https://wiki.chemika.be/api.php?action=feedcontributions&feedformat=atom&user=R0857325 2026-07-28T08:21:44Z Gebruikersbijdragen MediaWiki 1.43.0 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Advanced_Inorganic_Chemistry&diff=4989 2026-01-26T16:08:09Z

<p>R0857325: </p> <hr /> <div>[[Categorie:Machemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Vanaf 2024-2025 is er geen cursus meer, maar 9 pdf's, waaronder enkele wetenschappelijke papers. Het examen is open boek, waarbij ook elektronische toestellen gebruikt mogen worden.<br /> <br /> Starting from 2025-2026 the exam is still open book but no electronic devices are allowed.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> [[Categorie:Machemie]]<br /> <br /> ===26 January 2026===<br /> The exam is open book. There are 10 questions.<br /> #Places of the elements in the periodic table are fixed, why is this and why were they not in the 19th century?<br /> #How can the activity of water in seawater be determined experimentally?<br /> #What are the advantages and disadvantages of using molarity, molality and mole fraction concentration scales in thermodynamic calculations?<br /> #What is the difference between empirical, semi-empirical. What are their advantages, disadvantages?<br /> #Why do hydrated metal ions with a high electric charge have a stronger tendency to undergo hydrolysis than metals ions with a low charge?<br /> #phase diagram of CO2 is shown similar to that of water at p 144 course text. <br /> #*a) Give the Gibbs phase rule for: the liquid part, the line OA (the line that separates liquid from vapor), and O (the triple point).<br /> #*b) Why does the line OA stop at A?<br /> #*c) How can you explain the sublimation of CO2 at atmospheric pressure with this phase diagram?<br /> #Given is the Pourbaix diagram Mg. <br /> #*a)How can you derive from this diagram that manganese metal cannot be electrodeposited from an aqueous MnSO4 solution? <br /> #*b)Why is line 1 not flat as line 3 is? <br /> #*c)In a 0,1 M MgCl2 aqueous solution, is Mg2+ present? <br /> #*d)When the concentration is 10-6M, is it better to use activities explain why (not)?<br /> # Which are the three ion pairs that can form when a salt is dissolved in water, draw<br /> #Compare the T,x (temperature, composition) diagram of simple eutectic systems for binary system of two metals, solid and liquid for salts.<br /> #?<br /> <br /> <br /> ===27 January 2025===<br /> The exam is open book. You're allowed to use everything, including internet, as long as you don't communicate with each other. There are 10 questions.<br /> #Why is it necessary to use activities instead of concentrations when calculating chemical equilibria in concentrated electrolyte solutions?<br /> #How can the activities of metal ions be determined experimentally?<br /> #What are the advantages and disadvantages of using molarity, molality and mole fraction concentration scales in thermodynamic calculations?<br /> #Explain the observation that CoCl2 is insoluble in POCl3 solvent, but readily dissolves upon addition of liquid SbCl5 to the suspension?<br /> #Is group 3 of the periodic system composed of the elements Sc-Y-La-Ac odr Sc-Y-Lu-Lr? Give arguments in favor or against these two options.<br /> #Why do hydrated metal ions with a high electric charge have a stronger tendency to undergo hydrolysis than metals ions with a low charge?<br /> #Given is the phase diagram of the binary system copper-silver. Sketch a cooling curve from 1000°C to room temperature for (a) a mixture 40 wt% Ag + 60 wt% Cu, and (b) the eutectic mixture.<br /> #Given is the Pourbaix diagram of manganese. How can you derive from this diagram that manganese metal cannot be electrodeposited with a high current efficiency from an aqueous MnSO4 solution?<br /> #What concentration (in molality) of LaCl3 gives a solution with an ionic strength I of 1.0?<br /> #Given is the phase diagram of the binary system gallium-palladium. Which of the following compounds show a congruent melting point and which an incongruent melting point: PdGa5, Pd3Ga7, PdGa, Pd5Ga3, Pd2Ga? How can you derive this melting behavior from the phase diagram?<br /> <br /> === 29 januari 2024 ===<br /> The exam is open book. You're allowed to use everything, including internet, as long as you don't communicate with each other.<br /> #Write the element abundance equations and the corresponding vector-matrix form for a reaction involving the species NH3, O2, NO, NO2 and H2O. Assume that the initial state of the system consists of NH3 and O2 in the molar ratio 4:7. (Example 2.4 p 24 course text)<br /> #The enthalpy changes for the following three reactions, which represent the formation of dilute boric acid solution, the dissolution of crystalline boric oxide and the formation of liquid water respectively, are as follows: (see example 3.7 on p 64 of the course text, it is identical). Find the enthalpy of formation for B2O3 (boric acid) from its elements.<br /> #What elements belong to group III? Sc-Y-Lu-Lr or Sc-Y-La-Ac? Give arguments in favor or against for both options.<br /> #A phase diagram of CO2 is shown similar to that of water at p 144 course text. <br /> #*a) Give the Gibbs phase rule for: the liquid part, the line OA (the line that separates liquid from vapor), and O (the triple point).<br /> #*b) Why does the line OA stop at A?<br /> #The figure showing fractional crystallisation (Fig 6.30 p 172 course text) is shown. How can two components be seperated using Fractional crystallisation?<br /> <br /> === 30 januari 2023 ===<br /> #What is the mechanism of sensitized lanthanide luminescence? Use a scheme to illustrate this mechanism.<br /> #Xenon fluoride reactions<br /> #*a) Discuss the synthesis and reactivity of xenon fluorides. <br /> #*b) Why is it easier to prepare xenon compounds than argon compounds? <br /> #Octahedral crystal field<br /> #*a) How do p-orbitals and d-orbitals split in an octahedral crystal field?<br /> #*b) Determine the ligand field stabilization energy LFSE for the following octahedral metal complexes (a) d3 (b) high-spin d5 (c) high-spin d6 (d) low-spin d6 (e) d9<br /> #Describe the hysteresis loop of a ferromagnetic material.<br /> #How do polarizing power and polarizability of ions influence partial covalent bond formation of ionic compounds? What different stages can be observed between a purely ionic bond and a purely covalent bond?<br /> <br /> === 18 augustus 2022 ===<br /> #What is the mechanism of sensitized lanthanide luminescence? Use a scheme to illustrate this mechanism.<br /> #Xenon fluoride reactions<br /> #*a) Discuss the synthesis and reactivity of xenon fluorides. <br /> #*b) Why is it easier to prepare xenon compounds than argon compounds? <br /> #Determine the ligand field stabilization energy LFSE for the following octahedral metal complexes (a) d3 (b) high-spin d5 (c) high-spin d6 (d) low-spin d6 (e) d9<br /> #Give 5 examples that illustrate the anomalous chemical behavior of lithium compared to the other alkali metals. <br /> #What are the main later developments of the periodic system after Mendeleev’s contributions in 1869–1870?<br /> <br /> === 28 januari 2020 - VM===<br /> #Periodiek systeem<br /> #*a) Periodic trends in MV, density, IE en electronegativiteit <br /> #*b) Bespreek La vs Lu in IIIb<br /> #Lanthanide-contractie<br /> #*a)Trend in ion en atoomradius van lanthaniden<br /> #*b) Waarom 4d en 5d metalen gelijkaardige eigenschappen hebben<br /> #Solvents<br /> #*a) Manieren om non-aqueous solvent op te delen (protisch vs aprotisch - donor vs acceptor)<br /> #*b) wat zijn donor- en acceptor solvents?<br /> #*c) Hoe geeft men donorsterkte kwantitatief weer? <br /> #d-blok metalen<br /> #*a) Jahn Teller-effect<br /> #*b) Waarom d3 en d8 uitgesproken octahedrisch zijn<br /> #CT<br /> #*a) Wat zijn charge transfer bands?<br /> #*b) Vergelijk LMCT en MLCT<br /> #*c) welke d-metaal-complexen vertonen CT-bands?<br /> #*d) Hoe kan je CT-bands waarnemen?<br /> #*e) Welke lanthaniden vertonen CT en waarom?</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Advanced_Inorganic_Chemistry&diff=4988 2026-01-26T16:06:44Z

<p>R0857325: </p> <hr /> <div>[[Categorie:Machemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Vanaf 2024-2025 is er geen cursus meer, maar 9 pdf's, waaronder enkele wetenschappelijke papers. Het examen is open boek, waarbij ook elektronische toestellen gebruikt mogen worden.<br /> <br /> Starting from 2025-2026 the exam is still open book but no electronic devices are allowed.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> [[Categorie:Machemie]]<br /> <br /> ===26 January 2026===<br /> The exam is open book. There are 10 questions.<br /> #Places of the elements in the periodic table are fixed, why is this and why were they not in the 19th century?<br /> #How can the activity of water in seawater be determined experimentally?<br /> #What are the advantages and disadvantages of using molarity, molality and mole fraction concentration scales in thermodynamic calculations?<br /> #What is the difference between empirical, semi-empirical. What are their advantages, disadvantages?<br /> #Why do hydrated metal ions with a high electric charge have a stronger tendency to undergo hydrolysis than metals ions with a low charge?<br /> #phase diagram of CO2 is shown similar to that of water at p 144 course text. <br /> #*a) Give the Gibbs phase rule for: the liquid part, the line OA (the line that separates liquid from vapor), and O (the triple point).<br /> #*b) Why does the line OA stop at A?<br /> #Given is the Pourbaix diagram Mg. <br /> #*a)How can you derive from this diagram that manganese metal cannot be electrodeposited from an aqueous MnSO4 solution? <br /> #*b)Why is line 1 not flat as line 3 is? <br /> #*c)In a 0,1 M MgCl2 aqueous solution, is Mg2+ present? <br /> #*d)When the concentration is 10-6M, is it better to use activities explain why (not)?<br /> # Which are the three ion pairs that can form when a salt is dissolved in water, draw<br /> #Compare the T,x (temperature, composition) diagram of simple eutectic systems for binary system of two metals, solid and liquid for salts.<br /> #?<br /> <br /> <br /> ===27 January 2025===<br /> The exam is open book. You're allowed to use everything, including internet, as long as you don't communicate with each other. There are 10 questions.<br /> #Why is it necessary to use activities instead of concentrations when calculating chemical equilibria in concentrated electrolyte solutions?<br /> #How can the activities of metal ions be determined experimentally?<br /> #What are the advantages and disadvantages of using molarity, molality and mole fraction concentration scales in thermodynamic calculations?<br /> #Explain the observation that CoCl2 is insoluble in POCl3 solvent, but readily dissolves upon addition of liquid SbCl5 to the suspension?<br /> #Is group 3 of the periodic system composed of the elements Sc-Y-La-Ac odr Sc-Y-Lu-Lr? Give arguments in favor or against these two options.<br /> #Why do hydrated metal ions with a high electric charge have a stronger tendency to undergo hydrolysis than metals ions with a low charge?<br /> #Given is the phase diagram of the binary system copper-silver. Sketch a cooling curve from 1000°C to room temperature for (a) a mixture 40 wt% Ag + 60 wt% Cu, and (b) the eutectic mixture.<br /> #Given is the Pourbaix diagram of manganese. How can you derive from this diagram that manganese metal cannot be electrodeposited with a high current efficiency from an aqueous MnSO4 solution?<br /> #What concentration (in molality) of LaCl3 gives a solution with an ionic strength I of 1.0?<br /> #Given is the phase diagram of the binary system gallium-palladium. Which of the following compounds show a congruent melting point and which an incongruent melting point: PdGa5, Pd3Ga7, PdGa, Pd5Ga3, Pd2Ga? How can you derive this melting behavior from the phase diagram?<br /> <br /> === 29 januari 2024 ===<br /> The exam is open book. You're allowed to use everything, including internet, as long as you don't communicate with each other.<br /> #Write the element abundance equations and the corresponding vector-matrix form for a reaction involving the species NH3, O2, NO, NO2 and H2O. Assume that the initial state of the system consists of NH3 and O2 in the molar ratio 4:7. (Example 2.4 p 24 course text)<br /> #The enthalpy changes for the following three reactions, which represent the formation of dilute boric acid solution, the dissolution of crystalline boric oxide and the formation of liquid water respectively, are as follows: (see example 3.7 on p 64 of the course text, it is identical). Find the enthalpy of formation for B2O3 (boric acid) from its elements.<br /> #What elements belong to group III? Sc-Y-Lu-Lr or Sc-Y-La-Ac? Give arguments in favor or against for both options.<br /> #A phase diagram of CO2 is shown similar to that of water at p 144 course text. <br /> #*a) Give the Gibbs phase rule for: the liquid part, the line OA (the line that separates liquid from vapor), and O (the triple point).<br /> #*b) Why does the line OA stop at A?<br /> #The figure showing fractional crystallisation (Fig 6.30 p 172 course text) is shown. How can two components be seperated using Fractional crystallisation?<br /> <br /> === 30 januari 2023 ===<br /> #What is the mechanism of sensitized lanthanide luminescence? Use a scheme to illustrate this mechanism.<br /> #Xenon fluoride reactions<br /> #*a) Discuss the synthesis and reactivity of xenon fluorides. <br /> #*b) Why is it easier to prepare xenon compounds than argon compounds? <br /> #Octahedral crystal field<br /> #*a) How do p-orbitals and d-orbitals split in an octahedral crystal field?<br /> #*b) Determine the ligand field stabilization energy LFSE for the following octahedral metal complexes (a) d3 (b) high-spin d5 (c) high-spin d6 (d) low-spin d6 (e) d9<br /> #Describe the hysteresis loop of a ferromagnetic material.<br /> #How do polarizing power and polarizability of ions influence partial covalent bond formation of ionic compounds? What different stages can be observed between a purely ionic bond and a purely covalent bond?<br /> <br /> === 18 augustus 2022 ===<br /> #What is the mechanism of sensitized lanthanide luminescence? Use a scheme to illustrate this mechanism.<br /> #Xenon fluoride reactions<br /> #*a) Discuss the synthesis and reactivity of xenon fluorides. <br /> #*b) Why is it easier to prepare xenon compounds than argon compounds? <br /> #Determine the ligand field stabilization energy LFSE for the following octahedral metal complexes (a) d3 (b) high-spin d5 (c) high-spin d6 (d) low-spin d6 (e) d9<br /> #Give 5 examples that illustrate the anomalous chemical behavior of lithium compared to the other alkali metals. <br /> #What are the main later developments of the periodic system after Mendeleev’s contributions in 1869–1870?<br /> <br /> === 28 januari 2020 - VM===<br /> #Periodiek systeem<br /> #*a) Periodic trends in MV, density, IE en electronegativiteit <br /> #*b) Bespreek La vs Lu in IIIb<br /> #Lanthanide-contractie<br /> #*a)Trend in ion en atoomradius van lanthaniden<br /> #*b) Waarom 4d en 5d metalen gelijkaardige eigenschappen hebben<br /> #Solvents<br /> #*a) Manieren om non-aqueous solvent op te delen (protisch vs aprotisch - donor vs acceptor)<br /> #*b) wat zijn donor- en acceptor solvents?<br /> #*c) Hoe geeft men donorsterkte kwantitatief weer? <br /> #d-blok metalen<br /> #*a) Jahn Teller-effect<br /> #*b) Waarom d3 en d8 uitgesproken octahedrisch zijn<br /> #CT<br /> #*a) Wat zijn charge transfer bands?<br /> #*b) Vergelijk LMCT en MLCT<br /> #*c) welke d-metaal-complexen vertonen CT-bands?<br /> #*d) Hoe kan je CT-bands waarnemen?<br /> #*e) Welke lanthaniden vertonen CT en waarom?</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Bio-inorganic_Chemistry&diff=4927 2026-01-19T13:56:25Z

<p>R0857325: </p> <hr /> <div>[[Categorie: Machemie]]<br /> [[Categorie:Mabb]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Nieuw vak sinds 2013-2014. Het vak wordt gedoceerd door Prof. Tatjana Vogt en behandelt verschillende aspecten van de bioanorganische chemie, gaande van de functie van metalen in enzymen, mogelijke onderzoeksmethoden tot medicinale toepassingen. Lessen in het Engels, examen afleggen mag zowel in het Engels als het Nederlands. Het is een mondeling examen met schriftelijke voorbereiding: je moet dus je antwoord gaan vertellen/uitleggen, ze leest niet gewoon je blad. Taak staat op 8 van de 20 punten. Op het examen vraagt Vogt iets over de paper. <br /> 2024-... gedoceerd door Vogt en Azambuja, schriftelijk examen (elk op 6 punten).<br /> <br /> <br /> ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0Y55AE.htm<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===19 jan 2026===<br /> ====Deel Vogt====<br /> # (3p) Compare O2-binding of hemocyanin with hemerythin, what is the oxidation state before, after O2-binding?<br /> #* a. which technique(s) are used to study the O2-binding?<br /> # (3p) Cisplatin<br /> #* a. How is cisplatin activated in cell, what is the role of Cl- in this. Which adduct forms cisplatin, why does it cause cell death?<br /> #* b. Give 2 mechanisms that cause resistance to cisplatin<br /> <br /> ====Deel Azambuja====<br /> # (2p) Mr element given with stable OT: 1+, 2+, amount bound ligands 4-5, geometry: tetrahedral/square pyramidal/, pKa: 9,<br /> #* a. explain reactivity metal ion<br /> #* b. explain what metalloenzyme it can be identified as, give at least 2 reasons<br /> #* c. give reaction mechanism of the reaction the metalloenzyme wil catalyse<br /> # (2p) mimetic compound given with 2 Cu2+ centers, is it appropriate mimetic compound for PAP?<br /> # (0,8p) Advantages, disadvantages mimetic compounds<br /> #(0,6p) Methylmalonyl CoA mutase (exerciselist 2, exercise 2)<br /> === January 2026 ===<br /> Deel Vogt<br /> 1. Human Serum Albumin: Has a Zn2+ binding site. How did they find out where it binds? What techniques weere used?<br /> 2. Give examples of hydrolytic Enzymes where Zn plays a critical role.<br /> a) Why is Zn good for hydrolytic reactions?<br /> 3.Why is Gd3+ bound to a polydentate ligand when introduced in vivo? a) What properties does Gd3+ have?<br /> 4. Explain the antenna effect in complexes in optical imaging. Why do we measure in the IR region?<br /> <br /> ====Deel Azambuja====<br /> 1. There is this Mr element that found on a planet that behaves like a metal. Properties of metal given (pka, REDOX potential, ox states, geometry.)<br /> a) explain the reactivity<br /> b) explain what metalloenzyme type it can be identified as<br /> c) propose a reaction and the mechnaism of the metalloenzyme<br /> 2. Biomimetic compound given (similar to peptidase with CoIII center). Evaluate and discuss whether it is a good / appropriate mimic.<br /> 3. Explain the purpose of studying biomimetic compounds. What can you explore with them, applications, disadvantages, advantages. etc.<br /> 4. Why does thermolysin and carboxypeptidase A exhibit different cleavage selectivity despite both enzymes<br /> having Zn(II) in their catalytic site? Is there a difference in the mechanism of the hydrolysis reaction?<br /> <br /> ===10 jan 2025===<br /> ====Deel Vogt====<br /> # (4p) Siderophore (endobacteria, structuur gegeven)<br /> #* a. Teken waar het ijzeratoom in de structuur gebonden is<br /> #* b. Wat is het oxidatiegetal van ijzer (gebonden)<br /> #* c. Welke andere metalen kunnen in de plaats van ijzer binden?<br /> #* d. Wat is het nut van gebonden ijzer aan de structuur om een bacteriecel binnen te dringen?<br /> #* e. Op welke manier wordt ijzer vrijgezet van het siderophore in de cel?<br /> # (2p) Wat maakt 99mTc zeer geschikt voor single photon emission computed tomography (SPECT)? Hoe wordt dit isotoop in een klinische omgeving geproduceerd?<br /> <br /> ====Deel Azambuja====<br /> # (1p) Wat maakt Zn(II) ideaal in een hydrolysereactie?<br /> # (2p) Reactiemechanisme van urease uitwerken<br /> # (3p) Gegeven structuur (Excercise list 4, excercise 3, Coumaphos) - In the Leuven Chem&amp;Tech building there is a situation in need of attention. A room has several bottles of different pesticides, and the Health, Safety and Environment Department cannot safely deal with it. As the chemist in charge, you have been asked to provide options that would convert the compounds below to less harmful compounds. Based on what you have learned in Bioinorganic Chemistry:<br /> #* a. Propose different options of catalysts (enzymes or model systems) that could be used to convert the <br /> compounds into another product, providing the reasons for your suggestions, the reactions involved in the proposed system and as many details as you can about the reactive center (metals, (type of) ligands, structure…) and the reaction mechanism. PS: Note that each molecule may be susceptible to more than one reaction. <br /> #* b. Propose a mimic model. as many details as you can about the reactive center (metals, (type of) ligands, structure…) and the reaction mechanism.<br /> <br /> ===13 jan 2023===<br /> # (3p) Azurine is een redox enzyme met abnormale reductie potentiaal. <br /> #* a. Waarom is de reductie potentiaal zo hoog? <br /> #* b. Met welke techniek kan je de actieve site bestuderen en waarom? <br /> # (4p) Superoxide dismutase is een enzyme met Cu en Zn in de actieve site. <br /> #* a. Geef de algemene reactievergelijking <br /> #* b. Beschrijf de stappen die leiden tot de reactie. <br /> #* c. Is zink essentieel voor het enzyme? Wat is de mogelijke rol van Zn(II)? <br /> #* d. Welke andere metalen naast Cu kunnen nog gebruikt worden en waarom? <br /> # (3p) Mossbauer spectrum van een [2Fe-2S]+ Rieske protein <br /> #* a. Beschrijf het voorkomen van het spectrum (2 doubletten) <br /> #* b. Bepaal de oxidatietoestand van Fe en leg uit adhv elektronen structuur. <br /> # (2p) Wat maakt 99mTc zeer geschikt voor single photon emission computed tomography (SPECT)? Hoe wordt dit isotoop in een klinische omgeving geproduceerd?<br /> <br /> ===24 jan 2022===<br /> # (3p) Transferrin:<br /> #* a. Geef de verschillende vormen van transferrin die afhangt van de verzadigheid met Fe.<br /> #* b. Welke van deze vormen is het meest stabiel?<br /> #* c. Welk anion bindt bij transferrin nog? (Bicarbonaat)<br /> #* d. Sorteer op affiniteit: Fe(III), Fe(II), Ga (III) &amp; Cd(II)<br /> # (3p) [2Fe-2S]1+ Riekske cluster met de Mössbauer spectrum:<br /> #* a. Wat zie je op de grafiek? <br /> #* b. Geeft de electronen structuur en de oxidatie toestanden. <br /> # (4p) Purple acid phosphatase PAP:<br /> #* a. Vul het mechanisme aan, geef de oxidatie toestanden en het product.<br /> #* b. Waarom is het paars?<br /> #* c. Waarom is de ideale pH = 6?<br /> # (2p) Geef 3 kationen met een antimicrobiële werking en licht minstens 1 mechanisme hiervan toe.<br /> <br /> ===6 jan 2021===<br /> # op 2p: Ferritin bestaat uit 2 subunits. <br /> #* a. Wat is het verschil tussen de twee subunits of vlak van activiteit?<br /> #* b. Via welke mechanismen wordt ijzer vrijgezet? Welke is het meest plausibel in vivo?<br /> # op 3p: Geef de electron spin states van ijzer in rubredoxin (Je kreeg gegevens van Fe zoals atoomnummer). Op welke manieren kan dit bestudeerd worden. Leg uit waarom het high spin is.<br /> # op 5p: Gegeven: Complex 4 of cytochroom C oxidase intermediate A en F zijn gegeven. <br /> #* a. Geef de algemene ractievergelijking. <br /> #* b. Geef het meest waarschijnlijke voorstel voor het P intermediate. <br /> #* c. Welk residu speelt een belangrijke rol in de active site tijdens intermediate P?<br /> #* d. Waarvan komen de electronen nodig om intermediate P te vormen?<br /> #* e. Met welke technieken kunnen we de intermediaren bestuderen? <br /> # op 2p: Geef de 4 resistentiemechanismen tegen Cis platina en geef 2 manieren om dit te omzeilen.<br /> <br /> ===27 jan 2020===<br /> # op 2?p: Geef de verschillen en gelijkenissen uit bij L en H type subunits van ferritine. <br /> # op 4p: Gegeven: de structuur van een Model System voor Myoglobin + 2 NMR spectra<br /> #* a. Welk spectrum hoort bij het complex met O2 gebonden (oxy) en welk zonder O2 (deoxy) + Waarom?<br /> #* b. Leg uit waarom het mogelijk is dat dit model system een hogere affiniteit voor O2 dan CO heeft.<br /> #* c. Hoe is O2 gebonden aan Fe in de oxy vorm en met welke techniek(en) kan je dit bestuderen?<br /> # op 4p: Gegeven: een gedeeltelijk ingevuld reactiemechanisme van purple acid phosphatase<br /> #* a. Vul in op het schema: Welke 2 metalen + oxidatietoestanden + missende structuur + missende transitietoestand + uittredend product (ROH was het)<br /> #* b. Waarom is het enzyme paars (Metal to Metal charge transfer band in UV-Vis spectrum)<br /> #* c. Gegeven: grafiek (activiteit van het enzyme ifv pH) leg uit (pH-optimum, te lage pH geen activiteit: waarom?)<br /> #* d. Met welke techniek kunnen we het mechanisme bestuderen? (Mossbauer, vooral EPR)<br /> # op 2p: Geef de resistentiemechanismen tegen Cis platina en leg uit wat we hieraan kunnen doen bij sommigen. ( hint: als je lang genoeg blijft zagen en tekenen over transplatina dan vraagt ze niet meer achter de laatste 2 mechanismen)<br /> <br /> ===10 jan 2020===<br /> # op 4p: Transferrin<br /> #*Structuur en functie toelichten<br /> #*Rol bicarbonaat uitleggen<br /> #*Waarom kunnen ook andere metalen dit proteµîne binden?<br /> #*4 metalen in afnemende affiniteit voor binding site plaatsen<br /> # op 3p: Mössbauerspectrum Rieske proteïne, geef oxidatie toestanden, welke ox toestand hoort bij welke piek? Teken de verschillende elektronenconfiguraties.<br /> # op 3p: Vul het reactiemechanisme van Cyt P450 aan en vermeld de verschillende oxidatietoestanden. Met welke spectroscopische technieken zijn deze te karakteriseren?<br /> # op 2p: Geef 3 kationen met een antimicrobiële werking en licht minstens 1 mechanisme hiervan toe.<br /> <br /> ===28 jan 2019===<br /> # (4p) 1HNMR-spectra van oxy- en deoxy Mb gegeven en een Mb-structuur.<br /> #* Welke vorm hoort bij welk spectrum en waarom?<br /> #* Kan er irreversibele oxidatie optreden met de vorming van een µ-oxo-dimeer (Fe-O-O-Fe) na oxidatie met O2?<br /> #* Hoe bindt O2 en met welke technieken kan je dit bestuderen?<br /> # (2p) resistentie mechanismen cisplatina en hoe te omzeilen.<br /> # (6p) Sulfite oxidase.<br /> #* Vul het schema aan<br /> #* Wat gebeurt er met de elektronen die vrij komen?<br /> #* Wat is de rol van molybdopterin?<br /> <br /> ===11 jan 2019===<br /> # (3p) Copper proteins <br /> #* How are metal centres in copper proteins classified and based on what is this classification made?<br /> #* What is the main function of Cu(II) and why?<br /> #* What is the most useful method to study Cu centres in biochemistry and what concrete information can be extracted from this technique? Explain why it cannot be used for type III Cu centres.<br /> #* bijvraag : welke techniek nog = UV-vis want hebben een andere kleur.<br /> # (4p) Cytochromes P450 are regarded as oxidizing enzymes, yet they consume one eq. of NADPH for each catalytic cycle.<br /> #* What does the 450 represent? <br /> #* What is the most common reaction catalyzed by P450 and why is NADPH required?<br /> #* Fill in intermediate 6.<br /> #* Fill in the missing shunt from 5b back to intermediate 2 <br /> # (3p) Explain the electron structure of Fe in the oxidized and reduced state in [2Fe-2S] ferredoxins. Which two spectroscopic methods can be used to distinguish them and why?<br /> # (2p) What makes 99mTc highly suitable for single photon emission computed tomography (SPECT)? How is this isotope being produced in a clinical environment?<br /> <br /> ===29 jan 2018===<br /> #cytochrome oxidase reaction + electron origin + oxidation states<br /> #Da enzyme met Cobalt en AdoB12 radicaal<br /> #electronic structure of (de)oxy Mb + techniques to differentiate?<br /> #Cisplating resistance mechanisms + how to counteract them?<br /> <br /> ===25 jan2018===<br /> #Gd(III) waarom is dit een goed contrast agents? Wat zijn de nadelen? Wat kunnen we hieraan doen? (2p)<br /> #Reactiemechanisme van citraat naar isocitraat (aconitase)<br /> ##Bespreek de 3 hoofdreacties in het mechanisme. Vul de ontbrekende producten en stap aan (? En A was water en de 180° flip). <br /> ##Waarom is de stap aangeduid als A zo belangrijk? <br /> ##In welke pathway speelt dit enzyme een belangrijke rol? (3p)<br /> #bespreek de stappen van de Fe-incorporatie van ferritine. Hoe kan je Fe terug veijzetten uit het ferritine. (3p)<br /> #De 2 mossbauer spectra van [4Fe-4S] gegeven. Welk spectra hoort bij 1+ en welk bij 2+ toestand. Verklaar waarom (4p)<br /> <br /> ===25 jan 2018 VM===<br /> #3 Voorbeelden van antimicrobiële metaal kationen met bewezen werking<br /> #P450 <br /> ##Waarom 450 <br /> ##Welke reacties katalyseren ze? waarom NADPH<br /> ##Intermediar VI aanvullen<br /> #Ferritine, hoe opgebouwd (24 mer) welke verschillende bouwstenen (H en L) en welk verschil aan de hand van wel specifiek weefsel we ze vinden en wat is het verschil tussen deze beide bouwsten met betrekking tot reactiviteit<br /> #2 Mossbauer spectra van 3Fe4S +I en 3Fe4S 0 welke hoort bij wat en verklaar bij nader<br /> <br /> ===12 jan 2018===<br /> # (4p) Fe(III) is transported through the body via transferrin, a Fe(III) protein.<br /> ## Which anion is important to bind Fe(III)? (= bicarbonaat)<br /> ## What structural changes/molecular forms are induced when Fe(III) is bound to transferrin.<br /> ## What experiment can be used to distinguish the different molecular forms of transferrin?<br /> ## Does it bind only Fe(III) or could other metals also bind?<br /> # (3p) Two 1HNMR spectra are given. One is of oxidized myoglobin and the other is of deoxidized myoglobin. Which spectra belongs to the oxidized and wich to the deoxidized form? Explain why.<br /> #* Gegeven: Structuur van Fe in de ring + twee spectra met serieuze pieken en daarbij telkens ook een spectra van de protonen van bèta corrin. Eén spectra was niets te zien van de protonen van bèta corrin &amp; de andere vertoonde twee pieken rond 50 ppm. De reden dat 02-bound myoglobin diamagnetic is omwille van binding met zuurstof. Unbound myoglobin is paramagnetic en zal dus upfield shifts veroorzaken in het NMR spectrum.<br /> # (3p) Alkaline en purple acid phosphatase<br /> ## Fill in missing metals, reaction products and transition states<br /> ## What is the main difference in active site between purple acid phosphatase and alkaline phosphatase. Do they work at same conditions?<br /> #* Bijvraag: wat gebeurt er bij een heel lage pH bij purple acid phosphatase (= anders wordt ook OH aan ijzer ook geprotoneerd en is er geen nucleofiele aanval op fosfaat)<br /> # (2p)<br /> #* What makes 99mTc highly suitable for single photon emission computed tomography (SPECT)?<br /> #* How is this isotope being produced in a clinical environment?<br /> <br /> ===01 sep 2017 ===<br /> # (3p)<br /> #* How are copper sites classified?<br /> #* Which technique is used to study them, what results do you get from it?<br /> #* Why does this technique not work for type III?<br /> # (3p) Given is part of the reaction mechanism of purple acid phosphatase (voorbeeld examen)<br /> #* Fill in the missing metal centers, transition state and reaction products<br /> #* What is the main difference between the active site of purple acid phosphatase and alkaline phophatase?<br /> #* Can both enzymes be used under the same conditions?<br /> # (3p)<br /> #* Draw and explain the 2 different electronic configurations of Rebredoxins.<br /> #* Which spectroscopic techniques can be used to distinguish these 2 states?<br /> #* Why are both state in high spin?<br /> # (3p)<br /> #* Discuss the 4 bindingspots of Human Serum Albumine.<br /> #* Where and why would Hg(II) bind?<br /> <br /> ===30 jan 2017 ===<br /> #<br /> #* Advantages of coordination compound based dyes for optical imaging.<br /> #* Most common metals for this method and why<br /> #<br /> #* Axial groups on methylmalonyl CoA mutase<br /> #* which reaction is catalysed by this enzym<br /> #* Explain the first step of this reaction mechanism and what is the oxidation state(s) of Co<br /> # -&gt; 2 Mossbauer spectra gegeven<br /> #* 2 most important limits of 57Fe Mossbauer spectroscopie<br /> #* Which parameters can be derivate from the spectra<br /> #* Which of the 2 has the most symmetry and explain why<br /> #<br /> #* 2 subunits of ferritin + explain proportion difference in different tissues between the 2 subunits<br /> #* Most important difference between the 2 subunits<br /> <br /> ===26 jan 2017===<br /> # What are metallothioneines? Which metals are associated and why does it bind so many metals? <br /> # Why is Gd a good metal for MRI enhancement? What's the problem with Gd and how is this solved? <br /> # P450: In which reaction is it involved? Draw remaining intermediates (4,5,6). Why is NADPH used? How many electrons are participating? <br /> # Describe binding of oxygen to hemoglobin. How is this related to cooperative binding? How is the binding regulated?<br /> <br /> ===10 jan 2017===<br /> # (2p)<br /> #* What makes 99mTc highly suitable for single photon emission computed tomography (SPECT)?<br /> #* How is this isotope being produced in a clinical environment?<br /> # (3p)<br /> #* Which metal is found in the active sit of hemerythrin?<br /> #* How does oxygen Bind to it?<br /> #* Explain the oxidation states present in oxy and in deoxy form of hemeryhtrin. Which technique iq best suitable to study this and why?<br /> # (4p) Given is part of the reaction mechanism of purple acid phosphatase (voorbeeld examen)<br /> #* Fill in the missing metal centers, transition state and reaction products<br /> #* What is the main difference between the active site of purple acid phosphatase and alkaline phophataseµ? Can both enzymes be used under the same conditions?<br /> # (3p)<br /> #* What are the different electron carrying components in complex III from the mitochondrial respiration?<br /> #* explain how electrons are being transported to cytochrome c.<br /> <br /> ===25 jan 2016===<br /> # &amp;lt;sup&amp;gt;99m&amp;lt;/sup&amp;gt;Tc: properties that make it useful for SPECT, production in clinical environment<br /> # Reaction mechanism of aconitase<br /> # Rubredoxin: elektronenconfiguratie en hoe de twee vormen via spectroscopische techniek onderscheiden<br /> # Welke elektronencarriers zijn er in Complex III en hoe wordt cytochroom C hier gereduceerd?<br /> <br /> ===21 jan 2016===<br /> # Bespreek humaan serum albumine, 4 bindingsplaatsen. Waar en waarom zou Hg(II) binden<br /> # Exact de vraag van het voorbeeldexamen op toledo ivm alkaline en purple acid phosphatase (reactieschema aanvullen en het verschil uitleggen)<br /> # Nitrogenase uitleggen, welke delen voor wat dienen, reactievergelijking geven<br /> # Hemerythrin, oxidatie dingen uitleggen, techniek om dit te bestuderen.<br /> <br /> ===22 jan 2015 (nm)===<br /> #How are copper sites classified? Which technique is used to study them, what results do you get from it? Why does this technique not work for type III<br /> #Which factors regulate O2 binding to hemoglobin? And how?<br /> #Fill in the missing reactant and reaction products (Dimethyl sulfoxide reductase), what are the oxidation states of Mo? Draw the overall chemical reaction. Where do the 2 electrons come from?<br /> #Give two examples of Platinum anti-tumor drugs with better efficacy<br /> <br /> ===23 jan 2014 (vm)===<br /> #Give four mechanisms by which cells can become resistant to cisplatin. How can you circumvent these resistance mechanisms? (4p)<br /> #Reaction mechanism of aconitase: (6p)<br /> #*fill in the missing reactants and reaction products. <br /> #*Identify the three main reactions in this mechanisms. <br /> #*Why is the step indicated with A so important? (A was the 180° flip)<br /> #*In which pathway does this enzyme play an important role within the cell?<br /> #Explain in detail the electronic states of Fe in the oxy and deoxy states of myoglobin. Which technique is best to differentiate between these two states? (4p)<br /> #Which electron carriers play a role in complex III of the mitochondrial respiration pathway? How do electrons reach cytochrome c? (6p)<br /> <br /> ===15 jan 2014 (vm)===<br /> # Why is Gd a good metal for MRI? What are the disadvantages? How are these problems being attacked? (4p) <br /> # Which reaction is catalysed by methylmalonyl-CoA mutase? Describe the first reaction step? (6p)<br /> # Two Mossbauer spectra were given from two different di-iron species(6p)<br /> #* What do you need in order to obtain these Fe Mossbauer spectra?<br /> #* What parameters can you derive from these graphs? <br /> #* Which is more symmetric and why?<br /> # What function do metallothioneines have? What metals and aminoacids are associated with them? Are they specific for certain metals? (4p)<br /> <br /> ===15 jan 2014 (nm)===<br /> # properties that make it useful for SPECT, production in clinical environment (4p) <br /> # Reaction mechanism of purple acid phosphatase (6p)<br /> #* Fill in missing metals, reaction products and transition states <br /> #* What is the main difference in active site between purple acid phosphatase and alkaline phosphatase. Do they work at same conditions? <br /> # Explain the electronic structure of Fe in oxidized and reduced [2Fe-2S] ferredoxins. Which two spectroscopic methods can be used to distinguish between them and why? (5p)<br /> # What is the major consequence of O binding to the structure of hemoglobine? How is this related to cooperative binding? (5p)</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Industri%C3%ABle_Chemie&diff=4897 2026-01-16T11:54:36Z

<p>R0857325: </p> <hr /> <div>[[Categorie:Machemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> Het vak Industrial Chemistry wordt sinds academiejaar 2019-2020 volledig gegeven door Alain Molinard. De cursus was toen van Jan en Alain en de focus lag volledig anders. Examenvragen van voor 2019 zijn dus '''niet representatief''' om te leren.<br /> Sinds COVID wordt het vak enkel volledig schriftelijk ondervraagd.<br /> <br /> Je mag kiezen of je het examen in het engels of nederlands beantwoord.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 16 januari 2026 ===<br /> ''Het examen was volledig schriftelijk''<br /> <br /> # Methaan pyrolyse, waarom is het duurzamer dan alternatieve H2 routes.<br /> # Definieer: vaste kost, variabele kost, EBIT, netto inkomen en omzet (revenue). Wat is de wiskundige relatie tussen deze termen? <br /> # leg CBAM uit binnen ETS<br /> # REACH, CLP regulation, leg uit welke impact die heeft op downstream users<br /> # 5 types emissie van chemische industrie, geef termen en woordje uitleg erover<br /> # iceberg theory of BIRD <br /> <br /> ===15 januari 2025===<br /> ''Het examen was volledig schriftelijk''<br /> <br /> # Wat zijn de doelstellingen van REACH en CLP en hoe verbeteren ze human health en environment?<br /> # Wat is de ladder van Lansink? Hoe kan dit toegepast worden op de chemische industrie?<br /> # Wat is carbon leakage in context van ETS?<br /> # Wat zijn de voordelen van vaste katalysatoren in aanwezigheid van gasvormige reagentia? Beschrijf de 3 reactoren die gebruikt worden. Vergelijk hun voordelen en nadelen.<br /> # Definieer: vaste kost, variabele kost, EBIT, netto inkomen en omzet (revenue). Wat is de wiskundige relatie tussen deze termen?<br /> # Wat is circulaire economie? Waar zou chemische industrie kunnen helpen? Wat zouden mogelijke bottlenecks zijn?<br /> <br /> === 24 januari 2024 ===<br /> ''Het examen was volledig schriftelijk''<br /> <br /> # Wat zijn de voordelen van vaste katalysatoren in aanwezigheid van gasvormige reagentia? Beschrijf de 3 reactoren die gebruikt worden. Vergelijk hun voordelen en nadelen.<br /> # Lijst de acties die men kan ondernemen om een risico te verminderen van meest effectief naar minst effectief (die slides met de kat en muis). Hij vroeg geen voorbeelden maar ik denk wel dat hij alle extra info apprecieert<br /> # Definieer: vaste kost, variabele kost, EBIT, netto inkomen en omzet (revenue). Wat is de wiskundige relatie tussen deze termen? <br /> # Wat is het verschil tussen CCS en CCU? Leg uit waarom de effectiviteit van CCU afhangt van de afkomst van de koolstof.<br /> # Leg EU ETS volledig uit.<br /> # Wat is circulaire economie? Waar zou chemische industrie kunnen helpen? Wat zouden mogelijke bottlenecks zijn?<br /> <br /> === 25 januari 2023 ===<br /> ''Het examen was volledig schriftelijk''<br /> <br /> # Wat zijn de voordelen van vaste katalysatoren in aanwezigheid van gasvormige reagentia? Beschrijf de 3 reactoren die gebruikt worden. Vergelijk hun voordelen en nadelen.<br /> # Lijst de acties die men kan ondernemen om een risico te verminderen van meest effectief naar minst effectief (die slides met de kat en muis). Hij vroeg geen voorbeelden maar ik denk wel dat hij alle extra info apprecieert<br /> # Definieer: vaste kost, variabele kost, EBIT, netto inkomen en omzet (revenue). <br /> #* Wat is de wiskundige relatie tussen deze termen? (ook rechtse helft van schema geven waar pijlen naar beneden op staan met market price en contribution margin etc..; COGS niet vergeten te vermelden)<br /> # Wat is het verschil tussen CCS en CCU? <br /> #* Leg uit waarom de effectiviteit van CCU afhangt van de afkomst van de koolstof. (ik denk dat Alain altijd wel voorbeelden apprecieert, dus eerst zeggen dat dit een GHG-emissie reductie toepassing is (daling CO2) en dat Antwerp@C (CCS) dat doet, en CCU bv. Power to Methanol)<br /> # Leg EU ETS (emission trade system) volledig uit, wat is “cap en trade”? (volledig in detail dus verband met decouple effect uit hoofdstuk 2 en ook hoofdstuk 6, allowance niet vergeten te vermelden en uit te leggen)<br /> # Definieer circulaire economie, lineaire economie en recycling economie<br /> #* Leg de verschillen uit tussen de 3.<br /> #* Een CEO zegt: “circulaire economie vermindert risico’s en brengt opportuniteiten” leg dit uit (geef dus de VERMINDERDE risico’s en de mogelijke opportuniteiten)<br /> <br /> === 18 januari 2023 ===<br /> ''Het examen was volledig schriftelijk''<br /> <br /> # Ammoniakproductie volledig uitleggen.<br /> #* Waarom wordt er gewerkt bij verhoogde druk. <br /> #* Waarom is er een limiet op 350 bar.<br /> # Geef een example van een robot for maintenance/inspection<br /> #* Leg uit wat deze allemaal kan doen (voorbeelden genoeg in hoofdstuk 7 en 8)<br /> #* Geef de voordelen op vlak van safety, health, environment en cost.<br /> # Wat is shale gas? (nieuwe vraag, dus hij wil waarschijnlijk uitleg van de extractie ervan, en wat shale gas is tov andere fuels)<br /> #* Geef economische en ecologische voordelen/nadelen van het gebruik van shale gas.<br /> # In-line analyse, on-line analyse en off-line analyse uitleggen. (met tekening is het beste)<br /> #* Waarom kunnen In-line en on-line analyse niet altijd gebruikt worden om elke chemische parameter te meten? <br /> # Wat zijn de hoofdbronnen van GHG-emmisie? (niet specifiek in chemische sector gevraagd)<br /> #* Hoezo is er reductie van GHG-emissie terwijl productievolume stijgt?<br /> # Zonne-energie en windenergie zijn duurzame alternatieven voor fossil fuels: waarom worden deze toch nog niet voor 100% gebruikt in chemische productie installaties?<br /> <br /> === 23 juni 2022 ===<br /> <br /> # Hoe definieer je: circulaire economie en de verschillen met lineaire en recycling economie &amp; risico's en opportuniteiten<br /> # Lijst de acties die men kan ondernemen om een risico te verminderen van meest effectief naar minst effectief (die slides met de kat en muis). Geef voor elke actie een voorbeeld.<br /> # Waarom is de HPPO route voor de vorming van PO te verkiezen boven de chlorohydrin route en styreen monomeer route?<br /> # Vraag met grafiek van kost voor ethyleenproductie: waarom was er in 2011 een daling van deze kost in Noord Amerika? Waarom was er na enkele jaren een vertraagde daling van deze kost in Europa?<br /> # Zonne-energie en windenergie als duurzame alternatieven voor fossil fuels: waarom worden deze toch nog niet voor 100% gebruikt in chemische productie installaties?<br /> # Wat is methane pyrolysis? Beschrijf dit proces. Waarom is het meer duurzaam dan andere processen voor de productie van waterstof?<br /> <br /> === 11 juni 2021 ===<br /> <br /> # Beargumenteer waarom vaste katalysatoren in de aanwezigheid van gasvormige reagentia zo populair zijn in de industrie. Beschrijf de 3 reactoren die gebruikt worden en vergelijk hun voordelen en nadelen.<br /> # Lijst de acties die men kan ondernemen om een risico te verminderen van meest effectief naar minst effectief (die slides met de kat en muis).<br /> # Definieer: vaste kost, variabele kost, EBIT, netto inkomen en omzet. Wat is de wiskundige relatie tussen deze termen?<br /> # In line en on line analyse hebben bepaalde voordelen in vergelijking met off line analyse, maar waarom kunnen deze 2 analysesystemen niet altijd gebruikt worden om elke chemische parameter te meten? <br /> # Wat is het verschil tussen CCS en CCU? Leg uit waarom de effectiviteit van CCU afhangt van de afkomst van de koolstof.<br /> # Hoe definieer je: circulaire economie en de verschillen met lineaire en recycling economie &amp; risico's en opportuniteiten<br /> <br /> === 15 juni 2020 ===<br /> <br /> # Beargumenteer waarom vaste katalysatoren in de aanwezigheid van gasvormige reagentia zo populair zijn in de industrie. Beschrijf de 3 reactoren die gebruikt worden en vergelijk hun voordelen en nadelen.<br /> # Wat is het verschil tussen vaste en variabele kosten en geen minstens twee voorbeelden van elk. <br /> # Leg uit kort uit: off-line, online en inline analyse. Geef een korte beschrijving, en welke voordelen hebben inline en online t.o.v. off-line?<br /> #Broeikasgas uitstoot (GHG emissie) is gedaald met 57%. Leg uit in het algemeen wat de grootste oorzaken zijn van GHG emissie in de chemische industrie, en wat de redenen kunnen zijn dat de uitstoot daalt ondanks dat het productie volume toeneemt.<br /> # Leg volgend principe uit: methoden en concepten van EHSQ systemen focussen op continue verbetering, gebaseerd op het PDCA-principe<br /> # Hoe definieer je: circulaire economie en de verschillen met lineaire en recycling economie &amp; risico's en opportuniteiten<br /> <br /> === 25 Juni 2019 VM ===<br /> alain<br /> <br /> #vraag 1: uitleggen online (bijvraag verschil off line, in line)<br /> <br /> NIR als meetinstrument on line (waar staat de IR zelf, waarom (trillingen installatie enzo))<br /> <br /> #vraag 2: Talent management, waarom is het nuttig voor bedrijf en werknemer.<br /> <br /> verschil talent en competence<br /> <br /> #vraag 3: wat is een sustainable company, waar houdt deze rekening mee, hoe doet deze dat (people profit planet etc)<br /> <br /> jan<br /> <br /> #vraag 1: rent analyse<br /> <br /> #vraag 2: procesveiligheid. je krijgt een schema van die tank met veiligheidsmaatregelen (quenching tank enzo)<br /> <br /> waaruit komen de maatregelen voort, wat zijn de soorten maatregelen (primair, secundair)<br /> <br /> #vraag 3: energiebeleid, hoe in een bedrijf. wat zijn de pijlers van energiebeleid in europa. (geen getallen, algemeen) Artikel over benchmarking. waarom is er een limiet aan co2 vermindering? (thermodynamisch optimum)<br /> <br /> === 24 Juni 2019 VM === <br /> Deel Jan<br /> #Bespreking rentabiliteit van je businessplan: vraagt vooral hoe je NPV etc hebt berekend.<br /> #ammoniak synthese: 2 grafieken gegeven uit de slides en hiermee het effect van de temperatuur en druk uitleggen op de synthese.<br /> Uitleggen hoe de Fe katalysator wordt gereduceerd en de rol van water hierin bespreken.<br /> Uitleggen waarom de Fe katalysator zo belangrijk is voor je ammoniak synthese.<br /> #Je krijgt een artikel over energiebeleid + Waarom is energiebeleid belangrijk en bespreek de algemene pijlers voor energiebeleid in Europa in de toekomst. (Zelfde als 21/06 VM)<br /> <br /> Deel Alain<br /> #Wat is circulaire economie en wat is het verschil met recycling economie. Geef de opportunities en threats die het oplost.<br /> #Vraag over EHSQ over energiemanagement, waarom je het moet doen en hoe, ISO 50001 uitleggen enzo, people planet profit.<br /> #Wat is het verschil tussen talentmanagement en kijken naar competenties in HR. Welke voordelen geeft het voor het bedrijf en voor de werknemer.<br /> <br /> ===21 juni 2019 voormiddag ===<br /> ALAIN: <br /> - een geïntegreerd zorgsysteem werkt volgens het principe van PDCA, leg dit uit. (EHSQ)<br /> - near IR kan gebruikt worden als online techniek voor de kwaliteit van het staal te bepalen. Alles uitleggen, online, near IR, in welke toepassing we da gezien hebben (tekening best geven) (EHSQ)<br /> - Waarom heeft een bedrijf een visie en hoe zorgen ze ervoor dat hun arbeiders dit naleven. (Strategie, visie en missie)<br /> <br /> JAN<br /> - rentabiliteit van businessplan (payback time, NPV, NPI, Depreciation en Discount rate)<br /> - wat is het verschil tussen gevaar en risico? Wat is een risicoanalyse en hoe zorgen ze ervoor dat deze correct uitgevoerd wordt? Efficiëntie van de mogelijke risico vermindering. (Occupational safety)<br /> - een artikel rond energie: bespreek de zin die aangeduid is (energie), hoe wordt er in de chemische industrie gewerkt aan energie-efficiëntie (hoofdstukken gecombineerd), bespreek de pijlers waar men in Europa in de toekomst op richt (klimaat)<br /> <br /> Apart bij een van hen: <br /> businessplan bespreken: random vragen<br /> <br /> <br /> ===25 juni 2018 namiddag===<br /> zie examen 27 juni 2017<br /> <br /> ===25 juni 2018 voormiddag===<br /> zie examen 24 juni 2017<br /> <br /> ===22 juni 2018 voormiddag===<br /> zie examen 23 juni 2017<br /> <br /> ===27 juni 2017 namiddag===<br /> #Geef de pijlers van talent management en geef enkele voorbeelden/concepten om deze pijlers te illustreren. <br /> #Ethyleenoxide<br /> ##Uit welke 4 componenten bestaat de katalysator? Hoe wordt deze katalysator gemaakt en waarom op deze manier? Wat is het effect op de samenstelling van de katalysator? <br /> ##Bespreek het mechanisme voor de vorming van ethyleenoxide (TPR-massaspectrum gegeven).<br /> ##Waarom wordt een ethyleenoxide installatie vaak gecombineerd met een ethyleenglycol installatie?<br /> #Procesveiligheid<br /> ##Bespreek de veiligheidsmaatregelen die genomen worden bij de ammoniumnitraat tank (afbeelding van de AN tank gegeven met ALLE veiligheidsmaatregelen al op getekend: primaire voor proces, primaire voor fouten en secundaire). <br /> ##Welk aanpak schuilt er achter deze maatregelen? <br /> #Rentabiliteit (ingevulde tabel gegeven)<br /> ##Hoe komt men aan de kosten/baten?<br /> ##Bespreek de afschrijvingswaarden. <br /> ##Hoe gaat men van de netto cash flow naar de geactualiseerde netto cash flow in jaar 5?<br /> ##Is het project rendabel?<br /> #Energie (heel kort artikel gegeven)<br /> ##Waarom is het verantwoord om van een veilingsysteem naar een benchmarksysteem over te schakelen?<br /> ##Wat is het energiebeleid in de chemie (staat los van het artikel)?<br /> #Innovatie: eigen voorbeeld uit het hoorcollege.<br /> <br /> ===24 juni 2017 voormiddag en namiddag===<br /> #Visie (zie andere jaren)<br /> #NH3 synthese (zie andere jaren)<br /> #Historische evolutie in arbeidsveiligheid, procesveiligheid en milieu (zie andere jaren)<br /> #Artikel over energie (zie andere jaren)<br /> #Rentabiliteit (zie andere jaren)<br /> #Innovatie (zie andere jaren)<br /> <br /> ===23 juni 2017 voormiddag en namiddag===<br /> #Wat is een zorgsysteem en wat is het nut voor een onderneming?<br /> #Risicoanalyse<br /> ##Wat is het verschil tussen risico en gevaar?<br /> ##Hoe neem je juiste risico reductie maatregelen en de kosten efficiëntie?<br /> ##Wat is een risicoanalyse en hoe wordt er gezorgd dat deze juist gemaakt wordt?<br /> #Kraken <br /> ##Waarom wordt kraken toegepast?<br /> ##Wat zijn gelijkenissen en verschillen tussen thermisch en stoomkraken?<br /> ##Waarom wordt katalytisch kraken toegepast?<br /> ##Beschrijf kraakscherpte a.h.v. figuur<br /> #Rentabiliteitsanalyse<br /> ##Hoe kom je aan kosten/baten?<br /> ##Hoe ga je van cashflow naar actuele cashflow?<br /> ##Is de onderneming rendabel?<br /> ##Leg de afschrijvingen uit<br /> #Artikel over energie-efficiëntie: <br /> ##zin in aangeduid en uitleggen<br /> ##Hoe werken chemische bedrijven mee aan energie-efficiëntie<br /> #Innovatie: oefening uit hoorcollege, breng je eigen voorbeeld mee<br /> <br /> ===23 juni 2014 voormiddag en namiddag===<br /> #Wat is een zorgsysteem? Wat is het nut ervan voor de onderneming?<br /> #Synthese van ammoniak (2 grafieken uit cursus gegeven)<br /> ##Bespreek de invloed van temperatuur, druk en reactievoering op de keuze van de omstandigheden voor de ammoniaksynthesereactie. <br /> ##Hoe wordt de katalysator geactiveerd? Wat is de rol van waterdamp hierin?<br /> ##Bespreek volgende stelling &quot;De katalysator is het hart van de ammoniakfabriek&quot;. <br /> #Bespreek de historische evolutie in het aanpakken van volgende problematieken:<br /> ##procesveiligheid<br /> ##arbeidsveiligheid<br /> ##milieu<br /> #Rentabiliteitsanalyse: Een bedrijf wil het vullen van vaten automatiseren. Hierbij komt kijken een investeringskost, een negatieve kost vanwege verminderen van energieverbruik en ontslaan van 2 werknemers, en een positieve kost vanwege sociale bijdrage. Tabel gegeven.<br /> ##Is deze investering rendabel?<br /> ##Wat is het verschil tussen de waarden in de rij 'Totale cashflow' en 'Verdisconteerde cashflow'?<br /> ##Nog een paar kleine vraagjes<br /> #Vraag over innovatie (die zelf naar het examen meegebracht moest worden)<br /> <br /> ===22 juni 2014 voormiddag en namiddag===<br /> #Waarom definieert een onderneming een visie? En hoe wordt deze nagestreefd?<br /> #kraken<br /> ##Waarom wordt er gekraakt?<br /> ##Geef de gelijkenissen en verschillen tussen thermisch kraken en stoomkraken<br /> ##Waarom werd katalytisch kraken ontwikkeld?<br /> ##Geef aan de hand van de figuur weer wat er bedoeld wordt met kraakscherpte (figuur over kraakscherpte gegeven)<br /> #Veiligheid<br /> ##Wat is een risico-analyse?<br /> ##Bespreek efficiëntie (kosten-effeciëntie/verhaal van kat en muis)<br /> #Rentabiliteit (schema en opgave gegeven)<br /> ##Hoe kom je aan de kosten/baten?<br /> ##Bespreek wettelijke afschrijvingen<br /> ##Bespreek hoe je in jaar 5 aan de actuele waarde komt.<br /> ##Is het rendabel?<br /> #energie-efficiëntie<br /> ##Artikel gegeven, bespreek daar een zin uit.<br /> ##Hoe wordt er in de chemische industrie zuinig omgegaan met energie?<br /> #innovatie: oefening uit hoorcollege.</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Polymer_Sciences:_from_Synthesis_to_Polymer_Material&diff=4860 2026-01-12T16:06:23Z

<p>R0857325: </p> <hr /> <div>[[Categorie:Machemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Sinds 2023-2024 heeft professor Nies dit vak langs zich gelegd. Het deel Physical Chemistry is nu verdeeld tussen professor Ianiro (deel Physical Chemistry) en professor Goderis (deel Crystallization).<br /> We gaan er daarom vanuit dat alle voorgaande vragen van professor Nies waardeloos zijn voor reference. Ianiro heeft delen van de leerstof ook aangepast. Dus je zal moeten zien welke vragen goede oefeningen zijn.<br /> Professor Koeckelberghs zijn deel Polymer Chemistry is nog steeds hetzelfde. <br /> Dezelfde cesuur is nog steeds van kracht. Haal minimaal 9/20 voor deel Physics (2/3 totaal punt) en 9/20 op deel Chemistry (1/3 totaal punt), of haal maximum een 9/20 in totaal.<br /> <br /> (Voor '23-'24: Gedoceerd door Professor Nies en Professor Koeckelberghs. Lessen zijn altijd in het Engels. De verdeling is 2/3 op het deel van Nies en 1/3 op het deel van Koeckelberghs. Bij Nies zijn er ook verplichte assignments tijdens het jaar, die meetellen voor een fractie 4/(12-N) van de punten van zijn deel (met N aantal assignments, doorgaans 2). Nies zijn examen is gesloten boek en er moet maar één vraag bij hem mondeling besproken worden (deze wordt op voorhand aangeduid). Bij Koeckelberghs zijn alle vragen mondeling te bespreken.)<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===12/01/2026 ===<br /> ====Prof. Ianiro====<br /> #8 multiple choice questions (0.5 point per question, no gis-correction)<br /> #(6p) critical parameter, discuss its limiting values for polymer solution,blend. Why can polymer solutions be homogeneous even if weak repulsion is present?<br /> #(10p) A gel is an elastomeric network swollen with solvent. The equilibrium volume fraction of solvent in the network when the gel is immersed in a reservoir of solvent can be calculated by solving the following equation numerically: (see document on Toledo for the right equation) where 𝑘 is the number of chain strands in the network and 𝑣0 is the volume of a solvent molecule. Describe the procedure to derive this equation. Remember that the volume of the dry network is 𝑉P and is different from the swollen volume. A qualitative but very detailed step-by-step description of the derivation is sufficient. A mathematical derivation is also OK<br /> <br /> # (20p)Describe a strategy to model kinetics for formation spherullites. What are the limitations to this strategy? Provide a solution to the equation for the early stages assuming instant nucleation followed by growth.<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Compare free radical, anionic and cationic vinyl polymerization concerning the monomers used, termination, the possibility/ how to turn the polymerization into a living polymerization and T ceiling<br /> #Discuss ROMP<br /> <br /> <br /> ===04/09/2025===<br /> ====Prof. Ianiro====<br /> #Multiple choice: formula Mn, formula R_(RMS,FRC), formula spinodal, density of specific brush, counterion condensation, depletion layers around colloidals, BCP self assembly of amphiphilic BCPs in selective solvent<br /> #Derive delta F_NET = 1/2*k_B*T*k/V*(lambda x² + lambda y² + lambda z² -3). Formulas P(R(x,y,z),N) and vector R(x,y,z) given<br /> #Spinodal diagram: give all parts, give all formulas, give all phase separation mechanisms, T-dependence of interaction paramter chi_AB<br /> #Thermodynamics of melting of lamellar crystal. Mention/derive Gibbs-Thomson-Tamman equation. Assume delta H^m &amp; delta S^m do not change.<br /> ##(not completely mathematically, professor didn't know the GTT-equation from memory himself lol). Part of derivation about &quot;Melting bulk crystal&quot; was important.<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Discuss Tceil: apply on vinyl and ROP polymers. Does Tc depend on the polymerization type for a specific monomer? Is Tc equally applicable for radical and controlled radical polymerization for a specific monomer?<br /> #Discuss influence of molecular structure of vinyl monomer on chance to be polymerized. Correlate monomer structure with ways to be polymerized, rate of polymerization, retardation and inhibition.<br /> #Discuss living cationic vinyl polymerization.<br /> <br /> ===20/01/2025 Morning===<br /> ====Prof. Ianiro====<br /> #8 multiple choice questions (0.5 point per question, no gis-correction)<br /> #*Scaling of R with N for ideal and real chain, scaling of viscosity with N, excluded volume, F-H parameter, critical parameter in blend vs solution<br /> #(8p) A gel is an elastomeric network swollen with solvent. The equilibrium volume fraction of solvent in the network when the gel is immersed in a reservoir of solvent can be calculated by solving the following equation numerically: (see document on Toledo for the right equation) where 𝑘 is the number of chain strands in the network and 𝑣0 is the volume of a solvent molecule. Describe the procedure to derive this equation. Remember that the volume of the dry network is 𝑉P and is different from the swollen volume. A qualitative but very detailed step-by-step description of the derivation is sufficient. A mathematical derivation is also OK<br /> #(8p) Morphology of self-assembled structures in selective solvent. What are the determining factors for morphology selection? Provide a thermodynamic description of block copolymer solution self-assembly using the approach. Describe the critical micelle concentration (in forumula or in words).<br /> #Crystallization: Describe the melting thermodynamics of lamellar crystals and the dependence of the observed melting temperature on the lamellar thickness.<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Compare free radical, anionic and cationic vinyl polymerization concerning the monomers used, termination and the possibility and way to turn the polymerization into a living polymerization.<br /> #For a copolymerisation with monomers M1 and M2, define the copolymerization parameters (he means r1 and r2). What factors have an influence on this parameter? Give an example.<br /> #Discuss RAFT polymerisation.<br /> <br /> ===17/01/2025 Morning===<br /> ====Prof. Ianiro====<br /> # 8 multiple choice questions, half point each. No GIS-correction. <br /> # (cristallization) Describe a strategy to model the kinetics of formation of spherulites. What are the limitations of this strategy? Provide a solution to the equation for the early stages of the process assuming instantaneous nucleation followed by growth.<br /> # (6pt) Describe how the critical parameter (Formula given) can be derived and discuss its limiting value for large chain lengths in the case of polymer solutions and blends. Why polymer solutions can be homogeneous even if weak repulsion is present while neat attraction is needed for a polymer blend to be homogeneous? <br /> # (10pt) Starting from the Flory-Huggins free-energy of mixing (formula given) derive the free energy change of a polymer-colloid mixture when the depletion layers around the colloidal particles overlap (formula given) In the equations above, � denotes the volume fraction, � denotes the chain length (number of monomers), � DC is the interaction parameter, �2AB is the lattice volume, �Q is the number of polymer molecules, �:RIH2AJ is the overlapping volume, �P is the accessible volume in the absence of overlap.<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> # (10pt) What is living/controlled polymerisation? How to experimentally test if a polymer is living controlled? How can a Free Radical Polymerisation become controlled?<br /> # (6pt) Vinyl monomer. What are the requirements to be able to polymerise? What kind of polymerisations are there? How does the structure affect the polymerisation rate?<br /> # (4pt) Explain emulsion polymerisation briefly.<br /> <br /> ===19th of January 2024 Afternoon===<br /> ====Prof. Ianiro====<br /> # 8 Multiple choice questions, half a point each. No GIS-correction:<br /> #*formula Mn, formula Rrms, formula spinodal curve, definition counterion condensation, formula CHIcritical of long poly chain, density of brush layer (densely grafted, flat, good solvent),...<br /> #Keeping in mind that volume fractions and probabilities are connected, derive the Flory-Huggins enthalpy of mixing in a lattice with number of nearest neighbors 𝑧 and with interaction energies 𝜀AB, 𝜀AA, 𝜀BB.<br /> #Explain how polymers behave in the bulk and discuss the concept of relaxation time remembering that the diffusion coefficient is defined by Stokes-Einstein relation 𝐷 = 𝑘B𝑇/𝜁. Where 𝜁 is the friction coefficient, and that the time needed to diffuse of a distance 𝑥 is 𝑡 = 𝑥^2/6𝐷. Link the relaxation time to the rheological behavior of polymers and to the different viscosity (scaling) regimes that can be observed as a function of the chain length 𝑁.<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Compare free radical, anionic and cationic vinyl polymerization concerning the monomers used, termination and the possibility and way to turn the polymerization into a living polymerization.<br /> #Explain difference chain- and step-growth. How do we demonstrate which one we have?<br /> #Discuss ROMP.<br /> <br /> ====Prof. Goderis====<br /> #Lamella with surface X,Y, depth l. How is Tm related to l (derivation). Image given.<br /> #Explain shortly how the thickness of a lamella can be measures using X-ray christallography.<br /> #The image in exercise 1 is an ideal respresentation of a polymer crystal. What does it actually look like in a polymer melt?<br /> <br /> ===19th of January 2024 Morning===<br /> ====Prof. Ianiro====<br /> #8 multiple choice questions, half a point each. No GIS-correction.<br /> #Given the entropy: S = -kb(3→R.→R/(2*l^2*N)). For a generic vector: →v^2 = vx^2 + vy^2 + vz^2. Derive the entropy change when a chain is deformed in an arbitrary direction. Describe how to use this to calculate the entropy change upon deformation of a network of k randomly oriented polymer strands.<br /> #What is excl. Volume? How to calculate it, how does it relate to interaction between monomers of real chain? What is the FH-interaction parameter ChiAB and how is it defined? What is the relationship between excl vol and FH-interaction parameter?<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #What is living/controlled polymerisation? How to experimentally test if a polymer is living controlled? How can a Free Radical Polymerisation become controlled?<br /> #Vinyl monomer. What are the requirements to be able to polymerise? What kind of polymerisations are there? How does the structure affect the polymerisation rate?<br /> #Explain emulsion polymerisation briefly.<br /> <br /> ====Prof. Goderis====<br /> #Lamella with surface X,Y, depth l. How is Tm related to l (derivation). [This is slide 73-74 of prof Goderis.] Image given.<br /> #Explain shortly how the thickness of a lamella can be measures using X-ray christallography.<br /> #The image in exercise 1 is an ideal respresentation of a polymer crystal. What does it actually look like in a polymer melt?<br /> <br /> ===20th of January 2023===<br /> ====Prof. Nies====<br /> #Eq. 1.40 is given. Discuss the limiting behavior for L&lt;&lt;lp and L&gt;&gt;lp. The Kuhn length was defined by two equations. Write them down and give a qualitative description. Based on this, give the relationship between lK and lp. Can a chain with L&lt;&lt;lp also be seen as Kuhn chain? Explain.<br /> #Scientist claim that a polymer in solution shows a Phi(2)-T diagram with a closed loop miscibility hole. Chi(crit,1-2) are given as are T(crit,1-2). The values of Chi(0), Chi(1) and Chi(2) are provided too (Eq. 2.19). From this, calculate s2 and Phi(crit,1-2). Show either qualitatively of quantitatively if their reasoning for a closed loop miscibility hole is justified. Make a sketch of the Phi(2)-T diagram containing Phi(crit,2), T(crit,1-2), the binodals and spinodals.<br /> #Figure 3.27 is given and a graph that demonstrates the linear behavior between 1/l and Tm. In several steps you are guided towards deriving the Gibbs-Thomson-Tammann equation.<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Compare anionic and cationic ROP in terms of: monomers, initiators, propagation, transfer, termination and their ceiling temperature.<br /> #Discuss, based on the structure of vinyl monomers, in what way they can be polymerized. Relate the stability of the active species to Rp and discuss retardation and inhibition.<br /> #Discuss briefly how conversion and molar mass relate to each other in step-growth polymerization.<br /> <br /> ===27 augustus 2022===<br /> ====Prof. Nies====<br /> #Grafiek van specific volume relaxation uitleggen<br /> #Gibbs-Thomson equation afleiden<br /> #Polymer in solvent is cooled, binodal/spinodal and Tg curves zijn gegeven. 1) Leg uit wat je denkt dat er zal gebeuren, 2) welke morphology denk je dat gevormd wordt voor trage vs snelle cooling? <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #free radical, anionic and cationic polymerization vergelijken op vlak van a) monomers b) termination reaction c) possibility for living polymerization<br /> #ring opening metathesis polymerization bespreken<br /> ===20 januari 2022===<br /> ====Prof. Nies====<br /> #Afleiding maken van de end to end distance van de freely rotating chain + uitleggen waarom er ⟨ .... ⟩ haakjes worden gebruikt + uitleggen wat L voor de FRC is<br /> #Gegeven formule van de gibbs vrije energie van menging (FH)Flory huggins<br /> #*Wat is de thermodynamische voorwaarde voor spinodaal gedrag? + Wat is de thermodynamische voorwaarde voor kritische toestand?<br /> #*Leid ook verder af wat chi kritisch en phi kritisch zijn hieruit (opnieuw afleiden!)<br /> #*Bepaal of de gegeven Tcritisch op een UCST of LCST systeem wijst <br /> #*Geef UCST en LCST namen voluit<br /> #*Teken een phi T diagram waar je de UCST of LCST van in de oefening uitlegt en uittekend<br /> #Avrami equation gegeven en eveneens een avrami plot<br /> #*Leg uit wat m en k zijn in deze vergelijking<br /> #*Leg uit wat we in deze plot zien ivm de equation, over de volledige tijdsinterval<br /> #*Teken zelf een plot volgens Avrami, waar hetzelfde polymeer (syndiotactic polystyrene) bij andere Tc was: Tc oorspronkelijke plot was 110°C, de 3 anderen waren -30°C, 105°C, 175°C --&gt; Tm en Tg van polystyreen waren gegeven!<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Definieer en bespreek living/controlled polymerization. Welke experimenten kan je uitvoeren om aan te tonen dat het gaat om een living/controlled polymerization. Bespreek de algemene methode waarop een free-radical polymerization omgezet wordt in een controlled polymerization. <br /> #Bespreek emulsion polymerization <br /> <br /> ===13 januari 2021===<br /> Verkorte examenduur omwille van corona<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Definieer en bespreek living/controlled polymerization. Welke experimenten kan je uitvoeren om aan te tonen dat het gaat om een living/controlled polymerization. Bespreek de algemene methode waarop een free-radical polymerization omgezet wordt in een controlled polymerization. <br /> #Bespreek emulsion polymerization <br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Gegeven formule van de gibbs vrije energie van menging (FH)<br /> #*Geef de betekenis van ieder symbool in de formule en de eenheid <br /> #*Wat is de thermodynamische voorwaarde voor spinodaal gedrag? <br /> #*Wat is de thermodynamische voorwaarde voor kritische toestand? <br /> #*Schrijf UCST en LCST languit <br /> #*Leidt de vergelijking van chikritisch en phikritisch af<br /> #*Oefening: berekenen Chikritisch, UCST of LCST gedrag? Tekenen fasediagram en verloop van chi in functie van de temperatuur <br /> #Leidt de vergelijking voor de average squared end-to-end distance af voor een WLC met de vergelijking voor een FRC gegeven. <br /> ===16 januari 2020===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Anionic, cationic en radical vinyl polymerisation vergelijken ivm monomeren, terminatie en mogelijkheid tot controlled/living<br /> #Step growth en chain growth vergelijken en hoe je kan bepalen wanneer je welke hebt<br /> #Metathese kort uitleggen<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Taak uitleggen (mondeling).<br /> #Gibs-Thomson-Tammann afleiden voor lamellar crystal, vergelijking voor Gibbs fusie is gegeven<br /> #Derive expression for deltaG = G(deformed) - G(undeformed). Expressions for the squared end-to-end distance for FJC and P(R)dR are given<br /> <br /> ===17 januari 2019===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Anionic, cationic en radical vinyl polymerisation vergelijken ivm monomeren, terminatie en mogelijkheid tot controlled/living<br /> #Step growth en chain growth vergelijken en hoe je kan bepalen wanneer je welke hebt<br /> #Metathese kort uitleggen<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Taak uitleggen (mondeling).<br /> #Grafiek over Tg afhankelijkheid van de cooling rate, uitleggen op moleculair niveau (met betrekking tot mobiliteit)<br /> #Afleiding radius of gyration geven (fjc), toon aan dat &lt;s²&gt;= lb² (N+1)(N-1)/6N en of de uitdrukking verandert als er interacties zijn tussen de massa's met Lennard Jones interactie potentiaal?<br /> <br /> ===14 januari 2019===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #living/controlled polymerization: definitie + uitleggen. Hoe kunt ge dat experimenteel kunt nagaan. Principe uitleggen hoe ge van free radical polymerization naar controlled polymerization gaat.<br /> #De invloed van de moleculaire structuur van vinyl polymeren op polymerisatie en op de polymerisation rate en dan ook nog op inhibitie en retardatie<br /> #bespreek emulsion polymerization<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Bespreek uw taak: gewoon uw taak uitleggen aan Nies (mondelinge vraag)<br /> #plot van volumeverandering i.f.v. de tijd (case2-figuur 25) gegeven, bespreek ... (physical ageing)<br /> #afleiding voor de Thomson-Tammann smelttemperatuur van een eindig sfeer kristal, met de fusie Gibbs vrij energie van een oneindig groot kristal gegeven<br /> <br /> ===31 januari 2018===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Anionic versus cationic ring opening polymerization:<br /> #*monomeer<br /> #*intiator<br /> #*general polymerization mechanism<br /> #*termination + transfer<br /> #*ceiling temperature<br /> #Influence of the molecular structure of vinyl monomers on possibility to polymerize. Correlate the molecular structure with:<br /> #*the way monomers can be polymerized<br /> #*rate of polymerization<br /> #*retardation + inhibition<br /> #Influence of conversion on molar mass in step growth polymerization<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Formula growth rate given (case 3 eq. 1.28)<br /> #*discuss the origin of the exponential facors and the front factor in the given equation.<br /> #*discuss dependence of the growth rate on the size of the crystal at a chosen crystallization temperature. Make a schematic plot of the predicted growth rate versus the crystal size for the chosen crystallization temperature.<br /> #*what are the consequences for the predicted growth rate for crystallization behaviour at a particular crystallization temperature?<br /> #Figure volume relaxation (case 2 figure 27)<br /> #Rubbers<br /> #*Define an ideal rubber<br /> #*Derive expression for deltaG = G(deformed) - G(undeformed)<br /> Expressions for the squared end-to-end distance for FJC and P(R)dR are given<br /> <br /> ===25 januari 2018===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #ceiling temperature vergelijken bij vinyl polymerization en ring opening polymerization + kleine bijvragen daarover<br /> #controlled radical polymerization (NMP en ATRP)<br /> #living cationic polymerization<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #grafiek spinodal, binodal (die met Berghman's point) toegepast op PDLC, vorming van PDLC uitleggen aan de hand van grafiek<br /> #physical ageing<br /> #avrami plot<br /> <br /> ===19 januari 2018===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #anionic, cationic en radical vinyl polymerisation vergelijken ivm monomeren, terminatie en mogelijkheid tot controlled/living<br /> #step growth en chain growth vergelijken en hoe ge kunt bepalen wanneer ge wa hebt<br /> #ROMP uitleggen<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #taak bespreken (mondeling)<br /> #Gibs-Thomson-Tammann afleiden voor lamellar crystal, vergelijking voor Gibbs fusie is gegeven<br /> #spinodal en critical condition geven + afleiden helemaal en berekenen wat de critische waarden zijn voor 'chi' en 'fi-2', vergelijking Gibbs gegeven<br /> Huggings formule gegeven (niet in boek) is een uitbreiding van Flory-huggings vergelijking, wanneer zijn die aan elkaar gelijk en wat is de betekenis dan<br /> <br /> ===15 januari 2018===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #living/controlled polymerization: definitie + uitleggen. Hoe kunt ge dat experimenteel kunt nagaan. Principe uitleggen hoe ge van free radical polymerization naar controlled polymerization gaat.<br /> #De invloed van de moleculaire structuur van vinyl polymeren op polymerisatie en op de polymerisation rate en dan ook nog op inhibitie en retardatie<br /> #bespreek emulsion polymerization<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Bespreek uw taak: gewoon uw taak uitleggen aan Nies (mondelinge vraag)<br /> #plot van volumeverandering i.f.v. de tijd (case2-figuur 25) gegeven, bespreek ... (physical ageing)<br /> #afleiding voor de Thomson-Tammann smelttemperatuur van een eindig sfeer kristal, met de fusie Gibbs vrij energie van een oneindig groot kristal gegeven<br /> <br /> ===25 augustus 2017===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Vergelijk anionische ring opening polymerizatie met kationische ring opening polymerizatie op vlak van<br /> #*monomeer<br /> #*intiator<br /> #*mechanisme<br /> #*terminatie/recombinatie<br /> #*ceiling temperature<br /> #Lewis Mayo en die R ratio's daar in. Welke dingen invloed daar op hebben en hoe + voorbeeld<br /> #Welk invloed heeft de vorderingsgraad op molaire massa in step growth polymerizatie?<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #(mondelinge vraag) bespreek grafiek en waarom dat dit gebeurt (uitleggen op moleculair niveau), grafiek van physical ageing<br /> #Afleiding van hoofdstuk 4 Gibbs vrije energie wanneer een ideaal rubber deformatie ondergaat<br /> #vanalles van UCST en LCST, iets vaags.<br /> <br /> <br /> ===20 januari 2017===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Anionische, kationische en frp uitleggen obv monomeer, terminatie en hoe ge het levend kunt maken<br /> #Step growth en chain growth<br /> #Ringopening methatese<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> Vraag 1:<br /> #Wat is de definitie van een FRC?<br /> #Bij welke condities is de FRC gelijk aan de FJC<br /> #Bereken Lk en Nk voor de limiet van een enorm lange FRC (&lt;R2&gt;frc gegeven)<br /> #Leidt een vergelijking af voor de mean squared end-to-end distance van een ideaal lineair diblock copolymeer bestaande uit Nk1 Kuhn monomeren met lengte lk dat vasthangt via 1 einde aan Nk2 Kuhn monomeren met lengte lk2<br /> Vraag 2:<br /> #Mengsel van PS in methylcyclohexaan (Mw = 355kg/mol)<br /> Bij T=350K bestaat het mengsel uit 1 homogene vloeibare fase. Deze T is 6K boven de flory T. Polymeer volume fractie in de homogene fase is O,2<br /> Bij T=335K: twee vloeibare fases, de polymeer volume fracties van de coexistant fases zijn 0,003 en 0,435<br /> In de compositie range {0,002-0,044} en {0,336-0,435} is de structuur van de initiele fase scheiding kleine druppels in een matrix fase<br /> #*Schets het verloop van delta Gmix ifv de volledige compositierange bij T=333K<br /> #*Duid de points of interest in deze curve aan en leg ze uit.<br /> #*Leg tot he point uit waarom je vraag a zo geschetst hebt<br /> #*Wat zal de morfologie zijn in de initiële fase van scheiding?<br /> <br /> <br /> ===19 Januari 2017===<br /> ====Prof. Koekcelberghs====<br /> #Vergelijken ven anionische en kationische ringopeningpolymerisatie op vlak van<br /> #*Initiatie/Initiatoren<br /> #*Terminatie/transfer<br /> #*Mechanisme<br /> #*Mogelijke monomeren<br /> #*Ceiling temperature<br /> #Geef de factoren die een copolymerisatie beïnvloeden <br /> #Geef de invloed van de conversie bij een step-growth polymerisatie<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Vraag 1: bespreek je taak helemaal (mondeling)<br /> #Vraag 2: Leid het verschil in Gibbs vrije energie voor een vervormd en onvervormd ideaal rubber af. End-to-end distance van een ideaal rubber en de Gaussische distributie zijn gegeven.<br /> #Vraag 3: Gegeven een stelling die zegt dat er een closed-gap miscibility gap plaatsvindt, met een formule voor chi in functie van T. 2 kritische waarden voor de temperatuur zijn gegeven. De vraag is: kan deze stelling kloppen? <br /> <br /> <br /> ===16 januari 2017===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #living/controlled polymerization: definitie + uitleggen. Hoe kunt ge dat experimenteel kunt nagaan. Principe uitleggen hoe ge van free radical polymerization naar controlled polymerization gaat.<br /> #De invloed van de moleculaire structuur van vinyl polymeren op polymerisatie en op de polymerisation rate en dan ook nog op inhibitie en retardatie<br /> #bespreek emulsion polymerization<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Bespreek uw taak: gewoon uw taak uitleggen aan Nies (mondelinge vraag)<br /> #zie theoretical questions doc case 3 vraag 13, maar alleen de excess Gibbs energy en de chemical potentials waren gegeven<br /> #Vraag 3:<br /> #*thermodynamische uitdrukking voor spinodal en critical conditions afleiden.<br /> #*zie theoretical questions doc case 2 vraag 4 en de uitdrukking voor de Gibbs energy is gegeven<br /> #*de verbeterde Huggins uitdrukking voor de Gibbs energy is gegeven en daarvoor de enthalipsche en entropische bijdragen bepalen.<br /> #*De FH uitdrukking is een speciaal geval van de Huggins uitdrukking: bepaal de conditie van y waarvoor dit geld + geef de fysische betekenis van die conditie<br /> <br /> ===14 januari 2016===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Vergelijk chemisch geïnitieerde FRP en ATR op vlak van:<br /> #*Algemeen protocol<br /> #*Snelheidsvergelijkingen<br /> #*Invloed van de moleculaire structuur op de snelheid van polymerisatie<br /> #Leg uit: step growth en chain growth polymerisatie. Hoe kan je experimenteel onderscheid maken tussen beide?<br /> #Leg kort uit: Ziegler-Nattakatalysator<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Gegeven: Tg in functie van cooling rate. Verklaar de moleculaire oorsprong van dit fenomeen. (oral)<br /> #*Mondelinge bijvraag: wat bepaalt, naast de kinetische energie, ook mee het vrije volume?<br /> #Leid een formule af voor het smeltpunt van een eindig sferisch kristal.<br /> #Vrije energie van mengen volgens Flory-Huggins gegeven:<br /> #*Wat zijn de spinodale en kristische voorwaarden?<br /> #*Geef de betekenis en eenheiden van elke parameter in de vergelijking.<br /> #*Geef een concrete uitdrukking voor de kritische en spinodale voorwaarden afgeleid uit de bovenstaande vergelijking.<br /> #*Geef een concrete uitdrukking voor de kritische phi en chi.<br /> #*Gegeven een uitgebreide variant van de vergelijking van Flory en Huggins. Wat zijn de enthalpische en entropische bijdragen?<br /> #*De oorspronkelijke formule van Flory en Huggins is een bijzonder geval van de bovenstaande vergelijking. Onder welke voorwaarde is dit en waarmee komt dit fysisch overeen?<br /> <br /> ===11 januari 2016===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Define living/controlled polymerisation. Hoe neem je dit experimenteel waar? Hoe maak je free radical controlled?<br /> #Wat is de invloed van moleculaire structuur van monomeer op manier vinylpolymerisatie, snelheid en retardation/inhibition?<br /> #Bespreek emulsiepolymerisatie.<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Case 2, figuur 27 uitleggen (specifiek volume in functie van tijd) (oral)<br /> #Leid Gibbs Thomson uitdrukking af voor smelttemperatuur van sferisch kristal.<br /> #Uitdrukking s^2 en massacentrum gegeven:<br /> #*Leid average radius of gyration af met alles massa's = m.<br /> #*Toon aan dat average radius of gyration = lb^2 (N+1)(N-1)/6N als i=1,2,3,...,N-1.<br /> #*Veranderen de uitdrukking als er interacties zijn tussen de massa's met Lennard Jones interactie potentiaal?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Discuss the ceiling temperature and apply it on both the vinyl polymerization and ring opening polymerization. Is the ceiling temperature of a particular monomer dependent on the way it's polymerized?<br /> Is it possible that a particular monomer, of which the ceiling temperature is such that only low-molar mass oligomers can be obtained via a living anionic polymerization at a certain temperature, can be polymerized into high-molar mass polymer using a free radical polymerization at the same temperature? Motivate your anwer.<br /> #Explain the principle of a controlled radical polymerization and apply it on NMP and ATRP.<br /> #Discuss briefly the living cationic vinyl polymerization.<br /> ====Prof. Nies====<br /> Zie onderstaande afbeelding.<br /> [ <br /> #Assignment 1 (oral)<br /> #The &amp;lt;i&amp;gt;free rotating chain&amp;lt;/i&amp;gt; (FRC) consists of N bonding vectors l&amp;lt;sub&amp;gt;i&amp;lt;/sub&amp;gt;, i=1,...,N with constant bond length |l&amp;lt;sub&amp;gt;i&amp;lt;/sub&amp;gt;| = l&amp;lt;sub&amp;gt;b&amp;lt;/sub&amp;gt; and constant bond angles Ï´&amp;lt;sub&amp;gt;ii+1&amp;lt;/sub&amp;gt;=Ï´, i=1,...,N between the successive bonding vectors. The average quadratic end-to-end distance &amp;lt;R²&amp;gt;, valid for all physically sensible values of N, l&amp;lt;sub&amp;gt;b&amp;lt;/sub&amp;gt; and Ï´, is given by [[Bestand:R-FRC.JPG]]<br /> #*Show that the average quadratic end-to-end distance &amp;lt;R²&amp;gt; of the FRC chain with very small bond angles also can be written in the Kratky-Porod chain form: &amp;lt;R²&amp;gt; = 2l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;L-2l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;²(1-exp(-L/l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;),<br /> with l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;=l&amp;lt;sub&amp;gt;b&amp;lt;/sub&amp;gt;L/(1-cosÏ´) the perstistence length and L the contour length.<br /> #Derive from the general thermodynamic equilibrium conditions the melting point of a polymer crystal in equilibrium with a solution of the polymer.<br /> For the polymer solution you can use the Flory-Huggins excess Gibbs-energy of mixing.<br /> [[Bestand:G(mix).JPG]]<br /> <br /> The chemical potentials of the components are given by:<br /> [[Bestand:Chempot.JPG]] ]<br /> <br /> [[Bestand:240113nies.png]]<br /> <br /> ===18 januari 2013===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Compare chemically initiated free radical polymerization and ATRP, for the following aspects:<br /> #*general concept<br /> #*rate of polymerization<br /> #*influence of molecule structure on polymerization rate<br /> #Discuss the differences in mechanism of chain growth and step growth polymerization. How can one investigate which type of polymerization he is dealing with?<br /> #Explain briefly: Ziegler-Natta catalyst<br /> ====Prof. Nies====<br /> #Discussion of assignment 1 (oral)<br /> <br /> Zie onderstaande afbeelding.<br /> <br /> #The expression of average squared end-to-end distance of the Kratky-Porod chain is given: &amp;lt;R²&amp;gt; = 2l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;L - 2l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;²(1-exp(-L/l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;)<br /> #*Derive expressions for the Kuhn segment length and the number of Kuhn segments for this chain.<br /> #*Discuss your results. For instance, did you make any assumptions? Mention them explicitly.<br /> #The excess Gibbs ebergy of mixing in the Flory-Huggins model is given: ΔG/N&amp;lt;sub&amp;gt;l&amp;lt;/sub&amp;gt;kT = Δg/kT = (φ&amp;lt;sub&amp;gt;1&amp;lt;/sub&amp;gt;/s&amp;lt;sub&amp;gt;1&amp;lt;/sub&amp;gt;)lnφ&amp;lt;sub&amp;gt;1&amp;lt;/sub&amp;gt; + (φ&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt;/s&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt;)lnφ&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt; + χφ&amp;lt;sub&amp;gt;1&amp;lt;/sub&amp;gt;φ&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt;<br /> #*Derive expressions for the spinodal and critical conditions.<br /> #*Derive from these expressions the formulae for the critical composition φ&amp;lt;sub&amp;gt;2,cr&amp;lt;/sub&amp;gt; and critical value of χ.<br /> #*What is the relevance of the spinodal for material behaviour?<br /> [[Bestand:180113nies.png]]<br /> <br /> ===20 januari 2012===<br /> ====Professor Nies====<br /> #Gegeven een fase-diagram uit Case II. Wat gebeurt er als er vanuit punt A (dat links van de critical point lag):<br /> #* traag wordt afgekoeld<br /> #* wordt gequenched (1000K/min)<br /> #* Hoe ziet de oplossing er na koelen uit voor beide gevallen<br /> #5 begrippen uitleggen:<br /> #*Thermo-elastische inversie<br /> #*Physical ageing<br /> #*Second order transition<br /> #*Effective pair potential<br /> #*Nucleation &amp;amp; growth<br /> #Leidt de spinodal en critical conditions af en ook de waarden voor Fi(2,crit) en Chi(krit).<br /> <br /> ====Professor Koeckelberghs====<br /> #Wat is de ceiling temperatuur en correleer dit met vinylpolymerisatie en Ring opening polymerisatie. Is de ceiling temperatuur afhankelijk van hoe we polymeriseren? Stel we polymeriseren via een living anionische polymerisatie. Het monomeer heeft een lage ceiling temperatuur, wat ervoor zorgt dat er geen lange polymeerketens worden gevormd. Kan men dan langere ketens verkrijgen als men bij dezelfde temperatuur via een radicale polymerisatie polymeriseert?<br /> #M1 en M2 worden gecopolymeriseerd. Geef de parameters voor beide monomeren en leg uit waarvan deze afhangen.<br /> # Leg uit: (radicalaire) emulsiepolymerisatie<br /> <br /> ===21 januari 2011===<br /> ====Professor Nies====<br /> # Teken het verloop van de de gibssvrij-energie in functie van volumefractie bij een temperatuur van 300K. Volumefracties = 0,2. Coexistence points en spinodal points gegeven. Ook de verschillende punten aanduiden en kort uitleggen. (deze vraag was mondeling)<br /> # Formule p 50 case 1 gegeven (zonder 4e term)<br /> #* leg de symbolen uit + dimensies + eenheden<br /> #* wat bedoelt men met &amp;quot;volgens de Flory benadering...&amp;quot;<br /> #* leg de twee verschillende termen uit<br /> #* Bereken end-to-end distance in evenwicht bij een flory-solvent<br /> #* Bereken end-to-end distance in evenwicht bij een goed solvent<br /> # Avramiplot+vergelijking gegeven<br /> #*leg de parameters uit<br /> #*hoe kan je volumefractie kristallijne fase meten, leg kort techniek uit.<br /> #*geef een kwalitatieve bespreking van de grafiek<br /> #*wat kan je uit de parameters afleiden<br /> <br /> ====Professor Koeckelberghs====<br /> # zie vragen vorig jaar<br /> <br /> ===15 januari 2010===<br /> ====Professor Nies====<br /> #Er was de grafiek gegeven met daarop de binodal, spinodal en Tg curve. Met daarop 3 punten aangegeven, telkens in het homogene gebied boven de binodal en boven Tg. Punt A: Links van kritische punt, punt B tussen kritische punt en Berghmans punt en punt C rechts van Berghmanspunt. (Alleen deze vraag mondeling)<br /> #*Wat vindt plaats als je in punt A traag afkoelt?<br /> #*Wat vindt plaats als je in punt A afkoelt met 1000K/min<br /> #*Wat vindt plaats als je in punt B traag afkoelt<br /> #*Wat vindt plaats als je in punt B afkoelt met 1000K/min<br /> #*Wat vindt plaats als je in punt C traag afkoelt?<br /> #*Wat vindt plaats als je in punt C afkoelt met 1000K/min<br /> #Vergelijking van Groeisnelheid bij kristallisatie (U) gegeven: U=Fexp(A)exp(B)exp(C) Zowel F,A,B,C waren gegeven in symbolen(vergelijking onder 7.B case III)<br /> #*Geef waarvoor de symbolen staan en wat hun eenheden zijn.<br /> #*Verklaar waar de Frontfactor (F) en de drie exp's vandaan komen<br /> #*Bespreek temperatuursafhankelijkheid en geef een schets<br /> #Geef de definitie van een ideale Rubber<br /> #* Leid de uitdrukking voor af voor S bij een willekeurige verandering. P(R) gegeven<br /> <br /> ====Koeckelberghs====<br /> #Vergelijk radicalaire, anionische en kationische vinylpolymerisatie<br /> #*Mogelijke monomere deeltjes (stabiliteit)<br /> #*Terminatie reacties<br /> #*Invloed van verschillende voorkomende deeltjes op sneldheid (hiermee bedoelde hij de associated ion pairs etc)<br /> #*Mogelijke manier om ze 'levend' te maken. (of quasi levend)<br /> #*? dacht dat er nog 1 was<br /> #Je wil een ideaal, perfect blockcopolymeer maken van MMA en MA op anionische wijze. Welk monomeer moet je eerst polymeriseren? Blijft indien je dit met ATRP wil doen de volgorde dezelfde?<br /> #Bespreek kort Ring Opening Metathesis Polymerisatie.</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Polymer_Sciences:_from_Synthesis_to_Polymer_Material&diff=4859 2026-01-12T16:03:55Z

<p>R0857325: </p> <hr /> <div>[[Categorie:Machemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Sinds 2023-2024 heeft professor Nies dit vak langs zich gelegd. Het deel Physical Chemistry is nu verdeeld tussen professor Ianiro (deel Physical Chemistry) en professor Goderis (deel Crystallization).<br /> We gaan er daarom vanuit dat alle voorgaande vragen van professor Nies waardeloos zijn voor reference. Ianiro heeft delen van de leerstof ook aangepast. Dus je zal moeten zien welke vragen goede oefeningen zijn.<br /> Professor Koeckelberghs zijn deel Polymer Chemistry is nog steeds hetzelfde. <br /> Dezelfde cesuur is nog steeds van kracht. Haal minimaal 9/20 voor deel Physics (2/3 totaal punt) en 9/20 op deel Chemistry (1/3 totaal punt), of haal maximum een 9/20 in totaal.<br /> <br /> (Voor '23-'24: Gedoceerd door Professor Nies en Professor Koeckelberghs. Lessen zijn altijd in het Engels. De verdeling is 2/3 op het deel van Nies en 1/3 op het deel van Koeckelberghs. Bij Nies zijn er ook verplichte assignments tijdens het jaar, die meetellen voor een fractie 4/(12-N) van de punten van zijn deel (met N aantal assignments, doorgaans 2). Nies zijn examen is gesloten boek en er moet maar één vraag bij hem mondeling besproken worden (deze wordt op voorhand aangeduid). Bij Koeckelberghs zijn alle vragen mondeling te bespreken.)<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===12/01/2026 ===<br /> ====Prof. Ianiro====<br /> #8 multiple choice questions (0.5 point per question, no gis-correction)<br /> #(6p) critical parameter, discuss its limiting values for polymer solution,blend. Why can polymer solutions be homogeneous even if weak repulsion is present?<br /> #(10p) A gel is an elastomeric network swollen with solvent. The equilibrium volume fraction of solvent in the network when the gel is immersed in a reservoir of solvent can be calculated by solving the following equation numerically: (see document on Toledo for the right equation) where 𝑘 is the number of chain strands in the network and 𝑣0 is the volume of a solvent molecule. Describe the procedure to derive this equation. Remember that the volume of the dry network is 𝑉P and is different from the swollen volume. A qualitative but very detailed step-by-step description of the derivation is sufficient. A mathematical derivation is also OK<br /> #(20p) Morphology of self-assembled structures in selective solvent. What are the determining factors for morphology selection? Provide a thermodynamic description of block copolymer solution self-assembly using the approach. Describe the critical micelle concentration (in forumula or in words).<br /> #Crystallization: Describe the melting thermodynamics of lamellar crystals and the dependence of the observed melting temperature on the lamellar thickness.<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Compare free radical, anionic and cationic vinyl polymerization concerning the monomers used, termination, the possibility/ how to turn the polymerization into a living polymerization and T ceiling<br /> #Discuss ROMP<br /> <br /> <br /> ===04/09/2025===<br /> ====Prof. Ianiro====<br /> #Multiple choice: formula Mn, formula R_(RMS,FRC), formula spinodal, density of specific brush, counterion condensation, depletion layers around colloidals, BCP self assembly of amphiphilic BCPs in selective solvent<br /> #Derive delta F_NET = 1/2*k_B*T*k/V*(lambda x² + lambda y² + lambda z² -3). Formulas P(R(x,y,z),N) and vector R(x,y,z) given<br /> #Spinodal diagram: give all parts, give all formulas, give all phase separation mechanisms, T-dependence of interaction paramter chi_AB<br /> #Thermodynamics of melting of lamellar crystal. Mention/derive Gibbs-Thomson-Tamman equation. Assume delta H^m &amp; delta S^m do not change.<br /> ##(not completely mathematically, professor didn't know the GTT-equation from memory himself lol). Part of derivation about &quot;Melting bulk crystal&quot; was important.<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Discuss Tceil: apply on vinyl and ROP polymers. Does Tc depend on the polymerization type for a specific monomer? Is Tc equally applicable for radical and controlled radical polymerization for a specific monomer?<br /> #Discuss influence of molecular structure of vinyl monomer on chance to be polymerized. Correlate monomer structure with ways to be polymerized, rate of polymerization, retardation and inhibition.<br /> #Discuss living cationic vinyl polymerization.<br /> <br /> ===20/01/2025 Morning===<br /> ====Prof. Ianiro====<br /> #8 multiple choice questions (0.5 point per question, no gis-correction)<br /> #*Scaling of R with N for ideal and real chain, scaling of viscosity with N, excluded volume, F-H parameter, critical parameter in blend vs solution<br /> #(8p) A gel is an elastomeric network swollen with solvent. The equilibrium volume fraction of solvent in the network when the gel is immersed in a reservoir of solvent can be calculated by solving the following equation numerically: (see document on Toledo for the right equation) where 𝑘 is the number of chain strands in the network and 𝑣0 is the volume of a solvent molecule. Describe the procedure to derive this equation. Remember that the volume of the dry network is 𝑉P and is different from the swollen volume. A qualitative but very detailed step-by-step description of the derivation is sufficient. A mathematical derivation is also OK<br /> #(8p) Morphology of self-assembled structures in selective solvent. What are the determining factors for morphology selection? Provide a thermodynamic description of block copolymer solution self-assembly using the approach. Describe the critical micelle concentration (in forumula or in words).<br /> #Crystallization: Describe the melting thermodynamics of lamellar crystals and the dependence of the observed melting temperature on the lamellar thickness.<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Compare free radical, anionic and cationic vinyl polymerization concerning the monomers used, termination and the possibility and way to turn the polymerization into a living polymerization.<br /> #For a copolymerisation with monomers M1 and M2, define the copolymerization parameters (he means r1 and r2). What factors have an influence on this parameter? Give an example.<br /> #Discuss RAFT polymerisation.<br /> <br /> ===17/01/2025 Morning===<br /> ====Prof. Ianiro====<br /> # 8 multiple choice questions, half point each. No GIS-correction. <br /> # (cristallization) Describe a strategy to model the kinetics of formation of spherulites. What are the limitations of this strategy? Provide a solution to the equation for the early stages of the process assuming instantaneous nucleation followed by growth.<br /> # (6pt) Describe how the critical parameter (Formula given) can be derived and discuss its limiting value for large chain lengths in the case of polymer solutions and blends. Why polymer solutions can be homogeneous even if weak repulsion is present while neat attraction is needed for a polymer blend to be homogeneous? <br /> # (10pt) Starting from the Flory-Huggins free-energy of mixing (formula given) derive the free energy change of a polymer-colloid mixture when the depletion layers around the colloidal particles overlap (formula given) In the equations above, � denotes the volume fraction, � denotes the chain length (number of monomers), � DC is the interaction parameter, �2AB is the lattice volume, �Q is the number of polymer molecules, �:RIH2AJ is the overlapping volume, �P is the accessible volume in the absence of overlap.<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> # (10pt) What is living/controlled polymerisation? How to experimentally test if a polymer is living controlled? How can a Free Radical Polymerisation become controlled?<br /> # (6pt) Vinyl monomer. What are the requirements to be able to polymerise? What kind of polymerisations are there? How does the structure affect the polymerisation rate?<br /> # (4pt) Explain emulsion polymerisation briefly.<br /> <br /> ===19th of January 2024 Afternoon===<br /> ====Prof. Ianiro====<br /> # 8 Multiple choice questions, half a point each. No GIS-correction:<br /> #*formula Mn, formula Rrms, formula spinodal curve, definition counterion condensation, formula CHIcritical of long poly chain, density of brush layer (densely grafted, flat, good solvent),...<br /> #Keeping in mind that volume fractions and probabilities are connected, derive the Flory-Huggins enthalpy of mixing in a lattice with number of nearest neighbors 𝑧 and with interaction energies 𝜀AB, 𝜀AA, 𝜀BB.<br /> #Explain how polymers behave in the bulk and discuss the concept of relaxation time remembering that the diffusion coefficient is defined by Stokes-Einstein relation 𝐷 = 𝑘B𝑇/𝜁. Where 𝜁 is the friction coefficient, and that the time needed to diffuse of a distance 𝑥 is 𝑡 = 𝑥^2/6𝐷. Link the relaxation time to the rheological behavior of polymers and to the different viscosity (scaling) regimes that can be observed as a function of the chain length 𝑁.<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Compare free radical, anionic and cationic vinyl polymerization concerning the monomers used, termination and the possibility and way to turn the polymerization into a living polymerization.<br /> #Explain difference chain- and step-growth. How do we demonstrate which one we have?<br /> #Discuss ROMP.<br /> <br /> ====Prof. Goderis====<br /> #Lamella with surface X,Y, depth l. How is Tm related to l (derivation). Image given.<br /> #Explain shortly how the thickness of a lamella can be measures using X-ray christallography.<br /> #The image in exercise 1 is an ideal respresentation of a polymer crystal. What does it actually look like in a polymer melt?<br /> <br /> ===19th of January 2024 Morning===<br /> ====Prof. Ianiro====<br /> #8 multiple choice questions, half a point each. No GIS-correction.<br /> #Given the entropy: S = -kb(3→R.→R/(2*l^2*N)). For a generic vector: →v^2 = vx^2 + vy^2 + vz^2. Derive the entropy change when a chain is deformed in an arbitrary direction. Describe how to use this to calculate the entropy change upon deformation of a network of k randomly oriented polymer strands.<br /> #What is excl. Volume? How to calculate it, how does it relate to interaction between monomers of real chain? What is the FH-interaction parameter ChiAB and how is it defined? What is the relationship between excl vol and FH-interaction parameter?<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #What is living/controlled polymerisation? How to experimentally test if a polymer is living controlled? How can a Free Radical Polymerisation become controlled?<br /> #Vinyl monomer. What are the requirements to be able to polymerise? What kind of polymerisations are there? How does the structure affect the polymerisation rate?<br /> #Explain emulsion polymerisation briefly.<br /> <br /> ====Prof. Goderis====<br /> #Lamella with surface X,Y, depth l. How is Tm related to l (derivation). [This is slide 73-74 of prof Goderis.] Image given.<br /> #Explain shortly how the thickness of a lamella can be measures using X-ray christallography.<br /> #The image in exercise 1 is an ideal respresentation of a polymer crystal. What does it actually look like in a polymer melt?<br /> <br /> ===20th of January 2023===<br /> ====Prof. Nies====<br /> #Eq. 1.40 is given. Discuss the limiting behavior for L&lt;&lt;lp and L&gt;&gt;lp. The Kuhn length was defined by two equations. Write them down and give a qualitative description. Based on this, give the relationship between lK and lp. Can a chain with L&lt;&lt;lp also be seen as Kuhn chain? Explain.<br /> #Scientist claim that a polymer in solution shows a Phi(2)-T diagram with a closed loop miscibility hole. Chi(crit,1-2) are given as are T(crit,1-2). The values of Chi(0), Chi(1) and Chi(2) are provided too (Eq. 2.19). From this, calculate s2 and Phi(crit,1-2). Show either qualitatively of quantitatively if their reasoning for a closed loop miscibility hole is justified. Make a sketch of the Phi(2)-T diagram containing Phi(crit,2), T(crit,1-2), the binodals and spinodals.<br /> #Figure 3.27 is given and a graph that demonstrates the linear behavior between 1/l and Tm. In several steps you are guided towards deriving the Gibbs-Thomson-Tammann equation.<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Compare anionic and cationic ROP in terms of: monomers, initiators, propagation, transfer, termination and their ceiling temperature.<br /> #Discuss, based on the structure of vinyl monomers, in what way they can be polymerized. Relate the stability of the active species to Rp and discuss retardation and inhibition.<br /> #Discuss briefly how conversion and molar mass relate to each other in step-growth polymerization.<br /> <br /> ===27 augustus 2022===<br /> ====Prof. Nies====<br /> #Grafiek van specific volume relaxation uitleggen<br /> #Gibbs-Thomson equation afleiden<br /> #Polymer in solvent is cooled, binodal/spinodal and Tg curves zijn gegeven. 1) Leg uit wat je denkt dat er zal gebeuren, 2) welke morphology denk je dat gevormd wordt voor trage vs snelle cooling? <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #free radical, anionic and cationic polymerization vergelijken op vlak van a) monomers b) termination reaction c) possibility for living polymerization<br /> #ring opening metathesis polymerization bespreken<br /> ===20 januari 2022===<br /> ====Prof. Nies====<br /> #Afleiding maken van de end to end distance van de freely rotating chain + uitleggen waarom er ⟨ .... ⟩ haakjes worden gebruikt + uitleggen wat L voor de FRC is<br /> #Gegeven formule van de gibbs vrije energie van menging (FH)Flory huggins<br /> #*Wat is de thermodynamische voorwaarde voor spinodaal gedrag? + Wat is de thermodynamische voorwaarde voor kritische toestand?<br /> #*Leid ook verder af wat chi kritisch en phi kritisch zijn hieruit (opnieuw afleiden!)<br /> #*Bepaal of de gegeven Tcritisch op een UCST of LCST systeem wijst <br /> #*Geef UCST en LCST namen voluit<br /> #*Teken een phi T diagram waar je de UCST of LCST van in de oefening uitlegt en uittekend<br /> #Avrami equation gegeven en eveneens een avrami plot<br /> #*Leg uit wat m en k zijn in deze vergelijking<br /> #*Leg uit wat we in deze plot zien ivm de equation, over de volledige tijdsinterval<br /> #*Teken zelf een plot volgens Avrami, waar hetzelfde polymeer (syndiotactic polystyrene) bij andere Tc was: Tc oorspronkelijke plot was 110°C, de 3 anderen waren -30°C, 105°C, 175°C --&gt; Tm en Tg van polystyreen waren gegeven!<br /> <br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Definieer en bespreek living/controlled polymerization. Welke experimenten kan je uitvoeren om aan te tonen dat het gaat om een living/controlled polymerization. Bespreek de algemene methode waarop een free-radical polymerization omgezet wordt in een controlled polymerization. <br /> #Bespreek emulsion polymerization <br /> <br /> ===13 januari 2021===<br /> Verkorte examenduur omwille van corona<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Definieer en bespreek living/controlled polymerization. Welke experimenten kan je uitvoeren om aan te tonen dat het gaat om een living/controlled polymerization. Bespreek de algemene methode waarop een free-radical polymerization omgezet wordt in een controlled polymerization. <br /> #Bespreek emulsion polymerization <br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Gegeven formule van de gibbs vrije energie van menging (FH)<br /> #*Geef de betekenis van ieder symbool in de formule en de eenheid <br /> #*Wat is de thermodynamische voorwaarde voor spinodaal gedrag? <br /> #*Wat is de thermodynamische voorwaarde voor kritische toestand? <br /> #*Schrijf UCST en LCST languit <br /> #*Leidt de vergelijking van chikritisch en phikritisch af<br /> #*Oefening: berekenen Chikritisch, UCST of LCST gedrag? Tekenen fasediagram en verloop van chi in functie van de temperatuur <br /> #Leidt de vergelijking voor de average squared end-to-end distance af voor een WLC met de vergelijking voor een FRC gegeven. <br /> ===16 januari 2020===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Anionic, cationic en radical vinyl polymerisation vergelijken ivm monomeren, terminatie en mogelijkheid tot controlled/living<br /> #Step growth en chain growth vergelijken en hoe je kan bepalen wanneer je welke hebt<br /> #Metathese kort uitleggen<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Taak uitleggen (mondeling).<br /> #Gibs-Thomson-Tammann afleiden voor lamellar crystal, vergelijking voor Gibbs fusie is gegeven<br /> #Derive expression for deltaG = G(deformed) - G(undeformed). Expressions for the squared end-to-end distance for FJC and P(R)dR are given<br /> <br /> ===17 januari 2019===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Anionic, cationic en radical vinyl polymerisation vergelijken ivm monomeren, terminatie en mogelijkheid tot controlled/living<br /> #Step growth en chain growth vergelijken en hoe je kan bepalen wanneer je welke hebt<br /> #Metathese kort uitleggen<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Taak uitleggen (mondeling).<br /> #Grafiek over Tg afhankelijkheid van de cooling rate, uitleggen op moleculair niveau (met betrekking tot mobiliteit)<br /> #Afleiding radius of gyration geven (fjc), toon aan dat &lt;s²&gt;= lb² (N+1)(N-1)/6N en of de uitdrukking verandert als er interacties zijn tussen de massa's met Lennard Jones interactie potentiaal?<br /> <br /> ===14 januari 2019===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #living/controlled polymerization: definitie + uitleggen. Hoe kunt ge dat experimenteel kunt nagaan. Principe uitleggen hoe ge van free radical polymerization naar controlled polymerization gaat.<br /> #De invloed van de moleculaire structuur van vinyl polymeren op polymerisatie en op de polymerisation rate en dan ook nog op inhibitie en retardatie<br /> #bespreek emulsion polymerization<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Bespreek uw taak: gewoon uw taak uitleggen aan Nies (mondelinge vraag)<br /> #plot van volumeverandering i.f.v. de tijd (case2-figuur 25) gegeven, bespreek ... (physical ageing)<br /> #afleiding voor de Thomson-Tammann smelttemperatuur van een eindig sfeer kristal, met de fusie Gibbs vrij energie van een oneindig groot kristal gegeven<br /> <br /> ===31 januari 2018===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Anionic versus cationic ring opening polymerization:<br /> #*monomeer<br /> #*intiator<br /> #*general polymerization mechanism<br /> #*termination + transfer<br /> #*ceiling temperature<br /> #Influence of the molecular structure of vinyl monomers on possibility to polymerize. Correlate the molecular structure with:<br /> #*the way monomers can be polymerized<br /> #*rate of polymerization<br /> #*retardation + inhibition<br /> #Influence of conversion on molar mass in step growth polymerization<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Formula growth rate given (case 3 eq. 1.28)<br /> #*discuss the origin of the exponential facors and the front factor in the given equation.<br /> #*discuss dependence of the growth rate on the size of the crystal at a chosen crystallization temperature. Make a schematic plot of the predicted growth rate versus the crystal size for the chosen crystallization temperature.<br /> #*what are the consequences for the predicted growth rate for crystallization behaviour at a particular crystallization temperature?<br /> #Figure volume relaxation (case 2 figure 27)<br /> #Rubbers<br /> #*Define an ideal rubber<br /> #*Derive expression for deltaG = G(deformed) - G(undeformed)<br /> Expressions for the squared end-to-end distance for FJC and P(R)dR are given<br /> <br /> ===25 januari 2018===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #ceiling temperature vergelijken bij vinyl polymerization en ring opening polymerization + kleine bijvragen daarover<br /> #controlled radical polymerization (NMP en ATRP)<br /> #living cationic polymerization<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #grafiek spinodal, binodal (die met Berghman's point) toegepast op PDLC, vorming van PDLC uitleggen aan de hand van grafiek<br /> #physical ageing<br /> #avrami plot<br /> <br /> ===19 januari 2018===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #anionic, cationic en radical vinyl polymerisation vergelijken ivm monomeren, terminatie en mogelijkheid tot controlled/living<br /> #step growth en chain growth vergelijken en hoe ge kunt bepalen wanneer ge wa hebt<br /> #ROMP uitleggen<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #taak bespreken (mondeling)<br /> #Gibs-Thomson-Tammann afleiden voor lamellar crystal, vergelijking voor Gibbs fusie is gegeven<br /> #spinodal en critical condition geven + afleiden helemaal en berekenen wat de critische waarden zijn voor 'chi' en 'fi-2', vergelijking Gibbs gegeven<br /> Huggings formule gegeven (niet in boek) is een uitbreiding van Flory-huggings vergelijking, wanneer zijn die aan elkaar gelijk en wat is de betekenis dan<br /> <br /> ===15 januari 2018===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #living/controlled polymerization: definitie + uitleggen. Hoe kunt ge dat experimenteel kunt nagaan. Principe uitleggen hoe ge van free radical polymerization naar controlled polymerization gaat.<br /> #De invloed van de moleculaire structuur van vinyl polymeren op polymerisatie en op de polymerisation rate en dan ook nog op inhibitie en retardatie<br /> #bespreek emulsion polymerization<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Bespreek uw taak: gewoon uw taak uitleggen aan Nies (mondelinge vraag)<br /> #plot van volumeverandering i.f.v. de tijd (case2-figuur 25) gegeven, bespreek ... (physical ageing)<br /> #afleiding voor de Thomson-Tammann smelttemperatuur van een eindig sfeer kristal, met de fusie Gibbs vrij energie van een oneindig groot kristal gegeven<br /> <br /> ===25 augustus 2017===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Vergelijk anionische ring opening polymerizatie met kationische ring opening polymerizatie op vlak van<br /> #*monomeer<br /> #*intiator<br /> #*mechanisme<br /> #*terminatie/recombinatie<br /> #*ceiling temperature<br /> #Lewis Mayo en die R ratio's daar in. Welke dingen invloed daar op hebben en hoe + voorbeeld<br /> #Welk invloed heeft de vorderingsgraad op molaire massa in step growth polymerizatie?<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #(mondelinge vraag) bespreek grafiek en waarom dat dit gebeurt (uitleggen op moleculair niveau), grafiek van physical ageing<br /> #Afleiding van hoofdstuk 4 Gibbs vrije energie wanneer een ideaal rubber deformatie ondergaat<br /> #vanalles van UCST en LCST, iets vaags.<br /> <br /> <br /> ===20 januari 2017===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Anionische, kationische en frp uitleggen obv monomeer, terminatie en hoe ge het levend kunt maken<br /> #Step growth en chain growth<br /> #Ringopening methatese<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> Vraag 1:<br /> #Wat is de definitie van een FRC?<br /> #Bij welke condities is de FRC gelijk aan de FJC<br /> #Bereken Lk en Nk voor de limiet van een enorm lange FRC (&lt;R2&gt;frc gegeven)<br /> #Leidt een vergelijking af voor de mean squared end-to-end distance van een ideaal lineair diblock copolymeer bestaande uit Nk1 Kuhn monomeren met lengte lk dat vasthangt via 1 einde aan Nk2 Kuhn monomeren met lengte lk2<br /> Vraag 2:<br /> #Mengsel van PS in methylcyclohexaan (Mw = 355kg/mol)<br /> Bij T=350K bestaat het mengsel uit 1 homogene vloeibare fase. Deze T is 6K boven de flory T. Polymeer volume fractie in de homogene fase is O,2<br /> Bij T=335K: twee vloeibare fases, de polymeer volume fracties van de coexistant fases zijn 0,003 en 0,435<br /> In de compositie range {0,002-0,044} en {0,336-0,435} is de structuur van de initiele fase scheiding kleine druppels in een matrix fase<br /> #*Schets het verloop van delta Gmix ifv de volledige compositierange bij T=333K<br /> #*Duid de points of interest in deze curve aan en leg ze uit.<br /> #*Leg tot he point uit waarom je vraag a zo geschetst hebt<br /> #*Wat zal de morfologie zijn in de initiële fase van scheiding?<br /> <br /> <br /> ===19 Januari 2017===<br /> ====Prof. Koekcelberghs====<br /> #Vergelijken ven anionische en kationische ringopeningpolymerisatie op vlak van<br /> #*Initiatie/Initiatoren<br /> #*Terminatie/transfer<br /> #*Mechanisme<br /> #*Mogelijke monomeren<br /> #*Ceiling temperature<br /> #Geef de factoren die een copolymerisatie beïnvloeden <br /> #Geef de invloed van de conversie bij een step-growth polymerisatie<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Vraag 1: bespreek je taak helemaal (mondeling)<br /> #Vraag 2: Leid het verschil in Gibbs vrije energie voor een vervormd en onvervormd ideaal rubber af. End-to-end distance van een ideaal rubber en de Gaussische distributie zijn gegeven.<br /> #Vraag 3: Gegeven een stelling die zegt dat er een closed-gap miscibility gap plaatsvindt, met een formule voor chi in functie van T. 2 kritische waarden voor de temperatuur zijn gegeven. De vraag is: kan deze stelling kloppen? <br /> <br /> <br /> ===16 januari 2017===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #living/controlled polymerization: definitie + uitleggen. Hoe kunt ge dat experimenteel kunt nagaan. Principe uitleggen hoe ge van free radical polymerization naar controlled polymerization gaat.<br /> #De invloed van de moleculaire structuur van vinyl polymeren op polymerisatie en op de polymerisation rate en dan ook nog op inhibitie en retardatie<br /> #bespreek emulsion polymerization<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Bespreek uw taak: gewoon uw taak uitleggen aan Nies (mondelinge vraag)<br /> #zie theoretical questions doc case 3 vraag 13, maar alleen de excess Gibbs energy en de chemical potentials waren gegeven<br /> #Vraag 3:<br /> #*thermodynamische uitdrukking voor spinodal en critical conditions afleiden.<br /> #*zie theoretical questions doc case 2 vraag 4 en de uitdrukking voor de Gibbs energy is gegeven<br /> #*de verbeterde Huggins uitdrukking voor de Gibbs energy is gegeven en daarvoor de enthalipsche en entropische bijdragen bepalen.<br /> #*De FH uitdrukking is een speciaal geval van de Huggins uitdrukking: bepaal de conditie van y waarvoor dit geld + geef de fysische betekenis van die conditie<br /> <br /> ===14 januari 2016===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Vergelijk chemisch geïnitieerde FRP en ATR op vlak van:<br /> #*Algemeen protocol<br /> #*Snelheidsvergelijkingen<br /> #*Invloed van de moleculaire structuur op de snelheid van polymerisatie<br /> #Leg uit: step growth en chain growth polymerisatie. Hoe kan je experimenteel onderscheid maken tussen beide?<br /> #Leg kort uit: Ziegler-Nattakatalysator<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Gegeven: Tg in functie van cooling rate. Verklaar de moleculaire oorsprong van dit fenomeen. (oral)<br /> #*Mondelinge bijvraag: wat bepaalt, naast de kinetische energie, ook mee het vrije volume?<br /> #Leid een formule af voor het smeltpunt van een eindig sferisch kristal.<br /> #Vrije energie van mengen volgens Flory-Huggins gegeven:<br /> #*Wat zijn de spinodale en kristische voorwaarden?<br /> #*Geef de betekenis en eenheiden van elke parameter in de vergelijking.<br /> #*Geef een concrete uitdrukking voor de kritische en spinodale voorwaarden afgeleid uit de bovenstaande vergelijking.<br /> #*Geef een concrete uitdrukking voor de kritische phi en chi.<br /> #*Gegeven een uitgebreide variant van de vergelijking van Flory en Huggins. Wat zijn de enthalpische en entropische bijdragen?<br /> #*De oorspronkelijke formule van Flory en Huggins is een bijzonder geval van de bovenstaande vergelijking. Onder welke voorwaarde is dit en waarmee komt dit fysisch overeen?<br /> <br /> ===11 januari 2016===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Define living/controlled polymerisation. Hoe neem je dit experimenteel waar? Hoe maak je free radical controlled?<br /> #Wat is de invloed van moleculaire structuur van monomeer op manier vinylpolymerisatie, snelheid en retardation/inhibition?<br /> #Bespreek emulsiepolymerisatie.<br /> <br /> ====Prof. Nies====<br /> #Case 2, figuur 27 uitleggen (specifiek volume in functie van tijd) (oral)<br /> #Leid Gibbs Thomson uitdrukking af voor smelttemperatuur van sferisch kristal.<br /> #Uitdrukking s^2 en massacentrum gegeven:<br /> #*Leid average radius of gyration af met alles massa's = m.<br /> #*Toon aan dat average radius of gyration = lb^2 (N+1)(N-1)/6N als i=1,2,3,...,N-1.<br /> #*Veranderen de uitdrukking als er interacties zijn tussen de massa's met Lennard Jones interactie potentiaal?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Discuss the ceiling temperature and apply it on both the vinyl polymerization and ring opening polymerization. Is the ceiling temperature of a particular monomer dependent on the way it's polymerized?<br /> Is it possible that a particular monomer, of which the ceiling temperature is such that only low-molar mass oligomers can be obtained via a living anionic polymerization at a certain temperature, can be polymerized into high-molar mass polymer using a free radical polymerization at the same temperature? Motivate your anwer.<br /> #Explain the principle of a controlled radical polymerization and apply it on NMP and ATRP.<br /> #Discuss briefly the living cationic vinyl polymerization.<br /> ====Prof. Nies====<br /> Zie onderstaande afbeelding.<br /> [ <br /> #Assignment 1 (oral)<br /> #The &amp;lt;i&amp;gt;free rotating chain&amp;lt;/i&amp;gt; (FRC) consists of N bonding vectors l&amp;lt;sub&amp;gt;i&amp;lt;/sub&amp;gt;, i=1,...,N with constant bond length |l&amp;lt;sub&amp;gt;i&amp;lt;/sub&amp;gt;| = l&amp;lt;sub&amp;gt;b&amp;lt;/sub&amp;gt; and constant bond angles Ï´&amp;lt;sub&amp;gt;ii+1&amp;lt;/sub&amp;gt;=Ï´, i=1,...,N between the successive bonding vectors. The average quadratic end-to-end distance &amp;lt;R²&amp;gt;, valid for all physically sensible values of N, l&amp;lt;sub&amp;gt;b&amp;lt;/sub&amp;gt; and Ï´, is given by [[Bestand:R-FRC.JPG]]<br /> #*Show that the average quadratic end-to-end distance &amp;lt;R²&amp;gt; of the FRC chain with very small bond angles also can be written in the Kratky-Porod chain form: &amp;lt;R²&amp;gt; = 2l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;L-2l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;²(1-exp(-L/l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;),<br /> with l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;=l&amp;lt;sub&amp;gt;b&amp;lt;/sub&amp;gt;L/(1-cosÏ´) the perstistence length and L the contour length.<br /> #Derive from the general thermodynamic equilibrium conditions the melting point of a polymer crystal in equilibrium with a solution of the polymer.<br /> For the polymer solution you can use the Flory-Huggins excess Gibbs-energy of mixing.<br /> [[Bestand:G(mix).JPG]]<br /> <br /> The chemical potentials of the components are given by:<br /> [[Bestand:Chempot.JPG]] ]<br /> <br /> [[Bestand:240113nies.png]]<br /> <br /> ===18 januari 2013===<br /> ====Prof. Koeckelberghs====<br /> #Compare chemically initiated free radical polymerization and ATRP, for the following aspects:<br /> #*general concept<br /> #*rate of polymerization<br /> #*influence of molecule structure on polymerization rate<br /> #Discuss the differences in mechanism of chain growth and step growth polymerization. How can one investigate which type of polymerization he is dealing with?<br /> #Explain briefly: Ziegler-Natta catalyst<br /> ====Prof. Nies====<br /> #Discussion of assignment 1 (oral)<br /> <br /> Zie onderstaande afbeelding.<br /> <br /> #The expression of average squared end-to-end distance of the Kratky-Porod chain is given: &amp;lt;R²&amp;gt; = 2l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;L - 2l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;²(1-exp(-L/l&amp;lt;sub&amp;gt;p&amp;lt;/sub&amp;gt;)<br /> #*Derive expressions for the Kuhn segment length and the number of Kuhn segments for this chain.<br /> #*Discuss your results. For instance, did you make any assumptions? Mention them explicitly.<br /> #The excess Gibbs ebergy of mixing in the Flory-Huggins model is given: ΔG/N&amp;lt;sub&amp;gt;l&amp;lt;/sub&amp;gt;kT = Δg/kT = (φ&amp;lt;sub&amp;gt;1&amp;lt;/sub&amp;gt;/s&amp;lt;sub&amp;gt;1&amp;lt;/sub&amp;gt;)lnφ&amp;lt;sub&amp;gt;1&amp;lt;/sub&amp;gt; + (φ&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt;/s&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt;)lnφ&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt; + χφ&amp;lt;sub&amp;gt;1&amp;lt;/sub&amp;gt;φ&amp;lt;sub&amp;gt;2&amp;lt;/sub&amp;gt;<br /> #*Derive expressions for the spinodal and critical conditions.<br /> #*Derive from these expressions the formulae for the critical composition φ&amp;lt;sub&amp;gt;2,cr&amp;lt;/sub&amp;gt; and critical value of χ.<br /> #*What is the relevance of the spinodal for material behaviour?<br /> [[Bestand:180113nies.png]]<br /> <br /> ===20 januari 2012===<br /> ====Professor Nies====<br /> #Gegeven een fase-diagram uit Case II. Wat gebeurt er als er vanuit punt A (dat links van de critical point lag):<br /> #* traag wordt afgekoeld<br /> #* wordt gequenched (1000K/min)<br /> #* Hoe ziet de oplossing er na koelen uit voor beide gevallen<br /> #5 begrippen uitleggen:<br /> #*Thermo-elastische inversie<br /> #*Physical ageing<br /> #*Second order transition<br /> #*Effective pair potential<br /> #*Nucleation &amp;amp; growth<br /> #Leidt de spinodal en critical conditions af en ook de waarden voor Fi(2,crit) en Chi(krit).<br /> <br /> ====Professor Koeckelberghs====<br /> #Wat is de ceiling temperatuur en correleer dit met vinylpolymerisatie en Ring opening polymerisatie. Is de ceiling temperatuur afhankelijk van hoe we polymeriseren? Stel we polymeriseren via een living anionische polymerisatie. Het monomeer heeft een lage ceiling temperatuur, wat ervoor zorgt dat er geen lange polymeerketens worden gevormd. Kan men dan langere ketens verkrijgen als men bij dezelfde temperatuur via een radicale polymerisatie polymeriseert?<br /> #M1 en M2 worden gecopolymeriseerd. Geef de parameters voor beide monomeren en leg uit waarvan deze afhangen.<br /> # Leg uit: (radicalaire) emulsiepolymerisatie<br /> <br /> ===21 januari 2011===<br /> ====Professor Nies====<br /> # Teken het verloop van de de gibssvrij-energie in functie van volumefractie bij een temperatuur van 300K. Volumefracties = 0,2. Coexistence points en spinodal points gegeven. Ook de verschillende punten aanduiden en kort uitleggen. (deze vraag was mondeling)<br /> # Formule p 50 case 1 gegeven (zonder 4e term)<br /> #* leg de symbolen uit + dimensies + eenheden<br /> #* wat bedoelt men met &amp;quot;volgens de Flory benadering...&amp;quot;<br /> #* leg de twee verschillende termen uit<br /> #* Bereken end-to-end distance in evenwicht bij een flory-solvent<br /> #* Bereken end-to-end distance in evenwicht bij een goed solvent<br /> # Avramiplot+vergelijking gegeven<br /> #*leg de parameters uit<br /> #*hoe kan je volumefractie kristallijne fase meten, leg kort techniek uit.<br /> #*geef een kwalitatieve bespreking van de grafiek<br /> #*wat kan je uit de parameters afleiden<br /> <br /> ====Professor Koeckelberghs====<br /> # zie vragen vorig jaar<br /> <br /> ===15 januari 2010===<br /> ====Professor Nies====<br /> #Er was de grafiek gegeven met daarop de binodal, spinodal en Tg curve. Met daarop 3 punten aangegeven, telkens in het homogene gebied boven de binodal en boven Tg. Punt A: Links van kritische punt, punt B tussen kritische punt en Berghmans punt en punt C rechts van Berghmanspunt. (Alleen deze vraag mondeling)<br /> #*Wat vindt plaats als je in punt A traag afkoelt?<br /> #*Wat vindt plaats als je in punt A afkoelt met 1000K/min<br /> #*Wat vindt plaats als je in punt B traag afkoelt<br /> #*Wat vindt plaats als je in punt B afkoelt met 1000K/min<br /> #*Wat vindt plaats als je in punt C traag afkoelt?<br /> #*Wat vindt plaats als je in punt C afkoelt met 1000K/min<br /> #Vergelijking van Groeisnelheid bij kristallisatie (U) gegeven: U=Fexp(A)exp(B)exp(C) Zowel F,A,B,C waren gegeven in symbolen(vergelijking onder 7.B case III)<br /> #*Geef waarvoor de symbolen staan en wat hun eenheden zijn.<br /> #*Verklaar waar de Frontfactor (F) en de drie exp's vandaan komen<br /> #*Bespreek temperatuursafhankelijkheid en geef een schets<br /> #Geef de definitie van een ideale Rubber<br /> #* Leid de uitdrukking voor af voor S bij een willekeurige verandering. P(R) gegeven<br /> <br /> ====Koeckelberghs====<br /> #Vergelijk radicalaire, anionische en kationische vinylpolymerisatie<br /> #*Mogelijke monomere deeltjes (stabiliteit)<br /> #*Terminatie reacties<br /> #*Invloed van verschillende voorkomende deeltjes op sneldheid (hiermee bedoelde hij de associated ion pairs etc)<br /> #*Mogelijke manier om ze 'levend' te maken. (of quasi levend)<br /> #*? dacht dat er nog 1 was<br /> #Je wil een ideaal, perfect blockcopolymeer maken van MMA en MA op anionische wijze. Welk monomeer moet je eerst polymeriseren? Blijft indien je dit met ATRP wil doen de volgorde dezelfde?<br /> #Bespreek kort Ring Opening Metathesis Polymerisatie.</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Polymer_Materials&diff=4814 2026-01-09T14:00:41Z

<p>R0857325: </p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Het vak werd vroeger gegeven door Prof. Erik Nies, maar wordt vanaf 2023-2024 gegeven door Bart Goderis en Guy Koeckelberghs. Het examen van Koeckelberghs is mondeling en het examen van Goderis is deels schriftelijk, deels mondeling. De cursus is ook veranderd in 2023-2024 waardoor sommige examenvragen van daarvoor mogelijks niet meer relevant zijn. De lessen van Prof. Koeckelberghs worden niet opgenomen. In 2024-2025 is de leerstof van Goderis weer deels veranderd.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===9 januari 2026===<br /> <br /> big questions Goderis (mondeling)<br /> <br /> # PS has brittle behaviour, why. Mechanical rejuvination can make it ductile, but after some time it becomes brittle again, why?<br /> # Fasediagram, teken fasen in miscible region, metastable region, unstable region. <br /> <br /> small questions Goderis (schriftelijk)<br /> <br /> # shish kebab structuur tekenen en uitleggen<br /> # Newtonian liquid<br /> # Rubberplateau, what is het moleculaire vereiste om dit te hebben?<br /> # stress relaxation, welk model gebruikt je en waarom niet andere (Kelvin-Voigt, Maxwell)<br /> # Which technique(s) would you use making layered thin plastic foil<br /> # waarom neem viscositeti toe met Mw tot de macht 3.4<br /> # ionomers<br /> # which structure has highest, lowest Tg + why (HDPE, PVC, PP)<br /> # 3 examples of polymers in nature<br /> # ...<br /> <br /> questions koeckelbergs<br /> <br /> # step grotwh en chain growth uitleggen<br /> # stereospecificiteit, wat is het + 2 voorbeelden van polymerisatietechnieken die specifieke tacticiteit geven<br /> # definieer Mn, Mw + hoe ga je ze meten?<br /> # Structuren gegeven, op welke manier kan je ze polymeriseren?<br /> <br /> ===21 januari 2025===<br /> <br /> big questions Goderis (mondeling)<br /> <br /> # hoe werken de twee mechanismen van plastische vervorming en hoe meet je ze experimenteel. ook vragen over PS, HIPS, salami stuctuur.<br /> # wat zijn compatibalisers, waarom gebruik je ze en hoe breng je ze in een polymeer<br /> <br /> small questions Goderis (schriftelijk)<br /> <br /> # shish kebab structuur tekenen en uitleggen<br /> # waarom gebruik je nylon niet als screws?<br /> # true vs engineering stress en strain<br /> # elastic inversion wat is het<br /> # ldpe blow film<br /> # wat is het percentage petroleum van alle fossiele brandstoffen die we gebruiken<br /> # waarom neem viscositeti toe met Mw tot de macht 3.4<br /> # couette cell tekenen en wat uitleg geven<br /> <br /> questions koeckelbergs<br /> <br /> # step chain en chain growth uitleggen<br /> # verschillende polymeren waaronder isobutylenen en methacrylaten hoe polymeriseren en waarom<br /> # hoe maak je de verschillende tacticiteiten van polymeren en waarom werkt dat<br /> <br /> ===14 januari 2025===<br /> big questions goderis (mondeling)<br /> <br /> # give the different types of polyethylene and how do you make them? there was also a graph given and u needed to point for each polyethylene a graph (graph is in the cursus)<br /> # how can you predict necking? what happens after mechanical rejuvenation and a deep notch?<br /> <br /> questions koeckelberghs (mondeling)<br /> # give the relation between MM and step-growth polymerization + formules<br /> # explain cationic polymerization, how can you make it a living polymerization? <br /> # exercises like in the cursus<br /> <br /> ===25 Januari 2024 (NM)===<br /> big questions Goderis (mondeling)<br /> <br /> # Explain the gel spinning process for Dyneema fibers. Why are they so strong? (How to determine the strength? -&gt; graph)<br /> # Does atactic polystyrene crystallize? Why (not)? How will the Tg change when: MM is increased, adding crosslinks, adding plasticizer. When butadiene is copolymerized with styrene, will the Tg change? (Give the formula of the Tg of a miscible mixture.)<br /> <br /> small questions Goderis (schriftelijk)<br /> <br /> # Properties vs performance.<br /> # Microplastics?<br /> # Flash?<br /> # Draw a Couette cell.<br /> # Co-extrusion?<br /> # Maxwell element vs Kelvin-Voigt element: which one is used for stress relaxation experiments? Why?<br /> # Ionomers?<br /> # Conformation of crystalline PE.<br /> # Why does η0 change with MM^3,4?<br /> # Draw the microstructure of LDPE.<br /> <br /> questions Koeckelberghs (mondeling)<br /> <br /> # Compare chain growth polymerization with step growth polymerization. How does the molar mass change during these reactions?<br /> # Give the formula to calculate the dispersity of a living polymer with the MM. Draw a graph of the polymerization reaction for living polymers.<br /> # Vinyl acetate and ethacrylic acid -&gt; radical/anionic/cationic? Why?<br /> <br /> ===16 Januari 2024===<br /> big questions Goderis (mondeling)<br /> <br /> # states of aggregation and effect of molecular weight<br /> # 3 ways of making thermoplastic elastomers (non-permanent crosslinks)<br /> <br /> small questions Goderis (schriftelijk)<br /> <br /> # plastic vs polymer<br /> # naphta<br /> # is LDPE of LLDPE copolymer<br /> # spinneret<br /> # blown film process<br /> # hoe is de conformatie van kristallijn polyethyleen<br /> # Poiseuille flow<br /> # iets over viscositeit<br /> <br /> questions Koeckelberghs (mondeling)<br /> <br /> #twee vinyl hoe te polymeriseren<br /> #wat is steoregulariteit heef twee types en heeft elke type een soort van polermerisatie da je die stereo krijgt <br /> #chain and step en MM<br /> <br /> ===12 Januari 2024===<br /> big question Goderis (mondeling) <br /> <br /> # polymer melt index(viscosity depends on what? (mm, temperature, shear rate(newton’s law: are polymers newtonian liquid, shear thinning behaviour? -&gt; also look at H7 slide 73<br /> # crystallization graph of 4 polymers (with Tg and Tm) and graph with specific volume something (H7 slide 43!!)-&gt; looks like amorphous polymer graph but it isnt!! -&gt; talk about PE conformations (HDPE LDPE LLDPE). (temperature dependance of free volume is also related to one of these questions (H6))<br /> <br /> <br /> small question Goderis<br /> <br /> # macromolecule vs polymer <br /> # thermo elastic inversion effect for rubbers(H7 slide 71)<br /> # True of false: shrinking foil is high polydispersity needed?<br /> # steam cracking? <br /> # why not use nylon screw? (we did it in the exercise) (strain reduces faster)<br /> # die swelling<br /> # which process for plastic bottles(extrusion blow molding and injection blow molding)<br /> # zero shear rate viscosity increases with mw^3.4 why (H7) <br /> # how to find toughness with tensile experiment (H6)<br /> # dont remember <br /> <br /> <br /> Guy (mondeling) <br /> # Mw and Mn -&gt; how to measure <br /> # anionic living polymerization (counterion, stability, solvent) -&gt; under which conditions: ex no O2/C02 -&gt; peroxide forming…<br /> # dibuteen and 4-Vinylphenol how to polymerize, stabilisatie en compatibele zijgroepen.<br /> <br /> ===24 Januari 2023===<br /> #Welke polymerisatie ondergaat wel/niet onderstaande molecule (10 punten)? <br /> #Begrippen (10 punten)<br /> #*Mz adhv molecular weight + welke eenheid heeft eindresultaat definitie<br /> #*Hoe ziet operating point van een injection er uit? Maak een schets/tekening. <br /> #*Staudinger Hypothese<br /> #UHMWPE (Tabel met gegevens gegeven; 10 punten)<br /> #*Wat is UHMWPE en wat is er speciaal aan?<br /> #*Is deze in coiled vorm? Ja/neen + leg uit waarom.<br /> #*Welke waarden in tabel hebben invloed/zeggen iets over volume van coiled vorm?<br /> #*Leid een formule af voor afhankelijkheid van Mw bij weight density van coiled vorm.<br /> #*Reken uit<br /> #Rubberen bal (ideaal rubber bij Rubbery plateau; 10 punten):<br /> #* Schets storage modulus en loss modulus tussen -50°C - 50°C met Tg = -19°C<br /> #*Leg de schets uit<br /> #*Bal wordt om de zoveel tijd losgelaten vanaf 1m hoog. Schets grafiek (h/T) en waarom heb je die zo geschetst?<br /> #*Hebben &quot;*&quot; 2 en 3 iets met elkaar te maken? Zo ja/neen? Waarom?<br /> <br /> ===29 Augustus 2022===<br /> #Polystyrene<br /> #FJC-model<br /> #Begrippen<br /> #*Staudinger Hypothese<br /> #*Mz<br /> #*Performance VS Property<br /> #Rectangular rubber loaded with mass. T lowers from 50°C to -50°C<br /> #* (zie vraag jan '22)<br /> ===25 januari 2022===<br /> #In which ways can Methyl vinyl ether be polymerised?<br /> #What is the freely jointed chain model + make a drawing indicating the relevant parameters. Give a basic expression for R, give a precise expression for the contour length L. Derive an expression for &lt;R.R&gt; and discuss for each step what you did. <br /> #<br /> #* - What is Newtonian viscosity and how can it be determined from the shear rate dependent viscosity? - Illustrate the dependence of the Newtonian viscosity on the molar mass, what are the molecular reasons for this?<br /> #*- What is a thermoplastic elastomer? - How is it made out of block copolymers? <br /> #* Give the Staudinger hypothesis.<br /> # Rectangular rubber loaded with mass. T lowers from 50°C to -50°C (tabel gegeven met veel gegevens) (oefening analoog aan set 5 over rubbers, oefening 2)<br /> #* What is an ideal rubber?<br /> #* Calculate length of the rubber at 50 °C (gewoon extension ratio berekenen, alle gegevens voor de formule zijn gegeven)<br /> #* Make a plot L(T) from - 50 °C to 50 °C and indicate length from previous exercise (dezelfde vgl oplossen maar dan voor andere temperaturen en je bekomt een dalende rechte vanaf glastransitietemperatuur want vanaf daar is de formule geldig)<br /> #* Explain this behaviour (elasticiteit en entropie)<br /> <br /> ===9 januari 2021===<br /> #In which ways can acrylonitrile be polymerized? <br /> #What is the freely jointed chain model + make a drawing indicating the relevant parameters. Give a basic expression for R, give a precise expression for the contour length L. Derive an expression for &lt;R.R&gt; and discuss for each step what you did. <br /> #<br /> #* Give the definition for Mz, starting from the molecular moments. Discuss each variable and give the units. <br /> #* What is the operating in injection moulding + make a drawing. <br /> #* PE is made by free radical polymerization (Mw = 50 kg/mole, D = Mw/Mn = 3.2), can we make super strong PE fibers from this? Explain<br /> #* State the Staudinger hypothesis. <br /> #A cylindrical nylon fiber is used to suspend a 10 kg rotor in a centrifuge experiment. At T = 60°C, L0 = 20 cm and after 50 minutes, L = 20.0045 cm. <br /> #* What mechanical analogue would you use to describe the centrifuge experiment?<br /> #* Calculate stress and strain at T = 60°C and after 50 minutes. <br /> #* Determine Rs, the radius of the nylon fiber. <br /> #* Determine the elongation of the fiber at T = -10°C and after 24 hours.<br /> <br /> ===22 januari 2020===<br /> <br /> #Vraag 1: Pagina 1 van voorbeeld examenvragen<br /> #Vraag 2 (mondeling): Rechthoekig rubber wordt beladen met een massa. T daalt van +50°C tot -50°c met 1°C/min en er is nog een tabel met een heel aantal gegevens beschikbaar. <br /> #* Bereken de lengte van het rubber bij 50°C (gewoon extension ratio berekenen, alle gegevens voor de formule zijn gegeven)<br /> #* Maak een plot van lengte ifv temperatuur en neem je bekomen lengte uit bovenstaande vraag mee (dezelfde vgl oplossen maar dan voor andere temperaturen en je bekomt een dalende rechte vanaf glastransitietemperatuur want vanaf daar is de formule geldig)<br /> #* Verklaar je observatie (elasticiteit is door entropie bepaald, geef analogie met veerconstante) <br /> #Gesloten boek: Pagina 2 van voorbeeld examenvragen<br /> <br /> ===13 januari 2020===<br /> #Vraag 1 van voorbeeldexamen (open boek)<br /> #Vraag met grafiek Young's modulus van voorbeeldexamen (open boek, mondeling)<br /> #Verschil copolymerisatie Ziegler-Natta vs metalloceen van voorbeeldexamen (gesloten boek)<br /> #Formule kracht elasticiteit, entropieveer van pagina 4 voorbeeldexamen (gesloten boek) <br /> #Tabel met info UHMWPE. Waarvoor staat UHMWPE? Wat is er typisch aan deze graad? Afleiden densiteit van coiled coil, welke assumpties maak je bij deze afleiding? Uitrekenen densiteit. Is (een specifieke naam van polymeer) PE in de coiled coil conformatie? <br /> <br /> ===14 januari 2019===<br /> <br /> #vraag 1: pagina 1 van voorbeeld examenvragen<br /> #vraag 2 (mondeling): Rechthoekig rubber wordt beladen met een massa. T daalt van +50°C tot -50°c met 1°C/min en er is nog een tabel met een heel aantal gegevens beschikbaar. <br /> #* Bereken de lengte van het rubber bij 50°C (gewoon extension ratio berekenen, alle gegevens voor de formule zijn gegeven)<br /> #* Maak een plot van lengte ifv temperatuur en neem je bekomen lengte uit bovenstaande vraag mee (dezelfde vgl oplossen maar dan voor andere temperaturen en je bekomt een dalende rechte vanaf glastransitietemperatuur want vanaf daar is de formule geldig)<br /> #* Verklaar je observatie (elasticiteit is door entropie bepaald, geef analogie met veerconstante) <br /> #Gesloten boek: pagina 2 van voorbeeld examenvragen<br /> <br /> ===16 januari 2018===<br /> #Hoe polymeriseert methylvinylether? (open boek)<br /> #Oefening elongatie nylon 66 vezel in centrifuge experiment (open boek, mondeling)<br /> #*welke verband tussen stress en strain<br /> #*Bereken stress en strain<br /> #*Bereken diameter draad<br /> #*Uitrekken bij andere T (onder Tg)<br /> #Vanalles over newtioniaanse viscositeit (def., te zien in shear thinning, verband met molaire massa)<br /> #Wat zijn thermoplastische elastomeren<br /> #Experiment met stelling (van voorbeeld examen blijkbaar)<br /> #*Klopt stelling<br /> #*Bewijs je redenering <br /> #*Geef alle variabelen en hun eenheden gebruikt in bewijs<br /> <br /> ===15 januari 2018===<br /> #Polymerisatie van acrylonitril (radicaal, kationisch, anionisch) (open boek)<br /> #Oefening van rubber (analoog aan laatste (set 5, ex 2) oefeningen, rubber wordt uitgerokken door een kracht, dit wordt gevolg bij temperaturen van 50 °C tot -50 °C, bespreek plot) (open boek, mondeling)<br /> #Leg het verschil uit tussen<br /> #*Performance &amp; property<br /> #*Entanglements &amp; cross-links<br /> #Extruder<br /> #*Geef vergelijk volumetrische flow<br /> #*Leg alle symbolen uit en geef de eenheden<br /> #*Een mould wordt aan een extruder gezet voor een rod-shaped object te maken,teken dit, geef werkings punt (Qextr=Qdie)</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Polymer_Materials&diff=4813 2026-01-09T13:58:43Z

<p>R0857325: </p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Het vak werd vroeger gegeven door Prof. Erik Nies, maar wordt vanaf 2023-2024 gegeven door Bart Goderis en Guy Koeckelberghs. Het examen van Koeckelberghs is mondeling en het examen van Goderis is deels schriftelijk, deels mondeling. De cursus is ook veranderd in 2023-2024 waardoor sommige examenvragen van daarvoor mogelijks niet meer relevant zijn. De lessen van Prof. Koeckelberghs worden niet opgenomen. In 2024-2025 is de leerstof van Goderis weer deels veranderd.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===9 januari 2026===<br /> <br /> big questions Goderis (mondeling)<br /> <br /> # PS has brittle behaviour, why. Mechanical rejuvination can make it ductile, but after some time it becomes brittle again, why?<br /> # Fasediagram, teken fasen in miscible region, metastable region, unstable region. <br /> <br /> small questions Goderis (schriftelijk)<br /> <br /> # shish kebab structuur tekenen en uitleggen<br /> # Newtonian liquid<br /> # Rubberplateau, what is het moleculaire vereiste om dit te hebben?<br /> # stress relaxation, welk model gebruikt je en waarom niet andere (Kelvin-Voigt, Maxwell)<br /> # Which technique(s) would you use making layered thin plastic foil<br /> # waarom neem viscositeti toe met Mw tot de macht 3.4<br /> # ionomers<br /> # which structure has highest, lowest Tg + why (HDPE, PVC, PP)<br /> # 3 examples of polymers in nature<br /> # ...<br /> <br /> questions koeckelbergs<br /> <br /> # step chain en chain growth uitleggen<br /> # stereospecificiteit, wat is het + 2 voorbeelden van polymerisatietechnieken die specifieke tacticiteit geven<br /> # definieer Mn, Mw + hoe ga je ze meten?<br /> # Structuren gegeven, op welke manier kan je ze polymeriseren?<br /> <br /> ===21 januari 2025===<br /> <br /> big questions Goderis (mondeling)<br /> <br /> # hoe werken de twee mechanismen van plastische vervorming en hoe meet je ze experimenteel. ook vragen over PS, HIPS, salami stuctuur.<br /> # wat zijn compatibalisers, waarom gebruik je ze en hoe breng je ze in een polymeer<br /> <br /> small questions Goderis (schriftelijk)<br /> <br /> # shish kebab structuur tekenen en uitleggen<br /> # waarom gebruik je nylon niet als screws?<br /> # true vs engineering stress en strain<br /> # elastic inversion wat is het<br /> # ldpe blow film<br /> # wat is het percentage petroleum van alle fossiele brandstoffen die we gebruiken<br /> # waarom neem viscositeti toe met Mw tot de macht 3.4<br /> # couette cell tekenen en wat uitleg geven<br /> <br /> questions koeckelbergs<br /> <br /> # step chain en chain growth uitleggen<br /> # verschillende polymeren waaronder isobutylenen en methacrylaten hoe polymeriseren en waarom<br /> # hoe maak je de verschillende tacticiteiten van polymeren en waarom werkt dat<br /> <br /> ===14 januari 2025===<br /> big questions goderis (mondeling)<br /> <br /> # give the different types of polyethylene and how do you make them? there was also a graph given and u needed to point for each polyethylene a graph (graph is in the cursus)<br /> # how can you predict necking? what happens after mechanical rejuvenation and a deep notch?<br /> <br /> questions koeckelberghs (mondeling)<br /> # give the relation between MM and step-growth polymerization + formules<br /> # explain cationic polymerization, how can you make it a living polymerization? <br /> # exercises like in the cursus<br /> <br /> ===25 Januari 2024 (NM)===<br /> big questions Goderis (mondeling)<br /> <br /> # Explain the gel spinning process for Dyneema fibers. Why are they so strong? (How to determine the strength? -&gt; graph)<br /> # Does atactic polystyrene crystallize? Why (not)? How will the Tg change when: MM is increased, adding crosslinks, adding plasticizer. When butadiene is copolymerized with styrene, will the Tg change? (Give the formula of the Tg of a miscible mixture.)<br /> <br /> small questions Goderis (schriftelijk)<br /> <br /> # Properties vs performance.<br /> # Microplastics?<br /> # Flash?<br /> # Draw a Couette cell.<br /> # Co-extrusion?<br /> # Maxwell element vs Kelvin-Voigt element: which one is used for stress relaxation experiments? Why?<br /> # Ionomers?<br /> # Conformation of crystalline PE.<br /> # Why does η0 change with MM^3,4?<br /> # Draw the microstructure of LDPE.<br /> <br /> questions Koeckelberghs (mondeling)<br /> <br /> # Compare chain growth polymerization with step growth polymerization. How does the molar mass change during these reactions?<br /> # Give the formula to calculate the dispersity of a living polymer with the MM. Draw a graph of the polymerization reaction for living polymers.<br /> # Vinyl acetate and ethacrylic acid -&gt; radical/anionic/cationic? Why?<br /> <br /> ===16 Januari 2024===<br /> big questions Goderis (mondeling)<br /> <br /> # states of aggregation and effect of molecular weight<br /> # 3 ways of making thermoplastic elastomers (non-permanent crosslinks)<br /> <br /> small questions Goderis (schriftelijk)<br /> <br /> # plastic vs polymer<br /> # naphta<br /> # is LDPE of LLDPE copolymer<br /> # spinneret<br /> # blown film process<br /> # hoe is de conformatie van kristallijn polyethyleen<br /> # Poiseuille flow<br /> # iets over viscositeit<br /> <br /> questions Koeckelberghs (mondeling)<br /> <br /> #twee vinyl hoe te polymeriseren<br /> #wat is steoregulariteit heef twee types en heeft elke type een soort van polermerisatie da je die stereo krijgt <br /> #chain and step en MM<br /> <br /> ===12 Januari 2024===<br /> big question Goderis (mondeling) <br /> <br /> # polymer melt index(viscosity depends on what? (mm, temperature, shear rate(newton’s law: are polymers newtonian liquid, shear thinning behaviour? -&gt; also look at H7 slide 73<br /> # crystallization graph of 4 polymers (with Tg and Tm) and graph with specific volume something (H7 slide 43!!)-&gt; looks like amorphous polymer graph but it isnt!! -&gt; talk about PE conformations (HDPE LDPE LLDPE). (temperature dependance of free volume is also related to one of these questions (H6))<br /> <br /> <br /> small question Goderis<br /> <br /> # macromolecule vs polymer <br /> # thermo elastic inversion effect for rubbers(H7 slide 71)<br /> # True of false: shrinking foil is high polydispersity needed?<br /> # steam cracking? <br /> # why not use nylon screw? (we did it in the exercise) (strain reduces faster)<br /> # die swelling<br /> # which process for plastic bottles(extrusion blow molding and injection blow molding)<br /> # zero shear rate viscosity increases with mw^3.4 why (H7) <br /> # how to find toughness with tensile experiment (H6)<br /> # dont remember <br /> <br /> <br /> Guy (mondeling) <br /> # Mw and Mn -&gt; how to measure <br /> # anionic living polymerization (counterion, stability, solvent) -&gt; under which conditions: ex no O2/C02 -&gt; peroxide forming…<br /> # dibuteen and 4-Vinylphenol how to polymerize, stabilisatie en compatibele zijgroepen.<br /> <br /> ===24 Januari 2023===<br /> #Welke polymerisatie ondergaat wel/niet onderstaande molecule (10 punten)? <br /> #Begrippen (10 punten)<br /> #*Mz adhv molecular weight + welke eenheid heeft eindresultaat definitie<br /> #*Hoe ziet operating point van een injection er uit? Maak een schets/tekening. <br /> #*Staudinger Hypothese<br /> #UHMWPE (Tabel met gegevens gegeven; 10 punten)<br /> #*Wat is UHMWPE en wat is er speciaal aan?<br /> #*Is deze in coiled vorm? Ja/neen + leg uit waarom.<br /> #*Welke waarden in tabel hebben invloed/zeggen iets over volume van coiled vorm?<br /> #*Leid een formule af voor afhankelijkheid van Mw bij weight density van coiled vorm.<br /> #*Reken uit<br /> #Rubberen bal (ideaal rubber bij Rubbery plateau; 10 punten):<br /> #* Schets storage modulus en loss modulus tussen -50°C - 50°C met Tg = -19°C<br /> #*Leg de schets uit<br /> #*Bal wordt om de zoveel tijd losgelaten vanaf 1m hoog. Schets grafiek (h/T) en waarom heb je die zo geschetst?<br /> #*Hebben &quot;*&quot; 2 en 3 iets met elkaar te maken? Zo ja/neen? Waarom?<br /> <br /> ===29 Augustus 2022===<br /> #Polystyrene<br /> #FJC-model<br /> #Begrippen<br /> #*Staudinger Hypothese<br /> #*Mz<br /> #*Performance VS Property<br /> #Rectangular rubber loaded with mass. T lowers from 50°C to -50°C<br /> #* (zie vraag jan '22)<br /> ===25 januari 2022===<br /> #In which ways can Methyl vinyl ether be polymerised?<br /> #What is the freely jointed chain model + make a drawing indicating the relevant parameters. Give a basic expression for R, give a precise expression for the contour length L. Derive an expression for &lt;R.R&gt; and discuss for each step what you did. <br /> #<br /> #* - What is Newtonian viscosity and how can it be determined from the shear rate dependent viscosity? - Illustrate the dependence of the Newtonian viscosity on the molar mass, what are the molecular reasons for this?<br /> #*- What is a thermoplastic elastomer? - How is it made out of block copolymers? <br /> #* Give the Staudinger hypothesis.<br /> # Rectangular rubber loaded with mass. T lowers from 50°C to -50°C (tabel gegeven met veel gegevens) (oefening analoog aan set 5 over rubbers, oefening 2)<br /> #* What is an ideal rubber?<br /> #* Calculate length of the rubber at 50 °C (gewoon extension ratio berekenen, alle gegevens voor de formule zijn gegeven)<br /> #* Make a plot L(T) from - 50 °C to 50 °C and indicate length from previous exercise (dezelfde vgl oplossen maar dan voor andere temperaturen en je bekomt een dalende rechte vanaf glastransitietemperatuur want vanaf daar is de formule geldig)<br /> #* Explain this behaviour (elasticiteit en entropie)<br /> <br /> ===9 januari 2021===<br /> #In which ways can acrylonitrile be polymerized? <br /> #What is the freely jointed chain model + make a drawing indicating the relevant parameters. Give a basic expression for R, give a precise expression for the contour length L. Derive an expression for &lt;R.R&gt; and discuss for each step what you did. <br /> #<br /> #* Give the definition for Mz, starting from the molecular moments. Discuss each variable and give the units. <br /> #* What is the operating in injection moulding + make a drawing. <br /> #* PE is made by free radical polymerization (Mw = 50 kg/mole, D = Mw/Mn = 3.2), can we make super strong PE fibers from this? Explain<br /> #* State the Staudinger hypothesis. <br /> #A cylindrical nylon fiber is used to suspend a 10 kg rotor in a centrifuge experiment. At T = 60°C, L0 = 20 cm and after 50 minutes, L = 20.0045 cm. <br /> #* What mechanical analogue would you use to describe the centrifuge experiment?<br /> #* Calculate stress and strain at T = 60°C and after 50 minutes. <br /> #* Determine Rs, the radius of the nylon fiber. <br /> #* Determine the elongation of the fiber at T = -10°C and after 24 hours.<br /> <br /> ===22 januari 2020===<br /> <br /> #Vraag 1: Pagina 1 van voorbeeld examenvragen<br /> #Vraag 2 (mondeling): Rechthoekig rubber wordt beladen met een massa. T daalt van +50°C tot -50°c met 1°C/min en er is nog een tabel met een heel aantal gegevens beschikbaar. <br /> #* Bereken de lengte van het rubber bij 50°C (gewoon extension ratio berekenen, alle gegevens voor de formule zijn gegeven)<br /> #* Maak een plot van lengte ifv temperatuur en neem je bekomen lengte uit bovenstaande vraag mee (dezelfde vgl oplossen maar dan voor andere temperaturen en je bekomt een dalende rechte vanaf glastransitietemperatuur want vanaf daar is de formule geldig)<br /> #* Verklaar je observatie (elasticiteit is door entropie bepaald, geef analogie met veerconstante) <br /> #Gesloten boek: Pagina 2 van voorbeeld examenvragen<br /> <br /> ===13 januari 2020===<br /> #Vraag 1 van voorbeeldexamen (open boek)<br /> #Vraag met grafiek Young's modulus van voorbeeldexamen (open boek, mondeling)<br /> #Verschil copolymerisatie Ziegler-Natta vs metalloceen van voorbeeldexamen (gesloten boek)<br /> #Formule kracht elasticiteit, entropieveer van pagina 4 voorbeeldexamen (gesloten boek) <br /> #Tabel met info UHMWPE. Waarvoor staat UHMWPE? Wat is er typisch aan deze graad? Afleiden densiteit van coiled coil, welke assumpties maak je bij deze afleiding? Uitrekenen densiteit. Is (een specifieke naam van polymeer) PE in de coiled coil conformatie? <br /> <br /> ===14 januari 2019===<br /> <br /> #vraag 1: pagina 1 van voorbeeld examenvragen<br /> #vraag 2 (mondeling): Rechthoekig rubber wordt beladen met een massa. T daalt van +50°C tot -50°c met 1°C/min en er is nog een tabel met een heel aantal gegevens beschikbaar. <br /> #* Bereken de lengte van het rubber bij 50°C (gewoon extension ratio berekenen, alle gegevens voor de formule zijn gegeven)<br /> #* Maak een plot van lengte ifv temperatuur en neem je bekomen lengte uit bovenstaande vraag mee (dezelfde vgl oplossen maar dan voor andere temperaturen en je bekomt een dalende rechte vanaf glastransitietemperatuur want vanaf daar is de formule geldig)<br /> #* Verklaar je observatie (elasticiteit is door entropie bepaald, geef analogie met veerconstante) <br /> #Gesloten boek: pagina 2 van voorbeeld examenvragen<br /> <br /> ===16 januari 2018===<br /> #Hoe polymeriseert methylvinylether? (open boek)<br /> #Oefening elongatie nylon 66 vezel in centrifuge experiment (open boek, mondeling)<br /> #*welke verband tussen stress en strain<br /> #*Bereken stress en strain<br /> #*Bereken diameter draad<br /> #*Uitrekken bij andere T (onder Tg)<br /> #Vanalles over newtioniaanse viscositeit (def., te zien in shear thinning, verband met molaire massa)<br /> #Wat zijn thermoplastische elastomeren<br /> #Experiment met stelling (van voorbeeld examen blijkbaar)<br /> #*Klopt stelling<br /> #*Bewijs je redenering <br /> #*Geef alle variabelen en hun eenheden gebruikt in bewijs<br /> <br /> ===15 januari 2018===<br /> #Polymerisatie van acrylonitril (radicaal, kationisch, anionisch) (open boek)<br /> #Oefening van rubber (analoog aan laatste (set 5, ex 2) oefeningen, rubber wordt uitgerokken door een kracht, dit wordt gevolg bij temperaturen van 50 °C tot -50 °C, bespreek plot) (open boek, mondeling)<br /> #Leg het verschil uit tussen<br /> #*Performance &amp; property<br /> #*Entanglements &amp; cross-links<br /> #Extruder<br /> #*Geef vergelijk volumetrische flow<br /> #*Leg alle symbolen uit en geef de eenheden<br /> #*Een mould wordt aan een extruder gezet voor een rod-shaped object te maken,teken dit, geef werkings punt (Qextr=Qdie)</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Polymer_Materials&diff=4812 2026-01-09T13:58:03Z

<p>R0857325: </p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Het vak werd vroeger gegeven door Prof. Erik Nies, maar wordt vanaf 2023-2024 gegeven door Bart Goderis en Guy Koeckelberghs. Het examen van Koeckelberghs is mondeling en het examen van Goderis is deels schriftelijk, deels mondeling. De cursus is ook veranderd in 2023-2024 waardoor sommige examenvragen van daarvoor mogelijks niet meer relevant zijn. De lessen van Prof. Koeckelberghs worden niet opgenomen. In 2024-2025 is de leerstof van Goderis weer deels veranderd.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===9 januari 2026===<br /> <br /> big questions Goderis (mondeling)<br /> <br /> # PS has brittle behaviour, why. Mechanical rejuvination can make it ductile, but after some time it becomes brittle again, why?<br /> # Fasediagram, teken fasen in miscible region, metastable region, unstable region. <br /> <br /> small questions Goderis (schriftelijk)<br /> <br /> # shish kebab structuur tekenen en uitleggen<br /> # Newton liquid<br /> # Rubberplateau, what is het moleculaire vereiste om dit te hebben?<br /> # stress relaxation, welk model gebruikt je en waarom niet andere (Kelvin-Voigt, Maxwell)<br /> # Which technique(s) would you use making layered thin plastic foil<br /> # waarom neem viscositeti toe met Mw tot de macht 3.4<br /> # ionomers<br /> # which structure has highest, lowest Tg + why (HDPE, PVC, PP)<br /> # 3 examples of polymers in nature<br /> # ...<br /> <br /> questions koeckelbergs<br /> <br /> # step chain en chain growth uitleggen<br /> # stereospecificiteit, wat is het + 2 voorbeelden van polymerisatietechnieken die specifieke tacticiteit geven<br /> # definieer Mn, Mw + hoe ga je ze meten?<br /> # Structuren gegeven, op welke manier kan je ze polymeriseren?<br /> <br /> ===21 januari 2025===<br /> <br /> big questions Goderis (mondeling)<br /> <br /> # hoe werken de twee mechanismen van plastische vervorming en hoe meet je ze experimenteel. ook vragen over PS, HIPS, salami stuctuur.<br /> # wat zijn compatibalisers, waarom gebruik je ze en hoe breng je ze in een polymeer<br /> <br /> small questions Goderis (schriftelijk)<br /> <br /> # shish kebab structuur tekenen en uitleggen<br /> # waarom gebruik je nylon niet als screws?<br /> # true vs engineering stress en strain<br /> # elastic inversion wat is het<br /> # ldpe blow film<br /> # wat is het percentage petroleum van alle fossiele brandstoffen die we gebruiken<br /> # waarom neem viscositeti toe met Mw tot de macht 3.4<br /> # couette cell tekenen en wat uitleg geven<br /> <br /> questions koeckelbergs<br /> <br /> # step chain en chain growth uitleggen<br /> # verschillende polymeren waaronder isobutylenen en methacrylaten hoe polymeriseren en waarom<br /> # hoe maak je de verschillende tacticiteiten van polymeren en waarom werkt dat<br /> <br /> ===14 januari 2025===<br /> big questions goderis (mondeling)<br /> <br /> # give the different types of polyethylene and how do you make them? there was also a graph given and u needed to point for each polyethylene a graph (graph is in the cursus)<br /> # how can you predict necking? what happens after mechanical rejuvenation and a deep notch?<br /> <br /> questions koeckelberghs (mondeling)<br /> # give the relation between MM and step-growth polymerization + formules<br /> # explain cationic polymerization, how can you make it a living polymerization? <br /> # exercises like in the cursus<br /> <br /> ===25 Januari 2024 (NM)===<br /> big questions Goderis (mondeling)<br /> <br /> # Explain the gel spinning process for Dyneema fibers. Why are they so strong? (How to determine the strength? -&gt; graph)<br /> # Does atactic polystyrene crystallize? Why (not)? How will the Tg change when: MM is increased, adding crosslinks, adding plasticizer. When butadiene is copolymerized with styrene, will the Tg change? (Give the formula of the Tg of a miscible mixture.)<br /> <br /> small questions Goderis (schriftelijk)<br /> <br /> # Properties vs performance.<br /> # Microplastics?<br /> # Flash?<br /> # Draw a Couette cell.<br /> # Co-extrusion?<br /> # Maxwell element vs Kelvin-Voigt element: which one is used for stress relaxation experiments? Why?<br /> # Ionomers?<br /> # Conformation of crystalline PE.<br /> # Why does η0 change with MM^3,4?<br /> # Draw the microstructure of LDPE.<br /> <br /> questions Koeckelberghs (mondeling)<br /> <br /> # Compare chain growth polymerization with step growth polymerization. How does the molar mass change during these reactions?<br /> # Give the formula to calculate the dispersity of a living polymer with the MM. Draw a graph of the polymerization reaction for living polymers.<br /> # Vinyl acetate and ethacrylic acid -&gt; radical/anionic/cationic? Why?<br /> <br /> ===16 Januari 2024===<br /> big questions Goderis (mondeling)<br /> <br /> # states of aggregation and effect of molecular weight<br /> # 3 ways of making thermoplastic elastomers (non-permanent crosslinks)<br /> <br /> small questions Goderis (schriftelijk)<br /> <br /> # plastic vs polymer<br /> # naphta<br /> # is LDPE of LLDPE copolymer<br /> # spinneret<br /> # blown film process<br /> # hoe is de conformatie van kristallijn polyethyleen<br /> # Poiseuille flow<br /> # iets over viscositeit<br /> <br /> questions Koeckelberghs (mondeling)<br /> <br /> #twee vinyl hoe te polymeriseren<br /> #wat is steoregulariteit heef twee types en heeft elke type een soort van polermerisatie da je die stereo krijgt <br /> #chain and step en MM<br /> <br /> ===12 Januari 2024===<br /> big question Goderis (mondeling) <br /> <br /> # polymer melt index(viscosity depends on what? (mm, temperature, shear rate(newton’s law: are polymers newtonian liquid, shear thinning behaviour? -&gt; also look at H7 slide 73<br /> # crystallization graph of 4 polymers (with Tg and Tm) and graph with specific volume something (H7 slide 43!!)-&gt; looks like amorphous polymer graph but it isnt!! -&gt; talk about PE conformations (HDPE LDPE LLDPE). (temperature dependance of free volume is also related to one of these questions (H6))<br /> <br /> <br /> small question Goderis<br /> <br /> # macromolecule vs polymer <br /> # thermo elastic inversion effect for rubbers(H7 slide 71)<br /> # True of false: shrinking foil is high polydispersity needed?<br /> # steam cracking? <br /> # why not use nylon screw? (we did it in the exercise) (strain reduces faster)<br /> # die swelling<br /> # which process for plastic bottles(extrusion blow molding and injection blow molding)<br /> # zero shear rate viscosity increases with mw^3.4 why (H7) <br /> # how to find toughness with tensile experiment (H6)<br /> # dont remember <br /> <br /> <br /> Guy (mondeling) <br /> # Mw and Mn -&gt; how to measure <br /> # anionic living polymerization (counterion, stability, solvent) -&gt; under which conditions: ex no O2/C02 -&gt; peroxide forming…<br /> # dibuteen and 4-Vinylphenol how to polymerize, stabilisatie en compatibele zijgroepen.<br /> <br /> ===24 Januari 2023===<br /> #Welke polymerisatie ondergaat wel/niet onderstaande molecule (10 punten)? <br /> #Begrippen (10 punten)<br /> #*Mz adhv molecular weight + welke eenheid heeft eindresultaat definitie<br /> #*Hoe ziet operating point van een injection er uit? Maak een schets/tekening. <br /> #*Staudinger Hypothese<br /> #UHMWPE (Tabel met gegevens gegeven; 10 punten)<br /> #*Wat is UHMWPE en wat is er speciaal aan?<br /> #*Is deze in coiled vorm? Ja/neen + leg uit waarom.<br /> #*Welke waarden in tabel hebben invloed/zeggen iets over volume van coiled vorm?<br /> #*Leid een formule af voor afhankelijkheid van Mw bij weight density van coiled vorm.<br /> #*Reken uit<br /> #Rubberen bal (ideaal rubber bij Rubbery plateau; 10 punten):<br /> #* Schets storage modulus en loss modulus tussen -50°C - 50°C met Tg = -19°C<br /> #*Leg de schets uit<br /> #*Bal wordt om de zoveel tijd losgelaten vanaf 1m hoog. Schets grafiek (h/T) en waarom heb je die zo geschetst?<br /> #*Hebben &quot;*&quot; 2 en 3 iets met elkaar te maken? Zo ja/neen? Waarom?<br /> <br /> ===29 Augustus 2022===<br /> #Polystyrene<br /> #FJC-model<br /> #Begrippen<br /> #*Staudinger Hypothese<br /> #*Mz<br /> #*Performance VS Property<br /> #Rectangular rubber loaded with mass. T lowers from 50°C to -50°C<br /> #* (zie vraag jan '22)<br /> ===25 januari 2022===<br /> #In which ways can Methyl vinyl ether be polymerised?<br /> #What is the freely jointed chain model + make a drawing indicating the relevant parameters. Give a basic expression for R, give a precise expression for the contour length L. Derive an expression for &lt;R.R&gt; and discuss for each step what you did. <br /> #<br /> #* - What is Newtonian viscosity and how can it be determined from the shear rate dependent viscosity? - Illustrate the dependence of the Newtonian viscosity on the molar mass, what are the molecular reasons for this?<br /> #*- What is a thermoplastic elastomer? - How is it made out of block copolymers? <br /> #* Give the Staudinger hypothesis.<br /> # Rectangular rubber loaded with mass. T lowers from 50°C to -50°C (tabel gegeven met veel gegevens) (oefening analoog aan set 5 over rubbers, oefening 2)<br /> #* What is an ideal rubber?<br /> #* Calculate length of the rubber at 50 °C (gewoon extension ratio berekenen, alle gegevens voor de formule zijn gegeven)<br /> #* Make a plot L(T) from - 50 °C to 50 °C and indicate length from previous exercise (dezelfde vgl oplossen maar dan voor andere temperaturen en je bekomt een dalende rechte vanaf glastransitietemperatuur want vanaf daar is de formule geldig)<br /> #* Explain this behaviour (elasticiteit en entropie)<br /> <br /> ===9 januari 2021===<br /> #In which ways can acrylonitrile be polymerized? <br /> #What is the freely jointed chain model + make a drawing indicating the relevant parameters. Give a basic expression for R, give a precise expression for the contour length L. Derive an expression for &lt;R.R&gt; and discuss for each step what you did. <br /> #<br /> #* Give the definition for Mz, starting from the molecular moments. Discuss each variable and give the units. <br /> #* What is the operating in injection moulding + make a drawing. <br /> #* PE is made by free radical polymerization (Mw = 50 kg/mole, D = Mw/Mn = 3.2), can we make super strong PE fibers from this? Explain<br /> #* State the Staudinger hypothesis. <br /> #A cylindrical nylon fiber is used to suspend a 10 kg rotor in a centrifuge experiment. At T = 60°C, L0 = 20 cm and after 50 minutes, L = 20.0045 cm. <br /> #* What mechanical analogue would you use to describe the centrifuge experiment?<br /> #* Calculate stress and strain at T = 60°C and after 50 minutes. <br /> #* Determine Rs, the radius of the nylon fiber. <br /> #* Determine the elongation of the fiber at T = -10°C and after 24 hours.<br /> <br /> ===22 januari 2020===<br /> <br /> #Vraag 1: Pagina 1 van voorbeeld examenvragen<br /> #Vraag 2 (mondeling): Rechthoekig rubber wordt beladen met een massa. T daalt van +50°C tot -50°c met 1°C/min en er is nog een tabel met een heel aantal gegevens beschikbaar. <br /> #* Bereken de lengte van het rubber bij 50°C (gewoon extension ratio berekenen, alle gegevens voor de formule zijn gegeven)<br /> #* Maak een plot van lengte ifv temperatuur en neem je bekomen lengte uit bovenstaande vraag mee (dezelfde vgl oplossen maar dan voor andere temperaturen en je bekomt een dalende rechte vanaf glastransitietemperatuur want vanaf daar is de formule geldig)<br /> #* Verklaar je observatie (elasticiteit is door entropie bepaald, geef analogie met veerconstante) <br /> #Gesloten boek: Pagina 2 van voorbeeld examenvragen<br /> <br /> ===13 januari 2020===<br /> #Vraag 1 van voorbeeldexamen (open boek)<br /> #Vraag met grafiek Young's modulus van voorbeeldexamen (open boek, mondeling)<br /> #Verschil copolymerisatie Ziegler-Natta vs metalloceen van voorbeeldexamen (gesloten boek)<br /> #Formule kracht elasticiteit, entropieveer van pagina 4 voorbeeldexamen (gesloten boek) <br /> #Tabel met info UHMWPE. Waarvoor staat UHMWPE? Wat is er typisch aan deze graad? Afleiden densiteit van coiled coil, welke assumpties maak je bij deze afleiding? Uitrekenen densiteit. Is (een specifieke naam van polymeer) PE in de coiled coil conformatie? <br /> <br /> ===14 januari 2019===<br /> <br /> #vraag 1: pagina 1 van voorbeeld examenvragen<br /> #vraag 2 (mondeling): Rechthoekig rubber wordt beladen met een massa. T daalt van +50°C tot -50°c met 1°C/min en er is nog een tabel met een heel aantal gegevens beschikbaar. <br /> #* Bereken de lengte van het rubber bij 50°C (gewoon extension ratio berekenen, alle gegevens voor de formule zijn gegeven)<br /> #* Maak een plot van lengte ifv temperatuur en neem je bekomen lengte uit bovenstaande vraag mee (dezelfde vgl oplossen maar dan voor andere temperaturen en je bekomt een dalende rechte vanaf glastransitietemperatuur want vanaf daar is de formule geldig)<br /> #* Verklaar je observatie (elasticiteit is door entropie bepaald, geef analogie met veerconstante) <br /> #Gesloten boek: pagina 2 van voorbeeld examenvragen<br /> <br /> ===16 januari 2018===<br /> #Hoe polymeriseert methylvinylether? (open boek)<br /> #Oefening elongatie nylon 66 vezel in centrifuge experiment (open boek, mondeling)<br /> #*welke verband tussen stress en strain<br /> #*Bereken stress en strain<br /> #*Bereken diameter draad<br /> #*Uitrekken bij andere T (onder Tg)<br /> #Vanalles over newtioniaanse viscositeit (def., te zien in shear thinning, verband met molaire massa)<br /> #Wat zijn thermoplastische elastomeren<br /> #Experiment met stelling (van voorbeeld examen blijkbaar)<br /> #*Klopt stelling<br /> #*Bewijs je redenering <br /> #*Geef alle variabelen en hun eenheden gebruikt in bewijs<br /> <br /> ===15 januari 2018===<br /> #Polymerisatie van acrylonitril (radicaal, kationisch, anionisch) (open boek)<br /> #Oefening van rubber (analoog aan laatste (set 5, ex 2) oefeningen, rubber wordt uitgerokken door een kracht, dit wordt gevolg bij temperaturen van 50 °C tot -50 °C, bespreek plot) (open boek, mondeling)<br /> #Leg het verschil uit tussen<br /> #*Performance &amp; property<br /> #*Entanglements &amp; cross-links<br /> #Extruder<br /> #*Geef vergelijk volumetrische flow<br /> #*Leg alle symbolen uit en geef de eenheden<br /> #*Een mould wordt aan een extruder gezet voor een rod-shaped object te maken,teken dit, geef werkings punt (Qextr=Qdie)</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Immunological_Biotechnology&diff=4440 2025-01-21T12:31:47Z

<p>R0857325: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak van derde bachelor biochemie. Ook gevolgd door zij die willen van chemie en biologie. Het wordt gegeven door Prof. Liliane Schoofs en is een mondeling examen met schriftelijke voorbereiding. Ze leest je antwoord en stelt dan bijvragen. Door de corona maatregelen is het vak nu volledig schriftelijk, en bestaat uit een combinatie van kleine open vragen met beperkte ruimte (1/3e blad of max 5 lijnen), en meerkeuzevragen.<br /> Er wordt een volledige en verplichte practicum week gehouden, je mag zelf je groepje kiezen (4 personen max). Van het practicum wordt ook een schriftelijk examen gehouden, waarbij je enkel vragen krijgt over de proefjes die jij hebt uitgevoerd.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> === 21 januari 2025===<br /> #CD4 en CD8 T cellen (1.5 blad)<br /> #*Hoe worden ze geactiveerd, welke moleculen komen er aan te pas<br /> #*Wat gebeurt er net nadat ze geactiveerd worden in de secundaire lymfe<br /> #*Wat zijn de functies van de effectorcellen<br /> #*Welke infecties bestrijden ze<br /> #Waarom is een ontstekingsrespons tegen bacterien in de darm negatief? (0.5 blad)<br /> #3 Foto's<br /> #*Original antigenic sin: wat is de beste keuze, een boostervaccin van delta-variant of van gewone variant<br /> #*lymfe; aanduiden waar naïve B, T cellen zaten en waar geactiveerde B cellen<br /> #*Variabele regio's aanduiden bij 'uitgerolde' Ig<br /> #MC (zonder giscorrectie)<br /> #Definities: extravasatie, clonal selection theory, superantigen<br /> <br /> === 23 januari 2024 ===<br /> #Leg immuunrespons uit na een vaccinatie. Op moleculair, cellulair en orgaan niveau<br /> #Figuur van 'Variability at coding joints by insertion of P and N nucleotides' (Ig gene rearrangement; HF 4, fig 5.11 in HB). Aanduiden in welke stap de P nucleotiden gevormd worden en de P nucleotiden zelf ook aanduiden.<br /> #Figuur Peyer's patch. Wat is het en duid alles aan op de figuur<br /> #10 meerkeuzevragen<br /> #Definities: <br /> #*original antigenic sin<br /> #*homing<br /> #*linked recognition<br /> #*M cell<br /> #*Figuur van Ig met constante regio van heavy chain aangeduid. Aanduiden welk gene segment hiervoor codeert op figuur van 'the germline organisation of the IgG' (HF 4, fig 5.5 in HB)<br /> <br /> === 31 augustus 2023 ===<br /> #Wat is autoimmunity en hoe komt het tot stand? Geef ook een voorbeeld van een auto-immune disease ter illustratie van je antwoord.<br /> #Figuur van linked recognition. Benoem onderdelen op de figuur, leg kort uit en waar vindt dit proces plaats?<br /> #Figuur van de werking van VDJ recombinase met RAG1 en RAG2 en Ku70 en Ku80. Je moest de prentjes nummeren in de juiste volgorde<br /> #10 meerkeuzevragen<br /> #Definities: innate lymphoid cells, original antigenic sin, E-selectin, clonal selection en mast cells<br /> <br /> === 21 augustus 2023 ===<br /> # Een gezonde persoon wordt besmet met mazelen en is hiertegen nog nooit gevaccineerd geweest. Leg het immuunrespons grondig uit, waar gebeurt welke stap cellulair en lichamelijk?<br /> # Short questions:<br /> #* Figuur Linked recognition. Benoem onderdelen op de figuur en leg kort uit, waar vindt dit plaats?<br /> #* Figuur immunoglobin &amp; genen. Genen aanduiden van gearceerd deel op immunoglobin<br /> #* 10 MC vragen<br /> # Definities:<br /> #* central tolerance<br /> #* Innate Lymphoid Cell<br /> #* Original antigenic sin<br /> #* P-selectin <br /> #* Receptor editing<br /> <br /> === 1 februari 2023 ===<br /> # Geef uitgebreid de drie processen waarbij diversiteit immunoglobines stijgt door somatische DNA rearrangement (max1,5pagina). Wat is het grootste voordeel aan polymorfisme van de HMC allelen voor individuen en soorten van hogere orde (max halve pagina) <br /> # Short questions:<br /> #* Figuur thymus dependent en independent antigenen. 2 signalen nodig voor activatie B cellen uitleggen adhv deze figuur.<br /> #* Figuur activatie B cellen in de spleen. Aanduiden en uitleggen<br /> #* 5 MC vragen over: secondary response, vaccin, TNF alfa auto immuunziekte, binding Ab, ?<br /> # Definities: NIET MET WOORDJES VERBINDEN, ZELF DEFINITIE KUNNEN GEVEN<br /> #* Extravasation<br /> #* Peyer's Patch<br /> #* Original antigenic sin<br /> #* Aanduiden welke antigenen gepresenteerd worden aan CD8 T cellen.<br /> #* Aanduiden 3 CDR op light chain V region (zie les 4 dia 10) <br /> <br /> === 24 januari 2023 ===<br /> # Leg de immuunrespons uit na een infectie met een pathogeen. Geef daarbij ook twee verschillen tussen een type 2 respons van een helminth en een type 3 respons van een extracellulaire pathogeen. (max 2 pagina's)<br /> # Short questions:<br /> #* Figuur van end joining tijdens VDJ rearrangement. Stap aanduiden waarin P nucleotiden gevormd worden en P nucleotiden aanduiden. <br /> #* Covid vaccin is gebaseerd op het spike proteïne van het coronavirus. Is de immuunrespons op infectie met de delta (10 mutaties in spike proteïne) en omicron (30 mutaties) variant even goed bij een boostervaccin gebaseerd op de originele variant als een vaccin gebaseerd op deze variant zelf? <br /> #* 4 MC vragen over ziekte waarbij deficiëntie in CD8 T cellen, en geen MHC class I aanwezig, wel veel antibodies en B cellen. (vragen over positieve selectie, waarom wel B cellen (niet afhankelijk van MHC I), PAP complex, soort pathogeen dat MHC I herkent)<br /> #* 1 MC over tumor van B cellen waarin mutatie waardoor minder V en J fragmenten, wat is het verschil tussen deze tumorcellen en normale B cellen. (vaag zonder context, maar was vrij makkelijk)<br /> # Definities:<br /> #* Homing<br /> #* Immunological synapse<br /> #* Mucosal tolerance<br /> #* Linked recognition<br /> #* Figuur van antibody en genen, deel van antibody gearceerd, aanduiden welke genen zorgen voor dat deel (was de constante regio van de light chain, dus C segment van genen zonder D fragmenten)<br /> <br /> === 6 september 2022 ===<br /> # Leg immuunrespons na vaccinatie met het covid mRNA vaccin uit, cellulair en lichaam niveau<br /> # Short questions:<br /> #* True/False: Iets van affiniteit stijging van beide, BCR en TCR<br /> #* MC: virale infectie met hoge IgM IgG verhouding wat kan je afleiden<br /> #* MC: Wat is Digeorge syndroom<br /> # Geef de definities van: Original antigenic sin, toll like receptor, class switching, homing, ... <br /> === 22 augustus 2022 ===<br /> # Figuur: Development of T-cells. Leg uit wat er op cellulair level gebeurd en wat er op level van the human body gebeurd (1 pagina).<br /> # Short questions:<br /> #* HIV attacks helper-T-cells<br /> #* Why are children with disrupt B-cell function vunerable to infection?<br /> #* Door dit proces hebben gewervelden miljoenen verschillende lymphocyten. Over welk proces gaat het, en leg uit?<br /> #* Uitleggen waarom bij een transplantatie het orgaan afgestoten kan worden door de donor.<br /> # Meerkeuze vragen:<br /> #* Mutant waarbij expressie van Rag1/Rag2 gewijzigd is, waar in het lichaam en welke eiwitten kun je allemaal controleren om dit vast te stellen? (9 opties: RAG1/RAG2 zelf in bone marrow/thyroid/of thymus, TCR in bone marrow/thyroid/of thymus, expressie van IgD en IgM in bone marrow/thyroid/of thymus)<br /> #* Met wat interageren T-cellen<br /> #* Wat gebeurd er als alternative mRNA splicing niet werkt?<br /> #* Hoezo worden we nog steeds ziek als ons adaptive immuunsysteem zo geoptimaliseerd is? <br /> #* Wat veroorzaakt een ziekte zoals Lupus?<br /> # Geef de definities van: Anergy, Digeorge syndrome, IgM, MHC restriction &amp; ITAM<br /> <br /> === 25 januari 2022 ===<br /> # Infection of a bacteria. Explain the immune respons (with schemes) (max 2 pages). <br /> # Figure (11.6): Naive T cell and Effector T cell: Leg uit; Welke cellen zie je, functie van die oppervlakte-moleculen...<br /> # Stellingen<br /> #* True/False: Classical MHC class I molecules are highly polymorphic, as opposed to MHC class Ib, which are oligomorphic + explain your answer<br /> #* True/False: A developing T cell may by chance express both an αβ heterodimer and a γδ heterodimer if all the loci recombine successfully. + explain<br /> #* Which Ig for pathogens and allergies? Omcirkel antwoord: IgA, IgE, IgM, IgD... <br /> #* True/False: innate receptors inherited in genome, adaptive's niet<br /> #* Woordjes matchen met definitie: Anergy, receptor editing, clonal selectie, en nog 1 woordje<br /> # Definities geven: linked recognition, class switch, toll like receptor, nog 2<br /> <br /> === 24 augustus 2020 ===<br /> Het examen was precies hetzelfde als het examen van 2 juli 2020.<br /> <br /> === 2 juli 2020 (inhaalexamen) ===<br /> # True/False en leg uit in max 5 lijnen: HIV valt de T helper cellen aan en daarom hebben patiënten met vergevorderde HIV geen enkel immuunsysteem meer.<br /> # Wat is het verschil tussen cytotoxische T cellen en T helper cellen?<br /> # Bij ... ziekte ontwikkelen de B cellen niet, en als gevolg hebben deze patiënten zeer veel infecties. Waarom? (max 5 lijnen)<br /> # Door dit proces hebben gewervelden miljoenen verschillende lymphocyten. Over welk proces gaat het, en leg uit?<br /> # Uitleggen waarom bij een transplantatie het orgaan afgestoten kan worden door de donor.<br /> # Figuur: ontwikkeling van een B/T cel, zeggen welke cel het is, en kort per stap uitleggen wat er in de figuur gebeurt zowel op cellulair vlak als op schaal van het lichaam.<br /> # 5 meerkeuzevragen (geen giscorrectie):<br /> #* Mutant waarbij expressie van Rag1/Rag2 gewijzigd is, waar in het lichaam en welke eiwitten kun je allemaal controleren om dit vast te stellen? (9 opties: RAG1/RAG2 zelf in bone marrow/thyroid/of thymus, TCR in bone marrow/thyroid/of thymus, expressie van IgD en IgM in bone marrow/thyroid/of thymus)<br /> #* Hoezo worden we nog steeds ziek als ons adaptive immuunsysteem zo geoptimaliseerd is? (zeer makkelijk)<br /> #* Cytotoxische T cellen kunnen binden aan: MHCI, MHCII, foreign antigens,...<br /> #* (lijst autoimmuunziektes) hebben allemaal gemeenschappelijk dat: (8 ofzo opties, alles aanduiden dat van toepassing was)<br /> #* laatste vergeten<br /> === 24 januari 2020 ===<br /> # Figuur: B cel die geactiveerd wordt door Helper T cel en door een bacterie met Ab. Dit ging verder naar de 3 technieken die Ab gebruiken in het humoral immunity (neutralisation, opsonization en complement activation)<br /> # Figuur: MHC class 1 molecules worden geladen met Ag-peptiden in het ER<br /> # Figuur: gekleurde T cel waarbij je moest zeggen welke delen gekleurd waren (granules en synaps van cytotoxic T cel) en wat de functie is<br /> # 3 afbeeldingen van Ab waarbij je de verschillen moest aanhalen (somatic hypermutation en class switching)<br /> <br /> === 17 januari 2020 ===<br /> # Figuur: differentiatie van naive T-cell naar actieve T-cellen en memory T-cellen<br /> # Figuur Gelelektroforese van Germline DNA en B-cell DNA <br /> # Figuur DJ recombinatie met RAG en Artemis<br /> # True/false vragen (+ 2 multiple choice):<br /> <br /> === 16 januari 2020 ===<br /> # Figuur: Infection and Immunity response can be divided in series of stages (aanvullen, uitleggen)<br /> # Figuur: Experiment met nude en scid muis<br /> # Figuur: T cell receptor alpha and beta chain gene rearrangement.<br /> # True/false vragen (2) (+ 1 multiple choice):<br /> #* een verhaaltje waar je moest zeggen of het: opsonisation, neutralisation, ... was<br /> #* waar en niet waar vragen waren beiden over Tcell Receptor<br /> === 13 januari 2020 ===<br /> # Figuur van extravasation waarbij neutrofiel aankomt op plaats van infectie, slowing down door selectines en uiteindelijk full stop door integrins. Waarna deze in het geïnfecteerde weefsel binnendringt.<br /> # Figuur waarbij je VDJ recombinatie moest uitleggen met elke stap. (vb bijvraag: Waarom heeft de light chain geen D segment)<br /> # Figuur van MHC-restrictie (deze term moet je geven) + uitleggen<br /> # True/false vragen (+ één multiple choice):<br /> #* Eosinophils worden vooral tegen parasieten ingeschakeld<br /> #* Progenitor Myeloids zijn voorgangers van T, B en NK cellen.<br /> #* Lipopolysacchariden zijn proteïnen die worden gesecreteerd.<br /> #* (Heel simpel) Nog iets over VDJ recombinatie waarbij je de zin moest aanvullen (je kon kiezen uit 4 termen), waarbij het ging over de DNA-segmenten, maar was heel makkelijk af te leiden welke term de juiste is.<br /> <br /> === 28 januari 2019 ===<br /> voor en namiddag hadden dezelfde vragen<br /> <br /> # Figuur van B cell die geactiveerd werd door Helper T cell en door een bacterie met Ab. Dit ging verder naar de 3 technieken die Ab gebruiken in het humoral immunity (neutralisation, opsonization en complement activation)<br /> # Figuur waarbij je moest uitleggen hoe MHC class 1 molecules worden geladen met Ag-peptiden in het ER.<br /> # Figuur van een MHC class 1 molcule die een peptide gebonden had, je zag dus de bèta-sheets en het peptide met zijn aminozuren. <br /> # Figuur van B cellen die in het been merg matureren tot plasma en memory cellen. Je moest zeggen dat er VDJ rearrangement komt, selectie van de B cellen o.b.v. self Ag, dit moest ook allemaal geplaatst worden in het lichaam.<br /> <br /> ===18/01/2019 NM===<br /> # Figuur van het maturatie process van T cellen in de thymus. Vraag: In welk orgaan speelt dit zich af en leg uit hoe dit gebeurt.<br /> # Figuur experiment van gel waarop germline DNA was geladen van C en V regio en van B cell DNA van C en V regio. Vraag: wat gebeurt er in dit experiment en wat kan je er uit afleiden (antwoord enkel op voorkant onder foto)<br /> # Figuur van verloop recombinatie DNA tussen D en J regio. Vraag: een aantal koppen waren weggelaten en moesten worden aangevuld en elke stap in 1 zin uitleggen<br /> # MC en juist fout vragen:<br /> #* Wat gebeurt er niet tijdens inflammation? (mogelijke anwtoorden: expressie cytokines, expressie chemokines, innate en adaptive immunity activeren, vernouwen van bloedvaten)<br /> #* Gebruiken NK cellen MHC class I? (mogelijke antwoorden: true or false)<br /> #* Wat gebeurde er niet in de evolutie van adaptieve immuniteit? (een aantal antwoorden die ik niet meer weet)<br /> #* Zorgen adaptieve immuniteitscellen voor specificiteit? (mogelijke antwoorden: true or false) <br /> #* Hematopoietic cellen kunnen nog in elke cel van het lichaam veranderen (mogelijke antwoorden: antwoorden true or false)<br /> <br /> ===17/01/2019 NM===<br /> # Figuur, opname bacterie, alles uitleggen, MF, dendritische cel, lymfe knopen, maturatie, ... Heel het immuunsysteem<br /> # Figuur, muizen SCID en Nude (alles staat op de afbeelding)<br /> # Figuur, Recombinatie T-cel (zelf aanvullen)<br /> # MP choice/ juist fout, 3 vraagjes eerste was over iemand die een ziekte had gekregen door het eten van fruit dat ze ingeblikt had. En dan moest ik zeggen welk mechanisme er het meest op ging reageren... Het ging om toxines dus had neutralisation gepakt, dat was juist. 2e snapte ik niets van, ging over bindingen tussen B- en T- cellen, het was complete nonsens, en dus fout. 3e was over recombinatie<br /> <br /> ===14 januari 2019 NM===<br /> # figuur uitleggen: virale infectie en laden van virale peptiden op MHC moleculen + wat daarna?<br /> # figuur uitleggen: experiment waarin beenmerg wordt getransfereerd naar bestraalde muizen met verschillend MHC genotype <br /> # figuur uitleggen: 3 manieren waarop Igs met rearranged V-region gewijzigd kunnen worden<br /> # 5 (gemakkelijke) korte vraagjes: 4 meerkeuze en 1 juist/fout<br /> <br /> ===23 augustus 2018 VM===<br /> # costimulus op immuuncellen, welke receptor, waarom?<br /> # class switching uitleggen: wat, wanneer,...<br /> # NK cellen, waneer, hoe mechanisme, hoe virus MHC-I tegehoudt<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> # Belang MHCI bij een niet geïnfecteerde cel<br /> # Activatie van naïve T-cel<br /> # geeft een verandering in de genen van een BCR uniek voor een b-cel<br /> ===18 januari 2018 VM===<br /> # Vergelijk folliculaire dendritische cel met een gewone dendritische cel.<br /> # Leg linked recognition uit en geef een medische toepassing.<br /> # Leg de werking van interferon gamma uit bij T cel differentiatie.<br /> <br /> ===16 januari 2018 VM===<br /> #Belang van Th1 cellen bij immuunrespons tegen intracellulaire bacterien<br /> #Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> #Bespreek en verklaar de invloed van meerdere immunizaties bij hetzelfde antigen bij humorale respons<br /> <br /> === 15 januari 2018 ===<br /> #costimulus op immuuncellen, welke receptor, waarom?<br /> #class switching uitleggen: wat, wanneer,...<br /> #NK cellen, waneer, hoe mechanisme, hoe virus MHC-I tegehoudt<br /> <br /> === 25 augustus 2017 VM ===<br /> # Bespreek de immuunrespons tegen extracellulaire parasieten.<br /> # Bespreek activatie van naïve B-cellen<br /> # Bespreek 3 fundamenteel verschillende mechanismen die auto-immuniteit voorkomen op verschillende plaatsen in het lichaam.<br /> <br /> === 31 januari 2017 ===<br /> #immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #activatie van naïve B-cellen<br /> #3 verdedigingsmechanisme om autoimmuniteit tegen te gaan<br /> <br /> === 30 januari 2017 VM ===<br /> #Belang van Th1 cellen bij immuunrespons tegen intracellulaire bacterien<br /> #Affinieteitmaturatie van B cellen<br /> #Bespreek de cellen die belangrijk zijn bij negatieve selectie van T cellen<br /> <br /> === 19 januari 2017 VM===<br /> #Immuunrespons endotheel<br /> #Thymus onafhankelijke B cel activatie<br /> #Centrale en perifere tolerantie T cellen a.d.h.v. voorbeeld<br /> <br /> === 17 januari 2017 NM=== <br /> #belang van MHC1 complex en gezonde lichaamscellen <br /> #Iets van bcr en gentransformatie <br /> #Activatie van Tcellen <br /> <br /> === 17 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek de rol van IFN-alfa en beta bij een virale infectie <br /> #Bespreek centrale en perifere tolerantie bij B CELLEN<br /> #Bespreek waarom CD8 T cellen meer stimulatie nodig hebben ivm CD4 T cellen <br /> <br /> === 16 januari 2017 NM ===<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten (wormen dus)<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.<br /> <br /> === 25 januari 2016 VM===<br /> # Geef de verschillen tussen folliculaire en normale dendritische cellen<br /> # Wat is linked recognition en geef een medische toepassing<br /> # Welke rol speelt IFN-γ bij de T-cel differentiatie?<br /> <br /> === 12 januari 2016 VM ===<br /> #Bespreek de immuunrespons op extracellulaire parasieten<br /> #Hoe worden naïve B-cellen geactiveerd?<br /> #Bespreek 3 fundamenteel verschillende mechanismen die autoimmuniteit voorkomen op verschillende plaatsen in het lichaam.<br /> <br /> === 11 januari 2016 NM ===<br /> #Bespreek het belang en mechanisme van activatie van het vasculair endotheel in de immuunrespons<br /> # Hoe kunnen B cellen geactiveerd worden als er geen T cellen aanwezig zijn<br /> # Centrale en perifere tolerantie van T cellen<br /> <br /> ===13 Jan 2015 (VM)===<br /> #Functie van interferon alfa en beta in virusinfectie<br /> #Bespreek aan de hand van een voorbeeld de centrale en perifere tolerantie van B cellen<br /> #Verklaar waarom CD8 meer costimulus nodig heeft dan CD4<br /> <br /> ===29 Jan 2014 (VM)===<br /> #Bespreek de vasculaire immunorespons van endotheelcellen<br /> #Bespreek thymus independent activation of B-cells<br /> #Bespreek aan de hand van een voorbeeld de centrale en perifere tolerantie van B cellen (ze zegt voorbeeld, maar als je gewoon uitlegt hoe de tolerantie tot stand komt is het goed)<br /> <br /> ===Jan 2014===<br /> #Functie van interferon alfa en beta in virusinfectie <br /> #Leg aan de hand van 1 voorbeeld de centrale en periferele tolerant van B cellen uit <br /> #Verklaar wrm CD8 meer costimulus nodig heeft dan CD4<br /> ===28 Jan 2014 (VM)===<br /> #Bespreek de expressie van een MHCI op een gezonde lichaamscel<br /> #Bespreek een verandering in de genen van de BCR die de B-cellen uniek maakt<br /> #Bespreek T cel priming.<br /> <br /> ===16 jan 2013 NM===<br /> (cfr 27 aug 2012)<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit.<br /> ===27 aug 2012===<br /> #Bespreek immuunrespons tegen extracellulaire parasieten<br /> #Bespreek activatie van naïeve B-cellen<br /> #Bespreek drie fundamenteel verschillende mechanismen die ons beschermen tegen auto-immuniteit. <br /> === 27 jan 2012 NM===<br /> # Sommige micro-organismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het micro-organisme?<br /> # Bewijs dat thymus-stromacellen essentieel zijn voor de ontwikkeling van T-cellen<br /> # Bespreek hoe Th1-cellen de reactie tegen intracellulaire pathogenen via de macrofagen coördineren.<br /> === 27 jan 2012 VM===<br /> # Macrofagen zijn zowel in het aangeboren als het adaptief immuunsysteem belangrijk. Verklaar<br /> # Bespreek de primaire en secundaire antistof reactie<br /> # Vergelijk NK en CTL cel. Belangrijkste gelijkenissen en verschillen<br /> === 22 aug 2011 NM ===<br /> # Bespreek de rol van macrofagen in zowel de aangeboren en als de adaptieve immuunrespons. <br /> # Vergelijk de primaire en de secundaire immuunrespons.<br /> # Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> <br /> === 28 jan 2011 VM ===<br /> # Sommige microorganismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het microorganisme?<br /> # Bespreek het hapten-carrier effect en geef een medische toepassing. <br /> # Hoe kan een T cel aangezet worden tot clonale expansie?<br /> === 29 jan 2010 NM ===<br /> # Bespreek de rol van macrofagen in zowel de aangeboren en als de adaptieve immuunrespons. <br /> # Vergelijk de primaire en de secundaire immuunrespons.<br /> # Bespreek de gelijkenissen en verschillen NK en CTL cellen.<br /> === 22 jan 2010 NM ===<br /> # Sommige microorganismen kunnen enzymen synthetiseren die het Fc fragment van antilichamen kunnen degraderen. Waarom zou deze eigenschap een hogere graad van overleving kunnen opleveren voor het microorganisme?<br /> # Bespreek het hapten-carrier effect en geef een medische toepassing. <br /> # Hoe kan een T cel aangezet worden tot clonale expansie?<br /> === 12 jan 2009 ===<br /> # Sommige organismen kunnen Fc fragmenten afbreken. waarom zou dit een hogere graad van overlevering opleveren?<br /> # Bewijs dat thymus stroma cellen essentieel zijn voor de ontwikkeling van T-cellen<br /> # Bespreek de interactie van Th1 cellen met macrofagen.<br /> === 12 jan 2009 ===<br /> # Bespreek de immunologische respons tegen een bacteriele infectie<br /> # Bespreek activatie van naive B-cel<br /> # 3 manieren om auto-immuniteit te omzeilen<br /> === 29 jan 2008 ===<br /> # Sommige pathogenen bevatten enzymen die die Fc fragmenten kunnen degraderen. Hoe kan dit een grotere overlevingskans opleveren voor dit pathogeen<br /> # Leg het hapteen-carrier effect uit en geef een toepassing<br /> # Hoe wordt een naïeve T-cel geactiveerd.<br /> <br /> === 28 jan 2008 ===<br /> # Activatie naive B cel<br /> # Immuunrespons tegen bacteriële infectie<br /> # 3 vbn. hoe er gezorgd wordt dat er geen autoimmuniteit is<br /> === 24 jan 2008 ===<br /> # Macrofagen hebben een rol in zowel innate als adaptive immunity, leg uit.<br /> # Leg de primaire en de secundaire antistofrespons uit.<br /> # leg gelijkenissen en verschillen uit van NK en CTL cells<br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # Bespreek de immuunrespons tegen bacteriële infectie (neen niet tegen intracellulaire, gewoon baceteriën int algemeen)<br /> # Bespreek activatie van naïeve B cel (neen niet T cel, goed lezen en vooral niet beginnen knallen van T cellen omdagu de voorbeeldvraag nog herinnert)<br /> # Bespreek de drie mechanismen die het lichaam beschermt tegen autoimmuniteit (of voorkomt of gebruikt ofzo)<br /> <br /> Practica:<br /> # Teken en leg uit. Kan je ook doen me een antigen me maar 1 epitoop<br /> # Wat leer je erdoor van de pI? Teken.<br /> # Wat is passieve en actieve hemagluttinatie + tekenen. Bewijs dat de interactie reversibel is<br /> # Leg het precipitatiemechanisme uit. Wat doet een PD10 kolom, naam + uitleg<br /> # Welke PAP concentratie verkies je (paar vb getalletjes, je kiest natuurlijk de beste). Verschil passieve en competitieve ELISA<br /> <br /> === 24 jan 2007 ===<br /> # bespreek de naieve Tcel en clonale expansie<br /> # Fc fragment: sommige organismen kunnen het afbreken. Hoe levert dit een hogere overleving op voor het organisme?<br /> # wat is het hapteen carrier-effect en geef toepasssingen.<br /> === 23 jan 2007 ===<br /> # bespreek de rol van macrofagen in aangeboren en adaptief immuunrespons<br /> # vergelijk: Primair vs Secundair immuunrespons<br /> # bespreek de gelijkenissen en verschillen NK - CTL.</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Chemische_Thermodynamica&diff=4350 2025-01-14T13:09:44Z

<p>R0857325: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Zowel gevolgd door chemie als biochemie, tegenwoordig in het derde jaar voor biochemie en tweede jaar chemie. Een 'mondeling' examen met schriftelijke voorbereiding. In theorie want in praktijk verloopt het examen zonder veel woorden. De examenstructuur is altijd dezelfde: 3 theorievragen en 2 oefeningen, waarvan één altijd gaat over entropieverandering. Sinds 2012-2013 komt één van de theorievragen uit één van de artikels die je vooraf moest lezen, enkel deze vraag wordt mondeling besproken.<br /> Het vak wordt gedoceerd door professor Thierry Verbiest.<br /> <br /> '''Alle vragen van het einde van elk hoofdstuk (Elisabeth I.):'''<br /> https://drive.google.com/file/d/1J_23Lh2eyP2lzxUNz9JKv4si8D7028PJ/view?usp=sharing<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===13 januari 2025 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen<br /> #*Wat is het hydrofoob effect? <br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu. <br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #isotherme processen<br /> #*leidt een afdrukking uit voor arbeid en warmte bij een reversibel en irreversibel isotherm proces<br /> #*Bewijs dat dH en dU gelijk zijn aan 0 voor een isotherm proces bij ideale gassen. Motiveer je antwoord.<br /> #*Leg uit waarom de geleverde arbeid bij een reversibel isotherm proces groter is dan bij een reversibel adiabatisch proces.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding<br /> #Micelvorming: leg uit hoe je ΔG°, ΔH°,ΔS° kan bepalen als je de kritische micelconcentratie kent. Leidt de relevante formules af.<br /> #Oefening 1: Wat is de reactie enthalpie van een reactie waarbij de evenwichtsconstante verdubbelt als de temperatuur verhoogd wordt met 15 K bij een temperatuur van 310 K?<br /> #Oefening 2: tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.<br /> #* Wat is de vormingsenthalpie<br /> #* Wat is de normale kooktemperatuur<br /> #* Wat is de druk in het tripelpunt<br /> <br /> === 10 januari 2025 NM ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen<br /> #*Wat is het hydrofoob effect? <br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu. <br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Uit de wiskunde weten we dat een differentiaal 𝑑𝑓 = 𝑎(𝑥,𝑦)𝑑𝑥 + 𝑏(𝑥,𝑦)𝑑𝑦 exact is als (𝜕𝑎/𝜕𝑦)𝑥=(𝜕𝑏/𝜕𝑥)𝑦. In de thermodynamica zou 𝑓 dan een toestandsfunctie zijn. Toon aan voor een mono-atomisch ideaal gas dat dq geen exacte differentiaal is, maar dat dq/T dat wel is. Maak gebruik van bovenstaande definitie van een exacte differentiaal en dq = dU - dW = CVdT + pdV<br /> #Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding<br /> #Carnot cyclus <br /> #Een waterdruppel met diameter 20mm wordt opgesplitst in 1000 gelijke kleine waterdruppeltjes. Bereken de arbeid die hiervoor nodig is. De oppervlaktespanning van water is 0,072N/m, het volume van een bol is (4/3)πr^3 en het oppervlak van een bol is 4πr^2.<br /> #Tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.<br /> #* Wat is de vormingsenthalpie<br /> #* Wat is de normale kooktemperatuur<br /> #* Wat is de druk in het tripelpunt<br /> <br /> === 10 januari 2025 VM ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen<br /> #*Wat is het hydrofoob effect? <br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu. <br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Uit de wiskunde weten we dat een differentiaal 𝑑𝑓 = 𝑎(𝑥,𝑦)𝑑𝑥 + 𝑏(𝑥,𝑦)𝑑𝑦 exact is als (𝜕𝑎/𝜕𝑦)𝑥=(𝜕𝑏/𝜕𝑥)𝑦. In de thermodynamica zou 𝑓 dan een toestandsfunctie zijn. Toon aan voor een mono-atomisch ideaal gas dat dq geen exacte differentiaal is, maar dat dq/T dat wel is. Maak gebruik van bovenstaande definitie van een exacte differentiaal en dq = dU - dW = CVdT + pdV<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Een waterdruppel met diameter 20mm wordt opgesplitst in 1000 gelijke kleine waterdruppeltjes. Bereken de arbeid die hiervoor nodig is. De oppervlaktespanning van water is 0,072N/m, het volume van een bol is (4/3)πr^3 en het oppervlak van een bol is 4πr^2.<br /> #Een ideaal gas wordt bij 37°C isotherm geëxpandeerd van 3 atm tot 1 atm. Bepaal q, W, ΔU, ΔH, ΔSsys en ΔSomg indien dit:<br /> #* reversibel gebeurt<br /> #* gebeurt bij een constante tegendruk van 1atm<br /> <br /> === 6 september 2024 ===<br /> #OPDRACHT: vuurpomp<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).<br /> #*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom<br /> #*Bijvragen<br /> #**Wat is reversibel en irreversibel?<br /> #**Waarom mag je Cv gebruiken? (Het volume is namelijk niet constant bij een compressie)<br /> #**Hoe zou je in beide gevallen (reversibel, irreversibel) de entropie berekenen?<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De variantie in het tripelpunt van een zuivere stof is nul.<br /> #*Het T,x-diagram van een ideaal mengsel kan nooit een azeotroop vertonen.<br /> #*Beschouw een vloeibaar mengsel van A en B. De samenstelling van de vloeistof is hierbij steeds gelijk aan de samenstelling van dampfase.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord.<br /> #*De evenwichtsconstante is dimensieloos.<br /> #* ΔG en ΔG° zijn constanten.<br /> #*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord.<br /> #*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.<br /> #*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenene.<br /> #*De elektrochemische potentiaal is hetzelfde als de chemische potentiaal.<br /> #Oefening 1: isotherme expansie van 3 atm naar 1 atm bij een temperatuur van 37°C. Geef de entropie van de omgeving en van het systeem in volgende gevallen:<br /> #*Reversibele expansie<br /> #*Irreversibel tegen een uitwendige druk van 1 atm<br /> #Oefening 2: je hebt een moedercel met straal 1 µm dat zich opsplitst in 2 gelijke dochtercellen. Het totaal volume blijft gelijk, maar de oppervlakte wordt groter. Wat is de arbeid die hiervoor verricht moet worden als je weet dat de oppervlaktespanning 3.12*10^(-3) N/m is?<br /> <br /> === 16 februari 2024 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #*Bijvragen over de CMC en surfactanten, 2e hoofdwet van thermodynamica &amp; het verband met Gibbs<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord.<br /> #*De evenwichtsconstante is dimensieloos.<br /> #* ΔG en ΔG° zijn constanten.<br /> #*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord. (3)<br /> <br /> #Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar. <br /> #*Bereken U, q en W<br /> #*Bereken ∆S(systeem)<br /> #*Bereken ∆G<br /> #Oefening: Het verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte<br /> <br /> <br /> === 1 februari 2024 NM ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #*Bijvragen over de CMC en surfactanten, 2e hoofdwet van thermodynamica &amp; het verband met gibbs, stabiliteitscurve proteinen, methanol vs water<br /> #Isotherme processen<br /> #*Leid een uitdrukking af voor arbeid en warmte bij een reversibel en irreversibel isotherm proces.<br /> #*Bewijs dat dU en dH gelijk zijn aan nul voor een isotherm proces bij ideale gassen. <br /> #*Leg uit waarom de geleverde arbeid bij een reversibel isotherm proces groter is dan bij een reversibel adiabatisch proces.<br /> #Micelvorming: leg uit hoe je ∆G°, ∆H° en ∆S° kan bepalen als je de kritische micelconcentratie kent. Leid de relevante formules af.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal mbv de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Oefening 1: Wat is de reactie enthalpie van een reactie waarbij de evenwichtsconstante verdubbelt als de temperatuur verhoogd wordt met 15 K bij een temperatuur van 310 K?<br /> #Oefening 2: Tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.<br /> #* Wat is de vormingsenthalpie<br /> #* Wat is de normale kooktemperatuur<br /> #* Wat is de druk in het tripelpunt<br /> <br /> === 23 januari 2024 NM ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> Bijvragen over de CMC, opbouw micellen en amfifiele moleculen, wat is de 2e hoofdwet van thermodynamica &amp; het verband met gibbs...<br /> # Carnot cyclus en omgekeerde Carnot cyclus<br /> #*Toon aan dat DU = 0 en DS = 0 voor de Carnot cyclus.<br /> #*Teken de Carnot cyclus in een T-S diagramma.<br /> #*Wanneer is het rendement van een warmtepomp het hoogst?In de winter of in <br /> de zomer? Verklaar je antwoord.<br /> #Waar of niet waar? Verklaar kort je antwoord.<br /> #*Bij een expansie van een ideaal gas in vacuüm is dU steeds gelijk aan nul.<br /> #*Het volume is een exacte differentiaal.<br /> #*Dichtheid is een extensieve grootheid.<br /> #*Bij een isotherm proces is dW = 0.<br /> #Micelvorming: leg uit hoe je ∆G°, ∆H° en ∆S° kan bepalen als je de kritische<br /> micelconcentratie kent. Leid de relevante formules af.<br /> #Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar. <br /> #*Bereken U, q en W<br /> #*Bereken ∆S(systeem)<br /> #*Bereken ∆G<br /> #Oefening: Tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.<br /> #* Wat is de vormingsenthalpie<br /> #* Wat is de normale kooktemperatuur<br /> #* Wat is de druk in het tripelpunt<br /> <br /> === 23 januari 2024 VM ===<br /> Exact de zelfde vragen als 12 januari 2024<br /> <br /> === 15 januari 2024 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> Bijvragen over de CMC, opbouw micellen en amfifiele moleculen, wat is de 2e hoofdwet van thermodynamica &amp; het verband met gibbs...<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Waar of niet waar?<br /> #*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij<br /> #*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.<br /> #*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning<br /> #*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.<br /> #Oefening: Bereken de molaire massa van creatine gegeven dat de osmotische druk van je 0.1g/l creatine-oplossing 13 torr bedroeg in vergelijking met water bij 25°C.<br /> #Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar. <br /> #*Bereken U, q en W<br /> #*Bereken &amp;Delta;S(systeem)<br /> #*Bereken &amp;Delta;G<br /> <br /> === 12 januari 2024 ===<br /> #OPDRACHT: vuurpomp<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).<br /> #*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom<br /> #*Bijvragen komen letterlijk uit de vragen dat je moet leren voor hoofdstuk 3 (enige dat ik daar verschillend van had: wat gebeurt er als je bij een reversibel proces iets klein aanpast zoals het teken van uw volumeverandering aanpassen compressie &lt;-&gt; expansie)<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer kort je antwoord.<br /> #*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.<br /> #*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenene.<br /> #*De elektrochemische potentiaal is hetzelfde als de chemische potentiaal.<br /> #oefening 1: isotherme expansie van 3 atm naar 1 atm bij een temperatuur van 37°C. Geef de entropie van de omgeving en van het systeem in volgende gevallen:<br /> #*Reversibele expansie<br /> #*Irreversibel tegen een uitwendige druk van 1 atm<br /> #oefening 2: je hebt een moedercel met straal 1 µm dat zich opsplitst in 2 gelijke dochtercellen. Het totaal volume blijft gelijk, maar de oppervlakte wordt groter. Wat is de arbeid die hiervoor verricht moet worden als je weet dat de oppervlaktespanning (iets in die aard) 1.26*10^(-)2 N/m is?<br /> <br /> === 28 augustus 2023 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De evenwichtsconstante is dimensieloos<br /> #*Delta G en delta G° zijn constanten<br /> #*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling<br /> #Beschouw een mengsel van vloeistof A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.<br /> #Oppervlaktespanning<br /> #*Waarom is de druk binnen in een vloeistofdruppel steeds hoger dan erbuiten?<br /> #*Waarom heeft hexaan een lagere oppervlaktespanning dan water?<br /> #*Waarom gebruiken we de Helmholtz functie om de Young-Laplace vergelijking af te leiden en niet de Gibbs functie?<br /> #Oefening 1: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte<br /> #Oefening 2: 0.133 mol van een ideaal gas wordt bij een initiële druk van 5 bar isotherm en reversibel geëxpandeerd van 3 liter tot 10 liter.<br /> #*Wat is de inwendige energie, de arbeid en de warmte?<br /> #*Wat is de entropieverandering van het systeem?<br /> #*Geef de gibbsfunctie.<br /> <br /> === 1 februari 2023 ===<br /> #OPDRACHT: vuurpomp<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).<br /> #*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom.<br /> #Toon aan met een afleiding (begin met vorderingsgraad) dat 𝑅𝑇 ln(𝐾p) = −∆𝐺̅°.<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagram en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅d = 0.<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk. Leg kort uit.<br /> #Beschouw een mengsel (of oplossing) van vloeistoffen A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.<br /> #OEFENING 1: Isotherme compressie van een ideaal gas van 3 atm tot 1 atm bij 27°C. Bereken ∆S(systeem) en ∆S(omgeving) in het reversibele geval en ook bij constante externe druk van 1 atm.<br /> #OEFENING 2: Een druppel water (bol met straal 10 mm) wordt gesplitst in 1000 equivalente kleinere druppels (ook bollen) waarbij het totaalvolume niet verandert. Bereken de arbeid die hiervoor nodig is. Gegeven formules voor volume en oppervlakte bol, oppervlaktespanning water (73 N/m).<br /> <br /> === 16 januari 2023 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De evenwichtsconstante is dimensieloos<br /> #*Delta G en delta G° zijn constanten<br /> #*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling <br /> #Schets fasediagramma van 2 stoffen A en B die slecht mengbaar zijn in vaste fase en goed mengbaar in vloeistoffase. Gibbs faseregel + leg uit<br /> #OEFENING 1: berekenen U, q, W, G, S, H <br /> #OEFENING 2: iets van een moedercel die splitst in 2 dochtercellen waarbij het volume gedeeld wordt door 2 maar de oppervlakte wel veranderd. Berekenen hoeveel arbeid er nodig is om dit proces te laten plaatsvinden (dus oppervlaktespanning doorbreken). Diameter moedercel, oppervlaktespanning, formule opp. en volume bol gegeven.<br /> <br /> === 1 september 2022 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.<br /> #*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenen.<br /> #*De eenheid van ionische activiteit is mol/kg.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de Laplace druk. Verklaar elke stap in je afleiding<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De variantie in het tripelpunt van een zuivere stof is nul.<br /> #*Het T,x-diagram van een ideaal mengsel kan nooit een azeotroop vertonen.<br /> #*Beschouw een vloeibaar mengsel van A en B. De samenstelling van de vloeistof is hierbij steeds gelijk aan de samenstelling van dampfase.<br /> #Oefening: isotherme en reversibele expansie. Berekenen van warmte, arbeid, inwendige energie, entropie van het systeem en gibbs functie <br /> #Oefening: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte<br /> <br /> === 25 augustus 2022 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De evenwichtsconstante is dimensieloos<br /> #*Delta G en delta G° zijn constanten<br /> #*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling <br /> #Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Beschouw een mengsel van vloeistof A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.<br /> #Oefening: isotherme en reversibele expansie. Berekenen van warmte, arbeid, inwendige energie, entropie van het systeem en gibbs functie <br /> #Oefening: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte <br /> <br /> === 17 januari 2022 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅d = 0?<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk? Leg kort uit.<br /> #<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #<br /> #Leid een formule af die aantoont dat een opgeloste stof die de oppervlaktespanning van een oplossing verlaagt, de neiging zal hebben zich op te stapelen aan het oppervlak. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #<br /> #Oefening 1: Wat is de reactie enthalpie van een reactie waarbij de evenwichtsconstante verdubbelt als de temperatuur verhoogd wordt met 15 K bij een temperatuur van 310 K?<br /> #<br /> #Oefening 2: 0.133 mol van een ideaal gas wordt bij een initiële druk van 5 bar isotherm en reversibel geëxpandeerd van 3 liter tot 10 liter.<br /> #*Wat is de inwendige energie, de arbeid en de warmte?<br /> #*Wat is de entropieverandering van het systeem?<br /> #*Geef de gibbsfunctie.<br /> <br /> === 31 augustus 2021 ===<br /> #Vuurpomp afleiding geven voor T en V<br /> #<br /> #Gibbs functie bij mengsels<br /> #*Toon aan dat gibbs ook een alternatieve vorm is voor de 2de hoofdwet<br /> #*Temperatuur- en drukafhankelijkheid van Gibbs functie.<br /> #<br /> #Waar of niet waar?<br /> #*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij<br /> #*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.<br /> #*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning<br /> #*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.<br /> <br /> #Proteine stabiliteit en fasediagram geven en alles uitleggen + de afleidingen van dG folded en unfolded!<br /> #Oefening1: Druk p is gegeven (zo niet kan je gwn pV=nRT stellen) enbij verwaeming is T1= 310 K en T2=325 K, tijdens die verwarming zal de evenwichtsconstante K veranderen tot 2.K (verdubbelen) gaan, wat is de standaard enthalpie? <br /> #Oefening2: gegeven is V1 = 3 L en V2= 10L met druk p=5bar en aantal mol stof = 0.133 mol, geheel is temperatuur onafhankelijk. <br /> #*Geef U, W en q voor als het proces isotherm reversibel expandeert<br /> #*Geef de entropie verandering van het systeem<br /> #*Geef de gibbs functie voor deze situatie<br /> <br /> === 27 januari 2021 ===<br /> #Artikel over proteïne: leg hydrofoob effect uit en waarom vouwing entropisch gedreven is<br /> #Adiabatische processen<br /> #* toon aan dat P1V1^(y)=P2V2^(y) voor een adiabatisch proces<br /> #* toon aan dat de arbeid bij een adiabatisch proces gegeven wordt door W= (Pfin*Vfin-Pinit*Vinit)/(y-1) en dat deze uitdrukking equivalent is met W=Cv(Tfin-Tinit)<br /> #* leg uit waarom we Cv mogen gebruiken in W=Cv(Tfin-Tinit) terwijl het volume niet constant blijft.<br /> # Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal.<br /> # Waar of niet waar?<br /> #* Vergroten van een oppervlak zet energie vrij<br /> #*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.<br /> #*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning<br /> #*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.<br /> #Oef: bereken verschil in entropie van het systeem. gegeven T1, P1 en T2, P2 en Cr (molaire)<br /> #Oef: gegeven: temperatuur tripelpunt, 2 punten (P,T) van naftaleen<br /> #*bereken delta H<br /> #*bereken normaal kookpunt naftaleen<br /> #*bereken P van tripelpunt<br /> <br /> <br /> === 11 januari 2021 ===<br /> #Artikel over proteïne: leg hydrofoob effect uit en waarom vouwing entropisch gedreven is<br /> #Osmose<br /> #La place druk<br /> #Joule -thompson coefficient aantonen dat die 0 is voor ideale gassen<br /> #*bewijs isobare coefficient voor thermische expansie is 1/T voor ideaal gas<br /> #* bewijs isotherme compressibiliteit is 1/p voor ideaal gas<br /> #* Is joule thompsoncoefficient positief of negatief bij een expansieproces dat resulteert in koelen <br /> #oef: w, q, Ssyst, Somg,U en H berekenen bij isotherm proces<br /> #* bij reversibel proces<br /> #*bij Pex van 1 atm<br /> #oef: tripelpunt, kritisch punt, normaal kookpunt en smeltpunt gegeven <br /> #* schets een fasediagram (P,T) hiervan<br /> #* kan je O2 smelten als je de druk verhoogt?<br /> #* bereken Hvap<br /> <br /> ===31 januari 2020===<br /> # Artikel over proteïne: Welke interacties spelen een rol bij de opvouwing van een bêta-hairpin? Hoe dragen deze interacties bij aan de enthalpieverandering van het opvouwingsproces? Gebruik tabel 1.<br /> # Oef: bereken q, W, U. Bereken entropie en Gibbs energie.<br /> # Oef: bereken verandering van entropie.<br /> # Temperatuur- en drukafhankelijkheid van Gibbs functie.<br /> # chemische potentiaal bij osmose afleiden. Hoe kan dit gebruikt worden om de molecuulmassa van polymeren te weten?<br /> <br /> ===17 januari 2020 VM===<br /> # Wat is CMC en geef de verandering in enthalpie bij micelvorming.<br /> # Oef: opwarming van een gas tegen constante druk (Cp gegeven). Bereken warmte, verandering in U en H.<br /> # Oef: bereken de verandering in entropie bij opwarming.<br /> # chemische potentiaal bij osmose afleiden. Hoe kan dit gebruikt worden om de molecuulmassa van polymeren te weten?<br /> # klassieke nucleatietheorie<br /> ===13 januari 2020 NM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oef: P2 en deltaG berekenen<br /> # Oef: deltaS berekenen<br /> # Chemische potentiaal voor zuivere vloeistof en voor mengsel geven. Wet van Raoult en Henry bespreken met een grafiek.<br /> # Membraanpotentiaal en Donnanpotentiaal. Bespreek het verschil. <br /> <br /> ===13 januari 2020 VM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oef: bereken q S en H bij isotherm<br /> # Oef: bereken q, U en G bij isobaar opwarmen gas<br /> # Schets fasediagramma van 2 stoffen A en B die slecht mengbaar zijn in vaste fase en goed mengbaar in vloeistoffase. Gibbs faseregel + leg uit<br /> # mengsel ideale oplossing formules afleiden + wet van Raoult (grafiek)<br /> ===25 januari 2019 NM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oef: dSsyst berekenen bij water gaat van ijs naar vlo (een oef uit oefenzitting 3 met ijs)<br /> # Oef: H U q berekenen bij gegeven T1 T2 p1 en Cp<br /> # Bespreek chemisch pot van mengsel ideale gassen en ideale vlo<br /> # Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom dat oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.<br /> <br /> ===18 januari 2019 NM===<br /> Zelfde als voormiddag, maar carnot cyclus vervangen door proteïne denaturatie + stabiliteitscurve<br /> ===18 januari 2019 VM===<br /> # Artikel over proteïne<br /> # Oefening: Kp gegeven bij twee temperaturen. Bereken delta G, H en S.<br /> # Oefening: 2 mol gas ondergaat isotherme compressie. T, p1 en delta S gegeven. Bereken einddruk en delta G. <br /> # Bespreek carnot cyclus (teken p-V diagram, bereken voor elke stap W, q, U en entropie verandering, toon aan dat U en S voor de hele reactie gelijk aan 0 zijn, bereken efficiëntie)<br /> # Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom dat oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.<br /> <br /> <br /> ===14 januari 2019 NM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oefening over een monoatomisch gas dat isotherm wordt samengedrukt, waardoor de entropie daalt. <br /> #* Wat is de einddruk?<br /> #* Wat is de delta G?<br /> # Oefening over mengsels (zoals gezien in de les). Moleculaire massas en dichtheden gegeven.<br /> #* Hoeveel volume water en methanol moet men mengen om een bepaalde samenstelling te krijgen<br /> # Toon aan dat de entropie gelijk is aan 0 voor een reversibel proces bij fasetransities (bv smelten). Toon ook aan dat dit verschillend is van 0 voor een irreversibel proces<br /> # Leid de formule van Clapeyron af en toon dit aan voor smelten en verdampen<br /> <br /> ===14 januari 2019 VM===<br /> #Vuurpomp<br /> #Oefening over een ideaal gas dat reversibel isotherm wordt geëxpandeerd. T, V1, V2 gegeven. Bereken deltaH, deltaU, deltaG, deltaA, q en W. <br /> #Oefening over een ideaal gas dat isotherm wordt geëxpandeerd. Bereken deltaS van universum, systeem en omgeving in reversibele en irreversibele omstandigheden. V1, V2 en temperatuur gegeven. Voor irreversibele voorwaarden bij een constante externe druk van 0.1 atm. <br /> #Colligatieve eigenschappen <br /> #*Uitleggen en grafiek geven, wat doet de opgeloste stof met het chemisch potentiaal van de vloeistof? <br /> #*Bespreek kookpuntsverhoging<br /> #*Bespreek osmose<br /> #Mengsels van vloeistoffen <br /> #*Leidt een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van mengsels van ideale oplossingen <br /> #*Hoe zit dit voor reële vloeistoffen? (+grafiek)<br /> <br /> ===1 februari 2018===<br /> #vuurpomp<br /> #vraag over donnanpotentiaal<br /> #vraag over mengsels<br /> <br /> ===26 januari 2018===<br /> #Proteinevouwing<br /> #Carnot cyclus<br /> #Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom da oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.<br /> #entropie oef<br /> #verdampingsenthalpie, kookpunt, verdampingsentropie en ebullioscopische cte.<br /> <br /> === 19 januari 2018 ===<br /> <br /> #Vuurpomp uitleggen<br /> # 1 mol gas word isotherm ontspannen, bepaal q, W, delta U, entropie van omgeving en systeem voor een reversibel en irreversibel geval<br /> # gas wordt opgewarmd, bepaal molaire entropie verandering<br /> # chemische potentiaal van vloeistoffen: ideale en reële mengsels, wet van Raoult en wet van Henry<br /> # denaturatie van proteïnen: formule voor delta G in functie van temperatuur afleiden, curve schetsen en grondig bespreken<br /> <br /> === 19 januari 2018===<br /> # Vuurpomp<br /> # 1 mol ideaal gas: expansie van 20L tot 200L bij 300K. Gevraagd: entropieverandering van systeem, omgeving en universum voor: <br /> #* a. Reversibel<br /> #* b. Irreversibel bij 0.1 atm buitendruk<br /> # Gevraagd: de verandering in molaire entropie bij verwarming van stikstofgas van 25°C tot 1000°C bij constante druk. ( Gegeven: Cp = 26.9835 + 5.9622*10(^-3) T – 377*10(^-7) T(^2) )<br /> # Beschouw de reactie 3A+2B &lt;=&gt; C+2D. <br /> #* Leid het verband van de standaard Gibbsfunctie en de evenwichtsconstante af. En wat met reële gassen? (1.5p)<br /> #* Toon de drukonafhankelijkheid aan (1p)<br /> #* Toon de temperatuursafhankelijkheid aan (1.5p)<br /> # Beschouw F(folded) &lt;=&gt; U(unfolded). <br /> #* Leid deltaG in functie van de temperatuur af (1.5p)<br /> #* schets de stabiliteitscurve en bespreek gronding (2.5p)<br /> <br /> === 15 januari 2018 ===<br /> <br /> # Vuurpomp uitleggen<br /> # Oefening op entropie met isotherme compressie ---&gt; bepaal einddruk en delta G<br /> # Oefening partieel molaire volumes<br /> # Entropie voor fasetransities afleiden<br /> # Clausius-Clapeyronvgl. afleiden en toepassen voor smelten en verdampen<br /> <br /> === 3 februari 2017 NM ===<br /> <br /> # Artikel over proteïne (4 ptn): Welke interacties spelen een rol bij de opvouwing van een bêta-hairpin? Hoe dragen deze interacties bij aan de enthalpieverandering van het opvouwingsproces? Gebruik tabel 1. (gegeven)<br /> #*Bijvragen: hij heeft een klokcurve op zijn blad getekend: hoe beïnvloed Cp de curve? (breder). Draagt water meer bij aan de opvouwing van de hairpin dan methanol? De opvouwing van de hydrofobe zijketens, hoe noemen we dit effect? (hij doelt op hydrofoob effect).<br /> # Oefening (2 ptn): gegeven: 1 mol, temperatuur 767°C verhogen naar 1027°C, druk gaat van 1 atm naar 6 atm, molaire Cv = 3/2 R. Bereken de enthalpieverandering en de entropieverandering. <br /> # Oefening (2 ptn): gegeven: 3 mol, temperatuur 27°C, de reactie is isotherm, druk gaat van 1 atm naar 5 atm. Bereken de verandering in vrije energie.<br /> # Carnot-cyclus:<br /> #* Teken het p-V en S-T diagram. (1,5 ptn)<br /> #* Bereken voor elke stap w, q, U en entropieverandering. (1,5 ptn)<br /> #* Toon aan dat de totale U en totale entropieverandering nul is. (1ptn)<br /> # Chemisch potentiaal mengsels (gas en vloeistof)<br /> #* Bespreek de verandering in Gibbs en entropie bij het mengen van ideale gassen. (1,6 ptn)<br /> #* Doe dit ook voor ideale vloeistoffen. (1,2 ptn)<br /> #* Kan je hetzelfde besluiten voor vloeistoffen en gassen? Bespreek dit. (1,2 ptn)<br /> <br /> === 27 januari 2017 NM ===<br /> <br /> # Artikel over proteïne<br /> # Oefening tripelpunt en kooktemperatuur<br /> # Oefening entropie berkenen<br /> # Chemisch potentiaal mengsel vloeistoffen, uitdrukking G en aantonen dat het entropie gedreven is<br /> # Kinetisch gasmodel en fotongas<br /> <br /> === 27 januari 2017 VM ===<br /> <br /> # Artikel over proteïnen<br /> # Geef q, U en W voor volgende processen met ideale gassen<br /> #* isotherme expansie in vacuum<br /> #* adiabatische expansie in vacuum<br /> #* isotherme expansie tegen constante druk<br /> #* adiabatische expansie tegen constante druk<br /> #* reversibele isotherme expansie<br /> #* reversibele adiabatische expansie<br /> #* isochoor proces (weet niet meer exact)<br /> # Chemische potentiaal kort uitleggen, geef afleiding metaal/metaalion electrode<br /> # Oefening triplepunt en kooktemperatuur<br /> # Oefening entropie berekening<br /> <br /> === 20 januari 2017 NM ===<br /> <br /> #Vuurpomp vertrekkende van de eerste hoofdwet van de thermodynamica<br /> #entropie (van systeem, universum en omgeving) als je een gas opwarmt van 768 tot 1028 K en samendrukt door het veranderen van de druk van 1 atm tot 6 atm. je mocht dit beschouwen als een reversibel proces. Wat is de entropie?<br /> #een mol gas (argon) ontspant zich bij 273K adiabatisch van 1L naar 10L, wat is de eindtemperatuur? gebruik voor warmtecapaciteit C(v)= 3/2R<br /> #leidt een formule af voor chemische potentiaal bij het mengen van twee stoffen. leidt dan ook de gibbsfunctie af en toon aan dat dit entropisch gedreven is.<br /> #Toon aan dat stoffen aan de oppervlakte van een stof de oppervlaktespanning doen dalen. Leidt de formule van Young-Laplace af.<br /> <br /> === 16 januari 2017 VM ===<br /> #Werking van de vuurpomp beschrijven m.b.v. de eerste hoofdwet van de thermodynamica.<br /> #Bereken een reactie-enthalpie bij 1000K (de reactie en de reactie-enthalpie bij 298K is gegeven).<br /> #Een gas bij 25°C wordt verwarmd bij constante druk tot het verdubbeld is in volume. Bereken de verandering in enthalpie, entropie en vrije energie.<br /> #Mengen van ideale gassen, formule afleiden. (en nog dingen maar die ben ik vergeten omda ik ze nie kon :'( )<br /> #Leid de Clapeyron af en pas toe op Vast-Vloeistof en Vloeistof-Damp.<br /> <br /> === 22 januari 2016 NM ===<br /> #vuurpomp<br /> #colligatieve eigenschappen, kookpuntsverhoging, osmose<br /> #clapeyron afleiden en toepassen op smelten en verdampen<br /> #entropie (sys, omg, univ) berekenen reversibel, irreversibel en enthalpie van systeem berekenen met T1, T2, Cp gegeven<br /> #entropie, enthalpie en inwendige energie berekenen waarbij een systeem verwarmd word tot het volume verdubbelt is met P constant en Ti, P en n gegeven<br /> <br /> === 15 januari 2016 (VM) ===<br /> #Het artikel over het vouwen van eiwitten bespreken.<br /> #De dampspanning van een zuivere stof op twee verschillende temperaturen krijg je. Bereken de verdampingsenthalpie, ebullioscopische constante (molaire massa gegeven.), de temperatuur waarop de vloeistof verdampt en de entropie van dit proces. <br /> #Een (zeer eenvoudige) oefening waarin de entropie moet berekend worden van een expansie.<br /> #Bespreek de carnot cyclus.<br /> #De laplace vergelijking uitleggen en verklaren waarom stoffen die aan het oppervlakte opstapelen de oppervlaktespanning verlagen.<br /> <br /> === 11 januari 2016 NM ===<br /> Hetzelfde als 11 januari VM<br /> <br /> === 11 januari 2016 VM ===<br /> #vuurpomp (opdracht)<br /> #tripelpunt oefening: gegeven temperatuur bij tripelpunt, Pvap(T1), Pvap(T2) te berekenen enthalpie(vap), kooktemp. bij normaaldruk en druk op tripelpunt.<br /> #entropie en enthalpie bij reversibel en irreversibel oefening: gegeven T1, T2, Cp<br /> #colligatieve eigenschappen bespreken (wat is het + invloed van de opgeloste stof op de chemische potentiaal van de vloeistof) en kookpuntsverhoging en osmose<br /> #elektrochemische potentiaal en metaal/metaalionelectrode + Nernstvergelijking (kort) afleiden + (heel kort) bespreken hoe enthalpie en entropie bepaald kan worden uit elektrochemie<br /> <br /> === 12 januari 2015 (NM) ===<br /> <br /> # 1. Dat vuur pomp stuff.<br /> # 2. Bereken tripel punt shit.<br /> # 3. Wat met entropie spelen n stuff.<br /> # 4. Een of ander carnot cyclus... komt dat iemand bekend voor?<br /> # 5. Wat shit met oppervlakte spanning en Young en een van zijn Franse maatjes afleiden<br /> <br /> === 17 januari 2014 ===<br /> <br /> # vraag over enthalpie bij peptide vouwen, vraag 1 van da document<br /> # Oefening om enthalpie te bereken bij 1000K terwijl de enthalpie is gegeven bij 298K van een reactievgl<br /> # Entropie berekening voor irreversibel en reversibel proces <br /> # leidt de formule van de oppervlaktespanning af, bewijs dat stoffen die de oppervlaktespanning verlagen de nijging hebben om zich aan de oppervlakte op te stapelen, Leidt de vergelijking van Young-dupre af<br /> # leg te elektrochemische potentiaal uit( gewoon de vergelijking uitleggen), leg membraanpotentiaal uit, leg metaal/metaan-ion elektrode uit<br /> <br /> === 28 januari 2013 ===<br /> <br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en pas dit toe op een metaal/metaalionelektrode.<br /> # Toon aan dat een adiabatische expansie kan leiden tot mistvorming in een erlenmeyer (artikel).<br /> # Oefening: bepaling van de molaire entropieverandering bij verwarmen en compresseren. Warmtecapaciteit bij constant volume is geggeven.<br /> # Oefening: bereken delta H bij 1000 K van de reactie: CO + H2O -&amp;gt; CO2 + H2. delta H bij 298 K is gegeven, als ook de Cp's van de stoffen.<br /> <br /> === 25 januari 2013 ===<br /> <br /> # bewijs: bij adiabatisch proces is p1V1^(lambda)=p2V2^(lambda)<br /> # bespreek de rol van enthalpie en entropie bij het hydrofoob effect<br /> # bepaling van de tempperatuursverandering bij adiabatische compressie (begin- en einddruk, begintemp gegeven)<br /> # bepaling van delta U en delta H bij een opwarming bij constante druk (cv, massa, molaire massa en begin- en eindtemp gegeven)<br /> <br /> === 18 januari 2013 ===<br /> <br /> # Toon aan dat de gemiddelde kinetische energie van een mol gas gelijk is aan 3/2 RT<br /> # Leg uit hoe een adiabatische expansie kan leiden tot mistvorming in een erlenmeyer (vraag uit artikel).<br /> # Oefening: entropieverandering van 298 K en 2 atm naar 233 K en 0.4 atm. Warmtecapaciteit bij constant volume is gegeven.<br /> # Oefening: geef temperatuur en druk bij het tripelpunt van een bepaalde stof, twee vergelijkingen met p en T zijn al gegeven, je moet alleen nog maar het stelsel van twee vergelijkingen en twee onbekenden oplossen.<br /> <br /> === 3 feb 2012 ===<br /> <br /> # Geef het verschil tussen een isotherme en een adiabatische expansie. <br /> # Toon aan dat de gemiddelde kinetische energie van een mol gas gelijk is aan 3/2 RT<br /> # Oefening: entropieverandering van 298 K en 2 atm naar 233 K en 0.4 atm<br /> # Oefening: geef temperatuur en druk bij het tripelpunt van een bepaalde stof, twee vergelijkingen met p en T zijn al gegeven, je moet alleen nog maar het stelsel van twee vergelijkingen en twee onbekenden oplossen.<br /> <br /> === 27 jan 2012 ===<br /> <br /> # Toon aan dat stoffen die de oppervlaktespanning verlagen, de neiging hebben om zich aan het oppervlak op te stapelen.<br /> # Leg uit, elektrochemische potentiaal en pas toe op de membraanpotentiaal.<br /> # Oefening op entropieverandering<br /> # Bereken q, U en H bij verwarming bij constante druk.<br /> === 20 jan 2012 VM ===<br /> <br /> # Bespreek osmose (bijvragen: geldt deze formule altijd, hoe aanpassen voor grotere C, hoe noem je dit?)<br /> # Geef de formules voor de warmte, arbeid en verandering in inwendige energie voor volgende processen met ideale gassen:<br /> #* isotherme expansie in vacuüm<br /> #* adiabatische expansie in vacuüm<br /> #* isotherme expansie tegen constante druk<br /> #* adiabatisch expansie tegen constante druk<br /> #* reversibele isotherme expansie<br /> #* reversibele adiabatische expansie<br /> #* (bijvraag: een stok met aan het uiteinde een stuk katoen in een omhulsel duwen (past perfect): hierna brandt het katoen, hoe verklaar je dit?)<br /> # Oef: zie oef 3 bij oude examenvragen<br /> # Oef: zie oef 7 bij oude examenvragen<br /> <br /> === 16 jan 2012 VM ===<br /> <br /> # Geef de carnotcyclus en bespreek U, w &amp;amp; q bij elk proces<br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.<br /> # Oefening over verandering Gibbs van reactie bij 1298K als Cp, H &amp;amp; S van alle reagentia en producten gegeven bij 298K <br /> # Oefening over entropieverandering van expansie (systeem, omgeving, universum) zowel a) reversibel b) irreversibel bij uitwendige druk van 0,1Atm<br /> <br /> === 28 jan 2011 ===<br /> <br /> #Bespreek osmose en hoe kan je hieruit molecuulgewicht bepalen (3de keer!!!)<br /> #Bespreek membraanpotentiaal<br /> #IJs wordt van -10°C tot +10°C verwarmd: wat is de entropietoename &amp;lt;u&amp;gt;van het systeem&amp;lt;/u&amp;gt;? (enthalpie en warmtecapaciteiten gegeven)<br /> #Bereken eindtemperatuur, q, W en U van een reversibele adiabatische compressie van 28l naar 10l. (C&amp;lt;sub&amp;gt;v&amp;lt;/sub&amp;gt; = 5/2R)<br /> <br /> <br /> === 21 jan 2011 VM ===<br /> # Geef de carnotcyclus en bespreek U, w &amp;amp; q bij elk proces<br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.<br /> # Oefening over verandering inwendige energie (delta U)<br /> # Oefening over entropieverandering<br /> <br /> === 17 jan 2011 ===<br /> <br /> # Bespreek osmose en leg uit hoe je hieruit molecuulgewichten kunt bekomen <br /> # Clapeyron afleiden + toepassen op fasediagramma (m.a.w. vgl vast-&amp;gt; vl., vl. -&amp;gt; gas en vast -&amp;gt; gas berekenen)<br /> # Oefening over entropieverandering <br /> # Oefening over verandering in gibbsfunctie<br /> <br /> === 15 jan 2010 ===<br /> <br /> # bespreek de adiabatische expansie <br /> # bespreek osmose en geef een toepassing <br /> # oefening over entropieverandering <br /> # oefening over verandering in gibbsfunctie<br /> <br /> === 11 jan 2010 VM ===<br /> # Bespreek het kinetischgasmodel en de gemiddelde Etr.<br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.<br /> # ?<br /> # ?<br /> <br /> === 11 jan 2010 NM ===<br /> # Toon aan met formules dat een stof die de oppervlaktespanning verlaagt de neiging heeft om zich aan het oppervlak op te stapelen.<br /> # Bewijs dat de totale entropie voor een Carnotcyclus gelijk is aan nul.<br /> # Entropieverandering berekenen van gas bij bepaalde gebeurtenis.<br /> # Veranderingen in U en H berekenen bij de opwarming van een ideaal gas bij constante druk.<br /> <br /> === 30 jan 2009 ===<br /> # Clapeyron afleiden+toepassen op vloeibaar-gas.<br /> # Kookpuntverhoging.<br /> # Adiabatische compressie van een gas met de volumes en de begin T en de Cv gegeven.<br /> # Entropieverandering van 25 C naar 1000 C met Cv gegeven.<br /> === 16 jan 2009 ===<br /> # bij mengen verandering in gibbs, entropie, enthalpie en volume<br /> # carnot bespreken, q, W en U bij elk proces, en efficientie berekenen<br /> # verandering in entropie berekenen wanneer een ideaal gas expandeert van 1l bij 12K naar 2l bij 24K <br /> # verandering in enthalpie en inwendige energie berekenen van een reactie, enkele vormingsenthalpieën gegeven en een verbrandingsenthalpie, en we mochten veronderstellen dat de gassen ideaal waren<br /> === 21 jan 2008 ===<br /> # clayperon+ toep. op verdampen<br /> # kookpuntsverhoging bespreken<br /> # adiabatische expansie 1L naar 10L, Ti = 273K, bereken eindtem Cv gegeven<br /> # compresie van 1atm naar 2atm en verwarmen van 300k naar 1000k. Cp gegeven. bereken entropieverandering.<br /> === 21 jan 2008 ===<br /> # geef de carnotcyclus en bespreek U, w &amp;amp; q bij elk proces<br /> # Bespreek de membraam potentiaal<br /> # adiabtische compressie gas (1 mol) van 48,4l naar 44,4 l en begin temp = 0°C. Eindtemperatuur berekenen<br /> # entropieverandering van verwarmen gas 25°C--&amp;gt;1000°C. Cp gegeven<br /> === 18 jan 2008 ===<br /> # druk en temperatuursafhankelijkheid van evenwichtsconstante<br /> # isotherme en adiabatische expansie van een ideaal gas bespreken<br /> # inwendige energie berekenen, vormingsenthalpie en temperatuur gegeven<br /> # enthalpie en entropie berekenen van faseovergang van water bij T = 263K, H(273K) gegeven en Cp's gegeven<br /> <br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # clapeyron afleiden en toepassen op vast/vloeistof<br /> # osmose bespreken<br /> # vormingsenthalpie berekenen bij 125°C van HBr uit H2 en Br2. met de Hf°bij 25°C gegeven. bereken ook de inwendige energieverandering. (Cp ook gegeven dacht ik (iemand die nog exact weet?) )<br /> # entropieverandering bij 1 mol ideaal gas met T1= 12K, T2= 24K en V1=1L en V2=2L. en Cv = 3/2 R<br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # twee ideale gassen, bepaal deltaG, S, H, V na mengen<br /> # kookpuntsverhoging bespreken<br /> # CO(g) + H20 (g) =&amp;gt; CO2(g) + H2(g) delta H (298K) = -10 kcal. zoek delta H (1000K) Cp's gegeven<br /> # bespreek de carnotcyclus in een STdiagramma<br /> <br /> === 30 aug 2008 ===<br /> # mengen van ideale gassen, bespreek delta G, delta H, delta S, delta U en delta V<br /> # geef q, U en W voor volgende processen met ideale gassen<br /> #* isotherme expansie in vacuum<br /> #* adiabatische expansie in vacuum<br /> #* isotherme exp tegen constante druk<br /> #* adiab exp cte P<br /> #* reversibele isoth exp<br /> #* rev adiab exp<br /> # ideaal gas bij 12K en 1L, bereken delta S bij het omzetten naar 24K en 2L. C=2/3R <br /> === 29 jan 2007 ===<br /> # bespreek de druk- en temperatuursafh van de evenwichtsconstante<br /> # de henryconstante van CO2 in H2O is 1,...*10^6, die in benzeen 8,...*10^4. In welke stof is CO2 het best oplosbaar?<br /> # Een oefening waarbij een ideaal gas van T en V veranderd. Bereken DeltaS.<br /> === 23 jan 2007 ===<br /> # bespreek osmose<br /> # oefening waar ge bij reversibele isotherme compressie U, q, H en W moet berekenen<br /> # een ideaal gas gaat van T1-&amp;gt;T2 en V1-&amp;gt; V2. Laat zien dat geldt: Delta S= Cv. ln(T2/T1)+n.R. ln(V2/V1) Cv mag onafhankelijk van de temperatuur genomen worden. <br /> === 20 jan 2007 ===<br /> # Geef de afleiding voor de vergelijking van clapeyron en pas dit toe op smelten<br /> # Geef een S-T diagramma van de Carnotcyclus<br /> # Bereken deltaH bij 1000K, je kreeg deltaH(298), de reactie en alle Cp's<br /> <br /> === 19 jan 2007 ===<br /> # het mengen van ideale gassen. Bespreek de gibs functie de entalpie, entropie, en volume verandering.<br /> # de carnot cyclus wordt meestal weergeven in een pv-diagrama, geef hem nu weer in een TS-diagramma<br /> === 18 jan 2007 ===<br /> # bewijs dat de evenwichtsconstante niet drukafhankelijk is, maar wel temperatuursafhankelijk<br /> # bewijs volgende uitdrukking voor de entropieverandering van een gas dat van temperatuur en volume verandert:<br /> #: deltaS = Cv*ln(T2/T1) + nR*ln(V2/V1)<br /> Oefening:<br /> # bereken molecuulmassa van een proteïne<br /> # oplossing en osmotische druk gegeven, bereken ??</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Gentechnologie&diff=4298 2025-01-10T14:15:31Z

<p>R0857325: /* 10 januari 2025 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Prof Lavigne. Biochemie volgt het samen met bio-ingenieurs. Oefenzittingen verplicht (niet in 2022, door corona?). Als Lavigne een vraag stelt verwacht hij dat je elk deel van de vraag uitlegt ook al wordt het niet expliciet gevraagd. Bijvoorbeeld; geef de voor- en nadelen van PET en pPIC, dan moet je PET en pPIC volledig uitleggen.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> <br /> ===10 januari 2025===<br /> #Grote PCR vraag<br /> #* Leg real-time PCR uit + toepassingen<br /> #* Gevoeligheid en precisie o.b.v. welke factoren (vanaf staalbereiding)<br /> #* leg in detail detectiemethoden uit die bijdragen aan specificiteit<br /> #'je bent een doctoraatstudent die genfunctie wil bepalen door genoom te verstoren met insert T-DNA...'<br /> #*Ontwerp een binaire vector, geef alle elementen dat je nodig hebt en leg uit waarvoor ze dienen<br /> #*Hoe kan je testen dat de insertie van T-DNA gelukt is en het juiste genoom onderbroken is door T-DNA?<br /> #kleine vragen<br /> #* Leg inductiesysteem en eigenschappen pBAD uit<br /> #*Exsite en GeneTailor<br /> #*Voor-en nadelen Pichia Pastoris<br /> #Oefening Paeshuyse gegeven: cDNA-sequentie, kozaksequentie, TAG-sequentie, stopcodons<br /> #*Kies vectorsysteem, waarom kies je deze?<br /> #*Maak schematische tekening van vector, benoem alle onderdelen<br /> #*Hoe moeten de CHO cellen worden verandert opdat je DHF kan gebruiken als merker, wat is het voordeel aan deze merker?<br /> #*Ontwerp primers zodat cDNA wordt geamplificeerd en er aan de C-terminus een TAG hangt<br /> <br /> ===12 januari 2024===<br /> #Grote PCR vraag<br /> #* Leg real-time PCR uit + toepassingen<br /> #* Gevoeligheid en precisie o.b.v. welke factoren?<br /> #* Som probes op (in detail)<br /> #Hypothetisch 'we doen een thesis scenario waarbij we planten willen transformeren'<br /> #* Illustreer en explain binaire vector<br /> #* Geef genetische transformatiemethode voor de insertie van T-DNA in plantcel<br /> #* Geef genotyperingsstrategie om homozygote mutant te identificeren (iets met primer, idk, wilde vraag dit)<br /> #Definities<br /> #* Explain BAC + complexiteit kloonbib<br /> #* Exsite - GeneTailor<br /> #* Expressie in Pichia Pastoris: voor- en nadelen<br /> #Oefening (vectorsysteem voor eukaryote cel)<br /> #* Kies vectorsysteem + why?<br /> #* Leg vector-onderdelen uit<br /> #* Vereiste aanpassing voor gebruik SV40 ori op expressievector? Voordeel SV40 ori?<br /> #* Primer-deel<br /> <br /> ===13 januari 2023===<br /> #Bespreek de parameters die de betrouwbaarheid van de PCR amplificatie kunnen verhogen, inclusief PCR-afgeleide technieken en detectiemethoden die bij real-time PCR zorgen voor gevoeligere en preciezere detectie <br /> #Bespreek in detail twee methoden om vreemd DNA binnen te brengen in plantencellen, en geef voor elke methode ook minstens 2 voordelen en nadelen (nieuwe prof sinds dit academiejaar voor het hoofdstuk over planten)<br /> #Definities<br /> #*BAC vector en de complexiteit van bank die werd aangemaakt via deze vector<br /> #*Exsite methode en genetailor methode<br /> #*Gebruik van URA gen als positieve en negatieve selectiemerker<br /> # Je wil bepaald eiwit tot expressie brengen in CHO cellen m.b.v. een eukaryoot expressie systeem (geen gist of schimmel).<br /> #* welk expressie systeem gebruik je? beargumenteer je keuze.<br /> #* Teken de vector en verklaar alle factoren die je gebruikt.<br /> #* Wat moet je veranderen aan de CHO cellen om de SV40 ori te kunnen gebruiken? wat is het voordeel van deze ori op replicatie?<br /> #* Teken de primers uit voor de amplificatie van het gen (volledige sequentie geven, kozak sequentie geven, stopcodon gegeven),en er moest ook een tag (sequentie gegeven) gehangen worden aan het 3'-uiteinde<br /> <br /> ===9 september 2022===<br /> # Grote theorievraag kwam van Paeshuyse (!): sequentie was gegeven en dit moest tot expressie gebracht worden in dierlijke cellen <br /> #* Beargumenteer welk expressiesysteem je gebruikt en waarom<br /> #* Teken de expressievector en benoem alle onderdelen <br /> #* Welke modificatie moet je doen bij CHO cellen om DHFR merker te gebruiken en wat is het voordeel van deze merker<br /> #* Doe hetzelfde maar dan in een plantencel, wat moet je veranderen? En teken de vector opnieuw met alle componenten <br /> # Een vector gegeven en alle onderdelen bespreken (2µm, colE1, bla, URA3, MBD, HIS6, factor X, Pgal1, CYC tt en restrictie-enzymen). Waarvoor zou je deze vector gebruiken?<br /> # Definities <br /> #* Bespreek de eigenschappen van cosmidevectoren en hoe je hiermee kloonbanken maakt<br /> #* Mutagenese via prone-PCR<br /> #* CTAB methode voor isolatie van plant DNA <br /> # Oefening van Lavigne (!): 2 exonen met sequenties waren gegeven, ook een tag met sequentie was gegeven. De bedoeling was om tag-exon1-exon2 te kloneren in een TOPO-T/A vector. Bespreek alle stappen van de klonering en beargumenteer.<br /> <br /> ===14 januari 2022===<br /> # Parameters die de betrouwbaarheid van amplificatie door middel van PCR verhogen. Ook de PCR afgeleide technieken die de gevoeligheid voor nucleïnezuurdetectie kunnen verhogen. (- Wat moet je antwoorden als PCR afgeleide technieken (er moeten nog technieken zijn!)? Gradient PCR, Emulsie PCR, RT PCR met een onderscheid tussen Taqman en de andere techniek, ... - Wat hoort er nog bij? formules voor efficientie, proofreading uitleggen, saturatiecurves, ...)<br /> # Een vector gegeven en alle onderdelen bespreken (2µm, ColE1, Zeo, Strep, MBD, factor X). Waarvoor zou je deze vector gebruiken?<br /> # Definieer alle elementen van BAC en hoe wordt dit gebruikt bij kloonbanken?<br /> # Wat zijn de principes van Exsite en GeneTailor?<br /> # Hoe werkt heat shock bij S. cerevisiae en wat zijn de componenten die hiervoor nodig zijn?<br /> # Paeshuyse: Een sequentie van een nanobody gegeven en je wilt hiervan een fusieproteïne maken dat een His-tag bevat aan het 5' uiteinde. Teken de primers die hiervoor nodig zijn (kozak sequentie gegeven, restrictie-sites gegeven, sequentie voor de his-tag gegeven en de nanobody sequentie gegeven. Hoe zou je dit implementeren in een eukaryoot? Teken de expressievector en expressiecassette. Wat is er nodig voor implementatie in een plant en waarom? Teken de expressievector en de expressiecassette.<br /> <br /> ===6 januari 2021===<br /> # Parameters die uw betrouwbaarheid van PCR amplificatie verlagen, met betrekking tot mutagenese (random &amp; gerichte pcr-methodes)<br /> # Een vector gegeven en alle onderdelen bespreken (HIS4, colE1, bla gen, aox1, MCS) voor wat zou je deze vector gebruiken?<br /> # Hoe maak je een random DNA bank met cosmidevectors?<br /> # definties<br /> #* Alkalische lyse<br /> #* CAPture techniek<br /> #* taqmanprobe real time PCR<br /> #paeshuyse: gelijka andere jaren <br /> <br /> ===28 augustus 2020===<br /> # Leg PET en pBAD expressiesystemen uit. Vergelijk ze en wat zijn de voor- en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (Geen paginalimiet)<br /> # Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)<br /> #* Leg cosmide vectoren uit en hoe kloonbanken worden gemaakt.<br /> #* CTAB methode<br /> #* Chemische ‘heat shock’ transformatie van S. cerevisiae uitleggen<br /> # Paeshuyse: ongeveer zoals in januari maar met SARS-Co2.<br /> <br /> ===22 januari 2020 ===<br /> # Leg PET en pPIC expressiesystemen uit. Vergelijk ze en wat zijn de voor- en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)<br /> # Leg BAC vectoren in detail uit en hoe maak je een kloonbank aan de hand van deze vectoren. Hoe bereken je het minimum aantal klonen die nodig zijn om een representatieve genoombank te hebben met de formule van Carbon en Clarke, welke voorwaarden moeten hiervoor voldaan zijn? (1 pagina + eventueel achterkant)<br /> # Geef de PCR parameters en PCR varianten die de specificiteit van PCR amplificatie verhogen. Leg telkens kort uit. (1 pagina + eventueel achterkant)<br /> # Definities (1/3e pagina voor elk)<br /> #* Leg gatewayclonering uit, werking en principe geven.<br /> #* Transposonmutagenese uitleggen en hoe dit gescreend wordt?<br /> #* Leg uit hoe men gisten chemisch transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.<br /> # paeshuyse: humaan interferon lambda wil je produceren in een eukaryoot systeem. RNA sequentie is gegeven.<br /> #* Welke gebruik je en beargumenteer.<br /> #* Hoe ziet je vector en expressiecassette eruit? Benoem elke component + korte uitleg.<br /> #* Teken primers met gegeven RE sites (Bamh1 &amp; EcoR1) om de CDS in een vector te kloneren. Kozak sequentie ook gegeven.<br /> #* Welke wijzigingen zijn nodig om dit gen in een plantenvector te kloneren? Teken de vector en de expressiecassette.<br /> <br /> ===30 augustus 2019 ===<br /> #Bespreek de factoren van een PCR die de gevoeligheid kunnen verhogen. Ook de PCR afgeleidde technieken die de gevoeligheid voor nucleïnezuurdetectie kunnen verhogen. <br /> #Bespreek het PET expressie systeem in E. coli, geef ook de voor en nadelen van expressie in deze bacterie.<br /> #(Paashuyse) Je wil Anti-IgE produceren in CHO cellen m.b.v. een eukaryoot expressie systeem (geen gist of schimmel).<br /> #* welk expressie systeem gebruik je? beargumenteer.<br /> #* Teken de vector en verklaar alle factoren die je gebruikt.<br /> #* Wat moet je veranderen aan de CHO cellen om de SV40 ori te kunnen gebruiken? wat is het voordeel van deze ori op replicatie.<br /> #* Als je anti-IgE in planten cellen zou willen produceren, hoe ziet de vector er dan uit? leg alle factoren uit.<br /> #Leg uit:<br /> #* Definieer alles van BAC's<br /> #* Gateway klonering<br /> #* Capture techniek voor full length cDNA klonering<br /> #Oefening: 2 exonen met sequentie waren gegeven, ook een tag met sequentie was gegeven. De bedoeling was om tag-exon1-exon2 te kloneren in een TOPO-T/A vector. Bespreek alle stappen van de klonering en beargumenteer. <br /> <br /> ===23 Januari 2019 ===<br /> # Welke parameters hebben een negatieve invloed op PCR in verband met mutagenese (geef hierbij ook PCR-gebaseerde technieken van random/directe mutagenese zoals mismatch priming, error-prone PCR..) <br /> # Vergelijk cosmide en BAC klonering en hoe bepaal je de complexiteit van genoombank (carbon clark)<br /> # (Paashuyse): Klonering van een bepaald eiwit in rat cellen<br /> #* A. Leg expressiesysteem uit<br /> #* B. Teken vector en benoem/verklaar alle factoren die je gebruikt<br /> #* c. Wat moet je veranderen aan de rat cellen om SV40 ori te kunnen gebruiken? en bespreek het effect op de replicatie<br /> #* d. Doe hetzelfde maar dan in een planten cel, wat moet je veranderen? En teken de vector opnieuw met alle componenten <br /> # Geef uitleg over<br /> #* Taqman probe<br /> #* CTAB methode<br /> #* PET<br /> # Oefening waarbij je een ori moest insereren in DNA, dit moest in frame zitten, de RE sites waren gegeven, bespreek je techniek en teken PCR primers die je hiervoor zou gebruiken<br /> <br /> ===31 Augustus 2018 ===<br /> # Leg PET en pPIC expressiesystemen uit.Vergelijk ze en wat zijn de voor en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)<br /> #<br /> #* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)<br /> #* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Hoe bereken je het minimum aantal klonen met de formule van Carbon en Clarke en welke voorwaarden moeten voldoen zijn? (1 bladzijde)<br /> # Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip): <br /> #* A. Alkalische Lyse<br /> #* B. Wat is de definitie van Hybrid Selected Translation?<br /> #* C. Leg uit hoe men gisten transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.<br /> # Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)<br /> #* a. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.<br /> #* b. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.<br /> <br /> <br /> ===24 januari 2018 ===<br /> # Leg PET en pBAD expressiesystemen uit. Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)<br /> #<br /> #* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)<br /> #* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Geef ook uitleg bij Carbon &amp; Clarke. (1 bladzijde)<br /> # Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip): <br /> #* A. CAPture techniek bij cDNA aanmaak<br /> #* B. Taqman RT-PCR<br /> #* C. Nodige elementen voor een episomaal shuttle-plasmide voor ''E. Coli'' en ''S. cerevesiae''<br /> # Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)<br /> #* A. Geef strategie (maak primers, staarten, restrictie) om uw insert in de entry-vector te krijgen.<br /> #* B. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.<br /> #* C. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.<br /> <br /> ===1 september 2017 VM===<br /> # Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef PCR afgeleide technieken voor nucleïnezuren.<br /> # Bespreek in detail en vergelijk het mechanisme van P1 en cosmide vectoren.<br /> # Bespreek de werking en schets het principe van PET-expressie systeem. Wat zijn de voor- en nadelen?<br /> # Kort omschrijven <br /> #* Definieer en bespreek CAPture techniek werking<br /> #* Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?<br /> #* Bespreek het principe van Gateway klonering.<br /> # Vraag Paeshuyse (oefening in verwerkt): allerlei gegevens (cDNA, knipplaatsen e.d.) <br /> #* Welke eukaryoot expressies systeem (geen schimmel of gist) zou jij gebruiken (voor dit humaan recombinant eiwit)? Beargumenteer.<br /> #* Teken de vector enzo.. (?)<br /> <br /> ===25 januari 2017 VM===<br /> # Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid<br /> # Bespreek de BAC clonering voor de aanmaak van banken.<br /> # Wat zijn de voordelen van recombinante expressie in gist? Vector pPIC wordt veel gebruikt in de industrie. Bespreek pPIC.<br /> # Kort omschrijven<br /> #*DNA shuffeling<br /> #*CAPture techniek werking<br /> #*Principe van TOPO-gemedieerde klonering<br /> #oefening: Gegevens over enzymen, genoom van 1,6*^10-4, enzym knipt in 1 à 2 kb fragmenten, foto van gelleke. Hoeveel recombinante moet je hebben om met 99% zekerheid te zeggen dat je sequentie aanwezig is? Nog een vraag. (Rekenmachine nodig!)<br /> #Vraag Paeshuyse: Creëer een humaan, recombinant faag lambda ding (?) Welk expressiesysteem zou je gebruiken? Teken de vector die je gebruikt. Nog iets...<br /> <br /> ===januari 2016===<br /> # Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid<br /> # Voordelen van recombinante expressie in gist, leg die ene gistvector uit (pPIC heette die dacht ik?)<br /> #Strategie voor het opstellen van een cosmidebank<br /> # Termen: CTAB DNA extractie, Taqman, manieren van transformatie van gist<br /> # Oefening met inverse PCR: vinden van primers en uittekenen van de techniek<br /> Volckaert: <br /> # Relatie Tm/zoutconcentratie (monovalente kationen)<br /> # De factoren die de renaturatie beinvloeden + verschil in gebruik van PNA, LNA en DNA als proben<br /> # Geef structuur van guanidinium isothiocyanaat en guanidinium thiocyanaat, waarvoor wordt dit molecule gebruikt<br /> # structuur van merker gegeven, leg uit waar onderdelen voor bedoeld zijn en benoem ze<br /> <br /> ===20 januari 2015===<br /> #Bespreek en vergelijk de verschillende PCR technieken voor zowel gerichte als random mutagenese.<br /> #Bespreek in detail het mechanisme van P1 faag en een cosmide en vergelijk.<br /> #Bespreek en schematiseer het principe van de capillaire Sanger sequentie.<br /> #Kleine vraagjes:<br /> ##Belang van humanisering bij Philia pastoris<br /> ##Definieer de CAPture techniek<br /> ##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?<br /> #Oefening: Je moet 2 exons (sequenties gegeven) van een bepaald gen aan elkaar ligeren (zonder een linker tussen). En deze C-terminaal aan een ‘Strep’-tag hangen (sequentie gegeven) en deze inbrengen in een vector die T-overhang heeft door TOPO. (verschillende stappen bespreken + primers geven!) (praktisch dezelfde oefening als de voorbije 2 jaar in januari)<br /> Volckaert 1. Geef de structuurformule van guanidinium (iso)thiocyanaat en waar het voor wordt gebruikt. 2. Leg chemische synthese van oligonucleotiden met een 5’ fosfaat uit (of teken) + geef voordeel hiervan. 3. Leg uit hoe DNA probes niet-radioactief gelabeld (en eventueel onder welke voorwaarden) kunnen worden met behulp van een streptavidine-alkalisch fosfatase fusie-eiwit 4a. T4 polynucleotide kinase werd vroeger gebruikt om uiteinden te fosforyleren zodat fragmenten geligeerd kunnen worden. Nu kan dit direct gebeuren bij de oligonucleotide synthese. Hoe doen ze dit? Bespreek (en of teken) dit. 4b. Wat is het voordeel hiervan? 5. Bespreek de relatieve Tm van DNA en LNA met betrekking tot hun gebruik in hybridisatie en mismatchgevoeligheid.<br /> <br /> === 21 januari 2014 ===<br /> #Bespreek algemeen principe van PCR en de reactiecomponenten. Bespreek afgeleide technieken die gebruikt worden om de specificiteit van de PCR-reactie te verhogen. (onbeperkte antwoordruimte) <br /> #Bespreek achtergrond en werking van cosmide (1pag)<br /> ##Bespreek en vergelijk pET en pBAD (1pag)<br /> #Korte vraagjes: Lavigne<br /> ##Bespreek CAPture techniek <br /> ##Bespreek de elementen die een YAC-kloneringsvector bevat. Bespreek Gateway klonering <br /> <br /> === 22 januari 2013 ===<br /> #Bespreek vectorsystemen voor het insereren van grote (&amp;gt;30kb) DNA-sequenties. Bespreek de formule van Carbon &amp;amp; Clarke. <br /> #Technieken: Okayama &amp;amp; Berg SAGE <br /> #Kleine vragen (Lavigne): <br /> ##Wat is error-prone PCR en hoe kan je het gebruiken in &amp;quot;directed evolution&amp;quot;? <br /> ##Bespreek en schets het PET-expressie systeem. <br /> ##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie? <br /> #Situeer ???, ??? en ??? in de historiek van de gentechnologie. Het rspL gen was één van de eerste genen die gebruikt werd voor positieve selectie. Leg uit waarvoor dit gen codeert en hoe de selectie gebeurt. Oefening: Sequentie met exons en introns gegeven. Ontwerp een techniek om de eerste twee exons aan elkaar te ligeren en in te bouwen in de gegeven vector (TOPO T/A vector), met een N-terminale STREP-tag (sequentie voor de STREP-tag was gegeven). Beschrijf en verantwoord elke stap.<br /> <br /> ===6 augustus 2012===<br />  #Kunkel tot in detail bespreken Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli. Is dit hetzelfde bij de afgeleide vectors van ColE1? (pBR322,...) <br /> #twee vraagjes Carbon en Clarke RAcE schetsen en uitleggen (beide)<br /> #kleine vraagjes:<br /> ##Bespreek COS-cellen URA3 (waarom belangrijke merker) <br /> ##Inclusion bodies (wat, wanneer, gewenst?) <br /> ##Duid het juiste aan: de zoutconcentratie doet Tm stijgen/dalen/beïnvloedt Tm niet + uitleggen waarom. <br /> ##synthesevraag: biotine-merking bij nucleïnezuurhybridisatie, alles uitleggen (hoe probe maken, hybridisatie, detectie)<br /> <br /> ===23 Jan 2012 NM===<br /> #Kunkel Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli <br /> #Bespreek de mogelijke kloneringsvectoren in gist <br /> #Kleine vragen:<br /> ##Co-transformatie bij dieren <br /> ##Bespreek doel van de technieken: oligocapping en capture <br /> ##Hot-start PCR Chromosome jumping<br /> <br /> ===31 Jan 2011 NM===<br /> #Bespreek de filamentaire fagen(M13, F1,...), hun eigenschappen, hun replicatie in E.coli en hoe zijn ze aangepast voor het gebruik als vectoren. <br /> #Bespreek het pMAL expressiesysteem voor de synthese van eiwitten via recombinanten. <br /> #Bijvragen:<br /> ##Hoe kan je het nodige aantal klonen bepalen voor een goede genoombank <br /> ##Bespreek die PiAN vectoren Kleine vragen: <br /> ##Wat is de N-regel van Varshavsky COSvectoren <br /> ##Wat is Spi-selectie Waarvoor dient Capping bij de synthese van oligonucleotiden? <br /> #Mondeling: cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman Methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese Hoe wordt de smelttemperatuur bepaalt SAGE<br /> <br /> ===17 Jan 2011 VM===<br /> #Fosforamidietcyclus (cyclus, beschermgroepen, capping,...) <br /> #Welke problemen bij aanmaken van cosmide vectoren en welke oplossingen hiervoor?<br /> #Bijvragen: <br /> ##Okayama &amp;amp; Berg <br /> ##cDNA klonering in een vector Methode van Henikoff voor systematische deleties <br /> #Kleine vragen<br /> ##IPTG sacB <br /> ##Carbon &amp;amp; Clarke vgl. (aantal klonen in een cDNA bank) <br /> ##Guanidiniumzouten<br /> #Mondeling: pMal expressiesystemen Kunkel Eckstein Pyrosequencing SOE<br /> <br /> ===17 Jan 2011 VM===<br /> #Aanmaak genoombanken soorten gistvectoren <br /> #Bijvragen: <br /> ##fotolithografische DNA synthese alkalische fosfatasen + toepassingen <br /> #Kleine vragen<br /> ##'hotstart' PCR Guanidinium thiocyanide biotine merking bij hybridisatie <br /> ##URA3 Modeling: pyrosequencing <br /> ##Methode van Eckstein CAPture SOE pMAL<br /> <br /> ===23 aug 2010 VM===<br /> #pyrosequencing soorten faag lambda vectoren Bijvragen: methode van Gubler en Hoffman chromosoomwalking <br /> #Kleine vragen: <br /> ##nested PCR capping in fosforamidietcyclus hoe het aantal klonen in een cDNA bank benaderen <br /> ##PNA Modeling: methode van Okyama en Berg <br /> ##biotine merking bij hybridisatie alkalische hydrolyse van RNA Spi selectie pMAL<br /> <br /> ===26 jan 2010 VM===<br /> #Bespreek cosmide vectoren en hoe ze efficient te gebruiken zijn. <br /> #Leg de methode van Hoffman en Gubler voor cDNA synthese uit. <br /> #Bijvragen: <br /> ##Welke vectorsystemen voor gist zijn er beschikbaar? <br /> ##Leg de pSC101 ori uit. <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Oclusion body's: wat, wanneer, nut? <br /> ##CI gen: wat en waarvoor gebruikt in de gentechnologie? <br /> ##Universele splicing van ssDNA met fokI. <br /> ##Modeling: Fosforamidiet versus fosfonaat methode. <br /> ##EtBr en SYBR. <br /> ##Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese. <br /> ##Biotine merking. <br /> ##ZOO blot.<br /> <br /> ===25 jan 2010 VM===<br /> #Bespreek de aanmaak van genoombanken (vectoren, inbouwmechanismen, enz.) <br /> #Bespreek de methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese. <br /> #Bijvragen: <br /> ##Welke vectoren voor klonering in gist? <br /> ##Wat zijn positieve en negatieve selectie voor klonering en geef voorbeelden. <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Nested PCR uitleggen. <br /> ##T4 en T7 zijn beide bacteriofaag polymerasen. <br /> ##Bespreek hun activiteit(en) en toepassingen. <br /> ##Type1, type2, type3, type2s, iso en neochizomeren, waarin verschillen deze restrictie enzymen? <br /> ##Hoeveel kloonen nodig in een genoom bank? <br /> #Mondeling: Okyama en berg Spi selectie Alkalische hydrolyse van RNA pMAL <br /> #Hoe wordt biotine gebruikt bij hybridisatie<br /> <br /> ===25 jan 2010 VM===<br /> #Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering, detailleer elke reactiestap.<br /> #Bijvragen: <br /> ##Fosforamidiet synthesecyclus <br /> ##Welke soorten alkalische fosfatase gebruiken we in de gentechnologie? <br /> ##Schets hun gebruik. <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Lamba ZAP vector <br /> ##Aan- en afwezigheid van rop in colE1-afgeleide plasmide en de invloed ervan op aantal plasmide in E.coli. <br /> ##Aantal kloons in een genoombank. <br /> ##Nested PCR Mondeling: pMAL expressiesysteem <br /> ##Pyrosequencing RDA Ligatiemechanisme Eckstein<br /> <br /> ===14 jan 2010===<br /> #Geef de belangrijkste biologische functies van de filamentaire faag vectoren en hoe deze gebruikt werden om vectoren mee te maken.Welke soorten faag lambda vectoren zijn er en schets kort hun gebruik <br /> #Bijvragen: <br /> ##cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman. <br /> ##Detailleer elke reactiestap. <br /> ##Wat is chromosome walking en hoe werkt het. <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Wat is en waarvoor dient de capping bij de synthese van oligonucleotiden. <br /> ##Exonuclease III <br /> ##Hoe bepalen we het aantal kloons dat nodig is bij het opstellen van een genoombank. <br /> ##Inverse PCR Mondeling: pMal <br /> ##LCR Puntmutaties volgens Eckstein Mu-2 gistvector <br /> ##Pyrosequencing<br /> <br /> ===30 jan 2009===<br /> #fosforamidiet synthesecyclus geven problemen klonering met cosmidevectoren + oplossingen<br /> #Bijvragen: <br /> ##okyama en berg progressieve deleties met exonuclease III <br /> #Kleine vragen : <br /> ##IPTG sacB carbon en clarke vgl rol guanidinimun zouten + structuur <br /> #Mondeling: RDA pyrosequencing eckstein pMal lambda zap<br /> <br /> ===30 jan 2009===<br /> #Soorten Bacteriofaag lamda vectoren pET expressie vector systeem<br /> #Bijvragen<br /> ##Pyrosequencing Gubler-Hoffman cDNA synthese<br /> # Kleine vragen<br /> ##Tm voor oligonucleotiden sacB en toepassing in Gentechnolgie Statistische benadering genoom insertie PNA + structuur <br /> #Mondeling: inverse PCR Eckstein RDA SOE CAPture<br /> <br /> ===27 jan 2009 ===<br /> #replicatiemechanisme, regulatie en aantal kopieën ColE1-afgeleide vectoren Soorten bacteriofaag lambda vectoren en hun werking schetsen <br /> #Bijvragen: <br /> ##cDNA klonering (Gubler &amp;amp; Hoffman, Okayama &amp;amp; Berg) <br /> ##chromosoom walking <br /> #Kleine vragen:<br /> ##inverse PCR Tth DNA polymerase (wat speciaal en welke extra mogelijkheden daardoor) <br /> ##capping in fosforamidiet, wat en waarom <br /> ##hoe bereken je aantal kloons in genomische DNA bank exonuclease III <br /> #Mondeling: SOE SAGE pMAL plaatsgerichte mutagenese volgens Kunkel pyrosequencing<br /> <br /> ===24 jan 2008===<br /> #Bespreek het replicatiemechanisme van ColE1- en afgeleide vectoren, de regulatie en het aantal plasmiden <br /> #Bespreek methoden om gen-gericht een genomische bank te screenen aan de hand van 'informatie' <br /> #Geef twee technieken voor positieve selectie van plasmiden <br /> #Geef de methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese <br /> #Kleine vragen<br /> ##Hoe kan de het cI gen voor positieve selectie zorgen?<br /> ##Wat is een moleculair baken ('molecular beacon')?<br /> ##Bespreek de twee soorten SV40 vectoren en het verschil Touch-down PCR <br /> ##Hoe kunnen we er voor zorgen dat er geselecteerd wordt op de mogelijkheid om te transformeren (of zo)?<br /> #Technieken: Pyrosequencing pET SOE Okyama-Berg ligatiemechanisme<br /> <br /> ===23 jan 2008===<br /> #Fotolithografische DNA synhtese: bescrhijf en verklaar. <br /> #Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering: wat zijn de voor/ nadelen? <br /> #Middelgrote vragen: <br /> ##Welke problemen zijn er bij het kloneren in cosmidevectoren en hoe hebben ze dit opgelost? <br /> ##Pyrosequencing: beschrijf, wat zijn voor/nadelen tov dideoxymethode <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Wat is IPTG: structuur, gebruik <br /> ##Wat is de par locus <br /> ##Wat is PNA: structuur <br /> ##Wat is T4 polynucleotide kinase, waarom is dit belangrijk in gentechnologie, reactiemechanisme? <br /> #Technieken: SOE CAPture EtBr pMAL Eckstein<br /> <br /> ===14 jan 2008===<br /> #Welke mogelijkheden zijn er om plaatsgerichte mutagenese te doen? <br /> #Vertel alles over LITMUS vectoren (Waarom in godsnaam is dit een hoofdvraag?) <br /> #Bijvragen: <br /> ##Welke problemen kunnen er zijn bij het kloneren in cosmidevectoren?<br /> ##Hoe hebben ze die omzeild? Schets de Okyama-Berg procedure. <br /> ##Wat zijn de voor- en nadelen? <br /> #Bij-bijvragen: <br /> ##Hoe is sacB een positief selectiekenmerk? <br /> ##Waarvoor staat spi selectie? <br /> ##Geef de 2 soorten SV40 vectoren + leg het verschil uit waarom worden er andere Tm-uitdrukkingen gebruikt voor oligonucleotiden en hele strengen? <br /> #Mondeling: RDA Pyrosequencing inteïne verwerking inverse PCR cap selectie<br /> <br /> ===31 jan 2007===<br /> #alles van cosmiden bespreken. alles van SV40 bespreken. <br /> #Middelgrote vragen: <br /> ##pyrosequencing <br /> ##cassettemutagenese <br /> #Kleine vragen: <br /> ##verschil southern en western blotting <br /> ##ethidiumbromide, structuur, problemen, <br /> ##gebruik Spi selectie inverse PCR<br /> ##wat is shearing <br /> #Technieken: Formule om het aantal klones te berekenen voor gDNA bank Oligocapping SOE ligatiemechanisme Eckstein Okayama en Berg<br /> <br /> ===23 jan 2007===<br /> #bespreek belangrijkste methoden voor site directed mutagenese bespreek replicatiemechanisme in pBR322 <br /> #welke verschillende strategien worden gebruikt met op lambda gebaseerde vectoren technieken met Ti vectoren <br /> #Mondeling: nested PCR quenching hoe beinvloed de DNA concentratie het werken met cosmiden en verklaar <br /> <br /> ===19 jan 2007===<br /> #Geef en bespreek enkele voorbeelden van het gebruik van alkalische fosfatasen.<br /> #Bespreek de eigenchappen en kenmerken van de pUC vectoren. <br /> #Vectoren afgeleid van bacteriofaag lambda. <br /> #SV40 vectoren. <br /> #Kleine vragen:<br /> ##Genotype van een E.Coli stam opdat deze geïnfecteerd kan worden door M13. <br /> ##Bespreek incompatibiliteit van plasmiden. <br /> #Mondeling voor te stellen technieken: SOE Pyrosequencing Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese Nick translatie&lt;</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Gentechnologie&diff=4297 2025-01-10T14:14:35Z

<p>R0857325: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Prof Lavigne. Biochemie volgt het samen met bio-ingenieurs. Oefenzittingen verplicht (niet in 2022, door corona?). Als Lavigne een vraag stelt verwacht hij dat je elk deel van de vraag uitlegt ook al wordt het niet expliciet gevraagd. Bijvoorbeeld; geef de voor- en nadelen van PET en pPIC, dan moet je PET en pPIC volledig uitleggen.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> <br /> ==10 januari 2025==<br /> #Grote PCR vraag<br /> #* Leg real-time PCR uit + toepassingen<br /> #* Gevoeligheid en precisie o.b.v. welke factoren (vanaf staalbereiding)<br /> #* leg in detail detectiemethoden uit die bijdragen aan specificiteit<br /> #'je bent een doctoraatstudent die genfunctie wil bepalen door genoom te verstoren met insert T-DNA...'<br /> #*Ontwerp een binaire vector, geef alle elementen dat je nodig hebt en leg uit waarvoor ze dienen<br /> #*Hoe kan je testen dat de insertie van T-DNA gelukt is en het juiste genoom onderbroken is door T-DNA?<br /> #kleine vragen<br /> #* Leg inductiesysteem en eigenschappen pBAD uit<br /> #*Exsite en GeneTailor<br /> #*Voor-en nadelen Pichia Pastoris<br /> #Oefening Paeshuyse gegeven: cDNA-sequentie, kozaksequentie, TAG-sequentie, stopcodons<br /> #*Kies vectorsysteem, waarom kies je deze?<br /> #*Maak schematische tekening van vector, benoem alle onderdelen<br /> #*Hoe moeten de CHO cellen worden verandert opdat je DHF kan gebruiken als merker, wat is het voordeel aan deze merker?<br /> #*Ontwerp primers zodat cDNA wordt geamplificeerd en er aan de C-terminus een TAG hangt<br /> <br /> ===12 januari 2024===<br /> #Grote PCR vraag<br /> #* Leg real-time PCR uit + toepassingen<br /> #* Gevoeligheid en precisie o.b.v. welke factoren?<br /> #* Som probes op (in detail)<br /> #Hypothetisch 'we doen een thesis scenario waarbij we planten willen transformeren'<br /> #* Illustreer en explain binaire vector<br /> #* Geef genetische transformatiemethode voor de insertie van T-DNA in plantcel<br /> #* Geef genotyperingsstrategie om homozygote mutant te identificeren (iets met primer, idk, wilde vraag dit)<br /> #Definities<br /> #* Explain BAC + complexiteit kloonbib<br /> #* Exsite - GeneTailor<br /> #* Expressie in Pichia Pastoris: voor- en nadelen<br /> #Oefening (vectorsysteem voor eukaryote cel)<br /> #* Kies vectorsysteem + why?<br /> #* Leg vector-onderdelen uit<br /> #* Vereiste aanpassing voor gebruik SV40 ori op expressievector? Voordeel SV40 ori?<br /> #* Primer-deel<br /> <br /> ===13 januari 2023===<br /> #Bespreek de parameters die de betrouwbaarheid van de PCR amplificatie kunnen verhogen, inclusief PCR-afgeleide technieken en detectiemethoden die bij real-time PCR zorgen voor gevoeligere en preciezere detectie <br /> #Bespreek in detail twee methoden om vreemd DNA binnen te brengen in plantencellen, en geef voor elke methode ook minstens 2 voordelen en nadelen (nieuwe prof sinds dit academiejaar voor het hoofdstuk over planten)<br /> #Definities<br /> #*BAC vector en de complexiteit van bank die werd aangemaakt via deze vector<br /> #*Exsite methode en genetailor methode<br /> #*Gebruik van URA gen als positieve en negatieve selectiemerker<br /> # Je wil bepaald eiwit tot expressie brengen in CHO cellen m.b.v. een eukaryoot expressie systeem (geen gist of schimmel).<br /> #* welk expressie systeem gebruik je? beargumenteer je keuze.<br /> #* Teken de vector en verklaar alle factoren die je gebruikt.<br /> #* Wat moet je veranderen aan de CHO cellen om de SV40 ori te kunnen gebruiken? wat is het voordeel van deze ori op replicatie?<br /> #* Teken de primers uit voor de amplificatie van het gen (volledige sequentie geven, kozak sequentie geven, stopcodon gegeven),en er moest ook een tag (sequentie gegeven) gehangen worden aan het 3'-uiteinde<br /> <br /> ===9 september 2022===<br /> # Grote theorievraag kwam van Paeshuyse (!): sequentie was gegeven en dit moest tot expressie gebracht worden in dierlijke cellen <br /> #* Beargumenteer welk expressiesysteem je gebruikt en waarom<br /> #* Teken de expressievector en benoem alle onderdelen <br /> #* Welke modificatie moet je doen bij CHO cellen om DHFR merker te gebruiken en wat is het voordeel van deze merker<br /> #* Doe hetzelfde maar dan in een plantencel, wat moet je veranderen? En teken de vector opnieuw met alle componenten <br /> # Een vector gegeven en alle onderdelen bespreken (2µm, colE1, bla, URA3, MBD, HIS6, factor X, Pgal1, CYC tt en restrictie-enzymen). Waarvoor zou je deze vector gebruiken?<br /> # Definities <br /> #* Bespreek de eigenschappen van cosmidevectoren en hoe je hiermee kloonbanken maakt<br /> #* Mutagenese via prone-PCR<br /> #* CTAB methode voor isolatie van plant DNA <br /> # Oefening van Lavigne (!): 2 exonen met sequenties waren gegeven, ook een tag met sequentie was gegeven. De bedoeling was om tag-exon1-exon2 te kloneren in een TOPO-T/A vector. Bespreek alle stappen van de klonering en beargumenteer.<br /> <br /> ===14 januari 2022===<br /> # Parameters die de betrouwbaarheid van amplificatie door middel van PCR verhogen. Ook de PCR afgeleide technieken die de gevoeligheid voor nucleïnezuurdetectie kunnen verhogen. (- Wat moet je antwoorden als PCR afgeleide technieken (er moeten nog technieken zijn!)? Gradient PCR, Emulsie PCR, RT PCR met een onderscheid tussen Taqman en de andere techniek, ... - Wat hoort er nog bij? formules voor efficientie, proofreading uitleggen, saturatiecurves, ...)<br /> # Een vector gegeven en alle onderdelen bespreken (2µm, ColE1, Zeo, Strep, MBD, factor X). Waarvoor zou je deze vector gebruiken?<br /> # Definieer alle elementen van BAC en hoe wordt dit gebruikt bij kloonbanken?<br /> # Wat zijn de principes van Exsite en GeneTailor?<br /> # Hoe werkt heat shock bij S. cerevisiae en wat zijn de componenten die hiervoor nodig zijn?<br /> # Paeshuyse: Een sequentie van een nanobody gegeven en je wilt hiervan een fusieproteïne maken dat een His-tag bevat aan het 5' uiteinde. Teken de primers die hiervoor nodig zijn (kozak sequentie gegeven, restrictie-sites gegeven, sequentie voor de his-tag gegeven en de nanobody sequentie gegeven. Hoe zou je dit implementeren in een eukaryoot? Teken de expressievector en expressiecassette. Wat is er nodig voor implementatie in een plant en waarom? Teken de expressievector en de expressiecassette.<br /> <br /> ===6 januari 2021===<br /> # Parameters die uw betrouwbaarheid van PCR amplificatie verlagen, met betrekking tot mutagenese (random &amp; gerichte pcr-methodes)<br /> # Een vector gegeven en alle onderdelen bespreken (HIS4, colE1, bla gen, aox1, MCS) voor wat zou je deze vector gebruiken?<br /> # Hoe maak je een random DNA bank met cosmidevectors?<br /> # definties<br /> #* Alkalische lyse<br /> #* CAPture techniek<br /> #* taqmanprobe real time PCR<br /> #paeshuyse: gelijka andere jaren <br /> <br /> ===28 augustus 2020===<br /> # Leg PET en pBAD expressiesystemen uit. Vergelijk ze en wat zijn de voor- en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (Geen paginalimiet)<br /> # Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)<br /> #* Leg cosmide vectoren uit en hoe kloonbanken worden gemaakt.<br /> #* CTAB methode<br /> #* Chemische ‘heat shock’ transformatie van S. cerevisiae uitleggen<br /> # Paeshuyse: ongeveer zoals in januari maar met SARS-Co2.<br /> <br /> ===22 januari 2020 ===<br /> # Leg PET en pPIC expressiesystemen uit. Vergelijk ze en wat zijn de voor- en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)<br /> # Leg BAC vectoren in detail uit en hoe maak je een kloonbank aan de hand van deze vectoren. Hoe bereken je het minimum aantal klonen die nodig zijn om een representatieve genoombank te hebben met de formule van Carbon en Clarke, welke voorwaarden moeten hiervoor voldaan zijn? (1 pagina + eventueel achterkant)<br /> # Geef de PCR parameters en PCR varianten die de specificiteit van PCR amplificatie verhogen. Leg telkens kort uit. (1 pagina + eventueel achterkant)<br /> # Definities (1/3e pagina voor elk)<br /> #* Leg gatewayclonering uit, werking en principe geven.<br /> #* Transposonmutagenese uitleggen en hoe dit gescreend wordt?<br /> #* Leg uit hoe men gisten chemisch transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.<br /> # paeshuyse: humaan interferon lambda wil je produceren in een eukaryoot systeem. RNA sequentie is gegeven.<br /> #* Welke gebruik je en beargumenteer.<br /> #* Hoe ziet je vector en expressiecassette eruit? Benoem elke component + korte uitleg.<br /> #* Teken primers met gegeven RE sites (Bamh1 &amp; EcoR1) om de CDS in een vector te kloneren. Kozak sequentie ook gegeven.<br /> #* Welke wijzigingen zijn nodig om dit gen in een plantenvector te kloneren? Teken de vector en de expressiecassette.<br /> <br /> ===30 augustus 2019 ===<br /> #Bespreek de factoren van een PCR die de gevoeligheid kunnen verhogen. Ook de PCR afgeleidde technieken die de gevoeligheid voor nucleïnezuurdetectie kunnen verhogen. <br /> #Bespreek het PET expressie systeem in E. coli, geef ook de voor en nadelen van expressie in deze bacterie.<br /> #(Paashuyse) Je wil Anti-IgE produceren in CHO cellen m.b.v. een eukaryoot expressie systeem (geen gist of schimmel).<br /> #* welk expressie systeem gebruik je? beargumenteer.<br /> #* Teken de vector en verklaar alle factoren die je gebruikt.<br /> #* Wat moet je veranderen aan de CHO cellen om de SV40 ori te kunnen gebruiken? wat is het voordeel van deze ori op replicatie.<br /> #* Als je anti-IgE in planten cellen zou willen produceren, hoe ziet de vector er dan uit? leg alle factoren uit.<br /> #Leg uit:<br /> #* Definieer alles van BAC's<br /> #* Gateway klonering<br /> #* Capture techniek voor full length cDNA klonering<br /> #Oefening: 2 exonen met sequentie waren gegeven, ook een tag met sequentie was gegeven. De bedoeling was om tag-exon1-exon2 te kloneren in een TOPO-T/A vector. Bespreek alle stappen van de klonering en beargumenteer. <br /> <br /> ===23 Januari 2019 ===<br /> # Welke parameters hebben een negatieve invloed op PCR in verband met mutagenese (geef hierbij ook PCR-gebaseerde technieken van random/directe mutagenese zoals mismatch priming, error-prone PCR..) <br /> # Vergelijk cosmide en BAC klonering en hoe bepaal je de complexiteit van genoombank (carbon clark)<br /> # (Paashuyse): Klonering van een bepaald eiwit in rat cellen<br /> #* A. Leg expressiesysteem uit<br /> #* B. Teken vector en benoem/verklaar alle factoren die je gebruikt<br /> #* c. Wat moet je veranderen aan de rat cellen om SV40 ori te kunnen gebruiken? en bespreek het effect op de replicatie<br /> #* d. Doe hetzelfde maar dan in een planten cel, wat moet je veranderen? En teken de vector opnieuw met alle componenten <br /> # Geef uitleg over<br /> #* Taqman probe<br /> #* CTAB methode<br /> #* PET<br /> # Oefening waarbij je een ori moest insereren in DNA, dit moest in frame zitten, de RE sites waren gegeven, bespreek je techniek en teken PCR primers die je hiervoor zou gebruiken<br /> <br /> ===31 Augustus 2018 ===<br /> # Leg PET en pPIC expressiesystemen uit.Vergelijk ze en wat zijn de voor en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)<br /> #<br /> #* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)<br /> #* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Hoe bereken je het minimum aantal klonen met de formule van Carbon en Clarke en welke voorwaarden moeten voldoen zijn? (1 bladzijde)<br /> # Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip): <br /> #* A. Alkalische Lyse<br /> #* B. Wat is de definitie van Hybrid Selected Translation?<br /> #* C. Leg uit hoe men gisten transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.<br /> # Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)<br /> #* a. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.<br /> #* b. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.<br /> <br /> <br /> ===24 januari 2018 ===<br /> # Leg PET en pBAD expressiesystemen uit. Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)<br /> #<br /> #* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)<br /> #* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Geef ook uitleg bij Carbon &amp; Clarke. (1 bladzijde)<br /> # Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip): <br /> #* A. CAPture techniek bij cDNA aanmaak<br /> #* B. Taqman RT-PCR<br /> #* C. Nodige elementen voor een episomaal shuttle-plasmide voor ''E. Coli'' en ''S. cerevesiae''<br /> # Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)<br /> #* A. Geef strategie (maak primers, staarten, restrictie) om uw insert in de entry-vector te krijgen.<br /> #* B. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.<br /> #* C. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.<br /> <br /> ===1 september 2017 VM===<br /> # Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef PCR afgeleide technieken voor nucleïnezuren.<br /> # Bespreek in detail en vergelijk het mechanisme van P1 en cosmide vectoren.<br /> # Bespreek de werking en schets het principe van PET-expressie systeem. Wat zijn de voor- en nadelen?<br /> # Kort omschrijven <br /> #* Definieer en bespreek CAPture techniek werking<br /> #* Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?<br /> #* Bespreek het principe van Gateway klonering.<br /> # Vraag Paeshuyse (oefening in verwerkt): allerlei gegevens (cDNA, knipplaatsen e.d.) <br /> #* Welke eukaryoot expressies systeem (geen schimmel of gist) zou jij gebruiken (voor dit humaan recombinant eiwit)? Beargumenteer.<br /> #* Teken de vector enzo.. (?)<br /> <br /> ===25 januari 2017 VM===<br /> # Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid<br /> # Bespreek de BAC clonering voor de aanmaak van banken.<br /> # Wat zijn de voordelen van recombinante expressie in gist? Vector pPIC wordt veel gebruikt in de industrie. Bespreek pPIC.<br /> # Kort omschrijven<br /> #*DNA shuffeling<br /> #*CAPture techniek werking<br /> #*Principe van TOPO-gemedieerde klonering<br /> #oefening: Gegevens over enzymen, genoom van 1,6*^10-4, enzym knipt in 1 à 2 kb fragmenten, foto van gelleke. Hoeveel recombinante moet je hebben om met 99% zekerheid te zeggen dat je sequentie aanwezig is? Nog een vraag. (Rekenmachine nodig!)<br /> #Vraag Paeshuyse: Creëer een humaan, recombinant faag lambda ding (?) Welk expressiesysteem zou je gebruiken? Teken de vector die je gebruikt. Nog iets...<br /> <br /> ===januari 2016===<br /> # Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid<br /> # Voordelen van recombinante expressie in gist, leg die ene gistvector uit (pPIC heette die dacht ik?)<br /> #Strategie voor het opstellen van een cosmidebank<br /> # Termen: CTAB DNA extractie, Taqman, manieren van transformatie van gist<br /> # Oefening met inverse PCR: vinden van primers en uittekenen van de techniek<br /> Volckaert: <br /> # Relatie Tm/zoutconcentratie (monovalente kationen)<br /> # De factoren die de renaturatie beinvloeden + verschil in gebruik van PNA, LNA en DNA als proben<br /> # Geef structuur van guanidinium isothiocyanaat en guanidinium thiocyanaat, waarvoor wordt dit molecule gebruikt<br /> # structuur van merker gegeven, leg uit waar onderdelen voor bedoeld zijn en benoem ze<br /> <br /> ===20 januari 2015===<br /> #Bespreek en vergelijk de verschillende PCR technieken voor zowel gerichte als random mutagenese.<br /> #Bespreek in detail het mechanisme van P1 faag en een cosmide en vergelijk.<br /> #Bespreek en schematiseer het principe van de capillaire Sanger sequentie.<br /> #Kleine vraagjes:<br /> ##Belang van humanisering bij Philia pastoris<br /> ##Definieer de CAPture techniek<br /> ##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?<br /> #Oefening: Je moet 2 exons (sequenties gegeven) van een bepaald gen aan elkaar ligeren (zonder een linker tussen). En deze C-terminaal aan een ‘Strep’-tag hangen (sequentie gegeven) en deze inbrengen in een vector die T-overhang heeft door TOPO. (verschillende stappen bespreken + primers geven!) (praktisch dezelfde oefening als de voorbije 2 jaar in januari)<br /> Volckaert 1. Geef de structuurformule van guanidinium (iso)thiocyanaat en waar het voor wordt gebruikt. 2. Leg chemische synthese van oligonucleotiden met een 5’ fosfaat uit (of teken) + geef voordeel hiervan. 3. Leg uit hoe DNA probes niet-radioactief gelabeld (en eventueel onder welke voorwaarden) kunnen worden met behulp van een streptavidine-alkalisch fosfatase fusie-eiwit 4a. T4 polynucleotide kinase werd vroeger gebruikt om uiteinden te fosforyleren zodat fragmenten geligeerd kunnen worden. Nu kan dit direct gebeuren bij de oligonucleotide synthese. Hoe doen ze dit? Bespreek (en of teken) dit. 4b. Wat is het voordeel hiervan? 5. Bespreek de relatieve Tm van DNA en LNA met betrekking tot hun gebruik in hybridisatie en mismatchgevoeligheid.<br /> <br /> === 21 januari 2014 ===<br /> #Bespreek algemeen principe van PCR en de reactiecomponenten. Bespreek afgeleide technieken die gebruikt worden om de specificiteit van de PCR-reactie te verhogen. (onbeperkte antwoordruimte) <br /> #Bespreek achtergrond en werking van cosmide (1pag)<br /> ##Bespreek en vergelijk pET en pBAD (1pag)<br /> #Korte vraagjes: Lavigne<br /> ##Bespreek CAPture techniek <br /> ##Bespreek de elementen die een YAC-kloneringsvector bevat. Bespreek Gateway klonering <br /> <br /> === 22 januari 2013 ===<br /> #Bespreek vectorsystemen voor het insereren van grote (&amp;gt;30kb) DNA-sequenties. Bespreek de formule van Carbon &amp;amp; Clarke. <br /> #Technieken: Okayama &amp;amp; Berg SAGE <br /> #Kleine vragen (Lavigne): <br /> ##Wat is error-prone PCR en hoe kan je het gebruiken in &amp;quot;directed evolution&amp;quot;? <br /> ##Bespreek en schets het PET-expressie systeem. <br /> ##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie? <br /> #Situeer ???, ??? en ??? in de historiek van de gentechnologie. Het rspL gen was één van de eerste genen die gebruikt werd voor positieve selectie. Leg uit waarvoor dit gen codeert en hoe de selectie gebeurt. Oefening: Sequentie met exons en introns gegeven. Ontwerp een techniek om de eerste twee exons aan elkaar te ligeren en in te bouwen in de gegeven vector (TOPO T/A vector), met een N-terminale STREP-tag (sequentie voor de STREP-tag was gegeven). Beschrijf en verantwoord elke stap.<br /> <br /> ===6 augustus 2012===<br />  #Kunkel tot in detail bespreken Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli. Is dit hetzelfde bij de afgeleide vectors van ColE1? (pBR322,...) <br /> #twee vraagjes Carbon en Clarke RAcE schetsen en uitleggen (beide)<br /> #kleine vraagjes:<br /> ##Bespreek COS-cellen URA3 (waarom belangrijke merker) <br /> ##Inclusion bodies (wat, wanneer, gewenst?) <br /> ##Duid het juiste aan: de zoutconcentratie doet Tm stijgen/dalen/beïnvloedt Tm niet + uitleggen waarom. <br /> ##synthesevraag: biotine-merking bij nucleïnezuurhybridisatie, alles uitleggen (hoe probe maken, hybridisatie, detectie)<br /> <br /> ===23 Jan 2012 NM===<br /> #Kunkel Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli <br /> #Bespreek de mogelijke kloneringsvectoren in gist <br /> #Kleine vragen:<br /> ##Co-transformatie bij dieren <br /> ##Bespreek doel van de technieken: oligocapping en capture <br /> ##Hot-start PCR Chromosome jumping<br /> <br /> ===31 Jan 2011 NM===<br /> #Bespreek de filamentaire fagen(M13, F1,...), hun eigenschappen, hun replicatie in E.coli en hoe zijn ze aangepast voor het gebruik als vectoren. <br /> #Bespreek het pMAL expressiesysteem voor de synthese van eiwitten via recombinanten. <br /> #Bijvragen:<br /> ##Hoe kan je het nodige aantal klonen bepalen voor een goede genoombank <br /> ##Bespreek die PiAN vectoren Kleine vragen: <br /> ##Wat is de N-regel van Varshavsky COSvectoren <br /> ##Wat is Spi-selectie Waarvoor dient Capping bij de synthese van oligonucleotiden? <br /> #Mondeling: cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman Methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese Hoe wordt de smelttemperatuur bepaalt SAGE<br /> <br /> ===17 Jan 2011 VM===<br /> #Fosforamidietcyclus (cyclus, beschermgroepen, capping,...) <br /> #Welke problemen bij aanmaken van cosmide vectoren en welke oplossingen hiervoor?<br /> #Bijvragen: <br /> ##Okayama &amp;amp; Berg <br /> ##cDNA klonering in een vector Methode van Henikoff voor systematische deleties <br /> #Kleine vragen<br /> ##IPTG sacB <br /> ##Carbon &amp;amp; Clarke vgl. (aantal klonen in een cDNA bank) <br /> ##Guanidiniumzouten<br /> #Mondeling: pMal expressiesystemen Kunkel Eckstein Pyrosequencing SOE<br /> <br /> ===17 Jan 2011 VM===<br /> #Aanmaak genoombanken soorten gistvectoren <br /> #Bijvragen: <br /> ##fotolithografische DNA synthese alkalische fosfatasen + toepassingen <br /> #Kleine vragen<br /> ##'hotstart' PCR Guanidinium thiocyanide biotine merking bij hybridisatie <br /> ##URA3 Modeling: pyrosequencing <br /> ##Methode van Eckstein CAPture SOE pMAL<br /> <br /> ===23 aug 2010 VM===<br /> #pyrosequencing soorten faag lambda vectoren Bijvragen: methode van Gubler en Hoffman chromosoomwalking <br /> #Kleine vragen: <br /> ##nested PCR capping in fosforamidietcyclus hoe het aantal klonen in een cDNA bank benaderen <br /> ##PNA Modeling: methode van Okyama en Berg <br /> ##biotine merking bij hybridisatie alkalische hydrolyse van RNA Spi selectie pMAL<br /> <br /> ===26 jan 2010 VM===<br /> #Bespreek cosmide vectoren en hoe ze efficient te gebruiken zijn. <br /> #Leg de methode van Hoffman en Gubler voor cDNA synthese uit. <br /> #Bijvragen: <br /> ##Welke vectorsystemen voor gist zijn er beschikbaar? <br /> ##Leg de pSC101 ori uit. <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Oclusion body's: wat, wanneer, nut? <br /> ##CI gen: wat en waarvoor gebruikt in de gentechnologie? <br /> ##Universele splicing van ssDNA met fokI. <br /> ##Modeling: Fosforamidiet versus fosfonaat methode. <br /> ##EtBr en SYBR. <br /> ##Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese. <br /> ##Biotine merking. <br /> ##ZOO blot.<br /> <br /> ===25 jan 2010 VM===<br /> #Bespreek de aanmaak van genoombanken (vectoren, inbouwmechanismen, enz.) <br /> #Bespreek de methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese. <br /> #Bijvragen: <br /> ##Welke vectoren voor klonering in gist? <br /> ##Wat zijn positieve en negatieve selectie voor klonering en geef voorbeelden. <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Nested PCR uitleggen. <br /> ##T4 en T7 zijn beide bacteriofaag polymerasen. <br /> ##Bespreek hun activiteit(en) en toepassingen. <br /> ##Type1, type2, type3, type2s, iso en neochizomeren, waarin verschillen deze restrictie enzymen? <br /> ##Hoeveel kloonen nodig in een genoom bank? <br /> #Mondeling: Okyama en berg Spi selectie Alkalische hydrolyse van RNA pMAL <br /> #Hoe wordt biotine gebruikt bij hybridisatie<br /> <br /> ===25 jan 2010 VM===<br /> #Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering, detailleer elke reactiestap.<br /> #Bijvragen: <br /> ##Fosforamidiet synthesecyclus <br /> ##Welke soorten alkalische fosfatase gebruiken we in de gentechnologie? <br /> ##Schets hun gebruik. <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Lamba ZAP vector <br /> ##Aan- en afwezigheid van rop in colE1-afgeleide plasmide en de invloed ervan op aantal plasmide in E.coli. <br /> ##Aantal kloons in een genoombank. <br /> ##Nested PCR Mondeling: pMAL expressiesysteem <br /> ##Pyrosequencing RDA Ligatiemechanisme Eckstein<br /> <br /> ===14 jan 2010===<br /> #Geef de belangrijkste biologische functies van de filamentaire faag vectoren en hoe deze gebruikt werden om vectoren mee te maken.Welke soorten faag lambda vectoren zijn er en schets kort hun gebruik <br /> #Bijvragen: <br /> ##cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman. <br /> ##Detailleer elke reactiestap. <br /> ##Wat is chromosome walking en hoe werkt het. <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Wat is en waarvoor dient de capping bij de synthese van oligonucleotiden. <br /> ##Exonuclease III <br /> ##Hoe bepalen we het aantal kloons dat nodig is bij het opstellen van een genoombank. <br /> ##Inverse PCR Mondeling: pMal <br /> ##LCR Puntmutaties volgens Eckstein Mu-2 gistvector <br /> ##Pyrosequencing<br /> <br /> ===30 jan 2009===<br /> #fosforamidiet synthesecyclus geven problemen klonering met cosmidevectoren + oplossingen<br /> #Bijvragen: <br /> ##okyama en berg progressieve deleties met exonuclease III <br /> #Kleine vragen : <br /> ##IPTG sacB carbon en clarke vgl rol guanidinimun zouten + structuur <br /> #Mondeling: RDA pyrosequencing eckstein pMal lambda zap<br /> <br /> ===30 jan 2009===<br /> #Soorten Bacteriofaag lamda vectoren pET expressie vector systeem<br /> #Bijvragen<br /> ##Pyrosequencing Gubler-Hoffman cDNA synthese<br /> # Kleine vragen<br /> ##Tm voor oligonucleotiden sacB en toepassing in Gentechnolgie Statistische benadering genoom insertie PNA + structuur <br /> #Mondeling: inverse PCR Eckstein RDA SOE CAPture<br /> <br /> ===27 jan 2009 ===<br /> #replicatiemechanisme, regulatie en aantal kopieën ColE1-afgeleide vectoren Soorten bacteriofaag lambda vectoren en hun werking schetsen <br /> #Bijvragen: <br /> ##cDNA klonering (Gubler &amp;amp; Hoffman, Okayama &amp;amp; Berg) <br /> ##chromosoom walking <br /> #Kleine vragen:<br /> ##inverse PCR Tth DNA polymerase (wat speciaal en welke extra mogelijkheden daardoor) <br /> ##capping in fosforamidiet, wat en waarom <br /> ##hoe bereken je aantal kloons in genomische DNA bank exonuclease III <br /> #Mondeling: SOE SAGE pMAL plaatsgerichte mutagenese volgens Kunkel pyrosequencing<br /> <br /> ===24 jan 2008===<br /> #Bespreek het replicatiemechanisme van ColE1- en afgeleide vectoren, de regulatie en het aantal plasmiden <br /> #Bespreek methoden om gen-gericht een genomische bank te screenen aan de hand van 'informatie' <br /> #Geef twee technieken voor positieve selectie van plasmiden <br /> #Geef de methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese <br /> #Kleine vragen<br /> ##Hoe kan de het cI gen voor positieve selectie zorgen?<br /> ##Wat is een moleculair baken ('molecular beacon')?<br /> ##Bespreek de twee soorten SV40 vectoren en het verschil Touch-down PCR <br /> ##Hoe kunnen we er voor zorgen dat er geselecteerd wordt op de mogelijkheid om te transformeren (of zo)?<br /> #Technieken: Pyrosequencing pET SOE Okyama-Berg ligatiemechanisme<br /> <br /> ===23 jan 2008===<br /> #Fotolithografische DNA synhtese: bescrhijf en verklaar. <br /> #Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering: wat zijn de voor/ nadelen? <br /> #Middelgrote vragen: <br /> ##Welke problemen zijn er bij het kloneren in cosmidevectoren en hoe hebben ze dit opgelost? <br /> ##Pyrosequencing: beschrijf, wat zijn voor/nadelen tov dideoxymethode <br /> #Kleine vragen: <br /> ##Wat is IPTG: structuur, gebruik <br /> ##Wat is de par locus <br /> ##Wat is PNA: structuur <br /> ##Wat is T4 polynucleotide kinase, waarom is dit belangrijk in gentechnologie, reactiemechanisme? <br /> #Technieken: SOE CAPture EtBr pMAL Eckstein<br /> <br /> ===14 jan 2008===<br /> #Welke mogelijkheden zijn er om plaatsgerichte mutagenese te doen? <br /> #Vertel alles over LITMUS vectoren (Waarom in godsnaam is dit een hoofdvraag?) <br /> #Bijvragen: <br /> ##Welke problemen kunnen er zijn bij het kloneren in cosmidevectoren?<br /> ##Hoe hebben ze die omzeild? Schets de Okyama-Berg procedure. <br /> ##Wat zijn de voor- en nadelen? <br /> #Bij-bijvragen: <br /> ##Hoe is sacB een positief selectiekenmerk? <br /> ##Waarvoor staat spi selectie? <br /> ##Geef de 2 soorten SV40 vectoren + leg het verschil uit waarom worden er andere Tm-uitdrukkingen gebruikt voor oligonucleotiden en hele strengen? <br /> #Mondeling: RDA Pyrosequencing inteïne verwerking inverse PCR cap selectie<br /> <br /> ===31 jan 2007===<br /> #alles van cosmiden bespreken. alles van SV40 bespreken. <br /> #Middelgrote vragen: <br /> ##pyrosequencing <br /> ##cassettemutagenese <br /> #Kleine vragen: <br /> ##verschil southern en western blotting <br /> ##ethidiumbromide, structuur, problemen, <br /> ##gebruik Spi selectie inverse PCR<br /> ##wat is shearing <br /> #Technieken: Formule om het aantal klones te berekenen voor gDNA bank Oligocapping SOE ligatiemechanisme Eckstein Okayama en Berg<br /> <br /> ===23 jan 2007===<br /> #bespreek belangrijkste methoden voor site directed mutagenese bespreek replicatiemechanisme in pBR322 <br /> #welke verschillende strategien worden gebruikt met op lambda gebaseerde vectoren technieken met Ti vectoren <br /> #Mondeling: nested PCR quenching hoe beinvloed de DNA concentratie het werken met cosmiden en verklaar <br /> <br /> ===19 jan 2007===<br /> #Geef en bespreek enkele voorbeelden van het gebruik van alkalische fosfatasen.<br /> #Bespreek de eigenchappen en kenmerken van de pUC vectoren. <br /> #Vectoren afgeleid van bacteriofaag lambda. <br /> #SV40 vectoren. <br /> #Kleine vragen:<br /> ##Genotype van een E.Coli stam opdat deze geïnfecteerd kan worden door M13. <br /> ##Bespreek incompatibiliteit van plasmiden. <br /> #Mondeling voor te stellen technieken: SOE Pyrosequencing Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese Nick translatie&lt;</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Moleculaire_Biologie&diff=3867 2024-01-29T13:53:27Z

<p>R0857325: /* 29 januari 2024 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak gedoceerd door:<br /> * Prof. M. De Ley (-∞ tot augustus 2009)<br /> * Prof. J. Robben (september 2009 - augustus 2023)<br /> * Prof F. Volckaert (tegelijk met Robben tot augustus 2022 ?)<br /> * Prof W. Vandenberg (tegelijk met Robben vanaf september 2022 en zelfstandig vanaf september 2023)<br /> <br /> Examen samenstelling (Sinds 2013)<br /> #Open vraag 1 (~1 blz; 5/20) <br /> #Open vraag 2 (~1 blz; 5/20)<br /> #Open vraag 3 (~1 blz; 5/20) ← Prof F. Volckaert zijn vraag<br /> #4 ≠ termen (~1 blz; 5/20) Concept//Figuur//Moleculair mechanisme//Naam eiwit//Methode<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===29 januari 2024===<br /> #bespreek V(D)J recombinatie, welk belang heeft dit in de biologie?<br /> #Welk probleem treedt er op bij replicatie van lineair DNA? Hoe lost de cel dit op?<br /> #Welke algemene translatieregulatiemechanismen zijn er bij eukaryoten?<br /> #Begrippen:<br /> #*Polyadenyleringssignalen<br /> #*TATA-binding protein<br /> #*nitrocellulose-assay<br /> #*IPTG<br /> <br /> ===23 januari 2024===<br /> #Bespreek de bouw en functie van het RNA-polymerase bij prokaryoten (holoenzym).<br /> #Bespreek translatie-initiatie bij eukaryoten.<br /> #Leg de RecBCD reactieweg uit bij E. coli en hoe is dit relevant bij andere organismen.<br /> #Begrippen:<br /> #*Southern blotting<br /> #*DNA-fotolyase<br /> #*Alternatieve splicing<br /> #*TFIID<br /> ===17 augustus 2023===<br /> #Leg attenuatie uit aan de hand van het Trp operon<br /> #Een gelijkaardig mechanisme van homologe recombinatie wordt gebruikt voor DNA dubbelstrengbreuk herstel in E. coli en voor meiotische homologe recombinatie in gist. Leg uit.<br /> #Welk probleem stelt zich bij de replicatie van lineair DNA voor dat zich niet voordoet bij circulair DNA? Welke oplossing(en) heeft de cel hiervoor? (telomerase)<br /> #Begrippen: codondegeneratie, groep II intron, polysoom, histon H1<br /> <br /> ===30 januari 2023===<br /> #Toon aan hoe de lambda faag zijn inbouw in het gastheergenoom reguleert en onderhoudt adhv een schema van de relevante moleculaire en genetische elementen. Hoe wordt lysogenie ongedaan gemaakt?<br /> #Wat is een Holiday-junctie? Hoe komt deze tot stand en hoe wordt deze ongedaan gemaakt? (Leg uit op moleculair niveau)<br /> #Bespreek de translatie-elongatiecyclus bij prokaryoten. (Schets + benoem relevante spelers)<br /> #4 begrippen<br /> #*RACE<br /> #*Groep II-intron<br /> #*Nucleosoom<br /> #*Processiviteit<br /> ===24 januari 2023===<br /> #Bespreek de mechanismen van transcriptieterminatie bij eu- en prokaryoten. (schets!)<br /> #Bespreek de onderstaande figuur. (trombone model)<br /> #Bespreek V(D)J-recombinatie.<br /> #* Geef het moleculaire mechanisme.<br /> #* Welk belang heeft dit in de biologie?<br /> #* Wat is het verband met transpositie?<br /> #4 begrippen<br /> #* Sanger-sequencing (dideoxyketenterminatie)<br /> #* Lysogene inductie (faag lamda)<br /> #* DABPolFEH-complex<br /> #* Aminoacyl-tRNA synthetase<br /> ===3 september 2022===<br /> # Attenuatie uitleggen aan de hand van de regulatie van het trp operon en hoe kan je dit in vitro bestuderen.<br /> #Hoe matuur mRNA maken<br /> #Wat hebben dsDNA-breuk repair in E.coli en homologe recombinatie in yeast gemeenschappelijk?<br /> #4 begrippen<br /> #* bitscore-tekening (zie splicing signals) van ..G..AUG.. (ging over de conservatie misschien?)<br /> #* peptidyltransferase<br /> #* Telomerase<br /> #* TFIID<br /> ===31 januari 2022===<br /> #Bespreek adhv een schema hoe faag lambda terecht komt in de lysogene fase. Hoe kan deze overgaan tot de lytische fase? <br /> #Welke moleculaire mechanismen moeten plaatsvinden voordat de translatie kan beginnen? (Beginnend van matuur mRNA) Welke algemene moleculaire mechanismen kunnen deze reguleren? <br /> #Bespreek de werking van RuvC in Holliday-juncties<br /> #4 begrippen<br /> #* Histoon modificaties<br /> #* Splicing signalen<br /> #* Yeast 2 hybrid<br /> #* Nucleotide excisie herstelling (DNA)<br /> <br /> ===25 januari 2022===<br /> #Leg schematisch het regulatiemechanisme van het ara operon uit. Wat is de invloed van glucose en arabinose?<br /> #Gegeven een tabel van genetische code. We weten dat de genetische code universeel is maar toch zien we sporen van evolutie. Leg uit aan de hand van de gegeven tabel. <br /> #Wat hebben retrovirussen en transposons gemeen, verklaar op moleculair vlak.<br /> #4 begrippen<br /> #* Heat shock respons (prokaryoten)<br /> #* PolyA-adenylatiesignaal<br /> #* Sanger (dideoxyketenterminatie)<br /> #* Base excisie herstelling (DNA)<br /> <br /> ===24 augustus 2021===<br /> # attenuatie uitleggen aan de hand van de regulatie van het trp operon <br /> # CTD van eukaryoot polymerase II : functie en structuur uitleggen<br /> # Wat hebben dsDNA-breuk repair in E.coli en homologe recombinatie in yeast gemeenschappelijk?<br /> # EF-G, Shine-Dalgarno box, RT-PCR, afbeelding dsDNA lariaat structuur (was een tekening met DNA of RNA met t- en D- loop en tail)?<br /> <br /> ===15 januari 2021===<br /> #Alternatieve splicing uitleggen en een concreet voorbeeld geven.<br /> #Translatie elongatie uitleggen en welke antibiotica invloed hierop hebben en waar.<br /> #Bespreek de verschillende herstelmechanismen van DNA schade in E. coli.<br /> #4 begrippen<br /> #* RecA<br /> #* foto van grote groef en kleine groef met donor en acceptor plaatsen<br /> #* DNA footprinting<br /> #*Group 2 introns<br /> <br /> ===7 januari 2021===<br /> #Iets over structurele kenmerken van transcriptie activators en de bindingsplekken in het DNA. <br /> # 2 deelvragen over eukaryote translatie initiatie<br /> #* Translatie initiatie uitleggen vanaf matuur mRNA in het cytosol (eukaryoot)<br /> #* Regulatie van translatie initiatie, hoe kan het gereguleerd worden als er vb celstress is.<br /> #Wat is homologe recombinatie, geef de moleculaire werking, welke eiwitten komen hier bij kijken.<br /> #Begrippen<br /> #* Sanger sequencing<br /> #* telomerase<br /> #* tekening van riboswitch met FMN als ligand<br /> #* splicingsignalen<br /> <br /> ===19 augustus 2020===<br /> '''(corona = 2 vragen ipv 3)'''<br /> #Verklaar met een schema hoe de lysogene cyclus ontstaat bij faag lamba infectie van een E.Coli. Hoe behoud men deze lysogene cyclus en hoe kan deze worden verbroken.<br /> #Wat is homologe recombinatie? Wat is het werkingsmechanisme? Welke eiwitten zijn erbij betrokken?<br /> #4 begrippen<br /> #* RACE<br /> #* mRNA-cap<br /> #* Kozak sequentie<br /> #* Telomerase<br /> <br /> ===30 januari 2020===<br /> #Leg het ara operon uit<br /> #Hoe kan je op experimentele wijze het begin van de transcriptie vinden en de 5' mRNA?<br /> #In het hoofdstuk transposase werd immunoglobulinegenen besproken, waarom werd dat hier besproken en hoe zien deze eruit?<br /> #4 begrippen<br /> #*Sanger sequencing<br /> #*Foto van splicing met snRNP's<br /> #*Gamma complex<br /> #* Shine-Delgarno box<br /> <br /> ===17 januari 2020===<br /> #a) Uitleggen start translatie initiatie bij eukaryoten. b) Hoe kan je de initiatie globaal reguleren?<br /> # Geef de verschillende structuren van DNA-bindende domeinen van transcriptie activators.<br /> # Wat is RecA? Waar vinden we het terug en hoe heeft men dat kunnen aantonen? Leg uit aan de hand van een tekening.<br /> # 4 begrippen: riboswitch (afbeelding gegeven), attenuatie, Yeast to hybrid en wobble pairing <br /> <br /> ===13 januari 2020 NM===<br /> #Wat zijn histonen en hoe reguleren ze de genexpressie?<br /> #Leg de verschillende stappen van translatie elongatie bij prokaryoten uit en de factoren die hierbij nodig zijn.<br /> #Leg het mechanisme van herstel van beschadigd DNA bij E.Coli uit.<br /> #4 begrippen:<br /> #*Sanger sequencing<br /> #*Riboswitch<br /> #*tekening R-loop<br /> #*RecA<br /> <br /> ===13 januari 2020 VM===<br /> #Geef de structuur, biosynthese van cap structuur van mRNA en vergelijk met prokaryoot.Wat zijn de effecten hiervan?<br /> #Leg uit hoe het ara-peron wordt gereguleerd.<br /> #Wat hebben retrovirussen en transposons gemeen, verklaar op moleculair vlak.<br /> #4 begrippen:<br /> #*DNA footprinting<br /> #*stopcodonsurpressie<br /> #*Tekening pausing &amp; backtracking<br /> #*OriC<br /> <br /> ===3 september 2019===<br /> #Verklaar met een schema hoe de lysogene cyclus ontstaat bij faag lamba infectie van een E.Coli. Hoe behoud men dee lysogene cyclus en hoe kan deze worden verbroken.<br /> #Vergelijk aan de hand van een schema de translatie initiatie bij prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Wat is de functie van RuvC bij de Holliday Junction? Maak een schets en beschrijf het mechanisme.<br /> #4 begrippen:<br /> #*zink vingers<br /> #*stopcodonsurpressie<br /> #*polysoom<br /> #*rollende cirkel replicatie<br /> <br /> ===30 augustus 2019===<br /> #Bespreek RNA-splicing. intron-herkenning, mechanisme, factoren, enzymen,... <br /> #Translatie elongatie bij eukaryoten<br /> #Trombonemodel<br /> #4 begrippen: Sanger sequencing, Riboswitch, figuur R-loop, RecA<br /> <br /> <br /> ===23 augustus 2019===<br /> #Structuur histonen en hun effect op de genexpressie<br /> #DNA schade en repair bij E.coli<br /> #Gelijkenis tussen retrovirussen en transposons, verder toelichten op moleculair vlak<br /> #4 begrippen: T(elomeer) loop, antiterminatie, yeast two hybrid methode en nog eentje maar die ben ik vergeten sorry xx<br /> <br /> ===21 januari 2019 NM===<br /> #Structuur van C-terminaal domein en geef de functies ervan.<br /> #Hoe kan je de start van transcriptie vanaf de promotor vinden (techniek)<br /> #Welke transposons komen voor bij zoogdieren. Leg bondig uit hoe die eruit zien. Hoe frequent komt dit voor bij mensen?<br /> #Begrippen: Rho onafhankelijke terminatie, Heat shock genes, U6, Wobble paring<br /> <br /> ===18 januari 2019 NM===<br /> #Gegeven een tabel van genetische code. Leg uit waarom de genetische code zowel een bevroren geval als een resultaat van evolutie is. <br /> #Geef de verschillende structuren van DNA-bindende domeinen van transcriptie activators.<br /> #Door welke mechanismen kunnen bij DNA-replicatie beide strengen simultaan gerepliceerd worden?<br /> #Begrippen: Antiterminatie, Yeast 2 hybrid, tekening van polyadenylatie, herschikking van immunoglobulinegenen.<br /> <br /> ===14 januari 2019 VM===<br /> #Geef de structuur en functie van prokaryote sigma-factor(en).<br /> #Wat is alternatieve splicing? Wat is de functie voor de cel? Geef een concreet voorbeeld.<br /> #Welk probleem treedt er op bij replicatie van lineair DNA? Hoe lost de cel dit op?<br /> #Begrippen: S1-mapping, tekening van G-C binding, eIF2a, holiday-junctie<br /> <br /> ===24 augustus 2018===<br /> #Bespreek de gelijkenissen en verschillen bij prokaryote en eukaryote promotors die betrekking hebben op eiwit genen. (dus alleen Class 2 voor eukaryoten) <br /> #Bespreek RNA-splicing. intron-herkenning, mechanisme, factoren, enzymen,... <br /> #Wat is homologe recombinatie? Wat is het werkingsmechanisme? Welke eiwitten zijn erbij betrokken?<br /> #begrippen: Riboswitch, tekining Kozak sequentie, telomerase en cDNA-cloning (dit is vanaf mRNA naar DNA gaan om het in een vector in te bouwen, staat voor complementair DNA)<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> #Welke rol spelen prokaryote sigma-factor(en) bij de transcriptie? Bespreek hun structuur en functie. (mondeling)<br /> #Hoe kan men experimenteel de transcriptie-start van een gen bepalen voor een bepaalde promoter?<br /> #Replicatie van lineair DNA (niet-circulair) met DNA polymerase vormt een probleem voor de cel. Wat is dit probleem? Hoe lost de cel dit probleem op?<br /> #Begrippen: Riboschakelaar (riboswitch), cDNA-kloning, tekening van kozaksequentie, RecBCD reactieweg (mondeling)<br /> <br /> ===22 januari 2018 VM===<br /> #Wat zijn histonen? Hoe zijn ze betrokken in de genexpressie? Bespreek het moleculaire niveau.<br /> #Structuur en functie van catabolic activatior protein (cap)<br /> #Waaorom past immunoglobine bij het hoofdstuk over transpositie?<br /> #Begrippen: mRNA cap, tekening van backtracking, oriC, sanger-methode<br /> <br /> ===18 januari 2018 NM===<br /> #Met welke methode kun je op experimentele wijze de relatieve hoeveelheid van mRNA aantonen? <br /> #Wat is alternative splicing? Wat is de functie voor de cel? Geef een concreet voorbeeld.<br /> #Geef het mechanisme van translatie elongatie bij prokaryoten.<br /> #Begrippen: Lacoperon met 3operatoren en CAPsite, Leu-zipper, peptidyltransfer en retrotransposon<br /> <br /> ===15 januari 2018 NM===<br /> #Geef de verschillen bij transcriptie initiatie tussen prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Geef de verschillende mogelijkheden voor transcriptie terminatie bij prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Wat is de functie van RuvC bij de Holliday Junction? Maak een schets en beschrijf het mechanisme.<br /> #Begrippen: Sanger Sequencing, Zn-vingers, U2 (SNRNP), stopcodonsupressie.<br /> <br /> ===15 januari 2018 VM===<br /> #Wat is alternatieve splicing? Hoe werkt het en wat is de functie ervan. Geef een concreet voorbeeld. (Mondeling)<br /> #Leg op moleculair niveau translatie-elongatie cyclus uit bij prokaryoten. (Schriftelijk)<br /> #Welke transposons komen voor bij zoogdieren. Leg bondig uit hoe die eruit zien. Hoe frequent komt dit voor bij mensen?(Schriftelijk)<br /> #Begrippen: DNA-footprinting, figuur zink vinger, polysoom, Holliday junctie (Mondeling)<br /> <br /> ===6 september 2017 NM===<br /> #Bespreek de effecten van arabinose en glucose op de expressie van het ara-operon. Verduidelijk de onderliggende mechanismen.<br /> #Bespreek de opvouwing van nucleair DNA bij eukaryoten en bespreek de effecten op de genexpressie. <br /> #Het Ds en Ac mechanisme bij maïs uitleggen. Waarom was deze wetenschappelijke ontdekking zo belangrijk?<br /> #Begrippen: figuur Zn-vinger, polysoom, Shine-Dalgarno box, klem lader (clamp loader)<br /> <br /> ===28 augustus 2017 VM===<br /> #Structuur, biosynthese en functie van cap bij mRNA van eukaroyten. Hoe zit het bij 5'-uiteinde van prokaroyten?<br /> #Welke methode(n) worden gebruikt voor het bepalen van de relatieve hoeveelheid van specifiek mRNA? Leg de werkwijzen uit.<br /> #Wat is homologe recombinatie? Welke moleculaire processen vinden plaats en welke eiwitten zijn betrokken?<br /> #Begrippen: Leu-zipper, nucleosoom, startcodon met kozak sequentie, dubbelstrengbreuk<br /> <br /> <br /> ===30 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek alternatieve splicing. Hoe werkt het en geef een concreet voorbeeld.<br /> #Tabel van codons. Leg uit: dit wijzigt nooit maar toch is er sprake van evolutie. <br /> #Het Ds en Ac mechanisme bij maïs uitleggen. Waarom was deze wetenschappelijke ontdekking zo belangrijk?<br /> #Begrippen: DNA footprint, resolvase, Zink finger (op de tekening staan 3 zink fingers), polysoom<br /> <br /> <br /> ===23 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek aan de hand van een figuur het trombonemodel van DNA-replicatie. Welke moleculaire structuren en processen van de DNA-replicatie komen in dit model naar voor.<br /> #Bespreek de structuur, functie en regulatie van de prokaryote sigma-factor(en).<br /> #Op welke experimentele manier kun je de transcriptiestart met een gegeven promotor bepalen. <br /> #Begrippen:<br /> #*enhancer<br /> #*cDNA kloning<br /> #*figuur van heatshock gen<br /> #*RecBCD-reactieweg<br /> <br /> ===20 januari 2017===<br /> #transcriptie terminatie bij pro en eukaryoten uitleggen<br /> #bespreek mRNA Cap-structuur bij eukaryoten (biosynthese, structuur, functie) en vergelijk met prokaryoten<br /> #welke moleculaire processen helpen bij de start van translatie bij eukaryoten. (start van matuur mRNA)<br /> #begrippen<br /> #*enhancer<br /> #*yeast two hybrid method<br /> #*tRNA mimicry<br /> #*herschikking van immunoglobinegenen<br /> <br /> === 19 januari 2017 NM===<br /> #Hoe wordt het ara operon gereguleerd?<br /> #Hoe beinvloeden histonen de genexpressie?<br /> #Wat heeft immunoglobuline met transpositie te maken?<br /> #begrippen<br /> #*Sanger sequencing<br /> #*zinkvinger (afbeelding)<br /> #*polysoom<br /> #*beta-klemlader<br /> <br /> === 16 januari 2017 NM===<br /> #Scanningscomplex van translatie initiatie bij eukaryoten<br /> #Methoden om binding van eiwitten aan DNA te bestuderen<br /> #recA welke functies en werking<br /> #begrippen<br /> #*sanger sequencing<br /> #*tekening zink vingers<br /> #*U2 snRNP<br /> #*stopcodonsuppressie<br /> <br /> ===16 januari 2017 VM===<br /> #telomeren<br /> #transcriptie bij eukaryoten<br /> #intron/extron splicing<br /> #begrippen<br /> #*cDNA<br /> #*enhancer<br /> #*tekening RNA mimicry<br /> #*recombinatie bij hemoglobine<br /> <br /> ===16 aug 2016 NM===<br /> #Bespreek de regulatie van het Trp operon. Wat wordt er bedoelt met attenuatie?<br /> #Genetische code is onveranderlijk, maar evolutie laat wel sporen na. Verklaar. (tabel met DNA codons gegeven)<br /> #Wat is homologe recombinatie? Wat zijn de moleculaire stappen in dit proces? Welke zijn de belangrijkste eiwitten?<br /> #Woordjes: <br /> #*Sanger methode<br /> #*Tekening Zinkvinger<br /> #*histonacetyltransferase HAT<br /> #*DNA-mismatch repair<br /> <br /> ===27 januari 2016===<br /> #Bespreek opvouwing bij eukaryoot DNA en de invloed op de genexpressie<br /> #Vergelijk translatie-intitiatie bij prokaryoten en eukaryoten<br /> #Er is een probleem bij de replicatie van lineair DNA. Bespreek en wat kunnen we hieraan doen.<br /> #Woordjes: Figuur 8.18, epitoop tagging, mRNA-cap, suppressor-tRNA<br /> <br /> ===25 januari 2016===<br /> #trp en attenuatie<br /> #chromatinestructuur<br /> #translatie initiatie eukaryoten + regulatie<br /> #Woordjes: <br /> #*foto footprinting<br /> #*cap mRNA<br /> #*base-excinsieherstel<br /> #*retrotransposons<br /> <br /> ===18 januari 2016 VM===<br /> #Geef de structuur, functie, biosynthese van de 5' cap en vergelijk dit met het 5' einde van de prokaryoten.<br /> #Bespreek de gelijkenissen en verschillen tussen pro- en eukaryoot RNA-polymerases.<br /> #Wat is homologe recombinatie, welke moleculaire stappen vinden hierbij plaats en wat zijn de belangrijkste eiwitten die hierin meespelen.<br /> #Woordjes: <br /> #*Sanger-sequencing<br /> #*Foto van antiterminatie – terminatie<br /> #*Nucleosoom<br /> #*DNA-mismatch repair<br /> <br /> ===15 januari 2016 NM===<br /> #Leg aan de hand van een tekening uit wat het trombone effect is en welke moleculaire structuren en functies worden hier in dit mechanisme samen getrokken.<br /> #Verklaar met een schema hoe de lysogene cyclus ontstaat bij faag lamba infectie van een E.Coli. Hoe behoud men dee lysogene cyclus en hoe kan deze worden verbroken.<br /> #Geef de structuur, functie, biosynthese van de 5' cap en vergelijk dit met het 5' einde van de prokaryoten;<br /> #Kleine vraagjes: <br /> #*Tekening van lac operon met O1 O2, O3 en CAP en RNAP bindingsplaatsen.<br /> #*Leu-zipper<br /> #*Peptidyltransferase<br /> #*Retrotransposons<br /> <br /> ===14 januari 2016 NM===<br /> #Welke experimentele methoden ken je om de interactie tussen dna en eiwit te bestuderen en hoe werken ze.<br /> #Bespreek transcriptie van eukaryote rna polymerase 2 en de factoren die hierin meespelen. <br /> #Bacteriële transposons, hoe werken ze en wat zijn voor- en nadelen.<br /> #Woordjes: <br /> #*Northern blotting<br /> #*wobble base paring<br /> #*u6<br /> #*en zo die haarspeld van heatshok<br /> <br /> ===13 januari 2016===<br /> #Terminatie van transcriptie bij prokaryoten<br /> #Functie en structuur van de C-terminaal van eukaryoot RNA pol II<br /> #Terminatie en hervatting bij eukaryoten ribosomen<br /> #Woordjes: <br /> #*S1 mapping<br /> #*RNA-DNA hybride met intron<br /> #*eIF2 alfa<br /> #*Holliday junctie<br /> <br /> ===26 januari 2015===<br /> #5'cap structuur, biosynthese en functie en vergelijken met 5' van prokaryote mRna<br /> #catabolic activator protein structuur en functie<br /> #wat is het probleem bij replicatie van lineair dna en hoe lost de cel dit op <br /> #tekening van lac operon (met de 3 operonen, structuur repressor uitleggen); enhanceosoom; peptidyl transfer; en v(d)j-recombination <br /> <br /> ===14 januari 2015===<br /> #verschillen en gelijkenissen tussen rna polymerase van prokaryoten en eukaryoten<br /> #alternatieve splitsing, ook een voorbeeld ervan geven<br /> #genconversie uitleggen aan de hand van een figuur<br /> #woordjes: abortieve transcriptie, tekening van het trombone model, aminoacyl trna synthetase en cdna kloning<br /> <br /> ===12 januari 2015 (NM)===<br /> #Hoe kun je de binding tussen dna en eiwitten bestuderen <br /> #Splicing <br /> #RecBCD <br /> #begrippen: sanger sequencing, zinkvingers afbeelding, histonmodelering, eif4e<br /> <br /> ===12 januari 2015 (VM)===<br /> #transcriptie-initiatie<br /> #translate-elongatie<br /> #transposons bacterie<br /> #woordjes: anti-sigmafactor, epitoop tagging, splicingfiguur en genvonversie<br /> <br /> ===16 jan 2015===<br /> #Bespreek de Trp operon regulatie. Wat is attenuatie?<br /> #Geef de histonen en hun modificaties + het gevolg van deze modificaties op de genexpressie.<br /> #Wat is V(D)J recombinatie en wat is het biologisch nut ervan?<br /> #Kleine vragen:<br /> #*Afbeelding van een Zn-Vinger<br /> #*Wat is een replisoom?<br /> #*Wat is stopcodon supressie.<br /> #*Bespreek de beta klemlader.<br /> <br /> ===3 september 2014===<br /> # Bespreek de effecten van arabinose en glucose op de expressie van het ara-operon. Verduidelijk de onderliggende mechanismen.<br /> # Bespreek de moleculaire processen die leiden tot het starten van de translatie bij eukaryoten (vertrekkende van matuur mRNA in het cytosol).<br /> #* Op welke wijze(n) kan de cel deze translatie-initiatie regelen?<br /> # Wat is homologe recombinatie? Wat zijn de moleculaire stappen in dit proces? Welke zijn de belangrijkste eiwitten?<br /> # Termen:<br /> #* Northern Blotting<br /> #* topoisomerase<br /> #* alternatieve splicing<br /> #* RNA splicing afbeelding uitleggen (halverwege de splicing met de lariaat reeds gevormd.)<br /> <br /> ===28 Augustus 2014===<br /> # Bespreek de regulatie van het trp operon. Wat wordt er bedoeld met attenuatie?<br /> # Bespreek op moleculair niveau de translatie elongatie cyclus bij prokaryoten.<br /> #* Hoe wordt deze cyclus afgebroken? (terminatie)<br /> # Wat is genconversie? Hoe algemeen komt dit voor?<br /> # Termen:<br /> #* DNA footprinting<br /> #* telomerase<br /> #* Rollende cirkel replicatie<br /> #* RNA splicing afbeelding uitleggen (halverwege de splicing met de lariaat reeds gevormd.)<br /> <br /> ===27 januari 2014 (voormiddag)===<br /> # hoe eiwitten ontdekken op DNA? meerder manieren (footprinting en nucleosoompositionering en hij vroeg dan nog naar CAP)<br /> # waar zorgen histonen voor bij DNA en aanpassingen?<br /> # translatie initiatie bij eukaryoten en geef de dingen die daarbij kunnen <br /> # woordjes:<br /> #*antiterminatie<br /> #*ticketing hypothese ofzoiets<br /> #*BER<br /> #*van die eiwitten iets met die herschikkingen<br /> <br /> ===17 jan 2014 (namiddag)===<br /> #bespreek de terminatie mechanismen bij prokaryoten<br /> #bespreek de translatie elongatie cyclus<br /> #bespreek RNA splicing<br /> #woordjes: S1 mapping, enhancer, amino acetyl tRNA syntethase, genconversie<br /> <br /> ===16 jan 2014 (namiddag)===<br /> # Bespreek de structuur en functie van kataboliet activerend proteïne (CAP)<br /> # Bespreek de invloed van histonen en hun modificaties op genexpressie<br /> # Tijdens de replicatie van lineair DNA is er een probleem. Hoe lost de cel dit op?<br /> # Leg uit: <br /> #* nucleaire receptoren<br /> #* polyadenylatiesignalen<br /> #* stopcodonsuppressors<br /> #* bacteriële transposons<br /> <br /> === 15 jan 2014 (voormiddag) ===<br /> # Geef de structuur en functies van de sigma(factoren) bij RNA polymerase van prokaryoten.<br /> # Leg uit wat de structuur en functies zijn van het C terminale domein van eukaryotisch RNA polymerase II.<br /> # De genetische code kan niet gewijzigd worden, toch zijn er sporen van evolutie. Bespreek deze stelling adhv de figuur. Gegeven figuur : tabel van alle mogelijke codons voor de verschillende aminozuren<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte:<br /> #* Epitoop tagging<br /> #* Type II introns<br /> #* Kozak sequentie <br /> #* Holliday-verbinding<br /> <br /> ===13 jan 2014 (namiddag) ===<br /> # Transcriptie initiatie bij prokaryoten<br /> # Splicing<br /> # Leg uit: <br /> #*A-DNA <br /> #*Southern blotting <br /> #*HAT <br /> #*eIF4E<br /> # Homologe recombinatie (enkel schriftelijk)<br /> <br /> ===13 jan 2014 (voormiddag)=== <br /> # bespreek invloed glucose en arabinose op ara-operon + onderligende moleculaire mechanismen<br /> # mRNA cap: bespreek de biosynthese, functie, vergelijk met 5' prokaryoot<br /> # wat hebben transposons en antilichamen gemeen? licht toe<br /> # leg uit: <br /> #*rho<br /> #*zinkvinger<br /> #*peptidyltransferase<br /> #*splicingsignalen<br /> <br /> === 28 jan 2013(voormiddag) ===<br /> <br /> # Geef de verschillen en gelijkenissen tussen de regulaire van lac- en trp-operon.<br /> # Bespreek hoe eukaryote ribosomen transcriptie temineren en hervatten.<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte:<br /> #* cDNA kloning<br /> #* Figuur van polyadenyleringscomplex<br /> #* Heat shock response<br /> #* Rolling circle replicatie<br /> <br /> === 16 jan 2012(voormiddag) ===<br /> <br /> # Structuur en functie van de CTD bij eukaryoot RNA-polymerase II beschrijven.<br /> # Sanger-methode voor sequentie-analyse bespreken.<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte:<br /> #* Zinkvinger<br /> #* Ribozyme<br /> #* Tekening van tRNA-mimicry<br /> #* Telomerase<br /> <br /> <br /> === 24 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> idem 18 januari 2010<br /> <br /> === 17 jan 2011 (namiddag) ===<br /> <br /> # Leg uit hoe lactose en glucose het lac operon beïnvloeden<br /> # Gen activiteit bij eukaryoten kan geanalyseerd worden aan de hand van DNase activiteit. <br /> #* Leg uit <br /> #* hoe doet men dit experimenteel<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte <br /> #* lariat <br /> #* eIF2 alfa <br /> #* wobble <br /> #* tekening van rolling circle replicatie (tekening van faag lamda)<br /> <br /> === 17 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Bespreek structuur en functie van prokaryoot RNA-polymerase (holoënzym)<br /> # Maak een vergelijking tussen translatie-initiatie bij prokaryoten en eukaryoten<br /> # Verklaar:<br /> #* Lysogenie<br /> #* Histon H1<br /> #* RT-PCR<br /> #* Fig. 21.34 (onderste deel alleen)<br /> <br /> <br /> === 29 jan 2010 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Bespreek transcriptie-initiatie bij prokaryoten.<br /> # Fig 21.18<br /> # Bespreek kort:<br /> #* C-waardeparadox<br /> #* Kozak-sequentie<br /> #* Epitope tagging<br /> #* EF-Tu<br /> <br /> === 19 jan 2010 ===<br /> <br /> # Bespreek het scanning-model bij eukaryote translatie-initiatie.<br /> # Welke methode(s) ken je om de transcriptiestartplaats / het 5' einde te bepalen?<br /> # Bespreek kort:<br /> #* Riboswitch<br /> #* TATA<br /> #* Zinkvinger<br /> #* Figuur met vorming thèta-structuur<br /> <br /> === 18 jan 2010 ===<br /> # Geef de overeenkomsten en verschillen tussen pro- en eukaryote promoters.<br /> # Bespreek fig. 14.27<br /> # bespreek kort:<br /> #* Ribosoombindingsplaats<br /> #* Moleculaire mimicrie<br /> #* RACE<br /> #* beta-clamp<br /> <br /> === 11 jan 2010 ===<br /> # Bespreek de structuur en functie van prokaryoot RNA-polymerase(holoënzyme)<br /> # Maak een vergelijking tussen translatie-initiatie bij pro-en eukaryoten.<br /> # bespreek kort:<br /> #* lysogenie<br /> #* H1 histonen<br /> #* RT-PCR<br /> #* Fig 21.34<br /> <br /> ----<br /> <br /> === 19 jan 2009 (De Ley)===<br /> # Bespreek terminatie bij prokaryote transcriptie.<br /> # RNA-editing<br /> # fig 4.11<br /> Kaartjes:<br /> # Zink-vinger<br /> # Nick-translatie<br /> <br /> === 16 jan 2009 (De Ley)===<br /> # Bespreek de methode van S1 mapping (5' en 3' einde) en primer extension.<br /> # Structuur prokaryotisch RNA polymerase en bespreking sigma als specificiteitsfactor.<br /> # fig. 14.1<br /> Kaartjes:<br /> # Bespreek MCS, valspositieven en directioneel klonen.<br /> # Plaatsgerichte mutagenese.<br /> <br /> === 15 jan 2009 (De Ley)===<br /> # DNA:<br /> #* Bespreek A, B en Z DNA (ook helemaal hoe DNA wordt opgebouwd).<br /> #* Hoe kan het G-C gehalte van DNA bepaald worden.<br /> # Bespreek de eukaryotische polymerases.<br /> # Figuur van pBR322 bespreken.<br /> Kaartjes:<br /> # Zink-vinger<br /> # fig 9.7<br /> <br /> === 25 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Plaats gerichte mutagenese.<br /> # Trp operon.<br /> # Stom figuur van dnase hypergevoeligheid bij actief/inactief dna.<br /> <br /> === 21 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Bespreek DNA fingerprinting en typing (+toepassingen en detectie)<br /> # Bespreek de lytische reproductiecyclus van faag lambda.<br /> # Foto van RNA editing.<br /> Kaartjes: <br /> # Figuurke van 30nm vezel van chromatine en dan zo verwijderen van histonen om dubbelstreng DNA te krijgen en dan nick van DNA.<br /> # Verschil tussen DNase en DMS footprinting.<br /> <br /> === 21 jan 2008 (De Ley)===<br /> # S1 mapping ( 3' en 5') + primer extension (verschillen, voor-en nadelen)<br /> # Alles over prokaryotisch RNApol (subeenheden, functies, experimenten met sigmafactor + virussentranscriptie, ...)<br /> # figuur: Intron-exon met die lus-structuur (vraagt ook hoe ge da beeld bekomt via EM)<br /> Kaartjes:<br /> # Merodiploid: constitutieve operator.<br /> # Proteïne - dna interactie figuur (met die helix-turn-helix).<br /> <br /> === 17 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Expressievectoren.<br /> # Acetylatie en deacetylatie (+Histone acetyltransferase cloning of zoiets).<br /> # fig 9.14 (vierde editie)<br /> Kaartjes:<br /> # Epitope tagging<br /> # fig 13.10<br /> <br /> === 14 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Bespreek het trp operon.<br /> # Bespreek site-directed mutagenesis.<br /> # vul tekening van DNAse hypersensitivity verder aan. Bespreek de gebruikte technieken.<br /> Kaartjes:<br /> # Zo'n schematje van een merodiploid van het lac operon.<br /> # De C-waarde paradox.<br /> <br /> === 26 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Prokaryoot RNApolymerase en sigma.<br /> # Figuur van RNAlooping.<br /> # S1mapping en primer extension.<br /> <br /> === 25 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Transcriptieterminatie bij prokaryoten.<br /> # RNAediting.<br /> # Figuur van pBluescript.<br /> <br /> === 25 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Reassociatie kinetica.<br /> # Alles over chromatine en H1.<br /> # Foto: P22 en 434 (lambda operator/repressor interacties).<br /> Kaartjes:<br /> # Bespreek de sigmacyclus.<br /> # DNA transcriptie.<br /> <br /> === 24 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Bespreek S1 mapping(zowel 3'als 5'einde) en primer extension.<br /> # Bespreek de structuur van de prokarytische RNApolymerase en ook sigma als specifiteitsfactor.<br /> # Foto van R-looping experiment.<br /> Kaartjes: <br /> # Plaque hybridisatie.<br /> # Dnase(1)-hypergevoeligheid.<br /> <br /> === 16 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Geef de verschillende methoden voor expressie van gekloonde genen(inbegrepen fusieproteïnen en hun zuivering).<br /> # Bespreek de acetylering en deacetylering van histonen (bespreek ook het kloneringsexperiment van histon-acetyl-transferase).<br /> # Figuur 9.17 pag. 258 bespreken.<br /> Kaartjes:<br /> # Vergelijk DNase footprinting met gel mobility shift. Zijn er specifieke voordelen van de ene techniek tov. de andere.<br /> # Figuur 9.18a pag 259 bespreken.</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Moleculaire_Biologie&diff=3866 2024-01-29T13:53:09Z

<p>R0857325: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak gedoceerd door:<br /> * Prof. M. De Ley (-∞ tot augustus 2009)<br /> * Prof. J. Robben (september 2009 - augustus 2023)<br /> * Prof F. Volckaert (tegelijk met Robben tot augustus 2022 ?)<br /> * Prof W. Vandenberg (tegelijk met Robben vanaf september 2022 en zelfstandig vanaf september 2023)<br /> <br /> Examen samenstelling (Sinds 2013)<br /> #Open vraag 1 (~1 blz; 5/20) <br /> #Open vraag 2 (~1 blz; 5/20)<br /> #Open vraag 3 (~1 blz; 5/20) ← Prof F. Volckaert zijn vraag<br /> #4 ≠ termen (~1 blz; 5/20) Concept//Figuur//Moleculair mechanisme//Naam eiwit//Methode<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===29 januari 2024===<br /> #bespreek V(D)J recombinatie, welk belang heeft dit in de biologie?<br /> #Welk probleem treedt er op bij replicatie van lineair DNA? Hoe lost de cel dit op?<br /> #Welke algemene translatierugelatiemechanismen zijn er bij eukaryoten?<br /> #Begrippen:<br /> #*Polyadenyleringssignalen<br /> #*TATA-binding protein<br /> #*nitrocellulose-assay<br /> #*IPTG<br /> ===23 januari 2024===<br /> #Bespreek de bouw en functie van het RNA-polymerase bij prokaryoten (holoenzym).<br /> #Bespreek translatie-initiatie bij eukaryoten.<br /> #Leg de RecBCD reactieweg uit bij E. coli en hoe is dit relevant bij andere organismen.<br /> #Begrippen:<br /> #*Southern blotting<br /> #*DNA-fotolyase<br /> #*Alternatieve splicing<br /> #*TFIID<br /> ===17 augustus 2023===<br /> #Leg attenuatie uit aan de hand van het Trp operon<br /> #Een gelijkaardig mechanisme van homologe recombinatie wordt gebruikt voor DNA dubbelstrengbreuk herstel in E. coli en voor meiotische homologe recombinatie in gist. Leg uit.<br /> #Welk probleem stelt zich bij de replicatie van lineair DNA voor dat zich niet voordoet bij circulair DNA? Welke oplossing(en) heeft de cel hiervoor? (telomerase)<br /> #Begrippen: codondegeneratie, groep II intron, polysoom, histon H1<br /> <br /> ===30 januari 2023===<br /> #Toon aan hoe de lambda faag zijn inbouw in het gastheergenoom reguleert en onderhoudt adhv een schema van de relevante moleculaire en genetische elementen. Hoe wordt lysogenie ongedaan gemaakt?<br /> #Wat is een Holiday-junctie? Hoe komt deze tot stand en hoe wordt deze ongedaan gemaakt? (Leg uit op moleculair niveau)<br /> #Bespreek de translatie-elongatiecyclus bij prokaryoten. (Schets + benoem relevante spelers)<br /> #4 begrippen<br /> #*RACE<br /> #*Groep II-intron<br /> #*Nucleosoom<br /> #*Processiviteit<br /> ===24 januari 2023===<br /> #Bespreek de mechanismen van transcriptieterminatie bij eu- en prokaryoten. (schets!)<br /> #Bespreek de onderstaande figuur. (trombone model)<br /> #Bespreek V(D)J-recombinatie.<br /> #* Geef het moleculaire mechanisme.<br /> #* Welk belang heeft dit in de biologie?<br /> #* Wat is het verband met transpositie?<br /> #4 begrippen<br /> #* Sanger-sequencing (dideoxyketenterminatie)<br /> #* Lysogene inductie (faag lamda)<br /> #* DABPolFEH-complex<br /> #* Aminoacyl-tRNA synthetase<br /> ===3 september 2022===<br /> # Attenuatie uitleggen aan de hand van de regulatie van het trp operon en hoe kan je dit in vitro bestuderen.<br /> #Hoe matuur mRNA maken<br /> #Wat hebben dsDNA-breuk repair in E.coli en homologe recombinatie in yeast gemeenschappelijk?<br /> #4 begrippen<br /> #* bitscore-tekening (zie splicing signals) van ..G..AUG.. (ging over de conservatie misschien?)<br /> #* peptidyltransferase<br /> #* Telomerase<br /> #* TFIID<br /> ===31 januari 2022===<br /> #Bespreek adhv een schema hoe faag lambda terecht komt in de lysogene fase. Hoe kan deze overgaan tot de lytische fase? <br /> #Welke moleculaire mechanismen moeten plaatsvinden voordat de translatie kan beginnen? (Beginnend van matuur mRNA) Welke algemene moleculaire mechanismen kunnen deze reguleren? <br /> #Bespreek de werking van RuvC in Holliday-juncties<br /> #4 begrippen<br /> #* Histoon modificaties<br /> #* Splicing signalen<br /> #* Yeast 2 hybrid<br /> #* Nucleotide excisie herstelling (DNA)<br /> <br /> ===25 januari 2022===<br /> #Leg schematisch het regulatiemechanisme van het ara operon uit. Wat is de invloed van glucose en arabinose?<br /> #Gegeven een tabel van genetische code. We weten dat de genetische code universeel is maar toch zien we sporen van evolutie. Leg uit aan de hand van de gegeven tabel. <br /> #Wat hebben retrovirussen en transposons gemeen, verklaar op moleculair vlak.<br /> #4 begrippen<br /> #* Heat shock respons (prokaryoten)<br /> #* PolyA-adenylatiesignaal<br /> #* Sanger (dideoxyketenterminatie)<br /> #* Base excisie herstelling (DNA)<br /> <br /> ===24 augustus 2021===<br /> # attenuatie uitleggen aan de hand van de regulatie van het trp operon <br /> # CTD van eukaryoot polymerase II : functie en structuur uitleggen<br /> # Wat hebben dsDNA-breuk repair in E.coli en homologe recombinatie in yeast gemeenschappelijk?<br /> # EF-G, Shine-Dalgarno box, RT-PCR, afbeelding dsDNA lariaat structuur (was een tekening met DNA of RNA met t- en D- loop en tail)?<br /> <br /> ===15 januari 2021===<br /> #Alternatieve splicing uitleggen en een concreet voorbeeld geven.<br /> #Translatie elongatie uitleggen en welke antibiotica invloed hierop hebben en waar.<br /> #Bespreek de verschillende herstelmechanismen van DNA schade in E. coli.<br /> #4 begrippen<br /> #* RecA<br /> #* foto van grote groef en kleine groef met donor en acceptor plaatsen<br /> #* DNA footprinting<br /> #*Group 2 introns<br /> <br /> ===7 januari 2021===<br /> #Iets over structurele kenmerken van transcriptie activators en de bindingsplekken in het DNA. <br /> # 2 deelvragen over eukaryote translatie initiatie<br /> #* Translatie initiatie uitleggen vanaf matuur mRNA in het cytosol (eukaryoot)<br /> #* Regulatie van translatie initiatie, hoe kan het gereguleerd worden als er vb celstress is.<br /> #Wat is homologe recombinatie, geef de moleculaire werking, welke eiwitten komen hier bij kijken.<br /> #Begrippen<br /> #* Sanger sequencing<br /> #* telomerase<br /> #* tekening van riboswitch met FMN als ligand<br /> #* splicingsignalen<br /> <br /> ===19 augustus 2020===<br /> '''(corona = 2 vragen ipv 3)'''<br /> #Verklaar met een schema hoe de lysogene cyclus ontstaat bij faag lamba infectie van een E.Coli. Hoe behoud men deze lysogene cyclus en hoe kan deze worden verbroken.<br /> #Wat is homologe recombinatie? Wat is het werkingsmechanisme? Welke eiwitten zijn erbij betrokken?<br /> #4 begrippen<br /> #* RACE<br /> #* mRNA-cap<br /> #* Kozak sequentie<br /> #* Telomerase<br /> <br /> ===30 januari 2020===<br /> #Leg het ara operon uit<br /> #Hoe kan je op experimentele wijze het begin van de transcriptie vinden en de 5' mRNA?<br /> #In het hoofdstuk transposase werd immunoglobulinegenen besproken, waarom werd dat hier besproken en hoe zien deze eruit?<br /> #4 begrippen<br /> #*Sanger sequencing<br /> #*Foto van splicing met snRNP's<br /> #*Gamma complex<br /> #* Shine-Delgarno box<br /> <br /> ===17 januari 2020===<br /> #a) Uitleggen start translatie initiatie bij eukaryoten. b) Hoe kan je de initiatie globaal reguleren?<br /> # Geef de verschillende structuren van DNA-bindende domeinen van transcriptie activators.<br /> # Wat is RecA? Waar vinden we het terug en hoe heeft men dat kunnen aantonen? Leg uit aan de hand van een tekening.<br /> # 4 begrippen: riboswitch (afbeelding gegeven), attenuatie, Yeast to hybrid en wobble pairing <br /> <br /> ===13 januari 2020 NM===<br /> #Wat zijn histonen en hoe reguleren ze de genexpressie?<br /> #Leg de verschillende stappen van translatie elongatie bij prokaryoten uit en de factoren die hierbij nodig zijn.<br /> #Leg het mechanisme van herstel van beschadigd DNA bij E.Coli uit.<br /> #4 begrippen:<br /> #*Sanger sequencing<br /> #*Riboswitch<br /> #*tekening R-loop<br /> #*RecA<br /> <br /> ===13 januari 2020 VM===<br /> #Geef de structuur, biosynthese van cap structuur van mRNA en vergelijk met prokaryoot.Wat zijn de effecten hiervan?<br /> #Leg uit hoe het ara-peron wordt gereguleerd.<br /> #Wat hebben retrovirussen en transposons gemeen, verklaar op moleculair vlak.<br /> #4 begrippen:<br /> #*DNA footprinting<br /> #*stopcodonsurpressie<br /> #*Tekening pausing &amp; backtracking<br /> #*OriC<br /> <br /> ===3 september 2019===<br /> #Verklaar met een schema hoe de lysogene cyclus ontstaat bij faag lamba infectie van een E.Coli. Hoe behoud men dee lysogene cyclus en hoe kan deze worden verbroken.<br /> #Vergelijk aan de hand van een schema de translatie initiatie bij prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Wat is de functie van RuvC bij de Holliday Junction? Maak een schets en beschrijf het mechanisme.<br /> #4 begrippen:<br /> #*zink vingers<br /> #*stopcodonsurpressie<br /> #*polysoom<br /> #*rollende cirkel replicatie<br /> <br /> ===30 augustus 2019===<br /> #Bespreek RNA-splicing. intron-herkenning, mechanisme, factoren, enzymen,... <br /> #Translatie elongatie bij eukaryoten<br /> #Trombonemodel<br /> #4 begrippen: Sanger sequencing, Riboswitch, figuur R-loop, RecA<br /> <br /> <br /> ===23 augustus 2019===<br /> #Structuur histonen en hun effect op de genexpressie<br /> #DNA schade en repair bij E.coli<br /> #Gelijkenis tussen retrovirussen en transposons, verder toelichten op moleculair vlak<br /> #4 begrippen: T(elomeer) loop, antiterminatie, yeast two hybrid methode en nog eentje maar die ben ik vergeten sorry xx<br /> <br /> ===21 januari 2019 NM===<br /> #Structuur van C-terminaal domein en geef de functies ervan.<br /> #Hoe kan je de start van transcriptie vanaf de promotor vinden (techniek)<br /> #Welke transposons komen voor bij zoogdieren. Leg bondig uit hoe die eruit zien. Hoe frequent komt dit voor bij mensen?<br /> #Begrippen: Rho onafhankelijke terminatie, Heat shock genes, U6, Wobble paring<br /> <br /> ===18 januari 2019 NM===<br /> #Gegeven een tabel van genetische code. Leg uit waarom de genetische code zowel een bevroren geval als een resultaat van evolutie is. <br /> #Geef de verschillende structuren van DNA-bindende domeinen van transcriptie activators.<br /> #Door welke mechanismen kunnen bij DNA-replicatie beide strengen simultaan gerepliceerd worden?<br /> #Begrippen: Antiterminatie, Yeast 2 hybrid, tekening van polyadenylatie, herschikking van immunoglobulinegenen.<br /> <br /> ===14 januari 2019 VM===<br /> #Geef de structuur en functie van prokaryote sigma-factor(en).<br /> #Wat is alternatieve splicing? Wat is de functie voor de cel? Geef een concreet voorbeeld.<br /> #Welk probleem treedt er op bij replicatie van lineair DNA? Hoe lost de cel dit op?<br /> #Begrippen: S1-mapping, tekening van G-C binding, eIF2a, holiday-junctie<br /> <br /> ===24 augustus 2018===<br /> #Bespreek de gelijkenissen en verschillen bij prokaryote en eukaryote promotors die betrekking hebben op eiwit genen. (dus alleen Class 2 voor eukaryoten) <br /> #Bespreek RNA-splicing. intron-herkenning, mechanisme, factoren, enzymen,... <br /> #Wat is homologe recombinatie? Wat is het werkingsmechanisme? Welke eiwitten zijn erbij betrokken?<br /> #begrippen: Riboswitch, tekining Kozak sequentie, telomerase en cDNA-cloning (dit is vanaf mRNA naar DNA gaan om het in een vector in te bouwen, staat voor complementair DNA)<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> #Welke rol spelen prokaryote sigma-factor(en) bij de transcriptie? Bespreek hun structuur en functie. (mondeling)<br /> #Hoe kan men experimenteel de transcriptie-start van een gen bepalen voor een bepaalde promoter?<br /> #Replicatie van lineair DNA (niet-circulair) met DNA polymerase vormt een probleem voor de cel. Wat is dit probleem? Hoe lost de cel dit probleem op?<br /> #Begrippen: Riboschakelaar (riboswitch), cDNA-kloning, tekening van kozaksequentie, RecBCD reactieweg (mondeling)<br /> <br /> ===22 januari 2018 VM===<br /> #Wat zijn histonen? Hoe zijn ze betrokken in de genexpressie? Bespreek het moleculaire niveau.<br /> #Structuur en functie van catabolic activatior protein (cap)<br /> #Waaorom past immunoglobine bij het hoofdstuk over transpositie?<br /> #Begrippen: mRNA cap, tekening van backtracking, oriC, sanger-methode<br /> <br /> ===18 januari 2018 NM===<br /> #Met welke methode kun je op experimentele wijze de relatieve hoeveelheid van mRNA aantonen? <br /> #Wat is alternative splicing? Wat is de functie voor de cel? Geef een concreet voorbeeld.<br /> #Geef het mechanisme van translatie elongatie bij prokaryoten.<br /> #Begrippen: Lacoperon met 3operatoren en CAPsite, Leu-zipper, peptidyltransfer en retrotransposon<br /> <br /> ===15 januari 2018 NM===<br /> #Geef de verschillen bij transcriptie initiatie tussen prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Geef de verschillende mogelijkheden voor transcriptie terminatie bij prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Wat is de functie van RuvC bij de Holliday Junction? Maak een schets en beschrijf het mechanisme.<br /> #Begrippen: Sanger Sequencing, Zn-vingers, U2 (SNRNP), stopcodonsupressie.<br /> <br /> ===15 januari 2018 VM===<br /> #Wat is alternatieve splicing? Hoe werkt het en wat is de functie ervan. Geef een concreet voorbeeld. (Mondeling)<br /> #Leg op moleculair niveau translatie-elongatie cyclus uit bij prokaryoten. (Schriftelijk)<br /> #Welke transposons komen voor bij zoogdieren. Leg bondig uit hoe die eruit zien. Hoe frequent komt dit voor bij mensen?(Schriftelijk)<br /> #Begrippen: DNA-footprinting, figuur zink vinger, polysoom, Holliday junctie (Mondeling)<br /> <br /> ===6 september 2017 NM===<br /> #Bespreek de effecten van arabinose en glucose op de expressie van het ara-operon. Verduidelijk de onderliggende mechanismen.<br /> #Bespreek de opvouwing van nucleair DNA bij eukaryoten en bespreek de effecten op de genexpressie. <br /> #Het Ds en Ac mechanisme bij maïs uitleggen. Waarom was deze wetenschappelijke ontdekking zo belangrijk?<br /> #Begrippen: figuur Zn-vinger, polysoom, Shine-Dalgarno box, klem lader (clamp loader)<br /> <br /> ===28 augustus 2017 VM===<br /> #Structuur, biosynthese en functie van cap bij mRNA van eukaroyten. Hoe zit het bij 5'-uiteinde van prokaroyten?<br /> #Welke methode(n) worden gebruikt voor het bepalen van de relatieve hoeveelheid van specifiek mRNA? Leg de werkwijzen uit.<br /> #Wat is homologe recombinatie? Welke moleculaire processen vinden plaats en welke eiwitten zijn betrokken?<br /> #Begrippen: Leu-zipper, nucleosoom, startcodon met kozak sequentie, dubbelstrengbreuk<br /> <br /> <br /> ===30 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek alternatieve splicing. Hoe werkt het en geef een concreet voorbeeld.<br /> #Tabel van codons. Leg uit: dit wijzigt nooit maar toch is er sprake van evolutie. <br /> #Het Ds en Ac mechanisme bij maïs uitleggen. Waarom was deze wetenschappelijke ontdekking zo belangrijk?<br /> #Begrippen: DNA footprint, resolvase, Zink finger (op de tekening staan 3 zink fingers), polysoom<br /> <br /> <br /> ===23 januari 2017 VM===<br /> #Bespreek aan de hand van een figuur het trombonemodel van DNA-replicatie. Welke moleculaire structuren en processen van de DNA-replicatie komen in dit model naar voor.<br /> #Bespreek de structuur, functie en regulatie van de prokaryote sigma-factor(en).<br /> #Op welke experimentele manier kun je de transcriptiestart met een gegeven promotor bepalen. <br /> #Begrippen:<br /> #*enhancer<br /> #*cDNA kloning<br /> #*figuur van heatshock gen<br /> #*RecBCD-reactieweg<br /> <br /> ===20 januari 2017===<br /> #transcriptie terminatie bij pro en eukaryoten uitleggen<br /> #bespreek mRNA Cap-structuur bij eukaryoten (biosynthese, structuur, functie) en vergelijk met prokaryoten<br /> #welke moleculaire processen helpen bij de start van translatie bij eukaryoten. (start van matuur mRNA)<br /> #begrippen<br /> #*enhancer<br /> #*yeast two hybrid method<br /> #*tRNA mimicry<br /> #*herschikking van immunoglobinegenen<br /> <br /> === 19 januari 2017 NM===<br /> #Hoe wordt het ara operon gereguleerd?<br /> #Hoe beinvloeden histonen de genexpressie?<br /> #Wat heeft immunoglobuline met transpositie te maken?<br /> #begrippen<br /> #*Sanger sequencing<br /> #*zinkvinger (afbeelding)<br /> #*polysoom<br /> #*beta-klemlader<br /> <br /> === 16 januari 2017 NM===<br /> #Scanningscomplex van translatie initiatie bij eukaryoten<br /> #Methoden om binding van eiwitten aan DNA te bestuderen<br /> #recA welke functies en werking<br /> #begrippen<br /> #*sanger sequencing<br /> #*tekening zink vingers<br /> #*U2 snRNP<br /> #*stopcodonsuppressie<br /> <br /> ===16 januari 2017 VM===<br /> #telomeren<br /> #transcriptie bij eukaryoten<br /> #intron/extron splicing<br /> #begrippen<br /> #*cDNA<br /> #*enhancer<br /> #*tekening RNA mimicry<br /> #*recombinatie bij hemoglobine<br /> <br /> ===16 aug 2016 NM===<br /> #Bespreek de regulatie van het Trp operon. Wat wordt er bedoelt met attenuatie?<br /> #Genetische code is onveranderlijk, maar evolutie laat wel sporen na. Verklaar. (tabel met DNA codons gegeven)<br /> #Wat is homologe recombinatie? Wat zijn de moleculaire stappen in dit proces? Welke zijn de belangrijkste eiwitten?<br /> #Woordjes: <br /> #*Sanger methode<br /> #*Tekening Zinkvinger<br /> #*histonacetyltransferase HAT<br /> #*DNA-mismatch repair<br /> <br /> ===27 januari 2016===<br /> #Bespreek opvouwing bij eukaryoot DNA en de invloed op de genexpressie<br /> #Vergelijk translatie-intitiatie bij prokaryoten en eukaryoten<br /> #Er is een probleem bij de replicatie van lineair DNA. Bespreek en wat kunnen we hieraan doen.<br /> #Woordjes: Figuur 8.18, epitoop tagging, mRNA-cap, suppressor-tRNA<br /> <br /> ===25 januari 2016===<br /> #trp en attenuatie<br /> #chromatinestructuur<br /> #translatie initiatie eukaryoten + regulatie<br /> #Woordjes: <br /> #*foto footprinting<br /> #*cap mRNA<br /> #*base-excinsieherstel<br /> #*retrotransposons<br /> <br /> ===18 januari 2016 VM===<br /> #Geef de structuur, functie, biosynthese van de 5' cap en vergelijk dit met het 5' einde van de prokaryoten.<br /> #Bespreek de gelijkenissen en verschillen tussen pro- en eukaryoot RNA-polymerases.<br /> #Wat is homologe recombinatie, welke moleculaire stappen vinden hierbij plaats en wat zijn de belangrijkste eiwitten die hierin meespelen.<br /> #Woordjes: <br /> #*Sanger-sequencing<br /> #*Foto van antiterminatie – terminatie<br /> #*Nucleosoom<br /> #*DNA-mismatch repair<br /> <br /> ===15 januari 2016 NM===<br /> #Leg aan de hand van een tekening uit wat het trombone effect is en welke moleculaire structuren en functies worden hier in dit mechanisme samen getrokken.<br /> #Verklaar met een schema hoe de lysogene cyclus ontstaat bij faag lamba infectie van een E.Coli. Hoe behoud men dee lysogene cyclus en hoe kan deze worden verbroken.<br /> #Geef de structuur, functie, biosynthese van de 5' cap en vergelijk dit met het 5' einde van de prokaryoten;<br /> #Kleine vraagjes: <br /> #*Tekening van lac operon met O1 O2, O3 en CAP en RNAP bindingsplaatsen.<br /> #*Leu-zipper<br /> #*Peptidyltransferase<br /> #*Retrotransposons<br /> <br /> ===14 januari 2016 NM===<br /> #Welke experimentele methoden ken je om de interactie tussen dna en eiwit te bestuderen en hoe werken ze.<br /> #Bespreek transcriptie van eukaryote rna polymerase 2 en de factoren die hierin meespelen. <br /> #Bacteriële transposons, hoe werken ze en wat zijn voor- en nadelen.<br /> #Woordjes: <br /> #*Northern blotting<br /> #*wobble base paring<br /> #*u6<br /> #*en zo die haarspeld van heatshok<br /> <br /> ===13 januari 2016===<br /> #Terminatie van transcriptie bij prokaryoten<br /> #Functie en structuur van de C-terminaal van eukaryoot RNA pol II<br /> #Terminatie en hervatting bij eukaryoten ribosomen<br /> #Woordjes: <br /> #*S1 mapping<br /> #*RNA-DNA hybride met intron<br /> #*eIF2 alfa<br /> #*Holliday junctie<br /> <br /> ===26 januari 2015===<br /> #5'cap structuur, biosynthese en functie en vergelijken met 5' van prokaryote mRna<br /> #catabolic activator protein structuur en functie<br /> #wat is het probleem bij replicatie van lineair dna en hoe lost de cel dit op <br /> #tekening van lac operon (met de 3 operonen, structuur repressor uitleggen); enhanceosoom; peptidyl transfer; en v(d)j-recombination <br /> <br /> ===14 januari 2015===<br /> #verschillen en gelijkenissen tussen rna polymerase van prokaryoten en eukaryoten<br /> #alternatieve splitsing, ook een voorbeeld ervan geven<br /> #genconversie uitleggen aan de hand van een figuur<br /> #woordjes: abortieve transcriptie, tekening van het trombone model, aminoacyl trna synthetase en cdna kloning<br /> <br /> ===12 januari 2015 (NM)===<br /> #Hoe kun je de binding tussen dna en eiwitten bestuderen <br /> #Splicing <br /> #RecBCD <br /> #begrippen: sanger sequencing, zinkvingers afbeelding, histonmodelering, eif4e<br /> <br /> ===12 januari 2015 (VM)===<br /> #transcriptie-initiatie<br /> #translate-elongatie<br /> #transposons bacterie<br /> #woordjes: anti-sigmafactor, epitoop tagging, splicingfiguur en genvonversie<br /> <br /> ===16 jan 2015===<br /> #Bespreek de Trp operon regulatie. Wat is attenuatie?<br /> #Geef de histonen en hun modificaties + het gevolg van deze modificaties op de genexpressie.<br /> #Wat is V(D)J recombinatie en wat is het biologisch nut ervan?<br /> #Kleine vragen:<br /> #*Afbeelding van een Zn-Vinger<br /> #*Wat is een replisoom?<br /> #*Wat is stopcodon supressie.<br /> #*Bespreek de beta klemlader.<br /> <br /> ===3 september 2014===<br /> # Bespreek de effecten van arabinose en glucose op de expressie van het ara-operon. Verduidelijk de onderliggende mechanismen.<br /> # Bespreek de moleculaire processen die leiden tot het starten van de translatie bij eukaryoten (vertrekkende van matuur mRNA in het cytosol).<br /> #* Op welke wijze(n) kan de cel deze translatie-initiatie regelen?<br /> # Wat is homologe recombinatie? Wat zijn de moleculaire stappen in dit proces? Welke zijn de belangrijkste eiwitten?<br /> # Termen:<br /> #* Northern Blotting<br /> #* topoisomerase<br /> #* alternatieve splicing<br /> #* RNA splicing afbeelding uitleggen (halverwege de splicing met de lariaat reeds gevormd.)<br /> <br /> ===28 Augustus 2014===<br /> # Bespreek de regulatie van het trp operon. Wat wordt er bedoeld met attenuatie?<br /> # Bespreek op moleculair niveau de translatie elongatie cyclus bij prokaryoten.<br /> #* Hoe wordt deze cyclus afgebroken? (terminatie)<br /> # Wat is genconversie? Hoe algemeen komt dit voor?<br /> # Termen:<br /> #* DNA footprinting<br /> #* telomerase<br /> #* Rollende cirkel replicatie<br /> #* RNA splicing afbeelding uitleggen (halverwege de splicing met de lariaat reeds gevormd.)<br /> <br /> ===27 januari 2014 (voormiddag)===<br /> # hoe eiwitten ontdekken op DNA? meerder manieren (footprinting en nucleosoompositionering en hij vroeg dan nog naar CAP)<br /> # waar zorgen histonen voor bij DNA en aanpassingen?<br /> # translatie initiatie bij eukaryoten en geef de dingen die daarbij kunnen <br /> # woordjes:<br /> #*antiterminatie<br /> #*ticketing hypothese ofzoiets<br /> #*BER<br /> #*van die eiwitten iets met die herschikkingen<br /> <br /> ===17 jan 2014 (namiddag)===<br /> #bespreek de terminatie mechanismen bij prokaryoten<br /> #bespreek de translatie elongatie cyclus<br /> #bespreek RNA splicing<br /> #woordjes: S1 mapping, enhancer, amino acetyl tRNA syntethase, genconversie<br /> <br /> ===16 jan 2014 (namiddag)===<br /> # Bespreek de structuur en functie van kataboliet activerend proteïne (CAP)<br /> # Bespreek de invloed van histonen en hun modificaties op genexpressie<br /> # Tijdens de replicatie van lineair DNA is er een probleem. Hoe lost de cel dit op?<br /> # Leg uit: <br /> #* nucleaire receptoren<br /> #* polyadenylatiesignalen<br /> #* stopcodonsuppressors<br /> #* bacteriële transposons<br /> <br /> === 15 jan 2014 (voormiddag) ===<br /> # Geef de structuur en functies van de sigma(factoren) bij RNA polymerase van prokaryoten.<br /> # Leg uit wat de structuur en functies zijn van het C terminale domein van eukaryotisch RNA polymerase II.<br /> # De genetische code kan niet gewijzigd worden, toch zijn er sporen van evolutie. Bespreek deze stelling adhv de figuur. Gegeven figuur : tabel van alle mogelijke codons voor de verschillende aminozuren<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte:<br /> #* Epitoop tagging<br /> #* Type II introns<br /> #* Kozak sequentie <br /> #* Holliday-verbinding<br /> <br /> ===13 jan 2014 (namiddag) ===<br /> # Transcriptie initiatie bij prokaryoten<br /> # Splicing<br /> # Leg uit: <br /> #*A-DNA <br /> #*Southern blotting <br /> #*HAT <br /> #*eIF4E<br /> # Homologe recombinatie (enkel schriftelijk)<br /> <br /> ===13 jan 2014 (voormiddag)=== <br /> # bespreek invloed glucose en arabinose op ara-operon + onderligende moleculaire mechanismen<br /> # mRNA cap: bespreek de biosynthese, functie, vergelijk met 5' prokaryoot<br /> # wat hebben transposons en antilichamen gemeen? licht toe<br /> # leg uit: <br /> #*rho<br /> #*zinkvinger<br /> #*peptidyltransferase<br /> #*splicingsignalen<br /> <br /> === 28 jan 2013(voormiddag) ===<br /> <br /> # Geef de verschillen en gelijkenissen tussen de regulaire van lac- en trp-operon.<br /> # Bespreek hoe eukaryote ribosomen transcriptie temineren en hervatten.<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte:<br /> #* cDNA kloning<br /> #* Figuur van polyadenyleringscomplex<br /> #* Heat shock response<br /> #* Rolling circle replicatie<br /> <br /> === 16 jan 2012(voormiddag) ===<br /> <br /> # Structuur en functie van de CTD bij eukaryoot RNA-polymerase II beschrijven.<br /> # Sanger-methode voor sequentie-analyse bespreken.<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte:<br /> #* Zinkvinger<br /> #* Ribozyme<br /> #* Tekening van tRNA-mimicry<br /> #* Telomerase<br /> <br /> <br /> === 24 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> idem 18 januari 2010<br /> <br /> === 17 jan 2011 (namiddag) ===<br /> <br /> # Leg uit hoe lactose en glucose het lac operon beïnvloeden<br /> # Gen activiteit bij eukaryoten kan geanalyseerd worden aan de hand van DNase activiteit. <br /> #* Leg uit <br /> #* hoe doet men dit experimenteel<br /> # Verklaar binnen de aangegeven ruimte <br /> #* lariat <br /> #* eIF2 alfa <br /> #* wobble <br /> #* tekening van rolling circle replicatie (tekening van faag lamda)<br /> <br /> === 17 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Bespreek structuur en functie van prokaryoot RNA-polymerase (holoënzym)<br /> # Maak een vergelijking tussen translatie-initiatie bij prokaryoten en eukaryoten<br /> # Verklaar:<br /> #* Lysogenie<br /> #* Histon H1<br /> #* RT-PCR<br /> #* Fig. 21.34 (onderste deel alleen)<br /> <br /> <br /> === 29 jan 2010 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Bespreek transcriptie-initiatie bij prokaryoten.<br /> # Fig 21.18<br /> # Bespreek kort:<br /> #* C-waardeparadox<br /> #* Kozak-sequentie<br /> #* Epitope tagging<br /> #* EF-Tu<br /> <br /> === 19 jan 2010 ===<br /> <br /> # Bespreek het scanning-model bij eukaryote translatie-initiatie.<br /> # Welke methode(s) ken je om de transcriptiestartplaats / het 5' einde te bepalen?<br /> # Bespreek kort:<br /> #* Riboswitch<br /> #* TATA<br /> #* Zinkvinger<br /> #* Figuur met vorming thèta-structuur<br /> <br /> === 18 jan 2010 ===<br /> # Geef de overeenkomsten en verschillen tussen pro- en eukaryote promoters.<br /> # Bespreek fig. 14.27<br /> # bespreek kort:<br /> #* Ribosoombindingsplaats<br /> #* Moleculaire mimicrie<br /> #* RACE<br /> #* beta-clamp<br /> <br /> === 11 jan 2010 ===<br /> # Bespreek de structuur en functie van prokaryoot RNA-polymerase(holoënzyme)<br /> # Maak een vergelijking tussen translatie-initiatie bij pro-en eukaryoten.<br /> # bespreek kort:<br /> #* lysogenie<br /> #* H1 histonen<br /> #* RT-PCR<br /> #* Fig 21.34<br /> <br /> ----<br /> <br /> === 19 jan 2009 (De Ley)===<br /> # Bespreek terminatie bij prokaryote transcriptie.<br /> # RNA-editing<br /> # fig 4.11<br /> Kaartjes:<br /> # Zink-vinger<br /> # Nick-translatie<br /> <br /> === 16 jan 2009 (De Ley)===<br /> # Bespreek de methode van S1 mapping (5' en 3' einde) en primer extension.<br /> # Structuur prokaryotisch RNA polymerase en bespreking sigma als specificiteitsfactor.<br /> # fig. 14.1<br /> Kaartjes:<br /> # Bespreek MCS, valspositieven en directioneel klonen.<br /> # Plaatsgerichte mutagenese.<br /> <br /> === 15 jan 2009 (De Ley)===<br /> # DNA:<br /> #* Bespreek A, B en Z DNA (ook helemaal hoe DNA wordt opgebouwd).<br /> #* Hoe kan het G-C gehalte van DNA bepaald worden.<br /> # Bespreek de eukaryotische polymerases.<br /> # Figuur van pBR322 bespreken.<br /> Kaartjes:<br /> # Zink-vinger<br /> # fig 9.7<br /> <br /> === 25 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Plaats gerichte mutagenese.<br /> # Trp operon.<br /> # Stom figuur van dnase hypergevoeligheid bij actief/inactief dna.<br /> <br /> === 21 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Bespreek DNA fingerprinting en typing (+toepassingen en detectie)<br /> # Bespreek de lytische reproductiecyclus van faag lambda.<br /> # Foto van RNA editing.<br /> Kaartjes: <br /> # Figuurke van 30nm vezel van chromatine en dan zo verwijderen van histonen om dubbelstreng DNA te krijgen en dan nick van DNA.<br /> # Verschil tussen DNase en DMS footprinting.<br /> <br /> === 21 jan 2008 (De Ley)===<br /> # S1 mapping ( 3' en 5') + primer extension (verschillen, voor-en nadelen)<br /> # Alles over prokaryotisch RNApol (subeenheden, functies, experimenten met sigmafactor + virussentranscriptie, ...)<br /> # figuur: Intron-exon met die lus-structuur (vraagt ook hoe ge da beeld bekomt via EM)<br /> Kaartjes:<br /> # Merodiploid: constitutieve operator.<br /> # Proteïne - dna interactie figuur (met die helix-turn-helix).<br /> <br /> === 17 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Expressievectoren.<br /> # Acetylatie en deacetylatie (+Histone acetyltransferase cloning of zoiets).<br /> # fig 9.14 (vierde editie)<br /> Kaartjes:<br /> # Epitope tagging<br /> # fig 13.10<br /> <br /> === 14 jan 2008 (De Ley)===<br /> # Bespreek het trp operon.<br /> # Bespreek site-directed mutagenesis.<br /> # vul tekening van DNAse hypersensitivity verder aan. Bespreek de gebruikte technieken.<br /> Kaartjes:<br /> # Zo'n schematje van een merodiploid van het lac operon.<br /> # De C-waarde paradox.<br /> <br /> === 26 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Prokaryoot RNApolymerase en sigma.<br /> # Figuur van RNAlooping.<br /> # S1mapping en primer extension.<br /> <br /> === 25 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Transcriptieterminatie bij prokaryoten.<br /> # RNAediting.<br /> # Figuur van pBluescript.<br /> <br /> === 25 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Reassociatie kinetica.<br /> # Alles over chromatine en H1.<br /> # Foto: P22 en 434 (lambda operator/repressor interacties).<br /> Kaartjes:<br /> # Bespreek de sigmacyclus.<br /> # DNA transcriptie.<br /> <br /> === 24 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Bespreek S1 mapping(zowel 3'als 5'einde) en primer extension.<br /> # Bespreek de structuur van de prokarytische RNApolymerase en ook sigma als specifiteitsfactor.<br /> # Foto van R-looping experiment.<br /> Kaartjes: <br /> # Plaque hybridisatie.<br /> # Dnase(1)-hypergevoeligheid.<br /> <br /> === 16 jan 2007 (De Ley)===<br /> # Geef de verschillende methoden voor expressie van gekloonde genen(inbegrepen fusieproteïnen en hun zuivering).<br /> # Bespreek de acetylering en deacetylering van histonen (bespreek ook het kloneringsexperiment van histon-acetyl-transferase).<br /> # Figuur 9.17 pag. 258 bespreken.<br /> Kaartjes:<br /> # Vergelijk DNase footprinting met gel mobility shift. Zijn er specifieke voordelen van de ene techniek tov. de andere.<br /> # Figuur 9.18a pag 259 bespreken.</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Microbiologie&diff=3828 2024-01-25T09:29:16Z

<p>R0857325: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Microbiologie wordt tegenwoordig in het tweede jaar gegeven. Vroeger was dit het derde jaar. Ook verhuisd van tweede naar eerste semester. Wordt gevolgd door studenten biologie en biochemie. Gedoceerd door Prof. Joris Winderickx. Normaal mondeling examen, wegens COVID toch schriftelijk. Practicum wordt geëvalueerd via een één verslag over al de practicumsessies.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===25 januari 2024===<br /> #(A)Bacteriën delen door binaire splijting. Wat weet je over het divisoom? Hoe vindt de cel het centrum? (B) Welke parameters kan men afleiden uit een groei curve? /5<br /> #Leg de stikstofcyclus uit en meer specifiek nitrificatie. (.../5)<br /> #Verklaar volgende termen: (.../4)<br /> #*latente virale infectie<br /> #*HxNy(influenza)<br /> #*mutualisme<br /> #*O-antigen<br /> #*amphixenose<br /> #*Crabtree-effect<br /> === 12 januari 2024 ===<br /> #Bacteriën kunnen zich verweren tegen virale infecties dmv restrictie-modificatie systeem en het CRISPR-Cas mechanisme, leg beide mechanismen uit. (.../5)<br /> #Leg de stikstofcyclus uit en meer specifiek stikstoffixatie. (.../5)<br /> #Verklaar volgende termen: (.../4)<br /> #*MIC<br /> #*Anthropozoönose<br /> #*Pasteur-effect<br /> #*Persistente virale infectie<br /> #*Mesodiaminopimelinezuur<br /> #*Syntrofie<br /> #*Cirri<br /> #*Peplomeren<br /> <br /> ===21 augustus 2023===<br /> # Wat weet je over mega- of reuzevirussen? (Giant viruses) Tip: je moet uit meerdere hoofdstukken iets geven<br /> # Bespreek de celwand van gram+ en gram- bacteriën en van Archaea. Teken zeker de polysaccharideketens. Welke Bacteria en Archaea bezitten geen celwand? <br /> # Begrippen: anammox, viraal tegument, hydrogenosoom (+reactie), H1N1 (influenza), evolutionaire chronometers, glycocalyx, commensalisme, anthroponose<br /> <br /> === 24 Januari 2023 ===<br /> (A) Bacteriën kunnen zich verweren tegen virale infecties dmv restrictie-modificatie systeem en het CRISPR-Cas mechanisme, leg beide mechanismen uit. (B) Welke invloed heeft dit op het ecosysteem? /5<br /> <br /> Detoxificatiemechanismen van zuurstof bij micro-organismen. /5<br /> <br /> verklaar volgende termen en geef het verband/verschil:<br /> *MIC en fenolcoëffiënt<br /> *Fimbriae en cirri<br /> *commensalisme en mutualisme<br /> *virulente virussen en getemperde virussen<br /> *watercoëfficiënt en compatable solute<br /> *Nitrificatie en anammox<br /> *anaerobe respiratie en fermentatie<br /> *Zoönose en anthroponose<br /> <br /> === 13 Januari 2023 ===<br /> #(A)Bacteriën delen door binaire splijting. Wat weet je over het divisoom? Hoe vindt de cel het centrum? (B) Welke parameters kan men afleiden uit een groei curve? /5<br /> #Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te maken dan een antiviraal middel? Gegeven dat het een RNA-Virus is, op welke doelwitten zou een antiviraal middel kunnen inwerken? Hoe kan je testen of je antiviraal middel effectief is? /5<br /> <br /> #verklaar volgende termen:<br /> #*cilia<br /> #*amensalisme<br /> #*hydrogenosoom(+reactie)<br /> #*MIC<br /> #*Wateractiviteit<br /> #*amphixenose<br /> #*Viroide<br /> #*persistente infectie<br /> <br /> === 25 Januari 2022 ===<br /> <br /> Hoe worden micro-organismen resistent? Welke mechanismen zorgen ervoor dat ze resistent zijn? Hoe wordt dit overgedragen? Is dit species-specifiek? /5<br /> <br /> Bespreek de bouw en werking/functie van prokaryote flagellen (Gram neg., gram pos. en Archaea). Vergelijk ook met eukaryote flagella. Bespreek fototaxis en verklaar hoe dit voordeel geeft in een ecosysteem. /5<br /> <br /> Stelling juist/fout + verklaar /4<br /> <br /> *Geen enkele bacterie (Bacteria + Archaea) kan leven zonder celwand <br /> <br /> *Een hydrogenosoom komt voor bij prokaryoten en oxideert pyruvaat tot AcCoA.<br /> <br /> *Decimale reductietijd neemt af bij toenemende verhittingstemperatuur <br /> <br /> *B-lactam werkt alleen op gram+ <br /> <br /> *Bij een persistente infectie wordt de gastheercel vernietigd.<br /> <br /> *Stikstoffixatie komt vooral voor in anoxygene condities <br /> <br /> *Chemolithotrofen halen hun energie uit fermentatie met substraatfosforylatie<br /> <br /> *Cyanobacteriën hebben phycobillisomen voor optimale lichtcaptatie<br /> <br /> === 17 januari 2022 ===<br /> #Leg de Baltimore-classificatie schematisch uit en verklaar op basis van wat deze gebaseerd werd. Hoe zou je een antiviraal middel maken voor Hepadnavirussen en op welke processen zou dit kunnen inwerken? Hoe kan je testen of dit middel effectief is?<br /> #Vergelijk de celwand van Archaea en grampositieve bacteriën door een gedetailleerde tekening te geven van de polysaccharideketen. Geef verschillende methodes om deze organismen van elkaar te scheiden.<br /> #Begrippen: Leg ze apart uit en geef gelijkenissen en verschillen. <br /> #*anammox - denitrificatie<br /> #*cirri - fimbrae<br /> #*fermentatie - anaerobe respiratie<br /> #*persistente infectie - latente infectie<br /> <br /> === 21 augustus 2021 ===<br /> #Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te maken dan een antiviraal middel? Waar bij een RNA-virus zou een antiviraal middel inwerken? Hoe kan je testen of je antiviraal middel effectief is?<br /> #Vergelijk de celwand van Gram negatief en positief aan de hand van tekeningen, vergelijk ook met celwand van eukaryoten en archaea. Hoe kan je Gram positief en Gram negatief onderscheiden, geef verschillende methodes.<br /> #Begrippen<br /> #*amensalisme - commensalisme<br /> #*wateractiviteit<br /> #*cycloheximide<br /> #*teichoïnezuur<br /> #*persistente en latente infectie<br /> #*MIC en fenolcoëfficient<br /> #*Cirri<br /> #*hydrogenosoom<br /> <br /> === 15 januari 2021 NM ===<br /> #Bespreek de bouw en inplanting van bacteriële flagella. Vergelijk ook met eukaryote flagella en cirri. Bespreek chemotaxis.<br /> #Welk is het belangrijke enzyme voor stikstoffixatie? Andere vormen van stikstof (zoals ammoniak) zijn zeer belangrijk, verklaar.<br /> #Verklaar en leg de verschillen/gelijkenissen uit:<br /> #*mesofiel - pathogeen<br /> #*guilde - gemeenschap<br /> #*retrovirus - hepadnavirus<br /> #*chemo-organotrofe anaerobe respiratie - fermentatie<br /> #*hydrogenosomen - mitochondriën<br /> #*antisepsis - desinfecteren<br /> #*mutualisme - protocoöperatie <br /> #* generatietijd - delingsefficiëntie <br /> === 11 januari 2021 NM ===<br /> #<br /> #Detoxificatie van micro-organismen<br /> #a) Leg het verschil in celwandstructuur tussen Gram-positieve en Gram-negatieve bacteriën uit en op welk principe berust de Gram-kleuring. b)Leg kort de celwand bij archaea en eukaryoten uit. c)Welke andere manieren, naast Gram-kleuring, zijn er om Gram-positieve en Gram-negatieve bacteriën van elkaar te onderscheiden?<br /> #Verklaar en leg de verschillen/gelijkenissen uit:<br /> #*guilde - gemeenschap<br /> #*retrovirussen - hepadnavirussen<br /> #*amensalisme - commensalisme<br /> #*chemo-organotrofe anaerobe respiratie - fermentatie<br /> #*generatietijd - delingsefficientie<br /> #*hydrogenosomen - mitochondriën<br /> #*antisepsis - desinfecteren<br /> #*nog 1tje<br /> <br /> === 17 augustus 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te ontwikkelen dan een antifungaal en een antiviraal middel? Gegeven dat het een RNA-virus is op welke processen/enzymen kan een antiviraal middel inwerken? b) Hoe kan je gemakkelijk testen of een middel tegen fagen effectief is?<br /> #a) Wat is de structuur, inplanting en werking/functie van prokaryote flagella en aanverwante structuren? Wat is het verschil met eukaryote flagella en aanverwante structuren en leg het principe van chemotaxis uit. b) Leg bondig phototaxis uit. <br /> #Begrippen <br /> #*Eclipsperiode<br /> #*Tegument<br /> #*viroïde<br /> #*Evolutionaire chronometers<br /> #*Griseofulin<br /> #*Mechanisme voor CO2 fixatie door de acetyl CoA pathway<br /> #*Peplomeren<br /> #*Quinolones<br /> <br /> === 20 januari 2020 NM ===<br /> #<br /> # Bespreek structuur en functie van flagella. Geef gelijkaardige structuren tussen gram-positieve en gram-negatieve [[Bacteria]]. Geef gelijkaardige structuren bij ''Archaea'' en eukaryoten. <br /> # Over resistentie, wat de mechanismen zijn, of dat species specifiek of aspecifiek is. Alternatieve therapieën tegen resistentie....<br /> #Begrippen:<br /> #*PFU en CFU<br /> #*Ammencialisme en commensialisme<br /> #*aw<br /> #*Cirri<br /> #*Teichoïnezuur<br /> #*MIC en fenolcoëfficient<br /> #*cycloheximide<br /> #*nog eentje<br /> <br /> === 17 januari 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Geef de functie en structuur van prokaryote flagel. Is er een verschil tussen grampositieve en gramnegatieve bacteria flagel? Geef ook analoge structuren. b) Geef minstens 3 andere methoden om grampositieve van de gramnegatieve bacteriën te scheiden (niet via gramkleuring). Hoe kan men in een waterstaal archaea, bacteria &amp; eukarya onderscheiden?<br /> #a) Detoxificatie van giftige zuurstof molecule. b) Welke rol zuurstof en gebonden stikstof componenten (zoals ammoniak) een invloed hebben op de stikstofcyclus?<br /> #Stellingen<br /> #*S-lagen zorgen voor vasthechting van de cel<br /> #*Cephalosporine werkt in op translatie<br /> #*&quot;Naakte&quot; en &quot;Envelopped&quot; virussen worden op dezelfde manier vrijgezet<br /> #*Viroïde is de niet infectieve vorm van een virus<br /> #*In hydrogenosoom zitten hydrogenasen<br /> #*Phycolisomen zijn enkel bij cyanobacteriën te vinden<br /> #*en nog 2 andere<br /> <br /> === 14 januari 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Influenza: verklaar HxNx, antigene shift, antigene drift. In welke Baltimore klasse bevindt influenza zich? b) waarop kunnen antivirale middelen inwerken? geef ook voorbeelden. Hoe zou jij te werk gaan om een nieuw antiviraal middel te maken?<br /> #Vergelijk celwand archae, gramnegatieve en grampositieve (structuren allemaal kunnen tekenen). ZIjn er zonder celwand, zo ja welke? Welke manieren zijn er naast gramkleuring om gramnegatieve en grampositieve van elkaar te onderscheiden? Hoe zou je in een waterstaal Archae, bacteria en eukarya onderscheiden van elkaar (zo min mogelijke stappen)<br /> #Begrippen<br /> #*syntorfie<br /> #*viroide<br /> #*evolutionaire chronometers<br /> #*streptomycines<br /> #*endo- en exotoxine<br /> #*anammoxoom<br /> #*Hydrogenesoom<br /> #<br /> <br /> === 13 januari 2020 NM ===<br /> <br /> #VRAGEN<br /> 1. antibiotica alles uitleggen hoe resistentie opbouwen, species specifiek? <br /> 2. Antifungale drugs voor membraansynthese en proteinsyntheseninhibitie + hoe bepaal je of een drug fungistatisch is?<br /> 3. Wat zijn biogeochemische cycli en leg dit uit adhv de N cyclus, geef alles + verklaar anammox reactie en stikstoffixatie<br /> <br /> #BEGRIPPEN<br /> <br /> Wateractiviteit<br /> Profaag<br /> Anammoxosoom<br /> Chlorosoom<br /> Stickland reactie<br /> Persistente infectie<br /> Endotoxine<br /> Surfactant<br /> <br /> ===5 september 2019===<br /> #<br /> # a) Influenza: verklaar HxNx, antigene shift, antigene shift. In welke Baltimore klasse bevindt influenza zich? b) waarop kunnen antivirale middelen inwerken? geef ook voorbeelden. Hoe zou jij te werk gaan om een nieuw antiviraal middel te maken en te TESTEN? <br /> #Geef een schematische voorstelling van de anoxygene fotosynthese van purperbacteriën en groenzwavelbacteriën, alsook de oxygene fotosynthese van cyanobacteriën. Bespreek de voornaamse verschillen, inclusief morfologische kenmerken, en plaats dit in een algemeen microbieel ecologische context.<br /> #Begrippen<br /> #*cilia<br /> #*viroide<br /> #*profaag<br /> #*persistente infectie<br /> #*wateractiviteit<br /> #*tegument<br /> #*MIC<br /> #*amensalisme<br /> <br /> ===14 januari 2019===<br /> #<br /> #*Hoe worden micro-organismen resistent? Welke mechanismen zorgen ervoor dat resistent zijn? Hoe wordt dit overgedragen? Welke van deze manieren zijn species-specifiek en welke species-aspecifiek?<br /> #*Je hebt een bodemstaal met micro-organismen, hoe ga je na dat deze micro-organismen een fungistatische werking hebben? + leg uit micro-organismen die groeien in het labo en micro-organismen laten groeien die niet in het labo kunnen groeien. Leg kort uit.<br /> #Leg uit HxNx, antigene drift en shift, waarom kan dit laatste zo snel gebeuren bij het influenzavirus? Tot welke klasse van Baltimore behoort Influenza. Geef het schema van de Baltimore classificatie en leg de principes uit.<br /> #Begrippen<br /> #*Syntrofie<br /> #*Evolutionaire chronometers<br /> #*Hydrogenosoom (+ reacties)<br /> #*Streptomycine<br /> #*Heterotroof<br /> #*Annamox<br /> #*Viroïde<br /> #*Endo- en exotoxines<br /> <br /> ===21 augustus 2018===<br /> #Je krijgt een waterstaal, hoe weet je welke GEKENDE micro-organismen hier inzitten waarvan je een metabool product wil onderzoeken. Hoe kan je testen dat dit een fungicide is?<br /> #Bespreek flagellen bij pro- en eukaryoten en leg chemotaxis uit<br /> #begrippen<br /> #*Surfactant<br /> #*tegument<br /> #*bacilli<br /> #*hydrogenosoom<br /> #*wateractiviteit<br /> #*phycobillisoom<br /> #*hopanoïde<br /> #*nog eentje maar ben ik vergeten<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> #Wat is een biogeochemische cycli? Geef schematisch de stikstofcyclus en beschrijf de voornaamste processen.<br /> #Bespreek de structuur, inplanting en werking van prokaryote flagellen en aanverwante structuren als ook het mechanisme van chemotaxis. Welke verschillen zijn er met een eukaryote flagel?<br /> #Begrippen: axiaal filament, griseofulin, peplomeren, quinolones, evolutionaire chronometers, mechanisme voor CO2 fixatie door de acetyl CoA pathway, viroïde, hopanoïde<br /> <br /> ===22 januari 2018 VM===<br /> #Leg uit: biogeochemische cycli. Geef schematisch de stikstofcyclus weer en bespreek de belangrijkste reacties. <br /> #Je krijgt een bodemstaal waaruit je onbekende micro-organismen moet identificeren, hierin zit een organisme dat metabole producten maakt die antifungicidaal werken, deze kunnen dienen voor een nieuw middel. Hoe ga je (zo efficiënt mogelijk) te werk?<br /> #begrippen: PFU en CFU, MIC en fenolcoëfficiënt, latente en persistente infectie, cirri, Aw, cycloheximide, commensalisme en ammensalisme en teichoïnezuur<br /> <br /> ===19 januari 2018===<br /> #Bespreek de structuur, werking en inplanting van bacteriële flagellen (met tekening). Wat is het mechanisme van chemotaxis? Wat zijn de verschillen met eukaryote flagellen.<br /> #Welke detoxificatiemechanismen zijn er van toxische zuurstof. Geef de enzymen en hun reacties. Hij wilt ook dat je een extra voorbeeld geeft. Wat is het belang van zuurstof in een microbiële ecosysteem.<br /> #8 termen: cycloheximide, sulfonilamide, aw, lysozymen, amensalisme, phycobiline, acetyl-CoA pathway en hepadnavirus<br /> <br /> ===15 januari 2018===<br /> #Bespreek kort de oxygene en anoxygene fotosynthese van micro-organismen en hun reducerend vermogen. Leg fermentaties van micro-organismen uit, hoe wordt hiermee energie gewonnen? /5<br /> #A)Waarvoor staat HxNx? B) Leg de Baltimore-classificatie uit. Welke types virussen hebben eigen polymerasen? C) weet ik niet meer, maar ook iets met virussen /5<br /> #8 stellingen, per juist antwoord 0,5 1)cyloheximine werkt niet op gramnnegatieve bacteriën 2)antibiotica-resistentie wordt aspecies-specifiek doorgegeven en voornamelijk via transductie 3)een guilde is een groep van klonaal verwante cellen 4)bij een peristenta infectie komen viruspartikels niet vrij en blijft de gastheer leven 5)bij amensalisme hebben beide partners altijd een voordeel 6)bij een hydrogenosoom wordt ATP geproduceerd via hydrolyse en H+ 7)een virion reffereert naar de extrcellulaire vorm van een virus 8)ben ik vergeten /4<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM===<br /> #bespreek de structuur en werking van de flagel bij bacteriële cellen + bespreek chemotaxis<br /> #detoxificatie van zuurstof<br /> #8 stelling juist/fout + verklaar<br /> #*gramnegatieve bachteriën zijn niet gevoelig voor beta-lactam ring <br /> #*antibiotica-resistentie is species-specifiek<br /> #*decimale reductietijd neemt af bij toenemende verhittingstemperatuur<br /> #*hydrogenosomen bij prokaryoten halen hun energie uit de oxidatie van pyruvaat<br /> #*stikstoffixatie komt vooral voor in anoxygene condities<br /> #*persistentie infectie van viruspartikels vernietigd de gastheercel<br /> #*geen enkele bacterie (Bacteria + Archaea) kan leven zonder celwand<br /> #*energiewinst bij fermentatie komt altijd van substraatfosforylatie<br /> <br /> ===23 januari 2017 NM===<br /> #bespreek hoe het kleine virale genoom toch een volledige functie qua replicatie en assemblage van een virus kan veroorzaken. geef voorbeelden en leg uit<br /> #virussen zijn niet altijd negatief. Bespreek en geef een voorbeeld ivm humaan microbioom<br /> #je hebt een bodemstaal met micro-organismen, hoe ga je na dat deze micro-organismen een fungistatische werking hebben? + leg uit micro-organismen die groeien in het labo en micro-organismen laten groeien die niet in het labo kunnen groeien.<br /> #vancomycine slaat niet aan, welke combinatie is het beste? keuze uit: vancomycine + cycloheximide/amphotericini/isoniazide/sulfanilamide<br /> #leg verschil en gelijkenis uit + bespreek<br /> #*mesofiel-pathogeen<br /> #*antiseptica-desinfectans<br /> #*fermentatie-chemoorganotroof anaeroobe respiratie<br /> #*chemoorganotroof-chemolithotroof<br /> #*generatietijd-delingscoefficient<br /> #*sporecortex-bacteriele celwand<br /> #*guilde-gemeenschap<br /> #*commensalisme-amensalisme<br /> <br /> ===23 januari 2017 VM===<br /> #bespreek de celwand bij gram - en gram + bacteriën en archaea. geef een manier om bacteria, archaea en eukaryoten te scheiden. geef minstens 3 manieren hoe je gram + en gram - bacteriën kan onderscheiden (zonder gram kleuring) <br /> #afbeelding cel met onderdelen aangeduid (celwand, 50S,...) geef voorbeelden van antibiotica die hier op inwerken en leg hun werking uit.<br /> #8 juist of fout vragen<br /> <br /> ===26 januari 2016===<br /> #Gegeven een tekening van een virtuele cel van een micro-organisme (aangeduid: DNA synthese, RNA synthese, mitotische spoelfiguur en microtubuli, celwand, plasmamembraan, translatie, foliumzuursynthese). Geef alle antimicrobiële middelen die erbij horen. Bespreek de mechanismen van de antimicrobiële middelen bij een verschillende manier van inwerking. <br /> #Flagellen pro-en eukaryoten (ook tekenen!). Welke andere bewegingsvormen ken je nog? Leg taxis uit. <br /> #Leg uit en bespreek de gelijkenissen en/of verschillen:<br /> #*halofielen - osmiofielen<br /> #*autotroof - heterotroof<br /> #*bacteriële celwand - sporeprotoplast<br /> #*chemoorganotroof - ...<br /> #*chemoorganofiel - ...<br /> #*chemooragnofiel anaeroobe respiratie - ...<br /> #* ...<br /> <br /> ===22 januari 2015===<br /> #Flagellen en cirri bij pro- en eukaryoten, bespreek chemo- en fototaxis.<br /> #Detoxificatiemechanismen<br /> #Acht stellingen, juist/niet juist en waarom (ieder op 0,5 punt)<br /> #*B-lactam werkt alleen op gram +<br /> #*Resistentie is species-specifiek<br /> #*Decimale reductietijd daalt altijd bij hogere T<br /> #*Bij fermentatie vindt de energiewinning altijd plaats door substraatfosforylatie<br /> #*Bacteria en Archaea kunnen nooit leven zonder celwand<br /> #*Stikstoffixatie is vooral anoxisch<br /> #*Hydrogenosomen komen voor bij prokaryoten waar ze pyruvaat oxideren tot -<br /> #*en nog een die ik me niet meer herinner.<br /> <br /> ===27 januari 2015===<br /> #verschil oxygene en anoxygene fototrofie + energie bij fermentatie<br /> #welke manieren van voortbeweging, verschil in pro en eukaryoten, (sex)pili, welk competitief voordeel?<br /> #juist/fout vragen<br /> <br /> ===19 januari 2015 (NM)===<br /> #Mechanismen van restentie en resistentie overdracht. Is resistentie speciesspecifiek? Methoden voor het post-antibioticatijdperk.<br /> #Photosynthese bij purperbacterien, groenzwavelbacteren en cyanobacterien schematisch tekenen en verschillen uitleggen. Linken met morfologie en ecologie. <br /> #8 juist-fout vraagjes<br /> #*Gram-negatieve bactierien zijn vatbaar voor ampicilline en amoxicilline.<br /> #*Ergosterolsynthese is geen goede target voor antifungale drugs.<br /> #*Bij een latente infectie komen er geen virusgenen tot expressie en komen er geen virussen vrij.<br /> #*Het nitrogenasecomplex werkt vooral in anoxische omstandigheden<br /> #*Een hydrogenosoom komt voor bij prokaryoten en oxideert pyruvaat tot AcCoA.<br /> #*...<br /> <br /> <br /> ===19 januari 2015 (VM)===<br /> #koolstofcyclus schematisch tekenen en alle metabole processen uitleggen (reacties zijn niet zo belangrijk)<br /> #Wat is de beste combinatie en slechtste combinatie? flucytosine + polyeen, griseofuline en polyeen, vancomycine en polyeen, en er was dan nog eentje maar die weet ik niet meer <br /> #woordjes uitleggen: <br /> #*exosporium <br /> #*evolutionaire chronometers <br /> #*omgekeerde citroencyclus<br /> #*...<br /> <br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> #Virussen zijn gekenmerkt door een klein genoom. Toch hebben ze alles om te voorzien in hun replicatie. Verklaar aan de hand van enkele voorbeelden. Sommige virussen hebben echter ook eigen polymerase enzymes nodig, identificeer hen aan de hand van de baltimore classificatie.<br /> #Je wordt gevraagd onbekende micro-organismen uit een staal water te identificeren; welke technieken gebruik je en hoe ga je te werk om te kijken of sommigen de mogelijkheid bezitten tot de productie van een fungistatisch middel om het te commercialiseren.<br /> #O2 kan giftig zijn; geef de detoxificatiemechanismen die micro-organismen bezitten om dit te bestrijden<br /> <br /> ===21 januari 2014===<br /> #de koolstofcyclus en metabole processen <br /> #detoxificatie mechanisme van zuurstofderivaten die door metabole processen geproduceerd worden en dan ne fungus bestrijden met een combinatie. <br /> #combinaties werden gegeven allemaal met myconazol: uitleggen welk het beste werkte en welk het minst.<br /> <br /> === 20 jan 2014 (namiddag) ===<br /> #koolstofcyclus<br /> #mechanismen van detoxificatie<br /> #patient is besmet met Candida, een syntetische azool werkt niet goed. Welke antibiotica mengeling is de beste? Gegeven = telkens een syntetische azool in combinatie met flucytosine, griseofulin, vancomycine, en nog 1 dat ik niet meer weet<br /> <br /> ===20 januari 2014 voormiddag===<br /> #antibioticaresistentie: hoe, verschillende mechanisme, hoe krijgen we dat in het lichaam<br /> #fungistatische drugs in natuurlijke bodem, hoe herkennen en er uit halen<br /> #virussen: verklaar HxNx, antigendrift en antigenenschift en waarom gaat antigenenschift zo gemakkelijk en baltimoreklassen van influenza + verklaren<br /> #woordjes<br /> #*hopanoide (hier moet ge dat dan vergelijken met sterol in eukaryoten enzo)<br /> #*hydrosoom<br /> #*viroiden<br /> #*endotoxine<br /> <br /> === 31 jan 2012 (voormiddag) ===<br /> # Geef de koolstofcyclus en leg kort alle processen uit die hierin voorkomen. (mondeling)<br /> # Een schema van een cel waarop verschillende delen aangeduid stonden (celwand, membraan, DNA+RNA-synthese, 50S ribosoon-subunit, 30 S ribosoom-subunit). Geef bij elk deel de antibiotica die hierop inwerken en leg, als er meerdere antibiotica bij bij één passen, hun actiemechanismen uit.<br /> # Verklaar:<br /> #* Fenol-coëfficiënt methode<br /> #* Virion<br /> #* Rolling-circle replicatie<br /> #* O-anitgen<br /> #* Fermentatiebalans<br /> #* Anamoxosoom<br /> #* Decimale Reductietijd<br /> #* Hopanoïde<br /> <br /> === 26 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Anoxigene fotosynthese bij purperbacterien en oxygene bij cyanobacteriën: Een schets geven en vergelijken.<br /> # Celwandstructuur bij bacteria(grampos en gram negatief)en archaea bespreken en vergelijken. En met welke techniek zou je deze kunnen onderscheiden<br /> # Een patiënt met een bacteriële infectie werd behandeld met chloramphenicol maar dit was niet erg werkzaam. Men zou kunnen combineren met vancomycine, tetracycline en cephalosporine. Wat gaat het minst werkzaam zijn? en welk het meeste?<br /> <br /> === 25 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Wat is metagenomics, wat kun je met deze techniek doen en beschrijf de voordelen aan de hand van een creatief (zelfverzonnen)voorbeeld<br /> # Stikstoffixatie: Bespreek en wat heeft zuurstof hiermee te maken?<br /> # Geef de biochemische werkingsmechanismen van: quinolones, aminoglycosiden, synthetische azolen en sulfonamides<br /> <br /> === 17 jan 2011 (namiddag) ===<br /> <br /> # Wat is metagenomics, wat kun je met deze techniek doen en beschrijf de voordelen aan de hand van een creatief (zelfverzonnen)voorbeeld<br /> # nitrificatie, denitrificatie en stikstoffixatie zijn belangrijke processen. Bespreek bondig de reacties en plaats in de stikstofcyclus. Wat heeft zuurstof hiermee te maken?<br /> # vergelijk de opbouw van de celwand van gram positieve en negatieve bacteriën met behulp van een schema, hoe zou je eenvoudig een onderscheid kunnen maken?<br /> <br /> === 21 jan 2010 ===<br /> # Geef de schematische voorstelling van de anoxigene fotosynthese bij purperbacteriën en de oxigene fotosynthese bij cyanobacteriën. Bespreek verschillen, incl. morfologische kenmerken en plaats dit in een algemeen microbiële context.<br /> # Hoe weet je of een medicijn bacteriostatisch, bacteriolytisch, bacteriocide, fungistatisch, fungicide is. (bijvraag: hoe zou jij dat bepalen als biochemist?) Wat is MIC en hoe bepaal je dat, fenolcoëfficient bespreken. De criteria bespreken voor een medicijn, antiseptica, desinfectans.<br /> # Mexicaanse griep is van het type H1N1. Leg uit wat HxNx is en leg antigene shift en antigene drift uit. Tot welke baltimore klasse behoort influenza.(bijvraag: middelen tegen influenza)<br /> <br /> === 11 jan 2010 ===<br /> # zuurstof kan toxisch zijn voor micro-organisme. Welke reactie zorgen voor de omzetting van deze toxische zuurstof?<br /> # bespreek de biochemische werkingsmechanisme van ampiciline en cephalosporine<br /> # geef alle pathways voor C02 fixatie? (het zijn er btw 8 en geen 5 zoals de meeste denken)<br /> === 27 jan 2009 ===<br /> <br /> # Verklaar:<br /> #* Baltimore classificatie<br /> #* tegument<br /> #* psychrotolerante mesofiel<br /> #* peritrieche flagelaat<br /> # Methanotrofen en methylotrofen, geef energiewinning en koolstof assimilatie<br /> # antifungale drugs; waarom moeilijker te maken dan antibacterieel en bespreek de reactiemechanismen van <br /> === 23 jan 2009 ===<br /> # C02 fixatie<br /> # hoe ga je te werk om uit een bodemstaal 1) alle micro-organismen te identificeren 2) een fungistatisch metaboliet te zoeken<br /> # Termpjes:<br /> #* aw<br /> #* serine pathway<br /> === 23 jan 2009 ===<br /> # Een gistcultuur is geïnfecteerd met cyanobacteriën. Geef een aantal manieren om weer een zuivere gistcultuur te verkrijgen.<br /> # Juist of fout vragen:<br /> #* S-lagen<br /> #* iets over pseudopeptidoglycaan van Archaea<br /> #* phycobilines<br /> #* de manier van vrijstelling van naakte vs 'enveloped' virussen<br /> #* cephalosporine<br /> # Nitraatreductie. En bespreek deze bij E.coli en Pseudomonas stutzeri.<br /> === 16 jan 2009 ===<br /> # 5 woorden verklaren:<br /> #* cephalosporine<br /> #* phycobilisoom<br /> #* hepadnavirussen<br /> #* serine pathway<br /> #* wateractiviteit aw<br /> # Waarom is het moeilijker om antiviraal middel te vinden dan een antibacterieel?<br /> # Biogeochemische cycli en stikstof-cyclus<br /> === 15 jun 2008 ===<br /> # bespreek de acetyl coA pathway en welke organisme gebruiken deze...<br /> # glycocalyx, hydrogenosoom, wateractiviteit, mutualisme, protocooperatie uitleggen<br /> # wat zijn fylogenetische merkers, wat doen ze en geef meerdere voorbeelden en leg uit<br /> === 13 jun 2008 ===<br /> # Denitrificatie en nitrificatie + waterzuivering<br /> # Hou zou je ALLE organismen in een bodemstaal classificeren en metabolisme nagaan?<br /> # wateractiviteit + welke organismen kunnen tegen lage + oplossing<br /> # Termen:<br /> #* amensalisme<br /> #* protocoöperatie<br /> #* S.cerevisiae geïnfecteerd met groen zwavel bacteriën... hoe los je dit op<br /> #* Verschil groenzwavel- en purperbacteriën op vlak van productie reducerend vermogen<br /> #* Antibioticaresistentiemechanismen<br /> #* fermentatie...hoe energie en reducerend vermogen verzorgen<br /> #* mutualisme<br /> #* syntrofie<br /> #* verschil antiseptica en desinfectantia<br /> === 13 jun 2008 ===<br /> # acetyl coA cyclus en welke organismen deze gebruiken<br /> # voorwaarden voor goede fylogenetische merkers en enkele voorbeelden<br /> # begrippen: pleiomorfie,monomorfie,chemostaat,....<br /> === 10 jun 2008 ===<br /> # penicillines hebben geen effect op Archaea en Gram negatieve bacterien. Juist of fout, leg uit ahv biochemische werking penicilline<br /> # wat is metagenomics, voordelen en toekomstperspectieven in toegepaste microbiologie<br /> # manieren van C02 fixatie<br /> === 27 aug 2007 ===<br /> # Stel men vraagt je om een antifungaal middel te ontwikkelen tegen gistinfecties bij mensen. Op welke principes zou je dit kunnen baseren en staaf met een voorbeeld. Hoe ga je te werk om te bepalen of je product een bacteriostatische of bacteriocide werking heeft? <br /> # Bespreek bondig de anoxische fotosynthese bij purperbacterieën<br /> # Wat zijn psychrofiele organismen? Hoe zijn ze aangepast aan hun milieu? Waarin verschillen ze met psychrotolerante organismen?<br /> # Practicumvraag: Geef met behulp van een schema het verschil tussen gram-positieve en gram-negatieve bacteriën. Met welke technieken kun je beide groepen onderscheiden?<br /> === 18 jun 2007 ===<br /> # De toxische producten die vanuit zuurstof gevormd worden en hoe de cel die onschadelijk maakt.<br /> # Geef alle manieren om CO2 te fixeren.<br /> # Termen: <br /> #* chemostaat<br /> #* glycocalyx<br /> #* micronutrienten<br /> #* macronutrienten<br /> #* hydrogenosoom<br /> #* monomorfisch<br /> #* pleiomorfisch<br /> === 15 jun 2007 ===<br /> # Leg de structuur en de werking van de bacteriële flagel uit en bespreek chemotaxis.<br /> # Hoe gaat u te werk om te bepalen of een stof een bacteriostatische of bactericide werking heeft?<br /> # Vergelijk de energie en reducerend vermogen vorming bij fototrofen en fermentatie.<br /> <br /> === 11 jun 2007 ===<br /> # bespreek de vorming en structuur van endosporen, welke zijn de voordelen hiervan voor de overleving van de bacterie en hoe moeten we daar mee omgaan als we de groei van zulde organismen willen onder controle houden<br /> # ken je manieren voor incorporatie van C02, zoja welke en beschrijf bondig de pathways <br /> # stel je hebt een bodemstaal met daarin nieuwe 'ongekende' organismen, beschrijf hoe je te werk zou gaan om deze te identificeren en welke manieren je zou gebruiken voor de classificatie<br /> <br /> === 11 jun 2007 ===<br /> # Hoe onstaat resistentie tegen antibiotica bij micro-organismen? Bespreek de verschillende mechanismen van resistentie. In een post-antibiotica tijdperk, welke methoden zou je gebruiken om bacteriele infecties tegen te gaan?<br /> # Bespreek de verschillende methodes die micro-organismen hebben om zich te beschermen tegen toxische zuurstof producten (door fotochemische reacties ontstaan).<br /> # Wat zijn biogeochemische cycli? Bespreek aan de hand van een schematische voorstelling van de koolstof cyclus.</div>

R0857325 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Analytische_Biochemie&diff=3756 2024-01-19T11:16:09Z

<p>R0857325: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Vak wordt gedoceerd door Peter Dedecker. 75% van de punten staat op theorie en de overige 25% op oefeningen. Je moet slagen op het theoriegedeelte om op het vak te slagen. Vaak komen dezelfde examenvragen terug.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> === 19 januari 2024 ===<br /> === Theorie mondeling===<br /> #Een collega wil een kleurloos, niet-fluorescent eiwit tot expressie brengen in E.Coli om daarna het proteïne op te zuiveren en voor andere doeleinden te gebruiken. Het gen kan aangepast worden.<br /> a) Hoe kan je testen of het gen tot expressie komt in E.Coli? (eenvoudige manier)<br /> b) Hoe kan je het proteïne opzuiveren? Teken bij elke techniek dat je gebruikt de instrumentatie en leg uit.<br /> c) Hoe kan je de zuiverheid van het staal testen?<br /> #Lange tekst over tomografie ( niet belangrijk) beeldvorming gebeurt door absorbantie<br /> a) geef de definitie van absorbantie<br /> b) geef de wiskundige afleiding van de totale absorbantie als lichtstraal door 2 stalen gaat en je A1 en A2 kent<br /> c) geef de totale absorbantie dat door n stalen gaat waarvan je de absorbantie kent<br /> d) teken de meetopstelling en benoem, leg uit waarom je dat gebruikt + wat is de invloed als je dit weghaalt? (bijvraag: geef voorbeeld van monochromator)<br /> <br /> ===Oefeningen===<br /> # je voert IEF uit op 2 peptiden: 'VRYHEID' en 'PRACHT'<br /> a) welk peptide is welke curve? (pKa-tabel gegeven met 3-lettercode)<br /> b) peptiden worden gescheiden door anionenwisselaar met pH 7,5. Teken het chromatogram, vergeet niet de bindings-en elutieconditites.<br /> === 18 augustus 2023 ===<br /> ====Theorie====<br /> #Er wordt onderzoek gedaan naar CAD (hartaandoening) waarbij urine van een patiënt vergeleken wordt met urine van een niet-patiënt. 4 resultaten die beschrijven welke eiwitten er in het urine aanwezig waren.<br /> a) Waarom doet men dit experiment (meer dan 1 reden geven)<br /> b) Later werd bekend gemaakt dat men CE-MS heeft toegepast. Wat is CE-MS? Leg uit via eventuele schema's + opstelling geven<br /> c) Waarom gebruikt men CE en MS tegelijkertijd? Waarom niet enkel CE of enkel MS? Kunnen we dit zien op de figuur?<br /> d) Hoe kan men de eiwitten identificeren?<br /> # Van Deemter vergelijking en bandverbreding uitleggen, een elektroforesemethode geven en dan uitleggen of de Van Deemter vergelijking toegepast kan worden op elektroforese.<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> #Eiwitten van elkaar scheiden. Beschikbare methodes zijn gelfiltratie, kationenuitwisselaar, anionenuitwisselaar en HIC<br /> #Concentratie bepalen van een eiwit, volume en absorbantie zijn gegeven<br /> #Hoe kan men de zuiverheid van de fracties controleren?<br /> === 1 februari 2023 ===<br /> ====Theorie====<br /> #Je hebt een eiwit X die complexen kan vormen met andere eiwitten. Je mag ervan uitgaan dat deze stevig binden. Leg uit welke technieken je zou gebruiken om te testen of en met welke andere eiwitten dit eiwit X gaat binden.<br /> #Absorbantie<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> #Size exclusion chromatography. V0 en Vi berekenen etc.<br /> #Tris-HCl buffer<br /> <br /> === 21 januari 2023===<br /> ====Theorie====<br /> #Maak een test die antilichamen tegen een bepaald virus detecteert, een test die virale partikels detecteert. Voor beide 1 die de gewone mens zonder labo kan en 1 die in het labo gedaan kan worden<br /> <br /> #Via een meetmethode kom je een signaal S uit, hoe kan je het omzetten in een absolute concentratie? Geef 2 methodes (interne en externe standaard)<br /> ====Oefeningen====<br /> #Warme en koude stock<br /> <br /> #Na-acetaat-azijnzuurbuffer<br /> <br /> ===8 september 2022===<br /> ====Schriftelijk (CORONA)====<br /> #Phenylalanine en phenylalanine 5-D scheiding door liquid chromatography waarbij de stalen meerdere runs doen door de kolom. (Is een experiment dat letterlijk in de cursustekst staat)<br /> ##Wat is het experiment? Teken het en op welke manier wordt er opgezuiverd?<br /> ##Leg resolutie uit en de termen w en delta t en N, teken een chromatogram waar w en delta t op duidelijk gemaakt worden.<br /> ##Van Deemter vergelijking uitleggen.<br /> ##Hoe kan je volgens een ander experiment phenylalanine en phenylalanine 5-D scheiden? Leg volledig uit.<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> #2 peptides 'DENK' en 'SCHRYF' en een IEP afbeelding welke peptide is welke curve (tabel met pkA's gegeven)<br /> #Hoe zouden deze peptides zich gedragen op een anionenwisselaar<br /> <br /> ===22 januari 2022===<br /> ====Schriftelijk (CORONA)====<br /> 1. Een collega heeft een eiwitopzuivering uitgevoerd in het labo en wilt dit staal verder experimenteel gebruiken, je bent echter niet zeker van de zuiverheid van het staal. Geef een eenvoudige methode om deze zuivering te controleren en een meer gesofisticeerde methode. Bespreek hoe je te werk gaat, teken de meetopstelling(en) en benoem de onderdelen, en leg uit. (Je mag ervanuit gaan dat het eiwit dat we gezuiverd willen hebben gekend is).<br /> <br /> 2. Je beslist om een preperatieve scheiding uit te voeren van het eiwit op basis van IEP, leg uit welke methode je kiest, hoe deze werkt, en teken de opstelling en benoem alle onderdelen. Leg uit wat 'iso-elektrisch punt' betekent.<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> Een peptide werd onderzocht met massaspectrometrie. MALDI-TOF leverde drie signalen (zie figuur A). De waargenomen ionen zijn ontstaan ten gevolge van protenering (in verschillende graad) van het peptide. <br /> #Leid de Mr-waarde af van het peptide. Geef de waarde bekomen voor iedere piek en de gemiddelde waarde (5 significantie cijfers).<br /> <br /> Na trypsine behandeling van een ander pepitde ontstonden acht fragmenten. Met [M+H]+ moleculion van één van deze acht fragmenten is gekenmerkt door m/z-waarde (deze waarde krijg je) (zie figuur B). MS/MS van deze component leverde 9 Y+ c-terminale dochterionen (zie figuur C&amp;D)<br /> <br /> #Leid de aminozuursequentie van het component wetende dat de aangegeven ionen, die onstaant bij MS/MS, Y+ splitsingsproducten zijn (zie figuur). Gebruik voor identificatie van de aminozuurresidu's de molmassa's zijn gegeven (figuur E). Schrijf de aminozuursequentie met de drieletterscode. Komt dit fragment aan de N-, C-terminaal of er tussen in voor?<br /> <br /> ===14 augustus 2021===<br /> ====Schriftelijk (CORONA)====<br /> Excretie en metabolisatie analyseren<br /> a) Vanwaar halen we het staal?<br /> b) Hoe toegediende molecule x en metabolieten herkennen? Houd rekening met dat dit molecule ook natuurlijk kan voorkomen in het lichaam<br /> c) Hoe moleculaire structuur te weten komen?<br /> d) Hoe molecule X kwantificeren?<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> a) Warme en koude stockoplossing<br /> b) Radioactiviteit na 7 dagen (halfwaardetijd is gegeven)<br /> <br /> ===11 januari 2021 VM===<br /> ====Schrifterlijk (CORONA)====<br /> #Urine stalen van CAD patienten en van gezonde Patienten worden onderzocht op bepaalde eiwitten door middel van CE-MS. Er zijn 4 grafieken gegeven. Wat is CE-MS? Leg werking gedetailleerd uit en teken ze ook beiden. Waarom worden zowel CE als MS gebruikt en niet enkel CE of enkel MS? Hoe worden de eiwitten uiteindelijk geïdentificeerd?<br /> <br /> ====Oefening====<br /> #Een IEF curve van 2 peptiden zijn gegeven en de 1letter codes van de peptiden (SCHEPEN en PRACHT). Bepaal welke curve bij welk peptide hoort. (Een tabel met alle pKa's zijn gegeven).<br /> #De peptiden worden onderworpen aan een anionenwisselaar die geijkt is met een buffer met pH 7.5. Wat zijn de bindings- en elutiecondities en maak een schematische voorstelling van het chromatogram.<br /> <br /> === 22 agustus 2020 NM===<br /> ====Schriftelijk (COVID19)====<br /> #Je krijgt menselijke cellen in overvloed en de Spike Proteïne (deeltje van covid virus) dat normaal gezien aanvalt op menselijke membraan proteïnen. Zorg ervoor dat je kan identificeren op welke menselijke cellulaire proteïnen deze Spike Proteïne zal binden en zorg ervoor dat je ze kan afzonderen van de andere menselijke cellulaire proteïnen. Geef ook alle mogelijke methodes voor het identificeren van de cellulaire proteïnen die zouden binden aan de Spike Proteïne. Stel er zijn meerdere soorten cellulaire proteïnen die binden aan het Spike Proteïne, wat doe je? Teken achteraf ook alle gebruikte technieken en duid de belangrijkste delen en kenmerken aan + leg uit.<br /> <br /> ====Oefening====<br /> ''Zelfde oefening INTERNE STANDAARD met andere getallen dan Oef 6 van WZ6!''<br /> #[Mg2+] in leidingwater moet bepaald worden. De watergroep doet dit door een staal van 100mL (met gezochte[Mg2+]) 10 keer te verdunnen. hiervan wordt dan 80mL genomen en deze wordt in een halfcel gezet. de elektrode duid een potentiaal van E1=-0,0688 V aan. Dan wordt er 1mL [standaard-opl = gegeven conc die ik niet meer weet] toegevoegd aan deze 80mL, en wordt dit verplaatst naar een 2de halfcel. de elektrode duid nu op een potentiaal E2= -0,0466 V aan. <br /> #*Gegeven is de Mr van Mg = 24 g/mol en ook E° van de halfreactie Mg2+ + 2e- --&gt; Mg ; E°= +2,33V (maakt niet uit want E° van de 2 halfreacies vallen weg dus overbodige info!)<br /> #*Bereken de oorspronkelijke [Mg2+] concentratie voor de verdunning.<br /> #* Zet dit om in ppm (parts pro MILLION dus aantal gram [Mg2+] / 10^-6 mg)<br /> <br /> === 30 januari 2020 NM===<br /> ====Mondeling====<br /> #Je wilt de proteinen uit een cellysaat identificeren en gebruikt hiervoor CE-MS. Teken en duid de onderdelen aan van beide opstellingen. Waarom gebruik je zowel CE als MS? Leg uit hoe CE werkt en maak tekeningen. Leg het verschil tussen CE en klassieke chromatografie uit en het verschil tussen CE en klassieke electroforese. Welke voor en nadelen zie je? Leg uit hoe je met MS de proteinen kan identificeren. Zijn er meerdere methoden mogelijk?<br /> ====Oefeningen====<br /> #*V0, Vi berekenen, Kd berekenen + massa uit elektroforese resutaat<br /> #*Buffer maken<br /> <br /> === 24 januari 2020 NM===<br /> ====Mondeling====<br /> Je hebt een nieuw geneesmiddel ontwikkeld en je wil weten waar in een proefdier je dit terug kan vinden en wat de structuur hiervan is. Gegeven is dat het gaat om een klein organisch molecule. Hoe doe je dit en leg alle technieken die je gebruikt hebt uit en teken deze ook.<br /> ====Oefeningen====<br /> Oefening op massaspectrometrie: Relatieve molecuulmassa bepalen met behulp van Maldi-Tof en daarna met behulp van MS/MS een aminozuursequentie bepalen en zeggen of dit N-terminaal, C-terminaal of in het midden voorkomt zoals in de oefenzitting.<br /> === 23 januari 2020 NM===<br /> '''De prof was zelf niet aanwezig, de vervanger deed de mondelinge vragen'''<br /> ====Mondeling====<br /> Gegeven een afbeelding (ppt 3 d15) met verschillende vloeiprofielen van KEC en AEC en in het midden de verschillende ladingen van eiwitten in functie van pH.<br /> Gevraagd is uitleg over die afbeelding. Welke techniek het is? (IEC) Wat de techniek doet? Uitleggen hoe de techniek werkt met tekeningen etc. Ook over de Van Deemter vergelijking gevraagd met bijvraagen over HETP, Rs formules (van de les, niet de oefenzitting) etc.<br /> ====Oefeningen====<br /> #Oefening ongeveer dezelfde aan oefenzitting 10 (combinatie van alle schedingstechnieken) waarbij ze vragen 6 proteïnen te scheiden en de condities voor en na een scheiding met chromatogrammen erbij.<br /> #Simpele absorbantie oefening (via de regel van 3)<br /> <br /> === 21 januari 2020 NM===<br /> ====Mondeling ====<br /> #Geef 3 methodes om de Mr van een onbekend eiwit te vinden, teken deze ook. Hoe kan je uit deze methodes de Mr halen? (MS, SDS Page, SEC, analytische centrifugatie)<br /> ====Oefeningen====<br /> # 1) 2 peptides 'DENK' en 'SCHRYF' en een IEP afbeelding welke peptide is welke curve (tabel met pkA's gegeven)<br /> # 2) Hoe zouden deze peptides zich gedragen op een anionenwisselaar<br /> # 3) fosfaatbuffer oefening<br /> ===20 januari 2020 NM===<br /> ====Mondeling====<br /> # Je hebt een kandidaat-geneesmiddel ontdekt. Welk eiwit gaat met het molecule associëren? Teken en bespreek alle technieken die je hiervoor gaat gebruiken. Hoe ga je het eiwit identificeren? (radio-labeling, HPLC en MS. Identificatie: SDS-PAGE en/of MS)<br /> ====Oefeningen====<br /> # Warme en koude stockoplossing <br /> # Natriumacetaat/azijnzuur buffer<br /> # Radioactiviteit na 7 dagen (halfwaardetijd is gegeven)<br /> <br /> ===6 februari 2019 vM===<br /> ====Mondeling====<br /> We vermoeden dat 2 eiwitten x en y in de cel met elkaar associëren,<br /> <br /> a) Hoe kunnen we dit experimenteel bepalen. We kunnen ervan uitgaan dat ze sterk interageren. (Immuno precipatie, SDS)<br /> <br /> b) Wat verandert er als een zwakke interactie vertonen? (In vivo)<br /> <br /> c) Hoe kan men eiwit Y identificeren? (MS-Western blotting)<br /> <br /> (teken alle technieken)<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> concentratie van een waterstaal berekenen via celpotentiaal en interne standaard<br /> <br /> ===25 januari 2019 NM===<br /> ====Mondeling====<br /> Een test maken om te zien of een persoon aan een bepaalde ziekte lijd (bv. HIV). Je krijgt een staal van de patiënt met de antilichamen. Ontwerp de test, je hebt alles voorhande van antilichamen, antigenen en je kan deze modificeren om een bepaalde functionele groep te hebben (signaal uitzenden)... Zorg ervoor dat de test colorimetrisch gedetecteerd kan worden, welk apparaat hebben we hier voor nodig? Teken dit en duid de onderdelen aan, schets kort de functie van de onderdelen (fotospectrometer). Vergeet niet dat je antilichamen tegen andere antilichamen kan hebben. Zoals konijn anti-rat, kat anti-muis, ... en zo dus ook anti-homo sapiens.<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> #Een peptide werd onderzocht met massaspectrometrie. MALDI-TOF leverde twee signalen (zie figuur A). De waargenomen ionen zijn ontstaan ten gevolge van protenering (in verschillende graad) van het peptide. Na trypsine behandeling ontstonden 3 fragmenten. Met [M+H]+ moleculion van één van deze driefragmenten is gekenmerkt door m/z-waarde van 611 (zie figuur B). MS/MS van deze component leverde 4 Y+ c-terminale dochterionen (zie figuur C)<br /> #*Leid de Mr-waarde af van het peptide. Geef de waarde bekomen voor iedere piek en de gemiddelde waarde (5 significantie cijfers).<br /> #*Bepaal de Mr-waarde voor de 2 trypsine-fragmenten en vergelijk de som van deze waarden met de Mr-waarde van het intacte polypeptide. Hoe is het verschil in massa te verklaren?<br /> #*Leid de aminozuursequentie van de '611' component wetende dat de aangegeven ionen, die onstaant bij MS/MS, Y+ splitsingsproducten zijn (zie figuur). Gebruik voor identificatie van de aminozuurresidu's de molmassa's zijn gegeven. Komt dit fragment aan de N-, C-terminaal of er tussen in voor?<br /> <br /> ===25 januari 2019 VM===<br /> ====Mondeling====<br /> <br /> Leg uit: Potentiometrie, Conductometrie en Voltametrie (amperometrie met variërende potentiaal) en leg uit hoe je de concentratie bepaalt voor een analiet M+<br /> Stel dat de reactie voor M+ niet specifiek kan opgaan. Hoe kan je de concentratie bepalen? (selectieve elektrode; haal hier de pH elektrode aan)<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> Mengsel met monomere proteïnen A,B,C en D gescheiden met 2D elektroforese; Mr en pI gegeven. Geef de eigenschappen van de proteïnen, hoe ze elueren/retentie ondervinden bij gelfiltratiechromatografie en anionenuitwisselingschromatografie en een oefening over de buffers<br /> <br /> ===26 januari 2018===<br /> ====Mondeling====<br /> #Een nieuw gesneesmiddel is gevonden, dit werkt in op een eiwit, je wil testen op welk eiwit dit inspeelt. Stel dat de binding tussen eiwit en molecule stabiel is (dus komt niet los tijdens de experimenten). Hoe ga je dit eiwit vinden en hoe kan je vinden welk eiwit dit is? Schrijf uit welke stappen je onderneemt.<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> #Een peptide werd onderzocht met massaspectrometrie. MALDI-TOF leverde twee signalen (zie figuur A). De waargenomen ionen zijn ontstaan ten gevolge van protenering (in verschillende graad) van het peptide. Na trypsine behandeling ontstonden 2 fragmenten. Met [M+H]+ moleculion van één van deze twee fragmenten is gekenmerkt door m/z-waarde van 611 (zie figuur B). MS/MS van deze component leverde 4 Y+ c-terminale dochterionen (zie figuur C)<br /> #*Leid de Mr-waarde af van het peptide. Geef de waarde bekomen voor iedere piek en de gemiddelde waarde (5 significantie cijfers).<br /> #*Bepaal de Mr-waarde voor de 2 trypsine-fragmenten en vergelijk de som van deze waarden met de Mr-waarde van het intacte polypeptide. Hoe is het verschil in massa te verklaren?<br /> #*Leid de aminozuursequentie van de '611' component wetende dat de aangegeven ionen, die onstaant bij MS/MS, Y+ splitsingsproducten zijn (zie figuur). Gebruik voor identificatie van de aminozuurresidu's de molmassa's zijn gegeven. Komt dit fragment aan de N- of C-terminaal?<br /> <br /> ===25 januari 2018===<br /> ====Mondeling====<br /> #Een team van chemici heeft een organisch geneesmiddel gemaakt en ingebracht in een proefdier. Hoe ga je te werk om te achterhalen in welke vormen (moleculaire structuren) het geneesmiddel voorkomt? Bespreek de techniek(en) die je gebruikt en maak er een schema van.<br /> <br /> ====Oefeningen====<br /> #Een IEF curve van 2 peptiden zijn gegeven en de 1letter codes van de peptiden (SCHEPEN en PRACHT). Bepaal welke curve bij welk peptide hoort. (Een tabel met alle pKa's zijn gegeven).<br /> #De peptiden worden onderworpen aan een anionenwisselaar die geijkt is met een buffer met pH 7.5. Wat zijn de bindings- en elutiecondities en maak een schematische voorstelling van het chromatogram.<br /> #De buffer is een Na-fosfaatbuffer (pKa'=6.7) met pH7.5 en I=0.1mol/dm^3. Er wordt Na2HPO4*7H2O (Mr=268) en NaH2PO4*2H2O (Mr=156) gebruikt. We willen 1L buffer maken. Laat je denkwijze zien en voer alle berekeningen uit.<br /> <br /> ===24 januari 2018===<br /> <br /> ====mondeling====<br /> #Een collega heeft een eiwitopzuivering uitgevoerd in het labo en wilt dit verder experimenteel gebruiken, je bent echter niet zeker van de zuiverheid van het staal. Hoe ga je te werk om deze zuiverheid te controleren? Hoe ga je te werk als je zeer grote zekerheid wilt over de zuiverheid? Bespreek hoe je te werk gaat, teken de meetopstelling(en) en benoem de onderdelen, en leg uit.<br /> #Stel dat het eiwit uit meerdere peptideketens bestaat, hoe beïnvloed dit het resultaat bekomen uit voorgaande methode vergeleken met als het slechts uit één peptideketen bestaat?<br /> #Je beslist om een preparatieve scheiding uit te voeren van het eiwit op basis van IEP, leg uit welke methode je kiest, hoe deze werkt, en teken de opstelling en benoem alle onderdelen. (hierbij bijvragen over resolutie en theoretische platen: van deemter vergelijking uitleggen en grafieken kunnen maken)<br /> <br /> ====oefeningen====<br /> #Je wilt een ATP oplossing maken met radioactief gelabelde P, gegeven info over gewenste oplossing, de scintillatieteller, de hot stock, de cold stock, en Mr van ATP. Maak deze oplossing (dus letterlijk zoals in de oefenzitting)<br /> #Van de gemaakte oplossing gebruik je 25ml direct, en 25ml pas 7 dagen later. Halfwaardetijd van 32P is 14.3 dagen. Hoe radioactief is de gemaakte oplossing nog na deze 7 dagen?<br /> #Als buffer hierbij gebruiken we een natriumacetaat buffer. We wensen 100ml met een ionische sterkte van 0.1M. Verder nog info over Mr en dichtheid van HOAc gegeven. Bereid deze buffer.<br /> <br /> ===5 september 2017===<br /> <br /> ====mondeling====<br /> #Hoe kan je uitzoeken waar en in welke moleculaire vorm een geneesmiddel, toegediend aan een proefdier, aanwezig is. (verschillende technieken zijn nodig: radiolabeling, HPLC en massaspectometrie (zie &amp;quot;toepassing&amp;quot; bij slide analyse van biomoleculen))<br /> <br /> ====schriftelijk====<br /> #capillaire elektroforese uitleggen + theoretische platen + goede preparatieve methode? + verschil met klassieke gel elektroforese<br /> #begrippen: PET, absorptiespectrum, scintillatieteller <br /> <br /> ====oefeningen====<br /> #8 proteïnen in een mengsel scheiden met gegeven technieken <br /> #hoe zie je dat eiwitopzuivering gelukt is<br /> #oef met wet van lambert-beer<br /> <br /> ===27 januari 2017 VM===<br /> ====mondeling====<br /> #ELISA: je hebt zika antigenen, deze kan je ook modificeren (fuseren met eiwit enzo)<br /> #leg uit hoe je een test maakt tegen zika virus; hoe werkt je test; hoe wordt meetsignaal opgewekt; detectie + tekening<br /> <br /> ====schriftelijk====<br /> #eiwitten uit cel + eiwit X gebonden aan Hist-tag<br /> #* leg uit hoe je deze tag kan gebruiken om eiwit X te zuiveren<br /> #*wat als eiwit X complexen vormt met andere eiwitten en na de opzuivering (vorige vraag) de eiwitten nog steeds complexen vormen, hoe zou je dan de identiteit van de gebonden eiwitten achterhalen? Schets opstelling + leg onderdelen uit<br /> #begrippen<br /> #*vlam ionisatie detectie<br /> #*isocratische elutie<br /> #*brekingsindex detector<br /> <br /> ====oefeningen====<br /> #biureet tabel aanvullen<br /> #absorptie oefening (bepaal c) met l=1cm, A=0.2, E=10.0dl/gcm<br /> #standaardcurve en dan C bepalen van de onbekende eiwit<br /> #*Na-fosfaatbuffer met pKa=6.9, pH=7.5, I=0.1mol dm^-3<br /> #*Na2HPO4.7H20 met Mr=268.00 en NaH2PO4.2H20 met Mr=156.00<br /> #* hoe maak ik een 1l buffer?<br /> <br /> === 26 januari 2017===<br /> ====mondeling====<br /> #nagaan of er contaminatie is in een eiwitopzuivering van een collega (methode a), hoe kan je dit extra controleren? wat is het effect op de methode a als je proteïne complex uit meerder eenheden bestaat?<br /> #voeg zelf een een nieuwe preparatieve eiwitzuivering uit op basis van iso-elektrisch punt.<br /> <br /> ====schriftelijk====<br /> #absorbantie uitleggen en een tekening + uitleg geven van apparaat dat dit kan meten. <br /> #3 begrippen<br /> ##activiteitscoëfficiënt<br /> ##quadrupole mass analyzer<br /> ##...<br /> ====oefening====<br /> #massa spectrometrie (bereken de molaire massa's, geef aminozuur volgorde, n-/c-terminus,...)<br /> <br /> ===25/01/2017 nm===<br /> ====Mondeling:====<br /> - 3 manieren uitleggen om Mr van eiwit te bepalen (+ tekeningen)<br /> ====Schriftelijk: ====<br /> - grafiek gegeven, hierover vanalles van de van deemter vergelijking uitleggen + een (chromatografische) techniek tekenen en uitleggen waarbij van deemter toepasbaar is<br /> - begrippen: osmotische shock, fotonverminigvuldiger, ionische sterkte<br /> ====Oefening:====<br /> - radioactieve oplossing maken<br /> - radioactief verval berekenen <br /> - borax buffer maken<br /> <br /> ===22 augustus NM===<br /> ====Mondeling====<br /> #je wilt een eiwit opzuiveren uit een cellysaat en je doet dit met Western blotting. <br /> ##leg uit hoe western blotting werkt <br /> ##hoe kan je de aanwezigheid aantonen en hoe meet je dit? <br /> ##hoe zorg je voor een goede controle voor je kan aantonen dat dit kwantitatief een goede techniek is? <br /> ##je wilt enkel de eiwitten uit 1 specifiek celorganel (bv mitochondriën), hoe ga je hiervoor te werk?<br /> ====Schriftelijk====<br /> #grafiek van theoretische plaathoogte met 3 verschillende korrelgroottes (stationaire fase): uitleggen + waarbij gebruikt + teken een voorbeeld waarbij dit van toepassing is.<br /> #retentietijd bij chromatografie, radiografie, potentiometrie<br /> ====oefening====<br /> #op strategie: 6 proteïnen opzuiveren. Daarna ook nog absorbantie berekenen.<br /> <br /> ===16 augustus 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Cocaïne werd opgespoord door de politie via een colorimetrische test, waarom is dit een goede methode? (How a $2 Roadside Drug Test Sends InnocentPeople to Jail) <br /> #Hoe ga je te werk om cocaïne aan te tonen in een complex mengsel? (stel je hebt alle apparatuur beschikbaar) + Structuur van cocaïne is gegeven!<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #Geef 3 technieken om de Mr van proteïnen te bepalen. (geen quaternaire structuur)<br /> #Leg volgende begrippen uit: standaard additie, de wet van Lambert-Beer, nauwkeurigheid vs precisie<br /> #Oefening: 4 proteïnen in 2D gel-elekroforese<br /> ##Wat kan je zeggen over de proteïnen op basis van deze gegevens? Hoe zouden deze elueren bij SEC + tekening? <br /> ##Hoe zouden deze elueren bij IEC + tekening, en hoe zou je te werk gaan?<br /> <br /> ====Oefening ====<br /> #over buffer maken<br /> <br /> ===29 januari 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Maak een ELISA test om antilichamen tegen een virus op te sporen in een bloedstaal. Je krijgt antigenen tegen dit antilichaam, en je hebt ook de mogelijkheid om aan deze antigenen een proteïne te fuseren. Een eigenschap van het antilichaam is dat het 5 antigenen kan binden. Hoe werkt je test? Hoe wek je de detectie van de antilichamen op?<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #ICP-AES: waarvoor staat de afkorting? Schets opstelling en leg werking uit. Als er andere elementen aanwezig zijn dan het element dat je wil detecteren, is dit dan een probleem? Standaardadditie uitleggen en uitleggen hoe je hiermee een meettoestel kan ijken.<br /> #Begrippen: <br /> ##Theoretische plaat<br /> ##Referentie-elektrode<br /> ##Positron Emissie Tomografie<br /> ====Oefening====<br /> #3 proteïnen zijn gegeven<br /> #uitleg geven over IEC-kationenwisselaar en SEC<br /> #Chromatogram van kationenwisselaar geven<br /> #chromatogram van SEC geven,...<br /> <br /> ===28 januari 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Hoe kan je uitzoeken waar en in welke moleculaire vorm een geneesmiddel, toegediend aan een proefdier, aanwezig is. (verschillende technieken zijn nodig: radiolabeling, HPLC en massaspectometrie (zie &amp;quot;toepassing&amp;quot; bij slide analyse van biomoleculen))<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #hoe werkt de pH-elektrode en leg uit. Wat moet je hieraan veranderen om deze werkzaam te maken voor stof X en wat moeten we aannemen over deze stof. Als stof X de lading n+ heeft wat is dan de relatie tussen de concentratie van stof X en het potentiaalverschil.<br /> #Begrippen<br /> ##relatieve centrifugaalkracht<br /> ##osmotische shock<br /> ##activatiecoëfficiënt<br /> ====Oefening====<br /> #concentratie van eiwit berekenen uit absorptievergelijking<br /> #tabel over biureet assay aanvullen<br /> #curve opstellen waaruit je de concentratie van een onbekend eiwit kunt halen als je weet dat A= 0.44<br /> #Na-acetaat-azijnzuur buffer maken<br /> <br /> ===22 januari 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Stel zelf een massaspectrometer samen om eiwitten te identificeren. Alle onderdelen uitleggen en analysestappen uitleggen hoe je een eiwit gaat identificeren. (eigenlijk heel het hoofdstuk van massaspectrometrie)<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #Hoeveelheid metaalionen bepalen via Coulometrie, Potentiometrie en Voltammetrie + verschil uitleggen<br /> #Begrippen:<br /> ##Positieve en negatieve controle<br /> ##Holle kathode lamp<br /> ##surface plasmon resonance<br /> ====Oefening====<br /> #radioactieve oplossing maken<br /> #radioactief verval<br /> #na-acetaat-azijnzuur buffer maken<br /> <br /> ===21 januari 2016 namiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Geef 2 manieren om een eiwit op te zuiveren (je moet nagaan bij je collega of er geen contaminaties zijn van andere eiwitten). 1 manier moet heel simpel zijn en de andere wat nauwkeuriger en complex. Leg ook uit hoe IEF werkt.<br /> ====Schriftelijk====<br /> #een grafiek van theoretische plaathoogte; uitleggen en formules geven.<br /> <br /> ====schriftelijk====<br /> #definities<br /> ##extinctiecoëfficiënt<br /> ##osmotische shock<br /> ##retentietijd bij chromatografie<br /> <br /> ====oefening====<br /> #massaspectrometrie: Mr waarden zoeken (individuele pieken + gemiddelde) en dan nog eens bij de dochterionen en het bijhorende eiwit eruit halen. (mbv de 3 letterige afkortingen van de aminozuren, je krijgt enkel alfabetische letters gegeven en de massa van de aminozuren (zonder water)).<br /> <br /> ===20 januari 2016 voormiddag===<br /> ====Mondeling====<br /> #Geef minstens 3 technieken om Mr van een eiwit te bepalen. Leg uit en maak een schets.<br /> <br /> ====Schriftelijk====<br /> #vraag over redoxreactie met stof A, en spectroscopie. <br /> #Hoe je potentiaal kon vinden (Wet van Nernst). <br /> #Hoe concentratie berekenen (stelsel oplossen). <br /> #Schets van opstelling die dit kan meten.<br /> #begrippen uitleggen in voorziene ruimte: <br /> ##surface plasmon resonance<br /> ##target vinden met affiniteits chromatografie en interne/externe standaard.<br /> <br /> ====Oefening====<br /> 2 proteïne zijn gegeven (DENK en SCHRYF) en een gel van IEF (4 en 8.9 waren pI ongeveer). Welk proteïne is welke curve en waarom? (Tabel met pka's is gegeven met lettercode en afkorting van aminozuren.) Je wilt die proteïnen scheiden met anionenwisselaar bij pH 7,5. Teken bijhorende chromatogram en condities. Je wilt dit doen met 1L Na-fosfaatbuffer van pH 7,5 met pKa=6.9 en I=0,3 mol/dm. Hoe maak je deze beginnend met Na2HPO4.7H2O (Mr=...) en NaH2PO4.2H2O (Mr=...)?<br /> <br /> OPGELET: dit vak is volledig aangepast sinds academiejaar 2015-2016!</div>

R0857325