Genetica: verschil tussen versies
kGeen bewerkingssamenvatting |
|||
| (50 tussenliggende versies door 28 gebruikers niet weergegeven) | |||
| Regel 2: | Regel 2: | ||
==Vakinformatie== | ==Vakinformatie== | ||
Vak van het | Vak van het eerste semester 1e jaar biochemie en biologie. (veranderd met het nieuwe programma 23-24). Ook tweedejaars biologen, chemisten en geologen kunnen hier zitten. | ||
Gedoceerd door Prof. | Gedoceerd door Prof Koen Geutens. | ||
Het examen duurt 3 uur. | |||
Er wordt tijdens de hoorcolleges nadruk gelegd op CRISPR/Cas9. Casussen gaan op 3/20 punten. Deze zijn doenbaar als je er de tijd voor neemt (casusdocument zelf lezen, leerstof doornemen etc.) Het examen bestaat uit 20 meerkeuzevragen die gebaseerd zijn op de vragen uit het boek en in de zelftestjes (wel moeilijker dan de zelftestjes). Ook uit de casussen komen er vragen terug en technieken en analysemethoden die in de casus gebruikt worden maar niet perse in de vragen terug komen moet je kennen. Deze staan op 13 punten. Er is ook 1 open vraag waar je 2 pagina's voor krijgt om hem op te schrijven. Deze staat op 4 punten. De lessen zijn nuttig, er worden al 3/6 vragen van de volgende casus samen gemaakt en besproken en aan het begin van de volgende les worden de andere 3 vragen besproken. | |||
==Examenvragen== | ==Examenvragen== | ||
==19 juni 2017 vm== | |||
===24 januari 2025=== | |||
de gender van bijen is diplohaplont, bevruchte eicellen zijn diploid en worden vrouwelijk en niet bevruchte eicellen zijn monoploid en worden mannelijk. na onderzoek kwam het DSC - FEM - DSX tot licht, waarbij werd aangetoond dat diploide homozygote DSC mutanten cellen mannelijk werden terwijl heterozygote DSC cellen vrouwelijk werden, waarbij DSC de regulatie van het fem gen zou reguleren. (FEM proteine bepaalt de splicing van DSX (dual sex)). Leg uit hoe jij dit zou onderzoeken | |||
meerkeuzevragen: | |||
MKV1: vraag over gynogenese, vroeg vs laat | |||
MKV2: wat is de kans om dubbelhomozygoot mutant te zijn bij de zelfbestuiving van een AAbbCcDdEe plant | |||
MKV3: chi kwadraat berekening, zijn de genen gekoppeld of niet | |||
MKV4: beorden de genen door middel van crossing over van gekoppelde genen (hoofdstuk 4) | |||
MKV6: PCR vraag, hoe lang de PCR cycli, enkelstrenging of dubbelstrengige primers, moet de restrictieknipplaatsen in de 5' of 3' kant zijn | |||
MKV7: vraag over HDR & NHEJ | |||
MKV10: vraag over CRISPR/Cas9 | |||
MKV12: vraag over hoofdstuk 18 (relaties tussen genen) | |||
MKV13: vraag over epistasie | |||
===10 januari 2025=== | |||
# 13 meerkeuzevragen | |||
# We zoeken een gen dat epilepsie veroorzaakt. Aan de hand van GWAS bij de mens hebben we een associate gevonden met het gen SNC1A. Door QTL bij een muis bekwamen we een ortholoog van dat gen als kandidaatgen. Leg uit hoe je gaat onderzoeken of dit het oorzakelijke gen is. | |||
===xx augustus 2024=== | |||
# 23 meerkeuzevragen | |||
# Hoe kan je zien of mutanten dezelfde regulatorische wegen gebruiken? Hoe zou je dit kunnen analyseren aan de hand van forwards genetics? | |||
===12 januari 2024=== | |||
# 23 meerkeuzevragen | |||
# Men wilt adhv reverse genetics een genfunctie onderzoeken. Leg een mogelijk experiment hiervoor uit. Als men uit meerdere technieken kan kiezen, verklaar waarom je bepaalde technieken niet gebruikt. Wat is een mogelijk controle-experiment. Wat zijn mogelijke problemen? | |||
===31 januari 2023=== | |||
# Verklaar de (on)juistheid van deze stellingen door de termen eerst te verklaren en dan de stelling te bevestigen of te weerleggen: "Een hoge concentratie tryptofaan zorgt voor derepressie van het trp operon omdat de repressor door allosterische regulatie niet meer kan binden op de operator" | |||
# Leg uit en vul aan: foto van STS 1,2,3,4 | |||
# Oefening: driepuntskruising | |||
#*Op welk chromosoom zijn deze genen gelegen (X) en wat zijn de parentale genotypes? | |||
#*In welke volgorde liggen deze genen? | |||
#*Bereken de afstand tussen de genen | |||
#*Bereken ook de afstand tussen de 2 uiterste genen uit de gegevens dus niet gewoon door de 2 recombinatiefrequenties op te tellen | |||
# Begrippen (<30 woorden): pleiotropie, leesraammutatie, RT-PCR, homeobox, Hardy-Weinberg evenwicht met formules | |||
===26 januari 2023=== | |||
# Verklaar de (on)juistheid van deze stellingen door de termen eerst te verklaren en dan de stelling te bevestigen of te weerleggen: "Voor de vorming van matuur mRNA worden er verschillende eiwitten gebruikt die een rol spelen, namelijk capping eiwit, poly-A-polymerase, het spliceosoom en nucleotide-excisie herstel enzymen." | |||
# Figuur van 32-CelStadium en 64-CelStadium van tunicaten. (macho-1 gen en fibroblast groeifactor) | |||
# Vraagstuk over Hardy-Weinberg evenwicht. | |||
# Begrippen: RNA interferentie, centiMorgan, disruptieve selectie, epistase, kloon-contig assemblage | |||
===9 september 2022=== | |||
# Stelling: "Ontwikkeling van celtypes bij een tunicaat wordt alleen bepaald door het spierbepalende macho-1 gen." | |||
# Figuur van transcriptie bij Eukaryoten. Vul de ontbrekende begrippen aan en leg uit. | |||
# Vraagstuk over 3 puntskruising met genen a,b&c die X-gebonden zijn: | |||
#*Wat is de volgorde van deze genen? | |||
#*Welk gen ligt in het midden? | |||
#*Wat zijn de kaartafstanden? | |||
# Begrippen: Hox gen, Hybridisatie, Inprenting, Integrine en Intron | |||
===1 februari 2022=== | |||
# Morfologische convergentie is GEEN belangrijke waarneming om evolutie aan te tonen. | |||
# Foto chromosoom kaarten + FISH bespreek EN vul de ontbrekende woorden aan op de foto. Zie hoofdstuk 18 | |||
# Vraagstuk: A) Teken een diagram met hoe je denkt dat een enhanceosoom werkt om RNA-P te recruteren voor een promotor van een gen. Komt dit systeem voor bij prokaryoten/eukaryoten of beide? B) Teken het lac operon met lactose en waar glucose afwezig is. Is er transcriptie aanwezig? Komt dit systeem voor bij prokaryoten/eukaryoten of beide? | |||
# Begrippen: Plasmidevectoren, pleiotropie, pluripotent, poly-A staart, polygene overerving. | |||
===27 januari 2022=== | |||
# Stelling: Een erfelijke genetische aandoening bij muizen kan blijvend hersteld worden door een combinatie van kruisingen en testen met merkers. | |||
# Grafiek uit boek/ppt van verschillende grootte snavelbek van een soort vogels, figuur rechte met grootte snavelbek vogels en nakomelingen. Vul figuur aan en leg uit wat dit is. | |||
# Sussanna haar vader lijdt aan de X-gebonden ziekte DMD. Sussana zelf is niet ziek en huwde met haar partner Jan die ook niet ziek is. Hun zoontje Steven zijn genotype is XXY en hij lijdt aan DMD. Geef schematisch weer en leg uit hoe dit kan. | |||
#Begrippen: Proteomica, Punett diagram, recessief, recombinant DNA en proteasoom | |||
===29 januari 2021=== | |||
#stelling: "fenotypische variatie komt bij bacteriën enkel voort uit genotypische factoren" | |||
#Foto van evolutie bij het paard | |||
#Driepuntskruising | |||
#Begrippen: DNA-bindingsmotief, DNA dubbel helix, DNA ligase, DNA methylatie en DNA vingerafdruk | |||
===22 juni 2020=== | |||
# Stelling: "transcriptie activatoreiwitten binden aan bacteriële genpromotoren" | |||
# Foto van 32 en 64 celstadium bij in tunicaat embryo | |||
# Heterozygoot voor 4 genen in testkruising. Welke genen zijn gekoppeld? Wat is het genotype van de heterozygoot? Teken de koppelingskaart. Gegeven verschillende nakomeling in verschillende hoeveelheden. | |||
# Begrippen: autosomaal, conservatieve replicatie, basesubstitutie, barr lichaampje, berkenspanner. | |||
===30 augustus 2019=== | |||
# Stelling: "Het fundamenteel verschil tussen positieve en negatieve controle van een gen is niet zo belangrijk." | |||
# Foto van drosophila kunstmatige selectie | |||
# Genotypes P, F1, F2 geven bij epistasie? | |||
# Recombinatie frequentie en stamboom voor een 3puntskruising | |||
# Begrippen: Apoptose, codominantie, dihybride kruising, diploïd, faag | |||
===17 juni 2019=== | |||
# Stelling: "Inversie op chromosoom 3 bij de Drosophila zorgt niet voor een genetische variatie?" | |||
# Foto van Himalaya siamese kat | |||
# Recombinatie frequentie en stamboom voor een 3puntskruising | |||
# Vraagstuk over lac operon en in welke mutanten de genen worden afgeschreven | |||
# Begrippen: Syntenie, Telofase, Telomerase, Tautomer effect, Syndroom van Down | |||
===14 juni 2019 NM=== | |||
#Stelling: Meiose ligt aan de basis van de variatie in het genoom. | |||
#Foto van pre-mRNA splicing en alternatieve splicing. | |||
#Stamboom: Welke grootouders van een vrouw hebben zeker geen invloed op haar X-chromosomen. | |||
#Er zijn 20000 genen en 85000 proteïnen. Verklaar hoe dit kan en geef een concreet voorbeeld uit de cursus. | |||
#Begrippen: enhancer, SNP, een-kopie gen, epigenetica, epistasie. | |||
===11 juni 2019 VM=== | |||
#Stelling: Klinefelter-,turner- en downsyndroom zijn het gevolg van foute recombinatie. | |||
#Foto van DNA banken | |||
#Oefening: stambomen | |||
#Vraagstuk: productie van Bicoid | |||
#Begrippen: elongatie, duplicatie, eenvoudig herhaald sequenties ... | |||
===22 juni 2018 NM=== | |||
#Stelling: Met PCR kan het doelDNA 11 keer vermeerderd worden. | |||
#Foto van kloon contig techniek | |||
#Oefening: mRNA uit een sjabloonDNAstreng opschrijven, amide en carboxylterminus aanduiden, overzetten in 3 AZ (ahv tabel) en aangeven of er nonsensemutaties mogelijk waren, zoja waar. | |||
# vraagstuk: Een gen dat codeert voor huids- en haarkleur. Europeanen en aziaten hebben 13 polymorfismen met 10 niet-synoniem. Afrikanen hebben er 5 met geen niet-synoniem. Verklaar de variatie tussen afrikanen en niet afrikanen. | |||
#Begrippen: replicatie, ras, recombinant DNA,... | |||
===28 juni 2018 voormiddag=== | |||
#Juist of onjuist: Splitsing voegt intronen samen en dit gebeurt enkel bij prokaryoten. (Elk woord uitleggen) | |||
#Figuur van uit het boek mbt embryo's waarvan de staartcellen naar het hoofd worden getransplanteerd en bij de ene figuur de straartcellen gewoon hoofdcellen worden in het hoofd en bij de andere figuur tot staartcellen in het hoofd differentiëren. (Determinatie uitleggen dus) | |||
#Oefening met een stamboom. a) Bepaal de manier van overerving. b) Kruising uitvoeren tussen allemaal neven en nichten van die stamboom | |||
#Oefening op driepuntskruising | |||
#Leg uit in elk max 30 woorden: SCNT, seksuele voortplanting, synaptonemaal complex, startcodon | |||
===27 juni 2018 namiddag=== | |||
#Stelling: Enkel meiose is verantwoordelijk voor genetische variatie. | |||
#Foto van het laden van tRNA. | |||
#Stamboomanalyse | |||
#Beargumenteer: eigen mening over een stelling geven. | |||
#genomica, genotype... | |||
===27 juni 2018 voormiddag=== | |||
#Bespreek de (on)waarheid van volgende stelling en bespreek elk element: bij het onderzoeken of 2 bacteriën tot dezelfde soort behoren, is het een goede eerste stap om te kijken naar een stukje DNA met een hoge mutatiesnelheid. | |||
#Afbeelding gegeven van een algemeen operon. Geef uitleg en benoem de aangeduide delen | |||
#Stamboomvraag: onderzoeken hoe de overerving wordt doorgegeven (autosomaal/X-of Y-gebonden; recessief/dominant), genotypes uitzoeken van zo veel mogelijk mensen en nog 1 klein vraagje | |||
#Driepuntskruisingsvraag: Leg de cijfers uit. Bereken de afstand en volgorde. | |||
#5 termen: Homeodomein, Heterochromatine, Helix-draai-helix motief en nog 2 andere | |||
===25 JUNI 2018=== | |||
#Maternale effectie bij embryonale ontwikkeling en hoe fenotype beïnvloed (met bicoid, nanos, dorsal....) | |||
#Figuur over beklengte vinken ifv vochtigheid (evolutie, overerfbaarheid...) | |||
#oefening genotype bepalen en allel op autosomen/geslachtchromosomen + uitleg | |||
#3 puntkruising | |||
#woordjes: Centraal dogma, buideldier, chromosoom, celdeling en nog 1 | |||
===19 juni 2018 NM=== | |||
#Stelling: pre-mRNA-processing enzymen omvatten excision herstel enzymen. | |||
#Foto van homologe structuren | |||
#Oefening: stamboom gegeven waarbij een genetisch erfelijk tandziekte is. Aan de hand van de stamboom hypothese geven (kenmerk dominant, recesief, geslachtsgebonden) en hiervoor de stamboom in genotypes schrijven. | |||
#Er zijn 2 genen uit een homeo box, met een mutantexperiment onderzoeken welke van de twee de andere reguleert. Gegevens experiment waren gegeven. | |||
#Begrippen: Replisoom, represor, restrictie endonuclease, restrictieplaats, reverse transcriptase. | |||
===18 juni 2018 NM=== | |||
#Stelling: "STS, sequenced tagged sites, hebben bijgedragen aan het bestuderen van het genoom op microscopisch niveau" | |||
#Geef uitleg bij de figuur: een tekening van DNA. | |||
#Oefening met stamboom van een zeldzame erfelijke ziekte. Is het een X-gebonden recessieve afwijking of een autosomaal gebonden allel dat alleen bij mannen tot uiting komt. Geef het genotype van generatie 5 voor beide gevallen. | |||
#Vage vraag over welke nucleotide substituties niet konden worden waargenomen via elektroforetische studies. | |||
#Begrippen: dominant, domesticatie, DNA-vingerafdruk, doseringscompensatie en DNA-supercoiling | |||
===18 juni 2018 VM=== | |||
#Stelling: "Evolutie heeft ervoor gezorgd dat organismen structuren hebben die perfect werken, zoals bijvoorbeeld het oog bij vertebraten" | |||
#Tekening over epistasie, afbeelding van kruising witte varianten mais wat witte en paarse F2 oplevert. | |||
#Oefening over overerving waarbij gegeven wordt dat er twee genen coderen voor de oogkleur en dat men twee heterozygote organismen voor beide genen gaat kruisen. Het fenotype dat deze beide organismen hebben is rood. Vervolgens wordt het fenotype van de nakomelingen gegeven en moet je verklaren hoe het kan dat deze fenotypen ontstaan. + verklaren waarom de term 'nieuw fenotype' bij deze nakomelingen gebruikt kan worden | |||
#Oefening over het lac operon waar je een tabel moet aanvullen met +'jes en -'etjes | |||
#Begrippen: chromatine, chromatide, chloroplast (en nog twee dingen die beginnen met ch) | |||
===15 juni 2018 NM=== | |||
#stelling:'Vrouwelijkheid, groei en gedrag zijn genetische kenmerken bij een bacterie.' | |||
#foto van gelelectroforese | |||
#Kruising met 4 fenotypes en 4 verschillende kruisingen gegeven | |||
#Een kader gegeven met info over aantal basenparen, genen, interons... Vragen over hoeveel interons er gemiddeld per gen waren enzo. Uitleg geven over genen die niet voor een eiwit coderen. | |||
#begrippen: transcriptiebel, transcriptiefactor, torsiespanning, terminatie en totipotent | |||
===15 juni 2018 vm=== | |||
#stelling:'Is de rol van meiose bij een gist, Neurospora en een plant (Arabidopsis) identiek? | |||
#tekening van een nucleosoom | |||
#vraagstuk: Steven heeft spierziekte van Duchenne (recessieve X-gekoppelde aandoening) en heeft als geslachtschromosomen XXY. Susanne (moeder van Steven) heeft de ziekte niet en haar man ook niet. Vader van Susanna had de ziekte wel. Verklaar waarom Steven beide aandoeningen heeft | |||
#vraagstuk: Een vraagstuk over een stof die RNA-productie blokkeert, maar toch kan een embryo de eerste 6 uur delen. Maar als deze stof na 6 uur wordt weggenomen, kan de gastrulatie niet plaatsvinden. Wat kan je besluiten over de genexpressie? | |||
#begrippen: wederkerige kruising, achterliggende streng, x-stralen diffractie, zink vinger motief en wiebelparing | |||
===5 september 2017 vm=== | |||
# stelling 'waterstofbruggen tussen nucleotiden hebben invloed op de structuur van DNA' | |||
# tekening over stamboom van het oerpaard tot het huidig paard; leg de tekening uit (evolutie) | |||
# kruising: parentale en F1 generatie gegeven, met frequentie. Welke stelling is juist. (hij wou niet zeggen als er meerdere antwoorden juist waren) | |||
# bespreek 2 methoden voor DNA sequentie bepaling en geef de voor- en nadelen ervan. | |||
# begrippen: polygene overerving, polymerase kettingractie, profase, poly-A-staart | |||
===23 juni 2017 nm=== | |||
#stelling "de celdelingen bij een embryo duren veel langer dan die bij een volwassen organisme" | |||
#tekening van een haai, tonijn, ichtyosaurus, en dolfijn | |||
#oefening met intermediaire overerving waarbij allelfrequentie gegeven was, en een populatie naar een gebied verplaatst wordt met andere fitnessvoorwaarden -> nieuwe allelfrequentie bepalen | |||
#oefening met 4 (ja vier) puntskruising, bepaal welke genen gekoppeld zijn + genotype van heterozygote ouder + koppelingskaart | |||
#begrippen uitleggen: amniocentese, anafase, aneuploïd, anticodon, apoptose | |||
===19 juni 2017 vm=== | |||
#stelling "koppelingskaarten geven goed de afstand weer" juist/fout | #stelling "koppelingskaarten geven goed de afstand weer" juist/fout | ||
#tekening van DNA-replicatie aanvullen | #tekening van DNA-replicatie aanvullen | ||
Huidige versie van 24 jan 2025 om 16:21
Vakinformatie
Vak van het eerste semester 1e jaar biochemie en biologie. (veranderd met het nieuwe programma 23-24). Ook tweedejaars biologen, chemisten en geologen kunnen hier zitten. Gedoceerd door Prof Koen Geutens. Het examen duurt 3 uur.
Er wordt tijdens de hoorcolleges nadruk gelegd op CRISPR/Cas9. Casussen gaan op 3/20 punten. Deze zijn doenbaar als je er de tijd voor neemt (casusdocument zelf lezen, leerstof doornemen etc.) Het examen bestaat uit 20 meerkeuzevragen die gebaseerd zijn op de vragen uit het boek en in de zelftestjes (wel moeilijker dan de zelftestjes). Ook uit de casussen komen er vragen terug en technieken en analysemethoden die in de casus gebruikt worden maar niet perse in de vragen terug komen moet je kennen. Deze staan op 13 punten. Er is ook 1 open vraag waar je 2 pagina's voor krijgt om hem op te schrijven. Deze staat op 4 punten. De lessen zijn nuttig, er worden al 3/6 vragen van de volgende casus samen gemaakt en besproken en aan het begin van de volgende les worden de andere 3 vragen besproken.
Examenvragen
24 januari 2025
de gender van bijen is diplohaplont, bevruchte eicellen zijn diploid en worden vrouwelijk en niet bevruchte eicellen zijn monoploid en worden mannelijk. na onderzoek kwam het DSC - FEM - DSX tot licht, waarbij werd aangetoond dat diploide homozygote DSC mutanten cellen mannelijk werden terwijl heterozygote DSC cellen vrouwelijk werden, waarbij DSC de regulatie van het fem gen zou reguleren. (FEM proteine bepaalt de splicing van DSX (dual sex)). Leg uit hoe jij dit zou onderzoeken
meerkeuzevragen: MKV1: vraag over gynogenese, vroeg vs laat MKV2: wat is de kans om dubbelhomozygoot mutant te zijn bij de zelfbestuiving van een AAbbCcDdEe plant MKV3: chi kwadraat berekening, zijn de genen gekoppeld of niet MKV4: beorden de genen door middel van crossing over van gekoppelde genen (hoofdstuk 4) MKV6: PCR vraag, hoe lang de PCR cycli, enkelstrenging of dubbelstrengige primers, moet de restrictieknipplaatsen in de 5' of 3' kant zijn MKV7: vraag over HDR & NHEJ MKV10: vraag over CRISPR/Cas9 MKV12: vraag over hoofdstuk 18 (relaties tussen genen) MKV13: vraag over epistasie
10 januari 2025
- 13 meerkeuzevragen
- We zoeken een gen dat epilepsie veroorzaakt. Aan de hand van GWAS bij de mens hebben we een associate gevonden met het gen SNC1A. Door QTL bij een muis bekwamen we een ortholoog van dat gen als kandidaatgen. Leg uit hoe je gaat onderzoeken of dit het oorzakelijke gen is.
xx augustus 2024
- 23 meerkeuzevragen
- Hoe kan je zien of mutanten dezelfde regulatorische wegen gebruiken? Hoe zou je dit kunnen analyseren aan de hand van forwards genetics?
12 januari 2024
- 23 meerkeuzevragen
- Men wilt adhv reverse genetics een genfunctie onderzoeken. Leg een mogelijk experiment hiervoor uit. Als men uit meerdere technieken kan kiezen, verklaar waarom je bepaalde technieken niet gebruikt. Wat is een mogelijk controle-experiment. Wat zijn mogelijke problemen?
31 januari 2023
- Verklaar de (on)juistheid van deze stellingen door de termen eerst te verklaren en dan de stelling te bevestigen of te weerleggen: "Een hoge concentratie tryptofaan zorgt voor derepressie van het trp operon omdat de repressor door allosterische regulatie niet meer kan binden op de operator"
- Leg uit en vul aan: foto van STS 1,2,3,4
- Oefening: driepuntskruising
- Op welk chromosoom zijn deze genen gelegen (X) en wat zijn de parentale genotypes?
- In welke volgorde liggen deze genen?
- Bereken de afstand tussen de genen
- Bereken ook de afstand tussen de 2 uiterste genen uit de gegevens dus niet gewoon door de 2 recombinatiefrequenties op te tellen
- Begrippen (<30 woorden): pleiotropie, leesraammutatie, RT-PCR, homeobox, Hardy-Weinberg evenwicht met formules
26 januari 2023
- Verklaar de (on)juistheid van deze stellingen door de termen eerst te verklaren en dan de stelling te bevestigen of te weerleggen: "Voor de vorming van matuur mRNA worden er verschillende eiwitten gebruikt die een rol spelen, namelijk capping eiwit, poly-A-polymerase, het spliceosoom en nucleotide-excisie herstel enzymen."
- Figuur van 32-CelStadium en 64-CelStadium van tunicaten. (macho-1 gen en fibroblast groeifactor)
- Vraagstuk over Hardy-Weinberg evenwicht.
- Begrippen: RNA interferentie, centiMorgan, disruptieve selectie, epistase, kloon-contig assemblage
9 september 2022
- Stelling: "Ontwikkeling van celtypes bij een tunicaat wordt alleen bepaald door het spierbepalende macho-1 gen."
- Figuur van transcriptie bij Eukaryoten. Vul de ontbrekende begrippen aan en leg uit.
- Vraagstuk over 3 puntskruising met genen a,b&c die X-gebonden zijn:
- Wat is de volgorde van deze genen?
- Welk gen ligt in het midden?
- Wat zijn de kaartafstanden?
- Begrippen: Hox gen, Hybridisatie, Inprenting, Integrine en Intron
1 februari 2022
- Morfologische convergentie is GEEN belangrijke waarneming om evolutie aan te tonen.
- Foto chromosoom kaarten + FISH bespreek EN vul de ontbrekende woorden aan op de foto. Zie hoofdstuk 18
- Vraagstuk: A) Teken een diagram met hoe je denkt dat een enhanceosoom werkt om RNA-P te recruteren voor een promotor van een gen. Komt dit systeem voor bij prokaryoten/eukaryoten of beide? B) Teken het lac operon met lactose en waar glucose afwezig is. Is er transcriptie aanwezig? Komt dit systeem voor bij prokaryoten/eukaryoten of beide?
- Begrippen: Plasmidevectoren, pleiotropie, pluripotent, poly-A staart, polygene overerving.
27 januari 2022
- Stelling: Een erfelijke genetische aandoening bij muizen kan blijvend hersteld worden door een combinatie van kruisingen en testen met merkers.
- Grafiek uit boek/ppt van verschillende grootte snavelbek van een soort vogels, figuur rechte met grootte snavelbek vogels en nakomelingen. Vul figuur aan en leg uit wat dit is.
- Sussanna haar vader lijdt aan de X-gebonden ziekte DMD. Sussana zelf is niet ziek en huwde met haar partner Jan die ook niet ziek is. Hun zoontje Steven zijn genotype is XXY en hij lijdt aan DMD. Geef schematisch weer en leg uit hoe dit kan.
- Begrippen: Proteomica, Punett diagram, recessief, recombinant DNA en proteasoom
29 januari 2021
- stelling: "fenotypische variatie komt bij bacteriën enkel voort uit genotypische factoren"
- Foto van evolutie bij het paard
- Driepuntskruising
- Begrippen: DNA-bindingsmotief, DNA dubbel helix, DNA ligase, DNA methylatie en DNA vingerafdruk
22 juni 2020
- Stelling: "transcriptie activatoreiwitten binden aan bacteriële genpromotoren"
- Foto van 32 en 64 celstadium bij in tunicaat embryo
- Heterozygoot voor 4 genen in testkruising. Welke genen zijn gekoppeld? Wat is het genotype van de heterozygoot? Teken de koppelingskaart. Gegeven verschillende nakomeling in verschillende hoeveelheden.
- Begrippen: autosomaal, conservatieve replicatie, basesubstitutie, barr lichaampje, berkenspanner.
30 augustus 2019
- Stelling: "Het fundamenteel verschil tussen positieve en negatieve controle van een gen is niet zo belangrijk."
- Foto van drosophila kunstmatige selectie
- Genotypes P, F1, F2 geven bij epistasie?
- Recombinatie frequentie en stamboom voor een 3puntskruising
- Begrippen: Apoptose, codominantie, dihybride kruising, diploïd, faag
17 juni 2019
- Stelling: "Inversie op chromosoom 3 bij de Drosophila zorgt niet voor een genetische variatie?"
- Foto van Himalaya siamese kat
- Recombinatie frequentie en stamboom voor een 3puntskruising
- Vraagstuk over lac operon en in welke mutanten de genen worden afgeschreven
- Begrippen: Syntenie, Telofase, Telomerase, Tautomer effect, Syndroom van Down
14 juni 2019 NM
- Stelling: Meiose ligt aan de basis van de variatie in het genoom.
- Foto van pre-mRNA splicing en alternatieve splicing.
- Stamboom: Welke grootouders van een vrouw hebben zeker geen invloed op haar X-chromosomen.
- Er zijn 20000 genen en 85000 proteïnen. Verklaar hoe dit kan en geef een concreet voorbeeld uit de cursus.
- Begrippen: enhancer, SNP, een-kopie gen, epigenetica, epistasie.
11 juni 2019 VM
- Stelling: Klinefelter-,turner- en downsyndroom zijn het gevolg van foute recombinatie.
- Foto van DNA banken
- Oefening: stambomen
- Vraagstuk: productie van Bicoid
- Begrippen: elongatie, duplicatie, eenvoudig herhaald sequenties ...
22 juni 2018 NM
- Stelling: Met PCR kan het doelDNA 11 keer vermeerderd worden.
- Foto van kloon contig techniek
- Oefening: mRNA uit een sjabloonDNAstreng opschrijven, amide en carboxylterminus aanduiden, overzetten in 3 AZ (ahv tabel) en aangeven of er nonsensemutaties mogelijk waren, zoja waar.
- vraagstuk: Een gen dat codeert voor huids- en haarkleur. Europeanen en aziaten hebben 13 polymorfismen met 10 niet-synoniem. Afrikanen hebben er 5 met geen niet-synoniem. Verklaar de variatie tussen afrikanen en niet afrikanen.
- Begrippen: replicatie, ras, recombinant DNA,...
28 juni 2018 voormiddag
- Juist of onjuist: Splitsing voegt intronen samen en dit gebeurt enkel bij prokaryoten. (Elk woord uitleggen)
- Figuur van uit het boek mbt embryo's waarvan de staartcellen naar het hoofd worden getransplanteerd en bij de ene figuur de straartcellen gewoon hoofdcellen worden in het hoofd en bij de andere figuur tot staartcellen in het hoofd differentiëren. (Determinatie uitleggen dus)
- Oefening met een stamboom. a) Bepaal de manier van overerving. b) Kruising uitvoeren tussen allemaal neven en nichten van die stamboom
- Oefening op driepuntskruising
- Leg uit in elk max 30 woorden: SCNT, seksuele voortplanting, synaptonemaal complex, startcodon
27 juni 2018 namiddag
- Stelling: Enkel meiose is verantwoordelijk voor genetische variatie.
- Foto van het laden van tRNA.
- Stamboomanalyse
- Beargumenteer: eigen mening over een stelling geven.
- genomica, genotype...
27 juni 2018 voormiddag
- Bespreek de (on)waarheid van volgende stelling en bespreek elk element: bij het onderzoeken of 2 bacteriën tot dezelfde soort behoren, is het een goede eerste stap om te kijken naar een stukje DNA met een hoge mutatiesnelheid.
- Afbeelding gegeven van een algemeen operon. Geef uitleg en benoem de aangeduide delen
- Stamboomvraag: onderzoeken hoe de overerving wordt doorgegeven (autosomaal/X-of Y-gebonden; recessief/dominant), genotypes uitzoeken van zo veel mogelijk mensen en nog 1 klein vraagje
- Driepuntskruisingsvraag: Leg de cijfers uit. Bereken de afstand en volgorde.
- 5 termen: Homeodomein, Heterochromatine, Helix-draai-helix motief en nog 2 andere
25 JUNI 2018
- Maternale effectie bij embryonale ontwikkeling en hoe fenotype beïnvloed (met bicoid, nanos, dorsal....)
- Figuur over beklengte vinken ifv vochtigheid (evolutie, overerfbaarheid...)
- oefening genotype bepalen en allel op autosomen/geslachtchromosomen + uitleg
- 3 puntkruising
- woordjes: Centraal dogma, buideldier, chromosoom, celdeling en nog 1
19 juni 2018 NM
- Stelling: pre-mRNA-processing enzymen omvatten excision herstel enzymen.
- Foto van homologe structuren
- Oefening: stamboom gegeven waarbij een genetisch erfelijk tandziekte is. Aan de hand van de stamboom hypothese geven (kenmerk dominant, recesief, geslachtsgebonden) en hiervoor de stamboom in genotypes schrijven.
- Er zijn 2 genen uit een homeo box, met een mutantexperiment onderzoeken welke van de twee de andere reguleert. Gegevens experiment waren gegeven.
- Begrippen: Replisoom, represor, restrictie endonuclease, restrictieplaats, reverse transcriptase.
18 juni 2018 NM
- Stelling: "STS, sequenced tagged sites, hebben bijgedragen aan het bestuderen van het genoom op microscopisch niveau"
- Geef uitleg bij de figuur: een tekening van DNA.
- Oefening met stamboom van een zeldzame erfelijke ziekte. Is het een X-gebonden recessieve afwijking of een autosomaal gebonden allel dat alleen bij mannen tot uiting komt. Geef het genotype van generatie 5 voor beide gevallen.
- Vage vraag over welke nucleotide substituties niet konden worden waargenomen via elektroforetische studies.
- Begrippen: dominant, domesticatie, DNA-vingerafdruk, doseringscompensatie en DNA-supercoiling
18 juni 2018 VM
- Stelling: "Evolutie heeft ervoor gezorgd dat organismen structuren hebben die perfect werken, zoals bijvoorbeeld het oog bij vertebraten"
- Tekening over epistasie, afbeelding van kruising witte varianten mais wat witte en paarse F2 oplevert.
- Oefening over overerving waarbij gegeven wordt dat er twee genen coderen voor de oogkleur en dat men twee heterozygote organismen voor beide genen gaat kruisen. Het fenotype dat deze beide organismen hebben is rood. Vervolgens wordt het fenotype van de nakomelingen gegeven en moet je verklaren hoe het kan dat deze fenotypen ontstaan. + verklaren waarom de term 'nieuw fenotype' bij deze nakomelingen gebruikt kan worden
- Oefening over het lac operon waar je een tabel moet aanvullen met +'jes en -'etjes
- Begrippen: chromatine, chromatide, chloroplast (en nog twee dingen die beginnen met ch)
15 juni 2018 NM
- stelling:'Vrouwelijkheid, groei en gedrag zijn genetische kenmerken bij een bacterie.'
- foto van gelelectroforese
- Kruising met 4 fenotypes en 4 verschillende kruisingen gegeven
- Een kader gegeven met info over aantal basenparen, genen, interons... Vragen over hoeveel interons er gemiddeld per gen waren enzo. Uitleg geven over genen die niet voor een eiwit coderen.
- begrippen: transcriptiebel, transcriptiefactor, torsiespanning, terminatie en totipotent
15 juni 2018 vm
- stelling:'Is de rol van meiose bij een gist, Neurospora en een plant (Arabidopsis) identiek?
- tekening van een nucleosoom
- vraagstuk: Steven heeft spierziekte van Duchenne (recessieve X-gekoppelde aandoening) en heeft als geslachtschromosomen XXY. Susanne (moeder van Steven) heeft de ziekte niet en haar man ook niet. Vader van Susanna had de ziekte wel. Verklaar waarom Steven beide aandoeningen heeft
- vraagstuk: Een vraagstuk over een stof die RNA-productie blokkeert, maar toch kan een embryo de eerste 6 uur delen. Maar als deze stof na 6 uur wordt weggenomen, kan de gastrulatie niet plaatsvinden. Wat kan je besluiten over de genexpressie?
- begrippen: wederkerige kruising, achterliggende streng, x-stralen diffractie, zink vinger motief en wiebelparing
5 september 2017 vm
- stelling 'waterstofbruggen tussen nucleotiden hebben invloed op de structuur van DNA'
- tekening over stamboom van het oerpaard tot het huidig paard; leg de tekening uit (evolutie)
- kruising: parentale en F1 generatie gegeven, met frequentie. Welke stelling is juist. (hij wou niet zeggen als er meerdere antwoorden juist waren)
- bespreek 2 methoden voor DNA sequentie bepaling en geef de voor- en nadelen ervan.
- begrippen: polygene overerving, polymerase kettingractie, profase, poly-A-staart
23 juni 2017 nm
- stelling "de celdelingen bij een embryo duren veel langer dan die bij een volwassen organisme"
- tekening van een haai, tonijn, ichtyosaurus, en dolfijn
- oefening met intermediaire overerving waarbij allelfrequentie gegeven was, en een populatie naar een gebied verplaatst wordt met andere fitnessvoorwaarden -> nieuwe allelfrequentie bepalen
- oefening met 4 (ja vier) puntskruising, bepaal welke genen gekoppeld zijn + genotype van heterozygote ouder + koppelingskaart
- begrippen uitleggen: amniocentese, anafase, aneuploïd, anticodon, apoptose
19 juni 2017 vm
- stelling "koppelingskaarten geven goed de afstand weer" juist/fout
- tekening van DNA-replicatie aanvullen
- oefening dihybride kruising
- uitleg 'chimeren'; denkvraag over toepassing
- begrippen uitleggen: promotor, proteasoom, proteomica, prokaryoot, Punnett-vierkant
16 juni 2017
- stelling over meiose en mitose
- tekening van trp operon
- oefening van overkruising, x-gebonden allelen
- hunchback, antennepedia (?) en engrailed bij drosophilia, waar denk je aan en waarin verschillen ze
- operon, openleesraam, pleiotropie, overkruising en gap genes
juni 2016
- foto plasmide
- hoeveelheid enkelstrengig en dubbelstrengig DNA bepalen
- weet rest neit meer (pfff zwak)
juni 2015
- Kan genetische clonering helpen in de veredeling van planten?
- Een foto van een Himalaya kat
- Een hele moeilijke oefening over de afstanden op chromosomen
- Een diploïde cel heeft 16 chromosomen, hoeveel zijn dit er na de metafase van meiose I? En hoeveel na de anafase? Teken de anafase.
- Begrippen waaronder codon, conservatief, replicate,...
17 juni 2014
- DNA banken zijn uitermate geschikt om het genoom te onderzoeken
- Tekening verklaren (epistasie : maiskolf die paars kleurde door 2 enzymen)
- Oefening stamboom maken+ chromosomen uitleggen (klinefeltersyndroom)
- Oefening op mitose/meiose
- repressor, regulatorisch eiwit, replicatie, replisoom en restrictie endonulease
16 juni 2014 namiddag
- Stelling: meiose heeft dezelfde rol in de levencycli van een bacterie, Neurospora en Arabidopsis.
- Tekeningetje van Translatie-initiatie
- Oef over het Lac-operon
- Een origineel peptide en een gemuteerd (1deletie en 1 insertie) Bepaal de base in weg en erbij is, en bepaal de mRNA sequentie van beide.
- Woordjes: domesticatie, ras, homologe structuren, morfogenese
16 juni 2014 voormiddag
- stelling: Neaderthalers hebben geen sexueel contact gehad met de moderne mens
- foto van nucleosome die verschuift op dna streng (pg 317)
- oefening over driepuntskruising
- oefening openleesraam zoeken en bijhorende polypeptide
- woordjes: translocatie, tRNA, transciptoom, transcriptieplaats
13 Juni 2013 NM
- Stelling: Genetische kaarten zijn hetzelfde als fysieke kaarten van het genoom.
- Foto van een 3D-tRNA molecule: bespreek de figuur
- Vraagstuk over recombinante genen en de allelpositie bepalen aan de hand van hoeveel vliegen van een bepaalde recombinant er zijn.
- Vraagstuk over een zeldzame ziekte met stamboom: enkele kansberekeningen etc.
- Woordjes: Deletie, Excisie-reparatie-resynthese, DNA bindingsdomein, Cytokinese
13 Juni 2013 VM
- Vergelijken van Meiose II met mitose. Heel goed de nadruk leggen op het verschil in functie
- tryptofaan operon
- Zo een oefeningetje met Lac-operon zoals op de taak
- Nog een oefeningetje op een X-gebonden recessieve ziekte (niet moeilijk)
- wat begrippen verklaren
Prof helpt u goed op weg als ge het niet weet
10 Juni 2013 VM
- Stelling: Het niet-nucleale genoom is identiek voor planten en dieren.
- Karyogram van iemand met trisomie 21 (syndroom van Down). Bespreek.
- Vraagstuk: a)De kans op een meisje is 0.5, hoe groot is dan de kans dat een gezin van 4 kinderen bestaat uit 3 meisjes en 1 jongen. b) De eigenlijke kans op een meisje is 0.49, hoe groot is nu de kans dat een gezin bestaat uit 3 meisjes en 1 jongen. c) Hoe groot is de kans als het eerste kind een jongen is en de 3 andere meisjes.
- Gegeven: DNA-sequentie en 2 mutaties op deze sequentie. a)Geef de aminozuursequentie gecodeerd door het DNA. b) Benoem de mutaties.
- 5 begrippen:
- Alternatieve splitsing
- Barr-lichaampje
- Aminoacyl-tRNA synthetase
- Apoptose
- Basesubstitutie
31 JAN 2012 VM
- Stelling: TATA-box is een transcriptiefactor die een rol speelt bij de selectie van de juiste startplaats bij eukaryoten bij de transcriptie door RNA polymerase II.
- Cirkelvormig tekeningetje van de celcyclus (zo van G1, G2, S, M maar dan zonder de letters). Bespreek.
- Vraagstuk: kaart+afstanden van genen op het chromosoom bepalen a.h.v tabelletje met de fenotypes van de nakomelingen.
- Bepalen of genen in HWE staan a.h.v chi².
- polyploïd, polyteen chromosoom, segment-polariteit gen, selectie, semisteriliteit, stamboomanalyse, standaardafwijking, stukuitwisseling en subeenheid.
20 JAN 2011 VM
- Stelling: Enkel diploïde genetische informatie is overerfbaar.
- Bespreek: figuur 12-10 a en b (afbeelding van de hox-genen bij een muis op de 4 chromosomen en de expressie ervan tijdens de ontwikkeling)
- Oefening over chromosoomtransformaties: je kreeg het oorspronkelijk chromosoom 123.456789 en moest dan de transformaties benoemen en de oorspronkelijke chromosomen in synaps tekenen om te laten zien wat er gebeurd is.
- Moeilijke oefening over een experiment mbt facetogen bij Drosophila ifv de temperatuur(2 genotypes). De genetische variantie en de fenotypische verdeling worden geschat. Je moest bij 4 experimentele situaties 'paren van reactie-normen' tekenen die horen bij de 2 genotypes. Een experimentele vaststelling was bijvoorbeeld: 'wanneer de erfelijkheid verhoogde, verlaagde de genetische variantie' of 'bij het verlagen van de variantie van de temperatuur ging de unimodale verdeling van het fenotype over in een bimodale verdeling' ...
- Begrippen:
- weifelaar
- X-chromosoom
- X-koppeling
- ...
21 JAN 2010
- Stelling: de waterstofbruggen gevormd door nucleotiden hebben geen invloed op de structuur van DNA.
- Afbeelding van het gal-systeem bij gist. (Gal4 bespreken, enhancing, UAR's, beetje eukaryote transcriptie-initiatie,...)
- Oefening van staartlengte bij varkentjes. Eentje heeft een lengte van 6cm, de andere van 30cm, en de nakomeling een van 18cm. Voor de F2-generatie 1/64 met staart van 6cm, en 1/64 met een staart van 30cm, en daartussen worden de lengtes 10,14,18,22,26 waargenomen, met het meeste nakomeling een staart van 18cm. En daar een aantal vragen over, die voortbouwen op "van hoeveel genen hangt de staartlengte af".
- Een welhaast analoge oefening van 5 soorten tarwe (wit, lichtrood, half rood, half donkerrood, donkerrrood).
- Begrippen:
- Enhanceosoom
- Epigenetisch stilleggen of "silencing"
- Epistasie
- Epigenetische merker
- Erfelijkheid in de ruime zin
- Homeologe chromosomen
- Homoloog chromosoom
- Homologie-afhankelijk herstel
- Homogametisch geslacht
- en nog 1...
20 JAN 2010
- Wat gebeurt er met RNA nadat het is afgeschreven van DNA dankzij RNA polymerase. Is er een verschil tussen pro en eukaryoten.
- foto van menselijk genoom. Beschrijf wat je ziet.
- makkelijk vraagstuk over autosomaal resessieve aandoening
- Ne moeilijke over Hardy-Weinberg.
- Begrippen.
- heterozygon
- hetersis
- Hfr
- hexaploid
- polypoide
19 JAN 2010
- stelling: Bicoid eiwit heeft een invloed op de paarrolgenen
- fig 11.2
- oefening op allelfrequentie bij een gegeven populatie met fenotypes van bloedgroepen
- chi²-oefening met hypothesetest, p-waarde,...
- woordjes:
- genconversie
- topoisomerase
- inversielussen
- homozygoot inversie
- kandidaatgen
- tetraploïd
- tetrade
- nog drie andere...
18 JAN 2010
Mondeling:
- Figuur van het fragiel-X syndroom
- de evolutie van genen gaat aan constante snelheid en houdt geen rekening met de gedegenereerde code..
Schriftelijk:
- een stamboom
- vraag over H² en h²
- pak definities
JAN 2010
Mondeling:
- Gaat genevolutie met een constante snelheid? (zonder rekening te houden met gedegenereerde codes)
- tekening van fragile X syndroom
Schriftelijk:
- Oefening met een stamboom
- een oefening op erfelijkheid
- hele hoop begrippen waar bijna allemaal gen of genetisch in voor kwamen....
JAN 2009
Mondeling:
- Stelling: Klinefelter-,turner- en downsyndroom zijn het gevolg van foute recombinatie
- Figuur bespreken: fig 10-4 in boek
- Juist of fout: de meiose speelt dezelfde rol in de levenscyclus van een bacterie, neurospora en een plant
Schriftelijk:
- Een ziekte, veroorzaakt door een mutatie op het 7de chromosoom vetoont bij de mensen met deze ziekte ernstige botafwijkingen in het gelaat. Beschouw de volgende waarnemingen en trek bij elke een conclusie:
a. 75% van de mannen , cariotype 23 vertoont bij deze afwijking ernstige tekenen van het andere geslacht b. Vrouwen , heterozygoot voor deze ziekte vertonen geen afwijkingen c. Het ziektegen vertoont 75% gemeenschappelijkheid met een gend dat ligt op het X chromosoom en bepalend is voor de ontwikkeling van de vrouwelijke geslachtskenmerken.
- Woordjes
29 JAN 2008
Mondeling:
- Stelling: operons hebben enkel negatieve regulatie.
- Figuur: 8.4 boek, over transcriptie algemeen
Schriftelijk:
- In 1931 vond Stern twee verschillende translocaties in drosophila. Hij ontdekte vrouwtjes met een extra stuk van het Y-chromosoom op hun X-chromosoom en andere vrouwtjes met een extra stuk chromosoom IV op hun X. Hij bestudeerde twee geslachtsgekoppelde genen: vleeskleurig (vle recessief) en staafvormig (St dominant). We kruisen dihybride staafvormige vrouwtjes met heteromorfe chromosomen (mutante allelen gelegen op X stuk van X-IV) met hemizygote vleeskleurige mannetjes met normale chromosomen. Teken de cytogenetische resultaten en beschrijf de genotypes/fenotypes van de nakomelingen.
- Een fruitvlieg is heterozygoot voor een paracentrische inversie. Na vele pogingen bleek het onmogelijk homozygoten voor de inversie te kweken. Wat is de meest waarschijnlijke verklaring hiervoor?
- Woordjes: A-plaats, cosupressie, dna-transposon, enol, epigenetische overerving, interferentie, klinefeltersyndroom, oncogen, plaque, silencer
28 JAN 2008
Mondeling:
- Stelling: Transcriptie en replicatie zijn genetisch gelijkaardige processen.
- Figuur 9-11 uitleggen (figuur over ribosomen).
Schriftelijk:
- Een oefening op recombinanten waarbij je moest zeggen of de genen gekoppeld waren en de kaartafstanden moest weergeven op een kaart. Ook moest je de genotypes van de ouders geven.
- Je kreeg zo'n tabelleke zoals bij lac operon en je moest zelf de + en - aanvullen.
- 10 woordjes: provirus, penetrantie, proto-oncogen, epigenetisch stilgelegd, F-, enzovoort