Medische Biotechnologie

Vakinformatie

Nieuw vak vanaf 2024-2025. Dit vak wordt gegeven door 3 proffen: Chris Van Den Haute (CVH), Rik Gijsbers en Marianne Carlon. Ze gaven 11 lessen + 2 lessen waarin ze alle leerstof toepasten. Het examen is grotendeels mondeling. De termen leg je alleen schriftelijk uit, maar de open vragen leg je mondeling uit bij de prof die de vraag heeft opgesteld. We kregen elk 2 volledige examens op 20 punten, 1 van CVH en 1 van Gijsbergs en als je mondeling ging afnemen bij één van de 2 proffen moest je hele examen van die prof al af zijn.

Examenvragen

25 juni 2025

Chris Van Den Haute: 10 termen

• CreloxP systeem uitleggen
• Verschil miRNA en shRNA
• Afbeelding alfasynnucleotide vs GFAM en mixed -> wat zie je en waarvoor dient het
• Hoe maak je een pseudopregnant vrouwtje
• Conditionele knockdown + 2 voorbeelden van wanneer je het zou gebruiken
• Wat is YAC en waarvoor wordt het gebruikt
• Wat is TK en wanneer zit het in DNA?
• Verschil chimeer en mozaicisme
• Ook een techniek afgebeeld ( DNA- RNA- proteinen) maar die afbeelding zagen we niet dus de vraag werd geschrapt.
• Waarvoor staan NHEJ en HDR

Open vraag (mondeling):

• Stamboom gegeven: 2 ouders (75 en 70) – 3 kinderen, 1 zoon (39) heeft dezelfde puntmutatie als de mama. De moeder heeft symptomen van een aandoening door neuronen die afsterven en de zoon begint hetzelfde te vertonen. Punt mutatie: CAC (His) -> CAA (Gln). We willen dit ziektebeeld nabootsen in een rodent model. We kennen het hele genoom van de personen. De gensequentie van het humane gen is dezelfde bij de rodents. Hoe ga je dit doen? Welke methode gebruik je? Leg uit. Geef voordelen van je werkwijze. Geef nadelen. Zijn er alternatieve manieren?

Rik Gijsbergs: 4 termen

• DeltaF508
• EMA
• Base editor
• Codon optimalisatie

1. Leg uit rAAVs -> waarvoor staat het, wat doet het, hoe kan je ze in plasmiden brengen en opzuiveren…
2. Er is een nieuwe variant SARSCoV_12K RNA virus opgedoken met een goed spike eiwit, je vraagt je af of je dit virus kan gebruiken als virale vector om CF aan te pakken en meer succesvol tot in de longcellen te komen. Je werkt in een labo en hebt je virale vectoren die je normaal gebruikt ter beschikbaar + al het materiaal dat je zou nodig hebben. Je hebt het nieuwe SARS virus in een neusswab ook ter beschikking. Hoe ga je te werk?

24 juni 2025

Chris Van Den Haute

• wat is een zink-vinger nuclease?
• foto van elektroforese bandjes, zeggen wat er gebeurt is en waarom het nuttig is
• wat is cre-lox systeem?
• wat is en doet het Fok1 enzyme?
• foto van groen gekleurd aphasynnucleine, foto van iets rood gekleurd GFAP, en dan die beide samen op een foto, uitleggen wat er is gebeurt en waarom het nuttig is
• verschil uitleggen tussen siRNA en miRNA
• voor wat dient een conditionele knock out, geef twee redenen om het te gebruiken
• wat is een pseudozwanger vrouwtje en hoe maak je die?
• wat is TK en wat doen het in het DNA construct?
• nog iets maar ik weet het niet meer

1. Er was een hemizygote punt mutatie in een vrouw, 2 van haar 3 kinderen hadden dezelfde mutatie. Hoe kan je deze aandoening bestuderen in een muis/rat model? => zygoot injectie of ES gen targeting

Rik Gijsbers

• 2A
• GVDH (niemand wist dit)
• VSV-G
• HEK293T cellen

1. Leg uit wat een SIN vector is. Hoe wordt dit gebruikt/ziet het eruit in een plasmide vector, een virale vector en na integratie in de cel? Waarom is SIN belangrijk in therapeutische behandelingen?
2. CTNS is een aandoening waar er oftewel een mutatie is van G339R, glycine —> arginine (puntmutatie). Hoe kan je de hypothese testen dat CTNS G339R zorgt voor een inactief gen? Hoe zou je de ziekte behandelen? Werkt je oplossing ook in een rat model waarbij een CTNS KO is gemaakt?