Chemika Examenwiki - Gebruikersbijdragen [nl]

Industriële Chemie

2019-06-23T15:59:57Z

LaurenV: /* Examenvragen */

[[Categorie:Machemie]]

==Vakinformatie==
Vak op 6 stp gedoceerd door Jan Remeysen (werkt bij BASF, maar dat zal vanzelf wel duidelijk worden). Het examen is mondeling met schriftelijke voorbereiding. Het mondeling zelf duurt wel lang, omdat Remeysen veel bijvragen stelt en graag over andere dingen praat (het mondeling is echt wel chill). Wat wel belangrijk is, is dat LETTERLIJK elk woord, concept of zin die in de cursus staat of in de les gezegd wordt (!!) een mogelijke vraag is op het examen. Opletten en zeer goed notities bijhouden is dus een must tijdens de lessen (en zeker niet te veel aan je thesis werken tijdens de lessen ;) ). De examenvragen worden vrijwel gerecycleerd, maar gaan dus vaak verder dan de vragen zelf op papier. In eenzelfde jaar stelt hij normaal niet dezelfde vragen op verschillende dagen (tenzij over energie en innovatie, zie verder), maar de reeks van de namiddag heeft wel steeds dezelfde vragen als die van de voormiddag (let wel, dit is tot nu toe zo geweest en kan mogelijks veranderen. Verantwoordelijkheid ligt uiteraard bij jezelf). Elk examen bevat minstens 3 vragen van een bepaalde soort: Rentabiliteit, Energie en Innovatie. De rentabiliteitsoefening is steeds gelijkaardig, maar wel een ander vraagstuk. De energie-vraag is vaak een artikel lezen en bespreken (soms wordt hetzelfde artikel gevraagd bij verschillende reeksen). De vraag over innovatie is de opdracht uit het hoorcollege waarbij je zelf een voorbeeld van innovatie meebrengt naar het examen en het bespreekt.

==Examenvragen==
===21 juni 2019 voormiddag ===
ALAIN:
- een geïntegreerd zorgsysteem werkt volgens het principe van PDCA, leg dit uit. (EHSQ)
- near IR kan gebruikt worden als online techniek voor de kwaliteit van het staal te bepalen. Alles uitleggen, online, near IR, in welke toepassing we da gezien hebben (tekening best geven) (EHSQ)
- Waarom heeft een bedrijf een visie en hoe zorgen ze ervoor dat hun arbeiders dit naleven. (Strategie, visie en missie)

JAN
- rentabiliteit van businessplan (payback time, NPV, NPI, Depreciation en Discount rate)
- wat is het verschil tussen gevaar en risico? Wat is een risicoanalyse en hoe zorgen ze ervoor dat deze correct uitgevoerd wordt? Efficiëntie van de mogelijke risico vermindering. (Occupational safety)
- een artikel rond energie: bespreek de zin die aangeduid is (energie), hoe wordt er in de chemische industrie gewerkt aan energie-efficiëntie (hoofdstukken gecombineerd), bespreek de pijlers waar men in Europa in de toekomst op richt (klimaat)

Apart bij een van hen:
businessplan bespreken: random vragen

===25 juni 2018 namiddag===
zie examen 27 juni 2017

===25 juni 2018 voormiddag===
zie examen 24 juni 2017

===22 juni 2018 voormiddag===
zie examen 23 juni 2017

===27 juni 2017 namiddag===
#Geef de pijlers van talent management en geef enkele voorbeelden/concepten om deze pijlers te illustreren.
#Ethyleenoxide
##Uit welke 4 componenten bestaat de katalysator? Hoe wordt deze katalysator gemaakt en waarom op deze manier? Wat is het effect op de samenstelling van de katalysator?
##Bespreek het mechanisme voor de vorming van ethyleenoxide (TPR-massaspectrum gegeven).
##Waarom wordt een ethyleenoxide installatie vaak gecombineerd met een ethyleenglycol installatie?
#Procesveiligheid
##Bespreek de veiligheidsmaatregelen die genomen worden bij de ammoniumnitraat tank (afbeelding van de AN tank gegeven met ALLE veiligheidsmaatregelen al op getekend: primaire voor proces, primaire voor fouten en secundaire).
##Welk aanpak schuilt er achter deze maatregelen?
#Rentabiliteit (ingevulde tabel gegeven)
##Hoe komt men aan de kosten/baten?
##Bespreek de afschrijvingswaarden.
##Hoe gaat men van de netto cash flow naar de geactualiseerde netto cash flow in jaar 5?
##Is het project rendabel?
#Energie (heel kort artikel gegeven)
##Waarom is het verantwoord om van een veilingsysteem naar een benchmarksysteem over te schakelen?
##Wat is het energiebeleid in de chemie (staat los van het artikel)?
#Innovatie: eigen voorbeeld uit het hoorcollege.

===24 juni 2017 voormiddag en namiddag===
#Visie (zie andere jaren)
#NH3 synthese (zie andere jaren)
#Historische evolutie in arbeidsveiligheid, procesveiligheid en milieu (zie andere jaren)
#Artikel over energie (zie andere jaren)
#Rentabiliteit (zie andere jaren)
#Innovatie (zie andere jaren)

===23 juni 2017 voormiddag en namiddag===
#Wat is een zorgsysteem en wat is het nut voor een onderneming?
#Risicoanalyse
##Wat is het verschil tussen risico en gevaar?
##Hoe neem je juiste risico reductie maatregelen en de kosten efficiëntie?
##Wat is een risicoanalyse en hoe wordt er gezorgd dat deze juist gemaakt wordt?
#Kraken
##Waarom wordt kraken toegepast?
##Wat zijn gelijkenissen en verschillen tussen thermisch en stoomkraken?
##Waarom wordt katalytisch kraken toegepast?
##Beschrijf kraakscherpte a.h.v. figuur
#Rentabiliteitsanalyse
##Hoe kom je aan kosten/baten?
##Hoe ga je van cashflow naar actuele cashflow?
##Is de onderneming rendabel?
##Leg de afschrijvingen uit
#Artikel over energie-efficiëntie:
##zin in aangeduid en uitleggen
##Hoe werken chemische bedrijven mee aan energie-efficiëntie
#Innovatie: oefening uit hoorcollege, breng je eigen voorbeeld mee

===23 juni 2014 voormiddag en namiddag===
#Wat is een zorgsysteem? Wat is het nut ervan voor de onderneming?
#Synthese van ammoniak (2 grafieken uit cursus gegeven)
##Bespreek de invloed van temperatuur, druk en reactievoering op de keuze van de omstandigheden voor de ammoniaksynthesereactie.
##Hoe wordt de katalysator geactiveerd? Wat is de rol van waterdamp hierin?
##Bespreek volgende stelling "De katalysator is het hart van de ammoniakfabriek".
#Bespreek de historische evolutie in het aanpakken van volgende problematieken:
##procesveiligheid
##arbeidsveiligheid
##milieu
#Rentabiliteitsanalyse: Een bedrijf wil het vullen van vaten automatiseren. Hierbij komt kijken een investeringskost, een negatieve kost vanwege verminderen van energieverbruik en ontslaan van 2 werknemers, en een positieve kost vanwege sociale bijdrage. Tabel gegeven.
##Is deze investering rendabel?
##Wat is het verschil tussen de waarden in de rij 'Totale cashflow' en 'Verdisconteerde cashflow'?
##Nog een paar kleine vraagjes
#Vraag over innovatie (die zelf naar het examen meegebracht moest worden)

===22 juni 2014 voormiddag en namiddag===
#Waarom definieert een onderneming een visie? En hoe wordt deze nagestreefd?
#kraken
##Waarom wordt er gekraakt?
##Geef de gelijkenissen en verschillen tussen thermisch kraken en stoomkraken
##Waarom werd katalytisch kraken ontwikkeld?
##Geef aan de hand van de figuur weer wat er bedoeld wordt met kraakscherpte (figuur over kraakscherpte gegeven)
#Veiligheid
##Wat is een risico-analyse?
##Bespreek efficiëntie (kosten-effeciëntie/verhaal van kat en muis)
#Rentabiliteit (schema en opgave gegeven)
##Hoe kom je aan de kosten/baten?
##Bespreek wettelijke afschrijvingen
##Bespreek hoe je in jaar 5 aan de actuele waarde komt.
##Is het rendabel?
#energie-efficiëntie
##Artikel gegeven, bespreek daar een zin uit.
##Hoe wordt er in de chemische industrie zuinig omgegaan met energie?
#innovatie: oefening uit hoorcollege.

Sustainable chemistry I

2019-06-13T17:17:42Z

LaurenV: /* Examenvragen */

[[Categorie:Machemie]]
==Vakinformatie==
Sustainable chemistry is een 3 studiepuntenvak dat gedoceerd wordt door 3 proffen. Hierdoor is er niet elke week les en verschuift het lesmoment soms omwille van de beschikbaarheid ban de gastlectoren. Het deel over ionic liquids, designer safer chemicals en bioprocesses & biodegradable materials wordt gegeven door Mario Smet. Daarnaast zijn er nog 2 delen die door gastlectoren worden gegeven. Eén deel wordt gegeven door Koen Van Aken en handelt over EcoScale en sustainable chemistry. Het laatste deel wordt gegeven door de Italiaan Luigi Vaccaro en gaat over concrete voorbeelden van duurzame syntheses in de medicinale chemie.

==Examenvragen==
===11 juni 2019===
#Explain toxicity of the following compounds and rank them in decreasing toxicity. (see attachment)[[Media:toxicity]].jpg]]
#(Given: structure sildenafil and synthetic route both medicinal and commercial) Explain the differences in synthetic approach in medicinal and commercial route to achieve the bond indicated with the arrow. Explain why this is not straightforward and explain why this is (nevertheless) advantageous. (arrow indicates the C=N bond of the pyrimidine, he asks for the amide formation (so Staab's reagent advantages, not cyclization))
#Give the two possible mechanisms of the reaction of epoxide and CO2 to form the cyclic carbonate with LFP's as a catalyst.

===13 juni 2018===
#Why is the following molecule toxic, how can you mitigate its toxicity [[Media:Examenvraag_sustainable_chemistry.jpg]]
#Talampanel. Synthesis is given explain why more sustainable. Explain the use of the XAD resin and give an alternative.
#What would you choose: biobased or biodegradable polymers. Motivate you answer.

===12 juni 2018===
#allyl alcohol, how is this toxic and how to modify the structure to make less toxic
#sertralin (slide with tetralone to sertralin) a) why is the assymetric formation of the enantiomerically pure tetralone not used b) compare the reductive amination with the first procedure in terms of sustainability
#cellulose a) why is it a good biobased material b) in which IL's does it dissolve and why c) compare viscose process to il method of dissolving cellulose in terms of sustainability

===30 augustus 2017===
#Vinyl chloride has some cancerogenic properties, explain where they come from.
#The commercial synthesis of sildenafil is way more sustainable with respect to use of solvents in comparison with the laboratory synthesis. Explain.
#The presence of halogenide ions reduces strongly the applicability of ionic liquids, explain.

Bestand:Toxicity.jpg

2019-06-12T08:51:02Z

LaurenV:

Sustainable chemistry I

2019-06-12T08:49:10Z

LaurenV: /* Examenvragen */

[[Categorie:Machemie]]
==Vakinformatie==
Sustainable chemistry is een 3 studiepuntenvak dat gedoceerd wordt door 3 proffen. Hierdoor is er niet elke week les en verschuift het lesmoment soms omwille van de beschikbaarheid ban de gastlectoren. Het deel over ionic liquids, designer safer chemicals en bioprocesses & biodegradable materials wordt gegeven door Mario Smet. Daarnaast zijn er nog 2 delen die door gastlectoren worden gegeven. Eén deel wordt gegeven door Koen Van Aken en handelt over EcoScale en sustainable chemistry. Het laatste deel wordt gegeven door de Italiaan Luigi Vaccaro en gaat over concrete voorbeelden van duurzame syntheses in de medicinale chemie.

==Examenvragen==
===11 juni 2019===
#Explain toxicity of the following compounds and rank them in decreasing toxicity. (see attachment)[[Media:toxicity]].jpg]]
#(Given: structure sildenafil and synthetic route both medicinal as commercial) Explain the differences in synthetic approach in medicinal and commercial rote to achieve the bond indicated with the arrow. Explain why this is not straightforward and explain why this is (nevertheless) advantageous. (arrow indicates the C=N bond of the pyrimidine, he asks for the amide formation (so Staab's reagent advantages, not cyclization))
#Give the two possible mechanisms of the reaction of epoxide and CO2 to form the cyclic carbonate with LFP's as a catalyst.

===13 juni 2018===
#Why is the following molecule toxic, how can you mitigate its toxicity [[Media:Examenvraag_sustainable_chemistry.jpg]]
#Talampanel. Synthesis is given explain why more sustainable. Explain the use of the XAD resin and give an alternative.
#What would you choose: biobased or biodegradable polymers. Motivate you answer.

===12 juni 2018===
#allyl alcohol, how is this toxic and how to modify the structure to make less toxic
#sertralin (slide with tetralone to sertralin) a) why is the assymetric formation of the enantiomerically pure tetralone not used b) compare the reductive amination with the first procedure in terms of sustainability
#cellulose a) why is it a good biobased material b) in which IL's does it dissolve and why c) compare viscose process to il method of dissolving cellulose in terms of sustainability

===30 augustus 2017===
#Vinyl chloride has some cancerogenic properties, explain where they come from.
#The commercial synthesis of sildenafil is way more sustainable with respect to use of solvents in comparison with the laboratory synthesis. Explain.
#The presence of halogenide ions reduces strongly the applicability of ionic liquids, explain.

Instrumentele Analytische Chemie

2019-01-14T16:46:41Z

LaurenV: /* De Gendt */

[[Categorie:Machemie]]

[[Categorie:Master Chemie]]

[[Categorie:Master Chemie]]
==Examenvragen==
===14 januari 2019 VM===
====De Gendt====
#Gegeven: ligging van een aantal pieken van een TXRF spectrum en tabellen met emissie- en absorptielijnen van de verschillende elementen.
#*Leg uit welke pieken van waar afkomstig zijn
#*Hoeveel energie heb je nodig om de anode te exciteren?
#*Verklaar vanwaar de pieken afkomstig zijn
#Interferenties ICPMS min 5 geven
#Verklaar waarom de brekingsindex kleiner is dan 1
#Quadrupool massafilter uitleggen met stabiliteitscurven (schetsen)
#CI uitleggen: met behulp van methaan de 3 stappen uitleggen

#mondelinge vragen:
#werking cryopomp
#molecular flow uitleggen
#isotope dilution mass spectrometry algemeen concept
#kinetische energie bij mass-analyzer een probleem. Waarom, wat eraan doen en wat beïnvloed het?
#leg de detectielimiet en de gevoeligheid uit, wat is het veband?
#welke pH is favorisabel om compounds te bewaren. (Zuur voor adsorptie tegen te gaan + wil horen dat bij basische pH dit ook werkt in principe maar dan verlies door neerslag)

====De Smedt====
#Leg de vier stappen van GFAAS uit
#Leg het verschil uit tussen atomaire en moleculaire absorptie
#Bespreek de chemische en instrumentele afwijkingen van de wet van Lambert-Beer
#Leg het begrip "specificiteit" uit en leg de link met massaspectrometrie en chromatografie met UV-detectie
#Bespreek en schets de opstelling van: de fluorimeter, de PMT
#
#mondelinge vragen:
#wat is de functie van de ion-surpressor?
#resolutie bij chromatografie en geef vbn.
#prisma: werking uitleggen en hoe gebruik je het?
#interferenties bij Flame AAS
#wat zijn statistical outliers

===15 januari 2017 VM===
====De Gendt====
#Gegeven: ligging van een aantal pieken van een TXRF spectrum en tabellen met emissie- en absorptielijnen van de verschillende elementen.
#*Leg uit welke pieken van waar afkomstig zijn
#*Hoeveel energie heb je nodig om de anode te exciteren?
#*Verklaar vanwaar de pieken afkomstig zijn
#Interferenties ICPMS
#Verklaar waarom de brekingsindex kleiner is dan 1
#Quadrupool massafilter uitleggen
#CI uitleggen: met behulp van methaan de 3 stappen uitleggen

====De Smedt====
#Leg de vier stappen van GFAAS uit
#Leg het verschil uit tussen atomaire en moleculaire absorptie
#Bespreek de chemische en instrumentele afwijkingen van de wet van Lambert-Beer
#Leg het begrip "specificiteit" uit en leg de link met massaspectrometrie en chromatografie met UV-detectie
#Bespreek de fluorimeter
#wat is de functie van de ion-surpressor? (leg ook werking uit)
#PMT uitleggen

===16 januari 2017===
====De Gendt====
#Verschil tussen accuratie en precisie uitleggen
#Leg de cryopomp uit
#Leg de interferenties en oplossingen hiervoor uit bij ICP-MS
#Bespreek de relatie tussen resolutie en transmissie, leg ook de relatie tussen kinetische energie en resolutie uit (in MS)
#Leg EI volledig uit, vergelijk met CI
#Leg TXRF volledig uit, verklaar ook de brekings index met formule (waarom dat n<1)
#4 mondeling vragen trekken

====Carl====
#Alle optische interferenties in Vlam AAS bespreken
#Bespreek 1 van de 2 volgende (Da zijn die artikels op toledo die ge denkt niet te moeten kennen :'( )
(a) Ruthenium uit pillen met GF AAS
(b) Arsenium uit dino skelet met ICP AAS

===16 januari 2016===
====De Gendt====
#Destillatie uitleggen en 2 componenten uit de cursus geven
#Gevoeligheid en DL en het verband geven
#Escape piek en Som piek uitleggen
#Waarom is de brekingsindex bij TXRF altijd kleiner dan 1 (formule geven)
#MALDI TOF
#Quadrupool met het diagram en stabiliteitscurve (a en q parameters)

====Carl====
#AAS vlam en GFAAS helemaal uitleggen
#TGA en DSC uitleggen

===13 januari 2015===
====De Gendt====
#Geef de definitie van detectielimiet en gevoeligheid. Geef ook hun verband grafisch weer.
#Leg met behulp van methaan de 3 stappen uit van chemische ionisatie. Kan THF geïoniseerd worden met NH3 als ionisatiegas? (protonaffiniteiten gegeven)
#Gegeven: ligging van een aantal pieken van een TXRF spectrum en tabellen met emissie- en absorptielijnen van de verschillende elementen. Benoem de pieken en geef uitleg bij de pieken die niet van het staal komen.
#Een analist lost met HF/HNO3 een aluminosilicaat op en wil met ICP-MS het Fe-gehalte bepalen aan de hand van de meest voorkomende isotoop.
#*Waarom gebruikt de analist HF? Welke voorzorgen moet hij nemen?
#*Welke isobare interferentie kan optreden?
#*Welke resolutie is vereist om de piek van de interferent af te scheiden?
#*Geef 3 manieren om de interferentie te overkomen.
#Mondeling: gegeven een afbeelding van de a vs q voor een quadrupole mass analyzer. Leg aan de hand van het werkingsprincipe van deze mass analyzer de figuur uit, bespreek hoe de massascheiding gebeurt en hoe we de resolutie kunnen verhogen.
#Willekeurige mondelinge bijvragen willekeurig te trekken (Wat wordt beïnvloed door de spanning en stroom van een X-stralenbron? Welke dragers kunnen we gebruiken als we Si willen bepalen met TXRF? Welke ionisatiebron voor MS heeft de grootste spreiding wat betreft kinetische energie en wat kunnen we hieraan doen?)

====Carl====
#(mondeling)
#*Circuit tekenen voor een systeem waar een monochromator sinusoidaal wordt gevariëerd om de signaal/achtergrondverhouding van een atomaire lijn te bepalen. Een bepaalde sinusoidale spanning komt overeen met de bewegende monochromator. De temperatuur wordt steeds verhoogd, het circuit moet hieruit bepalen bij welke temperatuur de signaal/achtergrondverhouding de grootste is en deze verhouding opslaan met een peak detector. De ingangsspanningen zijn de wisselspanning en die van de detector
#*Wat zijn de oorzaken van de temperatuursafhankelijke achtergrond en signaalintensiteit in een AES-experiment?
#(deze of 3 op te lossen) Geef voor een AAS-vlam experiment de oorzaken van spectrale interferentie en 3 manieren om deze op te lossen, waarbij je de opstelling moet tekenen voor elke methode.
#(deze of 2 op te lossen) Leg de werking uit van de volgende technieken en geef de belangijkste onderdelen:
#*AAS grafietoven
#*AAS hydridegeneratie

===12 januari 2015===
====De Gendt====
#*Geef de definitie van detectielimiet en gevoeligheid. Geef ook hun verband grafisch weer.
#*Beschrijf chemische ionisatie en electron impact ionisatie. Geef het verschil tussen deze technieken.
#*Bij massaspectrometrie kan men een electron impact ionisatie beter combineren met een magnetic sector/electrostatic sector massafilter dan met een TOF massafilter. Leg uit waarom en beschrijf ook de werking van beide massafilters kort.
#*Zoek de typische energiewaarden van de Ka en Kb lijnen op van Cr. Is een X-stralen bron van Zn met zijn typische Ka en Kb lijnen in staat deze X-stralen van Cr te genereren? Verklaar en geef alle nodige energiën.
#*Bij een ICPMS ontstaat er bij de 75As interferentie van 40Ar 35Cl. Bereken de nodige resolutie om deze pieken te onderscheiden. Geef ook (algemeen) 3 methoden om interferentie bij ICPMS te vermijden.
#*(MONDELING) Leg het werkingsprincipe van TXRF uit. Hierbij hoef je geen ingewikkelde formules te gebruiken.
#*(MONDELING) Hij heeft 18 vragen, daar moest je er 4 uit trekken.
#*Bij wafer mapping wordt de contaminatie volledig opgelost. Wat geeft de grootste contaminatie: 1 groot deeltje of veel kleine deeltjes
#*Wat geeft de gevoeligste vacuumdetectie: een capacitance manometer of een pirani gauge. Leg kort de werking van een capacitance manometer uit.
#*Wat is het beste voor organische moleculen: electron impact ionisatie of chemische ionisatie
#*Stel ik wilt Si in een staal onderzoeken met TXRF, welk substraat gebruik ik dan best?

====Carl====
#(MONDELING)Vraag 1(a): Teken alle componenten van een thermische gravimetrische techniek. Geef ook een korte beschrijving van de componenten. Elektronische componenten hoeven niet besproken te worden.
#*(i) Wat is een typische gevoeligheid? (M.a.w.: wat is het maximum massa dat je hiermee kunt meten?)
#*(ii) Wat zijn de gevoelige delen bij deze opstelling, waar kunnen er fouten en onzekerheden optreden?
#*(iii) Wat zijn de verschillende kalibratiemethoden?
#*(iv) Geef een voorbeeld van een meting en zijn interpretatie
#(MONDELING)Vraag 1(b): Gegeven is een elektronisch circuit. Bereken (algemeen, geen waarden) enkele voltages op bepaalde punten in dit circuit en het uiteindelijke uitgangsvoltage.
#Vraag 2 en vraag 3: kies één van deze vragen en los op. De andere hoef je dan niet op te lossen.
#*Vraag 3(a): Een onderzoeker wil 1 klein staal onderzoeken met behulp van een absorbantietechniek. Teken een mogelijke opstelling.
#*Vraag 3(b): Geef duidelijk weer waar het staal is voor en tijdens de meting, bespreek de plaatsing van de lichtbron en enkele eigenschappen van de lichtbron, geef duidelijk de gekozen absorbantietechniek en bespreek deze, bespreek hoe je de golflengtedispersie doet en bespreek de detectietechniek.Hier hoeven geen kalibratietechnieken, interferenties, background etc besproken te worden.

===15 januari 2013===
====De Gendt====
#Wat is het verschil tussen precisie en accuratesse?
#Hogere gevoeligheid geeft lagere detectielimiet. Leg uit en geef een figuur.
#Waarom is bij een golflengte-dispersieve TXRF de gevoeligheid van de detector van ondergeschikt belang t.o.v. de energie dispersieve technieken?
#Waterige oplossingen worden best bij zure pH in glazen flessen bewaard. Verklaar.
#Is het mogelijk om Kα en Kβ lijn te bekomen met een Zn K-lijn? Geef alle energieën en genoeg uitleg (de energieën op te zoeken in tabel).
#Bij een ICPMS-meting van een As/HCl/H2O in Ar als draaggas ontstaat er interferentie.
#*Wat is die interferentie?
#*Wat moet de resolutie zijn om de pieken te onderscheiden? (je krijgt een PSE)
#*Geef tenminste 2 manieren om die interferentie te verwijderen.
#Mondeling: Figuur van stabiliteitscurves. Eerst uitleggen voor welke techniek deze gebruikt worden (quadrupool massafilter), hoe de algemene werking is en hoe men de resolutie kan verbeteren. En nog een tweetal bijvragen, niet per se over de vraag zelf.

====Carl====
#Gegeven een hele uitleg over een atomaire emissie bij 295,5 nm en het gebrek ervan bij 265,5 nm, het spectrum voor emissie en een variatie in signaalintensiteit met temperatuur.
#*Teken een elektronisch circuit met operationele versterkers die de outputspanning Vout geeft die overeenkomstig is met grootste atomaire subovergangen. Nog gegeven: als λ=295 dan Vsin>=4,8V; wanneer Vsin=<0,2V en ertussenin voor golflengtes tussen 295,5 en 296,5 nm.
#*"ALs u het moeilijk vindt om een circuit te trekken, probeer dan de verschillende stappen die nodig zijn te beschrijven"
#*Geef de redenen waarom zowel de intensiteit van atomaire overgangen als de intensiteit van de achtergrond in een AES-experiment kan veranderen met temperatuur.
#Leg uit in detail de techniek van differentiële thermische analyse en toon grafisch de verschillende soorten signalen (en hun interpretatie) die vaak worden waargenomen tijden een analytische procedure. Beschrijf de kalibratiemethoden in verband met deze techniek.

===14 januari 2013===
====De Gendt====
Enkel laatste vraag mondeling te bespreken
#Bij TXRF is het belangrijk dat het substraat een kleiner brekingsindex kleiner is dan 1. Hoe kan een materiaal een brekingsindex hebben die kleiner is dan 1?
#Leg het verband uit tussen gevoeligheid en DL (geef een figuur voor gevoeligheid).
#Verklaar waarom bij quadrupool MS verhoogde resolutie gepaard gaat met verlaagde gevoeligheid.
#Waarom is CI te verkiezen boven EI bij MS van organische moleculen (geen set-up tekenen, wel duidelijk ionisatie mechanisme bespreken)
#Welke spectrale interferentie mag men verwachten bij de detectie van Fe? Bereken de resulutie (tabel met isotoopmassas gegeven)
#...
#tabel van Zr en Hf die worden bestraald met W en Mo lampen (TXRF). Vul de tabel in en leg wat uit waarom bepaalde elementen bij bepaalde lampen worden waargenomen. (Mondeling, daarna nog enkele korte vraagjes in de trant van de juist of fout vragen hieronder vermeld.

====Carl====
#Gekke vraag waarbij je veel moet rekenen en je best in tabelletjes werkt ;). Het kwam er op neer om aan de hand van gegeven Einsteincoëfficiënten en energie en ontaarding van bepaalde overgangen te berekenen welke overgangen de grootste intensiteit hebben.
#Beschrijf 1 van volgende technieken (voorbereiding staal, beschrijving van handelingen, interferenties, detectielimiet)
#*Bepaling As met hydridegeneratie AAS
#*Bepaling Ru met grafietoven AAS

===17 januari 2012===
====De Gendt====
Alles ook mondeling bespreken.
#Leg uit: EI en CI en geef de verschilpunten.
#5 correct of fout vragen + uitleg
#*Wat geeft de grootste contaminatie: een deeltje van 100µm grootte of 1000 deeltjes van 1 µm grootte. (dichtheid was gegeven) en moest het grootte deeltje zijn
#*Bij Quadrupool MS leidt verhoogde resolutie tot verlaging van gevoeligheid
#*Iets over de escape piek
#*Zuren worden best in een glazen fles bij zure pH bewaard
#Bereken de gevoeligheid die een massaspectrometer nodig heeft om 2 pieken, die van het staal en een interferentie (massa's waren gegeven) te berekenen. Geef ook enkele technieken om de interferentie tegen te gaan.
#Tabel van Zr en Hf die worden bestraald met W en Mo lampen (TXRF). Vul de tabel in en leg wat uit waarom bepaalde elementen bij bepaalde lampen worden waargenomen.

====Carl====
#a) Geef een eenvoudig circuit voor een absorbantie meter. b) Breidt dit uit zodat er minder ruis is.
#Beschrijf 1 van volgende technieken (voorbereiding staal, beschrijving van handelingen, interferenties, detectielimiet,...)
#*Bepaling As met hydridegeneratie AAS
#*Bepaling Ru met grafietoven AAS
#*Bepaling Se met hydridegeneratie AAS

===11 januari 2010===
====De Gendt====
2 vragen mondeling (vraag 1 en 3), de andere 2 vragen enkel schriftelijk.
#8 correct of fout vragen met uitleg (max 1 voor juist, 0 voor niet ingevuld en -0,5 voor fout)(8 punten)
#*EI geniet bij MS van organische moleculen de voorkeur op CI wegens de grotere Energie overdracht (of zoiets)
#*Bij Quadrupool MS leidt verhoogde resolutie tot verlaging van gevoeligheid
#*Wat geeft de grootste contaminatie: een deeltje van 100µm grootte of 1000 deeltjes van 1 µm grootte. (dichtheid was gegeven) en moest het grootste deeltje zijn
#*Men kan via ICPMS zeker zijn dat de piek bij 56Fe enkel van deze is, opgemeten in waterige matrix. (je krijgt lijst met isotopen van alle elementen)
#*Bij XRF zorgt enkel x-stralen voor excitatie
#*Zuren met hoog kookpunt kunnen door Isothermale (Suambient) boiling worden gezuiverd
#*Samples worden best in glazen flessen bij neutrale pH gehouden.
#*Is er bij een pomp in het vicous flow regime een hoog verschil in druk tussen de kamer en de inlaat?
#Leg het principe van een quadrupool MS uit. (Geen vgl's, gewoon principe) (4 punten)
#Spectrum van TXRF, bepalen van welk element elke piek komt en ook de oorsprong. (Sum peak etc) (periodiek systeem met spectrale overgangen gegeven + energieën gegeven) (5 punten)
#Welke interferenties treden op bij ICPMS en hoe kan je ze vermijden? (3 punten)

====Carl====
Beide vragen besproken op het mondelinge examen
#Rare oefening, vanalles berekenen maar vooral weten wat hoogste I geeft bij overgangen
#Interferenties bij AAS vlam en oven. Welke en leg uit hoe je ze kan verhelpen.

Instrumentele Analytische Chemie

2019-01-14T16:46:24Z

LaurenV: /* Examenvragen */

[[Categorie:Machemie]]

[[Categorie:Master Chemie]]

[[Categorie:Master Chemie]]
==Examenvragen==
===14 januari 2019 VM===
====De Gendt====
#Gegeven: ligging van een aantal pieken van een TXRF spectrum en tabellen met emissie- en absorptielijnen van de verschillende elementen.
#*Leg uit welke pieken van waar afkomstig zijn
#*Hoeveel energie heb je nodig om de anode te exciteren?
#*Verklaar vanwaar de pieken afkomstig zijn
#Interferenties ICPMS min 5 geven
#Verklaar waarom de brekingsindex kleiner is dan 1
#Quadrupool massafilter uitleggen met stabiliteitscurven (schetsen)
#CI uitleggen: met behulp van methaan de 3 stappen uitleggen
#
#mondelinge vragen:
#werking cryopomp
#molecular flow uitleggen
#isotope dilution mass spectrometry algemeen concept
#kinetische energie bij mass-analyzer een probleem. Waarom, wat eraan doen en wat beïnvloed het?
#leg de detectielimiet en de gevoeligheid uit, wat is het veband?
#welke pH is favorisabel om compounds te bewaren. (Zuur voor adsorptie tegen te gaan + wil horen dat bij basische pH dit ook werkt in principe maar dan verlies door neerslag)

====De Smedt====
#Leg de vier stappen van GFAAS uit
#Leg het verschil uit tussen atomaire en moleculaire absorptie
#Bespreek de chemische en instrumentele afwijkingen van de wet van Lambert-Beer
#Leg het begrip "specificiteit" uit en leg de link met massaspectrometrie en chromatografie met UV-detectie
#Bespreek en schets de opstelling van: de fluorimeter, de PMT
#
#mondelinge vragen:
#wat is de functie van de ion-surpressor?
#resolutie bij chromatografie en geef vbn.
#prisma: werking uitleggen en hoe gebruik je het?
#interferenties bij Flame AAS
#wat zijn statistical outliers

===15 januari 2017 VM===
====De Gendt====
#Gegeven: ligging van een aantal pieken van een TXRF spectrum en tabellen met emissie- en absorptielijnen van de verschillende elementen.
#*Leg uit welke pieken van waar afkomstig zijn
#*Hoeveel energie heb je nodig om de anode te exciteren?
#*Verklaar vanwaar de pieken afkomstig zijn
#Interferenties ICPMS
#Verklaar waarom de brekingsindex kleiner is dan 1
#Quadrupool massafilter uitleggen
#CI uitleggen: met behulp van methaan de 3 stappen uitleggen

====De Smedt====
#Leg de vier stappen van GFAAS uit
#Leg het verschil uit tussen atomaire en moleculaire absorptie
#Bespreek de chemische en instrumentele afwijkingen van de wet van Lambert-Beer
#Leg het begrip "specificiteit" uit en leg de link met massaspectrometrie en chromatografie met UV-detectie
#Bespreek de fluorimeter
#wat is de functie van de ion-surpressor? (leg ook werking uit)
#PMT uitleggen

===16 januari 2017===
====De Gendt====
#Verschil tussen accuratie en precisie uitleggen
#Leg de cryopomp uit
#Leg de interferenties en oplossingen hiervoor uit bij ICP-MS
#Bespreek de relatie tussen resolutie en transmissie, leg ook de relatie tussen kinetische energie en resolutie uit (in MS)
#Leg EI volledig uit, vergelijk met CI
#Leg TXRF volledig uit, verklaar ook de brekings index met formule (waarom dat n<1)
#4 mondeling vragen trekken

====Carl====
#Alle optische interferenties in Vlam AAS bespreken
#Bespreek 1 van de 2 volgende (Da zijn die artikels op toledo die ge denkt niet te moeten kennen :'( )
(a) Ruthenium uit pillen met GF AAS
(b) Arsenium uit dino skelet met ICP AAS

===16 januari 2016===
====De Gendt====
#Destillatie uitleggen en 2 componenten uit de cursus geven
#Gevoeligheid en DL en het verband geven
#Escape piek en Som piek uitleggen
#Waarom is de brekingsindex bij TXRF altijd kleiner dan 1 (formule geven)
#MALDI TOF
#Quadrupool met het diagram en stabiliteitscurve (a en q parameters)

====Carl====
#AAS vlam en GFAAS helemaal uitleggen
#TGA en DSC uitleggen

===13 januari 2015===
====De Gendt====
#Geef de definitie van detectielimiet en gevoeligheid. Geef ook hun verband grafisch weer.
#Leg met behulp van methaan de 3 stappen uit van chemische ionisatie. Kan THF geïoniseerd worden met NH3 als ionisatiegas? (protonaffiniteiten gegeven)
#Gegeven: ligging van een aantal pieken van een TXRF spectrum en tabellen met emissie- en absorptielijnen van de verschillende elementen. Benoem de pieken en geef uitleg bij de pieken die niet van het staal komen.
#Een analist lost met HF/HNO3 een aluminosilicaat op en wil met ICP-MS het Fe-gehalte bepalen aan de hand van de meest voorkomende isotoop.
#*Waarom gebruikt de analist HF? Welke voorzorgen moet hij nemen?
#*Welke isobare interferentie kan optreden?
#*Welke resolutie is vereist om de piek van de interferent af te scheiden?
#*Geef 3 manieren om de interferentie te overkomen.
#Mondeling: gegeven een afbeelding van de a vs q voor een quadrupole mass analyzer. Leg aan de hand van het werkingsprincipe van deze mass analyzer de figuur uit, bespreek hoe de massascheiding gebeurt en hoe we de resolutie kunnen verhogen.
#Willekeurige mondelinge bijvragen willekeurig te trekken (Wat wordt beïnvloed door de spanning en stroom van een X-stralenbron? Welke dragers kunnen we gebruiken als we Si willen bepalen met TXRF? Welke ionisatiebron voor MS heeft de grootste spreiding wat betreft kinetische energie en wat kunnen we hieraan doen?)

====Carl====
#(mondeling)
#*Circuit tekenen voor een systeem waar een monochromator sinusoidaal wordt gevariëerd om de signaal/achtergrondverhouding van een atomaire lijn te bepalen. Een bepaalde sinusoidale spanning komt overeen met de bewegende monochromator. De temperatuur wordt steeds verhoogd, het circuit moet hieruit bepalen bij welke temperatuur de signaal/achtergrondverhouding de grootste is en deze verhouding opslaan met een peak detector. De ingangsspanningen zijn de wisselspanning en die van de detector
#*Wat zijn de oorzaken van de temperatuursafhankelijke achtergrond en signaalintensiteit in een AES-experiment?
#(deze of 3 op te lossen) Geef voor een AAS-vlam experiment de oorzaken van spectrale interferentie en 3 manieren om deze op te lossen, waarbij je de opstelling moet tekenen voor elke methode.
#(deze of 2 op te lossen) Leg de werking uit van de volgende technieken en geef de belangijkste onderdelen:
#*AAS grafietoven
#*AAS hydridegeneratie

===12 januari 2015===
====De Gendt====
#*Geef de definitie van detectielimiet en gevoeligheid. Geef ook hun verband grafisch weer.
#*Beschrijf chemische ionisatie en electron impact ionisatie. Geef het verschil tussen deze technieken.
#*Bij massaspectrometrie kan men een electron impact ionisatie beter combineren met een magnetic sector/electrostatic sector massafilter dan met een TOF massafilter. Leg uit waarom en beschrijf ook de werking van beide massafilters kort.
#*Zoek de typische energiewaarden van de Ka en Kb lijnen op van Cr. Is een X-stralen bron van Zn met zijn typische Ka en Kb lijnen in staat deze X-stralen van Cr te genereren? Verklaar en geef alle nodige energiën.
#*Bij een ICPMS ontstaat er bij de 75As interferentie van 40Ar 35Cl. Bereken de nodige resolutie om deze pieken te onderscheiden. Geef ook (algemeen) 3 methoden om interferentie bij ICPMS te vermijden.
#*(MONDELING) Leg het werkingsprincipe van TXRF uit. Hierbij hoef je geen ingewikkelde formules te gebruiken.
#*(MONDELING) Hij heeft 18 vragen, daar moest je er 4 uit trekken.
#*Bij wafer mapping wordt de contaminatie volledig opgelost. Wat geeft de grootste contaminatie: 1 groot deeltje of veel kleine deeltjes
#*Wat geeft de gevoeligste vacuumdetectie: een capacitance manometer of een pirani gauge. Leg kort de werking van een capacitance manometer uit.
#*Wat is het beste voor organische moleculen: electron impact ionisatie of chemische ionisatie
#*Stel ik wilt Si in een staal onderzoeken met TXRF, welk substraat gebruik ik dan best?

====Carl====
#(MONDELING)Vraag 1(a): Teken alle componenten van een thermische gravimetrische techniek. Geef ook een korte beschrijving van de componenten. Elektronische componenten hoeven niet besproken te worden.
#*(i) Wat is een typische gevoeligheid? (M.a.w.: wat is het maximum massa dat je hiermee kunt meten?)
#*(ii) Wat zijn de gevoelige delen bij deze opstelling, waar kunnen er fouten en onzekerheden optreden?
#*(iii) Wat zijn de verschillende kalibratiemethoden?
#*(iv) Geef een voorbeeld van een meting en zijn interpretatie
#(MONDELING)Vraag 1(b): Gegeven is een elektronisch circuit. Bereken (algemeen, geen waarden) enkele voltages op bepaalde punten in dit circuit en het uiteindelijke uitgangsvoltage.
#Vraag 2 en vraag 3: kies één van deze vragen en los op. De andere hoef je dan niet op te lossen.
#*Vraag 3(a): Een onderzoeker wil 1 klein staal onderzoeken met behulp van een absorbantietechniek. Teken een mogelijke opstelling.
#*Vraag 3(b): Geef duidelijk weer waar het staal is voor en tijdens de meting, bespreek de plaatsing van de lichtbron en enkele eigenschappen van de lichtbron, geef duidelijk de gekozen absorbantietechniek en bespreek deze, bespreek hoe je de golflengtedispersie doet en bespreek de detectietechniek.Hier hoeven geen kalibratietechnieken, interferenties, background etc besproken te worden.

===15 januari 2013===
====De Gendt====
#Wat is het verschil tussen precisie en accuratesse?
#Hogere gevoeligheid geeft lagere detectielimiet. Leg uit en geef een figuur.
#Waarom is bij een golflengte-dispersieve TXRF de gevoeligheid van de detector van ondergeschikt belang t.o.v. de energie dispersieve technieken?
#Waterige oplossingen worden best bij zure pH in glazen flessen bewaard. Verklaar.
#Is het mogelijk om Kα en Kβ lijn te bekomen met een Zn K-lijn? Geef alle energieën en genoeg uitleg (de energieën op te zoeken in tabel).
#Bij een ICPMS-meting van een As/HCl/H2O in Ar als draaggas ontstaat er interferentie.
#*Wat is die interferentie?
#*Wat moet de resolutie zijn om de pieken te onderscheiden? (je krijgt een PSE)
#*Geef tenminste 2 manieren om die interferentie te verwijderen.
#Mondeling: Figuur van stabiliteitscurves. Eerst uitleggen voor welke techniek deze gebruikt worden (quadrupool massafilter), hoe de algemene werking is en hoe men de resolutie kan verbeteren. En nog een tweetal bijvragen, niet per se over de vraag zelf.

====Carl====
#Gegeven een hele uitleg over een atomaire emissie bij 295,5 nm en het gebrek ervan bij 265,5 nm, het spectrum voor emissie en een variatie in signaalintensiteit met temperatuur.
#*Teken een elektronisch circuit met operationele versterkers die de outputspanning Vout geeft die overeenkomstig is met grootste atomaire subovergangen. Nog gegeven: als λ=295 dan Vsin>=4,8V; wanneer Vsin=<0,2V en ertussenin voor golflengtes tussen 295,5 en 296,5 nm.
#*"ALs u het moeilijk vindt om een circuit te trekken, probeer dan de verschillende stappen die nodig zijn te beschrijven"
#*Geef de redenen waarom zowel de intensiteit van atomaire overgangen als de intensiteit van de achtergrond in een AES-experiment kan veranderen met temperatuur.
#Leg uit in detail de techniek van differentiële thermische analyse en toon grafisch de verschillende soorten signalen (en hun interpretatie) die vaak worden waargenomen tijden een analytische procedure. Beschrijf de kalibratiemethoden in verband met deze techniek.

===14 januari 2013===
====De Gendt====
Enkel laatste vraag mondeling te bespreken
#Bij TXRF is het belangrijk dat het substraat een kleiner brekingsindex kleiner is dan 1. Hoe kan een materiaal een brekingsindex hebben die kleiner is dan 1?
#Leg het verband uit tussen gevoeligheid en DL (geef een figuur voor gevoeligheid).
#Verklaar waarom bij quadrupool MS verhoogde resolutie gepaard gaat met verlaagde gevoeligheid.
#Waarom is CI te verkiezen boven EI bij MS van organische moleculen (geen set-up tekenen, wel duidelijk ionisatie mechanisme bespreken)
#Welke spectrale interferentie mag men verwachten bij de detectie van Fe? Bereken de resulutie (tabel met isotoopmassas gegeven)
#...
#tabel van Zr en Hf die worden bestraald met W en Mo lampen (TXRF). Vul de tabel in en leg wat uit waarom bepaalde elementen bij bepaalde lampen worden waargenomen. (Mondeling, daarna nog enkele korte vraagjes in de trant van de juist of fout vragen hieronder vermeld.

====Carl====
#Gekke vraag waarbij je veel moet rekenen en je best in tabelletjes werkt ;). Het kwam er op neer om aan de hand van gegeven Einsteincoëfficiënten en energie en ontaarding van bepaalde overgangen te berekenen welke overgangen de grootste intensiteit hebben.
#Beschrijf 1 van volgende technieken (voorbereiding staal, beschrijving van handelingen, interferenties, detectielimiet)
#*Bepaling As met hydridegeneratie AAS
#*Bepaling Ru met grafietoven AAS

===17 januari 2012===
====De Gendt====
Alles ook mondeling bespreken.
#Leg uit: EI en CI en geef de verschilpunten.
#5 correct of fout vragen + uitleg
#*Wat geeft de grootste contaminatie: een deeltje van 100µm grootte of 1000 deeltjes van 1 µm grootte. (dichtheid was gegeven) en moest het grootte deeltje zijn
#*Bij Quadrupool MS leidt verhoogde resolutie tot verlaging van gevoeligheid
#*Iets over de escape piek
#*Zuren worden best in een glazen fles bij zure pH bewaard
#Bereken de gevoeligheid die een massaspectrometer nodig heeft om 2 pieken, die van het staal en een interferentie (massa's waren gegeven) te berekenen. Geef ook enkele technieken om de interferentie tegen te gaan.
#Tabel van Zr en Hf die worden bestraald met W en Mo lampen (TXRF). Vul de tabel in en leg wat uit waarom bepaalde elementen bij bepaalde lampen worden waargenomen.

====Carl====
#a) Geef een eenvoudig circuit voor een absorbantie meter. b) Breidt dit uit zodat er minder ruis is.
#Beschrijf 1 van volgende technieken (voorbereiding staal, beschrijving van handelingen, interferenties, detectielimiet,...)
#*Bepaling As met hydridegeneratie AAS
#*Bepaling Ru met grafietoven AAS
#*Bepaling Se met hydridegeneratie AAS

===11 januari 2010===
====De Gendt====
2 vragen mondeling (vraag 1 en 3), de andere 2 vragen enkel schriftelijk.
#8 correct of fout vragen met uitleg (max 1 voor juist, 0 voor niet ingevuld en -0,5 voor fout)(8 punten)
#*EI geniet bij MS van organische moleculen de voorkeur op CI wegens de grotere Energie overdracht (of zoiets)
#*Bij Quadrupool MS leidt verhoogde resolutie tot verlaging van gevoeligheid
#*Wat geeft de grootste contaminatie: een deeltje van 100µm grootte of 1000 deeltjes van 1 µm grootte. (dichtheid was gegeven) en moest het grootste deeltje zijn
#*Men kan via ICPMS zeker zijn dat de piek bij 56Fe enkel van deze is, opgemeten in waterige matrix. (je krijgt lijst met isotopen van alle elementen)
#*Bij XRF zorgt enkel x-stralen voor excitatie
#*Zuren met hoog kookpunt kunnen door Isothermale (Suambient) boiling worden gezuiverd
#*Samples worden best in glazen flessen bij neutrale pH gehouden.
#*Is er bij een pomp in het vicous flow regime een hoog verschil in druk tussen de kamer en de inlaat?
#Leg het principe van een quadrupool MS uit. (Geen vgl's, gewoon principe) (4 punten)
#Spectrum van TXRF, bepalen van welk element elke piek komt en ook de oorsprong. (Sum peak etc) (periodiek systeem met spectrale overgangen gegeven + energieën gegeven) (5 punten)
#Welke interferenties treden op bij ICPMS en hoe kan je ze vermijden? (3 punten)

====Carl====
Beide vragen besproken op het mondelinge examen
#Rare oefening, vanalles berekenen maar vooral weten wat hoogste I geeft bij overgangen
#Interferenties bij AAS vlam en oven. Welke en leg uit hoe je ze kan verhelpen.

Polymer Sciences: from Synthesis to Polymer Material

2018-01-15T12:56:06Z

LaurenV: /* Examenvragen */

[[Categorie:Machemie]]

==Vakinformatie==
Gedoceerd door Professor Nies en Professor Koeckelberghs. Lessen zijn altijd in het Engels. De verdeling is 2/3 op het deel van Nies en 1/3 op het deel van Koeckelberghs. Bij Nies zijn er ook verplichte assignments tijdens het jaar, die meetellen voor een fractie 4/(12-N) van de punten van zijn deel (met N aantal assignments, doorgaans 2). Nies zijn examen is gesloten boek en er moet maar één vraag bij hem mondeling besproken worden (deze wordt op voorhand aangeduid). Bij Koeckelberghs zijn alle vragen mondeling te bespreken.

==Examenvragen==
===15 januari 2018===
====Prof. Koeckelberghs====
#living/controlled polymerization: definitie + uitleggen. Hoe kunt ge dat experimenteel kunt nagaan. Principe uitleggen hoe ge van free radical polymerization naar controlled polymerization gaat.
#De invloed van de moleculaire structuur van vinyl polymeren op polymerisatie en op de polymerisation rate en dan ook nog op inhibitie en retardatie
#bespreek emulsion polymerization

====Prof. Nies====
#Bespreek uw taak: gewoon uw taak uitleggen aan Nies (mondelinge vraag)
#plot van volumeverandering i.f.v. de tijd (case2-figuur 25) gegeven, bespreek ... (physical ageing)
#afleiding voor de Thomson-Tammann smelttemperatuur van een eindig sfeer kristal, met de fusie Gibbs vrij energie van een oneindig groot kristal gegeven

===25 augustus 2017===
====Prof. Koeckelberghs====
#Vergelijk anionische ring opening polymerizatie met kationische ring opening polymerizatie op vlak van
#*monomeer
#*intiator
#*mechanisme
#*terminatie/recombinatie
#*ceiling temperature
#Lewis Mayo en die R ratio's daar in. Welke dingen invloed daar op hebben en hoe + voorbeeld
#Welk invloed heeft de vorderingsgraad op molaire massa in step growth polymerizatie?

====Prof. Nies====
#(mondelinge vraag) bespreek grafiek en waarom dat dit gebeurt (uitleggen op moleculair niveau), grafiek van physical ageing
#Afleiding van hoofdstuk 4 Gibbs vrije energie wanneer een ideaal rubber deformatie ondergaat
#vanalles van UCST en LCST, iets vaags.

===20 januari 2017===
====Prof. Koeckelberghs====
#Anionische, kationische en frp uitleggen obv monomeer, terminatie en hoe ge het levend kunt maken
#Step growth en chain growth
#Ringopening methatese

====Prof. Nies====
Vraag 1:
#Wat is de definitie van een FRC?
#Bij welke condities is de FRC gelijk aan de FJC
#Bereken Lk en Nk voor de limiet van een enorm lange FRC (<R2>frc gegeven)
#Leidt een vergelijking af voor de mean squared end-to-end distance van een ideaal lineair diblock copolymeer bestaande uit Nk1 Kuhn monomeren met lengte lk dat vasthangt via 1 einde aan Nk2 Kuhn monomeren met lengte lk2
Vraag 2:
#Mengsel van PS in methylcyclohexaan (Mw = 355kg/mol)
Bij T=350K bestaat het mengsel uit 1 homogene vloeibare fase. Deze T is 6K boven de flory T. Polymeer volume fractie in de homogene fase is O,2
Bij T=335K: twee vloeibare fases, de polymeer volume fracties van de coexistant fases zijn 0,003 en 0,435
In de compositie range {0,002-0,044} en {0,336-0,435} is de structuur van de initiele fase scheiding kleine druppels in een matrix fase
#*Schets het verloop van delta Gmix ifv de volledige compositierange bij T=333K
#*Duid de points of interest in deze curve aan en leg ze uit.
#*Leg tot he point uit waarom je vraag a zo geschetst hebt
#*Wat zal de morfologie zijn in de initiële fase van scheiding?

===19 Januari 2017===
====Prof. Koekcelberghs====
#Vergelijken ven anionische en kationische ringopeningpolymerisatie op vlak van
#*Initiatie/Initiatoren
#*Terminatie/transfer
#*Mechanisme
#*Mogelijke monomeren
#*Ceiling temperature
#Geef de factoren die een copolymerisatie beïnvloeden
#Geef de invloed van de conversie bij een step-growth polymerisatie

====Prof. Nies====
#Vraag 1: bespreek je taak helemaal (mondeling)
#Vraag 2: Leid het verschil in Gibbs vrije energie voor een vervormd en onvervormd ideaal rubber af. End-to-end distance van een ideaal rubber en de Gaussische distributie zijn gegeven.
#Vraag 3: Gegeven een stelling die zegt dat er een closed-gap miscibility gap plaatsvindt, met een formule voor chi in functie van T. 2 kritische waarden voor de temperatuur zijn gegeven. De vraag is: kan deze stelling kloppen?

===16 januari 2017===
====Prof. Koeckelberghs====
#living/controlled polymerization: definitie + uitleggen. Hoe kunt ge dat experimenteel kunt nagaan. Principe uitleggen hoe ge van free radical polymerization naar controlled polymerization gaat.
#De invloed van de moleculaire structuur van vinyl polymeren op polymerisatie en op de polymerisation rate en dan ook nog op inhibitie en retardatie
#bespreek emulsion polymerization

====Prof. Nies====
#Bespreek uw taak: gewoon uw taak uitleggen aan Nies (mondelinge vraag)
#zie theoretical questions doc case 3 vraag 13, maar alleen de excess Gibbs energy en de chemical potentials waren gegeven
#Vraag 3:
#*thermodynamische uitdrukking voor spinodal en critical conditions afleiden.
#*zie theoretical questions doc case 2 vraag 4 en de uitdrukking voor de Gibbs energy is gegeven
#*de verbeterde Huggins uitdrukking voor de Gibbs energy is gegeven en daarvoor de enthalipsche en entropische bijdragen bepalen.
#*De FH uitdrukking is een speciaal geval van de Huggins uitdrukking: bepaal de conditie van y waarvoor dit geld + geef de fysische betekenis van die conditie

===14 januari 2016===
====Prof. Koeckelberghs====
#Vergelijk chemisch geïnitieerde FRP en ATR op vlak van:
#*Algemeen protocol
#*Snelheidsvergelijkingen
#*Invloed van de moleculaire structuur op de snelheid van polymerisatie
#Leg uit: step growth en chain growth polymerisatie. Hoe kan je experimenteel onderscheid maken tussen beide?
#Leg kort uit: Ziegler-Nattakatalysator

====Prof. Nies====
#Gegeven: Tg in functie van cooling rate. Verklaar de moleculaire oorsprong van dit fenomeen. (oral)
#*Mondelinge bijvraag: wat bepaalt, naast de kinetische energie, ook mee het vrije volume?
#Leid een formule af voor het smeltpunt van een eindig sferisch kristal.
#Vrije energie van mengen volgens Flory-Huggins gegeven:
#*Wat zijn de spinodale en kristische voorwaarden?
#*Geef de betekenis en eenheiden van elke parameter in de vergelijking.
#*Geef een concrete uitdrukking voor de kritische en spinodale voorwaarden afgeleid uit de bovenstaande vergelijking.
#*Geef een concrete uitdrukking voor de kritische phi en chi.
#*Gegeven een uitgebreide variant van de vergelijking van Flory en Huggins. Wat zijn de enthalpische en entropische bijdragen?
#*De oorspronkelijke formule van Flory en Huggins is een bijzonder geval van de bovenstaande vergelijking. Onder welke voorwaarde is dit en waarmee komt dit fysisch overeen?

===11 januari 2016===
====Prof. Koeckelberghs====
#Define living/controlled polymerisation. Hoe neem je dit experimenteel waar? Hoe maak je free radical controlled?
#Wat is de invloed van moleculaire structuur van monomeer op manier vinylpolymerisatie, snelheid en retardation/inhibition?
#Bespreek emulsiepolymerisatie.

====Prof. Nies====
#Case 2, figuur 27 uitleggen (specifiek volume in functie van tijd) (oral)
#Leid Gibbs Thomson uitdrukking af voor smelttemperatuur van sferisch kristal.
#Uitdrukking s^2 en massacentrum gegeven:
#*Leid average radius of gyration af met alles massa's = m.
#*Toon aan dat average radius of gyration = lb^2 (N+1)(N-1)/6N als i=1,2,3,...,N-1.
#*Veranderen de uitdrukking als er interacties zijn tussen de massa's met Lennard Jones interactie potentiaal?

===24 januari 2013===
====Prof. Koeckelberghs====
#Discuss the ceiling temperature and apply it on both the vinyl polymerization and ring opening polymerization. Is the ceiling temperature of a particular monomer dependent on the way it's polymerized?
Is it possible that a particular monomer, of which the ceiling temperature is such that only low-molar mass oligomers can be obtained via a living anionic polymerization at a certain temperature, can be polymerized into high-molar mass polymer using a free radical polymerization at the same temperature? Motivate your anwer.
#Explain the principle of a controlled radical polymerization and apply it on NMP and ATRP.
#Discuss briefly the living cationic vinyl polymerization.
====Prof. Nies====
Zie onderstaande afbeelding.
[
#Assignment 1 (oral)
#The free rotating chain (FRC) consists of N bonding vectors li, i=1,...,N with constant bond length |li| = lb and constant bond angles Ï´ii+1=Ï´, i=1,...,N between the successive bonding vectors. The average quadratic end-to-end distance <RÂ²>, valid for all physically sensible values of N, lb and Ï´, is given by [[Bestand:R-FRC.JPG]]
#*Show that the average quadratic end-to-end distance <RÂ²> of the FRC chain with very small bond angles also can be written in the Kratky-Porod chain form: <RÂ²> = 2lpL-2lpÂ²(1-exp(-L/lp),
with lp=lbL/(1-cosÏ´) the perstistence length and L the contour length.
#Derive from the general thermodynamic equilibrium conditions the melting point of a polymer crystal in equilibrium with a solution of the polymer.
For the polymer solution you can use the Flory-Huggins excess Gibbs-energy of mixing.
[[Bestand:G(mix).JPG]]

The chemical potentials of the components are given by:
[[Bestand:Chempot.JPG]] ]

[[Bestand:240113nies.png]]

===18 januari 2013===
====Prof. Koeckelberghs====
#Compare chemically initiated free radical polymerization and ATRP, for the following aspects:
#*general concept
#*rate of polymerization
#*influence of molecule structure on polymerization rate
#Discuss the differences in mechanism of chain growth and step growth polymerization. How can one investigate which type of polymerization he is dealing with?
#Explain briefly: Ziegler-Natta catalyst
====Prof. Nies====
#Discussion of assignment 1 (oral)

Zie onderstaande afbeelding.

#The expression of average squared end-to-end distance of the Kratky-Porod chain is given: <RÂ²> = 2lpL - 2lpÂ²(1-exp(-L/lp)
#*Derive expressions for the Kuhn segment length and the number of Kuhn segments for this chain.
#*Discuss your results. For instance, did you make any assumptions? Mention them explicitly.
#The excess Gibbs ebergy of mixing in the Flory-Huggins model is given: Î”G/NlkT = Î”g/kT = (Ï†1/s1)lnÏ†1 + (Ï†2/s2)lnÏ†2 + Ï‡Ï†1Ï†2
#*Derive expressions for the spinodal and critical conditions.
#*Derive from these expressions the formulae for the critical composition Ï†2,cr and critical value of Ï‡.
#*What is the relevance of the spinodal for material behaviour?
[[Bestand:180113nies.png]]

===20 januari 2012===
====Professor Nies====
#Gegeven een fase-diagram uit Case II. Wat gebeurt er als er vanuit punt A (dat links van de critical point lag):
#* traag wordt afgekoeld
#* wordt gequenched (1000K/min)
#* Hoe ziet de oplossing er na koelen uit voor beide gevallen
#5 begrippen uitleggen:
#*Thermo-elastische inversie
#*Physical ageing
#*Second order transition
#*Effective pair potential
#*Nucleation & growth
#Leidt de spinodal en critical conditions af en ook de waarden voor Fi(2,crit) en Chi(krit).

====Professor Koeckelberghs====
#Wat is de ceiling temperatuur en correleer dit met vinylpolymerisatie en Ring opening polymerisatie. Is de ceiling temperatuur afhankelijk van hoe we polymeriseren? Stel we polymeriseren via een living anionische polymerisatie. Het monomeer heeft een lage ceiling temperatuur, wat ervoor zorgt dat er geen lange polymeerketens worden gevormd. Kan men dan langere ketens verkrijgen als men bij dezelfde temperatuur via een radicale polymerisatie polymeriseert?
#M1 en M2 worden gecopolymeriseerd. Geef de parameters voor beide monomeren en leg uit waarvan deze afhangen.
# Leg uit: (radicalaire) emulsiepolymerisatie

===21 januari 2011===
====Professor Nies====
# Teken het verloop van de de gibssvrij-energie in functie van volumefractie bij een temperatuur van 300K. Volumefracties = 0,2. Coexistence points en spinodal points gegeven. Ook de verschillende punten aanduiden en kort uitleggen. (deze vraag was mondeling)
# Formule p 50 case 1 gegeven (zonder 4e term)
#* leg de symbolen uit + dimensies + eenheden
#* wat bedoelt men met "volgens de Flory benadering..."
#* leg de twee verschillende termen uit
#* Bereken end-to-end distance in evenwicht bij een flory-solvent
#* Bereken end-to-end distance in evenwicht bij een goed solvent
# Avramiplot+vergelijking gegeven
#*leg de parameters uit
#*hoe kan je volumefractie kristallijne fase meten, leg kort techniek uit.
#*geef een kwalitatieve bespreking van de grafiek
#*wat kan je uit de parameters afleiden

====Professor Koeckelberghs====
# zie vragen vorig jaar

===15 januari 2010===
====Professor Nies====
#Er was de grafiek gegeven met daarop de binodal, spinodal en Tg curve. Met daarop 3 punten aangegeven, telkens in het homogene gebied boven de binodal en boven Tg. Punt A: Links van kritische punt, punt B tussen kritische punt en Berghmans punt en punt C rechts van Berghmanspunt. (Alleen deze vraag mondeling)
#*Wat vindt plaats als je in punt A traag afkoelt?
#*Wat vindt plaats als je in punt A afkoelt met 1000K/min
#*Wat vindt plaats als je in punt B traag afkoelt
#*Wat vindt plaats als je in punt B afkoelt met 1000K/min
#*Wat vindt plaats als je in punt C traag afkoelt?
#*Wat vindt plaats als je in punt C afkoelt met 1000K/min
#Vergelijking van Groeisnelheid bij kristallisatie (U) gegeven: U=Fexp(A)exp(B)exp(C) Zowel F,A,B,C waren gegeven in symbolen(vergelijking onder 7.B case III)
#*Geef waarvoor de symbolen staan en wat hun eenheden zijn.
#*Verklaar waar de Frontfactor (F) en de drie exp's vandaan komen
#*Bespreek temperatuursafhankelijkheid en geef een schets
#Geef de definitie van een ideale Rubber
#* Leid de uitdrukking voor af voor S bij een willekeurige verandering. P(R) gegeven

====Koeckelberghs====
#Vergelijk radicalaire, anionische en kationische vinylpolymerisatie
#*Mogelijke monomere deeltjes (stabiliteit)
#*Terminatie reacties
#*Invloed van verschillende voorkomende deeltjes op sneldheid (hiermee bedoelde hij de associated ion pairs etc)
#*Mogelijke manier om ze 'levend' te maken. (of quasi levend)
#*? dacht dat er nog 1 was
#Je wil een ideaal, perfect blockcopolymeer maken van MMA en MA op anionische wijze. Welk monomeer moet je eerst polymeriseren? Blijft indien je dit met ATRP wil doen de volgorde dezelfde?
#Bespreek kort Ring Opening Metathesis Polymerisatie.

Bioinformatica en Modelering

2017-06-28T09:31:22Z

LaurenV: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]

==Vakinformatie==
Derde bachelor biochemie. Gedoceerd door Prof. Marc de Maeyer. Examen mondeling, oefeningen vooraf geÃ«valueerd via verslagen.
In totaal 7 examenvragen, waarvan de eerste twee beide op 5 punten staan en de eerste mondeling besproken moet worden. De rest bestaat uit kleinere vragen van elk 2 punten. Je krijgt altijd (bij het mondeling gedeelte) een vraag waarbij je voor 3 aminozuren, de structuur, drieletter- en Ã©Ã©nlettercode moet geven. 30% van de punten staat op de verslagen van de oefenzittingen.

Sinds 2016-2017 wordt het vak gedoceerd door A. Voet. De algemene puntenverdeling: 35ptn examen en 15ptn verslagen. De eerste vraag is steeds mondeling, de tweede vraag is een trekvraag. Bij de trekvraag is er geen voorbereiding, direct te beantwoorden. 20% van de totale eindscore staat op de verslagen van de oefenzitting, je moet hiervoor slagen anders faal je sowieso in eerste zit.

==Examenvragen==
=== 28 juni 2017 (VM) ===
# (mondeling) Bespreek CLUSTAL algoritme dat wordt gebruikt voor MSA. Wat kan je doen als er fouten opgetreden zijn in de eerste sequentie (zoeits, maar hij doelde op iteratieve procedure dus) (12 ptn)
# (mondeling) Trekvraag 1 vraag pp.:
#* tripeptide GIG teken plus phi, psi, omega en Chi 1 en 2 aanduiden plus waarvoor worden ze gebruikt.
#* Afbeelding van een phylogenetische boom: Wat voor boom is dit en wat zijn de cijfertjes bij de knooppunten.
# Bespreek de gebonden en niet-gebonden termen in de energie uitdrukking (FF). Waarvoor staan deze? (6ptn)
# Juist of fout (9 ptn)
#* Maximum parsimony is de enige methode die de relatie met de ancestrals reflecteert
#* PDB database bevat enkel experimentele structuren. Dus enkel structuren verkregen via Xray/Kristallografie of NMR.
#* Wanneer we een BLAST uitvoeren met een database met minder sequenties zal de E-waarde kleinzer zijn dan wanneer we een BLAST uitvoeren t.o.v. een database met veel sequenties
# Bespreek de verschillen tussen PAM en BLOSSUM matrices (3ptn)
=== 19 juni 2017 (NM) ===
# (mondeling) Bespreek homology modelling
# (mondeling) Trekvraag:
#* Contact map
# Ramachandran en rotameerplot.
## Teken het tripeptide SYT
## Duid de belangrijke hoeken aan op het peptide
## Waarvoor worden deze plots gebruikt?
# Juist of fout!
#* BLOSUM250 kan gebruikt worden voor zeer similaire sequenties
#* TBLASTN wordt gebruikt om homologie te zoeken tussen non-coding regions in DNA
#* N-W kan gebruikt worden om multidomeinproteïnen te aligneren waarvan 1 domein evolutionair verwant is
# Hoe kan je een boom wortelen? Bij welke methode gebeurt dit automatisch?

=== 19 juni 2017 (VM) ===
# (mondeling) Hoe phylogenetische boom maken. Leg ook schematisch uit de methode die de voorkeur draagt afhankelijk van de sequentie-informatie
# (mondeling) Trekvraag: (verschillende bij iedereen hier zijn een paar vb.)
#* hamiltoiaan
#* moleculaire klok hypothese
#* Protein Surface Representation
# C en W (cys en trp)--> lage of hoge waarden in vergelijking met de andere residuen in PAM of BLOSUM?
## Verklaar biochemisch
## Duid de hoeken aan (omega, chi 1 chi 2, psi, phi) aan de dipeptide CW
## Waarvoor zijn deze hoeken belangrijk? (Ramanchandran plot dus)
# Juist en Fout
#* hoogste bitscore gelijk aan 4
#* met een FF kan de energie van de conformatie niet berekend worden voor kleine molecule
#* PSI-Blast (sorry ik weet niet meer wat die juist erover vroeg)
# Hoe kan je met behulp van MSA info krijgen over tertiaire en quaternaire structuur van een familie van proteïnen

=== 12 juni 2017 (NM) ===
# (mondeling) Globale en locale alignering van twee sequenties. Bespreek de algoritmen.
# (mondeling) Trekkaart
#* Kaartje 1: Benoem de verschillende surfaces van een proteinen in Pymol.
#* Kaartje 2: Bespreek de Hamiltoniaan.
# Benoem pdb kolommen. Gaat het om een kristalstructuur of NMR? Tekening peptide.
# Juist of fout:
#* H bruggen hoeven in een Force field niet weergegeven te worden omdat ze al vervat zitten in de Lennard Jones term van de VdW stralen.
#* Is Neighbor joining altijd de meest nauwkeurige methode bij een phylogenetische analyse.
#* Klopt het dat PAM 250 en BLOSUM92 samenhoren zoals PAM120 en BLOSUM62.
# Nieuw virus ontdekt. De genomische sequentie is gekend. Virussen coderen proteinen in meerdere leesramen. Met welk programma (wees precies!) kan je opzoek gaan naar een homoloog?

=== 12 juni 2017 (VM) ===
# (15ptn) mondeling: Bespreek PAM matrices, wat is het, hoe kom je eraan en waarvoor gebruikt men het?
# (5ptn) mondeling: Trekvraag (er liggen zeker 9 kaartjes)
#* Kaartje 1: Foto van contact map (bijvraag: zijn er nog andere manieren om tot deze map te komen? (doelt op correlated mutations)
#* Kaartje 2: een rotameerplot
# (6ptn schriftelijk) Foto van PDB-file
## Bespreek alle kolommen
## Teken residu 559 (was isoleucine). Duid volgende hoeken aan: phi, psi, omega, chi1 en chi2
## Waarvoor worden hoeken phi en psi gebruikt?
# (9ptn, schriftelijk) Juist of fout? Verklaar ook waarom
#* Bij het maken van een polygenetic tree (met DNA of proteinen) via NJ of UPGMA wordt er gebruikt gemaakt van sequence similarity.
#* In de formule van Force Fields is de term van de waterstofbruggen altijd aanwezig.
#* Bij de sequentie alignering via Needleman-Wunch of Smith-Waterman is er steeds één uitkomst mogelijk.
# (3ptn, schriftelijk) Ik wil onderzoeken of mijn nieuw ontdekte virusgenoom homologie vertoont met een ander virusgenoom. Welk programma gebruikt ik best (wees specifiek!)?

=== 6 juni 2016 (VM) ===
# (mondeling)Het berekenen van een krachtveld kan veel pc-tijd innemen omwille van de vele interacties die moeten worden beschouwd, welke termen in de vgl van het ff hangen het meest af van het aantal atomen (en hoe?) hoe wordt de pc tijd onder controle gehouden.
# je krijgt van een collega een model, hoe evalueer je de kwaliteit?
# Wat is het meest belangrijke gegeven dat je nodig hebt wanneer je een katalytisch centrum wil inbouwen door gerichte mutaties?
# Is de DEE methode een minimisatiemethode of niet? Waarom wel/niet?
# Bespreek de wiskundige vergelijking die de interactie van de waterstofbruggen weergeeft.
# Wat is het essentiÃ«le verschil tussen de steepest descent minimisatie en de conjugated gradient minimisatie.
# Wat is het verschil tussen een Force Field en een Scoringsfunctie?

extra) tijdens mondeling krijgt ge nog een papier met drie AZ op (lange naam). Ge moet de 1lettercode en 3 lettercode geven en het peptide tekenen. Daarna hoe ge Ã©Ã©n van de AZ getekend hebt (cis of trans -> kijken naar omega hoek)

=== 24 juni 2015 ===
# Bespreek de verschillende dihedrale hoeken die een proteÃ¯ne kenmerken. Wat kun je hieruit besluiten? Geef mogelijke toepassingen waarbij deze hoeken gebruikt worden.
# Bespreek minimaal 3 veel voorkomende 3-dimensionale organisaties in eiwitstructuren en geef eventuele uitzonderingen hierop.
# Hoe kan men de 3D-structuur van loops voorspellen?
# Waarom heeft een alfa-helix een dipoolmoment?
# Hoe kun je de locatie van een beta-plaat bepalen zonder de 3D-structuur te kennen?
# Hoe bekomt of bepaalt men de 'angle bending' parameters?
# Bespreek het onderliggende principe van de steepest descent minimisatiemethode.

=== 6 juni 2014 (nm) ===
# (mondeling)De waterstofbrug is een belangrijke energie die kan gebruikt worden bij de ontwikkeling van biologische actieve stoffen. Bespreek de eigenschappen. Bespreek ook hoe we deze via berekeningen kunnen kwantificeren.
# (mondeling) Teken een tripeptide van volgende drie aminozuren: X,Y,Z (verschilt per persoon). Geef ook de drie-letter en de Ã©Ã©n-letter code. Bijvraag: Staan deze trans of cis?
# Hoe kan je de 3D structuur voorspellen van een eiwit sequentie die weinig sequentie homologie vertoont in vergelijking met gekende 3D structuren?
# Wat is een "nulde-orde" minimisatie methode? Verklaar m.b.v. voorbeelden.
# Bespreek hoe je een goede inschatting van de diÃ«lektrische constanten kon maken bij de berekening van de potentiÃ«le energie in een chemische structuur.
# Wat heb je nodig om een Force Field (FF) te kunnen definiÃ«ren?
# Wat is de 'Molecular Surface' en hoe bereken je deze?
# Hoe kan je de locatie van een alfa-helix in een eiwit bepalen zonder de 3D structuur te kennen?

=== 6 juni 2014 (vm) ===
# (mondeling)Het berekenen van een krachtveld kan veel pc-tijd innemen omwille van de vele interacties die moeten worden beschouwd, welke termen in de vgl van het ff hangen het meest af van het aantal atomen (en hoe?) hoe wordt de pc tijd onder controle gehouden.
# Je krijgt van een collega student een model. Hoe kan je en ga je na of dit een goed model is voor de 3D structuur van je echt eiwit?
# Bespreek de wiskundige vergelijking die de interactie van de waterstofbruggen weergeeft.
# Wat is het verschil tussen een Force Field en een Scoringsfunctie?
# Wat is het essentiÃ«le verschil tussen de steepest descent minimisatie en de conjugated gradient minimisatie.
# Wat is het meest belangrijke gegeven dat je nodig hebt wanneer je een katalytisch centrum wil inbouwen door gerichte mutaties?
# Is de DEE methode een minimisatiemethode of niet? Waarom wel/niet?

=== 17 juni 2013 ===
#(mondeling) Hoe kun je een proteÃ¯ne thermostabiliseren door mutaties in te voeren? Wat bereken je hiervoor?
#Fragment uit een pdb-file: 11 kolommen benoemen + uitleggen; en identificeren wat de bron was
#Rotameerconcept + toepassingen
#Ramachandramplot: tekenen + functie + gebruik en toepassingen.

=== 12 juni 2013 ===
# (mondeling) 3 aminozuren + bijvragen over de hoeken: aanduiden op de getekende structuur
# (mondeling) je krijgt van een collega een model, hoe evalueer je de kwaliteit?
# welke termen zorgen voor veel rekenwerk in je krachtveldmethode, waarom en hoe kan je dat rekenwerk toch beperken
# bespreek de elektrostatische term
# je hebt een fold en je wil de beste sequentie hiervoor, wat moet je doen?

=== 10 juni 2013 (nm) ===
# (mondeling) Hoe kunnen we het oppervlak van een molecule karakteriseren. Wat kunnen we hiermee doen?
# Hoe kan je een 3D model van een sequentie maken wanneer er weinig homologie is.
# Wat zijn de eigenschappen van de H-brug en hoe wordt de energie ervan gekwantiseerd?
# Welke gegevens heb je nodig wanneer je een katalytisch centrum wil inbouwen door gerichte mutaties?

=== 10 juni 2013 (vm) ===
# (mondeling)Het berekenen van een krachtveld kan veel pc-tijd innemen omwille van de vele interacties die moeten worden beschouwd, welke termen in de vgl van het ff hangen het meest af van het aantal atomen (en hoe?) hoe wordt de pc tijd onder controle gehouden.
# Je krijg van een collega student een model. Hoe kan je en ga je na of dit een goed model is voor de 3D structuur van je echt eiwit?
# bespreek de elektrostatische interacties van een krachtveld, de methoden om deze te bereken en voor- en nadelen.
# Hoe kan je de optimale sequentie bepalen uit een gegeven vouwing?

=== 11 juni 2012 (nm) ===
# (mondeling) Hoe kunnen we het oppervlak van een molecule karakteriseren. Wat kunnen we hiermee doen?
# Hoe kan je de 3D structuur voorspellen van een eiwit sequentie die weinig sequentie homologie toont in vergelijking met gekende 3D structuren?
# Wat is het rotameer concept en waarvoor kunnen we dit gebruiken?

=== 20 juni 2011 (nm) ===
# Hoe kan je een proteÃ¯ne thermostabiliseren?
# Bespreek de onderstaande PDB file (een stukje met ATOMS en dan moest je alle kolommen benoemen)
# Bespreek het rotameerconcept, waar kan je dit op toepassen?
# Kaartje: arginine, threonine en tryptofaan

=== 10 juni 2011 (vm) ===
# Voor energie van eiwit maken we gebruik van krachtvelden. Welke termen (en hoe? => formules !) zijn gevoelig voor het aantal atomen? Welke stappen kunnen we ondernemen om het rekenwerk toch onder -controle te houden?
# Je krijg van een collega student een model. Hoe kan je en ga je na of dit een goed model is voor de 3D structuur van je echt eiwit?
# Je slaagt er in het labo in om een proteÃ¯ne op te zuiveren. Je stuurt je proteÃ¯ne naar een bevriend labo om het te laten kristalliseren. Maar je vraagt al reeds de ruwe coÃ¶rdinaten op van haar proteÃ¯ne. Er waren ook nog geen kwantummechanische gegevens verkrijgbaar, dus nog geen elektronendensiteiten om de coÃ¶rdinaten juist in te situeren. Welke methode moet je gebruiken om de energie van haar proteÃ¯ne te minimaliseren. + leg uit hoe de methode werkt.
# Kaartje: arginine, histidine en aspargine

=== 7 juni 2010 (nm) ===
# bouw zoutbrug in, thermostabiliteit blijft gelijk. Waarom? ( + formules )
# bespreek alles van alpha-helix
# bespreek belangrijkste stappen homologie modellering
# kaartje : tryptofaan, isoleucine, asparagine, methionine ( structuur, 1-lettercode en 3-lettercode )
=== 7 juni 2010 (vm) ===
#hoe kan je een proteÃ¯ne thermostabiliseren?
#bespreek de onderstaande PDB file (een stukje met ATOMS en dan moest je alle kolommen benoemen)
#energieminimalisatie van een organisch molecule, welke methodes zou je gebruiken en bespreek.
-aminozuren: tryptofaan, histidine, glutamine en proline
=== 15 juni 2009 ===
# hoe kan je het oppervlak van een molecule karakteriseren?
#bespreek de onderstaande PDB file (een stukje met ATOMS en dan moest je alle kolommen benoemen)
#bespreek het rotameer concept, waar kan je dit op toepassen?
-Bijvraagje: welke residu's komen het meest voor in B-strands?
=== 15 juni 2009 ===
# Om een de energie van een proteÃ¯ne te bepalen moeten we een krachtveld toepassen. Wanneer we echter proteÃ¯nes hebben met veel atomen zal er meer rekenwerk zijn dan bij proteines met minder atomen. Welke termen zijn vooral (en hoe) afhankelijk van het aantal atomen? Waarom is dit zo en wat kunnen we doen het rekenwerk toch vlugger te laten gaan? (Mondeling)
# Bijvraagje mondeling: bespreek in 2 zinnen verschil tussen PAM en BLOSUM
# Kaartje 3 AZ
Schriftelijk:
# Bespreek en geef eigenschappen van de alfa-helix als dipool.
# Je hebt je proteÃ¯ne naar een bevriend labo gestuurd om te kristaliseren... enz. Welke minimisatietechniek gebruikje en bespreek deze.
=== 8 juni 2009 ===
# bouw zoutbrug in, thermostabiliteit blijft gelijk. Waarom? ( + formules )
# bespreek alles van alpha-helix
# bespreek belangrijkste stappen homologie modellering
# kaartje : histidine, isoleucine, asparaginezuur ( structuur, 1-lettercode en 3-lettercode )
=== 18 jan 2008 ===
# Je wil een proteÃ¯ne thermostabiliseren en voert daarom een zoutbrug in. Dit blijkt echter geen effect te hebben. Leg de mogelijke oorzaken uit. Gebruik de formules.
# Leg de belangrijkste stappen in homologie modellering uit.
# Je hebt een proteÃ¯ne opgezuiverd en stuurt het naar een bevriend labo. Blablabla, zie vorig jaar.
=== 18 jan 2008 ===
# Hoe kan je het oppervlak van een proteine karakteriseren, en wat kan je daarmee doen?
# Wat is het concept rotameren, en hoe kan je dit toepassen?
# Hoe voorspel je 2D structuur elementen, en als je een helix sequentie kent hoe kan je bepalen waar het zich zal bevinden in 3D structuur?
=== 1 feb 2007 ===
# Bespreek de verschillende torsiehoeken die in een proteÃ¯ne kunnen voorkomen en zeg waar ze een toepassing hebben
# Bespreek secundaire structuurvoorspelling en zeg hoe je meer informatie kan krijgen over de positie van een (voorspelde) helix in het proteÃ¯ne.
# Je hebt je proteÃ¯ne naar een bevriend labo gestuurd om te kristaliseren... enz. Welke minimisatietechniek gebruikje en bespreek deze.
=== 1 feb 2007 ===
# Bespreek de elektostatisch term van het krachtveld
# Bespreek beta sheet and beta strands
# van 2D naar 3D: welke minimisatiemethode?
=== 22 jan 2007 ===
# Hoe kunnen we een proteine thermostabiliseren
# tabellen van pdb bespreken
# van 2D naar 3D: welke minimisatiemethode?
=== 22 jan 2007 ===
# Hoe kan een oppervlak van een proteÃ¯ne gekarakteriseerd worden en hoe kan het worden toegepast
# Ge kreeg een PDB-file en daarvan moest ge al de kolommen bespreken, zeggen wat er in stond.
# Bespreek het rotameer-concept en waar wordt het gebruikt?
=== 19 jan 2007 ===
# Om een de energie van een proteÃ¯ne te bepalen moeten we een krachtveld toepassen. Wanneer we echter proteÃ¯nes hebben met veel atomen zal er meer rekenwerk zijn dan bij proteines met minder atomen. Waarom is dit zo en wat kunnen we doen het rekenwerk toch vlugger te laten gaan?
# Bespreek en geef eigenschappen van de alfa-helix als dipool.
# Je slaagt er in het labo in om een proteÃ¯ne op te zuiveren. Je stuurt je proteÃ¯ne naar een bevriend labo om het te laten kristalliseren. Maar je vraagt al reeds de ruwe coÃ¶rdinaten op van haar proteÃ¯ne. Er waren ook nog geen kwantummechanische gegevens verkrijgbaar, dus nog geen elektronendensiteiten om de coÃ¶rdinaten juist in te situeren. Welke methode moet je gebruiken om de energie van haar proteÃ¯ne te minimaliseren. + leg uit hoe de methode werkt.</text>

Spectroscopische Meettechnieken

2017-06-21T19:54:35Z

LaurenV: /* 21 juni 2017 */

[[Categorie:Bachelor Chemie]]

==Vakinformatie==
Hall0,
het vak sectrosocpische mettchen1eken is een ware belevenis. Professor Vander Auweraer is op zijn zachtst gezegd een fenomeen. Het moet gezegd worden, de lessen zijn niet bijster interessant en de cursus laat hier en daar wel eens te wensen over maar het is een zeer warm persoon. Spelling (of spleling in het Van Der Auweraers) is niet zijn sterkte punt. Het examen is openboek.

Bij dit openboekexamen helpt een inhoudsopgave wel, vermits deze niet door Prof Vander Auweraer zelf voorzien is, hebben we er zelf eentje gemaakt. De pagina's van Hoofdstuk 6 moeten je wel nog zelf nummeren van 1 tot 38 en hoofdstuk 8 van 101 tot 143 dan klopt normaal gezien alles (tenzij de cursus aangepast wordt).[[Bestand:Inhoudsopgave_spectroscopische_meettechnieken_2014.pdfâ€Ž]]

==Examenvragen==

===21 juni 2017 ===
# vraag 1 18 juni 2014
# vraag 2 18 juni 2014
# vraag 4 18 juni 2014
# vraag 5 18 juni 2014
# Aggregatie van niet-chirale chromoforen kan aanleiding geven tot circulair dicroïsme. Verwacht u een rotatiesterkte verschillend van nul voor pakking a en/of b?
(tekeningen van pakking a (=achiraal) en b (=chiraal))
- Pakking a: in zelfde vlak, onderlinge hoek = alfa = 120°, tèta is hoek met de as die beide centra verbind en alfa +2tèta=180°
- Pakking b: in 2 vlakken loodrecht op de as die hun verbind (tèta = 90°) en alfa =120°
Argumenteer zowel met de uitdrukking voor rotatiesterkte als op basis van eventuele chiraliteit v.d. gevormde aggregaten (zijn deze chiraal?)

===17 juni 2016 ===
[[Media:Voorbeeld.ogg]]
=== 15 juni 2016 ===

# H2 spectrum met invallende golflengte gegeven en ook nog 4 golflengtes van ramanrotatielijnen. Bereken r.
# Fe2O2 vraag (zie lager)
# Al+ vraag van op wiki van wat er met de laagste overgang gebeurt in een magneetveld
#Uitvoeren met deeltje in de doos:
Een allylradicaal waar je de energie van een dubbel bezet pi orbitaal in grondtoestand en die van een enkelbezette moest geven.
Bepaal ook de transitiedipool als de bindingslengte = 0,14 nm en de dubbele binding een hoek van 30 graden maakt met de richting van het molecule.
Bijvraag: is deze overgang mogelijk?

=== 19 juni 2015 ===
# nulpuntsenergie, bindingsenergie, afstand tussen 2 atomen, temperatuur (en miss nog andere dingen) gegeven. Gevraagd:
#* Wat zijn de vibratiefrequentie (cm-1), krachtconstante, en de anharmonisiteitsconstante?
#* Hoeveel vibratieniveaus zitten in de put?
#* Bereken de rotatieconstante.
#* Bereken zo nauwkeurig mogelijk de eerste 3 rotatieniveaus.
#* Hoe ziet het fluorescentiespectrum eruit?
# Geef het ESR spectrum van het butadieen radicaal anion. Dit radicaal heeft 4 equivalente protonen met een hyperfijnconstante van 14,3 gauss en twee equivalente protonen met een hyperfijnconstante van 2,8 gauss. Wat is de spindichtheid op elk van de koolstofatomen? Komt dit overeen met wat je verwacht van Huckel Moleculaire Orbitalen?
# Welke overgangen zijn mogelijk van het Ca+ -ion vanuit zijn elektronische stabielste toestand? Bereken de opsplitsing van de laagste aangeslagen elektronische toestand in een veld van 5T. (opgelet: juiste g parameter berekenen want delta S niet gelijk aan 0)

=== 17 juni 2015 ===
# Het absorptiespectrum van een CdSe kwantum dot (kubus met ribbe 2 nm) heeft een maximum bij 460 nm met een extinctiecoÃ«fficiÃ«nt van 49000 cm-1 in een midden met een brekingsindex n = 7. De breedte van de absorptieband bedraagt 400 cm-1. NB: U mag stellen dat Îµr = n2 en Îµ = ÎµrÎµ0.
#* Bereken de oscillatorsterkte.
#* Bereken de coÃ«fficiÃ«nt voor spontane emissie bij 485 nm.
#* Bereken het transitiedipool. (a, b & c max 1 blz.)
#* Gebruik het deeltje in de doos om de verschuiving te berekenen van de absorptieband voor de overgang tussen de valentieband en de conductieband (waarvan u mag aannemen dat de overgang van het hoogste niveau van de VB naar het laagste niveau van de CB is) ten opzichte van een CdSe kristal met oneindige dimensies. Gebruik als effectieve massa voor de elektronen en gaten respectievelijk 0.13me en 0.45me.
#* Bijvraag: Is deze overgang op basis van de gegevens voor Îµ, f en Âµ* toegelaten?
# Het rotatiespectrum van 1H35Cl vertoont opeenvolgende lijnen bij de volgende golfgetallen: 83.32, 104.13, 124.73, 145.37, 165.89, 186.23, 206.60, 226.86 cm-1. Bereken het traagheidsmoment en de bindingslengte. Voorspel de ligging van deze lijnen voor 2H35Cl (dit volstaat voor de eerste twee lijnen).
# Acetyleen: vibraties gegeven. Welke vibraties zijn IR actief? En welke Raman actief? Hoeveel normale vibratiemodes zijn er mogelijk? (1/2 Ã 1 blz.)
#* Bijvraag: Er zijn 5 vibraties getekend, terwijl 3N-5 = 7. Hoe is dit mogelijk?
# Wat gebeurt er voor waterstof met de overgang van 2D3/2 naar 2F5/2 in een magneetveld? (1 Ã 2 blz.)
#* Bijvraag: Welke techniek kun je gebruiken om de overgangen te bestuderen die enkel verschillen in mj?

===23 juni 2014 ===
# Het absorptiespectrum van een verbinding heeft een maximum bij 485 nm terwijl het maximum van het emissiespectrum bij 505 nm ligt. De EinsteincoÃ«fficient voor spontane emissie bedraagt 3,2 108 s-1. Bepaal het transitiedipool en de maximale extinctiecoÃ«fficient wanneer de breedte bij halve hoogte van de absorptieband 760 cm-1 bedraagt. U mag de absorptieband beschouwen als een gelijkbenige driehoek.(maximum 2 blz)
# De golflengte van de invallende straling in een Ramanspectrometer is 488,1 nm. Wat is het golfgetal van de eerste lijn van de Stokescomponent van het rotatie Ramanspectrum van 16O2? De bindingslengte bedraagt 0,121 nm.
# Voor CHCl3 vinden we voor de CH-stretching vibratie een intense band bij 3019 cm-1 en progressief zwakkere banden bij 5900, 8700 en 13315 cm-1. Bepaal de bindings- en dissociatie energie.
# Geef het ESR spectrum van het butadieen radicaal anion. Dit radicaal heeft 4 equivalente protonen met een hyperfijnconstante van 7,6 gauss en twee equivalente protonen met een hyperfijnconstante van 2,8 gauss. Wat is de spindichtheid op elk van de koolstofatomen?

=== 18 juni 2014 ===
[[Bestand:Examen spectro 18 06 2014.pdf]]

=== 10 juni 2014 ===
# Het absorptiespectrum van het monomethine thiacyanine MTHIATS heeft een maximum bij 440 nm (structuur gegeven maar eigenlijk niet nodig). De maximale extinctiecoÃ«fficiÃ«nt en de breedte bij halve hoogte van de absorptieband bedragen respectievelijk 8.0x104 lmol-1cm-1 en 1500 cm-1. Bepaal het transitiedipool en de EinsteincoÃ«fficiÃ«nt voor spontane emissie (maximum en gemiddelde van het emissiespectrum bij 22000 cm-1). U mag de absorptieband beschouwen als een gelijkbenige driehoek.
# Bereken Nj/N0 voor 1H19F molecule voor J=0, J=5 en J=10 bij 298K. De bindingsafstand is 0.92Ã… en de vibratie constante = 966Nm-1
#* Voor welke waarde van J is Nj/N0 maximaal?
#* Wat is de energie van de J=5 â†’ J=6 overgang?
# Het NO2+ ion bezit twee ontaarde IR-absorptiebanden bij 540 cm-1 en een (niet-ontaarde) IR-absorptieband bij 2360 cm-1. Daarnaast heeft het een Ramanband (deze overgang wordt niet in het IR-spectrum waargenomen) bij 1400 cm-1.
#* Verklaar dit spectrum en leg een verband met de moleculaire structuur van NO2+.
#* Verder wordt nog een weinig intense IR-absorptielijn waargenomen bij 3735 cm-1. Waaraan is deze te wijten?
# Hoe wordt de energie van een 2p-elektron van waterstof opgesplitst in een magneetveld B0? Bekijk alle mogelijke toestanden.
'''OPGEPAST:Bereken de juiste LandÃ© splitting factor (Ge)!! '''

# Wat is de magnetisatie van Na kernen in 1ml van een 1*10-3M oplossing Na+ ionen in een veld van 9 Tesla bij 298 Kelv1n (I= 3/2 voor Na)
'''OPGEPAST: dit is iets met een reeksontwikkeling zei hij op het examen...
'''

===17 juni 2013 Groep 1===
# nulpuntsenergie, bindingsenergie, afstand tussen 2 atomen, temperatuur (en miss nog andere dingen) gegeven. Gevraagd:
#* krachtconstante, vibratiefrequentie en anharmoniciteitsconstante
#* aantal vibratieniveaus
#* rotatieconstante
#* energie van eerste 3 rotatieniveaus
#* mogelijk fluorescentiespectrum
# iets ivm EPR van radicaal
#* spindichtheid op koolstofatomen berekenen
#* teken spectrum
#* vergelijken met resultaten van Huckel MO
# Ca+ => geeft grondtoestand en mogelijke transities hieruit en geef opsplitsing in energie van laagst energetische aangeslagen toestand in een veld van 5 Tesla.

===17 juni 2013 Groep 2===
#Bij het elektronisch-vibratie absorptiespectrum de ....overgang van BeO vindt men onderstaande bandoorsprongen voor de verschillende vibratie-rotatiebanden.
#*Bepaal de beste waarden voor Ï–e en Ï‡e voor de ... en ...toestand.
#*Bepaal de bindingsenergieÃ«n( zie examen 7 september 2011 vraag 5)
#hoe ziet het EPR spectrum van CD3Â° er uit?(I voor D=1). Als je weet dat de hyperfijnconstante voor CH3Â°=....G, wat is dan de hyperfijnconstante van CD3Â°?
#Bereken welk rotatieniveau van CH4 maximaal bezet zal zijn bij 25Â°C, B=.... let op, de ontaarding is hier nu (2J+1)Â² i.pv. (2J+1).

===22 juni 2012 Groep 1===
# Het absorptiespectrum van het monomethine thiacyanine MTHIATS heeft een maximum bij 440 nm (structuur gegeven maar eigenlijk niet nodig). De maximale extinctiecoÃ«fficiÃ«nt en de breedte bij halve hoogte van de absorptieband bedragen respectievelijk 8.0x104 lmol-1cm-1 en 1500 cm-1. Bepaal het transitiedipool en de EinsteincoÃ«fficiÃ«nt voor spontane emissie (maximum en gemiddelde van het emissiespectrum bij 22000 cm-1). U mag de absorptieband beschouwen als een gelijkbenige driehoek.
# Voor welke waarde van J is NJ/N0 maximaal voor het 1H19F molecule bij 298K. De bindingslengte bedraagt 0.92Ã…. Wat is de exacte energie van de J=5â†’J=6 overgang? De vibratiekrachtconstante is 966 Nm-1.
# Het NO2+ ion bezit twee ontaarde IR-absorptiebanden bij 540 cm-1 en een (niet-ontaarde) IR-absorptieband bij 2360 cm-1. Daarnaast heeft het een Ramanband (deze overgang wordt niet in het IR-spectrum waargenomen) bij 1400 cm-1.
#* Verklaar dit spectrum en leg een verband met de moleculaire structuur van NO2+.
#* Verder wordt nog een weinig intense IR-absorptielijn waargenomen bij 3735 cm-1. Waaraan is deze te wijten?
# Hoe wordt de energie van een 2p-elektron van waterstof opgesplitst in een magneetveld B0? Bekijk alle mogelijke toestanden.

===18 juni 2012===
# Wat is de magnetisatie van 1ml van een oplossing van 2H met als concentratie 10-3M in een veld van 9T en bij 298K. (I = 1)
# De traagheidsmomenten van het lineaire HgBr2 zijn zeer groot dus de O en S takken van de vibrationele Raman spectra tonen weinig rotationele structuur. Berekenen de bindingslengte als je weet dat J correspondeerd met de maximale intensiteit. Afstand tussen de maxima van de O en S takken is 15,2 cm-1.
# Een transitie van groot belang in zuurstofgas geeft aanleiding tot de 'Schumann-Runge band' in UV. De golfgetallen van de transities van de grondtoestand naar vibrationele niveaus van de eerst aangeslagen toestand zijn gegeven. Bereken de dissociatie-energie van de hoogste liggend elektronisch niveau. Dezelfde aangeslagen toestand dissocieert naar een O atoom met 1 grondtoestand en 1 aangeslagen atoom met een energie van 190 kJ/mol boven de grondtoestand. Bereken hieruit de dissociatie-energie van de grondtoestand van zuurstofgas.
# Yb3+ heeft een 2F configuratie. Welke toestand zullen door spinorbitaalkoppeling bekomen worden? Deze met de hoogste J-waarde ligt het laagst in energie. Bereken kwantitatief de invloed van een magneetveld met sterkte B(0). Is de oscillatorstekte groot voor de eerste aangeslagen toestand? (golflengte gegeven).
#* Bijvraag: met welke techniek zouden we het verschil tussen de energieniveau's kunnen meten?

===24 juni 2011 - groep 2===
# Het absorptiespectrum van CdSe kwantum dot heeft een maximum bij 460 nm met een molaire extinctiecoÃ«fficiÃ«nt van 49000 cm-1 M-1 in een midden met een brekingsindex gelijk aan 7. De breedte van de absorptieband bedraagt 400 cm-1.
#* Bereken de oscillatorsterkte.
#* Bereken de EinsteincoÃ«fficiÃ«nt voor spontane emissie voor de emissie bij 485 nm.
#*Bereken het transitiedipool.
# Gegeven: enkele pieken van het rotatiespectrum van HCl. Bereken het traagheidsmoment en de bindingslengte. Voorspel de eerste twee pieken van gedeutereerd HCl.
# Welk van de onderstaande vibraties van de acetyleen zijn IR-actief? Welk zijn Ramanactief? Hoeveel normale vibratiewijzen zijn hier mogelijk?
# Wat gebeurt voor waterstof met de overgang van 2D3/2 naar 2F5/2 in een magneetveld?

===24 juni 2011 - groep 1===
#Het rotatiespectrum van H2 (te beschouwen als starre rotator) bekomen door instralen met een laser bij 488 nm, bestaat uit een reeks lijnen bij 496.6 nm, 502.42 nm, 508.21 nm en 513.96 nm. Wat is de bindingsafstand?
#Het proteÃ¯ne hemo-erytrine staat in voor het zuurstoftransport in sommige ongewervelden. Elk proteÃ¯ne molecule heeft twee Fe2+ ionen die samenwerken om Ã©Ã©n molecule O2 te binden. De Fe2O2 groep van het gexoygeneerde hemo-erytrine is roodgekleurd en heeft een elektronische absorptie bij 500 nm. Het resonantie Raman-spectrum van het geoxygeneerde hemo-erytrine, bekomen met laser-excitatie bij 488 nm heeft een band bij 508.96 nm die toegeschreven wordt aan de O-O stretching van gebonden 16O2.
#*Welk voordeel biedt resonantie Raman spectroscopie t.o.v. infrarood absorptie-spectroscopie om de binding van O2 aan hemo-erytrine te bestuderen?
#*Naar welke golfgetal verschuift deze band in het Raman spectrum als 16O2 door 18O2 vervangen wordt?
#*De fundamentele vibratie golfgetallen van de O-O stretching mode van O2, O2- (superoxide anion) en O22- (peroxide anion) zijn respectievelijk 1555, 1107 and 878 cm-1. Verklaar deze trend in het licht van de elektronische structuur van O2, O2- and O22-.
#*Welke van de volgende species Fe22+O2; Fe2+Fe3+O2- of Fe23+O22- beschrijft het best de Fe2O2 hemo-erytrine, rekening met de resonantie Ramanband bij 844 cm-1 en de data in vraag c? Verklaar uw antwoord.
#*Het resonantiespectrum van hemo-erytrine met 16O18O heeft 2 banden die kunnen toegeschreven worden aan de O-O stretching mode van gebondenzuurstof. Met welk van de structuren die u hieronder ziet is dit compatibel en waarom? Het is mogelijk dat meer dan Ã©Ã©n structuur mogelijk is. [[Media:Fe2O2complex.JPG]]
#Welke nulde orde golffuncties vindt u voor de kernspin van de CH2F groep van benzylfluoride? Welk type NMR-spectrum geeft deze groep?
#Wat gebeurt voor Al+ met de laagste toegelaten elektronische overgang in een magneetveld met sterkte B?

===20 juni 2011===
# Twee He atomen (4 a.u.) vormen een complex bij 1 mK. Onderlinge afstand is 2,97 Ã…. De nulpuntsenergie bedraagt 2,0 *10-26 J, de bindingsenergie is 1,51 *10-23 J.
#* Wat zijn de vibratiefrequentie (cm-1), krachtconstante, en de anharmonisiteitsconstante?
#* Hoeveel vibratieniveaus zitten in de put?
#* Bereken de rotatieconstante.
#* Bereken zo nauwkeurig mogelijk de eerste 3 rotatieniveaus.
#* Hoe ziet het fluorescentiespectrum eruit?
#19F NMR spectrum van ClF3 was gegeven. Het spectum moest besproken worden en de structuur van ClF3 hieruit vinden.
# Welke overgangen zijn mogelijk van het Ca+ -ion vanuit zijn elektronische stabielste toestand? Bereken de opsplitsing van de laagste aangeslagen elektronische toestand in een veld van 5T.

===18 juni 2010===
#In a classic study of the application of NMR to the measurement of rotational barriers in molecules. P.M. Nair and J.D. Roberts (j. Am. Chem. Soc. 79, 4565 (1957)) obtained the 40 MHz 19F-NMR spectrum of F2BrCCBrC12. Their spectra are reproduced below. At 193 K. the spectrum shows five resonance peaks. Peaks I and III are separated by 160 Hz, as are IV and V. The ratio of the integrated intensities of peak II to peaks I, III, IV, and V is approximately 10 to 1. At 273 K. the five peaks have. collapsed into one. Explain the spectrum and its change with temperature. At what rate of inter conversion will the spectrum collapse to a single line? Calculate the rotational energy barrier between the rotational isomers on the assumption that it is related to the rate of interconversion between the isomers.
#*[[Bestand:Spectro_2010_1.jpg]]
#De traagheidsmomenten van het lineaire HgBr2 zijn zeer groot dus de O en S takken van de vibrationele Raman spectra tonen weinig rotationele structuur. Berekenen de bindingslengte als je weet dat J correspondeerd met de maximale intensiteit. Afstand tussen O en S takken is 15,2 cm-1
#Een transitie van groot belang in zuurstofgas geeft aanleiding tot de 'Schumann-Runge band' in UV. De golfgetallen van de transities van de grondtoestand naar vibrationele niveaus van de eerst aangeslagen toestand zijn gegeven. Bereken de dissociatie-energie van de hoogste liggend elektronisch niveau. Dezelfde aangeslagen toestand dissocieert naar een O atoom met 1 grondtoestand en 1 aangeslagen atoom met een energie van 190 kJ/mol boven de grondtoestand. Bereken hieruit de dissociatie-energie van de grondtoestand van zuurstofgas.
#Yb3+ heeft een 2F configuratie. Welke toestand zullen door spinorbitaalkoppeling bekomen worden. Deze met de hoogste J-waarde ligt het laagst in energie. Bereken kwantitatief de invloed van een magneetveld met sterkte 1 Tesla. Is de oscillatorstekte groot voor de eerste aangeslagen toestand. (golflengte gegeven)

===15 juni 2009===
#Het rotatiespectrum van H2 (te beschouwen als starre rotator) bekomen door instralen met een laser bij 488 nm, bestaat uit een reeks lijnen bij 496.6 nm, 502.42 nm, 508.21 nm en 513.96 nm. Wat is de bindingsafstand? (1 blz)
#Het proteÃ¯ne hemo-erytrine staat in voor het zuurstoftransport in sommige ongewervelden. Elk proteÃ¯ne molecule heeft twee Fe2+ ionen die samenwerken om Ã©Ã©n molecule O2 te binden. De Fe202 groep van het gexoygeneerde hemo-erytrine is roodgekleurd en heeft een elektronische absorptie bij 500 nm. Het resonantie Raman-spectrum van het geoxygeneerde hemo-erytrine, bekomen met laser-excitatie bij 488 nm heeft een band bij 508.96 nm die toegeschreven wordt aan de O-O stretching van gebonden 1602.
#*Welk voordeel biedt resonantie Raman spectroscopie t.o.v. infrarood absorptie-spectroscopie om de binding van O2 aan hemo-erytrine te bestuderen?
#*Naar welke golfgetal verschuift deze band in het Raman spectrum als 1602 door 1802 vervangen wordt?
#*De fundamentele vibratie golfgetallen van de O-O stretching mode van O2, 02 - (superoxide anion, and O2 2- (peroxide anion) zijn respectievelijk 1555, 1107 and 878 cm-1. Verklaar deze trend in het licht van de elektronische structuur van O2, 02 - and O2 2-.
#*Welke van de volgende species Fe22+O2; Fe2+Fe3+02- of Fe23+022- beschrijft het best de Fe2O2 hemo-erytrine, rekening met de resonantie Ramanband bij 844 cm-1 en de data in vraag c? Verklaar uw antwoord.
#*Het resonantiespectrum van hemo-erytrine met 16O18O heeft 2 banden die kunnen toegeschreven worden aan de O-O stretching mode van gebondenzuurstof. Met welk van de structuren die u hieronder ziet is dit compatibel en waarom? Het is mogelijk dat meer dan Ã©Ã©n structuur mogelijk is. [[Media:Fe2O2complex.JPG]]
#Voor een continu opgenomen NMR spectrum (geen Fourriettransform NMR) stelt men cast dat bij toename van B1 de intensiteit van een lijn bij het maximum toeneemt en daarna opnieuw afneemt. Hoe kun je dit verklaren (je mag dit zowel op kwalitatieve als op meer kwantitatieve wijze doen)?.
#Wat gebeurt voor Al+ met de laagste toegelaten overgang in een magneetveld met sterkte B? Werk kwantitatief uit.

===12 juni 2009===
====Groep 1====
# Twee He atomen (4 a.u.) vormen een complex bij 1 mK. Onderlinge afstand is 2,97 Ã…. De nulpuntsenergie bedraagt 2,0 *10-26 J, de bindingsenergie is 1,51 *10-23 J.
#* Wat zijn de vibratiefrequentie (cm-1), krachtconstante, en de anharmonisiteitsconstante?
#* Hoeveel vibratieniveaus zitten in de put?
#* Bereken de rotatieconstante.
#* Bereken zo nauwkeurig mogelijk de eerste 3 rotatieniveaus.
#* Hoe ziet het fluorescentiespectrum eruit?
# De longitudinale relaxatietijd van benzeen (Ï„c = 10-10 s) neemt toe wanneer de temperatuur toeneemt terwijl dat van een oligonucleotide een groot molecule (Ï„c = 10-6 s) afneemt. Ï„c neemt toe naarmate de temperatuur stijgt. Wat gebeurt er met de transversale relaxatietijd van de beide moleculen wanneer de temperatuur stijgt?
# Welke overgangen zijn mogelijk van het Ca+ -ion vanuit zijn elektronische stabielste toestand? Bereken de opsplitsing van de laagste aangeslagen elektronische toestand in een veld van 5T.

====Groep 2====
# Het absorptiespectrum van CdSe kwantum dot heeft een maximum bij 460 nm met een molaire extinctiecoÃ«fficiÃ«nt van 49000 cm^-1 M^-1 in een midden met een brekingsindex gelijk aan 7. De breedte van de absorptieband bedraagt 400 cm^-1.
#* Bereken de oscillatorsterkte.
#* Bereken de EinsteincoÃ«fficiÃ«nt voor spontane emissie voor de emissie bij 485 nm.
#*Bereken het transitiedipool.
# De golflengte van het ingestraalde licht bedraagt 488 nm in een Raman spectrometer. Wat is de golflengte van de eerste lijn van de Stokescomponent van het rotatie Ramanspectrum van 14N2? De bindingslengte bedraagt 0.109 nm
# Welk van de onderstaande vibraties van de acetyleen zijn IR-actief? Welk zijn Ramanactief? Hoeveel normale vibratiewijzen zijn hier mogelijk?
# Wat gebeurt voor waterstof met de overgang van 2D3/2 naar 2F5/2 in een magneetveld?

Spectroscopische Meettechnieken

2017-06-21T17:50:43Z

LaurenV:

[[Categorie:Bachelor Chemie]]

==Vakinformatie==
Hall0,
het vak sectrosocpische mettchen1eken is een ware belevenis. Professor Vander Auweraer is op zijn zachtst gezegd een fenomeen. Het moet gezegd worden, de lessen zijn niet bijster interessant en de cursus laat hier en daar wel eens te wensen over maar het is een zeer warm persoon. Spelling (of spleling in het Van Der Auweraers) is niet zijn sterkte punt. Het examen is openboek.

Bij dit openboekexamen helpt een inhoudsopgave wel, vermits deze niet door Prof Vander Auweraer zelf voorzien is, hebben we er zelf eentje gemaakt. De pagina's van Hoofdstuk 6 moeten je wel nog zelf nummeren van 1 tot 38 en hoofdstuk 8 van 101 tot 143 dan klopt normaal gezien alles (tenzij de cursus aangepast wordt).[[Bestand:Inhoudsopgave_spectroscopische_meettechnieken_2014.pdfâ€Ž]]

==Examenvragen==

===21 juni 2017 ===
# vraag 1 18 juni 2014
# vraag 2 18 juni 2014
# vraag 4 18 juni 2014
# vraag 5 18 juni 2014
# Aggregatie van niet-chirale chromoforen kan aanleiding geven tot circulair dicroïsme. Verwacht u een rotatiesterkte verschillend van nul voor pakking a en/of b?
(tekeningen van pakking a (= chiraal) en b (=achiraal))
- Pakking a: in zelfde vlak, onderlinge hoek = alfa = 120°, tèta is hoek met de as die beide centra verbind en alfa +2tèta=180°
- Pakking b: in 2 vlakken loodrecht op de as die hun verbind (tèta = 90°) en alfa =120°
Argumenteer zowel met de uitdrukking voor rotatiesterkte als op basis van eventuele chiraliteit v.d. gevormde aggregaten (zijn deze chiraal?)

===17 juni 2016 ===
[[Media:Voorbeeld.ogg]]
=== 15 juni 2016 ===

# H2 spectrum met invallende golflengte gegeven en ook nog 4 golflengtes van ramanrotatielijnen. Bereken r.
# Fe2O2 vraag (zie lager)
# Al+ vraag van op wiki van wat er met de laagste overgang gebeurt in een magneetveld
#Uitvoeren met deeltje in de doos:
Een allylradicaal waar je de energie van een dubbel bezet pi orbitaal in grondtoestand en die van een enkelbezette moest geven.
Bepaal ook de transitiedipool als de bindingslengte = 0,14 nm en de dubbele binding een hoek van 30 graden maakt met de richting van het molecule.
Bijvraag: is deze overgang mogelijk?

=== 19 juni 2015 ===
# nulpuntsenergie, bindingsenergie, afstand tussen 2 atomen, temperatuur (en miss nog andere dingen) gegeven. Gevraagd:
#* Wat zijn de vibratiefrequentie (cm-1), krachtconstante, en de anharmonisiteitsconstante?
#* Hoeveel vibratieniveaus zitten in de put?
#* Bereken de rotatieconstante.
#* Bereken zo nauwkeurig mogelijk de eerste 3 rotatieniveaus.
#* Hoe ziet het fluorescentiespectrum eruit?
# Geef het ESR spectrum van het butadieen radicaal anion. Dit radicaal heeft 4 equivalente protonen met een hyperfijnconstante van 14,3 gauss en twee equivalente protonen met een hyperfijnconstante van 2,8 gauss. Wat is de spindichtheid op elk van de koolstofatomen? Komt dit overeen met wat je verwacht van Huckel Moleculaire Orbitalen?
# Welke overgangen zijn mogelijk van het Ca+ -ion vanuit zijn elektronische stabielste toestand? Bereken de opsplitsing van de laagste aangeslagen elektronische toestand in een veld van 5T. (opgelet: juiste g parameter berekenen want delta S niet gelijk aan 0)

=== 17 juni 2015 ===
# Het absorptiespectrum van een CdSe kwantum dot (kubus met ribbe 2 nm) heeft een maximum bij 460 nm met een extinctiecoÃ«fficiÃ«nt van 49000 cm-1 in een midden met een brekingsindex n = 7. De breedte van de absorptieband bedraagt 400 cm-1. NB: U mag stellen dat Îµr = n2 en Îµ = ÎµrÎµ0.
#* Bereken de oscillatorsterkte.
#* Bereken de coÃ«fficiÃ«nt voor spontane emissie bij 485 nm.
#* Bereken het transitiedipool. (a, b & c max 1 blz.)
#* Gebruik het deeltje in de doos om de verschuiving te berekenen van de absorptieband voor de overgang tussen de valentieband en de conductieband (waarvan u mag aannemen dat de overgang van het hoogste niveau van de VB naar het laagste niveau van de CB is) ten opzichte van een CdSe kristal met oneindige dimensies. Gebruik als effectieve massa voor de elektronen en gaten respectievelijk 0.13me en 0.45me.
#* Bijvraag: Is deze overgang op basis van de gegevens voor Îµ, f en Âµ* toegelaten?
# Het rotatiespectrum van 1H35Cl vertoont opeenvolgende lijnen bij de volgende golfgetallen: 83.32, 104.13, 124.73, 145.37, 165.89, 186.23, 206.60, 226.86 cm-1. Bereken het traagheidsmoment en de bindingslengte. Voorspel de ligging van deze lijnen voor 2H35Cl (dit volstaat voor de eerste twee lijnen).
# Acetyleen: vibraties gegeven. Welke vibraties zijn IR actief? En welke Raman actief? Hoeveel normale vibratiemodes zijn er mogelijk? (1/2 Ã 1 blz.)
#* Bijvraag: Er zijn 5 vibraties getekend, terwijl 3N-5 = 7. Hoe is dit mogelijk?
# Wat gebeurt er voor waterstof met de overgang van 2D3/2 naar 2F5/2 in een magneetveld? (1 Ã 2 blz.)
#* Bijvraag: Welke techniek kun je gebruiken om de overgangen te bestuderen die enkel verschillen in mj?

===23 juni 2014 ===
# Het absorptiespectrum van een verbinding heeft een maximum bij 485 nm terwijl het maximum van het emissiespectrum bij 505 nm ligt. De EinsteincoÃ«fficient voor spontane emissie bedraagt 3,2 108 s-1. Bepaal het transitiedipool en de maximale extinctiecoÃ«fficient wanneer de breedte bij halve hoogte van de absorptieband 760 cm-1 bedraagt. U mag de absorptieband beschouwen als een gelijkbenige driehoek.(maximum 2 blz)
# De golflengte van de invallende straling in een Ramanspectrometer is 488,1 nm. Wat is het golfgetal van de eerste lijn van de Stokescomponent van het rotatie Ramanspectrum van 16O2? De bindingslengte bedraagt 0,121 nm.
# Voor CHCl3 vinden we voor de CH-stretching vibratie een intense band bij 3019 cm-1 en progressief zwakkere banden bij 5900, 8700 en 13315 cm-1. Bepaal de bindings- en dissociatie energie.
# Geef het ESR spectrum van het butadieen radicaal anion. Dit radicaal heeft 4 equivalente protonen met een hyperfijnconstante van 7,6 gauss en twee equivalente protonen met een hyperfijnconstante van 2,8 gauss. Wat is de spindichtheid op elk van de koolstofatomen?

=== 18 juni 2014 ===
[[Bestand:Examen spectro 18 06 2014.pdf]]

=== 10 juni 2014 ===
# Het absorptiespectrum van het monomethine thiacyanine MTHIATS heeft een maximum bij 440 nm (structuur gegeven maar eigenlijk niet nodig). De maximale extinctiecoÃ«fficiÃ«nt en de breedte bij halve hoogte van de absorptieband bedragen respectievelijk 8.0x104 lmol-1cm-1 en 1500 cm-1. Bepaal het transitiedipool en de EinsteincoÃ«fficiÃ«nt voor spontane emissie (maximum en gemiddelde van het emissiespectrum bij 22000 cm-1). U mag de absorptieband beschouwen als een gelijkbenige driehoek.
# Bereken Nj/N0 voor 1H19F molecule voor J=0, J=5 en J=10 bij 298K. De bindingsafstand is 0.92Ã… en de vibratie constante = 966Nm-1
#* Voor welke waarde van J is Nj/N0 maximaal?
#* Wat is de energie van de J=5 â†’ J=6 overgang?
# Het NO2+ ion bezit twee ontaarde IR-absorptiebanden bij 540 cm-1 en een (niet-ontaarde) IR-absorptieband bij 2360 cm-1. Daarnaast heeft het een Ramanband (deze overgang wordt niet in het IR-spectrum waargenomen) bij 1400 cm-1.
#* Verklaar dit spectrum en leg een verband met de moleculaire structuur van NO2+.
#* Verder wordt nog een weinig intense IR-absorptielijn waargenomen bij 3735 cm-1. Waaraan is deze te wijten?
# Hoe wordt de energie van een 2p-elektron van waterstof opgesplitst in een magneetveld B0? Bekijk alle mogelijke toestanden.
'''OPGEPAST:Bereken de juiste LandÃ© splitting factor (Ge)!! '''

# Wat is de magnetisatie van Na kernen in 1ml van een 1*10-3M oplossing Na+ ionen in een veld van 9 Tesla bij 298 Kelv1n (I= 3/2 voor Na)
'''OPGEPAST: dit is iets met een reeksontwikkeling zei hij op het examen...
'''

===17 juni 2013 Groep 1===
# nulpuntsenergie, bindingsenergie, afstand tussen 2 atomen, temperatuur (en miss nog andere dingen) gegeven. Gevraagd:
#* krachtconstante, vibratiefrequentie en anharmoniciteitsconstante
#* aantal vibratieniveaus
#* rotatieconstante
#* energie van eerste 3 rotatieniveaus
#* mogelijk fluorescentiespectrum
# iets ivm EPR van radicaal
#* spindichtheid op koolstofatomen berekenen
#* teken spectrum
#* vergelijken met resultaten van Huckel MO
# Ca+ => geeft grondtoestand en mogelijke transities hieruit en geef opsplitsing in energie van laagst energetische aangeslagen toestand in een veld van 5 Tesla.

===17 juni 2013 Groep 2===
#Bij het elektronisch-vibratie absorptiespectrum de ....overgang van BeO vindt men onderstaande bandoorsprongen voor de verschillende vibratie-rotatiebanden.
#*Bepaal de beste waarden voor Ï–e en Ï‡e voor de ... en ...toestand.
#*Bepaal de bindingsenergieÃ«n( zie examen 7 september 2011 vraag 5)
#hoe ziet het EPR spectrum van CD3Â° er uit?(I voor D=1). Als je weet dat de hyperfijnconstante voor CH3Â°=....G, wat is dan de hyperfijnconstante van CD3Â°?
#Bereken welk rotatieniveau van CH4 maximaal bezet zal zijn bij 25Â°C, B=.... let op, de ontaarding is hier nu (2J+1)Â² i.pv. (2J+1).

===22 juni 2012 Groep 1===
# Het absorptiespectrum van het monomethine thiacyanine MTHIATS heeft een maximum bij 440 nm (structuur gegeven maar eigenlijk niet nodig). De maximale extinctiecoÃ«fficiÃ«nt en de breedte bij halve hoogte van de absorptieband bedragen respectievelijk 8.0x104 lmol-1cm-1 en 1500 cm-1. Bepaal het transitiedipool en de EinsteincoÃ«fficiÃ«nt voor spontane emissie (maximum en gemiddelde van het emissiespectrum bij 22000 cm-1). U mag de absorptieband beschouwen als een gelijkbenige driehoek.
# Voor welke waarde van J is NJ/N0 maximaal voor het 1H19F molecule bij 298K. De bindingslengte bedraagt 0.92Ã…. Wat is de exacte energie van de J=5â†’J=6 overgang? De vibratiekrachtconstante is 966 Nm-1.
# Het NO2+ ion bezit twee ontaarde IR-absorptiebanden bij 540 cm-1 en een (niet-ontaarde) IR-absorptieband bij 2360 cm-1. Daarnaast heeft het een Ramanband (deze overgang wordt niet in het IR-spectrum waargenomen) bij 1400 cm-1.
#* Verklaar dit spectrum en leg een verband met de moleculaire structuur van NO2+.
#* Verder wordt nog een weinig intense IR-absorptielijn waargenomen bij 3735 cm-1. Waaraan is deze te wijten?
# Hoe wordt de energie van een 2p-elektron van waterstof opgesplitst in een magneetveld B0? Bekijk alle mogelijke toestanden.

===18 juni 2012===
# Wat is de magnetisatie van 1ml van een oplossing van 2H met als concentratie 10-3M in een veld van 9T en bij 298K. (I = 1)
# De traagheidsmomenten van het lineaire HgBr2 zijn zeer groot dus de O en S takken van de vibrationele Raman spectra tonen weinig rotationele structuur. Berekenen de bindingslengte als je weet dat J correspondeerd met de maximale intensiteit. Afstand tussen de maxima van de O en S takken is 15,2 cm-1.
# Een transitie van groot belang in zuurstofgas geeft aanleiding tot de 'Schumann-Runge band' in UV. De golfgetallen van de transities van de grondtoestand naar vibrationele niveaus van de eerst aangeslagen toestand zijn gegeven. Bereken de dissociatie-energie van de hoogste liggend elektronisch niveau. Dezelfde aangeslagen toestand dissocieert naar een O atoom met 1 grondtoestand en 1 aangeslagen atoom met een energie van 190 kJ/mol boven de grondtoestand. Bereken hieruit de dissociatie-energie van de grondtoestand van zuurstofgas.
# Yb3+ heeft een 2F configuratie. Welke toestand zullen door spinorbitaalkoppeling bekomen worden? Deze met de hoogste J-waarde ligt het laagst in energie. Bereken kwantitatief de invloed van een magneetveld met sterkte B(0). Is de oscillatorstekte groot voor de eerste aangeslagen toestand? (golflengte gegeven).
#* Bijvraag: met welke techniek zouden we het verschil tussen de energieniveau's kunnen meten?

===24 juni 2011 - groep 2===
# Het absorptiespectrum van CdSe kwantum dot heeft een maximum bij 460 nm met een molaire extinctiecoÃ«fficiÃ«nt van 49000 cm-1 M-1 in een midden met een brekingsindex gelijk aan 7. De breedte van de absorptieband bedraagt 400 cm-1.
#* Bereken de oscillatorsterkte.
#* Bereken de EinsteincoÃ«fficiÃ«nt voor spontane emissie voor de emissie bij 485 nm.
#*Bereken het transitiedipool.
# Gegeven: enkele pieken van het rotatiespectrum van HCl. Bereken het traagheidsmoment en de bindingslengte. Voorspel de eerste twee pieken van gedeutereerd HCl.
# Welk van de onderstaande vibraties van de acetyleen zijn IR-actief? Welk zijn Ramanactief? Hoeveel normale vibratiewijzen zijn hier mogelijk?
# Wat gebeurt voor waterstof met de overgang van 2D3/2 naar 2F5/2 in een magneetveld?

===24 juni 2011 - groep 1===
#Het rotatiespectrum van H2 (te beschouwen als starre rotator) bekomen door instralen met een laser bij 488 nm, bestaat uit een reeks lijnen bij 496.6 nm, 502.42 nm, 508.21 nm en 513.96 nm. Wat is de bindingsafstand?
#Het proteÃ¯ne hemo-erytrine staat in voor het zuurstoftransport in sommige ongewervelden. Elk proteÃ¯ne molecule heeft twee Fe2+ ionen die samenwerken om Ã©Ã©n molecule O2 te binden. De Fe2O2 groep van het gexoygeneerde hemo-erytrine is roodgekleurd en heeft een elektronische absorptie bij 500 nm. Het resonantie Raman-spectrum van het geoxygeneerde hemo-erytrine, bekomen met laser-excitatie bij 488 nm heeft een band bij 508.96 nm die toegeschreven wordt aan de O-O stretching van gebonden 16O2.
#*Welk voordeel biedt resonantie Raman spectroscopie t.o.v. infrarood absorptie-spectroscopie om de binding van O2 aan hemo-erytrine te bestuderen?
#*Naar welke golfgetal verschuift deze band in het Raman spectrum als 16O2 door 18O2 vervangen wordt?
#*De fundamentele vibratie golfgetallen van de O-O stretching mode van O2, O2- (superoxide anion) en O22- (peroxide anion) zijn respectievelijk 1555, 1107 and 878 cm-1. Verklaar deze trend in het licht van de elektronische structuur van O2, O2- and O22-.
#*Welke van de volgende species Fe22+O2; Fe2+Fe3+O2- of Fe23+O22- beschrijft het best de Fe2O2 hemo-erytrine, rekening met de resonantie Ramanband bij 844 cm-1 en de data in vraag c? Verklaar uw antwoord.
#*Het resonantiespectrum van hemo-erytrine met 16O18O heeft 2 banden die kunnen toegeschreven worden aan de O-O stretching mode van gebondenzuurstof. Met welk van de structuren die u hieronder ziet is dit compatibel en waarom? Het is mogelijk dat meer dan Ã©Ã©n structuur mogelijk is. [[Media:Fe2O2complex.JPG]]
#Welke nulde orde golffuncties vindt u voor de kernspin van de CH2F groep van benzylfluoride? Welk type NMR-spectrum geeft deze groep?
#Wat gebeurt voor Al+ met de laagste toegelaten elektronische overgang in een magneetveld met sterkte B?

===20 juni 2011===
# Twee He atomen (4 a.u.) vormen een complex bij 1 mK. Onderlinge afstand is 2,97 Ã…. De nulpuntsenergie bedraagt 2,0 *10-26 J, de bindingsenergie is 1,51 *10-23 J.
#* Wat zijn de vibratiefrequentie (cm-1), krachtconstante, en de anharmonisiteitsconstante?
#* Hoeveel vibratieniveaus zitten in de put?
#* Bereken de rotatieconstante.
#* Bereken zo nauwkeurig mogelijk de eerste 3 rotatieniveaus.
#* Hoe ziet het fluorescentiespectrum eruit?
#19F NMR spectrum van ClF3 was gegeven. Het spectum moest besproken worden en de structuur van ClF3 hieruit vinden.
# Welke overgangen zijn mogelijk van het Ca+ -ion vanuit zijn elektronische stabielste toestand? Bereken de opsplitsing van de laagste aangeslagen elektronische toestand in een veld van 5T.

===18 juni 2010===
#In a classic study of the application of NMR to the measurement of rotational barriers in molecules. P.M. Nair and J.D. Roberts (j. Am. Chem. Soc. 79, 4565 (1957)) obtained the 40 MHz 19F-NMR spectrum of F2BrCCBrC12. Their spectra are reproduced below. At 193 K. the spectrum shows five resonance peaks. Peaks I and III are separated by 160 Hz, as are IV and V. The ratio of the integrated intensities of peak II to peaks I, III, IV, and V is approximately 10 to 1. At 273 K. the five peaks have. collapsed into one. Explain the spectrum and its change with temperature. At what rate of inter conversion will the spectrum collapse to a single line? Calculate the rotational energy barrier between the rotational isomers on the assumption that it is related to the rate of interconversion between the isomers.
#*[[Bestand:Spectro_2010_1.jpg]]
#De traagheidsmomenten van het lineaire HgBr2 zijn zeer groot dus de O en S takken van de vibrationele Raman spectra tonen weinig rotationele structuur. Berekenen de bindingslengte als je weet dat J correspondeerd met de maximale intensiteit. Afstand tussen O en S takken is 15,2 cm-1
#Een transitie van groot belang in zuurstofgas geeft aanleiding tot de 'Schumann-Runge band' in UV. De golfgetallen van de transities van de grondtoestand naar vibrationele niveaus van de eerst aangeslagen toestand zijn gegeven. Bereken de dissociatie-energie van de hoogste liggend elektronisch niveau. Dezelfde aangeslagen toestand dissocieert naar een O atoom met 1 grondtoestand en 1 aangeslagen atoom met een energie van 190 kJ/mol boven de grondtoestand. Bereken hieruit de dissociatie-energie van de grondtoestand van zuurstofgas.
#Yb3+ heeft een 2F configuratie. Welke toestand zullen door spinorbitaalkoppeling bekomen worden. Deze met de hoogste J-waarde ligt het laagst in energie. Bereken kwantitatief de invloed van een magneetveld met sterkte 1 Tesla. Is de oscillatorstekte groot voor de eerste aangeslagen toestand. (golflengte gegeven)

===15 juni 2009===
#Het rotatiespectrum van H2 (te beschouwen als starre rotator) bekomen door instralen met een laser bij 488 nm, bestaat uit een reeks lijnen bij 496.6 nm, 502.42 nm, 508.21 nm en 513.96 nm. Wat is de bindingsafstand? (1 blz)
#Het proteÃ¯ne hemo-erytrine staat in voor het zuurstoftransport in sommige ongewervelden. Elk proteÃ¯ne molecule heeft twee Fe2+ ionen die samenwerken om Ã©Ã©n molecule O2 te binden. De Fe202 groep van het gexoygeneerde hemo-erytrine is roodgekleurd en heeft een elektronische absorptie bij 500 nm. Het resonantie Raman-spectrum van het geoxygeneerde hemo-erytrine, bekomen met laser-excitatie bij 488 nm heeft een band bij 508.96 nm die toegeschreven wordt aan de O-O stretching van gebonden 1602.
#*Welk voordeel biedt resonantie Raman spectroscopie t.o.v. infrarood absorptie-spectroscopie om de binding van O2 aan hemo-erytrine te bestuderen?
#*Naar welke golfgetal verschuift deze band in het Raman spectrum als 1602 door 1802 vervangen wordt?
#*De fundamentele vibratie golfgetallen van de O-O stretching mode van O2, 02 - (superoxide anion, and O2 2- (peroxide anion) zijn respectievelijk 1555, 1107 and 878 cm-1. Verklaar deze trend in het licht van de elektronische structuur van O2, 02 - and O2 2-.
#*Welke van de volgende species Fe22+O2; Fe2+Fe3+02- of Fe23+022- beschrijft het best de Fe2O2 hemo-erytrine, rekening met de resonantie Ramanband bij 844 cm-1 en de data in vraag c? Verklaar uw antwoord.
#*Het resonantiespectrum van hemo-erytrine met 16O18O heeft 2 banden die kunnen toegeschreven worden aan de O-O stretching mode van gebondenzuurstof. Met welk van de structuren die u hieronder ziet is dit compatibel en waarom? Het is mogelijk dat meer dan Ã©Ã©n structuur mogelijk is. [[Media:Fe2O2complex.JPG]]
#Voor een continu opgenomen NMR spectrum (geen Fourriettransform NMR) stelt men cast dat bij toename van B1 de intensiteit van een lijn bij het maximum toeneemt en daarna opnieuw afneemt. Hoe kun je dit verklaren (je mag dit zowel op kwalitatieve als op meer kwantitatieve wijze doen)?.
#Wat gebeurt voor Al+ met de laagste toegelaten overgang in een magneetveld met sterkte B? Werk kwantitatief uit.

===12 juni 2009===
====Groep 1====
# Twee He atomen (4 a.u.) vormen een complex bij 1 mK. Onderlinge afstand is 2,97 Ã…. De nulpuntsenergie bedraagt 2,0 *10-26 J, de bindingsenergie is 1,51 *10-23 J.
#* Wat zijn de vibratiefrequentie (cm-1), krachtconstante, en de anharmonisiteitsconstante?
#* Hoeveel vibratieniveaus zitten in de put?
#* Bereken de rotatieconstante.
#* Bereken zo nauwkeurig mogelijk de eerste 3 rotatieniveaus.
#* Hoe ziet het fluorescentiespectrum eruit?
# De longitudinale relaxatietijd van benzeen (Ï„c = 10-10 s) neemt toe wanneer de temperatuur toeneemt terwijl dat van een oligonucleotide een groot molecule (Ï„c = 10-6 s) afneemt. Ï„c neemt toe naarmate de temperatuur stijgt. Wat gebeurt er met de transversale relaxatietijd van de beide moleculen wanneer de temperatuur stijgt?
# Welke overgangen zijn mogelijk van het Ca+ -ion vanuit zijn elektronische stabielste toestand? Bereken de opsplitsing van de laagste aangeslagen elektronische toestand in een veld van 5T.

====Groep 2====
# Het absorptiespectrum van CdSe kwantum dot heeft een maximum bij 460 nm met een molaire extinctiecoÃ«fficiÃ«nt van 49000 cm^-1 M^-1 in een midden met een brekingsindex gelijk aan 7. De breedte van de absorptieband bedraagt 400 cm^-1.
#* Bereken de oscillatorsterkte.
#* Bereken de EinsteincoÃ«fficiÃ«nt voor spontane emissie voor de emissie bij 485 nm.
#*Bereken het transitiedipool.
# De golflengte van het ingestraalde licht bedraagt 488 nm in een Raman spectrometer. Wat is de golflengte van de eerste lijn van de Stokescomponent van het rotatie Ramanspectrum van 14N2? De bindingslengte bedraagt 0.109 nm
# Welk van de onderstaande vibraties van de acetyleen zijn IR-actief? Welk zijn Ramanactief? Hoeveel normale vibratiewijzen zijn hier mogelijk?
# Wat gebeurt voor waterstof met de overgang van 2D3/2 naar 2F5/2 in een magneetveld?

Moleculaire Herkenning

2017-06-17T13:12:22Z

LaurenV: /* 16 juni 2017 */

[[Categorie:Bachelor Chemie]]
==Vakinformatie==

Verplicht vak voor chemie. Moleculaire herkenning wordt gedoceerd door 2 proffen. Mario smet en Wim "sandalen" Dehaen. 50% van de punten staan op het examen, de andere 50% staan op een paper. Op het examen worden mondelinge vragen gesteld over de paper. Bij prof. Smet zijn dit normaal enkel de vragen die hij geeft bij de feedback op de paper,
prof. Dehaen stelt vaak ook extra vragen.

==Examenvragen==
=== 16 juni 2017 ===
#Dehaen:
#* welke factoren beinvloeden de molaire efficientie
#* synthese van hexathia18-kroon-6 vanuit ethyleenglycol en bis(2hydroxyethyl)sulfide op een veilige manier en wat doen we om de opbrengst zo hoog mogelijk te houden
#* wat zijn ansa-verbindingen en hoe kunnen ze meer inzicht geven over de ruimtevulling van de groepen
#* een structuur gegeven met 2 NH2 groepen een kroonether en een R (fenyl). 4-aminobutaanzuur is beter oplosbaar dan glycine (2-aminoazijnzuur) en 6-aminohexaanzuur. Hoe komt dit, welke interacties. De oplosbaarheid stijgt wanneer we R vervangen door (4-NO2-fenyl). Verklaar.
#* er zijn twee isomeren bij de synthese van resorcinarenen. Welke zijn dit?

#SMET:
#* gegeven een amide: RR'C=CH-CO-N(CH3)2 met onbekende receptor gaat interageren:
Welke interactie verwachten we, teken van reactieparameter, plus redeneer. Wat gebeurt er met de absolite waarde van de reactieparameter als we een van de R groepen vervangen door een H.
#* lipskin regel geven en wat is het belang tegenwoordig in farmaceutische industrie
#* Bij synthese van rotaxanen volgens iemand (Stoddart ofzo)(tetrakationisch complex) zal threading een hogere opbrengst geven dan clipping waarom?
Waarom dan niet altijd threading?

=== 19 juni 2015 ===
#Dehaen:
#* Stel een synthese voor voor het volgende molecule: vanuit p-tBu-fenol en p-Me-fenol een calix[4]areen met aan de 1,3-alcoholen het trimeer van p-Me-fenol (via ether). Deze twee benzeenringen zijn ook gedebutyleerd en alle overgebleven vrije hydroxylgroepen zijn gemethyleerd.
#* Bespreek aan de hand van hun structuurelementen de functie van nonactine en valinomycine (structuur gegeven).
#* Verbind de juiste gastheren met de juiste gasten en solventen. Gasten: Natriumion, p-diaminobenzeen, p-diaminobenzeen met beide stikstoffen tetragebutyleerd, benzoÃ«zuur. Gastheren: calix[4]areen, een groot dibenzokroonether, een resorcinareen verkregen na 24 uur reflux, alfa-cyclodextrine en een aromatisch diamide. Solventen: water (pH 3, 7, 10), MeOH & DCM.
#Smet:
#* 4-R-pyridine. Deze gast bindt enkel aan de gastheer indien de stikstof geprotoneerd is. Bepaal het teken van de Hammett-parameter rho. Op welke interactie zou de complexatie kunnen berusten?
#* Geef de twee methoden die gebruikt kunnen worden om de associatieconstante te schrijven in functie van deelassociatieconstanten. Beschrijf de fysische basis van het probleem dat hierbij optreedt.
#* Bespreek de moleculaire basis van plaquevorming zoals die optreedt bij bijvoorbeeld de ziekte van Alzheimer. Wat zijn de therapeutische mogelijkheden om dit tegen te gaan? Bijvraag: op welke secundaire structuren en soorten interacties berust de associatie?

===18 juni 2014 (voormiddag) ===
#Dehaen:
#* Geef een voorstel voor de synthese van een gegeven [2.2.2]cryptand uitgaande van chlooracetamide. Het cryptand heeft stikstoffen als bruggenhoofden, 2 ketens met telkens 2 zuurstoffen en 1 keten met 2 zwavelatomen. En hoe kan je de macroyclisatie bevorderen?
#* Transport van donor naar acceptorlaag via een organisch membraan? hoe gaat dit het beste met pentaglyme of met een [2.2.2]cryptand. Verklaar.
#* Verbind de juiste gast met de gegeven gastheren en solventen. Er zijn meer gastheren en solventen dan er gasten zijn.
#Smet:
#* Je hebt een gesubstitueerd chinoline (onbekende substituent). Dit chinoline complexeert enkel met een gastheer als de N niet geprotoneerd is. wat is het teken van de hammet-parameter Rho? welke interactie zal er zijn tussen de gast en de gastheer?
#* Geef de 4 belangrijkste entropieveranderingen bij complexatie en bespreek. Welke is verantwoordelijk voor preorganisatie? Leg uit.
#* Invloed ketenlengte benzokroonether op rendement van een catenaan met een tetrakationisch cyclofaan.

=== 19 juni 2014 (namiddag) ===
#Dehaen:
#* Geef een voorstel voor de synthese van een gegeven calix[4]hemisferand uitgaande van 2 gegeven fenolen. De receprot bestond uit een calix[4]areen met een hemisferand aangehecht op de 1- en 3-posities.
#* Gegeven de structuur van valinomycine en nonactine: bespreek de functie en hoe de verschillende structuurelementen hiertoe bijdragen.
#* Verbind de juiste gast met de gegeven gastheren en solventen. Er zijn meer gastheren en solventen dan er gasten zijn.
#**solventen: zuur, neutraal of basisch water, methanol, dicchloormethaan
#**gastheren: cyclodextrine, een grote benzokroonether, een calyxareen, stoel resorcinareen en een heteroaromatische receptor met amidefuncties.
#**gasten: natriumion, aromatisch diamine, aromatisch diammoniumzout, benzoÃ«zuur
#Smet:
#* Op welke 2 manieren kunnen we de totale associatieconstante beschouwen als een product van deelassociatieconstanten? Wat is bij elk het grootste fysisch probleem? Welk van deze 2 methoden is, op praktische gronden, te verkiezen en waarom?
#* Gegeven een amide met een para-gesubstitueerde fenylgroep op de N en de carbonyl. Dit molecule gaat waterstofbindingen aan met zowel de zuurstof als de NH. Wat is het teken van de Hammett-parameter rho voor het substituent op elke benzeenring?
#* Gegeven de structuur van een receptor bestaande uit een porfyrinering, gekoppeld aan een calixareen met ketens die veel heteroatomen bevatten. De bindingsconstanten van KI is hoog, die voor NaI en NaClO4 tussenin (en ongeveer gelijk), die van KClO4 laag. Verklaar waarom. (Deze structuur staat in de cursus ter hoogte van het deel over coÃ¶perativiteit).

=== 15 juni 2012 (namiddag) ===
#Dehaen:
#* Wat zijn pseudo-hoge verdunningsvoorwaarden en geef 2 voorbeelden hoe men dit in de praktijk bewerkstelligt.
#* Onderzoekers onderzochten de complexatieconstante van verbindingen A, B en C met het chloride-anion. Ondanks extra H-atoom beschikbaar, had C toch de laagste complexatieconstante. Volgorde was KA > KB >> KC. Volgens de onderzoekers had dit te maken met een verschillende preorganisatie. Verklaar. [[Bestand:MolHerExamenDehaen.jpg]]
#* Rangschik volgens toenemende affiniteit voor het kaliumkation en motiveer: 18-kroon-6, 1,10-dithia-18-kroon-6, benzo-18-kroon-6, [2.2.2]cryptand, 15-kroon-5, 21-kroon-7.
#Smet:
#* Voor een bepaald hydrofoob (gedeelte van een) gastmolecule werd aangetoond dat het de hydrofobe holte van de gastheer maar voor 55% vult in stabielste toestand. Verklaar thermodynamisch waarom het kan dat deze gedeeltelijk gevulde toestand meer bevoordeeld wordt dan de volledig gevulde holte.
#*
#** Welke interacties zijn van belang bij het catenaan gevormd uit '''1''', '''2''' en '''3'''?
#** Wat zou het effect zijn op de bindingsconstante moest het catenaan gevormd worden rond '''4''' i.p.v. '''1''' en waarom?
#** Beredeneer het teken van de Hammett parameter Ï van de catenatiereactie van '''5''' met het monogealkyleerd derivaat van '''3''' (hiermee wordt bedoeld, de open-ketenvorm van '''2''' enkelvoudig gebonden aan '''3'''). Sterische effecten van R mogen verwaarloosd worden [[Bestand:CatenaanSmet.png]]
#* Onderzoekers synthetiseerden bovenste verbinding als receptor voor de onderste (tekening is ''ongeveer'' juist). Belangrijke interacties hierbij zijn H-bruggen, maar ook de Ï€-Ï€-interacties tussen de eindstandige benzeenringen spelen een beduidende rol. Om aard en sterkte van deze Ï€-Ï€-interacties te onderzoeken synthetiseerde men een aantal derivaten van beide, en mat men het verschil in bindingssterkte voor verschillende substituenten op de benzeenringen. [[Bestand:receptorSmet.png]]
#** Welke complicatie valt te verwachten bij deze metingen, vanwege de verschillende substituenten op de derivaten?
#** Verklaar de waargenomen tendensen in de gemeten energiebijdragen, weergegeven in de tabel (deze waarden zijn gecorrigeerd voor de complicaties waarnaar gevraagd in eerste subvraag dus zijn ''juist'').
[[Bestand:tabelSmet.png]]

=== 17 juni 2011 (voormiddag) ===
#Dehaen:
#* Onderzoekers onderzochten de complexatieconstante van verbindingen A, B en C met het chloride-anion. Ondanks extra H-atoom beschikbaar, had C toch de laagste complexatieconstante. Volgorde was KA > KB >> KC. Volgens de onderzoekers had dit te maken met een verschillende preorganisatie. Verklaar. [[Bestand:MolHerExamenDehaen.jpg]]
#* Klassieke vraag. Verbind de juiste gast met gastheer en solvent. Licht toe en zeg welke interacties plaatsvinden.
#* Wat is de CAC? Waarom is het belangrijk dat deze gemeten wordt en hoe wordt deze gemeten?
#Smet:
#* Gegeven: [[Bestand:MolHerExamenMario.jpg]] Bepaal het teken van &rho;X, voor groep X en &rho;R, voor groep R. Waarom gaat bij zÃ©Ã©r elektronenzuigende groepen, bv. X=F-, de meting van de complexatieconstante met nucleofiele deeltjes niet meer correct verlopen?
#* Mag men de &Delta;G van interacties met de aromatische ring en de &Delta;G van interacties met de gedeprotoneerde carbonzuurfunctie zomaar optellen? Verklaar. [[Bestand:MolHerExamenMario2.jpg]]
#* De synthese van rotaxanen op vaste drager kan handig zijn. Onwaar/waar en verklaar.

=== 11 juni 2010 (namiddag) ===

#Dehaen:
#* geef de structuur van cyclotriveratryleen en de synthese vanuit veratrol. Waarom zijn asymmetrisch gesubstitueerde CTV's chiraal?
#* hoe kunnen we eigenschappen van een gegeven cyclofaan gebruiken om de grootte van de substituent op de ring te bepalen
#* geef de synthese van de macroring 15 kroon 5 maar ipv met zuurstoffen met (NH , O , NH, S, S) vanuit HSCH2CH2SH en H2NCH2CH2OCH2CH2NH2
#* welke gast past in welk solvent bij welke gastheer? gasten: (Fe3+, Yb3+, tetramethylammonium, benzoaat) solventen: (methanol, DCM, water met pH=3,7,10) gastheren:(een resorcinareen, een [4]-calixareen met een -O-CH2COOH op elke ring, een [6]-calixareen met op de ring aan de ene kant een SO3H aan de andere kant een staart met een hydroxyamide rest aan, een [6]-calixareen met daaraan een staart met aan het uiteinde een fenylureum staart
#Smet:
#* gegeven: een receptor met daarop 2 groepen die waterstofbruggen vormen met een HO- en een -CHO op drie verschillende liganden. Welke complex zal het stabielste zijn, en verklaar dit energetisch en entropisch (ligand 1 is een bifenyl, ligand 2 is een bifenyl met een huge (triethylmethyl-)substituent op een van de ringen en ligand 3 is gewoon een alifatische keten met die oh en cho aan de uiteinden)
#* wat is de dubbele mutantcyclus een geef een voorbeeld dat de voordelen duidelijk maakt

=== 11 juni 2010 (ochtend) ===

#Dehaen:
#* Bespreek de synthese van volgend cavitand, vertrekkende van resorcinareen. (afbeelding volgt nog)
#* Wat is [2,2]paracyclofaan? Geef de syntheses en eigenschappen (UV-spectrum).
#* Bespreek het kinetisch en thermodynamisch templaateffect.
#* 5 Macroringen gegeven; rangschik naar toenemende effectieve molariteit. (afbeelding volgt nog)
#Smet:
#* Gegeven 1-amino-5-R-naftaleen (met R een onbepaalde substituent). In een complex vormt deze aminogroep een waterstofbrug. Onderzoek wijst uit dat de "reactie"-parameter sterk positief is. Welke soort R-substituenten bevoordeligen de reactie? (leg uit met Hammett-vergelijking en de substituent-parameter) Bekleedt de aminogroep een donor- of acceptorfunctie bij het vormen van deze waterstofbrug?
#* Waarom is het entropieverlies van complexvorming in oplossing doorgaans kleiner dan in gasfase?

=== 19 juni 2009 ===

#Dehaen:
#* Verklaar waarom de effectieve molariteit stijgt bij een macrocysliche 10-ring, wanneer
#** a) rigide groepen worden gebruikt
#** b) heteroatomen worden gebruikt.
#* Wat is het verschil tussen een clathraat en een vaste stof-inclusie complex.
#* Schrijf de synthese op van dit cavitand (structuur is gegeven) vertrekkende van rescoriol. De cavitand is gelijkend op die in de cursus staat, maar op de 2' plaats heeft deze een COOH groep.
#* VÃ¶gth synthetiseerde vele cryptanden met substituenten X (structuur is gegeven). Hoe kon hij daarmee de grootte van de caviteit bepalen?
# Smet:
#* Je krijgt een complexatie van een gast en gastheer die via pi-pi interacties complexeert en net naast deze aromatische ringen een waterstofbrug vormt met een amide op de gast.
#** Men wil d.m.v. substituenteffecten op de aromatische ringen ph1 (= op gast) en ph2 (= op gastheer) de bijdrage voor deze pi-pi interactie meten. Welke complicatie verwacht je echter met deze methode, bij dit specifieke complex?
#** Verklaar in de tabel (tabel met horizontaal de para-ph1 substituenten en vertikaal de para-ph 2 substituenten) de verlopen van de incrementen. (De incrementen zijn aangepast aan de complicatie die je in het eerste puntje moet geven en zijn dus correct)
#** Bepaal ook het teken van de Hammett rho parameters.
#* Trage complexen.
#** Hoe kan je in een NMR spectrum zien of je te maken hebt met een traag complex
#** Wat is het voordeel van een extreem traag complex? Geef een relevant voorbeeld van hoe we er gebruik van kunnen maken.

=== 16 juni 2009 ===

# Dehaen:
#* match de gasten en de gastheren met de juiste solventen. Gast: 1,4-benzochinon, naftaleen-1,5-dicarbonzuur en 4-butylfenol ("voor mensen die niet goed zijn in naamgeving, zal ik de moleculen even op bord tekenen"). Solvent: water (ph= 2, 6, 10), MeOH, CCl4. Gasten: alpha-cyclodextrine, diazo-18-kroon-6, 18-kroon-6, [2,2]cyclofaan en 2 grote cyclofanen die getekend staan. Geef ook alle niet-covalente reacties en licht uw keuze toe
#* Wat is CAC, waarom belangrijk en hoe gemeten
#* reactie van een [2,2,1]cryptand opgebouwd uit bi en triÃ«thyleenglycolderivaten
#* Membraantransport van kationen met kroonethers en de voorwaarden waaraan dat kroonether moet voldoen
# Smet:
#* Het teken van rho (Hammet) bepalen uit een tabel met stabiliteitsconstanten met verschillende gevers en zuigers. De link vinden met het reactiemechanisme. Bijkomende vraag: wat gebeurt er met een sterke base en een sterke elektronzuiger. (ja wat onduidelijk als je het molecule niet ziet natuurlijk...)
#* Stelling: voor het gegeven molecule mag ik zomaar de deltaG optellen om de totale deltaG te berekenen.
#* Waarom kan het voordelig zijn om synthese van rotaxanen uit te voeren op een vaste fase

=== 9 juni 2008 ===

# Dehaen:
#* welke ionen passen in welke macroringen? (K+, Ag+, Eu3+, Li+ en nog een vieze grote molecule) De macrocyclische verbindingen zijn ook gegeven. Welk solvent pak je best? (H2O, H2O pH 10, MeOH of chloroform) Vermeld welke interacties plaatsvinden
#* bespreek de synthese van: -een calix[4]areen met twee nitraten, twee n-propyloxy's en een azakroonetheroverbrugging-
#* Wat is zijn zelfassemblage en zelforganisatie en illustreer met een voorbeeld
# MS:
#* Tabel horende bij compensatie-effect gegeven. Welke interacties? Bespreek de tendens in de tabel en ook het verschil in \Delta S tussen gasfase en oplossing.
#* tekening van een catenaan met een cyclofaan met nogal wat N in rond een benzokroonether gegeven. Deze verbinding toont met H-NMR slechts twee signalen (3,45 en 6,26 ppm of zo) voor de hydrochinon-waterstoffen. Reden? Bespreek ook de multipliciteit van de signalen.

=== 13 juni 2008 ===
# Dehaen:
#* Waarom is ethyleendioxy zo'n populaire eenheid in kroonetherchemie
#* Welke 2 groepen zijn belangrijk bij de complexatie van Fe bij de sideroforen
#* 3 gasten (Lithium, azide, tetramethylammonium), 5 solventen (MeOH, H2O( pH 2,6,10), CCl4), gastheren ([2.2.2]-cryptand, all-cis resorcinareen, cram's sferand, 18-kroon-6,...)
# M.S.:
#* Synthese van tetrakationisch cyclofaan
#* Vraagje over receptor die interageert met gast, welk teken heeft de hammett parameter rho.

Moleculaire Herkenning

2017-06-17T07:48:44Z

LaurenV: /* 16 juni 2017 */

[[Categorie:Bachelor Chemie]]
==Vakinformatie==

Verplicht vak voor chemie. Moleculaire herkenning wordt gedoceerd door 2 proffen. Mario smet en Wim "sandalen" Dehaen. 50% van de punten staan op het examen, de andere 50% staan op een paper. Op het examen worden mondelinge vragen gesteld over de paper. Bij prof. Smet zijn dit normaal enkel de vragen die hij geeft bij de feedback op de paper,
prof. Dehaen stelt vaak ook extra vragen.

==Examenvragen==
=== 16 juni 2017 ===
#Dehaen:
#* welke factoren beinvloeden de molaire efficientie
#* synthese van hexathia18-kroon-6 vanuit ethyleenglycol en bis(2hydroxyethyl)sulfide op een veilige manier en wat doen we om de opbrengst zo hoog mogelijk te houden
#* wat zijn ansa-verbindingen en hoe kunnen ze meer inzicht geven over de ruimtevulling van de groepen
#* een structuur gegeven met 2 NH2 groepen een kroonether en een R (fenyl). 4-nitrobutaanzuur is beter oplosbaar dan glycine (2-nitroazijnzuur) en 6-nitrohexaanzuur. Hoe komt dit, welke interacties. De oplosbaarheid stijgt wanneer we R vervangen door (4-NO2-fenyl). Verklaar.
#* er zijn twee isomeren bij de synthese van resorcinarenen. Welke zijn dit?

#SMET:
#* gegeven een amide: RR'C=CH-CO-N(CH3)2 met onbekende receptor gaat interageren:
Welke interactie verwachten we, teken van reactieparameter, plus redeneer. Wat gebeurt er met de absolite waarde van de reactieparameter als we een van de R groepen vervangen door een H.
#* lipskin regel geven en wat is het belang tegenwoordig in farmaceutische industrie
#* Bij synthese van rotaxanen volgens iemand (Stoddart ofzo)(tetrakationisch complex) zal threading een hogere opbrengst geven dan clipping waarom?
Waarom dan niet altijd threading?

=== 19 juni 2015 ===
#Dehaen:
#* Stel een synthese voor voor het volgende molecule: vanuit p-tBu-fenol en p-Me-fenol een calix[4]areen met aan de 1,3-alcoholen het trimeer van p-Me-fenol (via ether). Deze twee benzeenringen zijn ook gedebutyleerd en alle overgebleven vrije hydroxylgroepen zijn gemethyleerd.
#* Bespreek aan de hand van hun structuurelementen de functie van nonactine en valinomycine (structuur gegeven).
#* Verbind de juiste gastheren met de juiste gasten en solventen. Gasten: Natriumion, p-diaminobenzeen, p-diaminobenzeen met beide stikstoffen tetragebutyleerd, benzoÃ«zuur. Gastheren: calix[4]areen, een groot dibenzokroonether, een resorcinareen verkregen na 24 uur reflux, alfa-cyclodextrine en een aromatisch diamide. Solventen: water (pH 3, 7, 10), MeOH & DCM.
#Smet:
#* 4-R-pyridine. Deze gast bindt enkel aan de gastheer indien de stikstof geprotoneerd is. Bepaal het teken van de Hammett-parameter rho. Op welke interactie zou de complexatie kunnen berusten?
#* Geef de twee methoden die gebruikt kunnen worden om de associatieconstante te schrijven in functie van deelassociatieconstanten. Beschrijf de fysische basis van het probleem dat hierbij optreedt.
#* Bespreek de moleculaire basis van plaquevorming zoals die optreedt bij bijvoorbeeld de ziekte van Alzheimer. Wat zijn de therapeutische mogelijkheden om dit tegen te gaan? Bijvraag: op welke secundaire structuren en soorten interacties berust de associatie?

===18 juni 2014 (voormiddag) ===
#Dehaen:
#* Geef een voorstel voor de synthese van een gegeven [2.2.2]cryptand uitgaande van chlooracetamide. Het cryptand heeft stikstoffen als bruggenhoofden, 2 ketens met telkens 2 zuurstoffen en 1 keten met 2 zwavelatomen. En hoe kan je de macroyclisatie bevorderen?
#* Transport van donor naar acceptorlaag via een organisch membraan? hoe gaat dit het beste met pentaglyme of met een [2.2.2]cryptand. Verklaar.
#* Verbind de juiste gast met de gegeven gastheren en solventen. Er zijn meer gastheren en solventen dan er gasten zijn.
#Smet:
#* Je hebt een gesubstitueerd chinoline (onbekende substituent). Dit chinoline complexeert enkel met een gastheer als de N niet geprotoneerd is. wat is het teken van de hammet-parameter Rho? welke interactie zal er zijn tussen de gast en de gastheer?
#* Geef de 4 belangrijkste entropieveranderingen bij complexatie en bespreek. Welke is verantwoordelijk voor preorganisatie? Leg uit.
#* Invloed ketenlengte benzokroonether op rendement van een catenaan met een tetrakationisch cyclofaan.

=== 19 juni 2014 (namiddag) ===
#Dehaen:
#* Geef een voorstel voor de synthese van een gegeven calix[4]hemisferand uitgaande van 2 gegeven fenolen. De receprot bestond uit een calix[4]areen met een hemisferand aangehecht op de 1- en 3-posities.
#* Gegeven de structuur van valinomycine en nonactine: bespreek de functie en hoe de verschillende structuurelementen hiertoe bijdragen.
#* Verbind de juiste gast met de gegeven gastheren en solventen. Er zijn meer gastheren en solventen dan er gasten zijn.
#**solventen: zuur, neutraal of basisch water, methanol, dicchloormethaan
#**gastheren: cyclodextrine, een grote benzokroonether, een calyxareen, stoel resorcinareen en een heteroaromatische receptor met amidefuncties.
#**gasten: natriumion, aromatisch diamine, aromatisch diammoniumzout, benzoÃ«zuur
#Smet:
#* Op welke 2 manieren kunnen we de totale associatieconstante beschouwen als een product van deelassociatieconstanten? Wat is bij elk het grootste fysisch probleem? Welk van deze 2 methoden is, op praktische gronden, te verkiezen en waarom?
#* Gegeven een amide met een para-gesubstitueerde fenylgroep op de N en de carbonyl. Dit molecule gaat waterstofbindingen aan met zowel de zuurstof als de NH. Wat is het teken van de Hammett-parameter rho voor het substituent op elke benzeenring?
#* Gegeven de structuur van een receptor bestaande uit een porfyrinering, gekoppeld aan een calixareen met ketens die veel heteroatomen bevatten. De bindingsconstanten van KI is hoog, die voor NaI en NaClO4 tussenin (en ongeveer gelijk), die van KClO4 laag. Verklaar waarom. (Deze structuur staat in de cursus ter hoogte van het deel over coÃ¶perativiteit).

=== 15 juni 2012 (namiddag) ===
#Dehaen:
#* Wat zijn pseudo-hoge verdunningsvoorwaarden en geef 2 voorbeelden hoe men dit in de praktijk bewerkstelligt.
#* Onderzoekers onderzochten de complexatieconstante van verbindingen A, B en C met het chloride-anion. Ondanks extra H-atoom beschikbaar, had C toch de laagste complexatieconstante. Volgorde was KA > KB >> KC. Volgens de onderzoekers had dit te maken met een verschillende preorganisatie. Verklaar. [[Bestand:MolHerExamenDehaen.jpg]]
#* Rangschik volgens toenemende affiniteit voor het kaliumkation en motiveer: 18-kroon-6, 1,10-dithia-18-kroon-6, benzo-18-kroon-6, [2.2.2]cryptand, 15-kroon-5, 21-kroon-7.
#Smet:
#* Voor een bepaald hydrofoob (gedeelte van een) gastmolecule werd aangetoond dat het de hydrofobe holte van de gastheer maar voor 55% vult in stabielste toestand. Verklaar thermodynamisch waarom het kan dat deze gedeeltelijk gevulde toestand meer bevoordeeld wordt dan de volledig gevulde holte.
#*
#** Welke interacties zijn van belang bij het catenaan gevormd uit '''1''', '''2''' en '''3'''?
#** Wat zou het effect zijn op de bindingsconstante moest het catenaan gevormd worden rond '''4''' i.p.v. '''1''' en waarom?
#** Beredeneer het teken van de Hammett parameter Ï van de catenatiereactie van '''5''' met het monogealkyleerd derivaat van '''3''' (hiermee wordt bedoeld, de open-ketenvorm van '''2''' enkelvoudig gebonden aan '''3'''). Sterische effecten van R mogen verwaarloosd worden [[Bestand:CatenaanSmet.png]]
#* Onderzoekers synthetiseerden bovenste verbinding als receptor voor de onderste (tekening is ''ongeveer'' juist). Belangrijke interacties hierbij zijn H-bruggen, maar ook de Ï€-Ï€-interacties tussen de eindstandige benzeenringen spelen een beduidende rol. Om aard en sterkte van deze Ï€-Ï€-interacties te onderzoeken synthetiseerde men een aantal derivaten van beide, en mat men het verschil in bindingssterkte voor verschillende substituenten op de benzeenringen. [[Bestand:receptorSmet.png]]
#** Welke complicatie valt te verwachten bij deze metingen, vanwege de verschillende substituenten op de derivaten?
#** Verklaar de waargenomen tendensen in de gemeten energiebijdragen, weergegeven in de tabel (deze waarden zijn gecorrigeerd voor de complicaties waarnaar gevraagd in eerste subvraag dus zijn ''juist'').
[[Bestand:tabelSmet.png]]

=== 17 juni 2011 (voormiddag) ===
#Dehaen:
#* Onderzoekers onderzochten de complexatieconstante van verbindingen A, B en C met het chloride-anion. Ondanks extra H-atoom beschikbaar, had C toch de laagste complexatieconstante. Volgorde was KA > KB >> KC. Volgens de onderzoekers had dit te maken met een verschillende preorganisatie. Verklaar. [[Bestand:MolHerExamenDehaen.jpg]]
#* Klassieke vraag. Verbind de juiste gast met gastheer en solvent. Licht toe en zeg welke interacties plaatsvinden.
#* Wat is de CAC? Waarom is het belangrijk dat deze gemeten wordt en hoe wordt deze gemeten?
#Smet:
#* Gegeven: [[Bestand:MolHerExamenMario.jpg]] Bepaal het teken van &rho;X, voor groep X en &rho;R, voor groep R. Waarom gaat bij zÃ©Ã©r elektronenzuigende groepen, bv. X=F-, de meting van de complexatieconstante met nucleofiele deeltjes niet meer correct verlopen?
#* Mag men de &Delta;G van interacties met de aromatische ring en de &Delta;G van interacties met de gedeprotoneerde carbonzuurfunctie zomaar optellen? Verklaar. [[Bestand:MolHerExamenMario2.jpg]]
#* De synthese van rotaxanen op vaste drager kan handig zijn. Onwaar/waar en verklaar.

=== 11 juni 2010 (namiddag) ===

#Dehaen:
#* geef de structuur van cyclotriveratryleen en de synthese vanuit veratrol. Waarom zijn asymmetrisch gesubstitueerde CTV's chiraal?
#* hoe kunnen we eigenschappen van een gegeven cyclofaan gebruiken om de grootte van de substituent op de ring te bepalen
#* geef de synthese van de macroring 15 kroon 5 maar ipv met zuurstoffen met (NH , O , NH, S, S) vanuit HSCH2CH2SH en H2NCH2CH2OCH2CH2NH2
#* welke gast past in welk solvent bij welke gastheer? gasten: (Fe3+, Yb3+, tetramethylammonium, benzoaat) solventen: (methanol, DCM, water met pH=3,7,10) gastheren:(een resorcinareen, een [4]-calixareen met een -O-CH2COOH op elke ring, een [6]-calixareen met op de ring aan de ene kant een SO3H aan de andere kant een staart met een hydroxyamide rest aan, een [6]-calixareen met daaraan een staart met aan het uiteinde een fenylureum staart
#Smet:
#* gegeven: een receptor met daarop 2 groepen die waterstofbruggen vormen met een HO- en een -CHO op drie verschillende liganden. Welke complex zal het stabielste zijn, en verklaar dit energetisch en entropisch (ligand 1 is een bifenyl, ligand 2 is een bifenyl met een huge (triethylmethyl-)substituent op een van de ringen en ligand 3 is gewoon een alifatische keten met die oh en cho aan de uiteinden)
#* wat is de dubbele mutantcyclus een geef een voorbeeld dat de voordelen duidelijk maakt

=== 11 juni 2010 (ochtend) ===

#Dehaen:
#* Bespreek de synthese van volgend cavitand, vertrekkende van resorcinareen. (afbeelding volgt nog)
#* Wat is [2,2]paracyclofaan? Geef de syntheses en eigenschappen (UV-spectrum).
#* Bespreek het kinetisch en thermodynamisch templaateffect.
#* 5 Macroringen gegeven; rangschik naar toenemende effectieve molariteit. (afbeelding volgt nog)
#Smet:
#* Gegeven 1-amino-5-R-naftaleen (met R een onbepaalde substituent). In een complex vormt deze aminogroep een waterstofbrug. Onderzoek wijst uit dat de "reactie"-parameter sterk positief is. Welke soort R-substituenten bevoordeligen de reactie? (leg uit met Hammett-vergelijking en de substituent-parameter) Bekleedt de aminogroep een donor- of acceptorfunctie bij het vormen van deze waterstofbrug?
#* Waarom is het entropieverlies van complexvorming in oplossing doorgaans kleiner dan in gasfase?

=== 19 juni 2009 ===

#Dehaen:
#* Verklaar waarom de effectieve molariteit stijgt bij een macrocysliche 10-ring, wanneer
#** a) rigide groepen worden gebruikt
#** b) heteroatomen worden gebruikt.
#* Wat is het verschil tussen een clathraat en een vaste stof-inclusie complex.
#* Schrijf de synthese op van dit cavitand (structuur is gegeven) vertrekkende van rescoriol. De cavitand is gelijkend op die in de cursus staat, maar op de 2' plaats heeft deze een COOH groep.
#* VÃ¶gth synthetiseerde vele cryptanden met substituenten X (structuur is gegeven). Hoe kon hij daarmee de grootte van de caviteit bepalen?
# Smet:
#* Je krijgt een complexatie van een gast en gastheer die via pi-pi interacties complexeert en net naast deze aromatische ringen een waterstofbrug vormt met een amide op de gast.
#** Men wil d.m.v. substituenteffecten op de aromatische ringen ph1 (= op gast) en ph2 (= op gastheer) de bijdrage voor deze pi-pi interactie meten. Welke complicatie verwacht je echter met deze methode, bij dit specifieke complex?
#** Verklaar in de tabel (tabel met horizontaal de para-ph1 substituenten en vertikaal de para-ph 2 substituenten) de verlopen van de incrementen. (De incrementen zijn aangepast aan de complicatie die je in het eerste puntje moet geven en zijn dus correct)
#** Bepaal ook het teken van de Hammett rho parameters.
#* Trage complexen.
#** Hoe kan je in een NMR spectrum zien of je te maken hebt met een traag complex
#** Wat is het voordeel van een extreem traag complex? Geef een relevant voorbeeld van hoe we er gebruik van kunnen maken.

=== 16 juni 2009 ===

# Dehaen:
#* match de gasten en de gastheren met de juiste solventen. Gast: 1,4-benzochinon, naftaleen-1,5-dicarbonzuur en 4-butylfenol ("voor mensen die niet goed zijn in naamgeving, zal ik de moleculen even op bord tekenen"). Solvent: water (ph= 2, 6, 10), MeOH, CCl4. Gasten: alpha-cyclodextrine, diazo-18-kroon-6, 18-kroon-6, [2,2]cyclofaan en 2 grote cyclofanen die getekend staan. Geef ook alle niet-covalente reacties en licht uw keuze toe
#* Wat is CAC, waarom belangrijk en hoe gemeten
#* reactie van een [2,2,1]cryptand opgebouwd uit bi en triÃ«thyleenglycolderivaten
#* Membraantransport van kationen met kroonethers en de voorwaarden waaraan dat kroonether moet voldoen
# Smet:
#* Het teken van rho (Hammet) bepalen uit een tabel met stabiliteitsconstanten met verschillende gevers en zuigers. De link vinden met het reactiemechanisme. Bijkomende vraag: wat gebeurt er met een sterke base en een sterke elektronzuiger. (ja wat onduidelijk als je het molecule niet ziet natuurlijk...)
#* Stelling: voor het gegeven molecule mag ik zomaar de deltaG optellen om de totale deltaG te berekenen.
#* Waarom kan het voordelig zijn om synthese van rotaxanen uit te voeren op een vaste fase

=== 9 juni 2008 ===

# Dehaen:
#* welke ionen passen in welke macroringen? (K+, Ag+, Eu3+, Li+ en nog een vieze grote molecule) De macrocyclische verbindingen zijn ook gegeven. Welk solvent pak je best? (H2O, H2O pH 10, MeOH of chloroform) Vermeld welke interacties plaatsvinden
#* bespreek de synthese van: -een calix[4]areen met twee nitraten, twee n-propyloxy's en een azakroonetheroverbrugging-
#* Wat is zijn zelfassemblage en zelforganisatie en illustreer met een voorbeeld
# MS:
#* Tabel horende bij compensatie-effect gegeven. Welke interacties? Bespreek de tendens in de tabel en ook het verschil in \Delta S tussen gasfase en oplossing.
#* tekening van een catenaan met een cyclofaan met nogal wat N in rond een benzokroonether gegeven. Deze verbinding toont met H-NMR slechts twee signalen (3,45 en 6,26 ppm of zo) voor de hydrochinon-waterstoffen. Reden? Bespreek ook de multipliciteit van de signalen.

=== 13 juni 2008 ===
# Dehaen:
#* Waarom is ethyleendioxy zo'n populaire eenheid in kroonetherchemie
#* Welke 2 groepen zijn belangrijk bij de complexatie van Fe bij de sideroforen
#* 3 gasten (Lithium, azide, tetramethylammonium), 5 solventen (MeOH, H2O( pH 2,6,10), CCl4), gastheren ([2.2.2]-cryptand, all-cis resorcinareen, cram's sferand, 18-kroon-6,...)
# M.S.:
#* Synthese van tetrakationisch cyclofaan
#* Vraagje over receptor die interageert met gast, welk teken heeft de hammett parameter rho.

Moleculaire Herkenning

2017-06-17T07:48:18Z

LaurenV: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Chemie]]
==Vakinformatie==

Verplicht vak voor chemie. Moleculaire herkenning wordt gedoceerd door 2 proffen. Mario smet en Wim "sandalen" Dehaen. 50% van de punten staan op het examen, de andere 50% staan op een paper. Op het examen worden mondelinge vragen gesteld over de paper. Bij prof. Smet zijn dit normaal enkel de vragen die hij geeft bij de feedback op de paper,
prof. Dehaen stelt vaak ook extra vragen.

==Examenvragen==
=== 16 juni 2017 ===
#Dehaen:
#* welke factoren beinvloeden de molaire efficientie
#* synthese van hexathia18-kroon-6 vanuit ethyleenglycol en bis(2hydroxyethyl)sulfide op een veilige manier en wat doen we om de opbrengst zo hoog mogelijk te houden
#* wat zijn ansa-verbindingen en hoe kunnen ze meer inzicht geven over de ruimtevulling van de groepen
- een structuur gegeven met 2 NH2 groepen een kroonether en een R (fenyl). 4-nitrobutaanzuur is beter oplosbaar dan glycine (2-nitroazijnzuur) en 6-nitrohexaanzuur. Hoe komt dit, welke interacties. De oplosbaarheid stijgt wanneer we R vervangen door (4-NO2-fenyl). Verklaar.
#* er zijn twee isomeren bij de synthese van resorcinarenen. Welke zijn dit?

#SMET:
#* gegeven een amide: RR'C=CH-CO-N(CH3)2 met onbekende receptor gaat interageren:
Welke interactie verwachten we, teken van reactieparameter, plus redeneer. Wat gebeurt er met de absolite waarde van de reactieparameter als we een van de R groepen vervangen door een H.
#* lipskin regel geven en wat is het belang tegenwoordig in farmaceutische industrie
#* Bij synthese van rotaxanen volgens iemand (Stoddart ofzo)(tetrakationisch complex) zal threading een hogere opbrengst geven dan clipping waarom?
Waarom dan niet altijd threading?

=== 19 juni 2015 ===
#Dehaen:
#* Stel een synthese voor voor het volgende molecule: vanuit p-tBu-fenol en p-Me-fenol een calix[4]areen met aan de 1,3-alcoholen het trimeer van p-Me-fenol (via ether). Deze twee benzeenringen zijn ook gedebutyleerd en alle overgebleven vrije hydroxylgroepen zijn gemethyleerd.
#* Bespreek aan de hand van hun structuurelementen de functie van nonactine en valinomycine (structuur gegeven).
#* Verbind de juiste gastheren met de juiste gasten en solventen. Gasten: Natriumion, p-diaminobenzeen, p-diaminobenzeen met beide stikstoffen tetragebutyleerd, benzoÃ«zuur. Gastheren: calix[4]areen, een groot dibenzokroonether, een resorcinareen verkregen na 24 uur reflux, alfa-cyclodextrine en een aromatisch diamide. Solventen: water (pH 3, 7, 10), MeOH & DCM.
#Smet:
#* 4-R-pyridine. Deze gast bindt enkel aan de gastheer indien de stikstof geprotoneerd is. Bepaal het teken van de Hammett-parameter rho. Op welke interactie zou de complexatie kunnen berusten?
#* Geef de twee methoden die gebruikt kunnen worden om de associatieconstante te schrijven in functie van deelassociatieconstanten. Beschrijf de fysische basis van het probleem dat hierbij optreedt.
#* Bespreek de moleculaire basis van plaquevorming zoals die optreedt bij bijvoorbeeld de ziekte van Alzheimer. Wat zijn de therapeutische mogelijkheden om dit tegen te gaan? Bijvraag: op welke secundaire structuren en soorten interacties berust de associatie?

===18 juni 2014 (voormiddag) ===
#Dehaen:
#* Geef een voorstel voor de synthese van een gegeven [2.2.2]cryptand uitgaande van chlooracetamide. Het cryptand heeft stikstoffen als bruggenhoofden, 2 ketens met telkens 2 zuurstoffen en 1 keten met 2 zwavelatomen. En hoe kan je de macroyclisatie bevorderen?
#* Transport van donor naar acceptorlaag via een organisch membraan? hoe gaat dit het beste met pentaglyme of met een [2.2.2]cryptand. Verklaar.
#* Verbind de juiste gast met de gegeven gastheren en solventen. Er zijn meer gastheren en solventen dan er gasten zijn.
#Smet:
#* Je hebt een gesubstitueerd chinoline (onbekende substituent). Dit chinoline complexeert enkel met een gastheer als de N niet geprotoneerd is. wat is het teken van de hammet-parameter Rho? welke interactie zal er zijn tussen de gast en de gastheer?
#* Geef de 4 belangrijkste entropieveranderingen bij complexatie en bespreek. Welke is verantwoordelijk voor preorganisatie? Leg uit.
#* Invloed ketenlengte benzokroonether op rendement van een catenaan met een tetrakationisch cyclofaan.

=== 19 juni 2014 (namiddag) ===
#Dehaen:
#* Geef een voorstel voor de synthese van een gegeven calix[4]hemisferand uitgaande van 2 gegeven fenolen. De receprot bestond uit een calix[4]areen met een hemisferand aangehecht op de 1- en 3-posities.
#* Gegeven de structuur van valinomycine en nonactine: bespreek de functie en hoe de verschillende structuurelementen hiertoe bijdragen.
#* Verbind de juiste gast met de gegeven gastheren en solventen. Er zijn meer gastheren en solventen dan er gasten zijn.
#**solventen: zuur, neutraal of basisch water, methanol, dicchloormethaan
#**gastheren: cyclodextrine, een grote benzokroonether, een calyxareen, stoel resorcinareen en een heteroaromatische receptor met amidefuncties.
#**gasten: natriumion, aromatisch diamine, aromatisch diammoniumzout, benzoÃ«zuur
#Smet:
#* Op welke 2 manieren kunnen we de totale associatieconstante beschouwen als een product van deelassociatieconstanten? Wat is bij elk het grootste fysisch probleem? Welk van deze 2 methoden is, op praktische gronden, te verkiezen en waarom?
#* Gegeven een amide met een para-gesubstitueerde fenylgroep op de N en de carbonyl. Dit molecule gaat waterstofbindingen aan met zowel de zuurstof als de NH. Wat is het teken van de Hammett-parameter rho voor het substituent op elke benzeenring?
#* Gegeven de structuur van een receptor bestaande uit een porfyrinering, gekoppeld aan een calixareen met ketens die veel heteroatomen bevatten. De bindingsconstanten van KI is hoog, die voor NaI en NaClO4 tussenin (en ongeveer gelijk), die van KClO4 laag. Verklaar waarom. (Deze structuur staat in de cursus ter hoogte van het deel over coÃ¶perativiteit).

=== 15 juni 2012 (namiddag) ===
#Dehaen:
#* Wat zijn pseudo-hoge verdunningsvoorwaarden en geef 2 voorbeelden hoe men dit in de praktijk bewerkstelligt.
#* Onderzoekers onderzochten de complexatieconstante van verbindingen A, B en C met het chloride-anion. Ondanks extra H-atoom beschikbaar, had C toch de laagste complexatieconstante. Volgorde was KA > KB >> KC. Volgens de onderzoekers had dit te maken met een verschillende preorganisatie. Verklaar. [[Bestand:MolHerExamenDehaen.jpg]]
#* Rangschik volgens toenemende affiniteit voor het kaliumkation en motiveer: 18-kroon-6, 1,10-dithia-18-kroon-6, benzo-18-kroon-6, [2.2.2]cryptand, 15-kroon-5, 21-kroon-7.
#Smet:
#* Voor een bepaald hydrofoob (gedeelte van een) gastmolecule werd aangetoond dat het de hydrofobe holte van de gastheer maar voor 55% vult in stabielste toestand. Verklaar thermodynamisch waarom het kan dat deze gedeeltelijk gevulde toestand meer bevoordeeld wordt dan de volledig gevulde holte.
#*
#** Welke interacties zijn van belang bij het catenaan gevormd uit '''1''', '''2''' en '''3'''?
#** Wat zou het effect zijn op de bindingsconstante moest het catenaan gevormd worden rond '''4''' i.p.v. '''1''' en waarom?
#** Beredeneer het teken van de Hammett parameter Ï van de catenatiereactie van '''5''' met het monogealkyleerd derivaat van '''3''' (hiermee wordt bedoeld, de open-ketenvorm van '''2''' enkelvoudig gebonden aan '''3'''). Sterische effecten van R mogen verwaarloosd worden [[Bestand:CatenaanSmet.png]]
#* Onderzoekers synthetiseerden bovenste verbinding als receptor voor de onderste (tekening is ''ongeveer'' juist). Belangrijke interacties hierbij zijn H-bruggen, maar ook de Ï€-Ï€-interacties tussen de eindstandige benzeenringen spelen een beduidende rol. Om aard en sterkte van deze Ï€-Ï€-interacties te onderzoeken synthetiseerde men een aantal derivaten van beide, en mat men het verschil in bindingssterkte voor verschillende substituenten op de benzeenringen. [[Bestand:receptorSmet.png]]
#** Welke complicatie valt te verwachten bij deze metingen, vanwege de verschillende substituenten op de derivaten?
#** Verklaar de waargenomen tendensen in de gemeten energiebijdragen, weergegeven in de tabel (deze waarden zijn gecorrigeerd voor de complicaties waarnaar gevraagd in eerste subvraag dus zijn ''juist'').
[[Bestand:tabelSmet.png]]

=== 17 juni 2011 (voormiddag) ===
#Dehaen:
#* Onderzoekers onderzochten de complexatieconstante van verbindingen A, B en C met het chloride-anion. Ondanks extra H-atoom beschikbaar, had C toch de laagste complexatieconstante. Volgorde was KA > KB >> KC. Volgens de onderzoekers had dit te maken met een verschillende preorganisatie. Verklaar. [[Bestand:MolHerExamenDehaen.jpg]]
#* Klassieke vraag. Verbind de juiste gast met gastheer en solvent. Licht toe en zeg welke interacties plaatsvinden.
#* Wat is de CAC? Waarom is het belangrijk dat deze gemeten wordt en hoe wordt deze gemeten?
#Smet:
#* Gegeven: [[Bestand:MolHerExamenMario.jpg]] Bepaal het teken van &rho;X, voor groep X en &rho;R, voor groep R. Waarom gaat bij zÃ©Ã©r elektronenzuigende groepen, bv. X=F-, de meting van de complexatieconstante met nucleofiele deeltjes niet meer correct verlopen?
#* Mag men de &Delta;G van interacties met de aromatische ring en de &Delta;G van interacties met de gedeprotoneerde carbonzuurfunctie zomaar optellen? Verklaar. [[Bestand:MolHerExamenMario2.jpg]]
#* De synthese van rotaxanen op vaste drager kan handig zijn. Onwaar/waar en verklaar.

=== 11 juni 2010 (namiddag) ===

#Dehaen:
#* geef de structuur van cyclotriveratryleen en de synthese vanuit veratrol. Waarom zijn asymmetrisch gesubstitueerde CTV's chiraal?
#* hoe kunnen we eigenschappen van een gegeven cyclofaan gebruiken om de grootte van de substituent op de ring te bepalen
#* geef de synthese van de macroring 15 kroon 5 maar ipv met zuurstoffen met (NH , O , NH, S, S) vanuit HSCH2CH2SH en H2NCH2CH2OCH2CH2NH2
#* welke gast past in welk solvent bij welke gastheer? gasten: (Fe3+, Yb3+, tetramethylammonium, benzoaat) solventen: (methanol, DCM, water met pH=3,7,10) gastheren:(een resorcinareen, een [4]-calixareen met een -O-CH2COOH op elke ring, een [6]-calixareen met op de ring aan de ene kant een SO3H aan de andere kant een staart met een hydroxyamide rest aan, een [6]-calixareen met daaraan een staart met aan het uiteinde een fenylureum staart
#Smet:
#* gegeven: een receptor met daarop 2 groepen die waterstofbruggen vormen met een HO- en een -CHO op drie verschillende liganden. Welke complex zal het stabielste zijn, en verklaar dit energetisch en entropisch (ligand 1 is een bifenyl, ligand 2 is een bifenyl met een huge (triethylmethyl-)substituent op een van de ringen en ligand 3 is gewoon een alifatische keten met die oh en cho aan de uiteinden)
#* wat is de dubbele mutantcyclus een geef een voorbeeld dat de voordelen duidelijk maakt

=== 11 juni 2010 (ochtend) ===

#Dehaen:
#* Bespreek de synthese van volgend cavitand, vertrekkende van resorcinareen. (afbeelding volgt nog)
#* Wat is [2,2]paracyclofaan? Geef de syntheses en eigenschappen (UV-spectrum).
#* Bespreek het kinetisch en thermodynamisch templaateffect.
#* 5 Macroringen gegeven; rangschik naar toenemende effectieve molariteit. (afbeelding volgt nog)
#Smet:
#* Gegeven 1-amino-5-R-naftaleen (met R een onbepaalde substituent). In een complex vormt deze aminogroep een waterstofbrug. Onderzoek wijst uit dat de "reactie"-parameter sterk positief is. Welke soort R-substituenten bevoordeligen de reactie? (leg uit met Hammett-vergelijking en de substituent-parameter) Bekleedt de aminogroep een donor- of acceptorfunctie bij het vormen van deze waterstofbrug?
#* Waarom is het entropieverlies van complexvorming in oplossing doorgaans kleiner dan in gasfase?

=== 19 juni 2009 ===

#Dehaen:
#* Verklaar waarom de effectieve molariteit stijgt bij een macrocysliche 10-ring, wanneer
#** a) rigide groepen worden gebruikt
#** b) heteroatomen worden gebruikt.
#* Wat is het verschil tussen een clathraat en een vaste stof-inclusie complex.
#* Schrijf de synthese op van dit cavitand (structuur is gegeven) vertrekkende van rescoriol. De cavitand is gelijkend op die in de cursus staat, maar op de 2' plaats heeft deze een COOH groep.
#* VÃ¶gth synthetiseerde vele cryptanden met substituenten X (structuur is gegeven). Hoe kon hij daarmee de grootte van de caviteit bepalen?
# Smet:
#* Je krijgt een complexatie van een gast en gastheer die via pi-pi interacties complexeert en net naast deze aromatische ringen een waterstofbrug vormt met een amide op de gast.
#** Men wil d.m.v. substituenteffecten op de aromatische ringen ph1 (= op gast) en ph2 (= op gastheer) de bijdrage voor deze pi-pi interactie meten. Welke complicatie verwacht je echter met deze methode, bij dit specifieke complex?
#** Verklaar in de tabel (tabel met horizontaal de para-ph1 substituenten en vertikaal de para-ph 2 substituenten) de verlopen van de incrementen. (De incrementen zijn aangepast aan de complicatie die je in het eerste puntje moet geven en zijn dus correct)
#** Bepaal ook het teken van de Hammett rho parameters.
#* Trage complexen.
#** Hoe kan je in een NMR spectrum zien of je te maken hebt met een traag complex
#** Wat is het voordeel van een extreem traag complex? Geef een relevant voorbeeld van hoe we er gebruik van kunnen maken.

=== 16 juni 2009 ===

# Dehaen:
#* match de gasten en de gastheren met de juiste solventen. Gast: 1,4-benzochinon, naftaleen-1,5-dicarbonzuur en 4-butylfenol ("voor mensen die niet goed zijn in naamgeving, zal ik de moleculen even op bord tekenen"). Solvent: water (ph= 2, 6, 10), MeOH, CCl4. Gasten: alpha-cyclodextrine, diazo-18-kroon-6, 18-kroon-6, [2,2]cyclofaan en 2 grote cyclofanen die getekend staan. Geef ook alle niet-covalente reacties en licht uw keuze toe
#* Wat is CAC, waarom belangrijk en hoe gemeten
#* reactie van een [2,2,1]cryptand opgebouwd uit bi en triÃ«thyleenglycolderivaten
#* Membraantransport van kationen met kroonethers en de voorwaarden waaraan dat kroonether moet voldoen
# Smet:
#* Het teken van rho (Hammet) bepalen uit een tabel met stabiliteitsconstanten met verschillende gevers en zuigers. De link vinden met het reactiemechanisme. Bijkomende vraag: wat gebeurt er met een sterke base en een sterke elektronzuiger. (ja wat onduidelijk als je het molecule niet ziet natuurlijk...)
#* Stelling: voor het gegeven molecule mag ik zomaar de deltaG optellen om de totale deltaG te berekenen.
#* Waarom kan het voordelig zijn om synthese van rotaxanen uit te voeren op een vaste fase

=== 9 juni 2008 ===

# Dehaen:
#* welke ionen passen in welke macroringen? (K+, Ag+, Eu3+, Li+ en nog een vieze grote molecule) De macrocyclische verbindingen zijn ook gegeven. Welk solvent pak je best? (H2O, H2O pH 10, MeOH of chloroform) Vermeld welke interacties plaatsvinden
#* bespreek de synthese van: -een calix[4]areen met twee nitraten, twee n-propyloxy's en een azakroonetheroverbrugging-
#* Wat is zijn zelfassemblage en zelforganisatie en illustreer met een voorbeeld
# MS:
#* Tabel horende bij compensatie-effect gegeven. Welke interacties? Bespreek de tendens in de tabel en ook het verschil in \Delta S tussen gasfase en oplossing.
#* tekening van een catenaan met een cyclofaan met nogal wat N in rond een benzokroonether gegeven. Deze verbinding toont met H-NMR slechts twee signalen (3,45 en 6,26 ppm of zo) voor de hydrochinon-waterstoffen. Reden? Bespreek ook de multipliciteit van de signalen.

=== 13 juni 2008 ===
# Dehaen:
#* Waarom is ethyleendioxy zo'n populaire eenheid in kroonetherchemie
#* Welke 2 groepen zijn belangrijk bij de complexatie van Fe bij de sideroforen
#* 3 gasten (Lithium, azide, tetramethylammonium), 5 solventen (MeOH, H2O( pH 2,6,10), CCl4), gastheren ([2.2.2]-cryptand, all-cis resorcinareen, cram's sferand, 18-kroon-6,...)
# M.S.:
#* Synthese van tetrakationisch cyclofaan
#* Vraagje over receptor die interageert met gast, welk teken heeft de hammett parameter rho.