

===23 jan 2008===
#Fotolithografische DNA synhtese: bescrhijf en verklaar.
#Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering: wat zijn de voor/ nadelen?
#Middelgrote vragen:
##Welke problemen zijn er bij het kloneren in cosmidevectoren en hoe hebben ze dit opgelost?
##Pyrosequencing: beschrijf, wat zijn voor/nadelen tov dideoxymethode
#Kleine vragen:
##Wat is IPTG: structuur, gebruik
##Wat is de par locus
##Wat is PNA: structuur
##Wat is T4 polynucleotide kinase, waarom is dit belangrijk in gentechnologie, reactiemechanisme?
#Technieken: SOE CAPture EtBr pMAL Eckstein

===14 jan 2008===
#Welke mogelijkheden zijn er om plaatsgerichte mutagenese te doen?
#Vertel alles over LITMUS vectoren (Waarom in godsnaam is dit een hoofdvraag?)
#Bijvragen:
##Welke problemen kunnen er zijn bij het kloneren in cosmidevectoren?
##Hoe hebben ze die omzeild? Schets de Okyama-Berg procedure.
##Wat zijn de voor- en nadelen?
#Bij-bijvragen:
##Hoe is sacB een positief selectiekenmerk?
##Waarvoor staat spi selectie?
##Geef de 2 soorten SV40 vectoren + leg het verschil uit waarom worden er andere Tm-uitdrukkingen gebruikt voor oligonucleotiden en hele strengen?
#Mondeling: RDA Pyrosequencing inteÃ¯ne verwerking inverse PCR cap selectie

===31 jan 2007===
#alles van cosmiden bespreken. alles van SV40 bespreken.
#Middelgrote vragen:
##pyrosequencing
##cassettemutagenese
#Kleine vragen:
##verschil southern en western blotting
##ethidiumbromide, structuur, problemen,
##gebruik Spi selectie inverse PCR
##wat is shearing
#Technieken: Formule om het aantal klones te berekenen voor gDNA bank Oligocapping SOE ligatiemechanisme Eckstein Okayama en Berg

===23 jan 2007===
#bespreek belangrijkste methoden voor site directed mutagenese bespreek replicatiemechanisme in pBR322
#welke verschillende strategien worden gebruikt met op lambda gebaseerde vectoren technieken met Ti vectoren
#Mondeling: nested PCR quenching hoe beinvloed de DNA concentratie het werken met cosmiden en verklaar

===19 jan 2007===
#Geef en bespreek enkele voorbeelden van het gebruik van alkalische fosfatasen.
#Bespreek de eigenchappen en kenmerken van de pUC vectoren.
#Vectoren afgeleid van bacteriofaag lambda.
#SV40 vectoren.
#Kleine vragen:
##Genotype van een E.Coli stam opdat deze geÃ¯nfecteerd kan worden door M13.
##Bespreek incompatibiliteit van plasmiden.
#Mondeling voor te stellen technieken: SOE Pyrosequencing Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese Nick translatie<

Veredeling en Biotechnologie

2020-08-17T20:58:22Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.

==Examenvragen==
===17 Augustus 2020 VM===
====Dier====
#Bedrijf in Leuven voor biologisch varkensvlees.
#Fokwaardeschatting uitleggen met een concreet voorbeeld.
#schaap doodgebeten door hond of wolf?

====Plant====
#pedigree methode uitleggen, voor- en nadelen, vergelijken met SSD en hoe beter maken met merkers?
#CGMS
#BSA

===30 Januari 2020 VM===
====Dier====
#Bedrijf is Leuven voor hamproductie met veel smaak. Hoe ga je dit doen? ((Bijvraag: over welk vet (intracellulair vet), welk dier (Iberico))
#heterosis, wat is het en hoe komt het? (teken het schema, met de getallen van dominante en additieve effecten)
#hoe maak je varkens resistent tegen een virus? door receptor te muteren of backcrossing met resistente varkens ((Bijvragen: waarom geen CRISPR/Cas (EU) en hoe heet die kruising (veredelingskruising))

====Plant====
#Recurrent selection, principe en hoe ga je het doen? Wat is het uiteindelijk resultaat, cultivar? Waarvoor kan je het gebruiken? Verschil tussen GCA en SCA, wat kan je hiermee doen? Hoe maak je GCA/SCA recurrent selection en waarvoor kan je ze gebruiken? Bijvragen over de verschillende soorten recurrent selection.
#Brassicaceae type zelf incompatibiliteit. Moleculair/genetisch/cellulair mechanisme
#barnase en barstar. Toepassing in veredeling?

===29 Januari 2020 VM===
====Dier====
#Een lam voor vlees in Leuven, hoe?
#recombination loss
#z gelinkte veren bij kippen

====Plant====
#F1 hybride geef de stappen voor dit op te stellen en het gebruik daarvan
#tweepuntskruising en driepuntskruisen
#F1 steriliteit en waarom is GxE belangrijk?

===28 Januari 2020 VM===
====Dier====
#Ik heb een stuk grond in Leuven en ik wil een geit met veel melkproductie, wat doe ik?
#Verdringingskruising uitleggen en tekenen met een schema
#Hoe polygene eigenschappen opsporen met merkers en specifiek vb uitleggen

====Plant====
#Pedigree methode uitleggen en vergelijken met bulk en SSD. Voor en nadelen van de pedigree methode en hoe kunnen moleculair merkers helpen?
#Triploid block
#SPA en voor en nadelen

===28 Januari 2020 NM===
====Dier====
#In Togo heb je een bedrijf voor geitenmelk. Hoe zou je via genetica dit optimaliseren.
#Kunstmatige bevruchting van vissen in aquacultuur uitleggen. Zijn hier problemen mee? Geef een voorbeeld.
#Een bedrijf wordt ervan verdacht paardenvlees in de lasagne te gebruiken en dit niet te vermelden op het etiket. Stel een genetische test op om dit te achterhalen, hoe werkt de test?

====Plant====
#Wat zijn doubled haploids? Hoe worden ze algemeen gemaakt en geef een voorbeeld? Waarvoor zouden DH's gebruikt kunnen worden in veredeling?
#Geef het Solonaceae type zelf incompatibiliteit, moleculair en cellulair. Is dit gametofytisch of sporofytisch? is dit self recognition based of non-self? Wat zijn de complicaties in veredeling voor gewassen met dit soort ZI.
#Wat is bulked segregant analysis?

=== 17 januari 2019 VM===
====DIER====
#Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?
#Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?

====PLANT====
Mondeling
#Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?
Schriftelijk
#Dominantie epistasie
#Triploid block
#Simple QTL

===17 januari 2019 NM===
====DIER====
#Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen
#Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren
====PLANT====
#Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen
#Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan
#Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL
#Leg solanaceae-type self incompatibility uit

===30 januari 2019 NM===
====DIER====
#konijnen kweken; voor welke eigenschappen en hoe ga je te werk?
#Je wil dezelfde spiergroei kenmerkend voor Belgisch Wit-Blauw in geiten, hoe ga je te werk?
====PLANT====
Mondeling
#Leg uit Backcrossing, hoe kunnen moleculaire merkers het proces versnellen?
Schriftelijk
#Brassicaceae type zelf incompatibiliteit
#Heterosis en transgenese
#Leg uit apomixie

===23 augustus 2019 VM===
====DIER====
#kwaliteitsvol vlees, welke dieren en waarom?
#schaap met goede vruchtbaarheid naar een ander schaap overbrengen, hoe ga je te werk?

====PLANT====
#Dubbele haploiden
#BSA
#F1 steriliteit
#overerfbaarheid (enge, brede zin)

===4 september 2019 NM===
====DIER====
#Wat is heterosis? Hoe ga je dit gebruiken bij het selecteren van varkens?
#Dood schaap gevonden met een bijwoonde. Hond of wolf? Wat ga je doen, leg elke stap uit?

====PLANT====
#Backcrossing, wat is het, hoe doe je het en welke moleculaire merkers kunnen BC versnellen?
#CGMS
#SPA (QTL) mapping
#Zaadloze vruchten, hoe ga je dit bekomen?

=== 17 januari 2018 ===
====Plant====
# Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)
# Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?
# Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.
# Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?

====Dier====
# Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.
# Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?

===28 januari 2008===
#Vraag 1:
##Hardy-Weinberg
##genetische winst
##cytoplasmatische mannelijke steriliteit
##RNase
##transgressieve segregatie
##monosoom
##chimeer
##parthenogenie
##algemene combinatiegeschiktheid
##inteeltdepressie
#Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen
#Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploÃ¯die en autotetraploÃ¯die
#Bestendigheid: hoe bekomen?

===23 januari 2009===
====DIER====
#Vraag 1:
##Fokwaardeschatting
##SNP
##Recombinatiefractie
#Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening metÂ : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)
====PLANT====
#Vraag 1:
##Allelfrequentie
##Recurrente ouder
##Specifieke combinatiegeschiktheid
##Trisoom
##Insectenbestuiver
##QTL
#Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.
#Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)

===21 september 2009===
#Vraag 1:
##Overerfbaarheid
##SNP
##Koppelingsanalyse
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Antherencultuur
##Heterozygotie
##Inteeltdepressie
##Cultivar
##Monosoom
#(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschemaâ€™s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld.Â
#(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus.Â
#(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploÃ¯diegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiÃ«nt bij alloploÃ¯den als autoploÃ¯den?

===24 januari 2013===
====DIER====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##Fokwaarde
##Allelfrequentie
#musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##AFLP
##Heterozygositeit
##CoÃ«volutie
##PrefertilisatiebarriÃ¨re
##Genetische vooruitgang
#Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak.Â
#Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.

===23 januari 2014===
====DIERÂ ====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Heterozygoot (ivm merkers)
##AFLP
##...
#Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven.Â
#Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken.Â
#CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.
====DIER====
#Vraag 1:
##Zuivere lijn
##Bulmer effect
#Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Multitlijnveredeling(ivm merkers)
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Effectief aantal allelen
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Wat maakt een cultivar bestendig?Â
#Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken?Â
#Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.
====DIER====
#Vraag 1:
##Inteeltdepressie
##Stamboek
#Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Dominante merker
##CMS
##Transgressieve segregatie
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters?Â
#Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren.Â
#Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.

====DIER====
#Vraag 1:
##Fokdoel
##Heterosis
#Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Merkerdensiteit
##Genetisch recurrente selectie
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploÃ¯de of een autotetraploÃ¯de?Â
#Leg schema uit: synthetische cultivarÂ
===27 januari 2015===
====DIER====
#begrippen
##selectierespons
##multiplex PCR
##stressgen
#Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?
====PLANT====
#Begrippen
##QTL
##merkerdensiteit
##isolijn
##specifieke combinatiegeschiktheid
#Vragen
##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar.
##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)

===21 januari 2016===
====PLANT====
#woordjes
##dominante merker
##simmulariteitscoÃ«fficient
##algemene recombinatiegeschiktheid
##fenotypische recurrente selectie
#vragen
##bestendigheid realiseren hoe?
##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap
##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur
====DIER====
#Genomic selection
##op welk dier en welke eigenschap
##waarom
##hoe
#PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld
===14 januari 2016===
====PLANT====
SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie
Tekening van inteelt bij maïs
De vraag van tarwe, bulk, en single-seed
====DIER====
#Veredelings- en rotatiekruising
#Genetische test voor vruchtbaarheid maken

===14 januari 2016 (2)===
====PLANT====
#heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP
#wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?
# mondeling bespreking over artikel
#verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)
====DIER====
#schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?
#hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.

===31 januari 2017===
====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*CentiMorgan
#*SNP
#*genotype recurrente selectie
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?
#Artikel
#Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.
#Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?

===21 augustus 2017 NM ===

====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*aantal effectieve alleen
#*BSA (bulk segregant analysis)
#*recurrente ouder
#*isolijn
#Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?
#Artikel
#Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Vermeerderingspiramide
#Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.

=== 23 januari 2017 ===

====PLANT (Reeks 8) ====

Begrippen:

*AFLP
*Pre-fertilisatiebarrières
*Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)
*...

Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.

Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 27 augustus 2018 ===

====PLANT ====

Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden

*Apomixis
*Specifieke Combinatie Geschiktheid
*Merkerdensiteit

Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers

Vraag 3: Artikel

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

Veredeling en Biotechnologie

2020-08-17T20:58:02Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.

==Examenvragen==
===30 Januari 2020 VM===
====Dier====
#Bedrijf is Leuven voor hamproductie met veel smaak. Hoe ga je dit doen? ((Bijvraag: over welk vet (intracellulair vet), welk dier (Iberico))
#heterosis, wat is het en hoe komt het? (teken het schema, met de getallen van dominante en additieve effecten)
#hoe maak je varkens resistent tegen een virus? door receptor te muteren of backcrossing met resistente varkens ((Bijvragen: waarom geen CRISPR/Cas (EU) en hoe heet die kruising (veredelingskruising))

====Plant====
#Recurrent selection, principe en hoe ga je het doen? Wat is het uiteindelijk resultaat, cultivar? Waarvoor kan je het gebruiken? Verschil tussen GCA en SCA, wat kan je hiermee doen? Hoe maak je GCA/SCA recurrent selection en waarvoor kan je ze gebruiken? Bijvragen over de verschillende soorten recurrent selection.
#Brassicaceae type zelf incompatibiliteit. Moleculair/genetisch/cellulair mechanisme
#barnase en barstar. Toepassing in veredeling?

===29 Januari 2020 VM===
====Dier====
#Een lam voor vlees in Leuven, hoe?
#recombination loss
#z gelinkte veren bij kippen

====Plant====
#F1 hybride geef de stappen voor dit op te stellen en het gebruik daarvan
#tweepuntskruising en driepuntskruisen
#F1 steriliteit en waarom is GxE belangrijk?

===28 Januari 2020 VM===
====Dier====
#Ik heb een stuk grond in Leuven en ik wil een geit met veel melkproductie, wat doe ik?
#Verdringingskruising uitleggen en tekenen met een schema
#Hoe polygene eigenschappen opsporen met merkers en specifiek vb uitleggen

====Plant====
#Pedigree methode uitleggen en vergelijken met bulk en SSD. Voor en nadelen van de pedigree methode en hoe kunnen moleculair merkers helpen?
#Triploid block
#SPA en voor en nadelen

===28 Januari 2020 NM===
====Dier====
#In Togo heb je een bedrijf voor geitenmelk. Hoe zou je via genetica dit optimaliseren.
#Kunstmatige bevruchting van vissen in aquacultuur uitleggen. Zijn hier problemen mee? Geef een voorbeeld.
#Een bedrijf wordt ervan verdacht paardenvlees in de lasagne te gebruiken en dit niet te vermelden op het etiket. Stel een genetische test op om dit te achterhalen, hoe werkt de test?

====Plant====
#Wat zijn doubled haploids? Hoe worden ze algemeen gemaakt en geef een voorbeeld? Waarvoor zouden DH's gebruikt kunnen worden in veredeling?
#Geef het Solonaceae type zelf incompatibiliteit, moleculair en cellulair. Is dit gametofytisch of sporofytisch? is dit self recognition based of non-self? Wat zijn de complicaties in veredeling voor gewassen met dit soort ZI.
#Wat is bulked segregant analysis?

=== 17 januari 2019 VM===
====DIER====
#Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?
#Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?

====PLANT====
Mondeling
#Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?
Schriftelijk
#Dominantie epistasie
#Triploid block
#Simple QTL

===17 januari 2019 NM===
====DIER====
#Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen
#Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren
====PLANT====
#Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen
#Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan
#Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL
#Leg solanaceae-type self incompatibility uit

===30 januari 2019 NM===
====DIER====
#konijnen kweken; voor welke eigenschappen en hoe ga je te werk?
#Je wil dezelfde spiergroei kenmerkend voor Belgisch Wit-Blauw in geiten, hoe ga je te werk?
====PLANT====
Mondeling
#Leg uit Backcrossing, hoe kunnen moleculaire merkers het proces versnellen?
Schriftelijk
#Brassicaceae type zelf incompatibiliteit
#Heterosis en transgenese
#Leg uit apomixie

===23 augustus 2019 VM===
====DIER====
#kwaliteitsvol vlees, welke dieren en waarom?
#schaap met goede vruchtbaarheid naar een ander schaap overbrengen, hoe ga je te werk?

====PLANT====
#Dubbele haploiden
#BSA
#F1 steriliteit
#overerfbaarheid (enge, brede zin)

===4 september 2019 NM===
====DIER====
#Wat is heterosis? Hoe ga je dit gebruiken bij het selecteren van varkens?
#Dood schaap gevonden met een bijwoonde. Hond of wolf? Wat ga je doen, leg elke stap uit?

====PLANT====
#Backcrossing, wat is het, hoe doe je het en welke moleculaire merkers kunnen BC versnellen?
#CGMS
#SPA (QTL) mapping
#Zaadloze vruchten, hoe ga je dit bekomen?

=== 17 januari 2018 ===
====Plant====
# Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)
# Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?
# Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.
# Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?

====Dier====
# Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.
# Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?

===28 januari 2008===
#Vraag 1:
##Hardy-Weinberg
##genetische winst
##cytoplasmatische mannelijke steriliteit
##RNase
##transgressieve segregatie
##monosoom
##chimeer
##parthenogenie
##algemene combinatiegeschiktheid
##inteeltdepressie
#Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen
#Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploÃ¯die en autotetraploÃ¯die
#Bestendigheid: hoe bekomen?

===23 januari 2009===
====DIER====
#Vraag 1:
##Fokwaardeschatting
##SNP
##Recombinatiefractie
#Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening metÂ : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)
====PLANT====
#Vraag 1:
##Allelfrequentie
##Recurrente ouder
##Specifieke combinatiegeschiktheid
##Trisoom
##Insectenbestuiver
##QTL
#Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.
#Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)

===21 september 2009===
#Vraag 1:
##Overerfbaarheid
##SNP
##Koppelingsanalyse
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Antherencultuur
##Heterozygotie
##Inteeltdepressie
##Cultivar
##Monosoom
#(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschemaâ€™s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld.Â
#(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus.Â
#(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploÃ¯diegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiÃ«nt bij alloploÃ¯den als autoploÃ¯den?

===24 januari 2013===
====DIER====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##Fokwaarde
##Allelfrequentie
#musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##AFLP
##Heterozygositeit
##CoÃ«volutie
##PrefertilisatiebarriÃ¨re
##Genetische vooruitgang
#Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak.Â
#Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.

===23 januari 2014===
====DIERÂ ====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Heterozygoot (ivm merkers)
##AFLP
##...
#Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven.Â
#Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken.Â
#CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.
====DIER====
#Vraag 1:
##Zuivere lijn
##Bulmer effect
#Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Multitlijnveredeling(ivm merkers)
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Effectief aantal allelen
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Wat maakt een cultivar bestendig?Â
#Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken?Â
#Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.
====DIER====
#Vraag 1:
##Inteeltdepressie
##Stamboek
#Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Dominante merker
##CMS
##Transgressieve segregatie
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters?Â
#Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren.Â
#Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.

====DIER====
#Vraag 1:
##Fokdoel
##Heterosis
#Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Merkerdensiteit
##Genetisch recurrente selectie
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploÃ¯de of een autotetraploÃ¯de?Â
#Leg schema uit: synthetische cultivarÂ
===27 januari 2015===
====DIER====
#begrippen
##selectierespons
##multiplex PCR
##stressgen
#Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?
====PLANT====
#Begrippen
##QTL
##merkerdensiteit
##isolijn
##specifieke combinatiegeschiktheid
#Vragen
##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar.
##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)

===21 januari 2016===
====PLANT====
#woordjes
##dominante merker
##simmulariteitscoÃ«fficient
##algemene recombinatiegeschiktheid
##fenotypische recurrente selectie
#vragen
##bestendigheid realiseren hoe?
##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap
##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur
====DIER====
#Genomic selection
##op welk dier en welke eigenschap
##waarom
##hoe
#PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld
===14 januari 2016===
====PLANT====
SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie
Tekening van inteelt bij maïs
De vraag van tarwe, bulk, en single-seed
====DIER====
#Veredelings- en rotatiekruising
#Genetische test voor vruchtbaarheid maken

===14 januari 2016 (2)===
====PLANT====
#heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP
#wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?
# mondeling bespreking over artikel
#verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)
====DIER====
#schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?
#hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.

===31 januari 2017===
====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*CentiMorgan
#*SNP
#*genotype recurrente selectie
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?
#Artikel
#Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.
#Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?

===21 augustus 2017 NM ===

====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*aantal effectieve alleen
#*BSA (bulk segregant analysis)
#*recurrente ouder
#*isolijn
#Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?
#Artikel
#Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Vermeerderingspiramide
#Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.

=== 23 januari 2017 ===

====PLANT (Reeks 8) ====

Begrippen:

*AFLP
*Pre-fertilisatiebarrières
*Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)
*...

Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.

Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 27 augustus 2018 ===

====PLANT ====

Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden

*Apomixis
*Specifieke Combinatie Geschiktheid
*Merkerdensiteit

Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers

Vraag 3: Artikel

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

Veredeling en Biotechnologie

2020-08-17T20:57:12Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.

==Examenvragen==
===17 Augustus 2020 VM===
====Dier====
#Bedrijf in Leuven voor biologisch varkensvlees.
#Fokwaardeschatting uitleggen met een concreet voorbeeld.
#schaap doodgebeten door hond of wolf?

====Plant====
#pedigree methode uitleggen, voor- en nadelen, vergelijken met SSD en hoe beter maken met merkers?
#CGMS
#BSA

==Examenvragen==
===30 Januari 2020 VM===
====Dier====
#Bedrijf is Leuven voor hamproductie met veel smaak. Hoe ga je dit doen? ((Bijvraag: over welk vet (intracellulair vet), welk dier (Iberico))
#heterosis, wat is het en hoe komt het? (teken het schema, met de getallen van dominante en additieve effecten)
#hoe maak je varkens resistent tegen een virus? door receptor te muteren of backcrossing met resistente varkens ((Bijvragen: waarom geen CRISPR/Cas (EU) en hoe heet die kruising (veredelingskruising))

====Plant====
#Recurrent selection, principe en hoe ga je het doen? Wat is het uiteindelijk resultaat, cultivar? Waarvoor kan je het gebruiken? Verschil tussen GCA en SCA, wat kan je hiermee doen? Hoe maak je GCA/SCA recurrent selection en waarvoor kan je ze gebruiken? Bijvragen over de verschillende soorten recurrent selection.
#Brassicaceae type zelf incompatibiliteit. Moleculair/genetisch/cellulair mechanisme
#barnase en barstar. Toepassing in veredeling?

===29 Januari 2020 VM===
====Dier====
#Een lam voor vlees in Leuven, hoe?
#recombination loss
#z gelinkte veren bij kippen

====Plant====
#F1 hybride geef de stappen voor dit op te stellen en het gebruik daarvan
#tweepuntskruising en driepuntskruisen
#F1 steriliteit en waarom is GxE belangrijk?

===28 Januari 2020 VM===
====Dier====
#Ik heb een stuk grond in Leuven en ik wil een geit met veel melkproductie, wat doe ik?
#Verdringingskruising uitleggen en tekenen met een schema
#Hoe polygene eigenschappen opsporen met merkers en specifiek vb uitleggen

====Plant====
#Pedigree methode uitleggen en vergelijken met bulk en SSD. Voor en nadelen van de pedigree methode en hoe kunnen moleculair merkers helpen?
#Triploid block
#SPA en voor en nadelen

===28 Januari 2020 NM===
====Dier====
#In Togo heb je een bedrijf voor geitenmelk. Hoe zou je via genetica dit optimaliseren.
#Kunstmatige bevruchting van vissen in aquacultuur uitleggen. Zijn hier problemen mee? Geef een voorbeeld.
#Een bedrijf wordt ervan verdacht paardenvlees in de lasagne te gebruiken en dit niet te vermelden op het etiket. Stel een genetische test op om dit te achterhalen, hoe werkt de test?

====Plant====
#Wat zijn doubled haploids? Hoe worden ze algemeen gemaakt en geef een voorbeeld? Waarvoor zouden DH's gebruikt kunnen worden in veredeling?
#Geef het Solonaceae type zelf incompatibiliteit, moleculair en cellulair. Is dit gametofytisch of sporofytisch? is dit self recognition based of non-self? Wat zijn de complicaties in veredeling voor gewassen met dit soort ZI.
#Wat is bulked segregant analysis?

=== 17 januari 2019 VM===
====DIER====
#Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?
#Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?

====PLANT====
Mondeling
#Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?
Schriftelijk
#Dominantie epistasie
#Triploid block
#Simple QTL

===17 januari 2019 NM===
====DIER====
#Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen
#Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren
====PLANT====
#Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen
#Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan
#Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL
#Leg solanaceae-type self incompatibility uit

===30 januari 2019 NM===
====DIER====
#konijnen kweken; voor welke eigenschappen en hoe ga je te werk?
#Je wil dezelfde spiergroei kenmerkend voor Belgisch Wit-Blauw in geiten, hoe ga je te werk?
====PLANT====
Mondeling
#Leg uit Backcrossing, hoe kunnen moleculaire merkers het proces versnellen?
Schriftelijk
#Brassicaceae type zelf incompatibiliteit
#Heterosis en transgenese
#Leg uit apomixie

===23 augustus 2019 VM===
====DIER====
#kwaliteitsvol vlees, welke dieren en waarom?
#schaap met goede vruchtbaarheid naar een ander schaap overbrengen, hoe ga je te werk?

====PLANT====
#Dubbele haploiden
#BSA
#F1 steriliteit
#overerfbaarheid (enge, brede zin)

===4 september 2019 NM===
====DIER====
#Wat is heterosis? Hoe ga je dit gebruiken bij het selecteren van varkens?
#Dood schaap gevonden met een bijwoonde. Hond of wolf? Wat ga je doen, leg elke stap uit?

====PLANT====
#Backcrossing, wat is het, hoe doe je het en welke moleculaire merkers kunnen BC versnellen?
#CGMS
#SPA (QTL) mapping
#Zaadloze vruchten, hoe ga je dit bekomen?

=== 17 januari 2018 ===
====Plant====
# Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)
# Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?
# Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.
# Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?

====Dier====
# Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.
# Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?

===28 januari 2008===
#Vraag 1:
##Hardy-Weinberg
##genetische winst
##cytoplasmatische mannelijke steriliteit
##RNase
##transgressieve segregatie
##monosoom
##chimeer
##parthenogenie
##algemene combinatiegeschiktheid
##inteeltdepressie
#Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen
#Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploÃ¯die en autotetraploÃ¯die
#Bestendigheid: hoe bekomen?

===23 januari 2009===
====DIER====
#Vraag 1:
##Fokwaardeschatting
##SNP
##Recombinatiefractie
#Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening metÂ : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)
====PLANT====
#Vraag 1:
##Allelfrequentie
##Recurrente ouder
##Specifieke combinatiegeschiktheid
##Trisoom
##Insectenbestuiver
##QTL
#Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.
#Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)

===21 september 2009===
#Vraag 1:
##Overerfbaarheid
##SNP
##Koppelingsanalyse
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Antherencultuur
##Heterozygotie
##Inteeltdepressie
##Cultivar
##Monosoom
#(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschemaâ€™s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld.Â
#(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus.Â
#(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploÃ¯diegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiÃ«nt bij alloploÃ¯den als autoploÃ¯den?

===24 januari 2013===
====DIER====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##Fokwaarde
##Allelfrequentie
#musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##AFLP
##Heterozygositeit
##CoÃ«volutie
##PrefertilisatiebarriÃ¨re
##Genetische vooruitgang
#Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak.Â
#Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.

===23 januari 2014===
====DIERÂ ====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Heterozygoot (ivm merkers)
##AFLP
##...
#Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven.Â
#Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken.Â
#CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.
====DIER====
#Vraag 1:
##Zuivere lijn
##Bulmer effect
#Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Multitlijnveredeling(ivm merkers)
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Effectief aantal allelen
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Wat maakt een cultivar bestendig?Â
#Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken?Â
#Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.
====DIER====
#Vraag 1:
##Inteeltdepressie
##Stamboek
#Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Dominante merker
##CMS
##Transgressieve segregatie
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters?Â
#Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren.Â
#Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.

====DIER====
#Vraag 1:
##Fokdoel
##Heterosis
#Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Merkerdensiteit
##Genetisch recurrente selectie
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploÃ¯de of een autotetraploÃ¯de?Â
#Leg schema uit: synthetische cultivarÂ
===27 januari 2015===
====DIER====
#begrippen
##selectierespons
##multiplex PCR
##stressgen
#Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?
====PLANT====
#Begrippen
##QTL
##merkerdensiteit
##isolijn
##specifieke combinatiegeschiktheid
#Vragen
##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar.
##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)

===21 januari 2016===
====PLANT====
#woordjes
##dominante merker
##simmulariteitscoÃ«fficient
##algemene recombinatiegeschiktheid
##fenotypische recurrente selectie
#vragen
##bestendigheid realiseren hoe?
##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap
##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur
====DIER====
#Genomic selection
##op welk dier en welke eigenschap
##waarom
##hoe
#PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld
===14 januari 2016===
====PLANT====
SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie
Tekening van inteelt bij maïs
De vraag van tarwe, bulk, en single-seed
====DIER====
#Veredelings- en rotatiekruising
#Genetische test voor vruchtbaarheid maken

===14 januari 2016 (2)===
====PLANT====
#heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP
#wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?
# mondeling bespreking over artikel
#verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)
====DIER====
#schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?
#hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.

===31 januari 2017===
====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*CentiMorgan
#*SNP
#*genotype recurrente selectie
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?
#Artikel
#Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.
#Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?

===21 augustus 2017 NM ===

====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*aantal effectieve alleen
#*BSA (bulk segregant analysis)
#*recurrente ouder
#*isolijn
#Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?
#Artikel
#Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Vermeerderingspiramide
#Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.

=== 23 januari 2017 ===

====PLANT (Reeks 8) ====

Begrippen:

*AFLP
*Pre-fertilisatiebarrières
*Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)
*...

Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.

Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 27 augustus 2018 ===

====PLANT ====

Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden

*Apomixis
*Specifieke Combinatie Geschiktheid
*Merkerdensiteit

Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers

Vraag 3: Artikel

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

Model Organisms in Biological Research

2020-01-24T14:31:14Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */

[[Categorie: Mabb]]

== Vakinformatie ==
Model Organisms in biological research

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0G43AE.htm

== Examenvragen ==

'''2020 January'''

Give three tetrads

'''2019 January'''

QTL mapping

Optogenetics

give examples of prokaryotes in biological research and explain their use

what are terminator seeds, what is their use and given an example of how they work

'''2017-2018 January'''

Wich primates are used as model organism and for which applications?

Explain Tetrad analysis and the application.

Explain Pronucleus injection in mice and the application.

Explain foward genetics in ''C. elegans''.

Explain Cre recombinase system and how to use it giving examples

Gentechnologie

2020-01-22T13:14:09Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Prof Lavigne. Biochemie volgt het samen met bio-ingenieurs. Oefenzittingen verplicht.

==Examenvragen==

===22 januari 2020 ===
# Leg PET en pPIC expressiesystemen uit. Vergelijk ze en wat zijn de voor- en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
# Bespreek gedetailleerd Bac vectoren. Hoe bereken je het minimum aantal klonen met de formule van Carbon en Clarke en welke voorwaarden moeten voldoen zijn?
# Geef de PCR parameters en PCR varianten die de specificiteit verhogen. Leg telkens kort uit.
# Definities
#* Leg gatewayclonering uit, werking en principe geven.
#* Transposonmutagenese uitleggen en hoe dit gescreend wordt?
#* Leg uit hoe men gisten transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.
#paeshuyse

====30 augustus 2019 ====
#Bespreek de factoren van een PCR die de gevoeligheid kunnen verhogen. Ook de PCR afgeleidde technieken die de gevoeligheid voor nucleïnezuurdetectie kunnen verhogen.
#Bespreek het PET expressie systeem in E. coli, geef ook de voor en nadelen van expressie in deze bacterie.
#(Paashuyse) Je wil Anti-IgE produceren in CHO cellen m.b.v. een eukaryoot expressie systeem (geen gist of schimmel).
#* welk expressie systeem gebruik je? beargumenteer.
#* Teken de vector en verklaar alle factoren die je gebruikt.
#* Wat moet je veranderen aan de CHO cellen om de SV40 ori te kunnen gebruiken? wat is het voordeel van deze ori op replicatie.
#* Als je anti-IgE in planten cellen zou willen produceren, hoe ziet de vector er dan uit? leg alle factoren uit.
#Leg uit:
#* Definieer alles van BAC's
#* Gateway klonering
#* Capture techniek voor full length cDNA klonering
#Oefening: 2 exonen met sequentie waren gegeven, ook een tag met sequentie was gegeven. De bedoeling was om tag-exon1-exon2 te kloneren in een TOPO-T/A vector. Bespreek alle stappen van de klonering en beargumenteer.

====23 Januari 2019 ====
# Welke parameters hebben een negatieve invloed op PCR in verband met mutagenese (geef hierbij ook PCR-gebaseerde technieken van random/directe mutagenese zoals mismatch priming, error-prone PCR..)
# Vergelijk cosmide en BAC klonering en hoe bepaal je de complexiteit van genoombank (carbon clark)
# (Paashuyse): Klonering van een bepaald eiwit in rat cellen
#* A. Leg expressiesysteem uit
#* B. Teken vector en benoem/verklaar alle factoren die je gebruikt
#* c. Wat moet je veranderen aan de rat cellen om SV40 ori te kunnen gebruiken? en bespreek het effect op de replicatie
#* d. Doe hetzelfde maar dan in een planten cel, wat moet je veranderen? En teken de vector opnieuw met alle componenten
# Geef uitleg over
#* Taqman probe
#* CTAB methode
#* PET
# Oefening waarbij je een ori moest insereren in DNA, dit moest in frame zitten, de RE sites waren gegeven, bespreek je techniek en teken PCR primers die je hiervoor zou gebruiken

====31 Augustus 2018 ====
# Leg PET en pPIC expressiesystemen uit.Vergelijk ze en wat zijn de voor en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
#
#* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)
#* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Hoe bereken je het minimum aantal klonen met de formule van Carbon en Clarke en welke voorwaarden moeten voldoen zijn? (1 bladzijde)
# Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip):
#* A. Alkalische Lyse
#* B. Wat is de definitie van Hybrid Selected Translation?
#* C. Leg uit hoe men gisten transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.
# Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)
#* a. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.
#* b. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.

====24 januari 2018 ====
# Leg PET en pBAD expressiesystemen uit. Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
#
#* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)
#* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Geef ook uitleg bij Carbon & Clarke. (1 bladzijde)
# Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip):
#* A. CAPture techniek bij cDNA aanmaak
#* B. Taqman RT-PCR
#* C. Nodige elementen voor een episomaal shuttle-plasmide voor ''E. Coli'' en ''S. cerevesiae''
# Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)
#* A. Geef strategie (maak primers, staarten, restrictie) om uw insert in de entry-vector te krijgen.
#* B. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.
#* C. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.

====1 september 2017 VM====
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef PCR afgeleide technieken voor nucleïnezuren.
# Bespreek in detail en vergelijk het mechanisme van P1 en cosmide vectoren.
# Bespreek de werking en schets het principe van PET-expressie systeem. Wat zijn de voor- en nadelen?
# Kort omschrijven
#* Definieer en bespreek CAPture techniek werking
#* Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#* Bespreek het principe van Gateway klonering.
# Vraag Paeshuyse (oefening in verwerkt): allerlei gegevens (cDNA, knipplaatsen e.d.)
#* Welke eukaryoot expressies systeem (geen schimmel of gist) zou jij gebruiken (voor dit humaan recombinant eiwit)? Beargumenteer.
#* Teken de vector enzo.. (?)

====25 januari 2017 VM====
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid
# Bespreek de BAC clonering voor de aanmaak van banken.
# Wat zijn de voordelen van recombinante expressie in gist? Vector pPIC wordt veel gebruikt in de industrie. Bespreek pPIC.
# Kort omschrijven
#*DNA shuffeling
#*CAPture techniek werking
#*Principe van TOPO-gemedieerde klonering
#oefening: Gegevens over enzymen, genoom van 1,6*^10-4, enzym knipt in 1 à 2 kb fragmenten, foto van gelleke. Hoeveel recombinante moet je hebben om met 99% zekerheid te zeggen dat je sequentie aanwezig is? Nog een vraag. (Rekenmachine nodig!)
#Vraag Paeshuyse: Creëer een humaan, recombinant faag lambda ding (?) Welk expressiesysteem zou je gebruiken? Teken de vector die je gebruikt. Nog iets...

====januari 2016====
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid
# Voordelen van recombinante expressie in gist, leg die ene gistvector uit (pPIC heette die dacht ik?)
#Strategie voor het opstellen van een cosmidebank
# Termen: CTAB DNA extractie, Taqman, manieren van transformatie van gist
# Oefening met inverse PCR: vinden van primers en uittekenen van de techniek
Volckaert:
# Relatie Tm/zoutconcentratie (monovalente kationen)
# De factoren die de renaturatie beinvloeden + verschil in gebruik van PNA, LNA en DNA als proben
# Geef structuur van guanidinium isothiocyanaat en guanidinium thiocyanaat, waarvoor wordt dit molecule gebruikt
# structuur van merker gegeven, leg uit waar onderdelen voor bedoeld zijn en benoem ze

===20 januari 2015===
#Bespreek en vergelijk de verschillende PCR technieken voor zowel gerichte als random mutagenese.
#Bespreek in detail het mechanisme van P1 faag en een cosmide en vergelijk.
#Bespreek en schematiseer het principe van de capillaire Sanger sequentie.
#Kleine vraagjes:
##Belang van humanisering bijÂ Philia pastoris
##Definieer de CAPture techniek
##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#Oefening: Je moet 2 exons (sequenties gegeven) van een bepaald gen aan elkaar ligeren (zonder een linker tussen). En deze C-terminaal aan een â€˜Strepâ€™-tag hangen (sequentie gegeven) en deze inbrengen in een vector die T-overhang heeft door TOPO. (verschillende stappen bespreken + primers geven!) (praktisch dezelfde oefening als de voorbije 2 jaar in januari)
Volckaert 1. Geef de structuurformule van guanidinium (iso)thiocyanaat en waar het voor wordt gebruikt. 2. Leg chemische synthese van oligonucleotiden met een 5â€™ fosfaat uit (of teken) + geef voordeel hiervan. 3. Leg uit hoe DNA probes niet-radioactief gelabeld (en eventueel onder welke voorwaarden) kunnen worden met behulp van een streptavidine-alkalisch fosfatase fusie-eiwit 4a. T4 polynucleotide kinase werd vroeger gebruikt om uiteinden te fosforyleren zodat fragmenten geligeerd kunnen worden. Nu kan dit direct gebeuren bij de oligonucleotide synthese. Hoe doen ze dit? Bespreek (en of teken) dit. 4b. Wat is het voordeel hiervan? 5. Bespreek de relatieve Tm van DNA en LNA met betrekking tot hun gebruik in hybridisatie en mismatchgevoeligheid.

=== 21 januari 2014 ===
#Bespreek algemeen principe van PCR en de reactiecomponenten. Bespreek afgeleide technieken die gebruikt worden om de specificiteit van de PCR-reactie te verhogen. (onbeperkte antwoordruimte)
#Bespreek achtergrond en werking van cosmide (1pag)
##Bespreek en vergelijk pET en pBAD (1pag)
#Korte vraagjes: Lavigne
##Bespreek CAPture techniek
##Bespreek de elementen die een YAC-kloneringsvector bevat. Bespreek Gateway klonering

=== 22 januari 2013 ===
#Bespreek vectorsystemen voor het insereren van grote (>30kb) DNA-sequenties. Bespreek de formule van Carbon & Clarke.
#Technieken: Okayama & Berg SAGE
#Kleine vragen (Lavigne):
##Wat is error-prone PCR en hoe kan je het gebruiken in "directed evolution"?
##Bespreek en schets het PET-expressie systeem.
##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#SitueerÂ ???,Â ??? enÂ ??? in de historiek van de gentechnologie. Het rspL gen was Ã©Ã©n van de eerste genen die gebruikt werd voor positieve selectie. Leg uit waarvoor dit gen codeert en hoe de selectie gebeurt. Oefening: Sequentie met exons en introns gegeven. Ontwerp een techniek om de eerste twee exons aan elkaar te ligeren en in te bouwen in de gegeven vector (TOPO T/A vector), met een N-terminale STREP-tag (sequentie voor de STREP-tag was gegeven). Beschrijf en verantwoord elke stap.

===6 augustus 2012===
Â #Kunkel tot in detail bespreken Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli. Is dit hetzelfde bij de afgeleide vectors van ColE1? (pBR322,...)
#twee vraagjes Carbon en Clarke RAcE schetsen en uitleggen (beide)
#kleine vraagjes:
##Bespreek COS-cellen URA3 (waarom belangrijke merker)
##Inclusion bodies (wat, wanneer, gewenst?)
##Duid het juiste aan: de zoutconcentratie doet Tm stijgen/dalen/beÃ¯nvloedt Tm niet + uitleggen waarom.
##synthesevraag: biotine-merking bij nucleÃ¯nezuurhybridisatie, alles uitleggen (hoe probe maken, hybridisatie, detectie)

===23 Jan 2012 NM===
#Kunkel Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli
#Bespreek de mogelijke kloneringsvectoren in gist
#Kleine vragen:
##Co-transformatie bij dieren
##Bespreek doel van de technieken: oligocapping en capture
##Hot-start PCR Chromosome jumping

===31 Jan 2011 NM===
#Bespreek de filamentaire fagen(M13, F1,...), hun eigenschappen, hun replicatie in E.coli en hoe zijn ze aangepast voor het gebruik als vectoren.
#Bespreek het pMAL expressiesysteem voor de synthese van eiwitten via recombinanten.
#Bijvragen:
##Hoe kan je het nodige aantal klonen bepalen voor een goede genoombank
##Bespreek die PiAN vectoren Kleine vragen:
##Wat is de N-regel van Varshavsky COSvectoren
##Wat is Spi-selectie Waarvoor dient Capping bij de synthese van oligonucleotiden?
#Mondeling: cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman Methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese Hoe wordt de smelttemperatuur bepaalt SAGE

===17 Jan 2011 VM===
#Fosforamidietcyclus (cyclus, beschermgroepen, capping,...)
#Welke problemen bij aanmaken van cosmide vectoren en welke oplossingen hiervoor?
#Bijvragen:
##Okayama & Berg
##cDNA klonering in een vector Methode van Henikoff voor systematische deleties
#Kleine vragen
##IPTG sacB
##Carbon & Clarke vgl. (aantal klonen in een cDNA bank)
##Guanidiniumzouten
#Mondeling: pMal expressiesystemen Kunkel Eckstein Pyrosequencing SOE

===17 Jan 2011 VM===
#Aanmaak genoombanken soorten gistvectoren
#Bijvragen:
##fotolithografische DNA synthese alkalische fosfatasen + toepassingen
#Kleine vragen
##'hotstart' PCR Guanidinium thiocyanide biotine merking bij hybridisatie
##URA3 Modeling: pyrosequencing
##Methode van Eckstein CAPture SOE pMAL

===23 aug 2010 VM===
#pyrosequencing soorten faag lambda vectoren Bijvragen: methode van Gubler en Hoffman chromosoomwalking
#Kleine vragen:
##nested PCR capping in fosforamidietcyclus hoe het aantal klonen in een cDNA bank benaderen
##PNA Modeling: methode van Okyama en Berg
##biotine merking bij hybridisatie alkalische hydrolyse van RNA Spi selectie pMAL

===26 jan 2010 VM===
#Bespreek cosmide vectoren en hoe ze efficient te gebruiken zijn.
#Leg de methode van Hoffman en Gubler voor cDNA synthese uit.
#Bijvragen:
##Welke vectorsystemen voor gist zijn er beschikbaar?
##Leg de pSC101 ori uit.
#Kleine vragen:
##Oclusion body's: wat, wanneer, nut?
##CI gen: wat en waarvoor gebruikt in de gentechnologie?
##Universele splicing van ssDNA met fokI.
##Modeling: Fosforamidiet versus fosfonaat methode.
##EtBr en SYBR.
##Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese.
##Biotine merking.
##ZOO blot.

===25 jan 2010 VM===
#Bespreek de aanmaak van genoombanken (vectoren, inbouwmechanismen, enz.)
#Bespreek de methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese.
#Bijvragen:
##Welke vectoren voor klonering in gist?
##Wat zijn positieve en negatieve selectie voor klonering en geef voorbeelden.
#Kleine vragen:
##Nested PCR uitleggen.
##T4 en T7 zijn beide bacteriofaag polymerasen.
##Bespreek hun activiteit(en) en toepassingen.
##Type1, type2, type3, type2s, iso en neochizomeren, waarin verschillen deze restrictie enzymen?
##Hoeveel kloonen nodig in een genoom bank?
#Mondeling: Okyama en berg Spi selectie Alkalische hydrolyse van RNA pMAL
#Hoe wordt biotine gebruikt bij hybridisatie

===25 jan 2010 VM===
#Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering, detailleer elke reactiestap.
#Bijvragen:
##Fosforamidiet synthesecyclus
##Welke soorten alkalische fosfatase gebruiken we in de gentechnologie?
##Schets hun gebruik.
#Kleine vragen:
##Lamba ZAP vector
##Aan- en afwezigheid van rop in colE1-afgeleide plasmide en de invloed ervan op aantal plasmide in E.coli.
##Aantal kloons in een genoombank.
##Nested PCR Mondeling: pMAL expressiesysteem
##Pyrosequencing RDA Ligatiemechanisme Eckstein

===14 jan 2010===
#Geef de belangrijkste biologische functies van de filamentaire faag vectoren en hoe deze gebruikt werden om vectoren mee te maken.Welke soorten faag lambda vectoren zijn er en schets kort hun gebruik
#Bijvragen:
##cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman.
##Detailleer elke reactiestap.
##Wat is chromosome walking en hoe werkt het.
#Kleine vragen:
##Wat is en waarvoor dient de capping bij de synthese van oligonucleotiden.
##Exonuclease III
##Hoe bepalen we het aantal kloons dat nodig is bij het opstellen van een genoombank.
##Inverse PCR Mondeling: pMal
##LCR Puntmutaties volgens Eckstein Mu-2 gistvector
##Pyrosequencing

===30 jan 2009===
#fosforamidiet synthesecyclus geven problemen klonering met cosmidevectoren + oplossingen
#Bijvragen:
##okyama en berg progressieve deleties met exonuclease III
#Kleine vragenÂ :
##IPTG sacB carbon en clarke vgl rol guanidinimun zouten + structuur
#Mondeling: RDA pyrosequencing eckstein pMal lambda zap

===30 jan 2009===
#Soorten Bacteriofaag lamda vectoren pET expressie vector systeem
#Bijvragen
##Pyrosequencing Gubler-Hoffman cDNA synthese
# Kleine vragen
##Tm voor oligonucleotiden sacB en toepassing in Gentechnolgie Statistische benadering genoom insertie PNA + structuur
#Mondeling: inverse PCR Eckstein RDA SOE CAPture

===27 jan 2009Â ===
#replicatiemechanisme, regulatie en aantal kopieÃ«n ColE1-afgeleide vectoren Soorten bacteriofaag lambda vectoren en hun werking schetsen
#Bijvragen:
##cDNA klonering (Gubler & Hoffman, Okayama & Berg)
##chromosoom walking
#Kleine vragen:
##inverse PCR Tth DNA polymerase (wat speciaal en welke extra mogelijkheden daardoor)
##capping in fosforamidiet, wat en waarom
##hoe bereken je aantal kloons in genomische DNA bank exonuclease III
#Mondeling: SOE SAGE pMAL plaatsgerichte mutagenese volgens Kunkel pyrosequencing

===24 jan 2008===
#Bespreek het replicatiemechanisme van ColE1- en afgeleide vectoren, de regulatie en het aantal plasmiden
#Bespreek methoden om gen-gericht een genomische bank te screenen aan de hand van 'informatie'
#Geef twee technieken voor positieve selectie van plasmiden
#Geef de methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese
#Kleine vragen
##Hoe kan de het cI gen voor positieve selectie zorgen?
##Wat is een moleculair baken ('molecular beacon')?
##Bespreek de twee soorten SV40 vectoren en het verschil Touch-down PCR
##Hoe kunnen we er voor zorgen dat er geselecteerd wordt op de mogelijkheid om te transformeren (of zo)?
#Technieken: Pyrosequencing pET SOE Okyama-Berg ligatiemechanisme

===23 jan 2008===
#Fotolithografische DNA synhtese: bescrhijf en verklaar.
#Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering: wat zijn de voor/ nadelen?
#Middelgrote vragen:
##Welke problemen zijn er bij het kloneren in cosmidevectoren en hoe hebben ze dit opgelost?
##Pyrosequencing: beschrijf, wat zijn voor/nadelen tov dideoxymethode
#Kleine vragen:
##Wat is IPTG: structuur, gebruik
##Wat is de par locus
##Wat is PNA: structuur
##Wat is T4 polynucleotide kinase, waarom is dit belangrijk in gentechnologie, reactiemechanisme?
#Technieken: SOE CAPture EtBr pMAL Eckstein

===14 jan 2008===
#Welke mogelijkheden zijn er om plaatsgerichte mutagenese te doen?
#Vertel alles over LITMUS vectoren (Waarom in godsnaam is dit een hoofdvraag?)
#Bijvragen:
##Welke problemen kunnen er zijn bij het kloneren in cosmidevectoren?
##Hoe hebben ze die omzeild? Schets de Okyama-Berg procedure.
##Wat zijn de voor- en nadelen?
#Bij-bijvragen:
##Hoe is sacB een positief selectiekenmerk?
##Waarvoor staat spi selectie?
##Geef de 2 soorten SV40 vectoren + leg het verschil uit waarom worden er andere Tm-uitdrukkingen gebruikt voor oligonucleotiden en hele strengen?
#Mondeling: RDA Pyrosequencing inteÃ¯ne verwerking inverse PCR cap selectie

===31 jan 2007===
#alles van cosmiden bespreken. alles van SV40 bespreken.
#Middelgrote vragen:
##pyrosequencing
##cassettemutagenese
#Kleine vragen:
##verschil southern en western blotting
##ethidiumbromide, structuur, problemen,
##gebruik Spi selectie inverse PCR
##wat is shearing
#Technieken: Formule om het aantal klones te berekenen voor gDNA bank Oligocapping SOE ligatiemechanisme Eckstein Okayama en Berg

===23 jan 2007===
#bespreek belangrijkste methoden voor site directed mutagenese bespreek replicatiemechanisme in pBR322
#welke verschillende strategien worden gebruikt met op lambda gebaseerde vectoren technieken met Ti vectoren
#Mondeling: nested PCR quenching hoe beinvloed de DNA concentratie het werken met cosmiden en verklaar

===19 jan 2007===
#Geef en bespreek enkele voorbeelden van het gebruik van alkalische fosfatasen.
#Bespreek de eigenchappen en kenmerken van de pUC vectoren.
#Vectoren afgeleid van bacteriofaag lambda.
#SV40 vectoren.
#Kleine vragen:
##Genotype van een E.Coli stam opdat deze geÃ¯nfecteerd kan worden door M13.
##Bespreek incompatibiliteit van plasmiden.
#Mondeling voor te stellen technieken: SOE Pyrosequencing Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese Nick translatie<

Gentechnologie

2020-01-22T10:51:34Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Prof Lavigne. Biochemie volgt het samen met bio-ingenieurs. Oefenzittingen verplicht.

==Examenvragen==

=== 22 januari 2020 ===
# Leg PET en pPIC expressiesystemen uit.Vergelijk ze en wat zijn de voor en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
# Bespreek gedetailleerd Bac vectoren. Hoe bereken je het minimum aantal klonen met de formule van Carbon en Clarke en welke voorwaarden moeten voldoen zijn?
# Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit.
# Definities
#* Leg gatewayclonering uit, werking en principe geven.
#*transposonclonering en hoe dit gescreend wordt
#* Leg uit hoe men gisten transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.
#paeshuyse

==== 30 augustus 2019 ====
#Bespreek de factoren van een PCR die de gevoeligheid kunnen verhogen. Ook de PCR afgeleidde technieken die de gevoeligheid voor nucleïnezuurdetectie kunnen verhogen.
#Bespreek het PET expressie systeem in E. coli, geef ook de voor en nadelen van expressie in deze bacterie.
#(Paashuyse) Je wil Anti-IgE produceren in CHO cellen m.b.v. een eukaryoot expressie systeem (geen gist of schimmel).
#* welk expressie systeem gebruik je? beargumenteer.
#* Teken de vector en verklaar alle factoren die je gebruikt.
#* Wat moet je veranderen aan de CHO cellen om de SV40 ori te kunnen gebruiken? wat is het voordeel van deze ori op replicatie.
#* Als je anti-IgE in planten cellen zou willen produceren, hoe ziet de vector er dan uit? leg alle factoren uit.
#Leg uit:
#* Definieer alles van BAC's
#* Gateway klonering
#* Capture techniek voor full length cDNA klonering
#Oefening: 2 exonen met sequentie waren gegeven, ook een tag met sequentie was gegeven. De bedoeling was om tag-exon1-exon2 te kloneren in een TOPO-T/A vector. Bespreek alle stappen van de klonering en beargumenteer.

==== 23 Januari 2019 ====
# Welke parameters hebben een negatieve invloed op PCR in verband met mutagenese (geef hierbij ook PCR-gebaseerde technieken van random/directe mutagenese zoals mismatch priming, error-prone PCR..)
# Vergelijk cosmide en BAC klonering en hoe bepaal je de complexiteit van genoombank (carbon clark)
# (Paashuyse): Klonering van een bepaald eiwit in rat cellen
#* A. Leg expressiesysteem uit
#* B. Teken vector en benoem/verklaar alle factoren die je gebruikt
#* c. Wat moet je veranderen aan de rat cellen om SV40 ori te kunnen gebruiken? en bespreek het effect op de replicatie
#* d. Doe hetzelfde maar dan in een planten cel, wat moet je veranderen? En teken de vector opnieuw met alle componenten
# Geef uitleg over
#* Taqman probe
#* CTAB methode
#* PET
# Oefening waarbij je een ori moest insereren in DNA, dit moest in frame zitten, de RE sites waren gegeven, bespreek je techniek en teken PCR primers die je hiervoor zou gebruiken

==== 31 Augustus 2018 ====
# Leg PET en pPIC expressiesystemen uit.Vergelijk ze en wat zijn de voor en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
#
#* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)
#* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Hoe bereken je het minimum aantal klonen met de formule van Carbon en Clarke en welke voorwaarden moeten voldoen zijn? (1 bladzijde)
# Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip):
#* A. Alkalische Lyse
#* B. Wat is de definitie van Hybrid Selected Translation?
#* C. Leg uit hoe men gisten transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.
# Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)
#* a. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.
#* b. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.

==== 24 januari 2018 ====
# Leg PET en pBAD expressiesystemen uit. Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
#
#* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)
#* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Geef ook uitleg bij Carbon & Clarke. (1 bladzijde)
# Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip):
#* A. CAPture techniek bij cDNA aanmaak
#* B. Taqman RT-PCR
#* C. Nodige elementen voor een episomaal shuttle-plasmide voor ''E. Coli'' en ''S. cerevesiae''
# Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)
#* A. Geef strategie (maak primers, staarten, restrictie) om uw insert in de entry-vector te krijgen.
#* B. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.
#* C. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.

==== 1 september 2017 VM====
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef PCR afgeleide technieken voor nucleïnezuren.
# Bespreek in detail en vergelijk het mechanisme van P1 en cosmide vectoren.
# Bespreek de werking en schets het principe van PET-expressie systeem. Wat zijn de voor- en nadelen?
# Kort omschrijven
#* Definieer en bespreek CAPture techniek werking
#* Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#* Bespreek het principe van Gateway klonering.
# Vraag Paeshuyse (oefening in verwerkt): allerlei gegevens (cDNA, knipplaatsen e.d.)
#* Welke eukaryoot expressies systeem (geen schimmel of gist) zou jij gebruiken (voor dit humaan recombinant eiwit)? Beargumenteer.
#* Teken de vector enzo.. (?)

==== 25 januari 2017 VM====
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid
# Bespreek de BAC clonering voor de aanmaak van banken.
# Wat zijn de voordelen van recombinante expressie in gist? Vector pPIC wordt veel gebruikt in de industrie. Bespreek pPIC.
# Kort omschrijven
#*DNA shuffeling
#*CAPture techniek werking
#*Principe van TOPO-gemedieerde klonering
#oefening: Gegevens over enzymen, genoom van 1,6*^10-4, enzym knipt in 1 à 2 kb fragmenten, foto van gelleke. Hoeveel recombinante moet je hebben om met 99% zekerheid te zeggen dat je sequentie aanwezig is? Nog een vraag. (Rekenmachine nodig!)
#Vraag Paeshuyse: Creëer een humaan, recombinant faag lambda ding (?) Welk expressiesysteem zou je gebruiken? Teken de vector die je gebruikt. Nog iets...

====januari 2016====
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid
# Voordelen van recombinante expressie in gist, leg die ene gistvector uit (pPIC heette die dacht ik?)
#Strategie voor het opstellen van een cosmidebank
# Termen: CTAB DNA extractie, Taqman, manieren van transformatie van gist
# Oefening met inverse PCR: vinden van primers en uittekenen van de techniek
Volckaert:
# Relatie Tm/zoutconcentratie (monovalente kationen)
# De factoren die de renaturatie beinvloeden + verschil in gebruik van PNA, LNA en DNA als proben
# Geef structuur van guanidinium isothiocyanaat en guanidinium thiocyanaat, waarvoor wordt dit molecule gebruikt
# structuur van merker gegeven, leg uit waar onderdelen voor bedoeld zijn en benoem ze

===20 januari 2015===
#Bespreek en vergelijk de verschillende PCR technieken voor zowel gerichte als random mutagenese.
#Bespreek in detail het mechanisme van P1 faag en een cosmide en vergelijk.
#Bespreek en schematiseer het principe van de capillaire Sanger sequentie.
#Kleine vraagjes:
##Belang van humanisering bijÂ Philia pastoris
##Definieer de CAPture techniek
##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#Oefening: Je moet 2 exons (sequenties gegeven) van een bepaald gen aan elkaar ligeren (zonder een linker tussen). En deze C-terminaal aan een â€˜Strepâ€™-tag hangen (sequentie gegeven) en deze inbrengen in een vector die T-overhang heeft door TOPO. (verschillende stappen bespreken + primers geven!) (praktisch dezelfde oefening als de voorbije 2 jaar in januari)
Volckaert 1. Geef de structuurformule van guanidinium (iso)thiocyanaat en waar het voor wordt gebruikt. 2. Leg chemische synthese van oligonucleotiden met een 5â€™ fosfaat uit (of teken) + geef voordeel hiervan. 3. Leg uit hoe DNA probes niet-radioactief gelabeld (en eventueel onder welke voorwaarden) kunnen worden met behulp van een streptavidine-alkalisch fosfatase fusie-eiwit 4a. T4 polynucleotide kinase werd vroeger gebruikt om uiteinden te fosforyleren zodat fragmenten geligeerd kunnen worden. Nu kan dit direct gebeuren bij de oligonucleotide synthese. Hoe doen ze dit? Bespreek (en of teken) dit. 4b. Wat is het voordeel hiervan? 5. Bespreek de relatieve Tm van DNA en LNA met betrekking tot hun gebruik in hybridisatie en mismatchgevoeligheid.

=== 21 januari 2014 ===
#Bespreek algemeen principe van PCR en de reactiecomponenten. Bespreek afgeleide technieken die gebruikt worden om de specificiteit van de PCR-reactie te verhogen. (onbeperkte antwoordruimte)
#Bespreek achtergrond en werking van cosmide (1pag)
##Bespreek en vergelijk pET en pBAD (1pag)
#Korte vraagjes: Lavigne
##Bespreek CAPture techniek
##Bespreek de elementen die een YAC-kloneringsvector bevat. Bespreek Gateway klonering

=== 22 januari 2013 ===
#Bespreek vectorsystemen voor het insereren van grote (>30kb) DNA-sequenties. Bespreek de formule van Carbon & Clarke.
#Technieken: Okayama & Berg SAGE
#Kleine vragen (Lavigne):
##Wat is error-prone PCR en hoe kan je het gebruiken in "directed evolution"?
##Bespreek en schets het PET-expressie systeem.
##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#SitueerÂ ???,Â ??? enÂ ??? in de historiek van de gentechnologie. Het rspL gen was Ã©Ã©n van de eerste genen die gebruikt werd voor positieve selectie. Leg uit waarvoor dit gen codeert en hoe de selectie gebeurt. Oefening: Sequentie met exons en introns gegeven. Ontwerp een techniek om de eerste twee exons aan elkaar te ligeren en in te bouwen in de gegeven vector (TOPO T/A vector), met een N-terminale STREP-tag (sequentie voor de STREP-tag was gegeven). Beschrijf en verantwoord elke stap.

===6 augustus 2012===
Â #Kunkel tot in detail bespreken Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli. Is dit hetzelfde bij de afgeleide vectors van ColE1? (pBR322,...)
#twee vraagjes Carbon en Clarke RAcE schetsen en uitleggen (beide)
#kleine vraagjes:
##Bespreek COS-cellen URA3 (waarom belangrijke merker)
##Inclusion bodies (wat, wanneer, gewenst?)
##Duid het juiste aan: de zoutconcentratie doet Tm stijgen/dalen/beÃ¯nvloedt Tm niet + uitleggen waarom.
##synthesevraag: biotine-merking bij nucleÃ¯nezuurhybridisatie, alles uitleggen (hoe probe maken, hybridisatie, detectie)

===23 Jan 2012 NM===
#Kunkel Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli
#Bespreek de mogelijke kloneringsvectoren in gist
#Kleine vragen:
##Co-transformatie bij dieren
##Bespreek doel van de technieken: oligocapping en capture
##Hot-start PCR Chromosome jumping

===31 Jan 2011 NM===
#Bespreek de filamentaire fagen(M13, F1,...), hun eigenschappen, hun replicatie in E.coli en hoe zijn ze aangepast voor het gebruik als vectoren.
#Bespreek het pMAL expressiesysteem voor de synthese van eiwitten via recombinanten.
#Bijvragen:
##Hoe kan je het nodige aantal klonen bepalen voor een goede genoombank
##Bespreek die PiAN vectoren Kleine vragen:
##Wat is de N-regel van Varshavsky COSvectoren
##Wat is Spi-selectie Waarvoor dient Capping bij de synthese van oligonucleotiden?
#Mondeling: cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman Methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese Hoe wordt de smelttemperatuur bepaalt SAGE

===17 Jan 2011 VM===
#Fosforamidietcyclus (cyclus, beschermgroepen, capping,...)
#Welke problemen bij aanmaken van cosmide vectoren en welke oplossingen hiervoor?
#Bijvragen:
##Okayama & Berg
##cDNA klonering in een vector Methode van Henikoff voor systematische deleties
#Kleine vragen
##IPTG sacB
##Carbon & Clarke vgl. (aantal klonen in een cDNA bank)
##Guanidiniumzouten
#Mondeling: pMal expressiesystemen Kunkel Eckstein Pyrosequencing SOE

===17 Jan 2011 VM===
#Aanmaak genoombanken soorten gistvectoren
#Bijvragen:
##fotolithografische DNA synthese alkalische fosfatasen + toepassingen
#Kleine vragen
##'hotstart' PCR Guanidinium thiocyanide biotine merking bij hybridisatie
##URA3 Modeling: pyrosequencing
##Methode van Eckstein CAPture SOE pMAL

===23 aug 2010 VM===
#pyrosequencing soorten faag lambda vectoren Bijvragen: methode van Gubler en Hoffman chromosoomwalking
#Kleine vragen:
##nested PCR capping in fosforamidietcyclus hoe het aantal klonen in een cDNA bank benaderen
##PNA Modeling: methode van Okyama en Berg
##biotine merking bij hybridisatie alkalische hydrolyse van RNA Spi selectie pMAL

===26 jan 2010 VM===
#Bespreek cosmide vectoren en hoe ze efficient te gebruiken zijn.
#Leg de methode van Hoffman en Gubler voor cDNA synthese uit.
#Bijvragen:
##Welke vectorsystemen voor gist zijn er beschikbaar?
##Leg de pSC101 ori uit.
#Kleine vragen:
##Oclusion body's: wat, wanneer, nut?
##CI gen: wat en waarvoor gebruikt in de gentechnologie?
##Universele splicing van ssDNA met fokI.
##Modeling: Fosforamidiet versus fosfonaat methode.
##EtBr en SYBR.
##Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese.
##Biotine merking.
##ZOO blot.

===25 jan 2010 VM===
#Bespreek de aanmaak van genoombanken (vectoren, inbouwmechanismen, enz.)
#Bespreek de methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese.
#Bijvragen:
##Welke vectoren voor klonering in gist?
##Wat zijn positieve en negatieve selectie voor klonering en geef voorbeelden.
#Kleine vragen:
##Nested PCR uitleggen.
##T4 en T7 zijn beide bacteriofaag polymerasen.
##Bespreek hun activiteit(en) en toepassingen.
##Type1, type2, type3, type2s, iso en neochizomeren, waarin verschillen deze restrictie enzymen?
##Hoeveel kloonen nodig in een genoom bank?
#Mondeling: Okyama en berg Spi selectie Alkalische hydrolyse van RNA pMAL
#Hoe wordt biotine gebruikt bij hybridisatie

===25 jan 2010 VM===
#Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering, detailleer elke reactiestap.
#Bijvragen:
##Fosforamidiet synthesecyclus
##Welke soorten alkalische fosfatase gebruiken we in de gentechnologie?
##Schets hun gebruik.
#Kleine vragen:
##Lamba ZAP vector
##Aan- en afwezigheid van rop in colE1-afgeleide plasmide en de invloed ervan op aantal plasmide in E.coli.
##Aantal kloons in een genoombank.
##Nested PCR Mondeling: pMAL expressiesysteem
##Pyrosequencing RDA Ligatiemechanisme Eckstein

===14 jan 2010===
#Geef de belangrijkste biologische functies van de filamentaire faag vectoren en hoe deze gebruikt werden om vectoren mee te maken.Welke soorten faag lambda vectoren zijn er en schets kort hun gebruik
#Bijvragen:
##cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman.
##Detailleer elke reactiestap.
##Wat is chromosome walking en hoe werkt het.
#Kleine vragen:
##Wat is en waarvoor dient de capping bij de synthese van oligonucleotiden.
##Exonuclease III
##Hoe bepalen we het aantal kloons dat nodig is bij het opstellen van een genoombank.
##Inverse PCR Mondeling: pMal
##LCR Puntmutaties volgens Eckstein Mu-2 gistvector
##Pyrosequencing

===30 jan 2009===
#fosforamidiet synthesecyclus geven problemen klonering met cosmidevectoren + oplossingen
#Bijvragen:
##okyama en berg progressieve deleties met exonuclease III
#Kleine vragenÂ :
##IPTG sacB carbon en clarke vgl rol guanidinimun zouten + structuur
#Mondeling: RDA pyrosequencing eckstein pMal lambda zap

===30 jan 2009===
#Soorten Bacteriofaag lamda vectoren pET expressie vector systeem
#Bijvragen
##Pyrosequencing Gubler-Hoffman cDNA synthese
# Kleine vragen
##Tm voor oligonucleotiden sacB en toepassing in Gentechnolgie Statistische benadering genoom insertie PNA + structuur
#Mondeling: inverse PCR Eckstein RDA SOE CAPture

===27 jan 2009Â ===
#replicatiemechanisme, regulatie en aantal kopieÃ«n ColE1-afgeleide vectoren Soorten bacteriofaag lambda vectoren en hun werking schetsen
#Bijvragen:
##cDNA klonering (Gubler & Hoffman, Okayama & Berg)
##chromosoom walking
#Kleine vragen:
##inverse PCR Tth DNA polymerase (wat speciaal en welke extra mogelijkheden daardoor)
##capping in fosforamidiet, wat en waarom
##hoe bereken je aantal kloons in genomische DNA bank exonuclease III
#Mondeling: SOE SAGE pMAL plaatsgerichte mutagenese volgens Kunkel pyrosequencing

===24 jan 2008===
#Bespreek het replicatiemechanisme van ColE1- en afgeleide vectoren, de regulatie en het aantal plasmiden
#Bespreek methoden om gen-gericht een genomische bank te screenen aan de hand van 'informatie'
#Geef twee technieken voor positieve selectie van plasmiden
#Geef de methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese
#Kleine vragen
##Hoe kan de het cI gen voor positieve selectie zorgen?
##Wat is een moleculair baken ('molecular beacon')?
##Bespreek de twee soorten SV40 vectoren en het verschil Touch-down PCR
##Hoe kunnen we er voor zorgen dat er geselecteerd wordt op de mogelijkheid om te transformeren (of zo)?
#Technieken: Pyrosequencing pET SOE Okyama-Berg ligatiemechanisme

===23 jan 2008===
#Fotolithografische DNA synhtese: bescrhijf en verklaar.
#Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering: wat zijn de voor/ nadelen?
#Middelgrote vragen:
##Welke problemen zijn er bij het kloneren in cosmidevectoren en hoe hebben ze dit opgelost?
##Pyrosequencing: beschrijf, wat zijn voor/nadelen tov dideoxymethode
#Kleine vragen:
##Wat is IPTG: structuur, gebruik
##Wat is de par locus
##Wat is PNA: structuur
##Wat is T4 polynucleotide kinase, waarom is dit belangrijk in gentechnologie, reactiemechanisme?
#Technieken: SOE CAPture EtBr pMAL Eckstein

===14 jan 2008===
#Welke mogelijkheden zijn er om plaatsgerichte mutagenese te doen?
#Vertel alles over LITMUS vectoren (Waarom in godsnaam is dit een hoofdvraag?)
#Bijvragen:
##Welke problemen kunnen er zijn bij het kloneren in cosmidevectoren?
##Hoe hebben ze die omzeild? Schets de Okyama-Berg procedure.
##Wat zijn de voor- en nadelen?
#Bij-bijvragen:
##Hoe is sacB een positief selectiekenmerk?
##Waarvoor staat spi selectie?
##Geef de 2 soorten SV40 vectoren + leg het verschil uit waarom worden er andere Tm-uitdrukkingen gebruikt voor oligonucleotiden en hele strengen?
#Mondeling: RDA Pyrosequencing inteÃ¯ne verwerking inverse PCR cap selectie

===31 jan 2007===
#alles van cosmiden bespreken. alles van SV40 bespreken.
#Middelgrote vragen:
##pyrosequencing
##cassettemutagenese
#Kleine vragen:
##verschil southern en western blotting
##ethidiumbromide, structuur, problemen,
##gebruik Spi selectie inverse PCR
##wat is shearing
#Technieken: Formule om het aantal klones te berekenen voor gDNA bank Oligocapping SOE ligatiemechanisme Eckstein Okayama en Berg

===23 jan 2007===
#bespreek belangrijkste methoden voor site directed mutagenese bespreek replicatiemechanisme in pBR322
#welke verschillende strategien worden gebruikt met op lambda gebaseerde vectoren technieken met Ti vectoren
#Mondeling: nested PCR quenching hoe beinvloed de DNA concentratie het werken met cosmiden en verklaar

===19 jan 2007===
#Geef en bespreek enkele voorbeelden van het gebruik van alkalische fosfatasen.
#Bespreek de eigenchappen en kenmerken van de pUC vectoren.
#Vectoren afgeleid van bacteriofaag lambda.
#SV40 vectoren.
#Kleine vragen:
##Genotype van een E.Coli stam opdat deze geÃ¯nfecteerd kan worden door M13.
##Bespreek incompatibiliteit van plasmiden.
#Mondeling voor te stellen technieken: SOE Pyrosequencing Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese Nick translatie<

Advanced biochemistry and biotechnology

2020-01-17T13:52:49Z

Elisevanvyve: /* 17 januari 2020 VM */

[[Categorie: Mabb]]
==Vakinformatie==
Verdiepend vervolg op Moleculaire en Dynamische Biochemie van de 2e bachelor, gedoceerd door Prof Johan Robben. (Voor 2009-2010 door Prof M. De Ley en J. Robben)

Het examen is opgebouwd uit 2 grote, open vragen en 4 begrippen. De eerste vraag en de begrippen zijn schriftelijk met mondelinge toelichting: hij leest je antwoorden en stelt bijvragen indien nodig. De tweede open vraag is schriftelijk af te geven.

"De studenten hebben mij iets heel handig gegeven om na te gaan welke examenvragen ik de laatste jaren gesteld heb, ze houden het beter bij als ik zelf."
-- Quote Johan Robben, 2014

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/n/G0G74AN.htm

==Examenvragen==

=== 17 januari 2020 VM===

#5’ UTR van expressieregulatie bij eukaryoten
#cas9 systeem waar CRISPR is op gebaseerd en vergelijk met Argonaut
#Begrippen
#*attenuatie
#*nonsense-mediated decay
#*looped primer RT-PCR
#*proteasome stress response??

=== 25 januari 2019 NM===

#Leg de regulatie van het trp-operon uit
#Geef een schematisch overzicht van unfolded protein respons
#Begrippen
#* RITS
#* Shutdown decay
#* BMAL
#* uORF

=== 18 januari 2019 NM===

#3’ UTR bij eukaryoten
#Experimenteel knockdown van genen adhv RNAi
#Begrippen
#* RNA switch
#* Periodosoom
#* RNA editing
#* CMA

=== 18 januari 2019 VM===
#Bespreek de structuur en werking van riboschakelaars (riboswitches). Wat weet je over hun functie? Illustreer je antwoord met voorbeelden.
#Bespreek de moleculair-dynamische mechanismen die aan de basis liggen van het metabolische dag-nacht ritme bij zoogdieren.
#Begrippen
#* Selenocysteine
#* Nonsense-mediated decay
#* shRNA
#* Proximity-induced autoactivation

===22 januari 2018, VM===
#Geef overzicht van de regelmechanismen waarmee eukaryoten de translatie globaal (=niet eiwit specifiek) kan worden geregeld. In welke situatie is een dergelijke regeling van toepassing? Hoe ontsnappen sommige genen aan deze regeling?
#Bespreek op welke wijze(n) de poly(a)-staart van mRNA fungeert in expressie regulatie. (ook iets over de lengte ervan)
#Begrippen:
#* Retroreulatie
#* Genomische imprinting (+voorbeeld)
#* Nonsense-mediated decay
#*Nocturnine

===19 januari 2018, VM===
#Geef de gelijkenissen en verschillen voor de expressie regulatie aan de 5'-UTR en 5'-uiteinde regio bij prokaryoten en eukaryoten.
#Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress? (= ERAD en UPR)
#Begrippen:
#* Tac promotor (= is die gefuseerde promotor van lac operon en tac operon vanuit de werkzitting)
#* Rip: regulated intramembrane proteolysis
#* RITS
#* foto-entrainment

===21 augustus 2017===
#Controlemechanismen van mRNA bij eukaryoten.
#De rol van ubiquitine ligasen in proteïne turnover
#Begrippen:
#*Transcriptional gene silencing
#*Peptide mediated protein knockdownn
#*Familial fast sleep syndrome
#*Een vierde begrip

===3 februari 2017===
#Verduidelijk de structuur en werking van riboswitches . Leg hun functie uit
#Rol van Poly-A-staart bij regulatie van expressie
#Woordjes:
#*Nocturnine
#*uORF
#*Genetic imprinting
#*Chaperone-gemedieerde autofagie

===23 januari 2017===
#Globale translatie regulatie mechanisme uitleggen, wanneer is dit van toepassing en hoe ontsnappen genen eraan
#Op welke wijze(n) kan je de functie en voorkomen RNAi experimenteel uitvoeren?
#Bespreek kort
#*Retroregulation
#*Rip: regulated intramembrane proteolyse
#*nonsense mediated decay
#*Periodosoom

===20 januari 2017===
#Welke elementen in 3'-UTR voor expressieregulatie?
#Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress?
#Bespreek kort:
#*Attenuatie
#*Hairpin silencing
#*Translational recoding
#*Photo-entrainment

===29 januari 2016===
#UPR
#Circadische clock in zoogdieren
#Bespreek kort:
#*hairpin silencing
#*argonaut
#*genomic imprinting
#*riboswitch

===27 januari 2016===
#Geef overzichtelijk de technieken die kunnen gebruikt worden om het voorkomen en functies van kleine RNA's te bestuderen. (Hij was precies niet geÃ¯nteresseerd in RAKE, looped primer en al die dingen... Hij zei iets over sRNA sponzen en stabiele nucleïnezuuranalogen)
#Geef de werking en functie(s) van macroautophagie.
#Bespreek kort:
#*real-time RT-PCR
#*selenocysteÃ¯ne
#*caspasen
#*RIP.

===18 januari 2016===
#Hoe knockdown van genen bekomen via experimenten met RNA interferentie? wat zijn de aandachtpunten? bijvraag: wat zou je eerder gebruiken siRNA of via vector shRNA? en wat bij de mens?
#Translationele recoding wat is het en op welke manieren wordt het bereikt?
#Bespreek kort:
#*histonehermodellering
#*shut down decay
#*RNA editing
#*BMAL-CLOCK

===15 januari 2016===
#Globale translatie regulatie mechanisme uitleggen, wanneer is dit van toepassing (Stress enz), en hoe ontsnappen genen eraan (uORF)
#Rol van ubiquitinr ligases in proteïne turnover.
#Bespreek kort:
#*Chromatine remoddeling
#*Non stop decay
#*Periodosoom
#*Seed sequentie

===28 januari 2015===
#Bespreek het purine katabolisme + welke afwijkingen bij de mens?
#Wat weet je over Ubiquitine ligases in proteïne metabolisme?
#Bespreek kort:
#*RIP
#*Translationele hercodering
#*Exosoom
#*Looped-primer RT-PCR

===september 2014 ===
#Bespreek de N-endrule en eiwitafbraak. Vergelijk tussen eukaryoten en prokaryoten.
#Stel een dierenexperiment met RNAi; welke methoden voor knockdown van een gen stel je voor, welke verkies je voor het maximale resultaat?
#Bespreek kort:
#*RIP
#*Icterus
#*UPR
#*Nocturine

===31 januari 2014 ===
#Geef de diverse regulatiemechanismes van het (chole)sterolmetabolisme.
#Bespreek de invloed van ubiquitineligases op de proteïne turnover.
#Bespreek kort:
#*Geelzucht
#*genome imprinting
#*Initiator caspase
#*KiaC

===29 januari 2014 ===
# Bespreek overzichtelijk de mRNA kwaliteitscontrolemechanismen bij prokaryoten en eukaryoten
# Geef een overzicht van de verschillende mechanismen van cel-gecontroleerde eiwitafbraak die niet via proteasomen verloopt
#Bespreek kort:
#*Lesch-Nyhan-syndroom
#*Selenocysteine
#*Calnexin-calreticuline cyclus
#*Clock/BMAL1

===20 januari 2014===
#Bespreek schematische de biosynthese van heem. Hoe wordt het gereguleerd? En hoe werkt heem bij de algemene genexpressie?
#Bespreek "unfolded protein response" (UPR)?
#Leg kort uit
#* Trans-translatie
#*RNA editering
#*shRNA
#*Nocturnine

=== 21 januari 2013 ===
# Bespreek de mogelijke rol van de 5'-UTR in de posttranscriptionele expressieregultatie van prokaryoten.
# Bespreek het controlemechanisme van membraaneiwitten en eiwitten vÃ³Ã³r secretie. Welke mechanismen treden er op bij stress?
# Bespreek kort:
#* ALA-synthase
#* transtranslatie
#* Seed sequentie
#* nocturnine

=== 15 januari 2013 ===
# Bespreek de moleculaire mechanismen voor ijzerhomeostase.
# Bespreek het kloksysteem van Synechococcus (cyanobacterie). bijvraag: grote verschil met zoogdieren (= eiwitklok vs gen-gereguleerd)
# Bespreek kort:
#* thymidylaatsynthase
#* RNA editering
#* chaperone gemedieerde autofagie
#* argonaut

=== 3 februari 2012 ===
# Bespreek de moleculaire mechanismen voor de overerving van expressiepatronen tijdens de celcyclus. Wat is het belang hiervan?
# Bespreek de globale regulatiemechanismen bij proteasoom-afhankelijke proteolysis.
# Bespreek kort:
#* 5-FOA
#* RNA editering
#* seed sequence
#* nocturnine

=== 17 januari 2012 ===
# Bespreek de mogelijke rol van de 5'-UTR in de posttranscriptionele expressieregultatie van prokaryoten.
# Bespreek de globale regulatiemechanismen bij proteasoom-afhankelijke proteolysis.
# Bespreek kort:
#* Thymidilaatsynthetase
#* Geelzucht
#* CpG eiland
#* RITS

=== 1 september 2011 ===
# Schematische beschrijving heem biosynthese + hoe wordt cellulaire homeostase van heem bereikt?
# Geef overzicht van regelmechanismen waarmee bij eukaryoten de translatie globaal kan worden geregeld. In welke situaties is dergelijke regeling van toepassing? Hoe ontsnappen sommige genen aan de regeling?
# Bespreek kort:
#* histonmethyltransferase
#* nonsense mediated decay
#* photo entrainment
#* shRNA

=== 4 februari 2011 ===
# N-end rule
# Moleculaire dag en nacht ritme van het metabolisme van zoogdiercellen
# Bespreek kort:
#* geelzucht
#* selenocysteïne
#* Shutdown decay (SSD)
#* eIF2

=== 24 januari 2011 ===
# Geef het belang van de 3' Untranslated region bij expressie in eukaryoten.
# Leg het klok systeem van cyanobacteriÃ«n uit
# Bespreek kort:
#* OMP
#* RNA editing
#* toxine-antitoxine
#* ubiquitineligase E3

=== 18 januari 2011 ===
# Bespreek riboswitches.
# Op welke wijze(n) kan je RNAi experimenteel uitvoeren?
# Bespreek kort:
#* allopurinol
#* uORFs
#* ERAD
#* photo-entrainment

=== 29 januari 2010 ===
# Geef het belang van de 3' Untranslated region bij expressie in eukaryoten.
# Leg het klok systeem van cyanobacteriÃ«n uit, en de invloed op transcriptie.
# Bespreek kort:
#* OMP
#* ERAD
#* initiator caspases
#* myristoylisatie
=== 18 januari 2010 ===
# N-end rule
# Moleculaire dag en nacht ritme van het metabolisme van zoogdiercellen
# Bespreek kort:
#* geelzucht
#* selenocysteïne
#* RISC
#* endosomale lokalisatiesignaal

===12 januari 2010===
# Bespreek de purineafbraak en de verschillende metabole stoornissen bij de mens die hiermee verband houden.
# Bespreek de globale regulatie van eukaryote translatie. Hoe kunnen sommige genen aan deze regulatie ontsnappen?
# Bespreek kort:
#* Nocturnine
#* uORFs (valt weg, want bij vraag twee zitten ook al uORFs)
#* shRNA
#* nuclear localisation signal

===29 januari 2009===
MDL:
# purinebiosynthese en regulatie
# kaartjes:
#* Adaptor
#* Cascades, waarom?

JR:
# Controlemechanismen mRNA in eukaryoten
# kaartjes:
#* histonmethyltransferase
#* RITS

===29 januari 2009===
MDL: Calcium
JR: N end rule

===20 januari 2009===
Deley:
# Afbraak van vetzuren
# Kaartjes:
#* GPCR
#* werking van groeifactoren
Robben: manieren van doorgeven van expressie patronen bij celdeling. Waarom deze regeling? (epigenetic inheritance)

Nog Kaartjes:
# calnexine/calreticuline cycle
# Argonaut
# SH2 en SH3
# stimulatie van proteïnesynthese door hemine
# Ubiquitine als sorteringssignaal
# Thio-etherankers en thio-esterankers
# shRNA
# riboswitch
# RITS
# ARE (AU-rich element)
# transition state analog (daar moest hij n-PALA hebben)
# cascade, waarom?

===31 januari 2008===
MDL:
# Bespreek purineafbraak + storingen
# kaartjes: GPCR en de tabel heel in't begin van 't eerste hoofdstuk met E.Coli, S. Cerevisiae, ...

JRB:
# Bespreek lysosomale afbraak
# kaartjes: mRNA localizatie en non-sense mediated decay

===31 januari 2008===
MDL:
# Bespreek de vorming van deoxyribonucleotiden + regulatie
# kaartjes: oncogenen en amidelinked ankers

JRB:
# Bespreek methylering van histonen en DNA en hoe deze expressie kunnen reguleren
# kaartjes: eIF4E-bindend proteine en sRNA switch

===30 januari 2008===
# MDL: Pyrimidinebiosynthese
# JRB: Welke rol speelt poly(A) bij de vorming van proteinen (of zoiets)

===16 januari 2008===

MDL:
# Heem oxygenase systeem
# Kaartjes:
#* Amide linked myristoyl anchors
#* Calcium oscillaties

JR:

# Bespreek de globale mechanismen van translatieregulatie.
# Kaartjes:
#* miRNA
#* Calnexin-Calreticulin cycling

===16 januari 2008===
Hoofdvragen:
# op welke wijzen knockdown door RNA interferentie experimenteel kan gebruikt worden?
# Deoxyribunucleotide synthese en regulatie

Korte vragen:
# lambda repressor
# mRNA turnover
# cascades
# proteïnesynthese en hemine

Advanced biochemistry and biotechnology

2020-01-17T13:51:06Z

Elisevanvyve: /* 17 januari 2020 VM */

[[Categorie: Mabb]]
==Vakinformatie==
Verdiepend vervolg op Moleculaire en Dynamische Biochemie van de 2e bachelor, gedoceerd door Prof Johan Robben. (Voor 2009-2010 door Prof M. De Ley en J. Robben)

Het examen is opgebouwd uit 2 grote, open vragen en 4 begrippen. De eerste vraag en de begrippen zijn schriftelijk met mondelinge toelichting: hij leest je antwoorden en stelt bijvragen indien nodig. De tweede open vraag is schriftelijk af te geven.

"De studenten hebben mij iets heel handig gegeven om na te gaan welke examenvragen ik de laatste jaren gesteld heb, ze houden het beter bij als ik zelf."
-- Quote Johan Robben, 2014

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/n/G0G74AN.htm

==Examenvragen==

=== 17 januari 2020 VM===

#5’ UTR van expressieregulatie bij eukaryoten
#cas9 systeem waar CRISPR is op gebaseerd en vergelijk met Argonaut
#Begrippen
#*attenuatie
#*nonsense-mediated decay
#*looped primer RT-PCR
#*proteasome stress response

=== 25 januari 2019 NM===

#Leg de regulatie van het trp-operon uit
#Geef een schematisch overzicht van unfolded protein respons
#Begrippen
#* RITS
#* Shutdown decay
#* BMAL
#* uORF

=== 18 januari 2019 NM===

#3’ UTR bij eukaryoten
#Experimenteel knockdown van genen adhv RNAi
#Begrippen
#* RNA switch
#* Periodosoom
#* RNA editing
#* CMA

=== 18 januari 2019 VM===
#Bespreek de structuur en werking van riboschakelaars (riboswitches). Wat weet je over hun functie? Illustreer je antwoord met voorbeelden.
#Bespreek de moleculair-dynamische mechanismen die aan de basis liggen van het metabolische dag-nacht ritme bij zoogdieren.
#Begrippen
#* Selenocysteine
#* Nonsense-mediated decay
#* shRNA
#* Proximity-induced autoactivation

===22 januari 2018, VM===
#Geef overzicht van de regelmechanismen waarmee eukaryoten de translatie globaal (=niet eiwit specifiek) kan worden geregeld. In welke situatie is een dergelijke regeling van toepassing? Hoe ontsnappen sommige genen aan deze regeling?
#Bespreek op welke wijze(n) de poly(a)-staart van mRNA fungeert in expressie regulatie. (ook iets over de lengte ervan)
#Begrippen:
#* Retroreulatie
#* Genomische imprinting (+voorbeeld)
#* Nonsense-mediated decay
#*Nocturnine

===19 januari 2018, VM===
#Geef de gelijkenissen en verschillen voor de expressie regulatie aan de 5'-UTR en 5'-uiteinde regio bij prokaryoten en eukaryoten.
#Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress? (= ERAD en UPR)
#Begrippen:
#* Tac promotor (= is die gefuseerde promotor van lac operon en tac operon vanuit de werkzitting)
#* Rip: regulated intramembrane proteolysis
#* RITS
#* foto-entrainment

===21 augustus 2017===
#Controlemechanismen van mRNA bij eukaryoten.
#De rol van ubiquitine ligasen in proteïne turnover
#Begrippen:
#*Transcriptional gene silencing
#*Peptide mediated protein knockdownn
#*Familial fast sleep syndrome
#*Een vierde begrip

===3 februari 2017===
#Verduidelijk de structuur en werking van riboswitches . Leg hun functie uit
#Rol van Poly-A-staart bij regulatie van expressie
#Woordjes:
#*Nocturnine
#*uORF
#*Genetic imprinting
#*Chaperone-gemedieerde autofagie

===23 januari 2017===
#Globale translatie regulatie mechanisme uitleggen, wanneer is dit van toepassing en hoe ontsnappen genen eraan
#Op welke wijze(n) kan je de functie en voorkomen RNAi experimenteel uitvoeren?
#Bespreek kort
#*Retroregulation
#*Rip: regulated intramembrane proteolyse
#*nonsense mediated decay
#*Periodosoom

===20 januari 2017===
#Welke elementen in 3'-UTR voor expressieregulatie?
#Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress?
#Bespreek kort:
#*Attenuatie
#*Hairpin silencing
#*Translational recoding
#*Photo-entrainment

===29 januari 2016===
#UPR
#Circadische clock in zoogdieren
#Bespreek kort:
#*hairpin silencing
#*argonaut
#*genomic imprinting
#*riboswitch

===27 januari 2016===
#Geef overzichtelijk de technieken die kunnen gebruikt worden om het voorkomen en functies van kleine RNA's te bestuderen. (Hij was precies niet geÃ¯nteresseerd in RAKE, looped primer en al die dingen... Hij zei iets over sRNA sponzen en stabiele nucleïnezuuranalogen)
#Geef de werking en functie(s) van macroautophagie.
#Bespreek kort:
#*real-time RT-PCR
#*selenocysteÃ¯ne
#*caspasen
#*RIP.

===18 januari 2016===
#Hoe knockdown van genen bekomen via experimenten met RNA interferentie? wat zijn de aandachtpunten? bijvraag: wat zou je eerder gebruiken siRNA of via vector shRNA? en wat bij de mens?
#Translationele recoding wat is het en op welke manieren wordt het bereikt?
#Bespreek kort:
#*histonehermodellering
#*shut down decay
#*RNA editing
#*BMAL-CLOCK

===15 januari 2016===
#Globale translatie regulatie mechanisme uitleggen, wanneer is dit van toepassing (Stress enz), en hoe ontsnappen genen eraan (uORF)
#Rol van ubiquitinr ligases in proteïne turnover.
#Bespreek kort:
#*Chromatine remoddeling
#*Non stop decay
#*Periodosoom
#*Seed sequentie

===28 januari 2015===
#Bespreek het purine katabolisme + welke afwijkingen bij de mens?
#Wat weet je over Ubiquitine ligases in proteïne metabolisme?
#Bespreek kort:
#*RIP
#*Translationele hercodering
#*Exosoom
#*Looped-primer RT-PCR

===september 2014 ===
#Bespreek de N-endrule en eiwitafbraak. Vergelijk tussen eukaryoten en prokaryoten.
#Stel een dierenexperiment met RNAi; welke methoden voor knockdown van een gen stel je voor, welke verkies je voor het maximale resultaat?
#Bespreek kort:
#*RIP
#*Icterus
#*UPR
#*Nocturine

===31 januari 2014 ===
#Geef de diverse regulatiemechanismes van het (chole)sterolmetabolisme.
#Bespreek de invloed van ubiquitineligases op de proteïne turnover.
#Bespreek kort:
#*Geelzucht
#*genome imprinting
#*Initiator caspase
#*KiaC

===29 januari 2014 ===
# Bespreek overzichtelijk de mRNA kwaliteitscontrolemechanismen bij prokaryoten en eukaryoten
# Geef een overzicht van de verschillende mechanismen van cel-gecontroleerde eiwitafbraak die niet via proteasomen verloopt
#Bespreek kort:
#*Lesch-Nyhan-syndroom
#*Selenocysteine
#*Calnexin-calreticuline cyclus
#*Clock/BMAL1

===20 januari 2014===
#Bespreek schematische de biosynthese van heem. Hoe wordt het gereguleerd? En hoe werkt heem bij de algemene genexpressie?
#Bespreek "unfolded protein response" (UPR)?
#Leg kort uit
#* Trans-translatie
#*RNA editering
#*shRNA
#*Nocturnine

=== 21 januari 2013 ===
# Bespreek de mogelijke rol van de 5'-UTR in de posttranscriptionele expressieregultatie van prokaryoten.
# Bespreek het controlemechanisme van membraaneiwitten en eiwitten vÃ³Ã³r secretie. Welke mechanismen treden er op bij stress?
# Bespreek kort:
#* ALA-synthase
#* transtranslatie
#* Seed sequentie
#* nocturnine

=== 15 januari 2013 ===
# Bespreek de moleculaire mechanismen voor ijzerhomeostase.
# Bespreek het kloksysteem van Synechococcus (cyanobacterie). bijvraag: grote verschil met zoogdieren (= eiwitklok vs gen-gereguleerd)
# Bespreek kort:
#* thymidylaatsynthase
#* RNA editering
#* chaperone gemedieerde autofagie
#* argonaut

=== 3 februari 2012 ===
# Bespreek de moleculaire mechanismen voor de overerving van expressiepatronen tijdens de celcyclus. Wat is het belang hiervan?
# Bespreek de globale regulatiemechanismen bij proteasoom-afhankelijke proteolysis.
# Bespreek kort:
#* 5-FOA
#* RNA editering
#* seed sequence
#* nocturnine

=== 17 januari 2012 ===
# Bespreek de mogelijke rol van de 5'-UTR in de posttranscriptionele expressieregultatie van prokaryoten.
# Bespreek de globale regulatiemechanismen bij proteasoom-afhankelijke proteolysis.
# Bespreek kort:
#* Thymidilaatsynthetase
#* Geelzucht
#* CpG eiland
#* RITS

=== 1 september 2011 ===
# Schematische beschrijving heem biosynthese + hoe wordt cellulaire homeostase van heem bereikt?
# Geef overzicht van regelmechanismen waarmee bij eukaryoten de translatie globaal kan worden geregeld. In welke situaties is dergelijke regeling van toepassing? Hoe ontsnappen sommige genen aan de regeling?
# Bespreek kort:
#* histonmethyltransferase
#* nonsense mediated decay
#* photo entrainment
#* shRNA

=== 4 februari 2011 ===
# N-end rule
# Moleculaire dag en nacht ritme van het metabolisme van zoogdiercellen
# Bespreek kort:
#* geelzucht
#* selenocysteïne
#* Shutdown decay (SSD)
#* eIF2

=== 24 januari 2011 ===
# Geef het belang van de 3' Untranslated region bij expressie in eukaryoten.
# Leg het klok systeem van cyanobacteriÃ«n uit
# Bespreek kort:
#* OMP
#* RNA editing
#* toxine-antitoxine
#* ubiquitineligase E3

=== 18 januari 2011 ===
# Bespreek riboswitches.
# Op welke wijze(n) kan je RNAi experimenteel uitvoeren?
# Bespreek kort:
#* allopurinol
#* uORFs
#* ERAD
#* photo-entrainment

=== 29 januari 2010 ===
# Geef het belang van de 3' Untranslated region bij expressie in eukaryoten.
# Leg het klok systeem van cyanobacteriÃ«n uit, en de invloed op transcriptie.
# Bespreek kort:
#* OMP
#* ERAD
#* initiator caspases
#* myristoylisatie
=== 18 januari 2010 ===
# N-end rule
# Moleculaire dag en nacht ritme van het metabolisme van zoogdiercellen
# Bespreek kort:
#* geelzucht
#* selenocysteïne
#* RISC
#* endosomale lokalisatiesignaal

===12 januari 2010===
# Bespreek de purineafbraak en de verschillende metabole stoornissen bij de mens die hiermee verband houden.
# Bespreek de globale regulatie van eukaryote translatie. Hoe kunnen sommige genen aan deze regulatie ontsnappen?
# Bespreek kort:
#* Nocturnine
#* uORFs (valt weg, want bij vraag twee zitten ook al uORFs)
#* shRNA
#* nuclear localisation signal

===29 januari 2009===
MDL:
# purinebiosynthese en regulatie
# kaartjes:
#* Adaptor
#* Cascades, waarom?

JR:
# Controlemechanismen mRNA in eukaryoten
# kaartjes:
#* histonmethyltransferase
#* RITS

===29 januari 2009===
MDL: Calcium
JR: N end rule

===20 januari 2009===
Deley:
# Afbraak van vetzuren
# Kaartjes:
#* GPCR
#* werking van groeifactoren
Robben: manieren van doorgeven van expressie patronen bij celdeling. Waarom deze regeling? (epigenetic inheritance)

Nog Kaartjes:
# calnexine/calreticuline cycle
# Argonaut
# SH2 en SH3
# stimulatie van proteïnesynthese door hemine
# Ubiquitine als sorteringssignaal
# Thio-etherankers en thio-esterankers
# shRNA
# riboswitch
# RITS
# ARE (AU-rich element)
# transition state analog (daar moest hij n-PALA hebben)
# cascade, waarom?

===31 januari 2008===
MDL:
# Bespreek purineafbraak + storingen
# kaartjes: GPCR en de tabel heel in't begin van 't eerste hoofdstuk met E.Coli, S. Cerevisiae, ...

JRB:
# Bespreek lysosomale afbraak
# kaartjes: mRNA localizatie en non-sense mediated decay

===31 januari 2008===
MDL:
# Bespreek de vorming van deoxyribonucleotiden + regulatie
# kaartjes: oncogenen en amidelinked ankers

JRB:
# Bespreek methylering van histonen en DNA en hoe deze expressie kunnen reguleren
# kaartjes: eIF4E-bindend proteine en sRNA switch

===30 januari 2008===
# MDL: Pyrimidinebiosynthese
# JRB: Welke rol speelt poly(A) bij de vorming van proteinen (of zoiets)

===16 januari 2008===

MDL:
# Heem oxygenase systeem
# Kaartjes:
#* Amide linked myristoyl anchors
#* Calcium oscillaties

JR:

# Bespreek de globale mechanismen van translatieregulatie.
# Kaartjes:
#* miRNA
#* Calnexin-Calreticulin cycling

===16 januari 2008===
Hoofdvragen:
# op welke wijzen knockdown door RNA interferentie experimenteel kan gebruikt worden?
# Deoxyribunucleotide synthese en regulatie

Korte vragen:
# lambda repressor
# mRNA turnover
# cascades
# proteïnesynthese en hemine

Advanced biochemistry and biotechnology

2020-01-17T12:30:15Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */

[[Categorie: Mabb]]
==Vakinformatie==
Verdiepend vervolg op Moleculaire en Dynamische Biochemie van de 2e bachelor, gedoceerd door Prof Johan Robben. (Voor 2009-2010 door Prof M. De Ley en J. Robben)

Het examen is opgebouwd uit 2 grote, open vragen en 4 begrippen. De eerste vraag en de begrippen zijn schriftelijk met mondelinge toelichting: hij leest je antwoorden en stelt bijvragen indien nodig. De tweede open vraag is schriftelijk af te geven.

"De studenten hebben mij iets heel handig gegeven om na te gaan welke examenvragen ik de laatste jaren gesteld heb, ze houden het beter bij als ik zelf."
-- Quote Johan Robben, 2014

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/n/G0G74AN.htm

==Examenvragen==

=== 17 januari 2020 VM===

#5’ UTR van expressieregulatie bij eukaryoten
#cas9 systeem waar CrISPR is opgebaggerd en vergelijk met Argonaut
#Begrippen
#*attenuatie
#*nonsense-mediated decay
#*looped primer RT-PCR
#*proteasome stress response

=== 25 januari 2019 NM===

#Leg de regulatie van het trp-operon uit
#Geef een schematisch overzicht van unfolded protein respons
#Begrippen
#* RITS
#* Shutdown decay
#* BMAL
#* uORF

=== 18 januari 2019 NM===

#3’ UTR bij eukaryoten
#Experimenteel knockdown van genen adhv RNAi
#Begrippen
#* RNA switch
#* Periodosoom
#* RNA editing
#* CMA

=== 18 januari 2019 VM===
#Bespreek de structuur en werking van riboschakelaars (riboswitches). Wat weet je over hun functie? Illustreer je antwoord met voorbeelden.
#Bespreek de moleculair-dynamische mechanismen die aan de basis liggen van het metabolische dag-nacht ritme bij zoogdieren.
#Begrippen
#* Selenocysteine
#* Nonsense-mediated decay
#* shRNA
#* Proximity-induced autoactivation

===22 januari 2018, VM===
#Geef overzicht van de regelmechanismen waarmee eukaryoten de translatie globaal (=niet eiwit specifiek) kan worden geregeld. In welke situatie is een dergelijke regeling van toepassing? Hoe ontsnappen sommige genen aan deze regeling?
#Bespreek op welke wijze(n) de poly(a)-staart van mRNA fungeert in expressie regulatie. (ook iets over de lengte ervan)
#Begrippen:
#* Retroreulatie
#* Genomische imprinting (+voorbeeld)
#* Nonsense-mediated decay
#*Nocturnine

===19 januari 2018, VM===
#Geef de gelijkenissen en verschillen voor de expressie regulatie aan de 5'-UTR en 5'-uiteinde regio bij prokaryoten en eukaryoten.
#Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress? (= ERAD en UPR)
#Begrippen:
#* Tac promotor (= is die gefuseerde promotor van lac operon en tac operon vanuit de werkzitting)
#* Rip: regulated intramembrane proteolysis
#* RITS
#* foto-entrainment

===21 augustus 2017===
#Controlemechanismen van mRNA bij eukaryoten.
#De rol van ubiquitine ligasen in proteïne turnover
#Begrippen:
#*Transcriptional gene silencing
#*Peptide mediated protein knockdownn
#*Familial fast sleep syndrome
#*Een vierde begrip

===3 februari 2017===
#Verduidelijk de structuur en werking van riboswitches . Leg hun functie uit
#Rol van Poly-A-staart bij regulatie van expressie
#Woordjes:
#*Nocturnine
#*uORF
#*Genetic imprinting
#*Chaperone-gemedieerde autofagie

===23 januari 2017===
#Globale translatie regulatie mechanisme uitleggen, wanneer is dit van toepassing en hoe ontsnappen genen eraan
#Op welke wijze(n) kan je de functie en voorkomen RNAi experimenteel uitvoeren?
#Bespreek kort
#*Retroregulation
#*Rip: regulated intramembrane proteolyse
#*nonsense mediated decay
#*Periodosoom

===20 januari 2017===
#Welke elementen in 3'-UTR voor expressieregulatie?
#Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress?
#Bespreek kort:
#*Attenuatie
#*Hairpin silencing
#*Translational recoding
#*Photo-entrainment

===29 januari 2016===
#UPR
#Circadische clock in zoogdieren
#Bespreek kort:
#*hairpin silencing
#*argonaut
#*genomic imprinting
#*riboswitch

===27 januari 2016===
#Geef overzichtelijk de technieken die kunnen gebruikt worden om het voorkomen en functies van kleine RNA's te bestuderen. (Hij was precies niet geÃ¯nteresseerd in RAKE, looped primer en al die dingen... Hij zei iets over sRNA sponzen en stabiele nucleïnezuuranalogen)
#Geef de werking en functie(s) van macroautophagie.
#Bespreek kort:
#*real-time RT-PCR
#*selenocysteÃ¯ne
#*caspasen
#*RIP.

===18 januari 2016===
#Hoe knockdown van genen bekomen via experimenten met RNA interferentie? wat zijn de aandachtpunten? bijvraag: wat zou je eerder gebruiken siRNA of via vector shRNA? en wat bij de mens?
#Translationele recoding wat is het en op welke manieren wordt het bereikt?
#Bespreek kort:
#*histonehermodellering
#*shut down decay
#*RNA editing
#*BMAL-CLOCK

===15 januari 2016===
#Globale translatie regulatie mechanisme uitleggen, wanneer is dit van toepassing (Stress enz), en hoe ontsnappen genen eraan (uORF)
#Rol van ubiquitinr ligases in proteïne turnover.
#Bespreek kort:
#*Chromatine remoddeling
#*Non stop decay
#*Periodosoom
#*Seed sequentie

===28 januari 2015===
#Bespreek het purine katabolisme + welke afwijkingen bij de mens?
#Wat weet je over Ubiquitine ligases in proteïne metabolisme?
#Bespreek kort:
#*RIP
#*Translationele hercodering
#*Exosoom
#*Looped-primer RT-PCR

===september 2014 ===
#Bespreek de N-endrule en eiwitafbraak. Vergelijk tussen eukaryoten en prokaryoten.
#Stel een dierenexperiment met RNAi; welke methoden voor knockdown van een gen stel je voor, welke verkies je voor het maximale resultaat?
#Bespreek kort:
#*RIP
#*Icterus
#*UPR
#*Nocturine

===31 januari 2014 ===
#Geef de diverse regulatiemechanismes van het (chole)sterolmetabolisme.
#Bespreek de invloed van ubiquitineligases op de proteïne turnover.
#Bespreek kort:
#*Geelzucht
#*genome imprinting
#*Initiator caspase
#*KiaC

===29 januari 2014 ===
# Bespreek overzichtelijk de mRNA kwaliteitscontrolemechanismen bij prokaryoten en eukaryoten
# Geef een overzicht van de verschillende mechanismen van cel-gecontroleerde eiwitafbraak die niet via proteasomen verloopt
#Bespreek kort:
#*Lesch-Nyhan-syndroom
#*Selenocysteine
#*Calnexin-calreticuline cyclus
#*Clock/BMAL1

===20 januari 2014===
#Bespreek schematische de biosynthese van heem. Hoe wordt het gereguleerd? En hoe werkt heem bij de algemene genexpressie?
#Bespreek "unfolded protein response" (UPR)?
#Leg kort uit
#* Trans-translatie
#*RNA editering
#*shRNA
#*Nocturnine

=== 21 januari 2013 ===
# Bespreek de mogelijke rol van de 5'-UTR in de posttranscriptionele expressieregultatie van prokaryoten.
# Bespreek het controlemechanisme van membraaneiwitten en eiwitten vÃ³Ã³r secretie. Welke mechanismen treden er op bij stress?
# Bespreek kort:
#* ALA-synthase
#* transtranslatie
#* Seed sequentie
#* nocturnine

=== 15 januari 2013 ===
# Bespreek de moleculaire mechanismen voor ijzerhomeostase.
# Bespreek het kloksysteem van Synechococcus (cyanobacterie). bijvraag: grote verschil met zoogdieren (= eiwitklok vs gen-gereguleerd)
# Bespreek kort:
#* thymidylaatsynthase
#* RNA editering
#* chaperone gemedieerde autofagie
#* argonaut

=== 3 februari 2012 ===
# Bespreek de moleculaire mechanismen voor de overerving van expressiepatronen tijdens de celcyclus. Wat is het belang hiervan?
# Bespreek de globale regulatiemechanismen bij proteasoom-afhankelijke proteolysis.
# Bespreek kort:
#* 5-FOA
#* RNA editering
#* seed sequence
#* nocturnine

=== 17 januari 2012 ===
# Bespreek de mogelijke rol van de 5'-UTR in de posttranscriptionele expressieregultatie van prokaryoten.
# Bespreek de globale regulatiemechanismen bij proteasoom-afhankelijke proteolysis.
# Bespreek kort:
#* Thymidilaatsynthetase
#* Geelzucht
#* CpG eiland
#* RITS

=== 1 september 2011 ===
# Schematische beschrijving heem biosynthese + hoe wordt cellulaire homeostase van heem bereikt?
# Geef overzicht van regelmechanismen waarmee bij eukaryoten de translatie globaal kan worden geregeld. In welke situaties is dergelijke regeling van toepassing? Hoe ontsnappen sommige genen aan de regeling?
# Bespreek kort:
#* histonmethyltransferase
#* nonsense mediated decay
#* photo entrainment
#* shRNA

=== 4 februari 2011 ===
# N-end rule
# Moleculaire dag en nacht ritme van het metabolisme van zoogdiercellen
# Bespreek kort:
#* geelzucht
#* selenocysteïne
#* Shutdown decay (SSD)
#* eIF2

=== 24 januari 2011 ===
# Geef het belang van de 3' Untranslated region bij expressie in eukaryoten.
# Leg het klok systeem van cyanobacteriÃ«n uit
# Bespreek kort:
#* OMP
#* RNA editing
#* toxine-antitoxine
#* ubiquitineligase E3

=== 18 januari 2011 ===
# Bespreek riboswitches.
# Op welke wijze(n) kan je RNAi experimenteel uitvoeren?
# Bespreek kort:
#* allopurinol
#* uORFs
#* ERAD
#* photo-entrainment

=== 29 januari 2010 ===
# Geef het belang van de 3' Untranslated region bij expressie in eukaryoten.
# Leg het klok systeem van cyanobacteriÃ«n uit, en de invloed op transcriptie.
# Bespreek kort:
#* OMP
#* ERAD
#* initiator caspases
#* myristoylisatie
=== 18 januari 2010 ===
# N-end rule
# Moleculaire dag en nacht ritme van het metabolisme van zoogdiercellen
# Bespreek kort:
#* geelzucht
#* selenocysteïne
#* RISC
#* endosomale lokalisatiesignaal

===12 januari 2010===
# Bespreek de purineafbraak en de verschillende metabole stoornissen bij de mens die hiermee verband houden.
# Bespreek de globale regulatie van eukaryote translatie. Hoe kunnen sommige genen aan deze regulatie ontsnappen?
# Bespreek kort:
#* Nocturnine
#* uORFs (valt weg, want bij vraag twee zitten ook al uORFs)
#* shRNA
#* nuclear localisation signal

===29 januari 2009===
MDL:
# purinebiosynthese en regulatie
# kaartjes:
#* Adaptor
#* Cascades, waarom?

JR:
# Controlemechanismen mRNA in eukaryoten
# kaartjes:
#* histonmethyltransferase
#* RITS

===29 januari 2009===
MDL: Calcium
JR: N end rule

===20 januari 2009===
Deley:
# Afbraak van vetzuren
# Kaartjes:
#* GPCR
#* werking van groeifactoren
Robben: manieren van doorgeven van expressie patronen bij celdeling. Waarom deze regeling? (epigenetic inheritance)

Nog Kaartjes:
# calnexine/calreticuline cycle
# Argonaut
# SH2 en SH3
# stimulatie van proteïnesynthese door hemine
# Ubiquitine als sorteringssignaal
# Thio-etherankers en thio-esterankers
# shRNA
# riboswitch
# RITS
# ARE (AU-rich element)
# transition state analog (daar moest hij n-PALA hebben)
# cascade, waarom?

===31 januari 2008===
MDL:
# Bespreek purineafbraak + storingen
# kaartjes: GPCR en de tabel heel in't begin van 't eerste hoofdstuk met E.Coli, S. Cerevisiae, ...

JRB:
# Bespreek lysosomale afbraak
# kaartjes: mRNA localizatie en non-sense mediated decay

===31 januari 2008===
MDL:
# Bespreek de vorming van deoxyribonucleotiden + regulatie
# kaartjes: oncogenen en amidelinked ankers

JRB:
# Bespreek methylering van histonen en DNA en hoe deze expressie kunnen reguleren
# kaartjes: eIF4E-bindend proteine en sRNA switch

===30 januari 2008===
# MDL: Pyrimidinebiosynthese
# JRB: Welke rol speelt poly(A) bij de vorming van proteinen (of zoiets)

===16 januari 2008===

MDL:
# Heem oxygenase systeem
# Kaartjes:
#* Amide linked myristoyl anchors
#* Calcium oscillaties

JR:

# Bespreek de globale mechanismen van translatieregulatie.
# Kaartjes:
#* miRNA
#* Calnexin-Calreticulin cycling

===16 januari 2008===
Hoofdvragen:
# op welke wijzen knockdown door RNA interferentie experimenteel kan gebruikt worden?
# Deoxyribunucleotide synthese en regulatie

Korte vragen:
# lambda repressor
# mRNA turnover
# cascades
# proteïnesynthese en hemine

Laboratory Animal Sciences

2019-12-23T14:30:17Z

Elisevanvyve: /* 12 januari 2016 */

[[Categorie: Mabb]]
== Vakinformatie ==

Keuzevak, gedoceerd door Prof. Erna Dewil, dat vaak gevolgd wordt door master biochemie en mensen die met een doctoraat bezig zijn (alsook biologie, BMW, bio-ingenieurs studenten).
Door voor dit vak te slagen, krijg je een certificaat waardoor je experimenten mag uitvoeren op proefdieren. Schriftelijk voorbereiden, examen zelf was mondeling. Nu ios het examen volledig schriftelijk.

Vragen staan in Nederlands en Engels geschreven. Er wordt verwacht dat de antwoorden in het Engels geformuleerd worden.

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/E05E6AE.htm

== Examenvragen ==

=== 25 januari 2019 (NM) ===
Schriftelijk
Leg uit:
#*Harderian gland
#*Orbitapuncture
#*Bruce effect
#*Gavage
#Leg uit in detail: F1-hybride
#Leg uit in detail lokale anesthesie
#Leg uit in detail: Natuurlijk voeder
#Wat zijn mogelijke vormen van kooiverrijking, leg ze elk kort uit

=== 25 januari 2019 ===
Begrippen:
#isolator
#3 R’s
#zoonose
#lee-boot effect

Grote vragen
#Consomic strain
#Geef alle mogelijke analgesia en bespreek hun neveneffecten
#Welke infectie oorzaken zijn er? Hoe kan je deze vermijden?
#Effect van stress op behaviour

=== 31 januari 2018 versie A ===
Schriftelijk
#Welke factoren bepalen de nutriënten behoeften van proefdieren?
#Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?
#Welke invloed heeft licht en geluid op het welzijn van de proefdieren?
#Leg uit: premedicatie en sedatie
#Hoe kan bloedverlies bij chirurgische ingrepen vermeden worden? Wat zijn de belangrijkste postoperatieve zorgen?

===31 januari 2018 versie B===
Schriftelijk
#Leg uit:
#*Whitten effect
#*3 R's
#*isolator
#*Zoonose
#Welke effecten kan stress hebben op gedrag?
#Leg uit (in detail): F1 hybride
#Hoe kan een ziekte ontstaan in een animal facility en hoe kun je dit voorkomen?
#Wat zijn mogelijke vormen van analgie, en wat zijn de bijwerkingen?

===16 januari 2018===
Schriftelijk
#Leg uit:
#*Harderian gland
#*Orbitapuncture
#*Bruce effect
#*Gavage
#Leg uit in detail: congene stam
#Uitleggen lokale anesthesie
#Uitleggen natuurlijk voeder
#Wat zijn mogelijke vormen van kooiverrijking, leg kort uit.

=== 1 februari 2017 (versie A)===
#Welke factoren bepalen de nutriënten behoeften van proefdieren?
#Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?
#Welke invloed heeft licht en geluid op het welzijn van de proefdieren?
#Leg uit: premedicatie en sedatie en geef een voorbeeld
#Hoe kan bloedverlies bij chirurgische ingrepen vermeden worden? Wat zijn de belangrijkste postoperatieve zorgen?

===1 februari 2017 (versie B)===
#Leg uit:
#*Whitten effect
#*3 R's
#*isolator
#*Zoonose
#Welke effecten kan stress hebben op gedrag?
#Leg uit (in detail): Congene stam
#Hoe kan een ziekte ontstaan in een animal facility en hoe kun je dit voorkomen?
#Wat zijn mogelijke vormen van analgie, en wat zijn de bijwerkingen?

===17 januari 2017===
#Leg uit:
#*Harderian gland
#*Orbitapuncture
#*Bruce effect
#*?
#Leg uit F1 hybriden in muizen
#Uitleggen Lokale anesthesie
#Uitleggen natuurlijk voeder
#Wat zijn mogelijke vormen van kooiverrijking, hoe toepassen?

===13 januari 2016===
#Leg uit:
#*whittin effect
#*co isogene stam
#*isolator
#*zoonose en voorbeeld
#bespreek gasanesthesie
#welke infexties kunnen optreden en hoe voorkomen?
#effect van stress op gedrag
#de 3R's en telkens 1 voorbeeld

===12 januari 2016===
#Geef definitie proefdier en dierproef
#Hoe controleer je de gezondheidstoestand van een dier? Waarom is dit belangrijk?
#Leg uit: congene stam => Bijvraag: hoe geef je de naam hiervan weer (schrijfwijze)
#Waarom zijn correcte temperatuur en vochtigheid belangrijk voor proefdieren?
#Wat is kooiverrijking en waarom doet men dit?
#Extra bijvraag: Geef de 3 R's.

=== 22 jan 2015 (nm)===
# Leg uit
#* Bruce effect
#* Gavage
#* IVC
# Wat zijn de eigenschappen van hypnotische stoffen? (bijvraag: waarom zou je urethaan gebruiken in plaats van thiopental/pentobarbital?)
# Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?
# Welke omgevingsfactoren spelen een rol voor het welzijn van proefdieren? Bespreek er 2 in detail.
# Hoe doet men een gezondheidsscreening? Waarom is dit belangrijk?

=== 14 jan 2015 (nm)===
# Definitie proefdier, definitie dierproef
# Wat is het belang van gezondheidsscreenings? Wat is het belang van quarantaine? Hoe wordt dit in de praktijk uitgevoerd? Wat zijn de opties/mogelijkheden bij een besmetting?
# Bespreek outbred stam.
# Wat is het belang van geur en ventilatie bij het huishouden van proefdieren? Wat kunnen de gevolgen zijn als er iets misgaat?
# Bespreek alpha-adrenergic agonists.

=== 13 jan 2014 (vm) ===
# Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?
# Welke invloed heeft licht en geluid op het welzijn van de proefdieren?
# Wat is het belang en risico van bloedverlies bij chirurgische ingrepen en hoe kan dit vermeden worden?
# Welke factoren bepalen de nutriÃ«ntenbehoeften behoefte van proefdieren?
# Bespreek: hypnotische stoffen
# Bijvraag 1: Stel je proefdier wilt een bepaalde stof niet innemen omdat het een slechte smaak heeft, wat kan je hieraan doen?
# Bijvraag 2: Wat is zoocentrisme?

=== 17 jan 2013 (nm) ===
==== reeks 1====

# Bespreek inteeltstam
# Hoe infecties in de dierenfaciliteit vermijden?
# Hoe preventief allergieen vermijden?
# Wat is enrichment?
# Geef voorbeelden en stress bij een dier.

Nog meer vragen te vinden in dit bestand: [[Media:Extra_vragen_proefdierkunde.pdf]]

==== reeks 2 ====

# Leg uit:
#*IVC
#*chimeer
#*zoocentrisme
#*...
#Bespreek de eigenschappen van hypnotische stoffen
#Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?
#Welke omgevingsfactoren spelen een rol voor het welzijn van proefdieren? Bespreek er 2 in detail.
#Hoe doet men gezondheidsscreening? Waarom is dit belangrijk?
#Bijvraag: Bespreek housing van zebravis.

==== reeks 3 ====

#Leg uit:
#*Bruce effect
#*Isolator
#*Isogene stam
#*Antropocentrisme
#Stress kan bij proefdieren zorgen voor een verandering in gedrag. Leg uit.
#Leg uit: Lokale anaesthesie
#Leg uit: A2-Faciliteit
#Welke maatregelen moeten er getroffen worden om allergieën tegen te gaan.

=== 17 jan 2012 (vm) ===

# Geef de definitie van een "proefdier" en een "dierproef"
# Wat is het belang van gezondheidsscreeningen en quarantaine?
# Bespreek: congene stam
# Wat zijn de invloeden van temperatuur en vochtigheid op een proefdier?
# Wat is kooiverrijking en welke vormen zijn er?

=== 18 jan 2011 ===

# leg uit:
#* Co-isogenic strain
#* Whitten effect
#* Isolator
#* zoÃ¶nose
# Welke producten kunnen allemaal gebruikt worden voor volledige Anaesthesie. Bespreek kort. (Bijvraag: Hoe kan je weten hoe diep het dier in de verdoving is gebracht?)
# Wat is de invloed van stress op laboratorium dieren? (Bijvraag: Hoe kan je abnormaal gedrag onderscheiden van normaal gedrag?)
# Hoe kan een infectie in een proefdierverblijf binnen gebracht worden? Wat kan je doen om dit te voorkomen?
# Geef de 3 R's en geef per R twee voorbeelden.

=== 19 jan 2010 ===

# leg uit:
#* de 3R's
#* Whitten effect
#* gaveren
#* zoÃ¶nose
# bespreek lokale anaesthesie
# bespreek F1 hybride
# Waarom zijn temperatuur en relatieve vochtigheid belangrijk in huisvesting?
# de mogelijke contaminanten van natuurlijke voeders.

=== 12 jan 2010 ===

# Factoren die nutriÃ«ntenbehoeften bepalen?
# Verschillende producten voor anesthesie en hun werking?
# Invloed van licht en geluid op proefdieren?
# Welke formaliteiten moeten in orde zijn voor een experiment van start kan gaan?
# Belang van bloedverlies tegengaan bij chirurgische ingrepen en methodes?
# Bijvraag: 3 R's

Veredeling en Biotechnologie

2019-09-04T17:36:34Z

Elisevanvyve: /* PLANT */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.

==Examenvragen==
===28 januari 2008===
#Vraag 1:
##Hardy-Weinberg
##genetische winst
##cytoplasmatische mannelijke steriliteit
##RNase
##transgressieve segregatie
##monosoom
##chimeer
##parthenogenie
##algemene combinatiegeschiktheid
##inteeltdepressie
#Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen
#Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploÃ¯die en autotetraploÃ¯die
#Bestendigheid: hoe bekomen?

===23 januari 2009===
====DIER====
#Vraag 1:
##Fokwaardeschatting
##SNP
##Recombinatiefractie
#Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening metÂ : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)
====PLANT====
#Vraag 1:
##Allelfrequentie
##Recurrente ouder
##Specifieke combinatiegeschiktheid
##Trisoom
##Insectenbestuiver
##QTL
#Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.
#Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)

===21 september 2009===
#Vraag 1:
##Overerfbaarheid
##SNP
##Koppelingsanalyse
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Antherencultuur
##Heterozygotie
##Inteeltdepressie
##Cultivar
##Monosoom
#(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschemaâ€™s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld.Â
#(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus.Â
#(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploÃ¯diegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiÃ«nt bij alloploÃ¯den als autoploÃ¯den?

===24 januari 2013===
====DIER====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##Fokwaarde
##Allelfrequentie
#musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##AFLP
##Heterozygositeit
##CoÃ«volutie
##PrefertilisatiebarriÃ¨re
##Genetische vooruitgang
#Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak.Â
#Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.

===23 januari 2014===
====DIERÂ ====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Heterozygoot (ivm merkers)
##AFLP
##...
#Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven.Â
#Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken.Â
#CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.
====DIER====
#Vraag 1:
##Zuivere lijn
##Bulmer effect
#Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Multitlijnveredeling(ivm merkers)
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Effectief aantal allelen
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Wat maakt een cultivar bestendig?Â
#Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken?Â
#Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.
====DIER====
#Vraag 1:
##Inteeltdepressie
##Stamboek
#Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Dominante merker
##CMS
##Transgressieve segregatie
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters?Â
#Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren.Â
#Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.

====DIER====
#Vraag 1:
##Fokdoel
##Heterosis
#Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Merkerdensiteit
##Genetisch recurrente selectie
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploÃ¯de of een autotetraploÃ¯de?Â
#Leg schema uit: synthetische cultivarÂ
===27 januari 2015===
====DIER====
#begrippen
##selectierespons
##multiplex PCR
##stressgen
#Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?
====PLANT====
#Begrippen
##QTL
##merkerdensiteit
##isolijn
##specifieke combinatiegeschiktheid
#Vragen
##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar.
##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)

===21 januari 2016===
====PLANT====
#woordjes
##dominante merker
##simmulariteitscoÃ«fficient
##algemene recombinatiegeschiktheid
##fenotypische recurrente selectie
#vragen
##bestendigheid realiseren hoe?
##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap
##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur
====DIER====
#Genomic selection
##op welk dier en welke eigenschap
##waarom
##hoe
#PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld
===14 januari 2016===
====PLANT====
SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie
Tekening van inteelt bij maïs
De vraag van tarwe, bulk, en single-seed
====DIER====
#Veredelings- en rotatiekruising
#Genetische test voor vruchtbaarheid maken

===14 januari 2016 (2)===
====PLANT====
#heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP
#wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?
# mondeling bespreking over artikel
#verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)
====DIER====
#schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?
#hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.

===31 januari 2017===
====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*CentiMorgan
#*SNP
#*genotype recurrente selectie
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?
#Artikel
#Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.
#Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?

===21 augustus 2017 NM ===

====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*aantal effectieve alleen
#*BSA (bulk segregant analysis)
#*recurrente ouder
#*isolijn
#Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?
#Artikel
#Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Vermeerderingspiramide
#Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.

=== 23 januari 2017 ===

====PLANT (Reeks 8) ====

Begrippen:

*AFLP
*Pre-fertilisatiebarrières
*Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)
*...

Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.

Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 27 augustus 2018 ===

====PLANT ====

Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden

*Apomixis
*Specifieke Combinatie Geschiktheid
*Merkerdensiteit

Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers

Vraag 3: Artikel

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 17 januari 2018 ===
====Plant====
# Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)
# Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?
# Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.
# Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?

====Dier====
# Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.
# Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?

=== 17 januari 2019 VM===
====DIER====
#Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?
#Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?

====PLANT====
Mondeling
#Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?
Schriftelijk
#Dominantie epistasie
#Triploid block
#Simple QTL

===17 januari 2019 NM===
====DIER====
#Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen
#Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren
====PLANT====
#Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen
#Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan
#Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL
#Leg solanaceae-type self incompatibility uit

===30 januari 2019 NM===
====DIER====
#konijnen kweken; voor welke eigenschappen en hoe ga je te werk?
#Je wil dezelfde spiergroei kenmerkend voor Belgisch Wit-Blauw in geiten, hoe ga je te werk?
====PLANT====
Mondeling
#Leg uit Backcrossing, hoe kunnen moleculaire merkers het proces versnellen?
Schriftelijk
#Brassicaceae type zelf incompatibiliteit
#Heterosis en transgenese
#Leg uit apomixie

===23 augustus 2019 VM===
====DIER====
#kwaliteitsvol vlees, welke dieren en waarom?
#schaap met goede vruchtbaarheid naar een ander schaap overbrengen, hoe ga je te werk?

====PLANT====
#Dubbele haploiden
#BSA
#F1 steriliteit
#overerfbaarheid (enge, brede zin)

===4 september 2019 NM===
====DIER====
#Wat is heterosis? Hoe ga je dit gebruiken bij het selecteren van varkens?
#Dood schaap gevonden met een bijwoonde. Hond of wolf? Wat ga je doen, leg elke stap uit?

====PLANT====
#Backcrossing, wat is het, hoe doe je het en welke moleculaire merkers kunnen BC versnellen?
#CGMS
#SPA (QTL) mapping
#Zaadloze vruchten, hoe ga je dit bekomen?

Veredeling en Biotechnologie

2019-09-04T17:36:01Z

Elisevanvyve: /* 4 september 2019 */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.

==Examenvragen==
===28 januari 2008===
#Vraag 1:
##Hardy-Weinberg
##genetische winst
##cytoplasmatische mannelijke steriliteit
##RNase
##transgressieve segregatie
##monosoom
##chimeer
##parthenogenie
##algemene combinatiegeschiktheid
##inteeltdepressie
#Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen
#Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploÃ¯die en autotetraploÃ¯die
#Bestendigheid: hoe bekomen?

===23 januari 2009===
====DIER====
#Vraag 1:
##Fokwaardeschatting
##SNP
##Recombinatiefractie
#Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening metÂ : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)
====PLANT====
#Vraag 1:
##Allelfrequentie
##Recurrente ouder
##Specifieke combinatiegeschiktheid
##Trisoom
##Insectenbestuiver
##QTL
#Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.
#Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)

===21 september 2009===
#Vraag 1:
##Overerfbaarheid
##SNP
##Koppelingsanalyse
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Antherencultuur
##Heterozygotie
##Inteeltdepressie
##Cultivar
##Monosoom
#(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschemaâ€™s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld.Â
#(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus.Â
#(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploÃ¯diegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiÃ«nt bij alloploÃ¯den als autoploÃ¯den?

===24 januari 2013===
====DIER====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##Fokwaarde
##Allelfrequentie
#musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##AFLP
##Heterozygositeit
##CoÃ«volutie
##PrefertilisatiebarriÃ¨re
##Genetische vooruitgang
#Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak.Â
#Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.

===23 januari 2014===
====DIERÂ ====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Heterozygoot (ivm merkers)
##AFLP
##...
#Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven.Â
#Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken.Â
#CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.
====DIER====
#Vraag 1:
##Zuivere lijn
##Bulmer effect
#Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Multitlijnveredeling(ivm merkers)
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Effectief aantal allelen
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Wat maakt een cultivar bestendig?Â
#Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken?Â
#Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.
====DIER====
#Vraag 1:
##Inteeltdepressie
##Stamboek
#Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Dominante merker
##CMS
##Transgressieve segregatie
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters?Â
#Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren.Â
#Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.

====DIER====
#Vraag 1:
##Fokdoel
##Heterosis
#Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Merkerdensiteit
##Genetisch recurrente selectie
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploÃ¯de of een autotetraploÃ¯de?Â
#Leg schema uit: synthetische cultivarÂ
===27 januari 2015===
====DIER====
#begrippen
##selectierespons
##multiplex PCR
##stressgen
#Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?
====PLANT====
#Begrippen
##QTL
##merkerdensiteit
##isolijn
##specifieke combinatiegeschiktheid
#Vragen
##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar.
##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)

===21 januari 2016===
====PLANT====
#woordjes
##dominante merker
##simmulariteitscoÃ«fficient
##algemene recombinatiegeschiktheid
##fenotypische recurrente selectie
#vragen
##bestendigheid realiseren hoe?
##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap
##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur
====DIER====
#Genomic selection
##op welk dier en welke eigenschap
##waarom
##hoe
#PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld
===14 januari 2016===
====PLANT====
SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie
Tekening van inteelt bij maïs
De vraag van tarwe, bulk, en single-seed
====DIER====
#Veredelings- en rotatiekruising
#Genetische test voor vruchtbaarheid maken

===14 januari 2016 (2)===
====PLANT====
#heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP
#wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?
# mondeling bespreking over artikel
#verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)
====DIER====
#schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?
#hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.

===31 januari 2017===
====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*CentiMorgan
#*SNP
#*genotype recurrente selectie
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?
#Artikel
#Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.
#Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?

===21 augustus 2017 NM ===

====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*aantal effectieve alleen
#*BSA (bulk segregant analysis)
#*recurrente ouder
#*isolijn
#Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?
#Artikel
#Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Vermeerderingspiramide
#Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.

=== 23 januari 2017 ===

====PLANT (Reeks 8) ====

Begrippen:

*AFLP
*Pre-fertilisatiebarrières
*Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)
*...

Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.

Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 27 augustus 2018 ===

====PLANT ====

Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden

*Apomixis
*Specifieke Combinatie Geschiktheid
*Merkerdensiteit

Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers

Vraag 3: Artikel

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 17 januari 2018 ===
====Plant====
# Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)
# Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?
# Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.
# Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?

====Dier====
# Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.
# Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?

=== 17 januari 2019 VM===
====DIER====
#Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?
#Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?

====PLANT====
Mondeling
#Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?
Schriftelijk
#Dominantie epistasie
#Triploid block
#Simple QTL

===17 januari 2019 NM===
====DIER====
#Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen
#Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren
====PLANT====
#Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen
#Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan
#Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL
#Leg solanaceae-type self incompatibility uit

===30 januari 2019 NM===
====DIER====
#konijnen kweken; voor welke eigenschappen en hoe ga je te werk?
#Je wil dezelfde spiergroei kenmerkend voor Belgisch Wit-Blauw in geiten, hoe ga je te werk?
====PLANT====
Mondeling
#Leg uit Backcrossing, hoe kunnen moleculaire merkers het proces versnellen?
Schriftelijk
#Brassicaceae type zelf incompatibiliteit
#Heterosis en transgenese
#Leg uit apomixie

===23 augustus 2019 VM===
====DIER====
#kwaliteitsvol vlees, welke dieren en waarom?
#schaap met goede vruchtbaarheid naar een ander schaap overbrengen, hoe ga je te werk?

====PLANT====
#Dubbele haploiden
#BSA
#F1 steriliteit
#overerfbaarheid (enge, brede zin)

===4 september 2019 NM===
====DIER====
#Wat is heterosis? Hoe ga je dit gebruiken bij het selecteren van varkens?
#Dood schaap gevonden met een bijwoonde. Hond of wolf? Wat ga je doen, leg elke stap uit?

====PLANT====
#Backcrossing
#CGMS
#SPA (QTL) mapping
#Zaadloze vruchten, hoe ga je dit bekomen?

Veredeling en Biotechnologie

2019-09-04T17:35:42Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.

==Examenvragen==
===28 januari 2008===
#Vraag 1:
##Hardy-Weinberg
##genetische winst
##cytoplasmatische mannelijke steriliteit
##RNase
##transgressieve segregatie
##monosoom
##chimeer
##parthenogenie
##algemene combinatiegeschiktheid
##inteeltdepressie
#Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen
#Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploÃ¯die en autotetraploÃ¯die
#Bestendigheid: hoe bekomen?

===23 januari 2009===
====DIER====
#Vraag 1:
##Fokwaardeschatting
##SNP
##Recombinatiefractie
#Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening metÂ : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)
====PLANT====
#Vraag 1:
##Allelfrequentie
##Recurrente ouder
##Specifieke combinatiegeschiktheid
##Trisoom
##Insectenbestuiver
##QTL
#Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.
#Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)

===21 september 2009===
#Vraag 1:
##Overerfbaarheid
##SNP
##Koppelingsanalyse
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Antherencultuur
##Heterozygotie
##Inteeltdepressie
##Cultivar
##Monosoom
#(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschemaâ€™s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld.Â
#(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus.Â
#(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploÃ¯diegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiÃ«nt bij alloploÃ¯den als autoploÃ¯den?

===24 januari 2013===
====DIER====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##Fokwaarde
##Allelfrequentie
#musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##AFLP
##Heterozygositeit
##CoÃ«volutie
##PrefertilisatiebarriÃ¨re
##Genetische vooruitgang
#Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak.Â
#Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.

===23 januari 2014===
====DIERÂ ====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Heterozygoot (ivm merkers)
##AFLP
##...
#Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven.Â
#Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken.Â
#CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.
====DIER====
#Vraag 1:
##Zuivere lijn
##Bulmer effect
#Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Multitlijnveredeling(ivm merkers)
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Effectief aantal allelen
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Wat maakt een cultivar bestendig?Â
#Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken?Â
#Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.
====DIER====
#Vraag 1:
##Inteeltdepressie
##Stamboek
#Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Dominante merker
##CMS
##Transgressieve segregatie
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters?Â
#Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren.Â
#Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.

====DIER====
#Vraag 1:
##Fokdoel
##Heterosis
#Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Merkerdensiteit
##Genetisch recurrente selectie
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploÃ¯de of een autotetraploÃ¯de?Â
#Leg schema uit: synthetische cultivarÂ
===27 januari 2015===
====DIER====
#begrippen
##selectierespons
##multiplex PCR
##stressgen
#Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?
====PLANT====
#Begrippen
##QTL
##merkerdensiteit
##isolijn
##specifieke combinatiegeschiktheid
#Vragen
##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar.
##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)

===21 januari 2016===
====PLANT====
#woordjes
##dominante merker
##simmulariteitscoÃ«fficient
##algemene recombinatiegeschiktheid
##fenotypische recurrente selectie
#vragen
##bestendigheid realiseren hoe?
##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap
##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur
====DIER====
#Genomic selection
##op welk dier en welke eigenschap
##waarom
##hoe
#PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld
===14 januari 2016===
====PLANT====
SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie
Tekening van inteelt bij maïs
De vraag van tarwe, bulk, en single-seed
====DIER====
#Veredelings- en rotatiekruising
#Genetische test voor vruchtbaarheid maken

===14 januari 2016 (2)===
====PLANT====
#heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP
#wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?
# mondeling bespreking over artikel
#verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)
====DIER====
#schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?
#hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.

===31 januari 2017===
====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*CentiMorgan
#*SNP
#*genotype recurrente selectie
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?
#Artikel
#Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.
#Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?

===21 augustus 2017 NM ===

====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*aantal effectieve alleen
#*BSA (bulk segregant analysis)
#*recurrente ouder
#*isolijn
#Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?
#Artikel
#Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Vermeerderingspiramide
#Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.

=== 23 januari 2017 ===

====PLANT (Reeks 8) ====

Begrippen:

*AFLP
*Pre-fertilisatiebarrières
*Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)
*...

Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.

Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 27 augustus 2018 ===

====PLANT ====

Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden

*Apomixis
*Specifieke Combinatie Geschiktheid
*Merkerdensiteit

Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers

Vraag 3: Artikel

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 17 januari 2018 ===
====Plant====
# Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)
# Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?
# Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.
# Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?

====Dier====
# Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.
# Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?

=== 17 januari 2019 VM===
====DIER====
#Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?
#Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?

====PLANT====
Mondeling
#Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?
Schriftelijk
#Dominantie epistasie
#Triploid block
#Simple QTL

===17 januari 2019 NM===
====DIER====
#Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen
#Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren
====PLANT====
#Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen
#Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan
#Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL
#Leg solanaceae-type self incompatibility uit

===30 januari 2019 NM===
====DIER====
#konijnen kweken; voor welke eigenschappen en hoe ga je te werk?
#Je wil dezelfde spiergroei kenmerkend voor Belgisch Wit-Blauw in geiten, hoe ga je te werk?
====PLANT====
Mondeling
#Leg uit Backcrossing, hoe kunnen moleculaire merkers het proces versnellen?
Schriftelijk
#Brassicaceae type zelf incompatibiliteit
#Heterosis en transgenese
#Leg uit apomixie

===23 augustus 2019 VM===
====DIER====
#kwaliteitsvol vlees, welke dieren en waarom?
#schaap met goede vruchtbaarheid naar een ander schaap overbrengen, hoe ga je te werk?

====PLANT====
#Dubbele haploiden
#BSA
#F1 steriliteit
#overerfbaarheid (enge, brede zin)

===4 september 2019===
====DIER====
#Wat is heterosis? Hoe ga je dit gebruiken bij het selecteren van varkens?
#Dood schaap gevonden met een bijwoonde. Hond of wolf? Wat ga je doen, leg elke stap uit?

====PLANT====
#Backcrossing
#CGMS
#SPA (QTL) mapping
#Zaadloze vruchten, hoe ga je dit bekomen?

Veredeling en Biotechnologie

2019-09-02T12:15:54Z

Elisevanvyve: /* DIER */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.

==Examenvragen==
===28 januari 2008===
#Vraag 1:
##Hardy-Weinberg
##genetische winst
##cytoplasmatische mannelijke steriliteit
##RNase
##transgressieve segregatie
##monosoom
##chimeer
##parthenogenie
##algemene combinatiegeschiktheid
##inteeltdepressie
#Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen
#Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploÃ¯die en autotetraploÃ¯die
#Bestendigheid: hoe bekomen?

===23 januari 2009===
====DIER====
#Vraag 1:
##Fokwaardeschatting
##SNP
##Recombinatiefractie
#Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening metÂ : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)
====PLANT====
#Vraag 1:
##Allelfrequentie
##Recurrente ouder
##Specifieke combinatiegeschiktheid
##Trisoom
##Insectenbestuiver
##QTL
#Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.
#Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)

===21 september 2009===
#Vraag 1:
##Overerfbaarheid
##SNP
##Koppelingsanalyse
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Antherencultuur
##Heterozygotie
##Inteeltdepressie
##Cultivar
##Monosoom
#(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschemaâ€™s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld.Â
#(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus.Â
#(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploÃ¯diegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiÃ«nt bij alloploÃ¯den als autoploÃ¯den?

===24 januari 2013===
====DIER====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##Fokwaarde
##Allelfrequentie
#musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##AFLP
##Heterozygositeit
##CoÃ«volutie
##PrefertilisatiebarriÃ¨re
##Genetische vooruitgang
#Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak.Â
#Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.

===23 januari 2014===
====DIERÂ ====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Heterozygoot (ivm merkers)
##AFLP
##...
#Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven.Â
#Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken.Â
#CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.
====DIER====
#Vraag 1:
##Zuivere lijn
##Bulmer effect
#Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Multitlijnveredeling(ivm merkers)
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Effectief aantal allelen
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Wat maakt een cultivar bestendig?Â
#Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken?Â
#Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.
====DIER====
#Vraag 1:
##Inteeltdepressie
##Stamboek
#Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Dominante merker
##CMS
##Transgressieve segregatie
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters?Â
#Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren.Â
#Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.

====DIER====
#Vraag 1:
##Fokdoel
##Heterosis
#Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Merkerdensiteit
##Genetisch recurrente selectie
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploÃ¯de of een autotetraploÃ¯de?Â
#Leg schema uit: synthetische cultivarÂ
===27 januari 2015===
====DIER====
#begrippen
##selectierespons
##multiplex PCR
##stressgen
#Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?
====PLANT====
#Begrippen
##QTL
##merkerdensiteit
##isolijn
##specifieke combinatiegeschiktheid
#Vragen
##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar.
##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)

===21 januari 2016===
====PLANT====
#woordjes
##dominante merker
##simmulariteitscoÃ«fficient
##algemene recombinatiegeschiktheid
##fenotypische recurrente selectie
#vragen
##bestendigheid realiseren hoe?
##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap
##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur
====DIER====
#Genomic selection
##op welk dier en welke eigenschap
##waarom
##hoe
#PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld
===14 januari 2016===
====PLANT====
SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie
Tekening van inteelt bij maïs
De vraag van tarwe, bulk, en single-seed
====DIER====
#Veredelings- en rotatiekruising
#Genetische test voor vruchtbaarheid maken

===14 januari 2016 (2)===
====PLANT====
#heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP
#wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?
# mondeling bespreking over artikel
#verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)
====DIER====
#schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?
#hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.

===31 januari 2017===
====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*CentiMorgan
#*SNP
#*genotype recurrente selectie
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?
#Artikel
#Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.
#Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?

===21 augustus 2017 NM ===

====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*aantal effectieve alleen
#*BSA (bulk segregant analysis)
#*recurrente ouder
#*isolijn
#Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?
#Artikel
#Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Vermeerderingspiramide
#Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.

=== 23 januari 2017 ===

====PLANT (Reeks 8) ====

Begrippen:

*AFLP
*Pre-fertilisatiebarrières
*Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)
*...

Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.

Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 27 augustus 2018 ===

====PLANT ====

Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden

*Apomixis
*Specifieke Combinatie Geschiktheid
*Merkerdensiteit

Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers

Vraag 3: Artikel

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 17 januari 2018 ===
====Plant====
# Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)
# Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?
# Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.
# Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?

====Dier====
# Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.
# Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?

=== 17 januari 2019 VM===
====DIER====
#Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?
#Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?

====PLANT====
Mondeling
#Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?
Schriftelijk
#Dominantie epistasie
#Triploid block
#Simple QTL

===17 januari 2019 NM===
====DIER====
#Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen
#Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren
====PLANT====
#Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen
#Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan
#Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL
#Leg solanaceae-type self incompatibility uit

===30 januari 2019 NM===
====DIER====
#konijnen kweken; voor welke eigenschappen en hoe ga je te werk?
#Je wil dezelfde spiergroei kenmerkend voor Belgisch Wit-Blauw in geiten, hoe ga je te werk?
====PLANT====
Mondeling
#Leg uit Backcrossing, hoe kunnen moleculaire merkers het proces versnellen?
Schriftelijk
#Brassicaceae type zelf incompatibiliteit
#Heterosis en transgenese
#Leg uit apomixie

===23 augustus 2019 VM===
====DIER====
#kwaliteitsvol vlees, welke dieren en waarom?
#schaap met goede vruchtbaarheid naar een ander schaap overbrengen, hoe ga je te werk?

====PLANT====
#Dubbele haploiden
#BSA
#F1 steriliteit
#overerfbaarheid (enge, brede zin)

Veredeling en Biotechnologie

2019-09-02T12:15:25Z

Elisevanvyve: /* 23 augustus 2019 */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.

==Examenvragen==
===28 januari 2008===
#Vraag 1:
##Hardy-Weinberg
##genetische winst
##cytoplasmatische mannelijke steriliteit
##RNase
##transgressieve segregatie
##monosoom
##chimeer
##parthenogenie
##algemene combinatiegeschiktheid
##inteeltdepressie
#Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen
#Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploÃ¯die en autotetraploÃ¯die
#Bestendigheid: hoe bekomen?

===23 januari 2009===
====DIER====
#Vraag 1:
##Fokwaardeschatting
##SNP
##Recombinatiefractie
#Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening metÂ : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)
====PLANT====
#Vraag 1:
##Allelfrequentie
##Recurrente ouder
##Specifieke combinatiegeschiktheid
##Trisoom
##Insectenbestuiver
##QTL
#Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.
#Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)

===21 september 2009===
#Vraag 1:
##Overerfbaarheid
##SNP
##Koppelingsanalyse
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Antherencultuur
##Heterozygotie
##Inteeltdepressie
##Cultivar
##Monosoom
#(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschemaâ€™s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld.Â
#(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus.Â
#(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploÃ¯diegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiÃ«nt bij alloploÃ¯den als autoploÃ¯den?

===24 januari 2013===
====DIER====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##Fokwaarde
##Allelfrequentie
#musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##AFLP
##Heterozygositeit
##CoÃ«volutie
##PrefertilisatiebarriÃ¨re
##Genetische vooruitgang
#Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak.Â
#Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.

===23 januari 2014===
====DIERÂ ====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Heterozygoot (ivm merkers)
##AFLP
##...
#Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven.Â
#Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken.Â
#CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.
====DIER====
#Vraag 1:
##Zuivere lijn
##Bulmer effect
#Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Multitlijnveredeling(ivm merkers)
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Effectief aantal allelen
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Wat maakt een cultivar bestendig?Â
#Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken?Â
#Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.
====DIER====
#Vraag 1:
##Inteeltdepressie
##Stamboek
#Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Dominante merker
##CMS
##Transgressieve segregatie
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters?Â
#Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren.Â
#Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.

====DIER====
#Vraag 1:
##Fokdoel
##Heterosis
#Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Merkerdensiteit
##Genetisch recurrente selectie
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploÃ¯de of een autotetraploÃ¯de?Â
#Leg schema uit: synthetische cultivarÂ
===27 januari 2015===
====DIER====
#begrippen
##selectierespons
##multiplex PCR
##stressgen
#Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?
====PLANT====
#Begrippen
##QTL
##merkerdensiteit
##isolijn
##specifieke combinatiegeschiktheid
#Vragen
##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar.
##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)

===21 januari 2016===
====PLANT====
#woordjes
##dominante merker
##simmulariteitscoÃ«fficient
##algemene recombinatiegeschiktheid
##fenotypische recurrente selectie
#vragen
##bestendigheid realiseren hoe?
##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap
##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur
====DIER====
#Genomic selection
##op welk dier en welke eigenschap
##waarom
##hoe
#PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld
===14 januari 2016===
====PLANT====
SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie
Tekening van inteelt bij maïs
De vraag van tarwe, bulk, en single-seed
====DIER====
#Veredelings- en rotatiekruising
#Genetische test voor vruchtbaarheid maken

===14 januari 2016 (2)===
====PLANT====
#heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP
#wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?
# mondeling bespreking over artikel
#verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)
====DIER====
#schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?
#hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.

===31 januari 2017===
====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*CentiMorgan
#*SNP
#*genotype recurrente selectie
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?
#Artikel
#Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.
#Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?

===21 augustus 2017 NM ===

====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*aantal effectieve alleen
#*BSA (bulk segregant analysis)
#*recurrente ouder
#*isolijn
#Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?
#Artikel
#Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Vermeerderingspiramide
#Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.

=== 23 januari 2017 ===

====PLANT (Reeks 8) ====

Begrippen:

*AFLP
*Pre-fertilisatiebarrières
*Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)
*...

Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.

Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 27 augustus 2018 ===

====PLANT ====

Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden

*Apomixis
*Specifieke Combinatie Geschiktheid
*Merkerdensiteit

Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers

Vraag 3: Artikel

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 17 januari 2018 ===
====Plant====
# Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)
# Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?
# Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.
# Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?

====Dier====
# Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.
# Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?

=== 17 januari 2019 VM===
====DIER====
#Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?
#Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?

====PLANT====
Mondeling
#Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?
Schriftelijk
#Dominantie epistasie
#Triploid block
#Simple QTL

===17 januari 2019 NM===
====DIER====
#Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen
#Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren
====PLANT====
#Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen
#Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan
#Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL
#Leg solanaceae-type self incompatibility uit

===30 januari 2019 NM===
====DIER====
#konijnen kweken; voor welke eigenschappen en hoe ga je te werk?
#Je wil dezelfde spiergroei kenmerkend voor Belgisch Wit-Blauw in geiten, hoe ga je te werk?
====PLANT====
Mondeling
#Leg uit Backcrossing, hoe kunnen moleculaire merkers het proces versnellen?
Schriftelijk
#Brassicaceae type zelf incompatibiliteit
#Heterosis en transgenese
#Leg uit apomixie

===23 augustus 2019 VM===
====DIER====
#kwaliteitsvol vlees, welke dieren en waarom?
#schaap met goede vruchtbaarheid naar eend ander schaap overbrengen, hoe ga je te werk?
====PLANT====
#Dubbele haploiden
#BSA
#F1 steriliteit
#overerfbaarheid (enge, brede zin)

Veredeling en Biotechnologie

2019-09-02T12:15:02Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.

==Examenvragen==
===28 januari 2008===
#Vraag 1:
##Hardy-Weinberg
##genetische winst
##cytoplasmatische mannelijke steriliteit
##RNase
##transgressieve segregatie
##monosoom
##chimeer
##parthenogenie
##algemene combinatiegeschiktheid
##inteeltdepressie
#Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen
#Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploÃ¯die en autotetraploÃ¯die
#Bestendigheid: hoe bekomen?

===23 januari 2009===
====DIER====
#Vraag 1:
##Fokwaardeschatting
##SNP
##Recombinatiefractie
#Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening metÂ : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)
====PLANT====
#Vraag 1:
##Allelfrequentie
##Recurrente ouder
##Specifieke combinatiegeschiktheid
##Trisoom
##Insectenbestuiver
##QTL
#Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.
#Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)

===21 september 2009===
#Vraag 1:
##Overerfbaarheid
##SNP
##Koppelingsanalyse
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Antherencultuur
##Heterozygotie
##Inteeltdepressie
##Cultivar
##Monosoom
#(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschemaâ€™s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld.Â
#(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus.Â
#(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploÃ¯diegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiÃ«nt bij alloploÃ¯den als autoploÃ¯den?

===24 januari 2013===
====DIER====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##Fokwaarde
##Allelfrequentie
#musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##AFLP
##Heterozygositeit
##CoÃ«volutie
##PrefertilisatiebarriÃ¨re
##Genetische vooruitgang
#Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak.Â
#Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.

===23 januari 2014===
====DIERÂ ====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Heterozygoot (ivm merkers)
##AFLP
##...
#Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven.Â
#Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken.Â
#CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.
====DIER====
#Vraag 1:
##Zuivere lijn
##Bulmer effect
#Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Multitlijnveredeling(ivm merkers)
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Effectief aantal allelen
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Wat maakt een cultivar bestendig?Â
#Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken?Â
#Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.
====DIER====
#Vraag 1:
##Inteeltdepressie
##Stamboek
#Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Dominante merker
##CMS
##Transgressieve segregatie
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters?Â
#Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren.Â
#Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.

====DIER====
#Vraag 1:
##Fokdoel
##Heterosis
#Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Merkerdensiteit
##Genetisch recurrente selectie
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploÃ¯de of een autotetraploÃ¯de?Â
#Leg schema uit: synthetische cultivarÂ
===27 januari 2015===
====DIER====
#begrippen
##selectierespons
##multiplex PCR
##stressgen
#Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?
====PLANT====
#Begrippen
##QTL
##merkerdensiteit
##isolijn
##specifieke combinatiegeschiktheid
#Vragen
##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar.
##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)

===21 januari 2016===
====PLANT====
#woordjes
##dominante merker
##simmulariteitscoÃ«fficient
##algemene recombinatiegeschiktheid
##fenotypische recurrente selectie
#vragen
##bestendigheid realiseren hoe?
##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap
##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur
====DIER====
#Genomic selection
##op welk dier en welke eigenschap
##waarom
##hoe
#PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld
===14 januari 2016===
====PLANT====
SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie
Tekening van inteelt bij maïs
De vraag van tarwe, bulk, en single-seed
====DIER====
#Veredelings- en rotatiekruising
#Genetische test voor vruchtbaarheid maken

===14 januari 2016 (2)===
====PLANT====
#heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP
#wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?
# mondeling bespreking over artikel
#verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)
====DIER====
#schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?
#hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.

===31 januari 2017===
====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*CentiMorgan
#*SNP
#*genotype recurrente selectie
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?
#Artikel
#Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.
#Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?

===21 augustus 2017 NM ===

====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*aantal effectieve alleen
#*BSA (bulk segregant analysis)
#*recurrente ouder
#*isolijn
#Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?
#Artikel
#Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Vermeerderingspiramide
#Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.

=== 23 januari 2017 ===

====PLANT (Reeks 8) ====

Begrippen:

*AFLP
*Pre-fertilisatiebarrières
*Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)
*...

Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.

Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 27 augustus 2018 ===

====PLANT ====

Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden

*Apomixis
*Specifieke Combinatie Geschiktheid
*Merkerdensiteit

Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers

Vraag 3: Artikel

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 17 januari 2018 ===
====Plant====
# Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)
# Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?
# Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.
# Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?

====Dier====
# Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.
# Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?

=== 17 januari 2019 VM===
====DIER====
#Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?
#Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?

====PLANT====
Mondeling
#Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?
Schriftelijk
#Dominantie epistasie
#Triploid block
#Simple QTL

===17 januari 2019 NM===
====DIER====
#Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen
#Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren
====PLANT====
#Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen
#Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan
#Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL
#Leg solanaceae-type self incompatibility uit

===30 januari 2019 NM===
====DIER====
#konijnen kweken; voor welke eigenschappen en hoe ga je te werk?
#Je wil dezelfde spiergroei kenmerkend voor Belgisch Wit-Blauw in geiten, hoe ga je te werk?
====PLANT====
Mondeling
#Leg uit Backcrossing, hoe kunnen moleculaire merkers het proces versnellen?
Schriftelijk
#Brassicaceae type zelf incompatibiliteit
#Heterosis en transgenese
#Leg uit apomixie

===23 augustus 2019===
====DIER====
#kwaliteitsvol vlees, welke dieren en waarom?
#schaap met goede vruchtbaarheid naar eend ander schaap overbrengen, hoe ga je te werk?
====PLANT====
#Dubbele haploiden
#BSA
#F1 steriliteit
#overerfbaarheid (enge, brede zin)

Gentechnologie

2019-08-27T12:44:14Z

Elisevanvyve: /* 23 Januari 2019 */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Prof Lavigne. Biochemie volgt het samen met bio-ingenieurs. Oefenzittingen verplicht.

==Examenvragen==
==== 23 Januari 2019 ====
# Welke parameters hebben een negatieve invloed op PCR in verband met mutagenese (geef hierbij ook PCR-gebaseerde technieken van random/directe mutagenese zoals mismatch priming, error-prone PCR..)
# Vergelijk cosmide en BAC klonering en hoe bepaal je de complexiteit van genoombank (carbon clark)
# (Paashuyse): Klonering van een bepaald eiwit in rat cellen
#* A. Leg expressiesysteem uit
#* B. Teken vector en benoem/verklaar alle factoren die je gebruikt
#* c. Wat moet je veranderen aan de rat cellen om SV40 ori te kunnen gebruiken? en bespreek het effect op de replicatie
#* d. Doe hetzelfde maar dan in een planten cel, wat moet je veranderen? En teken de vector opnieuw met alle componenten
# Geef uitleg over
#* Taqman probe
#* CTAB methode
#* PET
# Oefening waarbij je een ori moest insereren in DNA, dit moest in frame zitten, de RE sites waren gegeven, bespreek je techniek en teken PCR primers die je hiervoor zou gebruiken

==== 31 Augustus 2018 ====
# Leg PET en pPIC expressiesystemen uit.Vergelijk ze en wat zijn de voor en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
#
#* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)
#* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Hoe bereken je het minimum aantal klonen met de formule van Carbon en Clarke en welke voorwaarden moeten voldoen zijn? (1 bladzijde)
# Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip):
#* A. Alkalische Lyse
#* B. Wat is de definitie van Hybrid Selected Translation?
#* C. Leg uit hoe men gisten transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.
# Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)
#* a. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.
#* b. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.

==== 24 januari 2018 ====
# Leg PET en pBAD expressiesystemen uit. Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
#
#* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)
#* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Geef ook uitleg bij Carbon & Clarke. (1 bladzijde)
# Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip):
#* A. CAPture techniek bij cDNA aanmaak
#* B. Taqman RT-PCR
#* C. Nodige elementen voor een episomaal shuttle-plasmide voor ''E. Coli'' en ''S. cerevesiae''
# Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)
#* A. Geef strategie (maak primers, staarten, restrictie) om uw insert in de entry-vector te krijgen.
#* B. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.
#* C. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.

==== 1 september 2017 VM====
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef PCR afgeleide technieken voor nucleïnezuren.
# Bespreek in detail en vergelijk het mechanisme van P1 en cosmide vectoren.
# Bespreek de werking en schets het principe van PET-expressie systeem. Wat zijn de voor- en nadelen?
# Kort omschrijven
#* Definieer en bespreek CAPture techniek werking
#* Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#* Bespreek het principe van Gateway klonering.
# Vraag Paeshuyse (oefening in verwerkt): allerlei gegevens (cDNA, knipplaatsen e.d.)
#* Welke eukaryoot expressies systeem (geen schimmel of gist) zou jij gebruiken (voor dit humaan recombinant eiwit)? Beargumenteer.
#* Teken de vector enzo.. (?)

==== 25 januari 2017 VM====
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid
# Bespreek de BAC clonering voor de aanmaak van banken.
# Wat zijn de voordelen van recombinante expressie in gist? Vector pPIC wordt veel gebruikt in de industrie. Bespreek pPIC.
# Kort omschrijven
#*DNA shuffeling
#*CAPture techniek werking
#*Principe van TOPO-gemedieerde klonering
#oefening: Gegevens over enzymen, genoom van 1,6*^10-4, enzym knipt in 1 à 2 kb fragmenten, foto van gelleke. Hoeveel recombinante moet je hebben om met 99% zekerheid te zeggen dat je sequentie aanwezig is? Nog een vraag. (Rekenmachine nodig!)
#Vraag Paeshuyse: Creëer een humaan, recombinant faag lambda ding (?) Welk expressiesysteem zou je gebruiken? Teken de vector die je gebruikt. Nog iets...

====januari 2016====
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid
# Voordelen van recombinante expressie in gist, leg die ene gistvector uit (pPIC heette die dacht ik?)
#Strategie voor het opstellen van een cosmidebank
# Termen: CTAB DNA extractie, Taqman, manieren van transformatie van gist
# Oefening met inverse PCR: vinden van primers en uittekenen van de techniek
Volckaert:
# Relatie Tm/zoutconcentratie (monovalente kationen)
# De factoren die de renaturatie beinvloeden + verschil in gebruik van PNA, LNA en DNA als proben
# Geef structuur van guanidinium isothiocyanaat en guanidinium thiocyanaat, waarvoor wordt dit molecule gebruikt
# structuur van merker gegeven, leg uit waar onderdelen voor bedoeld zijn en benoem ze

===20 januari 2015===
#Bespreek en vergelijk de verschillende PCR technieken voor zowel gerichte als random mutagenese.
#Bespreek in detail het mechanisme van P1 faag en een cosmide en vergelijk.
#Bespreek en schematiseer het principe van de capillaire Sanger sequentie.
#Kleine vraagjes:
##Belang van humanisering bijÂ Philia pastoris
##Definieer de CAPture techniek
##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#Oefening: Je moet 2 exons (sequenties gegeven) van een bepaald gen aan elkaar ligeren (zonder een linker tussen). En deze C-terminaal aan een â€˜Strepâ€™-tag hangen (sequentie gegeven) en deze inbrengen in een vector die T-overhang heeft door TOPO. (verschillende stappen bespreken + primers geven!) (praktisch dezelfde oefening als de voorbije 2 jaar in januari)
Volckaert 1. Geef de structuurformule van guanidinium (iso)thiocyanaat en waar het voor wordt gebruikt. 2. Leg chemische synthese van oligonucleotiden met een 5â€™ fosfaat uit (of teken) + geef voordeel hiervan. 3. Leg uit hoe DNA probes niet-radioactief gelabeld (en eventueel onder welke voorwaarden) kunnen worden met behulp van een streptavidine-alkalisch fosfatase fusie-eiwit 4a. T4 polynucleotide kinase werd vroeger gebruikt om uiteinden te fosforyleren zodat fragmenten geligeerd kunnen worden. Nu kan dit direct gebeuren bij de oligonucleotide synthese. Hoe doen ze dit? Bespreek (en of teken) dit. 4b. Wat is het voordeel hiervan? 5. Bespreek de relatieve Tm van DNA en LNA met betrekking tot hun gebruik in hybridisatie en mismatchgevoeligheid.

=== 21 januari 2014 ===
#Bespreek algemeen principe van PCR en de reactiecomponenten. Bespreek afgeleide technieken die gebruikt worden om de specificiteit van de PCR-reactie te verhogen. (onbeperkte antwoordruimte)
#Bespreek achtergrond en werking van cosmide (1pag)
##Bespreek en vergelijk pET en pBAD (1pag)
#Korte vraagjes: Lavigne
##Bespreek CAPture techniek
##Bespreek de elementen die een YAC-kloneringsvector bevat. Bespreek Gateway klonering

=== 22 januari 2013 ===
#Bespreek vectorsystemen voor het insereren van grote (>30kb) DNA-sequenties. Bespreek de formule van Carbon & Clarke.
#Technieken: Okayama & Berg SAGE
#Kleine vragen (Lavigne):
##Wat is error-prone PCR en hoe kan je het gebruiken in "directed evolution"?
##Bespreek en schets het PET-expressie systeem.
##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#SitueerÂ ???,Â ??? enÂ ??? in de historiek van de gentechnologie. Het rspL gen was Ã©Ã©n van de eerste genen die gebruikt werd voor positieve selectie. Leg uit waarvoor dit gen codeert en hoe de selectie gebeurt. Oefening: Sequentie met exons en introns gegeven. Ontwerp een techniek om de eerste twee exons aan elkaar te ligeren en in te bouwen in de gegeven vector (TOPO T/A vector), met een N-terminale STREP-tag (sequentie voor de STREP-tag was gegeven). Beschrijf en verantwoord elke stap.

===6 augustus 2012===
Â #Kunkel tot in detail bespreken Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli. Is dit hetzelfde bij de afgeleide vectors van ColE1? (pBR322,...)
#twee vraagjes Carbon en Clarke RAcE schetsen en uitleggen (beide)
#kleine vraagjes:
##Bespreek COS-cellen URA3 (waarom belangrijke merker)
##Inclusion bodies (wat, wanneer, gewenst?)
##Duid het juiste aan: de zoutconcentratie doet Tm stijgen/dalen/beÃ¯nvloedt Tm niet + uitleggen waarom.
##synthesevraag: biotine-merking bij nucleÃ¯nezuurhybridisatie, alles uitleggen (hoe probe maken, hybridisatie, detectie)

===23 Jan 2012 NM===
#Kunkel Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli
#Bespreek de mogelijke kloneringsvectoren in gist
#Kleine vragen:
##Co-transformatie bij dieren
##Bespreek doel van de technieken: oligocapping en capture
##Hot-start PCR Chromosome jumping

===31 Jan 2011 NM===
#Bespreek de filamentaire fagen(M13, F1,...), hun eigenschappen, hun replicatie in E.coli en hoe zijn ze aangepast voor het gebruik als vectoren.
#Bespreek het pMAL expressiesysteem voor de synthese van eiwitten via recombinanten.
#Bijvragen:
##Hoe kan je het nodige aantal klonen bepalen voor een goede genoombank
##Bespreek die PiAN vectoren Kleine vragen:
##Wat is de N-regel van Varshavsky COSvectoren
##Wat is Spi-selectie Waarvoor dient Capping bij de synthese van oligonucleotiden?
#Mondeling: cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman Methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese Hoe wordt de smelttemperatuur bepaalt SAGE

===17 Jan 2011 VM===
#Fosforamidietcyclus (cyclus, beschermgroepen, capping,...)
#Welke problemen bij aanmaken van cosmide vectoren en welke oplossingen hiervoor?
#Bijvragen:
##Okayama & Berg
##cDNA klonering in een vector Methode van Henikoff voor systematische deleties
#Kleine vragen
##IPTG sacB
##Carbon & Clarke vgl. (aantal klonen in een cDNA bank)
##Guanidiniumzouten
#Mondeling: pMal expressiesystemen Kunkel Eckstein Pyrosequencing SOE

===17 Jan 2011 VM===
#Aanmaak genoombanken soorten gistvectoren
#Bijvragen:
##fotolithografische DNA synthese alkalische fosfatasen + toepassingen
#Kleine vragen
##'hotstart' PCR Guanidinium thiocyanide biotine merking bij hybridisatie
##URA3 Modeling: pyrosequencing
##Methode van Eckstein CAPture SOE pMAL

===23 aug 2010 VM===
#pyrosequencing soorten faag lambda vectoren Bijvragen: methode van Gubler en Hoffman chromosoomwalking
#Kleine vragen:
##nested PCR capping in fosforamidietcyclus hoe het aantal klonen in een cDNA bank benaderen
##PNA Modeling: methode van Okyama en Berg
##biotine merking bij hybridisatie alkalische hydrolyse van RNA Spi selectie pMAL

===26 jan 2010 VM===
#Bespreek cosmide vectoren en hoe ze efficient te gebruiken zijn.
#Leg de methode van Hoffman en Gubler voor cDNA synthese uit.
#Bijvragen:
##Welke vectorsystemen voor gist zijn er beschikbaar?
##Leg de pSC101 ori uit.
#Kleine vragen:
##Oclusion body's: wat, wanneer, nut?
##CI gen: wat en waarvoor gebruikt in de gentechnologie?
##Universele splicing van ssDNA met fokI.
##Modeling: Fosforamidiet versus fosfonaat methode.
##EtBr en SYBR.
##Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese.
##Biotine merking.
##ZOO blot.

===25 jan 2010 VM===
#Bespreek de aanmaak van genoombanken (vectoren, inbouwmechanismen, enz.)
#Bespreek de methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese.
#Bijvragen:
##Welke vectoren voor klonering in gist?
##Wat zijn positieve en negatieve selectie voor klonering en geef voorbeelden.
#Kleine vragen:
##Nested PCR uitleggen.
##T4 en T7 zijn beide bacteriofaag polymerasen.
##Bespreek hun activiteit(en) en toepassingen.
##Type1, type2, type3, type2s, iso en neochizomeren, waarin verschillen deze restrictie enzymen?
##Hoeveel kloonen nodig in een genoom bank?
#Mondeling: Okyama en berg Spi selectie Alkalische hydrolyse van RNA pMAL
#Hoe wordt biotine gebruikt bij hybridisatie

===25 jan 2010 VM===
#Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering, detailleer elke reactiestap.
#Bijvragen:
##Fosforamidiet synthesecyclus
##Welke soorten alkalische fosfatase gebruiken we in de gentechnologie?
##Schets hun gebruik.
#Kleine vragen:
##Lamba ZAP vector
##Aan- en afwezigheid van rop in colE1-afgeleide plasmide en de invloed ervan op aantal plasmide in E.coli.
##Aantal kloons in een genoombank.
##Nested PCR Mondeling: pMAL expressiesysteem
##Pyrosequencing RDA Ligatiemechanisme Eckstein

===14 jan 2010===
#Geef de belangrijkste biologische functies van de filamentaire faag vectoren en hoe deze gebruikt werden om vectoren mee te maken.Welke soorten faag lambda vectoren zijn er en schets kort hun gebruik
#Bijvragen:
##cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman.
##Detailleer elke reactiestap.
##Wat is chromosome walking en hoe werkt het.
#Kleine vragen:
##Wat is en waarvoor dient de capping bij de synthese van oligonucleotiden.
##Exonuclease III
##Hoe bepalen we het aantal kloons dat nodig is bij het opstellen van een genoombank.
##Inverse PCR Mondeling: pMal
##LCR Puntmutaties volgens Eckstein Mu-2 gistvector
##Pyrosequencing

===30 jan 2009===
#fosforamidiet synthesecyclus geven problemen klonering met cosmidevectoren + oplossingen
#Bijvragen:
##okyama en berg progressieve deleties met exonuclease III
#Kleine vragenÂ :
##IPTG sacB carbon en clarke vgl rol guanidinimun zouten + structuur
#Mondeling: RDA pyrosequencing eckstein pMal lambda zap

===30 jan 2009===
#Soorten Bacteriofaag lamda vectoren pET expressie vector systeem
#Bijvragen
##Pyrosequencing Gubler-Hoffman cDNA synthese
# Kleine vragen
##Tm voor oligonucleotiden sacB en toepassing in Gentechnolgie Statistische benadering genoom insertie PNA + structuur
#Mondeling: inverse PCR Eckstein RDA SOE CAPture

===27 jan 2009Â ===
#replicatiemechanisme, regulatie en aantal kopieÃ«n ColE1-afgeleide vectoren Soorten bacteriofaag lambda vectoren en hun werking schetsen
#Bijvragen:
##cDNA klonering (Gubler & Hoffman, Okayama & Berg)
##chromosoom walking
#Kleine vragen:
##inverse PCR Tth DNA polymerase (wat speciaal en welke extra mogelijkheden daardoor)
##capping in fosforamidiet, wat en waarom
##hoe bereken je aantal kloons in genomische DNA bank exonuclease III
#Mondeling: SOE SAGE pMAL plaatsgerichte mutagenese volgens Kunkel pyrosequencing

===24 jan 2008===
#Bespreek het replicatiemechanisme van ColE1- en afgeleide vectoren, de regulatie en het aantal plasmiden
#Bespreek methoden om gen-gericht een genomische bank te screenen aan de hand van 'informatie'
#Geef twee technieken voor positieve selectie van plasmiden
#Geef de methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese
#Kleine vragen
##Hoe kan de het cI gen voor positieve selectie zorgen?
##Wat is een moleculair baken ('molecular beacon')?
##Bespreek de twee soorten SV40 vectoren en het verschil Touch-down PCR
##Hoe kunnen we er voor zorgen dat er geselecteerd wordt op de mogelijkheid om te transformeren (of zo)?
#Technieken: Pyrosequencing pET SOE Okyama-Berg ligatiemechanisme

===23 jan 2008===
#Fotolithografische DNA synhtese: bescrhijf en verklaar.
#Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering: wat zijn de voor/ nadelen?
#Middelgrote vragen:
##Welke problemen zijn er bij het kloneren in cosmidevectoren en hoe hebben ze dit opgelost?
##Pyrosequencing: beschrijf, wat zijn voor/nadelen tov dideoxymethode
#Kleine vragen:
##Wat is IPTG: structuur, gebruik
##Wat is de par locus
##Wat is PNA: structuur
##Wat is T4 polynucleotide kinase, waarom is dit belangrijk in gentechnologie, reactiemechanisme?
#Technieken: SOE CAPture EtBr pMAL Eckstein

===14 jan 2008===
#Welke mogelijkheden zijn er om plaatsgerichte mutagenese te doen?
#Vertel alles over LITMUS vectoren (Waarom in godsnaam is dit een hoofdvraag?)
#Bijvragen:
##Welke problemen kunnen er zijn bij het kloneren in cosmidevectoren?
##Hoe hebben ze die omzeild? Schets de Okyama-Berg procedure.
##Wat zijn de voor- en nadelen?
#Bij-bijvragen:
##Hoe is sacB een positief selectiekenmerk?
##Waarvoor staat spi selectie?
##Geef de 2 soorten SV40 vectoren + leg het verschil uit waarom worden er andere Tm-uitdrukkingen gebruikt voor oligonucleotiden en hele strengen?
#Mondeling: RDA Pyrosequencing inteÃ¯ne verwerking inverse PCR cap selectie

===31 jan 2007===
#alles van cosmiden bespreken. alles van SV40 bespreken.
#Middelgrote vragen:
##pyrosequencing
##cassettemutagenese
#Kleine vragen:
##verschil southern en western blotting
##ethidiumbromide, structuur, problemen,
##gebruik Spi selectie inverse PCR
##wat is shearing
#Technieken: Formule om het aantal klones te berekenen voor gDNA bank Oligocapping SOE ligatiemechanisme Eckstein Okayama en Berg

===23 jan 2007===
#bespreek belangrijkste methoden voor site directed mutagenese bespreek replicatiemechanisme in pBR322
#welke verschillende strategien worden gebruikt met op lambda gebaseerde vectoren technieken met Ti vectoren
#Mondeling: nested PCR quenching hoe beinvloed de DNA concentratie het werken met cosmiden en verklaar

===19 jan 2007===
#Geef en bespreek enkele voorbeelden van het gebruik van alkalische fosfatasen.
#Bespreek de eigenchappen en kenmerken van de pUC vectoren.
#Vectoren afgeleid van bacteriofaag lambda.
#SV40 vectoren.
#Kleine vragen:
##Genotype van een E.Coli stam opdat deze geÃ¯nfecteerd kan worden door M13.
##Bespreek incompatibiliteit van plasmiden.
#Mondeling voor te stellen technieken: SOE Pyrosequencing Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese Nick translatie<

Structurele en Fysiologische Biologie

2019-08-27T12:39:09Z

Elisevanvyve: /* Vakinformatie */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Eerstejaarsvak enkel aan biochemici en schakelstudenten gegeven, bestaat uit een deel plantkunde (Wim Van den Ende) en een deel dierkunde (Jozef Vanden Broeck). Deze delen hebben op dezelfde dag een examen, het ene mondeling en het andere schriftelijk, onbekend op voorhand dewelke mondeling en dewelke schriftelijk is. Beide examens hebben al jarenlang dezelfde opbouw van type vragen.
Voor 2de zit kan een vrijstelling aangevraagd worden voor het deel dat je door bent.

==Examenvragen PLANT==

===21 augustus 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek in detail een drietal manieren waarop planten ATP kunnen maken.
# Situeer bondig de termen "gespvormig" en "CRISPR/CAS"
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===28 januari 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek in detail een drietal manieren waarop planten ATP kunnen maken.
# Situeer bondig de termen "gespvormig" en "CRISPR/CAS"
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===14 januari 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# waterpotentiaal en zijn twee componenten
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===14 januari 2019 NM===
# 8 meerkeuzevragen
# Geef 3 manieren waarop planten ATP synthetiseren (glycolyse, ademhaling, Kreb cyclus, ...)
# Leg bondig uit: CRISPR/Cas en CAM planten
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===31 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek de evolutie & metabole diversiteit van prokaryoten en het ontstaan van de eukaryoten.
# Leg bondig uit: het ontstaan van hexaploïde tarwe, mechanisme voor de bloei van lange en korte dag planten.
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===30 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Waterpotentiaal en zijn 2 componenten
# SAR
# Massastroming
# Cyclus van bedektzadigen aanvullen. Is deze plant haplont, diplont of diplohaplont en beargumenteer.
===15 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Geef 3 manieren waarop een plant ATP aanmaakt en leg gedetailleerd uit
# Hypersensitieve respons en CAM planten bondig uitleggen
# Cyclus bedektzadigen aanvullen. Is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===21 aug 2017 NM===
#meerkeuzevragen
#Geef 3 manieren waarop een plant ATP aanmaakt en leg gedetailleerd uit
#gespvorming en CAM planten bondig uitleggen
#cyclus bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont? beargumenteer

===21 aug 2017 VM===
#meerkeuzevragen
#plantenhormonen met werking geven + uitleggen hoe hormoonsysteem in planten werkt
#guttatie en waterpotentiaal bondig uitleggen
#cyclus bedektzadigen aanvullen

===31 jan 2017===
#Meerkeuzevragen
#Waterpotentiaal met zijn 2 componenten uitleggen. Wat gebeurt er als je opgeloste stoffen toevoegt aan het omgevings water?
#Massastroming en SAR uitleggen.
#Cyclus van bedektzadigen aanvullen.

===26 jan 2016===
#8 meerkeuze vragen
#Mondelinge hoofdvraag: hoe wordt sucrose gevormd, hoe komt het in cortexe cellen van de wortels en wat is de bijdrage voor de accumulatie van K+
#Bijvraag: leg chemiosmose en fotorespiratie uit
#Bijvraag: cyclus aanvullen van de bedektzadigen

===30 jan 2014 nm===
#Meerkeuze
#Welke hormonen zijn er bij planten, welke staan in voor apicale dominantie en hoe werkt dit.
#Leg uit hoe herbicide resistentie werkt en leg het mechanisme van glyfosaat uit. Levenscyclus.

===29 jan 2014 nm===
#Meerkeuze
#Bespreek de diversiteit van fungi en geef de levenscyclus van een ascomyceet.
#Bespreek de rol van mieren in commensalisme en de overdracht van parasieten.
#Levenscyclus van varens.
===28 jan 2014 nm===
#8 meerkeuzevragen (4 punten)
#Bespreek de huidige wereldproblemen en geef aan hoe plantenbiotechnologie/biologie zou kunnen bijdragen tot het aanreiken van van oplossingen (8 punten)
#Vul aan en verklaar dit ecologisch model (Bottom-up effect). Hoe kon dit model op experimentele wijze geverifieerd worden? (3 punten)
#Levenscyclus bedektzadige aanvullen (5 punten)
===28 jan 2014 vm===
#Meerkeuze
#Plantenhormonen welke types? regulatie? welke komen voor bij apicale dominantie? Regulatie? Werking?
#Levenscyclus bladmossen
#Tekening van de muis, mier, plant, zaad (interacties verklaren)
===27 jan 2014===
# 8 meerkeuzevragen.
#Bespreek de diversiteit en evolutie van prokaryoten en het onstaan van eukaryoten.
# Figuur uitleggen over bottom-upeffecten en ontbrekende termen aanvllen.
#Foto van doorsnede monocotyl blad: wat is het + delen benoemen.
===13 jan 2014===
# 5 meerkeuzevragen.
#Aanvullen van termen en processen (mitose/meiose) bij de levenscyvlus van gymnospermen. (Letterlijk uit het handboek fig. 31.12 p609)
#Een plantencel in zuiver water en geleidelijk aan zout toevoegen, wat gebeurt er? Leg uit a.d.h.v. een duidelijke grafiek.
#Wat is een preprofaseband? (en nog een term ?? uitleggen)
===23 jan 2012===
#Leg uit wat er zal gebeuren bij een plantencel in zuiver water en wat als je opgeloste stoffen toevoegt aan de omgeving. Maak een schema aan de hand van de waterpotentiaal en zijn 2 subcomponenten en leg uit hoe deze veranderen.
#Leg uit fotorespiratie: hoe wat waarom waar.
#Situeer:
##glyphosaat
##methanogeen
##guttatie
##Mycorrhiza
#Levenscyclus. Aangeven om welke levenscyclus het ging (bladmossen) en beargumenteren. Structuren en processen aanvullen op tekening. Aangeven of het een haplonte, diplonte of haplodiplonte levenscyclys was.
===1 feb 2011 VM===
#Volledige weg beschrijven die een C-atoom aflegt als CO2 indien ingebouwd in pectine in de celwand van rhizodermiscellen. Waaruit bestaat de celwand en wat is de functie?
#Bespreek in detail de signaalgeving en metabolische wegen van Rhizobium in symbiose met een plant.
#. Figuur: levenscyclus bedektzadigen
#Situeer:
##hexaploÃ¯die by tarwe
##cavitatieï‚§
##gespvorming by Basidiomyceten ï‚§ induceerbare mutaties
===27 jan 2011 NM===
#Volledige weg beschrijven die een N-atoom aflegt van de bodem tot inbouw als glycoproteÃ¯ne in een bladepidermiscel
#Vgl mossen en angiospermen. Zeggen hoe deze zijn aangepast aan leven op het land
#Figuur:
##structuur van een blad met huidmondjes
##hetzelfde -.-
#Situeer:
##allotetraploÃ¯die
##guttatie
##sterke vs zwakke sinks
##bespreek metabolisme Archaea

===24 jan 2011 NM===
#De waterpotentiaal en de 2 componenten ervan bespreken als we een cel in zuiver water hebben en daar geleidelijk aan zout aan toevoegen. Schematisch weergeven en stap voor stap bespreken wat er met de cel gebeurt.
#Het verschil tussen gametofytische en sporofytische incompatibiliteit uitleggen. En een model geven voor gametofytische incompatibiliteit.
#Figuur:
##Doorsnede monocotyle stengel
##Vaatbundel en daarop floeem,
##xyleem en vezelschede benoemen
#Situeer:
##Endosymbiose
##ViroÃ¯den
##Soortkruisingen
##Lenticel
===24 jan 2011 VM===
#Bespreek structuur, samenstelling, functie en oorsprong van de plantencelwand.
#Bespreek de verschillen tussen C3, C4 en CAM
#Figuur: monokotyle stengel met vaatbundel
#Situeer:
##hydrogenosoom
##Agrobacterium tumefaciens
##massastroming (Munch hypothese)
##terminatortechnologie
===25 jan 2010 VM===
#Teken een dwarsdoorsnede van een wortel van een monokotyle plant. Wat is het verschil met een dikotyle plant?
#Bespreek (fysiologisch en chemisch) de weg die een CO2 molecule aflegt vanuit de lucht om ingebouwd de worden in de celwand van een
rhizodermiscel.
#Vergelijk CO2 fixatie bij C3 en C4 planten. Wat zijn de ethiologische implicaties?
#ABC van de bloemetjes
#Situeer:
#Soortkruising
#Isospore haplodiplont
#Worteldruk
#Basidiomyceten
#ï‚§Archebacteria
===18 jan 2010 NM===
#Bespreek de mogelijkheden voor overdracht van genetische informatie tussen individuen die tot een andere soort behoren.
#Vul volgende figuur aan en bespreek (die van potentiaal, niet met de kleurtjes, degene die ook in de cursus staat).
#Vergelijk CO2 fixatie bij CAM en C4 planten. 4. ABC van de bloemen.
#Situeer en bespreek:
##ascomyceten,
##heterospore haplodiplonten
##3 figuren: (een stengel ==> figuur helemaal onderaan rechts in voorbeeldvragen, een blad ==> die gele figuur zo :p en een wortel ==> laatste blz, rechts bovenaan)
===18 jan 2010 VM===
#Bespreek autotrofie bij prokaryoten en eukaryoten.
#Gametofytische incompatibiliteit.
#Fotorespiratie: wat, waar, hoe, waarom?
#Vul aan en bespreek zodat duidelijk wordt of het om een haplont, diplont of haplodiplont organisme gaat. Is dit type organisme al goed aangepast aan het landleven? (figuur van varens, zie voorbeeldvragen)
#Situeer en bespreek:
##3 figuren (monokotyl blad, dikotyle verdikte stengel, monokotyle vaatbundel),
##agrobacterium tumefaciens
##basidiomyceten.
===26 jan 2009===
#Plantencelwand: Samenstelling? Structuur? Functie? Oorsprong?
#Transport in planten: Hoe? Waar? Waarom?
#C4 en CAM planten: Wat? Waarom? Hoe? Verschil?
#Afbeelding van een diplohaplonte cyclus, en zeggen of deze plant al goed
is aangepast aan het leven op het land.
#Termen:
##Soortkruising
##Agrobacterium Tumefaciens
##Zelfincompatibiliteit
##Het ABC van de bloemetjes
##Fotoke van dwarse doorsnede van een plantenstengel, zeggen wa ge ziet en van die dinge..
===19 jan 2009===
#voortplantingscyclus (mos)
#bespreek zo goed mogelijk de opnamen van N uit nitraat (chemisch/fysisch) en inbouw in celwandprotÃ«ine epidermiscel 3. teken primaire stengel dikotyle plant + verschil monokotyle
#fotorespiratie: zin of onzin.
#Termen:
##gametofytische zelfincompabiliteit
##ABC van bloemen
##worteldruk
##retrovirussen
===28 jan 2008===
#vergelijk autotrofie bij eukaryoten en prokaryoten
#fotorespiratie
#zelf-incompabiliteit
#cyclus van varen aanvullen + aangepassingen aan het land
#Situeer:
##drie foto's
##Agrobacterium tumefaciens
##Basidiomyceet
===28 jan 2008===
#primaire dikotyle wortel tekenen en bespreken, vergelijken met monokotyle
#Welke fysische en chemische weg moet het N-atoom van NH4+ afleggen
om ingebouwd te kunnen worden in een celwandproteÃ¯ne van een blad
#Grafieken van CO2-opname van C3 en C4 planten. Zelf assen invullen en c3 en c4 aanduiden + uitleggen waarom
#Welke aanpassingen moet een landplant hebben ten opzichte van een wier
om te kunnen overleven op het land en is dit bij alle zo
#Bespreek:
##ascomyceten
##retrotransposons
##archeaebacteriÃ«n
##zelfincomptabiliteit
===21 jan 2008===
#Hoe genetische informatie overbrengen tussen individuen van verschillende soorten denk ik
#Bespreek en vul aan die figuur van de waterpotentiaal in een cel
#leg uit hoe CO2 wordt gefixeerd bij C4 planten en CAM planten en vergelijk
#geef een schematische voorstelling en een voorbeeld van een heterospore haplodiplont cyclus
#Situeer:
##Ascomyceten
##zelfincompatibiliteit
## 3 foto'kes ( stengel, wortel en blad)
===18 jan 2008===
#teken structuur monocotyle wortel, vgl met dicotyle
#bespreek fixatie co2 bij C4-C3 planten, ahv voor en nadelen
#voortplantingscyclus (van ascomyceten, was wel niet gegeven da het over asco ging ) aanvullen en uitleggen waarom het haplont/diplont/diplohaplont is
#bespreek hoe C via co2 kan ingebouwd worden in de rizodhermiscellen (
zowel fysich als chemisch )
#Situeer en bespreek:
##worteldruk
##basidiomyceten
##archeaebacteriÃ«n
##soortbestuiving
##retrovirussen
===14 jan 2008===
#Celwand: Samenstelling? Functie? Oorsprong? Structuur?
#Vergelijk het transport van mineralen en het transport van
fotosyntheseproducten
#Je gaat op excursie om C3/C4/CAM planten te inventariseren. Wat voor
materiaal neem je mee en leg uit.
#Tekening van een voortplantingscyclus: Is dit haplont/diplont/haplodiplont? Leg uit en geef aan of en hoe deze plant aan het landleven aangepast is.
#Situeer en bespreek:
##Zelfincopatibiliteit
##Agrobacterium tumefaciens
##3 tekeningen (doorsneden van stengel/wortel)
===2 feb 2007===
#twee grafieken zonder aanduidingen "vul aan en verklaar"
#genetische overdracht tussen individuen van dezelfde soort en verschillende soorten, leg uit
===15 jan 2007===
#Vul volgende grafiek aan en bespreek (die van de waterpotentiaal van de omgeving t o v die in de plantencel) en hoe zit dit in 't xyleem?
#Fotorespiratie: wat? waar? hoe? waarom?
#Situeer:
##lenticellen
##heterospore
##haplodiplonten
##zygomyceten
##endodermis
##gametofytische incompatibiliteit
##agrobacterium tumefaciens

==Examenvragen DIER==

===21 augustus 2019 VM===
# Begrippen verklaren: parthenogenese, eutelie, monocyt
# Termen verbinden idem vorige jaren
# Skeletspier structuur en hoe werkt deze (wat is een elektrische impuls)
# Glucosegehalte in bloedplasma en regulerende hormonen, waar worden glucose opgeslagen

===28 januari 2019 VM===
# Verklaar volgende begrippen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
# Verbind volgende begrippen en verklaar bondig:
## parapodia, radula, buisjes van Malphigi, pseudocoel, clitellum, cleidoïsch ei, ambulacra, choanocyten.
## Oligochaeta, Reptilia, Echinodermata, Porifera, Polychaeta, Nematoda, Insecta, Gastropoda
# Bespreek de rol van de maag en het duodenum in de spijvertering. Welke hormonen worden daar lokaal vrijgesteld en wat is hun rol?
# Bespreek de hartcyclus en bloedsomloop en de regulatie van de bloeddruk.

===14 januari 2019 VM===
# Begrippen verklaren: parthenogenese, eutelie, monocyt
# Termen verbinden idem vorige jaren
# Skeletspier structuur en hoe werkt deze
# Glucosegehalte in plasma en regulerende hormonen

===14 januari 2019 NM===
#Begrippen verklaren: gemmula, radula, planula
#Termen verbinden en kort de functie geven ervan: ambulacra (Echinodermata), mesoglea (Cnidaria), lofofoor (Branchiopoda), proglottiden (Cestoda), clitellum (Huridinae), corpus alata (Insecta), choanen, endostyl
# Leg de werking van bioluminescentie uit bij Aequorea victoria.
#Leg de menstruatiecyclus uit adhv de hormonen

===31 januari 2018 VM===
# Verklaar volgende begrippen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
# Verbind volgende begrippen en verklaar bondig: parapodia, radula, buisjes van Malphigi, pseudocoel, clitellum, cleidoïsch ei, ambulacra, choanocyten.
# Bespreek de rol van de maag en het duodenum in de spijvertering. Welke hormonen worden hier geproduceerd en wat is hun rol?
# Bespreek de hartcyclus en bloedsomloop en de regulatie van de bloeddruk.

===30 januari 2018 VM===
#Begrippen verklaren: Ambulacra, Thrombocyt, Mimicry
#Termen verbinden en kort de functie geven ervan: zie vorige jaren
#Osmoregulatie van zoetwater- en zoutwater vissen
#Geef de werking en structuur van het binnenoor.

===15 januari 2018 VM ===
# Begrippen verklaren: gemmulae, radula en parthenogenese.
# Verbinden: exact dezelfde begrippen als vorige jaren.
# Leg de werking van bioluminescentie uit bij Aequorea victoria.
# Geef de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.

===21 aug 2017 NM===
#Begrippen verklaren: Parafyletisch, Parthogenese, Eutelie
#Verbinden: exact dezelfde begrippen als vorige jaren
#Geen 3 bestrijdingsstrategiën tegen een insecten plaagsoort en leg uit
#Leg de menstruatiecyclus uit adhv de hormonen

===21 aug 2017 VM===
#verklaar: blastula, monocyt, convergete evolutie
#verbind, ongeveer zelfde begrippen als vorige jaren + zweetklier (mammalia), zijlijn (osteichthyes)
#Samenstelling van een spier + werking contractie
#hoe wordt het glucose gehalte in het bloed gereguleerd, welke hormonen werken hierbij en waar worden ze gemaakt
===31 jan 2017===
#Verklaar: dauer, ecdysis en filariasis.
#Verbind, zelfde begrippen als voorgaande jaren.
#Vergelijk zuurstof opname bij zoogdieren en insecten.
#Hoe werkt het doorgeven van zenuwimpulsen?

===26 januari 2016===
#Termen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
#Verbinden
#Uitleggen: 3 voorbeelden van tegenstroomprincipe en impulsgeleiding

===20 aug 2014===
#Begrippen:
##adaptieve radiatie
##gremmula
##eutelie
#Verbind:
##preenklier - spiraalplooi - pedipalpen - mesogloea - corpus alata - ambulacra - radula - citellum
##cnidaria - insecta - echinodermata - gestropoda - chondrichtys - hirunae - aves - chelicerata
#Geef het mechanisme van de bioluminescentie bij aquora victoria
#Bespreek de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.
===30 jan 2014===
#Begrippen :
##Metanefridium
##Regeneratie
##Clitellum
#Verbinden: mesogloea, speenklier, kieuwdeksel, pedipalp, ambulacra, corpora allata, spiraalplooi, radula
#Leg de menstruatiecyclus uit en geef 3 voorbeelden van tegenstrooomprincipe
===29 jan 2014 NM===
#Begrippen:
##Filiarsis
##Mimicry
##Corpora cardiaca
#Verbinden: termen van de vorig jaren.
#Leg de werking van longen en tracheÃ«n uit en vergelijk. Vergelijk
osmoregulatie bij zoet-en zoutwatervissen.
===28 jan 2014 NM===
#Termen:
##Lofofoor
##Adaptieve radiatie
##Protonefridium
#Verbind: parapodia(polychaeta), radula(Gastropoda), Antennae(Arthropoda), Mesogloea(cnidaria), clitellum(Oligochaeta), CleidoÃ¯sche ei(Reptilia), Ambulacra(Echinodermata), Gemmulae(Porifera)
#Illustreer aan de hand van drie voorbeelden het belang van het tegenstroomprincipe en leg uit.
#Leg het mechanisme uit van de elektrische impulsgeleiding door zenuwcellen.
===28 jan 2014 VM===
#Begrippen:
##Gemmula
##Radula
##Corpora allata
#Verbinden: termen van de vorig jaren.
#Bespreken en vergelijken het mechanisme van gasuitwisseling bij longen zoogdieren en vogels
#Welke hormonen worden gevormd in de gonaden bij de mens en regulatie.
===27 jan 2014===
#Termen:
##Planula
##RNA interference
##Eutelie
#Verbinden, opnieuw combinaite die hieronder al staat
#Bespreek de structuur en het contractiemechanisme van skeletspieren.
#Wat zijn de belangrijkste hormonen die door de schildklier geproduceerd worden en hoe worden ze gereguleerd?
===13 jan 2012===
#Leg uit:
##Gremule
##Eutelie
##Amnion
#Verbindt Latijnse namen met Latijnse namen. (letterlijk als in het voorbeeld examen)
#Leg bondig uit: Skeletspier (structuur, werking en regulatie)
#Welke hormonen spelen welke rol in de vrouwelijke voortplantingscycus?
===25 juni 2012===
#Termen:
##Nematocyst ï‚§?
##Metamorfose ï‚§ Lolofoo
##Amnion
#Verbinden (Combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)
#Bespreek en vergelijk drie types spierweefsel bij dieren.
#Bespreek rol van gal en pancreas in de spijsvertering (in invertebraten). 5. Bespreek de regulatie van hartcyclus en bloeddruk (in zoogdieren).
===22 juni 2012===
#Termen:
##Protonefridia
##Ecdysis
##Parthenogenese
##Mimicry
##Filariasis
#Verbinden ( was combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel
===19 juni 2012===
#Termen:
##Feromoon
##Dauer
##Regressieve evolutie
##Endostyl ï‚§
#Verbinden. Allemaal termen uit de vragen van vorige jaren.
#Geef de levenscyclus van de runderlintworm en bespreek.
#Leg het tegenstroomprincipe uit aan de hand van drie voorbeelden.
#Bespreek structuur en werking van de hypofyse. Welke hormonen zijn aanwezig in de hypofyse?
===24 juni 2011===
#Termen:
##Protonefridia
##regressieve evolutie
##Pseudocoeloom
##Dauer
##oncosfeer
#Verbinden:
##spicula, proglottiden, Clitellum, lofofoor, endocuticula, choanen, lijmcellen, rhopalia
##Ctenophora, Cestoda, Ectoprocta, Arthropoda, porifera, Sarcopterygii, Cnidaria, oligochaeta
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#welke hormonen reguleren het mannelijk voortplantingsstelsel (bij de mens)?
===23 juni 2011===
#Termen:
##Planula
##Cephalisatie
##Enterocoel
##Ecdysis
##RNA interference
#Verbinden: Parapodia, Spiraalplooi, antennae, scolex, choanen, lofofoor, lijmcellen,osculum
#Bespreek de evolutie van de mens (bondig)
#Bespreek de structuur van een lichaamsspier en de contractie er van 5. Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel
===21 juni 2011===
#Termen:
##Gemmula
##Adaptieve radiatie
##Eutelie
##Rhopalia ï‚§
#Verbinden:
##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum
##Aves, Osteichthyes, Chelicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea
#Bespreek bioluminiscentie.
#Hoe wordt de glucoseconcentratie in het plasma gereguleerd. 5. Bespreek de hormonen bij de menselijke voortplantingscyclus.
===21 juni 2010 NM===
#Termen:
##Regeneratie
##Protonefridia
##Scolex
##Corpora allata
#Verbinden:
##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum
##Aves, Osteichthyes, Chicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea
#Wat weet je over de evolutie van de mens. Bespreek bondig.
#Bespreek hartcyclus en bloedsomloop (bij zoogdieren) en de regulatie daarvan.
#Illustreer aan de hand van een voorbeeld het belang van het tegenstroomprincipe bij uitwisselingsprocessen.
===21 juni 2010 VM===
#Termen:
##Pseudocoeloom
##Clitellum
##Dauer
##Endostyl
##Corpora cardiata
#Verbinden:
##Antennae, Osculum, Spiraalplooi, Choanen, Parapodia, Scolex, Lijmcellen, Lofofoor
##Ctenophora, Ectoprocta, Cestoda, Porifera, Sarcopterygii, Condrichtyes, Crustacea, Polychaeta
#Schets de levenscyclus van Schistosoma.
#Vergelijk 3 types spierweefsel en leg het mechanisme van contractie uit. 5. Bespreek de hormonale regulatie van de menstruele cyclus.
===18 juni 2010===
#woordjes:
##adaptieve radiatie ï‚§ ascon
##nematocyst
##eutelie
##lofofoor
#verbinden: spicula (porifera), ambulacra (echinodermata), antennae (insecta), melkklieren (mammalia), rhopalia (cnidaria), proglottiden (cestoda), pseudocoel (nematoda), clitellum (huridinae)
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#vergelijken van osmoregulatie bij zout- en zoetwatervissen 5. principe van impulsgeleiding in zenuwcellen
===15 juni 2006===
#woordjes:
##regressieve evolutie
##mimicry
##filariasis
##ecdysis
##parthenogenese
#verbinden: radula (gastropoda), ambulacra (echinodermata), antennae (arthropoda), cloeidisch ei (reptilia), gemmulae (porifera), mesogloea (cnidaria), parapodium (polychaeta), lofofoor (brachiopoda)
#principe van bioluminiscentie in victoria aequorine uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#geef functie, structuur en regulatie van de hypofyse + welke hormonen komen erbij voor

Chemie Van Natuurproducten

2019-08-26T10:43:20Z

Elisevanvyve: /* 26 augustus 2019 */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==

==Examenvragen==

===26 augustus 2019===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#Stel een mogelijk reactiemechanisme op hoe B gemaakt wordt uit A. Hoe wordt A biosynthetisch gevormd? (A was polyketide en leek op de reactie met orsellinic acid maar met fenol groep ipv methylgroep)
#Oxidatie door NAD+ (Zie 21 juni ‘18 NM, vraag 2)

===20 juni 2019 VM===
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv 5-ring
#hoe zou je van molecule A naar molecule B gaan + geef een mogelijke biosynthese van molecule A (molecule A was een polyketide met een starter unit)
#2 moleculen gegeven en uitleggen welke van de 2 enantioselectief omgezet wordt door NADH naar een optisch actieve verbinding

===18 juni 2019 NM===
#Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat (Let op: hoe dit in de dropbox staat is niet 100% correct, de dubbele binding bovenaan kan direct aanvallen op het C-atoom waaraan OPP gebonden is om de ring te sluiten.)
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Bespreek de anti-oxidant werking van Vitamine C.

===18 juni 2019 VM===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek de anti-oxidant werking van Vitamine C

===15 juni 2019 VM===
#Polyketide ringsluiting + synthese bioketide
#Pyridoxal fosfaat oefening
#Oxidatie door NAD+

===7 juni 2019 NM===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#Stel een mogelijk reactiemechanisme op hoe B gemaakt wordt uit A. Hoe wordt A biosynthetisch gevormd? (A was polyketide)
#Bespreek de anti-oxiderende werking van Vitamine C

===7 juni 2019 VM===
#Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
#bespreek anti-oxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===4 september 2018 NM===
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv een 5-ring
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Wat zijn inositolen? + geef de biosynthese

===21 juni 2018 NM===
#Stetter-reagens
#NAD+/NADH reductie
#biosynthese inositol
[[Bestand:Knipsel.jpg]]

===21 juni 2018 VM===
#vorming 8 ring met pyridoxaal fosfaat
#ringsluiting van polyketide en de synthese van een polyketide geven
#stereospecifieke aanval bij reductie met NADH

===19 juni 2018===
#bespreek synthese humuleen
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2

===15 juni 2018===
#Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units')
#Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)
#Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+.

===11 juni 2018 VM===
#Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek antioxiderende werking van vitamine C

===21 juni 2017 NM===
#hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme
#reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --> ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)
#bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen

===21 juni 2017 voormiddag===
#bespreek synthese humuleen
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===20 juni 2017 namiddag===
# Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat
# een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)
# geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)

===20 juni 2017 voormiddag===
# oefening van polyketiden
# gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat
# oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).

===16 juni 2017===
# Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
# Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)
# Antioxidante werking van vitamine C

===13 juni 2017===
# Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)
# Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring.
# Stetteroefening.

===12 juni 2017===
# een oefening "met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie" da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter
# tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie
# theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit

===12 juni 2015===
#leg de werking van vitamine C uit als antioxidans
#Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat
#Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.

===20 agustus 2013===
#Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme
#Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+
#Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken

===19 juni 2013===
#Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit
#Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule
#Bespreek de synthese van vitamine C

===17 juni 2013===
#In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)
#Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)
#Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C

===14 juni 2013===
#Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert
#2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen
#Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.

===15 juni 2012 (namiddag)===
#Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.
#Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.
#Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.

===15 juni 2012 (voormiddag)===
#Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat
#Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?
#Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA

===20 juni 2011 (namiddag)===
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)
#Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.
#Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion

===14 juni 2010===
#Omzetting van histidine naar histamine (histidine zonder CO2) (structuren gegeven)
#Welk biomimetisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)
#Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit

===11 juni 2010===
#Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat
#Vetzuursynthese
#Radicale ortho-para-koppeling

===September 2009===
#DOPA en DOPAMINE
#Synthese inositolen
#Stereospecificiteit LADH

===12 juni 2009===
#Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?
#Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie
#Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan

===4 september 2008===
#De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.
#De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep

===17 juni 2008===
#Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt
#Fructose: fisher => hawordth omzetting
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD

===19 juni 2007===
#Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)
#Fructose fisher gegeven, geef haworth
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2) leg uit + geef structuur van FAD

===12 juni 2006===
#Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties
#Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?
#Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg

===12 juni 2006===
#Decarboxylatie van een aminozuur
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2): leg uit + geef structuur van FAD
#Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit

Chemie Van Natuurproducten

2019-08-26T10:41:44Z

Elisevanvyve: /* 26 augustus 2019 */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==

==Examenvragen==

===26 augustus 2019===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#Stel een mogelijk reactiemechanisme op hoe B gemaakt wordt uit A. Hoe wordt A biosynthetisch gevormd? (A was polyketide)
#Oxidatie door NAD+ (Zie 21 juni ‘18 NM, vraag 2)

===20 juni 2019 VM===
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv 5-ring
#hoe zou je van molecule A naar molecule B gaan + geef een mogelijke biosynthese van molecule A (molecule A was een polyketide met een starter unit)
#2 moleculen gegeven en uitleggen welke van de 2 enantioselectief omgezet wordt door NADH naar een optisch actieve verbinding

===18 juni 2019 NM===
#Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat (Let op: hoe dit in de dropbox staat is niet 100% correct, de dubbele binding bovenaan kan direct aanvallen op het C-atoom waaraan OPP gebonden is om de ring te sluiten.)
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Bespreek de anti-oxidant werking van Vitamine C.

===18 juni 2019 VM===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek de anti-oxidant werking van Vitamine C

===15 juni 2019 VM===
#Polyketide ringsluiting + synthese bioketide
#Pyridoxal fosfaat oefening
#Oxidatie door NAD+

===7 juni 2019 NM===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#Stel een mogelijk reactiemechanisme op hoe B gemaakt wordt uit A. Hoe wordt A biosynthetisch gevormd? (A was polyketide)
#Bespreek de anti-oxiderende werking van Vitamine C

===7 juni 2019 VM===
#Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
#bespreek anti-oxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===4 september 2018 NM===
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv een 5-ring
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Wat zijn inositolen? + geef de biosynthese

===21 juni 2018 NM===
#Stetter-reagens
#NAD+/NADH reductie
#biosynthese inositol
[[Bestand:Knipsel.jpg]]

===21 juni 2018 VM===
#vorming 8 ring met pyridoxaal fosfaat
#ringsluiting van polyketide en de synthese van een polyketide geven
#stereospecifieke aanval bij reductie met NADH

===19 juni 2018===
#bespreek synthese humuleen
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2

===15 juni 2018===
#Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units')
#Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)
#Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+.

===11 juni 2018 VM===
#Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek antioxiderende werking van vitamine C

===21 juni 2017 NM===
#hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme
#reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --> ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)
#bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen

===21 juni 2017 voormiddag===
#bespreek synthese humuleen
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===20 juni 2017 namiddag===
# Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat
# een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)
# geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)

===20 juni 2017 voormiddag===
# oefening van polyketiden
# gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat
# oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).

===16 juni 2017===
# Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
# Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)
# Antioxidante werking van vitamine C

===13 juni 2017===
# Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)
# Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring.
# Stetteroefening.

===12 juni 2017===
# een oefening "met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie" da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter
# tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie
# theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit

===12 juni 2015===
#leg de werking van vitamine C uit als antioxidans
#Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat
#Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.

===20 agustus 2013===
#Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme
#Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+
#Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken

===19 juni 2013===
#Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit
#Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule
#Bespreek de synthese van vitamine C

===17 juni 2013===
#In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)
#Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)
#Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C

===14 juni 2013===
#Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert
#2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen
#Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.

===15 juni 2012 (namiddag)===
#Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.
#Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.
#Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.

===15 juni 2012 (voormiddag)===
#Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat
#Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?
#Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA

===20 juni 2011 (namiddag)===
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)
#Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.
#Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion

===14 juni 2010===
#Omzetting van histidine naar histamine (histidine zonder CO2) (structuren gegeven)
#Welk biomimetisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)
#Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit

===11 juni 2010===
#Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat
#Vetzuursynthese
#Radicale ortho-para-koppeling

===September 2009===
#DOPA en DOPAMINE
#Synthese inositolen
#Stereospecificiteit LADH

===12 juni 2009===
#Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?
#Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie
#Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan

===4 september 2008===
#De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.
#De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep

===17 juni 2008===
#Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt
#Fructose: fisher => hawordth omzetting
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD

===19 juni 2007===
#Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)
#Fructose fisher gegeven, geef haworth
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2) leg uit + geef structuur van FAD

===12 juni 2006===
#Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties
#Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?
#Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg

===12 juni 2006===
#Decarboxylatie van een aminozuur
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2): leg uit + geef structuur van FAD
#Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit

Chemie Van Natuurproducten

2019-08-26T10:41:11Z

Elisevanvyve: /* 26 augustus 2019 */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==

==Examenvragen==

===26 augustus 2019===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#Stel een mogelijk reactiemechanisme op hoe B gemaakt wordt uit A. Hoe wordt A biosynthetisch gevormd? (A was polyketide)
#Oxidatie door NAD+ (Zie 21 juni ‘18, vraag 2)

===20 juni 2019 VM===
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv 5-ring
#hoe zou je van molecule A naar molecule B gaan + geef een mogelijke biosynthese van molecule A (molecule A was een polyketide met een starter unit)
#2 moleculen gegeven en uitleggen welke van de 2 enantioselectief omgezet wordt door NADH naar een optisch actieve verbinding

===18 juni 2019 NM===
#Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat (Let op: hoe dit in de dropbox staat is niet 100% correct, de dubbele binding bovenaan kan direct aanvallen op het C-atoom waaraan OPP gebonden is om de ring te sluiten.)
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Bespreek de anti-oxidant werking van Vitamine C.

===18 juni 2019 VM===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek de anti-oxidant werking van Vitamine C

===15 juni 2019 VM===
#Polyketide ringsluiting + synthese bioketide
#Pyridoxal fosfaat oefening
#Oxidatie door NAD+

===7 juni 2019 NM===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#Stel een mogelijk reactiemechanisme op hoe B gemaakt wordt uit A. Hoe wordt A biosynthetisch gevormd? (A was polyketide)
#Bespreek de anti-oxiderende werking van Vitamine C

===7 juni 2019 VM===
#Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
#bespreek anti-oxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===4 september 2018 NM===
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv een 5-ring
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Wat zijn inositolen? + geef de biosynthese

===21 juni 2018 NM===
#Stetter-reagens
#NAD+/NADH reductie
#biosynthese inositol
[[Bestand:Knipsel.jpg]]

===21 juni 2018 VM===
#vorming 8 ring met pyridoxaal fosfaat
#ringsluiting van polyketide en de synthese van een polyketide geven
#stereospecifieke aanval bij reductie met NADH

===19 juni 2018===
#bespreek synthese humuleen
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2

===15 juni 2018===
#Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units')
#Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)
#Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+.

===11 juni 2018 VM===
#Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek antioxiderende werking van vitamine C

===21 juni 2017 NM===
#hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme
#reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --> ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)
#bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen

===21 juni 2017 voormiddag===
#bespreek synthese humuleen
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===20 juni 2017 namiddag===
# Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat
# een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)
# geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)

===20 juni 2017 voormiddag===
# oefening van polyketiden
# gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat
# oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).

===16 juni 2017===
# Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
# Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)
# Antioxidante werking van vitamine C

===13 juni 2017===
# Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)
# Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring.
# Stetteroefening.

===12 juni 2017===
# een oefening "met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie" da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter
# tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie
# theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit

===12 juni 2015===
#leg de werking van vitamine C uit als antioxidans
#Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat
#Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.

===20 agustus 2013===
#Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme
#Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+
#Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken

===19 juni 2013===
#Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit
#Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule
#Bespreek de synthese van vitamine C

===17 juni 2013===
#In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)
#Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)
#Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C

===14 juni 2013===
#Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert
#2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen
#Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.

===15 juni 2012 (namiddag)===
#Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.
#Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.
#Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.

===15 juni 2012 (voormiddag)===
#Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat
#Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?
#Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA

===20 juni 2011 (namiddag)===
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)
#Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.
#Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion

===14 juni 2010===
#Omzetting van histidine naar histamine (histidine zonder CO2) (structuren gegeven)
#Welk biomimetisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)
#Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit

===11 juni 2010===
#Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat
#Vetzuursynthese
#Radicale ortho-para-koppeling

===September 2009===
#DOPA en DOPAMINE
#Synthese inositolen
#Stereospecificiteit LADH

===12 juni 2009===
#Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?
#Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie
#Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan

===4 september 2008===
#De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.
#De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep

===17 juni 2008===
#Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt
#Fructose: fisher => hawordth omzetting
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD

===19 juni 2007===
#Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)
#Fructose fisher gegeven, geef haworth
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2) leg uit + geef structuur van FAD

===12 juni 2006===
#Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties
#Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?
#Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg

===12 juni 2006===
#Decarboxylatie van een aminozuur
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2): leg uit + geef structuur van FAD
#Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit

Chemie Van Natuurproducten

2019-08-26T10:40:37Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==

==Examenvragen==

===26 augustus 2019===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#Stel een mogelijk reactiemechanisme op hoe B gemaakt wordt uit A. Hoe wordt A biosynthetisch gevormd? (A was polyketide)
#Oxidatie door NAD+

===20 juni 2019 VM===
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv 5-ring
#hoe zou je van molecule A naar molecule B gaan + geef een mogelijke biosynthese van molecule A (molecule A was een polyketide met een starter unit)
#2 moleculen gegeven en uitleggen welke van de 2 enantioselectief omgezet wordt door NADH naar een optisch actieve verbinding

===18 juni 2019 NM===
#Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat (Let op: hoe dit in de dropbox staat is niet 100% correct, de dubbele binding bovenaan kan direct aanvallen op het C-atoom waaraan OPP gebonden is om de ring te sluiten.)
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Bespreek de anti-oxidant werking van Vitamine C.

===18 juni 2019 VM===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek de anti-oxidant werking van Vitamine C

===15 juni 2019 VM===
#Polyketide ringsluiting + synthese bioketide
#Pyridoxal fosfaat oefening
#Oxidatie door NAD+

===7 juni 2019 NM===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#Stel een mogelijk reactiemechanisme op hoe B gemaakt wordt uit A. Hoe wordt A biosynthetisch gevormd? (A was polyketide)
#Bespreek de anti-oxiderende werking van Vitamine C

===7 juni 2019 VM===
#Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
#bespreek anti-oxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===4 september 2018 NM===
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv een 5-ring
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Wat zijn inositolen? + geef de biosynthese

===21 juni 2018 NM===
#Stetter-reagens
#NAD+/NADH reductie
#biosynthese inositol
[[Bestand:Knipsel.jpg]]

===21 juni 2018 VM===
#vorming 8 ring met pyridoxaal fosfaat
#ringsluiting van polyketide en de synthese van een polyketide geven
#stereospecifieke aanval bij reductie met NADH

===19 juni 2018===
#bespreek synthese humuleen
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2

===15 juni 2018===
#Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units')
#Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)
#Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+.

===11 juni 2018 VM===
#Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek antioxiderende werking van vitamine C

===21 juni 2017 NM===
#hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme
#reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --> ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)
#bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen

===21 juni 2017 voormiddag===
#bespreek synthese humuleen
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===20 juni 2017 namiddag===
# Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat
# een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)
# geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)

===20 juni 2017 voormiddag===
# oefening van polyketiden
# gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat
# oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).

===16 juni 2017===
# Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
# Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)
# Antioxidante werking van vitamine C

===13 juni 2017===
# Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)
# Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring.
# Stetteroefening.

===12 juni 2017===
# een oefening "met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie" da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter
# tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie
# theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit

===12 juni 2015===
#leg de werking van vitamine C uit als antioxidans
#Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat
#Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.

===20 agustus 2013===
#Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme
#Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+
#Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken

===19 juni 2013===
#Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit
#Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule
#Bespreek de synthese van vitamine C

===17 juni 2013===
#In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)
#Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)
#Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C

===14 juni 2013===
#Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert
#2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen
#Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.

===15 juni 2012 (namiddag)===
#Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.
#Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.
#Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.

===15 juni 2012 (voormiddag)===
#Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat
#Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?
#Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA

===20 juni 2011 (namiddag)===
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)
#Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.
#Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion

===14 juni 2010===
#Omzetting van histidine naar histamine (histidine zonder CO2) (structuren gegeven)
#Welk biomimetisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)
#Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit

===11 juni 2010===
#Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat
#Vetzuursynthese
#Radicale ortho-para-koppeling

===September 2009===
#DOPA en DOPAMINE
#Synthese inositolen
#Stereospecificiteit LADH

===12 juni 2009===
#Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?
#Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie
#Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan

===4 september 2008===
#De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.
#De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep

===17 juni 2008===
#Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt
#Fructose: fisher => hawordth omzetting
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD

===19 juni 2007===
#Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)
#Fructose fisher gegeven, geef haworth
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2) leg uit + geef structuur van FAD

===12 juni 2006===
#Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties
#Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?
#Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg

===12 juni 2006===
#Decarboxylatie van een aminozuur
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2): leg uit + geef structuur van FAD
#Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit

Chemie Van Natuurproducten

2019-08-21T13:09:29Z

Elisevanvyve: /* 21 juni 2017 namiddag */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==

==Examenvragen==
===20 juni 2019 VM===
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv 5-ring
#hoe zou je van molecule A naar molecule B gaan + geef een mogelijke biosynthese van molecule A (molecule A was een polyketide met een starter unit)
#2 moleculen gegeven en uitleggen welke van de 2 enantioselectief omgezet wordt door NADH naar een optisch actieve verbinding

===18 juni 2019 NM===
#Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat (Let op: hoe dit in de dropbox staat is niet 100% correct, de dubbele binding bovenaan kan direct aanvallen op het C-atoom waaraan OPP gebonden is om de ring te sluiten.)
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Bespreek de anti-oxidant werking van Vitamine C.

===18 juni 2019 VM===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek de anti-oxidant werking van Vitamine C

===15 juni 2019 VM===
#Polyketide ringsluiting + synthese bioketide
#Pyridoxal fosfaat oefening
#Oxidatie door NAD+
===7 juni 2019 NM===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#Stel een mogelijk reactiemechanisme op hoe B gemaakt wordt uit A. Hoe wordt A biosynthetisch gevormd? (A was polyketide)
#Bespreek de anti-oxiderende werking van Vitamine C

===7 juni 2019 VM===
#Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
#bespreek anti-oxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===4 september 2018 NM===
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv een 5-ring
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Wat zijn inositolen? + geef de biosynthese

===21 juni 2018 NM===
#Stetter-reagens
#NAD+/NADH reductie
#biosynthese inositol
[[Bestand:Knipsel.jpg]]

===21 juni 2018 VM===
#vorming 8 ring met pyridoxaal fosfaat
#ringsluiting van polyketide en de synthese van een polyketide geven
#stereospecifieke aanval bij reductie met NADH

===19 juni 2018===
#bespreek synthese humuleen
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2

===15 juni 2018===
#Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units')
#Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)
#Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+.

===11 juni 2018 VM===
#Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek antioxiderende werking van vitamine C

===21 juni 2017 NM===
#hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme
#reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --> ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)
#bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen

===21 juni 2017 voormiddag===
#bespreek synthese humuleen
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===20 juni 2017 namiddag===
# Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat
# een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)
# geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)

===20 juni 2017 voormiddag===
# oefening van polyketiden
# gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat
# oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).

===16 juni 2017===
# Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
# Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)
# Antioxidante werking van vitamine C

===13 juni 2017===
# Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)
# Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring.
# Stetteroefening.

===12 juni 2017===
# een oefening "met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie" da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter
# tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie
# theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit

===12 juni 2015===
#leg de werking van vitamine C uit als antioxidans
#Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat
#Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.

===20 agustus 2013===
#Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme
#Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+
#Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken

===19 juni 2013===
#Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit
#Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule
#Bespreek de synthese van vitamine C

===17 juni 2013===
#In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)
#Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)
#Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C

===14 juni 2013===
#Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert
#2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen
#Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.

===15 juni 2012 (namiddag)===
#Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.
#Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.
#Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.

===15 juni 2012 (voormiddag)===
#Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat
#Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?
#Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA

===20 juni 2011 (namiddag)===
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)
#Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.
#Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion

===14 juni 2010===
#Omzetting van histidine naar histamine (histidine zonder CO2) (structuren gegeven)
#Welk biomimetisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)
#Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit

===11 juni 2010===
#Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat
#Vetzuursynthese
#Radicale ortho-para-koppeling

===September 2009===
#DOPA en DOPAMINE
#Synthese inositolen
#Stereospecificiteit LADH

===12 juni 2009===
#Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?
#Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie
#Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan

===4 september 2008===
#De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.
#De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep

===17 juni 2008===
#Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt
#Fructose: fisher => hawordth omzetting
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD

===19 juni 2007===
#Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)
#Fructose fisher gegeven, geef haworth
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2) leg uit + geef structuur van FAD

===12 juni 2006===
#Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties
#Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?
#Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg

===12 juni 2006===
#Decarboxylatie van een aminozuur
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2): leg uit + geef structuur van FAD
#Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit

Chemie Van Natuurproducten

2019-08-21T13:09:16Z

Elisevanvyve: /* 11 juni 2018 voormiddag */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==

==Examenvragen==
===20 juni 2019 VM===
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv 5-ring
#hoe zou je van molecule A naar molecule B gaan + geef een mogelijke biosynthese van molecule A (molecule A was een polyketide met een starter unit)
#2 moleculen gegeven en uitleggen welke van de 2 enantioselectief omgezet wordt door NADH naar een optisch actieve verbinding

===18 juni 2019 NM===
#Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat (Let op: hoe dit in de dropbox staat is niet 100% correct, de dubbele binding bovenaan kan direct aanvallen op het C-atoom waaraan OPP gebonden is om de ring te sluiten.)
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Bespreek de anti-oxidant werking van Vitamine C.

===18 juni 2019 VM===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek de anti-oxidant werking van Vitamine C

===15 juni 2019 VM===
#Polyketide ringsluiting + synthese bioketide
#Pyridoxal fosfaat oefening
#Oxidatie door NAD+
===7 juni 2019 NM===
#Aan de hand van welk biomimetisch reagens gebeurt onderstaande reactie? (Stetter) Stel een mogelijk reactiemechanisme op.
#Stel een mogelijk reactiemechanisme op hoe B gemaakt wordt uit A. Hoe wordt A biosynthetisch gevormd? (A was polyketide)
#Bespreek de anti-oxiderende werking van Vitamine C

===7 juni 2019 VM===
#Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
#bespreek anti-oxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===4 september 2018 NM===
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv een 5-ring
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Wat zijn inositolen? + geef de biosynthese

===21 juni 2018 NM===
#Stetter-reagens
#NAD+/NADH reductie
#biosynthese inositol
[[Bestand:Knipsel.jpg]]

===21 juni 2018 VM===
#vorming 8 ring met pyridoxaal fosfaat
#ringsluiting van polyketide en de synthese van een polyketide geven
#stereospecifieke aanval bij reductie met NADH

===19 juni 2018===
#bespreek synthese humuleen
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2

===15 juni 2018===
#Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units')
#Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)
#Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+.

===11 juni 2018 VM===
#Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek antioxiderende werking van vitamine C

===21 juni 2017 namiddag===
#hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme
#reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --> ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)
#bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen

===21 juni 2017 voormiddag===
#bespreek synthese humuleen
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===20 juni 2017 namiddag===
# Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat
# een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)
# geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)

===20 juni 2017 voormiddag===
# oefening van polyketiden
# gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat
# oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).

===16 juni 2017===
# Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
# Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)
# Antioxidante werking van vitamine C

===13 juni 2017===
# Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)
# Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring.
# Stetteroefening.

===12 juni 2017===
# een oefening "met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie" da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter
# tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie
# theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit

===12 juni 2015===
#leg de werking van vitamine C uit als antioxidans
#Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat
#Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.

===20 agustus 2013===
#Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme
#Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+
#Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken

===19 juni 2013===
#Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit
#Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule
#Bespreek de synthese van vitamine C

===17 juni 2013===
#In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)
#Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)
#Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C

===14 juni 2013===
#Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert
#2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen
#Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.

===15 juni 2012 (namiddag)===
#Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.
#Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.
#Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.

===15 juni 2012 (voormiddag)===
#Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat
#Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?
#Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA

===20 juni 2011 (namiddag)===
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)
#Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.
#Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion

===14 juni 2010===
#Omzetting van histidine naar histamine (histidine zonder CO2) (structuren gegeven)
#Welk biomimetisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)
#Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit

===11 juni 2010===
#Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat
#Vetzuursynthese
#Radicale ortho-para-koppeling

===September 2009===
#DOPA en DOPAMINE
#Synthese inositolen
#Stereospecificiteit LADH

===12 juni 2009===
#Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?
#Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie
#Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan

===4 september 2008===
#De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.
#De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep

===17 juni 2008===
#Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt
#Fructose: fisher => hawordth omzetting
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD

===19 juni 2007===
#Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)
#Fructose fisher gegeven, geef haworth
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2) leg uit + geef structuur van FAD

===12 juni 2006===
#Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties
#Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?
#Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg

===12 juni 2006===
#Decarboxylatie van een aminozuur
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2): leg uit + geef structuur van FAD
#Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit

Structurele en Fysiologische Biologie

2019-08-21T11:36:26Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen DIER */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Eerstejaarsvak enkel aan biochemici en schakelstudenten gegeven, bestaat uit een deel plantkunde (Wim Van den Ende) en een deel dierkunde (Jozef Vanden Broeck). Deze delen hebben op dezelfde dag een examen, het ene mondeling en het andere schriftelijk, onbekend op voorhand dewelke mondeling en dewelke schriftelijk is. Beide examens hebben al jarenlang dezelfde opbouw van type vragen.

==Examenvragen PLANT==

===21 augustus 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek in detail een drietal manieren waarop planten ATP kunnen maken.
# Situeer bondig de termen "gespvormig" en "CRISPR/CAS"
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===28 januari 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek in detail een drietal manieren waarop planten ATP kunnen maken.
# Situeer bondig de termen "gespvormig" en "CRISPR/CAS"
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===14 januari 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# waterpotentiaal en zijn twee componenten
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===14 januari 2019 NM===
# 8 meerkeuzevragen
# Geef 3 manieren waarop planten ATP synthetiseren (glycolyse, ademhaling, Kreb cyclus, ...)
# Leg bondig uit: CRISPR/Cas en CAM planten
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===31 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek de evolutie & metabole diversiteit van prokaryoten en het ontstaan van de eukaryoten.
# Leg bondig uit: het ontstaan van hexaploïde tarwe, mechanisme voor de bloei van lange en korte dag planten.
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===30 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Waterpotentiaal en zijn 2 componenten
# SAR
# Massastroming
# Cyclus van bedektzadigen aanvullen. Is deze plant haplont, diplont of diplohaplont en beargumenteer.
===15 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Geef 3 manieren waarop een plant ATP aanmaakt en leg gedetailleerd uit
# Hypersensitieve respons en CAM planten bondig uitleggen
# Cyclus bedektzadigen aanvullen. Is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===21 aug 2017 NM===
#meerkeuzevragen
#Geef 3 manieren waarop een plant ATP aanmaakt en leg gedetailleerd uit
#gespvorming en CAM planten bondig uitleggen
#cyclus bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont? beargumenteer

===21 aug 2017 VM===
#meerkeuzevragen
#plantenhormonen met werking geven + uitleggen hoe hormoonsysteem in planten werkt
#guttatie en waterpotentiaal bondig uitleggen
#cyclus bedektzadigen aanvullen

===31 jan 2017===
#Meerkeuzevragen
#Waterpotentiaal met zijn 2 componenten uitleggen. Wat gebeurt er als je opgeloste stoffen toevoegt aan het omgevings water?
#Massastroming en SAR uitleggen.
#Cyclus van bedektzadigen aanvullen.

===26 jan 2016===
#8 meerkeuze vragen
#Mondelinge hoofdvraag: hoe wordt sucrose gevormd, hoe komt het in cortexe cellen van de wortels en wat is de bijdrage voor de accumulatie van K+
#Bijvraag: leg chemiosmose en fotorespiratie uit
#Bijvraag: cyclus aanvullen van de bedektzadigen

===30 jan 2014 nm===
#Meerkeuze
#Welke hormonen zijn er bij planten, welke staan in voor apicale dominantie en hoe werkt dit.
#Leg uit hoe herbicide resistentie werkt en leg het mechanisme van glyfosaat uit. Levenscyclus.

===29 jan 2014 nm===
#Meerkeuze
#Bespreek de diversiteit van fungi en geef de levenscyclus van een ascomyceet.
#Bespreek de rol van mieren in commensalisme en de overdracht van parasieten.
#Levenscyclus van varens.
===28 jan 2014 nm===
#8 meerkeuzevragen (4 punten)
#Bespreek de huidige wereldproblemen en geef aan hoe plantenbiotechnologie/biologie zou kunnen bijdragen tot het aanreiken van van oplossingen (8 punten)
#Vul aan en verklaar dit ecologisch model (Bottom-up effect). Hoe kon dit model op experimentele wijze geverifieerd worden? (3 punten)
#Levenscyclus bedektzadige aanvullen (5 punten)
===28 jan 2014 vm===
#Meerkeuze
#Plantenhormonen welke types? regulatie? welke komen voor bij apicale dominantie? Regulatie? Werking?
#Levenscyclus bladmossen
#Tekening van de muis, mier, plant, zaad (interacties verklaren)
===27 jan 2014===
# 8 meerkeuzevragen.
#Bespreek de diversiteit en evolutie van prokaryoten en het onstaan van eukaryoten.
# Figuur uitleggen over bottom-upeffecten en ontbrekende termen aanvllen.
#Foto van doorsnede monocotyl blad: wat is het + delen benoemen.
===13 jan 2014===
# 5 meerkeuzevragen.
#Aanvullen van termen en processen (mitose/meiose) bij de levenscyvlus van gymnospermen. (Letterlijk uit het handboek fig. 31.12 p609)
#Een plantencel in zuiver water en geleidelijk aan zout toevoegen, wat gebeurt er? Leg uit a.d.h.v. een duidelijke grafiek.
#Wat is een preprofaseband? (en nog een term ?? uitleggen)
===23 jan 2012===
#Leg uit wat er zal gebeuren bij een plantencel in zuiver water en wat als je opgeloste stoffen toevoegt aan de omgeving. Maak een schema aan de hand van de waterpotentiaal en zijn 2 subcomponenten en leg uit hoe deze veranderen.
#Leg uit fotorespiratie: hoe wat waarom waar.
#Situeer:
##glyphosaat
##methanogeen
##guttatie
##Mycorrhiza
#Levenscyclus. Aangeven om welke levenscyclus het ging (bladmossen) en beargumenteren. Structuren en processen aanvullen op tekening. Aangeven of het een haplonte, diplonte of haplodiplonte levenscyclys was.
===1 feb 2011 VM===
#Volledige weg beschrijven die een C-atoom aflegt als CO2 indien ingebouwd in pectine in de celwand van rhizodermiscellen. Waaruit bestaat de celwand en wat is de functie?
#Bespreek in detail de signaalgeving en metabolische wegen van Rhizobium in symbiose met een plant.
#. Figuur: levenscyclus bedektzadigen
#Situeer:
##hexaploÃ¯die by tarwe
##cavitatieï‚§
##gespvorming by Basidiomyceten ï‚§ induceerbare mutaties
===27 jan 2011 NM===
#Volledige weg beschrijven die een N-atoom aflegt van de bodem tot inbouw als glycoproteÃ¯ne in een bladepidermiscel
#Vgl mossen en angiospermen. Zeggen hoe deze zijn aangepast aan leven op het land
#Figuur:
##structuur van een blad met huidmondjes
##hetzelfde -.-
#Situeer:
##allotetraploÃ¯die
##guttatie
##sterke vs zwakke sinks
##bespreek metabolisme Archaea

===24 jan 2011 NM===
#De waterpotentiaal en de 2 componenten ervan bespreken als we een cel in zuiver water hebben en daar geleidelijk aan zout aan toevoegen. Schematisch weergeven en stap voor stap bespreken wat er met de cel gebeurt.
#Het verschil tussen gametofytische en sporofytische incompatibiliteit uitleggen. En een model geven voor gametofytische incompatibiliteit.
#Figuur:
##Doorsnede monocotyle stengel
##Vaatbundel en daarop floeem,
##xyleem en vezelschede benoemen
#Situeer:
##Endosymbiose
##ViroÃ¯den
##Soortkruisingen
##Lenticel
===24 jan 2011 VM===
#Bespreek structuur, samenstelling, functie en oorsprong van de plantencelwand.
#Bespreek de verschillen tussen C3, C4 en CAM
#Figuur: monokotyle stengel met vaatbundel
#Situeer:
##hydrogenosoom
##Agrobacterium tumefaciens
##massastroming (Munch hypothese)
##terminatortechnologie
===25 jan 2010 VM===
#Teken een dwarsdoorsnede van een wortel van een monokotyle plant. Wat is het verschil met een dikotyle plant?
#Bespreek (fysiologisch en chemisch) de weg die een CO2 molecule aflegt vanuit de lucht om ingebouwd de worden in de celwand van een
rhizodermiscel.
#Vergelijk CO2 fixatie bij C3 en C4 planten. Wat zijn de ethiologische implicaties?
#ABC van de bloemetjes
#Situeer:
#Soortkruising
#Isospore haplodiplont
#Worteldruk
#Basidiomyceten
#ï‚§Archebacteria
===18 jan 2010 NM===
#Bespreek de mogelijkheden voor overdracht van genetische informatie tussen individuen die tot een andere soort behoren.
#Vul volgende figuur aan en bespreek (die van potentiaal, niet met de kleurtjes, degene die ook in de cursus staat).
#Vergelijk CO2 fixatie bij CAM en C4 planten. 4. ABC van de bloemen.
#Situeer en bespreek:
##ascomyceten,
##heterospore haplodiplonten
##3 figuren: (een stengel ==> figuur helemaal onderaan rechts in voorbeeldvragen, een blad ==> die gele figuur zo :p en een wortel ==> laatste blz, rechts bovenaan)
===18 jan 2010 VM===
#Bespreek autotrofie bij prokaryoten en eukaryoten.
#Gametofytische incompatibiliteit.
#Fotorespiratie: wat, waar, hoe, waarom?
#Vul aan en bespreek zodat duidelijk wordt of het om een haplont, diplont of haplodiplont organisme gaat. Is dit type organisme al goed aangepast aan het landleven? (figuur van varens, zie voorbeeldvragen)
#Situeer en bespreek:
##3 figuren (monokotyl blad, dikotyle verdikte stengel, monokotyle vaatbundel),
##agrobacterium tumefaciens
##basidiomyceten.
===26 jan 2009===
#Plantencelwand: Samenstelling? Structuur? Functie? Oorsprong?
#Transport in planten: Hoe? Waar? Waarom?
#C4 en CAM planten: Wat? Waarom? Hoe? Verschil?
#Afbeelding van een diplohaplonte cyclus, en zeggen of deze plant al goed
is aangepast aan het leven op het land.
#Termen:
##Soortkruising
##Agrobacterium Tumefaciens
##Zelfincompatibiliteit
##Het ABC van de bloemetjes
##Fotoke van dwarse doorsnede van een plantenstengel, zeggen wa ge ziet en van die dinge..
===19 jan 2009===
#voortplantingscyclus (mos)
#bespreek zo goed mogelijk de opnamen van N uit nitraat (chemisch/fysisch) en inbouw in celwandprotÃ«ine epidermiscel 3. teken primaire stengel dikotyle plant + verschil monokotyle
#fotorespiratie: zin of onzin.
#Termen:
##gametofytische zelfincompabiliteit
##ABC van bloemen
##worteldruk
##retrovirussen
===28 jan 2008===
#vergelijk autotrofie bij eukaryoten en prokaryoten
#fotorespiratie
#zelf-incompabiliteit
#cyclus van varen aanvullen + aangepassingen aan het land
#Situeer:
##drie foto's
##Agrobacterium tumefaciens
##Basidiomyceet
===28 jan 2008===
#primaire dikotyle wortel tekenen en bespreken, vergelijken met monokotyle
#Welke fysische en chemische weg moet het N-atoom van NH4+ afleggen
om ingebouwd te kunnen worden in een celwandproteÃ¯ne van een blad
#Grafieken van CO2-opname van C3 en C4 planten. Zelf assen invullen en c3 en c4 aanduiden + uitleggen waarom
#Welke aanpassingen moet een landplant hebben ten opzichte van een wier
om te kunnen overleven op het land en is dit bij alle zo
#Bespreek:
##ascomyceten
##retrotransposons
##archeaebacteriÃ«n
##zelfincomptabiliteit
===21 jan 2008===
#Hoe genetische informatie overbrengen tussen individuen van verschillende soorten denk ik
#Bespreek en vul aan die figuur van de waterpotentiaal in een cel
#leg uit hoe CO2 wordt gefixeerd bij C4 planten en CAM planten en vergelijk
#geef een schematische voorstelling en een voorbeeld van een heterospore haplodiplont cyclus
#Situeer:
##Ascomyceten
##zelfincompatibiliteit
## 3 foto'kes ( stengel, wortel en blad)
===18 jan 2008===
#teken structuur monocotyle wortel, vgl met dicotyle
#bespreek fixatie co2 bij C4-C3 planten, ahv voor en nadelen
#voortplantingscyclus (van ascomyceten, was wel niet gegeven da het over asco ging ) aanvullen en uitleggen waarom het haplont/diplont/diplohaplont is
#bespreek hoe C via co2 kan ingebouwd worden in de rizodhermiscellen (
zowel fysich als chemisch )
#Situeer en bespreek:
##worteldruk
##basidiomyceten
##archeaebacteriÃ«n
##soortbestuiving
##retrovirussen
===14 jan 2008===
#Celwand: Samenstelling? Functie? Oorsprong? Structuur?
#Vergelijk het transport van mineralen en het transport van
fotosyntheseproducten
#Je gaat op excursie om C3/C4/CAM planten te inventariseren. Wat voor
materiaal neem je mee en leg uit.
#Tekening van een voortplantingscyclus: Is dit haplont/diplont/haplodiplont? Leg uit en geef aan of en hoe deze plant aan het landleven aangepast is.
#Situeer en bespreek:
##Zelfincopatibiliteit
##Agrobacterium tumefaciens
##3 tekeningen (doorsneden van stengel/wortel)
===2 feb 2007===
#twee grafieken zonder aanduidingen "vul aan en verklaar"
#genetische overdracht tussen individuen van dezelfde soort en verschillende soorten, leg uit
===15 jan 2007===
#Vul volgende grafiek aan en bespreek (die van de waterpotentiaal van de omgeving t o v die in de plantencel) en hoe zit dit in 't xyleem?
#Fotorespiratie: wat? waar? hoe? waarom?
#Situeer:
##lenticellen
##heterospore
##haplodiplonten
##zygomyceten
##endodermis
##gametofytische incompatibiliteit
##agrobacterium tumefaciens

==Examenvragen DIER==

===21 augustus 2019 VM===
# Begrippen verklaren: parthenogenese, eutelie, monocyt
# Termen verbinden idem vorige jaren
# Skeletspier structuur en hoe werkt deze (wat is een elektrische impuls)
# Glucosegehalte in bloedplasma en regulerende hormonen, waar worden glucose opgeslagen

===28 januari 2019 VM===
# Verklaar volgende begrippen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
# Verbind volgende begrippen en verklaar bondig:
## parapodia, radula, buisjes van Malphigi, pseudocoel, clitellum, cleidoïsch ei, ambulacra, choanocyten.
## Oligochaeta, Reptilia, Echinodermata, Porifera, Polychaeta, Nematoda, Insecta, Gastropoda
# Bespreek de rol van de maag en het duodenum in de spijvertering. Welke hormonen worden daar lokaal vrijgesteld en wat is hun rol?
# Bespreek de hartcyclus en bloedsomloop en de regulatie van de bloeddruk.

===14 januari 2019 VM===
# Begrippen verklaren: parthenogenese, eutelie, monocyt
# Termen verbinden idem vorige jaren
# Skeletspier structuur en hoe werkt deze
# Glucosegehalte in plasma en regulerende hormonen

===14 januari 2019 NM===
#Begrippen verklaren: gemmula, radula, planula
#Termen verbinden en kort de functie geven ervan: ambulacra (Echinodermata), mesoglea (Cnidaria), lofofoor (Branchiopoda), proglottiden (Cestoda), clitellum (Huridinae), corpus alata (Insecta), choanen, endostyl
# Leg de werking van bioluminescentie uit bij Aequorea victoria.
#Leg de menstruatiecyclus uit adhv de hormonen

===31 januari 2018 VM===
# Verklaar volgende begrippen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
# Verbind volgende begrippen en verklaar bondig: parapodia, radula, buisjes van Malphigi, pseudocoel, clitellum, cleidoïsch ei, ambulacra, choanocyten.
# Bespreek de rol van de maag en het duodenum in de spijvertering. Welke hormonen worden hier geproduceerd en wat is hun rol?
# Bespreek de hartcyclus en bloedsomloop en de regulatie van de bloeddruk.

===30 januari 2018 VM===
#Begrippen verklaren: Ambulacra, Thrombocyt, Mimicry
#Termen verbinden en kort de functie geven ervan: zie vorige jaren
#Osmoregulatie van zoetwater- en zoutwater vissen
#Geef de werking en structuur van het binnenoor.

===15 januari 2018 VM ===
# Begrippen verklaren: gemmulae, radula en parthenogenese.
# Verbinden: exact dezelfde begrippen als vorige jaren.
# Leg de werking van bioluminescentie uit bij Aequorea victoria.
# Geef de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.

===21 aug 2017 NM===
#Begrippen verklaren: Parafyletisch, Parthogenese, Eutelie
#Verbinden: exact dezelfde begrippen als vorige jaren
#Geen 3 bestrijdingsstrategiën tegen een insecten plaagsoort en leg uit
#Leg de menstruatiecyclus uit adhv de hormonen

===21 aug 2017 VM===
#verklaar: blastula, monocyt, convergete evolutie
#verbind, ongeveer zelfde begrippen als vorige jaren + zweetklier (mammalia), zijlijn (osteichthyes)
#Samenstelling van een spier + werking contractie
#hoe wordt het glucose gehalte in het bloed gereguleerd, welke hormonen werken hierbij en waar worden ze gemaakt
===31 jan 2017===
#Verklaar: dauer, ecdysis en filariasis.
#Verbind, zelfde begrippen als voorgaande jaren.
#Vergelijk zuurstof opname bij zoogdieren en insecten.
#Hoe werkt het doorgeven van zenuwimpulsen?

===26 januari 2016===
#Termen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
#Verbinden
#Uitleggen: 3 voorbeelden van tegenstroomprincipe en impulsgeleiding

===20 aug 2014===
#Begrippen:
##adaptieve radiatie
##gremmula
##eutelie
#Verbind:
##preenklier - spiraalplooi - pedipalpen - mesogloea - corpus alata - ambulacra - radula - citellum
##cnidaria - insecta - echinodermata - gestropoda - chondrichtys - hirunae - aves - chelicerata
#Geef het mechanisme van de bioluminescentie bij aquora victoria
#Bespreek de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.
===30 jan 2014===
#Begrippen :
##Metanefridium
##Regeneratie
##Clitellum
#Verbinden: mesogloea, speenklier, kieuwdeksel, pedipalp, ambulacra, corpora allata, spiraalplooi, radula
#Leg de menstruatiecyclus uit en geef 3 voorbeelden van tegenstrooomprincipe
===29 jan 2014 NM===
#Begrippen:
##Filiarsis
##Mimicry
##Corpora cardiaca
#Verbinden: termen van de vorig jaren.
#Leg de werking van longen en tracheÃ«n uit en vergelijk. Vergelijk
osmoregulatie bij zoet-en zoutwatervissen.
===28 jan 2014 NM===
#Termen:
##Lofofoor
##Adaptieve radiatie
##Protonefridium
#Verbind: parapodia(polychaeta), radula(Gastropoda), Antennae(Arthropoda), Mesogloea(cnidaria), clitellum(Oligochaeta), CleidoÃ¯sche ei(Reptilia), Ambulacra(Echinodermata), Gemmulae(Porifera)
#Illustreer aan de hand van drie voorbeelden het belang van het tegenstroomprincipe en leg uit.
#Leg het mechanisme uit van de elektrische impulsgeleiding door zenuwcellen.
===28 jan 2014 VM===
#Begrippen:
##Gemmula
##Radula
##Corpora allata
#Verbinden: termen van de vorig jaren.
#Bespreken en vergelijken het mechanisme van gasuitwisseling bij longen zoogdieren en vogels
#Welke hormonen worden gevormd in de gonaden bij de mens en regulatie.
===27 jan 2014===
#Termen:
##Planula
##RNA interference
##Eutelie
#Verbinden, opnieuw combinaite die hieronder al staat
#Bespreek de structuur en het contractiemechanisme van skeletspieren.
#Wat zijn de belangrijkste hormonen die door de schildklier geproduceerd worden en hoe worden ze gereguleerd?
===13 jan 2012===
#Leg uit:
##Gremule
##Eutelie
##Amnion
#Verbindt Latijnse namen met Latijnse namen. (letterlijk als in het voorbeeld examen)
#Leg bondig uit: Skeletspier (structuur, werking en regulatie)
#Welke hormonen spelen welke rol in de vrouwelijke voortplantingscycus?
===25 juni 2012===
#Termen:
##Nematocyst ï‚§?
##Metamorfose ï‚§ Lolofoo
##Amnion
#Verbinden (Combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)
#Bespreek en vergelijk drie types spierweefsel bij dieren.
#Bespreek rol van gal en pancreas in de spijsvertering (in invertebraten). 5. Bespreek de regulatie van hartcyclus en bloeddruk (in zoogdieren).
===22 juni 2012===
#Termen:
##Protonefridia
##Ecdysis
##Parthenogenese
##Mimicry
##Filariasis
#Verbinden ( was combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel
===19 juni 2012===
#Termen:
##Feromoon
##Dauer
##Regressieve evolutie
##Endostyl ï‚§
#Verbinden. Allemaal termen uit de vragen van vorige jaren.
#Geef de levenscyclus van de runderlintworm en bespreek.
#Leg het tegenstroomprincipe uit aan de hand van drie voorbeelden.
#Bespreek structuur en werking van de hypofyse. Welke hormonen zijn aanwezig in de hypofyse?
===24 juni 2011===
#Termen:
##Protonefridia
##regressieve evolutie
##Pseudocoeloom
##Dauer
##oncosfeer
#Verbinden:
##spicula, proglottiden, Clitellum, lofofoor, endocuticula, choanen, lijmcellen, rhopalia
##Ctenophora, Cestoda, Ectoprocta, Arthropoda, porifera, Sarcopterygii, Cnidaria, oligochaeta
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#welke hormonen reguleren het mannelijk voortplantingsstelsel (bij de mens)?
===23 juni 2011===
#Termen:
##Planula
##Cephalisatie
##Enterocoel
##Ecdysis
##RNA interference
#Verbinden: Parapodia, Spiraalplooi, antennae, scolex, choanen, lofofoor, lijmcellen,osculum
#Bespreek de evolutie van de mens (bondig)
#Bespreek de structuur van een lichaamsspier en de contractie er van 5. Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel
===21 juni 2011===
#Termen:
##Gemmula
##Adaptieve radiatie
##Eutelie
##Rhopalia ï‚§
#Verbinden:
##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum
##Aves, Osteichthyes, Chelicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea
#Bespreek bioluminiscentie.
#Hoe wordt de glucoseconcentratie in het plasma gereguleerd. 5. Bespreek de hormonen bij de menselijke voortplantingscyclus.
===21 juni 2010 NM===
#Termen:
##Regeneratie
##Protonefridia
##Scolex
##Corpora allata
#Verbinden:
##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum
##Aves, Osteichthyes, Chicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea
#Wat weet je over de evolutie van de mens. Bespreek bondig.
#Bespreek hartcyclus en bloedsomloop (bij zoogdieren) en de regulatie daarvan.
#Illustreer aan de hand van een voorbeeld het belang van het tegenstroomprincipe bij uitwisselingsprocessen.
===21 juni 2010 VM===
#Termen:
##Pseudocoeloom
##Clitellum
##Dauer
##Endostyl
##Corpora cardiata
#Verbinden:
##Antennae, Osculum, Spiraalplooi, Choanen, Parapodia, Scolex, Lijmcellen, Lofofoor
##Ctenophora, Ectoprocta, Cestoda, Porifera, Sarcopterygii, Condrichtyes, Crustacea, Polychaeta
#Schets de levenscyclus van Schistosoma.
#Vergelijk 3 types spierweefsel en leg het mechanisme van contractie uit. 5. Bespreek de hormonale regulatie van de menstruele cyclus.
===18 juni 2010===
#woordjes:
##adaptieve radiatie ï‚§ ascon
##nematocyst
##eutelie
##lofofoor
#verbinden: spicula (porifera), ambulacra (echinodermata), antennae (insecta), melkklieren (mammalia), rhopalia (cnidaria), proglottiden (cestoda), pseudocoel (nematoda), clitellum (huridinae)
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#vergelijken van osmoregulatie bij zout- en zoetwatervissen 5. principe van impulsgeleiding in zenuwcellen
===15 juni 2006===
#woordjes:
##regressieve evolutie
##mimicry
##filariasis
##ecdysis
##parthenogenese
#verbinden: radula (gastropoda), ambulacra (echinodermata), antennae (arthropoda), cloeidisch ei (reptilia), gemmulae (porifera), mesogloea (cnidaria), parapodium (polychaeta), lofofoor (brachiopoda)
#principe van bioluminiscentie in victoria aequorine uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#geef functie, structuur en regulatie van de hypofyse + welke hormonen komen erbij voor

Structurele en Fysiologische Biologie

2019-08-21T11:34:31Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen PLANT */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Eerstejaarsvak enkel aan biochemici en schakelstudenten gegeven, bestaat uit een deel plantkunde (Wim Van den Ende) en een deel dierkunde (Jozef Vanden Broeck). Deze delen hebben op dezelfde dag een examen, het ene mondeling en het andere schriftelijk, onbekend op voorhand dewelke mondeling en dewelke schriftelijk is. Beide examens hebben al jarenlang dezelfde opbouw van type vragen.

==Examenvragen PLANT==

===21 augustus 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek in detail een drietal manieren waarop planten ATP kunnen maken.
# Situeer bondig de termen "gespvormig" en "CRISPR/CAS"
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===28 januari 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek in detail een drietal manieren waarop planten ATP kunnen maken.
# Situeer bondig de termen "gespvormig" en "CRISPR/CAS"
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===14 januari 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# waterpotentiaal en zijn twee componenten
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===14 januari 2019 NM===
# 8 meerkeuzevragen
# Geef 3 manieren waarop planten ATP synthetiseren (glycolyse, ademhaling, Kreb cyclus, ...)
# Leg bondig uit: CRISPR/Cas en CAM planten
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===31 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek de evolutie & metabole diversiteit van prokaryoten en het ontstaan van de eukaryoten.
# Leg bondig uit: het ontstaan van hexaploïde tarwe, mechanisme voor de bloei van lange en korte dag planten.
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===30 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Waterpotentiaal en zijn 2 componenten
# SAR
# Massastroming
# Cyclus van bedektzadigen aanvullen. Is deze plant haplont, diplont of diplohaplont en beargumenteer.
===15 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Geef 3 manieren waarop een plant ATP aanmaakt en leg gedetailleerd uit
# Hypersensitieve respons en CAM planten bondig uitleggen
# Cyclus bedektzadigen aanvullen. Is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===21 aug 2017 NM===
#meerkeuzevragen
#Geef 3 manieren waarop een plant ATP aanmaakt en leg gedetailleerd uit
#gespvorming en CAM planten bondig uitleggen
#cyclus bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont? beargumenteer

===21 aug 2017 VM===
#meerkeuzevragen
#plantenhormonen met werking geven + uitleggen hoe hormoonsysteem in planten werkt
#guttatie en waterpotentiaal bondig uitleggen
#cyclus bedektzadigen aanvullen

===31 jan 2017===
#Meerkeuzevragen
#Waterpotentiaal met zijn 2 componenten uitleggen. Wat gebeurt er als je opgeloste stoffen toevoegt aan het omgevings water?
#Massastroming en SAR uitleggen.
#Cyclus van bedektzadigen aanvullen.

===26 jan 2016===
#8 meerkeuze vragen
#Mondelinge hoofdvraag: hoe wordt sucrose gevormd, hoe komt het in cortexe cellen van de wortels en wat is de bijdrage voor de accumulatie van K+
#Bijvraag: leg chemiosmose en fotorespiratie uit
#Bijvraag: cyclus aanvullen van de bedektzadigen

===30 jan 2014 nm===
#Meerkeuze
#Welke hormonen zijn er bij planten, welke staan in voor apicale dominantie en hoe werkt dit.
#Leg uit hoe herbicide resistentie werkt en leg het mechanisme van glyfosaat uit. Levenscyclus.

===29 jan 2014 nm===
#Meerkeuze
#Bespreek de diversiteit van fungi en geef de levenscyclus van een ascomyceet.
#Bespreek de rol van mieren in commensalisme en de overdracht van parasieten.
#Levenscyclus van varens.
===28 jan 2014 nm===
#8 meerkeuzevragen (4 punten)
#Bespreek de huidige wereldproblemen en geef aan hoe plantenbiotechnologie/biologie zou kunnen bijdragen tot het aanreiken van van oplossingen (8 punten)
#Vul aan en verklaar dit ecologisch model (Bottom-up effect). Hoe kon dit model op experimentele wijze geverifieerd worden? (3 punten)
#Levenscyclus bedektzadige aanvullen (5 punten)
===28 jan 2014 vm===
#Meerkeuze
#Plantenhormonen welke types? regulatie? welke komen voor bij apicale dominantie? Regulatie? Werking?
#Levenscyclus bladmossen
#Tekening van de muis, mier, plant, zaad (interacties verklaren)
===27 jan 2014===
# 8 meerkeuzevragen.
#Bespreek de diversiteit en evolutie van prokaryoten en het onstaan van eukaryoten.
# Figuur uitleggen over bottom-upeffecten en ontbrekende termen aanvllen.
#Foto van doorsnede monocotyl blad: wat is het + delen benoemen.
===13 jan 2014===
# 5 meerkeuzevragen.
#Aanvullen van termen en processen (mitose/meiose) bij de levenscyvlus van gymnospermen. (Letterlijk uit het handboek fig. 31.12 p609)
#Een plantencel in zuiver water en geleidelijk aan zout toevoegen, wat gebeurt er? Leg uit a.d.h.v. een duidelijke grafiek.
#Wat is een preprofaseband? (en nog een term ?? uitleggen)
===23 jan 2012===
#Leg uit wat er zal gebeuren bij een plantencel in zuiver water en wat als je opgeloste stoffen toevoegt aan de omgeving. Maak een schema aan de hand van de waterpotentiaal en zijn 2 subcomponenten en leg uit hoe deze veranderen.
#Leg uit fotorespiratie: hoe wat waarom waar.
#Situeer:
##glyphosaat
##methanogeen
##guttatie
##Mycorrhiza
#Levenscyclus. Aangeven om welke levenscyclus het ging (bladmossen) en beargumenteren. Structuren en processen aanvullen op tekening. Aangeven of het een haplonte, diplonte of haplodiplonte levenscyclys was.
===1 feb 2011 VM===
#Volledige weg beschrijven die een C-atoom aflegt als CO2 indien ingebouwd in pectine in de celwand van rhizodermiscellen. Waaruit bestaat de celwand en wat is de functie?
#Bespreek in detail de signaalgeving en metabolische wegen van Rhizobium in symbiose met een plant.
#. Figuur: levenscyclus bedektzadigen
#Situeer:
##hexaploÃ¯die by tarwe
##cavitatieï‚§
##gespvorming by Basidiomyceten ï‚§ induceerbare mutaties
===27 jan 2011 NM===
#Volledige weg beschrijven die een N-atoom aflegt van de bodem tot inbouw als glycoproteÃ¯ne in een bladepidermiscel
#Vgl mossen en angiospermen. Zeggen hoe deze zijn aangepast aan leven op het land
#Figuur:
##structuur van een blad met huidmondjes
##hetzelfde -.-
#Situeer:
##allotetraploÃ¯die
##guttatie
##sterke vs zwakke sinks
##bespreek metabolisme Archaea

===24 jan 2011 NM===
#De waterpotentiaal en de 2 componenten ervan bespreken als we een cel in zuiver water hebben en daar geleidelijk aan zout aan toevoegen. Schematisch weergeven en stap voor stap bespreken wat er met de cel gebeurt.
#Het verschil tussen gametofytische en sporofytische incompatibiliteit uitleggen. En een model geven voor gametofytische incompatibiliteit.
#Figuur:
##Doorsnede monocotyle stengel
##Vaatbundel en daarop floeem,
##xyleem en vezelschede benoemen
#Situeer:
##Endosymbiose
##ViroÃ¯den
##Soortkruisingen
##Lenticel
===24 jan 2011 VM===
#Bespreek structuur, samenstelling, functie en oorsprong van de plantencelwand.
#Bespreek de verschillen tussen C3, C4 en CAM
#Figuur: monokotyle stengel met vaatbundel
#Situeer:
##hydrogenosoom
##Agrobacterium tumefaciens
##massastroming (Munch hypothese)
##terminatortechnologie
===25 jan 2010 VM===
#Teken een dwarsdoorsnede van een wortel van een monokotyle plant. Wat is het verschil met een dikotyle plant?
#Bespreek (fysiologisch en chemisch) de weg die een CO2 molecule aflegt vanuit de lucht om ingebouwd de worden in de celwand van een
rhizodermiscel.
#Vergelijk CO2 fixatie bij C3 en C4 planten. Wat zijn de ethiologische implicaties?
#ABC van de bloemetjes
#Situeer:
#Soortkruising
#Isospore haplodiplont
#Worteldruk
#Basidiomyceten
#ï‚§Archebacteria
===18 jan 2010 NM===
#Bespreek de mogelijkheden voor overdracht van genetische informatie tussen individuen die tot een andere soort behoren.
#Vul volgende figuur aan en bespreek (die van potentiaal, niet met de kleurtjes, degene die ook in de cursus staat).
#Vergelijk CO2 fixatie bij CAM en C4 planten. 4. ABC van de bloemen.
#Situeer en bespreek:
##ascomyceten,
##heterospore haplodiplonten
##3 figuren: (een stengel ==> figuur helemaal onderaan rechts in voorbeeldvragen, een blad ==> die gele figuur zo :p en een wortel ==> laatste blz, rechts bovenaan)
===18 jan 2010 VM===
#Bespreek autotrofie bij prokaryoten en eukaryoten.
#Gametofytische incompatibiliteit.
#Fotorespiratie: wat, waar, hoe, waarom?
#Vul aan en bespreek zodat duidelijk wordt of het om een haplont, diplont of haplodiplont organisme gaat. Is dit type organisme al goed aangepast aan het landleven? (figuur van varens, zie voorbeeldvragen)
#Situeer en bespreek:
##3 figuren (monokotyl blad, dikotyle verdikte stengel, monokotyle vaatbundel),
##agrobacterium tumefaciens
##basidiomyceten.
===26 jan 2009===
#Plantencelwand: Samenstelling? Structuur? Functie? Oorsprong?
#Transport in planten: Hoe? Waar? Waarom?
#C4 en CAM planten: Wat? Waarom? Hoe? Verschil?
#Afbeelding van een diplohaplonte cyclus, en zeggen of deze plant al goed
is aangepast aan het leven op het land.
#Termen:
##Soortkruising
##Agrobacterium Tumefaciens
##Zelfincompatibiliteit
##Het ABC van de bloemetjes
##Fotoke van dwarse doorsnede van een plantenstengel, zeggen wa ge ziet en van die dinge..
===19 jan 2009===
#voortplantingscyclus (mos)
#bespreek zo goed mogelijk de opnamen van N uit nitraat (chemisch/fysisch) en inbouw in celwandprotÃ«ine epidermiscel 3. teken primaire stengel dikotyle plant + verschil monokotyle
#fotorespiratie: zin of onzin.
#Termen:
##gametofytische zelfincompabiliteit
##ABC van bloemen
##worteldruk
##retrovirussen
===28 jan 2008===
#vergelijk autotrofie bij eukaryoten en prokaryoten
#fotorespiratie
#zelf-incompabiliteit
#cyclus van varen aanvullen + aangepassingen aan het land
#Situeer:
##drie foto's
##Agrobacterium tumefaciens
##Basidiomyceet
===28 jan 2008===
#primaire dikotyle wortel tekenen en bespreken, vergelijken met monokotyle
#Welke fysische en chemische weg moet het N-atoom van NH4+ afleggen
om ingebouwd te kunnen worden in een celwandproteÃ¯ne van een blad
#Grafieken van CO2-opname van C3 en C4 planten. Zelf assen invullen en c3 en c4 aanduiden + uitleggen waarom
#Welke aanpassingen moet een landplant hebben ten opzichte van een wier
om te kunnen overleven op het land en is dit bij alle zo
#Bespreek:
##ascomyceten
##retrotransposons
##archeaebacteriÃ«n
##zelfincomptabiliteit
===21 jan 2008===
#Hoe genetische informatie overbrengen tussen individuen van verschillende soorten denk ik
#Bespreek en vul aan die figuur van de waterpotentiaal in een cel
#leg uit hoe CO2 wordt gefixeerd bij C4 planten en CAM planten en vergelijk
#geef een schematische voorstelling en een voorbeeld van een heterospore haplodiplont cyclus
#Situeer:
##Ascomyceten
##zelfincompatibiliteit
## 3 foto'kes ( stengel, wortel en blad)
===18 jan 2008===
#teken structuur monocotyle wortel, vgl met dicotyle
#bespreek fixatie co2 bij C4-C3 planten, ahv voor en nadelen
#voortplantingscyclus (van ascomyceten, was wel niet gegeven da het over asco ging ) aanvullen en uitleggen waarom het haplont/diplont/diplohaplont is
#bespreek hoe C via co2 kan ingebouwd worden in de rizodhermiscellen (
zowel fysich als chemisch )
#Situeer en bespreek:
##worteldruk
##basidiomyceten
##archeaebacteriÃ«n
##soortbestuiving
##retrovirussen
===14 jan 2008===
#Celwand: Samenstelling? Functie? Oorsprong? Structuur?
#Vergelijk het transport van mineralen en het transport van
fotosyntheseproducten
#Je gaat op excursie om C3/C4/CAM planten te inventariseren. Wat voor
materiaal neem je mee en leg uit.
#Tekening van een voortplantingscyclus: Is dit haplont/diplont/haplodiplont? Leg uit en geef aan of en hoe deze plant aan het landleven aangepast is.
#Situeer en bespreek:
##Zelfincopatibiliteit
##Agrobacterium tumefaciens
##3 tekeningen (doorsneden van stengel/wortel)
===2 feb 2007===
#twee grafieken zonder aanduidingen "vul aan en verklaar"
#genetische overdracht tussen individuen van dezelfde soort en verschillende soorten, leg uit
===15 jan 2007===
#Vul volgende grafiek aan en bespreek (die van de waterpotentiaal van de omgeving t o v die in de plantencel) en hoe zit dit in 't xyleem?
#Fotorespiratie: wat? waar? hoe? waarom?
#Situeer:
##lenticellen
##heterospore
##haplodiplonten
##zygomyceten
##endodermis
##gametofytische incompatibiliteit
##agrobacterium tumefaciens

==Examenvragen DIER==

===28 januari 2019 VM===
# Verklaar volgende begrippen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
# Verbind volgende begrippen en verklaar bondig:
## parapodia, radula, buisjes van Malphigi, pseudocoel, clitellum, cleidoïsch ei, ambulacra, choanocyten.
## Oligochaeta, Reptilia, Echinodermata, Porifera, Polychaeta, Nematoda, Insecta, Gastropoda
# Bespreek de rol van de maag en het duodenum in de spijvertering. Welke hormonen worden daar lokaal vrijgesteld en wat is hun rol?
# Bespreek de hartcyclus en bloedsomloop en de regulatie van de bloeddruk.

===14 januari 2019 VM===
# Begrippen verklaren: parthenogenese, eutelie, monocyt
# Termen verbinden idem vorige jaren
# Skeletspier structuur en hoe werkt deze
# Glucosegehalte in plasma en regulerende hormonen

===14 januari 2019 NM===
#Begrippen verklaren: gemmula, radula, planula
#Termen verbinden en kort de functie geven ervan: ambulacra (Echinodermata), mesoglea (Cnidaria), lofofoor (Branchiopoda), proglottiden (Cestoda), clitellum (Huridinae), corpus alata (Insecta), choanen, endostyl
# Leg de werking van bioluminescentie uit bij Aequorea victoria.
#Leg de menstruatiecyclus uit adhv de hormonen

===31 januari 2018 VM===
# Verklaar volgende begrippen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
# Verbind volgende begrippen en verklaar bondig: parapodia, radula, buisjes van Malphigi, pseudocoel, clitellum, cleidoïsch ei, ambulacra, choanocyten.
# Bespreek de rol van de maag en het duodenum in de spijvertering. Welke hormonen worden hier geproduceerd en wat is hun rol?
# Bespreek de hartcyclus en bloedsomloop en de regulatie van de bloeddruk.

===30 januari 2018 VM===
#Begrippen verklaren: Ambulacra, Thrombocyt, Mimicry
#Termen verbinden en kort de functie geven ervan: zie vorige jaren
#Osmoregulatie van zoetwater- en zoutwater vissen
#Geef de werking en structuur van het binnenoor.

===15 januari 2018 VM ===
# Begrippen verklaren: gemmulae, radula en parthenogenese.
# Verbinden: exact dezelfde begrippen als vorige jaren.
# Leg de werking van bioluminescentie uit bij Aequorea victoria.
# Geef de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.

===21 aug 2017 NM===
#Begrippen verklaren: Parafyletisch, Parthogenese, Eutelie
#Verbinden: exact dezelfde begrippen als vorige jaren
#Geen 3 bestrijdingsstrategiën tegen een insecten plaagsoort en leg uit
#Leg de menstruatiecyclus uit adhv de hormonen

===21 aug 2017 VM===
#verklaar: blastula, monocyt, convergete evolutie
#verbind, ongeveer zelfde begrippen als vorige jaren + zweetklier (mammalia), zijlijn (osteichthyes)
#Samenstelling van een spier + werking contractie
#hoe wordt het glucose gehalte in het bloed gereguleerd, welke hormonen werken hierbij en waar worden ze gemaakt
===31 jan 2017===
#Verklaar: dauer, ecdysis en filariasis.
#Verbind, zelfde begrippen als voorgaande jaren.
#Vergelijk zuurstof opname bij zoogdieren en insecten.
#Hoe werkt het doorgeven van zenuwimpulsen?

===26 januari 2016===
#Termen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
#Verbinden
#Uitleggen: 3 voorbeelden van tegenstroomprincipe en impulsgeleiding

===20 aug 2014===
#Begrippen:
##adaptieve radiatie
##gremmula
##eutelie
#Verbind:
##preenklier - spiraalplooi - pedipalpen - mesogloea - corpus alata - ambulacra - radula - citellum
##cnidaria - insecta - echinodermata - gestropoda - chondrichtys - hirunae - aves - chelicerata
#Geef het mechanisme van de bioluminescentie bij aquora victoria
#Bespreek de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.
===30 jan 2014===
#Begrippen :
##Metanefridium
##Regeneratie
##Clitellum
#Verbinden: mesogloea, speenklier, kieuwdeksel, pedipalp, ambulacra, corpora allata, spiraalplooi, radula
#Leg de menstruatiecyclus uit en geef 3 voorbeelden van tegenstrooomprincipe
===29 jan 2014 NM===
#Begrippen:
##Filiarsis
##Mimicry
##Corpora cardiaca
#Verbinden: termen van de vorig jaren.
#Leg de werking van longen en tracheÃ«n uit en vergelijk. Vergelijk
osmoregulatie bij zoet-en zoutwatervissen.
===28 jan 2014 NM===
#Termen:
##Lofofoor
##Adaptieve radiatie
##Protonefridium
#Verbind: parapodia(polychaeta), radula(Gastropoda), Antennae(Arthropoda), Mesogloea(cnidaria), clitellum(Oligochaeta), CleidoÃ¯sche ei(Reptilia), Ambulacra(Echinodermata), Gemmulae(Porifera)
#Illustreer aan de hand van drie voorbeelden het belang van het tegenstroomprincipe en leg uit.
#Leg het mechanisme uit van de elektrische impulsgeleiding door zenuwcellen.
===28 jan 2014 VM===
#Begrippen:
##Gemmula
##Radula
##Corpora allata
#Verbinden: termen van de vorig jaren.
#Bespreken en vergelijken het mechanisme van gasuitwisseling bij longen zoogdieren en vogels
#Welke hormonen worden gevormd in de gonaden bij de mens en regulatie.
===27 jan 2014===
#Termen:
##Planula
##RNA interference
##Eutelie
#Verbinden, opnieuw combinaite die hieronder al staat
#Bespreek de structuur en het contractiemechanisme van skeletspieren.
#Wat zijn de belangrijkste hormonen die door de schildklier geproduceerd worden en hoe worden ze gereguleerd?
===13 jan 2012===
#Leg uit:
##Gremule
##Eutelie
##Amnion
#Verbindt Latijnse namen met Latijnse namen. (letterlijk als in het voorbeeld examen)
#Leg bondig uit: Skeletspier (structuur, werking en regulatie)
#Welke hormonen spelen welke rol in de vrouwelijke voortplantingscycus?
===25 juni 2012===
#Termen:
##Nematocyst ï‚§?
##Metamorfose ï‚§ Lolofoo
##Amnion
#Verbinden (Combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)
#Bespreek en vergelijk drie types spierweefsel bij dieren.
#Bespreek rol van gal en pancreas in de spijsvertering (in invertebraten). 5. Bespreek de regulatie van hartcyclus en bloeddruk (in zoogdieren).
===22 juni 2012===
#Termen:
##Protonefridia
##Ecdysis
##Parthenogenese
##Mimicry
##Filariasis
#Verbinden ( was combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel
===19 juni 2012===
#Termen:
##Feromoon
##Dauer
##Regressieve evolutie
##Endostyl ï‚§
#Verbinden. Allemaal termen uit de vragen van vorige jaren.
#Geef de levenscyclus van de runderlintworm en bespreek.
#Leg het tegenstroomprincipe uit aan de hand van drie voorbeelden.
#Bespreek structuur en werking van de hypofyse. Welke hormonen zijn aanwezig in de hypofyse?
===24 juni 2011===
#Termen:
##Protonefridia
##regressieve evolutie
##Pseudocoeloom
##Dauer
##oncosfeer
#Verbinden:
##spicula, proglottiden, Clitellum, lofofoor, endocuticula, choanen, lijmcellen, rhopalia
##Ctenophora, Cestoda, Ectoprocta, Arthropoda, porifera, Sarcopterygii, Cnidaria, oligochaeta
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#welke hormonen reguleren het mannelijk voortplantingsstelsel (bij de mens)?
===23 juni 2011===
#Termen:
##Planula
##Cephalisatie
##Enterocoel
##Ecdysis
##RNA interference
#Verbinden: Parapodia, Spiraalplooi, antennae, scolex, choanen, lofofoor, lijmcellen,osculum
#Bespreek de evolutie van de mens (bondig)
#Bespreek de structuur van een lichaamsspier en de contractie er van 5. Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel
===21 juni 2011===
#Termen:
##Gemmula
##Adaptieve radiatie
##Eutelie
##Rhopalia ï‚§
#Verbinden:
##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum
##Aves, Osteichthyes, Chelicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea
#Bespreek bioluminiscentie.
#Hoe wordt de glucoseconcentratie in het plasma gereguleerd. 5. Bespreek de hormonen bij de menselijke voortplantingscyclus.
===21 juni 2010 NM===
#Termen:
##Regeneratie
##Protonefridia
##Scolex
##Corpora allata
#Verbinden:
##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum
##Aves, Osteichthyes, Chicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea
#Wat weet je over de evolutie van de mens. Bespreek bondig.
#Bespreek hartcyclus en bloedsomloop (bij zoogdieren) en de regulatie daarvan.
#Illustreer aan de hand van een voorbeeld het belang van het tegenstroomprincipe bij uitwisselingsprocessen.
===21 juni 2010 VM===
#Termen:
##Pseudocoeloom
##Clitellum
##Dauer
##Endostyl
##Corpora cardiata
#Verbinden:
##Antennae, Osculum, Spiraalplooi, Choanen, Parapodia, Scolex, Lijmcellen, Lofofoor
##Ctenophora, Ectoprocta, Cestoda, Porifera, Sarcopterygii, Condrichtyes, Crustacea, Polychaeta
#Schets de levenscyclus van Schistosoma.
#Vergelijk 3 types spierweefsel en leg het mechanisme van contractie uit. 5. Bespreek de hormonale regulatie van de menstruele cyclus.
===18 juni 2010===
#woordjes:
##adaptieve radiatie ï‚§ ascon
##nematocyst
##eutelie
##lofofoor
#verbinden: spicula (porifera), ambulacra (echinodermata), antennae (insecta), melkklieren (mammalia), rhopalia (cnidaria), proglottiden (cestoda), pseudocoel (nematoda), clitellum (huridinae)
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#vergelijken van osmoregulatie bij zout- en zoetwatervissen 5. principe van impulsgeleiding in zenuwcellen
===15 juni 2006===
#woordjes:
##regressieve evolutie
##mimicry
##filariasis
##ecdysis
##parthenogenese
#verbinden: radula (gastropoda), ambulacra (echinodermata), antennae (arthropoda), cloeidisch ei (reptilia), gemmulae (porifera), mesogloea (cnidaria), parapodium (polychaeta), lofofoor (brachiopoda)
#principe van bioluminiscentie in victoria aequorine uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#geef functie, structuur en regulatie van de hypofyse + welke hormonen komen erbij voor

Structurele en Fysiologische Biologie

2019-08-17T08:44:33Z

Elisevanvyve: /* 30 jan 2014 nm */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Eerstejaarsvak enkel aan biochemici en schakelstudenten gegeven, bestaat uit een deel plantkunde (Wim Van den Ende) en een deel dierkunde (Jozef Vanden Broeck). Deze delen hebben op dezelfde dag een examen, het ene mondeling en het andere schriftelijk, onbekend op voorhand dewelke mondeling en dewelke schriftelijk is. Beide examens hebben al jarenlang dezelfde opbouw van type vragen.

==Examenvragen PLANT==

===28 januari 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek in detail een drietal manieren waarop planten ATP kunnen maken.
# Situeer bondig de termen "gespvormig" en "CRISPR/CAS"
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===14 januari 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# waterpotentiaal en zijn twee componenten
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===14 januari 2019 NM===
# 8 meerkeuzevragen
# Geef 3 manieren waarop planten ATP synthetiseren (glycolyse, ademhaling, Kreb cyclus, ...)
# Leg bondig uit: CRISPR/Cas en CAM planten
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===31 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek de evolutie & metabole diversiteit van prokaryoten en het ontstaan van de eukaryoten.
# Leg bondig uit: het ontstaan van hexaploïde tarwe, mechanisme voor de bloei van lange en korte dag planten.
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===30 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Waterpotentiaal en zijn 2 componenten
# SAR
# Massastroming
# Cyclus van bedektzadigen aanvullen. Is deze plant haplont, diplont of diplohaplont en beargumenteer.
===15 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Geef 3 manieren waarop een plant ATP aanmaakt en leg gedetailleerd uit
# Hypersensitieve respons en CAM planten bondig uitleggen
# Cyclus bedektzadigen aanvullen. Is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===21 aug 2017 NM===
#meerkeuzevragen
#Geef 3 manieren waarop een plant ATP aanmaakt en leg gedetailleerd uit
#gespvorming en CAM planten bondig uitleggen
#cyclus bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont? beargumenteer

===21 aug 2017 VM===
#meerkeuzevragen
#plantenhormonen met werking geven + uitleggen hoe hormoonsysteem in planten werkt
#guttatie en waterpotentiaal bondig uitleggen
#cyclus bedektzadigen aanvullen

===31 jan 2017===
#Meerkeuzevragen
#Waterpotentiaal met zijn 2 componenten uitleggen. Wat gebeurt er als je opgeloste stoffen toevoegt aan het omgevings water?
#Massastroming en SAR uitleggen.
#Cyclus van bedektzadigen aanvullen.

===26 jan 2016===
#8 meerkeuze vragen
#Mondelinge hoofdvraag: hoe wordt sucrose gevormd, hoe komt het in cortexe cellen van de wortels en wat is de bijdrage voor de accumulatie van K+
#Bijvraag: leg chemiosmose en fotorespiratie uit
#Bijvraag: cyclus aanvullen van de bedektzadigen

===30 jan 2014 nm===
#Meerkeuze
#Welke hormonen zijn er bij planten, welke staan in voor apicale dominantie en hoe werkt dit.
#Leg uit hoe herbicide resistentie werkt en leg het mechanisme van glyfosaat uit. Levenscyclus.

===29 jan 2014 nm===
#Meerkeuze
#Bespreek de diversiteit van fungi en geef de levenscyclus van een ascomyceet.
#Bespreek de rol van mieren in commensalisme en de overdracht van parasieten.
#Levenscyclus van varens.
===28 jan 2014 nm===
#8 meerkeuzevragen (4 punten)
#Bespreek de huidige wereldproblemen en geef aan hoe plantenbiotechnologie/biologie zou kunnen bijdragen tot het aanreiken van van oplossingen (8 punten)
#Vul aan en verklaar dit ecologisch model (Bottom-up effect). Hoe kon dit model op experimentele wijze geverifieerd worden? (3 punten)
#Levenscyclus bedektzadige aanvullen (5 punten)
===28 jan 2014 vm===
#Meerkeuze
#Plantenhormonen welke types? regulatie? welke komen voor bij apicale dominantie? Regulatie? Werking?
#Levenscyclus bladmossen
#Tekening van de muis, mier, plant, zaad (interacties verklaren)
===27 jan 2014===
# 8 meerkeuzevragen.
#Bespreek de diversiteit en evolutie van prokaryoten en het onstaan van eukaryoten.
# Figuur uitleggen over bottom-upeffecten en ontbrekende termen aanvllen.
#Foto van doorsnede monocotyl blad: wat is het + delen benoemen.
===13 jan 2014===
# 5 meerkeuzevragen.
#Aanvullen van termen en processen (mitose/meiose) bij de levenscyvlus van gymnospermen. (Letterlijk uit het handboek fig. 31.12 p609)
#Een plantencel in zuiver water en geleidelijk aan zout toevoegen, wat gebeurt er? Leg uit a.d.h.v. een duidelijke grafiek.
#Wat is een preprofaseband? (en nog een term ?? uitleggen)
===23 jan 2012===
#Leg uit wat er zal gebeuren bij een plantencel in zuiver water en wat als je opgeloste stoffen toevoegt aan de omgeving. Maak een schema aan de hand van de waterpotentiaal en zijn 2 subcomponenten en leg uit hoe deze veranderen.
#Leg uit fotorespiratie: hoe wat waarom waar.
#Situeer:
##glyphosaat
##methanogeen
##guttatie
##Mycorrhiza
#Levenscyclus. Aangeven om welke levenscyclus het ging (bladmossen) en beargumenteren. Structuren en processen aanvullen op tekening. Aangeven of het een haplonte, diplonte of haplodiplonte levenscyclys was.
===1 feb 2011 VM===
#Volledige weg beschrijven die een C-atoom aflegt als CO2 indien ingebouwd in pectine in de celwand van rhizodermiscellen. Waaruit bestaat de celwand en wat is de functie?
#Bespreek in detail de signaalgeving en metabolische wegen van Rhizobium in symbiose met een plant.
#. Figuur: levenscyclus bedektzadigen
#Situeer:
##hexaploÃ¯die by tarwe
##cavitatieï‚§
##gespvorming by Basidiomyceten ï‚§ induceerbare mutaties
===27 jan 2011 NM===
#Volledige weg beschrijven die een N-atoom aflegt van de bodem tot inbouw als glycoproteÃ¯ne in een bladepidermiscel
#Vgl mossen en angiospermen. Zeggen hoe deze zijn aangepast aan leven op het land
#Figuur:
##structuur van een blad met huidmondjes
##hetzelfde -.-
#Situeer:
##allotetraploÃ¯die
##guttatie
##sterke vs zwakke sinks
##bespreek metabolisme Archaea

===24 jan 2011 NM===
#De waterpotentiaal en de 2 componenten ervan bespreken als we een cel in zuiver water hebben en daar geleidelijk aan zout aan toevoegen. Schematisch weergeven en stap voor stap bespreken wat er met de cel gebeurt.
#Het verschil tussen gametofytische en sporofytische incompatibiliteit uitleggen. En een model geven voor gametofytische incompatibiliteit.
#Figuur:
##Doorsnede monocotyle stengel
##Vaatbundel en daarop floeem,
##xyleem en vezelschede benoemen
#Situeer:
##Endosymbiose
##ViroÃ¯den
##Soortkruisingen
##Lenticel
===24 jan 2011 VM===
#Bespreek structuur, samenstelling, functie en oorsprong van de plantencelwand.
#Bespreek de verschillen tussen C3, C4 en CAM
#Figuur: monokotyle stengel met vaatbundel
#Situeer:
##hydrogenosoom
##Agrobacterium tumefaciens
##massastroming (Munch hypothese)
##terminatortechnologie
===25 jan 2010 VM===
#Teken een dwarsdoorsnede van een wortel van een monokotyle plant. Wat is het verschil met een dikotyle plant?
#Bespreek (fysiologisch en chemisch) de weg die een CO2 molecule aflegt vanuit de lucht om ingebouwd de worden in de celwand van een
rhizodermiscel.
#Vergelijk CO2 fixatie bij C3 en C4 planten. Wat zijn de ethiologische implicaties?
#ABC van de bloemetjes
#Situeer:
#Soortkruising
#Isospore haplodiplont
#Worteldruk
#Basidiomyceten
#ï‚§Archebacteria
===18 jan 2010 NM===
#Bespreek de mogelijkheden voor overdracht van genetische informatie tussen individuen die tot een andere soort behoren.
#Vul volgende figuur aan en bespreek (die van potentiaal, niet met de kleurtjes, degene die ook in de cursus staat).
#Vergelijk CO2 fixatie bij CAM en C4 planten. 4. ABC van de bloemen.
#Situeer en bespreek:
##ascomyceten,
##heterospore haplodiplonten
##3 figuren: (een stengel ==> figuur helemaal onderaan rechts in voorbeeldvragen, een blad ==> die gele figuur zo :p en een wortel ==> laatste blz, rechts bovenaan)
===18 jan 2010 VM===
#Bespreek autotrofie bij prokaryoten en eukaryoten.
#Gametofytische incompatibiliteit.
#Fotorespiratie: wat, waar, hoe, waarom?
#Vul aan en bespreek zodat duidelijk wordt of het om een haplont, diplont of haplodiplont organisme gaat. Is dit type organisme al goed aangepast aan het landleven? (figuur van varens, zie voorbeeldvragen)
#Situeer en bespreek:
##3 figuren (monokotyl blad, dikotyle verdikte stengel, monokotyle vaatbundel),
##agrobacterium tumefaciens
##basidiomyceten.
===26 jan 2009===
#Plantencelwand: Samenstelling? Structuur? Functie? Oorsprong?
#Transport in planten: Hoe? Waar? Waarom?
#C4 en CAM planten: Wat? Waarom? Hoe? Verschil?
#Afbeelding van een diplohaplonte cyclus, en zeggen of deze plant al goed
is aangepast aan het leven op het land.
#Termen:
##Soortkruising
##Agrobacterium Tumefaciens
##Zelfincompatibiliteit
##Het ABC van de bloemetjes
##Fotoke van dwarse doorsnede van een plantenstengel, zeggen wa ge ziet en van die dinge..
===19 jan 2009===
#voortplantingscyclus (mos)
#bespreek zo goed mogelijk de opnamen van N uit nitraat (chemisch/fysisch) en inbouw in celwandprotÃ«ine epidermiscel 3. teken primaire stengel dikotyle plant + verschil monokotyle
#fotorespiratie: zin of onzin.
#Termen:
##gametofytische zelfincompabiliteit
##ABC van bloemen
##worteldruk
##retrovirussen
===28 jan 2008===
#vergelijk autotrofie bij eukaryoten en prokaryoten
#fotorespiratie
#zelf-incompabiliteit
#cyclus van varen aanvullen + aangepassingen aan het land
#Situeer:
##drie foto's
##Agrobacterium tumefaciens
##Basidiomyceet
===28 jan 2008===
#primaire dikotyle wortel tekenen en bespreken, vergelijken met monokotyle
#Welke fysische en chemische weg moet het N-atoom van NH4+ afleggen
om ingebouwd te kunnen worden in een celwandproteÃ¯ne van een blad
#Grafieken van CO2-opname van C3 en C4 planten. Zelf assen invullen en c3 en c4 aanduiden + uitleggen waarom
#Welke aanpassingen moet een landplant hebben ten opzichte van een wier
om te kunnen overleven op het land en is dit bij alle zo
#Bespreek:
##ascomyceten
##retrotransposons
##archeaebacteriÃ«n
##zelfincomptabiliteit
===21 jan 2008===
#Hoe genetische informatie overbrengen tussen individuen van verschillende soorten denk ik
#Bespreek en vul aan die figuur van de waterpotentiaal in een cel
#leg uit hoe CO2 wordt gefixeerd bij C4 planten en CAM planten en vergelijk
#geef een schematische voorstelling en een voorbeeld van een heterospore haplodiplont cyclus
#Situeer:
##Ascomyceten
##zelfincompatibiliteit
## 3 foto'kes ( stengel, wortel en blad)
===18 jan 2008===
#teken structuur monocotyle wortel, vgl met dicotyle
#bespreek fixatie co2 bij C4-C3 planten, ahv voor en nadelen
#voortplantingscyclus (van ascomyceten, was wel niet gegeven da het over asco ging ) aanvullen en uitleggen waarom het haplont/diplont/diplohaplont is
#bespreek hoe C via co2 kan ingebouwd worden in de rizodhermiscellen (
zowel fysich als chemisch )
#Situeer en bespreek:
##worteldruk
##basidiomyceten
##archeaebacteriÃ«n
##soortbestuiving
##retrovirussen
===14 jan 2008===
#Celwand: Samenstelling? Functie? Oorsprong? Structuur?
#Vergelijk het transport van mineralen en het transport van
fotosyntheseproducten
#Je gaat op excursie om C3/C4/CAM planten te inventariseren. Wat voor
materiaal neem je mee en leg uit.
#Tekening van een voortplantingscyclus: Is dit haplont/diplont/haplodiplont? Leg uit en geef aan of en hoe deze plant aan het landleven aangepast is.
#Situeer en bespreek:
##Zelfincopatibiliteit
##Agrobacterium tumefaciens
##3 tekeningen (doorsneden van stengel/wortel)
===2 feb 2007===
#twee grafieken zonder aanduidingen "vul aan en verklaar"
#genetische overdracht tussen individuen van dezelfde soort en verschillende soorten, leg uit
===15 jan 2007===
#Vul volgende grafiek aan en bespreek (die van de waterpotentiaal van de omgeving t o v die in de plantencel) en hoe zit dit in 't xyleem?
#Fotorespiratie: wat? waar? hoe? waarom?
#Situeer:
##lenticellen
##heterospore
##haplodiplonten
##zygomyceten
##endodermis
##gametofytische incompatibiliteit
##agrobacterium tumefaciens

==Examenvragen DIER==

===28 januari 2019 VM===
# Verklaar volgende begrippen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
# Verbind volgende begrippen en verklaar bondig:
## parapodia, radula, buisjes van Malphigi, pseudocoel, clitellum, cleidoïsch ei, ambulacra, choanocyten.
## Oligochaeta, Reptilia, Echinodermata, Porifera, Polychaeta, Nematoda, Insecta, Gastropoda
# Bespreek de rol van de maag en het duodenum in de spijvertering. Welke hormonen worden daar lokaal vrijgesteld en wat is hun rol?
# Bespreek de hartcyclus en bloedsomloop en de regulatie van de bloeddruk.

===14 januari 2019 VM===
# Begrippen verklaren: parthenogenese, eutelie, monocyt
# Termen verbinden idem vorige jaren
# Skeletspier structuur en hoe werkt deze
# Glucosegehalte in plasma en regulerende hormonen

===14 januari 2019 NM===
#Begrippen verklaren: gemmula, radula, planula
#Termen verbinden en kort de functie geven ervan: ambulacra (Echinodermata), mesoglea (Cnidaria), lofofoor (Branchiopoda), proglottiden (Cestoda), clitellum (Huridinae), corpus alata (Insecta), choanen, endostyl
# Leg de werking van bioluminescentie uit bij Aequorea victoria.
#Leg de menstruatiecyclus uit adhv de hormonen

===31 januari 2018 VM===
# Verklaar volgende begrippen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
# Verbind volgende begrippen en verklaar bondig: parapodia, radula, buisjes van Malphigi, pseudocoel, clitellum, cleidoïsch ei, ambulacra, choanocyten.
# Bespreek de rol van de maag en het duodenum in de spijvertering. Welke hormonen worden hier geproduceerd en wat is hun rol?
# Bespreek de hartcyclus en bloedsomloop en de regulatie van de bloeddruk.

===30 januari 2018 VM===
#Begrippen verklaren: Ambulacra, Thrombocyt, Mimicry
#Termen verbinden en kort de functie geven ervan: zie vorige jaren
#Osmoregulatie van zoetwater- en zoutwater vissen
#Geef de werking en structuur van het binnenoor.

===15 januari 2018 VM ===
# Begrippen verklaren: gemmulae, radula en parthenogenese.
# Verbinden: exact dezelfde begrippen als vorige jaren.
# Leg de werking van bioluminescentie uit bij Aequorea victoria.
# Geef de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.

===21 aug 2017 NM===
#Begrippen verklaren: Parafyletisch, Parthogenese, Eutelie
#Verbinden: exact dezelfde begrippen als vorige jaren
#Geen 3 bestrijdingsstrategiën tegen een insecten plaagsoort en leg uit
#Leg de menstruatiecyclus uit adhv de hormonen

===21 aug 2017 VM===
#verklaar: blastula, monocyt, convergete evolutie
#verbind, ongeveer zelfde begrippen als vorige jaren + zweetklier (mammalia), zijlijn (osteichthyes)
#Samenstelling van een spier + werking contractie
#hoe wordt het glucose gehalte in het bloed gereguleerd, welke hormonen werken hierbij en waar worden ze gemaakt
===31 jan 2017===
#Verklaar: dauer, ecdysis en filariasis.
#Verbind, zelfde begrippen als voorgaande jaren.
#Vergelijk zuurstof opname bij zoogdieren en insecten.
#Hoe werkt het doorgeven van zenuwimpulsen?

===26 januari 2016===
#Termen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
#Verbinden
#Uitleggen: 3 voorbeelden van tegenstroomprincipe en impulsgeleiding

===20 aug 2014===
#Begrippen:
##adaptieve radiatie
##gremmula
##eutelie
#Verbind:
##preenklier - spiraalplooi - pedipalpen - mesogloea - corpus alata - ambulacra - radula - citellum
##cnidaria - insecta - echinodermata - gestropoda - chondrichtys - hirunae - aves - chelicerata
#Geef het mechanisme van de bioluminescentie bij aquora victoria
#Bespreek de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.
===30 jan 2014===
#Begrippen :
##Metanefridium
##Regeneratie
##Clitellum
#Verbinden: mesogloea, speenklier, kieuwdeksel, pedipalp, ambulacra, corpora allata, spiraalplooi, radula
#Leg de menstruatiecyclus uit en geef 3 voorbeelden van tegenstrooomprincipe
===29 jan 2014 NM===
#Begrippen:
##Filiarsis
##Mimicry
##Corpora cardiaca
#Verbinden: termen van de vorig jaren.
#Leg de werking van longen en tracheÃ«n uit en vergelijk. Vergelijk
osmoregulatie bij zoet-en zoutwatervissen.
===28 jan 2014 NM===
#Termen:
##Lofofoor
##Adaptieve radiatie
##Protonefridium
#Verbind: parapodia(polychaeta), radula(Gastropoda), Antennae(Arthropoda), Mesogloea(cnidaria), clitellum(Oligochaeta), CleidoÃ¯sche ei(Reptilia), Ambulacra(Echinodermata), Gemmulae(Porifera)
#Illustreer aan de hand van drie voorbeelden het belang van het tegenstroomprincipe en leg uit.
#Leg het mechanisme uit van de elektrische impulsgeleiding door zenuwcellen.
===28 jan 2014 VM===
#Begrippen:
##Gemmula
##Radula
##Corpora allata
#Verbinden: termen van de vorig jaren.
#Bespreken en vergelijken het mechanisme van gasuitwisseling bij longen zoogdieren en vogels
#Welke hormonen worden gevormd in de gonaden bij de mens en regulatie.
===27 jan 2014===
#Termen:
##Planula
##RNA interference
##Eutelie
#Verbinden, opnieuw combinaite die hieronder al staat
#Bespreek de structuur en het contractiemechanisme van skeletspieren.
#Wat zijn de belangrijkste hormonen die door de schildklier geproduceerd worden en hoe worden ze gereguleerd?
===13 jan 2012===
#Leg uit:
##Gremule
##Eutelie
##Amnion
#Verbindt Latijnse namen met Latijnse namen. (letterlijk als in het voorbeeld examen)
#Leg bondig uit: Skeletspier (structuur, werking en regulatie)
#Welke hormonen spelen welke rol in de vrouwelijke voortplantingscycus?
===25 juni 2012===
#Termen:
##Nematocyst ï‚§?
##Metamorfose ï‚§ Lolofoo
##Amnion
#Verbinden (Combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)
#Bespreek en vergelijk drie types spierweefsel bij dieren.
#Bespreek rol van gal en pancreas in de spijsvertering (in invertebraten). 5. Bespreek de regulatie van hartcyclus en bloeddruk (in zoogdieren).
===22 juni 2012===
#Termen:
##Protonefridia
##Ecdysis
##Parthenogenese
##Mimicry
##Filariasis
#Verbinden ( was combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel
===19 juni 2012===
#Termen:
##Feromoon
##Dauer
##Regressieve evolutie
##Endostyl ï‚§
#Verbinden. Allemaal termen uit de vragen van vorige jaren.
#Geef de levenscyclus van de runderlintworm en bespreek.
#Leg het tegenstroomprincipe uit aan de hand van drie voorbeelden.
#Bespreek structuur en werking van de hypofyse. Welke hormonen zijn aanwezig in de hypofyse?
===24 juni 2011===
#Termen:
##Protonefridia
##regressieve evolutie
##Pseudocoeloom
##Dauer
##oncosfeer
#Verbinden:
##spicula, proglottiden, Clitellum, lofofoor, endocuticula, choanen, lijmcellen, rhopalia
##Ctenophora, Cestoda, Ectoprocta, Arthropoda, porifera, Sarcopterygii, Cnidaria, oligochaeta
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#welke hormonen reguleren het mannelijk voortplantingsstelsel (bij de mens)?
===23 juni 2011===
#Termen:
##Planula
##Cephalisatie
##Enterocoel
##Ecdysis
##RNA interference
#Verbinden: Parapodia, Spiraalplooi, antennae, scolex, choanen, lofofoor, lijmcellen,osculum
#Bespreek de evolutie van de mens (bondig)
#Bespreek de structuur van een lichaamsspier en de contractie er van 5. Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel
===21 juni 2011===
#Termen:
##Gemmula
##Adaptieve radiatie
##Eutelie
##Rhopalia ï‚§
#Verbinden:
##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum
##Aves, Osteichthyes, Chelicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea
#Bespreek bioluminiscentie.
#Hoe wordt de glucoseconcentratie in het plasma gereguleerd. 5. Bespreek de hormonen bij de menselijke voortplantingscyclus.
===21 juni 2010 NM===
#Termen:
##Regeneratie
##Protonefridia
##Scolex
##Corpora allata
#Verbinden:
##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum
##Aves, Osteichthyes, Chicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea
#Wat weet je over de evolutie van de mens. Bespreek bondig.
#Bespreek hartcyclus en bloedsomloop (bij zoogdieren) en de regulatie daarvan.
#Illustreer aan de hand van een voorbeeld het belang van het tegenstroomprincipe bij uitwisselingsprocessen.
===21 juni 2010 VM===
#Termen:
##Pseudocoeloom
##Clitellum
##Dauer
##Endostyl
##Corpora cardiata
#Verbinden:
##Antennae, Osculum, Spiraalplooi, Choanen, Parapodia, Scolex, Lijmcellen, Lofofoor
##Ctenophora, Ectoprocta, Cestoda, Porifera, Sarcopterygii, Condrichtyes, Crustacea, Polychaeta
#Schets de levenscyclus van Schistosoma.
#Vergelijk 3 types spierweefsel en leg het mechanisme van contractie uit. 5. Bespreek de hormonale regulatie van de menstruele cyclus.
===18 juni 2010===
#woordjes:
##adaptieve radiatie ï‚§ ascon
##nematocyst
##eutelie
##lofofoor
#verbinden: spicula (porifera), ambulacra (echinodermata), antennae (insecta), melkklieren (mammalia), rhopalia (cnidaria), proglottiden (cestoda), pseudocoel (nematoda), clitellum (huridinae)
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#vergelijken van osmoregulatie bij zout- en zoetwatervissen 5. principe van impulsgeleiding in zenuwcellen
===15 juni 2006===
#woordjes:
##regressieve evolutie
##mimicry
##filariasis
##ecdysis
##parthenogenese
#verbinden: radula (gastropoda), ambulacra (echinodermata), antennae (arthropoda), cloeidisch ei (reptilia), gemmulae (porifera), mesogloea (cnidaria), parapodium (polychaeta), lofofoor (brachiopoda)
#principe van bioluminiscentie in victoria aequorine uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#geef functie, structuur en regulatie van de hypofyse + welke hormonen komen erbij voor

Structurele en Fysiologische Biologie

2019-08-16T18:26:44Z

Elisevanvyve: /* 14 januari 2019 NM */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Eerstejaarsvak enkel aan biochemici en schakelstudenten gegeven, bestaat uit een deel plantkunde (Wim Van den Ende) en een deel dierkunde (Jozef Vanden Broeck). Deze delen hebben op dezelfde dag een examen, het ene mondeling en het andere schriftelijk, onbekend op voorhand dewelke mondeling en dewelke schriftelijk is. Beide examens hebben al jarenlang dezelfde opbouw van type vragen.

==Examenvragen PLANT==

===28 januari 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek in detail een drietal manieren waarop planten ATP kunnen maken.
# Situeer bondig de termen "gespvormig" en "CRISPR/CAS"
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===14 januari 2019 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# waterpotentiaal en zijn twee componenten
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===14 januari 2019 NM===
# 8 meerkeuzevragen
# Geef 3 manieren waarop planten ATP synthetiseren (glycolyse, ademhaling, Kreb cyclus, ...)
# Leg bondig uit: CRISPR/Cas en CAM planten
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===31 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Bespreek de evolutie & metabole diversiteit van prokaryoten en het ontstaan van de eukaryoten.
# Leg bondig uit: het ontstaan van hexaploïde tarwe, mechanisme voor de bloei van lange en korte dag planten.
# Levenscyclus van bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===30 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Waterpotentiaal en zijn 2 componenten
# SAR
# Massastroming
# Cyclus van bedektzadigen aanvullen. Is deze plant haplont, diplont of diplohaplont en beargumenteer.
===15 januari 2018 VM===
# 8 meerkeuzevragen
# Geef 3 manieren waarop een plant ATP aanmaakt en leg gedetailleerd uit
# Hypersensitieve respons en CAM planten bondig uitleggen
# Cyclus bedektzadigen aanvullen. Is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont en beargumenteer.

===21 aug 2017 NM===
#meerkeuzevragen
#Geef 3 manieren waarop een plant ATP aanmaakt en leg gedetailleerd uit
#gespvorming en CAM planten bondig uitleggen
#cyclus bedektzadigen aanvullen + is deze plant haplont, diplont, of diplohaplont? beargumenteer

===21 aug 2017 VM===
#meerkeuzevragen
#plantenhormonen met werking geven + uitleggen hoe hormoonsysteem in planten werkt
#guttatie en waterpotentiaal bondig uitleggen
#cyclus bedektzadigen aanvullen

===31 jan 2017===
#Meerkeuzevragen
#Waterpotentiaal met zijn 2 componenten uitleggen. Wat gebeurt er als je opgeloste stoffen toevoegt aan het omgevings water?
#Massastroming en SAR uitleggen.
#Cyclus van bedektzadigen aanvullen.

===26 jan 2016===
#8 meerkeuze vragen
#Mondelinge hoofdvraag: hoe wordt sucrose gevormd, hoe komt het in cortexe cellen van de wortels en wat is de bijdrage voor de accumulatie van K+
#Bijvraag: leg chemiosmose en fotorespiratie uit
#Bijvraag: cyclus aanvullen van de bedektzadigen

===30 jan 2014 nm===
#Meerkeuze
#Welke hormonen zijn er bij planten, welke staan in voor apicale dominantie en hoe werkt dit.
#Leg uit hoe herbicide resistentie werkt en leg het mechanisme van glyphosfaat uit. Levenscyclus.
===29 jan 2014 nm===
#Meerkeuze
#Bespreek de diversiteit van fungi en geef de levenscyclus van een ascomyceet.
#Bespreek de rol van mieren in commensalisme en de overdracht van parasieten.
#Levenscyclus van varens.
===28 jan 2014 nm===
#8 meerkeuzevragen (4 punten)
#Bespreek de huidige wereldproblemen en geef aan hoe plantenbiotechnologie/biologie zou kunnen bijdragen tot het aanreiken van van oplossingen (8 punten)
#Vul aan en verklaar dit ecologisch model (Bottom-up effect). Hoe kon dit model op experimentele wijze geverifieerd worden? (3 punten)
#Levenscyclus bedektzadige aanvullen (5 punten)
===28 jan 2014 vm===
#Meerkeuze
#Plantenhormonen welke types? regulatie? welke komen voor bij apicale dominantie? Regulatie? Werking?
#Levenscyclus bladmossen
#Tekening van de muis, mier, plant, zaad (interacties verklaren)
===27 jan 2014===
# 8 meerkeuzevragen.
#Bespreek de diversiteit en evolutie van prokaryoten en het onstaan van eukaryoten.
# Figuur uitleggen over bottom-upeffecten en ontbrekende termen aanvllen.
#Foto van doorsnede monocotyl blad: wat is het + delen benoemen.
===13 jan 2014===
# 5 meerkeuzevragen.
#Aanvullen van termen en processen (mitose/meiose) bij de levenscyvlus van gymnospermen. (Letterlijk uit het handboek fig. 31.12 p609)
#Een plantencel in zuiver water en geleidelijk aan zout toevoegen, wat gebeurt er? Leg uit a.d.h.v. een duidelijke grafiek.
#Wat is een preprofaseband? (en nog een term ?? uitleggen)
===23 jan 2012===
#Leg uit wat er zal gebeuren bij een plantencel in zuiver water en wat als je opgeloste stoffen toevoegt aan de omgeving. Maak een schema aan de hand van de waterpotentiaal en zijn 2 subcomponenten en leg uit hoe deze veranderen.
#Leg uit fotorespiratie: hoe wat waarom waar.
#Situeer:
##glyphosaat
##methanogeen
##guttatie
##Mycorrhiza
#Levenscyclus. Aangeven om welke levenscyclus het ging (bladmossen) en beargumenteren. Structuren en processen aanvullen op tekening. Aangeven of het een haplonte, diplonte of haplodiplonte levenscyclys was.
===1 feb 2011 VM===
#Volledige weg beschrijven die een C-atoom aflegt als CO2 indien ingebouwd in pectine in de celwand van rhizodermiscellen. Waaruit bestaat de celwand en wat is de functie?
#Bespreek in detail de signaalgeving en metabolische wegen van Rhizobium in symbiose met een plant.
#. Figuur: levenscyclus bedektzadigen
#Situeer:
##hexaploÃ¯die by tarwe
##cavitatieï‚§
##gespvorming by Basidiomyceten ï‚§ induceerbare mutaties
===27 jan 2011 NM===
#Volledige weg beschrijven die een N-atoom aflegt van de bodem tot inbouw als glycoproteÃ¯ne in een bladepidermiscel
#Vgl mossen en angiospermen. Zeggen hoe deze zijn aangepast aan leven op het land
#Figuur:
##structuur van een blad met huidmondjes
##hetzelfde -.-
#Situeer:
##allotetraploÃ¯die
##guttatie
##sterke vs zwakke sinks
##bespreek metabolisme Archaea

===24 jan 2011 NM===
#De waterpotentiaal en de 2 componenten ervan bespreken als we een cel in zuiver water hebben en daar geleidelijk aan zout aan toevoegen. Schematisch weergeven en stap voor stap bespreken wat er met de cel gebeurt.
#Het verschil tussen gametofytische en sporofytische incompatibiliteit uitleggen. En een model geven voor gametofytische incompatibiliteit.
#Figuur:
##Doorsnede monocotyle stengel
##Vaatbundel en daarop floeem,
##xyleem en vezelschede benoemen
#Situeer:
##Endosymbiose
##ViroÃ¯den
##Soortkruisingen
##Lenticel
===24 jan 2011 VM===
#Bespreek structuur, samenstelling, functie en oorsprong van de plantencelwand.
#Bespreek de verschillen tussen C3, C4 en CAM
#Figuur: monokotyle stengel met vaatbundel
#Situeer:
##hydrogenosoom
##Agrobacterium tumefaciens
##massastroming (Munch hypothese)
##terminatortechnologie
===25 jan 2010 VM===
#Teken een dwarsdoorsnede van een wortel van een monokotyle plant. Wat is het verschil met een dikotyle plant?
#Bespreek (fysiologisch en chemisch) de weg die een CO2 molecule aflegt vanuit de lucht om ingebouwd de worden in de celwand van een
rhizodermiscel.
#Vergelijk CO2 fixatie bij C3 en C4 planten. Wat zijn de ethiologische implicaties?
#ABC van de bloemetjes
#Situeer:
#Soortkruising
#Isospore haplodiplont
#Worteldruk
#Basidiomyceten
#ï‚§Archebacteria
===18 jan 2010 NM===
#Bespreek de mogelijkheden voor overdracht van genetische informatie tussen individuen die tot een andere soort behoren.
#Vul volgende figuur aan en bespreek (die van potentiaal, niet met de kleurtjes, degene die ook in de cursus staat).
#Vergelijk CO2 fixatie bij CAM en C4 planten. 4. ABC van de bloemen.
#Situeer en bespreek:
##ascomyceten,
##heterospore haplodiplonten
##3 figuren: (een stengel ==> figuur helemaal onderaan rechts in voorbeeldvragen, een blad ==> die gele figuur zo :p en een wortel ==> laatste blz, rechts bovenaan)
===18 jan 2010 VM===
#Bespreek autotrofie bij prokaryoten en eukaryoten.
#Gametofytische incompatibiliteit.
#Fotorespiratie: wat, waar, hoe, waarom?
#Vul aan en bespreek zodat duidelijk wordt of het om een haplont, diplont of haplodiplont organisme gaat. Is dit type organisme al goed aangepast aan het landleven? (figuur van varens, zie voorbeeldvragen)
#Situeer en bespreek:
##3 figuren (monokotyl blad, dikotyle verdikte stengel, monokotyle vaatbundel),
##agrobacterium tumefaciens
##basidiomyceten.
===26 jan 2009===
#Plantencelwand: Samenstelling? Structuur? Functie? Oorsprong?
#Transport in planten: Hoe? Waar? Waarom?
#C4 en CAM planten: Wat? Waarom? Hoe? Verschil?
#Afbeelding van een diplohaplonte cyclus, en zeggen of deze plant al goed
is aangepast aan het leven op het land.
#Termen:
##Soortkruising
##Agrobacterium Tumefaciens
##Zelfincompatibiliteit
##Het ABC van de bloemetjes
##Fotoke van dwarse doorsnede van een plantenstengel, zeggen wa ge ziet en van die dinge..
===19 jan 2009===
#voortplantingscyclus (mos)
#bespreek zo goed mogelijk de opnamen van N uit nitraat (chemisch/fysisch) en inbouw in celwandprotÃ«ine epidermiscel 3. teken primaire stengel dikotyle plant + verschil monokotyle
#fotorespiratie: zin of onzin.
#Termen:
##gametofytische zelfincompabiliteit
##ABC van bloemen
##worteldruk
##retrovirussen
===28 jan 2008===
#vergelijk autotrofie bij eukaryoten en prokaryoten
#fotorespiratie
#zelf-incompabiliteit
#cyclus van varen aanvullen + aangepassingen aan het land
#Situeer:
##drie foto's
##Agrobacterium tumefaciens
##Basidiomyceet
===28 jan 2008===
#primaire dikotyle wortel tekenen en bespreken, vergelijken met monokotyle
#Welke fysische en chemische weg moet het N-atoom van NH4+ afleggen
om ingebouwd te kunnen worden in een celwandproteÃ¯ne van een blad
#Grafieken van CO2-opname van C3 en C4 planten. Zelf assen invullen en c3 en c4 aanduiden + uitleggen waarom
#Welke aanpassingen moet een landplant hebben ten opzichte van een wier
om te kunnen overleven op het land en is dit bij alle zo
#Bespreek:
##ascomyceten
##retrotransposons
##archeaebacteriÃ«n
##zelfincomptabiliteit
===21 jan 2008===
#Hoe genetische informatie overbrengen tussen individuen van verschillende soorten denk ik
#Bespreek en vul aan die figuur van de waterpotentiaal in een cel
#leg uit hoe CO2 wordt gefixeerd bij C4 planten en CAM planten en vergelijk
#geef een schematische voorstelling en een voorbeeld van een heterospore haplodiplont cyclus
#Situeer:
##Ascomyceten
##zelfincompatibiliteit
## 3 foto'kes ( stengel, wortel en blad)
===18 jan 2008===
#teken structuur monocotyle wortel, vgl met dicotyle
#bespreek fixatie co2 bij C4-C3 planten, ahv voor en nadelen
#voortplantingscyclus (van ascomyceten, was wel niet gegeven da het over asco ging ) aanvullen en uitleggen waarom het haplont/diplont/diplohaplont is
#bespreek hoe C via co2 kan ingebouwd worden in de rizodhermiscellen (
zowel fysich als chemisch )
#Situeer en bespreek:
##worteldruk
##basidiomyceten
##archeaebacteriÃ«n
##soortbestuiving
##retrovirussen
===14 jan 2008===
#Celwand: Samenstelling? Functie? Oorsprong? Structuur?
#Vergelijk het transport van mineralen en het transport van
fotosyntheseproducten
#Je gaat op excursie om C3/C4/CAM planten te inventariseren. Wat voor
materiaal neem je mee en leg uit.
#Tekening van een voortplantingscyclus: Is dit haplont/diplont/haplodiplont? Leg uit en geef aan of en hoe deze plant aan het landleven aangepast is.
#Situeer en bespreek:
##Zelfincopatibiliteit
##Agrobacterium tumefaciens
##3 tekeningen (doorsneden van stengel/wortel)
===2 feb 2007===
#twee grafieken zonder aanduidingen "vul aan en verklaar"
#genetische overdracht tussen individuen van dezelfde soort en verschillende soorten, leg uit
===15 jan 2007===
#Vul volgende grafiek aan en bespreek (die van de waterpotentiaal van de omgeving t o v die in de plantencel) en hoe zit dit in 't xyleem?
#Fotorespiratie: wat? waar? hoe? waarom?
#Situeer:
##lenticellen
##heterospore
##haplodiplonten
##zygomyceten
##endodermis
##gametofytische incompatibiliteit
##agrobacterium tumefaciens

==Examenvragen DIER==

===28 januari 2019 VM===
# Verklaar volgende begrippen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
# Verbind volgende begrippen en verklaar bondig:
## parapodia, radula, buisjes van Malphigi, pseudocoel, clitellum, cleidoïsch ei, ambulacra, choanocyten.
## Oligochaeta, Reptilia, Echinodermata, Porifera, Polychaeta, Nematoda, Insecta, Gastropoda
# Bespreek de rol van de maag en het duodenum in de spijvertering. Welke hormonen worden daar lokaal vrijgesteld en wat is hun rol?
# Bespreek de hartcyclus en bloedsomloop en de regulatie van de bloeddruk.

===14 januari 2019 VM===
# Begrippen verklaren: parthenogenese, eutelie, monocyt
# Termen verbinden idem vorige jaren
# Skeletspier structuur en hoe werkt deze
# Glucosegehalte in plasma en regulerende hormonen

===14 januari 2019 NM===
#Begrippen verklaren: gemmula, radula, planula
#Termen verbinden en kort de functie geven ervan: ambulacra (Echinodermata), mesoglea (Cnidaria), lofofoor (Branchiopoda), proglottiden (Cestoda), clitellum (Huridinae), corpus alata (Insecta), choanen, endostyl
# Leg de werking van bioluminescentie uit bij Aequorea victoria.
#Leg de menstruatiecyclus uit adhv de hormonen

===31 januari 2018 VM===
# Verklaar volgende begrippen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
# Verbind volgende begrippen en verklaar bondig: parapodia, radula, buisjes van Malphigi, pseudocoel, clitellum, cleidoïsch ei, ambulacra, choanocyten.
# Bespreek de rol van de maag en het duodenum in de spijvertering. Welke hormonen worden hier geproduceerd en wat is hun rol?
# Bespreek de hartcyclus en bloedsomloop en de regulatie van de bloeddruk.

===30 januari 2018 VM===
#Begrippen verklaren: Ambulacra, Thrombocyt, Mimicry
#Termen verbinden en kort de functie geven ervan: zie vorige jaren
#Osmoregulatie van zoetwater- en zoutwater vissen
#Geef de werking en structuur van het binnenoor.

===15 januari 2018 VM ===
# Begrippen verklaren: gemmulae, radula en parthenogenese.
# Verbinden: exact dezelfde begrippen als vorige jaren.
# Leg de werking van bioluminescentie uit bij Aequorea victoria.
# Geef de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.

===21 aug 2017 NM===
#Begrippen verklaren: Parafyletisch, Parthogenese, Eutelie
#Verbinden: exact dezelfde begrippen als vorige jaren
#Geen 3 bestrijdingsstrategiën tegen een insecten plaagsoort en leg uit
#Leg de menstruatiecyclus uit adhv de hormonen

===21 aug 2017 VM===
#verklaar: blastula, monocyt, convergete evolutie
#verbind, ongeveer zelfde begrippen als vorige jaren + zweetklier (mammalia), zijlijn (osteichthyes)
#Samenstelling van een spier + werking contractie
#hoe wordt het glucose gehalte in het bloed gereguleerd, welke hormonen werken hierbij en waar worden ze gemaakt
===31 jan 2017===
#Verklaar: dauer, ecdysis en filariasis.
#Verbind, zelfde begrippen als voorgaande jaren.
#Vergelijk zuurstof opname bij zoogdieren en insecten.
#Hoe werkt het doorgeven van zenuwimpulsen?

===26 januari 2016===
#Termen: RNA interferentie, epifyse, prothorax
#Verbinden
#Uitleggen: 3 voorbeelden van tegenstroomprincipe en impulsgeleiding

===20 aug 2014===
#Begrippen:
##adaptieve radiatie
##gremmula
##eutelie
#Verbind:
##preenklier - spiraalplooi - pedipalpen - mesogloea - corpus alata - ambulacra - radula - citellum
##cnidaria - insecta - echinodermata - gestropoda - chondrichtys - hirunae - aves - chelicerata
#Geef het mechanisme van de bioluminescentie bij aquora victoria
#Bespreek de structuur, werking en regulatie van een nefron bij zoogdieren.
===30 jan 2014===
#Begrippen :
##Metanefridium
##Regeneratie
##Clitellum
#Verbinden: mesogloea, speenklier, kieuwdeksel, pedipalp, ambulacra, corpora allata, spiraalplooi, radula
#Leg de menstruatiecyclus uit en geef 3 voorbeelden van tegenstrooomprincipe
===29 jan 2014 NM===
#Begrippen:
##Filiarsis
##Mimicry
##Corpora cardiaca
#Verbinden: termen van de vorig jaren.
#Leg de werking van longen en tracheÃ«n uit en vergelijk. Vergelijk
osmoregulatie bij zoet-en zoutwatervissen.
===28 jan 2014 NM===
#Termen:
##Lofofoor
##Adaptieve radiatie
##Protonefridium
#Verbind: parapodia(polychaeta), radula(Gastropoda), Antennae(Arthropoda), Mesogloea(cnidaria), clitellum(Oligochaeta), CleidoÃ¯sche ei(Reptilia), Ambulacra(Echinodermata), Gemmulae(Porifera)
#Illustreer aan de hand van drie voorbeelden het belang van het tegenstroomprincipe en leg uit.
#Leg het mechanisme uit van de elektrische impulsgeleiding door zenuwcellen.
===28 jan 2014 VM===
#Begrippen:
##Gemmula
##Radula
##Corpora allata
#Verbinden: termen van de vorig jaren.
#Bespreken en vergelijken het mechanisme van gasuitwisseling bij longen zoogdieren en vogels
#Welke hormonen worden gevormd in de gonaden bij de mens en regulatie.
===27 jan 2014===
#Termen:
##Planula
##RNA interference
##Eutelie
#Verbinden, opnieuw combinaite die hieronder al staat
#Bespreek de structuur en het contractiemechanisme van skeletspieren.
#Wat zijn de belangrijkste hormonen die door de schildklier geproduceerd worden en hoe worden ze gereguleerd?
===13 jan 2012===
#Leg uit:
##Gremule
##Eutelie
##Amnion
#Verbindt Latijnse namen met Latijnse namen. (letterlijk als in het voorbeeld examen)
#Leg bondig uit: Skeletspier (structuur, werking en regulatie)
#Welke hormonen spelen welke rol in de vrouwelijke voortplantingscycus?
===25 juni 2012===
#Termen:
##Nematocyst ï‚§?
##Metamorfose ï‚§ Lolofoo
##Amnion
#Verbinden (Combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)
#Bespreek en vergelijk drie types spierweefsel bij dieren.
#Bespreek rol van gal en pancreas in de spijsvertering (in invertebraten). 5. Bespreek de regulatie van hartcyclus en bloeddruk (in zoogdieren).
===22 juni 2012===
#Termen:
##Protonefridia
##Ecdysis
##Parthenogenese
##Mimicry
##Filariasis
#Verbinden ( was combinatie van termen die al gegeven zijn in de vorige examens)
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel
===19 juni 2012===
#Termen:
##Feromoon
##Dauer
##Regressieve evolutie
##Endostyl ï‚§
#Verbinden. Allemaal termen uit de vragen van vorige jaren.
#Geef de levenscyclus van de runderlintworm en bespreek.
#Leg het tegenstroomprincipe uit aan de hand van drie voorbeelden.
#Bespreek structuur en werking van de hypofyse. Welke hormonen zijn aanwezig in de hypofyse?
===24 juni 2011===
#Termen:
##Protonefridia
##regressieve evolutie
##Pseudocoeloom
##Dauer
##oncosfeer
#Verbinden:
##spicula, proglottiden, Clitellum, lofofoor, endocuticula, choanen, lijmcellen, rhopalia
##Ctenophora, Cestoda, Ectoprocta, Arthropoda, porifera, Sarcopterygii, Cnidaria, oligochaeta
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#welke hormonen reguleren het mannelijk voortplantingsstelsel (bij de mens)?
===23 juni 2011===
#Termen:
##Planula
##Cephalisatie
##Enterocoel
##Ecdysis
##RNA interference
#Verbinden: Parapodia, Spiraalplooi, antennae, scolex, choanen, lofofoor, lijmcellen,osculum
#Bespreek de evolutie van de mens (bondig)
#Bespreek de structuur van een lichaamsspier en de contractie er van 5. Bespreek het doorgeven van een elektrische impuls in een zenuwcel
===21 juni 2011===
#Termen:
##Gemmula
##Adaptieve radiatie
##Eutelie
##Rhopalia ï‚§
#Verbinden:
##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum
##Aves, Osteichthyes, Chelicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea
#Bespreek bioluminiscentie.
#Hoe wordt de glucoseconcentratie in het plasma gereguleerd. 5. Bespreek de hormonen bij de menselijke voortplantingscyclus.
===21 juni 2010 NM===
#Termen:
##Regeneratie
##Protonefridia
##Scolex
##Corpora allata
#Verbinden:
##Preenklier, Kieuwdeksel, Pedipalpen, Mesogloea, Endostyl, Ambulacra, Radula, Clitellum
##Aves, Osteichthyes, Chicerata, Cnidaria, Cephalochordata, Echinodermata, Gastropoda, Hirudinea
#Wat weet je over de evolutie van de mens. Bespreek bondig.
#Bespreek hartcyclus en bloedsomloop (bij zoogdieren) en de regulatie daarvan.
#Illustreer aan de hand van een voorbeeld het belang van het tegenstroomprincipe bij uitwisselingsprocessen.
===21 juni 2010 VM===
#Termen:
##Pseudocoeloom
##Clitellum
##Dauer
##Endostyl
##Corpora cardiata
#Verbinden:
##Antennae, Osculum, Spiraalplooi, Choanen, Parapodia, Scolex, Lijmcellen, Lofofoor
##Ctenophora, Ectoprocta, Cestoda, Porifera, Sarcopterygii, Condrichtyes, Crustacea, Polychaeta
#Schets de levenscyclus van Schistosoma.
#Vergelijk 3 types spierweefsel en leg het mechanisme van contractie uit. 5. Bespreek de hormonale regulatie van de menstruele cyclus.
===18 juni 2010===
#woordjes:
##adaptieve radiatie ï‚§ ascon
##nematocyst
##eutelie
##lofofoor
#verbinden: spicula (porifera), ambulacra (echinodermata), antennae (insecta), melkklieren (mammalia), rhopalia (cnidaria), proglottiden (cestoda), pseudocoel (nematoda), clitellum (huridinae)
#bestrijding van plaagsoorten uitleggen
#vergelijken van osmoregulatie bij zout- en zoetwatervissen 5. principe van impulsgeleiding in zenuwcellen
===15 juni 2006===
#woordjes:
##regressieve evolutie
##mimicry
##filariasis
##ecdysis
##parthenogenese
#verbinden: radula (gastropoda), ambulacra (echinodermata), antennae (arthropoda), cloeidisch ei (reptilia), gemmulae (porifera), mesogloea (cnidaria), parapodium (polychaeta), lofofoor (brachiopoda)
#principe van bioluminiscentie in victoria aequorine uitleggen
#beschrijf en vergelijk de gasuitwisseling bij tracheeÃ«n en longen
#geef functie, structuur en regulatie van de hypofyse + welke hormonen komen erbij voor

Spectroscopie van biomoleculen

2019-06-25T14:13:17Z

Elisevanvyve: /* 25 juni 2019 */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Dit vak wordt gegeven door Johan Hofkens en Tatjana Vogt. Het deel van Vogt is mondeling, Hofkens is schriftelijk. Je moet op beide delen minstens 4/10 halen om te slagen. Bij het herexamen kan je een vrijstelling aanvragen voor het deel dat je geslaagd bent.

==Examenvragen==
===25 juni 2019 VM===

====Vogt====
#NMR-spectrum(C9H10O3)
#Zeeman effect + frequentie berekenen met gegevens
#Fase 1 spectrum ->structuur proteinen

====Hofkens====
Zie examen 27 juni 2018

===11 juni 2019===

====Voght====
#NMR-spectrum met 1H, 13C, DEPT, IR, COSY en HETCOR gegeven (4 punten)
#Verschillende types relaxatie uitleggen, waarom dit belangrijk is in 13C NMR en waarom dit belangrijk is bij structuurbepaling van proteïnen (laatste heeft te maken met de grootte, tumbling en bandverbreding) (3 punten)
#Uitleggen waarom in vivo 1H en 13C NMR niet handig zijn + uitleggen waarom het wel handig is met 31P + voorbeeld geven van 31P NMR (3 punten)

====Hofkens====

#Je hebt een kit om een enzyme op te sporen, als het enzyme aanwezig is hydroliseert het een proteïne en zal het fluoresceren. Leg de werking van de kit en het spectrum uit. (4 punten)
#Simpele oefening over FRET, fluorescentieleeftijd en afstand tussen donor en acceptor. Je had maar 2 formules uit het formularium nodig en moest die de hele tijd anders invullen. (2 punten)
#4 begrippen: (4 punten)
#*limiting anisotropy
#*inner filter effect
#*auxochrome shift
#*anti-Stokes Raman

===27 juni 2018===
====Vogt====
# Oefening NMR (C8H19N) IOU = 0, symmetrisch molecule met NH groep in het midden
# wat is relaxatie bij cnmr spectroscopie, welke soorten en wat is het verband van relaxatie en bandverbreding
# 1D en 2D spectroscopie en proteïn ligand binding uitleggen (zowel fast als slow), uitleggen hoe je bepaald waar de binding van het ligand plaatsvind en hoe je de bindingsconstanten kan bepalen adv NMR

====Hofkens====
# 3 molecules met vibraties gegeven. zeggen wat de voorwaarde zijn voor IR en raman spectroscopie. zeggen welke structuren IR actief zijn. zeggen welke structuren raman actief zijn en raman en Ir aanduiden op een jablonski diagram
#* oefening over fret, gegeven zijn intensiteit gebonden en ongebonden en R0. bepalen van efficientie FRET, bepaal R, wat is de intensiteit van het molecule indien de afstand kleiner is.
# Begrippen: excitatie spectrum, perrin vgl, balmer reeks, transitiedipoolmoment

===26 juni 2018===
====Vogt====
# Oefening NMR (C11H14O2) - benzeenring met para 2 substituenten: eerste substituent COOH en tweede substituent C met 3 gebonden CH3
# Figuur van slow en fast exchange limit uitleggen + waarom zijn spectra temperatuursafhankelijk + wat is de coalescentie temperatuur + bereken de exchange rate (k) voor de coalescentie temperatuur
# Fase 1 van spectrum naar structuur uitleggen, welke NMR worden daar gebruikt en wat kom je te weten + wat is het grootste probleem bij grote proteinen om een NMR te bekomen

====Hofkens====
# Je hebt een hypothetisch lineair molecule AB2 gegeven, maar de Lewisstructuur hiervan is onbekend. M.a.w. je weet niet of het ABB is of BAB.
#* Hoeveel vibratiemodes zijn er voor elke structuur?
#* Op het IR-spectrum zijn pieken te zien die overeenkomen met drie normale vibratiesmodes. Welke structuur is het (BAB of ABB) en waarom?
#* In IR ligt de piek voor H2O op 3560 cm-1, veronderstel dat de krachtconstante gelijk is. Bereken de frequentie van de rekking van D2O (zwaar water)?
# Oefening 5 van oefenzitting 4 met volgende gegevens: IgG bindt aan de kleurstof Fluorescein. Concentraties zijn 0, 1*10^(-5), overmaat voor IgG; drie keer 4*10^(-7) voor Fluorescein en P = 0.03, 0.1450 en 0.3913. De formule voor Kd is gegeven.
#* bereken Kd als de extinctiecoëfficiënt en het kwantumrendement niet verstoord worden door de binding.
#* het kwantumrendement halveert bij de binding, wat gaat er gebeuren met de fractie Fluorescein in complex.
#* hoe bepaalt men of de extinctiecoëfficiënt en/of het kwantumrendement verandert bij de binding?
# Begrippen: inner filter effect, limiting anisotropy, auxochroom effect, TCSPC

===18 juni 2018===
====Vogt====
# Oefening met NMR (C9H10O3 - benzeenring met aldehyde en 2 keer O-CH3 gesubsidieerd) + verklaar plaats van substitutie
# 31P NMR vergelijken met 1H NMR en 13C NMR.
#*Waarom gebruik je P-NMR hier.
#*Hoe is de sensitiviteit van de 3 NMR's en welke is hier het beste + wat zijn de algemene factoren die sensitiviteit bepalen
#* Welke NMR gebruik je om deze reactie te bestuderen en waarom?
#* Hoe zou je de aanwezige concentratie water berekenen in deze vergelijking
#* Hoe zou je de omzettingsratio van de producten naar reagentia berekenen
#Leg uit waarom SAR by NMR een veelgebruikte techniek is voor de ontwikkelen van medicatie en leg werking uit
#* Leg uit wat de vereiste zijn van SAR
#* Leg uit wat voor-en nadelen zijn van SAR

====Hofkens====
# Teken een Frank-Condon energiediagram van een hypothetisch molecule in grondtoestand en geëxciteerde toestand. Benoem S0 en S1 op de figuur.
#* Teken een vibratiobele overgang
#* Teken een vibrationele excitatie in de elektrisch aangeslagen toestand
#* Wat is de tijdschaal van fluorescerende en teken dit

# Oefening over Stern-Volmer en quenchen instantende met volgende gegevens: unquenched lifetime is 26.3 ns. Concentratie Cl- (in mM) bedraagt 0-5-15-50 met bijhorende Intensiteiten 1-0.6-0.35 .15.Ook nog een grafiek gegeven van het molecule SPQ dat gequenched wordt met Cl- (grafiek toont intensiteit over golflengte bij verschillende (bovenstaande) concentraties
#* Bereken de quenchingconstante en teken de Stern-Volmer plot
#* In bloed bedraagt de concentratie van het aanwezige Cl- 103mM. Wat is de fluorescente leeftijd en fluorescerente intensiteit van het SPQ in het bloed.
#* Wat gebeurt er met de leeftijd als de concentratie Cl- daalt?
# Woordjes - max 1/2 blad uitleg per woord + verduidelijk eventueel met een figuur
#* TRES
#* Foto-elektrisch effect
#* Cotton- effect
#* Extinctie coëfficiënt

===6 september 2017===
====Vogt====
# oefening met NMR (C9H10O3)
# spin spin coupeling, uitleggen aan de hand van voorbeeldmolecule en beschrijven hoe het signaal van ieder proton gesplits zal worden.
# SAR methode bij het ontwikkelen van medicijnen. interactie ligand-proteine enzo uitleggen.
====Hofkens====
# (4pt) Spectra gegeven van Chryseen. Duid aan welk spectrum absorptie, fluorescentie en fosforescentie toont. De vervaltijd in regio 360-400nm is 10x kleiner dan die in de regio 500-600nm, leg uit waarom.Beschrijf alle waarnemingen van de spectra aan de hand van de geziene leerstof.
# (2pt) L-opstelling voor meting anisotropie, in propyleenglycol bij 233K ofzoiets. Gegeven Ivh, Ivv, Ihh en Ihv. Bereken de werkelijke anisotropie bij verticale excitatie. Hoe groot is de fout die je maakt als je niet corrigeert? Wat is de hoek tussen de excitatie en het emissie dipoolmoment? Stel dat we bij 293K werken en in ethanol, kunnen we de hoek dan nog steeds bepalen? wat gebeurt er met de anisotropie?
# (4pt) Woordjes
#* Foto-elektrisch effect
#* FRET
#* Single Photon Timing
#* Cottoneffect

=== 28 juni 2017===
====Vogt====
# oefening spectrum NMR
# COSY spectrum gegeven van molecule. Wijs elke functionele groep toe in het spectrum en leg uit waarom. Vertel de werking van COSY.
# Bespreek de drie fasen voor de structuurbepaling van proteïnen via NMR
==== Hofkens ====
# Gegeven is een simpele tekening van een hairpinstuctuur met donor en acceptor, deze is in evenwicht met zijn twee conformaties. De leeftijd van de donor in vrije oplossing is 10ns en acceptor is 2ns. Als de donor aan de hairpin hangt zien we een bi-exponentieel verval van 5ns en 1ns mer respectievelijk 95% en 5%. verklaar waarnemingen, bespreek de leeftijd van de acceptor in beide conformaties.
# Gegeven is die tekening vanuit de cursus over FMN en YMN en tabel met hoek teta. In tabel ook nog anisotropiewaarde van complex en zonder complex, alfa en de concentraie van FMN is niet gegeven. Bereken dissociatieconstante en verklaar de grafiek van die anisotropie.
# Woordjes:
#* Transitiedipoolmoment
#* Balmerreeks
#* Excitatiespectrum
#* Perrin vergelijking

===27 juni 2017===
====Vogt====
# H en C spectrum
# NOE
# fase 1 uitleggen van die fase 3 shit + probleem grote moleculen
====Hofkens====
# grafiek zoals in cursus van Eosin en Erytrosin (maar andere kleurstoffen). Alles bespreken wat je ziet. Tau en Q gegeven, bereken radioactieve en niet radiatieve snelheidsconstante. Als R= een of andere groep, waarom is dan de Tau en Q groter? En zou dit koppel een goed FRET paar zijn?
# anisotropie is 0,3 maar door scattering laat de filter 20% door, wat is de gemeten anisotropie
# woordjes:
#* foto-elektrisch effect
#* extinctie coefficient
#* TRES
#* cotton effect

===19 juni 2017===
====Vogt:====
# zeeman effect
# H/C spectrum
# in vivo nmr
====Hofkens====
# da van die even en oneven aantal dubbele bindingen en het effect daarvan op de golflengte, met cyanine en azocyanine.
# oef 5 van oefenzitting 4 denk ik (zoals vorig examen)
# woordjes:
#* Ro
#* Dynamic quenching
#* fluorescence quantum yield
#* resonance
#* Raman scattering

===13 juni 2017===
====Vogt====
# H- en IR spectrum gegeven van C11H14O2
# vraag2
#* 2 soorten relaxatie, leg uit
#* hoe beinvloeden deze het C-NMR
#* weet ik ook niet meer
# 1D en 2D NMR spectra:
#* verschillen, voor - en nadelen geven.
#* Kan je er ligand proteine bindingen mee onderzoeken?
#* hoe ziet men dit?
#* kan men zien aan met welk aminozuur de binding gebeurt? (Alles zowel voor slow- als fast exchange)
====Hofkens====
# membraanfusie experiment: gegeven structuur lipide met pyreen aan, fuseert met zelfde lipide zonder pyreen, absorptie spectra pyreen gegeven (voor de fusie). Hoe verandert het absorptie- en emissiespectra doorheen het experiment? Leg uit adhv zelf gemaakte tekeningen (grafieken).
# Oefening: zoals oefening 5 van oefenzitting 4
# 4 termen:
#* anti stokes
#* ramanscattering
#* emissiespectra
#* statische quencher
#* laatste weet ik niet meer

===7 juni 2016===
====Vogt====
# H- en C-spectrum, structuur afleiden.
# Je krijgt spintoestanden
#* Geef het aantal mogelijke spin oriëntaties en geef het weer op een grafische manier.
#* Hoe wordt dit effect genoemd? Is de electronen verdeling gelijk tussen 2 toestanden?
#* Welke factoren beïnvloeden deze indeling?
#* Wat kun je hieraan doen om NMR spectroscopie efficiënter te maken?
# Leg in vivo H- en C-NMR spectroscopie uit, integreer een voorbeeld in je uitleg.
#* Waarom wordt dit niet veel gebruikt?
#* P-NMR is wel nuttig in vivo, waarom?
#* Geef een voorbeeld waarin deze techniek gebruikt kan worden.

====Hofkens====
# Tekening met DNA-hairpin in open- en gesloten vorm. Aan uiteinde hangt een donor en acceptor. Donor vrij heeft leeftijd van 10 ns, acceptor vrij een leeftijd van 2 ns. Wanneer de leeftijd van de donor wordt gemeten (in de gesloten vorm) bekomen ze een bi-exponentiele verdeling voor de leeftijd: 5 ns 95% en 1 ns 5%.
#* Verklaar de resultaten.
#* Geef de leeftijd van de gesloten- en de open DNA-hairpin vorm.
#* Wat zal de leeftijd van de acceptor zijn in de open vorm, en wat in de gesloten DNA-hairpin vorm?
# Tekening van anisotropie gegeven (uit cursus met 2x10-2M en 2x10^-5M). Verklaar de tekening aan de hand van de gezienen leerstof.
# Bespreek kort maar juist (1/2bladzijde max)
#* foto-effect
#* Balmer-reeks
#* ...
#* transitiedipoolmoment.

===23 juni 2015===
====Vogt====
# H- en C-spectrum
# Slow en fast exchange uitleggen (waarom een spectrum bij hoge T slechts 1 signaal meer geeft i.p.v. 2) en de exchange constant berekenen.
# Hoe kan IR-Spectroscopy gebruikt worden om:
#* kwantitatief de concentratie van een staal te bepalen.
#* kwalitatief proteine structuur te bepalen.

====Hofkens====
# Gegeven een absorptiespectrum van verschillende kleurstoffen (steeds met een groter geconjungeerd systeem) verklaar alle waarnemingen, teken het fluorescentie spectrum van 2 van de stoffen, de quantumyield van kleurstof 1 is 0.9 hoe zal deze evolueren naarmate het molecule groter wordt?
# Atoommodel van Bohr uitleggen en op het belang voor de spectroscopie wijzen.
# Begrippen:
#* Cotton-effect
#* Inner filter effect
#* R0
#* Excimeer

===15 juni 2015===
====Vogt====
# H-spectrum+ IR-spectrum
# uitleg verdeling tussen de 2 spintoestanden. hoe onstaat deze verdeling en hoe kan je ze beïnvloeden.
# Leg uit de voor- en nadelen van 1D en 2D spectra en kan men aan de hand hiervan de ligand-proteïne interactie volgen. b. Kan je de snelheidsconstante K berekenen aan de hand van deze spectra? (zowel slow als fast exchange) c. kan je zien waar het ligand bind aan het proteïne? (zowel slow als fastexchange)
====Hofkens====
# twee prentjes van twee membranen. Eerst een eximeer daarna niet meer. Het gaat over membraanfusie. Geef de absorptie-en emissiespectra van beide toestanden. Wat leert men hieruit over membraanfusie?(af te leiden uit prentjes)
# hoe kan men de transitieconstante berekenen?
# woordjes:
#* limiterende anisotropie
#* cotton effect
#* inner filter effect
#* statische quenching

===17 juni 2013===
====Vogt====
# simpele oefening over een C9H10O3 spectrum, bij mondeling vroeg ze waarom dat een doublet of triplet of multiplet was.
# verschillende COSY spectra matchen met verschillende aminozuren
# welke NMR-technieken kunnen worden gebruikt om ligand-proteïne interacties te onderzoeken. Bijvraag ging over SAR, welke stappen enzo.. ook uitleggen dat die interactie snel of traag kan gebeuren.

====Hofkens====
# oefening; gegeven tau-waarden en p waarden. Hieruit P0, de rotationele correlatietijd en nog iets berekenen.
# het atoommodel van bohr uit de doeken doen, postulaten, formules,.. en de link leggen met de spectroscopy van vandaag.
# begrippen uitleggen:
#* R0
#* cotton effect
#* inner filter effect
#* excimeer

===10 juni 2013===
====Tatjana====
# Oefening waarbij H en C spectrum gegeven werden
# IR spectroscopie:
#* is de amide band I de enige bruikbare band voor het bepalen van de secundaire structuur van eiwitten of zijn er nog?
#* Verklaring geven voor de verschillende waarde van de amide piek bij alfa helix of b sheet.
#* Vaak ziet men 1 grote band en niet de verschillende pieken binnen de amide I band, hoe lost men dit op?
#* Is IR zo ook een kwantitatieve methode voor de bepaling van de secundaire structuur?
# Bespreek HSQC in verband met studies van proteïnen.
====Hofkens====
# oefening met 2 spectra gegeven van anisotropie-verval in de tijd van hetzelfde FP molecule. Het ene spectrum was bij lage concentratie FP, het andere bij hoge concentratie FP. Bij beiden werd het verval gemeten bij verschillende viscositeit en weergegeven in het spectrum (dus 5 vervalcurves in elk spectrum).
#* Verklaar de resultaten.
#* Wat kom je hierdoor te weten over het FP?
#* Bespreek in detail de meettechniek hoe men aan deze spectra komt. (4punten)
# Bespreek het foto-elektrisch effect van Einstein. Waarom is dit belangrijk voor spectroscopie? (2punten)
# Leg de volgende begrippen uit (max 1 blz per begrip) (4 punten):
#* circulair dichroïsme
#* magic angle
#* fosforescentie
#* J-aggregaat

===30 jun 2011===
====Tatjana====
# H-NMR en IR spectrum van C14H14 gegeven. (Het was 1,2-difenylethaan als structuur)
# Wat is NOE? Bereken de maximum signaalversterking bij 1H en 15N wanneer 15N de onderzochte kern is (gamma's gegeven).
# Bespreek kort de 3 fasen waarin men m.b.v. NMR de structuur van proteinen kan bepalen.
====Hofkens====
# Bij het meten van lifetimes zijn er vaak problemen met depolarisatie. Hoe los je dit anisotropieprobleem op. Verwerk de formule van anisotropie in je antwoord (6 punten).
# Gegeven zijn gegevens van een quenching experiment. Je moest een Stern-volmer ervan maken. Verschillende quenchingconstanten berekenen. (Super moeilijke oefening !)
# Oefening over Raman (Stokes en anti-Stokes): (2 punten)
#* exciterende laserfrequenties en een paar spectrumwaarden gegeven
#* en dan een paar vraagjes waar je frequenties of golflengtes moest berekenen.

===21 jun 2011===
====Tatjana====
# H-NMR en IR spectrum van C11H14O2 gegeven.
# Vijf kernen (12C, 14N, 17O, 31P en 51V) met hun I-waarde (totale spin van de kern) gegeven.
#* Geef het aantal mogelijke spinoriëntaties van elke kern en stel grafisch voor.
#* Wat is de frequentie van een signaal van een 31P-kern bij een magneetveld van 1 Tesla? (gamma, constante van Planck, pi en abundantie gegeven)
#* Zelfde vraag en zelfde gegevens, maar dan voor 51V.
#* Bij welk van beide kernen (31P en 51V) verwacht je onder dezelfde condities (concentratie, magneetveldsterkte) de hoogste S/N ratio?
# Welke NMR methoden kan je gebruiken om de binding van een klein ligand aan een proteïne te bestuderen? Hou rekening met het verschil tussen trage en snelle uitwisseling ten opzichte van de NMR-tijdschaal.

====Hofkens====
# Gegeven was een structuur (twee naftaleenmoleculen gekoppeld via een linker) en het bijhorende emissiespectrum met 3 pieken (opgenomen bij -60°C). De eerste piek had een fluorescentieverval van 2 ns, de middelste een bi-exponentieel verval en de laatste een verval van 12000 ns. Een concentratieverhoging heeft geen invloed op de vorm van het spectrum, maar wel op de intensiteit. Verklaar alle waarnemingen mbv Jablonski-energiediagram. Schat ook de golflengte bij max. absorptie mbv van de Woodward-Fieser-Scott regels en teken het absorptiespectrum. (6 punten)
# Gegeven zijn twee structuren met als enige verschil de plaats van één dubbele binding (waardoor die binding bij de ene structuur geconjugeerd is en bij de andere niet). Je mag geen gebruik maken van de Woodward-Fieser-Scott regels om lambda max te bepalen, maar je hebt wel een UV-VIS absorptiemeter ter beschikking. Hoe kan je die gebruiken om beide stoffen te onderscheiden? (2 punten)
# Oefening over Raman (Stokes en anti-Stokes): exciterende laserfrequenties en een paar spectrumwaarden gegeven, en dan een paar vraagjes waar je frequenties of golflengtes moest berekenen. (2 punten)

===17 jun 2011===
====Tatjana====
# H- en C- NMRspectrum geven, C9H10O3. Mondelinge bijvragen:
#* Waarom is die piek bv een triplet?
#* Wat is er belangrijk voor het solvent voor NMR?
# Bij een NMR meting met een toestel van 60MHz is het ligt de piek van CH3NO2 op 259.8 Hz van de referentiestof.
#* bereken de chemische shift bij 60MHz
#* op welke afstand zou de piek liggen bij 500MHz
#* bereken de chemische shift bij 500MHz
#* bijvraag: Waarom is de chemische shift belangrijk
# Hoe kan je IR-spectrometrie gebruiken om info over de secundaire structuur van een proteïne te bekomen? Voor welk type van proteïnen is deze methode vooral bruikbaar?
====Hofkens:====
# Gegeven was een schema van een natriumlamp. De lamp werkt als volgt: als er spanning gezet wordt over de lamp, wordt het ontspanningsgas(neon) geioniseerd. Bij botsing van dit geioniseerd gas met het natrium-kwik amalgaam komt natrium vrij. Zo wordt een lage natrium druk gecreeerd. Typisch voor zo'n lamp is de oranje kleur(zoals op de autosnelweg). Die kleur wordt veroorzaakt door het natrium. Verklaar dit aan de hand van concepten uit de cursus. Als de lamp net aangestoken is, is kleur niet oranje, maar roodachtig, verklaar. Een andere versie van zo'n lamp werkt met een hoge natrium druk, dit soort lampen geeft een wit-gele kleur. Verklaar dit aan de hand van concepten uit de cursus.(6 punten)
# Geef een bondige uitleg voor volgend begrippen(5 zinnen) met indien nodig een wiskundige uitdrukking(2 punten)
#* Extinctiecoefficient
#* Woodward-Fieser-Scott-regels
#* Lambert-Beer
#* Fluorescentie quenching
# oef(2 punten) Gegeven is dat HBr een band geeft bij 2558 cm^-1.
#* bereken de golflengte
#* je krijgt de uitdrukking van een veer(die met Mred) en gevraagt: bereken welke band DBr zal geven.(gegeven zijn m van H, D en Br en getal van Avogadro)

===15 jun 2010===
====Tatjana====
# H- en IR- spectrum geven, C4H9Br. Mondelinge bijvragen:
#* Wat moet normaal de opsplitsing zijn van dit multiplet?
#* Is het IR-spectrum hier nuttig?
# Wat is NOE? Bereken de maximum signaalversterking bij 1H en 31P wanneer 31P de onderzochte kern is (gamma's gegeven).
# Welke NMR methode kan je gebruiken om een KWANTITATIEVE analyse te maken van protein-ligand binding? Hou rekening met snelle en trage uitwisseling.

===18 jun 2009===
====Tatjana====
# H en C - NMR gegeven. Structuur? C14H14.
# Gegeven: 12C (I=0), 14N (I=1), 17O (I=5/2), 31P (I=1/2).
#* Hoeveel spinoriëntaties zijn er in een magnetisch veld? Stel grafisch voor.
#* 31P in magneetveld van 1 Tesla. Bij welke frequentie moet je 31P meten? h, gamma en pi gegeven.
# Hoe kan je IR-spectrometrie gebruiken om info over de secundaire structuur van een proteïne te bekomen? Voor welk type van proteïnen is deze methode vooral bruikbaar?

===16 jun 2008===
====Tatjana====
# Bespreek de drie fasen voor de structuurbepaling van proteïnen via NMR
# 3 COSY's gegeven, 6 AZ. Ken de 3 COSY's toe en leg uit waarom
# H-NMR en IR-spectrum gegeven. Geef structuur (butylethanoaat (en geen methylpentanoaat!))

===13 jun 2008===
====Tatjana====
# H en C spectrum van een molecule
# Je krijgt lysine en zijn H en C chemische shift waarden, teken DEPT, H-H COSY en C-H HSQC
# hoe kan je de binding van een ligand aan een proteïne bestuderen? Hou rekening met snelle en trage uitwisseling

===11 jun 2008===
====Tatjana====
# Je hebt een oplossing vitamine C (structuur gegeven). Bespreek hoe je met IR-spectroscopie de concentratie van de oplossing kunt bepalen.
# Geef het aantal verschillende spintoestanden van 12C (I=0),31P (I=1/2), 14N (I=1), 17O (I=5/2) en stel grafisch voor.
# Bereken frequentie (B0, gamma, h en pi gegeven) voor 31P

===27 jun 2007===
====Tatjana====
# Oefening, aromatische ring, twee O-CH3 en een keton erop
# Je kreeg een molecule en ge moest daar de zo'n dynamische interactie bespreken, van draaiing rond een binding (met slow exchange, coalescentie en fast exchange) en dan moest je de uitwisselingssnelheid bij coalescentie berekenen.
# Toepassing van IR op biomoleculen

===23 jun 2007===
====Tatjana====
# Basic oefeningske
# De NH2 groep stretcht permanent bij een frequentie van 1013 Hz. hierdoor heeft deze N-H verschillende bindingslengtes. Ga na of de individuele bindingslengtes kunnen gedetecteerd worden op een NMR-instrument van a) 250 MHZ en b) 900 MHz.
# Wat is HSQC en hoe kan deze techniek bijdragen bij het onderzoek van eiwitten

===21 jun 2007===
====Tatjana====
# Je kreeg een tekening van een benzeenring met daar een groep boven en ge moest de upfield en downfield effecten bespreken van die groep en die van de benzeenring.
# Hoe is NMR belangrijk voor SAR en ook SAR bespreken
# Een oefening met een symmetrische aromatische ring en een carboonzuur en een ester daar ergens in.

===18 jun 2007===
====Tatjana====
# Oefening: Nen C4H9Br, gewoon, H spectrum en (nutteloos) IR gegeven, en ge moet de structuur geven (twas gewoon lineair, dus best wel 'makkelijk")
# Theorie:
#* H @ 60MHz, zelfde toestel P @ ? MHz??? De 'gamma' van H en P was gegeven
# In vivo NMR, bespreek, leg uit,...

Chemie Van Natuurproducten

2019-06-06T13:58:29Z

Elisevanvyve: /* 14 juni 2010 */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==

==Examenvragen==
===4 september 2018 NM===
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv een 5-ring
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Wat zijn inositolen? + geef de biosynthese

===21 juni 2018 NM===
#Stetter-reagens
#NAD+/NADH reductie
#biosynthese inositol
[[Bestand:Knipsel.jpg]]

===21 juni 2018 VM===
#vorming 8 ring met pyridoxaal fosfaat
#ringsluiting van polyketide en de synthese van een polyketide geven
#stereospecifieke aanval bij reductie met NADH

===19 juni 2018===
#bespreek synthese humuleen
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2

===15 juni 2018===
#Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units')
#Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)
#Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+.

===11 juni 2018 voormiddag===
#Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek antioxiderende werking van vitamine C

===21 juni 2017 namiddag===
#hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme
#reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --> ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)
#bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen

===21 juni 2017 voormiddag===
#bespreek synthese humuleen
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===20 juni 2017 namiddag===
# Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat
# een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)
# geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)

===20 juni 2017 voormiddag===
# oefening van polyketiden
# gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat
# oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).

===16 juni 2017===
# Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
# Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)
# Antioxidante werking van vitamine C

===13 juni 2017===
# Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)
# Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring.
# Stetteroefening.

===12 juni 2017===
# een oefening "met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie" da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter
# tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie
# theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit

===12 juni 2015===
#leg de werking van vitamine C uit als antioxidans
#Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat
#Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.

===20 agustus 2013===
#Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme
#Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+
#Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken

===19 juni 2013===
#Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit
#Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule
#Bespreek de synthese van vitamine C

===17 juni 2013===
#In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)
#Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)
#Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C

===14 juni 2013===
#Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert
#2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen
#Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.

===15 juni 2012 (namiddag)===
#Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.
#Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.
#Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.

===15 juni 2012 (voormiddag)===
#Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat
#Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?
#Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA

===20 juni 2011 (namiddag)===
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)
#Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.
#Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion

===14 juni 2010===
#Omzetting van histidine naar histamine (histidine zonder CO2) (structuren gegeven)
#Welk biomimetisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)
#Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit

===11 juni 2010===
#Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat
#Vetzuursynthese
#Radicale ortho-para-koppeling

===September 2009===
#DOPA en DOPAMINE
#Synthese inositolen
#Stereospecificiteit LADH

===12 juni 2009===
#Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?
#Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie
#Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan

===4 september 2008===
#De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.
#De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep

===17 juni 2008===
#Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt
#Fructose: fisher => hawordth omzetting
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD

===19 juni 2007===
#Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)
#Fructose fisher gegeven, geef haworth
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2) leg uit + geef structuur van FAD

===12 juni 2006===
#Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties
#Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?
#Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg

===12 juni 2006===
#Decarboxylatie van een aminozuur
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2): leg uit + geef structuur van FAD
#Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit

Chemie Van Natuurproducten

2019-06-06T12:37:28Z

Elisevanvyve: /* 20 juni 2011 (namiddag) */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==

==Examenvragen==
===4 september 2018 NM===
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv een 5-ring
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Wat zijn inositolen? + geef de biosynthese

===21 juni 2018 NM===
#Stetter-reagens
#NAD+/NADH reductie
#biosynthese inositol
[[Bestand:Knipsel.jpg]]

===21 juni 2018 VM===
#vorming 8 ring met pyridoxaal fosfaat
#ringsluiting van polyketide en de synthese van een polyketide geven
#stereospecifieke aanval bij reductie met NADH

===19 juni 2018===
#bespreek synthese humuleen
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2

===15 juni 2018===
#Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units')
#Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)
#Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+.

===11 juni 2018 voormiddag===
#Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek antioxiderende werking van vitamine C

===21 juni 2017 namiddag===
#hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme
#reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --> ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)
#bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen

===21 juni 2017 voormiddag===
#bespreek synthese humuleen
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===20 juni 2017 namiddag===
# Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat
# een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)
# geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)

===20 juni 2017 voormiddag===
# oefening van polyketiden
# gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat
# oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).

===16 juni 2017===
# Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
# Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)
# Antioxidante werking van vitamine C

===13 juni 2017===
# Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)
# Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring.
# Stetteroefening.

===12 juni 2017===
# een oefening "met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie" da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter
# tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie
# theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit

===12 juni 2015===
#leg de werking van vitamine C uit als antioxidans
#Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat
#Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.

===20 agustus 2013===
#Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme
#Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+
#Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken

===19 juni 2013===
#Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit
#Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule
#Bespreek de synthese van vitamine C

===17 juni 2013===
#In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)
#Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)
#Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C

===14 juni 2013===
#Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert
#2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen
#Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.

===15 juni 2012 (namiddag)===
#Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.
#Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.
#Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.

===15 juni 2012 (voormiddag)===
#Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat
#Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?
#Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA

===20 juni 2011 (namiddag)===
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)
#Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.
#Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion

===14 juni 2010===
#Omzetting van histidine naar histamine (histidine zonder CO2) (structuren gegeven)
#Welk biomimetrisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)
#Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit

===11 juni 2010===
#Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat
#Vetzuursynthese
#Radicale ortho-para-koppeling

===September 2009===
#DOPA en DOPAMINE
#Synthese inositolen
#Stereospecificiteit LADH

===12 juni 2009===
#Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?
#Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie
#Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan

===4 september 2008===
#De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.
#De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep

===17 juni 2008===
#Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt
#Fructose: fisher => hawordth omzetting
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD

===19 juni 2007===
#Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)
#Fructose fisher gegeven, geef haworth
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2) leg uit + geef structuur van FAD

===12 juni 2006===
#Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties
#Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?
#Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg

===12 juni 2006===
#Decarboxylatie van een aminozuur
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2): leg uit + geef structuur van FAD
#Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit

Chemie Van Natuurproducten

2019-06-06T07:16:03Z

Elisevanvyve: /* 14 juni 2010 */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==

==Examenvragen==
===4 september 2018 NM===
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv een 5-ring
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Wat zijn inositolen? + geef de biosynthese

===21 juni 2018 NM===
#Stetter-reagens
#NAD+/NADH reductie
#biosynthese inositol
[[Bestand:Knipsel.jpg]]

===21 juni 2018 VM===
#vorming 8 ring met pyridoxaal fosfaat
#ringsluiting van polyketide en de synthese van een polyketide geven
#stereospecifieke aanval bij reductie met NADH

===19 juni 2018===
#bespreek synthese humuleen
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2

===15 juni 2018===
#Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units')
#Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)
#Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+.

===11 juni 2018 voormiddag===
#Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek antioxiderende werking van vitamine C

===21 juni 2017 namiddag===
#hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme
#reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --> ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)
#bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen

===21 juni 2017 voormiddag===
#bespreek synthese humuleen
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===20 juni 2017 namiddag===
# Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat
# een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)
# geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)

===20 juni 2017 voormiddag===
# oefening van polyketiden
# gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat
# oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).

===16 juni 2017===
# Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
# Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)
# Antioxidante werking van vitamine C

===13 juni 2017===
# Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)
# Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring.
# Stetteroefening.

===12 juni 2017===
# een oefening "met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie" da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter
# tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie
# theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit

===12 juni 2015===
#leg de werking van vitamine C uit als antioxidans
#Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat
#Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.

===20 agustus 2013===
#Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme
#Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+
#Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken

===19 juni 2013===
#Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit
#Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule
#Bespreek de synthese van vitamine C

===17 juni 2013===
#In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)
#Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)
#Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C

===14 juni 2013===
#Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert
#2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen
#Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.

===15 juni 2012 (namiddag)===
#Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.
#Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.
#Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.

===15 juni 2012 (voormiddag)===
#Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat
#Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?
#Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA

===20 juni 2011 (namiddag)===
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)
#Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.
#Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetrisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion

===14 juni 2010===
#Omzetting van histidine naar histamine (histidine zonder CO2) (structuren gegeven)
#Welk biomimetrisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)
#Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit

===11 juni 2010===
#Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat
#Vetzuursynthese
#Radicale ortho-para-koppeling

===September 2009===
#DOPA en DOPAMINE
#Synthese inositolen
#Stereospecificiteit LADH

===12 juni 2009===
#Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?
#Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie
#Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan

===4 september 2008===
#De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.
#De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep

===17 juni 2008===
#Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt
#Fructose: fisher => hawordth omzetting
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD

===19 juni 2007===
#Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)
#Fructose fisher gegeven, geef haworth
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2) leg uit + geef structuur van FAD

===12 juni 2006===
#Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties
#Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?
#Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg

===12 juni 2006===
#Decarboxylatie van een aminozuur
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2): leg uit + geef structuur van FAD
#Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit

Chemie Van Natuurproducten

2019-06-05T16:32:00Z

Elisevanvyve: /* 21 juni 2018 NM */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==

==Examenvragen==
===4 september 2018 NM===
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 8-ring ipv een 5-ring
#Hoe zou glutathione met dit molecule reageren?
#Wat zijn inositolen? + geef de biosynthese

===21 juni 2018 NM===
#Stetter-reagens
#NAD+/NADH reductie
#biosynthese inositol
[[Bestand:Knipsel.jpg]]

===21 juni 2018 VM===
#vorming 8 ring met pyridoxaal fosfaat
#ringsluiting van polyketide en de synthese van een polyketide geven
#stereospecifieke aanval bij reductie met NADH

===19 juni 2018===
#bespreek synthese humuleen
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2

===15 juni 2018===
#Geef een mogelijk reactie mechanismen van molecule A naar B. Hoe zou molecule A biosynthetisch gemaakt kunnen worden. (A was een polyketide gemaakt aan de hand van een starter unit uit het deel 'other starter units')
#Deaminatie van tryptofaan. (m.b.v. pyridoxaalfosfaat)
#Oxidatie van een gegeven molecule m.b.v. NAD+.

===11 juni 2018 voormiddag===
#Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat)
#Oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring
#Bespreek antioxiderende werking van vitamine C

===21 juni 2017 namiddag===
#hoe gebeurt volgende reactie (Stetter) + geef reactiemechanisme
#reactievergelijking aanvullen: molecule + NAD+ --> ? (oefening zoals die van appelzuur met NAD+)
#bespreek biosynthese van inositolen en wat zijn inositolen

===21 juni 2017 voormiddag===
#bespreek synthese humuleen
#bespreek antioxiderende werking van glutathion adhv H2O2
#oefening van ornithine naar hygrine maar dan een 7-ring ipv een 5-ring

===20 juni 2017 namiddag===
# Welk biomimetisch reagens werd er gebruikt bij deze synthese? (Stetter, bijvraag over zwak zure proton en functie van thiaminepyrofosfaat
# een oefening van hoe je een L-aminozuur omzet naar een D-aminozuur (met pyridoxaalfosfaat)
# geef 2 manieren waar we de biosynthese van acetoacetyl CoA gezien hebben (bijvraag: waar hebben we deze reacties gezien)

===20 juni 2017 voormiddag===
# oefening van polyketiden
# gegeven structuur omvormen m.b.v. pyridoxaalfosfaat
# oefening zoals die van appelzuur met NAD+ maar met een andere gegeven structuur (COOH groep vervangen door benzeenring, maar dit komt op hetzelfde neer).

===16 juni 2017===
# Vorming humuleen vanuit farnesylpyrofosfaat
# Reactie met glutathion (met Michaelacceptor C=C-C=O)
# Antioxidante werking van vitamine C

===13 juni 2017===
# Leg de werking van ascorbinezuur uit (vitamine C dus)
# Oefening gebaseerd op de theorie van de synthese uit ornithine en hygrine maar dan met een zesring ipv een vijfring.
# Stetteroefening.

===12 juni 2017===
# een oefening "met welk biomemtisch reagens gebeurt deze reactie" da was van 1 ring naar 2 ringen dus me stetter
# tweede oefening was van een aminozuur met een keten me een O in en een NH2 naar een 7ring (leek op ornithine naar hygrine) en da was mbv pyrodoxalfosfaat en ook claisen ester condensatie
# theorie: leg het anti-oxidans van vitamine C uit

===12 juni 2015===
#leg de werking van vitamine C uit als antioxidans
#Leg uit hoe humuleen gevormd wordt uit farnesylfosfaat
#Oefening gebaseerd is op de theorie van de synthese uit ornithine maar dan met een zevenring ipv een vijfring.

===20 agustus 2013===
#Terpenen: een gegeven molecule naar een nader molecule, geef het reactiemechanisme
#Oxidaite van een gegeven molecule met NAD+
#Geef 2 manieren om aceto-acetyl CoA te maken

===19 juni 2013===
#Met welk biomimetrisch reagens kun je volgende reactie uitvoeren? Schrijf een mogelijk reactie mechanisme uit
#Hoe reageert glutathion met onderstaande molecule
#Bespreek de synthese van vitamine C

===17 juni 2013===
#In de natuur wordt Caryophylleen gemaakt met behulp van farnesylpyrofosfaat. Werk een mogelijk reactiemechanisme uit tot het bekomen van dit product.(de structuur formule van farnesylpyrofosfaat werd niet gegeven)
#Werk het mechanisme uit en becommentarieer. (Oplossing: met behulp van pyrodoxaal fosfaat)
#Bespreek de antioxidatieve werking van vitamine C

===14 juni 2013===
#Hoe glutathion met een bepaald vaag molecule reageert
#2 manieren om acetoacetyl CoA te vormen
#Polyketiden: ge moet weten dat dat via de mechanisme van vetzuursynthese aangemaakt werd en dan moest ge nog mechanisme van dat polyketide naar een ander gegeven molecule schrijven, het was aldolcondensatie.

===15 juni 2012 (namiddag)===
#Oefening met stetter reagens. Welk molecule bootst stetter na en voor wat wordt dit in de natuur gebruikt.
#Racematie met pyridoxalfosfaat uitleggen en mechanisme uitschrijven voor gegeven moleculen. Voorwat pyridoxalfosfaat gebruikt wordt in de natuur.
#Mechanisme antioxidans van vitamine C uitleggen. Hoe wordt dit gemaakt.

===15 juni 2012 (voormiddag)===
#Structuur van humuleen gegeven. Geef de biosynthese van humuleen, vertrekkende van farnesylfosfaat
#Gegeven: Hoe reageert glutathione met deze verbinding?
#Geef de 2 biosynthesewegen die in de cursus gezien zijn voor acetoacetyl-CoA

===20 juni 2011 (namiddag)===
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomeer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH van 2-butaton en pyruvaat (+ appelzuur)
#Leg mechanisme van de anti-oxidantie werking uit van vitamine C. Geef ook de biosynthese.
#Geef een mogelijk mechanisme voor volgende reactie HOOC-(C=O)-C-C-C-(C=O)-C=C  (biomimetrisch reagens en Et3N)  1,4 cycloheptadion

===14 juni 2010===
#Omzetting van histidine naar histidine zonder CO2 (structuren gegeven)
#Welk biomimetrisch reagens zou je gebruiken, en wat zou een mechanisme kunnen zijn? (stetter)
#Leg het mechanisme van de anti-oxidantie werking van vitamine C uit

===11 juni 2010===
#Omzetting van L-AZ naar D-AZ mbv pyridoxaalfosfaat
#Vetzuursynthese
#Radicale ortho-para-koppeling

===September 2009===
#DOPA en DOPAMINE
#Synthese inositolen
#Stereospecificiteit LADH

===12 juni 2009===
#Becommentarieer op mechanistische wijze de volgende reactie (vul de nodige reagentia zelf aan). In welke biosynthese is deze reactie belangrijk?
#Schrijf het mechanisme op van de volgende reactie
#Bespreek de structuur van fosfatidylcholine en geef de biosynthese ervan

===4 september 2008===
#De structuren van ornitine en hygrine waren gegeven en je moest heel de reactieweg geven.
#De 4e stap van de purine synthese was gegeven, begin- en eindproduct en hij moest zeggen hoe de reactie verliep

===17 juni 2008===
#Bespreek decarboxylatie van phosphadityl serine naar phosphadityl ethanolamine (pyridoxalfosfaat). Ge kreeg de tekening van die molecules, hem vroeg dan de naam, vroeg ook nog achter choline en wat dat doet, hoe ge dat maakt
#Fructose: fisher => hawordth omzetting
#Welk van deze 2 verbindingen geven een enkel enantiomer? (enantioselectieve reactie: chiraal product) was reductie met NADH, van 2-butanon en pyruvaat. Hij vroeg ook nog hoe ge bv appelzuur oxideert met NAD

===19 juni 2007===
#Merhylering, waardoor gebeurt het en leg uit (SAM)
#Fructose fisher gegeven, geef haworth
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2) leg uit + geef structuur van FAD

===12 juni 2006===
#Omzetting van een ketocarbonzuur is AZ, hoe gaat dit in zijn werk in de cel, met welke reagentia, geef structuur + reacties
#Hoe worden verzadigde vetzuren opgebouwd in de natuur?
#Hoe wordt zuurstof in de cel getransporteerd, geef structuur + uitleg

===12 juni 2006===
#Decarboxylatie van een aminozuur
#R-C-C-COSCoA  R-C=C-COSCoA (mbv FAD => FADH2): leg uit + geef structuur van FAD
#Welk molecule zorgt voor spontane membraanvorming: geef structuur en leg uit

Veredeling en Biotechnologie

2019-01-29T11:01:48Z

Elisevanvyve: /* 17 januari 2019 */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.

==Examenvragen==
===28 januari 2008===
#Vraag 1:
##Hardy-Weinberg
##genetische winst
##cytoplasmatische mannelijke steriliteit
##RNase
##transgressieve segregatie
##monosoom
##chimeer
##parthenogenie
##algemene combinatiegeschiktheid
##inteeltdepressie
#Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen
#Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploÃ¯die en autotetraploÃ¯die
#Bestendigheid: hoe bekomen?

===23 januari 2009===
====DIER====
#Vraag 1:
##Fokwaardeschatting
##SNP
##Recombinatiefractie
#Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening metÂ : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)
====PLANT====
#Vraag 1:
##Allelfrequentie
##Recurrente ouder
##Specifieke combinatiegeschiktheid
##Trisoom
##Insectenbestuiver
##QTL
#Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.
#Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)

===21 september 2009===
#Vraag 1:
##Overerfbaarheid
##SNP
##Koppelingsanalyse
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Antherencultuur
##Heterozygotie
##Inteeltdepressie
##Cultivar
##Monosoom
#(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschemaâ€™s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld.Â
#(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus.Â
#(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploÃ¯diegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiÃ«nt bij alloploÃ¯den als autoploÃ¯den?

===24 januari 2013===
====DIER====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##Fokwaarde
##Allelfrequentie
#musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##AFLP
##Heterozygositeit
##CoÃ«volutie
##PrefertilisatiebarriÃ¨re
##Genetische vooruitgang
#Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak.Â
#Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.

===23 januari 2014===
====DIERÂ ====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Heterozygoot (ivm merkers)
##AFLP
##...
#Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven.Â
#Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken.Â
#CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.
====DIER====
#Vraag 1:
##Zuivere lijn
##Bulmer effect
#Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Multitlijnveredeling(ivm merkers)
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Effectief aantal allelen
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Wat maakt een cultivar bestendig?Â
#Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken?Â
#Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.
====DIER====
#Vraag 1:
##Inteeltdepressie
##Stamboek
#Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Dominante merker
##CMS
##Transgressieve segregatie
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters?Â
#Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren.Â
#Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.

====DIER====
#Vraag 1:
##Fokdoel
##Heterosis
#Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Merkerdensiteit
##Genetisch recurrente selectie
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploÃ¯de of een autotetraploÃ¯de?Â
#Leg schema uit: synthetische cultivarÂ
===27 januari 2015===
====DIER====
#begrippen
##selectierespons
##multiplex PCR
##stressgen
#Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?
====PLANT====
#Begrippen
##QTL
##merkerdensiteit
##isolijn
##specifieke combinatiegeschiktheid
#Vragen
##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar.
##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)

===21 januari 2016===
====PLANT====
#woordjes
##dominante merker
##simmulariteitscoÃ«fficient
##algemene recombinatiegeschiktheid
##fenotypische recurrente selectie
#vragen
##bestendigheid realiseren hoe?
##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap
##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur
====DIER====
#Genomic selection
##op welk dier en welke eigenschap
##waarom
##hoe
#PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld
===14 januari 2016===
====PLANT====
SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie
Tekening van inteelt bij maïs
De vraag van tarwe, bulk, en single-seed
====DIER====
#Veredelings- en rotatiekruising
#Genetische test voor vruchtbaarheid maken

===14 januari 2016 (2)===
====PLANT====
#heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP
#wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?
# mondeling bespreking over artikel
#verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)
====DIER====
#schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?
#hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.

===31 januari 2017===
====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*CentiMorgan
#*SNP
#*genotype recurrente selectie
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?
#Artikel
#Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.
#Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?

===21 augustus 2017 NM ===

====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*aantal effectieve alleen
#*BSA (bulk segregant analysis)
#*recurrente ouder
#*isolijn
#Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?
#Artikel
#Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Vermeerderingspiramide
#Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.

=== 23 januari 2017 ===

====PLANT (Reeks 8) ====

Begrippen:

*AFLP
*Pre-fertilisatiebarrières
*Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)
*...

Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.

Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 27 augustus 2018 ===

====PLANT ====

Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden

*Apomixis
*Specifieke Combinatie Geschiktheid
*Merkerdensiteit

Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers

Vraag 3: Artikel

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 17 januari 2018 ===
====Plant====
# Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)
# Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?
# Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.
# Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?

====Dier====
# Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.
# Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?

=== 17 januari 2019 VM===
====DIER====
#Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?
#Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?

====PLANT====
Mondeling
#Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?
Schriftelijk
#Dominantie epistasie
#Triploid block
#Simple QTL

===17 januari 2019 NM===
====DIER====
#Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen
#Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren
====PLANT====
#Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen
#Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan
#Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL
#Leg solanaceae-type self incompatibility uit

Veredeling en Biotechnologie

2019-01-29T11:01:38Z

Elisevanvyve: /* 17 januari 2019 */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.

==Examenvragen==
===28 januari 2008===
#Vraag 1:
##Hardy-Weinberg
##genetische winst
##cytoplasmatische mannelijke steriliteit
##RNase
##transgressieve segregatie
##monosoom
##chimeer
##parthenogenie
##algemene combinatiegeschiktheid
##inteeltdepressie
#Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen
#Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploÃ¯die en autotetraploÃ¯die
#Bestendigheid: hoe bekomen?

===23 januari 2009===
====DIER====
#Vraag 1:
##Fokwaardeschatting
##SNP
##Recombinatiefractie
#Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening metÂ : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)
====PLANT====
#Vraag 1:
##Allelfrequentie
##Recurrente ouder
##Specifieke combinatiegeschiktheid
##Trisoom
##Insectenbestuiver
##QTL
#Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.
#Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)

===21 september 2009===
#Vraag 1:
##Overerfbaarheid
##SNP
##Koppelingsanalyse
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Antherencultuur
##Heterozygotie
##Inteeltdepressie
##Cultivar
##Monosoom
#(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschemaâ€™s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld.Â
#(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus.Â
#(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploÃ¯diegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiÃ«nt bij alloploÃ¯den als autoploÃ¯den?

===24 januari 2013===
====DIER====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##Fokwaarde
##Allelfrequentie
#musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##AFLP
##Heterozygositeit
##CoÃ«volutie
##PrefertilisatiebarriÃ¨re
##Genetische vooruitgang
#Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak.Â
#Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.

===23 januari 2014===
====DIERÂ ====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Heterozygoot (ivm merkers)
##AFLP
##...
#Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven.Â
#Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken.Â
#CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.
====DIER====
#Vraag 1:
##Zuivere lijn
##Bulmer effect
#Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Multitlijnveredeling(ivm merkers)
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Effectief aantal allelen
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Wat maakt een cultivar bestendig?Â
#Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken?Â
#Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.
====DIER====
#Vraag 1:
##Inteeltdepressie
##Stamboek
#Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Dominante merker
##CMS
##Transgressieve segregatie
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters?Â
#Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren.Â
#Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.

====DIER====
#Vraag 1:
##Fokdoel
##Heterosis
#Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Merkerdensiteit
##Genetisch recurrente selectie
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploÃ¯de of een autotetraploÃ¯de?Â
#Leg schema uit: synthetische cultivarÂ
===27 januari 2015===
====DIER====
#begrippen
##selectierespons
##multiplex PCR
##stressgen
#Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?
====PLANT====
#Begrippen
##QTL
##merkerdensiteit
##isolijn
##specifieke combinatiegeschiktheid
#Vragen
##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar.
##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)

===21 januari 2016===
====PLANT====
#woordjes
##dominante merker
##simmulariteitscoÃ«fficient
##algemene recombinatiegeschiktheid
##fenotypische recurrente selectie
#vragen
##bestendigheid realiseren hoe?
##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap
##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur
====DIER====
#Genomic selection
##op welk dier en welke eigenschap
##waarom
##hoe
#PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld
===14 januari 2016===
====PLANT====
SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie
Tekening van inteelt bij maïs
De vraag van tarwe, bulk, en single-seed
====DIER====
#Veredelings- en rotatiekruising
#Genetische test voor vruchtbaarheid maken

===14 januari 2016 (2)===
====PLANT====
#heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP
#wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?
# mondeling bespreking over artikel
#verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)
====DIER====
#schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?
#hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.

===31 januari 2017===
====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*CentiMorgan
#*SNP
#*genotype recurrente selectie
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?
#Artikel
#Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.
#Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?

===21 augustus 2017 NM ===

====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*aantal effectieve alleen
#*BSA (bulk segregant analysis)
#*recurrente ouder
#*isolijn
#Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?
#Artikel
#Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Vermeerderingspiramide
#Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.

=== 23 januari 2017 ===

====PLANT (Reeks 8) ====

Begrippen:

*AFLP
*Pre-fertilisatiebarrières
*Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)
*...

Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.

Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 27 augustus 2018 ===

====PLANT ====

Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden

*Apomixis
*Specifieke Combinatie Geschiktheid
*Merkerdensiteit

Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers

Vraag 3: Artikel

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 17 januari 2018 ===
====Plant====
# Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)
# Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?
# Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.
# Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?

====Dier====
# Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.
# Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?

=== 17 januari 2019 VM===
====DIER====
#Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?
#Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?

====PLANT====
Mondeling
#Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?
Schriftelijk
#Dominantie epistasie
#Triploid block
#Simple QTL

===17 januari 2019===
====DIER====
#Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen
#Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren
====PLANT====
#Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen
#Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan
#Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL
#Leg solanaceae-type self incompatibility uit

Veredeling en Biotechnologie

2019-01-29T11:01:18Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.

==Examenvragen==
===28 januari 2008===
#Vraag 1:
##Hardy-Weinberg
##genetische winst
##cytoplasmatische mannelijke steriliteit
##RNase
##transgressieve segregatie
##monosoom
##chimeer
##parthenogenie
##algemene combinatiegeschiktheid
##inteeltdepressie
#Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen
#Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploÃ¯die en autotetraploÃ¯die
#Bestendigheid: hoe bekomen?

===23 januari 2009===
====DIER====
#Vraag 1:
##Fokwaardeschatting
##SNP
##Recombinatiefractie
#Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening metÂ : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)
====PLANT====
#Vraag 1:
##Allelfrequentie
##Recurrente ouder
##Specifieke combinatiegeschiktheid
##Trisoom
##Insectenbestuiver
##QTL
#Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.
#Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)

===21 september 2009===
#Vraag 1:
##Overerfbaarheid
##SNP
##Koppelingsanalyse
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Antherencultuur
##Heterozygotie
##Inteeltdepressie
##Cultivar
##Monosoom
#(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschemaâ€™s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld.Â
#(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus.Â
#(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploÃ¯diegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiÃ«nt bij alloploÃ¯den als autoploÃ¯den?

===24 januari 2013===
====DIER====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##Fokwaarde
##Allelfrequentie
#musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##AFLP
##Heterozygositeit
##CoÃ«volutie
##PrefertilisatiebarriÃ¨re
##Genetische vooruitgang
#Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak.Â
#Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.

===23 januari 2014===
====DIERÂ ====
#Vraag 1:
##Vermeerderingspiramide
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Heterozygoot (ivm merkers)
##AFLP
##...
#Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven.Â
#Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken.Â
#CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.
====DIER====
#Vraag 1:
##Zuivere lijn
##Bulmer effect
#Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen.Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Multitlijnveredeling(ivm merkers)
##Algemene combinatiegeschiktheid
##Effectief aantal allelen
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Wat maakt een cultivar bestendig?Â
#Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken?Â
#Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.
====DIER====
#Vraag 1:
##Inteeltdepressie
##Stamboek
#Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Dominante merker
##CMS
##Transgressieve segregatie
##InteeltcoÃ«fficiÃ«nt
#Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters?Â
#Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren.Â
#Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.

====DIER====
#Vraag 1:
##Fokdoel
##Heterosis
#Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is?Â
====PLANT====
#Vraag 1:
##Merkerdensiteit
##Genetisch recurrente selectie
##SimilariteitscoÃ«fficiÃ«nt
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploÃ¯de of een autotetraploÃ¯de?Â
#Leg schema uit: synthetische cultivarÂ
===27 januari 2015===
====DIER====
#begrippen
##selectierespons
##multiplex PCR
##stressgen
#Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?
====PLANT====
#Begrippen
##QTL
##merkerdensiteit
##isolijn
##specifieke combinatiegeschiktheid
#Vragen
##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar.
##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)

===21 januari 2016===
====PLANT====
#woordjes
##dominante merker
##simmulariteitscoÃ«fficient
##algemene recombinatiegeschiktheid
##fenotypische recurrente selectie
#vragen
##bestendigheid realiseren hoe?
##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap
##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur
====DIER====
#Genomic selection
##op welk dier en welke eigenschap
##waarom
##hoe
#PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld
===14 januari 2016===
====PLANT====
SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie
Tekening van inteelt bij maïs
De vraag van tarwe, bulk, en single-seed
====DIER====
#Veredelings- en rotatiekruising
#Genetische test voor vruchtbaarheid maken

===14 januari 2016 (2)===
====PLANT====
#heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP
#wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?
# mondeling bespreking over artikel
#verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)
====DIER====
#schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?
#hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.

===31 januari 2017===
====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*CentiMorgan
#*SNP
#*genotype recurrente selectie
#Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?
#Artikel
#Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.
#Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?

===21 augustus 2017 NM ===

====PLANT (mondeling)====
#woordjes:
#*aantal effectieve alleen
#*BSA (bulk segregant analysis)
#*recurrente ouder
#*isolijn
#Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?
#Artikel
#Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.

====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====
#Vermeerderingspiramide
#Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.

=== 23 januari 2017 ===

====PLANT (Reeks 8) ====

Begrippen:

*AFLP
*Pre-fertilisatiebarrières
*Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)
*...

Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.

Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 27 augustus 2018 ===

====PLANT ====

Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden

*Apomixis
*Specifieke Combinatie Geschiktheid
*Merkerdensiteit

Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers

Vraag 3: Artikel

Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)

====DIER====

Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?

Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.

=== 17 januari 2018 ===
====Plant====
# Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)
# Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?
# Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.
# Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?

====Dier====
# Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.
# Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?

=== 17 januari 2019 ===
====DIER====
#Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?
#Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?

====PLANT====
Mondeling
#Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?
Schriftelijk
#Dominantie epistasie
#Triploid block
#Simple QTL

===17 januari 2019===
====DIER====
#Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen
#Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren
====PLANT====
#Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen
#Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan
#Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL
#Leg solanaceae-type self incompatibility uit

Algemene Natuurkunde II

2019-01-28T17:20:17Z

Elisevanvyve: /* Vakinformatie */

[[Categorie:Bachelor Chemie]]
[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Vervolgvak op Algemene natuurkunde I. Vanaf het academiejaar 2009-2010 gedoceerd door prof Wübbenhorst.('''Let dus op, de oudere vragen komen van prof. Janssen''') Het is geen jaarvak meer, enkel examen in januari dus. Het betreft een mondeling examen met schriftelijke voorbereiding.

[[Categorie:Bachelor Chemie]]
[[Categorie:Bachelor Biochemie]]

==Examenvragen==

===28 januari 2019 NM===
#Beweging van een geladen deeltje in een magneetveld en massaspectrometer en cyclotron uitleggen (met formules)
#Straling van een zwart lichaam
#Condensator gevuld met water, bereken oppervlakte lading en E
#Dikte van een micaplaatje berekenen (proef van Young)

===28 januari 2019 VM===
#Wet van Faraday, Wet van Lenz, transformator uitleggen +Foucaultstromen
#Polarisatietoesten van em-straling + verstrooiing, absorptie, breking
#Twee bolschillen: potentiaalverschil R1 en R2 en capaciteit
#Solenoïde (zelfinductie en weerstand). Energie, vermogen, .. bepalen

===18 januari 2019 NM===
#Wet van Biot-Savart vergelijken met wet van Coulomb, + magnetische inductie rond oneindig lange draad geven
#Straling van een zwart lichaam
#Condensator waarvan de afstand tussen de platen met 20% verminderd wordt
#Er zijn twee verschillende stukken glas, met lengte l1 = 4 micrometer, l2 = 3,5 micrometer, n1 = 1,4, n2 = 1,6. Je stuurt er een lichtstraal door met golflengte lambda = 600 nm. Ze komen in dezelfde fase toe op de stukken glas, loodrecht, en gaan dan door naar een scherm. Wat is het faseverschil tussen de twee golven wanneer ze op het scherm komen?

===18 januari 2019 VM===
#Bespreek de wet van Biot-Savart, leg de gelijkenissen en verschillen t.o.v. de wet van coulomb uit (B(r) en E(r) vergelijken).Leidt de magnetische inductie B(r) rond een oneindig lange draad of m.b.v. de wet van Biot-Savart.
#Leg de temperatuursafhankelijkheid van de elektrische weerstand uit. NTC en PTC gedrag uitleggen. Normale metallische geleider vergelijken met een supergeleider. Bandenmodel voor kristalijne stoffen beschrijven. Kenmerken van een intrinsieke halfgeleider VS een gedopeerde halfgeleider. meerheids- en minderheidsladingdrager uitleggen. Beschrijf de temperatuursafhankelijkheid van intrinsieke en gedopeerde halfgeleiders aan de hand van een grafiek.
#Condensator waarvan de afstand tussen de platen met 20% verminderd wordt.
#Twee lichtstralen met golflengte 600 nm in de lucht zijn in fase wanneer ze invallen op twee rechthoekige stukjes glas. het eerste stuk heeft lengte=4µm en brekingsindex n=1,4 . Het tweede stuk heeft lengte=3,4µm en n=1,6. Achter de stukjes glas staat een scherm. wat is het faseverschil (in graden) waarmee ze aankomen?

===17 januari 2019 NM===
#Wet van Faraday en Lens bespreken, transformator + toepassing, foucaultstromen
#Laser, straling van een zwart lichaam (bijvraag: grafiek tekenen I(lamda) (brede klokvorm voor zwart lichaam vs dunne voor laser)
#Twee bolschillen: potentiaal en capaciteit
#Twee glasplaatjes met verschillende lengte en n. bepaal het faseverschil van twee loodrechte stralen (initieel in fase)

===17 januari 2019 VM===
#Wet van Biot-Savart vergelijken met wet van Coulomb, + magnetische inductie rond oneindig lange draad geven
#straling van een zwart lichaam
#Dikte micaplaatje proef van Young
#Condensator waarvan de afstand tussen de platen met 20% verminderd wordt

===24 augustus 2018===
#halfgeleiders + pn-juncite
#wet Biot-Savart toepassen op oneindig lange rechte draad
#condensator gevuld met water, oppervlakte lading en E berkekenen
#dikte miccaplaatje met proef van Young bepalen

===22 januari 2018 vm===
Zelfde als 15 januari 2018

===19 januari 2018 vm===

Theorie:
#De wet van Biot-Savart
#Verschil tussen intrinsieke en gedopeerde halfgeleider + pn-junctie
Oefeningen:
#2 bolschillen met lading q en -q, straal r1 en r2, bereken het potentiaalverschil en capaciteit.
#er zijn twee verschillende stukken glas, met lengte l1 = 4 micrometer, l2 = 3,5 micrometer, n1 = 1,4, n2 = 1,6. Je stuurt er een lichtstraal door met golflengte lambda = 600 nm. Ze komen in dezelfde fase toe op de stukken glas, loodrecht, en gaan dan door naar een scherm. Wat is het faseverschil tussen de twee golven wanneer ze op het scherm komen?

===18 januari 2018 vm===

Zie examen 17 januari 2017

Er werd ook nog gevraagd naar ferromagnetisme bij vraag 1

===15 januari 2018 nm===
Theorie:
#Beweging van een geladen deeltje in een magneetveld + massaspectrometer en cyclotron uitleggen
#RLC-keten uitleggen
Oefeningen:
#We weten van een micaplaatje dat het tussen de 6 en de 7 µm dik is. Om de dikte exact te bepalen gebruiken we de proef van Young, waarbij we het micaplaatje voor één van de spleten zetten (n=1,582). Er verschijnt een centraal maximum wanneer we golflengte 539 nm gebruiken. Wat is dus de precieze dikte van het micaplaatje?
#De ruimte tussen de platen tussen een condensator wordt helemaal opgevuld met zuiver water. Het dipoolmoment van een watermolecule is 6.10x10^-30Cm. Water heeft een dichtheid van 1.00g/cm³ en een molaire massa van 18g. De diëlektrische constante van water is 80. Het getal van Avogadro is 6.02x10^23.
#* Veronderstel dat de condensator zodanig opgeladen zou kunnen worden dat alle elektrische dipolen perfect uitgelijnd zijn met het elektrisch veld. Wat zou dan de geïnduceerde oppervlakteladingsdichtheid aan het wateroppervlak zijn?
#* Veronderstel dat de condensator zodanig opgeladen wordt, dat die geïnduceerde oppervlakteladingsdichtheid één duizendste bedraagt van de hierboven berekende waarde. Hoe groot is dan het elektrisch veld in de condensator?

===20 januari 2017 nm===
Theorie:
#Polarisatie toestanden
#Gedopeerde halfgeleiders vs zuivere halfgeleiders en de PN-junctie
Oefeningen:
#2 bolschillen. Potentiaal verschil en Electrisch veld berekenen van R naar oneindig.
#Solenoïde: magnetisch kracht na lange tijd en wanneer is deze half zo groot? (vermogen berekenen en hoeveel procent van het vermogen heeft het de 2e dan verbruikt)

===20 januari 2017 vm===
Theorie:
#Rlc keten uitleggen
#Wet van ampere (tijdsafhankelijk en onafhankelijk)
Oefeningen:
#een bol met 2 stralen en een elektrisch veld waarvan de lading en de potentiaal berekend moeten worden
#de oefening met licht dat door een gat moet op een hoogte van 50mm, gat zelf is 10mm groot en staat op 30 cm van de bron, wat zijn de golflengtes die aankomen bij het gat?

===19 januari 2017 nm===
helemaal hetzelfde als de voormiddag

===19 januari 2017 vm===
Theorie:
#Halfgeleiders (+grafieken temperatuursafhankelijkheid van n-en p-types)
#Biot-savart (eindig en oneindig)

Oefeningen:
#2 bolschillen: potentiaalverschil en capaciteit berekenen
#2 stukjes glas met lichtstraal (zelfde golflengte) erdoor: faseverschil berekenen

=== 17 januari 2017===
Zie examen 18 januari 2016.
#Magnetisatie en magnetische suceptibiliteit
#LASER
Bijvragen bij de werking van de LASER: wat zijn de eigenschappen van laserlicht? Wat zorgt voor de overgang van niveau 2 naar niveau1?

oefeningen
#oefening van condensator waarvan afstand tussen de platen met 20% verminderd wordt
#micaplaatje

=== 16 januari 2017===
Theorie:
#RLC-keten
#Beschrijf de beweging van een geladen deeltje in een magnetisch veld, cyclotron en massaspectrometer
Oefeningen:
#mica
#water in condensator

=== 18 januari 2016===
Theorie:
#Magnetisatie en magnetische suceptibiliteit
#LASER
Oefeningen:
#oef van condensator waarvan afstand tussen de platen met 20% verminderd wordt
#oef van het mica plaatje met dikte tussen 6 en 7 micro meter

=== 15 januari 2016 NM===
Theorie:
#Magnetisatie en magnetische suceptibiliteit
#LASER
Oefeningen:
#oef van condensator waarvan afstand tussen de platen met 20% verminderd wordt
#oef van het mica plaatje met dikte tussen 6 en 7 micro meter

=== 15 januari 2016 VM===
Theorie:
#laser
#magnetisatie en magnetische susceptibiliteit

Oefeningen:
#mica plaatje
#RC keten V1, V2 en V3 bepalen plus tijd waarop V het gemiddelde is van 2&3

=== 14 januari 2016 ===
Theorie:
#zuivere vs gedopeerde halfgeleiders (nog iets extra, we moesten nog een grafiek geven die in de slides staan maar niet in het boek: elektrische geleiding ifv temperatuur, maja dat was gewoon een bijvraag) + pn-junctie
#Geef de wet van Biot Savart en pas dit toe op een oneindig lange stroomvoerende draad

Oefeningen:
#2 geleidende bolschillen met zelfde middelpunt, verschillende stralen (R1, R2, respectievelijk kleinste en grootste). Op de kleinste zit een lading q, op de grootste een lading -q. Bepaal het potentiaalverschil tussen R2 en R1. Bepaal ook de capaciteit van deze condensator.
#er zijn twee verschillende stukken glas, met lengte l1 = 4 micrometer, l2 = 3,5 micrometer, n1 = 1,4, n2 = 1,6. Je stuurt er een lichtstraal door met golflengte lambda = 600 nm. Ze komen in dezelfde fase toe op de stukken glas, loodrecht, en gaan dan door naar een scherm. Wat is het faseverschil tussen de twee golven wanneer ze op het scherm komen?
(check oefeningen van examen 10 juni 2011)

===11 januari 2016===
Theorie:
#Wet van Ampère (uitbreiding) en daarbij ook de B rond een gesloten kromme.
#RLC uitleggen

Oefeningen:
# Bol met bolschil errond en zo diffractie, door da scherm met 200 lijnen / mm en dan een vierkantje op het waarnemingsscherm. (welke golflengten gaan door da vierkantje?)
===16 januari 2015===
Theorie:
#magnetisatie
#LASER
Oefeningen:
#RC-keten en V1,V2,V3 bepalen
#mica

===15 januari 2015===
Theorie:
#Wet van Ampère
#RLC in serie
Oefeningen:
#een bol en een bolschil, elektrisch veld en stralen gegeven en dan moest je de lading en de potentiaal aan het opp van de bol berekenen
#spleet, berekenen welke golflengtes er in het vierkant vallen

===12 januari 2015===
Theorie:
#zuivere vs gedopeerde halfgeleiders + pn-junctie
#de wet van Biot-Savart en de oneindige rechte geleider afleiden.
Oefeningen:
#bolvormige condensator (V + C berekenen)
#lichtstralen van dezelfde golflengte die door 2 glasblokjes gaan, faseverschil berekenen.

===26 januari 2015===
Theorie:
#Beschrijf de beweging van een geladen deeltje in een magnetisch veld, cyclotron en massaspectrometer
#LRC-kring
Oefeningen:
#Water in condensator
#Micaplaatje

===20 januari 2014 voormiddag===
Theorie:
# Magnetisatie en magnetische susceptibiliteit.
#LASER

Oefeningen: exact zoals 10 juni 2013 (voormiddag)

=== 14 januari 2014 voormiddag ===
Exact hetzelfde examen als 14 juni 2013. Zelfs de oefeningen waren dezelfde.

=== 19 juni 2013 namiddag ===
Exact hetzelfde examen als 10 juni 2013 namiddag. Zelfs de oefeningen waren dezelfde

=== 14 juni 2013 (zowel voor- als namiddag!)===
Theorie:
#Bespreek de beweging van een geladen deeltje in een magneetveld, plus uitleg cyclotron en massaspectrometer.
#Bespreek de RLC kring

Oefeningen:
#We weten van een micaplaatje dat het tussen de 6 en de 7 Âµm dik is. Om de dikte exact te bepalen gebruiken we de proef van Young, waarbij we het micaplaatje voor één van de spleten zetten (n=1,582). Er verschijnt een centraal maximum wanneer we golflengte 539 nm gebruiken. Wat is dus de precieze dikte van het micaplaatje?
#De ruimte tussen de platen tussen een condensator wordt helemaal opgevuld met zuiver water. Het dipoolmoment van een watermolecule is 6.10x10-30Cm. Water heeft een dichtheid van 1.00g/cmÂ³ en een molaire massa van 18g. De diëlektrische constante van water is 80. Het getal van Avogadro is 6.02x1023.
#* Veronderstel dat de condensator zodanig opgeladen zou kunnen worden dat alle elektrische dipolen perfect uitgelijnd zijn met het elektrisch veld. Wat zou dan de geïnduceerde oppervlakteladingsdichtheid aan het wateroppervlak zijn?
#* Veronderstel dat de condensator zodanig opgeladen wordt, dat die geïnduceerde oppervlakteladingsdichtheid één duizendste bedraagt van de hierboven berekende waarde. Hoe groot is dan het elektrisch veld in de condensator?

=== 11 juni 2013 (zowel voor- als namiddag!)===
Theorie:
# Leg uit, wet van Ampère zowel tijds als niet tijdsafhankelijk.
# Leg RLC kring uit

Oefeningen:
# Gegeven een bol met een lading en daar rond een bolschil, samen zijn ze ongeladen maar elk apart bezitten ze een lading. Geef hiervoor de lading van de bol en zijn potentiaal aan zijn oppervlak. Gegeven zijn de stralen van de bollen en de grootte van het elektrische veld.
# Golflengten tussen 400 en 700nm worden op een diffractierooster gestuurd met 200 lijnen/mm. Waarnemingsscherm staat op 0.3m. Op dit scherm is op een afstand van 0.05m een gat geknipt, een vierkant met zijden 0.01m. Welke golflengten zullen door dit gat vallen?

=== 10 juni 2013 (namiddag)===
Theorie:
#Geef de wet van Biot Savart en pas dit toe op een oneindig lange stroomvoerende draad
#Wat is een virtueel beeld? Kan je dat vormen met een vlakken spiegel? Holle spiegel? Bolle spiegel? Welke omstandigheden?

Oefeningen:
#Dieje kubus (zie oude examenvragen)
#Iets met een RLC kring met uitzonderlijke omstandigheden, R gegeven, wat is de capaciteit en de inductie in de kring. Uitzondelijke omstandighede dus da de amplitude van uw weerstand = amplitude zelfinductie = amplitude condensator = amplitude van de bron, en ge had ook een frequentie gegeven

=== 10 juni 2013 (voormiddag)===
Theorie:
# Bespreek polarisatietechnieken (verstrooiing, dichroïsme etc...)
# Magnetisatie & magnetische susceptibiliteit

Oefeningen:
#Gegeven is een RC-kring met R=100 kOhm; C=9,40 ÂµF; en V(bron)=15,0 V. Na lang wachten (de condensator eerst helemaal laten opladen) verminderen we de afstand tussen condensatorplaten met 20%, in verwaarloosbaar tijdsinterval.
#*Bereken potentiaalverschil over de condensator vlak voor (V1) en vlak na die verandering (V2)
#*Bereken het potentiaalverschil over de condensator op lange tijd na de verandering (V3).
#*Op welk tijdstip na de verandering zal de spanning over de weerstand gelijk zijn aan het gemiddelde van V2 en V3?
#We weten van een micaplaatje dat het tussen de 6 en de 7 Âµm dik is. Om de dikte exact te bepalen gebruiken we de proef van Young, waarbij we het micaplaatje voor één van de spleten zetten (n=1,582). Er verschijnt een centraal maximum wanneer we golflengte 539 nm gebruiken. Wat is dus de precieze dikte van het micaplaatje?

=== 12 juni 2012===
Theorie:
# Wet van Ampere bespreken voor stationaire en niet stationaire stromen
# RLC kring bespreken

Oefeningen:
# Er is een kubus gegeven met zijde a die in de oorsprong ligt van het xyz assenstelsel. Er is een elektrisch veld E_(=vector) = c*x*y*i_(i_ is de eenheidsvector) en c=844 N/(C*m^2). dit elektrisch veld is evenwijdig met de x-as. hoe groot moet zijde a zijn zodat de kubus 7nC bevat?
# ?

=== 11 juni 2012===
Exact dezelfde vragen als 27 juni 2011. Zelfs de waarden bij de oefeningen waren hetzelfde.

=== 27 juni 2011===
Theorie:
# Leg uit: magnetisatie en magnetische susceptibiliteit
# Bespreek de werking van een LASER

Oefeningen:
# Gegeven is een RC-kring met R=100 kOhm; C=9,40 ÂµF; en V(bron)=15,0 V. Na lang wachten (de condensator eerst helemaal laten opladen) verminderen we de afstand tussen condensatorplaten met 20%, in verwaarloosbaar tijdsinterval. a) Bereken potentiaalverschil over de condensator vlak voor (V1) en vlak na die verandering (V2). b) Bereken het potentiaalverschil over de condensator op lange tijd na de verandering (V3). c) Op welk tijdstip na de verandering zal de spanning over de weerstand gelijk zijn aan het gemiddelde van V2 en V3?
# We weten van een micaplaatje dat het tussen de 6 en de 7 Âµm dik is. Om de dikte exact te bepalen gebruiken we de proef van Young, waarbij we het micaplaatje voor Ã©Ã©n van de spleten zetten (n=1,582). Er verschijnt een centraal maximum wanneer we golflengte 539 nm gebruiken. Wat is dus de precieze dikte van het micaplaatje?

=== 17 juni 2011 ===
Theorie:
# Bespreek de beweging van een geladen deeltje in een magneetveld, plus uitleg cyclotron en massaspectrometer.
# Effectiefspanning uitleggen

=== 14 juni 2011 ===
Theorie:
# Geef wet van Biot-Savart en leid af voor een oneindig lange stroomvoerende draad
# Wat zijn mogelijke polarisatietoestanden van EM-straling? (geen polarisatietechnieken)

Oefeningen:
# Een kring met een solenoïde met 35mH en een weerstand van 0,35 Ohm, aangesloten op een batterij van 12V. Wat is de magnetische energie die de batterij heeft na een lange tijd? Hoeveel vermogen moet het batterij dan nog leveren? Na hoeveel tijd is de energie half zo groot? Wa is dan het vermogen v.d. batterij en hoeveel procent vraagt het opwekken van magnetische arbeid dan?
# Een tweespleten systeem met lambda = 500nm, d = 0,150mm en a = 30,0Âµm. Hoe vaak komen maxima voor? (enzovoort)
=== 10 juni 2011 (voormiddag) ===
Theorie:
# Wat is het verschil tussen een zuivere halfgeleider en een gedopeerde halfgeleider? geef uitleg over de pn-junctie.
# Leg uit wat een virtueel beeld is. Is het mogelijk om dit van een reëel voorwerp te bekomen bij een vlakke/holle/bolle spiegel. Onder welke omstandigheden?

oefeningen:
# Er is een kubus gegeven met zijde a die in de oorsprong ligt van het xyz assenstelsel. Er is een elektrisch veld E_(=vector) = c*x*y*i_(i_ is de eenheidsvector) en c=844 N/(C*m^2). dit elektrisch veld is evenwijdig met de x-as. hoe groot moet zijde a zijn zodat de kubus 7nC bevat?
# Je hebt een wisselspanningskring gegeven met V0 = 30,0V; omega = 314rad/s; I0=620mA ;en v=V0sin(omega*t-pi/4) en i=-I0cos(omega*t-pi/4). In de kring zit alleen nog een element X.
* identificeer dit element volledig
* door welk ander element kan je dit vervangen zodat de stroomamplitude gelijk blijft(de fase mag verschillen) en identificeer dat element. Je moet er maar 1 geven maar er zijn er 2 mogelijk.

=== 10 juni 2011 (namiddag) ===
Theorie:
# Bespreek de RLC-keten waarop een wisselspanning is aangesloten
# Wet van Ampère uitleggen (stationair en niet-stationair) Hij zegt er ook bij dat het gaat om het magneetveld rond een gesloten kromme, dus juiste formule vinden niet moeilijk

Oefeningen:
# 2 geleidende bolschillen met zelfde middelpunt, verschillende stralen (R1, R2, respectievelijk kleinste en grootste). Op de kleinste zit een lading q, op de grootste een lading -q. Bepaal het potentiaalverschil tussen R2 en R1. Bepaal ook de capaciteit van deze condensator.
# er zijn twee verschillende stukken glas, met lengte l1 = 4 micrometer, l2 = 3,5 micrometer, n1 = 1,4, n2 = 1,6. Je stuurt er een lichtstraal door met golflengte lambda = 600 nm. Ze komen in dezelfde fase toe op de stukken glas, loodrecht, en gaan dan door naar een scherm. Wat is het faseverschil tussen de twee golven wanneer ze op het scherm komen?

=== 11 juni 2010 ===
Theorie:
#Bespreek de beweging van een geladen deeltje in een magneetveld, plus uitleg cyclotron en massaspectrometer.
#Bespreek alle mogelijke polarisatie-toestanden van een EM-golf, manieren om polarisatie te bekomen niet beschrijven.

Oefeningen:
# Men laadt een condensator met een capaciteit 17mF volledig op en men koppelt hem dan los van de bron. Hierna is er een arbeid van 18,5 joule nodig om een extra lading van 13 mC van de ene plaat van de condensator naar de andere over te brengen. Wat was de EMK van de bron?
# Een spoel van 100 windingen wordt rond een cilinder gewikkeld met een doorsnede van 12 cmÂ². De cilinder is van een middenstof met Âµr = 1. Er wordt een magneetveld aangelegd van 1,6 T dat in de tijd omwisselt van de ene naar de andere richting maar altijd evenwijdig loopt met de symmetrieas van de spoel. Een weerstand van 13 Ohm wordt op de spoel aangesloten. Geef de lading die door deze weerstand stroomt.

=== 7 juni 2010 (WÃ¼bbenhorst dus) ===
Theorie:
# RLC-keten met wisselspanning uitleggen
# Wat is het verschil tussen een zuivere halfgeleider en een gedopeerde halfgeleider? geef uitleg over de pn-junctie.

Oefeningen:
# over een solenoïde met een L en een R die verbonden zijn aan een batterij. L, R en V waren gegeven en men vroeg de energie van de spoel op t= oneindig en vermogen dat de batterij moest leven
# ging over 2 stralen door glas met 2 verschillende n, met uiteindelijk de vraag: wat is het faseverschil van de 2 stralen aan het scherm achter het doorlopen van het glas?

===22 augustus 2009===
Theorie:
#Bespreek Foucaultstromen
#Effectiefspanning en effectiefstroom uitleggen

Oefeningen:
(Iemand aub?)

===17 augustus 2009===
Theorie:
#Leid een formule af voor de capaciteit van een vlakke en een cilindrische condensator
#Bespreek ferromagnetisme

Oefeningen:
#Een lading zit vast op een gegeven positie (x,y,z). Een andere lading beweegt van positie 1 (X1,Y1,Z1) naar 2 (X2,Y2,Z2). De ladingen zijn gegeven, de coordinaten ook. Hoeveel energie kost het om deze lading van positie 1 naar 2 te verplaatsen?
#Een oefening analoog aan weerkaatsing aan een zeepbel, of iets dergelijks. Opgave weet ik niet meer goed. (Iemand?)

===19 juni 2009===
Theorie:
# Vergelijk de gelijkstroom RC- en LR-kring.
# Bespreek alle mogelijke polarisatietoestanden van EM-straling. Methoden om dit te bereiken hoeven niet besproken te worden.

Oefeningen:
# We beschouwen een niet geleidende plaat van grote afmetingen. Op de ene zijde staat een positieve oppervlaktelading, op de andere zijde een negatieve (getallen gegeven uiteraard). Een proton wordt op 1mm afstand van de plaat vanuit rust losgelaten. Wat is de snelheid op 2 mm van de plaat?
# Effectiefspanning berekenen adhv. een gegeven v(t)-curve.
:[[Bestand:driehoekspanning.gif]]

===12 juni 2009===
Theorie:
# LASER.
# Wederzijdse inductie en zelfinductie.
Oefeningen:
# ?
# ?

===12 juni 2009===
Theorie:
# Geef de wet van Ampère voor stationaire stromen + voorbeeld. Leg uit welke aanpassing gedaan moet worden zodat deze wet ook geldig is voor tijdsafhankelijke stromen.
# Leg uit hoe men oscillerende .. kunt krijgen in een LC-kring.

Oefeningen:
# Een puntlading q bevindt zich op een afstand x op de middelloodlijn van een niet geleidende draad (2l) waar een homogeen verdeelde lading Q op zit. Wat is de kracht dat deze puntlading ondervindt?
# Zender op hoogte 70m, lengte van 1km en een ontvanger op hoogte x. Wat is kleinste x waar een maximum van straling invalt. Houd rekening met de rechtstreekse stralen en de gereflecteerde stralen op water.

===8 jun 2009===
Theorie:
# Leidt een formule af voor de capaciteit van een vlakke en een cilindrische condensator.
# Wat wordt er bedoeld met magnetisatie? Leg uit: relatieve permeabileit en magnetische susceptibiteit.

Oefeningen:
# Twee spoelen staan of vaste afstand van elkaar. Door de ene spoel loopt een stroom van 1A en de flux erdoor is 0.010Wb. Indien men nu een stroom van 2A door de tweede spoel stuurt, bedraagt de flux door de eerste spoel 0.012Wb.
#* Bereken de magnetische flux door de 2de spoel, gegeven dat de zelfinductie ervan gelijk is aan 0.003 (iets in die aard).
#* Bereken de wederzijdse inductiecoefficient.
#* Bereken de zelfinductie van de eerste spoel.
# Een radiogolf zendmast in punt B staat op 20km afstand van huis H. De intensiteit in H wordt gegeven door een gekende I[sup]0[/sup]. Op 100m afstand van mast B bouwt men een 2de mast A, die een hoek <math>&\X\theta \widehat{B A H}</math> is 30Â° (geen idee hoeveel het juist was).
#* Bereken de intensiteit in H.
#:[[Bestand:ANII-8.6.2009-oef2.png]]

===8 jun 2009===
Theorie:
# Bespreek RC-filters.
# Bespreek diffractie bij een oneindig lange spleet en (beknopt) bij een rechthoekige spleet.

Oefeningen:
# Twee RC-kringen gegeven, constructie van vanalle condensatoren in serie en parallel; V en R gegeven bij de ene kring; stroom door beide spanningsbronnen is gelijk; bereken Vx en R van de andere kring.
# Oneindig lange draad en in hetzelfde vlak evenwijdig ermee een vierkant. Bereken de wederzijdse inductiecoëfficiënt (afstand draad tot vierkant gegeven + lengte zijde vierkant).

===16 jun 2008===
Theorie:
# Bespreek de beweging van een geladen deeltje in een magneetveld. Leg, bij wijze van voorbeeld, de werking uit van een massaspectrometer of van een cyclotron.
# Bespreek de mogelijke polarisatietoestanden van em-straling (niet de methodes om tot polarisatie te komen)

Oefeningen:
# Condensator ( C= 17 microF) wordt een een onbekende batterij geschakeld en volledig opgeladen. Dan losgekoppeld. Er is aan arbeid 18,5J nodig om een bijkomende lading van 13,0 mC van de ene plaat naar de andere te verplaatsen. Bepaal emk van de batterij.
# spoel met 100 windingen wordt rond een metalen cilinder gewikkeld met een doorsnede van 12 cmÂ² en mu r = 1. Er wordt een weerstand over de spoel geplaatste van 13 ohm. Er is een magneet veld die door de spoel loopt (parallel met de as). Dit magneetveld varieert gedurende een bepaalde tijd van 1,6T in de ene richting naar 1,6T in de andere richting. Hoeveel lading loopt er in die tijd door de weerstand.

===16 jun 2008===
Theorie:
# Bespreek een geleider in elektrostatisch evenwicht.
# Bespreek hoe men een oscillerende ... kan maken in een LC-kring. (LC-kring uitleggen dus)

Oefeningen:
# 2 draden in tegengestelde stroomzin, stroom neemt lineair toe van 0 naar 100A in 7s, bereken emk in de lus tussen die draden
# een ongepolariseerd licht kan worden opgedeeld in een deel gepolariseerd en een deel ongepolariseerd, intensiteiten mag je optellen, een polarisator wordt 360Â° gedraaid, men merkt dat op een bepaald punt de intensiteit 5 keer groter is, hoeveel procent is maakt de gepolariseerde golf uit?

===13 jun 2008===
Theorie:
# Bespreek de begrippen magnetisatie en magnetische susceptibiliteit.
# Bespreek de proef van Young.

Oefeningen:
# iets met een geleidende bol en daarrond een geleidende bolschil en dan een elektrisch veld gegeven en zo de lading op de bol berekenen.
#een kring gegeven met een X waarvan ge moet zeggen of het een condensator of weerstand of zelfinductie moet zijn, vergelijkingen van i en v gegeven. En dan ook nog zeggen of je de X kan vervangen door iets anders waardoor de amplitude hetzelfde blijft maar de i en v niet in fase zijn.

===13 jun 2008===
Theorie:
# Wat is het verschil in elektrische geleiding bij zuivere halfgeleiders en gedopeerde halfgeleiders. Leg uit de werking van pn-junctie
# Bespreek de LRC-keten

Oefeningen
# LC keten
# Fase verschil berekenen 2 gelijke golven die elk door een blokje gaan met andere lengte en brekingsindex

===9 jun 2008===
Theorie:
# Bespreek wet Biot-Savart en gebruik om magneetveld rond oneindig lange draad met stroom af te leiden.
# Leg uit wat een virtueel beeld is. Is het mogelijk om dit van een reëel voorwerp te bekomen bij een vlakke/holle/bolle spiegel. Onder welke omstandigheden?

Oefeningen:
# De ruimte tussen een condensator is helemaal gevuld met water. Water heeft een dipoolmoment 6.10*10^-30 Cm. De molaire massa van water is 18. De dichtheid is 1g/cm^3. Water heeft een di-elektrische constante van 80.
#* bepaal de geïnduceerde oppervlakteladingsdichtheid wanneer alle dipolen zich volgens E uitlijnen.
#* stel dat de geïnduceerde oppervlakteladingsdichtheid 1/1000 is van die hierboven, wat is dan het elektrisch veld?
# In een RLC-kring is de frequentie 1.73kHz. De amplitude van de spanning over de weerstand, de amplitude van de spanning over de condensator, de amplitude van de inductie en de amplitude van de bronspanning zijn allen gelijk. R = 700 ohm. Bepaal L en C.

===15 jun 2007===
Theorie:
# Bespreek magnetisch moment + richting van magnetisch moment in magneetveld
# Serie RLC keten bespreken

Oefeningen:
# Stroom van 27A in begin, straal eerste cirkel R, straal tweede cirkel 2r, r = 0.1m, en bereken magnetische inductie in punt P. Draad overal even dik en overal even grote soortelijke weerstand
# Tweede is kurkje drijft op water, hoe lang moet de naald zijn opdat het zichtbaar is boven water. Brekingsindex water=1.33, lucht=1 Afmetingen staan erbij.

===12 jun 2007===
Theorie:
# Leg uit: elektrische stroom, stroomdichtheid en leid de wet van Ohm af.
# De wet van Ampère afleiden voor stationaire stromen en vertellen wat ge aan de basisformule moet veranderen als de stromen tijdsafhankelijk worden.

Oefeningen
# Berekenen hoeveel lading er door een weerstand gaat die aangesloten is op een geleidende lus die altijd maar kleiner en kleiner wordt. Loodrecht op de lus heerst er een magnetische inductie.
# Een typisch optica-vraagstukje: je hebt een schilderijtje en wil dat vastleggen op een gevoelige plaat, met een bolle lens met brandpunt= + 5 cm. Hoe ver moet het schilderijtje van de lens en hoe ver moet de lens van de gevoelige plaat.

Algemene Natuurkunde II

2019-01-28T17:20:00Z

Elisevanvyve: /* Examenvragen */