Biomoleculaire Kinetica en Thermodynamica

Vakinformatie

Nieuw vak vanaf 2025-2026, gegeven door Thiery Verbiest en Hideaki Mizuno. Het vak wordt in twee delen gegeven, zes lessen door Verbiest en vijf door Mizuno. Verbiest geeft thermodynamica en aan het einde van elk hoofdstuk vind je mogelijke examenvragen. Deze zijn ook de examenvragen die hij vraagt. Mizuno geeft kinetica en geeft geen examenvragen. Je moet op beide delen door zijn om het vak te kunnen slagen.

Examenvragen

11 juni 2026

Deel Thierry Verbiest

1. Beschouw 2 niet-mengbare vloeistoffen die beiden een opgeloste stof A bevatten. Stel een formule op voor de verdelingscoëfficiënt van de opgeloste stof tussen de twee vloeistoffen. (Hoofdstuk 2)
2. Bereken de pH van een 1M HCl oplossing gebruik makende van activiteiten (Davies vgl.). Toon aan dat je berekende waarde afwijkt van de pH berekend met concentraties. Verklaar. (Hoofdstuk 3)
3. Wat is circulair dichroïsme (werkingsprincipe) en hoe kan je dit gebruiken bij de studie van eiwitten? Zou je CD ook kunnen gebruiken bij de studie van DNA? (Hoofdstuk 4)
4. Waar of niet waar? (Hoofdstuk 6)
   1. Osmose en diffusie zijn hetzelfde.
   2. Osmose hangt af van de aarde van de opgeloste stof.
   3. Via vriespuntverlaging kan je in principe ook molecuulmassa's bepalen.

Deel Hideaki Mizuno

1. High-energy electrons are used by the electron-transport chain to generate a proton gradient across the inner mitochondrial membrane (IMM).
   1. How can the IMM have a strong proton motive force?
   2. How do protons rotate F0?
   3. Why is the rotation of F1 necessary to generate ATP?
   4. What is the role of the crista on the IMM? How does Cristae increase ATP synthase?
2. ATP is used in many reactions as an energy source in living systems. Why is ATP hydrolysis considered high-energy? Why does the cell keep the ATP/ADP ratio far above the equilibrium?
3. NAD+ and FAD are reduced electron carriers for activated electrons. Explain, based on their chemical structure, how these electron carriers work. Biochemically, NAD+ can only oxidise an alcohol to a ketone, and not an alkane to an alkene? Explain.