Chemika Examenwiki - Gebruikersbijdragen [nl]

Molecular Interactions between Fungi and their Hosts

2026-01-14T19:47:43Z

R0940561: /* Examenvraghttps://wiki.chemika.be/index.php?title=Chemika_Examenwiki:Privacybeleiden */

[[Categorie: Mabb]]

== Vakinformatie ==
Molecular Interactions between fungi and their hosts

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0B98AE.htm

== Examenvragen ==

=== 14 januari 2026 ===
#What processes are involved in C. albicans contact in oral epithelial cells? What virulence mechanisms does C. albicans use? How does the epithelial cells react? What are the main differences between immuno-competent and immuno-compromised patients? (5p)
#What are the virulence factors of Mucorales? What type of antifungal drug would you consider? (3p)
#What is the appressorium? Which pathways influence it? (4p)
#Als3 is an important factor in virulence of Candida albicans, what type of molecule is it? Explain the function. (4p)
#What type of molecule is Amphotericin B? How does it work? What are the mechanisms used by Candida auris to become resistant? (4p)

=== 29 augustus 2025 ===
#What processes are involved in C. albicans contact in oral epithelial cells? What virulence mechanisms does C. albicans use? How does the epithelial cells react? What are the main differences between immunu-competent and immuno-compromised patients?
#What is collateral sensitivity? How is it found in C. auris and give the mechanisms used to find it? How can it be used to combat C. auris?
#What is an appressorium? Give signal transduction or metabolic pathway mechanisms.
#What are the advantages of arbuscular mycorrhiza in plants? What are the molecular mechanisms? Is the fungi rewarded? What is the difference with a haustorium?

=== 15 januari 2025 ===
#Biofilm formation in Candida albicans (stages + mechanism). What in vitro and in vivo model did we see to study biofilm formation? (4)
#SA (4)
#White-opaque switching virulence. What? Regulation? What can be the biological reason? (4)
#Histoplasma capsulatum (3)
#Explain Avr-R system with Cladosporium fulvum - tomato as an example + link with the zigzag-model. How will you use this knowledge to make corn resistant to the disease Fusarium.(5)

=== 19 januari 2022 VM ===
#How can you easily distinguish between Ascomycetes and Basidiomycetes. Give the model organisms of plant and animal pathogens for both of these groups. (3 points)
#Cryptococcus neoformans. What is it? Describe the virulence factors. How does the host respond to such an invasion? How does Cryptococcus deal with this host defense response? What are the diseases that you can get from such an infection? (4 points)
#The role of high amounts of CO2 on morphogenesis in C. albicans. Describe the underlying signal transduction pathways. (3 points)
#Arbuscular mycorrhiza and haustoria. Describe the underlying molecular mechanisms behind exchange of carbon and nutrients for both. How can you investigate this? What is the functional difference between the two? (4 points)
#A synergestisch biofilmformation effect is observed both in vivo and in vitro for C. albicans and S. aureus. Several genes have been identified that are either upregulated or downregulated in C. albicans during this synergestic relationship that are not found when C. albicans is grown alone. How would you investigate these genes? Describe all the steps and the used techniques. Also give a possible animal model system in which you can investigate this. Which genes would be good targets for antifungal drug resistance? (6 points)

=== 29 januari 2020 VM===
#Explain how extracellular pH regulates morphogenesis in ''Candida albicans''.
#Discuss the origin and role of elicitors.
#Discuss the biosynthesis and role of phytoalexins.
#Explain the initial response of human epithelial cells upon encountering hyphal ''Candida albicans'' cells. What happens afterwards in immunocompetent people?
#In a recent screen, the lab has isolated a transcription factor in ''Candida glabrata'' that is overexpressed when cultured on RPMI medium at an atmospheric pressure of 5% CO2, and is not overexpressed when cells are grown in air. How are you going to investigate its potential role in virulence? What techniques and assays will you use and which steps do you do first?

=== 28 januari 2020 VM===
In general, take into account the molecules, proteins and genes involved when studying.
#Explain Avr-R system with Cladosporium fulvum - tomato as an example + link with the zigzag-model
#PR- PR5- Osmotin. Explain
#Types of drugs against fungi. Mechanisms to fight back
#ALS- ALS3. Explanation. All included
#A new genx has been overexpressed in C.glabrata when culturing over oral epithelial cells. What is the next step? What can you learn from this if you want to develop a new antifungal drug?

=== 20 januari 2020 VM===
#White-opaque switching in C. albicans
#Elicitors: role and origin
#Morphogenesis C. albicans: role CO2 and farnesol
#Fluconazole: mechanism en resistance
#RNA sequencing to understand plant-pathogenic interactions. They identified a transcript in M. grisea, highly upregulated 30min after M. grisea sporulation on the plant. What experiments to investigate the upregulated gene in M. grisea after the interaction with a rice plant.

===17 januari 2020 NM===
#Explain appressorium
#Explain SA + give the most important signal transduction pathways
#How can fungi avoid the human immune defense?
#Give the biology + virulence factors of cryptococcus neoformans
#During gene expression analysis of Candida glabrata, a gene was upregulated with low pH. How would you investigate if this gene is involved in virulence, adhesion or biofilm formation? Imagine this is your thesis topic, which type of experiments and which techniques would you use?
===17 januari 2020 VM===
#Where is PAL important, which reaction does in catalyse?
#A. fumigatus is an important human pathogen. What are its virulence factors? Why are healthy people not infected? What is important in basic azole resistance of the pathogen in the environment? (2nd part of the question: agriculture sprays their plants with azoles to prevent fungal infections on their crops. This will in turn cause resistance in the fungi present)
#What are the differences and similarities between ascomycetes and basidiomycetes? What are important plant and human fungal pathogens in both phyla?
#What are Paldoxins and how does it work?
#You used an deletion collection and found a strain with TF X deleted. In vitro it does not produce a biofilm. What is the first thing you do, how will you find its function? Can it be a target for a antifungal drug? what are the criteria for this? What experiments would you still do and what screen will you set up to test for an antifungal drug?

=== 30 januari 2019 VM ===
# Explain opaque-white phenotypic switch in C. Albicans and its relevance in virulence.
#* Bijvraag: de rol van white cellen in biofilm
# Elicitor uitleggen origin and role in plant defence (hij vroeg ook of een compatible interaction een incompatible reaction kan worden --> dus het zigzag model van clostridium tomato als vb)
# PR5 osmotin: How discoverd and role (explain everything)
# Fluconasole working and resistance mechanisms against it (leg alles uit incl. alles van azolen)
#* Bijvraag: Hoe komt het dat fluconasole resistentie vaak voorkomt in ziekenhuizen (antw: biofilm vorming)
# Er is een nieuw gen in C.glabrata ontdekt dat sterk tot expressie komt in anaerobe omstandigheden. How investigating if it plays a role in virulence and what it targets are.

=== 21 januari 2019 ===
#Explain the role of SA in plant defense. Which signalling pathways are important?
#Explain which classes of toxins exist and give an example of which class. Which type of fungi uses this. (He also asked why specific toxins are specific)
#Discuss different ways of fungal immune evasion of the human immune system. Which pathogen uses which strategy?
#Cryptococcus neoformans: biology and virulence factors
#Gene for adhesion in C. glabrata is discovered, how would you investigate its importance in adhesion, virulence, biofilms etc. Which techniques would you use. (He also asked how I would isolate compounds to treat it)

=== 18 januari 2019 ===
# wat is PAL, functie, welke reactie katalyseert het, waarbij is het van belang? welke pathways betrokken?
# wat is een appresorium en betrokken pathways
# ALS zijn belangrijk, wat zijn het? waarin is ALS3 belangrijk? is het een goede target voor antifungale drugs?
# aspergillus fumigatus virulence factors, wat ligt aan basis van resistentie in de natuur tegen azolen?
# TF gevonden die in overexpressie zorgt voor geen vorming van filamenten in C albicans. Hoe zou je verder onderzoeken wat de moleculaire basis is, is het een goede drug target? Hoe design je een screen om een drug te vinden?

=== 31 januari 2018 voormiddag===
#An essential, volatile oil derivative illustrates an antifungal activity in vitro. How would you try to reveal the mode of action of this compound? And how would you validate your results in vitro?
#Explain Aspergillus fumigatus and what happens if this fungus is recognized by the host immune system
#Explain ALS3 and its functions for Candida albicans. Would this compound be an interesting antifungal drug target? How would you investigate this? What research is still necessary?
# Explain the most important signal transduction pathways that occur when a plant succesfully manages to recognize a pathogen.
# Explain Fusicoccin and victorin, what are the differences. Explain their mode of action.
# What are symbiotic interactions? Explain in detail the most important symbiotic interactions.

=== 29 januari 2018 voormiddag===
#Explain Avr-R system with Cladosporium fulvum - tomato as an example + link with the zigzag-model
#What is Victorine? How is its function investigated?
#Explain different types of Mycorrhiza + how they exchange nutrients
#Describe the molecular mechanism of morphogenesis in C. albicans
#What are the major classes of antifungal drugs? Describe mechanism of action and resistance
#Explain the virulence factors of Aspergillus fumigatus? Why are healthy people not infected by A. fumigatus? How would you investigate whether a protein is important in virulence or not? How would you search for a drug against this a protein (if it is involved in virulence)?

=== 21 januari 2018 voormiddag===
#Explain all types of Mycorrhiza
#Explain toxin types and give 1 example of both
#Fully explain SA signalling
#Simmilarities and differences of Histoplasma and Coccidioides
#A new gene in Candida glabrata has been found in gene expression that plays a large roll in biofilms. How would you research this?
#Candida albicans recognition at endothelial cells and immunity

===31 januari 2017 voormiddag===
#histoplasma capsulatum and coccudioides immitis. What have these two pathogens in common? What are the known virulence factors? How can you treat such an infection?
#Explain Immune response against a Candida albicans ephitilial invasion. How would you study this? Can this specific host-pathogen interaction be targeted by compounds? How would you identify these compounds?
#How is morphogenesis regulated in Candida Albicans?
#What are the different types of toxins that a plant uses? Give an example of each and explain their function.
#What is an appressorium? Explain its function.
#Explain how carbon is translocated in plant-mycorrhiza. How would you investigate this?

===30 januari 2017 voormiddag===
#The first technique that was used to delete a gene in C. albicans was the URA-blaster cassette. How does that work. What are the problems with this method (position effect)? What are the currently used methods?
#Biofilm formation by C. albicans is a major problem in hospitals. What are the different stages of biofilm developtment? Which molecules are omportant during biofilm formation? How can this be investigated? What are the available methods to study biofilm formation? What would you do if you were asked to develop a novel antibiofilm molecule?
#What is Cryptococcus neoformans and what are the most important virulence factors?
#Describe the processes that can occur after initial contact between a fungus and a plant. How is the fungus able to penetrate the plant? Discuss the several forms of parasitism and pathogenesis that can occur and gice a schematic overview.
#Discuss the possible outcomes of a host-pathogen interaction, comment on the immune system of the plant and give a schematic overview. What is gene for gene resistance? And how can we exploit this for resistance breeding?

Chemische Thermodynamica

2025-01-21T17:53:11Z

R0940561: /* 21 januari 2025 VM */

[[Categorie:Bachelor Chemie]]
[[Categorie:Bachelor Biochemie]]

==Vakinformatie==
Zowel gevolgd door chemie als biochemie, tegenwoordig in het derde jaar voor biochemie en tweede jaar chemie. Een 'mondeling' examen met schriftelijke voorbereiding. In theorie want in praktijk verloopt het examen zonder veel woorden. De examenstructuur is altijd dezelfde: 3 theorievragen en 2 oefeningen, waarvan één altijd gaat over entropieverandering. Sinds 2012-2013 komt één van de theorievragen uit één van de artikels die je vooraf moest lezen, enkel deze vraag wordt mondeling besproken.
Het vak wordt gedoceerd door professor Thierry Verbiest.

'''Alle vragen van het einde van elk hoofdstuk (Elisabeth I.):'''
https://drive.google.com/file/d/1J_23Lh2eyP2lzxUNz9JKv4si8D7028PJ/view?usp=sharing

==Examenvragen==
===21 januari 2025 VM===
#OPDRACHT: de vuurpomp
#*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).
#*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?
#*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom.
#*Bijvragen: reversibel en irreversibel proces, waarom Cv gebruiken, W hoger voor isotherm of adiabatische processen, ΔS.
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅𝑑 = 0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. #*Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk. Leg kort uit.
#Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord.
#*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.
#*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenene.
#*De elektrochemische potentiaal is hetzelfde als de chemische potentiaal.
#Oefening 1: Een ideaal gas wordt bij 27°C isotherm geëxpandeerd van 3 atm tot 1 atm. Bepaal q, W, ΔU, ΔH, ΔSsys en ΔSomg indien dit:
#* reversibel gebeurt
#* gebeurt bij een constante tegendruk van 1atm
#Oefening 2: je hebt een moedercel met straal 1 µm dat zich opsplitst in 2 gelijke dochtercellen. Het totaal volume blijft gelijk, maar de oppervlakte wordt groter. Wat is de arbeid die hiervoor verricht moet worden als je weet dat de oppervlaktespanning 3.12*10^(-3) N/m is?

===20 januari 2025 NM===
#OPDRACHT: de vuurpomp
#*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).
#*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?
#*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom.
#*Bijvragen: reversibel en irreversibel proces, waarom Cv gebruiken, W hoger voor isotherm of adiabatische processen, ΔS.
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅𝑑 = 0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. #*Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk. Leg kort uit.
#Beschouw een mengsel (of oplossing) van vloeistof A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.
#Waar of niet waar? Motiveer kort je antwoord.
#*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij.
#*Schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.
#*Surfactanten verhogen de oppervlaktespanning.
#*Schaatsenrijders (een insect) kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.
#Oefening 1: Bereken de molaire massa van creatine gegeven dat de osmotische druk van je 0.1g/l creatine-oplossing 13 torr bedroeg in vergelijking met water bij 25°C.
#Oefening 2: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar.
#*Bereken interne energie, warmte en arbeid
#*Bereken entropie van het systeem
#*Bereken Gibbs vrije energie

===20 januari 2025 VM===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅𝑑 = 0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen.
#*Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk. Leg kort uit.
#Bespreek luchtvochtigheid en het verschil tussen droge bol en natte bol temperatuur.
#Waar of niet waar? Motiveer kort je antwoord.
#*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij.
#*Schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.
#*Surfactanten verhogen de oppervlaktespanning.
#*Schaatsenrijders (een insect) kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.
#Oefening 1: Bereken de molaire massa van creatine gegeven dat de osmotische druk van je 0.1g/l creatine-oplossing 13 torr bedroeg in vergelijking met water bij 25°C.
#Oefening 2: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar.
#*Bereken interne energie, warmte en arbeid
#*Bereken entropie van het systeem
#*Bereken Gibbs vrije energie

===13 januari 2025 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#isotherme processen
#*leidt een uitdrukking af voor arbeid en warmte bij een reversibel en irreversibel isotherm proces
#*Bewijs dat dH en dU gelijk zijn aan 0 voor een isotherm proces bij ideale gassen. Motiveer je antwoord.
#*Leg uit waarom de geleverde arbeid bij een reversibel isotherm proces groter is dan bij een reversibel adiabatisch proces.
#Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding
#Micelvorming: leg uit hoe je ΔG°, ΔH°,ΔS° kan bepalen als je de kritische micelconcentratie kent. Leidt de relevante formules af.
#Oefening 1: Wat is de reactie enthalpie van een reactie waarbij de evenwichtsconstante verdubbelt als de temperatuur verhoogd wordt met 15 K bij een temperatuur van 310 K?
#Oefening 2: tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.
#* Wat is de vormingsenthalpie
#* Wat is de normale kooktemperatuur
#* Wat is de druk in het tripelpunt

===10 januari 2025 NM===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Uit de wiskunde weten we dat een differentiaal 𝑑𝑓 = 𝑎(𝑥,𝑦)𝑑𝑥 + 𝑏(𝑥,𝑦)𝑑𝑦 exact is als (𝜕𝑎/𝜕𝑦)𝑥=(𝜕𝑏/𝜕𝑥)𝑦. In de thermodynamica zou 𝑓 dan een toestandsfunctie zijn. Toon aan voor een mono-atomisch ideaal gas dat dq geen exacte differentiaal is, maar dat dq/T dat wel is. Maak gebruik van bovenstaande definitie van een exacte differentiaal en dq = dU - dW = CVdT + pdV
#Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding
#Carnot cyclus
#Een waterdruppel met diameter 20mm wordt opgesplitst in 1000 gelijke kleine waterdruppeltjes. Bereken de arbeid die hiervoor nodig is. De oppervlaktespanning van water is 0,072N/m, het volume van een bol is (4/3)πr^3 en het oppervlak van een bol is 4πr^2.
#Tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.
#* Wat is de vormingsenthalpie
#* Wat is de normale kooktemperatuur
#* Wat is de druk in het tripelpunt

=== 10 januari 2025 VM ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Uit de wiskunde weten we dat een differentiaal 𝑑𝑓 = 𝑎(𝑥,𝑦)𝑑𝑥 + 𝑏(𝑥,𝑦)𝑑𝑦 exact is als (𝜕𝑎/𝜕𝑦)𝑥=(𝜕𝑏/𝜕𝑥)𝑦. In de thermodynamica zou 𝑓 dan een toestandsfunctie zijn. Toon aan voor een mono-atomisch ideaal gas dat dq geen exacte differentiaal is, maar dat dq/T dat wel is. Maak gebruik van bovenstaande definitie van een exacte differentiaal en dq = dU - dW = CVdT + pdV
#Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Een waterdruppel met diameter 20mm wordt opgesplitst in 1000 gelijke kleine waterdruppeltjes. Bereken de arbeid die hiervoor nodig is. De oppervlaktespanning van water is 0,072N/m, het volume van een bol is (4/3)πr^3 en het oppervlak van een bol is 4πr^2.
#Een ideaal gas wordt bij 37°C isotherm geëxpandeerd van 3 atm tot 1 atm. Bepaal q, W, ΔU, ΔH, ΔSsys en ΔSomg indien dit:
#* reversibel gebeurt
#* gebeurt bij een constante tegendruk van 1atm

=== 6 september 2024 ===
#OPDRACHT: vuurpomp
#*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).
#*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?
#*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom
#*Bijvragen
#**Wat is reversibel en irreversibel?
#**Waarom mag je Cv gebruiken? (Het volume is namelijk niet constant bij een compressie)
#**Hoe zou je in beide gevallen (reversibel, irreversibel) de entropie berekenen?
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord
#*De variantie in het tripelpunt van een zuivere stof is nul.
#*Het T,x-diagram van een ideaal mengsel kan nooit een azeotroop vertonen.
#*Beschouw een vloeibaar mengsel van A en B. De samenstelling van de vloeistof is hierbij steeds gelijk aan de samenstelling van dampfase.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord.
#*De evenwichtsconstante is dimensieloos.
#* ΔG en ΔG° zijn constanten.
#*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord.
#*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.
#*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenene.
#*De elektrochemische potentiaal is hetzelfde als de chemische potentiaal.
#Oefening 1: isotherme expansie van 3 atm naar 1 atm bij een temperatuur van 37°C. Geef de entropie van de omgeving en van het systeem in volgende gevallen:
#*Reversibele expansie
#*Irreversibel tegen een uitwendige druk van 1 atm
#Oefening 2: je hebt een moedercel met straal 1 µm dat zich opsplitst in 2 gelijke dochtercellen. Het totaal volume blijft gelijk, maar de oppervlakte wordt groter. Wat is de arbeid die hiervoor verricht moet worden als je weet dat de oppervlaktespanning 3.12*10^(-3) N/m is?

=== 16 februari 2024 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#*Bijvragen over de CMC en surfactanten, 2e hoofdwet van thermodynamica & het verband met Gibbs
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord.
#*De evenwichtsconstante is dimensieloos.
#* ΔG en ΔG° zijn constanten.
#*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord. (3)

#Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar.
#*Bereken U, q en W
#*Bereken ∆S(systeem)
#*Bereken ∆G
#Oefening: Het verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte

=== 1 februari 2024 NM ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#*Bijvragen over de CMC en surfactanten, 2e hoofdwet van thermodynamica & het verband met gibbs, stabiliteitscurve proteinen, methanol vs water
#Isotherme processen
#*Leid een uitdrukking af voor arbeid en warmte bij een reversibel en irreversibel isotherm proces.
#*Bewijs dat dU en dH gelijk zijn aan nul voor een isotherm proces bij ideale gassen.
#*Leg uit waarom de geleverde arbeid bij een reversibel isotherm proces groter is dan bij een reversibel adiabatisch proces.
#Micelvorming: leg uit hoe je ∆G°, ∆H° en ∆S° kan bepalen als je de kritische micelconcentratie kent. Leid de relevante formules af.
#Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal mbv de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Oefening 1: Wat is de reactie enthalpie van een reactie waarbij de evenwichtsconstante verdubbelt als de temperatuur verhoogd wordt met 15 K bij een temperatuur van 310 K?
#Oefening 2: Tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.
#* Wat is de vormingsenthalpie
#* Wat is de normale kooktemperatuur
#* Wat is de druk in het tripelpunt

=== 23 januari 2024 NM ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
Bijvragen over de CMC, opbouw micellen en amfifiele moleculen, wat is de 2e hoofdwet van thermodynamica & het verband met gibbs...
# Carnot cyclus en omgekeerde Carnot cyclus
#*Toon aan dat DU = 0 en DS = 0 voor de Carnot cyclus.
#*Teken de Carnot cyclus in een T-S diagramma.
#*Wanneer is het rendement van een warmtepomp het hoogst?In de winter of in
de zomer? Verklaar je antwoord.
#Waar of niet waar? Verklaar kort je antwoord.
#*Bij een expansie van een ideaal gas in vacuüm is dU steeds gelijk aan nul.
#*Het volume is een exacte differentiaal.
#*Dichtheid is een extensieve grootheid.
#*Bij een isotherm proces is dW = 0.
#Micelvorming: leg uit hoe je ∆G°, ∆H° en ∆S° kan bepalen als je de kritische
micelconcentratie kent. Leid de relevante formules af.
#Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar.
#*Bereken U, q en W
#*Bereken ∆S(systeem)
#*Bereken ∆G
#Oefening: Tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.
#* Wat is de vormingsenthalpie
#* Wat is de normale kooktemperatuur
#* Wat is de druk in het tripelpunt

=== 23 januari 2024 VM ===
Exact de zelfde vragen als 12 januari 2024

=== 15 januari 2024 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
Bijvragen over de CMC, opbouw micellen en amfifiele moleculen, wat is de 2e hoofdwet van thermodynamica & het verband met gibbs...
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.
#Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Waar of niet waar?
#*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij
#*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.
#*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning
#*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.
#Oefening: Bereken de molaire massa van creatine gegeven dat de osmotische druk van je 0.1g/l creatine-oplossing 13 torr bedroeg in vergelijking met water bij 25°C.
#Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar.
#*Bereken U, q en W
#*Bereken ΔS(systeem)
#*Bereken ΔG

=== 12 januari 2024 ===
#OPDRACHT: vuurpomp
#*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).
#*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?
#*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom
#*Bijvragen komen letterlijk uit de vragen dat je moet leren voor hoofdstuk 3 (enige dat ik daar verschillend van had: wat gebeurt er als je bij een reversibel proces iets klein aanpast zoals het teken van uw volumeverandering aanpassen compressie <-> expansie)
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.
#Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Waar of niet waar? Motiveer kort je antwoord.
#*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.
#*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenene.
#*De elektrochemische potentiaal is hetzelfde als de chemische potentiaal.
#oefening 1: isotherme expansie van 3 atm naar 1 atm bij een temperatuur van 37°C. Geef de entropie van de omgeving en van het systeem in volgende gevallen:
#*Reversibele expansie
#*Irreversibel tegen een uitwendige druk van 1 atm
#oefening 2: je hebt een moedercel met straal 1 µm dat zich opsplitst in 2 gelijke dochtercellen. Het totaal volume blijft gelijk, maar de oppervlakte wordt groter. Wat is de arbeid die hiervoor verricht moet worden als je weet dat de oppervlaktespanning (iets in die aard) 1.26*10^(-)2 N/m is?

=== 28 augustus 2023 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord
#*De evenwichtsconstante is dimensieloos
#*Delta G en delta G° zijn constanten
#*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling
#Beschouw een mengsel van vloeistof A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.
#Oppervlaktespanning
#*Waarom is de druk binnen in een vloeistofdruppel steeds hoger dan erbuiten?
#*Waarom heeft hexaan een lagere oppervlaktespanning dan water?
#*Waarom gebruiken we de Helmholtz functie om de Young-Laplace vergelijking af te leiden en niet de Gibbs functie?
#Oefening 1: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte
#Oefening 2: 0.133 mol van een ideaal gas wordt bij een initiële druk van 5 bar isotherm en reversibel geëxpandeerd van 3 liter tot 10 liter.
#*Wat is de inwendige energie, de arbeid en de warmte?
#*Wat is de entropieverandering van het systeem?
#*Geef de gibbsfunctie.

=== 1 februari 2023 ===
#OPDRACHT: vuurpomp
#*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).
#*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?
#*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom.
#Toon aan met een afleiding (begin met vorderingsgraad) dat 𝑅𝑇 ln(𝐾p) = −∆𝐺̅°.
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagram en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅d = 0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk. Leg kort uit.
#Beschouw een mengsel (of oplossing) van vloeistoffen A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.
#OEFENING 1: Isotherme compressie van een ideaal gas van 3 atm tot 1 atm bij 27°C. Bereken ∆S(systeem) en ∆S(omgeving) in het reversibele geval en ook bij constante externe druk van 1 atm.
#OEFENING 2: Een druppel water (bol met straal 10 mm) wordt gesplitst in 1000 equivalente kleinere druppels (ook bollen) waarbij het totaalvolume niet verandert. Bereken de arbeid die hiervoor nodig is. Gegeven formules voor volume en oppervlakte bol, oppervlaktespanning water (73 N/m).

=== 16 januari 2023 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord
#*De evenwichtsconstante is dimensieloos
#*Delta G en delta G° zijn constanten
#*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling
#Schets fasediagramma van 2 stoffen A en B die slecht mengbaar zijn in vaste fase en goed mengbaar in vloeistoffase. Gibbs faseregel + leg uit
#OEFENING 1: berekenen U, q, W, G, S, H
#OEFENING 2: iets van een moedercel die splitst in 2 dochtercellen waarbij het volume gedeeld wordt door 2 maar de oppervlakte wel veranderd. Berekenen hoeveel arbeid er nodig is om dit proces te laten plaatsvinden (dus oppervlaktespanning doorbreken). Diameter moedercel, oppervlaktespanning, formule opp. en volume bol gegeven.

=== 1 september 2022 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord
#*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.
#*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenen.
#*De eenheid van ionische activiteit is mol/kg.
#Leid een uitdrukking af voor de Laplace druk. Verklaar elke stap in je afleiding
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord
#*De variantie in het tripelpunt van een zuivere stof is nul.
#*Het T,x-diagram van een ideaal mengsel kan nooit een azeotroop vertonen.
#*Beschouw een vloeibaar mengsel van A en B. De samenstelling van de vloeistof is hierbij steeds gelijk aan de samenstelling van dampfase.
#Oefening: isotherme en reversibele expansie. Berekenen van warmte, arbeid, inwendige energie, entropie van het systeem en gibbs functie
#Oefening: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte

=== 25 augustus 2022 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord
#*De evenwichtsconstante is dimensieloos
#*Delta G en delta G° zijn constanten
#*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling
#Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Beschouw een mengsel van vloeistof A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.
#Oefening: isotherme en reversibele expansie. Berekenen van warmte, arbeid, inwendige energie, entropie van het systeem en gibbs functie
#Oefening: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte

=== 17 januari 2022 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅d = 0?
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk? Leg kort uit.
#
#Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.
#
#Leid een formule af die aantoont dat een opgeloste stof die de oppervlaktespanning van een oplossing verlaagt, de neiging zal hebben zich op te stapelen aan het oppervlak. Verklaar elke stap in je afleiding.
#
#Oefening 1: Wat is de reactie enthalpie van een reactie waarbij de evenwichtsconstante verdubbelt als de temperatuur verhoogd wordt met 15 K bij een temperatuur van 310 K?
#
#Oefening 2: 0.133 mol van een ideaal gas wordt bij een initiële druk van 5 bar isotherm en reversibel geëxpandeerd van 3 liter tot 10 liter.
#*Wat is de inwendige energie, de arbeid en de warmte?
#*Wat is de entropieverandering van het systeem?
#*Geef de gibbsfunctie.

=== 31 augustus 2021 ===
#Vuurpomp afleiding geven voor T en V
#
#Gibbs functie bij mengsels
#*Toon aan dat gibbs ook een alternatieve vorm is voor de 2de hoofdwet
#*Temperatuur- en drukafhankelijkheid van Gibbs functie.
#
#Waar of niet waar?
#*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij
#*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.
#*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning
#*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.

#Proteine stabiliteit en fasediagram geven en alles uitleggen + de afleidingen van dG folded en unfolded!
#Oefening1: Druk p is gegeven (zo niet kan je gwn pV=nRT stellen) enbij verwaeming is T1= 310 K en T2=325 K, tijdens die verwarming zal de evenwichtsconstante K veranderen tot 2.K (verdubbelen) gaan, wat is de standaard enthalpie?
#Oefening2: gegeven is V1 = 3 L en V2= 10L met druk p=5bar en aantal mol stof = 0.133 mol, geheel is temperatuur onafhankelijk.
#*Geef U, W en q voor als het proces isotherm reversibel expandeert
#*Geef de entropie verandering van het systeem
#*Geef de gibbs functie voor deze situatie

=== 27 januari 2021 ===
#Artikel over proteïne: leg hydrofoob effect uit en waarom vouwing entropisch gedreven is
#Adiabatische processen
#* toon aan dat P1V1^(y)=P2V2^(y) voor een adiabatisch proces
#* toon aan dat de arbeid bij een adiabatisch proces gegeven wordt door W= (Pfin*Vfin-Pinit*Vinit)/(y-1) en dat deze uitdrukking equivalent is met W=Cv(Tfin-Tinit)
#* leg uit waarom we Cv mogen gebruiken in W=Cv(Tfin-Tinit) terwijl het volume niet constant blijft.
# Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal.
# Waar of niet waar?
#* Vergroten van een oppervlak zet energie vrij
#*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.
#*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning
#*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.
#Oef: bereken verschil in entropie van het systeem. gegeven T1, P1 en T2, P2 en Cr (molaire)
#Oef: gegeven: temperatuur tripelpunt, 2 punten (P,T) van naftaleen
#*bereken delta H
#*bereken normaal kookpunt naftaleen
#*bereken P van tripelpunt

=== 11 januari 2021 ===
#Artikel over proteïne: leg hydrofoob effect uit en waarom vouwing entropisch gedreven is
#Osmose
#La place druk
#Joule -thompson coefficient aantonen dat die 0 is voor ideale gassen
#*bewijs isobare coefficient voor thermische expansie is 1/T voor ideaal gas
#* bewijs isotherme compressibiliteit is 1/p voor ideaal gas
#* Is joule thompsoncoefficient positief of negatief bij een expansieproces dat resulteert in koelen
#oef: w, q, Ssyst, Somg,U en H berekenen bij isotherm proces
#* bij reversibel proces
#*bij Pex van 1 atm
#oef: tripelpunt, kritisch punt, normaal kookpunt en smeltpunt gegeven
#* schets een fasediagram (P,T) hiervan
#* kan je O2 smelten als je de druk verhoogt?
#* bereken Hvap

===31 januari 2020===
# Artikel over proteïne: Welke interacties spelen een rol bij de opvouwing van een bêta-hairpin? Hoe dragen deze interacties bij aan de enthalpieverandering van het opvouwingsproces? Gebruik tabel 1.
# Oef: bereken q, W, U. Bereken entropie en Gibbs energie.
# Oef: bereken verandering van entropie.
# Temperatuur- en drukafhankelijkheid van Gibbs functie.
# chemische potentiaal bij osmose afleiden. Hoe kan dit gebruikt worden om de molecuulmassa van polymeren te weten?

===17 januari 2020 VM===
# Wat is CMC en geef de verandering in enthalpie bij micelvorming.
# Oef: opwarming van een gas tegen constante druk (Cp gegeven). Bereken warmte, verandering in U en H.
# Oef: bereken de verandering in entropie bij opwarming.
# chemische potentiaal bij osmose afleiden. Hoe kan dit gebruikt worden om de molecuulmassa van polymeren te weten?
# klassieke nucleatietheorie
===13 januari 2020 NM===
# Vuurpomp
# Oef: P2 en deltaG berekenen
# Oef: deltaS berekenen
# Chemische potentiaal voor zuivere vloeistof en voor mengsel geven. Wet van Raoult en Henry bespreken met een grafiek.
# Membraanpotentiaal en Donnanpotentiaal. Bespreek het verschil.

===13 januari 2020 VM===
# Vuurpomp
# Oef: bereken q S en H bij isotherm
# Oef: bereken q, U en G bij isobaar opwarmen gas
# Schets fasediagramma van 2 stoffen A en B die slecht mengbaar zijn in vaste fase en goed mengbaar in vloeistoffase. Gibbs faseregel + leg uit
# mengsel ideale oplossing formules afleiden + wet van Raoult (grafiek)
===25 januari 2019 NM===
# Vuurpomp
# Oef: dSsyst berekenen bij water gaat van ijs naar vlo (een oef uit oefenzitting 3 met ijs)
# Oef: H U q berekenen bij gegeven T1 T2 p1 en Cp
# Bespreek chemisch pot van mengsel ideale gassen en ideale vlo
# Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom dat oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.

===18 januari 2019 NM===
Zelfde als voormiddag, maar carnot cyclus vervangen door proteïne denaturatie + stabiliteitscurve
===18 januari 2019 VM===
# Artikel over proteïne
# Oefening: Kp gegeven bij twee temperaturen. Bereken delta G, H en S.
# Oefening: 2 mol gas ondergaat isotherme compressie. T, p1 en delta S gegeven. Bereken einddruk en delta G.
# Bespreek carnot cyclus (teken p-V diagram, bereken voor elke stap W, q, U en entropie verandering, toon aan dat U en S voor de hele reactie gelijk aan 0 zijn, bereken efficiëntie)
# Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom dat oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.

===14 januari 2019 NM===
# Vuurpomp
# Oefening over een monoatomisch gas dat isotherm wordt samengedrukt, waardoor de entropie daalt.
#* Wat is de einddruk?
#* Wat is de delta G?
# Oefening over mengsels (zoals gezien in de les). Moleculaire massas en dichtheden gegeven.
#* Hoeveel volume water en methanol moet men mengen om een bepaalde samenstelling te krijgen
# Toon aan dat de entropie gelijk is aan 0 voor een reversibel proces bij fasetransities (bv smelten). Toon ook aan dat dit verschillend is van 0 voor een irreversibel proces
# Leid de formule van Clapeyron af en toon dit aan voor smelten en verdampen

===14 januari 2019 VM===
#Vuurpomp
#Oefening over een ideaal gas dat reversibel isotherm wordt geëxpandeerd. T, V1, V2 gegeven. Bereken deltaH, deltaU, deltaG, deltaA, q en W.
#Oefening over een ideaal gas dat isotherm wordt geëxpandeerd. Bereken deltaS van universum, systeem en omgeving in reversibele en irreversibele omstandigheden. V1, V2 en temperatuur gegeven. Voor irreversibele voorwaarden bij een constante externe druk van 0.1 atm.
#Colligatieve eigenschappen
#*Uitleggen en grafiek geven, wat doet de opgeloste stof met het chemisch potentiaal van de vloeistof?
#*Bespreek kookpuntsverhoging
#*Bespreek osmose
#Mengsels van vloeistoffen
#*Leidt een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van mengsels van ideale oplossingen
#*Hoe zit dit voor reële vloeistoffen? (+grafiek)

===1 februari 2018===
#vuurpomp
#vraag over donnanpotentiaal
#vraag over mengsels

===26 januari 2018===
#Proteinevouwing
#Carnot cyclus
#Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom da oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.
#entropie oef
#verdampingsenthalpie, kookpunt, verdampingsentropie en ebullioscopische cte.

=== 19 januari 2018 ===

#Vuurpomp uitleggen
# 1 mol gas word isotherm ontspannen, bepaal q, W, delta U, entropie van omgeving en systeem voor een reversibel en irreversibel geval
# gas wordt opgewarmd, bepaal molaire entropie verandering
# chemische potentiaal van vloeistoffen: ideale en reële mengsels, wet van Raoult en wet van Henry
# denaturatie van proteïnen: formule voor delta G in functie van temperatuur afleiden, curve schetsen en grondig bespreken

=== 19 januari 2018===
# Vuurpomp
# 1 mol ideaal gas: expansie van 20L tot 200L bij 300K. Gevraagd: entropieverandering van systeem, omgeving en universum voor:
#* a. Reversibel
#* b. Irreversibel bij 0.1 atm buitendruk
# Gevraagd: de verandering in molaire entropie bij verwarming van stikstofgas van 25°C tot 1000°C bij constante druk. ( Gegeven: Cp = 26.9835 + 5.9622*10(^-3) T – 377*10(^-7) T(^2) )
# Beschouw de reactie 3A+2B <=> C+2D.
#* Leid het verband van de standaard Gibbsfunctie en de evenwichtsconstante af. En wat met reële gassen? (1.5p)
#* Toon de drukonafhankelijkheid aan (1p)
#* Toon de temperatuursafhankelijkheid aan (1.5p)
# Beschouw F(folded) <=> U(unfolded).
#* Leid deltaG in functie van de temperatuur af (1.5p)
#* schets de stabiliteitscurve en bespreek gronding (2.5p)

=== 15 januari 2018 ===

# Vuurpomp uitleggen
# Oefening op entropie met isotherme compressie ---> bepaal einddruk en delta G
# Oefening partieel molaire volumes
# Entropie voor fasetransities afleiden
# Clausius-Clapeyronvgl. afleiden en toepassen voor smelten en verdampen

=== 3 februari 2017 NM ===

# Artikel over proteïne (4 ptn): Welke interacties spelen een rol bij de opvouwing van een bêta-hairpin? Hoe dragen deze interacties bij aan de enthalpieverandering van het opvouwingsproces? Gebruik tabel 1. (gegeven)
#*Bijvragen: hij heeft een klokcurve op zijn blad getekend: hoe beïnvloed Cp de curve? (breder). Draagt water meer bij aan de opvouwing van de hairpin dan methanol? De opvouwing van de hydrofobe zijketens, hoe noemen we dit effect? (hij doelt op hydrofoob effect).
# Oefening (2 ptn): gegeven: 1 mol, temperatuur 767°C verhogen naar 1027°C, druk gaat van 1 atm naar 6 atm, molaire Cv = 3/2 R. Bereken de enthalpieverandering en de entropieverandering.
# Oefening (2 ptn): gegeven: 3 mol, temperatuur 27°C, de reactie is isotherm, druk gaat van 1 atm naar 5 atm. Bereken de verandering in vrije energie.
# Carnot-cyclus:
#* Teken het p-V en S-T diagram. (1,5 ptn)
#* Bereken voor elke stap w, q, U en entropieverandering. (1,5 ptn)
#* Toon aan dat de totale U en totale entropieverandering nul is. (1ptn)
# Chemisch potentiaal mengsels (gas en vloeistof)
#* Bespreek de verandering in Gibbs en entropie bij het mengen van ideale gassen. (1,6 ptn)
#* Doe dit ook voor ideale vloeistoffen. (1,2 ptn)
#* Kan je hetzelfde besluiten voor vloeistoffen en gassen? Bespreek dit. (1,2 ptn)

=== 27 januari 2017 NM ===

# Artikel over proteïne
# Oefening tripelpunt en kooktemperatuur
# Oefening entropie berkenen
# Chemisch potentiaal mengsel vloeistoffen, uitdrukking G en aantonen dat het entropie gedreven is
# Kinetisch gasmodel en fotongas

=== 27 januari 2017 VM ===

# Artikel over proteïnen
# Geef q, U en W voor volgende processen met ideale gassen
#* isotherme expansie in vacuum
#* adiabatische expansie in vacuum
#* isotherme expansie tegen constante druk
#* adiabatische expansie tegen constante druk
#* reversibele isotherme expansie
#* reversibele adiabatische expansie
#* isochoor proces (weet niet meer exact)
# Chemische potentiaal kort uitleggen, geef afleiding metaal/metaalion electrode
# Oefening triplepunt en kooktemperatuur
# Oefening entropie berekening

=== 20 januari 2017 NM ===

#Vuurpomp vertrekkende van de eerste hoofdwet van de thermodynamica
#entropie (van systeem, universum en omgeving) als je een gas opwarmt van 768 tot 1028 K en samendrukt door het veranderen van de druk van 1 atm tot 6 atm. je mocht dit beschouwen als een reversibel proces. Wat is de entropie?
#een mol gas (argon) ontspant zich bij 273K adiabatisch van 1L naar 10L, wat is de eindtemperatuur? gebruik voor warmtecapaciteit C(v)= 3/2R
#leidt een formule af voor chemische potentiaal bij het mengen van twee stoffen. leidt dan ook de gibbsfunctie af en toon aan dat dit entropisch gedreven is.
#Toon aan dat stoffen aan de oppervlakte van een stof de oppervlaktespanning doen dalen. Leidt de formule van Young-Laplace af.

=== 16 januari 2017 VM ===
#Werking van de vuurpomp beschrijven m.b.v. de eerste hoofdwet van de thermodynamica.
#Bereken een reactie-enthalpie bij 1000K (de reactie en de reactie-enthalpie bij 298K is gegeven).
#Een gas bij 25°C wordt verwarmd bij constante druk tot het verdubbeld is in volume. Bereken de verandering in enthalpie, entropie en vrije energie.
#Mengen van ideale gassen, formule afleiden. (en nog dingen maar die ben ik vergeten omda ik ze nie kon :'( )
#Leid de Clapeyron af en pas toe op Vast-Vloeistof en Vloeistof-Damp.

=== 22 januari 2016 NM ===
#vuurpomp
#colligatieve eigenschappen, kookpuntsverhoging, osmose
#clapeyron afleiden en toepassen op smelten en verdampen
#entropie (sys, omg, univ) berekenen reversibel, irreversibel en enthalpie van systeem berekenen met T1, T2, Cp gegeven
#entropie, enthalpie en inwendige energie berekenen waarbij een systeem verwarmd word tot het volume verdubbelt is met P constant en Ti, P en n gegeven

=== 15 januari 2016 (VM) ===
#Het artikel over het vouwen van eiwitten bespreken.
#De dampspanning van een zuivere stof op twee verschillende temperaturen krijg je. Bereken de verdampingsenthalpie, ebullioscopische constante (molaire massa gegeven.), de temperatuur waarop de vloeistof verdampt en de entropie van dit proces.
#Een (zeer eenvoudige) oefening waarin de entropie moet berekend worden van een expansie.
#Bespreek de carnot cyclus.
#De laplace vergelijking uitleggen en verklaren waarom stoffen die aan het oppervlakte opstapelen de oppervlaktespanning verlagen.

=== 11 januari 2016 NM ===
Hetzelfde als 11 januari VM

=== 11 januari 2016 VM ===
#vuurpomp (opdracht)
#tripelpunt oefening: gegeven temperatuur bij tripelpunt, Pvap(T1), Pvap(T2) te berekenen enthalpie(vap), kooktemp. bij normaaldruk en druk op tripelpunt.
#entropie en enthalpie bij reversibel en irreversibel oefening: gegeven T1, T2, Cp
#colligatieve eigenschappen bespreken (wat is het + invloed van de opgeloste stof op de chemische potentiaal van de vloeistof) en kookpuntsverhoging en osmose
#elektrochemische potentiaal en metaal/metaalionelectrode + Nernstvergelijking (kort) afleiden + (heel kort) bespreken hoe enthalpie en entropie bepaald kan worden uit elektrochemie

=== 12 januari 2015 (NM) ===

# 1. Dat vuur pomp stuff.
# 2. Bereken tripel punt shit.
# 3. Wat met entropie spelen n stuff.
# 4. Een of ander carnot cyclus... komt dat iemand bekend voor?
# 5. Wat shit met oppervlakte spanning en Young en een van zijn Franse maatjes afleiden

=== 17 januari 2014 ===

# vraag over enthalpie bij peptide vouwen, vraag 1 van da document
# Oefening om enthalpie te bereken bij 1000K terwijl de enthalpie is gegeven bij 298K van een reactievgl
# Entropie berekening voor irreversibel en reversibel proces
# leidt de formule van de oppervlaktespanning af, bewijs dat stoffen die de oppervlaktespanning verlagen de nijging hebben om zich aan de oppervlakte op te stapelen, Leidt de vergelijking van Young-dupre af
# leg te elektrochemische potentiaal uit( gewoon de vergelijking uitleggen), leg membraanpotentiaal uit, leg metaal/metaan-ion elektrode uit

=== 28 januari 2013 ===

# Bespreek de electrochemische potentiaal en pas dit toe op een metaal/metaalionelektrode.
# Toon aan dat een adiabatische expansie kan leiden tot mistvorming in een erlenmeyer (artikel).
# Oefening: bepaling van de molaire entropieverandering bij verwarmen en compresseren. Warmtecapaciteit bij constant volume is geggeven.
# Oefening: bereken delta H bij 1000 K van de reactie: CO + H2O -> CO2 + H2. delta H bij 298 K is gegeven, als ook de Cp's van de stoffen.

=== 25 januari 2013 ===

# bewijs: bij adiabatisch proces is p1V1^(lambda)=p2V2^(lambda)
# bespreek de rol van enthalpie en entropie bij het hydrofoob effect
# bepaling van de tempperatuursverandering bij adiabatische compressie (begin- en einddruk, begintemp gegeven)
# bepaling van delta U en delta H bij een opwarming bij constante druk (cv, massa, molaire massa en begin- en eindtemp gegeven)

=== 18 januari 2013 ===

# Toon aan dat de gemiddelde kinetische energie van een mol gas gelijk is aan 3/2 RT
# Leg uit hoe een adiabatische expansie kan leiden tot mistvorming in een erlenmeyer (vraag uit artikel).
# Oefening: entropieverandering van 298 K en 2 atm naar 233 K en 0.4 atm. Warmtecapaciteit bij constant volume is gegeven.
# Oefening: geef temperatuur en druk bij het tripelpunt van een bepaalde stof, twee vergelijkingen met p en T zijn al gegeven, je moet alleen nog maar het stelsel van twee vergelijkingen en twee onbekenden oplossen.

=== 3 feb 2012 ===

# Geef het verschil tussen een isotherme en een adiabatische expansie.
# Toon aan dat de gemiddelde kinetische energie van een mol gas gelijk is aan 3/2 RT
# Oefening: entropieverandering van 298 K en 2 atm naar 233 K en 0.4 atm
# Oefening: geef temperatuur en druk bij het tripelpunt van een bepaalde stof, twee vergelijkingen met p en T zijn al gegeven, je moet alleen nog maar het stelsel van twee vergelijkingen en twee onbekenden oplossen.

=== 27 jan 2012 ===

# Toon aan dat stoffen die de oppervlaktespanning verlagen, de neiging hebben om zich aan het oppervlak op te stapelen.
# Leg uit, elektrochemische potentiaal en pas toe op de membraanpotentiaal.
# Oefening op entropieverandering
# Bereken q, U en H bij verwarming bij constante druk.
=== 20 jan 2012 VM ===

# Bespreek osmose (bijvragen: geldt deze formule altijd, hoe aanpassen voor grotere C, hoe noem je dit?)
# Geef de formules voor de warmte, arbeid en verandering in inwendige energie voor volgende processen met ideale gassen:
#* isotherme expansie in vacuÃ¼m
#* adiabatische expansie in vacuÃ¼m
#* isotherme expansie tegen constante druk
#* adiabatisch expansie tegen constante druk
#* reversibele isotherme expansie
#* reversibele adiabatische expansie
#* (bijvraag: een stok met aan het uiteinde een stuk katoen in een omhulsel duwen (past perfect): hierna brandt het katoen, hoe verklaar je dit?)
# Oef: zie oef 3 bij oude examenvragen
# Oef: zie oef 7 bij oude examenvragen

=== 16 jan 2012 VM ===

# Geef de carnotcyclus en bespreek U, w & q bij elk proces
# Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.
# Oefening over verandering Gibbs van reactie bij 1298K als Cp, H & S van alle reagentia en producten gegeven bij 298K
# Oefening over entropieverandering van expansie (systeem, omgeving, universum) zowel a) reversibel b) irreversibel bij uitwendige druk van 0,1Atm

=== 28 jan 2011 ===

#Bespreek osmose en hoe kan je hieruit molecuulgewicht bepalen (3de keer!!!)
#Bespreek membraanpotentiaal
#IJs wordt van -10Â°C tot +10Â°C verwarmd: wat is de entropietoename van het systeem? (enthalpie en warmtecapaciteiten gegeven)
#Bereken eindtemperatuur, q, W en U van een reversibele adiabatische compressie van 28l naar 10l. (Cv = 5/2R)

=== 21 jan 2011 VM ===
# Geef de carnotcyclus en bespreek U, w & q bij elk proces
# Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.
# Oefening over verandering inwendige energie (delta U)
# Oefening over entropieverandering

=== 17 jan 2011 ===

# Bespreek osmose en leg uit hoe je hieruit molecuulgewichten kunt bekomen
# Clapeyron afleiden + toepassen op fasediagramma (m.a.w. vgl vast-> vl., vl. -> gas en vast -> gas berekenen)
# Oefening over entropieverandering
# Oefening over verandering in gibbsfunctie

=== 15 jan 2010 ===

# bespreek de adiabatische expansie
# bespreek osmose en geef een toepassing
# oefening over entropieverandering
# oefening over verandering in gibbsfunctie

=== 11 jan 2010 VM ===
# Bespreek het kinetischgasmodel en de gemiddelde Etr.
# Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.
# ?
# ?

=== 11 jan 2010 NM ===
# Toon aan met formules dat een stof die de oppervlaktespanning verlaagt de neiging heeft om zich aan het oppervlak op te stapelen.
# Bewijs dat de totale entropie voor een Carnotcyclus gelijk is aan nul.
# Entropieverandering berekenen van gas bij bepaalde gebeurtenis.
# Veranderingen in U en H berekenen bij de opwarming van een ideaal gas bij constante druk.

=== 30 jan 2009 ===
# Clapeyron afleiden+toepassen op vloeibaar-gas.
# Kookpuntverhoging.
# Adiabatische compressie van een gas met de volumes en de begin T en de Cv gegeven.
# Entropieverandering van 25 C naar 1000 C met Cv gegeven.
=== 16 jan 2009 ===
# bij mengen verandering in gibbs, entropie, enthalpie en volume
# carnot bespreken, q, W en U bij elk proces, en efficientie berekenen
# verandering in entropie berekenen wanneer een ideaal gas expandeert van 1l bij 12K naar 2l bij 24K
# verandering in enthalpie en inwendige energie berekenen van een reactie, enkele vormingsenthalpieën gegeven en een verbrandingsenthalpie, en we mochten veronderstellen dat de gassen ideaal waren
=== 21 jan 2008 ===
# clayperon+ toep. op verdampen
# kookpuntsverhoging bespreken
# adiabatische expansie 1L naar 10L, Ti = 273K, bereken eindtem Cv gegeven
# compresie van 1atm naar 2atm en verwarmen van 300k naar 1000k. Cp gegeven. bereken entropieverandering.
=== 21 jan 2008 ===
# geef de carnotcyclus en bespreek U, w & q bij elk proces
# Bespreek de membraam potentiaal
# adiabtische compressie gas (1 mol) van 48,4l naar 44,4 l en begin temp = 0Â°C. Eindtemperatuur berekenen
# entropieverandering van verwarmen gas 25Â°C-->1000Â°C. Cp gegeven
=== 18 jan 2008 ===
# druk en temperatuursafhankelijkheid van evenwichtsconstante
# isotherme en adiabatische expansie van een ideaal gas bespreken
# inwendige energie berekenen, vormingsenthalpie en temperatuur gegeven
# enthalpie en entropie berekenen van faseovergang van water bij T = 263K, H(273K) gegeven en Cp's gegeven

=== 14 jan 2008 ===
# clapeyron afleiden en toepassen op vast/vloeistof
# osmose bespreken
# vormingsenthalpie berekenen bij 125Â°C van HBr uit H2 en Br2. met de HfÂ°bij 25Â°C gegeven. bereken ook de inwendige energieverandering. (Cp ook gegeven dacht ik (iemand die nog exact weet?) )
# entropieverandering bij 1 mol ideaal gas met T1= 12K, T2= 24K en V1=1L en V2=2L. en Cv = 3/2 R
=== 14 jan 2008 ===
# twee ideale gassen, bepaal deltaG, S, H, V na mengen
# kookpuntsverhoging bespreken
# CO(g) + H20 (g) => CO2(g) + H2(g) delta H (298K) = -10 kcal. zoek delta H (1000K) Cp's gegeven
# bespreek de carnotcyclus in een STdiagramma

=== 30 aug 2008 ===
# mengen van ideale gassen, bespreek delta G, delta H, delta S, delta U en delta V
# geef q, U en W voor volgende processen met ideale gassen
#* isotherme expansie in vacuum
#* adiabatische expansie in vacuum
#* isotherme exp tegen constante druk
#* adiab exp cte P
#* reversibele isoth exp
#* rev adiab exp
# ideaal gas bij 12K en 1L, bereken delta S bij het omzetten naar 24K en 2L. C=2/3R
=== 29 jan 2007 ===
# bespreek de druk- en temperatuursafh van de evenwichtsconstante
# de henryconstante van CO2 in H2O is 1,...*10^6, die in benzeen 8,...*10^4. In welke stof is CO2 het best oplosbaar?
# Een oefening waarbij een ideaal gas van T en V veranderd. Bereken DeltaS.
=== 23 jan 2007 ===
# bespreek osmose
# oefening waar ge bij reversibele isotherme compressie U, q, H en W moet berekenen
# een ideaal gas gaat van T1->T2 en V1-> V2. Laat zien dat geldt: Delta S= Cv. ln(T2/T1)+n.R. ln(V2/V1) Cv mag onafhankelijk van de temperatuur genomen worden.
=== 20 jan 2007 ===
# Geef de afleiding voor de vergelijking van clapeyron en pas dit toe op smelten
# Geef een S-T diagramma van de Carnotcyclus
# Bereken deltaH bij 1000K, je kreeg deltaH(298), de reactie en alle Cp's

=== 19 jan 2007 ===
# het mengen van ideale gassen. Bespreek de gibs functie de entalpie, entropie, en volume verandering.
# de carnot cyclus wordt meestal weergeven in een pv-diagrama, geef hem nu weer in een TS-diagramma
=== 18 jan 2007 ===
# bewijs dat de evenwichtsconstante niet drukafhankelijk is, maar wel temperatuursafhankelijk
# bewijs volgende uitdrukking voor de entropieverandering van een gas dat van temperatuur en volume verandert:
#: deltaS = Cv*ln(T2/T1) + nR*ln(V2/V1)
Oefening:
# bereken molecuulmassa van een proteïne
# oplossing en osmotische druk gegeven, bereken ??

Chemische Thermodynamica

2025-01-21T17:52:20Z

R0940561: /* Examenvragen */

[[Categorie:Bachelor Chemie]]
[[Categorie:Bachelor Biochemie]]

==Vakinformatie==
Zowel gevolgd door chemie als biochemie, tegenwoordig in het derde jaar voor biochemie en tweede jaar chemie. Een 'mondeling' examen met schriftelijke voorbereiding. In theorie want in praktijk verloopt het examen zonder veel woorden. De examenstructuur is altijd dezelfde: 3 theorievragen en 2 oefeningen, waarvan één altijd gaat over entropieverandering. Sinds 2012-2013 komt één van de theorievragen uit één van de artikels die je vooraf moest lezen, enkel deze vraag wordt mondeling besproken.
Het vak wordt gedoceerd door professor Thierry Verbiest.

'''Alle vragen van het einde van elk hoofdstuk (Elisabeth I.):'''
https://drive.google.com/file/d/1J_23Lh2eyP2lzxUNz9JKv4si8D7028PJ/view?usp=sharing

==Examenvragen==
===21 januari 2025 VM===
#OPDRACHT: de vuurpomp
#*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).
#*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?
#*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom.
#*Bijvragen: reversibel en irreversibel proces, waarom Cv gebruiken, W hoger voor isotherm of adiabatische processen, ΔS.
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅𝑑 = 0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. #*Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk. Leg kort uit.
#Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord.
#*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.
#*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenene.
#*De elektrochemische potentiaal is hetzelfde als de chemische potentiaal.
#OEFENING 1: Een ideaal gas wordt bij 27°C isotherm geëxpandeerd van 3 atm tot 1 atm. Bepaal q, W, ΔU, ΔH, ΔSsys en ΔSomg indien dit:
#* reversibel gebeurt
#* gebeurt bij een constante tegendruk van 1atm
#OEFENING 2: je hebt een moedercel met straal 1 µm dat zich opsplitst in 2 gelijke dochtercellen. Het totaal volume blijft gelijk, maar de oppervlakte wordt groter. Wat is de arbeid die hiervoor verricht moet worden als je weet dat de oppervlaktespanning 3.12*10^(-3) N/m is?

===20 januari 2025 NM===
#OPDRACHT: de vuurpomp
#*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).
#*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?
#*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom.
#*Bijvragen: reversibel en irreversibel proces, waarom Cv gebruiken, W hoger voor isotherm of adiabatische processen, ΔS.
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅𝑑 = 0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. #*Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk. Leg kort uit.
#Beschouw een mengsel (of oplossing) van vloeistof A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.
#Waar of niet waar? Motiveer kort je antwoord.
#*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij.
#*Schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.
#*Surfactanten verhogen de oppervlaktespanning.
#*Schaatsenrijders (een insect) kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.
#Oefening 1: Bereken de molaire massa van creatine gegeven dat de osmotische druk van je 0.1g/l creatine-oplossing 13 torr bedroeg in vergelijking met water bij 25°C.
#Oefening 2: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar.
#*Bereken interne energie, warmte en arbeid
#*Bereken entropie van het systeem
#*Bereken Gibbs vrije energie

===20 januari 2025 VM===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅𝑑 = 0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen.
#*Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk. Leg kort uit.
#Bespreek luchtvochtigheid en het verschil tussen droge bol en natte bol temperatuur.
#Waar of niet waar? Motiveer kort je antwoord.
#*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij.
#*Schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.
#*Surfactanten verhogen de oppervlaktespanning.
#*Schaatsenrijders (een insect) kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.
#Oefening 1: Bereken de molaire massa van creatine gegeven dat de osmotische druk van je 0.1g/l creatine-oplossing 13 torr bedroeg in vergelijking met water bij 25°C.
#Oefening 2: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar.
#*Bereken interne energie, warmte en arbeid
#*Bereken entropie van het systeem
#*Bereken Gibbs vrije energie

===13 januari 2025 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#isotherme processen
#*leidt een uitdrukking af voor arbeid en warmte bij een reversibel en irreversibel isotherm proces
#*Bewijs dat dH en dU gelijk zijn aan 0 voor een isotherm proces bij ideale gassen. Motiveer je antwoord.
#*Leg uit waarom de geleverde arbeid bij een reversibel isotherm proces groter is dan bij een reversibel adiabatisch proces.
#Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding
#Micelvorming: leg uit hoe je ΔG°, ΔH°,ΔS° kan bepalen als je de kritische micelconcentratie kent. Leidt de relevante formules af.
#Oefening 1: Wat is de reactie enthalpie van een reactie waarbij de evenwichtsconstante verdubbelt als de temperatuur verhoogd wordt met 15 K bij een temperatuur van 310 K?
#Oefening 2: tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.
#* Wat is de vormingsenthalpie
#* Wat is de normale kooktemperatuur
#* Wat is de druk in het tripelpunt

===10 januari 2025 NM===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Uit de wiskunde weten we dat een differentiaal 𝑑𝑓 = 𝑎(𝑥,𝑦)𝑑𝑥 + 𝑏(𝑥,𝑦)𝑑𝑦 exact is als (𝜕𝑎/𝜕𝑦)𝑥=(𝜕𝑏/𝜕𝑥)𝑦. In de thermodynamica zou 𝑓 dan een toestandsfunctie zijn. Toon aan voor een mono-atomisch ideaal gas dat dq geen exacte differentiaal is, maar dat dq/T dat wel is. Maak gebruik van bovenstaande definitie van een exacte differentiaal en dq = dU - dW = CVdT + pdV
#Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding
#Carnot cyclus
#Een waterdruppel met diameter 20mm wordt opgesplitst in 1000 gelijke kleine waterdruppeltjes. Bereken de arbeid die hiervoor nodig is. De oppervlaktespanning van water is 0,072N/m, het volume van een bol is (4/3)πr^3 en het oppervlak van een bol is 4πr^2.
#Tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.
#* Wat is de vormingsenthalpie
#* Wat is de normale kooktemperatuur
#* Wat is de druk in het tripelpunt

=== 10 januari 2025 VM ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Uit de wiskunde weten we dat een differentiaal 𝑑𝑓 = 𝑎(𝑥,𝑦)𝑑𝑥 + 𝑏(𝑥,𝑦)𝑑𝑦 exact is als (𝜕𝑎/𝜕𝑦)𝑥=(𝜕𝑏/𝜕𝑥)𝑦. In de thermodynamica zou 𝑓 dan een toestandsfunctie zijn. Toon aan voor een mono-atomisch ideaal gas dat dq geen exacte differentiaal is, maar dat dq/T dat wel is. Maak gebruik van bovenstaande definitie van een exacte differentiaal en dq = dU - dW = CVdT + pdV
#Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Een waterdruppel met diameter 20mm wordt opgesplitst in 1000 gelijke kleine waterdruppeltjes. Bereken de arbeid die hiervoor nodig is. De oppervlaktespanning van water is 0,072N/m, het volume van een bol is (4/3)πr^3 en het oppervlak van een bol is 4πr^2.
#Een ideaal gas wordt bij 37°C isotherm geëxpandeerd van 3 atm tot 1 atm. Bepaal q, W, ΔU, ΔH, ΔSsys en ΔSomg indien dit:
#* reversibel gebeurt
#* gebeurt bij een constante tegendruk van 1atm

=== 6 september 2024 ===
#OPDRACHT: vuurpomp
#*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).
#*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?
#*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom
#*Bijvragen
#**Wat is reversibel en irreversibel?
#**Waarom mag je Cv gebruiken? (Het volume is namelijk niet constant bij een compressie)
#**Hoe zou je in beide gevallen (reversibel, irreversibel) de entropie berekenen?
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord
#*De variantie in het tripelpunt van een zuivere stof is nul.
#*Het T,x-diagram van een ideaal mengsel kan nooit een azeotroop vertonen.
#*Beschouw een vloeibaar mengsel van A en B. De samenstelling van de vloeistof is hierbij steeds gelijk aan de samenstelling van dampfase.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord.
#*De evenwichtsconstante is dimensieloos.
#* ΔG en ΔG° zijn constanten.
#*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord.
#*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.
#*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenene.
#*De elektrochemische potentiaal is hetzelfde als de chemische potentiaal.
#Oefening 1: isotherme expansie van 3 atm naar 1 atm bij een temperatuur van 37°C. Geef de entropie van de omgeving en van het systeem in volgende gevallen:
#*Reversibele expansie
#*Irreversibel tegen een uitwendige druk van 1 atm
#Oefening 2: je hebt een moedercel met straal 1 µm dat zich opsplitst in 2 gelijke dochtercellen. Het totaal volume blijft gelijk, maar de oppervlakte wordt groter. Wat is de arbeid die hiervoor verricht moet worden als je weet dat de oppervlaktespanning 3.12*10^(-3) N/m is?

=== 16 februari 2024 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#*Bijvragen over de CMC en surfactanten, 2e hoofdwet van thermodynamica & het verband met Gibbs
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord.
#*De evenwichtsconstante is dimensieloos.
#* ΔG en ΔG° zijn constanten.
#*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord. (3)

#Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar.
#*Bereken U, q en W
#*Bereken ∆S(systeem)
#*Bereken ∆G
#Oefening: Het verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte

=== 1 februari 2024 NM ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#*Bijvragen over de CMC en surfactanten, 2e hoofdwet van thermodynamica & het verband met gibbs, stabiliteitscurve proteinen, methanol vs water
#Isotherme processen
#*Leid een uitdrukking af voor arbeid en warmte bij een reversibel en irreversibel isotherm proces.
#*Bewijs dat dU en dH gelijk zijn aan nul voor een isotherm proces bij ideale gassen.
#*Leg uit waarom de geleverde arbeid bij een reversibel isotherm proces groter is dan bij een reversibel adiabatisch proces.
#Micelvorming: leg uit hoe je ∆G°, ∆H° en ∆S° kan bepalen als je de kritische micelconcentratie kent. Leid de relevante formules af.
#Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal mbv de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Oefening 1: Wat is de reactie enthalpie van een reactie waarbij de evenwichtsconstante verdubbelt als de temperatuur verhoogd wordt met 15 K bij een temperatuur van 310 K?
#Oefening 2: Tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.
#* Wat is de vormingsenthalpie
#* Wat is de normale kooktemperatuur
#* Wat is de druk in het tripelpunt

=== 23 januari 2024 NM ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
Bijvragen over de CMC, opbouw micellen en amfifiele moleculen, wat is de 2e hoofdwet van thermodynamica & het verband met gibbs...
# Carnot cyclus en omgekeerde Carnot cyclus
#*Toon aan dat DU = 0 en DS = 0 voor de Carnot cyclus.
#*Teken de Carnot cyclus in een T-S diagramma.
#*Wanneer is het rendement van een warmtepomp het hoogst?In de winter of in
de zomer? Verklaar je antwoord.
#Waar of niet waar? Verklaar kort je antwoord.
#*Bij een expansie van een ideaal gas in vacuüm is dU steeds gelijk aan nul.
#*Het volume is een exacte differentiaal.
#*Dichtheid is een extensieve grootheid.
#*Bij een isotherm proces is dW = 0.
#Micelvorming: leg uit hoe je ∆G°, ∆H° en ∆S° kan bepalen als je de kritische
micelconcentratie kent. Leid de relevante formules af.
#Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar.
#*Bereken U, q en W
#*Bereken ∆S(systeem)
#*Bereken ∆G
#Oefening: Tripelpunt: T bij tripelpunt gegeven en 2 paren van druk en temperatuur gegeven bij verdampen.
#* Wat is de vormingsenthalpie
#* Wat is de normale kooktemperatuur
#* Wat is de druk in het tripelpunt

=== 23 januari 2024 VM ===
Exact de zelfde vragen als 12 januari 2024

=== 15 januari 2024 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
Bijvragen over de CMC, opbouw micellen en amfifiele moleculen, wat is de 2e hoofdwet van thermodynamica & het verband met gibbs...
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.
#Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Waar of niet waar?
#*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij
#*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.
#*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning
#*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.
#Oefening: Bereken de molaire massa van creatine gegeven dat de osmotische druk van je 0.1g/l creatine-oplossing 13 torr bedroeg in vergelijking met water bij 25°C.
#Oefening: Isotherme reversibele expansie van 0.133 mol ideaal gas van 3l naar 10l. De initiële druk bedroeg 5 bar.
#*Bereken U, q en W
#*Bereken ΔS(systeem)
#*Bereken ΔG

=== 12 januari 2024 ===
#OPDRACHT: vuurpomp
#*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).
#*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?
#*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom
#*Bijvragen komen letterlijk uit de vragen dat je moet leren voor hoofdstuk 3 (enige dat ik daar verschillend van had: wat gebeurt er als je bij een reversibel proces iets klein aanpast zoals het teken van uw volumeverandering aanpassen compressie <-> expansie)
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆S=0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijke. Leg kort uit.
#Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Waar of niet waar? Motiveer kort je antwoord.
#*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.
#*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenene.
#*De elektrochemische potentiaal is hetzelfde als de chemische potentiaal.
#oefening 1: isotherme expansie van 3 atm naar 1 atm bij een temperatuur van 37°C. Geef de entropie van de omgeving en van het systeem in volgende gevallen:
#*Reversibele expansie
#*Irreversibel tegen een uitwendige druk van 1 atm
#oefening 2: je hebt een moedercel met straal 1 µm dat zich opsplitst in 2 gelijke dochtercellen. Het totaal volume blijft gelijk, maar de oppervlakte wordt groter. Wat is de arbeid die hiervoor verricht moet worden als je weet dat de oppervlaktespanning (iets in die aard) 1.26*10^(-)2 N/m is?

=== 28 augustus 2023 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord
#*De evenwichtsconstante is dimensieloos
#*Delta G en delta G° zijn constanten
#*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling
#Beschouw een mengsel van vloeistof A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.
#Oppervlaktespanning
#*Waarom is de druk binnen in een vloeistofdruppel steeds hoger dan erbuiten?
#*Waarom heeft hexaan een lagere oppervlaktespanning dan water?
#*Waarom gebruiken we de Helmholtz functie om de Young-Laplace vergelijking af te leiden en niet de Gibbs functie?
#Oefening 1: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte
#Oefening 2: 0.133 mol van een ideaal gas wordt bij een initiële druk van 5 bar isotherm en reversibel geëxpandeerd van 3 liter tot 10 liter.
#*Wat is de inwendige energie, de arbeid en de warmte?
#*Wat is de entropieverandering van het systeem?
#*Geef de gibbsfunctie.

=== 1 februari 2023 ===
#OPDRACHT: vuurpomp
#*Leid een uitdrukking af voor de eindtemperatuur en eindvolume bij de vuurpomp (zonder getallen).
#*De werking van de vuurpomp steunt op een irreversibele adiabatische compressie. Hoe zou je de eindtemperatuur en eindvolume berekenen in het reversibele geval?
#*Leid een uitdrukking af voor de arbeid in beide gevallen. Is deze gelijk of verschillend voor beide processen? Leg uit waarom.
#Toon aan met een afleiding (begin met vorderingsgraad) dat 𝑅𝑇 ln(𝐾p) = −∆𝐺̅°.
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagram en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅d = 0.
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk. Leg kort uit.
#Beschouw een mengsel (of oplossing) van vloeistoffen A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.
#OEFENING 1: Isotherme compressie van een ideaal gas van 3 atm tot 1 atm bij 27°C. Bereken ∆S(systeem) en ∆S(omgeving) in het reversibele geval en ook bij constante externe druk van 1 atm.
#OEFENING 2: Een druppel water (bol met straal 10 mm) wordt gesplitst in 1000 equivalente kleinere druppels (ook bollen) waarbij het totaalvolume niet verandert. Bereken de arbeid die hiervoor nodig is. Gegeven formules voor volume en oppervlakte bol, oppervlaktespanning water (73 N/m).

=== 16 januari 2023 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord
#*De evenwichtsconstante is dimensieloos
#*Delta G en delta G° zijn constanten
#*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling
#Schets fasediagramma van 2 stoffen A en B die slecht mengbaar zijn in vaste fase en goed mengbaar in vloeistoffase. Gibbs faseregel + leg uit
#OEFENING 1: berekenen U, q, W, G, S, H
#OEFENING 2: iets van een moedercel die splitst in 2 dochtercellen waarbij het volume gedeeld wordt door 2 maar de oppervlakte wel veranderd. Berekenen hoeveel arbeid er nodig is om dit proces te laten plaatsvinden (dus oppervlaktespanning doorbreken). Diameter moedercel, oppervlaktespanning, formule opp. en volume bol gegeven.

=== 1 september 2022 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord
#*Het Debije-Hückel model laat ons toe om een uitdrukking af te leiden voor de elektrochemische potentiaal.
#*De gemiddelde activiteitscoëfficiënt wordt gebruikt omwille van experimentele redenen.
#*De eenheid van ionische activiteit is mol/kg.
#Leid een uitdrukking af voor de Laplace druk. Verklaar elke stap in je afleiding
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord
#*De variantie in het tripelpunt van een zuivere stof is nul.
#*Het T,x-diagram van een ideaal mengsel kan nooit een azeotroop vertonen.
#*Beschouw een vloeibaar mengsel van A en B. De samenstelling van de vloeistof is hierbij steeds gelijk aan de samenstelling van dampfase.
#Oefening: isotherme en reversibele expansie. Berekenen van warmte, arbeid, inwendige energie, entropie van het systeem en gibbs functie
#Oefening: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte

=== 25 augustus 2022 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen (hydrofoob effect)
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#Waar of niet waar? Motiveer je antwoord
#*De evenwichtsconstante is dimensieloos
#*Delta G en delta G° zijn constanten
#*Endotherme reacties worden gunstig beïnvloed door een temperatuursdaling
#Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal. Verklaar elke stap in je afleiding.
#Beschouw een mengsel van vloeistof A en B. Leid een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van A en B in het mengsel. Bespreek hierbij de wet van Raoult en Henry en illustreer met een grafiek.
#Oefening: isotherme en reversibele expansie. Berekenen van warmte, arbeid, inwendige energie, entropie van het systeem en gibbs functie
#Oefening: verwarmen van 3 mol zuurstofgas bij constante druk. Berekenen van enthalpie, inwendige energie en warmte

=== 17 januari 2022 ===
#OPDRACHT: vouwen van proteïnen
#*Wat is het hydrofoob effect?
#*Leg uit waarom dit grotendeels een entropisch effect is.
#*Leg uit waarom het hydrofoob effect één van de drijvende krachten is bij het vouwen van proteïnen in waterig milieu.
#*Is het hydrofoob effect ook de drijvende kracht bij micelvorming ? Leg uit.
#
#Proteïnen
#*Bespreek het fasediagramma en de stabiliteit van proteïnen.
#*Waarom is de stabiliteit van een proteïne maximaal als ∆𝑆̅d = 0?
#*Thermofiele bacteriën kunnen zeer hoge temperaturen verdragen, deels omdat hun proteïnen stabiel zijn bij hoge temperaturen. Welke thermodynamische parameter is hiervoor verantwoordelijk? Leg kort uit.
#
#Leid een uitdrukking af voor de cryoscopische constante. Verklaar elke stap in je afleiding.
#
#Leid een formule af die aantoont dat een opgeloste stof die de oppervlaktespanning van een oplossing verlaagt, de neiging zal hebben zich op te stapelen aan het oppervlak. Verklaar elke stap in je afleiding.
#
#Oefening 1: Wat is de reactie enthalpie van een reactie waarbij de evenwichtsconstante verdubbelt als de temperatuur verhoogd wordt met 15 K bij een temperatuur van 310 K?
#
#Oefening 2: 0.133 mol van een ideaal gas wordt bij een initiële druk van 5 bar isotherm en reversibel geëxpandeerd van 3 liter tot 10 liter.
#*Wat is de inwendige energie, de arbeid en de warmte?
#*Wat is de entropieverandering van het systeem?
#*Geef de gibbsfunctie.

=== 31 augustus 2021 ===
#Vuurpomp afleiding geven voor T en V
#
#Gibbs functie bij mengsels
#*Toon aan dat gibbs ook een alternatieve vorm is voor de 2de hoofdwet
#*Temperatuur- en drukafhankelijkheid van Gibbs functie.
#
#Waar of niet waar?
#*Vergroten van een oppervlak zet energie vrij
#*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.
#*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning
#*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.

#Proteine stabiliteit en fasediagram geven en alles uitleggen + de afleidingen van dG folded en unfolded!
#Oefening1: Druk p is gegeven (zo niet kan je gwn pV=nRT stellen) enbij verwaeming is T1= 310 K en T2=325 K, tijdens die verwarming zal de evenwichtsconstante K veranderen tot 2.K (verdubbelen) gaan, wat is de standaard enthalpie?
#Oefening2: gegeven is V1 = 3 L en V2= 10L met druk p=5bar en aantal mol stof = 0.133 mol, geheel is temperatuur onafhankelijk.
#*Geef U, W en q voor als het proces isotherm reversibel expandeert
#*Geef de entropie verandering van het systeem
#*Geef de gibbs functie voor deze situatie

=== 27 januari 2021 ===
#Artikel over proteïne: leg hydrofoob effect uit en waarom vouwing entropisch gedreven is
#Adiabatische processen
#* toon aan dat P1V1^(y)=P2V2^(y) voor een adiabatisch proces
#* toon aan dat de arbeid bij een adiabatisch proces gegeven wordt door W= (Pfin*Vfin-Pinit*Vinit)/(y-1) en dat deze uitdrukking equivalent is met W=Cv(Tfin-Tinit)
#* leg uit waarom we Cv mogen gebruiken in W=Cv(Tfin-Tinit) terwijl het volume niet constant blijft.
# Leid een uitdrukking af voor de membraanpotentiaal met behulp van de elektrochemische potentiaal.
# Waar of niet waar?
#* Vergroten van een oppervlak zet energie vrij
#*schuim is onstabiel omdat schuim een zeer groot oppervlak heeft.
#*surfactanten verhogen de oppervlaktespanning
#*schaatsrijders kunnen op het water lopen omwille van de oppervlaktespanning van water.
#Oef: bereken verschil in entropie van het systeem. gegeven T1, P1 en T2, P2 en Cr (molaire)
#Oef: gegeven: temperatuur tripelpunt, 2 punten (P,T) van naftaleen
#*bereken delta H
#*bereken normaal kookpunt naftaleen
#*bereken P van tripelpunt

=== 11 januari 2021 ===
#Artikel over proteïne: leg hydrofoob effect uit en waarom vouwing entropisch gedreven is
#Osmose
#La place druk
#Joule -thompson coefficient aantonen dat die 0 is voor ideale gassen
#*bewijs isobare coefficient voor thermische expansie is 1/T voor ideaal gas
#* bewijs isotherme compressibiliteit is 1/p voor ideaal gas
#* Is joule thompsoncoefficient positief of negatief bij een expansieproces dat resulteert in koelen
#oef: w, q, Ssyst, Somg,U en H berekenen bij isotherm proces
#* bij reversibel proces
#*bij Pex van 1 atm
#oef: tripelpunt, kritisch punt, normaal kookpunt en smeltpunt gegeven
#* schets een fasediagram (P,T) hiervan
#* kan je O2 smelten als je de druk verhoogt?
#* bereken Hvap

===31 januari 2020===
# Artikel over proteïne: Welke interacties spelen een rol bij de opvouwing van een bêta-hairpin? Hoe dragen deze interacties bij aan de enthalpieverandering van het opvouwingsproces? Gebruik tabel 1.
# Oef: bereken q, W, U. Bereken entropie en Gibbs energie.
# Oef: bereken verandering van entropie.
# Temperatuur- en drukafhankelijkheid van Gibbs functie.
# chemische potentiaal bij osmose afleiden. Hoe kan dit gebruikt worden om de molecuulmassa van polymeren te weten?

===17 januari 2020 VM===
# Wat is CMC en geef de verandering in enthalpie bij micelvorming.
# Oef: opwarming van een gas tegen constante druk (Cp gegeven). Bereken warmte, verandering in U en H.
# Oef: bereken de verandering in entropie bij opwarming.
# chemische potentiaal bij osmose afleiden. Hoe kan dit gebruikt worden om de molecuulmassa van polymeren te weten?
# klassieke nucleatietheorie
===13 januari 2020 NM===
# Vuurpomp
# Oef: P2 en deltaG berekenen
# Oef: deltaS berekenen
# Chemische potentiaal voor zuivere vloeistof en voor mengsel geven. Wet van Raoult en Henry bespreken met een grafiek.
# Membraanpotentiaal en Donnanpotentiaal. Bespreek het verschil.

===13 januari 2020 VM===
# Vuurpomp
# Oef: bereken q S en H bij isotherm
# Oef: bereken q, U en G bij isobaar opwarmen gas
# Schets fasediagramma van 2 stoffen A en B die slecht mengbaar zijn in vaste fase en goed mengbaar in vloeistoffase. Gibbs faseregel + leg uit
# mengsel ideale oplossing formules afleiden + wet van Raoult (grafiek)
===25 januari 2019 NM===
# Vuurpomp
# Oef: dSsyst berekenen bij water gaat van ijs naar vlo (een oef uit oefenzitting 3 met ijs)
# Oef: H U q berekenen bij gegeven T1 T2 p1 en Cp
# Bespreek chemisch pot van mengsel ideale gassen en ideale vlo
# Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom dat oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.

===18 januari 2019 NM===
Zelfde als voormiddag, maar carnot cyclus vervangen door proteïne denaturatie + stabiliteitscurve
===18 januari 2019 VM===
# Artikel over proteïne
# Oefening: Kp gegeven bij twee temperaturen. Bereken delta G, H en S.
# Oefening: 2 mol gas ondergaat isotherme compressie. T, p1 en delta S gegeven. Bereken einddruk en delta G.
# Bespreek carnot cyclus (teken p-V diagram, bereken voor elke stap W, q, U en entropie verandering, toon aan dat U en S voor de hele reactie gelijk aan 0 zijn, bereken efficiëntie)
# Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom dat oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.

===14 januari 2019 NM===
# Vuurpomp
# Oefening over een monoatomisch gas dat isotherm wordt samengedrukt, waardoor de entropie daalt.
#* Wat is de einddruk?
#* Wat is de delta G?
# Oefening over mengsels (zoals gezien in de les). Moleculaire massas en dichtheden gegeven.
#* Hoeveel volume water en methanol moet men mengen om een bepaalde samenstelling te krijgen
# Toon aan dat de entropie gelijk is aan 0 voor een reversibel proces bij fasetransities (bv smelten). Toon ook aan dat dit verschillend is van 0 voor een irreversibel proces
# Leid de formule van Clapeyron af en toon dit aan voor smelten en verdampen

===14 januari 2019 VM===
#Vuurpomp
#Oefening over een ideaal gas dat reversibel isotherm wordt geëxpandeerd. T, V1, V2 gegeven. Bereken deltaH, deltaU, deltaG, deltaA, q en W.
#Oefening over een ideaal gas dat isotherm wordt geëxpandeerd. Bereken deltaS van universum, systeem en omgeving in reversibele en irreversibele omstandigheden. V1, V2 en temperatuur gegeven. Voor irreversibele voorwaarden bij een constante externe druk van 0.1 atm.
#Colligatieve eigenschappen
#*Uitleggen en grafiek geven, wat doet de opgeloste stof met het chemisch potentiaal van de vloeistof?
#*Bespreek kookpuntsverhoging
#*Bespreek osmose
#Mengsels van vloeistoffen
#*Leidt een uitdrukking af voor de chemische potentiaal van mengsels van ideale oplossingen
#*Hoe zit dit voor reële vloeistoffen? (+grafiek)

===1 februari 2018===
#vuurpomp
#vraag over donnanpotentiaal
#vraag over mengsels

===26 januari 2018===
#Proteinevouwing
#Carnot cyclus
#Oppervlakteverschijnselen: young-Laplace + vergelijking waarom da oppervlaktespanning daalt als C opp stijgt.
#entropie oef
#verdampingsenthalpie, kookpunt, verdampingsentropie en ebullioscopische cte.

=== 19 januari 2018 ===

#Vuurpomp uitleggen
# 1 mol gas word isotherm ontspannen, bepaal q, W, delta U, entropie van omgeving en systeem voor een reversibel en irreversibel geval
# gas wordt opgewarmd, bepaal molaire entropie verandering
# chemische potentiaal van vloeistoffen: ideale en reële mengsels, wet van Raoult en wet van Henry
# denaturatie van proteïnen: formule voor delta G in functie van temperatuur afleiden, curve schetsen en grondig bespreken

=== 19 januari 2018===
# Vuurpomp
# 1 mol ideaal gas: expansie van 20L tot 200L bij 300K. Gevraagd: entropieverandering van systeem, omgeving en universum voor:
#* a. Reversibel
#* b. Irreversibel bij 0.1 atm buitendruk
# Gevraagd: de verandering in molaire entropie bij verwarming van stikstofgas van 25°C tot 1000°C bij constante druk. ( Gegeven: Cp = 26.9835 + 5.9622*10(^-3) T – 377*10(^-7) T(^2) )
# Beschouw de reactie 3A+2B <=> C+2D.
#* Leid het verband van de standaard Gibbsfunctie en de evenwichtsconstante af. En wat met reële gassen? (1.5p)
#* Toon de drukonafhankelijkheid aan (1p)
#* Toon de temperatuursafhankelijkheid aan (1.5p)
# Beschouw F(folded) <=> U(unfolded).
#* Leid deltaG in functie van de temperatuur af (1.5p)
#* schets de stabiliteitscurve en bespreek gronding (2.5p)

=== 15 januari 2018 ===

# Vuurpomp uitleggen
# Oefening op entropie met isotherme compressie ---> bepaal einddruk en delta G
# Oefening partieel molaire volumes
# Entropie voor fasetransities afleiden
# Clausius-Clapeyronvgl. afleiden en toepassen voor smelten en verdampen

=== 3 februari 2017 NM ===

# Artikel over proteïne (4 ptn): Welke interacties spelen een rol bij de opvouwing van een bêta-hairpin? Hoe dragen deze interacties bij aan de enthalpieverandering van het opvouwingsproces? Gebruik tabel 1. (gegeven)
#*Bijvragen: hij heeft een klokcurve op zijn blad getekend: hoe beïnvloed Cp de curve? (breder). Draagt water meer bij aan de opvouwing van de hairpin dan methanol? De opvouwing van de hydrofobe zijketens, hoe noemen we dit effect? (hij doelt op hydrofoob effect).
# Oefening (2 ptn): gegeven: 1 mol, temperatuur 767°C verhogen naar 1027°C, druk gaat van 1 atm naar 6 atm, molaire Cv = 3/2 R. Bereken de enthalpieverandering en de entropieverandering.
# Oefening (2 ptn): gegeven: 3 mol, temperatuur 27°C, de reactie is isotherm, druk gaat van 1 atm naar 5 atm. Bereken de verandering in vrije energie.
# Carnot-cyclus:
#* Teken het p-V en S-T diagram. (1,5 ptn)
#* Bereken voor elke stap w, q, U en entropieverandering. (1,5 ptn)
#* Toon aan dat de totale U en totale entropieverandering nul is. (1ptn)
# Chemisch potentiaal mengsels (gas en vloeistof)
#* Bespreek de verandering in Gibbs en entropie bij het mengen van ideale gassen. (1,6 ptn)
#* Doe dit ook voor ideale vloeistoffen. (1,2 ptn)
#* Kan je hetzelfde besluiten voor vloeistoffen en gassen? Bespreek dit. (1,2 ptn)

=== 27 januari 2017 NM ===

# Artikel over proteïne
# Oefening tripelpunt en kooktemperatuur
# Oefening entropie berkenen
# Chemisch potentiaal mengsel vloeistoffen, uitdrukking G en aantonen dat het entropie gedreven is
# Kinetisch gasmodel en fotongas

=== 27 januari 2017 VM ===

# Artikel over proteïnen
# Geef q, U en W voor volgende processen met ideale gassen
#* isotherme expansie in vacuum
#* adiabatische expansie in vacuum
#* isotherme expansie tegen constante druk
#* adiabatische expansie tegen constante druk
#* reversibele isotherme expansie
#* reversibele adiabatische expansie
#* isochoor proces (weet niet meer exact)
# Chemische potentiaal kort uitleggen, geef afleiding metaal/metaalion electrode
# Oefening triplepunt en kooktemperatuur
# Oefening entropie berekening

=== 20 januari 2017 NM ===

#Vuurpomp vertrekkende van de eerste hoofdwet van de thermodynamica
#entropie (van systeem, universum en omgeving) als je een gas opwarmt van 768 tot 1028 K en samendrukt door het veranderen van de druk van 1 atm tot 6 atm. je mocht dit beschouwen als een reversibel proces. Wat is de entropie?
#een mol gas (argon) ontspant zich bij 273K adiabatisch van 1L naar 10L, wat is de eindtemperatuur? gebruik voor warmtecapaciteit C(v)= 3/2R
#leidt een formule af voor chemische potentiaal bij het mengen van twee stoffen. leidt dan ook de gibbsfunctie af en toon aan dat dit entropisch gedreven is.
#Toon aan dat stoffen aan de oppervlakte van een stof de oppervlaktespanning doen dalen. Leidt de formule van Young-Laplace af.

=== 16 januari 2017 VM ===
#Werking van de vuurpomp beschrijven m.b.v. de eerste hoofdwet van de thermodynamica.
#Bereken een reactie-enthalpie bij 1000K (de reactie en de reactie-enthalpie bij 298K is gegeven).
#Een gas bij 25°C wordt verwarmd bij constante druk tot het verdubbeld is in volume. Bereken de verandering in enthalpie, entropie en vrije energie.
#Mengen van ideale gassen, formule afleiden. (en nog dingen maar die ben ik vergeten omda ik ze nie kon :'( )
#Leid de Clapeyron af en pas toe op Vast-Vloeistof en Vloeistof-Damp.

=== 22 januari 2016 NM ===
#vuurpomp
#colligatieve eigenschappen, kookpuntsverhoging, osmose
#clapeyron afleiden en toepassen op smelten en verdampen
#entropie (sys, omg, univ) berekenen reversibel, irreversibel en enthalpie van systeem berekenen met T1, T2, Cp gegeven
#entropie, enthalpie en inwendige energie berekenen waarbij een systeem verwarmd word tot het volume verdubbelt is met P constant en Ti, P en n gegeven

=== 15 januari 2016 (VM) ===
#Het artikel over het vouwen van eiwitten bespreken.
#De dampspanning van een zuivere stof op twee verschillende temperaturen krijg je. Bereken de verdampingsenthalpie, ebullioscopische constante (molaire massa gegeven.), de temperatuur waarop de vloeistof verdampt en de entropie van dit proces.
#Een (zeer eenvoudige) oefening waarin de entropie moet berekend worden van een expansie.
#Bespreek de carnot cyclus.
#De laplace vergelijking uitleggen en verklaren waarom stoffen die aan het oppervlakte opstapelen de oppervlaktespanning verlagen.

=== 11 januari 2016 NM ===
Hetzelfde als 11 januari VM

=== 11 januari 2016 VM ===
#vuurpomp (opdracht)
#tripelpunt oefening: gegeven temperatuur bij tripelpunt, Pvap(T1), Pvap(T2) te berekenen enthalpie(vap), kooktemp. bij normaaldruk en druk op tripelpunt.
#entropie en enthalpie bij reversibel en irreversibel oefening: gegeven T1, T2, Cp
#colligatieve eigenschappen bespreken (wat is het + invloed van de opgeloste stof op de chemische potentiaal van de vloeistof) en kookpuntsverhoging en osmose
#elektrochemische potentiaal en metaal/metaalionelectrode + Nernstvergelijking (kort) afleiden + (heel kort) bespreken hoe enthalpie en entropie bepaald kan worden uit elektrochemie

=== 12 januari 2015 (NM) ===

# 1. Dat vuur pomp stuff.
# 2. Bereken tripel punt shit.
# 3. Wat met entropie spelen n stuff.
# 4. Een of ander carnot cyclus... komt dat iemand bekend voor?
# 5. Wat shit met oppervlakte spanning en Young en een van zijn Franse maatjes afleiden

=== 17 januari 2014 ===

# vraag over enthalpie bij peptide vouwen, vraag 1 van da document
# Oefening om enthalpie te bereken bij 1000K terwijl de enthalpie is gegeven bij 298K van een reactievgl
# Entropie berekening voor irreversibel en reversibel proces
# leidt de formule van de oppervlaktespanning af, bewijs dat stoffen die de oppervlaktespanning verlagen de nijging hebben om zich aan de oppervlakte op te stapelen, Leidt de vergelijking van Young-dupre af
# leg te elektrochemische potentiaal uit( gewoon de vergelijking uitleggen), leg membraanpotentiaal uit, leg metaal/metaan-ion elektrode uit

=== 28 januari 2013 ===

# Bespreek de electrochemische potentiaal en pas dit toe op een metaal/metaalionelektrode.
# Toon aan dat een adiabatische expansie kan leiden tot mistvorming in een erlenmeyer (artikel).
# Oefening: bepaling van de molaire entropieverandering bij verwarmen en compresseren. Warmtecapaciteit bij constant volume is geggeven.
# Oefening: bereken delta H bij 1000 K van de reactie: CO + H2O -> CO2 + H2. delta H bij 298 K is gegeven, als ook de Cp's van de stoffen.

=== 25 januari 2013 ===

# bewijs: bij adiabatisch proces is p1V1^(lambda)=p2V2^(lambda)
# bespreek de rol van enthalpie en entropie bij het hydrofoob effect
# bepaling van de tempperatuursverandering bij adiabatische compressie (begin- en einddruk, begintemp gegeven)
# bepaling van delta U en delta H bij een opwarming bij constante druk (cv, massa, molaire massa en begin- en eindtemp gegeven)

=== 18 januari 2013 ===

# Toon aan dat de gemiddelde kinetische energie van een mol gas gelijk is aan 3/2 RT
# Leg uit hoe een adiabatische expansie kan leiden tot mistvorming in een erlenmeyer (vraag uit artikel).
# Oefening: entropieverandering van 298 K en 2 atm naar 233 K en 0.4 atm. Warmtecapaciteit bij constant volume is gegeven.
# Oefening: geef temperatuur en druk bij het tripelpunt van een bepaalde stof, twee vergelijkingen met p en T zijn al gegeven, je moet alleen nog maar het stelsel van twee vergelijkingen en twee onbekenden oplossen.

=== 3 feb 2012 ===

# Geef het verschil tussen een isotherme en een adiabatische expansie.
# Toon aan dat de gemiddelde kinetische energie van een mol gas gelijk is aan 3/2 RT
# Oefening: entropieverandering van 298 K en 2 atm naar 233 K en 0.4 atm
# Oefening: geef temperatuur en druk bij het tripelpunt van een bepaalde stof, twee vergelijkingen met p en T zijn al gegeven, je moet alleen nog maar het stelsel van twee vergelijkingen en twee onbekenden oplossen.

=== 27 jan 2012 ===

# Toon aan dat stoffen die de oppervlaktespanning verlagen, de neiging hebben om zich aan het oppervlak op te stapelen.
# Leg uit, elektrochemische potentiaal en pas toe op de membraanpotentiaal.
# Oefening op entropieverandering
# Bereken q, U en H bij verwarming bij constante druk.
=== 20 jan 2012 VM ===

# Bespreek osmose (bijvragen: geldt deze formule altijd, hoe aanpassen voor grotere C, hoe noem je dit?)
# Geef de formules voor de warmte, arbeid en verandering in inwendige energie voor volgende processen met ideale gassen:
#* isotherme expansie in vacuÃ¼m
#* adiabatische expansie in vacuÃ¼m
#* isotherme expansie tegen constante druk
#* adiabatisch expansie tegen constante druk
#* reversibele isotherme expansie
#* reversibele adiabatische expansie
#* (bijvraag: een stok met aan het uiteinde een stuk katoen in een omhulsel duwen (past perfect): hierna brandt het katoen, hoe verklaar je dit?)
# Oef: zie oef 3 bij oude examenvragen
# Oef: zie oef 7 bij oude examenvragen

=== 16 jan 2012 VM ===

# Geef de carnotcyclus en bespreek U, w & q bij elk proces
# Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.
# Oefening over verandering Gibbs van reactie bij 1298K als Cp, H & S van alle reagentia en producten gegeven bij 298K
# Oefening over entropieverandering van expansie (systeem, omgeving, universum) zowel a) reversibel b) irreversibel bij uitwendige druk van 0,1Atm

=== 28 jan 2011 ===

#Bespreek osmose en hoe kan je hieruit molecuulgewicht bepalen (3de keer!!!)
#Bespreek membraanpotentiaal
#IJs wordt van -10Â°C tot +10Â°C verwarmd: wat is de entropietoename van het systeem? (enthalpie en warmtecapaciteiten gegeven)
#Bereken eindtemperatuur, q, W en U van een reversibele adiabatische compressie van 28l naar 10l. (Cv = 5/2R)

=== 21 jan 2011 VM ===
# Geef de carnotcyclus en bespreek U, w & q bij elk proces
# Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.
# Oefening over verandering inwendige energie (delta U)
# Oefening over entropieverandering

=== 17 jan 2011 ===

# Bespreek osmose en leg uit hoe je hieruit molecuulgewichten kunt bekomen
# Clapeyron afleiden + toepassen op fasediagramma (m.a.w. vgl vast-> vl., vl. -> gas en vast -> gas berekenen)
# Oefening over entropieverandering
# Oefening over verandering in gibbsfunctie

=== 15 jan 2010 ===

# bespreek de adiabatische expansie
# bespreek osmose en geef een toepassing
# oefening over entropieverandering
# oefening over verandering in gibbsfunctie

=== 11 jan 2010 VM ===
# Bespreek het kinetischgasmodel en de gemiddelde Etr.
# Bespreek de electrochemische potentiaal en leg uit a.d.h.v. een metaal/metaalionelektrode.
# ?
# ?

=== 11 jan 2010 NM ===
# Toon aan met formules dat een stof die de oppervlaktespanning verlaagt de neiging heeft om zich aan het oppervlak op te stapelen.
# Bewijs dat de totale entropie voor een Carnotcyclus gelijk is aan nul.
# Entropieverandering berekenen van gas bij bepaalde gebeurtenis.
# Veranderingen in U en H berekenen bij de opwarming van een ideaal gas bij constante druk.

=== 30 jan 2009 ===
# Clapeyron afleiden+toepassen op vloeibaar-gas.
# Kookpuntverhoging.
# Adiabatische compressie van een gas met de volumes en de begin T en de Cv gegeven.
# Entropieverandering van 25 C naar 1000 C met Cv gegeven.
=== 16 jan 2009 ===
# bij mengen verandering in gibbs, entropie, enthalpie en volume
# carnot bespreken, q, W en U bij elk proces, en efficientie berekenen
# verandering in entropie berekenen wanneer een ideaal gas expandeert van 1l bij 12K naar 2l bij 24K
# verandering in enthalpie en inwendige energie berekenen van een reactie, enkele vormingsenthalpieën gegeven en een verbrandingsenthalpie, en we mochten veronderstellen dat de gassen ideaal waren
=== 21 jan 2008 ===
# clayperon+ toep. op verdampen
# kookpuntsverhoging bespreken
# adiabatische expansie 1L naar 10L, Ti = 273K, bereken eindtem Cv gegeven
# compresie van 1atm naar 2atm en verwarmen van 300k naar 1000k. Cp gegeven. bereken entropieverandering.
=== 21 jan 2008 ===
# geef de carnotcyclus en bespreek U, w & q bij elk proces
# Bespreek de membraam potentiaal
# adiabtische compressie gas (1 mol) van 48,4l naar 44,4 l en begin temp = 0Â°C. Eindtemperatuur berekenen
# entropieverandering van verwarmen gas 25Â°C-->1000Â°C. Cp gegeven
=== 18 jan 2008 ===
# druk en temperatuursafhankelijkheid van evenwichtsconstante
# isotherme en adiabatische expansie van een ideaal gas bespreken
# inwendige energie berekenen, vormingsenthalpie en temperatuur gegeven
# enthalpie en entropie berekenen van faseovergang van water bij T = 263K, H(273K) gegeven en Cp's gegeven

=== 14 jan 2008 ===
# clapeyron afleiden en toepassen op vast/vloeistof
# osmose bespreken
# vormingsenthalpie berekenen bij 125Â°C van HBr uit H2 en Br2. met de HfÂ°bij 25Â°C gegeven. bereken ook de inwendige energieverandering. (Cp ook gegeven dacht ik (iemand die nog exact weet?) )
# entropieverandering bij 1 mol ideaal gas met T1= 12K, T2= 24K en V1=1L en V2=2L. en Cv = 3/2 R
=== 14 jan 2008 ===
# twee ideale gassen, bepaal deltaG, S, H, V na mengen
# kookpuntsverhoging bespreken
# CO(g) + H20 (g) => CO2(g) + H2(g) delta H (298K) = -10 kcal. zoek delta H (1000K) Cp's gegeven
# bespreek de carnotcyclus in een STdiagramma

=== 30 aug 2008 ===
# mengen van ideale gassen, bespreek delta G, delta H, delta S, delta U en delta V
# geef q, U en W voor volgende processen met ideale gassen
#* isotherme expansie in vacuum
#* adiabatische expansie in vacuum
#* isotherme exp tegen constante druk
#* adiab exp cte P
#* reversibele isoth exp
#* rev adiab exp
# ideaal gas bij 12K en 1L, bereken delta S bij het omzetten naar 24K en 2L. C=2/3R
=== 29 jan 2007 ===
# bespreek de druk- en temperatuursafh van de evenwichtsconstante
# de henryconstante van CO2 in H2O is 1,...*10^6, die in benzeen 8,...*10^4. In welke stof is CO2 het best oplosbaar?
# Een oefening waarbij een ideaal gas van T en V veranderd. Bereken DeltaS.
=== 23 jan 2007 ===
# bespreek osmose
# oefening waar ge bij reversibele isotherme compressie U, q, H en W moet berekenen
# een ideaal gas gaat van T1->T2 en V1-> V2. Laat zien dat geldt: Delta S= Cv. ln(T2/T1)+n.R. ln(V2/V1) Cv mag onafhankelijk van de temperatuur genomen worden.
=== 20 jan 2007 ===
# Geef de afleiding voor de vergelijking van clapeyron en pas dit toe op smelten
# Geef een S-T diagramma van de Carnotcyclus
# Bereken deltaH bij 1000K, je kreeg deltaH(298), de reactie en alle Cp's

=== 19 jan 2007 ===
# het mengen van ideale gassen. Bespreek de gibs functie de entalpie, entropie, en volume verandering.
# de carnot cyclus wordt meestal weergeven in een pv-diagrama, geef hem nu weer in een TS-diagramma
=== 18 jan 2007 ===
# bewijs dat de evenwichtsconstante niet drukafhankelijk is, maar wel temperatuursafhankelijk
# bewijs volgende uitdrukking voor de entropieverandering van een gas dat van temperatuur en volume verandert:
#: deltaS = Cv*ln(T2/T1) + nR*ln(V2/V1)
Oefening:
# bereken molecuulmassa van een proteïne
# oplossing en osmotische druk gegeven, bereken ??

Gentechnologie

2025-01-11T12:30:26Z

R0940561: /* 10 januari 2025 */

[[Categorie:Bachelor Biochemie]]
[[Categorie:Bachelor Chemie]]
==Vakinformatie==
Prof Lavigne. Biochemie volgt het samen met bio-ingenieurs. Oefenzittingen verplicht (niet in 2022, door corona?). Als Lavigne een vraag stelt verwacht hij dat je elk deel van de vraag uitlegt ook al wordt het niet expliciet gevraagd. Bijvoorbeeld; geef de voor- en nadelen van PET en pPIC, dan moet je PET en pPIC volledig uitleggen.

==Examenvragen==

===10 januari 2025===
#Grote PCR vraag
#* Leg real-time PCR uit + toepassingen
#* Gevoeligheid en precisie o.b.v. welke factoren (vanaf staalbereiding)
#* leg in detail detectiemethoden uit die bijdragen aan specificiteit
#'je bent een doctoraatstudent die genfunctie wil bepalen door genoom te verstoren met insert T-DNA...'
#*Ontwerp een binaire vector, geef alle elementen dat je nodig hebt en leg uit waarvoor ze dienen
#*Hoe kan je testen dat de insertie van T-DNA gelukt is en het juiste genoom onderbroken is door T-DNA?
#kleine vragen
#* Leg inductiesysteem en eigenschappen pBAD uit
#*Exsite en GeneTailor
#*Voor-en nadelen Pichia Pastoris
#Oefening Paeshuyse gegeven: cDNA-sequentie, kozaksequentie, TAG-sequentie, stopcodons
#*Kies vectorsysteem, waarom kies je deze?
#*Maak schematische tekening van vector, benoem alle onderdelen
#*Hoe moeten de CHO cellen worden verandert opdat je DHFR kan gebruiken als merker, wat is het voordeel aan deze merker?
#*Ontwerp primers zodat cDNA wordt geamplificeerd en er aan de C-terminus een TAG hangt

===12 januari 2024===
#Grote PCR vraag
#* Leg real-time PCR uit + toepassingen
#* Gevoeligheid en precisie o.b.v. welke factoren?
#* Som probes op (in detail)
#Hypothetisch 'we doen een thesis scenario waarbij we planten willen transformeren'
#* Illustreer en explain binaire vector
#* Geef genetische transformatiemethode voor de insertie van T-DNA in plantcel
#* Geef genotyperingsstrategie om homozygote mutant te identificeren (iets met primer, idk, wilde vraag dit)
#Definities
#* Explain BAC + complexiteit kloonbib
#* Exsite - GeneTailor
#* Expressie in Pichia Pastoris: voor- en nadelen
#Oefening (vectorsysteem voor eukaryote cel)
#* Kies vectorsysteem + why?
#* Leg vector-onderdelen uit
#* Vereiste aanpassing voor gebruik SV40 ori op expressievector? Voordeel SV40 ori?
#* Primer-deel

===13 januari 2023===
#Bespreek de parameters die de betrouwbaarheid van de PCR amplificatie kunnen verhogen, inclusief PCR-afgeleide technieken en detectiemethoden die bij real-time PCR zorgen voor gevoeligere en preciezere detectie
#Bespreek in detail twee methoden om vreemd DNA binnen te brengen in plantencellen, en geef voor elke methode ook minstens 2 voordelen en nadelen (nieuwe prof sinds dit academiejaar voor het hoofdstuk over planten)
#Definities
#*BAC vector en de complexiteit van bank die werd aangemaakt via deze vector
#*Exsite methode en genetailor methode
#*Gebruik van URA gen als positieve en negatieve selectiemerker
# Je wil bepaald eiwit tot expressie brengen in CHO cellen m.b.v. een eukaryoot expressie systeem (geen gist of schimmel).
#* welk expressie systeem gebruik je? beargumenteer je keuze.
#* Teken de vector en verklaar alle factoren die je gebruikt.
#* Wat moet je veranderen aan de CHO cellen om de SV40 ori te kunnen gebruiken? wat is het voordeel van deze ori op replicatie?
#* Teken de primers uit voor de amplificatie van het gen (volledige sequentie geven, kozak sequentie geven, stopcodon gegeven),en er moest ook een tag (sequentie gegeven) gehangen worden aan het 3'-uiteinde

===9 september 2022===
# Grote theorievraag kwam van Paeshuyse (!): sequentie was gegeven en dit moest tot expressie gebracht worden in dierlijke cellen
#* Beargumenteer welk expressiesysteem je gebruikt en waarom
#* Teken de expressievector en benoem alle onderdelen
#* Welke modificatie moet je doen bij CHO cellen om DHFR merker te gebruiken en wat is het voordeel van deze merker
#* Doe hetzelfde maar dan in een plantencel, wat moet je veranderen? En teken de vector opnieuw met alle componenten
# Een vector gegeven en alle onderdelen bespreken (2µm, colE1, bla, URA3, MBD, HIS6, factor X, Pgal1, CYC tt en restrictie-enzymen). Waarvoor zou je deze vector gebruiken?
# Definities
#* Bespreek de eigenschappen van cosmidevectoren en hoe je hiermee kloonbanken maakt
#* Mutagenese via prone-PCR
#* CTAB methode voor isolatie van plant DNA
# Oefening van Lavigne (!): 2 exonen met sequenties waren gegeven, ook een tag met sequentie was gegeven. De bedoeling was om tag-exon1-exon2 te kloneren in een TOPO-T/A vector. Bespreek alle stappen van de klonering en beargumenteer.

===14 januari 2022===
# Parameters die de betrouwbaarheid van amplificatie door middel van PCR verhogen. Ook de PCR afgeleide technieken die de gevoeligheid voor nucleïnezuurdetectie kunnen verhogen. (- Wat moet je antwoorden als PCR afgeleide technieken (er moeten nog technieken zijn!)? Gradient PCR, Emulsie PCR, RT PCR met een onderscheid tussen Taqman en de andere techniek, ... - Wat hoort er nog bij? formules voor efficientie, proofreading uitleggen, saturatiecurves, ...)
# Een vector gegeven en alle onderdelen bespreken (2µm, ColE1, Zeo, Strep, MBD, factor X). Waarvoor zou je deze vector gebruiken?
# Definieer alle elementen van BAC en hoe wordt dit gebruikt bij kloonbanken?
# Wat zijn de principes van Exsite en GeneTailor?
# Hoe werkt heat shock bij S. cerevisiae en wat zijn de componenten die hiervoor nodig zijn?
# Paeshuyse: Een sequentie van een nanobody gegeven en je wilt hiervan een fusieproteïne maken dat een His-tag bevat aan het 5' uiteinde. Teken de primers die hiervoor nodig zijn (kozak sequentie gegeven, restrictie-sites gegeven, sequentie voor de his-tag gegeven en de nanobody sequentie gegeven. Hoe zou je dit implementeren in een eukaryoot? Teken de expressievector en expressiecassette. Wat is er nodig voor implementatie in een plant en waarom? Teken de expressievector en de expressiecassette.

===6 januari 2021===
# Parameters die uw betrouwbaarheid van PCR amplificatie verlagen, met betrekking tot mutagenese (random & gerichte pcr-methodes)
# Een vector gegeven en alle onderdelen bespreken (HIS4, colE1, bla gen, aox1, MCS) voor wat zou je deze vector gebruiken?
# Hoe maak je een random DNA bank met cosmidevectors?
# definties
#* Alkalische lyse
#* CAPture techniek
#* taqmanprobe real time PCR
#paeshuyse: gelijka andere jaren

===28 augustus 2020===
# Leg PET en pBAD expressiesystemen uit. Vergelijk ze en wat zijn de voor- en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (Geen paginalimiet)
# Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)
#* Leg cosmide vectoren uit en hoe kloonbanken worden gemaakt.
#* CTAB methode
#* Chemische ‘heat shock’ transformatie van S. cerevisiae uitleggen
# Paeshuyse: ongeveer zoals in januari maar met SARS-Co2.

===22 januari 2020 ===
# Leg PET en pPIC expressiesystemen uit. Vergelijk ze en wat zijn de voor- en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
# Leg BAC vectoren in detail uit en hoe maak je een kloonbank aan de hand van deze vectoren. Hoe bereken je het minimum aantal klonen die nodig zijn om een representatieve genoombank te hebben met de formule van Carbon en Clarke, welke voorwaarden moeten hiervoor voldaan zijn? (1 pagina + eventueel achterkant)
# Geef de PCR parameters en PCR varianten die de specificiteit van PCR amplificatie verhogen. Leg telkens kort uit. (1 pagina + eventueel achterkant)
# Definities (1/3e pagina voor elk)
#* Leg gatewayclonering uit, werking en principe geven.
#* Transposonmutagenese uitleggen en hoe dit gescreend wordt?
#* Leg uit hoe men gisten chemisch transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.
# paeshuyse: humaan interferon lambda wil je produceren in een eukaryoot systeem. RNA sequentie is gegeven.
#* Welke gebruik je en beargumenteer.
#* Hoe ziet je vector en expressiecassette eruit? Benoem elke component + korte uitleg.
#* Teken primers met gegeven RE sites (Bamh1 & EcoR1) om de CDS in een vector te kloneren. Kozak sequentie ook gegeven.
#* Welke wijzigingen zijn nodig om dit gen in een plantenvector te kloneren? Teken de vector en de expressiecassette.

===30 augustus 2019 ===
#Bespreek de factoren van een PCR die de gevoeligheid kunnen verhogen. Ook de PCR afgeleidde technieken die de gevoeligheid voor nucleïnezuurdetectie kunnen verhogen.
#Bespreek het PET expressie systeem in E. coli, geef ook de voor en nadelen van expressie in deze bacterie.
#(Paashuyse) Je wil Anti-IgE produceren in CHO cellen m.b.v. een eukaryoot expressie systeem (geen gist of schimmel).
#* welk expressie systeem gebruik je? beargumenteer.
#* Teken de vector en verklaar alle factoren die je gebruikt.
#* Wat moet je veranderen aan de CHO cellen om de SV40 ori te kunnen gebruiken? wat is het voordeel van deze ori op replicatie.
#* Als je anti-IgE in planten cellen zou willen produceren, hoe ziet de vector er dan uit? leg alle factoren uit.
#Leg uit:
#* Definieer alles van BAC's
#* Gateway klonering
#* Capture techniek voor full length cDNA klonering
#Oefening: 2 exonen met sequentie waren gegeven, ook een tag met sequentie was gegeven. De bedoeling was om tag-exon1-exon2 te kloneren in een TOPO-T/A vector. Bespreek alle stappen van de klonering en beargumenteer.

===23 Januari 2019 ===
# Welke parameters hebben een negatieve invloed op PCR in verband met mutagenese (geef hierbij ook PCR-gebaseerde technieken van random/directe mutagenese zoals mismatch priming, error-prone PCR..)
# Vergelijk cosmide en BAC klonering en hoe bepaal je de complexiteit van genoombank (carbon clark)
# (Paashuyse): Klonering van een bepaald eiwit in rat cellen
#* A. Leg expressiesysteem uit
#* B. Teken vector en benoem/verklaar alle factoren die je gebruikt
#* c. Wat moet je veranderen aan de rat cellen om SV40 ori te kunnen gebruiken? en bespreek het effect op de replicatie
#* d. Doe hetzelfde maar dan in een planten cel, wat moet je veranderen? En teken de vector opnieuw met alle componenten
# Geef uitleg over
#* Taqman probe
#* CTAB methode
#* PET
# Oefening waarbij je een ori moest insereren in DNA, dit moest in frame zitten, de RE sites waren gegeven, bespreek je techniek en teken PCR primers die je hiervoor zou gebruiken

===31 Augustus 2018 ===
# Leg PET en pPIC expressiesystemen uit.Vergelijk ze en wat zijn de voor en nadelen? Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
#
#* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)
#* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Hoe bereken je het minimum aantal klonen met de formule van Carbon en Clarke en welke voorwaarden moeten voldoen zijn? (1 bladzijde)
# Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip):
#* A. Alkalische Lyse
#* B. Wat is de definitie van Hybrid Selected Translation?
#* C. Leg uit hoe men gisten transformeert en wat de benodigde commponenten zijn.
# Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)
#* a. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.
#* b. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.

===24 januari 2018 ===
# Leg PET en pBAD expressiesystemen uit. Welke parameters zijn er nog belangrijk bij de recombinante expressie? (geen paginalimiet)
#
#* A. Geef de PCR parameters (en PCR varianten) die de specificiteit verhogen. Leg kort telkens kort uit. (1 bladzijde)
#* B. Bespreek in detail hoe cosmidebanken gemaakt worden. Geef ook uitleg bij Carbon & Clarke. (1 bladzijde)
# Geef definities/uitleg voor volgende begrippen (1/3e van een blad antwoordruimte per begrip):
#* A. CAPture techniek bij cDNA aanmaak
#* B. Taqman RT-PCR
#* C. Nodige elementen voor een episomaal shuttle-plasmide voor ''E. Coli'' en ''S. cerevesiae''
# Deel Prof. J. Paeshuyse. Gegeven: sequentie van insert, knipplaatsen die niet in het insert knippen (met bijhorende sequentie) en een pENTR-vector met alle elementen (en knipplaatsen)
#* A. Geef strategie (maak primers, staarten, restrictie) om uw insert in de entry-vector te krijgen.
#* B. Welk eukaryoot expressiesysteem gebruik je en verklaar je keuze.
#* C. Teken eukaryote expressievector en verklaar alle gebruikte elementen.

===1 september 2017 VM===
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef PCR afgeleide technieken voor nucleïnezuren.
# Bespreek in detail en vergelijk het mechanisme van P1 en cosmide vectoren.
# Bespreek de werking en schets het principe van PET-expressie systeem. Wat zijn de voor- en nadelen?
# Kort omschrijven
#* Definieer en bespreek CAPture techniek werking
#* Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#* Bespreek het principe van Gateway klonering.
# Vraag Paeshuyse (oefening in verwerkt): allerlei gegevens (cDNA, knipplaatsen e.d.)
#* Welke eukaryoot expressies systeem (geen schimmel of gist) zou jij gebruiken (voor dit humaan recombinant eiwit)? Beargumenteer.
#* Teken de vector enzo.. (?)

===25 januari 2017 VM===
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid
# Bespreek de BAC clonering voor de aanmaak van banken.
# Wat zijn de voordelen van recombinante expressie in gist? Vector pPIC wordt veel gebruikt in de industrie. Bespreek pPIC.
# Kort omschrijven
#*DNA shuffeling
#*CAPture techniek werking
#*Principe van TOPO-gemedieerde klonering
#oefening: Gegevens over enzymen, genoom van 1,6*^10-4, enzym knipt in 1 à 2 kb fragmenten, foto van gelleke. Hoeveel recombinante moet je hebben om met 99% zekerheid te zeggen dat je sequentie aanwezig is? Nog een vraag. (Rekenmachine nodig!)
#Vraag Paeshuyse: Creëer een humaan, recombinant faag lambda ding (?) Welk expressiesysteem zou je gebruiken? Teken de vector die je gebruikt. Nog iets...

===januari 2016===
# Met welke factoren kun je de nauwkeurigheid van een PCR-reactie verbeteren en geef afgeleide technieken met een hogere nauwkeurigheid
# Voordelen van recombinante expressie in gist, leg die ene gistvector uit (pPIC heette die dacht ik?)
#Strategie voor het opstellen van een cosmidebank
# Termen: CTAB DNA extractie, Taqman, manieren van transformatie van gist
# Oefening met inverse PCR: vinden van primers en uittekenen van de techniek
Volckaert:
# Relatie Tm/zoutconcentratie (monovalente kationen)
# De factoren die de renaturatie beinvloeden + verschil in gebruik van PNA, LNA en DNA als proben
# Geef structuur van guanidinium isothiocyanaat en guanidinium thiocyanaat, waarvoor wordt dit molecule gebruikt
# structuur van merker gegeven, leg uit waar onderdelen voor bedoeld zijn en benoem ze

===20 januari 2015===
#Bespreek en vergelijk de verschillende PCR technieken voor zowel gerichte als random mutagenese.
#Bespreek in detail het mechanisme van P1 faag en een cosmide en vergelijk.
#Bespreek en schematiseer het principe van de capillaire Sanger sequentie.
#Kleine vraagjes:
##Belang van humanisering bijÂ Philia pastoris
##Definieer de CAPture techniek
##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#Oefening: Je moet 2 exons (sequenties gegeven) van een bepaald gen aan elkaar ligeren (zonder een linker tussen). En deze C-terminaal aan een â€˜Strepâ€™-tag hangen (sequentie gegeven) en deze inbrengen in een vector die T-overhang heeft door TOPO. (verschillende stappen bespreken + primers geven!) (praktisch dezelfde oefening als de voorbije 2 jaar in januari)
Volckaert 1. Geef de structuurformule van guanidinium (iso)thiocyanaat en waar het voor wordt gebruikt. 2. Leg chemische synthese van oligonucleotiden met een 5â€™ fosfaat uit (of teken) + geef voordeel hiervan. 3. Leg uit hoe DNA probes niet-radioactief gelabeld (en eventueel onder welke voorwaarden) kunnen worden met behulp van een streptavidine-alkalisch fosfatase fusie-eiwit 4a. T4 polynucleotide kinase werd vroeger gebruikt om uiteinden te fosforyleren zodat fragmenten geligeerd kunnen worden. Nu kan dit direct gebeuren bij de oligonucleotide synthese. Hoe doen ze dit? Bespreek (en of teken) dit. 4b. Wat is het voordeel hiervan? 5. Bespreek de relatieve Tm van DNA en LNA met betrekking tot hun gebruik in hybridisatie en mismatchgevoeligheid.

=== 21 januari 2014 ===
#Bespreek algemeen principe van PCR en de reactiecomponenten. Bespreek afgeleide technieken die gebruikt worden om de specificiteit van de PCR-reactie te verhogen. (onbeperkte antwoordruimte)
#Bespreek achtergrond en werking van cosmide (1pag)
##Bespreek en vergelijk pET en pBAD (1pag)
#Korte vraagjes: Lavigne
##Bespreek CAPture techniek
##Bespreek de elementen die een YAC-kloneringsvector bevat. Bespreek Gateway klonering

=== 22 januari 2013 ===
#Bespreek vectorsystemen voor het insereren van grote (>30kb) DNA-sequenties. Bespreek de formule van Carbon & Clarke.
#Technieken: Okayama & Berg SAGE
#Kleine vragen (Lavigne):
##Wat is error-prone PCR en hoe kan je het gebruiken in "directed evolution"?
##Bespreek en schets het PET-expressie systeem.
##Hoe kunnen we de URA3 merker gebruiken voor positieve en negatieve selectie?
#SitueerÂ ???,Â ??? enÂ ??? in de historiek van de gentechnologie. Het rspL gen was Ã©Ã©n van de eerste genen die gebruikt werd voor positieve selectie. Leg uit waarvoor dit gen codeert en hoe de selectie gebeurt. Oefening: Sequentie met exons en introns gegeven. Ontwerp een techniek om de eerste twee exons aan elkaar te ligeren en in te bouwen in de gegeven vector (TOPO T/A vector), met een N-terminale STREP-tag (sequentie voor de STREP-tag was gegeven). Beschrijf en verantwoord elke stap.

===6 augustus 2012===
Â #Kunkel tot in detail bespreken Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli. Is dit hetzelfde bij de afgeleide vectors van ColE1? (pBR322,...)
#twee vraagjes Carbon en Clarke RAcE schetsen en uitleggen (beide)
#kleine vraagjes:
##Bespreek COS-cellen URA3 (waarom belangrijke merker)
##Inclusion bodies (wat, wanneer, gewenst?)
##Duid het juiste aan: de zoutconcentratie doet Tm stijgen/dalen/beÃ¯nvloedt Tm niet + uitleggen waarom.
##synthesevraag: biotine-merking bij nucleÃ¯nezuurhybridisatie, alles uitleggen (hoe probe maken, hybridisatie, detectie)

===23 Jan 2012 NM===
#Kunkel Schets replicatie- en regulatie mechanisme van ColE1 in E. coli
#Bespreek de mogelijke kloneringsvectoren in gist
#Kleine vragen:
##Co-transformatie bij dieren
##Bespreek doel van de technieken: oligocapping en capture
##Hot-start PCR Chromosome jumping

===31 Jan 2011 NM===
#Bespreek de filamentaire fagen(M13, F1,...), hun eigenschappen, hun replicatie in E.coli en hoe zijn ze aangepast voor het gebruik als vectoren.
#Bespreek het pMAL expressiesysteem voor de synthese van eiwitten via recombinanten.
#Bijvragen:
##Hoe kan je het nodige aantal klonen bepalen voor een goede genoombank
##Bespreek die PiAN vectoren Kleine vragen:
##Wat is de N-regel van Varshavsky COSvectoren
##Wat is Spi-selectie Waarvoor dient Capping bij de synthese van oligonucleotiden?
#Mondeling: cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman Methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese Hoe wordt de smelttemperatuur bepaalt SAGE

===17 Jan 2011 VM===
#Fosforamidietcyclus (cyclus, beschermgroepen, capping,...)
#Welke problemen bij aanmaken van cosmide vectoren en welke oplossingen hiervoor?
#Bijvragen:
##Okayama & Berg
##cDNA klonering in een vector Methode van Henikoff voor systematische deleties
#Kleine vragen
##IPTG sacB
##Carbon & Clarke vgl. (aantal klonen in een cDNA bank)
##Guanidiniumzouten
#Mondeling: pMal expressiesystemen Kunkel Eckstein Pyrosequencing SOE

===17 Jan 2011 VM===
#Aanmaak genoombanken soorten gistvectoren
#Bijvragen:
##fotolithografische DNA synthese alkalische fosfatasen + toepassingen
#Kleine vragen
##'hotstart' PCR Guanidinium thiocyanide biotine merking bij hybridisatie
##URA3 Modeling: pyrosequencing
##Methode van Eckstein CAPture SOE pMAL

===23 aug 2010 VM===
#pyrosequencing soorten faag lambda vectoren Bijvragen: methode van Gubler en Hoffman chromosoomwalking
#Kleine vragen:
##nested PCR capping in fosforamidietcyclus hoe het aantal klonen in een cDNA bank benaderen
##PNA Modeling: methode van Okyama en Berg
##biotine merking bij hybridisatie alkalische hydrolyse van RNA Spi selectie pMAL

===26 jan 2010 VM===
#Bespreek cosmide vectoren en hoe ze efficient te gebruiken zijn.
#Leg de methode van Hoffman en Gubler voor cDNA synthese uit.
#Bijvragen:
##Welke vectorsystemen voor gist zijn er beschikbaar?
##Leg de pSC101 ori uit.
#Kleine vragen:
##Oclusion body's: wat, wanneer, nut?
##CI gen: wat en waarvoor gebruikt in de gentechnologie?
##Universele splicing van ssDNA met fokI.
##Modeling: Fosforamidiet versus fosfonaat methode.
##EtBr en SYBR.
##Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese.
##Biotine merking.
##ZOO blot.

===25 jan 2010 VM===
#Bespreek de aanmaak van genoombanken (vectoren, inbouwmechanismen, enz.)
#Bespreek de methode van Kunkel voor plaatsgerichte mutagenese.
#Bijvragen:
##Welke vectoren voor klonering in gist?
##Wat zijn positieve en negatieve selectie voor klonering en geef voorbeelden.
#Kleine vragen:
##Nested PCR uitleggen.
##T4 en T7 zijn beide bacteriofaag polymerasen.
##Bespreek hun activiteit(en) en toepassingen.
##Type1, type2, type3, type2s, iso en neochizomeren, waarin verschillen deze restrictie enzymen?
##Hoeveel kloonen nodig in een genoom bank?
#Mondeling: Okyama en berg Spi selectie Alkalische hydrolyse van RNA pMAL
#Hoe wordt biotine gebruikt bij hybridisatie

===25 jan 2010 VM===
#Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering, detailleer elke reactiestap.
#Bijvragen:
##Fosforamidiet synthesecyclus
##Welke soorten alkalische fosfatase gebruiken we in de gentechnologie?
##Schets hun gebruik.
#Kleine vragen:
##Lamba ZAP vector
##Aan- en afwezigheid van rop in colE1-afgeleide plasmide en de invloed ervan op aantal plasmide in E.coli.
##Aantal kloons in een genoombank.
##Nested PCR Mondeling: pMAL expressiesysteem
##Pyrosequencing RDA Ligatiemechanisme Eckstein

===14 jan 2010===
#Geef de belangrijkste biologische functies van de filamentaire faag vectoren en hoe deze gebruikt werden om vectoren mee te maken.Welke soorten faag lambda vectoren zijn er en schets kort hun gebruik
#Bijvragen:
##cDNA synthese volgens Gubler en Hoffman.
##Detailleer elke reactiestap.
##Wat is chromosome walking en hoe werkt het.
#Kleine vragen:
##Wat is en waarvoor dient de capping bij de synthese van oligonucleotiden.
##Exonuclease III
##Hoe bepalen we het aantal kloons dat nodig is bij het opstellen van een genoombank.
##Inverse PCR Mondeling: pMal
##LCR Puntmutaties volgens Eckstein Mu-2 gistvector
##Pyrosequencing

===30 jan 2009===
#fosforamidiet synthesecyclus geven problemen klonering met cosmidevectoren + oplossingen
#Bijvragen:
##okyama en berg progressieve deleties met exonuclease III
#Kleine vragenÂ :
##IPTG sacB carbon en clarke vgl rol guanidinimun zouten + structuur
#Mondeling: RDA pyrosequencing eckstein pMal lambda zap

===30 jan 2009===
#Soorten Bacteriofaag lamda vectoren pET expressie vector systeem
#Bijvragen
##Pyrosequencing Gubler-Hoffman cDNA synthese
# Kleine vragen
##Tm voor oligonucleotiden sacB en toepassing in Gentechnolgie Statistische benadering genoom insertie PNA + structuur
#Mondeling: inverse PCR Eckstein RDA SOE CAPture

===27 jan 2009Â ===
#replicatiemechanisme, regulatie en aantal kopieÃ«n ColE1-afgeleide vectoren Soorten bacteriofaag lambda vectoren en hun werking schetsen
#Bijvragen:
##cDNA klonering (Gubler & Hoffman, Okayama & Berg)
##chromosoom walking
#Kleine vragen:
##inverse PCR Tth DNA polymerase (wat speciaal en welke extra mogelijkheden daardoor)
##capping in fosforamidiet, wat en waarom
##hoe bereken je aantal kloons in genomische DNA bank exonuclease III
#Mondeling: SOE SAGE pMAL plaatsgerichte mutagenese volgens Kunkel pyrosequencing

===24 jan 2008===
#Bespreek het replicatiemechanisme van ColE1- en afgeleide vectoren, de regulatie en het aantal plasmiden
#Bespreek methoden om gen-gericht een genomische bank te screenen aan de hand van 'informatie'
#Geef twee technieken voor positieve selectie van plasmiden
#Geef de methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese
#Kleine vragen
##Hoe kan de het cI gen voor positieve selectie zorgen?
##Wat is een moleculair baken ('molecular beacon')?
##Bespreek de twee soorten SV40 vectoren en het verschil Touch-down PCR
##Hoe kunnen we er voor zorgen dat er geselecteerd wordt op de mogelijkheid om te transformeren (of zo)?
#Technieken: Pyrosequencing pET SOE Okyama-Berg ligatiemechanisme

===23 jan 2008===
#Fotolithografische DNA synhtese: bescrhijf en verklaar.
#Okayama en Berg procedure voor cDNA klonering: wat zijn de voor/ nadelen?
#Middelgrote vragen:
##Welke problemen zijn er bij het kloneren in cosmidevectoren en hoe hebben ze dit opgelost?
##Pyrosequencing: beschrijf, wat zijn voor/nadelen tov dideoxymethode
#Kleine vragen:
##Wat is IPTG: structuur, gebruik
##Wat is de par locus
##Wat is PNA: structuur
##Wat is T4 polynucleotide kinase, waarom is dit belangrijk in gentechnologie, reactiemechanisme?
#Technieken: SOE CAPture EtBr pMAL Eckstein

===14 jan 2008===
#Welke mogelijkheden zijn er om plaatsgerichte mutagenese te doen?
#Vertel alles over LITMUS vectoren (Waarom in godsnaam is dit een hoofdvraag?)
#Bijvragen:
##Welke problemen kunnen er zijn bij het kloneren in cosmidevectoren?
##Hoe hebben ze die omzeild? Schets de Okyama-Berg procedure.
##Wat zijn de voor- en nadelen?
#Bij-bijvragen:
##Hoe is sacB een positief selectiekenmerk?
##Waarvoor staat spi selectie?
##Geef de 2 soorten SV40 vectoren + leg het verschil uit waarom worden er andere Tm-uitdrukkingen gebruikt voor oligonucleotiden en hele strengen?
#Mondeling: RDA Pyrosequencing inteÃ¯ne verwerking inverse PCR cap selectie

===31 jan 2007===
#alles van cosmiden bespreken. alles van SV40 bespreken.
#Middelgrote vragen:
##pyrosequencing
##cassettemutagenese
#Kleine vragen:
##verschil southern en western blotting
##ethidiumbromide, structuur, problemen,
##gebruik Spi selectie inverse PCR
##wat is shearing
#Technieken: Formule om het aantal klones te berekenen voor gDNA bank Oligocapping SOE ligatiemechanisme Eckstein Okayama en Berg

===23 jan 2007===
#bespreek belangrijkste methoden voor site directed mutagenese bespreek replicatiemechanisme in pBR322
#welke verschillende strategien worden gebruikt met op lambda gebaseerde vectoren technieken met Ti vectoren
#Mondeling: nested PCR quenching hoe beinvloed de DNA concentratie het werken met cosmiden en verklaar

===19 jan 2007===
#Geef en bespreek enkele voorbeelden van het gebruik van alkalische fosfatasen.
#Bespreek de eigenchappen en kenmerken van de pUC vectoren.
#Vectoren afgeleid van bacteriofaag lambda.
#SV40 vectoren.
#Kleine vragen:
##Genotype van een E.Coli stam opdat deze geÃ¯nfecteerd kan worden door M13.
##Bespreek incompatibiliteit van plasmiden.
#Mondeling voor te stellen technieken: SOE Pyrosequencing Methode van Eckstein voor plaatsgerichte mutagenese Nick translatie<