Molecular Cell Biology

Vakinformatie

Molecular Cell Biology

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/e/G0F75AE.htm

Examenvragen

13/06/2019 VM

Hoofdvragen

1. Bespreek de import van proteïnen in mitochondriën.
2. Bespreek Na+/K+ ATPase en (werking + functie) en vergelijk met andere types ATPase pompen
3. Bespreek receptor mediated endocytosis adhv voorbeelden
4. Practicum: hoe bepaal je de specifieke activiteit van een hexokinase in een gistextract

Bijvragen

1. Hoe wordt de pH in dierlijke cellen constant gehouden en wat is het belang hiervan?
2. Watertransportproteïnen
3. Hoe kan je in VITRO golgi transport tussen goli nagaan?
4. Basolaterale-apicale sortering
5. Heerst er een potentiaalverschil over beide mitochondriale membranen? leg uit.

7/06/2019

Hoofdvragen

1. Bespreek de synthese van proteïnen op het RER
2. Bespreek de verschillende ATPases
3. Hoe worden vesikels gevormd, hoe worden proteïnen naar de vesikel gebracht en hoe gebeurt fusie ervan
4. Practicum: hoe bepaal je de specifieke activiteit van een hexokinase in een gistextract

Bijvragen

1. Selectiviteit van ion channels
2. Bewijzen van cisternale pogressie (=maturatie)
3. Unfolded protein response
4. Je bent een onderzoeker en je wil een abnormaal hoge hoeveelheid membraanproteïnen in de organellen van de secretorische pathway bekomen. Hoe doe je dit.
5. Je spuit een geconcentreerde suiker- en NaCl-oplossing in in het bloed van muizen. Komt het suiker en het zout in de darmepitheelcellen en de darm terecht?

14/06/2018 NM

Hoofdvragen

1. Bespreek de import van proteïnen in mitochondriën.
2. Bespreek receptor gemedieerde endocytose aan de hand van enkele voorbeelden.
3. Bespreek ATPase pompen.
4. Hoe kan men glucosetransport volgen?

Bijvragen

1. Bespreek bloed antigen.
2. Hoe wordt de maag verzuurd?
3. Hoe kan men de laterale diffusiessnelheid berekenen?
4. Hoe zou men experimenteel kunnen nagaan of een molecule via symport of via gefaciliteerde diffusie wordt opgenomen? (Door ervoor te zorgen dat er een gradiënt is zodat symport niet werkt. Als er dan toch opname is, zal dit via gefaciliteerde diffusie zijn).
5. Een onderzoeker brengt in gistcellen een gen tot expressie dat codeert voor een cellulase met de bedoeling om met de gistcellen cellulose af te breken. In het medium vindt hij echter geen ceullulase activiteit. Bespreek mogelijke oorzaken. (Alle stappen in de secretory pathway bekijken en beschrijven wat er mis kan gaan).

14/06/2018 VM

Hoofdvragen

1. Bespreek synthese van oplosbare en membraan proteïnen op het RER
2. Bespreek Na+/K+ ATPase en (werking + functie) en vergelijk met andere types ATPase pompen
3. Bespreek glycosylatie aan en geef voorbeelden
4. Bepalen trehalase activiteit in functie van de omgeving

Bijvragen

1. Wat zijn porines, en wat zijn de consequenties van hun aanwezigheid?
2. Hoe wordt de pH in dierlijke cellen constant gehouden en wat is het belang hiervan?
3. Bespreek de rol van anion-transporter in erythrocyten bij de uitwisseling van CO2 en O2
4. Hoe komt water van de darm binnen in de cellen en hoe kunnen patiënten met diarree behandeld worden?
5. Zijn gistmutanten die geen invertase productie vertonen thermosensitief? Bespreek de verschillende mogelijkheden.

08/06/2018 NM

Hoofdvragen

1. bespreek import van proteinen in mitochondrien
2. bespreek receptor mediated endocytosis adhv voorbeelden
3. bespreek glycosylatie en de functie (geef voorbeelden)
4. Practicum: glucose import

Bijvragen

1. bespreek verzuring van het maaglumen
2. bespreek unfolded protein response
3. bespreek post golgi proteolytic cleavage
4. hoe kan je lateraal transport van lipiden in de membraan nagaan? (FRAP. bijvraag: waarom is er een 50% recovery en geen 100%? --> associatie met membranaire proteinen en het cytoskelet)
5. Transporteren aquaporines enkel selectief water of worden er meerdere kleine moleculen mee getransporteerd? Hoe kan je dat met experimenten uit de cursus aantonen. (experiment met transgene kikker oocyeten)

08/06/2018 VM

Hoofdvragen

1. bespreek de synthese van proteïnen op het RER
2. bespreek de verschillende ATPases
3. Hoe worden vesikals gevormd, hoe worden proteïnen naar de vesikel gebracht en hoe gebeurt fusie ervan
4. Practicum: hoe bepaal je de specifieke activiteit van een hexokinase in een gistextract

Bijvragen

1. Bespreek transportproteïnen in vacuole van de tonoplast
2. Watertransportkanalen
3. Het wetenschappelijk belang van genetische defecten in lysosomen
4. wetenschappelijk experiment waaruit je cisternal maturation kan afleiden en hoe werkt het precies
5. een onderzoeker heeft antistoffen tegen de N-terminus en de C-terminus van een niet essentieel plasmamembraanproteine van een temperatuursensitieve mutant. Na switch naar de restrictieve temperatuur geven alleen de antilichamen van de N-terminus nog een respons. In welke genen zou de mutatie gelegen kunnen zijn? De antilichamen worden toegevoegd na celextractie, SDS-PAGE en western blot. (De mutatie ligt in genen die inwerken op processen die plaatsvinden tussen het vertalen van het mRNA en het binnendringen van het proteïnen in het ER.)

11/06/2015 NM

Hoofdvragen

1. Bespreek de synthese van proteïnen op het RER
2. Bespreek de verschillende ATPases
3. Bespreek mechanisme en rol van glycosilatie aan de hand van verschillende voorbeelden (nieuw!)
4. Practicum: Hoe bepaal je de specifieke activiteit van een hexokinase in een gistextract?

Bijvragen

1. Hoe kan je in VITRO golgi transport nagaan? (had te maken met golgi's van 2 verschillende cellen, waarvan één geen glycosilatie kon aanbrengen)
2. Bespreek bloedantigenen
3. Bespreek transportproteïnen in vacuole (nieuw!)
4. Onderzoekers ontdekken een glucose transporten in plasmamembraan die niet kan geëndocyteerd worden. Welke verschillende oorzaken kan dit hebben en hoe kan men onderzoeken welke de echte oorzaak is? (het probleem kan in het transportproteïne zelf zitten. Dus een mutatie in herkenningssequentie voor adapterproteïnen, of in de machinery die vesikelvorming veroorzaakt. Als het aan het proteïne ligt, zal dit poteïne in een wt cel ook niet kunnen werken, ligt het aan de de vesikelproteïnen (zoals AP, ARF, etc.) dan kunnen andere transporters ook niet opgenomen worden)
5. Onderzoekers willen een vitaminetransporter van plasmamembraan van een plantencel in vacuole plaatsen om daar vitaminen op te slaan. Hoe ga je te werk en wat denk je hiervan. (invoegen vacuole targeting sequence, maar dit zal nooit werken want membraantransporter werkt in de verkeerde richting (in plasmamembraan pompt die richting cytosol, zal dat in vacuole ook doen)

05/06/2015 VM

Hoofdvragen

1. Bespreek de synthese van proteïnen op het RER
2. Bespreek de werking en functie van het Na/K ATPase en vergelijk met de andere ATPase.
3. Bespreek receptor gemedieerde endocytose adhv een aantal voorbeelden
4. Practicum: hoe bepaal je de specifieke activiteit van een hexokinase in een gistextract?

Bijvragen

1. Bespreek de unfolded protein pathway
2. Bespreek: watertransportproteïnen
3. Het wetenschappelijk belang van genetische defecten in lysosomen
4. Je spuit een geconcentreerde suiker- en NaCl-oplossing in in het bloed van muizen. Komt het suiker en het zout in de darmepitheelcellen en de darm terecht? (In epitheel komt hij wel terecht door GLUT2 welke via concentratieverschil werkt. In het lumen komt de glucose niet omdat de 2Na+/1Glucose symporter aangedreven wordt door de Na+-gradient)

Heerst er een potentiaalverschil over beide mitochondriale membranen? (Nee: Buitenste membraan bevat porines, dus intermembranaire ruimte is gelijk met cytosol)

01/09/2014 VM

Hoofdvragen

1. Bespreek de import van proteïnen in de mitochondriën.
2. Bespreek de werking en functie van het Na/K ATPase en vergelijk met de andere ATPase.
3. Bespreek de verschillende pathways en maturatie voor proteïnen bestemd voor de lysosomen.
4. Practicum: hoe kan men de opnamesnelheid van glucose in gistcellen bepalen. (radioactivitief gemerkt)

Bijvragen

1. Er zijn veel unfolded proteïnen in het ER, bespreek. (Ire1 dimeer endonuclease activiteit)
2. Hoe kan een onderzoeker de latere migratie van membranaire proteïnen onderzoeken? (FRAP)
3. Bespreek de unfolded proteïns pathway.
4. Je spuit een geconcentreerde suiker- en NaCl-oplossing in in het bloed van muizen. Komt het suiker en het zout in de darmepitheelcellen en de darm terecht? (wel in de cellen maar niet in de darmen, => GLUT4 transporteert via gradiënt)

Je brengt een Na+/glucose transporter tot expressie in het celmembraan van gist. Werkt wel, maar het transport van glucose valt vrij snel stil. Wat is hiervan de oorzaak en hoe kan je dit verhelpen. (geen Na gradiënt meer => toevoegen na/k pomp, K-kanaal)

=Hoofdvragen

1. Bespreek de synthese van proteïnen op het RER
2. Vergelijk de ATPasen
3. Bespreek receptor gemedieerde endocytose adhv een aantal voorbeelden
4. Practicum: hoe kan men de opnamesnelheid van glucose in gistcellen bepalen

Bijvragen

1. Basolaterale-apicale sortering (VSV G glycoprotein & influenza HA)
2. Bespreek de bloedantigenen (ABO systeem)
3. Bespreek de post-golgi proteolytische modificatie.
4. een onderzoeker heeft antistoffen tegen de N-terminus en de C-terminus van een niet essentieel plasmamembraanproteine van een temperatuursensitieve mutant. Na switch naar de restrictieve temperatuur geven alleen de antilichamen van de N-terminus nog een respons. In welke genen zou de mutatie gelegen kunnen zijn? (SNAP bij ER)

Een nieuwe toxische stof wordt ontdekt die het aminozuurtransport in een cel meteen stillegt, toch is er geen binding van de toxische stof aan een aminozuurtransporter vast te stellen. Bespreek de mogelijke componenten die wel een invloed hebben. (ATP aanmaak)

11/06/2012 NM

Hoofdvragen

1. Bespreek de werking en functie van het Na/K ATPase en vergelijk met de andere ATPasen
2. Bespreek de import van proteïnen in de mitochondriën
3. Bespreek de structuur van cilia en leg uit hoe ze bewegen
4. Practicum: hoe bepaal je de specifieke activiteit van een hexokinase in een gistextract

Bijvragen

1. Bespreek de post golgi proteolytische modificatie
2. Stel, je wil een vitamine laten opstapelen in de vacuole, daarvoor wil je een transporter van op de plasmamembraan inbouwen in de vacuolelmembraan. Wat denk je hiervan en hou ze je dit doen.
3. Bespreek de glycosilatie van proteinen in het RER
4. Heerst er een potentiaalverschil over beide mitochondriale membranen? leg uit.
5. Bespreek de verzuring van het maaglumen.

10/06/2011 NM

Hoofdvragen

1. Leg transport van proteïnen naar RER uit.
2. Structuur cilia + beweging uitleggen.
3. ATP-ase pompen bespreken.
4. Uitleggen pract. trehalose.

Bijvragen

1. Basolaterale - apicale sortering
2. Post-golgimodificering van proteinen
3. wetenschappelijk experiment waaruit je cisternal maturation kan afleiden
4. uitleggen hoe genetisch onderzoek kan leiden tot het onderzoeken van de beweging van ciliën.
5. Denkvraag: een onderzoeker wil graag de pH van mitochondriën verlagen. Hij wil dit simpel doen, door een H+ ATPase toe te voegen aan de membraan. Hoe kan hij dit doen en welke problemen kunnen er optreden?

27/06/2011 VM

Hoofdvragen

1. Structuur cilia + beweging
2. Hoe worden proteïnen naar mitochondriën getarget?
3. Bespreek hoe vesikels gevormd worden, hoe proteïnen worden gerecruteerd en hoe ze naar de juiste bestemming gestuurd worden.
4. Hoe kan de hoeveelheid cAMP in functie van de beschikbare voedingsstoffen gemeten worden?

Bijvragen

1. Hoe wordt de pH in dierlijke cellen constant gehouden en wat is het belang hiervan?
2. Wat is de oorzaak van diarree en wat is een mogelijke oplossing?
3. Bespreek volgende stelling: Integrale transmembranaire proteïnen bestaan altijd uit een aan alpha-helices.
4. Transporteren aquaporines ook onselectief andere moleculen en uit welk experiment in de cursus kan je dit besluiten?
5. Je brengt een Na+/glucose transporter tot expressie in het celmembraan van gist. Werkt wel, maar het transport van glucose valt vrij snel stil. Wat is hiervan de oorzaak en hoe kan je dit verhelpen.

20/06/2011 NM

Hoofdvragen

1. Bespreek de synthese van proteïnen op het RER
2. Bespreek Receptor gemedieerde endocytose aan de hand van een aantal voorbeelden
3. Bespreek de werking en functie van Na+/K+-ATPase en vergelijk deze met de andere klassen ATPasen
4. Practicum: Hoe bepaal je de specifieke Trehalase-activiteit uit gistextracten

Bijvragen

1. Wat zijn porines, en wat zijn de consequenties van hun aanwezigheid?
2. Bespreek de apicale-basolaterale proteïne-sortering
3. Bespreek het dynamisch gedrag van microtubuli
4. Je spuit een geconcentreerde suiker- en NaCl-oplossing in in het bloed van muizen. Komt het suiker en het zout in de darmepitheelcellen en de darm terecht?
5. Het gen voor het enzyme cellulase wordt in een gistcel ingebracht zodat deze cel cellulose zou kan afbreken. Toch wordt er geen cellulase activiteit in het medium waargenomen. Bespreek alle mogelijke oorzaken hiervan

20/06/2011 VM

Hoofdvragen

1. Bespreek de structuur en beweging van cilia
2. Bespreek import van proteinen in mitochondriën
3. Bespreek de verschillende ATPases
4. Practicum: Hoe bepaal je de specifieke activiteit van een hexokinase uit gistextracten

Bijvragen

1. Hoe bestudeer je in vitro het transport tussen Golgi compartimenten
2. Het wetenschappelijk belang van genetische defecten in lysosomen
3. Bespreek glycosylatie in het ER
4. Hebben beide mitochondrienmembranen een membraanpotentiaal? leg uit
5. Een onderzoeker heeft antistoffen tegen de N-terminus en de C-terminus van een niet essentieel plasmamembraanproteine van een temperatuursensitieve mutant. na switch naar de restrictieve temperatuur geven alleen de N-terminale antilichamen nog een respons, in welke genen zou de mutatie gelegen kunnen zijn?

10/06/2011 NM

Hoofdvragen

1. Bespreek de synthese van proteïnen op het RER
2. Bespreek de verschillende klassen ATPasen
3. Bespreek de werking van de cilia
4. Practicum: Trehalase

Bijvragen

1. Post-Golgi proteolytische processing
2. Aanwijzingen voor cisternale progressie
3. Apicale-basolaterale sortering
4. Hoe werkingsmechanisme cilia onderzoeken met behulp van genetische experimenten
5. Een onderzoeker wil een H+ ATPase targeten naar mitochondriën. Hoe + wat zijn de eventuele problemen

10/06/2011 VM

Hoofdvragen

1. Bespreek de mechanismen hoe proteïnen naar de mitochondriën getarged worden
2. Bespreek receptor gemedieerde endocytose aan de hand van een aantal voorbeelden
3. Bespreek de werking en de functie van Na+,K+ ATPasen en vergelijk deze met andere ATPasen
4. Practicum: cAMP bepaling

Bijvragen

1. Bespreek het regelmechanisme voor ongevouwen proteïnen
2. Bespreek: watertransportproteïnen
3. Bespreek glycosylatie in het ER
4. Je spuit een geconcentreerde suiker- en NaCl-oplossing in in het bloed van muizen. Komt het suiker en het zout in de darmepitheelcellen en de darm terecht?

In een gistcel wordt een Na+/glucose symporter tot expressie gebracht. Het transport van glucose stopt redelijk snel. Hoe komt dit en wat is een mogelijke oplossing?

14/06/2010

Hoofdvragen

1. Bespreek hoe vesikels gevormd worden, proteïnen gerecruteerd worden en naar de juiste bestemmingen in de cel getransporteerd
2. Bespreek receptor gemedieerde endocytose aan de hand van een aantal voorbeelden
3. Bespreek de structuur van cilia en hun beweging
4. Practicum: hoe kan men de opnamesnelheid van glucose in gistcellen bepalen

Bijvragen

1. Bespreek het wetenschappelijk belang van genetische defecten in lysosomen
2. Bespreek glycosylatie in het ER
3. Hoe kan men het transport van proteïnen in de celmembraan experimenteel onderzoek
4. Bespreek de bloedantigenen
5. Transporteren aquaporines enkel water of ook onselectief andere kleine moleculen? Uit welk experiment kun je dit besluit trekken?

10 juni 2010

Hoofdvragen

1. discuss the pathways and maturation mechanisms involved in the transport between ER and Lysosomes
2. Discuss the mechanism of receptormediated endoycytosis using a few representative examples (will be added when my brain should resume its work)
3. cAMP determination in function of the nutrients

Bijvragen

1. discuss the AB0 system
2. how can it be that the aminoacidtransporter doesnt work anymore when you add a compound which doesnt react with that transporter (more exact version, see below)
3. discuss watertransportproteins
4. discuss the dynamic behaviour of microtubulis
5. how can it be that certain cancer patients turn resistant against cytostatica

8/06/2010

Hoofdvragen

1. leg de mechanismen uit hoe vesicles geladen worden, hoe ze hun proteïenen selecteren en hoe ze naar het juiste target membraan gebracht worden
2. bespreek alle soorten ATP pompen in membranen
3. Bespreek de mechanismen hoe proteïnen naar de mitochondriën getarged worden
4. bespreek hoe men trehalase activiteit kan bestuderen in gistcellen

Bijvragen

1. bespreek de post-golgi proteolytische processing
2. bespreek het regelmechanisme voor ongevouwen proteïnen
3. en nog drie andere...

7/06/2010

Hoofdvragen

1. Synthese proteïnen op RER
2. ATPase pompen bespreken
3. Cilia: beweging en structuur
4. cAMP - bepaling ifv omgeving

Bijvragen

1. Post-golgi proteolytische processing
2. Apicale - basolaterale sortering
3. Hoe wordt de inhoud van de maag verzuurd?
4. N/C-terminus antilichamen, zie hieronder
5. Cellulose/cellulase, geen activiteit. zie hieronder

9/06/2009

Hoofdvragen

1. Synthese proteïnen op ER
2. ATPasen bespreken
3. Beweging en structuur cilia
4. cAMP bepaling

Bijvragen

1. Apicaal basolateraal proteïnen afleveren
2. Wetenschappelijke gevolgen van ziekte lysosomen (I cell disease)
3. ABO bloedgroepen
4. Transporteren aquaporinen enkel water? Ja of neen? Uitleggen aan de hand van experiment uit de cursus
5. Nieuw transportcomplex. Wil testen, door gebruik van KCN. Hoe?

9/06/2009

Hoofdvragen

1. Bespreek synthese van proteïnen in de mitochondriën
2. die van die cilia
3. Bespreek receptor-gemedieerde endocytose adhv een aantal voorbeelden.
4. Practicum: hoe kan je de opname van glucose in gistcellen bestuderen?

Bijvragen

1. Die van unfolded protein response
2. Hoe kan je het transport van proteïnen in het Golgi apparaat in vitro bestuderen? (nvdr: dat is dus niet fluorescentie en radioactieve cohorten)
3. Je spuit een geconcentreerde suiker- en NaCl-oplossing in in het bloed van muizen. Komt het suiker en het zout in de darmepitheelcellen en de darm terecht?
4. Die van symport-gefaciliteerde diffusie
5. Hoe komt het dat bepaalde kankerpatiënten niet reageren op bepaalde cytostatica?

17/062008

Hoofdvragen

1. bespreek ciliën en hun beweging
2. bespreek de werking en de functie van Na+,K+ ATPasen
3. bespreek het vormen van vesikels, het recruteren van proteïnen en het selecteren van het targetmembraan
4. practicum: hoe kan de specifieke activiteit van hexokinase uit celextracten van gistcellen bepaald worden?

Bijvragen

1. Bespreek basolaterale-apicale sortering van proteïnen
2. Bespreek de wetenschappelijke belangen bij genetische aandoeningen in de lysosomen.
3. bespreek glycosylatie in het ER
4. Een nieuwe toxische stof wordt ontdekt die het aminozuurtransport in een cel meteen stillegt, toch is er geen binding van de toxische stof aan een aminozuurtransporter vast te stellen. Bespreek de mogelijke componenten die wel een invloed hebben.
5. Het gen voor het enzyme cellulase wordt in een gistcel ingebracht zodat deze cel cellulose zou kan afbreken. Toch wordt er geen cellulase activiteit in het medium waargenomen. Bespreek alle mogelijke oorzaken hiervan

11 juni 2008

Hoofdvragen

1. bespreek de synthese van proteïnen op het RER
2. bespreek de mechanismen van vesiculair transport in cellen
3. bespreek de verschillende typen ATPase pompen
4. practicum: hoe kunnen we de trehalase activiteit van een organisme bepalen in functie van de omgeving

Bijvragen

1. bespreek motorproteïnen
2. geef de "unfolded protein respons"
3. weet ik ni meer
4. hoe zou je bepalen of een bepaald molecule via symport of gefaciliteerde diffusie de cel binnenkomt

een onderzoeker heeft antistoffen tegen de N-terminus en de C-terminus van een niet essentieel plasmamembraanproteine van een temperatuursensitieve mutant. na switch naar de restrictieve temperatuur gevenalleen de N-terminale antilichamen nog een respons, in welke genen zou de mutatie gelegen kunnen zijn?