Medische Biotechnologie

Vakinformatie

Nieuw vak vanaf 2024-2025. Dit vak wordt gegeven door 3 proffen: Chris Van Den Haute (CVH), Rik Gijsbers en Marianne Carlon. Ze gaven 11 lessen + 2 lessen waarin ze alle leerstof toepasten. Het examen is grotendeels mondeling. De termen leg je alleen schriftelijk uit, maar de open vragen leg je mondeling uit bij de prof die de vraag heeft opgesteld. We kregen elk 2 volledige examens op 20 punten, 1 van CVH en 1 van Gijsbergs en als je mondeling ging afnemen bij één van de 2 proffen moest je hele examen van die prof al af zijn.

Examenvragen

24 juni 2026 (10u00)

1. 8 termen schriftelijk (elk begrip op 1.5)

• 2A
• Niet functionele titratie
• VSV-G
• Figuur met verschillende kleur technieken samen toegepast
• Cre-lox systeem
• Prime editor
• Wat is matrigel en waarom is het belangerijk bij organoïde
• Nog eentje

2. Gijsbers mondeling (12 pt)

Er is een nieuwe variant SARSCoV_12K RNA virus opgedoken met een goed spike eiwit, je vraagt je af of je dit virus kan gebruiken als virale vector om CF aan te pakken en meer succesvol tot in de longcellen te komen. Je werkt in een labo en hebt je virale vectoren die je normaal gebruikt ter beschikbaar + al het materiaal dat je zou nodig hebben. Je hebt het nieuwe SARS virus in een neusswab ook ter beschikking. Hoe ga je te werk?

• Hoe ga je te werk?
• Welk model gebruik je om vectoren te bestuderen?
• ...
• Bijvragen
  • Specifiek over RNA opzuivering

3. Van Den Haute mondeling (12 pt)

Stamboom gegeven: 2 ouders (75 en 70) – 3 kinderen, 1 zoon (39) heeft dezelfde puntmutatie als de mama. De moeder heeft symptomen van een aandoening door neuronen die afsterven en de zoon begint hetzelfde te vertonen. Punt mutatie: CAC (His) -> CAA (Gln). We willen dit ziektebeeld nabootsen in een rodent model. We kennen het hele genoom van de personen. De gensequentie van het humane gen is dezelfde bij de rodents. Hoe ga je dit doen? Welke methode gebruik je? Leg uit. Geef voordelen van je werkwijze. Geef nadelen. Zijn er alternatieve manieren?

• Wat is er gebeurt, uitleggen wat je ziet?
• Welke strategie hiervoor gebruiken?
• Leg techniek uit
• Voordeel/ nadeel
• Andere alternatieven
• Bijvragen
  • Wat is een chimere muis?
  • Wat als ik je een chimere muis geef hoe weet je dat het chimeer is?
  • Waarom thymidine kinase gebruikt?
  • Als alternatieve methode CRISPR?
  • Brengt meestal mutatie in beide allelen? Wat als we dat niet willen?
  • Je kan die homozygoot kruisen met wildtype om zo terug een heterozygoot te bekomen
  • Bevat elke bruine muis de mutatie?

4. Carlon schriftelijk (12 pt)

• Figuur gegeven, mechanisme van CRISPR in natuur
• Je moest beschrijven/aanduiden/ tekenen als je wou. Welke mechanisme is weegegeven? Leg uit de mechanisme.

23 juni 2026 (NM)

1. 8 termen schriftelijk (elk begrip op 1.5)

• Insertionele mutagenese
• GVDH
• IRES+ wanneer gebruikt men dit?
• Conditionele knock down
• Wat weet je over Dolly?
• Figuur van gelelektroforese (leek op WT, mutatie, heterozygoot)
• Wat is Wnt + waarom gebruikt?
• Welke elementen zorgen voor specificiteit bij CRISPR systeem?

2. Gijsbers mondeling (12 pt)

CTNS eiwit is gekend om een deletie van 57 kb in spierweefsel etc. Het ontbreken van het CTNS eiwit zorgt voor opstapeling van cystine. Er is een casestudie die wil onderzoeken of W259R (geen idee op welke positie het was) of deze mutatie ook een gelijkaardig effect heeft. We krijgen voorlopercellen van spiercellen; (1) WT/WT gezond (2) del57/WT (3) 57/57.

• Welk celmodel gebruik je om de mutatie W259R te bestuderen?
• Hoe ziet het fenotype eruit? (dood eiwit, niet gevouwen, niet stabiel, verkeerd gevouwen)
• Bijvragen
  • In welke vorm komt het DNA dat je besteld bij de firma?
  • Wat als je lentivirale injecteert met 1 wildtype: dan kan het de cystine opstapeling verminderen?

3. Van Den Haute mondeling

Stamboom gegeven: 2 ouders (75 en 70) – 3 kinderen, 1 zoon (39) heeft dezelfde puntmutatie als de mama. De moeder heeft symptomen van een aandoening door neuronen die afsterven en de zoon begint hetzelfde te vertonen. Punt mutatie: CAC (His) -> CAA (Gln). We willen dit ziektebeeld nabootsen in een rodent model. We kennen het hele genoom van de personen. De gensequentie van het humane gen is dezelfde bij de rodents. Hoe ga je dit doen? Welke methode gebruik je? Leg uit. Geef voordelen van je werkwijze. Geef nadelen. Zijn er alternatieve manieren?

• Wat is er gebeurt, uitleggen wat je ziet?
• Welke strategie hiervoor gebruiken?
• Leg techniek uit
• Voordeel/ nadeel
• Andere alternatieven
• Bijvragen
  • Wat is een chimere muis?
  • Wat als ik je een chimere muis geef hoe weet je dat het chimeer is?
  • Waarom thymidine kinase gebruikt?
  • Als alternatieve methode CRISPR?
  • Brengt meestal mutatie in beide allelen? Wat als we dat niet willen?
  • Je kan die homozygoot kruisen met wildtype om zo terug een heterozygoot te bekomen
  • Bevat elke bruine muis de mutatie?

4. Carlon mondeling

• Figuur gegeven
• Je moest beschrijven/aanduiden/ tekenen als je wou. Hoe is dit gerelateerd aan organoïdekweek?Waarvan worden organoïden gemaakt? Welke ECM-gel gebruiken we meestal voor zo een modellen? Waar is de apicale en basale zijde op de tekening.

25 juni 2025

Chris Van Den Haute: 10 termen

• CreloxP systeem uitleggen
• Verschil miRNA en shRNA
• Afbeelding alfasynnucleotide vs GFAM en mixed -> wat zie je en waarvoor dient het
• Hoe maak je een pseudopregnant vrouwtje
• Conditionele knockdown + 2 voorbeelden van wanneer je het zou gebruiken
• Wat is YAC en waarvoor wordt het gebruikt
• Wat is TK en wanneer zit het in DNA?
• Verschil chimeer en mozaicisme
• Ook een techniek afgebeeld ( DNA- RNA- proteinen) maar die afbeelding zagen we niet dus de vraag werd geschrapt.
• Waarvoor staan NHEJ en HDR

Open vraag (mondeling):

• Stamboom gegeven: 2 ouders (75 en 70) – 3 kinderen, 1 zoon (39) heeft dezelfde puntmutatie als de mama. De moeder heeft symptomen van een aandoening door neuronen die afsterven en de zoon begint hetzelfde te vertonen. Punt mutatie: CAC (His) -> CAA (Gln). We willen dit ziektebeeld nabootsen in een rodent model. We kennen het hele genoom van de personen. De gensequentie van het humane gen is dezelfde bij de rodents. Hoe ga je dit doen? Welke methode gebruik je? Leg uit. Geef voordelen van je werkwijze. Geef nadelen. Zijn er alternatieve manieren?

Rik Gijsbers: 4 termen

• DeltaF508
• EMA
• Base editor
• Codon optimalisatie

1. Leg uit rAAVs -> waarvoor staat het, wat doet het, hoe kan je ze in plasmiden brengen en opzuiveren…
2. Er is een nieuwe variant SARSCoV_12K RNA virus opgedoken met een goed spike eiwit, je vraagt je af of je dit virus kan gebruiken als virale vector om CF aan te pakken en meer succesvol tot in de longcellen te komen. Je werkt in een labo en hebt je virale vectoren die je normaal gebruikt ter beschikbaar + al het materiaal dat je zou nodig hebben. Je hebt het nieuwe SARS virus in een neusswab ook ter beschikking. Hoe ga je te werk?

24 juni 2025

Chris Van Den Haute

• wat is een zink-vinger nuclease?
• foto van elektroforese bandjes, zeggen wat er gebeurt is en waarom het nuttig is
• wat is cre-lox systeem?
• wat is en doet het Fok1 enzyme?
• foto van groen gekleurd aphasynnucleine, foto van iets rood gekleurd GFAP, en dan die beide samen op een foto, uitleggen wat er is gebeurt en waarom het nuttig is
• verschil uitleggen tussen siRNA en miRNA
• voor wat dient een conditionele knock out, geef twee redenen om het te gebruiken
• wat is een pseudozwanger vrouwtje en hoe maak je die?
• wat is TK en wat doen het in het DNA construct?
• nog iets maar ik weet het niet meer

1. Er was een hemizygote punt mutatie in een vrouw, 2 van haar 3 kinderen hadden dezelfde mutatie. Hoe kan je deze aandoening bestuderen in een muis/rat model? => zygoot injectie of ES gen targeting

Rik Gijsbers

• 2A
• GVDH (niemand wist dit)
• VSV-G
• HEK293T cellen

1. Leg uit wat een SIN vector is. Hoe wordt dit gebruikt/ziet het eruit in een plasmide vector, een virale vector en na integratie in de cel? Waarom is SIN belangrijk in therapeutische behandelingen?
2. CTNS is een aandoening waar er oftewel een mutatie is van G339R, glycine —> arginine (puntmutatie). Hoe kan je de hypothese testen dat CTNS G339R zorgt voor een inactief gen? Hoe zou je de ziekte behandelen? Werkt je oplossing ook in een rat model waarbij een CTNS KO is gemaakt?