https://wiki.chemika.be/api.php?action=feedcontributions&feedformat=atom&user=R0893094 2026-07-28T08:21:59Z Gebruikersbijdragen MediaWiki 1.43.0 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Plant_Development_and_Metabolic_Regulation&diff=4962 2026-01-22T18:12:02Z

<p>R0893094: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie: Mabb]]<br /> <br /> == Vakinformatie ==<br /> Plant development and metabolic regulation<br /> <br /> ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0G45AE.htm<br /> <br /> == Examenvragen ==<br /> <br /> ===22/01/2026===<br /> <br /> Apical dominance: fill in scheme + explain (4)<br /> <br /> Lateral root formation + hormones. Do environmental factors have an influence? Use schemes (4)<br /> <br /> Shorter: (2 each)<br /> <br /> *Sweet immunity<br /> <br /> *Mechanism of N-terminal domain of EIN2 in ethylene response<br /> <br /> *RIN in tomato<br /> <br /> *Mechanism of flowering and vernalisation in wheat<br /> <br /> ===29/01/2025===<br /> <br /> Apical dominance: fill in scheme + explain<br /> <br /> Explain the formation of root hair cells<br /> <br /> Briefly discuss: wound priming (sweet immunity), CTR mutant related to ethylene, coincidence model in Ara and rice, role of fructan in barley seeds <br /> <br /> ===23/01/2025===<br /> <br /> Explain COP/DET mutant in relation to photomorphogenesis and skotomorphogenesis and explain the mechanisms in detail.<br /> <br /> Given: the picture about vasculature and with the leaf gap and sometimes leafs cut off etc -&gt; explain the context of this figure/ this figure.<br /> <br /> Briefly discuss: T6P and flowering, sugar and hormones for bud outgrowth, drought with wt, smr1 mutant and SMR1 OE, difference between elicitor and priming<br /> <br /> ===31/01/2024===<br /> <br /> Explain the formation of root hair cells<br /> <br /> Apical dominance: fill in scheme + explain<br /> <br /> Briefly discuss<br /> <br /> coincidence model in Ara and rice<br /> <br /> sweet immunity<br /> <br /> CTR mutant related to ethylene<br /> <br /> SMR1 and ratio stomata/ pavement cells<br /> <br /> ===25/01/2024===<br /> <br /> - explain COP/DET<br /> <br /> - explain figure about vasculature formation<br /> <br /> briefly discuss:<br /> <br /> a) Role of T6P during flowering<br /> <br /> b) Hormone/sugar signals for outgrowth of rose bud<br /> <br /> c) role of miR172 in floral organ identity<br /> <br /> d) drought tolerance of WT, smr1, SMR1 over expressing lines. which mechanisms are in play?<br /> <br /> ===30/08/2022===<br /> <br /> - explain the formation of root hair cells (7)<br /> <br /> -Discuss clonal analysis and average cell numbers (5)<br /> <br /> briefly discuss: (8, 2 each)<br /> <br /> a) ABCE floral system<br /> <br /> b) Sweet immunity<br /> <br /> c) BHP role in root cells fate<br /> <br /> d) what happens when QC cells get Lazer ablated? and how can we visualise that?<br /> <br /> ===03/02/2022===<br /> COP/DET<br /> <br /> Roothair formation, positioning, growth<br /> <br /> Smaller questions:<br /> a)coincidence model<br /> <br /> b)Give 3 shoot apical meristem mutants and the phenotype<br /> <br /> c)sweet immunity<br /> <br /> d)Influence of miRNA and sugar on stress and development. Role of SPL and DELLA.<br /> <br /> ===22 januari 2021===<br /> COP/DET en mutanten die hielpen bij dit te onderzoeken<br /> <br /> regulation G1/S and S/M transition.<br /> <br /> Small questions <br /> a)Sweet immunity <br /> <br /> b)hoe kan je invertase enzym activiteit bepalen in een plant extract<br /> <br /> c)Wox figure explain<br /> <br /> ===22 januari 2021===<br /> wortelhaarvorming uitleggen<br /> <br /> COP/DET<br /> <br /> a) sweet immunity<br /> <br /> b)de rol van suikers &amp; mirna in maturatie van plant <br /> <br /> c)hoe kan je invertase enzym activiteit bepalen in een plant extract<br /> <br /> ===17/01/2019===<br /> COP/DET<br /> <br /> regulation G1/S and S/M transition.<br /> <br /> Explain briefly: <br /> a) sweet priming<br /> <br /> b) polarity in Fucus<br /> <br /> c) explain the figure: WOX<br /> <br /> ===17/01/2019===<br /> Apical dominance: fill in scheme + explain<br /> <br /> roothair formation<br /> <br /> Smaller questions:<br /> a) coincidence model in Ara and rice<br /> <br /> b) sweet immunity<br /> <br /> c) influence of miRNA and sugar on stress and development</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Advanced_biochemistry_and_biotechnology&diff=4896 2026-01-16T09:46:10Z

<p>R0893094: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie: Mabb]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Verdiepend vervolg op Moleculaire Biologie en Dynamische Biochemie van de 2e bachelor. <br /> Voor 2009-2010 door Prof M. De Ley en J. Robben. Van 2010 - 2021 gedoceerd door J. Robben. Vanaf 2019-2020 is dit vak van naam veranderd, het heet nu Advanced Biochemistry and biotechnology. In 2021 - 2022 gedoceerd door Prof Johan Robben en Shehab Ismail. Vanaf 2023-2024 wordt het vak volledig gedoceerd door Shehab Ismail. <br /> <br /> Het examen is opgebouwd uit 2 delen. Een deel over een paper en een deel open vragen en definities.<br /> <br /> <br /> &amp;quot;De studenten hebben mij iets heel handig gegeven om na te gaan welke examenvragen ik de laatste jaren gesteld heb, ze houden het beter bij als ik zelf.&amp;quot; <br /> -- Quote Johan Robben, 2014<br /> <br /> ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/n/G0G74AN.htm<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===15 januari 2026===<br /> Research paper: Paper about mad2 and mad3 mRNA decay during mitosis in yeast.<br /> * Approximate half-life using a graph and also calculate the degradation constant.<br /> * Why did they use Pulse chase mechanism (was explained in the question) instead of heat-sensitive yeast?<br /> * Why did they use Dhhp1 mutants and what can you conclude from that experiment?<br /> <br /> Answer the following questions (half a page, but you can write more if you want):<br /> * How is miRNA produced from pri-miRNA. Give the key steps, involved proteins and compartments<br /> * Attenuation of trp operon transcription in E.coli<br /> * PROTAC + give the advantages compared to small molecule inhibitors<br /> * Nonsense-mediated decay<br /> <br /> Answer these questions (also half a page, but you can write more if you want):<br /> * Oncohistones: why do they cause cancer, give mechanisms not related to PTMs.<br /> * Chaperone mediated autophagy<br /> * Give the 3 steps of CRISPR-Cas immunity<br /> * CRISPR can overlook a few not-correct bonded nucleotides so can cause off-target mutagenesis. How can you increase specificity of CRISPR?<br /> * How can you discover aptamers when binding to a molecule of interest?<br /> <br /> ===24 januari 2025===<br /> Research paper:<br /> Questions about the G1 to S phase transition. Focus was on the phosphorylation of SIC1 by the G1 cyclin-CDK1 complex to activate S cyclin-CDK and on the different subunits of a cullin ring E3 ligase complex and how they interact.<br /> <br /> Answer the following questions:<br /> * Exercise with half-life of protein, total protein at steady state is 10,2 femtogram, kdeg is given, in a steady state. Calculate how many time is needed to degrade 5,1 and synthesize new 5,1. There are 10 mRNAs in the cell, calculate the translation rate per mRNA.<br /> * CRISPR can overlook a few not-correct bonded nucleotides so can cause off-target mutagenesis. How can you increase specificity of CRISPR? <br /> * What is the influence of codon-dependent translational elongation on the half-life of mRNA? <br /> Concisely discuss:<br /> * Biogenesis of miRNA from pri-miRNA transcript to mature miRNA.<br /> * Mechanisms of the activation of transcription initiation in prokaryotes.<br /> * Oncohistones: why do they cause cancer, give mechanisms not related to PTMs.<br /> <br /> ===16 januari 2025===<br /> Research paper:<br /> Question about Hif-1α and VHL and their roles in hypoxia.<br /> * Gel with VHL and Hif-1α in hypoxia and normoxia. What can you conclude?<br /> * Gel with VHL, Hif-1α and compound X. What is the role of compound X?<br /> * Another gel which I forgot.<br /> * Gel with mutated Hif-1α. What conclusions can you draw here?<br /> * Can you give a summary of / total conclusion from this experiment?<br /> Answer the following questions:<br /> * Exercise with half-life of protein, total protein at steady state is 10,2 femtogram, kdeg is given, in a steady state. Calculate how many time is needed to degrade 5,1 and synthesize new 5,1. And calculate synthesis rate constant. There is 10 mRNA in the cell.<br /> * CRISPR can overlook a few not-correct bonded nucleotides so can cause off-target mutagenesis. How can you increase specificity of CRISPR? <br /> * Nonsense mediated decay<br /> * Why do some protein have longer lifetime than others?<br /> Answere these questions<br /> * Mechanisms of prokaryotic transcription activation<br /> * miRNA target mRNA. How do they do this? Give different target sites on mRNA? (or something like this)<br /> * maybe some other questions which i forgot :(<br /> <br /> ===20 augustus 2024===<br /> Research paper: SAR genes mad2 and mad3 were examined because little is known about them. (12/40)<br /> * Determine the half lifetime of mad2 and mad3 (read from graph). <br /> * Why did the researchers not use temperature-sensitive methods? <br /> * Why did they add cycloheximide (CHX)? <br /> * Why did they also use Dhhp1 mutants? What can you conclude from this experiment?<br /> Small questions (15/40)<br /> * Translational coupling<br /> * PROTAC + give the advantages compared to small molecule inhibitors<br /> * Nonsense-mediated decay<br /> * Chaperone mediated autophagy<br /> * Attenuation of trp operon transcription in E.coli <br /> Answer these questions (13/40)<br /> * CRISPR can overlook a few not-correct bonded nucleotides so can cause off-target mutagenesis. How can you increase specificity of CRISPR? <br /> * Describe how histone mutations, that are not post translational modification mutations, can cause cancer. <br /> * Ago (=argonaute) is shown to increase the specificity of miRNA to its target RNA up to a fold of 300. How does the argonaute increase the specificity between its miRNA and the target mRNA?<br /> * One more question which i forgot :/<br /> <br /> ===26 januari 2024===<br /> Research paper: A proteasome without USP14 was found, do study with ubiquitinated cyclinB and non-ubi cyclinB showed different bands when in mixture with proteasome, proteasome+USP14, proteasome+USP14+IU1. (12/40)<br /> *In lanes 5 and 6 (Proteasome+USP14) we can see a lower molecular weight compared to lanes 2 and 3 (Proteasome without USP14), explain why. <br /> *In lane 3 we see no more band compared to lane 6, explain why. <br /> *In the lane with non-ubi cyclinB we always see a band, why? <br /> *What function do you think that IU1 has? <br /> <br /> Small questions (15/40) <br /> *Attenuation of trp operon transcription in E.coli <br /> *How can you discover aptamers when binding to a molecule of interest? <br /> *Issues with using siRNA <br /> *Chaperone mediated autophagy<br /> *Genetic code flexibility <br /> <br /> Answer these questions (13/40) <br /> *Exercise with half-life of protein, total protein is 4,2, kdeg is given, in a steady state. Calculate how many time is needed to degrade 2,1 and synthesize new 2,1. <br /> *CRISPR can overlook a few not-correct bonded nucleotides so can cause off-target mutagenesis. How can you increase specificity of CRISPR? <br /> *What is the influence of codon-dependent translational elongation on the half-life of mRNA? <br /> *1 more question<br /> <br /> ===18 januari 2024===<br /> Research paper: SAR genes mad2 and mad3 were examined because little is known about them. (12/40)<br /> * Determine the half lifetime of mad2 and mad3 (read from graph). <br /> * Why did the researchers not use temperature-sensitive methods? <br /> * Why did they add cycloheximide (CHX)? <br /> * Why did they also use Dhhp1 mutants? What can you conclude from this experiment? <br /> Small questions (15/40)<br /> * Translational coupling<br /> * Mechanisms of prokaryotic transcription activation<br /> * PROTAC + give the advantages compared to small molecule inhibitors<br /> * Nonsense-mediated decay<br /> * Types of miRNA targets<br /> Answer these questions (13/40)<br /> * CRISPR allows for gene editing, but sometimes mutations are allowed that cause non-specific targeting. Describe a way in which you can enhance the specificity of CRISPR-Cas9. <br /> * Describe how histone mutations, that are not post translational modification mutations, can cause cancer. <br /> * What are the properties of proteins that affect their lifetime?<br /> * eIF2-GDP is recycled back to reproduce the ternary complex to start translation initiation. eIF2B can be inhibited by phosphorylation of eIF2 by eIF2alpha. Phosphorylation increases affinity of eIF2 to eIF2B. How does this inhibit translation initiation? <br /> ===19 januari 2023===<br /> J. Robben's deel<br /> #mRNA cap van expressieregulatie. (5)<br /> #Begrippen: Translational coupling, Genomic imprinting, Nonsense suppression, RNA turnover analysis (5)<br /> <br /> S. Ismail's deel<br /> #Grote vraag (6)<br /> #* Vraagstuk over deletion Ups14 uit proteasome en dan een SDS-PAGE gedaan en visualisatie met een Western blot. 3 verschillende toestanden (Ups14 weg, + WT, + catalytic inactive Usp14) op 3 verschillende tijdspunten.<br /> #*Verklaar de resultaten van het experiment<br /> #Kleinere vraag<br /> #* RNA interference: 2 ssRNA (sense &amp; antisense) and 1 dsRNA --&gt; he changed conclusion and you had to find the mistake &amp; in C.elegans also effect seen in offspring, how possible? (4)<br /> #Kleine vraagjes<br /> #* PROTAC uitleggen (3)<br /> #* 3 fasen CRISPR-interference in bacteria (3)<br /> #* different endocytosis (2)<br /> #* 2 names for miRNA expression analysis (2)<br /> <br /> ===30 augustus 2022===<br /> J. Robben's deel<br /> #5’ UTR en cap van expressieregulatie bij eukaryoten. (5)<br /> #Begrippen: Translational coupling, RNA editing, Rip: regulated intramembrane proteolysis &amp; exosome (5)<br /> <br /> S. Ismail's deel<br /> #Grote vraag (6)<br /> #* Vraagstuk waarin er 6 verschillende tubes waren die een andere inhoud hadden. Hierop werd een northern blot gedaan en je kreeg een foto van de bekomen gel hiervan. Elke 1ste tube bevatte een pri-miRNA, elke tweede tube een pri-miRNA + microprocessor complex. De eerste pri-miRNA had een stemloop van 35 bp, een tweede met een 35 bp +1 en een derde met 35 bp + 3. Van elke tube werden de bandjes op de gel weergegeven.<br /> #*Verklaar de resultaten van het experiment<br /> #*Uit wat bestaat het microprocessor complex?<br /> #*Geef een andere naam voor het microprocessor complex.<br /> #Kleinere vraagjes<br /> #* The two-signal membrane binding model bij meristoylation - uitleggen wat dit inhoudt (4)<br /> #* Geef de factoren die de stabiliteit van proteïnen kunnen beïnvloeden - leg 1 uit. (4)<br /> #Kleine vraagjes<br /> #* 3 fasen tot komen van CRISPR-Cas systeem in bacteria (2)<br /> #* Verschillende manieren van lysosomale degradatie (2)<br /> #* Verschil in mechanisme van HECT en RING - E3 (2)<br /> <br /> ===28 januari 2022===<br /> J. Robben's deel<br /> #5’ UTR van expressieregulatie bij prokaryoten. (5)<br /> #Begrippen: DNA acetylation, RNA editing, eIF4-binding proteïne &amp; NMD (5)<br /> <br /> S. Ismail's deel<br /> #Kleine vragen (6)<br /> #* Geef 2 voorbeelden van small interfering RNA.<br /> #* Geef een detectietechniek voor je miRNA of interest.<br /> #* Foto van goed opgevouwen proteïne en minder goed opgevouwen proteïne. Welke heeft de langste half-time?<br /> #* Functie E3.<br /> #* Geef 3 soorten lipid modifications.<br /> #* Geef 1 functie van CRISPR in bacteriën<br /> #Uitleggen hoe je van pri-miRNA tot mature miRNA geraakt. (4)<br /> <br /> ===20 januari 2022===<br /> J. Robben's deel<br /> #Bespreek op welke wijze(n) de poly(A)-staart van mRNA fungeert in eukaryote expressie regulatie. (5)<br /> #Begrippen: Selenocysteine, Translational coupling, Genomic imprinting &amp; toxin-antitoxin (5)<br /> <br /> S. Ismail's deel<br /> #Kleine vragen (6)<br /> #* Welke van de RNA duplexen (2 fotos) zal door AGO2 worden geknipt voor het maken van guide strand<br /> #* Welke is beter voor stabiele cellijn te maken: synthetische siRNA of vectorbased siRNA.<br /> #* Noem de stappen/ fasen op om tot het CRISPR-Cas system te komen.<br /> #* Noem 3 verschillende autophagie types op.<br /> #* E1, E2 en E3 zijn enzymen in de ubiquitinylatie pathway. Wat doet E1?<br /> #* Wat is het 2e aminozuur waaraan de myristoyltie plaats vindt en waarom kan het enkel deze aminozuur zijn?<br /> #Bespreek hoe dat topologie, disorderd protein en protein-protein interacties de stabiliteit beïnvloeden. (4)<br /> <br /> ===22 januari 2021===<br /> #Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress? (= ERAD en UPR)<br /> #Experimenteel knockdown van genen adhv RNAi, geef de experimentele wijze, welke moeilijkheden kunnen optreden en hoe kan je dit voorkomen?<br /> #Begrippen<br /> #*Translationele koppeling<br /> #*Prime edditing (met Crispr)<br /> #*foto-entrainment<br /> #*selenocysteïne<br /> <br /> ===14 januari 2021 NM===<br /> #Bespreek overzichtelijk de werking en rol van lysosomen in eiwit-turnover. Vermeld een voorbeeld van een biotechnologische toepassing die gebruikt maakt van deze kennis.<br /> #Cas9 is recentelijk aangepast voor andere toepassingen dan deze van genomische &quot;schaar&quot;. Verduidelijk en concretiseer.<br /> #Begrippen<br /> #*Genomische imprinting<br /> #*RNA-editing<br /> #*RNA-induced silencing complex (RISC)<br /> #*Periodosoom<br /> <br /> ===24 januari 2020 NM===<br /> #Globale translatiemechanismen bij eukaryoten. Wanneer is dit van toepassing? Hoe kunnen genen dit ontwijken?<br /> #Op welke wijze(n) kan je RNAi experimenteel uitvoeren?<br /> #Begrippen<br /> #*Translationele koppeling <br /> #*CMA<br /> #*PAM<br /> #*Selenocysteïne<br /> <br /> === 20 januari 2020 NM===<br /> #Bespreek hoe prokaryoten genexpressie reguleren via anti-sense mechanismen.<br /> #Bespreek de N-endrule en eiwitafbraak. Vergelijk tussen eukaryoten en prokaryoten.<br /> #Begrippen<br /> #*Hfq<br /> #*RNA editing<br /> #*shRNA<br /> #*prime editing<br /> <br /> === 17 januari 2020 VM===<br /> <br /> #5’ UTR van expressieregulatie bij eukaryoten<br /> #cas9 systeem waar CRISPR is op gebaseerd en vergelijk met Argonaut<br /> #Begrippen<br /> #*attenuatie<br /> #*nonsense-mediated decay<br /> #*looped primer RT-PCR<br /> #*proteasome stress response (Rpn4 + PACE)<br /> <br /> === 25 januari 2019 NM===<br /> <br /> #Leg de regulatie van het trp-operon uit<br /> #Geef een schematisch overzicht van unfolded protein respons<br /> #Begrippen<br /> #* RITS<br /> #* Shutdown decay<br /> #* BMAL<br /> #* uORF<br /> <br /> === 18 januari 2019 NM===<br /> <br /> #3’ UTR bij eukaryoten<br /> #Experimenteel knockdown van genen adhv RNAi<br /> #Begrippen<br /> #* RNA switch<br /> #* Periodosoom<br /> #* RNA editing<br /> #* CMA<br /> <br /> === 18 januari 2019 VM===<br /> #Bespreek de structuur en werking van riboschakelaars (riboswitches). Wat weet je over hun functie? Illustreer je antwoord met voorbeelden. <br /> #Bespreek de moleculair-dynamische mechanismen die aan de basis liggen van het metabolische dag-nacht ritme bij zoogdieren. <br /> #Begrippen<br /> #* Selenocysteine<br /> #* Nonsense-mediated decay<br /> #* shRNA<br /> #* Proximity-induced autoactivation <br /> <br /> ===22 januari 2018, VM===<br /> #Geef overzicht van de regelmechanismen waarmee eukaryoten de translatie globaal (=niet eiwit specifiek) kan worden geregeld. In welke situatie is een dergelijke regeling van toepassing? Hoe ontsnappen sommige genen aan deze regeling?<br /> #Bespreek op welke wijze(n) de poly(a)-staart van mRNA fungeert in expressie regulatie. (ook iets over de lengte ervan)<br /> #Begrippen:<br /> #* Retroreulatie<br /> #* Genomische imprinting (+voorbeeld)<br /> #* Nonsense-mediated decay<br /> #*Nocturnine<br /> <br /> ===19 januari 2018, VM===<br /> #Geef de gelijkenissen en verschillen voor de expressie regulatie aan de 5'-UTR en 5'-uiteinde regio bij prokaryoten en eukaryoten.<br /> #Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress? (= ERAD en UPR)<br /> #Begrippen:<br /> #* Tac promotor (= is die gefuseerde promotor van lac operon en tac operon vanuit de werkzitting)<br /> #* Rip: regulated intramembrane proteolysis<br /> #* RITS<br /> #* foto-entrainment<br /> <br /> ===21 augustus 2017===<br /> #Controlemechanismen van mRNA bij eukaryoten. <br /> #De rol van ubiquitine ligasen in proteïne turnover <br /> #Begrippen:<br /> #*Transcriptional gene silencing<br /> #*Peptide mediated protein knockdownn<br /> #*Familial fast sleep syndrome<br /> #*Een vierde begrip<br /> <br /> ===3 februari 2017===<br /> #Verduidelijk de structuur en werking van riboswitches . Leg hun functie uit<br /> #Rol van Poly-A-staart bij regulatie van expressie<br /> #Woordjes:<br /> #*Nocturnine<br /> #*uORF<br /> #*Genetic imprinting<br /> #*Chaperone-gemedieerde autofagie<br /> <br /> ===23 januari 2017===<br /> #Globale translatie regulatie mechanisme uitleggen, wanneer is dit van toepassing en hoe ontsnappen genen eraan<br /> #Op welke wijze(n) kan je de functie en voorkomen RNAi experimenteel uitvoeren?<br /> #Bespreek kort <br /> #*Retroregulation<br /> #*Rip: regulated intramembrane proteolyse<br /> #*nonsense mediated decay<br /> #*Periodosoom <br /> <br /> <br /> ===20 januari 2017===<br /> #Welke elementen in 3'-UTR voor expressieregulatie?<br /> #Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress?<br /> #Bespreek kort:<br /> #*Attenuatie<br /> #*Hairpin silencing<br /> #*Translational recoding<br /> #*Photo-entrainment<br /> <br /> ===29 januari 2016===<br /> #UPR<br /> #Circadische clock in zoogdieren<br /> #Bespreek kort:<br /> #*hairpin silencing<br /> #*argonaut<br /> #*genomic imprinting<br /> #*riboswitch<br /> <br /> ===27 januari 2016===<br /> #Geef overzichtelijk de technieken die kunnen gebruikt worden om het voorkomen en functies van kleine RNA's te bestuderen. (Hij was precies niet geïnteresseerd in RAKE, looped primer en al die dingen... Hij zei iets over sRNA sponzen en stabiele nucleïnezuuranalogen)<br /> #Geef de werking en functie(s) van macroautophagie.<br /> #Bespreek kort:<br /> #*real-time RT-PCR<br /> #*selenocysteïne<br /> #*caspasen<br /> #*RIP.<br /> <br /> ===18 januari 2016===<br /> #Hoe knockdown van genen bekomen via experimenten met RNA interferentie? wat zijn de aandachtpunten? bijvraag: wat zou je eerder gebruiken siRNA of via vector shRNA? en wat bij de mens?<br /> #Translationele recoding wat is het en op welke manieren wordt het bereikt?<br /> #Bespreek kort:<br /> #*histonehermodellering<br /> #*shut down decay<br /> #*RNA editing<br /> #*BMAL-CLOCK<br /> <br /> ===15 januari 2016===<br /> #Globale translatie regulatie mechanisme uitleggen, wanneer is dit van toepassing (Stress enz), en hoe ontsnappen genen eraan (uORF)<br /> #Rol van ubiquitinr ligases in proteïne turnover.<br /> #Bespreek kort:<br /> #*Chromatine remoddeling<br /> #*Non stop decay<br /> #*Periodosoom<br /> #*Seed sequentie<br /> <br /> ===28 januari 2015===<br /> #Bespreek het purine katabolisme + welke afwijkingen bij de mens?<br /> #Wat weet je over Ubiquitine ligases in proteïne metabolisme?<br /> #Bespreek kort:<br /> #*RIP<br /> #*Translationele hercodering<br /> #*Exosoom<br /> #*Looped-primer RT-PCR<br /> <br /> ===september 2014 ===<br /> #Bespreek de N-endrule en eiwitafbraak. Vergelijk tussen eukaryoten en prokaryoten.<br /> #Stel een dierenexperiment met RNAi; welke methoden voor knockdown van een gen stel je voor, welke verkies je voor het maximale resultaat?<br /> #Bespreek kort:<br /> #*RIP<br /> #*Icterus<br /> #*UPR<br /> #*Nocturine<br /> <br /> ===31 januari 2014 ===<br /> #Geef de diverse regulatiemechanismes van het (chole)sterolmetabolisme. <br /> #Bespreek de invloed van ubiquitineligases op de proteïne turnover.<br /> #Bespreek kort:<br /> #*Geelzucht<br /> #*genome imprinting<br /> #*Initiator caspase <br /> #*KiaC<br /> <br /> ===29 januari 2014 ===<br /> # Bespreek overzichtelijk de mRNA kwaliteitscontrolemechanismen bij prokaryoten en eukaryoten <br /> # Geef een overzicht van de verschillende mechanismen van cel-gecontroleerde eiwitafbraak die niet via proteasomen verloopt <br /> #Bespreek kort: <br /> #*Lesch-Nyhan-syndroom<br /> #*Selenocysteine<br /> #*Calnexin-calreticuline cyclus<br /> #*Clock/BMAL1<br /> <br /> ===20 januari 2014===<br /> #Bespreek schematische de biosynthese van heem. Hoe wordt het gereguleerd? En hoe werkt heem bij de algemene genexpressie? <br /> #Bespreek &quot;unfolded protein response&quot; (UPR)? <br /> #Leg kort uit<br /> #* Trans-translatie<br /> #*RNA editering <br /> #*shRNA <br /> #*Nocturnine<br /> <br /> === 21 januari 2013 ===<br /> # Bespreek de mogelijke rol van de 5'-UTR in de posttranscriptionele expressieregultatie van prokaryoten.<br /> # Bespreek het controlemechanisme van membraaneiwitten en eiwitten vóór secretie. Welke mechanismen treden er op bij stress?<br /> # Bespreek kort:<br /> #* ALA-synthase<br /> #* transtranslatie<br /> #* Seed sequentie<br /> #* nocturnine<br /> <br /> === 15 januari 2013 ===<br /> # Bespreek de moleculaire mechanismen voor ijzerhomeostase.<br /> # Bespreek het kloksysteem van Synechococcus (cyanobacterie). bijvraag: grote verschil met zoogdieren (= eiwitklok vs gen-gereguleerd)<br /> # Bespreek kort:<br /> #* thymidylaatsynthase<br /> #* RNA editering<br /> #* chaperone gemedieerde autofagie<br /> #* argonaut<br /> <br /> === 3 februari 2012 ===<br /> # Bespreek de moleculaire mechanismen voor de overerving van expressiepatronen tijdens de celcyclus. Wat is het belang hiervan?<br /> # Bespreek de globale regulatiemechanismen bij proteasoom-afhankelijke proteolysis.<br /> # Bespreek kort:<br /> #* 5-FOA<br /> #* RNA editering<br /> #* seed sequence<br /> #* nocturnine<br /> <br /> === 17 januari 2012 ===<br /> # Bespreek de mogelijke rol van de 5'-UTR in de posttranscriptionele expressieregultatie van prokaryoten.<br /> # Bespreek de globale regulatiemechanismen bij proteasoom-afhankelijke proteolysis.<br /> # Bespreek kort: <br /> #* Thymidilaatsynthetase<br /> #* Geelzucht<br /> #* CpG eiland<br /> #* RITS<br /> <br /> === 1 september 2011 ===<br /> # Schematische beschrijving heem biosynthese + hoe wordt cellulaire homeostase van heem bereikt?<br /> # Geef overzicht van regelmechanismen waarmee bij eukaryoten de translatie globaal kan worden geregeld. In welke situaties is dergelijke regeling van toepassing? Hoe ontsnappen sommige genen aan de regeling?<br /> # Bespreek kort: <br /> #* histonmethyltransferase<br /> #* nonsense mediated decay<br /> #* photo entrainment<br /> #* shRNA<br /> <br /> === 4 februari 2011 ===<br /> # N-end rule<br /> # Moleculaire dag en nacht ritme van het metabolisme van zoogdiercellen<br /> # Bespreek kort: <br /> #* geelzucht<br /> #* selenocysteïne<br /> #* Shutdown decay (SSD)<br /> #* eIF2<br /> <br /> === 24 januari 2011 ===<br /> # Geef het belang van de 3' Untranslated region bij expressie in eukaryoten.<br /> # Leg het klok systeem van cyanobacteriën uit<br /> # Bespreek kort: <br /> #* OMP<br /> #* RNA editing<br /> #* toxine-antitoxine<br /> #* ubiquitineligase E3<br /> <br /> === 18 januari 2011 ===<br /> # Bespreek riboswitches.<br /> # Op welke wijze(n) kan je RNAi experimenteel uitvoeren?<br /> # Bespreek kort:<br /> #* allopurinol<br /> #* uORFs<br /> #* ERAD<br /> #* photo-entrainment<br /> <br /> === 29 januari 2010 ===<br /> # Geef het belang van de 3' Untranslated region bij expressie in eukaryoten.<br /> # Leg het klok systeem van cyanobacteriën uit, en de invloed op transcriptie.<br /> # Bespreek kort: <br /> #* OMP<br /> #* ERAD<br /> #* initiator caspases<br /> #* myristoylisatie<br /> === 18 januari 2010 ===<br /> # N-end rule<br /> # Moleculaire dag en nacht ritme van het metabolisme van zoogdiercellen<br /> # Bespreek kort: <br /> #* geelzucht<br /> #* selenocysteïne<br /> #* RISC<br /> #* endosomale lokalisatiesignaal<br /> <br /> ===12 januari 2010===<br /> # Bespreek de purineafbraak en de verschillende metabole stoornissen bij de mens die hiermee verband houden.<br /> # Bespreek de globale regulatie van eukaryote translatie. Hoe kunnen sommige genen aan deze regulatie ontsnappen?<br /> # Bespreek kort:<br /> #* Nocturnine<br /> #* uORFs (valt weg, want bij vraag twee zitten ook al uORFs)<br /> #* shRNA<br /> #* nuclear localisation signal<br /> <br /> ===29 januari 2009===<br /> MDL:<br /> # purinebiosynthese en regulatie<br /> # kaartjes:<br /> #* Adaptor<br /> #* Cascades, waarom?<br /> <br /> JR:<br /> # Controlemechanismen mRNA in eukaryoten<br /> # kaartjes:<br /> #* histonmethyltransferase<br /> #* RITS<br /> <br /> ===29 januari 2009===<br /> MDL: Calcium<br /> JR: N end rule<br /> <br /> ===20 januari 2009===<br /> Deley: <br /> # Afbraak van vetzuren<br /> # Kaartjes:<br /> #* GPCR<br /> #* werking van groeifactoren<br /> Robben: manieren van doorgeven van expressie patronen bij celdeling. Waarom deze regeling? (epigenetic inheritance)<br /> <br /> Nog Kaartjes:<br /> # calnexine/calreticuline cycle<br /> # Argonaut<br /> # SH2 en SH3<br /> # stimulatie van proteïnesynthese door hemine<br /> # Ubiquitine als sorteringssignaal<br /> # Thio-etherankers en thio-esterankers<br /> # shRNA<br /> # riboswitch<br /> # RITS<br /> # ARE (AU-rich element)<br /> # transition state analog (daar moest hij n-PALA hebben)<br /> # cascade, waarom?<br /> <br /> ===31 januari 2008===<br /> MDL: <br /> # Bespreek purineafbraak + storingen<br /> # kaartjes: GPCR en de tabel heel in't begin van 't eerste hoofdstuk met E.Coli, S. Cerevisiae, ...<br /> <br /> JRB: <br /> # Bespreek lysosomale afbraak<br /> # kaartjes: mRNA localizatie en non-sense mediated decay<br /> <br /> ===31 januari 2008===<br /> MDL: <br /> # Bespreek de vorming van deoxyribonucleotiden + regulatie<br /> # kaartjes: oncogenen en amidelinked ankers<br /> <br /> JRB: <br /> # Bespreek methylering van histonen en DNA en hoe deze expressie kunnen reguleren<br /> # kaartjes: eIF4E-bindend proteine en sRNA switch<br /> <br /> ===30 januari 2008===<br /> # MDL: Pyrimidinebiosynthese<br /> # JRB: Welke rol speelt poly(A) bij de vorming van proteinen (of zoiets)<br /> <br /> ===16 januari 2008===<br /> <br /> MDL:<br /> # Heem oxygenase systeem<br /> # Kaartjes:<br /> #* Amide linked myristoyl anchors<br /> #* Calcium oscillaties<br /> <br /> JR:<br /> <br /> # Bespreek de globale mechanismen van translatieregulatie.<br /> # Kaartjes:<br /> #* miRNA<br /> #* Calnexin-Calreticulin cycling<br /> <br /> ===16 januari 2008===<br /> Hoofdvragen:<br /> # op welke wijzen knockdown door RNA interferentie experimenteel kan gebruikt worden?<br /> # Deoxyribunucleotide synthese en regulatie<br /> <br /> Korte vragen:<br /> # lambda repressor<br /> # mRNA turnover<br /> # cascades<br /> # proteïnesynthese en hemine</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Advanced_Biological_Data_Analysis&diff=4389 2025-01-17T14:43:45Z

<p>R0893094: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie: Mabb]]<br /> <br /> == Vakinformatie ==<br /> Keuze-truncus vak voor master Biochemie (verplicht voor master Biologie), gegeven door Piet van den Berg, Tom Wenseleers &amp; Hans Jacquemyn. Open boek examen waar je 2 datasets moet analyseren die gelijkaardig zijn aan die van de oefenzittingen. 10/20 voor het onderdeel van PVDB &amp; TW. 10/20 voor het onderdeel van HJ.<br /> <br /> Dit werd vroeger gegeven door professors Tom Wenseleers en Hans Jacquemyn. Het examen is schriftelijk open boek, en bestaat uit het ter plekke statistisch analyseren van verschillende datasets op de computer. Hierbij staat het deel gegeven door Wenseleers en Jacquemyn elk op 10 van de 20 punten.<br /> <br /> ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0F87AE.htm<br /> <br /> == Examenvragen ==<br /> <br /> <br /> ===14 januari 2025===<br /> <br /> ====Piet van den Berg &amp; Tom Wenseleers====<br /> <br /> The brown skua (Catharacta antarctica) is a large predatory seabird that occurs in the Antarctic and subantarctic regions. The species exhibits sexual dimorphism that goes in the opposite direction than what is typically observed: females are about 5% larger than males. In this study, the researchers aimed to investigate whether there are differences in cognitive performance between the sexes of this species. To measure this, they developed a ‘string-pulling task’ in which the birds were presented with two strings, only one of which was attached to a reward. The birds were allowed to pull only one of the strings to try to obtain the reward. The entire string and the reward were visible to the birds, so it was in principle possible for them to work out which string would yield the reward. There were two conditions: a ‘parallel’ condition, in which the two strings ran in parallel next to each other, and a (more difficult) ‘crossed’ condition, where the strings crossed and so it was harder to see which string would yield the reward. They tested 11 individual birds (6 females and 5 males, individual birds are labelled in the column ‘Bird_ID’) for 16 consecutive trials in both experimental conditions (so a total of 32 trials per bird). In each trial, they recorded whether the bird pulled the string that had the reward (‘Success’ = 1) or the string without the reward (‘Success’ = 0). They randomized which string had the reward between trials.<br /> <br /> Run a data analysis in R to answer the question below. Then write your answer on the next page of this document. Make sure your answer is clear and concise, and that your conclusion is supported by the data analysis that you performed. Paste the output (tables and figures) that is needed to support your argument to this document, but don’t paste code in this file (hand in your R script separately and make sure that it is clear). Make sure that your name is in the filename of both documents!<br /> <br /> QUESTION: Are there any differences in cognitive ability between male and female birds across the different experimental conditions? <br /> <br /> Run models to answer the question above. At least include Sex and experimental Condition as predictor variables in each model (since these are explicitly relevant to the research question). Also consider models that include the interaction between these two variables and models that include Trial, but don’t include interactions between Trial and the other variables. Include the appropriate random effects structure in each model. Check for overdispersion. Base your conclusions on a proper model selection procedure. For the purpose of this exercise, there is no need to do any other model diagnosis checks. Visualize the best model with an as good as possible visual representation. Write a clear conclusion (important!).<br /> <br /> (Excel contained Bird_ID, Sex, Condition, Succes and Trial)<br /> <br /> ====Hans Jacquemyn====<br /> <br /> Data set: Epipactis.xlsx<br /> <br /> Ecological processes are central to the formation of new species. When barriers to gene flow emerge between populations (e.g. shifts in flowering time, landscape changes), there is an increased likelihood that divergent selection and local adaptation will lead to the rapid formation of ecotypes, and potentially new species. However, it is often not clear to what extent populations have diverged genetically and morphologically. This may be particularly true for the orchid genus Epipactis. This genus contains a problematical complex of taxa among which species limits are difficult to define. As a result, different authors have treated the taxonomy of Epipactis in different ways, some recognizing the different taxa as distinct species, others considering them as minor intraspecific variants. In dune habitats in Belgium, plants that closely resemble the widespread Epipactis helleborine can be regularly encountered. The precise taxonomic position of these plants, however, is not clear and currently subject to debate; some regard it as a variety of E. helleborine (E. helleborine var. neerlandica), some as a subspecies (E. helleborine subsp. neerlandica), whereas others consider it as a distinct species (E. neerlandica). In this study, 28 different morphological characters were measured for plants growing in two dune (WH2 and TY1) and two forest (MW1 and MW2) populations to investigate to what extent dune and forest ecotypes differ morphologically. These characters were related to the size of the plant (traits T1–T14), leaf characteristics (T15–T16), and floral morphology (T17–T28). <br /> <br /> 1) Investigate whether the overall morphology differs significantly between plants of the forest and dune ecotype. <br /> <br /> 2) Illustrate graphically which variables best explain variation in morphology between both ecotypes and identify the variables that most determine the morphological difference between the two ecotypes. <br /> <br /> 3) Can you notice a significant difference in overall morphology between the different populations that were sampled and did these differences depend on the ecotype? <br /> <br /> (Excel contained population, ecotype, plant and T1-28 (continuous data))<br /> <br /> ===2024===<br /> <br /> ====Piet van den Berg &amp; Tom Wenseleers====<br /> <br /> Clownfish (Amphiprion spp.) are marine fish found in reefs in the eastern Indian Ocean and the western Pacific that have symbiotic relationships with sea anemones. They live in highly socially structured harems and are aggressively territorial.<br /> <br /> In this study, the researchers were interested in understanding the aggressive behaviours of two species of clownfish: <br /> - the common clownfish (A. ocellaris) and <br /> - the orange clownfish (A. percula; variable ‘AmphiprionSpecies’ in the dataset)<br /> <br /> They observed aggressive behaviours towards unfamiliar conspecifics of the fish at 24 different territories (indicated with ‘TerritoryID’ in the dataset), which each housed one or multiple clownfish harems. The researchers presented various males and females (variable ‘Sex’) from each territory with an unfamiliar conspecific, and then counted the number of aggressive behaviours that the fish exhibited in a timeframe of 5 minutes (‘AgressionEvents’). <br /> Run a data analysis in R to answer the question below. Then write your answer on the next page of this document. Make sure your answer is clear and concise, and that your conclusion is supported by the data analysis that you performed. Paste the output (tables and figures) that is needed to support your argument to this document, but don’t paste code in this file (hand in your R script separately and make sure that it is clear). Make sure that your name is in the filename of both documents!<br />  <br /> QUESTION: How does aggression depend on species and sex?<br /> - Run models that consider all combinations of variables mentioned in the question above (including models that consider only single predictors). <br /> - Also run a model that considers the interaction. <br /> - Choose the best model. <br /> - Check for overdispersion and continue with the appropriate model. <br /> - For the purpose of this exercise, there is no need to do any other model diagnosis checks. <br /> - Visualize the best model with an as good as possible visual representation. Write a clear conclusion (important!).<br /> <br /> <br /> ====Hans Jacquemyn====<br /> <br /> Ecological processes are central to the formation of new species. When barriers to gene flow emerge between populations (e.g. shifts in flowering time, landscape changes), there is an increased likelihood that divergent selection and local adaptation will lead to the rapid formation of ecotypes, and potentially new species. However, it is often not clear to what extent populations have diverged genetically and morphologically. This may be particularly true for the orchid genus Epipactis. This genus contains a problematical complex of taxa among which species limits are difficult to define. As a result, different authors have treated the taxonomy of Epipactis in different ways, some recognizing the different taxa as distinct species, others considering them as minor intraspecific variants. In dune habitats in Belgium, plants that closely resemble the widespread Epipactis helleborine can be regularly encountered. The precise taxonomic position of these plants, however, is not clear and currently subject to debate; some regard it as a variety of E. helleborine (E. helleborine var. neerlandica), some as a subspecies (E. helleborine subsp. neerlandica), whereas others consider it as a distinct species (E. neerlandica). <br /> In this study, 28 different morphological characters were measured for plants growing in dune and forest habitats to investigate to what extent dune and forest ecotypes differ morphologically. These characters were related to the size of the plant (traits T1–T14), leaf characteristics (T15–T16), and floral morphology (T17–T28). <br /> <br /> <br /> 1) Investigate whether the overall morphology differs significantly between plants of the forest and dune ecotype and identify the variables that most determine the morphological difference between the two ecotypes. <br /> <br /> 2) Illustrate graphically which variables best explain variation in morphology between both ecotypes. <br /> <br /> 3) Can you notice a significant difference in overall morphology between the different populations that were sampled and did these differences depend on the ecotype? Illustrate your answer with the appropriate graph.<br /> <br /> ===2024===<br /> <br /> ====Piet van den Berg &amp; Tom Wenseleers====<br /> <br /> Swifts are insectivorous birds belonging to family of Apodidae. Swifts resemble swallows in both morphology and niche, but the two families are only distantly related – their similarity is due to convergent evolution. They occur on all continents and those endemic to temperate regions are typically migratory. Swifts are particularly active during twilight (when their insect prey also tend to be more active) and can ascend to high altitudes when they are foraging.<br /> <br /> In this study, the researchers wanted to know if swifts are influenced by the brightness of the moon during their foraging bouts. Specifically, they were interested to know if moon illuminance affected the altitude reached during their foraging bouts by swifts of three species: the common swift (Apus apus), the pallid swift (Apus pallidus) and the alpine swift (Tachymarptis melba). The researchers equipped the animals with sensors that allow to make rough altitude estimations. For a large number of foraging bouts, the researchers logged whether the bird reached a high altitude or not (‘high’ was defined as more than the mean plus a standard deviation of flight altitudes during the day; this is recorded under the variable “altbin” in the dataset: 1 for a high altitude and 0 for a low altitude). They also measured moon illuminance (“moon_illuminance”) during each foraging bout and included the species of the measured individual in the dataset (“species”). They had many measurements for each individual (the individual is indicated by “tag” in the dataset).<br /> Run a data analysis in R to answer the question below. Then write your answer on the next page of this document. Make sure your answer is clear and concise, and that your conclusion is supported by the data analysis that you performed. Paste the output (tables and figures) that is needed to support your argument to this document, but don’t paste code in this file (hand in your R script separately and make sure that it is clear). Make sure that your name is in the filename of both documents! Exercise <br /> QUESTION: How does moon illuminance affect flight altitude in the three species of swift?<br /> - Run models that consider all combinations of variables mentioned above (including models that consider only single predictors). <br /> <br /> - Also run a model that considers the interaction. Choose the best model. <br /> - Check for overdispersion and continue with the appropriate model. <br /> - For the purpose of this exercise, there is no need to do any other model diagnosis checks. Visualize the best model with an as good as possible visual representation. <br /> - Write a clear conclusion (important!).<br /> <br /> <br /> ====Hans Jacquemyn====<br /> <br /> Primula veris is a distylous plant species that can be found in forest and grassland habitats (Fig. 1). Populations of P. veris typically contain long-styled (L-morph) and short-styled (S-morph) plants. Due to the pronounced differences in environmental conditions (e.g. light conditions, soil moisture content) between forests and grasslands, we can expect that plants growing in these habitats display different growth characteristics. <br /> <br /> <br /> <br /> Fig. 1 Example of Primula veris growing in grassland habitat.<br /> <br /> To test this hypothesis, a large number of plant characteristics were measured:<br /> • Leaf dry mass (Leaf_dry_mass) (g)<br /> • Number of leafs (Leafs)<br /> • Number of flower stalks (Flower_stalks)<br /> • Average length of flowering stalks (Stalk_length) (cm)<br /> • Total number of flowers (Total_flowers)<br /> • Average number of flowers per flowering stalk (Average_flowers)<br /> • Leaf surface area (Leaf_surface_area) (cm²)<br /> • Leaf width (Leaf_width) (cm)<br /> • Leaf length (Leaf_length) (cm)<br /> • Number of stomata (Stomata)<br /> • Specific leaf area (SLA) : ratio of leaf area to dry mass<br /> <br /> Besides, information on the habitat (forest or grassland), morph type (short-styled (S) or long-styled (L)), and the population from which plants were sampled (Population) is provided as well. <br /> <br /> 1) Investigate whether the overall morphology differs significantly between plants from grasslands and plants in forests and whether this difference is significantly affected by morph type. <br /> <br /> 2) Which variables are most important in determining the difference in overall morphology between forest and grassland plants? <br /> <br /> Illustrate your results with the appropriate figures. Please also explain in detail why you have chosen for a particular analysis technique. <br /> <br /> <br /> <br /> <br /> <br /> <br /> ===30 januari 2023===<br /> ====Piet van den Berg &amp; Tom Wenseleers====<br /> In this study, the researchers were interested in how dominance relationships affect food sharing in the wild. In 4,549 hours of observations, they recorded all instances where there was the possibility for sharing food (potential sharing events). This was the case when one individual had food (the “possessor”) and another individual begged to obtain some of it (the “potential partner”). They recorded whether the begging behaviour resulted in the possessor sharing food with the potential partner (“Sharing” in the dataset; 1 if food was shared, 0 if not). They gave each individual an identity tag and recorded these for both individuals in each potential sharing event (“Possessor” and “PotentialPartner” in the dataset) and they also recorded their dominance ranks (“DominancePossessor” and “DominancePotentialPartner”). Most individuals were observed in multiple potential sharing events.<br /> <br /> QUESTION: How does dominance rank affect food sharing in chimpanzees? <br /> <br /> Run models with the dominance ranks of the possessor and the potential partner as predictors. Consider all combinations (both ranks separately, both together, and a model that also includes the interaction). Choose the best model. Include the appropriate random effects structure in all models that you run. Check for overdispersion and continue with the appropriate model. For the purpose of this exercise, there is no need to do any other model diagnosis checks. Visualize the best model. Write a clear conclusion (important!).<br /> <br /> ====Hans Jacquemyn====<br /> #The marsh orchid (Dactylorhiza sphagnicola) and the heat-spotted orchid (Dactylorhiza maculata) (Fig. 1) are two orchid species that are able to hybridize when they co-occur. In the Belgian Ardennes, both allopatric and sympatric populations of both orchids can be found and there are some indications that hybridization occurs in sympatric populations. In order to get better insights in the hybridization process, the morphology of a large number of plants was investigated in a large sympatric population where both species co-occurred. In total 28 morphological traits were measured (Table 1). The same characteristics were also measured for a large number of plants in allopatric populations (one for each species). The data have been summarized in two datasets. The dataset sympatric.xlsx contains all data for the sympatric population, the dataset allopatric.xlsx contains the data for the allopatric populations. <br /> #* A. Investigate whether the two species can be unequivocally distinguished based on the measured characteristics?<br /> #* B. Which traits are most important to distinguish the two species?<br /> #* C. Are there indications that hybridization has occurred in the sympatric population? How can you deduce this from your analysis? <br /> <br /> ===17 januari 2020 NM ===<br /> ====Tom Wenseleers - oral (you receive the questions in an R file)====<br /> # The provided data file contains detailed data on the survival of the passengers of the titanic (survived=0/1 for passengers that died or not) as a function of, amongst others, their age (&quot;age&quot;), their sex (&quot;sex&quot;) and the price they paid for their ticket (&quot;priceperticket&quot;).<br /> #* A. Fit a model of passenger survival in function of age, sex &amp; priceperticket with the appropriate error structure. Start with a model that takes into account all possible higher-order interaction effects and then use stepwise backward model reduction and calculate the best model based on the bayesian information criterion bic. Test for the possible presence of outliers &amp; influential observations and remove those if necessary.<br /> #* B. Make effect plots of all the predictors in your best model (on the link scale but using y axis response plot labels, using type=&quot;rescale&quot;) and interpret the results.<br /> #* C. Calculate the log(odds ratio) to survive for male passengers of average age that paid for the most expensive ticket vs those that paid for the cheapest one. Do the same for female passengers. Did the log odds of them surviving go up in proportion to the price they paid for their ticket, or was there an unfair advantage for those that paid for the most expensive one?<br /> Paste all R code + all tabular &amp; graphical output &amp; interpretation in a word document and do the same for the part of hans jacquemyn and hand it over to the assistant saved as lastname_firstname.docx &amp; lastname_firstname.r (zip these two files as lastname_firstname_exam.zip)<br /> <br /> ====Hans Jacquemyn (in a Word document)====<br /> #Orchids rely on mycorrhizal fungi to complete their life cycle. Recent research has shown that these fungi can be quite diverse and belong to different genera. Fungal communities are also likely to vary between orchid populations. Little,however, is known about the factors determining variation in fungal communities and whether this variation affects the population dynamics of orchids. It can be expected that differences in soil conditions have a significant impact on mycorrhizal communities and therefore impact on the population dynamics of the orchids. To test this hypothesis fungal communities were determined in a large number of populations of the terrestrial orchid Neottia ovata (Fig. 1). For each population a series of soil characteristics was measured and the change in population size was assessed by comparing the population size in 2003 with that in 2013. Data were collected in three separate plots in each population. The data have been summarized in two datasets, one that gives for each population the abundance (number of sequences) of all detected fungi (Neottia_fungi.xlsx), and one that gives an overview of the soil characteristics (Neottia_soil.xlsx). <br /> #* The soil characteristics that were measured are soil moisture content (moist), organic matter (OM), phosphate concentration (P), nitrate concentration (NO3) and ammonium concentration (NH4). The last file also tells you whether a population has increased (1) or decreased in size (0) between 2003 and 2013.<br /> #* A. Assess whether fungal communities vary among populations? <br /> #* B. Investigate whether variation in fungal communities can be related to soil conditions. Which soil variables have the largest effect on fungal communities?<br /> #* C. Investigate whether the observed changes in population size can be related to variation in mycorrhizal communities. <br /> <br /> ===17 januari 2020 VM ===<br /> ====Tom Wenseleers - oral (you receive the questions in an R file)====<br /> # Researchers were interested to test if queen pheromones of the honeybee, which in that species are emitted by the queen to stop the workers from reproducing, would also inhibit the reproduction of either workers or queens in the bumblebee. They hypothesized that such cross activity might be observed in the event that these compounds exploit conserved physiological pathways linked with the regulation of reproduction. To test this hypothesis, the researchers exposed bumblebee queens and bumblebee worker groups (groups of 20 workers each) to either a blank solvent-only control or a solution of honeybee queen pheromones for a period of 2 weeks. Subsequently, they dissected the queens and workers and measured the size of the largest oocyte in their ovaries to be able to test for any effects on ovary development. For each of the worker groups, these measurements were averaged over all individuals. In terms of experimental design, genetic background was controlled for by doing the experiment in a paired fashion, whereby the worker groups exposed to each replicate control and queen pheromone treatment were derived from the same source colony and similarly, the queens exposed to each replicate control and queen pheromone treatment were taken to be sisters of each other (colony or sibgroup is encoded as variable &quot;id&quot; in the dataset). In your analysis, take into account this non-independence through the inclusion of a random effect term, and use a model with the appropriate error distribution.<br /> #* Aim: Test whether honeybee queen pheromones inhibit ovary development and whether this effect is caste dependent. (cf. dataset &quot;data.csv&quot;).<br /> #* SPECIFIC QUESTIONS:<br /> #** A. Display your data using &quot;spaghetti plots&quot;, i.e. plot oocyte size in function of treatment, using two different panels for caste, and connect points that are measured from individuals from the same colony (for workers) or sib-group (for queens). Make this plot both using lattice's xyplot and ggplot2.<br /> #** B. Fit a model of oocyte size (SIZE_OOCYTE) in function of TREATMENT and CASTE, either considering a possible interaction effect between both or not, taking into account possible random effects and use a model with the appropriate error distribution. Decide which model is best based on the AIC criterion. What is the name of the type of model you fitted? (in this case a linear mixed effects model was ok, since the distribution or errors was normal: lme() or lmer())<br /> #** C. Make effect plots of the effects in your model and explain what these imply.<br /> #** D. Carry out the relevant tests for the significance of the different effects. What do these tell you? Also carry out Tukey posthoc tests to test the effect of treatment for each of the two castes. What would the conclusion have been if you would have ignored the dependency in your data (variable ID, i.e. colony or sibship)? WOuld the effect of TREATMENT have been more or less significant then and why? (just do a normal lm here)<br /> #** E. Test whether the residuals of your model conform to your assumed error distribution.<br /> <br /> ====Hans Jacquemyn (in a Word document)====<br /> #The marsh orchid (Dactylorhiza sphagnicola) and the heat-spotted orchid (Dactylorhiza maculata) (Fig. 1) are two orchid species that are able to hybridize when they co-occur. In the Belgian Ardennes, both allopatric and sympatric populations of both orchids can be found and there are some indications that hybridization occurs in sympatric populations. In order to get better insights in the hybridization process, the morphology of a large number of plants was investigated in a large sympatric population where both species co-occurred. In total 28 morphological traits were measured (Table 1). The same characteristics were also measured for a large number of plants in allopatric populations (one for each species). The data have been summarized in two datasets. The dataset sympatric.xlsx contains all data for the sympatric population, the dataset allopatric.xlsx contains the data for the allopatric populations. <br /> #*Given Vegetative traits: Plant height from soil level (cm), Number of cauline leaves, Lowermost leaf length (cm), Lowermost leaf maximum width (cm), Length of second leaf (cm), Maximum width of the second leaf (cm), Position of the second leaf greatest width (cm), Uppermost leaf length (cm), Uppermost internodium length (cm), Stem diameter under infl orescence (mm), Stem diameter above lowermost leaf (mm), Number of flowers, Inflorescence length (cm), Length of inflorescence axis between the bract insertion points of first and fifth flowers (cm)<br /> #*Given Flower traits: Bract length (cm), Bract width (cm), Ovary length (cm), Lateral sepals length (cm), Lateral sepals width (cm), Petals length (cm), Petals width (cm), Labellum length (cm), Labellum lateral lobes length from base (cm), Labellum median lobe length (cm), Labellum width (cm), Labellum median lobe width at base (cm), Spur length (cm), Spur diameter at base (cm)<br /> #* A. Investigate whether the two species can be unequivocally distinguished based on the measured characteristics?<br /> #* B. Which traits are most important to distinguish the two species?<br /> #* C. Are there indications that hybridization has occurred in the sympatric population? How can you deduce this from your analysis? Illustrate your answer with the appropriate figures and explain which analysis you have used and why.<br /> <br /> ===6 januari 2019===<br /> ====Tom Wenseleers - oral (you receive the questions in an R file)====<br /> <br /> # Researchers were interested to test if queen pheromones of the honeybee, which in that species are emitted by the queen to stop the workers from reproducing, would also inhibit the reproduction of either workers or queens in the bumblebee. They hypothesized that such cross activity might be observed in the event that these compounds exploit conserved physiological pathways linked with the regulation of reproduction. To test this hypothesis, the researchers exposed bumblebee queens and bumblebee worker groups (groups of 20 workers each) to either a blank solvent-only control or a solution of honeybee queen pheromones for a period of 2 weeks. Subsequently, they dissected the queens and workers and measured the size of the largest oocyte in their ovaries to be able to test for any effects on ovary development. For each of the worker groups, these measurements were averaged over all individuals. In terms of experimental design, genetic background was controlled for by doing the experiment in a paired fashion, whereby the worker groups exposed to each replicate control and queen pheromone treatment were derived from the same source colony and similarly, the queens exposed to each replicate control and queen pheromone treatment were taken to be sisters of each other (colony or sibgroup is encoded as variable &quot;id&quot; in the dataset). In your analysis, take into account this non-independence through the inclusion of a random effect term, and use a model with the appropriate error distribution.<br /> #* Aim: Test whether honeybee queen pheromones inhibit ovary development and whether this effect is caste dependent. (cf. dataset &quot;data.csv&quot;).<br /> #* Specific questions:<br /> #** A. Display your data using &quot;spaghetti plots&quot;, i.e. plot oocyte size in function of treatment, using two different panels for caste, and connect points that are measured from individuals from the same colony (for workers) or sib-group (for queens). Make this plot both using lattice's xyplot and ggplot2.<br /> #** B. Fit a model of oocyte size (SIZE_OOCYTE) in function of TREATMENT and CASTE, either considering a possible interaction effect between both or not, taking into account possible random effects and use a model with the appropriate error distribution. Decide which model is best based on the AIC criterion. What is the name of the type of model you fitted? (in this case a linear mixed effects model was ok, since the distribution or errors was normal: lme() or lmer())<br /> #** C. Make effect plots of the effects in your model and explain what these imply.<br /> #** D. Carry out the relevant tests for the significance of the different effects. What do these tell you? Also carry out Tukey posthoc tests to test the effect of treatment for each of the two castes. What would the conclusion have been if you would have ignored the dependency in your data (variable ID, i.e. colony or sibship)? WOuld the effect of TREATMENT have been more or less significant then and why? (just do a normal lm here)<br /> #** E. Test whether the residuals of your model conform to your assumed error distribution. (he wanted to see a histogram of the residuals)<br /> <br /> ====Hans Jacquemyn (in a Word document)====<br /> # Evolutionary theory predicts that coexistence of two closely related plant species can have a major impact on floral morphology and plant mating systems. To test this prediction, floral morphology of a large number of individuals from both allopatric and sympatric populations of Common centaury (Centaurium erythraea) and Seaside centaury (C. littorale) (Fig. 1) were investigated along the Belgian coast. For each individual seven floral traits were measured (Table 1). (Data set: Centaurium.xlsx) (Table 1: ''Floral traits measured in allopatric and sympatric populations of Centaurium erythraea en C. littorale along the Belgian coast.'' (Given traits and variables were: Total length of the flower (mm), Total Petal length (mm), Petal width (mm), Ovary length (mm), Style length (mm), Length of the anthers (mm), Level of herkogamy (mm))<br /> #* A. Investigate whether floral morphology differs significantly between flowers of Centaurium erythraea and C. littorale.<br /> #* B. Illustrate graphically which variables best explain variation in floral morphology between both species and indicate which variable most determines the difference between the two species.<br /> #* C. Can you notice a difference in floral morphology between allopatric and sympatric populations? Is this difference determined by the identity of the species? If yes, explain how and illustrate with the appropriate graph.<br /> #* D. Based on your results, can you conclude that allopatric populations can as easily discerned from sympatric populations for C. erythraea as for C. littorale? And which floral traits are best suited to discern allopatric from sympatric populations?</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Algemene_Ziekteleer&diff=4027 2024-06-12T11:53:45Z

<p>R0893094: /* 10 Juni 2024 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Pieter Gillard doceert het vak Algemene Ziekteleer. Biochemie optie verbreding volgt dit op gasthuisberg samen met farmacie. Het examen is schriftelijk.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===10 Juni 2024===<br /> # Wat is verouderen, welk effect heeft dit op de lichaamsfuncties en hoe is dit verbonden aan frailty. Geef ook de pathofysiologie van frailty.<br /> # Hoe ontstaat koorts? Wat zijn de voor- en nadelen van koorts? Is het zinvol om koorts te behandelen?<br /> # Het RAAS systeem is soms het gevolg of de oorzaak van een ziekte. Bespreek het verband met RAAS en:<br /> #* Hartsdecompensatie<br /> #* Metabole alkalose met ECV contractie<br /> #* Hyperkalemie<br /> #* Dehydratatie<br /> #* Levercirrose<br /> # Meerkeuze:<br /> ## Wat is niet waar in verband met cannabisgebruik (zelfstudieles)<br /> ## Welke van de volgende ziektes is geen overgevoeligheidsreactie:<br /> ##* Type 1 diabetes<br /> ##* Ziekte van Graves<br /> ##* Mucoviscidose<br /> ##* Allergie<br /> ##* Rheumatoid arthritis<br /> <br /> ===12 Juni 2023=== <br /> # Bespreek hyperthermie en zijn pathofysiologie en bespreek de invloed van geneesmiddelen hierop. <br /> # Bespreek de pathofysiologie en oorzaken van oedeem. <br /> # Geef het verband tussen diabetes (type 1 en/ of 2) en:<br /> #* Dehydratatie<br /> #* Metabole acidose<br /> #* Auto-immuniteit<br /> #* Obesitas<br /> #* Neuropatische pijn<br /> # Meerkeuze:<br /> ## Vraag over medication overuse headache (zelfstudieles)<br /> ## Welke is geen oorzaak van hyperkalemie<br /> ##* Nierinsufficiëntie<br /> ##* ACE inhibitor<br /> ##* Teveel mineralocorticoïden<br /> ##* Acidose<br /> ##* Insuline tekort<br /> <br /> ===23 Augustus 2022=== <br /> # Leg overgevoeligheidsreactie Type 1 en 2 uit + klinische toepassingen en voorbeelden<br /> # Leg de pathofysiologie uit van hypokalemie<br /> # Geef het verband tussen insufficiente nierwerking en:<br /> #* Hyperkalemie<br /> #* Hypocalcemie<br /> #* Oedeemvorming<br /> #* Metabole acidose<br /> #* Dehydratatie<br /> # Meerkeuze:<br /> ## Zijn oorzaken van hyperthermie behalve:<br /> ## wjetnjet meer<br /> ===17 juni 2022=== <br /> # Leg de stressreactie uit en het verband met hyperglycemie, fertiliteit en ischemisch hartlijden <br /> # Leg dehydratatie uit en bespreek de pathogenese ervan met enkele voorbeelden <br /> # Geef het verband tussen inflammatie en: <br /> #* Atherosclerose <br /> #* Kanker <br /> #* Obesitas <br /> #* Hitteslag <br /> #* neuropathische pijn <br /> # 2 meerkeuzevragen, een met en een zonder giscorrectie <br /> ===10 juni 2021===<br /> # Leg de pathofysiologie uit van koorts en hyperthermie en geef enkele belangrijke oorzaken van beiden.<br /> # Bespreek de pH, pCO2 en HCO3- bij respiratoire alkalose en respiratoire acidose en geef voor beiden enkele oorzaken. <br /> # Geef het verband tussen kanker en:<br /> #* Inflammatie<br /> #* Hypercalcemie<br /> #* Koorts<br /> #* Pijn<br /> #* Immuuntherapie<br /> # Meerkeuze vragen<br /> ## Hartfalen (hartdecompensatie) heeft te maken met...(giscorrectie, meerdere aanduiden)<br /> ##* Te kort aan aldosterone<br /> ##* Te kort aan cortisol<br /> ##* Na retentie<br /> ##* RAAS systeem<br /> ##* Iets met sympatisch zenuwstelsel<br /> ## Hyperkalemie, wat past niet in het rijtje (1 aanduiden, geen giscorrectie)<br /> ##* Insuline tekort<br /> ##* ACE inhibitoren<br /> ##* Lisdiuretica<br /> ##* Acidose <br /> ##* Nierinsufficiëntie<br /> <br /> ===11 juni 2020===<br /> # Bespreek het verband tussen inflammatie en obesitas en inflammatie en atherosclerose.<br /> # Bespreek de pathogenese en de oorzaken van oedemen.<br /> # Geneesmiddelen kunnen soms pathologieën veroorzaken, bespreek hoe dit het geval is bij volgende pathologieën:<br /> #* hypokalemie<br /> #* neuropathische pijn<br /> #* inflammatie<br /> #* hyponatremie<br /> #* hyperthermie<br /> #Meerkeuze vragen:<br /> ## Welke ziektes zijn overgevoeligheidsreacties? (giscorrectie, meerdere aanduiden)<br /> ##* Reumatoïde arthritis<br /> ##* lupus<br /> ##* mucovisidose<br /> ##* ziekte van Graves (hyperthyreoïdie)<br /> ##* diabetes type 2<br /> ## Wat is geen oorzaak van hypernatremie? (1 aanduiden, geen giscorrectie)<br /> ##* Toedienen van hypertone vloeistoffen<br /> ##* Ziekte van Adisson<br /> ##* osmotische diurese<br /> ##* diabetes insipidus<br /> ##* te lage vochtinname<br /> <br /> === 12 juni 2019 ===<br /> # Bespreek chemokines, histamine en het inflammasoom in context van de ontstekingsreactie.<br /> # Wat is de pathogenese en de oorzaak van hyperkalemie.<br /> # Bespreek endotheelschade en endotheel dysfuntie bij:<br /> #* obesitas<br /> #* type 3 overgevoeligheidsreacties<br /> #* transplant rejectie<br /> #* oedeem<br /> # Meerkeuze vragen (meerdere antwoorden kunnen juist zijn)<br /> ## Over de zelfstudieles (depressie)<br /> ## Wat hoort er bij oedeemvorming bij leverschade<br /> <br /> === 13 juni 2018 ===<br /> # Bespreek de stressrespons en het verband met hyperglycemie, metabool syndroom en hart- en vaatziekten <br /> # Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypokalemie.<br /> # Bespreek het verband tussen inflammatie en: <br /> #* koorts<br /> #* overgevoeligheidsreactie type 2<br /> #* atherosclerose<br /> #* kanker<br /> #* pijnfacilitatie<br /> # Meerkeuze<br /> ## Volgende zaken hebben te maken met oedeem behalve:<br /> ##* hartdecompensatie<br /> ##* veneuze insufficiëntie<br /> ##* nierfalen<br /> ##* levercirrose<br /> ##* neuroleptica<br /> ## Volgende zaken hebben te maken met migraine behalve:<br /> ##* activatie hypothalamus en limbisch systeem<br /> ##* inhibitie n. trigemius<br /> ##* centrale sensitisatie<br /> ##* CSD<br /> ##* CGRP<br /> <br /> === 22 augustus VM 2017 ===<br /> # Bespreek de stressreactie en breng de pathenogenese in verband mer hyperglycemie, hartdecompensatie en maagulcer<br /> # Definieer dehydratatie en bespreek de pathenogenese.<br /> # In levensbedreigende situaties reageert het lichaam soms heel extreem op enkele situaties (visieuze cirkel). Bespreek dit kort in verband met: <br /> #*Hartdecompensatie<br /> #*Ketoacidose<br /> #*SIRS<br /> #*Anafylactische shock<br /> #*Hitteslag<br /> # 3 ptn Meerkeuze:<br /> #* Volgende zaken maken komen voor bij magaline neuroleptische syndroom BEHALVE: <br /> ## Dehydratatie<br /> ## Hyperthermie<br /> ## Spierrigiditeit<br /> ## Oedeem<br /> ## Dopamineantagonisten<br /> #* Volgende inhibitoren zijn voorhanden bij de virale cyclus van HIV BEHALVE: <br /> ## Glucoinhibitoren<br /> ## ...<br /> <br /> === 14 juni VM 2017 ===<br /> #6pt Wat is het verband met kanker en inflammatie, kanker en obesitas inflammatie en obesitas.<br /> #6pt Hoe ontstaat koorts, geef enkele voorbeelden en moet koorts behandeld worden?<br /> #5pt De nieren zijn belangrijk bij verschillende pathologieën. Geef het verband met de nieren en acidose, dehydratatie, hypocalcemie, oedeem en hyperkalemie.<br /> #3pt Meerkeuze: <br /> #* Wat is niet belangrijk bij auto-immuunziekten?<br /> ## ... <br /> #* Volgende zaken helpen mee bij de pijnsensatie behalve: <br /> ## beta A vezels (= antwoord)<br /> ## nocebo <br /> ## iets van neuronen <br /> ## inflammatie<br /> <br /> ===Vragen afkomstig van Farmacie:===<br /> Examenvragen (prof. Gillard)<br /> <br /> Open vragen<br /> <br /> #Leg uit wat dehydratie is met de bijbehorende pathologieën.<br /> #Leg het verband uit tussen de stress reactie met maagulcus, hyperglycemie en hartischemie.<br /> #Bespreek de extreme reactie die optreed of de vicieuze cirkel die plaatsvindt bij anafylactische shock, SIRS, hyperthermie en hartdecompensatie.<br /> #Wat is verouderen, welk effect heeft dit op de lichaamsfuncties en hoe is dit verbonden aan frailty.<br /> #Metabole acidose high anion gap, leg de pathogenese en oorzaken uit.<br /> #Geneesmiddelen kunnen de oorzaak zijn van pathologische toestanden maar kunnen ook gebruikt worden om ze te bestrijden. Geef voor ieder onderdeel een geneesmiddelengroep die hierop inwerkt.<br /> #Hyperthermie<br /> #Hypokaliëmie<br /> #Migraine<br /> #Hyponatremie<br /> #Inflammatie<br /> #Bespreek type I en type III overgevoeligheidsreacties.<br /> #Bespreek 3 recessieve overerfbare aandoeningen.<br /> #Bespreek pathologie ivm PTH.<br /> #Bespreek migraine.<br /> #Bespreek klaring en negatieve vrij water klaring en geef klinische voorbeelden bij stoornissen.<br /> #Bespreek de gevolgen van hypokalemie die een invloed kan hebben op homeostasemechanismen.<br /> #Bespreek ontstaan en behandeling van koorts.<br /> #Wat gebeurt er met alle homeostasemechanismen bij acute nierinsufficiëntie?<br /> #Hoe ontstaat aneuploïdie.<br /> #Bespreek de acute ontstekingsreactie en hoe kunnen farmaca de reactie blokkeren?<br /> #Bespreek congenitale bijnierschorshyperplasie.<br /> #Wat weet u over de behandeling en kenmerken van dominantie overerving?<br /> #Bespreek RIA en Rlogieën die gepaard gaan met chronische nierinsufficiëntie.<br /> #Wat zijn de nadelige gevolgen van een stressreactie.<br /> #Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypocalcemie.<br /> #Bespreek oedeem in de context van leverpathologie.<br /> #Geef de mogelijke oorzaken van polyurie.<br /> #Welke homeostase mechanismen kunnen ontregeld geraken door een ontregelde diabetes mellitus en hoe?<br /> #Bespreek de acute fase reactie.<br /> #Bespreek hoofdpijn.<br /> #Wat weet u over auto-immuniteit?<br /> #Bespreek respiratoire alkalose.<br /> #Vitamine D aandoeningen. Leg uit.<br /> #Congenitale bijnierschorshyperplasie. Leg uit.<br /> #Bespreek de behandeling van hypothermie.<br /> #Bespreek de rol van glucocorticoïden bij de stressreactie.<br /> #Hitteslag:<br /> ##wat is de functie van de acute fase eiwitten?<br /> ##wat doen heat shock proteïnen, wat zijn dat?<br /> ##Verhoogde vaatpermeabiliteit, welke gevolgen?<br /> #Wat is het verband tussen de temperatuur en coagulatie vs fibrinolyse?<br /> #Bespreek hyperosmolaire dehydratie.<br /> #Wat weet je over maligne hyperthermie?<br /> #Hoe ontstaat leukocytose en wat is de basis van een verhoogde sedimentatiesnelheid van RBC.<br /> #Bespreek metabole alkalose.<br /> #Bespreek het verband tussen ziekte, veroudering en dood.<br /> #Bespreek de neurofysiologische basis van de pijnsensatie.<br /> #Bespreek het ontstaan en de gevolgen van hyperkaliëmie.<br /> #Bespreek tertiaire hyperparathyroïdie.<br /> #Wat is ouderdom, verandering van ouderdom, evolutie van doodsoorzaken en levensverwachting.<br /> #Geef 3 voorbeelden van aangeboren ongevoeligheid aan een of ander hormoon.<br /> #Hoe bereken je de vrij-water klaring en geef 2 voorbeelden van wanneer deze verhoogd is.<br /> #Leg RAST uit.<br /> #Geef de klinische gevolgen van hypercalciëmie.​<br /> #Wat is de link tussen centraal zenuwstelsel en:<br /> ##Stressreactie<br /> ##Frailty (artikel)<br /> ##Metabole alkalose<br /> ##Koorts<br /> ##Pijnsensitisatie<br /> #Bespreek de cellulaire fase van de acute ontstekingsreactie.<br /> #Bespreek alle homeostasemechanismen die een invloed hebben op de neuromusculaire excitabiliteit.<br /> #Geef de oorzaken van een gestegen plasma-calcium met een normaal of verlaagd PTH.<br /> #Bespreek oedeem bij overvulling.<br /> #Bespreek metabole acidose.<br /> #Bespreek pathogenese en oorzaken van oedeem.<br /> #Bespreek het verband tussen diabetes (type 1 of 2) en:<br /> ##dehydratatie<br /> ##auto-immuniteit<br /> ##kalium homeostase<br /> ##obesitas<br /> ##metabole acidose<br /> #Meerkeuzevragen<br /> <br /> #Wat vindt niet plaats tijdens een stress respons<br /> ##Aldosterone daling<br /> ##Stimulatie ADH secretie<br /> ##Catecholamine vrijzetting<br /> ##Stimulatie bijniercortex<br /> …<br /> #Wat is geen oorzaak van migraine?<br /> ##Centrale sensitisatie<br /> ##Activatie van trigemino<br /> ##Inflammatie<br /> ##Auto-immuun ziekte<br /> …<br /> #Welke is geen overgevoeligheidsziekte?<br /> ##Reumatoïde artritis<br /> ##Pernicieuze anemie<br /> ##Mucoviscidose<br /> …<br /> #Wat is geen factor in de oedeemvorming bij levercirrose/leverfalen<br /> ##hoog renine<br /> ##splanchnische hypotensie<br /> ##toename ECF<br /> ##laag albumine<br /> ##vasoconstrictie splanchnische vaten<br /> #Wat is geen inhiberende factor voor de pijntransmissie<br /> ##niet-nociceptieve<br /> ##µ-agonisten<br /> ##NMDA-antagonisten<br /> …<br /> #Wat is niet betrokken bij maligne syndroom (hyperthermie, oedeem, deshydratatie D2 antagonist)</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Algemene_Ziekteleer&diff=4026 2024-06-12T11:53:24Z

<p>R0893094: /* 10 Juni 2024 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Pieter Gillard doceert het vak Algemene Ziekteleer. Biochemie optie verbreding volgt dit op gasthuisberg samen met farmacie. Het examen is schriftelijk.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> ===10 Juni 2024===<br /> # Wat is verouderen, welk effect heeft dit op de lichaamsfuncties en hoe is dit verbonden aan frailty. Geef ook de pathofysiologie van frailty.<br /> # Hoe ontstaat koorts? Wat zijn de voor- en nadelen van koorts? Is het zinvol om koorts te behandelen?<br /> # Het RAAS systeem is soms het gevolg of de oorzaak van een ziekte. Bespreek het verband met RAAS en:<br /> #* Hartsdecompensatie<br /> #* Metabole alkalose met ECV contractie<br /> #* Hyperkalemie<br /> #* Dehydratatie<br /> #* Levercirose<br /> # Meerkeuze:<br /> ## Wat is niet waar in verband met cannabisgebruik (zelfstudieles)<br /> ## Welke van de volgende ziektes is geen overgevoeligheidsreactie:<br /> ##* Type 1 diabetes<br /> ##* Ziekte van Graves<br /> ##* Mucoviscidose<br /> ##* Allergie<br /> ##* Rheumatoid arthritis<br /> <br /> ===12 Juni 2023=== <br /> # Bespreek hyperthermie en zijn pathofysiologie en bespreek de invloed van geneesmiddelen hierop. <br /> # Bespreek de pathofysiologie en oorzaken van oedeem. <br /> # Geef het verband tussen diabetes (type 1 en/ of 2) en:<br /> #* Dehydratatie<br /> #* Metabole acidose<br /> #* Auto-immuniteit<br /> #* Obesitas<br /> #* Neuropatische pijn<br /> # Meerkeuze:<br /> ## Vraag over medication overuse headache (zelfstudieles)<br /> ## Welke is geen oorzaak van hyperkalemie<br /> ##* Nierinsufficiëntie<br /> ##* ACE inhibitor<br /> ##* Teveel mineralocorticoïden<br /> ##* Acidose<br /> ##* Insuline tekort<br /> <br /> ===23 Augustus 2022=== <br /> # Leg overgevoeligheidsreactie Type 1 en 2 uit + klinische toepassingen en voorbeelden<br /> # Leg de pathofysiologie uit van hypokalemie<br /> # Geef het verband tussen insufficiente nierwerking en:<br /> #* Hyperkalemie<br /> #* Hypocalcemie<br /> #* Oedeemvorming<br /> #* Metabole acidose<br /> #* Dehydratatie<br /> # Meerkeuze:<br /> ## Zijn oorzaken van hyperthermie behalve:<br /> ## wjetnjet meer<br /> ===17 juni 2022=== <br /> # Leg de stressreactie uit en het verband met hyperglycemie, fertiliteit en ischemisch hartlijden <br /> # Leg dehydratatie uit en bespreek de pathogenese ervan met enkele voorbeelden <br /> # Geef het verband tussen inflammatie en: <br /> #* Atherosclerose <br /> #* Kanker <br /> #* Obesitas <br /> #* Hitteslag <br /> #* neuropathische pijn <br /> # 2 meerkeuzevragen, een met en een zonder giscorrectie <br /> ===10 juni 2021===<br /> # Leg de pathofysiologie uit van koorts en hyperthermie en geef enkele belangrijke oorzaken van beiden.<br /> # Bespreek de pH, pCO2 en HCO3- bij respiratoire alkalose en respiratoire acidose en geef voor beiden enkele oorzaken. <br /> # Geef het verband tussen kanker en:<br /> #* Inflammatie<br /> #* Hypercalcemie<br /> #* Koorts<br /> #* Pijn<br /> #* Immuuntherapie<br /> # Meerkeuze vragen<br /> ## Hartfalen (hartdecompensatie) heeft te maken met...(giscorrectie, meerdere aanduiden)<br /> ##* Te kort aan aldosterone<br /> ##* Te kort aan cortisol<br /> ##* Na retentie<br /> ##* RAAS systeem<br /> ##* Iets met sympatisch zenuwstelsel<br /> ## Hyperkalemie, wat past niet in het rijtje (1 aanduiden, geen giscorrectie)<br /> ##* Insuline tekort<br /> ##* ACE inhibitoren<br /> ##* Lisdiuretica<br /> ##* Acidose <br /> ##* Nierinsufficiëntie<br /> <br /> ===11 juni 2020===<br /> # Bespreek het verband tussen inflammatie en obesitas en inflammatie en atherosclerose.<br /> # Bespreek de pathogenese en de oorzaken van oedemen.<br /> # Geneesmiddelen kunnen soms pathologieën veroorzaken, bespreek hoe dit het geval is bij volgende pathologieën:<br /> #* hypokalemie<br /> #* neuropathische pijn<br /> #* inflammatie<br /> #* hyponatremie<br /> #* hyperthermie<br /> #Meerkeuze vragen:<br /> ## Welke ziektes zijn overgevoeligheidsreacties? (giscorrectie, meerdere aanduiden)<br /> ##* Reumatoïde arthritis<br /> ##* lupus<br /> ##* mucovisidose<br /> ##* ziekte van Graves (hyperthyreoïdie)<br /> ##* diabetes type 2<br /> ## Wat is geen oorzaak van hypernatremie? (1 aanduiden, geen giscorrectie)<br /> ##* Toedienen van hypertone vloeistoffen<br /> ##* Ziekte van Adisson<br /> ##* osmotische diurese<br /> ##* diabetes insipidus<br /> ##* te lage vochtinname<br /> <br /> === 12 juni 2019 ===<br /> # Bespreek chemokines, histamine en het inflammasoom in context van de ontstekingsreactie.<br /> # Wat is de pathogenese en de oorzaak van hyperkalemie.<br /> # Bespreek endotheelschade en endotheel dysfuntie bij:<br /> #* obesitas<br /> #* type 3 overgevoeligheidsreacties<br /> #* transplant rejectie<br /> #* oedeem<br /> # Meerkeuze vragen (meerdere antwoorden kunnen juist zijn)<br /> ## Over de zelfstudieles (depressie)<br /> ## Wat hoort er bij oedeemvorming bij leverschade<br /> <br /> === 13 juni 2018 ===<br /> # Bespreek de stressrespons en het verband met hyperglycemie, metabool syndroom en hart- en vaatziekten <br /> # Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypokalemie.<br /> # Bespreek het verband tussen inflammatie en: <br /> #* koorts<br /> #* overgevoeligheidsreactie type 2<br /> #* atherosclerose<br /> #* kanker<br /> #* pijnfacilitatie<br /> # Meerkeuze<br /> ## Volgende zaken hebben te maken met oedeem behalve:<br /> ##* hartdecompensatie<br /> ##* veneuze insufficiëntie<br /> ##* nierfalen<br /> ##* levercirrose<br /> ##* neuroleptica<br /> ## Volgende zaken hebben te maken met migraine behalve:<br /> ##* activatie hypothalamus en limbisch systeem<br /> ##* inhibitie n. trigemius<br /> ##* centrale sensitisatie<br /> ##* CSD<br /> ##* CGRP<br /> <br /> === 22 augustus VM 2017 ===<br /> # Bespreek de stressreactie en breng de pathenogenese in verband mer hyperglycemie, hartdecompensatie en maagulcer<br /> # Definieer dehydratatie en bespreek de pathenogenese.<br /> # In levensbedreigende situaties reageert het lichaam soms heel extreem op enkele situaties (visieuze cirkel). Bespreek dit kort in verband met: <br /> #*Hartdecompensatie<br /> #*Ketoacidose<br /> #*SIRS<br /> #*Anafylactische shock<br /> #*Hitteslag<br /> # 3 ptn Meerkeuze:<br /> #* Volgende zaken maken komen voor bij magaline neuroleptische syndroom BEHALVE: <br /> ## Dehydratatie<br /> ## Hyperthermie<br /> ## Spierrigiditeit<br /> ## Oedeem<br /> ## Dopamineantagonisten<br /> #* Volgende inhibitoren zijn voorhanden bij de virale cyclus van HIV BEHALVE: <br /> ## Glucoinhibitoren<br /> ## ...<br /> <br /> === 14 juni VM 2017 ===<br /> #6pt Wat is het verband met kanker en inflammatie, kanker en obesitas inflammatie en obesitas.<br /> #6pt Hoe ontstaat koorts, geef enkele voorbeelden en moet koorts behandeld worden?<br /> #5pt De nieren zijn belangrijk bij verschillende pathologieën. Geef het verband met de nieren en acidose, dehydratatie, hypocalcemie, oedeem en hyperkalemie.<br /> #3pt Meerkeuze: <br /> #* Wat is niet belangrijk bij auto-immuunziekten?<br /> ## ... <br /> #* Volgende zaken helpen mee bij de pijnsensatie behalve: <br /> ## beta A vezels (= antwoord)<br /> ## nocebo <br /> ## iets van neuronen <br /> ## inflammatie<br /> <br /> ===Vragen afkomstig van Farmacie:===<br /> Examenvragen (prof. Gillard)<br /> <br /> Open vragen<br /> <br /> #Leg uit wat dehydratie is met de bijbehorende pathologieën.<br /> #Leg het verband uit tussen de stress reactie met maagulcus, hyperglycemie en hartischemie.<br /> #Bespreek de extreme reactie die optreed of de vicieuze cirkel die plaatsvindt bij anafylactische shock, SIRS, hyperthermie en hartdecompensatie.<br /> #Wat is verouderen, welk effect heeft dit op de lichaamsfuncties en hoe is dit verbonden aan frailty.<br /> #Metabole acidose high anion gap, leg de pathogenese en oorzaken uit.<br /> #Geneesmiddelen kunnen de oorzaak zijn van pathologische toestanden maar kunnen ook gebruikt worden om ze te bestrijden. Geef voor ieder onderdeel een geneesmiddelengroep die hierop inwerkt.<br /> #Hyperthermie<br /> #Hypokaliëmie<br /> #Migraine<br /> #Hyponatremie<br /> #Inflammatie<br /> #Bespreek type I en type III overgevoeligheidsreacties.<br /> #Bespreek 3 recessieve overerfbare aandoeningen.<br /> #Bespreek pathologie ivm PTH.<br /> #Bespreek migraine.<br /> #Bespreek klaring en negatieve vrij water klaring en geef klinische voorbeelden bij stoornissen.<br /> #Bespreek de gevolgen van hypokalemie die een invloed kan hebben op homeostasemechanismen.<br /> #Bespreek ontstaan en behandeling van koorts.<br /> #Wat gebeurt er met alle homeostasemechanismen bij acute nierinsufficiëntie?<br /> #Hoe ontstaat aneuploïdie.<br /> #Bespreek de acute ontstekingsreactie en hoe kunnen farmaca de reactie blokkeren?<br /> #Bespreek congenitale bijnierschorshyperplasie.<br /> #Wat weet u over de behandeling en kenmerken van dominantie overerving?<br /> #Bespreek RIA en Rlogieën die gepaard gaan met chronische nierinsufficiëntie.<br /> #Wat zijn de nadelige gevolgen van een stressreactie.<br /> #Bespreek de pathogenese en oorzaken van hypocalcemie.<br /> #Bespreek oedeem in de context van leverpathologie.<br /> #Geef de mogelijke oorzaken van polyurie.<br /> #Welke homeostase mechanismen kunnen ontregeld geraken door een ontregelde diabetes mellitus en hoe?<br /> #Bespreek de acute fase reactie.<br /> #Bespreek hoofdpijn.<br /> #Wat weet u over auto-immuniteit?<br /> #Bespreek respiratoire alkalose.<br /> #Vitamine D aandoeningen. Leg uit.<br /> #Congenitale bijnierschorshyperplasie. Leg uit.<br /> #Bespreek de behandeling van hypothermie.<br /> #Bespreek de rol van glucocorticoïden bij de stressreactie.<br /> #Hitteslag:<br /> ##wat is de functie van de acute fase eiwitten?<br /> ##wat doen heat shock proteïnen, wat zijn dat?<br /> ##Verhoogde vaatpermeabiliteit, welke gevolgen?<br /> #Wat is het verband tussen de temperatuur en coagulatie vs fibrinolyse?<br /> #Bespreek hyperosmolaire dehydratie.<br /> #Wat weet je over maligne hyperthermie?<br /> #Hoe ontstaat leukocytose en wat is de basis van een verhoogde sedimentatiesnelheid van RBC.<br /> #Bespreek metabole alkalose.<br /> #Bespreek het verband tussen ziekte, veroudering en dood.<br /> #Bespreek de neurofysiologische basis van de pijnsensatie.<br /> #Bespreek het ontstaan en de gevolgen van hyperkaliëmie.<br /> #Bespreek tertiaire hyperparathyroïdie.<br /> #Wat is ouderdom, verandering van ouderdom, evolutie van doodsoorzaken en levensverwachting.<br /> #Geef 3 voorbeelden van aangeboren ongevoeligheid aan een of ander hormoon.<br /> #Hoe bereken je de vrij-water klaring en geef 2 voorbeelden van wanneer deze verhoogd is.<br /> #Leg RAST uit.<br /> #Geef de klinische gevolgen van hypercalciëmie.​<br /> #Wat is de link tussen centraal zenuwstelsel en:<br /> ##Stressreactie<br /> ##Frailty (artikel)<br /> ##Metabole alkalose<br /> ##Koorts<br /> ##Pijnsensitisatie<br /> #Bespreek de cellulaire fase van de acute ontstekingsreactie.<br /> #Bespreek alle homeostasemechanismen die een invloed hebben op de neuromusculaire excitabiliteit.<br /> #Geef de oorzaken van een gestegen plasma-calcium met een normaal of verlaagd PTH.<br /> #Bespreek oedeem bij overvulling.<br /> #Bespreek metabole acidose.<br /> #Bespreek pathogenese en oorzaken van oedeem.<br /> #Bespreek het verband tussen diabetes (type 1 of 2) en:<br /> ##dehydratatie<br /> ##auto-immuniteit<br /> ##kalium homeostase<br /> ##obesitas<br /> ##metabole acidose<br /> #Meerkeuzevragen<br /> <br /> #Wat vindt niet plaats tijdens een stress respons<br /> ##Aldosterone daling<br /> ##Stimulatie ADH secretie<br /> ##Catecholamine vrijzetting<br /> ##Stimulatie bijniercortex<br /> …<br /> #Wat is geen oorzaak van migraine?<br /> ##Centrale sensitisatie<br /> ##Activatie van trigemino<br /> ##Inflammatie<br /> ##Auto-immuun ziekte<br /> …<br /> #Welke is geen overgevoeligheidsziekte?<br /> ##Reumatoïde artritis<br /> ##Pernicieuze anemie<br /> ##Mucoviscidose<br /> …<br /> #Wat is geen factor in de oedeemvorming bij levercirrose/leverfalen<br /> ##hoog renine<br /> ##splanchnische hypotensie<br /> ##toename ECF<br /> ##laag albumine<br /> ##vasoconstrictie splanchnische vaten<br /> #Wat is geen inhiberende factor voor de pijntransmissie<br /> ##niet-nociceptieve<br /> ##µ-agonisten<br /> ##NMDA-antagonisten<br /> …<br /> #Wat is niet betrokken bij maligne syndroom (hyperthermie, oedeem, deshydratatie D2 antagonist)</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Moleculaire_Architectuur&diff=3863 2024-01-28T09:37:03Z

<p>R0893094: /* 27 januari 2024 */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> Verplicht vak voor chemie. <br /> <br /> Dit vak wordt gegeven door professor Van Meervelt, hij is de aangenaamheid zelve op het examen!<br /> Zijn bijvragen zijn wel aan de moeilijke kant. Maar hij zal je altijd helpen de bijvragen beetje bij beetje op te lossen. Het examen duurt 4u.<br /> <br /> Kristallografie is het vak Moleculaire Architectuur, maar dan zonder NMR (het laatste hoofdstuk). Dit is eigenlijk de voorloper van moleculaire architectuur. Het wordt ook nu nog aan de geologen gegeven.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 27 januari 2024 ===<br /> # Hoe wordt de elektronendichtheid bepaald aan de hand van een diffractiepatroon. Geef de nodige formules en leg ook het faseprobleem en resolutie uit. (8p)<br /> # H NMR: Geef structuur, opsplitsingpatronen, chemische shift. Welke koolstof zou de grootste chemische shift hebben in C NMR? Is er een McLafferty omlegging mogelijk?<br /> # Ruimtegroep Pcan. (8p)<br /> # Puntgroep van 2 moleculen bepalen (2p elk) en een vlakgroep (zoals bij die kunstwerken)<br /> # Gegeven atoomposities (0,0,0) en (1/2, 1/2, 1/2), tabel sin(thèta)/lambda, a = b en c waarden gegeven. De hoeken zijn 90°. Wat is het Bravaisrooster? Bereken de grootte van de intensiteit. Bereken afbuigingshoek bij CuK(alpha) straling. Wat is de kortste afstand in het kristalrooster? (6p)<br /> # MALDI-TOF, FT-IR en kubische dichste bolstapeling uitleggen + tekenen (6p)<br /> <br /> === 6 september 2023 ===<br /> # Wat is de zwaar atoom methode? Wanneer wordt deze gebruikt? Alternatief? (8p)<br /> # H NMR: C5H8O2, Geef structuur, opsplitsingpatronen, chemische shift, verwachtte C-NMR off-resonance spectrum met chemische shift en multipliciteit van de pieken.<br /> # Ruimtegroep Pnab. (8p)<br /> # Puntgroep van 2 moleculen bepalen (2p elk) 1 was over 4 isomeren trichloornaftaleen<br /> # Gegeven atoomposities, tabel sin(thèta)/lambda, a, c, gamma = 120°. Wat is het Bravaisrooster en bolstapeling? Bereken de grootte en de fase van de structuurfactor, bereken afbuigingshoek bij CuK(alpha) straling. Geldt de wet van Friedel hier? (6p)<br /> # EI en CI, verklaar waarom vC-H &gt; vC=O &gt; vC-C bij IR, hoe lading bepalen bij MS (6p)<br /> <br /> === 17 augustus 2023 ===<br /> # Bol van Ewald uitleggen + welke factoren hebben invloed + reciproke rooster uitleggen. (8p)<br /> # NMR: C5H8O2, Geef structuur, opsplitsingpatronen, chemische shift, verwachtte C-NMR off-resonance spectrum. + Wat zal er gebeuren als je druppel van D2O toevoegt. <br /> # Ruimtegroep Pnam. (8p)<br /> # Puntgroep van 2 moleculen bepalen (2p)<br /> # Atoomposities gegeven, bereken positie van atoom en de fase van de structuurfactor. (6p)<br /> # Dichtste bolstapeling, Mclafferty omlegging, ESI uitleggen + tekeningen (6p)<br /> <br /> === 28 januari 2023 ===<br /> # Hoe wordt de elektronendichtheid bepaald voor een kristalstructuur? Wat zijn de voorwaarden hiervoor en leg resolutie uit. (8 punten)<br /> # NMR: C11H12O2 (benzeen met olefine erop en een estergroep met daaraan een ethylgroep) (8 punten)<br /> # Ruimtegroep: Pcam [https://www.yumpu.com/nl/document/read/66391261/ruimtegroepen|Ruimtegroepen] (8 punten)<br /> # Puntgroep van 2 moleculen en 1 vlakgroep bepalen(zoals in de oefenzitting) (p4g) (beide 2 punten)<br /> # Atoomposities gegeven, bereken de fase van de structuurfactor, de afbuigingshoek, de intensiteit. Wat is het Bravaisrooster? Waar zouden de hoogste pieken liggen in de pattersonfunctie? Tabel met sin teta/lambda, fa en fb gegeven (6 punten)<br /> # MALDI-TOF en FT-IR, geef ook tekeningen (6 punten)<br /> <br /> === 18 Augustus 2022 ===<br /> # '''Zwaaratoommethode: wnr gebruikt? alternatief?'''<br /> # H-NMR<br /> # Ruimtegroep Pmcb<br /> # Puntgroep: kies 4 isomeren tetrachloornaftaleen<br /> # '''CsCl cel: vlak (110) -&gt; geef vlakgroep en symmetrie-elementen'''<br /> # CdI2: Geg: atoompos; a, c, gamma; tabel met sin(theta)/lambda t.o.v. fCd en fI<br /> ##Geef Bravais, bolstapeling<br /> ##Reflectie (110) -&gt; geef fase van F en afbuighoek bij gebruik CuKa<br /> ##Friedelproof?<br /> # McLafferty; vC-H &gt; vC-O &gt; vC-C (IR); lading bepalen (MS)<br /> === 29 januari 2022 ===<br /> # Wat is het &quot;faseprobleem&quot;? Hoe op te lossen?<br /> # H-NMR spectrum: Geef structuur, opsplitsingpatronen, chemische shift, verwachtte C-NMR off-resonance spectrum. <br /> # Ruimtegroep Pnca. [https://www.yumpu.com/nl/document/read/66391261/ruimtegroepen|Ruimtegroepen]<br /> # Puntgroepen van 2 moleculen bepalen. Punt- '''&amp; vlakgroep bepalen en tekenen van ijzer in het vlak (110)'''<br /> # Oefeningen waarbij posities van HgS zijn gegeven. Bepaal intensiteit bij F(200). Geef het bravais rooster. Bepaal de S-Hg binding-afstand.<br /> # ATR-IR, MALDI-TOF. Voor volle punten: voeg tekeningen van de apparaten toe. Het wordt niet gezegd, maar hij verwacht dat je het weet.<br /> <br /> === 16 augustus 2021 ===<br /> # A.d.h.v de elektronendichtheid een kristalstructuur bepalen (+ resolutie)<br /> # H-NMR spectrum van C6H6N2O2. Drie isomeren, drie spectra. Bepaal de structuur. Teken de opsplitsingspatronen. Bereken waar mogelijk de chemische shift m.b.v. het tabellenboek. Verschil in c13-nmr/IR spectra tussen isomeren?<br /> # Ruimtegroep Pcan. [https://www.yumpu.com/nl/document/read/66391261/ruimtegroepen|Ruimtegroepen]<br /> # Puntgroepen van 4 moleculen bepalen.<br /> # Oefening waarbij equivalente posities van Br gegeven zijn en pattersonpieken gegeven en hieruit de atoompositie van Br bepalen. Bepaal F020 en de fase.<br /> # Dichtste bolstapeling en &quot;hoe lading bij MS te weten komen&quot; uitleggen<br /> <br /> === 27 januari 2021 ===<br /> # constructie van ewald uitleggen + welke factoren hebben invloed<br /> # H-NMR spectrum van C11H12O2. Bepaal de structuur. Teken de opsplitsingspatronen. Bereken waar mogelijk de chemische shift m.b.v. het tabellenboek. Hoeveel pieken verwacht je in het c13-nmr spectrum?<br /> # Teken a,b-projectie van ruimtegroep Pbnm. Geef de equivalente posities, de multipliciteit en de asymmetrische eenheid. Geef 2 speciale posities en verklaar waarom ze speciaal zijn. Geef de puntgroep en de Pattersongroep. Bepaal de systematische afwezigheden. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid.[https://www.yumpu.com/nl/document/read/66391261/ruimtegroepen|Ruimtegroepen]<br /> # Puntgroepen van 4 moleculen bepalen.<br /> # Oefening waarbij equivalente posities van Pt gegeven zijn en pattersonpieken gegeven en hieruit de atoompositie van Pt bepalen. Bepaal F020 en de fase. Voldoet dit aan de wet van friedel?<br /> # MALDI-TOF en Mclafferty omlegging uitleggen <br /> <br /> ===6 januari 2021===<br /> # Leg uit de Pattersonfunctie uit. Zeg hoe ze berekend wordt, hoe ze kan bijdragen tot de bepaling van de kristalstructuur.<br /> # H-NMR spectrum van C5H8O2. Bepaal de structuur. Teken de opsplitsingspatronen. Bereken waar mogelijk de chemische shift m.b.v. het tabellenboek. Teken het verwachte off resonance C13-NMR spectrum met chemische shift waarde en multipliciteit van de pieken.<br /> # Teken a,b-projectie van ruimtegroep Pcnb. Geef de equivalente posities, de multipliciteit en de asymmetrische eenheid. Geef 2 speciale posities en verklaar waarom ze speciaal zijn. Geef de puntgroep en de Pattersongroep. Bepaal de systematische afwezigheden. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid. [https://www.yumpu.com/nl/document/read/66391261/ruimtegroepen|Ruimtegroepen]<br /> # Puntgroepen van 4 moleculen bepalen.<br /> # Atoomposities van PoCl2, tabel met f(Po) en f(Cl) in functie van sin0/λ gegeven. Bereken de fase van de structuurfactor voor reflectie 110. <br /> # ATR-IR en ESI uitleggen.<br /> <br /> ===13 augustus 2020===<br /> # Leg uit hoe men a.d.h.v. de elektronendichtheid een kristalstructuur exact kan bepalen<br /> # H-NMR spectrum van C5H10O. Bepaal de structuur. Teken de opsplitsingspatronen. Bereken waar mogelijk de chemische shift m.b.v. het tabellenboek. Teken het verwachte off resonance C13-NMR spectrum.<br /> # Teken a,b-projectie van ruimtegroep Pman. Geef de equivalente posities, de multipliciteit en de asymmetrische eenheid. Geef 2 speciale posities en verklaar waarom ze speciaal zijn. Geef de puntgroep en de Pattersongroep. Bepaal de systematische afwezigheden.<br /> # Puntgroepen van 4 moleculen bepalen.<br /> # Atoomposities van PbO gegeven. Bepaal de bravaisrooster, de symmetrie elementen die door O gaan, teken de pattersonfunctie en toon aan dat de intensiteiten van reflectie (200) gelijk is aan de intensiteit (020).<br /> # ATR-IR en ESI uitleggen.<br /> <br /> ===27 januari 2020 NM===<br /> # Leg uit hoe men a.d.h.v. de elektronendichtheid een kristalstructuur exact kan bepalen<br /> # Bespreek ionisatietechniekenen die gebruikt worden om een massaspectrum te bepalen<br /> # Teken a,b-projectie van ruimtegroep Pbna. Geef de equivalente posities, de multipliciteit en de asymmetrische eenheid. Geef 2 speciale posities en verklaar waarom ze speciaal zijn. Geef de puntgroep en de Pattersongroep. Bepaal de systematische afwezigheden.<br /> # Bepaal puntgroepen van verschillende aromaten. Teken de symmetrie-elementen.<br /> # Geef de opsplitsing van waterstofatomen in m-dichloorbenzeen. Chemische shift?<br /> # Lithiumfluoride kristalliseert in een kubisch kristal met a = 4 A volgens het NaCl-type (je zou moeten weten wat dit betekent). Afmetingen van het kristalrooster zijn gegeven. Als men bestraald met CuK straling bekomt men een diffractiepatroon. Welke reflecties hebben de grootste intensiteit, die van (300) of (400)? Wat gebeurt er met de afbuigingshoek en intensiteit als <br /> ##F vervangen wordt door I?<br /> ##de afmetingen van de eenheidscel verdubbelen?<br /> <br /> ===27 januari 2020 VM===<br /> # Leid de formule voor de structuurfactor af. Kan je deze ook experimenteel bepalen?<br /> # H-NMR spectrum van C6H6N2O2. Bepaal de structuur van de isomeren. Teken de opsplitsingspatronen.<br /> # Puntgroep Pbma. Geef de equivalente posities, de multipliciteit en de asymmetrische eenheid. Geef 2 speciale posities en verklaar waarom ze speciaal zijn. Geef de puntgroep en de Pattersongroep. Bepaal de systematische afwezigheden.<br /> # Bepaal de puntgroep van isomeren van trichloorbenzeen. Teken de symmetrie-elementen.<br /> # Gegeven zijn de posities van Ag en I in een AgI kristal met a = 6.5 A. Bepaal voor de reflectie (004) de fase van de structuurfactor, de intensiteit en de afbuighoek. Geef het Bravaisrooster.<br /> # Leg ATR-IR uit. Leg uit hoe we de lading kunnen bepalen bij massaspectrometrie.<br /> <br /> ===24 januari 2020===<br /> # Hoe kan men de kristalstructuur verder verfijnen?<br /> # NOE, NOESY, COSY<br /> # Ruimtegroep Pcmn met gewoonlijke bijvragen.<br /> # Gegeven de afmetingen van de eenheidscel en 2 atoomposities, bepaal de intensiteit en afbuigingshoek (2θ) van de reflecties (001) en (002) (tabel met sin θ/λ en f&lt;sub&gt;j&lt;/sub&gt; ook gegeven). Geef ook het Bravaisrooster.<br /> # 4 vormen van dioxine gegeven, duid alle symmetrie-elementen aan en bepaal de puntgroep.<br /> # Begrippen: Laue groep ; EI en CI (massaspectrometrie)<br /> <br /> ===16 januari 2020===<br /> # Leid de structuurfactor af. Kan deze ook experimenteel bepaald worden? (mondeling)<br /> # Gegeven C5H10O H-NMR spectrum, bepaal de structuur van de chemische stof die dit spectrum geeft. (mondeling). Er is D2O-shake, dus de O die voorkomt is in de vorm van -OH.<br /> # Ruimtegroep Pmca, gebruikelijke bijvragen.<br /> # Pattersonfunctie Oefening met intensiteit enzo berekenen. Structuur was op eerste zicht niet centrosymmetrisch, maar was het wel met andere oorsprong.<br /> # Wat is de vlakgroep van het (110) vlak van NaCl? Teken en geef alle symmetrie-elementen.<br /> # Begrippen: MALDI-TOF, verklaar waarom CH &gt; C=O &gt; C-C (bij IR)<br /> <br /> ===13 januari 2020 - namiddag===<br /> #Theorie: Leg de contructie van Ewald uit. Welke factoren hebben hier invloed op? Bijvraag: moet je alle reciproke roosterpunten meten? (Neeh, n-tallige assen/symmetrie)<br /> #Theorie: H-NMR gegeven van C10H13NO2. Bijvragen over welke pieken we zouden zien bij IR, hoe je de koppelingsconstante kan bepalen.<br /> #Puntgroep Pcmb met gebruikelijke bijvragen<br /> #Oefening: Verschillende puntgroepen geven van de isomeren van tetrachloorkubaan.<br /> #Oefening: Platinacomplex met ruimtegroep Pc1/m, posities gegeven in de ruimtegroep ( xyz, -x-y-z...) en coördinaten gegeven van zwaarste atomen in Patterson. Bepaal de positie van Pt, wat is de fase bij structuurfactor F(020), geldt de wet van Friedel? <br /> #Begrippen: McLafferty omlegging + hexagonale en kubische dichtste bolstapeling uitleggen<br /> <br /> ===13 januari 2020 - voormiddag===<br /> #Theorie: Hoe wordt het principe van Fourier synthese toegepast in de kristalstructuurbepaling?<br /> #Theorie: NOE, NOESY en COSY<br /> #Puntgroep Pmcb met gebruikelijke bijvragen<br /> #Oefening: Puntgroepen van vier structuren<br /> #Oefening: CdI2: Bravaisrooster bepalen, voor structuurfactor fase bepalen en afbuigingshoek als CuK(alfa) straling gebruikt wordt, geldt wet van Friedel? <br /> #Begrippen: ATR-IR + ESI uitleggen<br /> <br /> ===26 augustus 2019===<br /> #Theorie: Hoe wordt het principe van Fourier synthese toegepast in de kristalstructuurbepaling?<br /> #NMR-vraag: 3 verschillende H-NMR spectra van isomeren met brutoformule C6H8N2O2. Teken ook de opsplitsingspatronen.<br /> #Puntgroep Pcnb met gebruikelijke bijvragen<br /> #Oefening: Vlakgroep vlak 110 NaCl. Geef alle symmetrie-elementen.<br /> #Oefening: Bepaal de fase en intensiteit van PoCl2 in de reflectie (110). Gegeven zijn de atoomposities en de karakteristieke straling.<br /> #Begrippen: ESI + CuKalfa uitleggen<br /> <br /> ===28 januari 2019===<br /> #Hoe kan je een model verbeteren na het oplossen van het faseprobleem?<br /> #H-NMR van C5H8O2 bijvragen over IR.<br /> #Pmcn met bijvragen.<br /> #puntgroep van 4 isomeren van dioxine.<br /> #AgI posities van de atomen gegeven (breuken) a=6.50 A. tabel met sin(theta)/lambda gegeven voor fAg en fI. Bravais rooster geven, fase, hoek en intensiteit berekenen.<br /> #ATR-IR en ESI.<br /> ===17 januari 2019===<br /> #Geef de afleiding van de structuurfactor. Is deze experimenteel te bepalen? <br /> #H1-NMR van C10H13NO2 (Bijvragen over IR: wat als we van dit molecule een IR spectrum zouden opnemen? Waar zien we dan pieken? Welke zijn sterk? Welke niet?)<br /> #Ruimtegroep Pnam met bijgvragen <br /> #Puntgroep bepalen van de isomeren van tetrachloorkubaan (molecuulmodelletje gegeven)<br /> #Rood loodoxide PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel<br /> a=3,975 A en c=5,023 Atomen liggen op de posities: <br /> Pb(1): 0 ½ 0.2385 <br /> Pb(2): ½ 0 -0.2385 <br /> O(1): 0 0 0 <br /> O(2): ½ ½ 0 <br /> Wat is het Bravaisrooster? Welke symmetrie-elementen gaan door O2? Construeer de pattersonfunctie. Waar vinden we de sterkste pieken? Toon aan dat de intenstiteit van reflectie 200 en 020 gelijk is. <br /> #Mclafferty omlegging en kubische en hexagonale dichtste bolstapeling. <br /> ===14 januari 2019===<br /> # Hoe kan men met de Pattersonfunctie het faseprobleem oplossen? (mondeling)<br /> # NOE en NOESY, COSY (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pman met bijvragen<br /> # Puntgroepen van 4 verschillende aromaten<br /> # CdI2: Bravaisrooster bepalen, voor structuurfactor fase bepalen en afbuigingshoek als CuK(alfa) straling gebruikt wordt, maxima van de Pattersonfunctie geven<br /> # MALDI-TOF uitleggen en golfgetallen vergelijken bij IR spectroscopie<br /> <br /> === 4 september 2018===<br /> # Geef de contructie van Ewald<br /> # H-NMR van C10H12O3<br /> # Ruimtegroep Pcnb<br /> # Geef de puntgroep van 4 isomeren van tetrachloornaftaleen die aanleiding geven tot een andere puntgroep. <br /> # PbO kristaliseert uit in eenheidscel met gegeven dimensies en atoomposities. Gevraagd: Construeer de pattersonfunctie, waar zijn de sterkste pieken? Tot welk Bravais rooster behoort dit? Wat is de afbuighoek van het 110 vlak met CuKalfa? <br /> # Begrippen: Kubisch en hexagonale dichtste bolstapeling + McLafferty omlegging<br /> <br /> ===27 augustus 2018===<br /> # Hoe kan men het faseprobleem oplossen met behulp van de Pattersonfunctie? (dus ook uitleggen wat faseprobleem is, formule van pattersonfunctie geven,...) (mondeling)<br /> # Gegeven drie H-NMR spectra, alle drie C6H6N2O2, bepaal structuren, en verklaar de verschillende spectra (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pcmn met alle gebruikelijke vragen<br /> # Bepaal tot welke puntgroepen de isomeren van trichloorbenzeen behoren, teken alle symmetrie-elementen<br /> # Oefening met CdI2, bepaal fasehoek van de reflectie op (110) en afbuighoek theta, tot welk bravais rooster behoort dit? Waar bevinden zich de maxima bij de Pattersonfunctie?<br /> # Begrippen: MALDI-TOF, Laue groep<br /> <br /> ===15 juni 2018===<br /> # Leid de structuurfactor af. Kan deze ook experimenteel bepaald worden? (mondeling)<br /> # Gegeven een H-NMR spectrum, bepaal de structuur van de chemische stof die dit spectrum geeft. (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pmca, gebruikelijke bijvragen.<br /> # Oefening met intensiteit enzo berekenen. Structuur was op eerste zicht niet centrosymmetrisch, maar was het wel met andere oorsprong.<br /> # Wat is de vlakgroep van het (110) vlak van NaCl? Teken en geef alle symmetrie-elementen.<br /> # Begrippen: MALDI-TOF, kubisch dichtste bolstapeling<br /> <br /> ===11 juni 2018===<br /> # Waarom Pattersonfunctie belangrijk bij het faseprobleem?<br /> # NMR: C10H1202<br /> # Ruimtegroep Pbab met alle bijhorende vragen<br /> # Puntgroepen geven van 4 verschillende aromatische verbindingen + symmetrie elementen aanduiden<br /> # Oefening waarbij celparameters en 2 atomen gegeven zijn. Intensiteit en afbuighoek berekenen voor (001) en (002). Tot welk Bravais rooster gehoord deze kristalstructuur? <br /> # Begrippen: CuKalfa en ESI<br /> <br /> ===27 juni 2017===<br /> # Stappen van kristalstructuurbepaling<br /> # NMR, een piek waar bij stond deze verdwijnt bij schudden met D2O, bijvraag waarom deze piek verdwijnt, ook bijvragen over C13 NMR en IR<br /> # Ruimtegroep Pcmm en bijvragen<br /> # Vlakgroep vlak 110 NaCl<br /> # Bepalen van intensiteit reflectie van vlak 200, lengte en fractionele coördinaten gegeven<br /> # Beschrijf MALDI-TOF en kubisch dichtste bolstapeling<br /> <br /> ===22 juni 2017 NM===<br /> # Structuurverfijning van kristalstructuurbepaling<br /> # Leg uit: NOE en NOESY<br /> # Ruimtegroep Pcan met alle bijhorende vragen<br /> # Oefening waar 4 moleculen stonden waarvan je de puntgroep moest bepalen<br /> # Oefening met tabel Sintheta/golflengte- intensiteit en hoek 2theta bepalen<br /> # begrippen: CuKalfa en Resolutie <br /> <br /> === 16 juni 2017 NM===<br /> #Hoe Faseprobleem oplossen met Patterson functie <br /> #1H- Nmr ( bijvragen : welke piek is het belangrijkst bij IR-spectra , hoeveel pieken zullen er zijn bij C13,..) <br /> #Ruimtegroep ( ik dacht Pbmn )<br /> #Intensiteit bepalen en afbuighoek bepalen <br /> #Puntgroep van tetrachloornaftaleen ( eerst isomeren geven en van elk isomeer puntgroep bepalen) <br /> #Mc-lafferty omlegging<br /> #chemische ionisatie<br /> ===16 juni 2017 VM===<br /> #leid de formule voor de structuurfactor af en vertel hoe je deze experimenteel kan bepalen.<br /> #Geef alle ionisatie technieken gebruikt in MS.<br /> #Puntgroep Pbcm met gebruikelijke bijvragen<br /> #Geef de puntgroepen van alle isomeren van tetrachloor kubaan en teken de symmetrie elementen<br /> #verklaar chemische shift, koppelingsconstante en shift reagens<br /> ===12 juni 2017===<br /> #leg constructie van Ewald uit<br /> #nmr spectra (geef structuur molecule ) C10H12O3<br /> #ruimtegroep Pncm met alle bijhorende vraagjes (asymmetrische eenheid, multipliciteit, equivaltente posities, patterson, puntgroep, systematische afwezigheden)<br /> #Vlakgroep van (110) vlak van ijzer. Geef alle symmetrie elementen<br /> #oefening ivm fase berekenen en intensiteit (CdI2, sin(theta)/golflengte is gegeven, bepaal fCd, fI en zo de rest)<br /> #begrippen: ESI &amp; Wet van Friedel<br /> <br /> ===21 augustus 2015===<br /> # stappen van de kristalstructuur bepaling<br /> # Welke methode voor ionisatie worden er gebruikt bij massaspectroscopie<br /> # Pcan (met alle gebruikelijke bijvraagjes)<br /> # Vlakgroep van (110) vlak van ijzer. Geef alle symmetrie elementen<br /> # PoCL2: ge krijgt Sin theta/lambda en uw celafmetingen, geef Fhkl, Ihkl en uw hoek<br /> # Bespreek de termen chemische shift, koppelingsconstante en shiftreagens<br /> <br /> === 18 augustus 2015 vm ===<br /> # leg het principe van uit van verfijning van een kristalstructuur<br /> # leg volgende begrippen uit: NOE en NOESY<br /> # ruimtegroep Pbmn en alle vraagjes zoals altijd<br /> # puntgroepen geven 4 isomeren van een of ander molecule<br /> # voor een bepaalde reflectie de fase van de structuurfactor berekenen en de intensiteit<br /> # 2 stellingen (juist of fout):<br /> #* Bij een ESI spectrum zijn er geen fragmentaties<br /> #* Bij kubische dichtste bolstapeling liggen alle atomen op speciale posities<br /> === 24 juni 2015 ===<br /> # Nmr spectra<br /> # verfijning van kristalstructuur<br /> # Vlak groep van ijzer<br /> # Ruimte groep Pcan + al die bijvragen<br /> # Oefening sin theta/lambda. ..<br /> # 2 stellingen: <br /> #* esi heeft geen fragmentaties<br /> #* In ccp liggen alle atomen op speciale posities<br /> <br /> === 18 juni 2015 ===<br /> # Hoe kunnen we met behulp van de pattersonfunctie het faseprobleem oplossen?<br /> # Leg uit NOE en NOESY<br /> # puntgroep Pbmn<br /> # Bepaal de puntgroep van de isomeren van tetrachloorkubaan en duid alle symmetrie-elementen aan<br /> # Bereken de fase van de structuurfactor en de intensiteit voor CdI2 met <br /> #* Eenheidscel a=4,24 A, c=6,86 A, gamma=120°<br /> #* Posities: Cd 0 0 0, I(1) 2/3 1/3 1/4, I(2) 1/3 2/3 3/4<br /> #* sin theta/lamba 0,0 0,1 0,2 0,3 fCd 48 44,58 38,44 33,22 fI 53 49,36 42,79 37,14<br /> # Verklaar de begrippen CuKalfa en resolutie<br /> <br /> === 9 juni 2015 vm ===<br /> # Leid de uitdrukking van de structuurfactor af. Hoe kan je de structuurfactor experimenteel bepalen?<br /> # H-NMR spectra van 3 isomeren C6H6N2O2<br /> # Ruimtegroep Pncm<br /> #* Equivalente posities<br /> #* multipliciteit<br /> #* asymmetrische eenheid<br /> #* Geef 2 speciale posities (waarom speciaal?)<br /> #* van welke puntgroep afgeleid?<br /> #* Pattersongroep?<br /> #*Systematische afwezigheden<br /> # Bepaal de puntgroep van verschillende isomeren van tetrachloornaftaleen. Duid de symmetrie elementen aan.<br /> # Rood Loodoxide PbO kristalliseert in tetragonale eenheidscel a= 3.975 c= 5.023<br /> #* Waar vind je in Pattersonfunctie sterkste pieken?<br /> # Leg uit : ESI en ATR-IR<br /> <br /> ===25 juni 2014===<br /> #Geef de stappen voor kristalstructuurbepaling (mondeling)<br /> #Wat is NOE? (mondeling)<br /> #Ruimtegroep Pcnb<br /> #Geef puntgroep van alle isomeren van tetrachloorkubaan<br /> #Intensiteit van In en afbuighoek: vormfactor, atoomposities zijn gegeven<br /> #Stellingen<br /> #*Bij ESI is geen fragmentatie<br /> #*Bij kubisch dichtste bolstapeling liggen de atomen op speciale posities<br /> <br /> ===13 juni 2014===<br /> # Hoe kunnen we met behulp van de pattersonfunctie het faseprobleem oplossen? (mondeling)<br /> # NMR spectrum met gesubstitueerde benzeenring (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pbnm met alle typische bijvragen (asymmetrische eenheid, speciale posities + waarom ze speciaal zijn, pattersongroep, puntgroep en systematische afwezigheden)<br /> # Geef de vlakgroep van (110) van ijzer<br /> # Oefening op structuurfactor. Vormfactoren met bijhorende sin(θ)/λ zijn gegeven, net als de fractionele coördinaten en de grootte van de eenheidscel<br /> # Wat is ESI?<br /> <br /> ===13 juni 2013===<br /> # Ruimtegroep Pbmb.<br /> # Wat is de vlakgroep van het vlak (110) in de ijzerstructuur?<br /> # NMR-spectrum gegeven. Stelling: Bevat dit spectrum een AX6 systeem?<br /> # Leg volgende begrippen uit: Laue groep, resolutie, temperatuursfactor.<br /> # Gegeven: posities van In en celparameters (a en c). Teken een a,b-projectie van de eenheidscel. Welk Bravais-rooster heeft de cel? Bepaal de afbuighoek 2theta en de intensiteit van de reflecties (001) en (002). Wat is de puntgroep rond de middelste In? Waar bevinden zich de hoogste Pattersonpieken?<br /> <br /> ===10 juni 2013===<br /> # Teken ruimtegroep Pbnb (ab-projectie) en geef equivalente posities, speciale posities, systematische afwezigheden, puntgroep waarvan de ruimtegroep is afgeleid en asymetrische eenheid. (Schriftelijk, na 1 uur af te geven.)<br /> # Wat is de vlakgroep van het vlak (110) in de platina-strucuur? (Structuur is dus van buiten te kennen!) Bijvraag: is dit vlak de eenheidscel van de vlakgroep? (Mondeling)<br /> # Bespreek: voor ethylisobutyraat (spectrum en structuur gegeven) is een ontkoppelingsexperiment niet mogelijk. Bijvragen: hoe bepalen we de frequentie die we moeten gebruiken voor het ontkoppelingsexperiment? Link de verschillende pieken aan de verschillende groepen. (Mondeling)<br /> # Leg de Ewald-constructie uit. Bijvraag: wat gebeurt er als we het kristal draaien? (Mondeling)<br /> # Gegeven: posities van Mo en Ni in een MoNi4-legering en parameters a en c. Teken een a,b-projectie van de eenheidscel. Welk Bravais-rooster heeft de cel? Bepaal de 2-theta en de intensiteit van de reflectie (002). Wat is de puntgroep rond Mo? Geef de hoogste pattersonpieken.<br /> <br /> ===16 juni 2011===<br /> # Teken ruimtegroep Pmcn (ab-projectie) en geef equivalente posities, puntgroep waar deze ruimtegroep van is afgeleid, asymmetrische eenheid, 2 speciale posities en bijhorende Pattersongroep. Zijn er systematische afwezigheden?<br /> # Stellingen:<br /> #* Het vlak (110) wordt bij Fe en bij NaCl beschreven door dezelfde vlakgroep<br /> #* Bij een goed verfijnde structuur zijn de pieken op de verschilfourier te verwaarlozen<br /> #* Voor de waterstofatomen met delta 6,8 is een ontkoppelingsexperiment niet mogelijk (NMR-spectrum van ethyl-4-methoxybenzoaat gegeven, het gaat om de waterstoffen op C3 en C5 van de benzeenring). <br /> # Oefening: PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel, a en c gegeven. Twee posities voor Pb en voor O gegeven. Teken de ab-projectie. Door welke puntgroep wordt de geometrie rond de Pb-atomen beschreven? Door welk Bravaisrooster wordt het kristal beschreven? Bepaal de fase van de intensiteit van afgebogen stralingsbundel voor het vlak (110) voor CuK-alpha (tabel met enkele waarden gegeven voor f van Pb en O ifv sin(theta)/lambda). Teken het vlak (110) en de invallende en afgebogen stralingsbundel op de tekening.<br /> <br /> ===10 juni 2010 (NM)===<br /> # Teken ruimtegroep Pmnb en klassieke vragen: equivalente posities, 2 speciale posities, systematische afwezigheden, asymmetrische eenheid, puntgroep,..<br /> # Stellingen:<br /> #* De temperatuur heeft geen invloed op de kristalstructuurbepaling.<br /> #* Het is niet mogelijk om P2 en Pm van elkaar te onderscheiden met behulp van intensiteitsmetingen.<br /> # NMR-spectrum en bepalen of het overeenkomt met het gegeven molecule.<br /> # Oefening: AgI kristal, a= 6,50 Angstrom, coordinaten van atomen zijn gegeven, en tabel van f ifv sin/lambda.<br /> #* Geef a,b-projectie + Bravaisrooster<br /> #* Bereken Intensiteit en bereken afbuighoek van vlak 004<br /> #* Geef puntsymmetrie rond Ag en rond I<br /> #* Waar verwacht je de hoogste Pattersonpieken?<br /> <br /> ===23 juni 2009===<br /> # teken ruimtegroep (Pnca dacht ik) &amp;amp; geef eq. posities, 2 speciale posities, syst. afwezigheden, puntgroep, ...<br /> # Stellingen:<br /> #* rotatiesymmetrie kan bepaald worden via rotatiediffractie(dat een ding waar ge een kristal draait, ik ben niet meer zeker of dat zo heet)<br /> #* bij verschilelektronendichtheidsmap gaat de hoogte van de pieken verloren bij verfijning (ofzoiets toch)<br /> # NMR van 1,1-dimethoxyethaan<br /> # Oefening: alfa-uranium heeft volgende coordinaten op speciale posities: +-(0,y,1/4) +-(1/2,1/2-y,-1/4) a b en c gegeven(3 verschillende waarden) 2 groottes van structuurfactoren gegeven en de fu in functie van sin(theta).<br /> #* y is 0.10 of 0.15, bepaal dit met bhv de gegevens. <br /> #* Teken een a,b-projectie. <br /> #* Beschrijf de omringing van het U-atoom via de puntgroep van het atoom. <br /> #* Teken de pattersongroep.<br /> ===17 juni 2009===<br /> # Ruimtegroep Pcan: equivalente posities, multipliciteit, asymmetrische eenheid, 2 speciale posities, puntgroep, systematische afwezigheden<br /> # Stellingen<br /> #* De temperatuurfactoren van Pt in een Pt-kristal zijn isotroop (Antwoord: Waar want ze liggen op speciale posities)<br /> #* De symmetrie van een diffractiepatroon van een kristal wordt bepaald door de ruimtegroep<br /> #* NMR: aspirine<br /> # Oefening: Nikkelarsenide (a, c en gamma=120° is gegeven) De posities van Nikkel en van arseen zijn ook gegeven. <br /> #* Geef de ab-projectie, bravais rooster, wat is de stapeling van Arseen, puntgroep rond Arseen en rond nikkel <br /> #* Bij reflecties (200), (300) en (030) en Cu K-alfa straling<br /> #** Voorspel de hoogste intensiteit<br /> #** Voorspel de grootste afbuighoeken<br /> #* Wat is de resolutie bij een afbuighoek van 100° en bij Cu K-alfa straling<br /> <br /> === 15 juni 2009 ===<br /> # Ruimtegroep (ik denk Pbmn) met klassieke vragen<br /> # Stellingen<br /> #* Pm en Cm hebben dezelfde Harkersecties<br /> #* Cobalt kan geïoniseerd worden met Cu K alfa straling<br /> #* NMR<br /> # Oefening: HgS met coördinaten Hg en S gegeven. Alle elementen geven van 11 juni op uitzondering van de afbuighoek en dit voor de vlakken 200 en 400. <br /> <br /> === 11 juni 2009 ===<br /> # Ruimtegroep + asymmetrische eenheid + 2 speciale posities + iets met systematische afwezigheden<br /> # Stellingen<br /> #* Het 110 vlak van Fe vertoont C4v (Bijvragen: aantonen op modellekes)<br /> #* De atomen bij hexagonale dichtste bolstapeling liggen allemaal op speciale posities (Bijvraag: Hij vraagt om de kubische bolstapeling te laten zien, met die pingpongballetjes en hoe heten de ruimtes tussen die pingpongballekes) <br /> #* NMR: een benzeen met een chloor op en op para positie iets me een ethyl en een keton (Bijvraag: hoe zie je dat het een spectrum van de 1ste orde of 2de orde is)<br /> # Oefening: ik kreeg een tabel met fractionele coördinaten van ReO3 en zo'n tabel met sin (theta) / lamda en vormfactoren. Ik moest een ab projectie tekenen, bravais rooster geven, intensiteit berekenen, afbuighoek bepalen, hoogste pattersonpieken voorspellen.<br /> <br /> === 24 juni 2008 ===<br /> # Pmca met klassieke vragen<br /> # Stellingen<br /> #* Alle atomen van sfaleriet bezetten speciale posities<br /> #* Een kristalrooster kan ondubbelzinnig bepaald worden adhv systematische afwezigheden<br /> #* isopropyltolueen<br /> # Wolfraam-rooster en CuKa straling, vlakken (211) en (310)<br /> #* teken 3D-rooster en duidt [sic] vlakken aan<br /> #* Welke intensiteit is sterkst, bij (221) of bij (310)<br /> #* Welke reflectiehoek is grootst, bij (221) of bij (310)<br /> #* Welke zijn de sterkste Pattersonpieken?<br /> <br /> === 19 juni 2008 ===<br /> # Pbmn tekenen + assym. eenheid + equi. pos. + multipliciteit + 2 speciale pos. + Systematische afwezigheden + van welke puntgroep<br /> # Stellingen<br /> #* De temp. heeft geen invloed op het diffractiepatroon<br /> #* De vlakken 001 en 110 van Fe hebben dezelfde vlakgroep (ook zeggen welke vlakgroep(en))<br /> #* NMR<br /> #De structuur van LiF en NaCl is dezelfde, a = ...., kristalafmeting 0,2mmx0,2mmx0,2mm en wordt bestraald met Cu kalfa. Bereken F003 en F004. Welke intensiteit is het hoogst? Wat gebeurt er met de diffractiehoek en de intensiteit als je:<br /> #*F vervangt door I<br /> #*de cel verdubbeld<br /> #*Waar verwacht je de sterkste Pattersonpieken<br /> <br /> === 19 juni 2008 ===<br /> # P nmb tekenen + puntgroep + asymetrische eenheid + equi posities<br /> # stellingen ( waar of niet waar )<br /> #* Pm en Cm hebben dezelfde harkersecties<br /> #* R staat voor de resolutie van een structuurbepaling<br /> #* spectrum en molecule gegeven, horen ze bij elkaar?<br /> # oefening : NH4HgCl3 heeft eenheidscel a = ... c =... en atoomposities N, Hg en 3 Cl-en gegeven: (ook alpha-Cu straling zoda je uw lambda ook kent) (tabel sin(theta)/lambda en f waarden van Cl, Hg en N gegeven)<br /> #* geef (a,b) projectie van eenheidscel<br /> #* bepaal Bravais rooster<br /> #* bepaal intensiteit en afbuigrichting 2theta van de reflectie (004)<br /> #* Hg door welke puntgroep omringt<br /> <br /> ===23 juni 2008===<br /> #Ruimtegroep tekenen. In dit geval Pman. Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?<br /> #Bespreek volgende stellingen. Geef telkens ook een korte motivatie:<br /> #*Op basis van systematische afwezigheden kan geen verschil gemaakt worden tussen de ruimtegroepen P2 en P2/m.<br /> #*De temperatuurfactoren van &amp;lt;math&amp;gt;\alpha&amp;lt;/math&amp;gt;-Fe zijn isotroop.<br /> #*NMR-spectrum en molecule. Kunnen die bij elkaar horen?<br /> #kristal met Li2O met één lengte gegeven (kubisch dus) <br /> #*teken ab projectie gegeven zijn de posities van de atomen<br /> #*geef puntgroep rond Li en O<br /> #*geef bravais rooster<br /> #*twee vlakken gegeven welke grootste hoek en welke grootste intensiteit<br /> #*waar bevinden zich de grootste patterson pieken<br /> <br /> ===27 juni 2007===<br /> #Ruimtegroep tekenen. Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?<br /> #Bespreek volgende stellingen. Geef telkens ook een korte motivatie:<br /> #*Op basis van systematische afwezigheden kan geen verschil gemaakt worden tussen de ruimtegroepen P2 en P2/m.<br /> #*De temperatuurfactoren van &amp;lt;math&amp;gt;\alpha&amp;lt;/math&amp;gt;-Fe zijn isotroop.<br /> #*NMR-spectrum en molecule. Kunnen die bij elkaar horen?<br /> #Typische gecombineerde oefening. Diffractiemeting op wolfraam met Cu-&amp;lt;math&amp;gt;\alpha&amp;lt;/math&amp;gt; straling. Beschouw vlakken (211) en (310). Een tabel met &amp;lt;math&amp;gt;\frac{\sin \theta}{\lambda}&amp;lt;/math&amp;gt; waarden is gegeven.<br /> #*Teken het reële rooster en duidt de vlakken aan.<br /> #*Teken ab-projectie van het reciproke rooster, en duidt hier ook de vlakken aan.<br /> #*Voor welk vlak verwacht je de grootste reflectiehoek.<br /> #*Voor welk vlak verwacht je de grootste intensiteit.<br /> <br /> ===Vragen eerste zit vrijdag 30 juni 2006 (Fysica)===<br /> #Teken Pbna (ab-projectie). Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?<br /> #Zijn volgende stellingen waar of vals?<br /> #*Omgeving van een bol in hexagonaal dichtste bolstapeling is C3h.<br /> #*&amp;lt;math&amp;gt;P2_1&amp;lt;/math&amp;gt; en &amp;lt;math&amp;gt;P2_1/m&amp;lt;/math&amp;gt; zijn niet te onderscheiden met behulp van de speciale posities.<br /> #*Dit is het NMR-spectrum van... (iets ingewikkeld)<br /> #LiF kristalliseert zoals NaCl in kubische cel met parameter a = 0,4026 nm. We gebruiken CuKa straling en een kristal met dimensie 0,2x0,2x0,2.<br /> #*Geef de ab-projectie van de structuur.<br /> #*Geef de reciproke parameters.<br /> #*netvlakken 003 en 004: welke heeft grootste intensiteit van de gereflecteerde straal?<br /> #*Wat gebeurt met deze reflecties (dus hoek, intensiteit, fase) als we F vervangen door I. Wat gebeurt er als we de afmetingen van het kristal verdubbelen?<br /> #*Welke zijn de grootste pieken in de Pattersonfunctie?<br /> <br /> === Vragen eerste zit dinsdag 27 juni 2006 (Geologie) ===<br /> (dit waren vragen van geologie, zij hebben ook een deel poederdiffractie dat voor fysici niet gekend hoeft te zijn)<br /> <br /> *teken de ruimtegroep Pncm (a,b-projectie)<br /> Geef equivalente posities, multipliciteit en assymmetrische eenheid<br /> <br /> Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid?<br /> <br /> Geef twee speciale posities<br /> <br /> *stellingen:<br /> De atomen in perovskiet liggen allemaal op speciale posities<br /> <br /> De ruimtegroepen P2/c en Pc behoren tot zelfde pattersongroep<br /> <br /> *loodoxide PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel<br /> a=3,975 A en c=5,023 A<br /> atomen liggen op de posities:<br /> Pb(1): 0 ½ 0.2385<br /> Pb(2): ½ 0 -0.2385<br /> O(1): 0 0 0<br /> O(2): ½ ½ 0<br /> Teken een a,b-projectie van de eenheidscel en beschrijf de omringing van de loodatomen met behulp van een puntgroep<br /> <br /> Welk Bravaisrooster?<br /> <br /> Bepaal voor de reflectie (110) de fase van de structuurfactor en intensiteit<br /> Teken het vlak (110) en de invallende en afgebogen bundel bij op de a,b-projectie bij gebruik van CuKα <br /> <br /> Bereken de positie van de diffractielijn op een Debye-Scherrer film<br /> (camerastraal=28,7mm en CuKα)<br /> <br /> Teken schematisch de film<br /> <br /> === Vragen eerste zit donderdag 22 juni 2006 (Fysica) ===<br /> *eerste vraag:<br /> Teken een ab-projectie van de ruimtegroep Pmcb<br /> en alles der op en der aan, puntgroep, patterson, equivalente posities...<br /> <br /> *Tweede vraag:<br /> Zijn volgende stellingen waar, verklaar:<br /> 1. kan men uit een diffractie patroon de aanwezigheid opmaken van een S4 as?<br /> 2. Is de R-waarde een maat voor de resolutie van een diffractie?<br /> 3. Is dit het NMR spectrum van ... (een onuitspreekbare naam)<br /> <br /> *Derde vraag:<br /> Oefeningen op een hexagonaal stelsel CadmiumdiJood met straling bepalen en uittekenen.&lt;/text&gt;</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Moleculaire_Architectuur&diff=3862 2024-01-28T09:36:24Z

<p>R0893094: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> Verplicht vak voor chemie. <br /> <br /> Dit vak wordt gegeven door professor Van Meervelt, hij is de aangenaamheid zelve op het examen!<br /> Zijn bijvragen zijn wel aan de moeilijke kant. Maar hij zal je altijd helpen de bijvragen beetje bij beetje op te lossen. Het examen duurt 4u.<br /> <br /> Kristallografie is het vak Moleculaire Architectuur, maar dan zonder NMR (het laatste hoofdstuk). Dit is eigenlijk de voorloper van moleculaire architectuur. Het wordt ook nu nog aan de geologen gegeven.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 27 januari 2024 ===<br /> # Hoe wordt de elektronendichtheid bepaald aan de hand van een diffractiepatroon. Geef de nodige formules en leg ook het faseprobleem en resolutie uit. (8p)<br /> # H NMR: Geef structuur, opsplitsingpatronen, chemische shift. Welke koolstof zou de grootste chemische shift hebben in C NMR?<br /> # Ruimtegroep Pcan. (8p)<br /> # Puntgroep van 2 moleculen bepalen (2p elk) en een vlakgroep (zoals bij die kunstwerken)<br /> # Gegeven atoomposities (0,0,0) en (1/2, 1/2, 1/2), tabel sin(thèta)/lambda, a = b en c waarden gegeven. De hoeken zijn 90°. Wat is het Bravaisrooster? Bereken de grootte van de intensiteit. Bereken afbuigingshoek bij CuK(alpha) straling. Wat is de kortste afstand in het kristalrooster? (6p)<br /> # MALDI-TOF, FT-IR en kubische dichste bolstapeling uitleggen + tekenen (6p)<br /> <br /> === 6 september 2023 ===<br /> # Wat is de zwaar atoom methode? Wanneer wordt deze gebruikt? Alternatief? (8p)<br /> # H NMR: C5H8O2, Geef structuur, opsplitsingpatronen, chemische shift, verwachtte C-NMR off-resonance spectrum met chemische shift en multipliciteit van de pieken.<br /> # Ruimtegroep Pnab. (8p)<br /> # Puntgroep van 2 moleculen bepalen (2p elk) 1 was over 4 isomeren trichloornaftaleen<br /> # Gegeven atoomposities, tabel sin(thèta)/lambda, a, c, gamma = 120°. Wat is het Bravaisrooster en bolstapeling? Bereken de grootte en de fase van de structuurfactor, bereken afbuigingshoek bij CuK(alpha) straling. Geldt de wet van Friedel hier? (6p)<br /> # EI en CI, verklaar waarom vC-H &gt; vC=O &gt; vC-C bij IR, hoe lading bepalen bij MS (6p)<br /> <br /> === 17 augustus 2023 ===<br /> # Bol van Ewald uitleggen + welke factoren hebben invloed + reciproke rooster uitleggen. (8p)<br /> # NMR: C5H8O2, Geef structuur, opsplitsingpatronen, chemische shift, verwachtte C-NMR off-resonance spectrum. + Wat zal er gebeuren als je druppel van D2O toevoegt. <br /> # Ruimtegroep Pnam. (8p)<br /> # Puntgroep van 2 moleculen bepalen (2p)<br /> # Atoomposities gegeven, bereken positie van atoom en de fase van de structuurfactor. (6p)<br /> # Dichtste bolstapeling, Mclafferty omlegging, ESI uitleggen + tekeningen (6p)<br /> <br /> === 28 januari 2023 ===<br /> # Hoe wordt de elektronendichtheid bepaald voor een kristalstructuur? Wat zijn de voorwaarden hiervoor en leg resolutie uit. (8 punten)<br /> # NMR: C11H12O2 (benzeen met olefine erop en een estergroep met daaraan een ethylgroep) (8 punten)<br /> # Ruimtegroep: Pcam [https://www.yumpu.com/nl/document/read/66391261/ruimtegroepen|Ruimtegroepen] (8 punten)<br /> # Puntgroep van 2 moleculen en 1 vlakgroep bepalen(zoals in de oefenzitting) (p4g) (beide 2 punten)<br /> # Atoomposities gegeven, bereken de fase van de structuurfactor, de afbuigingshoek, de intensiteit. Wat is het Bravaisrooster? Waar zouden de hoogste pieken liggen in de pattersonfunctie? Tabel met sin teta/lambda, fa en fb gegeven (6 punten)<br /> # MALDI-TOF en FT-IR, geef ook tekeningen (6 punten)<br /> <br /> === 18 Augustus 2022 ===<br /> # '''Zwaaratoommethode: wnr gebruikt? alternatief?'''<br /> # H-NMR<br /> # Ruimtegroep Pmcb<br /> # Puntgroep: kies 4 isomeren tetrachloornaftaleen<br /> # '''CsCl cel: vlak (110) -&gt; geef vlakgroep en symmetrie-elementen'''<br /> # CdI2: Geg: atoompos; a, c, gamma; tabel met sin(theta)/lambda t.o.v. fCd en fI<br /> ##Geef Bravais, bolstapeling<br /> ##Reflectie (110) -&gt; geef fase van F en afbuighoek bij gebruik CuKa<br /> ##Friedelproof?<br /> # McLafferty; vC-H &gt; vC-O &gt; vC-C (IR); lading bepalen (MS)<br /> === 29 januari 2022 ===<br /> # Wat is het &quot;faseprobleem&quot;? Hoe op te lossen?<br /> # H-NMR spectrum: Geef structuur, opsplitsingpatronen, chemische shift, verwachtte C-NMR off-resonance spectrum. <br /> # Ruimtegroep Pnca. [https://www.yumpu.com/nl/document/read/66391261/ruimtegroepen|Ruimtegroepen]<br /> # Puntgroepen van 2 moleculen bepalen. Punt- '''&amp; vlakgroep bepalen en tekenen van ijzer in het vlak (110)'''<br /> # Oefeningen waarbij posities van HgS zijn gegeven. Bepaal intensiteit bij F(200). Geef het bravais rooster. Bepaal de S-Hg binding-afstand.<br /> # ATR-IR, MALDI-TOF. Voor volle punten: voeg tekeningen van de apparaten toe. Het wordt niet gezegd, maar hij verwacht dat je het weet.<br /> <br /> === 16 augustus 2021 ===<br /> # A.d.h.v de elektronendichtheid een kristalstructuur bepalen (+ resolutie)<br /> # H-NMR spectrum van C6H6N2O2. Drie isomeren, drie spectra. Bepaal de structuur. Teken de opsplitsingspatronen. Bereken waar mogelijk de chemische shift m.b.v. het tabellenboek. Verschil in c13-nmr/IR spectra tussen isomeren?<br /> # Ruimtegroep Pcan. [https://www.yumpu.com/nl/document/read/66391261/ruimtegroepen|Ruimtegroepen]<br /> # Puntgroepen van 4 moleculen bepalen.<br /> # Oefening waarbij equivalente posities van Br gegeven zijn en pattersonpieken gegeven en hieruit de atoompositie van Br bepalen. Bepaal F020 en de fase.<br /> # Dichtste bolstapeling en &quot;hoe lading bij MS te weten komen&quot; uitleggen<br /> <br /> === 27 januari 2021 ===<br /> # constructie van ewald uitleggen + welke factoren hebben invloed<br /> # H-NMR spectrum van C11H12O2. Bepaal de structuur. Teken de opsplitsingspatronen. Bereken waar mogelijk de chemische shift m.b.v. het tabellenboek. Hoeveel pieken verwacht je in het c13-nmr spectrum?<br /> # Teken a,b-projectie van ruimtegroep Pbnm. Geef de equivalente posities, de multipliciteit en de asymmetrische eenheid. Geef 2 speciale posities en verklaar waarom ze speciaal zijn. Geef de puntgroep en de Pattersongroep. Bepaal de systematische afwezigheden. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid.[https://www.yumpu.com/nl/document/read/66391261/ruimtegroepen|Ruimtegroepen]<br /> # Puntgroepen van 4 moleculen bepalen.<br /> # Oefening waarbij equivalente posities van Pt gegeven zijn en pattersonpieken gegeven en hieruit de atoompositie van Pt bepalen. Bepaal F020 en de fase. Voldoet dit aan de wet van friedel?<br /> # MALDI-TOF en Mclafferty omlegging uitleggen <br /> <br /> ===6 januari 2021===<br /> # Leg uit de Pattersonfunctie uit. Zeg hoe ze berekend wordt, hoe ze kan bijdragen tot de bepaling van de kristalstructuur.<br /> # H-NMR spectrum van C5H8O2. Bepaal de structuur. Teken de opsplitsingspatronen. Bereken waar mogelijk de chemische shift m.b.v. het tabellenboek. Teken het verwachte off resonance C13-NMR spectrum met chemische shift waarde en multipliciteit van de pieken.<br /> # Teken a,b-projectie van ruimtegroep Pcnb. Geef de equivalente posities, de multipliciteit en de asymmetrische eenheid. Geef 2 speciale posities en verklaar waarom ze speciaal zijn. Geef de puntgroep en de Pattersongroep. Bepaal de systematische afwezigheden. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid. [https://www.yumpu.com/nl/document/read/66391261/ruimtegroepen|Ruimtegroepen]<br /> # Puntgroepen van 4 moleculen bepalen.<br /> # Atoomposities van PoCl2, tabel met f(Po) en f(Cl) in functie van sin0/λ gegeven. Bereken de fase van de structuurfactor voor reflectie 110. <br /> # ATR-IR en ESI uitleggen.<br /> <br /> ===13 augustus 2020===<br /> # Leg uit hoe men a.d.h.v. de elektronendichtheid een kristalstructuur exact kan bepalen<br /> # H-NMR spectrum van C5H10O. Bepaal de structuur. Teken de opsplitsingspatronen. Bereken waar mogelijk de chemische shift m.b.v. het tabellenboek. Teken het verwachte off resonance C13-NMR spectrum.<br /> # Teken a,b-projectie van ruimtegroep Pman. Geef de equivalente posities, de multipliciteit en de asymmetrische eenheid. Geef 2 speciale posities en verklaar waarom ze speciaal zijn. Geef de puntgroep en de Pattersongroep. Bepaal de systematische afwezigheden.<br /> # Puntgroepen van 4 moleculen bepalen.<br /> # Atoomposities van PbO gegeven. Bepaal de bravaisrooster, de symmetrie elementen die door O gaan, teken de pattersonfunctie en toon aan dat de intensiteiten van reflectie (200) gelijk is aan de intensiteit (020).<br /> # ATR-IR en ESI uitleggen.<br /> <br /> ===27 januari 2020 NM===<br /> # Leg uit hoe men a.d.h.v. de elektronendichtheid een kristalstructuur exact kan bepalen<br /> # Bespreek ionisatietechniekenen die gebruikt worden om een massaspectrum te bepalen<br /> # Teken a,b-projectie van ruimtegroep Pbna. Geef de equivalente posities, de multipliciteit en de asymmetrische eenheid. Geef 2 speciale posities en verklaar waarom ze speciaal zijn. Geef de puntgroep en de Pattersongroep. Bepaal de systematische afwezigheden.<br /> # Bepaal puntgroepen van verschillende aromaten. Teken de symmetrie-elementen.<br /> # Geef de opsplitsing van waterstofatomen in m-dichloorbenzeen. Chemische shift?<br /> # Lithiumfluoride kristalliseert in een kubisch kristal met a = 4 A volgens het NaCl-type (je zou moeten weten wat dit betekent). Afmetingen van het kristalrooster zijn gegeven. Als men bestraald met CuK straling bekomt men een diffractiepatroon. Welke reflecties hebben de grootste intensiteit, die van (300) of (400)? Wat gebeurt er met de afbuigingshoek en intensiteit als <br /> ##F vervangen wordt door I?<br /> ##de afmetingen van de eenheidscel verdubbelen?<br /> <br /> ===27 januari 2020 VM===<br /> # Leid de formule voor de structuurfactor af. Kan je deze ook experimenteel bepalen?<br /> # H-NMR spectrum van C6H6N2O2. Bepaal de structuur van de isomeren. Teken de opsplitsingspatronen.<br /> # Puntgroep Pbma. Geef de equivalente posities, de multipliciteit en de asymmetrische eenheid. Geef 2 speciale posities en verklaar waarom ze speciaal zijn. Geef de puntgroep en de Pattersongroep. Bepaal de systematische afwezigheden.<br /> # Bepaal de puntgroep van isomeren van trichloorbenzeen. Teken de symmetrie-elementen.<br /> # Gegeven zijn de posities van Ag en I in een AgI kristal met a = 6.5 A. Bepaal voor de reflectie (004) de fase van de structuurfactor, de intensiteit en de afbuighoek. Geef het Bravaisrooster.<br /> # Leg ATR-IR uit. Leg uit hoe we de lading kunnen bepalen bij massaspectrometrie.<br /> <br /> ===24 januari 2020===<br /> # Hoe kan men de kristalstructuur verder verfijnen?<br /> # NOE, NOESY, COSY<br /> # Ruimtegroep Pcmn met gewoonlijke bijvragen.<br /> # Gegeven de afmetingen van de eenheidscel en 2 atoomposities, bepaal de intensiteit en afbuigingshoek (2θ) van de reflecties (001) en (002) (tabel met sin θ/λ en f&lt;sub&gt;j&lt;/sub&gt; ook gegeven). Geef ook het Bravaisrooster.<br /> # 4 vormen van dioxine gegeven, duid alle symmetrie-elementen aan en bepaal de puntgroep.<br /> # Begrippen: Laue groep ; EI en CI (massaspectrometrie)<br /> <br /> ===16 januari 2020===<br /> # Leid de structuurfactor af. Kan deze ook experimenteel bepaald worden? (mondeling)<br /> # Gegeven C5H10O H-NMR spectrum, bepaal de structuur van de chemische stof die dit spectrum geeft. (mondeling). Er is D2O-shake, dus de O die voorkomt is in de vorm van -OH.<br /> # Ruimtegroep Pmca, gebruikelijke bijvragen.<br /> # Pattersonfunctie Oefening met intensiteit enzo berekenen. Structuur was op eerste zicht niet centrosymmetrisch, maar was het wel met andere oorsprong.<br /> # Wat is de vlakgroep van het (110) vlak van NaCl? Teken en geef alle symmetrie-elementen.<br /> # Begrippen: MALDI-TOF, verklaar waarom CH &gt; C=O &gt; C-C (bij IR)<br /> <br /> ===13 januari 2020 - namiddag===<br /> #Theorie: Leg de contructie van Ewald uit. Welke factoren hebben hier invloed op? Bijvraag: moet je alle reciproke roosterpunten meten? (Neeh, n-tallige assen/symmetrie)<br /> #Theorie: H-NMR gegeven van C10H13NO2. Bijvragen over welke pieken we zouden zien bij IR, hoe je de koppelingsconstante kan bepalen.<br /> #Puntgroep Pcmb met gebruikelijke bijvragen<br /> #Oefening: Verschillende puntgroepen geven van de isomeren van tetrachloorkubaan.<br /> #Oefening: Platinacomplex met ruimtegroep Pc1/m, posities gegeven in de ruimtegroep ( xyz, -x-y-z...) en coördinaten gegeven van zwaarste atomen in Patterson. Bepaal de positie van Pt, wat is de fase bij structuurfactor F(020), geldt de wet van Friedel? <br /> #Begrippen: McLafferty omlegging + hexagonale en kubische dichtste bolstapeling uitleggen<br /> <br /> ===13 januari 2020 - voormiddag===<br /> #Theorie: Hoe wordt het principe van Fourier synthese toegepast in de kristalstructuurbepaling?<br /> #Theorie: NOE, NOESY en COSY<br /> #Puntgroep Pmcb met gebruikelijke bijvragen<br /> #Oefening: Puntgroepen van vier structuren<br /> #Oefening: CdI2: Bravaisrooster bepalen, voor structuurfactor fase bepalen en afbuigingshoek als CuK(alfa) straling gebruikt wordt, geldt wet van Friedel? <br /> #Begrippen: ATR-IR + ESI uitleggen<br /> <br /> ===26 augustus 2019===<br /> #Theorie: Hoe wordt het principe van Fourier synthese toegepast in de kristalstructuurbepaling?<br /> #NMR-vraag: 3 verschillende H-NMR spectra van isomeren met brutoformule C6H8N2O2. Teken ook de opsplitsingspatronen.<br /> #Puntgroep Pcnb met gebruikelijke bijvragen<br /> #Oefening: Vlakgroep vlak 110 NaCl. Geef alle symmetrie-elementen.<br /> #Oefening: Bepaal de fase en intensiteit van PoCl2 in de reflectie (110). Gegeven zijn de atoomposities en de karakteristieke straling.<br /> #Begrippen: ESI + CuKalfa uitleggen<br /> <br /> ===28 januari 2019===<br /> #Hoe kan je een model verbeteren na het oplossen van het faseprobleem?<br /> #H-NMR van C5H8O2 bijvragen over IR.<br /> #Pmcn met bijvragen.<br /> #puntgroep van 4 isomeren van dioxine.<br /> #AgI posities van de atomen gegeven (breuken) a=6.50 A. tabel met sin(theta)/lambda gegeven voor fAg en fI. Bravais rooster geven, fase, hoek en intensiteit berekenen.<br /> #ATR-IR en ESI.<br /> ===17 januari 2019===<br /> #Geef de afleiding van de structuurfactor. Is deze experimenteel te bepalen? <br /> #H1-NMR van C10H13NO2 (Bijvragen over IR: wat als we van dit molecule een IR spectrum zouden opnemen? Waar zien we dan pieken? Welke zijn sterk? Welke niet?)<br /> #Ruimtegroep Pnam met bijgvragen <br /> #Puntgroep bepalen van de isomeren van tetrachloorkubaan (molecuulmodelletje gegeven)<br /> #Rood loodoxide PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel<br /> a=3,975 A en c=5,023 Atomen liggen op de posities: <br /> Pb(1): 0 ½ 0.2385 <br /> Pb(2): ½ 0 -0.2385 <br /> O(1): 0 0 0 <br /> O(2): ½ ½ 0 <br /> Wat is het Bravaisrooster? Welke symmetrie-elementen gaan door O2? Construeer de pattersonfunctie. Waar vinden we de sterkste pieken? Toon aan dat de intenstiteit van reflectie 200 en 020 gelijk is. <br /> #Mclafferty omlegging en kubische en hexagonale dichtste bolstapeling. <br /> ===14 januari 2019===<br /> # Hoe kan men met de Pattersonfunctie het faseprobleem oplossen? (mondeling)<br /> # NOE en NOESY, COSY (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pman met bijvragen<br /> # Puntgroepen van 4 verschillende aromaten<br /> # CdI2: Bravaisrooster bepalen, voor structuurfactor fase bepalen en afbuigingshoek als CuK(alfa) straling gebruikt wordt, maxima van de Pattersonfunctie geven<br /> # MALDI-TOF uitleggen en golfgetallen vergelijken bij IR spectroscopie<br /> <br /> === 4 september 2018===<br /> # Geef de contructie van Ewald<br /> # H-NMR van C10H12O3<br /> # Ruimtegroep Pcnb<br /> # Geef de puntgroep van 4 isomeren van tetrachloornaftaleen die aanleiding geven tot een andere puntgroep. <br /> # PbO kristaliseert uit in eenheidscel met gegeven dimensies en atoomposities. Gevraagd: Construeer de pattersonfunctie, waar zijn de sterkste pieken? Tot welk Bravais rooster behoort dit? Wat is de afbuighoek van het 110 vlak met CuKalfa? <br /> # Begrippen: Kubisch en hexagonale dichtste bolstapeling + McLafferty omlegging<br /> <br /> ===27 augustus 2018===<br /> # Hoe kan men het faseprobleem oplossen met behulp van de Pattersonfunctie? (dus ook uitleggen wat faseprobleem is, formule van pattersonfunctie geven,...) (mondeling)<br /> # Gegeven drie H-NMR spectra, alle drie C6H6N2O2, bepaal structuren, en verklaar de verschillende spectra (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pcmn met alle gebruikelijke vragen<br /> # Bepaal tot welke puntgroepen de isomeren van trichloorbenzeen behoren, teken alle symmetrie-elementen<br /> # Oefening met CdI2, bepaal fasehoek van de reflectie op (110) en afbuighoek theta, tot welk bravais rooster behoort dit? Waar bevinden zich de maxima bij de Pattersonfunctie?<br /> # Begrippen: MALDI-TOF, Laue groep<br /> <br /> ===15 juni 2018===<br /> # Leid de structuurfactor af. Kan deze ook experimenteel bepaald worden? (mondeling)<br /> # Gegeven een H-NMR spectrum, bepaal de structuur van de chemische stof die dit spectrum geeft. (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pmca, gebruikelijke bijvragen.<br /> # Oefening met intensiteit enzo berekenen. Structuur was op eerste zicht niet centrosymmetrisch, maar was het wel met andere oorsprong.<br /> # Wat is de vlakgroep van het (110) vlak van NaCl? Teken en geef alle symmetrie-elementen.<br /> # Begrippen: MALDI-TOF, kubisch dichtste bolstapeling<br /> <br /> ===11 juni 2018===<br /> # Waarom Pattersonfunctie belangrijk bij het faseprobleem?<br /> # NMR: C10H1202<br /> # Ruimtegroep Pbab met alle bijhorende vragen<br /> # Puntgroepen geven van 4 verschillende aromatische verbindingen + symmetrie elementen aanduiden<br /> # Oefening waarbij celparameters en 2 atomen gegeven zijn. Intensiteit en afbuighoek berekenen voor (001) en (002). Tot welk Bravais rooster gehoord deze kristalstructuur? <br /> # Begrippen: CuKalfa en ESI<br /> <br /> ===27 juni 2017===<br /> # Stappen van kristalstructuurbepaling<br /> # NMR, een piek waar bij stond deze verdwijnt bij schudden met D2O, bijvraag waarom deze piek verdwijnt, ook bijvragen over C13 NMR en IR<br /> # Ruimtegroep Pcmm en bijvragen<br /> # Vlakgroep vlak 110 NaCl<br /> # Bepalen van intensiteit reflectie van vlak 200, lengte en fractionele coördinaten gegeven<br /> # Beschrijf MALDI-TOF en kubisch dichtste bolstapeling<br /> <br /> ===22 juni 2017 NM===<br /> # Structuurverfijning van kristalstructuurbepaling<br /> # Leg uit: NOE en NOESY<br /> # Ruimtegroep Pcan met alle bijhorende vragen<br /> # Oefening waar 4 moleculen stonden waarvan je de puntgroep moest bepalen<br /> # Oefening met tabel Sintheta/golflengte- intensiteit en hoek 2theta bepalen<br /> # begrippen: CuKalfa en Resolutie <br /> <br /> === 16 juni 2017 NM===<br /> #Hoe Faseprobleem oplossen met Patterson functie <br /> #1H- Nmr ( bijvragen : welke piek is het belangrijkst bij IR-spectra , hoeveel pieken zullen er zijn bij C13,..) <br /> #Ruimtegroep ( ik dacht Pbmn )<br /> #Intensiteit bepalen en afbuighoek bepalen <br /> #Puntgroep van tetrachloornaftaleen ( eerst isomeren geven en van elk isomeer puntgroep bepalen) <br /> #Mc-lafferty omlegging<br /> #chemische ionisatie<br /> ===16 juni 2017 VM===<br /> #leid de formule voor de structuurfactor af en vertel hoe je deze experimenteel kan bepalen.<br /> #Geef alle ionisatie technieken gebruikt in MS.<br /> #Puntgroep Pbcm met gebruikelijke bijvragen<br /> #Geef de puntgroepen van alle isomeren van tetrachloor kubaan en teken de symmetrie elementen<br /> #verklaar chemische shift, koppelingsconstante en shift reagens<br /> ===12 juni 2017===<br /> #leg constructie van Ewald uit<br /> #nmr spectra (geef structuur molecule ) C10H12O3<br /> #ruimtegroep Pncm met alle bijhorende vraagjes (asymmetrische eenheid, multipliciteit, equivaltente posities, patterson, puntgroep, systematische afwezigheden)<br /> #Vlakgroep van (110) vlak van ijzer. Geef alle symmetrie elementen<br /> #oefening ivm fase berekenen en intensiteit (CdI2, sin(theta)/golflengte is gegeven, bepaal fCd, fI en zo de rest)<br /> #begrippen: ESI &amp; Wet van Friedel<br /> <br /> ===21 augustus 2015===<br /> # stappen van de kristalstructuur bepaling<br /> # Welke methode voor ionisatie worden er gebruikt bij massaspectroscopie<br /> # Pcan (met alle gebruikelijke bijvraagjes)<br /> # Vlakgroep van (110) vlak van ijzer. Geef alle symmetrie elementen<br /> # PoCL2: ge krijgt Sin theta/lambda en uw celafmetingen, geef Fhkl, Ihkl en uw hoek<br /> # Bespreek de termen chemische shift, koppelingsconstante en shiftreagens<br /> <br /> === 18 augustus 2015 vm ===<br /> # leg het principe van uit van verfijning van een kristalstructuur<br /> # leg volgende begrippen uit: NOE en NOESY<br /> # ruimtegroep Pbmn en alle vraagjes zoals altijd<br /> # puntgroepen geven 4 isomeren van een of ander molecule<br /> # voor een bepaalde reflectie de fase van de structuurfactor berekenen en de intensiteit<br /> # 2 stellingen (juist of fout):<br /> #* Bij een ESI spectrum zijn er geen fragmentaties<br /> #* Bij kubische dichtste bolstapeling liggen alle atomen op speciale posities<br /> === 24 juni 2015 ===<br /> # Nmr spectra<br /> # verfijning van kristalstructuur<br /> # Vlak groep van ijzer<br /> # Ruimte groep Pcan + al die bijvragen<br /> # Oefening sin theta/lambda. ..<br /> # 2 stellingen: <br /> #* esi heeft geen fragmentaties<br /> #* In ccp liggen alle atomen op speciale posities<br /> <br /> === 18 juni 2015 ===<br /> # Hoe kunnen we met behulp van de pattersonfunctie het faseprobleem oplossen?<br /> # Leg uit NOE en NOESY<br /> # puntgroep Pbmn<br /> # Bepaal de puntgroep van de isomeren van tetrachloorkubaan en duid alle symmetrie-elementen aan<br /> # Bereken de fase van de structuurfactor en de intensiteit voor CdI2 met <br /> #* Eenheidscel a=4,24 A, c=6,86 A, gamma=120°<br /> #* Posities: Cd 0 0 0, I(1) 2/3 1/3 1/4, I(2) 1/3 2/3 3/4<br /> #* sin theta/lamba 0,0 0,1 0,2 0,3 fCd 48 44,58 38,44 33,22 fI 53 49,36 42,79 37,14<br /> # Verklaar de begrippen CuKalfa en resolutie<br /> <br /> === 9 juni 2015 vm ===<br /> # Leid de uitdrukking van de structuurfactor af. Hoe kan je de structuurfactor experimenteel bepalen?<br /> # H-NMR spectra van 3 isomeren C6H6N2O2<br /> # Ruimtegroep Pncm<br /> #* Equivalente posities<br /> #* multipliciteit<br /> #* asymmetrische eenheid<br /> #* Geef 2 speciale posities (waarom speciaal?)<br /> #* van welke puntgroep afgeleid?<br /> #* Pattersongroep?<br /> #*Systematische afwezigheden<br /> # Bepaal de puntgroep van verschillende isomeren van tetrachloornaftaleen. Duid de symmetrie elementen aan.<br /> # Rood Loodoxide PbO kristalliseert in tetragonale eenheidscel a= 3.975 c= 5.023<br /> #* Waar vind je in Pattersonfunctie sterkste pieken?<br /> # Leg uit : ESI en ATR-IR<br /> <br /> ===25 juni 2014===<br /> #Geef de stappen voor kristalstructuurbepaling (mondeling)<br /> #Wat is NOE? (mondeling)<br /> #Ruimtegroep Pcnb<br /> #Geef puntgroep van alle isomeren van tetrachloorkubaan<br /> #Intensiteit van In en afbuighoek: vormfactor, atoomposities zijn gegeven<br /> #Stellingen<br /> #*Bij ESI is geen fragmentatie<br /> #*Bij kubisch dichtste bolstapeling liggen de atomen op speciale posities<br /> <br /> ===13 juni 2014===<br /> # Hoe kunnen we met behulp van de pattersonfunctie het faseprobleem oplossen? (mondeling)<br /> # NMR spectrum met gesubstitueerde benzeenring (mondeling)<br /> # Ruimtegroep Pbnm met alle typische bijvragen (asymmetrische eenheid, speciale posities + waarom ze speciaal zijn, pattersongroep, puntgroep en systematische afwezigheden)<br /> # Geef de vlakgroep van (110) van ijzer<br /> # Oefening op structuurfactor. Vormfactoren met bijhorende sin(θ)/λ zijn gegeven, net als de fractionele coördinaten en de grootte van de eenheidscel<br /> # Wat is ESI?<br /> <br /> ===13 juni 2013===<br /> # Ruimtegroep Pbmb.<br /> # Wat is de vlakgroep van het vlak (110) in de ijzerstructuur?<br /> # NMR-spectrum gegeven. Stelling: Bevat dit spectrum een AX6 systeem?<br /> # Leg volgende begrippen uit: Laue groep, resolutie, temperatuursfactor.<br /> # Gegeven: posities van In en celparameters (a en c). Teken een a,b-projectie van de eenheidscel. Welk Bravais-rooster heeft de cel? Bepaal de afbuighoek 2theta en de intensiteit van de reflecties (001) en (002). Wat is de puntgroep rond de middelste In? Waar bevinden zich de hoogste Pattersonpieken?<br /> <br /> ===10 juni 2013===<br /> # Teken ruimtegroep Pbnb (ab-projectie) en geef equivalente posities, speciale posities, systematische afwezigheden, puntgroep waarvan de ruimtegroep is afgeleid en asymetrische eenheid. (Schriftelijk, na 1 uur af te geven.)<br /> # Wat is de vlakgroep van het vlak (110) in de platina-strucuur? (Structuur is dus van buiten te kennen!) Bijvraag: is dit vlak de eenheidscel van de vlakgroep? (Mondeling)<br /> # Bespreek: voor ethylisobutyraat (spectrum en structuur gegeven) is een ontkoppelingsexperiment niet mogelijk. Bijvragen: hoe bepalen we de frequentie die we moeten gebruiken voor het ontkoppelingsexperiment? Link de verschillende pieken aan de verschillende groepen. (Mondeling)<br /> # Leg de Ewald-constructie uit. Bijvraag: wat gebeurt er als we het kristal draaien? (Mondeling)<br /> # Gegeven: posities van Mo en Ni in een MoNi4-legering en parameters a en c. Teken een a,b-projectie van de eenheidscel. Welk Bravais-rooster heeft de cel? Bepaal de 2-theta en de intensiteit van de reflectie (002). Wat is de puntgroep rond Mo? Geef de hoogste pattersonpieken.<br /> <br /> ===16 juni 2011===<br /> # Teken ruimtegroep Pmcn (ab-projectie) en geef equivalente posities, puntgroep waar deze ruimtegroep van is afgeleid, asymmetrische eenheid, 2 speciale posities en bijhorende Pattersongroep. Zijn er systematische afwezigheden?<br /> # Stellingen:<br /> #* Het vlak (110) wordt bij Fe en bij NaCl beschreven door dezelfde vlakgroep<br /> #* Bij een goed verfijnde structuur zijn de pieken op de verschilfourier te verwaarlozen<br /> #* Voor de waterstofatomen met delta 6,8 is een ontkoppelingsexperiment niet mogelijk (NMR-spectrum van ethyl-4-methoxybenzoaat gegeven, het gaat om de waterstoffen op C3 en C5 van de benzeenring). <br /> # Oefening: PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel, a en c gegeven. Twee posities voor Pb en voor O gegeven. Teken de ab-projectie. Door welke puntgroep wordt de geometrie rond de Pb-atomen beschreven? Door welk Bravaisrooster wordt het kristal beschreven? Bepaal de fase van de intensiteit van afgebogen stralingsbundel voor het vlak (110) voor CuK-alpha (tabel met enkele waarden gegeven voor f van Pb en O ifv sin(theta)/lambda). Teken het vlak (110) en de invallende en afgebogen stralingsbundel op de tekening.<br /> <br /> ===10 juni 2010 (NM)===<br /> # Teken ruimtegroep Pmnb en klassieke vragen: equivalente posities, 2 speciale posities, systematische afwezigheden, asymmetrische eenheid, puntgroep,..<br /> # Stellingen:<br /> #* De temperatuur heeft geen invloed op de kristalstructuurbepaling.<br /> #* Het is niet mogelijk om P2 en Pm van elkaar te onderscheiden met behulp van intensiteitsmetingen.<br /> # NMR-spectrum en bepalen of het overeenkomt met het gegeven molecule.<br /> # Oefening: AgI kristal, a= 6,50 Angstrom, coordinaten van atomen zijn gegeven, en tabel van f ifv sin/lambda.<br /> #* Geef a,b-projectie + Bravaisrooster<br /> #* Bereken Intensiteit en bereken afbuighoek van vlak 004<br /> #* Geef puntsymmetrie rond Ag en rond I<br /> #* Waar verwacht je de hoogste Pattersonpieken?<br /> <br /> ===23 juni 2009===<br /> # teken ruimtegroep (Pnca dacht ik) &amp;amp; geef eq. posities, 2 speciale posities, syst. afwezigheden, puntgroep, ...<br /> # Stellingen:<br /> #* rotatiesymmetrie kan bepaald worden via rotatiediffractie(dat een ding waar ge een kristal draait, ik ben niet meer zeker of dat zo heet)<br /> #* bij verschilelektronendichtheidsmap gaat de hoogte van de pieken verloren bij verfijning (ofzoiets toch)<br /> # NMR van 1,1-dimethoxyethaan<br /> # Oefening: alfa-uranium heeft volgende coordinaten op speciale posities: +-(0,y,1/4) +-(1/2,1/2-y,-1/4) a b en c gegeven(3 verschillende waarden) 2 groottes van structuurfactoren gegeven en de fu in functie van sin(theta).<br /> #* y is 0.10 of 0.15, bepaal dit met bhv de gegevens. <br /> #* Teken een a,b-projectie. <br /> #* Beschrijf de omringing van het U-atoom via de puntgroep van het atoom. <br /> #* Teken de pattersongroep.<br /> ===17 juni 2009===<br /> # Ruimtegroep Pcan: equivalente posities, multipliciteit, asymmetrische eenheid, 2 speciale posities, puntgroep, systematische afwezigheden<br /> # Stellingen<br /> #* De temperatuurfactoren van Pt in een Pt-kristal zijn isotroop (Antwoord: Waar want ze liggen op speciale posities)<br /> #* De symmetrie van een diffractiepatroon van een kristal wordt bepaald door de ruimtegroep<br /> #* NMR: aspirine<br /> # Oefening: Nikkelarsenide (a, c en gamma=120° is gegeven) De posities van Nikkel en van arseen zijn ook gegeven. <br /> #* Geef de ab-projectie, bravais rooster, wat is de stapeling van Arseen, puntgroep rond Arseen en rond nikkel <br /> #* Bij reflecties (200), (300) en (030) en Cu K-alfa straling<br /> #** Voorspel de hoogste intensiteit<br /> #** Voorspel de grootste afbuighoeken<br /> #* Wat is de resolutie bij een afbuighoek van 100° en bij Cu K-alfa straling<br /> <br /> === 15 juni 2009 ===<br /> # Ruimtegroep (ik denk Pbmn) met klassieke vragen<br /> # Stellingen<br /> #* Pm en Cm hebben dezelfde Harkersecties<br /> #* Cobalt kan geïoniseerd worden met Cu K alfa straling<br /> #* NMR<br /> # Oefening: HgS met coördinaten Hg en S gegeven. Alle elementen geven van 11 juni op uitzondering van de afbuighoek en dit voor de vlakken 200 en 400. <br /> <br /> === 11 juni 2009 ===<br /> # Ruimtegroep + asymmetrische eenheid + 2 speciale posities + iets met systematische afwezigheden<br /> # Stellingen<br /> #* Het 110 vlak van Fe vertoont C4v (Bijvragen: aantonen op modellekes)<br /> #* De atomen bij hexagonale dichtste bolstapeling liggen allemaal op speciale posities (Bijvraag: Hij vraagt om de kubische bolstapeling te laten zien, met die pingpongballetjes en hoe heten de ruimtes tussen die pingpongballekes) <br /> #* NMR: een benzeen met een chloor op en op para positie iets me een ethyl en een keton (Bijvraag: hoe zie je dat het een spectrum van de 1ste orde of 2de orde is)<br /> # Oefening: ik kreeg een tabel met fractionele coördinaten van ReO3 en zo'n tabel met sin (theta) / lamda en vormfactoren. Ik moest een ab projectie tekenen, bravais rooster geven, intensiteit berekenen, afbuighoek bepalen, hoogste pattersonpieken voorspellen.<br /> <br /> === 24 juni 2008 ===<br /> # Pmca met klassieke vragen<br /> # Stellingen<br /> #* Alle atomen van sfaleriet bezetten speciale posities<br /> #* Een kristalrooster kan ondubbelzinnig bepaald worden adhv systematische afwezigheden<br /> #* isopropyltolueen<br /> # Wolfraam-rooster en CuKa straling, vlakken (211) en (310)<br /> #* teken 3D-rooster en duidt [sic] vlakken aan<br /> #* Welke intensiteit is sterkst, bij (221) of bij (310)<br /> #* Welke reflectiehoek is grootst, bij (221) of bij (310)<br /> #* Welke zijn de sterkste Pattersonpieken?<br /> <br /> === 19 juni 2008 ===<br /> # Pbmn tekenen + assym. eenheid + equi. pos. + multipliciteit + 2 speciale pos. + Systematische afwezigheden + van welke puntgroep<br /> # Stellingen<br /> #* De temp. heeft geen invloed op het diffractiepatroon<br /> #* De vlakken 001 en 110 van Fe hebben dezelfde vlakgroep (ook zeggen welke vlakgroep(en))<br /> #* NMR<br /> #De structuur van LiF en NaCl is dezelfde, a = ...., kristalafmeting 0,2mmx0,2mmx0,2mm en wordt bestraald met Cu kalfa. Bereken F003 en F004. Welke intensiteit is het hoogst? Wat gebeurt er met de diffractiehoek en de intensiteit als je:<br /> #*F vervangt door I<br /> #*de cel verdubbeld<br /> #*Waar verwacht je de sterkste Pattersonpieken<br /> <br /> === 19 juni 2008 ===<br /> # P nmb tekenen + puntgroep + asymetrische eenheid + equi posities<br /> # stellingen ( waar of niet waar )<br /> #* Pm en Cm hebben dezelfde harkersecties<br /> #* R staat voor de resolutie van een structuurbepaling<br /> #* spectrum en molecule gegeven, horen ze bij elkaar?<br /> # oefening : NH4HgCl3 heeft eenheidscel a = ... c =... en atoomposities N, Hg en 3 Cl-en gegeven: (ook alpha-Cu straling zoda je uw lambda ook kent) (tabel sin(theta)/lambda en f waarden van Cl, Hg en N gegeven)<br /> #* geef (a,b) projectie van eenheidscel<br /> #* bepaal Bravais rooster<br /> #* bepaal intensiteit en afbuigrichting 2theta van de reflectie (004)<br /> #* Hg door welke puntgroep omringt<br /> <br /> ===23 juni 2008===<br /> #Ruimtegroep tekenen. In dit geval Pman. Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?<br /> #Bespreek volgende stellingen. Geef telkens ook een korte motivatie:<br /> #*Op basis van systematische afwezigheden kan geen verschil gemaakt worden tussen de ruimtegroepen P2 en P2/m.<br /> #*De temperatuurfactoren van &amp;lt;math&amp;gt;\alpha&amp;lt;/math&amp;gt;-Fe zijn isotroop.<br /> #*NMR-spectrum en molecule. Kunnen die bij elkaar horen?<br /> #kristal met Li2O met één lengte gegeven (kubisch dus) <br /> #*teken ab projectie gegeven zijn de posities van de atomen<br /> #*geef puntgroep rond Li en O<br /> #*geef bravais rooster<br /> #*twee vlakken gegeven welke grootste hoek en welke grootste intensiteit<br /> #*waar bevinden zich de grootste patterson pieken<br /> <br /> ===27 juni 2007===<br /> #Ruimtegroep tekenen. Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?<br /> #Bespreek volgende stellingen. Geef telkens ook een korte motivatie:<br /> #*Op basis van systematische afwezigheden kan geen verschil gemaakt worden tussen de ruimtegroepen P2 en P2/m.<br /> #*De temperatuurfactoren van &amp;lt;math&amp;gt;\alpha&amp;lt;/math&amp;gt;-Fe zijn isotroop.<br /> #*NMR-spectrum en molecule. Kunnen die bij elkaar horen?<br /> #Typische gecombineerde oefening. Diffractiemeting op wolfraam met Cu-&amp;lt;math&amp;gt;\alpha&amp;lt;/math&amp;gt; straling. Beschouw vlakken (211) en (310). Een tabel met &amp;lt;math&amp;gt;\frac{\sin \theta}{\lambda}&amp;lt;/math&amp;gt; waarden is gegeven.<br /> #*Teken het reële rooster en duidt de vlakken aan.<br /> #*Teken ab-projectie van het reciproke rooster, en duidt hier ook de vlakken aan.<br /> #*Voor welk vlak verwacht je de grootste reflectiehoek.<br /> #*Voor welk vlak verwacht je de grootste intensiteit.<br /> <br /> ===Vragen eerste zit vrijdag 30 juni 2006 (Fysica)===<br /> #Teken Pbna (ab-projectie). Geef equivalente posities, multipliciteit, twee speciale posities en de asymetrische eenheid. Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid? Welke Pattersongroep?<br /> #Zijn volgende stellingen waar of vals?<br /> #*Omgeving van een bol in hexagonaal dichtste bolstapeling is C3h.<br /> #*&amp;lt;math&amp;gt;P2_1&amp;lt;/math&amp;gt; en &amp;lt;math&amp;gt;P2_1/m&amp;lt;/math&amp;gt; zijn niet te onderscheiden met behulp van de speciale posities.<br /> #*Dit is het NMR-spectrum van... (iets ingewikkeld)<br /> #LiF kristalliseert zoals NaCl in kubische cel met parameter a = 0,4026 nm. We gebruiken CuKa straling en een kristal met dimensie 0,2x0,2x0,2.<br /> #*Geef de ab-projectie van de structuur.<br /> #*Geef de reciproke parameters.<br /> #*netvlakken 003 en 004: welke heeft grootste intensiteit van de gereflecteerde straal?<br /> #*Wat gebeurt met deze reflecties (dus hoek, intensiteit, fase) als we F vervangen door I. Wat gebeurt er als we de afmetingen van het kristal verdubbelen?<br /> #*Welke zijn de grootste pieken in de Pattersonfunctie?<br /> <br /> === Vragen eerste zit dinsdag 27 juni 2006 (Geologie) ===<br /> (dit waren vragen van geologie, zij hebben ook een deel poederdiffractie dat voor fysici niet gekend hoeft te zijn)<br /> <br /> *teken de ruimtegroep Pncm (a,b-projectie)<br /> Geef equivalente posities, multipliciteit en assymmetrische eenheid<br /> <br /> Van welke puntgroep is deze ruimtegroep afgeleid?<br /> <br /> Geef twee speciale posities<br /> <br /> *stellingen:<br /> De atomen in perovskiet liggen allemaal op speciale posities<br /> <br /> De ruimtegroepen P2/c en Pc behoren tot zelfde pattersongroep<br /> <br /> *loodoxide PbO kristalliseert in een tetragonale eenheidscel<br /> a=3,975 A en c=5,023 A<br /> atomen liggen op de posities:<br /> Pb(1): 0 ½ 0.2385<br /> Pb(2): ½ 0 -0.2385<br /> O(1): 0 0 0<br /> O(2): ½ ½ 0<br /> Teken een a,b-projectie van de eenheidscel en beschrijf de omringing van de loodatomen met behulp van een puntgroep<br /> <br /> Welk Bravaisrooster?<br /> <br /> Bepaal voor de reflectie (110) de fase van de structuurfactor en intensiteit<br /> Teken het vlak (110) en de invallende en afgebogen bundel bij op de a,b-projectie bij gebruik van CuKα <br /> <br /> Bereken de positie van de diffractielijn op een Debye-Scherrer film<br /> (camerastraal=28,7mm en CuKα)<br /> <br /> Teken schematisch de film<br /> <br /> === Vragen eerste zit donderdag 22 juni 2006 (Fysica) ===<br /> *eerste vraag:<br /> Teken een ab-projectie van de ruimtegroep Pmcb<br /> en alles der op en der aan, puntgroep, patterson, equivalente posities...<br /> <br /> *Tweede vraag:<br /> Zijn volgende stellingen waar, verklaar:<br /> 1. kan men uit een diffractie patroon de aanwezigheid opmaken van een S4 as?<br /> 2. Is de R-waarde een maat voor de resolutie van een diffractie?<br /> 3. Is dit het NMR spectrum van ... (een onuitspreekbare naam)<br /> <br /> *Derde vraag:<br /> Oefeningen op een hexagonaal stelsel CadmiumdiJood met straling bepalen en uittekenen.&lt;/text&gt;</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Chemische_Thermodynamica&diff=3816 2024-01-23T09:01:35Z

<p>R0893094: /* 23 januari 2024 NM */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Zowel gevolgd door chemie als biochemie, tegenwoordig in het derde jaar voor biochemie en tweede jaar chemie. Een 'mondeling' examen met schriftelijke voorbereiding. In theorie want in praktijk verloopt het examen zonder veel woorden. De examenstructuur is altijd dezelfde: 3 theorievragen en 2 oefeningen, waarvan één altijd gaat over entropieverandering. Sinds 2012-2013 komt één van de theorievragen uit één van de artikels die je vooraf moest lezen, enkel deze vraag wordt mondeling besproken.<br /> Het vak wordt gedoceerd door professor Thierry Verbiest, oefenzittingen werden vroeger gegeven door de zo mogelijk nog sympathiekere Maarten Vanbel.<br /> <br /> '''Alle vragen van het einde van elk hoofdstuk (Elisabeth I.):'''<br /> https://drive.google.com/file/d/1J_23Lh2eyP2lzxUNz9JKv4si8D7028PJ/view?usp=sharing<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 23 januari 2024 NM ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> Bijvragen over de CMC, opbouw micellen en amfifiele moleculen, wat is de 2e hoofdwet van thermodynamica &amp; het verband met gibbs...<br /> # Carnot cyclus en omgekeerde Carnot cyclus<br /> #*Toon aan dat DU = 0 en DS = 0 voor de Carnot cyclus.<br /> #*Teken de Carnot cyclus in een T-S diagramma.<br /> #*Wanneer is het rendement van een warmtepomp het hoogst?In de winter of in <br /> de zomer? Verklaar je antwoord.<br /> #Waar of niet waar? Verklaar kort je antwoord.<br /> #*Bij een expansie van een ideaal gas in vacuüm is dU steeds gelijk aan nul.<br /> #*Het volume is een exacte differentiaal.<br /> #*Dichtheid is een extensieve grootheid.<br /> #*Bij een isotherm proces is dW = 0.<br /> #Micelvorming: leg uit hoe je ∆G°, ∆H° en ∆S° kan bepalen als je de kritische<br /> micelconcentratie kent. Leid de relevante formules af.<br /> #Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar. <br /> #*Bereken U, q en W<br /> #*Bereken ∆S(systeem)<br /> #*Bereken ∆G<br /> #Oefening: Tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.<br /> #* Wat is de vormingsenthalpie<br /> #* Wat is de normale kooktemperatuur<br /> #* Wat is de druk in het tripelpunt<br /> <br /> === 15 januari 2024 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> Bijvragen over de CMC, opbouw micellen en amfifiele moleculen, wat is de 2e hoofdwet van thermodynamica &amp; het verband met gibbs...<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Waar of niet waar?<br /> #*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij<br /> #*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.<br /> #*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning<br /> #*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.<br /> #Oefening: Bereken de molaire massa van creatine gegeven dat de osmotische druk van je 0.1g/l creatine-oplossing 13 torr bedroeg in vergelijking met water bij 25°C.<br /> #Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar. <br /> #*Bereken U, q en W<br /> #*Bereken &amp;Delta;S(systeem)<br /> #*Bereken &amp;Delta;G<br /> <br /> === 12 januari 2024 ===<br /> #OPDRACHT: vuurpomp<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).<br /> #*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom<br /> #*Bijvragen komen letterlijk uit de vragen dat je moet leren voor hoofdstuk 3 (enige dat ik daar verschillend van had: wat gebeurd er als je bij een reversibel proces iets klein aanpast zoals het teken van uw volumeverandering aanpassen compressie &lt;-&gt; expansie)<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer kort je antwoord.<br /> #*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.<br /> #*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenene.<br /> #*De elektrochemische potentiaal is hetzelfde als de chemische potentiaal.<br /> #oefening 1: isotherme expansie van 3 atm naar 1 atm bij een temperatuur van 37°C. Geef de entropie van de omgeving en van het systeem in volgende gevallen:<br /> #*Reversibele expansie<br /> #*Irreversibel tegen een uitwendige druk van 1 atm<br /> #oefening 2: je hebt een moedercel met straal 1 µm dat zich opsplitst in 2 gelijke dochtercellen. Het totaal volume blijft gelijk, maar de oppervlakte wordt groter. Wat is de arbeid die hiervoor verricht moet worden als je weet dat de oppervlaktespanning (iets in die aard) 1.26*10^(-)2 N/m is?<br /> <br /> === 28 augustus 2023 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De evenwichtsconstante is dimensieloos<br /> #*Delta G en delta G° zijn constanten<br /> #*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling<br /> #Beschouw een mengsel van vloeistof A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.<br /> #Oppervlaktespanning<br /> #*Waarom is de druk binnen in een vloeistofdruppel steeds hoger dan erbuiten?<br /> #*Waarom heeft hexaan een lagere oppervlaktespanning dan water?<br /> #*Waarom gebruiken we de Helmholtz functie om de Young-Laplace vergelijking af te leiden en niet de Gibbs functie?<br /> #Oefening 1: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte<br /> #Oefening 2: 0.133 mol van een ideaal gas wordt bij een initiële druk van 5 bar isotherm en reversibel geëxpandeerd van 3 liter tot 10 liter.<br /> #*Wat is de inwendige energie, de arbeid en de warmte?<br /> #*Wat is de entropieverandering van het systeem?<br /> #*Geef de gibbsfunctie.<br /> <br /> === 1 februari 2023 ===<br /> #OPDRACHT: vuurpomp<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).<br /> #*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom.<br /> #Toon aan met een afleiding (begin met vorderingsgraad) dat 𝑅𝑇 ln(𝐾p) = −∆𝐺̅°.<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagram en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅d = 0.<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk. Leg kort uit.<br /> #Beschouw een mengsel (of oplossing) van vloeistoffen A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.<br /> #OEFENING 1: Isotherme compressie van een ideaal gas van 3 atm tot 1 atm bij 27°C. Bereken ∆S(systeem) en ∆S(omgeving) in het reversibele geval en ook bij constante externe druk van 1 atm.<br /> #OEFENING 2: Een druppel water (bol met straal 10 mm) wordt gesplitst in 1000 equivalente kleinere druppels (ook bollen) waarbij het totaalvolume niet verandert. Bereken de arbeid die hiervoor nodig is. Gegeven formules voor volume en oppervlakte bol, oppervlaktespanning water (73 N/m).<br /> <br /> === 16 januari 2023 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De evenwichtsconstante is dimensieloos<br /> #*Delta G en delta G° zijn constanten<br /> #*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling <br /> #Schets fasediagramma van 2 stoffen A en B die slecht mengbaar zijn in vaste fase en goed mengbaar in vloeistoffase. Gibbs faseregel + leg uit<br /> #OEFENING 1: berekenen U, q, W, G, S, H <br /> #OEFENING 2: iets van een moedercel die splitst in 2 dochtercellen waarbij het volume gedeeld wordt door 2 maar de oppervlakte wel veranderd. Berekenen hoeveel arbeid er nodig is om dit proces te laten plaatsvinden (dus oppervlaktespanning doorbreken). Diameter moedercel, oppervlaktespanning, formule opp. en volume bol gegeven.<br /> <br /> === 1 september 2022 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.<br /> #*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenen.<br /> #*De eenheid van ionische activiteit is mol/kg.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de Laplace druk. Verklaar elke stap in je afleiding<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De variantie in het tripelpunt van een zuivere stof is nul.<br /> #*Het T,x-diagram van een ideaal mengsel kan nooit een azeotroop vertonen.<br /> #*Beschouw een vloeibaar mengsel van A en B. De samenstelling van de vloeistof is hierbij steeds gelijk aan de samenstelling van dampfase.<br /> #Oefening: isotherme en reversibele expansie. Berekenen van warmte, arbeid, inwendige energie, entropie van het systeem en gibbs functie <br /> #Oefening: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte<br /> <br /> === 25 augustus 2022 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De evenwichtsconstante is dimensieloos<br /> #*Delta G en delta G° zijn constanten<br /> #*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling <br /> #Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Beschouw een mengsel van vloeistof A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.<br /> #Oefening: isotherme en reversibele expansie. Berekenen van warmte, arbeid, inwendige energie, entropie van het systeem en gibbs functie <br /> #Oefening: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte <br /> <br /> === 17 januari 2022 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅d = 0?<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk? Leg kort uit.<br /> #<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #<br /> #Leid een formule af die aantoont dat een opgeloste stof die de oppervlaktespanning van een oplossing verlaagt, de neiging zal hebben zich op te stapelen aan het oppervlak. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #<br /> #Oefening 1: Wat is de reactie enthalpie van een reactie waarbij de evenwichtsconstante verdubbelt als de temperatuur verhoogd wordt met 15 K bij een temperatuur van 310 K?<br /> #<br /> #Oefening 2: 0.133 mol van een ideaal gas wordt bij een initiële druk van 5 bar isotherm en reversibel geëxpandeerd van 3 liter tot 10 liter.<br /> #*Wat is de inwendige energie, de arbeid en de warmte?<br /> #*Wat is de entropieverandering van het systeem?<br /> #*Geef de gibbsfunctie.<br /> <br /> === 31 augustus 2021 ===<br /> #Vuurpomp afleiding geven voor T en V<br /> #<br /> #Gibbs functie bij mengsels<br /> #*Toon aan dat gibbs ook een alternatieve vorm is voor de 2de hoofdwet<br /> #*Temperatuur- en drukafhankelijkheid van Gibbs functie.<br /> #<br /> #Waar of niet waar?<br /> #*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij<br /> #*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.<br /> #*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning<br /> #*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.<br /> <br /> #Proteine stabiliteit en fasediagram geven en alles uitleggen + de afleidingen van dG folded en unfolded!<br /> #Oefening1: Druk p is gegeven (zo niet kan je gwn pV=nRT stellen) enbij verwaeming is T1= 310 K en T2=325 K, tijdens die verwarming zal de evenwichtsconstante K veranderen tot 2.K (verdubbelen) gaan, wat is de standaard enthalpie? <br /> #Oefening2: gegeven is V1 = 3 L en V2= 10L met druk p=5bar en aantal mol stof = 0.133 mol, geheel is temperatuur onafhankelijk. <br /> #*Geef U, W en q voor als het proces isotherm reversibel expandeert<br /> #*Geef de entropie verandering van het systeem<br /> #*Geef de gibbs functie voor deze situatie<br /> <br /> === 27 januari 2021 ===<br /> #Artikel over proteïne: leg hydrofoob effect uit en waarom vouwing entropisch gedreven is<br /> #Adiabatische processen<br /> #* toon aan dat P1V1^(y)=P2V2^(y) voor een adiabatisch proces<br /> #* toon aan dat de arbeid bij een adiabatisch proces gegeven wordt door W= (Pfin*Vfin-Pinit*Vinit)/(y-1) en dat deze uitdrukking equivalent is met W=Cv(Tfin-Tinit)<br /> #* leg uit waarom we Cv mogen gebruiken in W=Cv(Tfin-Tinit) terwijl het volume niet constant blijft.<br /> # Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal.<br /> # Waar of niet waar?<br /> #* Vergroten van een oppervlak zet energie vrij<br /> #*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.<br /> #*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning<br /> #*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.<br /> #Oef: bereken verschil in entropie van het systeem. gegeven T1, P1 en T2, P2 en Cr (molaire)<br /> #Oef: gegeven: temperatuur tripelpunt, 2 punten (P,T) van naftaleen<br /> #*bereken delta H<br /> #*bereken normaal kookpunt naftaleen<br /> #*bereken P van tripelpunt<br /> <br /> <br /> === 11 januari 2021 ===<br /> #Artikel over proteïne: leg hydrofoob effect uit en waarom vouwing entropisch gedreven is<br /> #Osmose<br /> #La place druk<br /> #Joule -thompson coefficient aantonen dat die 0 is voor ideale gassen<br /> #*bewijs isobare coefficient voor thermische expansie is 1/T voor ideaal gas<br /> #* bewijs isotherme compressibiliteit is 1/p voor ideaal gas<br /> #* Is joule thompsoncoefficient positief of negatief bij een expansieproces dat resulteert in koelen <br /> #oef: w, q, Ssyst, Somg,U en H berekenen bij isotherm proces<br /> #* bij reversibel proces<br /> #*bij Pex van 1 atm<br /> #oef: tripelpunt, kritisch punt, normaal kookpunt en smeltpunt gegeven <br /> #* schets een fasediagram (P,T) hiervan<br /> #* kan je O2 smelten als je de druk verhoogt?<br /> #* bereken Hvap<br /> <br /> ===31 januari 2020===<br /> # Artikel over proteïne: Welke interacties spelen een rol bij de opvouwing van een bêta-hairpin? Hoe dragen deze interacties bij aan de enthalpieverandering van het opvouwingsproces? Gebruik tabel 1.<br /> # Oef: bereken q, W, U. Bereken entropie en Gibbs energie.<br /> # Oef: bereken verandering van entropie.<br /> # Temperatuur- en drukafhankelijkheid van Gibbs functie.<br /> # chemische potentiaal bij osmose afleiden. Hoe kan dit gebruikt worden om de molecuulmassa van polymeren te weten?<br /> <br /> ===17 januari 2020 VM===<br /> # Wat is CMC en geef de verandering in enthalpie bij micelvorming.<br /> # Oef: opwarming van een gas tegen constante druk (Cp gegeven). Bereken warmte, verandering in U en H.<br /> # Oef: bereken de verandering in entropie bij opwarming.<br /> # chemische potentiaal bij osmose afleiden. Hoe kan dit gebruikt worden om de molecuulmassa van polymeren te weten?<br /> # klassieke nucleatietheorie<br /> ===13 januari 2020 NM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oef: P2 en deltaG berekenen<br /> # Oef: deltaS berekenen<br /> # Chemische potentiaal voor zuivere vloeistof en voor mengsel geven. Wet van Raoult en Henry bespreken met een grafiek.<br /> # Membraanpotentiaal en Donnanpotentiaal. Bespreek het verschil. <br /> <br /> ===13 januari 2020 VM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oef: bereken q S en H bij isotherm<br /> # Oef: bereken q, U en G bij isobaar opwarmen gas<br /> # Schets fasediagramma van 2 stoffen A en B die slecht mengbaar zijn in vaste fase en goed mengbaar in vloeistoffase. Gibbs faseregel + leg uit<br /> # mengsel ideale oplossing formules afleiden + wet van Raoult (grafiek)<br /> ===25 januari 2019 NM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oef: dSsyst berekenen bij water gaat van ijs naar vlo (een oef uit oefenzitting 3 met ijs)<br /> # Oef: H U q berekenen bij gegeven T1 T2 p1 en Cp<br /> # Bespreek chemisch pot van mengsel ideale gassen en ideale vlo<br /> # Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom dat oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.<br /> <br /> ===18 januari 2019 NM===<br /> Zelfde als voormiddag, maar carnot cyclus vervangen door proteïne denaturatie + stabiliteitscurve<br /> ===18 januari 2019 VM===<br /> # Artikel over proteïne<br /> # Oefening: Kp gegeven bij twee temperaturen. Bereken delta G, H en S.<br /> # Oefening: 2 mol gas ondergaat isotherme compressie. T, p1 en delta S gegeven. Bereken einddruk en delta G. <br /> # Bespreek carnot cyclus (teken p-V diagram, bereken voor elke stap W, q, U en entropie verandering, toon aan dat U en S voor de hele reactie gelijk aan 0 zijn, bereken efficiëntie)<br /> # Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom dat oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.<br /> <br /> <br /> ===14 januari 2019 NM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oefening over een monoatomisch gas dat isotherm wordt samengedrukt, waardoor de entropie daalt. <br /> #* Wat is de einddruk?<br /> #* Wat is de delta G?<br /> # Oefening over mengsels (zoals gezien in de les). Moleculaire massas en dichtheden gegeven.<br /> #* Hoeveel volume water en methanol moet men mengen om een bepaalde samenstelling te krijgen<br /> # Toon aan dat de entropie gelijk is aan 0 voor een reversibel proces bij fasetransities (bv smelten). Toon ook aan dat dit verschillend is van 0 voor een irreversibel proces<br /> # Leid de formule van Clapeyron af en toon dit aan voor smelten en verdampen<br /> <br /> ===14 januari 2019 VM===<br /> #Vuurpomp<br /> #Oefening over een ideaal gas dat reversibel isotherm wordt geëxpandeerd. T, V1, V2 gegeven. Bereken deltaH, deltaU, deltaG, deltaA, q en W. <br /> #Oefening over een ideaal gas dat isotherm wordt geëxpandeerd. Bereken deltaS van universum, systeem en omgeving in reversibele en irreversibele omstandigheden. V1, V2 en temperatuur gegeven. Voor irreversibele voorwaarden bij een constante externe druk van 0.1 atm. <br /> #Colligatieve eigenschappen <br /> #*Uitleggen en grafiek geven, wat doet de opgeloste stof met het chemisch potentiaal van de vloeistof? <br /> #*Bespreek kookpuntsverhoging<br /> #*Bespreek osmose<br /> #Mengsels van vloeistoffen <br /> #*Leidt een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van mengsels van ideale oplossingen <br /> #*Hoe zit dit voor reële vloeistoffen? (+grafiek)<br /> <br /> ===1 februari 2018===<br /> #vuurpomp<br /> #vraag over donnanpotentiaal<br /> #vraag over mengsels<br /> <br /> ===26 januari 2018===<br /> #Proteinevouwing<br /> #Carnot cyclus<br /> #Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom da oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.<br /> #entropie oef<br /> #verdampingsenthalpie, kookpunt, verdampingsentropie en ebullioscopische cte.<br /> <br /> === 19 januari 2018 ===<br /> <br /> #Vuurpomp uitleggen<br /> # 1 mol gas word isotherm ontspannen, bepaal q, W, delta U, entropie van omgeving en systeem voor een reversibel en irreversibel geval<br /> # gas wordt opgewarmd, bepaal molaire entropie verandering<br /> # chemische potentiaal van vloeistoffen: ideale en reële mengsels, wet van Raoult en wet van Henry<br /> # denaturatie van proteïnen: formule voor delta G in functie van temperatuur afleiden, curve schetsen en grondig bespreken<br /> <br /> === 19 januari 2018===<br /> # Vuurpomp<br /> # 1 mol ideaal gas: expansie van 20L tot 200L bij 300K. Gevraagd: entropieverandering van systeem, omgeving en universum voor: <br /> #* a. Reversibel<br /> #* b. Irreversibel bij 0.1 atm buitendruk<br /> # Gevraagd: de verandering in molaire entropie bij verwarming van stikstofgas van 25°C tot 1000°C bij constante druk. ( Gegeven: Cp = 26.9835 + 5.9622*10(^-3) T – 377*10(^-7) T(^2) )<br /> # Beschouw de reactie 3A+2B &lt;=&gt; C+2D. <br /> #* Leid het verband van de standaard Gibbsfunctie en de evenwichtsconstante af. En wat met reële gassen? (1.5p)<br /> #* Toon de drukonafhankelijkheid aan (1p)<br /> #* Toon de temperatuursafhankelijkheid aan (1.5p)<br /> # Beschouw F(folded) &lt;=&gt; U(unfolded). <br /> #* Leid deltaG in functie van de temperatuur af (1.5p)<br /> #* schets de stabiliteitscurve en bespreek gronding (2.5p)<br /> <br /> === 15 januari 2018 ===<br /> <br /> # Vuurpomp uitleggen<br /> # Oefening op entropie met isotherme compressie ---&gt; bepaal einddruk en delta G<br /> # Oefening partieel molaire volumes<br /> # Entropie voor fasetransities afleiden<br /> # Clausius-Clapeyronvgl. afleiden en toepassen voor smelten en verdampen<br /> <br /> === 3 februari 2017 NM ===<br /> <br /> # Artikel over proteïne (4 ptn): Welke interacties spelen een rol bij de opvouwing van een bêta-hairpin? Hoe dragen deze interacties bij aan de enthalpieverandering van het opvouwingsproces? Gebruik tabel 1. (gegeven)<br /> #*Bijvragen: hij heeft een klokcurve op zijn blad getekend: hoe beïnvloed Cp de curve? (breder). Draagt water meer bij aan de opvouwing van de hairpin dan methanol? De opvouwing van de hydrofobe zijketens, hoe noemen we dit effect? (hij doelt op hydrofoob effect).<br /> # Oefening (2 ptn): gegeven: 1 mol, temperatuur 767°C verhogen naar 1027°C, druk gaat van 1 atm naar 6 atm, molaire Cv = 3/2 R. Bereken de enthalpieverandering en de entropieverandering. <br /> # Oefening (2 ptn): gegeven: 3 mol, temperatuur 27°C, de reactie is isotherm, druk gaat van 1 atm naar 5 atm. Bereken de verandering in vrije energie.<br /> # Carnot-cyclus:<br /> #* Teken het p-V en S-T diagram. (1,5 ptn)<br /> #* Bereken voor elke stap w, q, U en entropieverandering. (1,5 ptn)<br /> #* Toon aan dat de totale U en totale entropieverandering nul is. (1ptn)<br /> # Chemisch potentiaal mengsels (gas en vloeistof)<br /> #* Bespreek de verandering in Gibbs en entropie bij het mengen van ideale gassen. (1,6 ptn)<br /> #* Doe dit ook voor ideale vloeistoffen. (1,2 ptn)<br /> #* Kan je hetzelfde besluiten voor vloeistoffen en gassen? Bespreek dit. (1,2 ptn)<br /> <br /> === 27 januari 2017 NM ===<br /> <br /> # Artikel over proteïne<br /> # Oefening tripelpunt en kooktemperatuur<br /> # Oefening entropie berkenen<br /> # Chemisch potentiaal mengsel vloeistoffen, uitdrukking G en aantonen dat het entropie gedreven is<br /> # Kinetisch gasmodel en fotongas<br /> <br /> === 27 januari 2017 VM ===<br /> <br /> # Artikel over proteïnen<br /> # Geef q, U en W voor volgende processen met ideale gassen<br /> #* isotherme expansie in vacuum<br /> #* adiabatische expansie in vacuum<br /> #* isotherme expansie tegen constante druk<br /> #* adiabatische expansie tegen constante druk<br /> #* reversibele isotherme expansie<br /> #* reversibele adiabatische expansie<br /> #* isochoor proces (weet niet meer exact)<br /> # Chemische potentiaal kort uitleggen, geef afleiding metaal/metaalion electrode<br /> # Oefening triplepunt en kooktemperatuur<br /> # Oefening entropie berekening<br /> <br /> === 20 januari 2017 NM ===<br /> <br /> #Vuurpomp vertrekkende van de eerste hoofdwet van de thermodynamica<br /> #entropie (van systeem, universum en omgeving) als je een gas opwarmt van 768 tot 1028 K en samendrukt door het veranderen van de druk van 1 atm tot 6 atm. je mocht dit beschouwen als een reversibel proces. Wat is de entropie?<br /> #een mol gas (argon) ontspant zich bij 273K adiabatisch van 1L naar 10L, wat is de eindtemperatuur? gebruik voor warmtecapaciteit C(v)= 3/2R<br /> #leidt een formule af voor chemische potentiaal bij het mengen van twee stoffen. leidt dan ook de gibbsfunctie af en toon aan dat dit entropisch gedreven is.<br /> #Toon aan dat stoffen aan de oppervlakte van een stof de oppervlaktespanning doen dalen. Leidt de formule van Young-Laplace af.<br /> <br /> === 16 januari 2017 VM ===<br /> #Werking van de vuurpomp beschrijven m.b.v. de eerste hoofdwet van de thermodynamica.<br /> #Bereken een reactie-enthalpie bij 1000K (de reactie en de reactie-enthalpie bij 298K is gegeven).<br /> #Een gas bij 25°C wordt verwarmd bij constante druk tot het verdubbeld is in volume. Bereken de verandering in enthalpie, entropie en vrije energie.<br /> #Mengen van ideale gassen, formule afleiden. (en nog dingen maar die ben ik vergeten omda ik ze nie kon :'( )<br /> #Leid de Clapeyron af en pas toe op Vast-Vloeistof en Vloeistof-Damp.<br /> <br /> === 22 januari 2016 NM ===<br /> #vuurpomp<br /> #colligatieve eigenschappen, kookpuntsverhoging, osmose<br /> #clapeyron afleiden en toepassen op smelten en verdampen<br /> #entropie (sys, omg, univ) berekenen reversibel, irreversibel en enthalpie van systeem berekenen met T1, T2, Cp gegeven<br /> #entropie, enthalpie en inwendige energie berekenen waarbij een systeem verwarmd word tot het volume verdubbelt is met P constant en Ti, P en n gegeven<br /> <br /> === 15 januari 2016 (VM) ===<br /> #Het artikel over het vouwen van eiwitten bespreken.<br /> #De dampspanning van een zuivere stof op twee verschillende temperaturen krijg je. Bereken de verdampingsenthalpie, ebullioscopische constante (molaire massa gegeven.), de temperatuur waarop de vloeistof verdampt en de entropie van dit proces. <br /> #Een (zeer eenvoudige) oefening waarin de entropie moet berekend worden van een expansie.<br /> #Bespreek de carnot cyclus.<br /> #De laplace vergelijking uitleggen en verklaren waarom stoffen die aan het oppervlakte opstapelen de oppervlaktespanning verlagen.<br /> <br /> === 11 januari 2016 NM ===<br /> Hetzelfde als 11 januari VM<br /> <br /> === 11 januari 2016 VM ===<br /> #vuurpomp (opdracht)<br /> #tripelpunt oefening: gegeven temperatuur bij tripelpunt, Pvap(T1), Pvap(T2) te berekenen enthalpie(vap), kooktemp. bij normaaldruk en druk op tripelpunt.<br /> #entropie en enthalpie bij reversibel en irreversibel oefening: gegeven T1, T2, Cp<br /> #colligatieve eigenschappen bespreken (wat is het + invloed van de opgeloste stof op de chemische potentiaal van de vloeistof) en kookpuntsverhoging en osmose<br /> #elektrochemische potentiaal en metaal/metaalionelectrode + Nernstvergelijking (kort) afleiden + (heel kort) bespreken hoe enthalpie en entropie bepaald kan worden uit elektrochemie<br /> <br /> === 12 januari 2015 (NM) ===<br /> <br /> # 1. Dat vuur pomp stuff.<br /> # 2. Bereken tripel punt shit.<br /> # 3. Wat met entropie spelen n stuff.<br /> # 4. Een of ander carnot cyclus... komt dat iemand bekend voor?<br /> # 5. Wat shit met oppervlakte spanning en Young en een van zijn Franse maatjes afleiden<br /> <br /> === 17 januari 2014 ===<br /> <br /> # vraag over enthalpie bij peptide vouwen, vraag 1 van da document<br /> # Oefening om enthalpie te bereken bij 1000K terwijl de enthalpie is gegeven bij 298K van een reactievgl<br /> # Entropie berekening voor irreversibel en reversibel proces <br /> # leidt de formule van de oppervlaktespanning af, bewijs dat stoffen die de oppervlaktespanning verlagen de nijging hebben om zich aan de oppervlakte op te stapelen, Leidt de vergelijking van Young-dupre af<br /> # leg te elektrochemische potentiaal uit( gewoon de vergelijking uitleggen), leg membraanpotentiaal uit, leg metaal/metaan-ion elektrode uit<br /> <br /> === 28 januari 2013 ===<br /> <br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en pas dit toe op een metaal/metaalionelektrode.<br /> # Toon aan dat een adiabatische expansie kan leiden tot mistvorming in een erlenmeyer (artikel).<br /> # Oefening: bepaling van de molaire entropieverandering bij verwarmen en compresseren. Warmtecapaciteit bij constant volume is geggeven.<br /> # Oefening: bereken delta H bij 1000 K van de reactie: CO + H2O -&amp;gt; CO2 + H2. delta H bij 298 K is gegeven, als ook de Cp's van de stoffen.<br /> <br /> === 25 januari 2013 ===<br /> <br /> # bewijs: bij adiabatisch proces is p1V1^(lambda)=p2V2^(lambda)<br /> # bespreek de rol van enthalpie en entropie bij het hydrofoob effect<br /> # bepaling van de tempperatuursverandering bij adiabatische compressie (begin- en einddruk, begintemp gegeven)<br /> # bepaling van delta U en delta H bij een opwarming bij constante druk (cv, massa, molaire massa en begin- en eindtemp gegeven)<br /> <br /> === 18 januari 2013 ===<br /> <br /> # Toon aan dat de gemiddelde kinetische energie van een mol gas gelijk is aan 3/2 RT<br /> # Leg uit hoe een adiabatische expansie kan leiden tot mistvorming in een erlenmeyer (vraag uit artikel).<br /> # Oefening: entropieverandering van 298 K en 2 atm naar 233 K en 0.4 atm. Warmtecapaciteit bij constant volume is gegeven.<br /> # Oefening: geef temperatuur en druk bij het tripelpunt van een bepaalde stof, twee vergelijkingen met p en T zijn al gegeven, je moet alleen nog maar het stelsel van twee vergelijkingen en twee onbekenden oplossen.<br /> <br /> === 3 feb 2012 ===<br /> <br /> # Geef het verschil tussen een isotherme en een adiabatische expansie. <br /> # Toon aan dat de gemiddelde kinetische energie van een mol gas gelijk is aan 3/2 RT<br /> # Oefening: entropieverandering van 298 K en 2 atm naar 233 K en 0.4 atm<br /> # Oefening: geef temperatuur en druk bij het tripelpunt van een bepaalde stof, twee vergelijkingen met p en T zijn al gegeven, je moet alleen nog maar het stelsel van twee vergelijkingen en twee onbekenden oplossen.<br /> <br /> === 27 jan 2012 ===<br /> <br /> # Toon aan dat stoffen die de oppervlaktespanning verlagen, de neiging hebben om zich aan het oppervlak op te stapelen.<br /> # Leg uit, elektrochemische potentiaal en pas toe op de membraanpotentiaal.<br /> # Oefening op entropieverandering<br /> # Bereken q, U en H bij verwarming bij constante druk.<br /> === 20 jan 2012 VM ===<br /> <br /> # Bespreek osmose (bijvragen: geldt deze formule altijd, hoe aanpassen voor grotere C, hoe noem je dit?)<br /> # Geef de formules voor de warmte, arbeid en verandering in inwendige energie voor volgende processen met ideale gassen:<br /> #* isotherme expansie in vacuüm<br /> #* adiabatische expansie in vacuüm<br /> #* isotherme expansie tegen constante druk<br /> #* adiabatisch expansie tegen constante druk<br /> #* reversibele isotherme expansie<br /> #* reversibele adiabatische expansie<br /> #* (bijvraag: een stok met aan het uiteinde een stuk katoen in een omhulsel duwen (past perfect): hierna brandt het katoen, hoe verklaar je dit?)<br /> # Oef: zie oef 3 bij oude examenvragen<br /> # Oef: zie oef 7 bij oude examenvragen<br /> <br /> === 16 jan 2012 VM ===<br /> <br /> # Geef de carnotcyclus en bespreek U, w &amp;amp; q bij elk proces<br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.<br /> # Oefening over verandering Gibbs van reactie bij 1298K als Cp, H &amp;amp; S van alle reagentia en producten gegeven bij 298K <br /> # Oefening over entropieverandering van expansie (systeem, omgeving, universum) zowel a) reversibel b) irreversibel bij uitwendige druk van 0,1Atm<br /> <br /> === 28 jan 2011 ===<br /> <br /> #Bespreek osmose en hoe kan je hieruit molecuulgewicht bepalen (3de keer!!!)<br /> #Bespreek membraanpotentiaal<br /> #IJs wordt van -10°C tot +10°C verwarmd: wat is de entropietoename &amp;lt;u&amp;gt;van het systeem&amp;lt;/u&amp;gt;? (enthalpie en warmtecapaciteiten gegeven)<br /> #Bereken eindtemperatuur, q, W en U van een reversibele adiabatische compressie van 28l naar 10l. (C&amp;lt;sub&amp;gt;v&amp;lt;/sub&amp;gt; = 5/2R)<br /> <br /> <br /> === 21 jan 2011 VM ===<br /> # Geef de carnotcyclus en bespreek U, w &amp;amp; q bij elk proces<br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.<br /> # Oefening over verandering inwendige energie (delta U)<br /> # Oefening over entropieverandering<br /> <br /> === 17 jan 2011 ===<br /> <br /> # Bespreek osmose en leg uit hoe je hieruit molecuulgewichten kunt bekomen <br /> # Clapeyron afleiden + toepassen op fasediagramma (m.a.w. vgl vast-&amp;gt; vl., vl. -&amp;gt; gas en vast -&amp;gt; gas berekenen)<br /> # Oefening over entropieverandering <br /> # Oefening over verandering in gibbsfunctie<br /> <br /> === 15 jan 2010 ===<br /> <br /> # bespreek de adiabatische expansie <br /> # bespreek osmose en geef een toepassing <br /> # oefening over entropieverandering <br /> # oefening over verandering in gibbsfunctie<br /> <br /> === 11 jan 2010 VM ===<br /> # Bespreek het kinetischgasmodel en de gemiddelde Etr.<br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.<br /> # ?<br /> # ?<br /> <br /> === 11 jan 2010 NM ===<br /> # Toon aan met formules dat een stof die de oppervlaktespanning verlaagt de neiging heeft om zich aan het oppervlak op te stapelen.<br /> # Bewijs dat de totale entropie voor een Carnotcyclus gelijk is aan nul.<br /> # Entropieverandering berekenen van gas bij bepaalde gebeurtenis.<br /> # Veranderingen in U en H berekenen bij de opwarming van een ideaal gas bij constante druk.<br /> <br /> === 30 jan 2009 ===<br /> # Clapeyron afleiden+toepassen op vloeibaar-gas.<br /> # Kookpuntverhoging.<br /> # Adiabatische compressie van een gas met de volumes en de begin T en de Cv gegeven.<br /> # Entropieverandering van 25 C naar 1000 C met Cv gegeven.<br /> === 16 jan 2009 ===<br /> # bij mengen verandering in gibbs, entropie, enthalpie en volume<br /> # carnot bespreken, q, W en U bij elk proces, en efficientie berekenen<br /> # verandering in entropie berekenen wanneer een ideaal gas expandeert van 1l bij 12K naar 2l bij 24K <br /> # verandering in enthalpie en inwendige energie berekenen van een reactie, enkele vormingsenthalpieën gegeven en een verbrandingsenthalpie, en we mochten veronderstellen dat de gassen ideaal waren<br /> === 21 jan 2008 ===<br /> # clayperon+ toep. op verdampen<br /> # kookpuntsverhoging bespreken<br /> # adiabatische expansie 1L naar 10L, Ti = 273K, bereken eindtem Cv gegeven<br /> # compresie van 1atm naar 2atm en verwarmen van 300k naar 1000k. Cp gegeven. bereken entropieverandering.<br /> === 21 jan 2008 ===<br /> # geef de carnotcyclus en bespreek U, w &amp;amp; q bij elk proces<br /> # Bespreek de membraam potentiaal<br /> # adiabtische compressie gas (1 mol) van 48,4l naar 44,4 l en begin temp = 0°C. Eindtemperatuur berekenen<br /> # entropieverandering van verwarmen gas 25°C--&amp;gt;1000°C. Cp gegeven<br /> === 18 jan 2008 ===<br /> # druk en temperatuursafhankelijkheid van evenwichtsconstante<br /> # isotherme en adiabatische expansie van een ideaal gas bespreken<br /> # inwendige energie berekenen, vormingsenthalpie en temperatuur gegeven<br /> # enthalpie en entropie berekenen van faseovergang van water bij T = 263K, H(273K) gegeven en Cp's gegeven<br /> <br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # clapeyron afleiden en toepassen op vast/vloeistof<br /> # osmose bespreken<br /> # vormingsenthalpie berekenen bij 125°C van HBr uit H2 en Br2. met de Hf°bij 25°C gegeven. bereken ook de inwendige energieverandering. (Cp ook gegeven dacht ik (iemand die nog exact weet?) )<br /> # entropieverandering bij 1 mol ideaal gas met T1= 12K, T2= 24K en V1=1L en V2=2L. en Cv = 3/2 R<br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # twee ideale gassen, bepaal deltaG, S, H, V na mengen<br /> # kookpuntsverhoging bespreken<br /> # CO(g) + H20 (g) =&amp;gt; CO2(g) + H2(g) delta H (298K) = -10 kcal. zoek delta H (1000K) Cp's gegeven<br /> # bespreek de carnotcyclus in een STdiagramma<br /> <br /> === 30 aug 2008 ===<br /> # mengen van ideale gassen, bespreek delta G, delta H, delta S, delta U en delta V<br /> # geef q, U en W voor volgende processen met ideale gassen<br /> #* isotherme expansie in vacuum<br /> #* adiabatische expansie in vacuum<br /> #* isotherme exp tegen constante druk<br /> #* adiab exp cte P<br /> #* reversibele isoth exp<br /> #* rev adiab exp<br /> # ideaal gas bij 12K en 1L, bereken delta S bij het omzetten naar 24K en 2L. C=2/3R <br /> === 29 jan 2007 ===<br /> # bespreek de druk- en temperatuursafh van de evenwichtsconstante<br /> # de henryconstante van CO2 in H2O is 1,...*10^6, die in benzeen 8,...*10^4. In welke stof is CO2 het best oplosbaar?<br /> # Een oefening waarbij een ideaal gas van T en V veranderd. Bereken DeltaS.<br /> === 23 jan 2007 ===<br /> # bespreek osmose<br /> # oefening waar ge bij reversibele isotherme compressie U, q, H en W moet berekenen<br /> # een ideaal gas gaat van T1-&amp;gt;T2 en V1-&amp;gt; V2. Laat zien dat geldt: Delta S= Cv. ln(T2/T1)+n.R. ln(V2/V1) Cv mag onafhankelijk van de temperatuur genomen worden. <br /> === 20 jan 2007 ===<br /> # Geef de afleiding voor de vergelijking van clapeyron en pas dit toe op smelten<br /> # Geef een S-T diagramma van de Carnotcyclus<br /> # Bereken deltaH bij 1000K, je kreeg deltaH(298), de reactie en alle Cp's<br /> <br /> === 19 jan 2007 ===<br /> # het mengen van ideale gassen. Bespreek de gibs functie de entalpie, entropie, en volume verandering.<br /> # de carnot cyclus wordt meestal weergeven in een pv-diagrama, geef hem nu weer in een TS-diagramma<br /> === 18 jan 2007 ===<br /> # bewijs dat de evenwichtsconstante niet drukafhankelijk is, maar wel temperatuursafhankelijk<br /> # bewijs volgende uitdrukking voor de entropieverandering van een gas dat van temperatuur en volume verandert:<br /> #: deltaS = Cv*ln(T2/T1) + nR*ln(V2/V1)<br /> Oefening:<br /> # bereken molecuulmassa van een proteïne<br /> # oplossing en osmotische druk gegeven, bereken ??</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Chemische_Thermodynamica&diff=3815 2024-01-23T09:00:58Z

<p>R0893094: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Chemie]]<br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> <br /> ==Vakinformatie==<br /> Zowel gevolgd door chemie als biochemie, tegenwoordig in het derde jaar voor biochemie en tweede jaar chemie. Een 'mondeling' examen met schriftelijke voorbereiding. In theorie want in praktijk verloopt het examen zonder veel woorden. De examenstructuur is altijd dezelfde: 3 theorievragen en 2 oefeningen, waarvan één altijd gaat over entropieverandering. Sinds 2012-2013 komt één van de theorievragen uit één van de artikels die je vooraf moest lezen, enkel deze vraag wordt mondeling besproken.<br /> Het vak wordt gedoceerd door professor Thierry Verbiest, oefenzittingen werden vroeger gegeven door de zo mogelijk nog sympathiekere Maarten Vanbel.<br /> <br /> '''Alle vragen van het einde van elk hoofdstuk (Elisabeth I.):'''<br /> https://drive.google.com/file/d/1J_23Lh2eyP2lzxUNz9JKv4si8D7028PJ/view?usp=sharing<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 23 januari 2024 NM ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> Bijvragen over de CMC, opbouw micellen en amfifiele moleculen, wat is de 2e hoofdwet van thermodynamica &amp; het verband met gibbs...<br /> # Carnot cyclus en omgekeerde Carnot cyclus<br /> #*Toon aan dat DU = 0 en DS = 0 voor de Carnot cyclus.<br /> #*Teken de Carnot cyclus in een T-S diagramma.<br /> #*Wanneer is het rendement van een warmtepomp het hoogst? In de winter of in <br /> de zomer? Verklaar je antwoord.<br /> #Waar of niet waar? Verklaar kort je antwoord.<br /> #*Bij een expansie van een ideaal gas in vacuüm is dU steeds gelijk aan nul.<br /> #*Het volume is een exacte differentiaal.<br /> #*Dichtheid is een extensieve grootheid.<br /> #*Bij een isotherm proces is dW = 0.<br /> #Micelvorming: leg uit hoe je ∆G°, ∆H° en ∆S° kan bepalen als je de kritische<br /> micelconcentratie kent. Leid de relevante formules af.<br /> #Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar. <br /> #*Bereken U, q en W<br /> #*Bereken ∆S(systeem)<br /> #*Bereken ∆G<br /> #Oefening: Tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.<br /> #* Wat is de vormingsenthalpie<br /> #* Wat is de normale kooktemperatuur<br /> #* Wat is de druk in het tripelpunt<br /> <br /> === 15 januari 2024 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> Bijvragen over de CMC, opbouw micellen en amfifiele moleculen, wat is de 2e hoofdwet van thermodynamica &amp; het verband met gibbs...<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Waar of niet waar?<br /> #*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij<br /> #*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.<br /> #*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning<br /> #*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.<br /> #Oefening: Bereken de molaire massa van creatine gegeven dat de osmotische druk van je 0.1g/l creatine-oplossing 13 torr bedroeg in vergelijking met water bij 25°C.<br /> #Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar. <br /> #*Bereken U, q en W<br /> #*Bereken &amp;Delta;S(systeem)<br /> #*Bereken &amp;Delta;G<br /> <br /> === 12 januari 2024 ===<br /> #OPDRACHT: vuurpomp<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).<br /> #*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom<br /> #*Bijvragen komen letterlijk uit de vragen dat je moet leren voor hoofdstuk 3 (enige dat ik daar verschillend van had: wat gebeurd er als je bij een reversibel proces iets klein aanpast zoals het teken van uw volumeverandering aanpassen compressie &lt;-&gt; expansie)<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer kort je antwoord.<br /> #*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.<br /> #*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenene.<br /> #*De elektrochemische potentiaal is hetzelfde als de chemische potentiaal.<br /> #oefening 1: isotherme expansie van 3 atm naar 1 atm bij een temperatuur van 37°C. Geef de entropie van de omgeving en van het systeem in volgende gevallen:<br /> #*Reversibele expansie<br /> #*Irreversibel tegen een uitwendige druk van 1 atm<br /> #oefening 2: je hebt een moedercel met straal 1 µm dat zich opsplitst in 2 gelijke dochtercellen. Het totaal volume blijft gelijk, maar de oppervlakte wordt groter. Wat is de arbeid die hiervoor verricht moet worden als je weet dat de oppervlaktespanning (iets in die aard) 1.26*10^(-)2 N/m is?<br /> <br /> === 28 augustus 2023 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De evenwichtsconstante is dimensieloos<br /> #*Delta G en delta G° zijn constanten<br /> #*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling<br /> #Beschouw een mengsel van vloeistof A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.<br /> #Oppervlaktespanning<br /> #*Waarom is de druk binnen in een vloeistofdruppel steeds hoger dan erbuiten?<br /> #*Waarom heeft hexaan een lagere oppervlaktespanning dan water?<br /> #*Waarom gebruiken we de Helmholtz functie om de Young-Laplace vergelijking af te leiden en niet de Gibbs functie?<br /> #Oefening 1: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte<br /> #Oefening 2: 0.133 mol van een ideaal gas wordt bij een initiële druk van 5 bar isotherm en reversibel geëxpandeerd van 3 liter tot 10 liter.<br /> #*Wat is de inwendige energie, de arbeid en de warmte?<br /> #*Wat is de entropieverandering van het systeem?<br /> #*Geef de gibbsfunctie.<br /> <br /> === 1 februari 2023 ===<br /> #OPDRACHT: vuurpomp<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).<br /> #*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?<br /> #*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom.<br /> #Toon aan met een afleiding (begin met vorderingsgraad) dat 𝑅𝑇 ln(𝐾p) = −∆𝐺̅°.<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagram en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅d = 0.<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk. Leg kort uit.<br /> #Beschouw een mengsel (of oplossing) van vloeistoffen A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.<br /> #OEFENING 1: Isotherme compressie van een ideaal gas van 3 atm tot 1 atm bij 27°C. Bereken ∆S(systeem) en ∆S(omgeving) in het reversibele geval en ook bij constante externe druk van 1 atm.<br /> #OEFENING 2: Een druppel water (bol met straal 10 mm) wordt gesplitst in 1000 equivalente kleinere druppels (ook bollen) waarbij het totaalvolume niet verandert. Bereken de arbeid die hiervoor nodig is. Gegeven formules voor volume en oppervlakte bol, oppervlaktespanning water (73 N/m).<br /> <br /> === 16 januari 2023 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De evenwichtsconstante is dimensieloos<br /> #*Delta G en delta G° zijn constanten<br /> #*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling <br /> #Schets fasediagramma van 2 stoffen A en B die slecht mengbaar zijn in vaste fase en goed mengbaar in vloeistoffase. Gibbs faseregel + leg uit<br /> #OEFENING 1: berekenen U, q, W, G, S, H <br /> #OEFENING 2: iets van een moedercel die splitst in 2 dochtercellen waarbij het volume gedeeld wordt door 2 maar de oppervlakte wel veranderd. Berekenen hoeveel arbeid er nodig is om dit proces te laten plaatsvinden (dus oppervlaktespanning doorbreken). Diameter moedercel, oppervlaktespanning, formule opp. en volume bol gegeven.<br /> <br /> === 1 september 2022 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.<br /> #*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenen.<br /> #*De eenheid van ionische activiteit is mol/kg.<br /> #Leid een uitdrukking af voor de Laplace druk. Verklaar elke stap in je afleiding<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De variantie in het tripelpunt van een zuivere stof is nul.<br /> #*Het T,x-diagram van een ideaal mengsel kan nooit een azeotroop vertonen.<br /> #*Beschouw een vloeibaar mengsel van A en B. De samenstelling van de vloeistof is hierbij steeds gelijk aan de samenstelling van dampfase.<br /> #Oefening: isotherme en reversibele expansie. Berekenen van warmte, arbeid, inwendige energie, entropie van het systeem en gibbs functie <br /> #Oefening: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte<br /> <br /> === 25 augustus 2022 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #Waar of niet waar? Motiveer je antwoord<br /> #*De evenwichtsconstante is dimensieloos<br /> #*Delta G en delta G° zijn constanten<br /> #*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling <br /> #Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #Beschouw een mengsel van vloeistof A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.<br /> #Oefening: isotherme en reversibele expansie. Berekenen van warmte, arbeid, inwendige energie, entropie van het systeem en gibbs functie <br /> #Oefening: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte <br /> <br /> === 17 januari 2022 ===<br /> #OPDRACHT: vouwen van proteïnen<br /> #*Wat is het hydrofoob effect?<br /> #*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.<br /> #*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.<br /> #*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.<br /> #<br /> #Proteïnen<br /> #*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.<br /> #*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅d = 0?<br /> #*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk? Leg kort uit.<br /> #<br /> #Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #<br /> #Leid een formule af die aantoont dat een opgeloste stof die de oppervlaktespanning van een oplossing verlaagt, de neiging zal hebben zich op te stapelen aan het oppervlak. Verklaar elke stap in je afleiding.<br /> #<br /> #Oefening 1: Wat is de reactie enthalpie van een reactie waarbij de evenwichtsconstante verdubbelt als de temperatuur verhoogd wordt met 15 K bij een temperatuur van 310 K?<br /> #<br /> #Oefening 2: 0.133 mol van een ideaal gas wordt bij een initiële druk van 5 bar isotherm en reversibel geëxpandeerd van 3 liter tot 10 liter.<br /> #*Wat is de inwendige energie, de arbeid en de warmte?<br /> #*Wat is de entropieverandering van het systeem?<br /> #*Geef de gibbsfunctie.<br /> <br /> === 31 augustus 2021 ===<br /> #Vuurpomp afleiding geven voor T en V<br /> #<br /> #Gibbs functie bij mengsels<br /> #*Toon aan dat gibbs ook een alternatieve vorm is voor de 2de hoofdwet<br /> #*Temperatuur- en drukafhankelijkheid van Gibbs functie.<br /> #<br /> #Waar of niet waar?<br /> #*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij<br /> #*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.<br /> #*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning<br /> #*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.<br /> <br /> #Proteine stabiliteit en fasediagram geven en alles uitleggen + de afleidingen van dG folded en unfolded!<br /> #Oefening1: Druk p is gegeven (zo niet kan je gwn pV=nRT stellen) enbij verwaeming is T1= 310 K en T2=325 K, tijdens die verwarming zal de evenwichtsconstante K veranderen tot 2.K (verdubbelen) gaan, wat is de standaard enthalpie? <br /> #Oefening2: gegeven is V1 = 3 L en V2= 10L met druk p=5bar en aantal mol stof = 0.133 mol, geheel is temperatuur onafhankelijk. <br /> #*Geef U, W en q voor als het proces isotherm reversibel expandeert<br /> #*Geef de entropie verandering van het systeem<br /> #*Geef de gibbs functie voor deze situatie<br /> <br /> === 27 januari 2021 ===<br /> #Artikel over proteïne: leg hydrofoob effect uit en waarom vouwing entropisch gedreven is<br /> #Adiabatische processen<br /> #* toon aan dat P1V1^(y)=P2V2^(y) voor een adiabatisch proces<br /> #* toon aan dat de arbeid bij een adiabatisch proces gegeven wordt door W= (Pfin*Vfin-Pinit*Vinit)/(y-1) en dat deze uitdrukking equivalent is met W=Cv(Tfin-Tinit)<br /> #* leg uit waarom we Cv mogen gebruiken in W=Cv(Tfin-Tinit) terwijl het volume niet constant blijft.<br /> # Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal.<br /> # Waar of niet waar?<br /> #* Vergroten van een oppervlak zet energie vrij<br /> #*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.<br /> #*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning<br /> #*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.<br /> #Oef: bereken verschil in entropie van het systeem. gegeven T1, P1 en T2, P2 en Cr (molaire)<br /> #Oef: gegeven: temperatuur tripelpunt, 2 punten (P,T) van naftaleen<br /> #*bereken delta H<br /> #*bereken normaal kookpunt naftaleen<br /> #*bereken P van tripelpunt<br /> <br /> <br /> === 11 januari 2021 ===<br /> #Artikel over proteïne: leg hydrofoob effect uit en waarom vouwing entropisch gedreven is<br /> #Osmose<br /> #La place druk<br /> #Joule -thompson coefficient aantonen dat die 0 is voor ideale gassen<br /> #*bewijs isobare coefficient voor thermische expansie is 1/T voor ideaal gas<br /> #* bewijs isotherme compressibiliteit is 1/p voor ideaal gas<br /> #* Is joule thompsoncoefficient positief of negatief bij een expansieproces dat resulteert in koelen <br /> #oef: w, q, Ssyst, Somg,U en H berekenen bij isotherm proces<br /> #* bij reversibel proces<br /> #*bij Pex van 1 atm<br /> #oef: tripelpunt, kritisch punt, normaal kookpunt en smeltpunt gegeven <br /> #* schets een fasediagram (P,T) hiervan<br /> #* kan je O2 smelten als je de druk verhoogt?<br /> #* bereken Hvap<br /> <br /> ===31 januari 2020===<br /> # Artikel over proteïne: Welke interacties spelen een rol bij de opvouwing van een bêta-hairpin? Hoe dragen deze interacties bij aan de enthalpieverandering van het opvouwingsproces? Gebruik tabel 1.<br /> # Oef: bereken q, W, U. Bereken entropie en Gibbs energie.<br /> # Oef: bereken verandering van entropie.<br /> # Temperatuur- en drukafhankelijkheid van Gibbs functie.<br /> # chemische potentiaal bij osmose afleiden. Hoe kan dit gebruikt worden om de molecuulmassa van polymeren te weten?<br /> <br /> ===17 januari 2020 VM===<br /> # Wat is CMC en geef de verandering in enthalpie bij micelvorming.<br /> # Oef: opwarming van een gas tegen constante druk (Cp gegeven). Bereken warmte, verandering in U en H.<br /> # Oef: bereken de verandering in entropie bij opwarming.<br /> # chemische potentiaal bij osmose afleiden. Hoe kan dit gebruikt worden om de molecuulmassa van polymeren te weten?<br /> # klassieke nucleatietheorie<br /> ===13 januari 2020 NM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oef: P2 en deltaG berekenen<br /> # Oef: deltaS berekenen<br /> # Chemische potentiaal voor zuivere vloeistof en voor mengsel geven. Wet van Raoult en Henry bespreken met een grafiek.<br /> # Membraanpotentiaal en Donnanpotentiaal. Bespreek het verschil. <br /> <br /> ===13 januari 2020 VM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oef: bereken q S en H bij isotherm<br /> # Oef: bereken q, U en G bij isobaar opwarmen gas<br /> # Schets fasediagramma van 2 stoffen A en B die slecht mengbaar zijn in vaste fase en goed mengbaar in vloeistoffase. Gibbs faseregel + leg uit<br /> # mengsel ideale oplossing formules afleiden + wet van Raoult (grafiek)<br /> ===25 januari 2019 NM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oef: dSsyst berekenen bij water gaat van ijs naar vlo (een oef uit oefenzitting 3 met ijs)<br /> # Oef: H U q berekenen bij gegeven T1 T2 p1 en Cp<br /> # Bespreek chemisch pot van mengsel ideale gassen en ideale vlo<br /> # Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom dat oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.<br /> <br /> ===18 januari 2019 NM===<br /> Zelfde als voormiddag, maar carnot cyclus vervangen door proteïne denaturatie + stabiliteitscurve<br /> ===18 januari 2019 VM===<br /> # Artikel over proteïne<br /> # Oefening: Kp gegeven bij twee temperaturen. Bereken delta G, H en S.<br /> # Oefening: 2 mol gas ondergaat isotherme compressie. T, p1 en delta S gegeven. Bereken einddruk en delta G. <br /> # Bespreek carnot cyclus (teken p-V diagram, bereken voor elke stap W, q, U en entropie verandering, toon aan dat U en S voor de hele reactie gelijk aan 0 zijn, bereken efficiëntie)<br /> # Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom dat oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.<br /> <br /> <br /> ===14 januari 2019 NM===<br /> # Vuurpomp<br /> # Oefening over een monoatomisch gas dat isotherm wordt samengedrukt, waardoor de entropie daalt. <br /> #* Wat is de einddruk?<br /> #* Wat is de delta G?<br /> # Oefening over mengsels (zoals gezien in de les). Moleculaire massas en dichtheden gegeven.<br /> #* Hoeveel volume water en methanol moet men mengen om een bepaalde samenstelling te krijgen<br /> # Toon aan dat de entropie gelijk is aan 0 voor een reversibel proces bij fasetransities (bv smelten). Toon ook aan dat dit verschillend is van 0 voor een irreversibel proces<br /> # Leid de formule van Clapeyron af en toon dit aan voor smelten en verdampen<br /> <br /> ===14 januari 2019 VM===<br /> #Vuurpomp<br /> #Oefening over een ideaal gas dat reversibel isotherm wordt geëxpandeerd. T, V1, V2 gegeven. Bereken deltaH, deltaU, deltaG, deltaA, q en W. <br /> #Oefening over een ideaal gas dat isotherm wordt geëxpandeerd. Bereken deltaS van universum, systeem en omgeving in reversibele en irreversibele omstandigheden. V1, V2 en temperatuur gegeven. Voor irreversibele voorwaarden bij een constante externe druk van 0.1 atm. <br /> #Colligatieve eigenschappen <br /> #*Uitleggen en grafiek geven, wat doet de opgeloste stof met het chemisch potentiaal van de vloeistof? <br /> #*Bespreek kookpuntsverhoging<br /> #*Bespreek osmose<br /> #Mengsels van vloeistoffen <br /> #*Leidt een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van mengsels van ideale oplossingen <br /> #*Hoe zit dit voor reële vloeistoffen? (+grafiek)<br /> <br /> ===1 februari 2018===<br /> #vuurpomp<br /> #vraag over donnanpotentiaal<br /> #vraag over mengsels<br /> <br /> ===26 januari 2018===<br /> #Proteinevouwing<br /> #Carnot cyclus<br /> #Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom da oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.<br /> #entropie oef<br /> #verdampingsenthalpie, kookpunt, verdampingsentropie en ebullioscopische cte.<br /> <br /> === 19 januari 2018 ===<br /> <br /> #Vuurpomp uitleggen<br /> # 1 mol gas word isotherm ontspannen, bepaal q, W, delta U, entropie van omgeving en systeem voor een reversibel en irreversibel geval<br /> # gas wordt opgewarmd, bepaal molaire entropie verandering<br /> # chemische potentiaal van vloeistoffen: ideale en reële mengsels, wet van Raoult en wet van Henry<br /> # denaturatie van proteïnen: formule voor delta G in functie van temperatuur afleiden, curve schetsen en grondig bespreken<br /> <br /> === 19 januari 2018===<br /> # Vuurpomp<br /> # 1 mol ideaal gas: expansie van 20L tot 200L bij 300K. Gevraagd: entropieverandering van systeem, omgeving en universum voor: <br /> #* a. Reversibel<br /> #* b. Irreversibel bij 0.1 atm buitendruk<br /> # Gevraagd: de verandering in molaire entropie bij verwarming van stikstofgas van 25°C tot 1000°C bij constante druk. ( Gegeven: Cp = 26.9835 + 5.9622*10(^-3) T – 377*10(^-7) T(^2) )<br /> # Beschouw de reactie 3A+2B &lt;=&gt; C+2D. <br /> #* Leid het verband van de standaard Gibbsfunctie en de evenwichtsconstante af. En wat met reële gassen? (1.5p)<br /> #* Toon de drukonafhankelijkheid aan (1p)<br /> #* Toon de temperatuursafhankelijkheid aan (1.5p)<br /> # Beschouw F(folded) &lt;=&gt; U(unfolded). <br /> #* Leid deltaG in functie van de temperatuur af (1.5p)<br /> #* schets de stabiliteitscurve en bespreek gronding (2.5p)<br /> <br /> === 15 januari 2018 ===<br /> <br /> # Vuurpomp uitleggen<br /> # Oefening op entropie met isotherme compressie ---&gt; bepaal einddruk en delta G<br /> # Oefening partieel molaire volumes<br /> # Entropie voor fasetransities afleiden<br /> # Clausius-Clapeyronvgl. afleiden en toepassen voor smelten en verdampen<br /> <br /> === 3 februari 2017 NM ===<br /> <br /> # Artikel over proteïne (4 ptn): Welke interacties spelen een rol bij de opvouwing van een bêta-hairpin? Hoe dragen deze interacties bij aan de enthalpieverandering van het opvouwingsproces? Gebruik tabel 1. (gegeven)<br /> #*Bijvragen: hij heeft een klokcurve op zijn blad getekend: hoe beïnvloed Cp de curve? (breder). Draagt water meer bij aan de opvouwing van de hairpin dan methanol? De opvouwing van de hydrofobe zijketens, hoe noemen we dit effect? (hij doelt op hydrofoob effect).<br /> # Oefening (2 ptn): gegeven: 1 mol, temperatuur 767°C verhogen naar 1027°C, druk gaat van 1 atm naar 6 atm, molaire Cv = 3/2 R. Bereken de enthalpieverandering en de entropieverandering. <br /> # Oefening (2 ptn): gegeven: 3 mol, temperatuur 27°C, de reactie is isotherm, druk gaat van 1 atm naar 5 atm. Bereken de verandering in vrije energie.<br /> # Carnot-cyclus:<br /> #* Teken het p-V en S-T diagram. (1,5 ptn)<br /> #* Bereken voor elke stap w, q, U en entropieverandering. (1,5 ptn)<br /> #* Toon aan dat de totale U en totale entropieverandering nul is. (1ptn)<br /> # Chemisch potentiaal mengsels (gas en vloeistof)<br /> #* Bespreek de verandering in Gibbs en entropie bij het mengen van ideale gassen. (1,6 ptn)<br /> #* Doe dit ook voor ideale vloeistoffen. (1,2 ptn)<br /> #* Kan je hetzelfde besluiten voor vloeistoffen en gassen? Bespreek dit. (1,2 ptn)<br /> <br /> === 27 januari 2017 NM ===<br /> <br /> # Artikel over proteïne<br /> # Oefening tripelpunt en kooktemperatuur<br /> # Oefening entropie berkenen<br /> # Chemisch potentiaal mengsel vloeistoffen, uitdrukking G en aantonen dat het entropie gedreven is<br /> # Kinetisch gasmodel en fotongas<br /> <br /> === 27 januari 2017 VM ===<br /> <br /> # Artikel over proteïnen<br /> # Geef q, U en W voor volgende processen met ideale gassen<br /> #* isotherme expansie in vacuum<br /> #* adiabatische expansie in vacuum<br /> #* isotherme expansie tegen constante druk<br /> #* adiabatische expansie tegen constante druk<br /> #* reversibele isotherme expansie<br /> #* reversibele adiabatische expansie<br /> #* isochoor proces (weet niet meer exact)<br /> # Chemische potentiaal kort uitleggen, geef afleiding metaal/metaalion electrode<br /> # Oefening triplepunt en kooktemperatuur<br /> # Oefening entropie berekening<br /> <br /> === 20 januari 2017 NM ===<br /> <br /> #Vuurpomp vertrekkende van de eerste hoofdwet van de thermodynamica<br /> #entropie (van systeem, universum en omgeving) als je een gas opwarmt van 768 tot 1028 K en samendrukt door het veranderen van de druk van 1 atm tot 6 atm. je mocht dit beschouwen als een reversibel proces. Wat is de entropie?<br /> #een mol gas (argon) ontspant zich bij 273K adiabatisch van 1L naar 10L, wat is de eindtemperatuur? gebruik voor warmtecapaciteit C(v)= 3/2R<br /> #leidt een formule af voor chemische potentiaal bij het mengen van twee stoffen. leidt dan ook de gibbsfunctie af en toon aan dat dit entropisch gedreven is.<br /> #Toon aan dat stoffen aan de oppervlakte van een stof de oppervlaktespanning doen dalen. Leidt de formule van Young-Laplace af.<br /> <br /> === 16 januari 2017 VM ===<br /> #Werking van de vuurpomp beschrijven m.b.v. de eerste hoofdwet van de thermodynamica.<br /> #Bereken een reactie-enthalpie bij 1000K (de reactie en de reactie-enthalpie bij 298K is gegeven).<br /> #Een gas bij 25°C wordt verwarmd bij constante druk tot het verdubbeld is in volume. Bereken de verandering in enthalpie, entropie en vrije energie.<br /> #Mengen van ideale gassen, formule afleiden. (en nog dingen maar die ben ik vergeten omda ik ze nie kon :'( )<br /> #Leid de Clapeyron af en pas toe op Vast-Vloeistof en Vloeistof-Damp.<br /> <br /> === 22 januari 2016 NM ===<br /> #vuurpomp<br /> #colligatieve eigenschappen, kookpuntsverhoging, osmose<br /> #clapeyron afleiden en toepassen op smelten en verdampen<br /> #entropie (sys, omg, univ) berekenen reversibel, irreversibel en enthalpie van systeem berekenen met T1, T2, Cp gegeven<br /> #entropie, enthalpie en inwendige energie berekenen waarbij een systeem verwarmd word tot het volume verdubbelt is met P constant en Ti, P en n gegeven<br /> <br /> === 15 januari 2016 (VM) ===<br /> #Het artikel over het vouwen van eiwitten bespreken.<br /> #De dampspanning van een zuivere stof op twee verschillende temperaturen krijg je. Bereken de verdampingsenthalpie, ebullioscopische constante (molaire massa gegeven.), de temperatuur waarop de vloeistof verdampt en de entropie van dit proces. <br /> #Een (zeer eenvoudige) oefening waarin de entropie moet berekend worden van een expansie.<br /> #Bespreek de carnot cyclus.<br /> #De laplace vergelijking uitleggen en verklaren waarom stoffen die aan het oppervlakte opstapelen de oppervlaktespanning verlagen.<br /> <br /> === 11 januari 2016 NM ===<br /> Hetzelfde als 11 januari VM<br /> <br /> === 11 januari 2016 VM ===<br /> #vuurpomp (opdracht)<br /> #tripelpunt oefening: gegeven temperatuur bij tripelpunt, Pvap(T1), Pvap(T2) te berekenen enthalpie(vap), kooktemp. bij normaaldruk en druk op tripelpunt.<br /> #entropie en enthalpie bij reversibel en irreversibel oefening: gegeven T1, T2, Cp<br /> #colligatieve eigenschappen bespreken (wat is het + invloed van de opgeloste stof op de chemische potentiaal van de vloeistof) en kookpuntsverhoging en osmose<br /> #elektrochemische potentiaal en metaal/metaalionelectrode + Nernstvergelijking (kort) afleiden + (heel kort) bespreken hoe enthalpie en entropie bepaald kan worden uit elektrochemie<br /> <br /> === 12 januari 2015 (NM) ===<br /> <br /> # 1. Dat vuur pomp stuff.<br /> # 2. Bereken tripel punt shit.<br /> # 3. Wat met entropie spelen n stuff.<br /> # 4. Een of ander carnot cyclus... komt dat iemand bekend voor?<br /> # 5. Wat shit met oppervlakte spanning en Young en een van zijn Franse maatjes afleiden<br /> <br /> === 17 januari 2014 ===<br /> <br /> # vraag over enthalpie bij peptide vouwen, vraag 1 van da document<br /> # Oefening om enthalpie te bereken bij 1000K terwijl de enthalpie is gegeven bij 298K van een reactievgl<br /> # Entropie berekening voor irreversibel en reversibel proces <br /> # leidt de formule van de oppervlaktespanning af, bewijs dat stoffen die de oppervlaktespanning verlagen de nijging hebben om zich aan de oppervlakte op te stapelen, Leidt de vergelijking van Young-dupre af<br /> # leg te elektrochemische potentiaal uit( gewoon de vergelijking uitleggen), leg membraanpotentiaal uit, leg metaal/metaan-ion elektrode uit<br /> <br /> === 28 januari 2013 ===<br /> <br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en pas dit toe op een metaal/metaalionelektrode.<br /> # Toon aan dat een adiabatische expansie kan leiden tot mistvorming in een erlenmeyer (artikel).<br /> # Oefening: bepaling van de molaire entropieverandering bij verwarmen en compresseren. Warmtecapaciteit bij constant volume is geggeven.<br /> # Oefening: bereken delta H bij 1000 K van de reactie: CO + H2O -&amp;gt; CO2 + H2. delta H bij 298 K is gegeven, als ook de Cp's van de stoffen.<br /> <br /> === 25 januari 2013 ===<br /> <br /> # bewijs: bij adiabatisch proces is p1V1^(lambda)=p2V2^(lambda)<br /> # bespreek de rol van enthalpie en entropie bij het hydrofoob effect<br /> # bepaling van de tempperatuursverandering bij adiabatische compressie (begin- en einddruk, begintemp gegeven)<br /> # bepaling van delta U en delta H bij een opwarming bij constante druk (cv, massa, molaire massa en begin- en eindtemp gegeven)<br /> <br /> === 18 januari 2013 ===<br /> <br /> # Toon aan dat de gemiddelde kinetische energie van een mol gas gelijk is aan 3/2 RT<br /> # Leg uit hoe een adiabatische expansie kan leiden tot mistvorming in een erlenmeyer (vraag uit artikel).<br /> # Oefening: entropieverandering van 298 K en 2 atm naar 233 K en 0.4 atm. Warmtecapaciteit bij constant volume is gegeven.<br /> # Oefening: geef temperatuur en druk bij het tripelpunt van een bepaalde stof, twee vergelijkingen met p en T zijn al gegeven, je moet alleen nog maar het stelsel van twee vergelijkingen en twee onbekenden oplossen.<br /> <br /> === 3 feb 2012 ===<br /> <br /> # Geef het verschil tussen een isotherme en een adiabatische expansie. <br /> # Toon aan dat de gemiddelde kinetische energie van een mol gas gelijk is aan 3/2 RT<br /> # Oefening: entropieverandering van 298 K en 2 atm naar 233 K en 0.4 atm<br /> # Oefening: geef temperatuur en druk bij het tripelpunt van een bepaalde stof, twee vergelijkingen met p en T zijn al gegeven, je moet alleen nog maar het stelsel van twee vergelijkingen en twee onbekenden oplossen.<br /> <br /> === 27 jan 2012 ===<br /> <br /> # Toon aan dat stoffen die de oppervlaktespanning verlagen, de neiging hebben om zich aan het oppervlak op te stapelen.<br /> # Leg uit, elektrochemische potentiaal en pas toe op de membraanpotentiaal.<br /> # Oefening op entropieverandering<br /> # Bereken q, U en H bij verwarming bij constante druk.<br /> === 20 jan 2012 VM ===<br /> <br /> # Bespreek osmose (bijvragen: geldt deze formule altijd, hoe aanpassen voor grotere C, hoe noem je dit?)<br /> # Geef de formules voor de warmte, arbeid en verandering in inwendige energie voor volgende processen met ideale gassen:<br /> #* isotherme expansie in vacuüm<br /> #* adiabatische expansie in vacuüm<br /> #* isotherme expansie tegen constante druk<br /> #* adiabatisch expansie tegen constante druk<br /> #* reversibele isotherme expansie<br /> #* reversibele adiabatische expansie<br /> #* (bijvraag: een stok met aan het uiteinde een stuk katoen in een omhulsel duwen (past perfect): hierna brandt het katoen, hoe verklaar je dit?)<br /> # Oef: zie oef 3 bij oude examenvragen<br /> # Oef: zie oef 7 bij oude examenvragen<br /> <br /> === 16 jan 2012 VM ===<br /> <br /> # Geef de carnotcyclus en bespreek U, w &amp;amp; q bij elk proces<br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.<br /> # Oefening over verandering Gibbs van reactie bij 1298K als Cp, H &amp;amp; S van alle reagentia en producten gegeven bij 298K <br /> # Oefening over entropieverandering van expansie (systeem, omgeving, universum) zowel a) reversibel b) irreversibel bij uitwendige druk van 0,1Atm<br /> <br /> === 28 jan 2011 ===<br /> <br /> #Bespreek osmose en hoe kan je hieruit molecuulgewicht bepalen (3de keer!!!)<br /> #Bespreek membraanpotentiaal<br /> #IJs wordt van -10°C tot +10°C verwarmd: wat is de entropietoename &amp;lt;u&amp;gt;van het systeem&amp;lt;/u&amp;gt;? (enthalpie en warmtecapaciteiten gegeven)<br /> #Bereken eindtemperatuur, q, W en U van een reversibele adiabatische compressie van 28l naar 10l. (C&amp;lt;sub&amp;gt;v&amp;lt;/sub&amp;gt; = 5/2R)<br /> <br /> <br /> === 21 jan 2011 VM ===<br /> # Geef de carnotcyclus en bespreek U, w &amp;amp; q bij elk proces<br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.<br /> # Oefening over verandering inwendige energie (delta U)<br /> # Oefening over entropieverandering<br /> <br /> === 17 jan 2011 ===<br /> <br /> # Bespreek osmose en leg uit hoe je hieruit molecuulgewichten kunt bekomen <br /> # Clapeyron afleiden + toepassen op fasediagramma (m.a.w. vgl vast-&amp;gt; vl., vl. -&amp;gt; gas en vast -&amp;gt; gas berekenen)<br /> # Oefening over entropieverandering <br /> # Oefening over verandering in gibbsfunctie<br /> <br /> === 15 jan 2010 ===<br /> <br /> # bespreek de adiabatische expansie <br /> # bespreek osmose en geef een toepassing <br /> # oefening over entropieverandering <br /> # oefening over verandering in gibbsfunctie<br /> <br /> === 11 jan 2010 VM ===<br /> # Bespreek het kinetischgasmodel en de gemiddelde Etr.<br /> # Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.<br /> # ?<br /> # ?<br /> <br /> === 11 jan 2010 NM ===<br /> # Toon aan met formules dat een stof die de oppervlaktespanning verlaagt de neiging heeft om zich aan het oppervlak op te stapelen.<br /> # Bewijs dat de totale entropie voor een Carnotcyclus gelijk is aan nul.<br /> # Entropieverandering berekenen van gas bij bepaalde gebeurtenis.<br /> # Veranderingen in U en H berekenen bij de opwarming van een ideaal gas bij constante druk.<br /> <br /> === 30 jan 2009 ===<br /> # Clapeyron afleiden+toepassen op vloeibaar-gas.<br /> # Kookpuntverhoging.<br /> # Adiabatische compressie van een gas met de volumes en de begin T en de Cv gegeven.<br /> # Entropieverandering van 25 C naar 1000 C met Cv gegeven.<br /> === 16 jan 2009 ===<br /> # bij mengen verandering in gibbs, entropie, enthalpie en volume<br /> # carnot bespreken, q, W en U bij elk proces, en efficientie berekenen<br /> # verandering in entropie berekenen wanneer een ideaal gas expandeert van 1l bij 12K naar 2l bij 24K <br /> # verandering in enthalpie en inwendige energie berekenen van een reactie, enkele vormingsenthalpieën gegeven en een verbrandingsenthalpie, en we mochten veronderstellen dat de gassen ideaal waren<br /> === 21 jan 2008 ===<br /> # clayperon+ toep. op verdampen<br /> # kookpuntsverhoging bespreken<br /> # adiabatische expansie 1L naar 10L, Ti = 273K, bereken eindtem Cv gegeven<br /> # compresie van 1atm naar 2atm en verwarmen van 300k naar 1000k. Cp gegeven. bereken entropieverandering.<br /> === 21 jan 2008 ===<br /> # geef de carnotcyclus en bespreek U, w &amp;amp; q bij elk proces<br /> # Bespreek de membraam potentiaal<br /> # adiabtische compressie gas (1 mol) van 48,4l naar 44,4 l en begin temp = 0°C. Eindtemperatuur berekenen<br /> # entropieverandering van verwarmen gas 25°C--&amp;gt;1000°C. Cp gegeven<br /> === 18 jan 2008 ===<br /> # druk en temperatuursafhankelijkheid van evenwichtsconstante<br /> # isotherme en adiabatische expansie van een ideaal gas bespreken<br /> # inwendige energie berekenen, vormingsenthalpie en temperatuur gegeven<br /> # enthalpie en entropie berekenen van faseovergang van water bij T = 263K, H(273K) gegeven en Cp's gegeven<br /> <br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # clapeyron afleiden en toepassen op vast/vloeistof<br /> # osmose bespreken<br /> # vormingsenthalpie berekenen bij 125°C van HBr uit H2 en Br2. met de Hf°bij 25°C gegeven. bereken ook de inwendige energieverandering. (Cp ook gegeven dacht ik (iemand die nog exact weet?) )<br /> # entropieverandering bij 1 mol ideaal gas met T1= 12K, T2= 24K en V1=1L en V2=2L. en Cv = 3/2 R<br /> === 14 jan 2008 ===<br /> # twee ideale gassen, bepaal deltaG, S, H, V na mengen<br /> # kookpuntsverhoging bespreken<br /> # CO(g) + H20 (g) =&amp;gt; CO2(g) + H2(g) delta H (298K) = -10 kcal. zoek delta H (1000K) Cp's gegeven<br /> # bespreek de carnotcyclus in een STdiagramma<br /> <br /> === 30 aug 2008 ===<br /> # mengen van ideale gassen, bespreek delta G, delta H, delta S, delta U en delta V<br /> # geef q, U en W voor volgende processen met ideale gassen<br /> #* isotherme expansie in vacuum<br /> #* adiabatische expansie in vacuum<br /> #* isotherme exp tegen constante druk<br /> #* adiab exp cte P<br /> #* reversibele isoth exp<br /> #* rev adiab exp<br /> # ideaal gas bij 12K en 1L, bereken delta S bij het omzetten naar 24K en 2L. C=2/3R <br /> === 29 jan 2007 ===<br /> # bespreek de druk- en temperatuursafh van de evenwichtsconstante<br /> # de henryconstante van CO2 in H2O is 1,...*10^6, die in benzeen 8,...*10^4. In welke stof is CO2 het best oplosbaar?<br /> # Een oefening waarbij een ideaal gas van T en V veranderd. Bereken DeltaS.<br /> === 23 jan 2007 ===<br /> # bespreek osmose<br /> # oefening waar ge bij reversibele isotherme compressie U, q, H en W moet berekenen<br /> # een ideaal gas gaat van T1-&amp;gt;T2 en V1-&amp;gt; V2. Laat zien dat geldt: Delta S= Cv. ln(T2/T1)+n.R. ln(V2/V1) Cv mag onafhankelijk van de temperatuur genomen worden. <br /> === 20 jan 2007 ===<br /> # Geef de afleiding voor de vergelijking van clapeyron en pas dit toe op smelten<br /> # Geef een S-T diagramma van de Carnotcyclus<br /> # Bereken deltaH bij 1000K, je kreeg deltaH(298), de reactie en alle Cp's<br /> <br /> === 19 jan 2007 ===<br /> # het mengen van ideale gassen. Bespreek de gibs functie de entalpie, entropie, en volume verandering.<br /> # de carnot cyclus wordt meestal weergeven in een pv-diagrama, geef hem nu weer in een TS-diagramma<br /> === 18 jan 2007 ===<br /> # bewijs dat de evenwichtsconstante niet drukafhankelijk is, maar wel temperatuursafhankelijk<br /> # bewijs volgende uitdrukking voor de entropieverandering van een gas dat van temperatuur en volume verandert:<br /> #: deltaS = Cv*ln(T2/T1) + nR*ln(V2/V1)<br /> Oefening:<br /> # bereken molecuulmassa van een proteïne<br /> # oplossing en osmotische druk gegeven, bereken ??</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Veredeling_en_Biotechnologie&diff=3749 2024-01-19T08:32:03Z

<p>R0893094: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div><br /> [[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Minor verbreding van biochemie volgt het vak veredeling samen met bio-ingenieurs optie landbouwkunde. Het bestaat uit 2 delen: plant en dier. Het deel plant wordt gegeven door N. De Storme (sinds academiejaar 2018-2019) en is veel meer leerstof dan deel dier. Deel dier wordt gegeven door N. Buys. Voor deel plant is enkel de eerste vraag mondeling en voor deel dier zijn alle vragen mondeling. Tijdens het jaar zijn er practica sessies en verplichte oefenzittingen, waarvan niets op het examen zal staan.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===18 januari 2024===<br /> ====Dier====<br /> #Genetische adviseur: varkensham met meer smaak<br /> #Z-linked feathering uitleggen en waarom dit handig is<br /> #Gene editing in huisdieren (Wat is het en zou dit gebruikt kunnen worden voor iets? Waarom wel of niet?)<br /> <br /> ====Plant====<br /> #pedigree methode uitleggen (figuur!), welke soort cultibar wordt bekomen, wat zijn de voor en nadelen? Vergelijken met Bulk methode<br /> #CGMS uitleggen via schema, vergelijk met CMS<br /> #AFLP genotypering uitleggen (figuur!), waarvoor kan dit gebruikt worden?<br /> <br /> ===19 januari 2023=== <br /> ====Dier====<br /> #Leghennen in de Kempen (Waarop selecteren? Waarom? Hoe meten? Strategie + welke technieken)<br /> #QTL: wat is het, leg uit adhv een voorbeeld, hoe kan je een QTL zoeken?<br /> #Leg kort uit: epistasis, recombination loss<br /> <br /> ====Plant====<br /> #Wat is genetische winst, hoe bereken je het, hoe kan je het voorspellen, geef twee manieren om het te maximaliseren, wat is de algemene dynamiek van genetische winst in een veredelingsproces (/4)<br /> #F1 hybride zaad is een 3-lijn systeem, leg in detail uit, op welk biologisch fenomeen is dit gebaseerd, wat is het verschil met 2-lijn,... (/4)<br /> #Wat is een synthetische cultivar, waarvoor kan je het gebruiken, wat is het verschil met een F1 hybride cultivar (/2)<br /> <br /> ===2 September 2022 (schriftelijk)=== <br /> ====Dier====<br /> #Je wilt de bevolking in Togo van melk voorzien. Hoe doe je dit? Wees duidelijk, verklaar elke stap en leg uit waarom je dit adviseert.<br /> #Een hond wordt verdacht de kat van de buren dood te bijten. Hoe ga je dit na? Geef elke stap in je werkwijze en leg uit. <br /> <br /> ==== PLant ====<br /> #Recurrente selectie uitleggen. Wat is het algemene doel. Wat is RS voor GCA en SCA. ... (zeer gedetailleerde vraag) (/4)<br /> # Zaadlethaliteit van F1 door tripbloide block. Hoe komt dit? Geef de biochemische werking. Waarom is dit een hinder in veredeling. Hoe kunnen we dit oplossen (geef een voorbeeld). ... (details!) (/3)<br /> # QTL mapping via BSA. Leg BSA uit. Verklaar de uitspraak: Afhankelijk van het fenotype kenmerk moet je QTL mapping anders uitvoeren? (/3)<br /> <br /> ===20 Januari 2022 (schriftelijk)=== <br /> ====Dier====<br /> #Varkenskwekerij in Spanje. Waarvoor ga je selecteren en waarom? Hoe ga je dit aanpakken? <br /> #Een bepaalde monogene recessieve afwijking bij Belgisch Witblauw wordt veroorzaakt door een puntmutatie in een bepaald gen. Hoe ga je testen hoeveel dit voorkomt in de populatie? <br /> <br /> ====Plant====<br /> #Family selection (/5) <br /> #F1 hybdride steriliteit (/3) <br /> #CO-interferentie bij linkage mapping (/2)<br /> <br /> ===16 Januari 2021 VM===<br /> ====Dier====<br /> #Geitenhouderij in Leuven. Waarvoor ga je selecteren en waarom? Hoe ga je dit aanpakken?<br /> #Je wil de dubbel gespierdheid van het Belgisch Witblauw in een schaap brengen, hoe ga je dit aanpakken?<br /> <br /> ====Plant====<br /> #F1 hybride zaadproductie: leg het verschil uit tussen het twee-lijn systeem en het drie-lijn systeem.<br /> #Single point analysis<br /> #Leg uit transgressie en hoe komt dit aan bod binnen de veredeling?<br /> <br /> ===17 Augustus 2020 VM===<br /> ====Dier====<br /> #Bedrijf in Leuven voor biologisch varkensvlees.<br /> #Fokwaardeschatting uitleggen met een concreet voorbeeld.<br /> #schaap doodgebeten door hond of wolf?<br /> <br /> ====Plant====<br /> #pedigree methode uitleggen, voor- en nadelen, vergelijken met SSD en hoe beter maken met merkers?<br /> #CGMS<br /> #BSA <br /> <br /> ===30 Januari 2020 VM===<br /> ====Dier====<br /> #Bedrijf is Leuven voor hamproductie met veel smaak. Hoe ga je dit doen? ((Bijvraag: over welk vet (intracellulair vet), welk dier (Iberico))<br /> #heterosis, wat is het en hoe komt het? (teken het schema, met de getallen van dominante en additieve effecten)<br /> #hoe maak je varkens resistent tegen een virus? door receptor te muteren of backcrossing met resistente varkens ((Bijvragen: waarom geen CRISPR/Cas (EU) en hoe heet die kruising (veredelingskruising)) <br /> <br /> ====Plant====<br /> #Recurrent selection, principe en hoe ga je het doen? Wat is het uiteindelijk resultaat, cultivar? Waarvoor kan je het gebruiken? Verschil tussen GCA en SCA, wat kan je hiermee doen? Hoe maak je GCA/SCA recurrent selection en waarvoor kan je ze gebruiken? Bijvragen over de verschillende soorten recurrent selection.<br /> #Brassicaceae type zelf incompatibiliteit. Moleculair/genetisch/cellulair mechanisme<br /> #barnase en barstar. Toepassing in veredeling?<br /> <br /> ===29 Januari 2020 VM===<br /> ====Dier====<br /> #Een lam voor vlees in Leuven, hoe? <br /> #recombination loss <br /> #z gelinkte veren bij kippen<br /> <br /> ====Plant====<br /> #F1 hybride geef de stappen voor dit op te stellen en het gebruik daarvan <br /> #tweepuntskruising en driepuntskruisen<br /> #F1 steriliteit en waarom is GxE belangrijk?<br /> <br /> ===28 Januari 2020 VM===<br /> ====Dier====<br /> #Ik heb een stuk grond in Leuven en ik wil een geit met veel melkproductie, wat doe ik?<br /> #Verdringingskruising uitleggen en tekenen met een schema<br /> #Hoe polygene eigenschappen opsporen met merkers en specifiek vb uitleggen<br /> <br /> ====Plant====<br /> #Pedigree methode uitleggen en vergelijken met bulk en SSD. Voor en nadelen van de pedigree methode en hoe kunnen moleculair merkers helpen?<br /> #Triploid block<br /> #SPA en voor en nadelen <br /> <br /> ===28 Januari 2020 NM===<br /> ====Dier====<br /> #In Togo heb je een bedrijf voor geitenmelk. Hoe zou je via genetica dit optimaliseren.<br /> #Kunstmatige bevruchting van vissen in aquacultuur uitleggen. Zijn hier problemen mee? Geef een voorbeeld.<br /> #Een bedrijf wordt ervan verdacht paardenvlees in de lasagne te gebruiken en dit niet te vermelden op het etiket. Stel een genetische test op om dit te achterhalen, hoe werkt de test?<br /> <br /> ====Plant====<br /> #Wat zijn doubled haploids? Hoe worden ze algemeen gemaakt en geef een voorbeeld? Waarvoor zouden DH's gebruikt kunnen worden in veredeling?<br /> #Geef het Solonaceae type zelf incompatibiliteit, moleculair en cellulair. Is dit gametofytisch of sporofytisch? is dit self recognition based of non-self? Wat zijn de complicaties in veredeling voor gewassen met dit soort ZI. <br /> #Wat is bulked segregant analysis?<br /> <br /> === 17 januari 2019 VM===<br /> ====DIER====<br /> #Schapen kweken; wat wil je, hoe en waarom?<br /> #Achterhalen van duroc vlees in vleeswaar, genetisch; hoe, wat zijn de stappen?<br /> <br /> ====PLANT====<br /> Mondeling<br /> #Wat zijn dubbele haploiden; definitie, hoe en waarom?<br /> Schriftelijk<br /> #Dominantie epistasie<br /> #Triploid block <br /> #Simple QTL<br /> <br /> ===17 januari 2019 NM===<br /> ====DIER====<br /> #Leg veredelings- en rotatiekruising uit met schema en voorbeeld, doel van beide uitleggen<br /> #Hoe QTL vinden die gelinkt is aan een hoger cholesterolgehalte in eieren<br /> ====PLANT====<br /> #Leg backcrossing uit (principe, doel) en hoe kunnen genetische merkers hierbij helpen<br /> #Erfelijkheid in enge zin: hoe berekenen, wat is invloed op keuze van veredeling en efficiëntie hiervan<br /> #Leg Linkage disequilibrium uit, wat is het nut hiervan in QTL<br /> #Leg solanaceae-type self incompatibility uit<br /> <br /> ===30 januari 2019 NM===<br /> ====DIER====<br /> #konijnen kweken; voor welke eigenschappen en hoe ga je te werk?<br /> #Je wil dezelfde spiergroei kenmerkend voor Belgisch Wit-Blauw in geiten, hoe ga je te werk?<br /> ====PLANT====<br /> Mondeling<br /> #Leg uit Backcrossing, hoe kunnen moleculaire merkers het proces versnellen?<br /> Schriftelijk<br /> #Brassicaceae type zelf incompatibiliteit<br /> #Heterosis en transgenese<br /> #Leg uit apomixie<br /> <br /> ===23 augustus 2019 VM===<br /> ====DIER====<br /> #kwaliteitsvol vlees, welke dieren en waarom?<br /> #schaap met goede vruchtbaarheid naar een ander schaap overbrengen, hoe ga je te werk?<br /> <br /> ====PLANT====<br /> #Dubbele haploiden<br /> #BSA<br /> #F1 steriliteit<br /> #overerfbaarheid (enge, brede zin)<br /> <br /> ===4 september 2019 NM===<br /> ====DIER====<br /> #Wat is heterosis? Hoe ga je dit gebruiken bij het selecteren van varkens?<br /> #Dood schaap gevonden met een bijwoonde. Hond of wolf? Wat ga je doen, leg elke stap uit?<br /> <br /> ====PLANT====<br /> #Backcrossing, wat is het, hoe doe je het en welke moleculaire merkers kunnen BC versnellen?<br /> #CGMS<br /> #SPA (QTL) mapping<br /> #Zaadloze vruchten, hoe ga je dit bekomen?<br /> <br /> === 17 januari 2018 ===<br /> ====Plant====<br /> # Wat is backcross breeding? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe kunnen moleculaire merkers helpen? (hij stelt op het moment zelf nog extra bijvragen)<br /> # Wat is linkage disequilibrium, hoe kan je het berekenen, wat is het effect van recombinatie?<br /> # Leg het Solonaceae type Zelfincompatibiliteit uit.<br /> # Wat is erfbaarheid in enge zin? Hoe bepaald het de veredelingsstrategie en de efficiëntie van veredeling?<br /> <br /> ====Dier====<br /> # Wat is veredelingskruising en rotatiekruising? Geef een schema en een voorbeeld waarbij het gebruikt wordt.<br /> # Hoe kan een QTL voor de cholesterol in de dooier van eieren gevonden worden?<br /> <br /> ===28 januari 2008===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Hardy-Weinberg<br /> ##genetische winst<br /> ##cytoplasmatische mannelijke steriliteit<br /> ##RNase<br /> ##transgressieve segregatie<br /> ##monosoom<br /> ##chimeer<br /> ##parthenogenie<br /> ##algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##inteeltdepressie<br /> #Het moeilijke bij het maken van hybride cultivars is het aanmaken en selecteren van de ouderlijnen<br /> #Belang van crossing over in plantenveredeling + hoe zit het met allotetraploïdie en autotetraploïdie<br /> #Bestendigheid: hoe bekomen?<br /> <br /> ===23 januari 2009===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokwaardeschatting<br /> ##SNP<br /> ##Recombinatiefractie<br /> #Je wil het genetisch rendement in een veehouderij verbeteren, op welke eigenschappen ga je selecteren? Pas dit toe voor varkens en melkkoeien. Hou hierbij rekening met : de markten met andere vereisten, welke rassen geef je een voorkeur , zijn kruisingen hierbij nuttig (rassennamen!)<br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Allelfrequentie<br /> ##Recurrente ouder<br /> ##Specifieke combinatiegeschiktheid<br /> ##Trisoom<br /> ##Insectenbestuiver<br /> ##QTL<br /> #Geef de soorten merkers voor verwantschapstesten en genenkaarten op te stellen. Geef voor- en nadelen en enkele bedenkingen.<br /> #Leg systeem synthetische cultivar met kruisbestuivers uit. Je krijgt zelfs de engelse uitleg erbij dat naast de figuur in de cursus staat. (bijvraagje was of je heterosis kan verliezen na de eerste polycross, ja want je werkt met halfsib je kent de vaders niet)<br /> <br /> ===21 september 2009===<br /> #Vraag 1:<br /> ##Overerfbaarheid<br /> ##SNP<br /> ##Koppelingsanalyse<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Antherencultuur<br /> ##Heterozygotie<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Cultivar<br /> ##Monosoom<br /> #(Dier) Bespreek de verschillende kruisingsschema’s met betrekking tot additieve effecten. Geef tevens van elk schema een voorbeeld. <br /> #(Plant) Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp van de figuur in de cursus. <br /> #(Plant) Zijn merkers handig bij het nagaan van de ploïdiegraad van planten. Moet men hierbij een onderscheid maken tussen zelfbevruchters en kruisbevruchters? Gaat dit even efficiënt bij alloploïden als autoploïden?<br /> <br /> ===24 januari 2013===<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Fokwaarde<br /> ##Allelfrequentie<br /> #musculaire dystonie: hoe ga je genetische test opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##AFLP<br /> ##Heterozygositeit<br /> ##Coëvolutie<br /> ##Prefertilisatiebarrière<br /> ##Genetische vooruitgang<br /> #Inteeltlijnen maken (voor hybride cultivars) is de moeilijkste stap voor aanmaak hybride cultivars. Bespreek deze uitspraak. <br /> #Tekening van plant A, B, A, R en hybride (bij cms); leg uit.<br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> ====DIER ====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Vermeerderingspiramide<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Genetische test ontwikkelen bij varkens voor vruchtbaarheidsgen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Heterozygoot (ivm merkers)<br /> ##AFLP<br /> ##...<br /> #Eigenschappen van merkers (polymorf) en uitleg erbij geven. <br /> #Selectieproblemen bij inteeltlijnen voor hybride cultivar aan te maken. <br /> #CMS bij hydride cultivar via tekening uitleg.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Zuivere lijn<br /> ##Bulmer effect<br /> #Op welke diersoort en op welke eigenschap zou je Genomic selection toepassen. <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Multitlijnveredeling(ivm merkers)<br /> ##Algemene combinatiegeschiktheid<br /> ##Effectief aantal allelen<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Wat maakt een cultivar bestendig? <br /> #Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? <br /> #Figuur van afstammelingenselectie van zelfbestuivers uitleggen.<br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Inteeltdepressie<br /> ##Stamboek<br /> #Hoe zou je een genetische selectie voor 'hoornloos' rund opstellen? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Dominante merker<br /> ##CMS<br /> ##Transgressieve segregatie<br /> ##Inteeltcoëfficiënt<br /> #Wat zijn volgens jou de problemen bij het veredelen van zelfbevruchters? <br /> #Uitleggen hoe je m.b.v. een merker op een genenkaart (reeds gelinkt aan een QTL) zou selecteren. <br /> #Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters uitleggen.<br /> <br /> ====DIER====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Fokdoel<br /> ##Heterosis<br /> #Hoe zou je bepalen of een ham van een iberico is? <br /> ====PLANT====<br /> #Vraag 1:<br /> ##Merkerdensiteit<br /> ##Genetisch recurrente selectie<br /> ##Similariteitscoëfficiënt<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde? <br /> #Leg schema uit: synthetische cultivar <br /> ===27 januari 2015===<br /> ====DIER====<br /> #begrippen <br /> ##selectierespons<br /> ##multiplex PCR<br /> ##stressgen <br /> #Wat is genomic selection en bij welke landbouwdieren zou je dit toepassen?<br /> ====PLANT====<br /> #Begrippen<br /> ##QTL <br /> ##merkerdensiteit<br /> ##isolijn <br /> ##specifieke combinatiegeschiktheid <br /> #Vragen<br /> ##Je wil tarwe veredelen voor aantal korrels per aar. <br /> ##Waarom is de bulk methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming? <br /> ##Welke moleculaire merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan? <br /> ##Bespreek het veredelingsschema voor de aanmaak van een synthetische cultivar (tekening met engelse tekst gegeven)<br /> <br /> <br /> ===21 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> #woordjes<br /> ##dominante merker<br /> ##simmulariteitscoëfficient<br /> ##algemene recombinatiegeschiktheid<br /> ##fenotypische recurrente selectie<br /> #vragen<br /> ##bestendigheid realiseren hoe?<br /> ##QTL gebruiken voor te veredelen op een eigenschap<br /> ##bulk methode zelfbestuiving uitleggen adhv figuur<br /> ====DIER====<br /> #Genomic selection<br /> ##op welk dier en welke eigenschap<br /> ##waarom<br /> ##hoe<br /> #PCR-RFLP:leg uit en geef een voorbeeld<br /> ===14 januari 2016===<br /> ====PLANT====<br /> SSR, fenotypisch recurrente selectie, dominante merker, verwachte heterozygotie<br /> Tekening van inteelt bij maïs<br /> De vraag van tarwe, bulk, en single-seed<br /> ====DIER====<br /> #Veredelings- en rotatiekruising<br /> #Genetische test voor vruchtbaarheid maken<br /> <br /> ===14 januari 2016 (2)===<br /> ====PLANT====<br /> #heterozygotie ( verwijzing naar deel biotechnologie), inteeltcoefficient(opnieuw verwijzen naar deel biotechnologie), prezygotische barriere, AFLP <br /> #wat is de moeilijkheid in het selecteren en maken van inteeltlijnen bij het maken van een hybridecultivar?<br /> # mondeling bespreking over artikel<br /> #verklaar de onderstaande tekening ( das de laatste figuur die we gezien hebben over hybridecultivars)<br /> ====DIER====<br /> #schets vermeerderingspiramide, wat is het?, bij welke dieren wordt het toegepast en waarom?<br /> #hoe kan men weten of vlees van een everzwijn is en niet van een gewoon varken?ontwikkel hiervoor een methode om dit na te gaan.<br /> <br /> ===31 januari 2017===<br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*CentiMorgan<br /> #*SNP<br /> #*genotype recurrente selectie<br /> #Leg de stelling uit: Is er bij een zelfbevruchtende plant meer genetische diversiteit bij een allotetraploïde of een autotetraploïde?<br /> #Artikel<br /> #Tekening synthetische cultivar bespreken. (Bijvragen: hoe zou je de eerste gekloonde lijn verkrijgen? (=inteelt), Waar ergens is er recurrente selectie (is dit genotypisch of fenotypisch)? (= genotypisch, bij de afstammingstest) Wordt de synthetische cultivar gebruikt voor additieve geneffecten? (= ja, want heterosis)<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Leg genetische vooruitgang uit aan de hand van een voorbeeld.<br /> #Hoe zou je een merker ontwikkelen voor vleeskwaliteit bij varkens? Hoe gebruik je dit in je selectie?<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM ===<br /> <br /> ====PLANT (mondeling)====<br /> #woordjes:<br /> #*aantal effectieve alleen<br /> #*BSA (bulk segregant analysis)<br /> #*recurrente ouder<br /> #*isolijn<br /> #Wat zijn volgens jou de grootste verschillen tussen veredeling bij zelf en kruisbevruchters?<br /> #Artikel <br /> #Geef uitleg bij afbeelding van bulk ... bij zelfbevruchters.<br /> <br /> ====DIER (uitzonderlijk schriftelijk)====<br /> #Vermeerderingspiramide <br /> #Geef techniek om hoornloze runderen via merkers te identificeren.<br /> <br /> === 23 januari 2017 ===<br /> <br /> ====PLANT (Reeks 8) ====<br /> <br /> Begrippen:<br /> <br /> *AFLP<br /> *Pre-fertilisatiebarrières<br /> *Inteeltcoëfficiënt (hij heeft ook graag de formule uit de cursus erbij)<br /> *...<br /> <br /> Vraag 2: De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.<br /> <br /> Vraag 3: Artikel (Eigen versie artikel mag je meebrengen, ook taak afdrukken en meebrengen. Hij heeft je taak zelf ook afgedrukt en er opmerkingen bij geschreven. Daarover gaan de vragen voornamelijk.)<br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ====DIER====<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vruchtbaarheidstest op voor schapen. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.<br /> <br /> <br /> === 27 augustus 2018 ===<br /> <br /> ====PLANT ====<br /> <br /> Beschrijf de begrippen adhv 3-4 woorden<br /> <br /> *Apomixis<br /> *Specifieke Combinatie Geschiktheid<br /> *Merkerdensiteit<br /> <br /> <br /> Vraag 2: Bespreek de verwantschapsonderzoek en cultivar identificatie adhv merkers<br /> <br /> Vraag 3: Artikel <br /> <br /> Vraag 4: CMS (tekening gegeven, maar te klein om tekst te kunnen lezen)<br /> <br /> ====DIER====<br /> <br /> Vraag 1: Vermeerderingspiramide. Leg uit aan de hand van een figuur. Waarom wordt dit gebruikt en bij welke landbouwhuisdieren wordt het toegepast?<br /> <br /> Vraag 2: Stel een vaderschapstest op voor honden. Leg stap voor stap uit hoe je te werk gaat.</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Dynamische_Biochemie&diff=3434 2023-06-11T07:59:13Z

<p>R0893094: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> <br /> Werd gedoceerd door prof. Johan Robben (met emeritaat in 2023) en werd geleidelijk aan overgenomen door prof. Susana Rocha. Het deel van professor Rocha was Engelstalig. Wanneer ze het vak volledig begon te doceren, heeft ze een deel in het Nederlands en een deel in het Engels gegeven. De leerstof komt uit de cursus ''Biochemistry'' van Reginald H Garrett en Charles M Grisham. Voor het studeren van het examen zijn echter ook de (zeer overzichtelijke) slides en hoorcolleges aan te raden.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> ===10 juni 2023===<br /> #Synthese van palmitinezuur<br /> #Serine proteases<br /> #Vergelijk het metabolisme van de lever na een maaltijd en na langdurig vasten aan de hand van een overzichtelijk schema<br /> #Begrippen:<br /> ##DAY bij pH 6,5<br /> ##Ribonucleotide synthetase<br /> ##kinesine<br /> ##gefaciliteerd transport<br /> <br /> ===30 augustus 2022===<br /> #Synthese palmitinezuur geven en de regulering ervan.<br /> #Vergelijk het metabolisme van de lever en de spier bij langdurige (maar aerobe) inspanning.<br /> #Op welke manieren kunnen eiwitten met het membraan verbonden zijn? (verduidelijk met figuur/schema)<br /> ## peptide: DPQ bij pH = 6<br /> ##transitietoestand<br /> ##serine protease<br /> ##coöperativiteit<br /> <br /> ===30 juni 2022===<br /> #Bespreek het enzymmechanisme van serine proteasen. Verduidelijk met tekeningen/schema<br /> #Op welke manieren kunnen eiwitten met het membraan verbonden zijn? (verduidelijk met figuur/schema)<br /> #Geef het C1 metabolisme en de link met andere pathways. Verduidelijk met een figuur/schema<br /> #Begrippen:<br /> ##WIK bij pH = 8<br /> ##Glycerolfosfaat-shuttle<br /> ##Pyruvaatcarboxylase katalyseert een anaplerotische reactie.<br /> ##Grafiek van ATP, ADP en AMP in functie van Energy Charge<br /> <br /> ===11 juni 2022===<br /> #Bespreek de glucose-homeostase (in het menselijk lichaam). Licht toe aan de hand van de betrokken metabolische pathways. <br /> #Leid de Michaelis-Menten vergelijking af voor een algemene enzymatische reactie. licht toe. <br /> #Bespreek de algemene N-flow bij de afbraak van aminozuren. Bespreek algemeen wat er met het C-skelet kan gebeuren. <br /> #Begrippen:<br /> ##KEY bij pH=8<br /> ##2,3-bisfosfoglyceraat<br /> ##Tubuline<br /> ##Tekening van Ramachandranplot gegeven<br /> <br /> ===1 september 2021===<br /> #De vorming van oxaalazijnzuur uit asparaginezuur is een anaplerotische reactie. Verduidelijk en situeer de plaats ervan in het metabolisme.<br /> #Bespreek het belang van de citraat-malaat-pyruvaat-shuttle bij de synthese van vetten uit suikers. Bespreek met een schema.<br /> #Bespreek het belang van waterstofbruggen in de structuur van proteïnen. Verduidelijk met tekeningen. <br /> #Begrippen<br /> ##PEK bij pH=8<br /> ##Verhouding kcat/Km<br /> ##Glycogeenfosforylase<br /> ##Serine-proteasen<br /> <br /> ===19 juni 2021===<br /> #Hoe kan je experimenteel de kinetische parameters bepalen van inhibitie? En werk dit mathematisch uit voor een competitieve inhibitor. (5 punten)<br /> #Bespreek hoe de moleculaire activiteit van motorproteïnen aan de basis ligt van transport binnenin de cel. (5 punten)<br /> #Welke weg legt stikstof af bij aminozuurafbraak + Wat gebeurt er met het koolstofskelet? Bespreek met een schema. (5 punten)<br /> #Begrippen (5 punten)<br /> ##HER tripeptide bij pH 5<br /> ##Carnitine shuttle<br /> ##Ribonucleotide reductase<br /> ##Verband tussen diabetes en ketonen<br /> <br /> ===2 juni 2021===<br /> #Leg adhv de transitietoestand uit hoe een enzyme werkt.<br /> #Leg adhv coöperativiteit en allosterie uit hoe de functie van hemoglobine biochemisch wordt bepaald.<br /> #Hoe wordt de glucose homeostase in stand gehouden in het menselijk lichaam en bespreek de biochemische pathways.(H22 slide 26 &quot;Glucose homeostase&quot; is belangrijkste)<br /> #Begrippen<br /> ##WIK peptide<br /> ##Actine als motorproteïne<br /> ##Glutamaat dehydrogenase<br /> ##Foto energy charge<br /> <br /> ===24 juni 2020===<br /> #Ramachandranplot gegeven, leg uit wat we hier uit kunnen afleiden, hoe komt dit tot stand, wat is het belang van deze analyse<br /> #Leg het glucose en vetzuurmetabolisme in de lever uit adhv citraat-malaat-pyruvaat shuttle, gebruik schema's<br /> #Begrippen<br /> ##WNL peptide<br /> ##ADA<br /> ##Energy charge<br /> ##Figuur Ken Dill's trechter<br /> <br /> ===19 juni 2020===<br /> #Hoe kan je experimenteel de kinetische parameters bepalen van inhibitie? En werk dit mathematisch uit voor een competitieve inhibitor. ''(6 punten)''<br /> #Bespreek de '''volledige''' metabolische afbraak van een TAG : 2x palmitinezuur, 1x linolzuur, 1x glycerol (NIET VERGETEN!!). ''(6 punten)''<br /> #Begrippen ''(2 punten/begrip)''<br /> ##Tripeptide PIK bij pH 8<br /> ##Actine als motorproteïne<br /> ##Gefaciliteerd transport<br /> ##Grafiek van ATP homeostase [https://drive.google.com/file/d/1hHmZiE98yXEb8oHjGywEZecAjy4yMmCY/view?usp=sharing]<br /> <br /> ===12 juni 2020===<br /> #leg uit hoe proteïnen interageren met het membraan. Leg uit met schema en figuren <br /> #wat is het c1 metabolisme en connectie met nucleotide synthese<br /> #begrippen<br /> ##RYS peptide<br /> ##serine-protease<br /> ##fructose-2,6-p<br /> ##glucose-alanine cyclus<br /> <br /> ===8 juni 2020===<br /> #Enzymatische regulatie glycogeenfosforylase + fysiologische context<br /> #Welke weg legt stikstof af bij aminozuurafbraak + Wat gebeurt er met het koolstofskelet?<br /> #Begrippen<br /> ##HEK tripeptide<br /> ##ribonucleotide reductase <br /> ##ES++<br /> ##grafiek van energy charge, (ATP homeostase?)<br /> <br /> ===23 augustus 2019===<br /> #Op welke manieren kunnen eiwitten met het membraan verbonden zijn, biochemisch en structureel? Verduidelijk met figuur/schema.<br /> #Bespreek de reciproke regulatie van de gluconeogenese en glycolyse.<br /> #Geef de afbraak van purinenucleotiden en welke metabolische stoornissen hiermee verband houden.<br /> #Begrippen<br /> ##tripeptide bij pH 5: HSD<br /> ##F-actine<br /> ##carnithine shuttle<br /> ##figuur van ATP homeostase<br /> <br /> ===25 juni 2019===<br /> #Bespreek de concepten allosterie en coöperativiteit a.h.v hemoglobine en myoglobine (formule van Hill coëfficiënt uitwerken) Bijvraag: waar bindt CO2/2,3-BFG<br /> #Bespreek met een overzichtelijke figuur de pentosefosfaatweg. Functie + regulatie<br /> #Bespreek de synthese en afbraak van VLDL. Geef de fysiologische functie<br /> #Begrippen<br /> ##tripeptide bij pH8: WEK<br /> ##jicht (bijvraag: allopurinol)<br /> ##THF (bijvraag: uit wat gemaakt? foliumzuur)<br /> ##Ken Dill's trechter (Bijvraag: waarom is de trechter open? omddat eiwitten dynamisch zijn)<br /> <br /> ===21 juni 2019 namiddag===<br /> #Bespreek de werking van een enzym aan de hand van de transitietoestand + toepassingen hierop. <br /> #Geef de afbraak van purinenucleotiden en welke metabolische stoornissen hiermee verband houden. <br /> #Vergelijk met een duidelijk schema de spier en lever bij 100m sprint ten opzichte van een langdurige aerobe inspanning (marathon).<br /> #Begrippen:<br /> ##tripeptide QFD bij pH5<br /> ##HMG-CoA reductase<br /> ##Hill-coëfficiënt<br /> ##afbeelding ramachandran plot<br /> <br /> ===21 juni 2019 voormiddag===<br /> #Bespreek hoe de stikstof afkomstig van aminozuren verteerd wordt. Wat gebeurt er met het koolstofskelet? <br /> #Welke factoren zijn van toepassing op de stabiliteit van de opvouwing en structuur van proteïnen? <br /> #Vergelijk met een duidelijk schema de spier en lever in rust ten opzichte van bij langdurige aerobe inspanning. Wat is de link tussen de twee organen? <br /> #Begrippen:<br /> ##tripeptide DHS bij pH8 (bijvraag: waaraan doet het samen voorkomen van deze drie aminozuren je aan denken?)<br /> ##CoA<br /> ##ribonucleotide reductase<br /> ##afbeelding Lineweaver-Burk plot van pure noncompetitieve inhibitie<br /> <br /> ===11 juni 2019 namiddag===<br /> #Wanneer kunnen aminozuren omgezet worden in glucose? Verduidelijk met een schema. Geef enkele voorbeelden en in welke fysiologische context dit kan. (mondeling)<br /> #Op welke manieren kunnen eiwitten met het membraan kunnen verbonden zijn, biochemisch en structureel? Verduidelijk met figuur/schema.<br /> #Glycogeen metabolisme (synthese, afbraak, regulatie)<br /> #Begrippen:<br /> ##tripeptide HIS bij pH8<br /> ##ketonen<br /> ##anaplerotische reactie<br /> ##grafiek van Hill equation<br /> <br /> ===11 juni 2019 voormiddag===<br /> #Beschrijf de volledige afbraak van volgend triacylglycerol (2 verzadigde, 1 onverzadigde).<br /> #Hoe kan je experimenteel het inhibitiemechanisme bepalen en werk mathematisch uit voor een competitieve inhibitor.<br /> #Bespreek de moleculaire activiteit van motorproteïnen bij spiercontractie.<br /> #Begrippen:<br /> ##tripeptide PER bij pH 6<br /> ##NADPH<br /> ##aspartaattransaminase<br /> ##figuur van ATP homeostase<br /> <br /> ===24 augustus 2018 namiddag===<br /> #Vergelijk wat er gebeurt in de lever, spieren en vetweefsel tijdens een korte, intense inspanning (sprint) en een lange marathon. Leg uit a.d.v. schema's/tekeningen.<br /> #Hoe zoek je in de praktijk uit volgens welk werkingsmechanisme een inhibitor werkt. Onderbouw theoretisch.<br /> #Leg uit hoe de moleculaire activiteit van motorproteïnen aan de basis ligt van spiercontractie.<br /> #Begrippen:<br /> ##tripeptide REK bij pH 6<br /> ##glucose-6-fosfaatdehydrogenase<br /> ##transaminatie<br /> ##afbeelding van Kenn Dill’s tunnel <br /> <br /> ===22 juni 2018 namiddag===<br /> #Geef het enzymmechanisme van serine proteasen. (ook reactiemechanisme tekenen)<br /> #Geef de metabolisatie van glucose en vetzuren in de lever. Verduidelijk met een figuur/schema.<br /> #Geef het C1 metabolisme en de link met aminozuren en nucleotiden. Verduidelijk met een figuur/schema<br /> #Begrippen:<br /> ##tripeptide WIS bij pH6<br /> ##carnitine shuttle<br /> ##2,3bisfosfaatglyceraat<br /> ##Grafiek van ramachandran plot werd gegeven.<br /> <br /> ===22 juni 2018 voormiddag===<br /> #Glycogeen metabolisme (synthese, afbraak, regulatie en fysiologische context)<br /> #Op welke manieren kunnen eiwitten met het membraan kunnen verbonden zijn? (verduidelijk met figuur/schema)<br /> #Geef het C1 metabolisme en de link met aminozuren en nucleotiden (verduidelijk met figuur/schema)<br /> #Begrippen<br /> ##tripeptide DHS <br /> ##alaninetransaminase<br /> ##anapleurotische reactie<br /> ##grafiek van hemoglobine<br /> <br /> ===1 september 2017 namiddag===<br /> #Bespreek met een duidelijke figuur hoe N het lichaam verlaat (krebs bicycle)<br /> #Op welke manieren kunnen eiwitten met het membraan connecteren?<br /> #Glycogeen fosforylase: welke reactie katalyseert het? Locatie? Fysiologische functie? regulatie?<br /> #Begrippen<br /> ##tripeptide RIP<br /> ##kinesine<br /> ##alfa-oxidatie<br /> ##grafiek van ATP homeostasis.<br /> <br /> ===28 juni 2017 voormiddag=== <br /> #Bespreek de motorproteïnen<br /> #Geef C1 metabolisme en link met nucleotiden synthese<br /> #Geef een schema van de opname, vertering, omzetting van lipiden in het lichaam<br /> #Begrippen<br /> ##tripeptide<br /> ##grafiek van ATP homeostasis<br /> ##acetyl-CoA carboxylase<br /> ##?<br /> <br /> ===27 juni 2017 voormiddag===<br /> #mondeling: geef de stabiliserende krachten van de vouwing en de structuur van eiwitten. Licht dit thermodynamisch toe.<br /> #Bespreek met een overzichtelijke figuur de pentosefosfaatweg en geef die zijn functies. (We moesten niet de volledige pentosefosfaatweg geven, enkel de belangrijkste stappen)<br /> #Bespreek met een figuur wat het verband is tussen eens suikerrijk dieet en zwaarlijvigheid.<br /> #4 begrippen:<br /> ##Tripeptide CRF bij pH 6<br /> ## carnitineshuttle<br /> ##de structuur van carbamoyl fosfaat<br /> ## serine protease<br /> <br /> ===23 juni 2017 namiddag===<br /> #mondeling: manieren waarop eiwitten met het membraan kunnen verbonden zijn.<br /> #cholesterol synthese + regulatie<br /> #C1 metabolisme bij nucleotiden<br /> #4 begrippen<br /> ##tripeptide KYV bij pH8<br /> ##actine<br /> ##citraat-pyruvaat-malaat shuttle<br /> ##structuur van creatinefosfaat<br /> <br /> ===23 juni 2017===<br /> #Glycogeen fosforylase: werking, lokalisatie, regulatie, fysiologische omstandigheden<br /> #Experimenteel type inhibitor bepalen + niet-competitieve inhibitor mathematisch uitwerken.<br /> #Omzetting glucose tot aminozuren: voorbeelden en fysiologische omstandigheden<br /> #4 begrippen<br /> ##MGD bij pH 6<br /> ## HMG-CoA<br /> ## ATP-homeostase<br /> ##Afbeelding ribonucleotide reductase<br /> <br /> ===17 juni 2017===<br /> #Allosterie en cooperativiteit hemoglobine (Bijvraag: grafiek allosterie zuurstof+Hb, hoe bindt Hb met zuurstof, haem-ring, Hill-coëfficiënt (+grafiek)) (mondeling)<br /> #Afbraak vertakt vetzuur adhv fytaanzuur (molecule gegeven) (schriftelijk)<br /> #N-Flow afbraak aminozuren, wat met koolstofskelet? (schriftelijk)<br /> #4 termen (mondeling)<br /> ##Tripeptide FYD (bij pH = 7)<br /> ##ribunocleotidereductase<br /> ##katalytische efficiëntie<br /> ##Afbeelding Ramachandran plot<br /> ===28 augustus 2015===<br /> #Bespreek allosterie en cooperativiteit aan de hand van Hemoglobine.<br /> #Bespreek de regulatie van de afbraak en synthese van glycogeen<br /> #Hoe worden aminozuren omgezet in glucose en in welke fysiologische omstandigheden kan dit gebeuren.<br /> #kleine vraagjes:<br /> ##DIK<br /> ##algemene zuurbase catalase<br /> ##AcetylCoenzymeA carbocylase (ACC)<br /> ===23 juni 2015===<br /> #bespreek schematisch de synthese en het export van lipiden in de lever.<br /> #wat is 1c metabolisme en welke rol speelt het in de nucleotide synthese.<br /> #Een vraagstuk waarin je formules over MM kinetiek moet toepassen (niet zo moeilijk. )<br /> #bespreek:<br /> ##willekeurig tripeptide<br /> ##pepck<br /> ##foto met membraanverankerde proteines<br /> ##transaminatie<br /> <br /> ===19 juni 2015===<br /> #Bespreek de glucose homeostase in het menselijk lichaam.<br /> #Bespreek schematisch de N-flow bij afbraak van aminozuren, vertel ook wat er gebeurd met het koolstofgedeelte.<br /> #Aspirine is een inhibitor voor het cyclo-oxygenase. Hoe kan je experimenteel te werk gaan om na te gaan of aspirine (I) op dezelfde plaats op het enzyume (E) bindt als het natuurlijke substraat arachidonzuur (S) dan wel op een plaats ver weg van de active site. Ondersteun je redenering met een vergelijking.<br /> #bespreek:<br /> ##tripeptide TAK bij pH 7 (K is dus ook geprotoneerd)<br /> ##Serine protease<br /> ##Glycerolfosfaat-shuttle<br /> ===12 Juni 2015===<br /> #Bespreek de enzymatische regulatie van glycogeenfosforylase en geef de fysiologische context (mondeling).<br /> #Geef schematisch de N-flux die voorkomt bij de afbraak van aminozuren. Wat gebeurt er met de koolstof? (schriftelijk)<br /> #Geef schematisch het metabolisme van de hersenen in goed gevoede staat en bij vasten. Welke rol spelen de lever en het vetweefsel? (schriftelijk)<br /> #Verklaar:<br /> ##ATP synthase<br /> ##Aminozurensequentie DIP bij pH 7<br /> ##Hill Coëfficiënt<br /> ===1 september 2014===<br /> #Glycogeen fosfatase: enzymatische regulering en metabolische condities<br /> #Wat zijn Ketone aminozuren en wanneer zijn ze van belang<br /> #Metabolisme lever en spieren bij rust en langdurige (aerobe)inspanning. Wat is de functie van de lever?<br /> #Bespreek:<br /> ##tripeptide: KAT<br /> ##Bohr effect<br /> ##Malonyl-Coa<br /> ##nucleotide dehydrogenase afbeelding<br /> ===24 Juni 2014===<br /> #Het kan je experimenteel de kinetische factoren van inhibitors bepalen?<br /> #Geef het C1 metabolisme van nucleotiden<br /> #Vergelijk het metabolisme van de lever en de spier. Zowel in rust als bij langdurige (maar aerobe) inspanning<br /> #verklaar de volgende termen:<br /> ##ATP synthase<br /> ##aminozuursequentie RAT<br /> ##het enzyme glycogeen fosforylase<br /> ##Bohr effect<br /> ===19 augustus 2013===<br /> #Bespreek de concepten allosterie en coöperativiteit a.h.v hemoglobine en myoglobine<br /> #Geef schematisch de stikstofflow bij afbraak aminozuren + wat gebeurt er met het koolstofgedeelte<br /> ##een lipideanker<br /> ##Glycogeenfosforylase<br /> ##Malaat-aspartaat shuttle<br /> ##Ramachandran plot<br /> ===21 juni 2013===<br /> #Bespreek de regulatie van glycogeen fosforylase. Geef telkens de fysiologische context.<br /> #Bespreek de omzetting van aminozuren in glucose. Geef de fysiologische context (bij de mens).<br /> #Geef uitleg:<br /> ##Hill-coëfficiënt<br /> ##Dyneine<br /> ##Afbeelding van structuur van S-adenosyl homocysteine<br /> ##Carnithine-shuttle<br /> ===25 juni 2012===<br /> #Bespreek het belang van motorproteïnen bij de spiercontractie.<br /> #Bespreek de rol van de lever in het triacylglyceridemetabolisme.<br /> #Geef uitleg:<br /> ##Hill-coëfficiënt<br /> ##Glutamine synthetase<br /> ##Sfingolipide<br /> ===25 juni 2011===<br /> #Bespreek hoe je de Km van een enzymatische reactie in theorie en in de praktijk bepaalt.<br /> #Leg uit hoe de concentratie van cholesterol in het cytosol wordt gereguleerd.<br /> #Bespreek de volgende begrippen:<br /> ##Tekening van Ramachandronplot<br /> ##Structuur van PEP<br /> ##Propionyl-CoA<br /> ##Glycogeen phosphorylase<br /> ===27 augustus 2010===<br /> #Bespreek van triacylglycerolen de vertering, opname, transport en metabolisme in het menselijk lichaam.<br /> #Bespreek volgende begrippen:<br /> ##glucose-alaninecyclus<br /> ##structuur<br /> ##glycogeenfosforylase<br /> ##Stiksoffixatie<br /> ===18 juni 2010 (NM Chemie minor B&amp;amp;B)===<br /> #Bespreek de relatie tussen het suiker- en vetzuurmetabolisme.<br /> #Bespreek volgende begrippen:<br /> ##Carbamoylfosfaat synthase<br /> ##Structuur van sfingomyeline was gegeven.<br /> ##Ornithine<br /> ##HDL<br /> ##Stiksoffixatie<br /> ===18 juni 2010 (VM)===<br /> #Bespreek de reciproke regulatie van de gluconeogenese en glycolyse.<br /> #Bespreek volgende begrippen:<br /> ##Acetyl-Coa-carboxylase<br /> ##Structuur van methionine is gegeven<br /> ##Fosfatidinezuur<br /> ##Alpha-oxidatie<br /> ##Energielading<br /> ===23 juni 2009===<br /> #Glycogeenmetabolisme (synthese, afbraak en regulering)<br /> #Bespreek de lipidebiosynthese in de lever<br /> #Leg volgende begrippen uit:<br /> ##Ornithine-transcarbomylase<br /> ##Ceramide<br /> ##carnithine-shuttle<br /> ===19 juni 2009===<br /> #Bespreek de homeostatische regulering van cholesterol in de levercel.<br /> #Vergelijk aan de hand van een figuur of tekening de energiestatus van een levercel na een maaltijd en na langdurig vasten. Wat is de rol van de lever?<br /> #Leg de volgende dingen uit:<br /> ##Pyruvaatcarboxylase<br /> ##Malonyl-CoA<br /> ##Ketonlichamen<br /> ===15 juni 2009===<br /> #Synthese palmitinezuur geven en de regulering ervan.<br /> #De ureumcyclus aanvullen (cofactoren, enzymen,...)<br /> #Verklaar de volgende 4 termen:<br /> ##Propionyl CoA<br /> ##Vitamine B<br /> ## ?<br /> ##?<br /> ===27 juni 2008===<br /> #Gluconeogenese en glycolyse met elkaar vergelijken qua regulatie etc.<br /> #VLDL metabolisme bespreken.<br /> #Korte vraagjes:<br /> ##Fosfatidine zuur<br /> ##Glutamaatdehydrogenase<br /> ##Nonsens repressie<br /> ##tructuur van propionyl-S-CoA<br /> ===26 juni 2008===<br /> #Palmitinezuur: synthese + regulatie (relatie vetzuur/suikermetabolisme).<br /> #Ureumcyclus/N-flow in de cel: zowat helft gegeven, hoop gaten in te vullen (producten, enzymes, structuren, cofactoren...).<br /> #Korte vraagjes:<br /> ##Coricyclus<br /> ##Chilomicronen<br /> ##Sphingomyeline<br /> ##Amino-acyl-tRNAsynthase</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Microbiologie&diff=3211 2023-01-24T13:17:54Z

<p>R0893094: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Microbiologie wordt tegenwoordig in het tweede jaar gegeven. Vroeger was dit het derde jaar. Ook verhuisd van tweede naar eerste semester. Wordt gevolgd door studenten biologie en biochemie. Gedoceerd door Prof. Joris Winderickx. Normaal mondeling examen, wegens COVID toch schriftelijk. Practicum wordt geëvalueerd via een één verslag over al de practicumsessies.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 24 Januari 2023 ===<br /> (A) restrictie-modificatie systeem en CRISPR-Cas mechanisme uitleggen. (B) Welke invloed heeft dit op het ecosysteem? /5<br /> <br /> Detoxificatie van zuurstof bij micro-organismen. /5<br /> <br /> verklaar volgende termen en geef het verband/verschil:<br /> *MIC en fenolcoëffiënt<br /> *Fimbrae en cirri<br /> *commensalisme en mutualisme<br /> *virulente virussen en getemperde virussen<br /> *watercoëfficiënt en compatable solute<br /> *Nitrificatie en anammox<br /> *anaerobe respiratie en fermentatie<br /> *Zoönose en anthroponose<br /> <br /> === 13 Januari 2023 ===<br /> #(A)Bacteriën delen door binaire splijting. Wat weet je over het divisoom? Hoe vindt de cel het centrum? (B) Welke parameters kan men afleiden uit een groei curve? /5<br /> #Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te maken dan een antiviraal middel? Gegeven dat het een RNA-Virus is, op welke doelwitten zou een antiviraal middel kunnen inwerken? Hoe kan je testen of je antiviraal middel effectief is? /5<br /> <br /> #verklaar volgende termen:<br /> #*cilia<br /> #*amensalisme<br /> #*hydrogenosoom(+reactie)<br /> #*MIC<br /> #*Wateractiviteit<br /> #*amphixenose<br /> #*Viroide<br /> #*persistente infectie<br /> <br /> === 25 Januari 2022 ===<br /> <br /> Hoe worden micro-organismen resistent? Welke mechanismen zorgen ervoor dat ze resistent zijn? Hoe wordt dit overgedragen? Is dit species-specifiek? /5<br /> <br /> Bespreek de bouw en werking/functie van prokaryote flagellen (Gram neg., gram pos. en Archaea). Vergelijk ook met eukaryote flagella. Bespreek fototaxis en verklaar hoe dit voordeel geeft in een ecosysteem. /5<br /> <br /> Stelling juist/fout + verklaar /4<br /> <br /> *Geen enkele bacterie (Bacteria + Archaea) kan leven zonder celwand <br /> <br /> *Een hydrogenosoom komt voor bij prokaryoten en oxideert pyruvaat tot AcCoA.<br /> <br /> *Decimale reductietijd neemt af bij toenemende verhittingstemperatuur <br /> <br /> *B-lactam werkt alleen op gram+ <br /> <br /> *Bij een persistente infectie wordt de gastheercel vernietigd.<br /> <br /> *Stikstoffixatie komt vooral voor in anoxygene condities <br /> <br /> *Chemolithotrofen halen hun energie uit fermentatie met substraatfosforylatie<br /> <br /> *Cyanobacteriën hebben phycobillisomen voor optimale lichtcaptatie<br /> <br /> === 17 januari 2022 ===<br /> #Leg de Baltimore-classificatie schematisch uit en verklaar op basis van wat deze gebaseerd werd. Hoe zou je een antiviraal middel maken voor Hepadnavirussen en op welke processen zou dit kunnen inwerken? Hoe kan je testen of dit middel effectief is?<br /> #Vergelijk de celwand van Archaea en grampositieve bacteriën door een gedetailleerde tekening te geven van de polysaccharideketen. Geef verschillende methodes om deze organismen van elkaar te scheiden.<br /> #Begrippen: Leg ze apart uit en geef gelijkenissen en verschillen. <br /> #*anammox - denitrificatie<br /> #*cirri - fimbrae<br /> #*fermentatie - anaerobe respiratie<br /> #*persistente infectie - latente infectie<br /> <br /> === 21 augustus 2021 ===<br /> #Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te maken dan een antiviraal middel? Waar bij een RNA-virus zou een antiviraal middel inwerken? Hoe kan je testen of je antiviraal middel effectief is?<br /> #Vergelijk de celwand van Gram negatief en positief aan de hand van tekeningen, vergelijk ook met celwand van eukaryoten en archaea. Hoe kan je Gram positief en Gram negatief onderscheiden, geef verschillende methodes.<br /> #Begrippen<br /> #*amensalisme - commensalisme<br /> #*wateractiviteit<br /> #*cycloheximide<br /> #*teichoïnezuur<br /> #*persistente en latente infectie<br /> #*MIC en fenolcoëfficient<br /> #*Cirri<br /> #*hydrogenosoom<br /> <br /> === 15 januari 2021 NM ===<br /> #Bespreek de bouw en inplanting van bacteriële flagella. Vergelijk ook met eukaryote flagella en cirri. Bespreek chemotaxis.<br /> #Welk is het belangrijke enzyme voor stikstoffixatie? Andere vormen van stikstof (zoals ammoniak) zijn zeer belangrijk, verklaar.<br /> #Verklaar en leg de verschillen/gelijkenissen uit:<br /> #*mesofiel - pathogeen<br /> #*guilde - gemeenschap<br /> #*retrovirus - hepadnavirus<br /> #*chemo-organotrofe anaerobe respiratie - fermentatie<br /> #*hydrogenosomen - mitochondriën<br /> #*antisepsis - desinfecteren<br /> #*mutualisme - protocoöperatie <br /> #* generatietijd - delingsefficiëntie <br /> === 11 januari 2021 NM ===<br /> #<br /> #Detoxificatie van micro-organismen<br /> #a) Leg het verschil in celwandstructuur tussen Gram-positieve en Gram-negatieve bacteriën uit en op welk principe berust de Gram-kleuring. b)Leg kort de celwand bij archaea en eukaryoten uit. c)Welke andere manieren, naast Gram-kleuring, zijn er om Gram-positieve en Gram-negatieve bacteriën van elkaar te onderscheiden?<br /> #Verklaar en leg de verschillen/gelijkenissen uit:<br /> #*guilde - gemeenschap<br /> #*retrovirussen - hepadnavirussen<br /> #*amensalisme - commensalisme<br /> #*chemo-organotrofe anaerobe respiratie - fermentatie<br /> #*generatietijd - delingsefficientie<br /> #*hydrogenosomen - mitochondriën<br /> #*antisepsis - desinfecteren<br /> #*nog 1tje<br /> <br /> === 17 augustus 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te ontwikkelen dan een antifungaal en een antiviraal middel? Gegeven dat het een RNA-virus is op welke processen/enzymen kan een antiviraal middel inwerken? b) Hoe kan je gemakkelijk testen of een middel tegen fagen effectief is?<br /> #a) Wat is de structuur, inplanting en werking/functie van prokaryote flagella en aanverwante structuren? Wat is het verschil met eukaryote flagella en aanverwante structuren en leg het principe van chemotaxis uit. b) Leg bondig phototaxis uit. <br /> #Begrippen <br /> #*Eclipsperiode<br /> #*Tegument<br /> #*viroïde<br /> #*Evolutionaire chronometers<br /> #*Griseofulin<br /> #*Mechanisme voor CO2 fixatie door de acetyl CoA pathway<br /> #*Peplomeren<br /> #*Quinolones<br /> <br /> === 20 januari 2020 NM ===<br /> #<br /> # Bespreek structuur en functie van flagella. Geef gelijkaardige structuren tussen gram-positieve en gram-negatieve [[Bacteria]]. Geef gelijkaardige structuren bij ''Archaea'' en eukaryoten. <br /> # Over resistentie, wat de mechanismen zijn, of dat species specifiek of aspecifiek is. Alternatieve therapieën tegen resistentie....<br /> #Begrippen:<br /> #*PFU en CFU<br /> #*Ammencialisme en commensialisme<br /> #*aw<br /> #*Cirri<br /> #*Teichoïnezuur<br /> #*MIC en fenolcoëfficient<br /> #*cycloheximide<br /> #*nog eentje<br /> <br /> === 17 januari 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Geef de functie en structuur van prokaryote flagel. Is er een verschil tussen grampositieve en gramnegatieve bacteria flagel? Geef ook analoge structuren. b) Geef minstens 3 andere methoden om grampositieve van de gramnegatieve bacteriën te scheiden (niet via gramkleuring). Hoe kan men in een waterstaal archaea, bacteria &amp; eukarya onderscheiden?<br /> #a) Detoxificatie van giftige zuurstof molecule. b) Welke rol zuurstof en gebonden stikstof componenten (zoals ammoniak) een invloed hebben op de stikstofcyclus?<br /> #Stellingen<br /> #*S-lagen zorgen voor vasthechting van de cel<br /> #*Cephalosporine werkt in op translatie<br /> #*&quot;Naakte&quot; en &quot;Envelopped&quot; virussen worden op dezelfde manier vrijgezet<br /> #*Viroïde is de niet infectieve vorm van een virus<br /> #*In hydrogenosoom zitten hydrogenasen<br /> #*Phycolisomen zijn enkel bij cyanobacteriën te vinden<br /> #*en nog 2 andere<br /> <br /> === 14 januari 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Influenza: verklaar HxNx, antigene shift, antigene drift. In welke Baltimore klasse bevindt influenza zich? b) waarop kunnen antivirale middelen inwerken? geef ook voorbeelden. Hoe zou jij te werk gaan om een nieuw antiviraal middel te maken?<br /> #Vergelijk celwand archae, gramnegatieve en grampositieve (structuren allemaal kunnen tekenen). ZIjn er zonder celwand, zo ja welke? Welke manieren zijn er naast gramkleuring om gramnegatieve en grampositieve van elkaar te onderscheiden? Hoe zou je in een waterstaal Archae, bacteria en eukarya onderscheiden van elkaar (zo min mogelijke stappen)<br /> #Begrippen<br /> #*syntorfie<br /> #*viroide<br /> #*evolutionaire chronometers<br /> #*streptomycines<br /> #*endo- en exotoxine<br /> #*anammoxoom<br /> #*Hydrogenesoom<br /> #<br /> <br /> === 13 januari 2020 NM ===<br /> <br /> #VRAGEN<br /> 1. antibiotica alles uitleggen hoe resistentie opbouwen, species specifiek? <br /> 2. Antifungale drugs voor membraansynthese en proteinsyntheseninhibitie + hoe bepaal je of een drug fungistatisch is?<br /> 3. Wat zijn biogeochemische cycli en leg dit uit adhv de N cyclus, geef alles + verklaar anammox reactie en stikstoffixatie<br /> <br /> #BEGRIPPEN<br /> <br /> Wateractiviteit<br /> Profaag<br /> Anammoxosoom<br /> Chlorosoom<br /> Stickland reactie<br /> Persistente infectie<br /> Endotoxine<br /> Surfactant<br /> <br /> ===5 september 2019===<br /> #<br /> # a) Influenza: verklaar HxNx, antigene shift, antigene shift. In welke Baltimore klasse bevindt influenza zich? b) waarop kunnen antivirale middelen inwerken? geef ook voorbeelden. Hoe zou jij te werk gaan om een nieuw antiviraal middel te maken en te TESTEN? <br /> #Geef een schematische voorstelling van de anoxygene fotosynthese van purperbacteriën en groenzwavelbacteriën, alsook de oxygene fotosynthese van cyanobacteriën. Bespreek de voornaamse verschillen, inclusief morfologische kenmerken, en plaats dit in een algemeen microbieel ecologische context.<br /> #Begrippen<br /> #*cilia<br /> #*viroide<br /> #*profaag<br /> #*persistente infectie<br /> #*wateractiviteit<br /> #*tegument<br /> #*MIC<br /> #*amensalisme<br /> <br /> ===14 januari 2019===<br /> #<br /> #*Hoe worden micro-organismen resistent? Welke mechanismen zorgen ervoor dat resistent zijn? Hoe wordt dit overgedragen? Welke van deze manieren zijn species-specifiek en welke species-aspecifiek?<br /> #*Je hebt een bodemstaal met micro-organismen, hoe ga je na dat deze micro-organismen een fungistatische werking hebben? + leg uit micro-organismen die groeien in het labo en micro-organismen laten groeien die niet in het labo kunnen groeien. Leg kort uit.<br /> #Leg uit HxNx, antigene drift en shift, waarom kan dit laatste zo snel gebeuren bij het influenzavirus? Tot welke klasse van Baltimore behoort Influenza. Geef het schema van de Baltimore classificatie en leg de principes uit.<br /> #Begrippen<br /> #*Syntrofie<br /> #*Evolutionaire chronometers<br /> #*Hydrogenosoom (+ reacties)<br /> #*Streptomycine<br /> #*Heterotroof<br /> #*Annamox<br /> #*Viroïde<br /> #*Endo- en exotoxines<br /> <br /> ===21 augustus 2018===<br /> #Je krijgt een waterstaal, hoe weet je welke GEKENDE micro-organismen hier inzitten waarvan je een metabool product wil onderzoeken. Hoe kan je testen dat dit een fungicide is?<br /> #Bespreek flagellen bij pro- en eukaryoten en leg chemotaxis uit<br /> #begrippen<br /> #*Surfactant<br /> #*tegument<br /> #*bacilli<br /> #*hydrogenosoom<br /> #*wateractiviteit<br /> #*phycobillisoom<br /> #*hopanoïde<br /> #*nog eentje maar ben ik vergeten<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> #Wat is een biogeochemische cycli? Geef schematisch de stikstofcyclus en beschrijf de voornaamste processen.<br /> #Bespreek de structuur, inplanting en werking van prokaryote flagellen en aanverwante structuren als ook het mechanisme van chemotaxis. Welke verschillen zijn er met een eukaryote flagel?<br /> #Begrippen: axiaal filament, griseofulin, peplomeren, quinolones, evolutionaire chronometers, mechanisme voor CO2 fixatie door de acetyl CoA pathway, viroïde, hopanoïde<br /> <br /> ===22 januari 2018 VM===<br /> #Leg uit: biogeochemische cycli. Geef schematisch de stikstofcyclus weer en bespreek de belangrijkste reacties. <br /> #Je krijgt een bodemstaal waaruit je onbekende micro-organismen moet identificeren, hierin zit een organisme dat metabole producten maakt die antifungicidaal werken, deze kunnen dienen voor een nieuw middel. Hoe ga je (zo efficiënt mogelijk) te werk?<br /> #begrippen: PFU en CFU, MIC en fenolcoëfficiënt, latente en persistente infectie, cirri, Aw, cycloheximide, commensalisme en ammensalisme en teichoïnezuur<br /> <br /> ===19 januari 2018===<br /> #Bespreek de structuur, werking en inplanting van bacteriële flagellen (met tekening). Wat is het mechanisme van chemotaxis? Wat zijn de verschillen met eukaryote flagellen.<br /> #Welke detoxificatiemechanismen zijn er van toxische zuurstof. Geef de enzymen en hun reacties. Hij wilt ook dat je een extra voorbeeld geeft. Wat is het belang van zuurstof in een microbiële ecosysteem.<br /> #8 termen: cycloheximide, sulfonilamide, aw, lysozymen, amensalisme, phycobiline, acetyl-CoA pathway en hepadnavirus<br /> <br /> ===15 januari 2018===<br /> #Bespreek kort de oxygene en anoxygene fotosynthese van micro-organismen en hun reducerend vermogen. Leg fermentaties van micro-organismen uit, hoe wordt hiermee energie gewonnen? /5<br /> #A)Waarvoor staat HxNx? B) Leg de Baltimore-classificatie uit. Welke types virussen hebben eigen polymerasen? C) weet ik niet meer, maar ook iets met virussen /5<br /> #8 stellingen, per juist antwoord 0,5 1)cyloheximine werkt niet op gramnnegatieve bacteriën 2)antibiotica-resistentie wordt aspecies-specifiek doorgegeven en voornamelijk via transductie 3)een guilde is een groep van klonaal verwante cellen 4)bij een peristenta infectie komen viruspartikels niet vrij en blijft de gastheer leven 5)bij amensalisme hebben beide partners altijd een voordeel 6)bij een hydrogenosoom wordt ATP geproduceerd via hydrolyse en H+ 7)een virion reffereert naar de extrcellulaire vorm van een virus 8)ben ik vergeten /4<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM===<br /> #bespreek de structuur en werking van de flagel bij bacteriële cellen + bespreek chemotaxis<br /> #detoxificatie van zuurstof<br /> #8 stelling juist/fout + verklaar<br /> #*gramnegatieve bachteriën zijn niet gevoelig voor beta-lactam ring <br /> #*antibiotica-resistentie is species-specifiek<br /> #*decimale reductietijd neemt af bij toenemende verhittingstemperatuur<br /> #*hydrogenosomen bij prokaryoten halen hun energie uit de oxidatie van pyruvaat<br /> #*stikstoffixatie komt vooral voor in anoxygene condities<br /> #*persistentie infectie van viruspartikels vernietigd de gastheercel<br /> #*geen enkele bacterie (Bacteria + Archaea) kan leven zonder celwand<br /> #*energiewinst bij fermentatie komt altijd van substraatfosforylatie<br /> <br /> ===23 januari 2017 NM===<br /> #bespreek hoe het kleine virale genoom toch een volledige functie qua replicatie en assemblage van een virus kan veroorzaken. geef voorbeelden en leg uit<br /> #virussen zijn niet altijd negatief. Bespreek en geef een voorbeeld ivm humaan microbioom<br /> #je hebt een bodemstaal met micro-organismen, hoe ga je na dat deze micro-organismen een fungistatische werking hebben? + leg uit micro-organismen die groeien in het labo en micro-organismen laten groeien die niet in het labo kunnen groeien.<br /> #vancomycine slaat niet aan, welke combinatie is het beste? keuze uit: vancomycine + cycloheximide/amphotericini/isoniazide/sulfanilamide<br /> #leg verschil en gelijkenis uit + bespreek<br /> #*mesofiel-pathogeen<br /> #*antiseptica-desinfectans<br /> #*fermentatie-chemoorganotroof anaeroobe respiratie<br /> #*chemoorganotroof-chemolithotroof<br /> #*generatietijd-delingscoefficient<br /> #*sporecortex-bacteriele celwand<br /> #*guilde-gemeenschap<br /> #*commensalisme-amensalisme<br /> <br /> ===23 januari 2017 VM===<br /> #bespreek de celwand bij gram - en gram + bacteriën en archaea. geef een manier om bacteria, archaea en eukaryoten te scheiden. geef minstens 3 manieren hoe je gram + en gram - bacteriën kan onderscheiden (zonder gram kleuring) <br /> #afbeelding cel met onderdelen aangeduid (celwand, 50S,...) geef voorbeelden van antibiotica die hier op inwerken en leg hun werking uit.<br /> #8 juist of fout vragen<br /> <br /> ===26 januari 2016===<br /> #Gegeven een tekening van een virtuele cel van een micro-organisme (aangeduid: DNA synthese, RNA synthese, mitotische spoelfiguur en microtubuli, celwand, plasmamembraan, translatie, foliumzuursynthese). Geef alle antimicrobiële middelen die erbij horen. Bespreek de mechanismen van de antimicrobiële middelen bij een verschillende manier van inwerking. <br /> #Flagellen pro-en eukaryoten (ook tekenen!). Welke andere bewegingsvormen ken je nog? Leg taxis uit. <br /> #Leg uit en bespreek de gelijkenissen en/of verschillen:<br /> #*halofielen - osmiofielen<br /> #*autotroof - heterotroof<br /> #*bacteriële celwand - sporeprotoplast<br /> #*chemoorganotroof - ...<br /> #*chemoorganofiel - ...<br /> #*chemooragnofiel anaeroobe respiratie - ...<br /> #* ...<br /> <br /> ===22 januari 2015===<br /> #Flagellen en cirri bij pro- en eukaryoten, bespreek chemo- en fototaxis.<br /> #Detoxificatiemechanismen<br /> #Acht stellingen, juist/niet juist en waarom (ieder op 0,5 punt)<br /> #*B-lactam werkt alleen op gram +<br /> #*Resistentie is species-specifiek<br /> #*Decimale reductietijd daalt altijd bij hogere T<br /> #*Bij fermentatie vindt de energiewinning altijd plaats door substraatfosforylatie<br /> #*Bacteria en Archaea kunnen nooit leven zonder celwand<br /> #*Stikstoffixatie is vooral anoxisch<br /> #*Hydrogenosomen komen voor bij prokaryoten waar ze pyruvaat oxideren tot -<br /> #*en nog een die ik me niet meer herinner.<br /> <br /> ===27 januari 2015===<br /> #verschil oxygene en anoxygene fototrofie + energie bij fermentatie<br /> #welke manieren van voortbeweging, verschil in pro en eukaryoten, (sex)pili, welk competitief voordeel?<br /> #juist/fout vragen<br /> <br /> ===19 januari 2015 (NM)===<br /> #Mechanismen van restentie en resistentie overdracht. Is resistentie speciesspecifiek? Methoden voor het post-antibioticatijdperk.<br /> #Photosynthese bij purperbacterien, groenzwavelbacteren en cyanobacterien schematisch tekenen en verschillen uitleggen. Linken met morfologie en ecologie. <br /> #8 juist-fout vraagjes<br /> #*Gram-negatieve bactierien zijn vatbaar voor ampicilline en amoxicilline.<br /> #*Ergosterolsynthese is geen goede target voor antifungale drugs.<br /> #*Bij een latente infectie komen er geen virusgenen tot expressie en komen er geen virussen vrij.<br /> #*Het nitrogenasecomplex werkt vooral in anoxische omstandigheden<br /> #*Een hydrogenosoom komt voor bij prokaryoten en oxideert pyruvaat tot AcCoA.<br /> #*...<br /> <br /> <br /> ===19 januari 2015 (VM)===<br /> #koolstofcyclus schematisch tekenen en alle metabole processen uitleggen (reacties zijn niet zo belangrijk)<br /> #Wat is de beste combinatie en slechtste combinatie? flucytosine + polyeen, griseofuline en polyeen, vancomycine en polyeen, en er was dan nog eentje maar die weet ik niet meer <br /> #woordjes uitleggen: <br /> #*exosporium <br /> #*evolutionaire chronometers <br /> #*omgekeerde citroencyclus<br /> #*...<br /> <br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> #Virussen zijn gekenmerkt door een klein genoom. Toch hebben ze alles om te voorzien in hun replicatie. Verklaar aan de hand van enkele voorbeelden. Sommige virussen hebben echter ook eigen polymerase enzymes nodig, identificeer hen aan de hand van de baltimore classificatie.<br /> #Je wordt gevraagd onbekende micro-organismen uit een staal water te identificeren; welke technieken gebruik je en hoe ga je te werk om te kijken of sommigen de mogelijkheid bezitten tot de productie van een fungistatisch middel om het te commercialiseren.<br /> #O2 kan giftig zijn; geef de detoxificatiemechanismen die micro-organismen bezitten om dit te bestrijden<br /> <br /> ===21 januari 2014===<br /> #de koolstofcyclus en metabole processen <br /> #detoxificatie mechanisme van zuurstofderivaten die door metabole processen geproduceerd worden en dan ne fungus bestrijden met een combinatie. <br /> #combinaties werden gegeven allemaal met myconazol: uitleggen welk het beste werkte en welk het minst.<br /> <br /> === 20 jan 2014 (namiddag) ===<br /> #koolstofcyclus<br /> #mechanismen van detoxificatie<br /> #patient is besmet met Candida, een syntetische azool werkt niet goed. Welke antibiotica mengeling is de beste? Gegeven = telkens een syntetische azool in combinatie met flucytosine, griseofulin, vancomycine, en nog 1 dat ik niet meer weet<br /> <br /> ===20 januari 2014 voormiddag===<br /> #antibioticaresistentie: hoe, verschillende mechanisme, hoe krijgen we dat in het lichaam<br /> #fungistatische drugs in natuurlijke bodem, hoe herkennen en er uit halen<br /> #virussen: verklaar HxNx, antigendrift en antigenenschift en waarom gaat antigenenschift zo gemakkelijk en baltimoreklassen van influenza + verklaren<br /> #woordjes<br /> #*hopanoide (hier moet ge dat dan vergelijken met sterol in eukaryoten enzo)<br /> #*hydrosoom<br /> #*viroiden<br /> #*endotoxine<br /> <br /> === 31 jan 2012 (voormiddag) ===<br /> # Geef de koolstofcyclus en leg kort alle processen uit die hierin voorkomen. (mondeling)<br /> # Een schema van een cel waarop verschillende delen aangeduid stonden (celwand, membraan, DNA+RNA-synthese, 50S ribosoon-subunit, 30 S ribosoom-subunit). Geef bij elk deel de antibiotica die hierop inwerken en leg, als er meerdere antibiotica bij bij één passen, hun actiemechanismen uit.<br /> # Verklaar:<br /> #* Fenol-coëfficiënt methode<br /> #* Virion<br /> #* Rolling-circle replicatie<br /> #* O-anitgen<br /> #* Fermentatiebalans<br /> #* Anamoxosoom<br /> #* Decimale Reductietijd<br /> #* Hopanoïde<br /> <br /> === 26 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Anoxigene fotosynthese bij purperbacterien en oxygene bij cyanobacteriën: Een schets geven en vergelijken.<br /> # Celwandstructuur bij bacteria(grampos en gram negatief)en archaea bespreken en vergelijken. En met welke techniek zou je deze kunnen onderscheiden<br /> # Een patiënt met een bacteriële infectie werd behandeld met chloramphenicol maar dit was niet erg werkzaam. Men zou kunnen combineren met vancomycine, tetracycline en cephalosporine. Wat gaat het minst werkzaam zijn? en welk het meeste?<br /> <br /> === 25 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Wat is metagenomics, wat kun je met deze techniek doen en beschrijf de voordelen aan de hand van een creatief (zelfverzonnen)voorbeeld<br /> # Stikstoffixatie: Bespreek en wat heeft zuurstof hiermee te maken?<br /> # Geef de biochemische werkingsmechanismen van: quinolones, aminoglycosiden, synthetische azolen en sulfonamides<br /> <br /> === 17 jan 2011 (namiddag) ===<br /> <br /> # Wat is metagenomics, wat kun je met deze techniek doen en beschrijf de voordelen aan de hand van een creatief (zelfverzonnen)voorbeeld<br /> # nitrificatie, denitrificatie en stikstoffixatie zijn belangrijke processen. Bespreek bondig de reacties en plaats in de stikstofcyclus. Wat heeft zuurstof hiermee te maken?<br /> # vergelijk de opbouw van de celwand van gram positieve en negatieve bacteriën met behulp van een schema, hoe zou je eenvoudig een onderscheid kunnen maken?<br /> <br /> === 21 jan 2010 ===<br /> # Geef de schematische voorstelling van de anoxigene fotosynthese bij purperbacteriën en de oxigene fotosynthese bij cyanobacteriën. Bespreek verschillen, incl. morfologische kenmerken en plaats dit in een algemeen microbiële context.<br /> # Hoe weet je of een medicijn bacteriostatisch, bacteriolytisch, bacteriocide, fungistatisch, fungicide is. (bijvraag: hoe zou jij dat bepalen als biochemist?) Wat is MIC en hoe bepaal je dat, fenolcoëfficient bespreken. De criteria bespreken voor een medicijn, antiseptica, desinfectans.<br /> # Mexicaanse griep is van het type H1N1. Leg uit wat HxNx is en leg antigene shift en antigene drift uit. Tot welke baltimore klasse behoort influenza.(bijvraag: middelen tegen influenza)<br /> <br /> === 11 jan 2010 ===<br /> # zuurstof kan toxisch zijn voor micro-organisme. Welke reactie zorgen voor de omzetting van deze toxische zuurstof?<br /> # bespreek de biochemische werkingsmechanisme van ampiciline en cephalosporine<br /> # geef alle pathways voor C02 fixatie? (het zijn er btw 8 en geen 5 zoals de meeste denken)<br /> === 27 jan 2009 ===<br /> <br /> # Verklaar:<br /> #* Baltimore classificatie<br /> #* tegument<br /> #* psychrotolerante mesofiel<br /> #* peritrieche flagelaat<br /> # Methanotrofen en methylotrofen, geef energiewinning en koolstof assimilatie<br /> # antifungale drugs; waarom moeilijker te maken dan antibacterieel en bespreek de reactiemechanismen van <br /> === 23 jan 2009 ===<br /> # C02 fixatie<br /> # hoe ga je te werk om uit een bodemstaal 1) alle micro-organismen te identificeren 2) een fungistatisch metaboliet te zoeken<br /> # Termpjes:<br /> #* aw<br /> #* serine pathway<br /> === 23 jan 2009 ===<br /> # Een gistcultuur is geïnfecteerd met cyanobacteriën. Geef een aantal manieren om weer een zuivere gistcultuur te verkrijgen.<br /> # Juist of fout vragen:<br /> #* S-lagen<br /> #* iets over pseudopeptidoglycaan van Archaea<br /> #* phycobilines<br /> #* de manier van vrijstelling van naakte vs 'enveloped' virussen<br /> #* cephalosporine<br /> # Nitraatreductie. En bespreek deze bij E.coli en Pseudomonas stutzeri.<br /> === 16 jan 2009 ===<br /> # 5 woorden verklaren:<br /> #* cephalosporine<br /> #* phycobilisoom<br /> #* hepadnavirussen<br /> #* serine pathway<br /> #* wateractiviteit aw<br /> # Waarom is het moeilijker om antiviraal middel te vinden dan een antibacterieel?<br /> # Biogeochemische cycli en stikstof-cyclus<br /> === 15 jun 2008 ===<br /> # bespreek de acetyl coA pathway en welke organisme gebruiken deze...<br /> # glycocalyx, hydrogenosoom, wateractiviteit, mutualisme, protocooperatie uitleggen<br /> # wat zijn fylogenetische merkers, wat doen ze en geef meerdere voorbeelden en leg uit<br /> === 13 jun 2008 ===<br /> # Denitrificatie en nitrificatie + waterzuivering<br /> # Hou zou je ALLE organismen in een bodemstaal classificeren en metabolisme nagaan?<br /> # wateractiviteit + welke organismen kunnen tegen lage + oplossing<br /> # Termen:<br /> #* amensalisme<br /> #* protocoöperatie<br /> #* S.cerevisiae geïnfecteerd met groen zwavel bacteriën... hoe los je dit op<br /> #* Verschil groenzwavel- en purperbacteriën op vlak van productie reducerend vermogen<br /> #* Antibioticaresistentiemechanismen<br /> #* fermentatie...hoe energie en reducerend vermogen verzorgen<br /> #* mutualisme<br /> #* syntrofie<br /> #* verschil antiseptica en desinfectantia<br /> === 13 jun 2008 ===<br /> # acetyl coA cyclus en welke organismen deze gebruiken<br /> # voorwaarden voor goede fylogenetische merkers en enkele voorbeelden<br /> # begrippen: pleiomorfie,monomorfie,chemostaat,....<br /> === 10 jun 2008 ===<br /> # penicillines hebben geen effect op Archaea en Gram negatieve bacterien. Juist of fout, leg uit ahv biochemische werking penicilline<br /> # wat is metagenomics, voordelen en toekomstperspectieven in toegepaste microbiologie<br /> # manieren van C02 fixatie<br /> === 27 aug 2007 ===<br /> # Stel men vraagt je om een antifungaal middel te ontwikkelen tegen gistinfecties bij mensen. Op welke principes zou je dit kunnen baseren en staaf met een voorbeeld. Hoe ga je te werk om te bepalen of je product een bacteriostatische of bacteriocide werking heeft? <br /> # Bespreek bondig de anoxische fotosynthese bij purperbacterieën<br /> # Wat zijn psychrofiele organismen? Hoe zijn ze aangepast aan hun milieu? Waarin verschillen ze met psychrotolerante organismen?<br /> # Practicumvraag: Geef met behulp van een schema het verschil tussen gram-positieve en gram-negatieve bacteriën. Met welke technieken kun je beide groepen onderscheiden?<br /> === 18 jun 2007 ===<br /> # De toxische producten die vanuit zuurstof gevormd worden en hoe de cel die onschadelijk maakt.<br /> # Geef alle manieren om CO2 te fixeren.<br /> # Termen: <br /> #* chemostaat<br /> #* glycocalyx<br /> #* micronutrienten<br /> #* macronutrienten<br /> #* hydrogenosoom<br /> #* monomorfisch<br /> #* pleiomorfisch<br /> === 15 jun 2007 ===<br /> # Leg de structuur en de werking van de bacteriële flagel uit en bespreek chemotaxis.<br /> # Hoe gaat u te werk om te bepalen of een stof een bacteriostatische of bactericide werking heeft?<br /> # Vergelijk de energie en reducerend vermogen vorming bij fototrofen en fermentatie.<br /> <br /> === 11 jun 2007 ===<br /> # bespreek de vorming en structuur van endosporen, welke zijn de voordelen hiervan voor de overleving van de bacterie en hoe moeten we daar mee omgaan als we de groei van zulde organismen willen onder controle houden<br /> # ken je manieren voor incorporatie van C02, zoja welke en beschrijf bondig de pathways <br /> # stel je hebt een bodemstaal met daarin nieuwe 'ongekende' organismen, beschrijf hoe je te werk zou gaan om deze te identificeren en welke manieren je zou gebruiken voor de classificatie<br /> <br /> === 11 jun 2007 ===<br /> # Hoe onstaat resistentie tegen antibiotica bij micro-organismen? Bespreek de verschillende mechanismen van resistentie. In een post-antibiotica tijdperk, welke methoden zou je gebruiken om bacteriele infecties tegen te gaan?<br /> # Bespreek de verschillende methodes die micro-organismen hebben om zich te beschermen tegen toxische zuurstof producten (door fotochemische reacties ontstaan).<br /> # Wat zijn biogeochemische cycli? Bespreek aan de hand van een schematische voorstelling van de koolstof cyclus.</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Microbiologie&diff=3210 2023-01-24T13:17:39Z

<p>R0893094: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Microbiologie wordt tegenwoordig in het tweede jaar gegeven. Vroeger was dit het derde jaar. Ook verhuisd van tweede naar eerste semester. Wordt gevolgd door studenten biologie en biochemie. Gedoceerd door Prof. Joris Winderickx. Normaal mondeling examen, wegens COVID toch schriftelijk. Practicum wordt geëvalueerd via een één verslag over al de practicumsessies.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 24 Januari 2023 ===<br /> (A) restrictie-modificatie systeem en CRISPR-Cas mechanisme uitleggen. (B) Welke invloed heeft dit op het ecosysteem? /5<br /> <br /> Detoxificatie van zuurstof van micro-organismen. /5<br /> <br /> verklaar volgende termen en geef het verband/verschil:<br /> *MIC en fenolcoëffiënt<br /> *Fimbrae en cirri<br /> *commensalisme en mutualisme<br /> *virulente virussen en getemperde virussen<br /> *watercoëfficiënt en compatable solute<br /> *Nitrificatie en anammox<br /> *anaerobe respiratie en fermentatie<br /> *Zoönose en anthroponose<br /> <br /> === 13 Januari 2023 ===<br /> #(A)Bacteriën delen door binaire splijting. Wat weet je over het divisoom? Hoe vindt de cel het centrum? (B) Welke parameters kan men afleiden uit een groei curve? /5<br /> #Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te maken dan een antiviraal middel? Gegeven dat het een RNA-Virus is, op welke doelwitten zou een antiviraal middel kunnen inwerken? Hoe kan je testen of je antiviraal middel effectief is? /5<br /> <br /> #verklaar volgende termen:<br /> #*cilia<br /> #*amensalisme<br /> #*hydrogenosoom(+reactie)<br /> #*MIC<br /> #*Wateractiviteit<br /> #*amphixenose<br /> #*Viroide<br /> #*persistente infectie<br /> <br /> === 25 Januari 2022 ===<br /> <br /> Hoe worden micro-organismen resistent? Welke mechanismen zorgen ervoor dat ze resistent zijn? Hoe wordt dit overgedragen? Is dit species-specifiek? /5<br /> <br /> Bespreek de bouw en werking/functie van prokaryote flagellen (Gram neg., gram pos. en Archaea). Vergelijk ook met eukaryote flagella. Bespreek fototaxis en verklaar hoe dit voordeel geeft in een ecosysteem. /5<br /> <br /> Stelling juist/fout + verklaar /4<br /> <br /> *Geen enkele bacterie (Bacteria + Archaea) kan leven zonder celwand <br /> <br /> *Een hydrogenosoom komt voor bij prokaryoten en oxideert pyruvaat tot AcCoA.<br /> <br /> *Decimale reductietijd neemt af bij toenemende verhittingstemperatuur <br /> <br /> *B-lactam werkt alleen op gram+ <br /> <br /> *Bij een persistente infectie wordt de gastheercel vernietigd.<br /> <br /> *Stikstoffixatie komt vooral voor in anoxygene condities <br /> <br /> *Chemolithotrofen halen hun energie uit fermentatie met substraatfosforylatie<br /> <br /> *Cyanobacteriën hebben phycobillisomen voor optimale lichtcaptatie<br /> <br /> === 17 januari 2022 ===<br /> #Leg de Baltimore-classificatie schematisch uit en verklaar op basis van wat deze gebaseerd werd. Hoe zou je een antiviraal middel maken voor Hepadnavirussen en op welke processen zou dit kunnen inwerken? Hoe kan je testen of dit middel effectief is?<br /> #Vergelijk de celwand van Archaea en grampositieve bacteriën door een gedetailleerde tekening te geven van de polysaccharideketen. Geef verschillende methodes om deze organismen van elkaar te scheiden.<br /> #Begrippen: Leg ze apart uit en geef gelijkenissen en verschillen. <br /> #*anammox - denitrificatie<br /> #*cirri - fimbrae<br /> #*fermentatie - anaerobe respiratie<br /> #*persistente infectie - latente infectie<br /> <br /> === 21 augustus 2021 ===<br /> #Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te maken dan een antiviraal middel? Waar bij een RNA-virus zou een antiviraal middel inwerken? Hoe kan je testen of je antiviraal middel effectief is?<br /> #Vergelijk de celwand van Gram negatief en positief aan de hand van tekeningen, vergelijk ook met celwand van eukaryoten en archaea. Hoe kan je Gram positief en Gram negatief onderscheiden, geef verschillende methodes.<br /> #Begrippen<br /> #*amensalisme - commensalisme<br /> #*wateractiviteit<br /> #*cycloheximide<br /> #*teichoïnezuur<br /> #*persistente en latente infectie<br /> #*MIC en fenolcoëfficient<br /> #*Cirri<br /> #*hydrogenosoom<br /> <br /> === 15 januari 2021 NM ===<br /> #Bespreek de bouw en inplanting van bacteriële flagella. Vergelijk ook met eukaryote flagella en cirri. Bespreek chemotaxis.<br /> #Welk is het belangrijke enzyme voor stikstoffixatie? Andere vormen van stikstof (zoals ammoniak) zijn zeer belangrijk, verklaar.<br /> #Verklaar en leg de verschillen/gelijkenissen uit:<br /> #*mesofiel - pathogeen<br /> #*guilde - gemeenschap<br /> #*retrovirus - hepadnavirus<br /> #*chemo-organotrofe anaerobe respiratie - fermentatie<br /> #*hydrogenosomen - mitochondriën<br /> #*antisepsis - desinfecteren<br /> #*mutualisme - protocoöperatie <br /> #* generatietijd - delingsefficiëntie <br /> === 11 januari 2021 NM ===<br /> #<br /> #Detoxificatie van micro-organismen<br /> #a) Leg het verschil in celwandstructuur tussen Gram-positieve en Gram-negatieve bacteriën uit en op welk principe berust de Gram-kleuring. b)Leg kort de celwand bij archaea en eukaryoten uit. c)Welke andere manieren, naast Gram-kleuring, zijn er om Gram-positieve en Gram-negatieve bacteriën van elkaar te onderscheiden?<br /> #Verklaar en leg de verschillen/gelijkenissen uit:<br /> #*guilde - gemeenschap<br /> #*retrovirussen - hepadnavirussen<br /> #*amensalisme - commensalisme<br /> #*chemo-organotrofe anaerobe respiratie - fermentatie<br /> #*generatietijd - delingsefficientie<br /> #*hydrogenosomen - mitochondriën<br /> #*antisepsis - desinfecteren<br /> #*nog 1tje<br /> <br /> === 17 augustus 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te ontwikkelen dan een antifungaal en een antiviraal middel? Gegeven dat het een RNA-virus is op welke processen/enzymen kan een antiviraal middel inwerken? b) Hoe kan je gemakkelijk testen of een middel tegen fagen effectief is?<br /> #a) Wat is de structuur, inplanting en werking/functie van prokaryote flagella en aanverwante structuren? Wat is het verschil met eukaryote flagella en aanverwante structuren en leg het principe van chemotaxis uit. b) Leg bondig phototaxis uit. <br /> #Begrippen <br /> #*Eclipsperiode<br /> #*Tegument<br /> #*viroïde<br /> #*Evolutionaire chronometers<br /> #*Griseofulin<br /> #*Mechanisme voor CO2 fixatie door de acetyl CoA pathway<br /> #*Peplomeren<br /> #*Quinolones<br /> <br /> === 20 januari 2020 NM ===<br /> #<br /> # Bespreek structuur en functie van flagella. Geef gelijkaardige structuren tussen gram-positieve en gram-negatieve [[Bacteria]]. Geef gelijkaardige structuren bij ''Archaea'' en eukaryoten. <br /> # Over resistentie, wat de mechanismen zijn, of dat species specifiek of aspecifiek is. Alternatieve therapieën tegen resistentie....<br /> #Begrippen:<br /> #*PFU en CFU<br /> #*Ammencialisme en commensialisme<br /> #*aw<br /> #*Cirri<br /> #*Teichoïnezuur<br /> #*MIC en fenolcoëfficient<br /> #*cycloheximide<br /> #*nog eentje<br /> <br /> === 17 januari 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Geef de functie en structuur van prokaryote flagel. Is er een verschil tussen grampositieve en gramnegatieve bacteria flagel? Geef ook analoge structuren. b) Geef minstens 3 andere methoden om grampositieve van de gramnegatieve bacteriën te scheiden (niet via gramkleuring). Hoe kan men in een waterstaal archaea, bacteria &amp; eukarya onderscheiden?<br /> #a) Detoxificatie van giftige zuurstof molecule. b) Welke rol zuurstof en gebonden stikstof componenten (zoals ammoniak) een invloed hebben op de stikstofcyclus?<br /> #Stellingen<br /> #*S-lagen zorgen voor vasthechting van de cel<br /> #*Cephalosporine werkt in op translatie<br /> #*&quot;Naakte&quot; en &quot;Envelopped&quot; virussen worden op dezelfde manier vrijgezet<br /> #*Viroïde is de niet infectieve vorm van een virus<br /> #*In hydrogenosoom zitten hydrogenasen<br /> #*Phycolisomen zijn enkel bij cyanobacteriën te vinden<br /> #*en nog 2 andere<br /> <br /> === 14 januari 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Influenza: verklaar HxNx, antigene shift, antigene drift. In welke Baltimore klasse bevindt influenza zich? b) waarop kunnen antivirale middelen inwerken? geef ook voorbeelden. Hoe zou jij te werk gaan om een nieuw antiviraal middel te maken?<br /> #Vergelijk celwand archae, gramnegatieve en grampositieve (structuren allemaal kunnen tekenen). ZIjn er zonder celwand, zo ja welke? Welke manieren zijn er naast gramkleuring om gramnegatieve en grampositieve van elkaar te onderscheiden? Hoe zou je in een waterstaal Archae, bacteria en eukarya onderscheiden van elkaar (zo min mogelijke stappen)<br /> #Begrippen<br /> #*syntorfie<br /> #*viroide<br /> #*evolutionaire chronometers<br /> #*streptomycines<br /> #*endo- en exotoxine<br /> #*anammoxoom<br /> #*Hydrogenesoom<br /> #<br /> <br /> === 13 januari 2020 NM ===<br /> <br /> #VRAGEN<br /> 1. antibiotica alles uitleggen hoe resistentie opbouwen, species specifiek? <br /> 2. Antifungale drugs voor membraansynthese en proteinsyntheseninhibitie + hoe bepaal je of een drug fungistatisch is?<br /> 3. Wat zijn biogeochemische cycli en leg dit uit adhv de N cyclus, geef alles + verklaar anammox reactie en stikstoffixatie<br /> <br /> #BEGRIPPEN<br /> <br /> Wateractiviteit<br /> Profaag<br /> Anammoxosoom<br /> Chlorosoom<br /> Stickland reactie<br /> Persistente infectie<br /> Endotoxine<br /> Surfactant<br /> <br /> ===5 september 2019===<br /> #<br /> # a) Influenza: verklaar HxNx, antigene shift, antigene shift. In welke Baltimore klasse bevindt influenza zich? b) waarop kunnen antivirale middelen inwerken? geef ook voorbeelden. Hoe zou jij te werk gaan om een nieuw antiviraal middel te maken en te TESTEN? <br /> #Geef een schematische voorstelling van de anoxygene fotosynthese van purperbacteriën en groenzwavelbacteriën, alsook de oxygene fotosynthese van cyanobacteriën. Bespreek de voornaamse verschillen, inclusief morfologische kenmerken, en plaats dit in een algemeen microbieel ecologische context.<br /> #Begrippen<br /> #*cilia<br /> #*viroide<br /> #*profaag<br /> #*persistente infectie<br /> #*wateractiviteit<br /> #*tegument<br /> #*MIC<br /> #*amensalisme<br /> <br /> ===14 januari 2019===<br /> #<br /> #*Hoe worden micro-organismen resistent? Welke mechanismen zorgen ervoor dat resistent zijn? Hoe wordt dit overgedragen? Welke van deze manieren zijn species-specifiek en welke species-aspecifiek?<br /> #*Je hebt een bodemstaal met micro-organismen, hoe ga je na dat deze micro-organismen een fungistatische werking hebben? + leg uit micro-organismen die groeien in het labo en micro-organismen laten groeien die niet in het labo kunnen groeien. Leg kort uit.<br /> #Leg uit HxNx, antigene drift en shift, waarom kan dit laatste zo snel gebeuren bij het influenzavirus? Tot welke klasse van Baltimore behoort Influenza. Geef het schema van de Baltimore classificatie en leg de principes uit.<br /> #Begrippen<br /> #*Syntrofie<br /> #*Evolutionaire chronometers<br /> #*Hydrogenosoom (+ reacties)<br /> #*Streptomycine<br /> #*Heterotroof<br /> #*Annamox<br /> #*Viroïde<br /> #*Endo- en exotoxines<br /> <br /> ===21 augustus 2018===<br /> #Je krijgt een waterstaal, hoe weet je welke GEKENDE micro-organismen hier inzitten waarvan je een metabool product wil onderzoeken. Hoe kan je testen dat dit een fungicide is?<br /> #Bespreek flagellen bij pro- en eukaryoten en leg chemotaxis uit<br /> #begrippen<br /> #*Surfactant<br /> #*tegument<br /> #*bacilli<br /> #*hydrogenosoom<br /> #*wateractiviteit<br /> #*phycobillisoom<br /> #*hopanoïde<br /> #*nog eentje maar ben ik vergeten<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> #Wat is een biogeochemische cycli? Geef schematisch de stikstofcyclus en beschrijf de voornaamste processen.<br /> #Bespreek de structuur, inplanting en werking van prokaryote flagellen en aanverwante structuren als ook het mechanisme van chemotaxis. Welke verschillen zijn er met een eukaryote flagel?<br /> #Begrippen: axiaal filament, griseofulin, peplomeren, quinolones, evolutionaire chronometers, mechanisme voor CO2 fixatie door de acetyl CoA pathway, viroïde, hopanoïde<br /> <br /> ===22 januari 2018 VM===<br /> #Leg uit: biogeochemische cycli. Geef schematisch de stikstofcyclus weer en bespreek de belangrijkste reacties. <br /> #Je krijgt een bodemstaal waaruit je onbekende micro-organismen moet identificeren, hierin zit een organisme dat metabole producten maakt die antifungicidaal werken, deze kunnen dienen voor een nieuw middel. Hoe ga je (zo efficiënt mogelijk) te werk?<br /> #begrippen: PFU en CFU, MIC en fenolcoëfficiënt, latente en persistente infectie, cirri, Aw, cycloheximide, commensalisme en ammensalisme en teichoïnezuur<br /> <br /> ===19 januari 2018===<br /> #Bespreek de structuur, werking en inplanting van bacteriële flagellen (met tekening). Wat is het mechanisme van chemotaxis? Wat zijn de verschillen met eukaryote flagellen.<br /> #Welke detoxificatiemechanismen zijn er van toxische zuurstof. Geef de enzymen en hun reacties. Hij wilt ook dat je een extra voorbeeld geeft. Wat is het belang van zuurstof in een microbiële ecosysteem.<br /> #8 termen: cycloheximide, sulfonilamide, aw, lysozymen, amensalisme, phycobiline, acetyl-CoA pathway en hepadnavirus<br /> <br /> ===15 januari 2018===<br /> #Bespreek kort de oxygene en anoxygene fotosynthese van micro-organismen en hun reducerend vermogen. Leg fermentaties van micro-organismen uit, hoe wordt hiermee energie gewonnen? /5<br /> #A)Waarvoor staat HxNx? B) Leg de Baltimore-classificatie uit. Welke types virussen hebben eigen polymerasen? C) weet ik niet meer, maar ook iets met virussen /5<br /> #8 stellingen, per juist antwoord 0,5 1)cyloheximine werkt niet op gramnnegatieve bacteriën 2)antibiotica-resistentie wordt aspecies-specifiek doorgegeven en voornamelijk via transductie 3)een guilde is een groep van klonaal verwante cellen 4)bij een peristenta infectie komen viruspartikels niet vrij en blijft de gastheer leven 5)bij amensalisme hebben beide partners altijd een voordeel 6)bij een hydrogenosoom wordt ATP geproduceerd via hydrolyse en H+ 7)een virion reffereert naar de extrcellulaire vorm van een virus 8)ben ik vergeten /4<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM===<br /> #bespreek de structuur en werking van de flagel bij bacteriële cellen + bespreek chemotaxis<br /> #detoxificatie van zuurstof<br /> #8 stelling juist/fout + verklaar<br /> #*gramnegatieve bachteriën zijn niet gevoelig voor beta-lactam ring <br /> #*antibiotica-resistentie is species-specifiek<br /> #*decimale reductietijd neemt af bij toenemende verhittingstemperatuur<br /> #*hydrogenosomen bij prokaryoten halen hun energie uit de oxidatie van pyruvaat<br /> #*stikstoffixatie komt vooral voor in anoxygene condities<br /> #*persistentie infectie van viruspartikels vernietigd de gastheercel<br /> #*geen enkele bacterie (Bacteria + Archaea) kan leven zonder celwand<br /> #*energiewinst bij fermentatie komt altijd van substraatfosforylatie<br /> <br /> ===23 januari 2017 NM===<br /> #bespreek hoe het kleine virale genoom toch een volledige functie qua replicatie en assemblage van een virus kan veroorzaken. geef voorbeelden en leg uit<br /> #virussen zijn niet altijd negatief. Bespreek en geef een voorbeeld ivm humaan microbioom<br /> #je hebt een bodemstaal met micro-organismen, hoe ga je na dat deze micro-organismen een fungistatische werking hebben? + leg uit micro-organismen die groeien in het labo en micro-organismen laten groeien die niet in het labo kunnen groeien.<br /> #vancomycine slaat niet aan, welke combinatie is het beste? keuze uit: vancomycine + cycloheximide/amphotericini/isoniazide/sulfanilamide<br /> #leg verschil en gelijkenis uit + bespreek<br /> #*mesofiel-pathogeen<br /> #*antiseptica-desinfectans<br /> #*fermentatie-chemoorganotroof anaeroobe respiratie<br /> #*chemoorganotroof-chemolithotroof<br /> #*generatietijd-delingscoefficient<br /> #*sporecortex-bacteriele celwand<br /> #*guilde-gemeenschap<br /> #*commensalisme-amensalisme<br /> <br /> ===23 januari 2017 VM===<br /> #bespreek de celwand bij gram - en gram + bacteriën en archaea. geef een manier om bacteria, archaea en eukaryoten te scheiden. geef minstens 3 manieren hoe je gram + en gram - bacteriën kan onderscheiden (zonder gram kleuring) <br /> #afbeelding cel met onderdelen aangeduid (celwand, 50S,...) geef voorbeelden van antibiotica die hier op inwerken en leg hun werking uit.<br /> #8 juist of fout vragen<br /> <br /> ===26 januari 2016===<br /> #Gegeven een tekening van een virtuele cel van een micro-organisme (aangeduid: DNA synthese, RNA synthese, mitotische spoelfiguur en microtubuli, celwand, plasmamembraan, translatie, foliumzuursynthese). Geef alle antimicrobiële middelen die erbij horen. Bespreek de mechanismen van de antimicrobiële middelen bij een verschillende manier van inwerking. <br /> #Flagellen pro-en eukaryoten (ook tekenen!). Welke andere bewegingsvormen ken je nog? Leg taxis uit. <br /> #Leg uit en bespreek de gelijkenissen en/of verschillen:<br /> #*halofielen - osmiofielen<br /> #*autotroof - heterotroof<br /> #*bacteriële celwand - sporeprotoplast<br /> #*chemoorganotroof - ...<br /> #*chemoorganofiel - ...<br /> #*chemooragnofiel anaeroobe respiratie - ...<br /> #* ...<br /> <br /> ===22 januari 2015===<br /> #Flagellen en cirri bij pro- en eukaryoten, bespreek chemo- en fototaxis.<br /> #Detoxificatiemechanismen<br /> #Acht stellingen, juist/niet juist en waarom (ieder op 0,5 punt)<br /> #*B-lactam werkt alleen op gram +<br /> #*Resistentie is species-specifiek<br /> #*Decimale reductietijd daalt altijd bij hogere T<br /> #*Bij fermentatie vindt de energiewinning altijd plaats door substraatfosforylatie<br /> #*Bacteria en Archaea kunnen nooit leven zonder celwand<br /> #*Stikstoffixatie is vooral anoxisch<br /> #*Hydrogenosomen komen voor bij prokaryoten waar ze pyruvaat oxideren tot -<br /> #*en nog een die ik me niet meer herinner.<br /> <br /> ===27 januari 2015===<br /> #verschil oxygene en anoxygene fototrofie + energie bij fermentatie<br /> #welke manieren van voortbeweging, verschil in pro en eukaryoten, (sex)pili, welk competitief voordeel?<br /> #juist/fout vragen<br /> <br /> ===19 januari 2015 (NM)===<br /> #Mechanismen van restentie en resistentie overdracht. Is resistentie speciesspecifiek? Methoden voor het post-antibioticatijdperk.<br /> #Photosynthese bij purperbacterien, groenzwavelbacteren en cyanobacterien schematisch tekenen en verschillen uitleggen. Linken met morfologie en ecologie. <br /> #8 juist-fout vraagjes<br /> #*Gram-negatieve bactierien zijn vatbaar voor ampicilline en amoxicilline.<br /> #*Ergosterolsynthese is geen goede target voor antifungale drugs.<br /> #*Bij een latente infectie komen er geen virusgenen tot expressie en komen er geen virussen vrij.<br /> #*Het nitrogenasecomplex werkt vooral in anoxische omstandigheden<br /> #*Een hydrogenosoom komt voor bij prokaryoten en oxideert pyruvaat tot AcCoA.<br /> #*...<br /> <br /> <br /> ===19 januari 2015 (VM)===<br /> #koolstofcyclus schematisch tekenen en alle metabole processen uitleggen (reacties zijn niet zo belangrijk)<br /> #Wat is de beste combinatie en slechtste combinatie? flucytosine + polyeen, griseofuline en polyeen, vancomycine en polyeen, en er was dan nog eentje maar die weet ik niet meer <br /> #woordjes uitleggen: <br /> #*exosporium <br /> #*evolutionaire chronometers <br /> #*omgekeerde citroencyclus<br /> #*...<br /> <br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> #Virussen zijn gekenmerkt door een klein genoom. Toch hebben ze alles om te voorzien in hun replicatie. Verklaar aan de hand van enkele voorbeelden. Sommige virussen hebben echter ook eigen polymerase enzymes nodig, identificeer hen aan de hand van de baltimore classificatie.<br /> #Je wordt gevraagd onbekende micro-organismen uit een staal water te identificeren; welke technieken gebruik je en hoe ga je te werk om te kijken of sommigen de mogelijkheid bezitten tot de productie van een fungistatisch middel om het te commercialiseren.<br /> #O2 kan giftig zijn; geef de detoxificatiemechanismen die micro-organismen bezitten om dit te bestrijden<br /> <br /> ===21 januari 2014===<br /> #de koolstofcyclus en metabole processen <br /> #detoxificatie mechanisme van zuurstofderivaten die door metabole processen geproduceerd worden en dan ne fungus bestrijden met een combinatie. <br /> #combinaties werden gegeven allemaal met myconazol: uitleggen welk het beste werkte en welk het minst.<br /> <br /> === 20 jan 2014 (namiddag) ===<br /> #koolstofcyclus<br /> #mechanismen van detoxificatie<br /> #patient is besmet met Candida, een syntetische azool werkt niet goed. Welke antibiotica mengeling is de beste? Gegeven = telkens een syntetische azool in combinatie met flucytosine, griseofulin, vancomycine, en nog 1 dat ik niet meer weet<br /> <br /> ===20 januari 2014 voormiddag===<br /> #antibioticaresistentie: hoe, verschillende mechanisme, hoe krijgen we dat in het lichaam<br /> #fungistatische drugs in natuurlijke bodem, hoe herkennen en er uit halen<br /> #virussen: verklaar HxNx, antigendrift en antigenenschift en waarom gaat antigenenschift zo gemakkelijk en baltimoreklassen van influenza + verklaren<br /> #woordjes<br /> #*hopanoide (hier moet ge dat dan vergelijken met sterol in eukaryoten enzo)<br /> #*hydrosoom<br /> #*viroiden<br /> #*endotoxine<br /> <br /> === 31 jan 2012 (voormiddag) ===<br /> # Geef de koolstofcyclus en leg kort alle processen uit die hierin voorkomen. (mondeling)<br /> # Een schema van een cel waarop verschillende delen aangeduid stonden (celwand, membraan, DNA+RNA-synthese, 50S ribosoon-subunit, 30 S ribosoom-subunit). Geef bij elk deel de antibiotica die hierop inwerken en leg, als er meerdere antibiotica bij bij één passen, hun actiemechanismen uit.<br /> # Verklaar:<br /> #* Fenol-coëfficiënt methode<br /> #* Virion<br /> #* Rolling-circle replicatie<br /> #* O-anitgen<br /> #* Fermentatiebalans<br /> #* Anamoxosoom<br /> #* Decimale Reductietijd<br /> #* Hopanoïde<br /> <br /> === 26 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Anoxigene fotosynthese bij purperbacterien en oxygene bij cyanobacteriën: Een schets geven en vergelijken.<br /> # Celwandstructuur bij bacteria(grampos en gram negatief)en archaea bespreken en vergelijken. En met welke techniek zou je deze kunnen onderscheiden<br /> # Een patiënt met een bacteriële infectie werd behandeld met chloramphenicol maar dit was niet erg werkzaam. Men zou kunnen combineren met vancomycine, tetracycline en cephalosporine. Wat gaat het minst werkzaam zijn? en welk het meeste?<br /> <br /> === 25 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Wat is metagenomics, wat kun je met deze techniek doen en beschrijf de voordelen aan de hand van een creatief (zelfverzonnen)voorbeeld<br /> # Stikstoffixatie: Bespreek en wat heeft zuurstof hiermee te maken?<br /> # Geef de biochemische werkingsmechanismen van: quinolones, aminoglycosiden, synthetische azolen en sulfonamides<br /> <br /> === 17 jan 2011 (namiddag) ===<br /> <br /> # Wat is metagenomics, wat kun je met deze techniek doen en beschrijf de voordelen aan de hand van een creatief (zelfverzonnen)voorbeeld<br /> # nitrificatie, denitrificatie en stikstoffixatie zijn belangrijke processen. Bespreek bondig de reacties en plaats in de stikstofcyclus. Wat heeft zuurstof hiermee te maken?<br /> # vergelijk de opbouw van de celwand van gram positieve en negatieve bacteriën met behulp van een schema, hoe zou je eenvoudig een onderscheid kunnen maken?<br /> <br /> === 21 jan 2010 ===<br /> # Geef de schematische voorstelling van de anoxigene fotosynthese bij purperbacteriën en de oxigene fotosynthese bij cyanobacteriën. Bespreek verschillen, incl. morfologische kenmerken en plaats dit in een algemeen microbiële context.<br /> # Hoe weet je of een medicijn bacteriostatisch, bacteriolytisch, bacteriocide, fungistatisch, fungicide is. (bijvraag: hoe zou jij dat bepalen als biochemist?) Wat is MIC en hoe bepaal je dat, fenolcoëfficient bespreken. De criteria bespreken voor een medicijn, antiseptica, desinfectans.<br /> # Mexicaanse griep is van het type H1N1. Leg uit wat HxNx is en leg antigene shift en antigene drift uit. Tot welke baltimore klasse behoort influenza.(bijvraag: middelen tegen influenza)<br /> <br /> === 11 jan 2010 ===<br /> # zuurstof kan toxisch zijn voor micro-organisme. Welke reactie zorgen voor de omzetting van deze toxische zuurstof?<br /> # bespreek de biochemische werkingsmechanisme van ampiciline en cephalosporine<br /> # geef alle pathways voor C02 fixatie? (het zijn er btw 8 en geen 5 zoals de meeste denken)<br /> === 27 jan 2009 ===<br /> <br /> # Verklaar:<br /> #* Baltimore classificatie<br /> #* tegument<br /> #* psychrotolerante mesofiel<br /> #* peritrieche flagelaat<br /> # Methanotrofen en methylotrofen, geef energiewinning en koolstof assimilatie<br /> # antifungale drugs; waarom moeilijker te maken dan antibacterieel en bespreek de reactiemechanismen van <br /> === 23 jan 2009 ===<br /> # C02 fixatie<br /> # hoe ga je te werk om uit een bodemstaal 1) alle micro-organismen te identificeren 2) een fungistatisch metaboliet te zoeken<br /> # Termpjes:<br /> #* aw<br /> #* serine pathway<br /> === 23 jan 2009 ===<br /> # Een gistcultuur is geïnfecteerd met cyanobacteriën. Geef een aantal manieren om weer een zuivere gistcultuur te verkrijgen.<br /> # Juist of fout vragen:<br /> #* S-lagen<br /> #* iets over pseudopeptidoglycaan van Archaea<br /> #* phycobilines<br /> #* de manier van vrijstelling van naakte vs 'enveloped' virussen<br /> #* cephalosporine<br /> # Nitraatreductie. En bespreek deze bij E.coli en Pseudomonas stutzeri.<br /> === 16 jan 2009 ===<br /> # 5 woorden verklaren:<br /> #* cephalosporine<br /> #* phycobilisoom<br /> #* hepadnavirussen<br /> #* serine pathway<br /> #* wateractiviteit aw<br /> # Waarom is het moeilijker om antiviraal middel te vinden dan een antibacterieel?<br /> # Biogeochemische cycli en stikstof-cyclus<br /> === 15 jun 2008 ===<br /> # bespreek de acetyl coA pathway en welke organisme gebruiken deze...<br /> # glycocalyx, hydrogenosoom, wateractiviteit, mutualisme, protocooperatie uitleggen<br /> # wat zijn fylogenetische merkers, wat doen ze en geef meerdere voorbeelden en leg uit<br /> === 13 jun 2008 ===<br /> # Denitrificatie en nitrificatie + waterzuivering<br /> # Hou zou je ALLE organismen in een bodemstaal classificeren en metabolisme nagaan?<br /> # wateractiviteit + welke organismen kunnen tegen lage + oplossing<br /> # Termen:<br /> #* amensalisme<br /> #* protocoöperatie<br /> #* S.cerevisiae geïnfecteerd met groen zwavel bacteriën... hoe los je dit op<br /> #* Verschil groenzwavel- en purperbacteriën op vlak van productie reducerend vermogen<br /> #* Antibioticaresistentiemechanismen<br /> #* fermentatie...hoe energie en reducerend vermogen verzorgen<br /> #* mutualisme<br /> #* syntrofie<br /> #* verschil antiseptica en desinfectantia<br /> === 13 jun 2008 ===<br /> # acetyl coA cyclus en welke organismen deze gebruiken<br /> # voorwaarden voor goede fylogenetische merkers en enkele voorbeelden<br /> # begrippen: pleiomorfie,monomorfie,chemostaat,....<br /> === 10 jun 2008 ===<br /> # penicillines hebben geen effect op Archaea en Gram negatieve bacterien. Juist of fout, leg uit ahv biochemische werking penicilline<br /> # wat is metagenomics, voordelen en toekomstperspectieven in toegepaste microbiologie<br /> # manieren van C02 fixatie<br /> === 27 aug 2007 ===<br /> # Stel men vraagt je om een antifungaal middel te ontwikkelen tegen gistinfecties bij mensen. Op welke principes zou je dit kunnen baseren en staaf met een voorbeeld. Hoe ga je te werk om te bepalen of je product een bacteriostatische of bacteriocide werking heeft? <br /> # Bespreek bondig de anoxische fotosynthese bij purperbacterieën<br /> # Wat zijn psychrofiele organismen? Hoe zijn ze aangepast aan hun milieu? Waarin verschillen ze met psychrotolerante organismen?<br /> # Practicumvraag: Geef met behulp van een schema het verschil tussen gram-positieve en gram-negatieve bacteriën. Met welke technieken kun je beide groepen onderscheiden?<br /> === 18 jun 2007 ===<br /> # De toxische producten die vanuit zuurstof gevormd worden en hoe de cel die onschadelijk maakt.<br /> # Geef alle manieren om CO2 te fixeren.<br /> # Termen: <br /> #* chemostaat<br /> #* glycocalyx<br /> #* micronutrienten<br /> #* macronutrienten<br /> #* hydrogenosoom<br /> #* monomorfisch<br /> #* pleiomorfisch<br /> === 15 jun 2007 ===<br /> # Leg de structuur en de werking van de bacteriële flagel uit en bespreek chemotaxis.<br /> # Hoe gaat u te werk om te bepalen of een stof een bacteriostatische of bactericide werking heeft?<br /> # Vergelijk de energie en reducerend vermogen vorming bij fototrofen en fermentatie.<br /> <br /> === 11 jun 2007 ===<br /> # bespreek de vorming en structuur van endosporen, welke zijn de voordelen hiervan voor de overleving van de bacterie en hoe moeten we daar mee omgaan als we de groei van zulde organismen willen onder controle houden<br /> # ken je manieren voor incorporatie van C02, zoja welke en beschrijf bondig de pathways <br /> # stel je hebt een bodemstaal met daarin nieuwe 'ongekende' organismen, beschrijf hoe je te werk zou gaan om deze te identificeren en welke manieren je zou gebruiken voor de classificatie<br /> <br /> === 11 jun 2007 ===<br /> # Hoe onstaat resistentie tegen antibiotica bij micro-organismen? Bespreek de verschillende mechanismen van resistentie. In een post-antibiotica tijdperk, welke methoden zou je gebruiken om bacteriele infecties tegen te gaan?<br /> # Bespreek de verschillende methodes die micro-organismen hebben om zich te beschermen tegen toxische zuurstof producten (door fotochemische reacties ontstaan).<br /> # Wat zijn biogeochemische cycli? Bespreek aan de hand van een schematische voorstelling van de koolstof cyclus.</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Microbiologie&diff=3209 2023-01-24T13:17:18Z

<p>R0893094: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Microbiologie wordt tegenwoordig in het tweede jaar gegeven. Vroeger was dit het derde jaar. Ook verhuisd van tweede naar eerste semester. Wordt gevolgd door studenten biologie en biochemie. Gedoceerd door Prof. Joris Winderickx. Normaal mondeling examen, wegens COVID toch schriftelijk. Practicum wordt geëvalueerd via een één verslag over al de practicumsessies.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 24 Januari 2023 ===<br /> (A) restrictie-modificatie systeem en CRISPR-Cas mechanisme uitleggen. (B) Welke invloed heeft dit op het ecosysteem? /5<br /> Detoxificatie van zuurstof van micro-organismen.<br /> <br /> verklaar volgende termen en geef het verband/verschil:<br /> *MIC en fenolcoëffiënt<br /> *Fimbrae en cirri<br /> *commensalisme en mutualisme<br /> *virulente virussen en getemperde virussen<br /> *watercoëfficiënt en compatable solute<br /> *Nitrificatie en anammox<br /> *anaerobe respiratie en fermentatie<br /> *Zoönose en anthroponose<br /> <br /> === 13 Januari 2023 ===<br /> #(A)Bacteriën delen door binaire splijting. Wat weet je over het divisoom? Hoe vindt de cel het centrum? (B) Welke parameters kan men afleiden uit een groei curve? /5<br /> #Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te maken dan een antiviraal middel? Gegeven dat het een RNA-Virus is, op welke doelwitten zou een antiviraal middel kunnen inwerken? Hoe kan je testen of je antiviraal middel effectief is? /5<br /> <br /> #verklaar volgende termen:<br /> #*cilia<br /> #*amensalisme<br /> #*hydrogenosoom(+reactie)<br /> #*MIC<br /> #*Wateractiviteit<br /> #*amphixenose<br /> #*Viroide<br /> #*persistente infectie<br /> <br /> === 25 Januari 2022 ===<br /> <br /> Hoe worden micro-organismen resistent? Welke mechanismen zorgen ervoor dat ze resistent zijn? Hoe wordt dit overgedragen? Is dit species-specifiek? /5<br /> <br /> Bespreek de bouw en werking/functie van prokaryote flagellen (Gram neg., gram pos. en Archaea). Vergelijk ook met eukaryote flagella. Bespreek fototaxis en verklaar hoe dit voordeel geeft in een ecosysteem. /5<br /> <br /> Stelling juist/fout + verklaar /4<br /> <br /> *Geen enkele bacterie (Bacteria + Archaea) kan leven zonder celwand <br /> <br /> *Een hydrogenosoom komt voor bij prokaryoten en oxideert pyruvaat tot AcCoA.<br /> <br /> *Decimale reductietijd neemt af bij toenemende verhittingstemperatuur <br /> <br /> *B-lactam werkt alleen op gram+ <br /> <br /> *Bij een persistente infectie wordt de gastheercel vernietigd.<br /> <br /> *Stikstoffixatie komt vooral voor in anoxygene condities <br /> <br /> *Chemolithotrofen halen hun energie uit fermentatie met substraatfosforylatie<br /> <br /> *Cyanobacteriën hebben phycobillisomen voor optimale lichtcaptatie<br /> <br /> === 17 januari 2022 ===<br /> #Leg de Baltimore-classificatie schematisch uit en verklaar op basis van wat deze gebaseerd werd. Hoe zou je een antiviraal middel maken voor Hepadnavirussen en op welke processen zou dit kunnen inwerken? Hoe kan je testen of dit middel effectief is?<br /> #Vergelijk de celwand van Archaea en grampositieve bacteriën door een gedetailleerde tekening te geven van de polysaccharideketen. Geef verschillende methodes om deze organismen van elkaar te scheiden.<br /> #Begrippen: Leg ze apart uit en geef gelijkenissen en verschillen. <br /> #*anammox - denitrificatie<br /> #*cirri - fimbrae<br /> #*fermentatie - anaerobe respiratie<br /> #*persistente infectie - latente infectie<br /> <br /> === 21 augustus 2021 ===<br /> #Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te maken dan een antiviraal middel? Waar bij een RNA-virus zou een antiviraal middel inwerken? Hoe kan je testen of je antiviraal middel effectief is?<br /> #Vergelijk de celwand van Gram negatief en positief aan de hand van tekeningen, vergelijk ook met celwand van eukaryoten en archaea. Hoe kan je Gram positief en Gram negatief onderscheiden, geef verschillende methodes.<br /> #Begrippen<br /> #*amensalisme - commensalisme<br /> #*wateractiviteit<br /> #*cycloheximide<br /> #*teichoïnezuur<br /> #*persistente en latente infectie<br /> #*MIC en fenolcoëfficient<br /> #*Cirri<br /> #*hydrogenosoom<br /> <br /> === 15 januari 2021 NM ===<br /> #Bespreek de bouw en inplanting van bacteriële flagella. Vergelijk ook met eukaryote flagella en cirri. Bespreek chemotaxis.<br /> #Welk is het belangrijke enzyme voor stikstoffixatie? Andere vormen van stikstof (zoals ammoniak) zijn zeer belangrijk, verklaar.<br /> #Verklaar en leg de verschillen/gelijkenissen uit:<br /> #*mesofiel - pathogeen<br /> #*guilde - gemeenschap<br /> #*retrovirus - hepadnavirus<br /> #*chemo-organotrofe anaerobe respiratie - fermentatie<br /> #*hydrogenosomen - mitochondriën<br /> #*antisepsis - desinfecteren<br /> #*mutualisme - protocoöperatie <br /> #* generatietijd - delingsefficiëntie <br /> === 11 januari 2021 NM ===<br /> #<br /> #Detoxificatie van micro-organismen<br /> #a) Leg het verschil in celwandstructuur tussen Gram-positieve en Gram-negatieve bacteriën uit en op welk principe berust de Gram-kleuring. b)Leg kort de celwand bij archaea en eukaryoten uit. c)Welke andere manieren, naast Gram-kleuring, zijn er om Gram-positieve en Gram-negatieve bacteriën van elkaar te onderscheiden?<br /> #Verklaar en leg de verschillen/gelijkenissen uit:<br /> #*guilde - gemeenschap<br /> #*retrovirussen - hepadnavirussen<br /> #*amensalisme - commensalisme<br /> #*chemo-organotrofe anaerobe respiratie - fermentatie<br /> #*generatietijd - delingsefficientie<br /> #*hydrogenosomen - mitochondriën<br /> #*antisepsis - desinfecteren<br /> #*nog 1tje<br /> <br /> === 17 augustus 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te ontwikkelen dan een antifungaal en een antiviraal middel? Gegeven dat het een RNA-virus is op welke processen/enzymen kan een antiviraal middel inwerken? b) Hoe kan je gemakkelijk testen of een middel tegen fagen effectief is?<br /> #a) Wat is de structuur, inplanting en werking/functie van prokaryote flagella en aanverwante structuren? Wat is het verschil met eukaryote flagella en aanverwante structuren en leg het principe van chemotaxis uit. b) Leg bondig phototaxis uit. <br /> #Begrippen <br /> #*Eclipsperiode<br /> #*Tegument<br /> #*viroïde<br /> #*Evolutionaire chronometers<br /> #*Griseofulin<br /> #*Mechanisme voor CO2 fixatie door de acetyl CoA pathway<br /> #*Peplomeren<br /> #*Quinolones<br /> <br /> === 20 januari 2020 NM ===<br /> #<br /> # Bespreek structuur en functie van flagella. Geef gelijkaardige structuren tussen gram-positieve en gram-negatieve [[Bacteria]]. Geef gelijkaardige structuren bij ''Archaea'' en eukaryoten. <br /> # Over resistentie, wat de mechanismen zijn, of dat species specifiek of aspecifiek is. Alternatieve therapieën tegen resistentie....<br /> #Begrippen:<br /> #*PFU en CFU<br /> #*Ammencialisme en commensialisme<br /> #*aw<br /> #*Cirri<br /> #*Teichoïnezuur<br /> #*MIC en fenolcoëfficient<br /> #*cycloheximide<br /> #*nog eentje<br /> <br /> === 17 januari 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Geef de functie en structuur van prokaryote flagel. Is er een verschil tussen grampositieve en gramnegatieve bacteria flagel? Geef ook analoge structuren. b) Geef minstens 3 andere methoden om grampositieve van de gramnegatieve bacteriën te scheiden (niet via gramkleuring). Hoe kan men in een waterstaal archaea, bacteria &amp; eukarya onderscheiden?<br /> #a) Detoxificatie van giftige zuurstof molecule. b) Welke rol zuurstof en gebonden stikstof componenten (zoals ammoniak) een invloed hebben op de stikstofcyclus?<br /> #Stellingen<br /> #*S-lagen zorgen voor vasthechting van de cel<br /> #*Cephalosporine werkt in op translatie<br /> #*&quot;Naakte&quot; en &quot;Envelopped&quot; virussen worden op dezelfde manier vrijgezet<br /> #*Viroïde is de niet infectieve vorm van een virus<br /> #*In hydrogenosoom zitten hydrogenasen<br /> #*Phycolisomen zijn enkel bij cyanobacteriën te vinden<br /> #*en nog 2 andere<br /> <br /> === 14 januari 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Influenza: verklaar HxNx, antigene shift, antigene drift. In welke Baltimore klasse bevindt influenza zich? b) waarop kunnen antivirale middelen inwerken? geef ook voorbeelden. Hoe zou jij te werk gaan om een nieuw antiviraal middel te maken?<br /> #Vergelijk celwand archae, gramnegatieve en grampositieve (structuren allemaal kunnen tekenen). ZIjn er zonder celwand, zo ja welke? Welke manieren zijn er naast gramkleuring om gramnegatieve en grampositieve van elkaar te onderscheiden? Hoe zou je in een waterstaal Archae, bacteria en eukarya onderscheiden van elkaar (zo min mogelijke stappen)<br /> #Begrippen<br /> #*syntorfie<br /> #*viroide<br /> #*evolutionaire chronometers<br /> #*streptomycines<br /> #*endo- en exotoxine<br /> #*anammoxoom<br /> #*Hydrogenesoom<br /> #<br /> <br /> === 13 januari 2020 NM ===<br /> <br /> #VRAGEN<br /> 1. antibiotica alles uitleggen hoe resistentie opbouwen, species specifiek? <br /> 2. Antifungale drugs voor membraansynthese en proteinsyntheseninhibitie + hoe bepaal je of een drug fungistatisch is?<br /> 3. Wat zijn biogeochemische cycli en leg dit uit adhv de N cyclus, geef alles + verklaar anammox reactie en stikstoffixatie<br /> <br /> #BEGRIPPEN<br /> <br /> Wateractiviteit<br /> Profaag<br /> Anammoxosoom<br /> Chlorosoom<br /> Stickland reactie<br /> Persistente infectie<br /> Endotoxine<br /> Surfactant<br /> <br /> ===5 september 2019===<br /> #<br /> # a) Influenza: verklaar HxNx, antigene shift, antigene shift. In welke Baltimore klasse bevindt influenza zich? b) waarop kunnen antivirale middelen inwerken? geef ook voorbeelden. Hoe zou jij te werk gaan om een nieuw antiviraal middel te maken en te TESTEN? <br /> #Geef een schematische voorstelling van de anoxygene fotosynthese van purperbacteriën en groenzwavelbacteriën, alsook de oxygene fotosynthese van cyanobacteriën. Bespreek de voornaamse verschillen, inclusief morfologische kenmerken, en plaats dit in een algemeen microbieel ecologische context.<br /> #Begrippen<br /> #*cilia<br /> #*viroide<br /> #*profaag<br /> #*persistente infectie<br /> #*wateractiviteit<br /> #*tegument<br /> #*MIC<br /> #*amensalisme<br /> <br /> ===14 januari 2019===<br /> #<br /> #*Hoe worden micro-organismen resistent? Welke mechanismen zorgen ervoor dat resistent zijn? Hoe wordt dit overgedragen? Welke van deze manieren zijn species-specifiek en welke species-aspecifiek?<br /> #*Je hebt een bodemstaal met micro-organismen, hoe ga je na dat deze micro-organismen een fungistatische werking hebben? + leg uit micro-organismen die groeien in het labo en micro-organismen laten groeien die niet in het labo kunnen groeien. Leg kort uit.<br /> #Leg uit HxNx, antigene drift en shift, waarom kan dit laatste zo snel gebeuren bij het influenzavirus? Tot welke klasse van Baltimore behoort Influenza. Geef het schema van de Baltimore classificatie en leg de principes uit.<br /> #Begrippen<br /> #*Syntrofie<br /> #*Evolutionaire chronometers<br /> #*Hydrogenosoom (+ reacties)<br /> #*Streptomycine<br /> #*Heterotroof<br /> #*Annamox<br /> #*Viroïde<br /> #*Endo- en exotoxines<br /> <br /> ===21 augustus 2018===<br /> #Je krijgt een waterstaal, hoe weet je welke GEKENDE micro-organismen hier inzitten waarvan je een metabool product wil onderzoeken. Hoe kan je testen dat dit een fungicide is?<br /> #Bespreek flagellen bij pro- en eukaryoten en leg chemotaxis uit<br /> #begrippen<br /> #*Surfactant<br /> #*tegument<br /> #*bacilli<br /> #*hydrogenosoom<br /> #*wateractiviteit<br /> #*phycobillisoom<br /> #*hopanoïde<br /> #*nog eentje maar ben ik vergeten<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> #Wat is een biogeochemische cycli? Geef schematisch de stikstofcyclus en beschrijf de voornaamste processen.<br /> #Bespreek de structuur, inplanting en werking van prokaryote flagellen en aanverwante structuren als ook het mechanisme van chemotaxis. Welke verschillen zijn er met een eukaryote flagel?<br /> #Begrippen: axiaal filament, griseofulin, peplomeren, quinolones, evolutionaire chronometers, mechanisme voor CO2 fixatie door de acetyl CoA pathway, viroïde, hopanoïde<br /> <br /> ===22 januari 2018 VM===<br /> #Leg uit: biogeochemische cycli. Geef schematisch de stikstofcyclus weer en bespreek de belangrijkste reacties. <br /> #Je krijgt een bodemstaal waaruit je onbekende micro-organismen moet identificeren, hierin zit een organisme dat metabole producten maakt die antifungicidaal werken, deze kunnen dienen voor een nieuw middel. Hoe ga je (zo efficiënt mogelijk) te werk?<br /> #begrippen: PFU en CFU, MIC en fenolcoëfficiënt, latente en persistente infectie, cirri, Aw, cycloheximide, commensalisme en ammensalisme en teichoïnezuur<br /> <br /> ===19 januari 2018===<br /> #Bespreek de structuur, werking en inplanting van bacteriële flagellen (met tekening). Wat is het mechanisme van chemotaxis? Wat zijn de verschillen met eukaryote flagellen.<br /> #Welke detoxificatiemechanismen zijn er van toxische zuurstof. Geef de enzymen en hun reacties. Hij wilt ook dat je een extra voorbeeld geeft. Wat is het belang van zuurstof in een microbiële ecosysteem.<br /> #8 termen: cycloheximide, sulfonilamide, aw, lysozymen, amensalisme, phycobiline, acetyl-CoA pathway en hepadnavirus<br /> <br /> ===15 januari 2018===<br /> #Bespreek kort de oxygene en anoxygene fotosynthese van micro-organismen en hun reducerend vermogen. Leg fermentaties van micro-organismen uit, hoe wordt hiermee energie gewonnen? /5<br /> #A)Waarvoor staat HxNx? B) Leg de Baltimore-classificatie uit. Welke types virussen hebben eigen polymerasen? C) weet ik niet meer, maar ook iets met virussen /5<br /> #8 stellingen, per juist antwoord 0,5 1)cyloheximine werkt niet op gramnnegatieve bacteriën 2)antibiotica-resistentie wordt aspecies-specifiek doorgegeven en voornamelijk via transductie 3)een guilde is een groep van klonaal verwante cellen 4)bij een peristenta infectie komen viruspartikels niet vrij en blijft de gastheer leven 5)bij amensalisme hebben beide partners altijd een voordeel 6)bij een hydrogenosoom wordt ATP geproduceerd via hydrolyse en H+ 7)een virion reffereert naar de extrcellulaire vorm van een virus 8)ben ik vergeten /4<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM===<br /> #bespreek de structuur en werking van de flagel bij bacteriële cellen + bespreek chemotaxis<br /> #detoxificatie van zuurstof<br /> #8 stelling juist/fout + verklaar<br /> #*gramnegatieve bachteriën zijn niet gevoelig voor beta-lactam ring <br /> #*antibiotica-resistentie is species-specifiek<br /> #*decimale reductietijd neemt af bij toenemende verhittingstemperatuur<br /> #*hydrogenosomen bij prokaryoten halen hun energie uit de oxidatie van pyruvaat<br /> #*stikstoffixatie komt vooral voor in anoxygene condities<br /> #*persistentie infectie van viruspartikels vernietigd de gastheercel<br /> #*geen enkele bacterie (Bacteria + Archaea) kan leven zonder celwand<br /> #*energiewinst bij fermentatie komt altijd van substraatfosforylatie<br /> <br /> ===23 januari 2017 NM===<br /> #bespreek hoe het kleine virale genoom toch een volledige functie qua replicatie en assemblage van een virus kan veroorzaken. geef voorbeelden en leg uit<br /> #virussen zijn niet altijd negatief. Bespreek en geef een voorbeeld ivm humaan microbioom<br /> #je hebt een bodemstaal met micro-organismen, hoe ga je na dat deze micro-organismen een fungistatische werking hebben? + leg uit micro-organismen die groeien in het labo en micro-organismen laten groeien die niet in het labo kunnen groeien.<br /> #vancomycine slaat niet aan, welke combinatie is het beste? keuze uit: vancomycine + cycloheximide/amphotericini/isoniazide/sulfanilamide<br /> #leg verschil en gelijkenis uit + bespreek<br /> #*mesofiel-pathogeen<br /> #*antiseptica-desinfectans<br /> #*fermentatie-chemoorganotroof anaeroobe respiratie<br /> #*chemoorganotroof-chemolithotroof<br /> #*generatietijd-delingscoefficient<br /> #*sporecortex-bacteriele celwand<br /> #*guilde-gemeenschap<br /> #*commensalisme-amensalisme<br /> <br /> ===23 januari 2017 VM===<br /> #bespreek de celwand bij gram - en gram + bacteriën en archaea. geef een manier om bacteria, archaea en eukaryoten te scheiden. geef minstens 3 manieren hoe je gram + en gram - bacteriën kan onderscheiden (zonder gram kleuring) <br /> #afbeelding cel met onderdelen aangeduid (celwand, 50S,...) geef voorbeelden van antibiotica die hier op inwerken en leg hun werking uit.<br /> #8 juist of fout vragen<br /> <br /> ===26 januari 2016===<br /> #Gegeven een tekening van een virtuele cel van een micro-organisme (aangeduid: DNA synthese, RNA synthese, mitotische spoelfiguur en microtubuli, celwand, plasmamembraan, translatie, foliumzuursynthese). Geef alle antimicrobiële middelen die erbij horen. Bespreek de mechanismen van de antimicrobiële middelen bij een verschillende manier van inwerking. <br /> #Flagellen pro-en eukaryoten (ook tekenen!). Welke andere bewegingsvormen ken je nog? Leg taxis uit. <br /> #Leg uit en bespreek de gelijkenissen en/of verschillen:<br /> #*halofielen - osmiofielen<br /> #*autotroof - heterotroof<br /> #*bacteriële celwand - sporeprotoplast<br /> #*chemoorganotroof - ...<br /> #*chemoorganofiel - ...<br /> #*chemooragnofiel anaeroobe respiratie - ...<br /> #* ...<br /> <br /> ===22 januari 2015===<br /> #Flagellen en cirri bij pro- en eukaryoten, bespreek chemo- en fototaxis.<br /> #Detoxificatiemechanismen<br /> #Acht stellingen, juist/niet juist en waarom (ieder op 0,5 punt)<br /> #*B-lactam werkt alleen op gram +<br /> #*Resistentie is species-specifiek<br /> #*Decimale reductietijd daalt altijd bij hogere T<br /> #*Bij fermentatie vindt de energiewinning altijd plaats door substraatfosforylatie<br /> #*Bacteria en Archaea kunnen nooit leven zonder celwand<br /> #*Stikstoffixatie is vooral anoxisch<br /> #*Hydrogenosomen komen voor bij prokaryoten waar ze pyruvaat oxideren tot -<br /> #*en nog een die ik me niet meer herinner.<br /> <br /> ===27 januari 2015===<br /> #verschil oxygene en anoxygene fototrofie + energie bij fermentatie<br /> #welke manieren van voortbeweging, verschil in pro en eukaryoten, (sex)pili, welk competitief voordeel?<br /> #juist/fout vragen<br /> <br /> ===19 januari 2015 (NM)===<br /> #Mechanismen van restentie en resistentie overdracht. Is resistentie speciesspecifiek? Methoden voor het post-antibioticatijdperk.<br /> #Photosynthese bij purperbacterien, groenzwavelbacteren en cyanobacterien schematisch tekenen en verschillen uitleggen. Linken met morfologie en ecologie. <br /> #8 juist-fout vraagjes<br /> #*Gram-negatieve bactierien zijn vatbaar voor ampicilline en amoxicilline.<br /> #*Ergosterolsynthese is geen goede target voor antifungale drugs.<br /> #*Bij een latente infectie komen er geen virusgenen tot expressie en komen er geen virussen vrij.<br /> #*Het nitrogenasecomplex werkt vooral in anoxische omstandigheden<br /> #*Een hydrogenosoom komt voor bij prokaryoten en oxideert pyruvaat tot AcCoA.<br /> #*...<br /> <br /> <br /> ===19 januari 2015 (VM)===<br /> #koolstofcyclus schematisch tekenen en alle metabole processen uitleggen (reacties zijn niet zo belangrijk)<br /> #Wat is de beste combinatie en slechtste combinatie? flucytosine + polyeen, griseofuline en polyeen, vancomycine en polyeen, en er was dan nog eentje maar die weet ik niet meer <br /> #woordjes uitleggen: <br /> #*exosporium <br /> #*evolutionaire chronometers <br /> #*omgekeerde citroencyclus<br /> #*...<br /> <br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> #Virussen zijn gekenmerkt door een klein genoom. Toch hebben ze alles om te voorzien in hun replicatie. Verklaar aan de hand van enkele voorbeelden. Sommige virussen hebben echter ook eigen polymerase enzymes nodig, identificeer hen aan de hand van de baltimore classificatie.<br /> #Je wordt gevraagd onbekende micro-organismen uit een staal water te identificeren; welke technieken gebruik je en hoe ga je te werk om te kijken of sommigen de mogelijkheid bezitten tot de productie van een fungistatisch middel om het te commercialiseren.<br /> #O2 kan giftig zijn; geef de detoxificatiemechanismen die micro-organismen bezitten om dit te bestrijden<br /> <br /> ===21 januari 2014===<br /> #de koolstofcyclus en metabole processen <br /> #detoxificatie mechanisme van zuurstofderivaten die door metabole processen geproduceerd worden en dan ne fungus bestrijden met een combinatie. <br /> #combinaties werden gegeven allemaal met myconazol: uitleggen welk het beste werkte en welk het minst.<br /> <br /> === 20 jan 2014 (namiddag) ===<br /> #koolstofcyclus<br /> #mechanismen van detoxificatie<br /> #patient is besmet met Candida, een syntetische azool werkt niet goed. Welke antibiotica mengeling is de beste? Gegeven = telkens een syntetische azool in combinatie met flucytosine, griseofulin, vancomycine, en nog 1 dat ik niet meer weet<br /> <br /> ===20 januari 2014 voormiddag===<br /> #antibioticaresistentie: hoe, verschillende mechanisme, hoe krijgen we dat in het lichaam<br /> #fungistatische drugs in natuurlijke bodem, hoe herkennen en er uit halen<br /> #virussen: verklaar HxNx, antigendrift en antigenenschift en waarom gaat antigenenschift zo gemakkelijk en baltimoreklassen van influenza + verklaren<br /> #woordjes<br /> #*hopanoide (hier moet ge dat dan vergelijken met sterol in eukaryoten enzo)<br /> #*hydrosoom<br /> #*viroiden<br /> #*endotoxine<br /> <br /> === 31 jan 2012 (voormiddag) ===<br /> # Geef de koolstofcyclus en leg kort alle processen uit die hierin voorkomen. (mondeling)<br /> # Een schema van een cel waarop verschillende delen aangeduid stonden (celwand, membraan, DNA+RNA-synthese, 50S ribosoon-subunit, 30 S ribosoom-subunit). Geef bij elk deel de antibiotica die hierop inwerken en leg, als er meerdere antibiotica bij bij één passen, hun actiemechanismen uit.<br /> # Verklaar:<br /> #* Fenol-coëfficiënt methode<br /> #* Virion<br /> #* Rolling-circle replicatie<br /> #* O-anitgen<br /> #* Fermentatiebalans<br /> #* Anamoxosoom<br /> #* Decimale Reductietijd<br /> #* Hopanoïde<br /> <br /> === 26 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Anoxigene fotosynthese bij purperbacterien en oxygene bij cyanobacteriën: Een schets geven en vergelijken.<br /> # Celwandstructuur bij bacteria(grampos en gram negatief)en archaea bespreken en vergelijken. En met welke techniek zou je deze kunnen onderscheiden<br /> # Een patiënt met een bacteriële infectie werd behandeld met chloramphenicol maar dit was niet erg werkzaam. Men zou kunnen combineren met vancomycine, tetracycline en cephalosporine. Wat gaat het minst werkzaam zijn? en welk het meeste?<br /> <br /> === 25 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Wat is metagenomics, wat kun je met deze techniek doen en beschrijf de voordelen aan de hand van een creatief (zelfverzonnen)voorbeeld<br /> # Stikstoffixatie: Bespreek en wat heeft zuurstof hiermee te maken?<br /> # Geef de biochemische werkingsmechanismen van: quinolones, aminoglycosiden, synthetische azolen en sulfonamides<br /> <br /> === 17 jan 2011 (namiddag) ===<br /> <br /> # Wat is metagenomics, wat kun je met deze techniek doen en beschrijf de voordelen aan de hand van een creatief (zelfverzonnen)voorbeeld<br /> # nitrificatie, denitrificatie en stikstoffixatie zijn belangrijke processen. Bespreek bondig de reacties en plaats in de stikstofcyclus. Wat heeft zuurstof hiermee te maken?<br /> # vergelijk de opbouw van de celwand van gram positieve en negatieve bacteriën met behulp van een schema, hoe zou je eenvoudig een onderscheid kunnen maken?<br /> <br /> === 21 jan 2010 ===<br /> # Geef de schematische voorstelling van de anoxigene fotosynthese bij purperbacteriën en de oxigene fotosynthese bij cyanobacteriën. Bespreek verschillen, incl. morfologische kenmerken en plaats dit in een algemeen microbiële context.<br /> # Hoe weet je of een medicijn bacteriostatisch, bacteriolytisch, bacteriocide, fungistatisch, fungicide is. (bijvraag: hoe zou jij dat bepalen als biochemist?) Wat is MIC en hoe bepaal je dat, fenolcoëfficient bespreken. De criteria bespreken voor een medicijn, antiseptica, desinfectans.<br /> # Mexicaanse griep is van het type H1N1. Leg uit wat HxNx is en leg antigene shift en antigene drift uit. Tot welke baltimore klasse behoort influenza.(bijvraag: middelen tegen influenza)<br /> <br /> === 11 jan 2010 ===<br /> # zuurstof kan toxisch zijn voor micro-organisme. Welke reactie zorgen voor de omzetting van deze toxische zuurstof?<br /> # bespreek de biochemische werkingsmechanisme van ampiciline en cephalosporine<br /> # geef alle pathways voor C02 fixatie? (het zijn er btw 8 en geen 5 zoals de meeste denken)<br /> === 27 jan 2009 ===<br /> <br /> # Verklaar:<br /> #* Baltimore classificatie<br /> #* tegument<br /> #* psychrotolerante mesofiel<br /> #* peritrieche flagelaat<br /> # Methanotrofen en methylotrofen, geef energiewinning en koolstof assimilatie<br /> # antifungale drugs; waarom moeilijker te maken dan antibacterieel en bespreek de reactiemechanismen van <br /> === 23 jan 2009 ===<br /> # C02 fixatie<br /> # hoe ga je te werk om uit een bodemstaal 1) alle micro-organismen te identificeren 2) een fungistatisch metaboliet te zoeken<br /> # Termpjes:<br /> #* aw<br /> #* serine pathway<br /> === 23 jan 2009 ===<br /> # Een gistcultuur is geïnfecteerd met cyanobacteriën. Geef een aantal manieren om weer een zuivere gistcultuur te verkrijgen.<br /> # Juist of fout vragen:<br /> #* S-lagen<br /> #* iets over pseudopeptidoglycaan van Archaea<br /> #* phycobilines<br /> #* de manier van vrijstelling van naakte vs 'enveloped' virussen<br /> #* cephalosporine<br /> # Nitraatreductie. En bespreek deze bij E.coli en Pseudomonas stutzeri.<br /> === 16 jan 2009 ===<br /> # 5 woorden verklaren:<br /> #* cephalosporine<br /> #* phycobilisoom<br /> #* hepadnavirussen<br /> #* serine pathway<br /> #* wateractiviteit aw<br /> # Waarom is het moeilijker om antiviraal middel te vinden dan een antibacterieel?<br /> # Biogeochemische cycli en stikstof-cyclus<br /> === 15 jun 2008 ===<br /> # bespreek de acetyl coA pathway en welke organisme gebruiken deze...<br /> # glycocalyx, hydrogenosoom, wateractiviteit, mutualisme, protocooperatie uitleggen<br /> # wat zijn fylogenetische merkers, wat doen ze en geef meerdere voorbeelden en leg uit<br /> === 13 jun 2008 ===<br /> # Denitrificatie en nitrificatie + waterzuivering<br /> # Hou zou je ALLE organismen in een bodemstaal classificeren en metabolisme nagaan?<br /> # wateractiviteit + welke organismen kunnen tegen lage + oplossing<br /> # Termen:<br /> #* amensalisme<br /> #* protocoöperatie<br /> #* S.cerevisiae geïnfecteerd met groen zwavel bacteriën... hoe los je dit op<br /> #* Verschil groenzwavel- en purperbacteriën op vlak van productie reducerend vermogen<br /> #* Antibioticaresistentiemechanismen<br /> #* fermentatie...hoe energie en reducerend vermogen verzorgen<br /> #* mutualisme<br /> #* syntrofie<br /> #* verschil antiseptica en desinfectantia<br /> === 13 jun 2008 ===<br /> # acetyl coA cyclus en welke organismen deze gebruiken<br /> # voorwaarden voor goede fylogenetische merkers en enkele voorbeelden<br /> # begrippen: pleiomorfie,monomorfie,chemostaat,....<br /> === 10 jun 2008 ===<br /> # penicillines hebben geen effect op Archaea en Gram negatieve bacterien. Juist of fout, leg uit ahv biochemische werking penicilline<br /> # wat is metagenomics, voordelen en toekomstperspectieven in toegepaste microbiologie<br /> # manieren van C02 fixatie<br /> === 27 aug 2007 ===<br /> # Stel men vraagt je om een antifungaal middel te ontwikkelen tegen gistinfecties bij mensen. Op welke principes zou je dit kunnen baseren en staaf met een voorbeeld. Hoe ga je te werk om te bepalen of je product een bacteriostatische of bacteriocide werking heeft? <br /> # Bespreek bondig de anoxische fotosynthese bij purperbacterieën<br /> # Wat zijn psychrofiele organismen? Hoe zijn ze aangepast aan hun milieu? Waarin verschillen ze met psychrotolerante organismen?<br /> # Practicumvraag: Geef met behulp van een schema het verschil tussen gram-positieve en gram-negatieve bacteriën. Met welke technieken kun je beide groepen onderscheiden?<br /> === 18 jun 2007 ===<br /> # De toxische producten die vanuit zuurstof gevormd worden en hoe de cel die onschadelijk maakt.<br /> # Geef alle manieren om CO2 te fixeren.<br /> # Termen: <br /> #* chemostaat<br /> #* glycocalyx<br /> #* micronutrienten<br /> #* macronutrienten<br /> #* hydrogenosoom<br /> #* monomorfisch<br /> #* pleiomorfisch<br /> === 15 jun 2007 ===<br /> # Leg de structuur en de werking van de bacteriële flagel uit en bespreek chemotaxis.<br /> # Hoe gaat u te werk om te bepalen of een stof een bacteriostatische of bactericide werking heeft?<br /> # Vergelijk de energie en reducerend vermogen vorming bij fototrofen en fermentatie.<br /> <br /> === 11 jun 2007 ===<br /> # bespreek de vorming en structuur van endosporen, welke zijn de voordelen hiervan voor de overleving van de bacterie en hoe moeten we daar mee omgaan als we de groei van zulde organismen willen onder controle houden<br /> # ken je manieren voor incorporatie van C02, zoja welke en beschrijf bondig de pathways <br /> # stel je hebt een bodemstaal met daarin nieuwe 'ongekende' organismen, beschrijf hoe je te werk zou gaan om deze te identificeren en welke manieren je zou gebruiken voor de classificatie<br /> <br /> === 11 jun 2007 ===<br /> # Hoe onstaat resistentie tegen antibiotica bij micro-organismen? Bespreek de verschillende mechanismen van resistentie. In een post-antibiotica tijdperk, welke methoden zou je gebruiken om bacteriele infecties tegen te gaan?<br /> # Bespreek de verschillende methodes die micro-organismen hebben om zich te beschermen tegen toxische zuurstof producten (door fotochemische reacties ontstaan).<br /> # Wat zijn biogeochemische cycli? Bespreek aan de hand van een schematische voorstelling van de koolstof cyclus.</div>

R0893094 https://wiki.chemika.be/index.php?title=Microbiologie&diff=3208 2023-01-24T13:16:26Z

<p>R0893094: /* Examenvragen */</p> <hr /> <div>[[Categorie:Bachelor Biochemie]]<br /> ==Vakinformatie==<br /> Microbiologie wordt tegenwoordig in het tweede jaar gegeven. Vroeger was dit het derde jaar. Ook verhuisd van tweede naar eerste semester. Wordt gevolgd door studenten biologie en biochemie. Gedoceerd door Prof. Joris Winderickx. Normaal mondeling examen, wegens COVID toch schriftelijk. Practicum wordt geëvalueerd via een één verslag over al de practicumsessies.<br /> <br /> ==Examenvragen==<br /> <br /> === 24 Januari 2023 ===<br /> # (A) restrictie-modificatie systeem en CRISPR-Cas mechanisme uitleggen. (B) Welke invloed heeft dit op het ecosysteem?<br /> # Detoxificatie van zuurstof van micro-organismen.<br /> <br /> # verklaar volgende termen en geef het verband/verschil:<br /> #*MIC en fenolcoëffiënt<br /> #*Fimbrae en cirri<br /> #*commensalisme en mutualisme<br /> #*virulente virussen en getemperde virussen<br /> #*watercoëfficiënt en compatable solute<br /> #*Nitrificatie en anammox<br /> #*anaerobe respiratie en fermentatie<br /> #*Zoönose en anthroponose<br /> <br /> === 13 Januari 2023 ===<br /> #(A)Bacteriën delen door binaire splijting. Wat weet je over het divisoom? Hoe vindt de cel het centrum? (B) Welke parameters kan men afleiden uit een groei curve? /5<br /> #Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te maken dan een antiviraal middel? Gegeven dat het een RNA-Virus is, op welke doelwitten zou een antiviraal middel kunnen inwerken? Hoe kan je testen of je antiviraal middel effectief is? /5<br /> <br /> #verklaar volgende termen:<br /> #*cilia<br /> #*amensalisme<br /> #*hydrogenosoom(+reactie)<br /> #*MIC<br /> #*Wateractiviteit<br /> #*amphixenose<br /> #*Viroide<br /> #*persistente infectie<br /> <br /> === 25 Januari 2022 ===<br /> <br /> Hoe worden micro-organismen resistent? Welke mechanismen zorgen ervoor dat ze resistent zijn? Hoe wordt dit overgedragen? Is dit species-specifiek? /5<br /> <br /> Bespreek de bouw en werking/functie van prokaryote flagellen (Gram neg., gram pos. en Archaea). Vergelijk ook met eukaryote flagella. Bespreek fototaxis en verklaar hoe dit voordeel geeft in een ecosysteem. /5<br /> <br /> Stelling juist/fout + verklaar /4<br /> <br /> *Geen enkele bacterie (Bacteria + Archaea) kan leven zonder celwand <br /> <br /> *Een hydrogenosoom komt voor bij prokaryoten en oxideert pyruvaat tot AcCoA.<br /> <br /> *Decimale reductietijd neemt af bij toenemende verhittingstemperatuur <br /> <br /> *B-lactam werkt alleen op gram+ <br /> <br /> *Bij een persistente infectie wordt de gastheercel vernietigd.<br /> <br /> *Stikstoffixatie komt vooral voor in anoxygene condities <br /> <br /> *Chemolithotrofen halen hun energie uit fermentatie met substraatfosforylatie<br /> <br /> *Cyanobacteriën hebben phycobillisomen voor optimale lichtcaptatie<br /> <br /> === 17 januari 2022 ===<br /> #Leg de Baltimore-classificatie schematisch uit en verklaar op basis van wat deze gebaseerd werd. Hoe zou je een antiviraal middel maken voor Hepadnavirussen en op welke processen zou dit kunnen inwerken? Hoe kan je testen of dit middel effectief is?<br /> #Vergelijk de celwand van Archaea en grampositieve bacteriën door een gedetailleerde tekening te geven van de polysaccharideketen. Geef verschillende methodes om deze organismen van elkaar te scheiden.<br /> #Begrippen: Leg ze apart uit en geef gelijkenissen en verschillen. <br /> #*anammox - denitrificatie<br /> #*cirri - fimbrae<br /> #*fermentatie - anaerobe respiratie<br /> #*persistente infectie - latente infectie<br /> <br /> === 21 augustus 2021 ===<br /> #Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te maken dan een antiviraal middel? Waar bij een RNA-virus zou een antiviraal middel inwerken? Hoe kan je testen of je antiviraal middel effectief is?<br /> #Vergelijk de celwand van Gram negatief en positief aan de hand van tekeningen, vergelijk ook met celwand van eukaryoten en archaea. Hoe kan je Gram positief en Gram negatief onderscheiden, geef verschillende methodes.<br /> #Begrippen<br /> #*amensalisme - commensalisme<br /> #*wateractiviteit<br /> #*cycloheximide<br /> #*teichoïnezuur<br /> #*persistente en latente infectie<br /> #*MIC en fenolcoëfficient<br /> #*Cirri<br /> #*hydrogenosoom<br /> <br /> === 15 januari 2021 NM ===<br /> #Bespreek de bouw en inplanting van bacteriële flagella. Vergelijk ook met eukaryote flagella en cirri. Bespreek chemotaxis.<br /> #Welk is het belangrijke enzyme voor stikstoffixatie? Andere vormen van stikstof (zoals ammoniak) zijn zeer belangrijk, verklaar.<br /> #Verklaar en leg de verschillen/gelijkenissen uit:<br /> #*mesofiel - pathogeen<br /> #*guilde - gemeenschap<br /> #*retrovirus - hepadnavirus<br /> #*chemo-organotrofe anaerobe respiratie - fermentatie<br /> #*hydrogenosomen - mitochondriën<br /> #*antisepsis - desinfecteren<br /> #*mutualisme - protocoöperatie <br /> #* generatietijd - delingsefficiëntie <br /> === 11 januari 2021 NM ===<br /> #<br /> #Detoxificatie van micro-organismen<br /> #a) Leg het verschil in celwandstructuur tussen Gram-positieve en Gram-negatieve bacteriën uit en op welk principe berust de Gram-kleuring. b)Leg kort de celwand bij archaea en eukaryoten uit. c)Welke andere manieren, naast Gram-kleuring, zijn er om Gram-positieve en Gram-negatieve bacteriën van elkaar te onderscheiden?<br /> #Verklaar en leg de verschillen/gelijkenissen uit:<br /> #*guilde - gemeenschap<br /> #*retrovirussen - hepadnavirussen<br /> #*amensalisme - commensalisme<br /> #*chemo-organotrofe anaerobe respiratie - fermentatie<br /> #*generatietijd - delingsefficientie<br /> #*hydrogenosomen - mitochondriën<br /> #*antisepsis - desinfecteren<br /> #*nog 1tje<br /> <br /> === 17 augustus 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Waarom is het makkelijker om een antibacterieel middel te ontwikkelen dan een antifungaal en een antiviraal middel? Gegeven dat het een RNA-virus is op welke processen/enzymen kan een antiviraal middel inwerken? b) Hoe kan je gemakkelijk testen of een middel tegen fagen effectief is?<br /> #a) Wat is de structuur, inplanting en werking/functie van prokaryote flagella en aanverwante structuren? Wat is het verschil met eukaryote flagella en aanverwante structuren en leg het principe van chemotaxis uit. b) Leg bondig phototaxis uit. <br /> #Begrippen <br /> #*Eclipsperiode<br /> #*Tegument<br /> #*viroïde<br /> #*Evolutionaire chronometers<br /> #*Griseofulin<br /> #*Mechanisme voor CO2 fixatie door de acetyl CoA pathway<br /> #*Peplomeren<br /> #*Quinolones<br /> <br /> === 20 januari 2020 NM ===<br /> #<br /> # Bespreek structuur en functie van flagella. Geef gelijkaardige structuren tussen gram-positieve en gram-negatieve [[Bacteria]]. Geef gelijkaardige structuren bij ''Archaea'' en eukaryoten. <br /> # Over resistentie, wat de mechanismen zijn, of dat species specifiek of aspecifiek is. Alternatieve therapieën tegen resistentie....<br /> #Begrippen:<br /> #*PFU en CFU<br /> #*Ammencialisme en commensialisme<br /> #*aw<br /> #*Cirri<br /> #*Teichoïnezuur<br /> #*MIC en fenolcoëfficient<br /> #*cycloheximide<br /> #*nog eentje<br /> <br /> === 17 januari 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Geef de functie en structuur van prokaryote flagel. Is er een verschil tussen grampositieve en gramnegatieve bacteria flagel? Geef ook analoge structuren. b) Geef minstens 3 andere methoden om grampositieve van de gramnegatieve bacteriën te scheiden (niet via gramkleuring). Hoe kan men in een waterstaal archaea, bacteria &amp; eukarya onderscheiden?<br /> #a) Detoxificatie van giftige zuurstof molecule. b) Welke rol zuurstof en gebonden stikstof componenten (zoals ammoniak) een invloed hebben op de stikstofcyclus?<br /> #Stellingen<br /> #*S-lagen zorgen voor vasthechting van de cel<br /> #*Cephalosporine werkt in op translatie<br /> #*&quot;Naakte&quot; en &quot;Envelopped&quot; virussen worden op dezelfde manier vrijgezet<br /> #*Viroïde is de niet infectieve vorm van een virus<br /> #*In hydrogenosoom zitten hydrogenasen<br /> #*Phycolisomen zijn enkel bij cyanobacteriën te vinden<br /> #*en nog 2 andere<br /> <br /> === 14 januari 2020 VM ===<br /> #<br /> #a) Influenza: verklaar HxNx, antigene shift, antigene drift. In welke Baltimore klasse bevindt influenza zich? b) waarop kunnen antivirale middelen inwerken? geef ook voorbeelden. Hoe zou jij te werk gaan om een nieuw antiviraal middel te maken?<br /> #Vergelijk celwand archae, gramnegatieve en grampositieve (structuren allemaal kunnen tekenen). ZIjn er zonder celwand, zo ja welke? Welke manieren zijn er naast gramkleuring om gramnegatieve en grampositieve van elkaar te onderscheiden? Hoe zou je in een waterstaal Archae, bacteria en eukarya onderscheiden van elkaar (zo min mogelijke stappen)<br /> #Begrippen<br /> #*syntorfie<br /> #*viroide<br /> #*evolutionaire chronometers<br /> #*streptomycines<br /> #*endo- en exotoxine<br /> #*anammoxoom<br /> #*Hydrogenesoom<br /> #<br /> <br /> === 13 januari 2020 NM ===<br /> <br /> #VRAGEN<br /> 1. antibiotica alles uitleggen hoe resistentie opbouwen, species specifiek? <br /> 2. Antifungale drugs voor membraansynthese en proteinsyntheseninhibitie + hoe bepaal je of een drug fungistatisch is?<br /> 3. Wat zijn biogeochemische cycli en leg dit uit adhv de N cyclus, geef alles + verklaar anammox reactie en stikstoffixatie<br /> <br /> #BEGRIPPEN<br /> <br /> Wateractiviteit<br /> Profaag<br /> Anammoxosoom<br /> Chlorosoom<br /> Stickland reactie<br /> Persistente infectie<br /> Endotoxine<br /> Surfactant<br /> <br /> ===5 september 2019===<br /> #<br /> # a) Influenza: verklaar HxNx, antigene shift, antigene shift. In welke Baltimore klasse bevindt influenza zich? b) waarop kunnen antivirale middelen inwerken? geef ook voorbeelden. Hoe zou jij te werk gaan om een nieuw antiviraal middel te maken en te TESTEN? <br /> #Geef een schematische voorstelling van de anoxygene fotosynthese van purperbacteriën en groenzwavelbacteriën, alsook de oxygene fotosynthese van cyanobacteriën. Bespreek de voornaamse verschillen, inclusief morfologische kenmerken, en plaats dit in een algemeen microbieel ecologische context.<br /> #Begrippen<br /> #*cilia<br /> #*viroide<br /> #*profaag<br /> #*persistente infectie<br /> #*wateractiviteit<br /> #*tegument<br /> #*MIC<br /> #*amensalisme<br /> <br /> ===14 januari 2019===<br /> #<br /> #*Hoe worden micro-organismen resistent? Welke mechanismen zorgen ervoor dat resistent zijn? Hoe wordt dit overgedragen? Welke van deze manieren zijn species-specifiek en welke species-aspecifiek?<br /> #*Je hebt een bodemstaal met micro-organismen, hoe ga je na dat deze micro-organismen een fungistatische werking hebben? + leg uit micro-organismen die groeien in het labo en micro-organismen laten groeien die niet in het labo kunnen groeien. Leg kort uit.<br /> #Leg uit HxNx, antigene drift en shift, waarom kan dit laatste zo snel gebeuren bij het influenzavirus? Tot welke klasse van Baltimore behoort Influenza. Geef het schema van de Baltimore classificatie en leg de principes uit.<br /> #Begrippen<br /> #*Syntrofie<br /> #*Evolutionaire chronometers<br /> #*Hydrogenosoom (+ reacties)<br /> #*Streptomycine<br /> #*Heterotroof<br /> #*Annamox<br /> #*Viroïde<br /> #*Endo- en exotoxines<br /> <br /> ===21 augustus 2018===<br /> #Je krijgt een waterstaal, hoe weet je welke GEKENDE micro-organismen hier inzitten waarvan je een metabool product wil onderzoeken. Hoe kan je testen dat dit een fungicide is?<br /> #Bespreek flagellen bij pro- en eukaryoten en leg chemotaxis uit<br /> #begrippen<br /> #*Surfactant<br /> #*tegument<br /> #*bacilli<br /> #*hydrogenosoom<br /> #*wateractiviteit<br /> #*phycobillisoom<br /> #*hopanoïde<br /> #*nog eentje maar ben ik vergeten<br /> <br /> ===29 januari 2018 VM===<br /> #Wat is een biogeochemische cycli? Geef schematisch de stikstofcyclus en beschrijf de voornaamste processen.<br /> #Bespreek de structuur, inplanting en werking van prokaryote flagellen en aanverwante structuren als ook het mechanisme van chemotaxis. Welke verschillen zijn er met een eukaryote flagel?<br /> #Begrippen: axiaal filament, griseofulin, peplomeren, quinolones, evolutionaire chronometers, mechanisme voor CO2 fixatie door de acetyl CoA pathway, viroïde, hopanoïde<br /> <br /> ===22 januari 2018 VM===<br /> #Leg uit: biogeochemische cycli. Geef schematisch de stikstofcyclus weer en bespreek de belangrijkste reacties. <br /> #Je krijgt een bodemstaal waaruit je onbekende micro-organismen moet identificeren, hierin zit een organisme dat metabole producten maakt die antifungicidaal werken, deze kunnen dienen voor een nieuw middel. Hoe ga je (zo efficiënt mogelijk) te werk?<br /> #begrippen: PFU en CFU, MIC en fenolcoëfficiënt, latente en persistente infectie, cirri, Aw, cycloheximide, commensalisme en ammensalisme en teichoïnezuur<br /> <br /> ===19 januari 2018===<br /> #Bespreek de structuur, werking en inplanting van bacteriële flagellen (met tekening). Wat is het mechanisme van chemotaxis? Wat zijn de verschillen met eukaryote flagellen.<br /> #Welke detoxificatiemechanismen zijn er van toxische zuurstof. Geef de enzymen en hun reacties. Hij wilt ook dat je een extra voorbeeld geeft. Wat is het belang van zuurstof in een microbiële ecosysteem.<br /> #8 termen: cycloheximide, sulfonilamide, aw, lysozymen, amensalisme, phycobiline, acetyl-CoA pathway en hepadnavirus<br /> <br /> ===15 januari 2018===<br /> #Bespreek kort de oxygene en anoxygene fotosynthese van micro-organismen en hun reducerend vermogen. Leg fermentaties van micro-organismen uit, hoe wordt hiermee energie gewonnen? /5<br /> #A)Waarvoor staat HxNx? B) Leg de Baltimore-classificatie uit. Welke types virussen hebben eigen polymerasen? C) weet ik niet meer, maar ook iets met virussen /5<br /> #8 stellingen, per juist antwoord 0,5 1)cyloheximine werkt niet op gramnnegatieve bacteriën 2)antibiotica-resistentie wordt aspecies-specifiek doorgegeven en voornamelijk via transductie 3)een guilde is een groep van klonaal verwante cellen 4)bij een peristenta infectie komen viruspartikels niet vrij en blijft de gastheer leven 5)bij amensalisme hebben beide partners altijd een voordeel 6)bij een hydrogenosoom wordt ATP geproduceerd via hydrolyse en H+ 7)een virion reffereert naar de extrcellulaire vorm van een virus 8)ben ik vergeten /4<br /> <br /> ===21 augustus 2017 NM===<br /> #bespreek de structuur en werking van de flagel bij bacteriële cellen + bespreek chemotaxis<br /> #detoxificatie van zuurstof<br /> #8 stelling juist/fout + verklaar<br /> #*gramnegatieve bachteriën zijn niet gevoelig voor beta-lactam ring <br /> #*antibiotica-resistentie is species-specifiek<br /> #*decimale reductietijd neemt af bij toenemende verhittingstemperatuur<br /> #*hydrogenosomen bij prokaryoten halen hun energie uit de oxidatie van pyruvaat<br /> #*stikstoffixatie komt vooral voor in anoxygene condities<br /> #*persistentie infectie van viruspartikels vernietigd de gastheercel<br /> #*geen enkele bacterie (Bacteria + Archaea) kan leven zonder celwand<br /> #*energiewinst bij fermentatie komt altijd van substraatfosforylatie<br /> <br /> ===23 januari 2017 NM===<br /> #bespreek hoe het kleine virale genoom toch een volledige functie qua replicatie en assemblage van een virus kan veroorzaken. geef voorbeelden en leg uit<br /> #virussen zijn niet altijd negatief. Bespreek en geef een voorbeeld ivm humaan microbioom<br /> #je hebt een bodemstaal met micro-organismen, hoe ga je na dat deze micro-organismen een fungistatische werking hebben? + leg uit micro-organismen die groeien in het labo en micro-organismen laten groeien die niet in het labo kunnen groeien.<br /> #vancomycine slaat niet aan, welke combinatie is het beste? keuze uit: vancomycine + cycloheximide/amphotericini/isoniazide/sulfanilamide<br /> #leg verschil en gelijkenis uit + bespreek<br /> #*mesofiel-pathogeen<br /> #*antiseptica-desinfectans<br /> #*fermentatie-chemoorganotroof anaeroobe respiratie<br /> #*chemoorganotroof-chemolithotroof<br /> #*generatietijd-delingscoefficient<br /> #*sporecortex-bacteriele celwand<br /> #*guilde-gemeenschap<br /> #*commensalisme-amensalisme<br /> <br /> ===23 januari 2017 VM===<br /> #bespreek de celwand bij gram - en gram + bacteriën en archaea. geef een manier om bacteria, archaea en eukaryoten te scheiden. geef minstens 3 manieren hoe je gram + en gram - bacteriën kan onderscheiden (zonder gram kleuring) <br /> #afbeelding cel met onderdelen aangeduid (celwand, 50S,...) geef voorbeelden van antibiotica die hier op inwerken en leg hun werking uit.<br /> #8 juist of fout vragen<br /> <br /> ===26 januari 2016===<br /> #Gegeven een tekening van een virtuele cel van een micro-organisme (aangeduid: DNA synthese, RNA synthese, mitotische spoelfiguur en microtubuli, celwand, plasmamembraan, translatie, foliumzuursynthese). Geef alle antimicrobiële middelen die erbij horen. Bespreek de mechanismen van de antimicrobiële middelen bij een verschillende manier van inwerking. <br /> #Flagellen pro-en eukaryoten (ook tekenen!). Welke andere bewegingsvormen ken je nog? Leg taxis uit. <br /> #Leg uit en bespreek de gelijkenissen en/of verschillen:<br /> #*halofielen - osmiofielen<br /> #*autotroof - heterotroof<br /> #*bacteriële celwand - sporeprotoplast<br /> #*chemoorganotroof - ...<br /> #*chemoorganofiel - ...<br /> #*chemooragnofiel anaeroobe respiratie - ...<br /> #* ...<br /> <br /> ===22 januari 2015===<br /> #Flagellen en cirri bij pro- en eukaryoten, bespreek chemo- en fototaxis.<br /> #Detoxificatiemechanismen<br /> #Acht stellingen, juist/niet juist en waarom (ieder op 0,5 punt)<br /> #*B-lactam werkt alleen op gram +<br /> #*Resistentie is species-specifiek<br /> #*Decimale reductietijd daalt altijd bij hogere T<br /> #*Bij fermentatie vindt de energiewinning altijd plaats door substraatfosforylatie<br /> #*Bacteria en Archaea kunnen nooit leven zonder celwand<br /> #*Stikstoffixatie is vooral anoxisch<br /> #*Hydrogenosomen komen voor bij prokaryoten waar ze pyruvaat oxideren tot -<br /> #*en nog een die ik me niet meer herinner.<br /> <br /> ===27 januari 2015===<br /> #verschil oxygene en anoxygene fototrofie + energie bij fermentatie<br /> #welke manieren van voortbeweging, verschil in pro en eukaryoten, (sex)pili, welk competitief voordeel?<br /> #juist/fout vragen<br /> <br /> ===19 januari 2015 (NM)===<br /> #Mechanismen van restentie en resistentie overdracht. Is resistentie speciesspecifiek? Methoden voor het post-antibioticatijdperk.<br /> #Photosynthese bij purperbacterien, groenzwavelbacteren en cyanobacterien schematisch tekenen en verschillen uitleggen. Linken met morfologie en ecologie. <br /> #8 juist-fout vraagjes<br /> #*Gram-negatieve bactierien zijn vatbaar voor ampicilline en amoxicilline.<br /> #*Ergosterolsynthese is geen goede target voor antifungale drugs.<br /> #*Bij een latente infectie komen er geen virusgenen tot expressie en komen er geen virussen vrij.<br /> #*Het nitrogenasecomplex werkt vooral in anoxische omstandigheden<br /> #*Een hydrogenosoom komt voor bij prokaryoten en oxideert pyruvaat tot AcCoA.<br /> #*...<br /> <br /> <br /> ===19 januari 2015 (VM)===<br /> #koolstofcyclus schematisch tekenen en alle metabole processen uitleggen (reacties zijn niet zo belangrijk)<br /> #Wat is de beste combinatie en slechtste combinatie? flucytosine + polyeen, griseofuline en polyeen, vancomycine en polyeen, en er was dan nog eentje maar die weet ik niet meer <br /> #woordjes uitleggen: <br /> #*exosporium <br /> #*evolutionaire chronometers <br /> #*omgekeerde citroencyclus<br /> #*...<br /> <br /> <br /> ===23 januari 2014===<br /> #Virussen zijn gekenmerkt door een klein genoom. Toch hebben ze alles om te voorzien in hun replicatie. Verklaar aan de hand van enkele voorbeelden. Sommige virussen hebben echter ook eigen polymerase enzymes nodig, identificeer hen aan de hand van de baltimore classificatie.<br /> #Je wordt gevraagd onbekende micro-organismen uit een staal water te identificeren; welke technieken gebruik je en hoe ga je te werk om te kijken of sommigen de mogelijkheid bezitten tot de productie van een fungistatisch middel om het te commercialiseren.<br /> #O2 kan giftig zijn; geef de detoxificatiemechanismen die micro-organismen bezitten om dit te bestrijden<br /> <br /> ===21 januari 2014===<br /> #de koolstofcyclus en metabole processen <br /> #detoxificatie mechanisme van zuurstofderivaten die door metabole processen geproduceerd worden en dan ne fungus bestrijden met een combinatie. <br /> #combinaties werden gegeven allemaal met myconazol: uitleggen welk het beste werkte en welk het minst.<br /> <br /> === 20 jan 2014 (namiddag) ===<br /> #koolstofcyclus<br /> #mechanismen van detoxificatie<br /> #patient is besmet met Candida, een syntetische azool werkt niet goed. Welke antibiotica mengeling is de beste? Gegeven = telkens een syntetische azool in combinatie met flucytosine, griseofulin, vancomycine, en nog 1 dat ik niet meer weet<br /> <br /> ===20 januari 2014 voormiddag===<br /> #antibioticaresistentie: hoe, verschillende mechanisme, hoe krijgen we dat in het lichaam<br /> #fungistatische drugs in natuurlijke bodem, hoe herkennen en er uit halen<br /> #virussen: verklaar HxNx, antigendrift en antigenenschift en waarom gaat antigenenschift zo gemakkelijk en baltimoreklassen van influenza + verklaren<br /> #woordjes<br /> #*hopanoide (hier moet ge dat dan vergelijken met sterol in eukaryoten enzo)<br /> #*hydrosoom<br /> #*viroiden<br /> #*endotoxine<br /> <br /> === 31 jan 2012 (voormiddag) ===<br /> # Geef de koolstofcyclus en leg kort alle processen uit die hierin voorkomen. (mondeling)<br /> # Een schema van een cel waarop verschillende delen aangeduid stonden (celwand, membraan, DNA+RNA-synthese, 50S ribosoon-subunit, 30 S ribosoom-subunit). Geef bij elk deel de antibiotica die hierop inwerken en leg, als er meerdere antibiotica bij bij één passen, hun actiemechanismen uit.<br /> # Verklaar:<br /> #* Fenol-coëfficiënt methode<br /> #* Virion<br /> #* Rolling-circle replicatie<br /> #* O-anitgen<br /> #* Fermentatiebalans<br /> #* Anamoxosoom<br /> #* Decimale Reductietijd<br /> #* Hopanoïde<br /> <br /> === 26 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Anoxigene fotosynthese bij purperbacterien en oxygene bij cyanobacteriën: Een schets geven en vergelijken.<br /> # Celwandstructuur bij bacteria(grampos en gram negatief)en archaea bespreken en vergelijken. En met welke techniek zou je deze kunnen onderscheiden<br /> # Een patiënt met een bacteriële infectie werd behandeld met chloramphenicol maar dit was niet erg werkzaam. Men zou kunnen combineren met vancomycine, tetracycline en cephalosporine. Wat gaat het minst werkzaam zijn? en welk het meeste?<br /> <br /> === 25 jan 2011 (voormiddag) ===<br /> <br /> # Wat is metagenomics, wat kun je met deze techniek doen en beschrijf de voordelen aan de hand van een creatief (zelfverzonnen)voorbeeld<br /> # Stikstoffixatie: Bespreek en wat heeft zuurstof hiermee te maken?<br /> # Geef de biochemische werkingsmechanismen van: quinolones, aminoglycosiden, synthetische azolen en sulfonamides<br /> <br /> === 17 jan 2011 (namiddag) ===<br /> <br /> # Wat is metagenomics, wat kun je met deze techniek doen en beschrijf de voordelen aan de hand van een creatief (zelfverzonnen)voorbeeld<br /> # nitrificatie, denitrificatie en stikstoffixatie zijn belangrijke processen. Bespreek bondig de reacties en plaats in de stikstofcyclus. Wat heeft zuurstof hiermee te maken?<br /> # vergelijk de opbouw van de celwand van gram positieve en negatieve bacteriën met behulp van een schema, hoe zou je eenvoudig een onderscheid kunnen maken?<br /> <br /> === 21 jan 2010 ===<br /> # Geef de schematische voorstelling van de anoxigene fotosynthese bij purperbacteriën en de oxigene fotosynthese bij cyanobacteriën. Bespreek verschillen, incl. morfologische kenmerken en plaats dit in een algemeen microbiële context.<br /> # Hoe weet je of een medicijn bacteriostatisch, bacteriolytisch, bacteriocide, fungistatisch, fungicide is. (bijvraag: hoe zou jij dat bepalen als biochemist?) Wat is MIC en hoe bepaal je dat, fenolcoëfficient bespreken. De criteria bespreken voor een medicijn, antiseptica, desinfectans.<br /> # Mexicaanse griep is van het type H1N1. Leg uit wat HxNx is en leg antigene shift en antigene drift uit. Tot welke baltimore klasse behoort influenza.(bijvraag: middelen tegen influenza)<br /> <br /> === 11 jan 2010 ===<br /> # zuurstof kan toxisch zijn voor micro-organisme. Welke reactie zorgen voor de omzetting van deze toxische zuurstof?<br /> # bespreek de biochemische werkingsmechanisme van ampiciline en cephalosporine<br /> # geef alle pathways voor C02 fixatie? (het zijn er btw 8 en geen 5 zoals de meeste denken)<br /> === 27 jan 2009 ===<br /> <br /> # Verklaar:<br /> #* Baltimore classificatie<br /> #* tegument<br /> #* psychrotolerante mesofiel<br /> #* peritrieche flagelaat<br /> # Methanotrofen en methylotrofen, geef energiewinning en koolstof assimilatie<br /> # antifungale drugs; waarom moeilijker te maken dan antibacterieel en bespreek de reactiemechanismen van <br /> === 23 jan 2009 ===<br /> # C02 fixatie<br /> # hoe ga je te werk om uit een bodemstaal 1) alle micro-organismen te identificeren 2) een fungistatisch metaboliet te zoeken<br /> # Termpjes:<br /> #* aw<br /> #* serine pathway<br /> === 23 jan 2009 ===<br /> # Een gistcultuur is geïnfecteerd met cyanobacteriën. Geef een aantal manieren om weer een zuivere gistcultuur te verkrijgen.<br /> # Juist of fout vragen:<br /> #* S-lagen<br /> #* iets over pseudopeptidoglycaan van Archaea<br /> #* phycobilines<br /> #* de manier van vrijstelling van naakte vs 'enveloped' virussen<br /> #* cephalosporine<br /> # Nitraatreductie. En bespreek deze bij E.coli en Pseudomonas stutzeri.<br /> === 16 jan 2009 ===<br /> # 5 woorden verklaren:<br /> #* cephalosporine<br /> #* phycobilisoom<br /> #* hepadnavirussen<br /> #* serine pathway<br /> #* wateractiviteit aw<br /> # Waarom is het moeilijker om antiviraal middel te vinden dan een antibacterieel?<br /> # Biogeochemische cycli en stikstof-cyclus<br /> === 15 jun 2008 ===<br /> # bespreek de acetyl coA pathway en welke organisme gebruiken deze...<br /> # glycocalyx, hydrogenosoom, wateractiviteit, mutualisme, protocooperatie uitleggen<br /> # wat zijn fylogenetische merkers, wat doen ze en geef meerdere voorbeelden en leg uit<br /> === 13 jun 2008 ===<br /> # Denitrificatie en nitrificatie + waterzuivering<br /> # Hou zou je ALLE organismen in een bodemstaal classificeren en metabolisme nagaan?<br /> # wateractiviteit + welke organismen kunnen tegen lage + oplossing<br /> # Termen:<br /> #* amensalisme<br /> #* protocoöperatie<br /> #* S.cerevisiae geïnfecteerd met groen zwavel bacteriën... hoe los je dit op<br /> #* Verschil groenzwavel- en purperbacteriën op vlak van productie reducerend vermogen<br /> #* Antibioticaresistentiemechanismen<br /> #* fermentatie...hoe energie en reducerend vermogen verzorgen<br /> #* mutualisme<br /> #* syntrofie<br /> #* verschil antiseptica en desinfectantia<br /> === 13 jun 2008 ===<br /> # acetyl coA cyclus en welke organismen deze gebruiken<br /> # voorwaarden voor goede fylogenetische merkers en enkele voorbeelden<br /> # begrippen: pleiomorfie,monomorfie,chemostaat,....<br /> === 10 jun 2008 ===<br /> # penicillines hebben geen effect op Archaea en Gram negatieve bacterien. Juist of fout, leg uit ahv biochemische werking penicilline<br /> # wat is metagenomics, voordelen en toekomstperspectieven in toegepaste microbiologie<br /> # manieren van C02 fixatie<br /> === 27 aug 2007 ===<br /> # Stel men vraagt je om een antifungaal middel te ontwikkelen tegen gistinfecties bij mensen. Op welke principes zou je dit kunnen baseren en staaf met een voorbeeld. Hoe ga je te werk om te bepalen of je product een bacteriostatische of bacteriocide werking heeft? <br /> # Bespreek bondig de anoxische fotosynthese bij purperbacterieën<br /> # Wat zijn psychrofiele organismen? Hoe zijn ze aangepast aan hun milieu? Waarin verschillen ze met psychrotolerante organismen?<br /> # Practicumvraag: Geef met behulp van een schema het verschil tussen gram-positieve en gram-negatieve bacteriën. Met welke technieken kun je beide groepen onderscheiden?<br /> === 18 jun 2007 ===<br /> # De toxische producten die vanuit zuurstof gevormd worden en hoe de cel die onschadelijk maakt.<br /> # Geef alle manieren om CO2 te fixeren.<br /> # Termen: <br /> #* chemostaat<br /> #* glycocalyx<br /> #* micronutrienten<br /> #* macronutrienten<br /> #* hydrogenosoom<br /> #* monomorfisch<br /> #* pleiomorfisch<br /> === 15 jun 2007 ===<br /> # Leg de structuur en de werking van de bacteriële flagel uit en bespreek chemotaxis.<br /> # Hoe gaat u te werk om te bepalen of een stof een bacteriostatische of bactericide werking heeft?<br /> # Vergelijk de energie en reducerend vermogen vorming bij fototrofen en fermentatie.<br /> <br /> === 11 jun 2007 ===<br /> # bespreek de vorming en structuur van endosporen, welke zijn de voordelen hiervan voor de overleving van de bacterie en hoe moeten we daar mee omgaan als we de groei van zulde organismen willen onder controle houden<br /> # ken je manieren voor incorporatie van C02, zoja welke en beschrijf bondig de pathways <br /> # stel je hebt een bodemstaal met daarin nieuwe 'ongekende' organismen, beschrijf hoe je te werk zou gaan om deze te identificeren en welke manieren je zou gebruiken voor de classificatie<br /> <br /> === 11 jun 2007 ===<br /> # Hoe onstaat resistentie tegen antibiotica bij micro-organismen? Bespreek de verschillende mechanismen van resistentie. In een post-antibiotica tijdperk, welke methoden zou je gebruiken om bacteriele infecties tegen te gaan?<br /> # Bespreek de verschillende methodes die micro-organismen hebben om zich te beschermen tegen toxische zuurstof producten (door fotochemische reacties ontstaan).<br /> # Wat zijn biogeochemische cycli? Bespreek aan de hand van een schematische voorstelling van de koolstof cyclus.</div>

R0893094