Advanced biochemistry and biotechnology

Uit Chemika Examenwiki
Naar navigatie springen Naar zoeken springen

Vakinformatie

Verdiepend vervolg op Moleculaire Biologie en Dynamische Biochemie van de 2e bachelor. Voor 2009-2010 door Prof M. De Ley en J. Robben. Van 2010 - 2021 gedoceerd door J. Robben. Vanaf 2019-2020 is dit vak van naam veranderd, het heet nu Advanced Biochemistry and biotechnology. In 2021 - 2022 gedoceerd door Prof Johan Robben en Shehab Ismail. Vanaf 2023-2024 wordt het vak volledig gedoceerd door Shehab Ismail.

Het examen is opgebouwd uit 2 delen. Een deel over een paper en een deel open vragen en definities.


"De studenten hebben mij iets heel handig gegeven om na te gaan welke examenvragen ik de laatste jaren gesteld heb, ze houden het beter bij als ik zelf." -- Quote Johan Robben, 2014

ECTS-fiche: https://onderwijsaanbod.kuleuven.be/syllabi/n/G0G74AN.htm

Examenvragen

24 januari 2025

Research paper: Questions about the G1 to S phase transition. Focus was on the phosphorylation of SIC1 by the G1 cyclin-CDK1 complex to activate S cyclin-CDK and on the different subunits of a cullin ring E3 ligase complex and how they interact.

Answer the following questions:

  • Exercise with half-life of protein, total protein at steady state is 10,2 femtogram, kdeg is given, in a steady state. Calculate how many time is needed to degrade 5,1 and synthesize new 5,1. There are 10 mRNAs in the cell, calculate the translation rate per mRNA.
  • CRISPR can overlook a few not-correct bonded nucleotides so can cause off-target mutagenesis. How can you increase specificity of CRISPR?
  • What is the influence of codon-dependent translational elongation on the half-life of mRNA?

Concisely discuss:

  • Biogenesis of miRNA from pri-miRNA transcript to mature miRNA.
  • Mechanisms of the activation of transcription initiation in prokaryotes.
  • Oncohistones: why do they cause cancer, give mechanisms not related to PTMs.

16 januari 2025

Research paper: Question about Hif-1α and VHL and their roles in hypoxia.

  • Gel with VHL and Hif-1α in hypoxia and normoxia. What can you conclude?
  • Gel with VHL, Hif-1α and compound X. What is the role of compound X?
  • Another gel which I forgot.
  • Gel with mutated Hif-1α. What conclusions can you draw here?
  • Can you give a summary of / total conclusion from this experiment?

Answer the following questions:

  • Exercise with half-life of protein, total protein at steady state is 10,2 femtogram, kdeg is given, in a steady state. Calculate how many time is needed to degrade 5,1 and synthesize new 5,1. And calculate synthesis rate constant. There is 10 mRNA in the cell.
  • CRISPR can overlook a few not-correct bonded nucleotides so can cause off-target mutagenesis. How can you increase specificity of CRISPR?
  • Nonsense mediated decay
  • Why do some protein have longer lifetime than others?

Answere these questions

  • Mechanisms of prokaryotic transcription activation
  • miRNA target mRNA. How do they do this? Give different target sites on mRNA? (or something like this)
  • maybe some other questions which i forgot :(

20 augustus 2024

Research paper: SAR genes mad2 and mad3 were examined because little is known about them. (12/40)

  • Determine the half lifetime of mad2 and mad3 (read from graph).
  • Why did the researchers not use temperature-sensitive methods?
  • Why did they add cycloheximide (CHX)?
  • Why did they also use Dhhp1 mutants? What can you conclude from this experiment?

Small questions (15/40)

  • Translational coupling
  • PROTAC + give the advantages compared to small molecule inhibitors
  • Nonsense-mediated decay
  • Chaperone mediated autophagy
  • Attenuation of trp operon transcription in E.coli

Answer these questions (13/40)

  • CRISPR can overlook a few not-correct bonded nucleotides so can cause off-target mutagenesis. How can you increase specificity of CRISPR?
  • Describe how histone mutations, that are not post translational modification mutations, can cause cancer.
  • Ago (=argonaute) is shown to increase the specificity of miRNA to its target RNA up to a fold of 300. How does the argonaute increase the specificity between its miRNA and the target mRNA?
  • One more question which i forgot :/

26 januari 2024

Research paper: A proteasome without USP14 was found, do study with ubiquitinated cyclinB and non-ubi cyclinB showed different bands when in mixture with proteasome, proteasome+USP14, proteasome+USP14+IU1. (12/40)

  • In lanes 5 and 6 (Proteasome+USP14) we can see a lower molecular weight compared to lanes 2 and 3 (Proteasome without USP14), explain why.
  • In lane 3 we see no more band compared to lane 6, explain why.
  • In the lane with non-ubi cyclinB we always see a band, why?
  • What function do you think that IU1 has?

Small questions (15/40)

  • Attenuation of trp operon transcription in E.coli
  • How can you discover aptamers when binding to a molecule of interest?
  • Issues with using siRNA
  • Chaperone mediated autophagy
  • Genetic code flexibility

Answer these questions (13/40)

  • Exercise with half-life of protein, total protein is 4,2, kdeg is given, in a steady state. Calculate how many time is needed to degrade 2,1 and synthesize new 2,1.
  • CRISPR can overlook a few not-correct bonded nucleotides so can cause off-target mutagenesis. How can you increase specificity of CRISPR?
  • What is the influence of codon-dependent translational elongation on the half-life of mRNA?
  • 1 more question

18 januari 2024

Research paper: SAR genes mad2 and mad3 were examined because little is known about them. (12/40)

  • Determine the half lifetime of mad2 and mad3 (read from graph).
  • Why did the researchers not use temperature-sensitive methods?
  • Why did they add cycloheximide (CHX)?
  • Why did they also use Dhhp1 mutants? What can you conclude from this experiment?

Small questions (15/40)

  • Translational coupling
  • Mechanisms of prokaryotic transcription activation
  • PROTAC + give the advantages compared to small molecule inhibitors
  • Nonsense-mediated decay
  • Types of miRNA targets

Answer these questions (13/40)

  • CRISPR allows for gene editing, but sometimes mutations are allowed that cause non-specific targeting. Describe a way in which you can enhance the specificity of CRISPR-Cas9.
  • Describe how histone mutations, that are not post translational modification mutations, can cause cancer.
  • What are the properties of proteins that affect their lifetime?
  • eIF2-GDP is recycled back to reproduce the ternary complex to start translation initiation. eIF2B can be inhibited by phosphorylation of eIF2 by eIF2alpha. Phosphorylation increases affinity of eIF2 to eIF2B. How does this inhibit translation initiation?

19 januari 2023

J. Robben's deel

  1. mRNA cap van expressieregulatie. (5)
  2. Begrippen: Translational coupling, Genomic imprinting, Nonsense suppression, RNA turnover analysis (5)

S. Ismail's deel

  1. Grote vraag (6)
    • Vraagstuk over deletion Ups14 uit proteasome en dan een SDS-PAGE gedaan en visualisatie met een Western blot. 3 verschillende toestanden (Ups14 weg, + WT, + catalytic inactive Usp14) op 3 verschillende tijdspunten.
    • Verklaar de resultaten van het experiment
  2. Kleinere vraag
    • RNA interference: 2 ssRNA (sense & antisense) and 1 dsRNA --> he changed conclusion and you had to find the mistake & in C.elegans also effect seen in offspring, how possible? (4)
  3. Kleine vraagjes
    • PROTAC uitleggen (3)
    • 3 fasen CRISPR-interference in bacteria (3)
    • different endocytosis (2)
    • 2 names for miRNA expression analysis (2)

30 augustus 2022

J. Robben's deel

  1. 5’ UTR en cap van expressieregulatie bij eukaryoten. (5)
  2. Begrippen: Translational coupling, RNA editing, Rip: regulated intramembrane proteolysis & exosome (5)

S. Ismail's deel

  1. Grote vraag (6)
    • Vraagstuk waarin er 6 verschillende tubes waren die een andere inhoud hadden. Hierop werd een northern blot gedaan en je kreeg een foto van de bekomen gel hiervan. Elke 1ste tube bevatte een pri-miRNA, elke tweede tube een pri-miRNA + microprocessor complex. De eerste pri-miRNA had een stemloop van 35 bp, een tweede met een 35 bp +1 en een derde met 35 bp + 3. Van elke tube werden de bandjes op de gel weergegeven.
    • Verklaar de resultaten van het experiment
    • Uit wat bestaat het microprocessor complex?
    • Geef een andere naam voor het microprocessor complex.
  2. Kleinere vraagjes
    • The two-signal membrane binding model bij meristoylation - uitleggen wat dit inhoudt (4)
    • Geef de factoren die de stabiliteit van proteïnen kunnen beïnvloeden - leg 1 uit. (4)
  3. Kleine vraagjes
    • 3 fasen tot komen van CRISPR-Cas systeem in bacteria (2)
    • Verschillende manieren van lysosomale degradatie (2)
    • Verschil in mechanisme van HECT en RING - E3 (2)

28 januari 2022

J. Robben's deel

  1. 5’ UTR van expressieregulatie bij prokaryoten. (5)
  2. Begrippen: DNA acetylation, RNA editing, eIF4-binding proteïne & NMD (5)

S. Ismail's deel

  1. Kleine vragen (6)
    • Geef 2 voorbeelden van small interfering RNA.
    • Geef een detectietechniek voor je miRNA of interest.
    • Foto van goed opgevouwen proteïne en minder goed opgevouwen proteïne. Welke heeft de langste half-time?
    • Functie E3.
    • Geef 3 soorten lipid modifications.
    • Geef 1 functie van CRISPR in bacteriën
  2. Uitleggen hoe je van pri-miRNA tot mature miRNA geraakt. (4)

20 januari 2022

J. Robben's deel

  1. Bespreek op welke wijze(n) de poly(A)-staart van mRNA fungeert in eukaryote expressie regulatie. (5)
  2. Begrippen: Selenocysteine, Translational coupling, Genomic imprinting & toxin-antitoxin (5)

S. Ismail's deel

  1. Kleine vragen (6)
    • Welke van de RNA duplexen (2 fotos) zal door AGO2 worden geknipt voor het maken van guide strand
    • Welke is beter voor stabiele cellijn te maken: synthetische siRNA of vectorbased siRNA.
    • Noem de stappen/ fasen op om tot het CRISPR-Cas system te komen.
    • Noem 3 verschillende autophagie types op.
    • E1, E2 en E3 zijn enzymen in de ubiquitinylatie pathway. Wat doet E1?
    • Wat is het 2e aminozuur waaraan de myristoyltie plaats vindt en waarom kan het enkel deze aminozuur zijn?
  2. Bespreek hoe dat topologie, disorderd protein en protein-protein interacties de stabiliteit beïnvloeden. (4)

22 januari 2021

  1. Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress? (= ERAD en UPR)
  2. Experimenteel knockdown van genen adhv RNAi, geef de experimentele wijze, welke moeilijkheden kunnen optreden en hoe kan je dit voorkomen?
  3. Begrippen
    • Translationele koppeling
    • Prime edditing (met Crispr)
    • foto-entrainment
    • selenocysteïne

14 januari 2021 NM

  1. Bespreek overzichtelijk de werking en rol van lysosomen in eiwit-turnover. Vermeld een voorbeeld van een biotechnologische toepassing die gebruikt maakt van deze kennis.
  2. Cas9 is recentelijk aangepast voor andere toepassingen dan deze van genomische "schaar". Verduidelijk en concretiseer.
  3. Begrippen
    • Genomische imprinting
    • RNA-editing
    • RNA-induced silencing complex (RISC)
    • Periodosoom

24 januari 2020 NM

  1. Globale translatiemechanismen bij eukaryoten. Wanneer is dit van toepassing? Hoe kunnen genen dit ontwijken?
  2. Op welke wijze(n) kan je RNAi experimenteel uitvoeren?
  3. Begrippen
    • Translationele koppeling
    • CMA
    • PAM
    • Selenocysteïne

20 januari 2020 NM

  1. Bespreek hoe prokaryoten genexpressie reguleren via anti-sense mechanismen.
  2. Bespreek de N-endrule en eiwitafbraak. Vergelijk tussen eukaryoten en prokaryoten.
  3. Begrippen
    • Hfq
    • RNA editing
    • shRNA
    • prime editing

17 januari 2020 VM

  1. 5’ UTR van expressieregulatie bij eukaryoten
  2. cas9 systeem waar CRISPR is op gebaseerd en vergelijk met Argonaut
  3. Begrippen
    • attenuatie
    • nonsense-mediated decay
    • looped primer RT-PCR
    • proteasome stress response (Rpn4 + PACE)

25 januari 2019 NM

  1. Leg de regulatie van het trp-operon uit
  2. Geef een schematisch overzicht van unfolded protein respons
  3. Begrippen
    • RITS
    • Shutdown decay
    • BMAL
    • uORF

18 januari 2019 NM

  1. 3’ UTR bij eukaryoten
  2. Experimenteel knockdown van genen adhv RNAi
  3. Begrippen
    • RNA switch
    • Periodosoom
    • RNA editing
    • CMA

18 januari 2019 VM

  1. Bespreek de structuur en werking van riboschakelaars (riboswitches). Wat weet je over hun functie? Illustreer je antwoord met voorbeelden.
  2. Bespreek de moleculair-dynamische mechanismen die aan de basis liggen van het metabolische dag-nacht ritme bij zoogdieren.
  3. Begrippen
    • Selenocysteine
    • Nonsense-mediated decay
    • shRNA
    • Proximity-induced autoactivation

22 januari 2018, VM

  1. Geef overzicht van de regelmechanismen waarmee eukaryoten de translatie globaal (=niet eiwit specifiek) kan worden geregeld. In welke situatie is een dergelijke regeling van toepassing? Hoe ontsnappen sommige genen aan deze regeling?
  2. Bespreek op welke wijze(n) de poly(a)-staart van mRNA fungeert in expressie regulatie. (ook iets over de lengte ervan)
  3. Begrippen:
    • Retroreulatie
    • Genomische imprinting (+voorbeeld)
    • Nonsense-mediated decay
    • Nocturnine

19 januari 2018, VM

  1. Geef de gelijkenissen en verschillen voor de expressie regulatie aan de 5'-UTR en 5'-uiteinde regio bij prokaryoten en eukaryoten.
  2. Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress? (= ERAD en UPR)
  3. Begrippen:
    • Tac promotor (= is die gefuseerde promotor van lac operon en tac operon vanuit de werkzitting)
    • Rip: regulated intramembrane proteolysis
    • RITS
    • foto-entrainment

21 augustus 2017

  1. Controlemechanismen van mRNA bij eukaryoten.
  2. De rol van ubiquitine ligasen in proteïne turnover
  3. Begrippen:
    • Transcriptional gene silencing
    • Peptide mediated protein knockdownn
    • Familial fast sleep syndrome
    • Een vierde begrip

3 februari 2017

  1. Verduidelijk de structuur en werking van riboswitches . Leg hun functie uit
  2. Rol van Poly-A-staart bij regulatie van expressie
  3. Woordjes:
    • Nocturnine
    • uORF
    • Genetic imprinting
    • Chaperone-gemedieerde autofagie

23 januari 2017

  1. Globale translatie regulatie mechanisme uitleggen, wanneer is dit van toepassing en hoe ontsnappen genen eraan
  2. Op welke wijze(n) kan je de functie en voorkomen RNAi experimenteel uitvoeren?
  3. Bespreek kort
    • Retroregulation
    • Rip: regulated intramembrane proteolyse
    • nonsense mediated decay
    • Periodosoom


20 januari 2017

  1. Welke elementen in 3'-UTR voor expressieregulatie?
  2. Welk mechanisme voor controleren van nieuw geproduceerde membraaneiwitten en eiwitten voor export, en wat gebeurt er bij stress?
  3. Bespreek kort:
    • Attenuatie
    • Hairpin silencing
    • Translational recoding
    • Photo-entrainment

29 januari 2016

  1. UPR
  2. Circadische clock in zoogdieren
  3. Bespreek kort:
    • hairpin silencing
    • argonaut
    • genomic imprinting
    • riboswitch

27 januari 2016

  1. Geef overzichtelijk de technieken die kunnen gebruikt worden om het voorkomen en functies van kleine RNA's te bestuderen. (Hij was precies niet geïnteresseerd in RAKE, looped primer en al die dingen... Hij zei iets over sRNA sponzen en stabiele nucleïnezuuranalogen)
  2. Geef de werking en functie(s) van macroautophagie.
  3. Bespreek kort:
    • real-time RT-PCR
    • selenocysteïne
    • caspasen
    • RIP.

18 januari 2016

  1. Hoe knockdown van genen bekomen via experimenten met RNA interferentie? wat zijn de aandachtpunten? bijvraag: wat zou je eerder gebruiken siRNA of via vector shRNA? en wat bij de mens?
  2. Translationele recoding wat is het en op welke manieren wordt het bereikt?
  3. Bespreek kort:
    • histonehermodellering
    • shut down decay
    • RNA editing
    • BMAL-CLOCK

15 januari 2016

  1. Globale translatie regulatie mechanisme uitleggen, wanneer is dit van toepassing (Stress enz), en hoe ontsnappen genen eraan (uORF)
  2. Rol van ubiquitinr ligases in proteïne turnover.
  3. Bespreek kort:
    • Chromatine remoddeling
    • Non stop decay
    • Periodosoom
    • Seed sequentie

28 januari 2015

  1. Bespreek het purine katabolisme + welke afwijkingen bij de mens?
  2. Wat weet je over Ubiquitine ligases in proteïne metabolisme?
  3. Bespreek kort:
    • RIP
    • Translationele hercodering
    • Exosoom
    • Looped-primer RT-PCR

september 2014

  1. Bespreek de N-endrule en eiwitafbraak. Vergelijk tussen eukaryoten en prokaryoten.
  2. Stel een dierenexperiment met RNAi; welke methoden voor knockdown van een gen stel je voor, welke verkies je voor het maximale resultaat?
  3. Bespreek kort:
    • RIP
    • Icterus
    • UPR
    • Nocturine

31 januari 2014

  1. Geef de diverse regulatiemechanismes van het (chole)sterolmetabolisme.
  2. Bespreek de invloed van ubiquitineligases op de proteïne turnover.
  3. Bespreek kort:
    • Geelzucht
    • genome imprinting
    • Initiator caspase
    • KiaC

29 januari 2014

  1. Bespreek overzichtelijk de mRNA kwaliteitscontrolemechanismen bij prokaryoten en eukaryoten
  2. Geef een overzicht van de verschillende mechanismen van cel-gecontroleerde eiwitafbraak die niet via proteasomen verloopt
  3. Bespreek kort:
    • Lesch-Nyhan-syndroom
    • Selenocysteine
    • Calnexin-calreticuline cyclus
    • Clock/BMAL1

20 januari 2014

  1. Bespreek schematische de biosynthese van heem. Hoe wordt het gereguleerd? En hoe werkt heem bij de algemene genexpressie?
  2. Bespreek "unfolded protein response" (UPR)?
  3. Leg kort uit
    • Trans-translatie
    • RNA editering
    • shRNA
    • Nocturnine

21 januari 2013

  1. Bespreek de mogelijke rol van de 5'-UTR in de posttranscriptionele expressieregultatie van prokaryoten.
  2. Bespreek het controlemechanisme van membraaneiwitten en eiwitten vóór secretie. Welke mechanismen treden er op bij stress?
  3. Bespreek kort:
    • ALA-synthase
    • transtranslatie
    • Seed sequentie
    • nocturnine

15 januari 2013

  1. Bespreek de moleculaire mechanismen voor ijzerhomeostase.
  2. Bespreek het kloksysteem van Synechococcus (cyanobacterie). bijvraag: grote verschil met zoogdieren (= eiwitklok vs gen-gereguleerd)
  3. Bespreek kort:
    • thymidylaatsynthase
    • RNA editering
    • chaperone gemedieerde autofagie
    • argonaut

3 februari 2012

  1. Bespreek de moleculaire mechanismen voor de overerving van expressiepatronen tijdens de celcyclus. Wat is het belang hiervan?
  2. Bespreek de globale regulatiemechanismen bij proteasoom-afhankelijke proteolysis.
  3. Bespreek kort:
    • 5-FOA
    • RNA editering
    • seed sequence
    • nocturnine

17 januari 2012

  1. Bespreek de mogelijke rol van de 5'-UTR in de posttranscriptionele expressieregultatie van prokaryoten.
  2. Bespreek de globale regulatiemechanismen bij proteasoom-afhankelijke proteolysis.
  3. Bespreek kort:
    • Thymidilaatsynthetase
    • Geelzucht
    • CpG eiland
    • RITS

1 september 2011

  1. Schematische beschrijving heem biosynthese + hoe wordt cellulaire homeostase van heem bereikt?
  2. Geef overzicht van regelmechanismen waarmee bij eukaryoten de translatie globaal kan worden geregeld. In welke situaties is dergelijke regeling van toepassing? Hoe ontsnappen sommige genen aan de regeling?
  3. Bespreek kort:
    • histonmethyltransferase
    • nonsense mediated decay
    • photo entrainment
    • shRNA

4 februari 2011

  1. N-end rule
  2. Moleculaire dag en nacht ritme van het metabolisme van zoogdiercellen
  3. Bespreek kort:
    • geelzucht
    • selenocysteïne
    • Shutdown decay (SSD)
    • eIF2

24 januari 2011

  1. Geef het belang van de 3' Untranslated region bij expressie in eukaryoten.
  2. Leg het klok systeem van cyanobacteriën uit
  3. Bespreek kort:
    • OMP
    • RNA editing
    • toxine-antitoxine
    • ubiquitineligase E3

18 januari 2011

  1. Bespreek riboswitches.
  2. Op welke wijze(n) kan je RNAi experimenteel uitvoeren?
  3. Bespreek kort:
    • allopurinol
    • uORFs
    • ERAD
    • photo-entrainment

29 januari 2010

  1. Geef het belang van de 3' Untranslated region bij expressie in eukaryoten.
  2. Leg het klok systeem van cyanobacteriën uit, en de invloed op transcriptie.
  3. Bespreek kort:
    • OMP
    • ERAD
    • initiator caspases
    • myristoylisatie

18 januari 2010

  1. N-end rule
  2. Moleculaire dag en nacht ritme van het metabolisme van zoogdiercellen
  3. Bespreek kort:
    • geelzucht
    • selenocysteïne
    • RISC
    • endosomale lokalisatiesignaal

12 januari 2010

  1. Bespreek de purineafbraak en de verschillende metabole stoornissen bij de mens die hiermee verband houden.
  2. Bespreek de globale regulatie van eukaryote translatie. Hoe kunnen sommige genen aan deze regulatie ontsnappen?
  3. Bespreek kort:
    • Nocturnine
    • uORFs (valt weg, want bij vraag twee zitten ook al uORFs)
    • shRNA
    • nuclear localisation signal

29 januari 2009

MDL:

  1. purinebiosynthese en regulatie
  2. kaartjes:
    • Adaptor
    • Cascades, waarom?

JR:

  1. Controlemechanismen mRNA in eukaryoten
  2. kaartjes:
    • histonmethyltransferase
    • RITS

29 januari 2009

MDL: Calcium JR: N end rule

20 januari 2009

Deley:

  1. Afbraak van vetzuren
  2. Kaartjes:
    • GPCR
    • werking van groeifactoren

Robben: manieren van doorgeven van expressie patronen bij celdeling. Waarom deze regeling? (epigenetic inheritance)

Nog Kaartjes:

  1. calnexine/calreticuline cycle
  2. Argonaut
  3. SH2 en SH3
  4. stimulatie van proteïnesynthese door hemine
  5. Ubiquitine als sorteringssignaal
  6. Thio-etherankers en thio-esterankers
  7. shRNA
  8. riboswitch
  9. RITS
  10. ARE (AU-rich element)
  11. transition state analog (daar moest hij n-PALA hebben)
  12. cascade, waarom?

31 januari 2008

MDL:

  1. Bespreek purineafbraak + storingen
  2. kaartjes: GPCR en de tabel heel in't begin van 't eerste hoofdstuk met E.Coli, S. Cerevisiae, ...

JRB:

  1. Bespreek lysosomale afbraak
  2. kaartjes: mRNA localizatie en non-sense mediated decay

31 januari 2008

MDL:

  1. Bespreek de vorming van deoxyribonucleotiden + regulatie
  2. kaartjes: oncogenen en amidelinked ankers

JRB:

  1. Bespreek methylering van histonen en DNA en hoe deze expressie kunnen reguleren
  2. kaartjes: eIF4E-bindend proteine en sRNA switch

30 januari 2008

  1. MDL: Pyrimidinebiosynthese
  2. JRB: Welke rol speelt poly(A) bij de vorming van proteinen (of zoiets)

16 januari 2008

MDL:

  1. Heem oxygenase systeem
  2. Kaartjes:
    • Amide linked myristoyl anchors
    • Calcium oscillaties

JR:

  1. Bespreek de globale mechanismen van translatieregulatie.
  2. Kaartjes:
    • miRNA
    • Calnexin-Calreticulin cycling

16 januari 2008

Hoofdvragen:

  1. op welke wijzen knockdown door RNA interferentie experimenteel kan gebruikt worden?
  2. Deoxyribunucleotide synthese en regulatie

Korte vragen:

  1. lambda repressor
  2. mRNA turnover
  3. cascades
  4. proteïnesynthese en hemine
Overgenomen van "https://wiki.chemika.be/index.php?title=Advanced_biochemistry_and_biotechnology&oldid=4871"