Chemika Examenwiki - Gebruikersbijdragen [nl]

Advanced biochemistry and biotechnology

2023-01-20T17:32:33Z

R0737746: /* Examenvragen */

[[Categorie: Mabb]]
==Vakinformatie==
Verdiepend vervolg op Moleculaire Biologie en Dynamische Biochemie van de 2e bachelor. In 2021 - 2022 gedoceerd door Prof Johan Robben en Shehab Ismail. Voor 2009-2010 door Prof M. De Ley en J. Robben. Van 2010 - 2021 gedoceerd door J. Robben. Vanaf 2019-2020 is dit vak van naam veranderd, het heet nu Gevorderde Biochemie en Biotechnologie.

Het examen is opgebouwd uit 2 grote, open vragen en 4 begrippen. De eerste vraag en de begrippen zijn schriftelijk met mondelinge toelichting: hij leest je antwoorden en stelt bijvragen indien nodig. De tweede open vraag is schriftelijk af te geven.

"De studenten hebben mij iets heel handig gegeven om na te gaan welke examenvragen ik de laatste jaren gesteld heb, ze houden het beter bij als ik zelf."
-- Quote Johan Robben, 2014

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/n/G0G74AN.htm

==Examenvragen==
===19 januari 2023===
J. Robben's deel
#mRNA cap van expressieregulatie. (5)
#Begrippen: Translational coupling, Genomic imprinting, Nonsense suppression, RNA turnover analysis (5)

S. Ismail's deel
#Grote vraag (6)
#* Vraagstuk over deletion Ups14 uit proteasome en dan een SDS-PAGE gedaan en visualisatie met een Western blot. 3 verschillende toestanden (Ups14 weg, + WT, + catalytic inactive Usp14) op 3 verschillende tijdspunten.
#*Verklaar de resultaten van het experiment
#Kleinere vraag
#* RNA interference: 2 ssRNA (sense & antisense) and 1 dsRNA --> he changed conclusion and you had to find the mistake & in C.elegans also effect seen in offspring, how possible? (4)
#Kleine vraagjes
#* PROTAC uitleggen (3)
#* 3 fasen CRISPR-interference in bacteria (3)
#* different endocytosis (2)
#* 2 names for miRNA expression analysis (2)

===30 augustus 2022===
J. Robben's deel
#5’ UTR en cap van expressieregulatie bij eukaryoten. (5)
#Begrippen: Translational coupling, RNA editing, Rip: regulated intramembrane proteolysis & exosome (5)

S. Ismail's deel
#Grote vraag (6)
#* Vraagstuk waarin er 6 verschillende tubes waren die een andere inhoud hadden. Hierop werd een northern blot gedaan en je kreeg een foto van de bekomen gel hiervan. Elke 1ste tube bevatte een pri-miRNA, elke tweede tube een pri-miRNA + microprocessor complex. De eerste pri-miRNA had een stemloop van 35 bp, een tweede met een 35 bp +1 en een derde met 35 bp + 3. Van elke tube werden de bandjes op de gel weergegeven.
#*Verklaar de resultaten van het experiment
#*Uit wat bestaat het microprocessor complex?
#*Geef een andere naam voor het microprocessor complex.
#Kleinere vraagjes
#* The two-signal membrane binding model bij meristoylation - uitleggen wat dit inhoudt (4)
#* Geef de factoren die de stabiliteit van proteïnen kunnen beïnvloeden - leg 1 uit. (4)
#Kleine vraagjes
#* 3 fasen tot komen van CRISPR-Cas systeem in bacteria (2)
#* Verschillende manieren van lysosomale degradatie (2)
#* Verschil in mechanisme van HECT en RING - E3 (2)

===28 januari 2022===
J. Robben's deel
#5’ UTR van expressieregulatie bij prokaryoten. (5)
#Begrippen: DNA acetylation, RNA editing, eIF4-binding proteïne & NMD (5)

S. Ismail's deel
#Kleine vragen (6)
#* Geef 2 voorbeelden van small interfering RNA.
#* Geef een detectietechniek voor je miRNA of interest.
#* Foto van goed opgevouwen proteïne en minder goed opgevouwen proteïne. Welke heeft de langste half-time?
#* Functie E3.
#* Geef 3 soorten lipid modifications.
#* Geef 1 functie van CRISPR in bacteriën
#Uitleggen hoe je van pri-miRNA tot mature miRNA geraakt. (4)

===20 januari 2022===
J. Robben's deel
#Bespreek op welke wijze(n) de poly(A)-staart van mRNA fungeert in eukaryote expressie regulatie. (5)
#Begrippen: Selenocysteine, Translational coupling, Genomic imprinting & toxin-antitoxin (5)

S. Ismail's deel
#Kleine vragen (6)
#* Welke van de RNA duplexen (2 fotos) zal door AGO2 worden geknipt voor het maken van guide strand
#* Welke is beter voor stabiele cellijn te maken: synthetische siRNA of vectorbased siRNA.
#* Noem de stappen/ fasen op om tot het CRISPR-Cas system te komen.
#* Noem 3 verschillende autophagie types op.
#* E1, E2 en E3 zijn enzymen in de ubiquitinylatie pathway. Wat doet E1?
#* Wat is het 2e aminozuur waaraan de myristoyltie plaats vindt en waarom kan het enkel deze aminozuur zijn?
#Bespreek hoe dat topologie, disorderd protein en protein-protein interacties de stabiliteit beïnvloeden. (4)

===22 januari 2021===
#Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress? (= ERAD en UPR)
#Experimenteel knockdown van genen adhv RNAi, geef de experimentele wijze, welke moeilijkheden kunnen optreden en hoe kan je dit voorkomen?
#Begrippen
#*Translationele koppeling
#*Prime edditing (met Crispr)
#*foto-entrainment
#*selenocysteïne

===14 januari 2021 NM===
#Bespreek overzichtelijk de werking en rol van lysosomen in eiwit-turnover. Vermeld een voorbeeld van een biotechnologische toepassing die gebruikt maakt van deze kennis.
#Cas9 is recentelijk aangepast voor andere toepassingen dan deze van genomische "schaar". Verduidelijk en concretiseer.
#Begrippen
#*Genomische imprinting
#*RNA-editing
#*RNA-induced silencing complex (RISC)
#*Periodosoom

===24 januari 2020 NM===
#Globale translatiemechanismen bij eukaryoten. Wanneer is dit van toepassing? Hoe kunnen genen dit ontwijken?
#Op welke wijze(n) kan je RNAi experimenteel uitvoeren?
#Begrippen
#*Translationele koppeling
#*CMA
#*PAM
#*Selenocysteïne

=== 20 januari 2020 NM===
#Bespreek hoe prokaryoten genexpressie reguleren via anti-sense mechanismen.
#Bespreek de N-endrule en eiwitafbraak. Vergelijk tussen eukaryoten en prokaryoten.
#Begrippen
#*Hfq
#*RNA editing
#*shRNA
#*prime editing

=== 17 januari 2020 VM===

#5’ UTR van expressieregulatie bij eukaryoten
#cas9 systeem waar CRISPR is op gebaseerd en vergelijk met Argonaut
#Begrippen
#*attenuatie
#*nonsense-mediated decay
#*looped primer RT-PCR
#*proteasome stress response (Rpn4 + PACE)

=== 25 januari 2019 NM===

#Leg de regulatie van het trp-operon uit
#Geef een schematisch overzicht van unfolded protein respons
#Begrippen
#* RITS
#* Shutdown decay
#* BMAL
#* uORF

=== 18 januari 2019 NM===

#3’ UTR bij eukaryoten
#Experimenteel knockdown van genen adhv RNAi
#Begrippen
#* RNA switch
#* Periodosoom
#* RNA editing
#* CMA

=== 18 januari 2019 VM===
#Bespreek de structuur en werking van riboschakelaars (riboswitches). Wat weet je over hun functie? Illustreer je antwoord met voorbeelden.
#Bespreek de moleculair-dynamische mechanismen die aan de basis liggen van het metabolische dag-nacht ritme bij zoogdieren.
#Begrippen
#* Selenocysteine
#* Nonsense-mediated decay
#* shRNA
#* Proximity-induced autoactivation

===22 januari 2018, VM===
#Geef overzicht van de regelmechanismen waarmee eukaryoten de translatie globaal (=niet eiwit specifiek) kan worden geregeld. In welke situatie is een dergelijke regeling van toepassing? Hoe ontsnappen sommige genen aan deze regeling?
#Bespreek op welke wijze(n) de poly(a)-staart van mRNA fungeert in expressie regulatie. (ook iets over de lengte ervan)
#Begrippen:
#* Retroreulatie
#* Genomische imprinting (+voorbeeld)
#* Nonsense-mediated decay
#*Nocturnine

===19 januari 2018, VM===
#Geef de gelijkenissen en verschillen voor de expressie regulatie aan de 5'-UTR en 5'-uiteinde regio bij prokaryoten en eukaryoten.
#Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress? (= ERAD en UPR)
#Begrippen:
#* Tac promotor (= is die gefuseerde promotor van lac operon en tac operon vanuit de werkzitting)
#* Rip: regulated intramembrane proteolysis
#* RITS
#* foto-entrainment

===21 augustus 2017===
#Controlemechanismen van mRNA bij eukaryoten.
#De rol van ubiquitine ligasen in proteïne turnover
#Begrippen:
#*Transcriptional gene silencing
#*Peptide mediated protein knockdownn
#*Familial fast sleep syndrome
#*Een vierde begrip

===3 februari 2017===
#Verduidelijk de structuur en werking van riboswitches . Leg hun functie uit
#Rol van Poly-A-staart bij regulatie van expressie
#Woordjes:
#*Nocturnine
#*uORF
#*Genetic imprinting
#*Chaperone-gemedieerde autofagie

===23 januari 2017===
#Globale translatie regulatie mechanisme uitleggen, wanneer is dit van toepassing en hoe ontsnappen genen eraan
#Op welke wijze(n) kan je de functie en voorkomen RNAi experimenteel uitvoeren?
#Bespreek kort
#*Retroregulation
#*Rip: regulated intramembrane proteolyse
#*nonsense mediated decay
#*Periodosoom

===20 januari 2017===
#Welke elementen in 3'-UTR voor expressieregulatie?
#Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress?
#Bespreek kort:
#*Attenuatie
#*Hairpin silencing
#*Translational recoding
#*Photo-entrainment

===29 januari 2016===
#UPR
#Circadische clock in zoogdieren
#Bespreek kort:
#*hairpin silencing
#*argonaut
#*genomic imprinting
#*riboswitch

===27 januari 2016===
#Geef overzichtelijk de technieken die kunnen gebruikt worden om het voorkomen en functies van kleine RNA's te bestuderen. (Hij was precies niet geÃ¯nteresseerd in RAKE, looped primer en al die dingen... Hij zei iets over sRNA sponzen en stabiele nucleïnezuuranalogen)
#Geef de werking en functie(s) van macroautophagie.
#Bespreek kort:
#*real-time RT-PCR
#*selenocysteÃ¯ne
#*caspasen
#*RIP.

===18 januari 2016===
#Hoe knockdown van genen bekomen via experimenten met RNA interferentie? wat zijn de aandachtpunten? bijvraag: wat zou je eerder gebruiken siRNA of via vector shRNA? en wat bij de mens?
#Translationele recoding wat is het en op welke manieren wordt het bereikt?
#Bespreek kort:
#*histonehermodellering
#*shut down decay
#*RNA editing
#*BMAL-CLOCK

===15 januari 2016===
#Globale translatie regulatie mechanisme uitleggen, wanneer is dit van toepassing (Stress enz), en hoe ontsnappen genen eraan (uORF)
#Rol van ubiquitinr ligases in proteïne turnover.
#Bespreek kort:
#*Chromatine remoddeling
#*Non stop decay
#*Periodosoom
#*Seed sequentie

===28 januari 2015===
#Bespreek het purine katabolisme + welke afwijkingen bij de mens?
#Wat weet je over Ubiquitine ligases in proteïne metabolisme?
#Bespreek kort:
#*RIP
#*Translationele hercodering
#*Exosoom
#*Looped-primer RT-PCR

===september 2014 ===
#Bespreek de N-endrule en eiwitafbraak. Vergelijk tussen eukaryoten en prokaryoten.
#Stel een dierenexperiment met RNAi; welke methoden voor knockdown van een gen stel je voor, welke verkies je voor het maximale resultaat?
#Bespreek kort:
#*RIP
#*Icterus
#*UPR
#*Nocturine

===31 januari 2014 ===
#Geef de diverse regulatiemechanismes van het (chole)sterolmetabolisme.
#Bespreek de invloed van ubiquitineligases op de proteïne turnover.
#Bespreek kort:
#*Geelzucht
#*genome imprinting
#*Initiator caspase
#*KiaC

===29 januari 2014 ===
# Bespreek overzichtelijk de mRNA kwaliteitscontrolemechanismen bij prokaryoten en eukaryoten
# Geef een overzicht van de verschillende mechanismen van cel-gecontroleerde eiwitafbraak die niet via proteasomen verloopt
#Bespreek kort:
#*Lesch-Nyhan-syndroom
#*Selenocysteine
#*Calnexin-calreticuline cyclus
#*Clock/BMAL1

===20 januari 2014===
#Bespreek schematische de biosynthese van heem. Hoe wordt het gereguleerd? En hoe werkt heem bij de algemene genexpressie?
#Bespreek "unfolded protein response" (UPR)?
#Leg kort uit
#* Trans-translatie
#*RNA editering
#*shRNA
#*Nocturnine

=== 21 januari 2013 ===
# Bespreek de mogelijke rol van de 5'-UTR in de posttranscriptionele expressieregultatie van prokaryoten.
# Bespreek het controlemechanisme van membraaneiwitten en eiwitten vÃ³Ã³r secretie. Welke mechanismen treden er op bij stress?
# Bespreek kort:
#* ALA-synthase
#* transtranslatie
#* Seed sequentie
#* nocturnine

=== 15 januari 2013 ===
# Bespreek de moleculaire mechanismen voor ijzerhomeostase.
# Bespreek het kloksysteem van Synechococcus (cyanobacterie). bijvraag: grote verschil met zoogdieren (= eiwitklok vs gen-gereguleerd)
# Bespreek kort:
#* thymidylaatsynthase
#* RNA editering
#* chaperone gemedieerde autofagie
#* argonaut

=== 3 februari 2012 ===
# Bespreek de moleculaire mechanismen voor de overerving van expressiepatronen tijdens de celcyclus. Wat is het belang hiervan?
# Bespreek de globale regulatiemechanismen bij proteasoom-afhankelijke proteolysis.
# Bespreek kort:
#* 5-FOA
#* RNA editering
#* seed sequence
#* nocturnine

=== 17 januari 2012 ===
# Bespreek de mogelijke rol van de 5'-UTR in de posttranscriptionele expressieregultatie van prokaryoten.
# Bespreek de globale regulatiemechanismen bij proteasoom-afhankelijke proteolysis.
# Bespreek kort:
#* Thymidilaatsynthetase
#* Geelzucht
#* CpG eiland
#* RITS

=== 1 september 2011 ===
# Schematische beschrijving heem biosynthese + hoe wordt cellulaire homeostase van heem bereikt?
# Geef overzicht van regelmechanismen waarmee bij eukaryoten de translatie globaal kan worden geregeld. In welke situaties is dergelijke regeling van toepassing? Hoe ontsnappen sommige genen aan de regeling?
# Bespreek kort:
#* histonmethyltransferase
#* nonsense mediated decay
#* photo entrainment
#* shRNA

=== 4 februari 2011 ===
# N-end rule
# Moleculaire dag en nacht ritme van het metabolisme van zoogdiercellen
# Bespreek kort:
#* geelzucht
#* selenocysteïne
#* Shutdown decay (SSD)
#* eIF2

=== 24 januari 2011 ===
# Geef het belang van de 3' Untranslated region bij expressie in eukaryoten.
# Leg het klok systeem van cyanobacteriÃ«n uit
# Bespreek kort:
#* OMP
#* RNA editing
#* toxine-antitoxine
#* ubiquitineligase E3

=== 18 januari 2011 ===
# Bespreek riboswitches.
# Op welke wijze(n) kan je RNAi experimenteel uitvoeren?
# Bespreek kort:
#* allopurinol
#* uORFs
#* ERAD
#* photo-entrainment

=== 29 januari 2010 ===
# Geef het belang van de 3' Untranslated region bij expressie in eukaryoten.
# Leg het klok systeem van cyanobacteriÃ«n uit, en de invloed op transcriptie.
# Bespreek kort:
#* OMP
#* ERAD
#* initiator caspases
#* myristoylisatie
=== 18 januari 2010 ===
# N-end rule
# Moleculaire dag en nacht ritme van het metabolisme van zoogdiercellen
# Bespreek kort:
#* geelzucht
#* selenocysteïne
#* RISC
#* endosomale lokalisatiesignaal

===12 januari 2010===
# Bespreek de purineafbraak en de verschillende metabole stoornissen bij de mens die hiermee verband houden.
# Bespreek de globale regulatie van eukaryote translatie. Hoe kunnen sommige genen aan deze regulatie ontsnappen?
# Bespreek kort:
#* Nocturnine
#* uORFs (valt weg, want bij vraag twee zitten ook al uORFs)
#* shRNA
#* nuclear localisation signal

===29 januari 2009===
MDL:
# purinebiosynthese en regulatie
# kaartjes:
#* Adaptor
#* Cascades, waarom?

JR:
# Controlemechanismen mRNA in eukaryoten
# kaartjes:
#* histonmethyltransferase
#* RITS

===29 januari 2009===
MDL: Calcium
JR: N end rule

===20 januari 2009===
Deley:
# Afbraak van vetzuren
# Kaartjes:
#* GPCR
#* werking van groeifactoren
Robben: manieren van doorgeven van expressie patronen bij celdeling. Waarom deze regeling? (epigenetic inheritance)

Nog Kaartjes:
# calnexine/calreticuline cycle
# Argonaut
# SH2 en SH3
# stimulatie van proteïnesynthese door hemine
# Ubiquitine als sorteringssignaal
# Thio-etherankers en thio-esterankers
# shRNA
# riboswitch
# RITS
# ARE (AU-rich element)
# transition state analog (daar moest hij n-PALA hebben)
# cascade, waarom?

===31 januari 2008===
MDL:
# Bespreek purineafbraak + storingen
# kaartjes: GPCR en de tabel heel in't begin van 't eerste hoofdstuk met E.Coli, S. Cerevisiae, ...

JRB:
# Bespreek lysosomale afbraak
# kaartjes: mRNA localizatie en non-sense mediated decay

===31 januari 2008===
MDL:
# Bespreek de vorming van deoxyribonucleotiden + regulatie
# kaartjes: oncogenen en amidelinked ankers

JRB:
# Bespreek methylering van histonen en DNA en hoe deze expressie kunnen reguleren
# kaartjes: eIF4E-bindend proteine en sRNA switch

===30 januari 2008===
# MDL: Pyrimidinebiosynthese
# JRB: Welke rol speelt poly(A) bij de vorming van proteinen (of zoiets)

===16 januari 2008===

MDL:
# Heem oxygenase systeem
# Kaartjes:
#* Amide linked myristoyl anchors
#* Calcium oscillaties

JR:

# Bespreek de globale mechanismen van translatieregulatie.
# Kaartjes:
#* miRNA
#* Calnexin-Calreticulin cycling

===16 januari 2008===
Hoofdvragen:
# op welke wijzen knockdown door RNA interferentie experimenteel kan gebruikt worden?
# Deoxyribunucleotide synthese en regulatie

Korte vragen:
# lambda repressor
# mRNA turnover
# cascades
# proteïnesynthese en hemine

Model Organisms in Biological Research

2022-01-25T11:00:00Z

R0737746: /* Examenvragen */

[[Categorie: Mabb]]

== Vakinformatie ==
Model Organisms in biological research

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0G43AE.htm

== Examenvragen ==
'''2022 Voorbeeld examen'''

Self chosen article (4/20):

- Question A1. Give two (2) arguments why this organism is / these organisms are suited to
tackle the specific research question at hand.

- Question A2. Give two (2) arguments why it is a model organism / they are model
organisms; as opposed to model systems, as per the distinction made in the course.

- Question A3. Could any other model organism discussed during the course have been used
to address the research question? Why (not)? Do you agree with the authors’ choice? Why
(not)?

- Question A4. Given the findings and conclusions of the article, propose one additional
method or approach that was covered in the course, that may be of use for this research.
Explain in sufficient conceptual detail why this would be useful or logical, and which insight
would be gained from using this tool/method/approach.

THEORY - LECTURE-ONLY PART (9/20):
Motor neuron injury can lead to loss of motor function (movement/locomotion) with poor recovery due to limited regeneration. The NICD protein is well conserved in animals and while it is upregulated after axonal injury, it is a negative regulator of axonal regeneration. You are tasked to find genes that through their effect on NICD levels may affect axonal regeneration, specifically so in the case of motor neuron injury.

Explain how you would proceed to complete this task, making sure your answer contains clear arguments for considering the following elements:

- Do you need live organisms to address this question? Do they need to be model organisms? Why (not)?

- Which organism(s) discussed during the course would be suited to tackle this question? Would you use one or multiple ones?

- How will you retrieve information that will allow you to correlate genetic interventions, NICD levels, axonal regeneration and motor function recovery? How will you probe for causality of interventions?

- Next to proposing a research approach, provide at least one limitation that would need to be considered as well.

'''2021 August'''

Self chosen article:

- Why is this organism chosen for this research question

- Why is this organism chosen instead of another model organism

- Do you agree with the choice of the author

- Knowing the results, what technique or method would you add to this research

- Give 2 arguments why this organism is a model organisms.

Theoretical Question:

What is QTL mapping? What is it used for? Which model organisms did we discuss QTL mapping strategies for and would it be suitable for other model organisms discussed in the course?

'''2021 January'''

Self chosen article:

- Why is this organism chosen for this research question

- Why is this organism chosen instead of another model organism

- Do you agree with the choice of the author

- Knowing the results, what technique or method would you add to this research

- Give 2 arguments why this organism is a model organisms.

Theoretical question:

- Explain terminator seeds

- After doing a forward screening in C. elegans, they found mutants with altered body length. Explain the strategy how you can know the causal mutations. Can you perform this stragety in other organisms and which step is important for causality?

- Explain morpholinos and compare with other similar technique.

'''2020 January'''

What is a polytene chromosome and how is it used for genetics? (Extra questions: Why was it easier to have this to study genetics, answer because it is much bigger thanks to endoduplication which means that you can see it under a microscope. If you would have found a piece of the chromosome and you can sequence it, how can you find where it is located on the polytene chromosome, answer was in situ hybridisation [You can't answer CRISPR or something like that because it didn't exist back then].)

ES technology, any alternatives?

Give three tetrads

- explain the Tet system

- explain tetrad analysis

- explain transformation in Arabidopsis thaliana.

- Explain P elements

- QTL mapping

'''2019 January'''

ES technology mice

QTL mapping

Optogenetics

give examples of prokaryotes in biological research and explain their use

what are terminator seeds, what is their use and given an example of how they work

'''2017-2018 January'''

Wich primates are used as model organism and for which applications?

Explain Tetrad analysis and the application.

Explain Pronucleus injection in mice and the application.

Explain foward genetics in ''C. elegans''.

Explain Cre recombinase system and how to use it giving examples

Model Organisms in Biological Research

2022-01-25T10:58:25Z

R0737746: /* Examenvragen */

[[Categorie: Mabb]]

== Vakinformatie ==
Model Organisms in biological research

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0G43AE.htm

== Examenvragen ==
'''2022 Voorbeeld examen'''

Self chosen article (4/20):

- Question A1. Give two (2) arguments why this organism is / these organisms are suited to
tackle the specific research question at hand.

- Question A2. Give two (2) arguments why it is a model organism / they are model
organisms; as opposed to model systems, as per the distinction made in the course.

- Question A3. Could any other model organism discussed during the course have been used
to address the research question? Why (not)? Do you agree with the authors’ choice? Why
(not)?

- Question A4. Given the findings and conclusions of the article, propose one additional
method or approach that was covered in the course, that may be of use for this research.
Explain in sufficient conceptual detail why this would be useful or logical, and which insight
would be gained from using this tool/method/approach.

THEORY - LECTURE-ONLY PART (9/20):
Motor neuron injury can lead to loss of motor function (movement/locomotion) with poor recovery due to limited regeneration. The NICD protein is well conserved in animals and while it is upregulated after axonal injury, it is a negative regulator of axonal regeneration. You are tasked to find genes that through their effect on NICD levels may affect axonal regeneration, specifically so in the case of motor neuron injury.

Explain how you would proceed to complete this task, making sure your answer contains clear arguments for considering the following elements:
- Do you need live organisms to address this question? Do they need to be model organisms? Why (not)?
- Which organism(s) discussed during the course would be suited to tackle this question? Would you use one or multiple ones?
- How will you retrieve information that will allow you to correlate genetic interventions, NICD levels, axonal regeneration and motor function recovery? How will you probe for causality of interventions?
- Next to proposing a research approach, provide at least one limitation that would need to be considered as well.

'''2021 August'''

Self chosen article:

- Why is this organism chosen for this research question

- Why is this organism chosen instead of another model organism

- Do you agree with the choice of the author

- Knowing the results, what technique or method would you add to this research

- Give 2 arguments why this organism is a model organisms.

Theoretical Question:

What is QTL mapping? What is it used for? Which model organisms did we discuss QTL mapping strategies for and would it be suitable for other model organisms discussed in the course?

'''2021 January'''

Self chosen article:

- Why is this organism chosen for this research question

- Why is this organism chosen instead of another model organism

- Do you agree with the choice of the author

- Knowing the results, what technique or method would you add to this research

- Give 2 arguments why this organism is a model organisms.

Theoretical question:

- Explain terminator seeds

- After doing a forward screening in C. elegans, they found mutants with altered body length. Explain the strategy how you can know the causal mutations. Can you perform this stragety in other organisms and which step is important for causality?

- Explain morpholinos and compare with other similar technique.

'''2020 January'''

What is a polytene chromosome and how is it used for genetics? (Extra questions: Why was it easier to have this to study genetics, answer because it is much bigger thanks to endoduplication which means that you can see it under a microscope. If you would have found a piece of the chromosome and you can sequence it, how can you find where it is located on the polytene chromosome, answer was in situ hybridisation [You can't answer CRISPR or something like that because it didn't exist back then].)

ES technology, any alternatives?

Give three tetrads

- explain the Tet system

- explain tetrad analysis

- explain transformation in Arabidopsis thaliana.

- Explain P elements

- QTL mapping

'''2019 January'''

ES technology mice

QTL mapping

Optogenetics

give examples of prokaryotes in biological research and explain their use

what are terminator seeds, what is their use and given an example of how they work

'''2017-2018 January'''

Wich primates are used as model organism and for which applications?

Explain Tetrad analysis and the application.

Explain Pronucleus injection in mice and the application.

Explain foward genetics in ''C. elegans''.

Explain Cre recombinase system and how to use it giving examples

Model Organisms in Biological Research

2022-01-25T10:57:54Z

R0737746: /* Examenvragen */

[[Categorie: Mabb]]

== Vakinformatie ==
Model Organisms in biological research

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0G43AE.htm

== Examenvragen ==
'''2022 Voorbeeld examen'''

Self chosen article (4/20):

- Question A1. Give two (2) arguments why this organism is / these organisms are suited to
tackle the specific research question at hand.

- Question A2. Give two (2) arguments why it is a model organism / they are model
organisms; as opposed to model systems, as per the distinction made in the course.

- Question A3. Could any other model organism discussed during the course have been used
to address the research question? Why (not)? Do you agree with the authors’ choice? Why
(not)?

- Question A4. Given the findings and conclusions of the article, propose one additional
method or approach that was covered in the course, that may be of use for this research.
Explain in sufficient conceptual detail why this would be useful or logical, and which insight
would be gained from using this tool/method/approach.

THEORY - LECTURE-ONLY PART (9/20):
Motor neuron injury can lead to loss of motor function (movement/locomotion) with poor recovery due to limited regeneration. The NICD protein is well conserved in animals and while it is upregulated after axonal injury, it is a negative regulator of axonal regeneration. You are tasked to find genes that through their effect on NICD levels may affect axonal regeneration, specifically so in the case of motor neuron injury.

Explain how you would proceed to complete this task, making sure your answer contains clear arguments for considering the following elements:
- Do you need live organisms to address this question? Do they need to be model organisms? Why (not)?
- Which organism(s) discussed during the course would be suited to tackle this question? Would you use one or multiple ones?
- How will you retrieve information that will allow you to correlate genetic interventions, NICD levels, axonal regeneration and motor function recovery? How will you probe for causality of interventions?
- Next to proposing a research approach, provide at least one limitation that would need to be considered as well.

'''2021 August'''

Self chosen article:

- Why is this organism chosen for this research question

- Why is this organism chosen instead of another model organism

- Do you agree with the choice of the author

- Knowing the results, what technique or method would you add to this research

- Give 2 arguments why this organism is a model organisms.

Theoretical Question:

What is QTL mapping? What is it used for? Which model organisms did we discuss QTL mapping strategies for and would it be suitable for other model organisms discussed in the course?

'''2021 January'''

Self chosen article:

- Why is this organism chosen for this research question

- Why is this organism chosen instead of another model organism

- Do you agree with the choice of the author

- Knowing the results, what technique or method would you add to this research

- Give 2 arguments why this organism is a model organisms.

Theoretical question:

- Explain terminator seeds

- After doing a forward screening in C. elegans, they found mutants with altered body length. Explain the strategy how you can know the causal mutations. Can you perform this stragety in other organisms and which step is important for causality?

- Explain morpholinos and compare with other similar technique.

'''2020 January'''

What is a polytene chromosome and how is it used for genetics? (Extra questions: Why was it easier to have this to study genetics, answer because it is much bigger thanks to endoduplication which means that you can see it under a microscope. If you would have found a piece of the chromosome and you can sequence it, how can you find where it is located on the polytene chromosome, answer was in situ hybridisation [You can't answer CRISPR or something like that because it didn't exist back then].)

ES technology, any alternatives?

Give three tetrads

- explain the Tet system

- explain tetrad analysis

- explain transformation in Arabidopsis thaliana.

- Explain P elements

- QTL mapping

'''2019 January'''

ES technology mice

QTL mapping

Optogenetics

give examples of prokaryotes in biological research and explain their use

what are terminator seeds, what is their use and given an example of how they work

'''2017-2018 January'''

Wich primates are used as model organism and for which applications?

Explain Tetrad analysis and the application.

Explain Pronucleus injection in mice and the application.

Explain foward genetics in ''C. elegans''.

Explain Cre recombinase system and how to use it giving examples

Laboratory Animal Sciences

2021-11-19T09:39:36Z

R0737746: /* Examenvragen */

[[Categorie: Mabb]]
== Vakinformatie ==

Keuzevak, gedoceerd door Prof. Erna Dewil, dat vaak gevolgd wordt door master biochemie en mensen die met een doctoraat bezig zijn (alsook biologie, farmacie, BMW, bio-ingenieurs studenten).
Door voor dit vak te slagen, krijg je een certificaat (=FELASA B) waardoor je experimenten mag uitvoeren op proefdieren. Schriftelijk voorbereiden, examen zelf was mondeling (dit was vroeger zo, dat zie je aan de oudere examenvragen). Nu is het examen volledig schriftelijk. De vragen staan in Nederlands en Engels geschreven. Er wordt verwacht dat de antwoorden in het Engels geformuleerd worden.

Het examen vindt plaats in een grote aula en sinds het schriftelijk wordt afgenomen, zijn er per examenmoment twee verschillende examenversies. Elke even rij krijgt dezelfde vragen en elke oneven rij krijgt dezelfde vragenreeks.

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/E05E6AE.htm

== Examenvragen ==

===19 november 2021 ===
#Define:
#*Harderian gland
#*IVC
#*Humane endpoints
#*Animal Welfare Body
# Gasanasthesia
# Environmental factors influencing welfare, explain 2 in detail.
# Which formalities have to be in order to perform animal experiments?
# How is health screening done and why is it important?

===25 oktober 2021 ===
#Define:
#*Whitten effect
#*Isolator
#*Oribital puncture
#*Animal Welfare Body
# Gasanasthesia
# Environmental factors influencing welfare, explain 2 in detail.
# What is post operative care and why is it important
# Congene stam

===22 januari 2021 ===
#Define:
#*Whitten effect
#*Zoocentrism
#*Co-isogenic strain
#*Zoonosis + give an example
# Describe natural feed.
# Explain local anaesthesia.
# What are the possible sources of infection in the animal facility? How can these be prevented?.
# What are the the 3 R's? Give 1 example of each one.

===30 Januari 2020 NM versie B===
#Define:
#*Lee-Boot effect
#*Severity assessment
#*Isolator
#*Zoonosis
#What are the effects of stress on the behaviour of a laboratory animal?
#Explain in detail: Consomic strain
#What are the possible sources of infection? How can we avoid them?
#Explain the 2 types of Analgesia. What are their possible side effects?

===30 Januari 2020 NM versie A===
#define:
#*bruce effect
#*gavage
#*reverse? orbital punction
#*Harderian gland
#Explain local anaesthesia
#Give 3 factors that can influence the severity score
#What is environmental enrichment and why is it important?
#Explain everything about natural feed

===24 januari 2020 (NM, versie B)===
#Define:
#*Whitten effect
#*Animal welfare body
#*Humane endpoints
#*IVC
#Gasanaesthesia
#How is healthmonitoring done and why is this important?
#List all environmental factors that influence an animal's wellbeing and explain 2 in detail.
#Which formalities need to be in order before cunducting animal experiments?

=== 24 januari 2020 (NM, versie "") ===
#What are the factors which determine the needed nutrients in animal food?
#How can you check if an animal is under enough anaesthesia for a chirurgic procedure?
#Given: code for a kind of stem. Explain this type.
#Why are ventilation and odor important for the housing of lab animals?
#What can decrease blood loss during a chirurgic procedure? How can you provide good post-operative care for a lab animal?

=== 25 januari 2019 (NM) ===
Schriftelijk
Leg uit:
#*Harderian gland
#*Orbitapuncture
#*Bruce effect
#*Gavage
#Leg uit in detail: F1-hybride
#Leg uit in detail lokale anesthesie
#Leg uit in detail: Natuurlijk voeder
#Wat zijn mogelijke vormen van kooiverrijking, leg ze elk kort uit

=== 25 januari 2019 ===
Begrippen:
#*isolator
#*3 R’s
#*zoonose
#*lee-boot effect

Grote vragen
#Consomic strain
#Geef alle mogelijke analgesia en bespreek hun neveneffecten
#Welke infectie oorzaken zijn er? Hoe kan je deze vermijden?
#Effect van stress op behaviour

=== 31 januari 2018 versie A ===
Schriftelijk
#Welke factoren bepalen de nutriënten behoeften van proefdieren?
#Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?
#Welke invloed heeft licht en geluid op het welzijn van de proefdieren?
#Leg uit: premedicatie en sedatie
#Hoe kan bloedverlies bij chirurgische ingrepen vermeden worden? Wat zijn de belangrijkste postoperatieve zorgen?

===31 januari 2018 versie B===
Schriftelijk
#Leg uit:
#*Whitten effect
#*3 R's
#*isolator
#*Zoonose
#Welke effecten kan stress hebben op gedrag?
#Leg uit (in detail): F1 hybride
#Hoe kan een ziekte ontstaan in een animal facility en hoe kun je dit voorkomen?
#Wat zijn mogelijke vormen van analgie, en wat zijn de bijwerkingen?

===16 januari 2018===
Schriftelijk
#Leg uit:
#*Harderian gland
#*Orbitapuncture
#*Bruce effect
#*Gavage
#Leg uit in detail: congene stam
#Uitleggen lokale anesthesie
#Uitleggen natuurlijk voeder
#Wat zijn mogelijke vormen van kooiverrijking, leg kort uit.

=== 1 februari 2017 (versie A)===
#Welke factoren bepalen de nutriënten behoeften van proefdieren?
#Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?
#Welke invloed heeft licht en geluid op het welzijn van de proefdieren?
#Leg uit: premedicatie en sedatie en geef een voorbeeld
#Hoe kan bloedverlies bij chirurgische ingrepen vermeden worden? Wat zijn de belangrijkste postoperatieve zorgen?

===1 februari 2017 (versie B)===
#Leg uit:
#*Whitten effect
#*3 R's
#*isolator
#*Zoonose
#Welke effecten kan stress hebben op gedrag?
#Leg uit (in detail): Congene stam
#Hoe kan een ziekte ontstaan in een animal facility en hoe kun je dit voorkomen?
#Wat zijn mogelijke vormen van analgie, en wat zijn de bijwerkingen?

===17 januari 2017===
#Leg uit:
#*Harderian gland
#*Orbitapuncture
#*Bruce effect
#*?
#Leg uit F1 hybriden in muizen
#Uitleggen Lokale anesthesie
#Uitleggen natuurlijk voeder
#Wat zijn mogelijke vormen van kooiverrijking, hoe toepassen?

===13 januari 2016===
#Leg uit:
#*whittin effect
#*co isogene stam
#*isolator
#*zoonose en voorbeeld
#bespreek gasanesthesie
#welke infexties kunnen optreden en hoe voorkomen?
#effect van stress op gedrag
#de 3R's en telkens 1 voorbeeld

===12 januari 2016===
#Geef definitie proefdier en dierproef
#Hoe controleer je de gezondheidstoestand van een dier? Waarom is dit belangrijk?
#Leg uit: congene stam => Bijvraag: hoe geef je de naam hiervan weer (schrijfwijze)
#Waarom zijn correcte temperatuur en vochtigheid belangrijk voor proefdieren?
#Wat is kooiverrijking en waarom doet men dit?
#Extra bijvraag: Geef de 3 R's.

=== 22 jan 2015 (nm)===
# Leg uit
#* Bruce effect
#* Gavage
#* IVC
# Wat zijn de eigenschappen van hypnotische stoffen? (bijvraag: waarom zou je urethaan gebruiken in plaats van thiopental/pentobarbital?)
# Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?
# Welke omgevingsfactoren spelen een rol voor het welzijn van proefdieren? Bespreek er 2 in detail.
# Hoe doet men een gezondheidsscreening? Waarom is dit belangrijk?

=== 14 jan 2015 (nm)===
# Definitie proefdier, definitie dierproef
# Wat is het belang van gezondheidsscreenings? Wat is het belang van quarantaine? Hoe wordt dit in de praktijk uitgevoerd? Wat zijn de opties/mogelijkheden bij een besmetting?
# Bespreek outbred stam.
# Wat is het belang van geur en ventilatie bij het huishouden van proefdieren? Wat kunnen de gevolgen zijn als er iets misgaat?
# Bespreek alpha-adrenergic agonists.

=== 13 jan 2014 (vm) ===
# Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?
# Welke invloed heeft licht en geluid op het welzijn van de proefdieren?
# Wat is het belang en risico van bloedverlies bij chirurgische ingrepen en hoe kan dit vermeden worden?
# Welke factoren bepalen de nutriÃ«ntenbehoeften behoefte van proefdieren?
# Bespreek: hypnotische stoffen
# Bijvraag 1: Stel je proefdier wilt een bepaalde stof niet innemen omdat het een slechte smaak heeft, wat kan je hieraan doen?
# Bijvraag 2: Wat is zoocentrisme?

=== 17 jan 2013 (nm) ===
==== reeks 1====

# Bespreek inteeltstam
# Hoe infecties in de dierenfaciliteit vermijden?
# Hoe preventief allergieen vermijden?
# Wat is enrichment?
# Geef voorbeelden en stress bij een dier.

Nog meer vragen te vinden in dit bestand: [[Media:Extra_vragen_proefdierkunde.pdf]]

==== reeks 2 ====

# Leg uit:
#*IVC
#*chimeer
#*zoocentrisme
#*...
#Bespreek de eigenschappen van hypnotische stoffen
#Welke formaliteiten moeten in orde zijn alvorens dierproeven te mogen aanvatten?
#Welke omgevingsfactoren spelen een rol voor het welzijn van proefdieren? Bespreek er 2 in detail.
#Hoe doet men gezondheidsscreening? Waarom is dit belangrijk?
#Bijvraag: Bespreek housing van zebravis.

==== reeks 3 ====

#Leg uit:
#*Bruce effect
#*Isolator
#*Isogene stam
#*Antropocentrisme
#Stress kan bij proefdieren zorgen voor een verandering in gedrag. Leg uit.
#Leg uit: Lokale anaesthesie
#Leg uit: A2-Faciliteit
#Welke maatregelen moeten er getroffen worden om allergieën tegen te gaan.

=== 17 jan 2012 (vm) ===

# Geef de definitie van een "proefdier" en een "dierproef"
# Wat is het belang van gezondheidsscreeningen en quarantaine?
# Bespreek: congene stam
# Wat zijn de invloeden van temperatuur en vochtigheid op een proefdier?
# Wat is kooiverrijking en welke vormen zijn er?

=== 18 jan 2011 ===

# leg uit:
#* Co-isogenic strain
#* Whitten effect
#* Isolator
#* zoÃ¶nose
# Welke producten kunnen allemaal gebruikt worden voor volledige Anaesthesie. Bespreek kort. (Bijvraag: Hoe kan je weten hoe diep het dier in de verdoving is gebracht?)
# Wat is de invloed van stress op laboratorium dieren? (Bijvraag: Hoe kan je abnormaal gedrag onderscheiden van normaal gedrag?)
# Hoe kan een infectie in een proefdierverblijf binnen gebracht worden? Wat kan je doen om dit te voorkomen?
# Geef de 3 R's en geef per R twee voorbeelden.

=== 19 jan 2010 ===

# leg uit:
#* de 3R's
#* Whitten effect
#* gaveren
#* zoÃ¶nose
# bespreek lokale anaesthesie
# bespreek F1 hybride
# Waarom zijn temperatuur en relatieve vochtigheid belangrijk in huisvesting?
# de mogelijke contaminanten van natuurlijke voeders.

=== 12 jan 2010 ===

# Factoren die nutriÃ«ntenbehoeften bepalen?
# Verschillende producten voor anesthesie en hun werking?
# Invloed van licht en geluid op proefdieren?
# Welke formaliteiten moeten in orde zijn voor een experiment van start kan gaan?
# Belang van bloedverlies tegengaan bij chirurgische ingrepen en methodes?
# Bijvraag: 3 R's

Algemene Ziekteleer

2021-06-11T09:28:16Z

R0737746: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
==Vakinformatie==
Pieter Gillard doceert het vak Algemene Ziekteleer. Biochemie optie verbreding volgt dit op gasthuisberg samen met farmacie. Het examen is schriftelijk.

==Examenvragen==
===10 juni 2021===
# Leg de pathofysiologie uit van koorts en hyperthermie en geef enkele belangrijke oorzaken van beiden.
# Bespreek de pH, pCO2 en HCO3- bij respiratoire alkalose en respiratoire acidose en geef voor beiden enkele oorzaken.
# Geef het verband tussen kanker en:
#* Inflammatie
#* Hypercalcemie
#* Koorts
#* Pijn
#* Immuuntherapie
# Meerkeuze vragen
## Hartfalen (hartdecompensatie) heeft te maken met...(giscorrectie, meerdere aanduiden)
##* Te kort aan aldosterone
##* Te kort aan cortisol
##* Na retentie
##* RAAS systeem
##* Iets met sympatisch zenuwstelsel
## Hyperkalemie, wat past niet in het rijtje (1 aanduiden, geen giscorrectie)
##* Insuline tekort
##* ACE inhibitoren
##* Lisdiuretica
##* Acidose
##* Nierinsufficiëntie

===11 juni 2020===
# Bespreek het verband tussen inflammatie en obesitas en inflammatie en atherosclerose.
# Bespreek de pathogenese en de oorzaken van oedemen.
# Geneesmiddelen kunnen soms pathologieën veroorzaken, bespreek hoe dit het geval is bij volgende pathologieën:
#* hypokalemie
#* neuropathische pijn
#* inflammatie
#* hyponatremie
#* hyperthermie
#Meerkeuze vragen:
## Welke ziektes zijn overgevoeligheidsreacties? (giscorrectie, meerdere aanduiden)
##* Reumatoïde arthritis
##* lupus
##* mucovisidose
##* ziekte van Graves (hyperthyreoïdie)
##* diabetes type 2
## Wat is geen oorzaak van hypernatremie? (1 aanduiden, geen giscorrectie)
##* Toedienen van hypertone vloeistoffen
##* Ziekte van Adisson
##* osmotische diurese
##* diabetes insipidus
##* te lage vochtinname

=== 12 juni 2019 ===
# Bespreek chemokines, histamine en het inflammasoom in context van de ontstekingsreactie.
# Wat is de pathogenese en de oorzaak van hyperkalemie.
# Bespreek endotheelschade en endotheel dysfuntie bij:
#* obesitas
#* type 3 overgevoeligheidsreacties
#* transpant rejectie
#* oedeem
# Meerkeuze vragen (meerdere antwoorden kunnen juist zijn)
## Over de zelfstudieles (depressie)
## Wat hoort er bij oedeemvorming bij leverschade

=== 13 juni 2018 ===
# Bespreek de stressrespons en het verband met hyperglycemie, metabool syndroom en hart- en vaatziekten
# Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypokalemie.
# Bespreek het verband tussen inflammatie en:
#* koorts
#* overgevoeligheidsreactie type 2
#* atherosclerose
#* kanker
#* pijnfacilitatie
# Meerkeuze
## Volgende zaken hebben te maken met oedeem behalve:
##* hartdecompensatie
##* veneuze insufficiëntie
##* nierfalen
##* levercirrose
##* neuroleptica
## Volgende zaken hebben te maken met migraine behalve:
##* activatie hypothalamus en limbisch systeem
##* inhibitie n. trigemius
##* centrale sensitisatie
##* CSD
##* CGRP

=== 22 augustus VM 2017 ===
# Bespreek de stressreactie en breng de pathenogenese in verband mer hyperglycemie, hartdecompensatie en maagulcer
# Definieer dehydratatie en bespreek de pathenogenese.
# In levensbedreigende situaties reageert het lichaam soms heel extreem op enkele situaties (visieuze cirkel). Bespreek dit kort in verband met:
#*Hartdecompensatie
#*Ketoacidose
#*SIRS
#*Anafylactische shock
#*Hitteslag
# 3 ptn Meerkeuze:
#* Volgende zaken maken komen voor bij magaline neuroleptische syndroom BEHALVE:
## Dehydratatie
## Hyperthermie
## Spierrigiditeit
## Oedeem
## Dopamineantagonisten
#* Volgende inhibitoren zijn voorhanden bij de virale cyclus van HIV BEHALVE:
## Glucoinhibitoren
## ...

=== 14 juni VM 2017 ===
#6pt Wat is het verband met kanker en inflammatie, kanker en obesitas inflammatie en obesitas.
#6pt Hoe ontstaat koorts, geef enkele voorbeelden en moet koorts behandeld worden?
#5pt De nieren zijn belangrijk bij verschillende pathologieën. Geef het verband met de nieren en acidose, dehydratatie, hypocalcemie, oedeem en hyperkalemie.
#3pt Meerkeuze:
#* Wat is niet belangrijk bij auto-immuunziekten?
## ...
#* Volgende zaken helpen mee bij de pijnsensatie behalve:
## beta A vezels (= antwoord)
## nocebo
## iets van neuronen
## inflammatie

===Vragen afkomstig van Farmacie:===
Examenvragen (prof. Gillard)

Open vragen

#Leg uit wat dehydratie is met de bijbehorende pathologieën.
#Leg het verband uit tussen de stress reactie met maagulcus, hyperglycemie en hartischemie.
#Bespreek de extreme reactie die optreed of de vicieuze cirkel die plaatsvindt bij anafylactische shock, SIRS, hyperthermie en hartdecompensatie.
#Wat is verouderen, welk effect heeft dit op de lichaamsfuncties en hoe is dit verbonden aan frailty.
#Metabole acidose high anion gap, leg de pathogenese en oorzaken uit.
#Geneesmiddelen kunnen de oorzaak zijn van pathologische toestanden maar kunnen ook gebruikt worden om ze te bestrijden. Geef voor ieder onderdeel een geneesmiddelengroep die hierop inwerkt.
#Hyperthermie
#Hypokaliëmie
#Migraine
#Hyponatremie
#Inflammatie
#Bespreek type I en type III overgevoeligheidsreacties.
#Bespreek 3 recessieve overerfbare aandoeningen.
#Bespreek pathologie ivm PTH.
#Bespreek migraine.
#Bespreek klaring en negatieve vrij water klaring en geef klinische voorbeelden bij stoornissen.
#Bespreek de gevolgen van hypokalemie die een invloed kan hebben op homeostasemechanismen.
#Bespreek ontstaan en behandeling van koorts.
#Wat gebeurt er met alle homeostasemechanismen bij acute nierinsufficiëntie?
#Hoe ontstaat aneuploïdie.
#Bespreek de acute ontstekingsreactie en hoe kunnen farmaca de reactie blokkeren?
#Bespreek congenitale bijnierschorshyperplasie.
#Wat weet u over de behandeling en kenmerken van dominantie overerving?
#Bespreek RIA en Rlogieën die gepaard gaan met chronische nierinsufficiëntie.
#Wat zijn de nadelige gevolgen van een stressreactie.
#Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypocalcemie.
#Bespreek oedeem in de context van leverpathologie.
#Geef de mogelijke oorzaken van polyurie.
#Welke homeostase mechanismen kunnen ontregeld geraken door een ontregelde diabetes mellitus en hoe?
#Bespreek de acute fase reactie.
#Bespreek hoofdpijn.
#Wat weet u over auto-immuniteit?
#Bespreek respiratoire alkalose.
#Vitamine D aandoeningen. Leg uit.
#Congenitale bijnierschorshyperplasie. Leg uit.
#Bespreek de behandeling van hypothermie.
#Bespreek de rol van glucocorticoïden bij de stressreactie.
#Hitteslag:
##wat is de functie van de acute fase eiwitten?
##wat doen heat shock proteïnen, wat zijn dat?
##Verhoogde vaatpermeabiliteit, welke gevolgen?
#Wat is het verband tussen de temperatuur en coagulatie vs fibrinolyse?
#Bespreek hyperosmolaire dehydratie.
#Wat weet je over maligne hyperthermie?
#Hoe ontstaat leukocytose en wat is de basis van een verhoogde sedimentatiesnelheid van RBC.
#Bespreek metabole alkalose.
#Bespreek het verband tussen ziekte, veroudering en dood.
#Bespreek de neurofysiologische basis van de pijnsensatie.
#Bespreek het ontstaan en de gevolgen van hyperkaliëmie.
#Bespreek tertiaire hyperparathyroïdie.
#Wat is ouderdom, verandering van ouderdom, evolutie van doodsoorzaken en levensverwachting.
#Geef 3 voorbeelden van aangeboren ongevoeligheid aan een of ander hormoon.
#Hoe bereken je de vrij-water klaring en geef 2 voorbeelden van wanneer deze verhoogd is.
#Leg RAST uit.
#Geef de klinische gevolgen van hypercalciëmie.
#Wat is de link tussen centraal zenuwstelsel en:
##Stressreactie
##Frailty (artikel)
##Metabole alkalose
##Koorts
##Pijnsensitisatie
#Bespreek de cellulaire fase van de acute ontstekingsreactie.
#Bespreek alle homeostasemechanismen die een invloed hebben op de neuromusculaire excitabiliteit.
#Geef de oorzaken van een gestegen plasma-calcium met een normaal of verlaagd PTH.
#Bespreek oedeem bij overvulling.
#Bespreek metabole acidose.
#Bespreek pathogenese en oorzaken van oedeem.
#Bespreek het verband tussen diabetes (type 1 of 2) en:
##dehydratatie
##auto-immuniteit
##kalium homeostase
##obesitas
##metabole acidose
#Meerkeuzevragen

#Wat vindt niet plaats tijdens een stress respons
##Aldosterone daling
##Stimulatie ADH secretie
##Catecholamine vrijzetting
##Stimulatie bijniercortex
…
#Wat is geen oorzaak van migraine?
##Centrale sensitisatie
##Activatie van trigemino
##Inflammatie
##Auto-immuun ziekte
…
#Welke is geen overgevoeligheidsziekte?
##Reumatoïde artritis
##Pernicieuze anemie
##Mucoviscidose
…
#Wat is geen factor in de oedeemvorming bij levercirrose/leverfalen
##hoog renine
##splanchnische hypotensie
##toename ECF
##laag albumine
##vasoconstrictie splanchnische vaten
#Wat is geen inhiberende factor voor de pijntransmissie
##niet-nociceptieve
##µ-agonisten
##NMDA-antagonisten
…
#Wat is niet betrokken bij maligne syndroom (hyperthermie, oedeem, deshydratatie D2 antagonist)