Plant Physiology

Vakinformatie

Gedoceerd door Prof. Filip Rolland. Open vragen gaan vaak over een onderwerp dat aangeduid is met een uitroepteken in de slides. Sinds 2024 zijn 2 van de 4 vragen mondeling met schriftelijke voorbereiding.

Examenvragen

9 januari 2026 NM

1. Phloem transport (Phloem loading, unloading, mass flow), explain different cell types. (mondeling)
2. a) What types of photoreceptors are there, how do they work? En hoe kan je bepaalde responsen toeschrijven aan een receptor? b) Picture GA hormone: biosynthesis pathway, precursors, which other hormones have similar synthesis, functional groups?
3. Ethylene signaling pathway. In what way different/similar from other plant hormone signaling pathways. Which mechanism is conserved. Photo of Arabisopsis wild type seedlings and a mutant (ctr1). Describe the phenotypes and explain why the mutant has this phenotype. What effect does ethylene have on cell wall structure? (mondeling)
4. Wat is het ABC model en quartet model en hoe verklaart dit de genetische basis van bloem organen. Geef voorbeelden van mutanten en hun fenotype. (figuur gegeven)

Bijvraag ethylene: Hoe precies wordt de orientatie van de microfibrillen in de cellwall bepaald? --> praat over CESA-complexen die het cytoskelet als 'guidance' gebruiken voor de orientatie. Bijvraag phloem: bij polymer trapping wordt sucruse omgezet in raffinose, wat wordt exact toegevoegd (galactose) en welk enzyme katalyseert dit (een invertase)

24 januari 2025 NM

1. Phloem transport (Phloem loading, unloading, mass flow), explain different cell types. (mondeling)
2. a) What types of photoreceptors are there, how do they work? En hoe kan je bepaalde responsen toeschrijven aan een receptor? b) Picture GA hormone: biosynthesis pathway, precursors, which other hormones have similar synthesis, functional groups?
3. Ethylene signaling pathway. In what way different/similar from other plant hormone signaling pathways. Which mechanism is conserved. Photo of Arabisopsis wild type seedlings and a mutant (ctr1). Describe the phenotypes and explain why the mutant has this phenotype. What effect does ethylene have on cell wall structure? (mondeling)
4. Wat is het ABC model en quartet model en hoe verklaart dit de genetische basis van bloem organen. Geef voorbeelden van mutanten en hun fenotype. (figuur gegeven)

24 januari 2025 VM

1. Main steps of the Calvin-Benson cycle + how is it regulated by light? how and where are products from the light reactions used.
2. a) Explain the coincidence model b) Picture cytokinin hormone: biosynthesis pathway, precursors, which other hormones have similar synthesis
3. Giberellin signaling pathway, explain the mechanism and the similarities/differences with other pathways, effects of GA on the celwall, 3 response mutants, usage for epistasis analyses? (mondeling)
4. Leaf identity, complexity, polarity (mondeling)

25 januari 2024

1. Main steps of the Calvin-Benson cycle + how is it regulated by light? how and where are products from the light reactions used. (bijvragen vooral over oxygenase activiteit van rubisco)
2. a) What are the endogenous and external factors that influence germination? b) Picture cytokinin hormone: biosynthesis pathway, precursors, which other hormones have similar synthesis.
3. Geef de belangrijkste stappen en mechanismen in de GA signaling pathway + wat is verschillend/ gelijk aan andere plant signaling pathways + 3 soorten response mutants + hoe gebruiken voor epistasis analyse? + Verband GA en celwandstructuur
4. Wat is het ABC model en quartet model en hoe verklaart dit de genetische basis van bloem organen.

12 januari 2024 NM

1. Floëem transport (Phloem loading, unloading, mass flow) (mondeling)
2. a) What types of photoreceptors are there, how do they work b) Picture GA hormone: biosynthesis pathway, precursors, which other hormones have similar synthesis
3. Ethylene signaling pathway bespreken, op wat is deze pathway gebaseerd, foto mutant uitleggen welke mutant, effect ethylene op celwand (mondeling)
4. Leaf identity, complexity, polarity

Bijvragen: voorbeeld voor plant dat polymer trapping doet, wat als floëem lekt, waarvoor dient de triple response (ecologische context) -> uitwijken van obstakels, welke types van companion cells, hoe precies zorgt ethyleen ervoor dat laterale expansie (niet enkel oriëntatie microfibrillen in celwand maar ook hoe precies dat werkt), rol van suikeralcoholen in floëem

12 januari 2024 VM

1. CB-cycle: most important enzymes, most important phases (mondeling)
2. a) Explain the coincidence model b) Picture cytokinin hormone: biosynthesis pathway, precursors, which other hormones have similar synthesis
3. Giberellin signaling pathway bespreken, op wat is deze pathway gebaseerd, effect GA op celwand, 3 soorten response mutants, hoe gebruiken voor epistasis analyse? (mondeling)
4. Leaf identity, complexity, polarity

1 februari 2023

1. Bespreek de sucrosesynthese en hoe deze gereguleerd is
2. Floëem transport
3. a) 4 fotoreceptoren b) Welk hormoon (GA), Biosynthetic PW, other hormones that have similar precursors
4. Ethylene signaling pathway. In what way different/similar from other plant hormone signaling pathways. Which mechanism is conserved. Photo of Arabisopsis wild type seedlings and a mutant. Describe the phenotypes and explain why the mutant has this phenotype. What effect does ethylene have on cell wall structure?
5. Leaf identity, complexity, polarity

26 januari 2023

1. Main steps of the Calvin-Benson cycle + how is it regulated by light?
2. Phloem transport (loading, unloading)
3. (a) Which hormone? (cytokinin). Biosynthetic PW, other hormones that have similar precursors. (b) main photoreceptors
4. Geef de belangrijkste stappen en mechanismen in de GA signaling pathway + 3 soorten response mutants + hoe gebruiken voor epistasis analyse? + Verband GA en celwandstructuur
5. Leaf identity, complexity, polarity

29 augustus 2022

1. Main steps of the Calvin-Benson cycle + how is it regulated by light?
2. Phloem transport (loading, unloading)
3. (a) Which hormone? (cytokinin). Biosynthetic PW, other hormones that have similar precursors. (b) main photoreceptors
4. Geef de belangrijkste stappen en mechanismen in de GA signaling pathway + 3 soorten response mutants + hoe gebruiken voor epistasis analyse? + Verband GA en celwandstructuur
5. Leaf identity, complexity, polarity

3 februari 2022

1. Main steps of the Calvin-Benson cycle + how is it regulated by light?
2. Phloem transport (loading, unloading)
3. Which hormone? (GA) Describe its synthesis
4. Ethylene signaling (+ picture of mutant, explain)
5. leaf identity, complexity, polarity

18 januari 2021

Corona: alles schriftelijk + het volledige vak werd gegeven door prof Rolland! 5 vragen, elk op 4 punten

1. Bespreek sucrose synthese en de regulatie ervan
2. Phloem loading/unloading/transport
3. Welk hormoon is gegeven? (cytokinin) Precursor is afgeleid van welke pathway? Zijn er nog andere hormonen die daarvan afgeleid zijn? (2) Invloed van auxine en cytokinine op RAM en SAM (2)
4. Geef de belangrijkste stappen en mechanismen in de GA signaling pathway + 3 soorten response mutants + hoe gebruiken voor epistasis analyse? + Verband GA en celwandstructuur
5. Bespreek leaf identity, complexity & polarity

24 januari 2020

Van den Ende (schriftelijk)

1. Verschil dieren en planten bij respiratie. Hoe passen deze aanpassingen bij hun levensstijl?
2. Starch degradation and synthesis in source leaves. Rol fructose 2,6bp en verschil dag en nacht.

Rolland (mondeling)

1. Which hormone is this (GA), from which biosynthetic pathway is it produced? Which other plant hormones have similar precursors?
2. Discuss the role of auxin and cytokinin in meristem formation and maintenance. Why are WUS and STM TF important for maintaining the meristem?
3. Ethylene signaling pathway. In what way different/similar from other plant hormone signaling pathways. Which mechanism is conserved. Photo of Arabisopsis wild type seedlings and a mutant. Describe the phenotypes and explain why the mutant has this phenotype. What effect does ethylene have on cell wall structure?

Geuten (mondeling)

1. Floral organ identity genes on genetic and molecular level
2. Overgang van dormantie naar germinatie op moleculair niveau

23 januari 2020

Van den Ende (schriftelijk)

1. Phloem loading and unloading, what is polymer trapping?
2. Discuss the differences & similarities between respiration, photosynthesis and photorespiration

Rolland (mondeling)

1. Which hormone is this (GA), from which biosynthetic pathway is it produced? Which other plant hormones have similar precursors?
2. Discuss the role of auxin and cytokinin in meristem formation and maintenance. Why are WUS and STM TF important for maintaining the meristem?
3. Ethylene signaling pathway. In what way different/similar from other plant hormone signaling pathways. Which mechanism is conserved. Photo of Arabisopsis wild type seedlings and a mutant (ctr1). Describe the phenotypes and explain why the mutant has this phenotype. What effect does ethylene have on cell wall structure?

Geuten (mondeling)

1. Discuss how gravitropy is regulated on a molecular level
2. Development of adaxial and abaxial side of leaves.

20 januari 2020

VDE:

1. Bespreek starch degradation. Why is it important that this is strictly regulated?
2. Explain the light reactions by drawing the Z-scheme. How many photons are needed per O2 produced? Link this to this figure. (figuur quantum yield, woorden invullen)

Rolland:

1. Which hormone is this (GA), from which biosynthetic pathway is it produced? Which other plant hormones have similar precursors?
2. Discuss the role of auxin and cytokinin in meristem formation and maintenance. Why are WUS and STM TF important?
3. Ethylene signalling pathway. In what way different/similar from other plant hormone signalling pathways. Which mechanism is conserved. Photo of Arabisopsis wild type seedlings and a mutant. Describe the phenotypes and explain why the mutant has this phenotype. What effect has ethylene on cell wall structure (longitudinal or lateral )?

Geuten

1. Compare root hair and thrichome formation.
2. How is dormancy and germination regulated on a molecular level?

17 januari 2020

Geuten (mondeling):

1. Explain which genes are both necessary and sufficient to determine the flora organ identity (class E genes). Also explain how they work. (Ik heb het Quartet model uitgelegd en ook het ABC-model gegeven. Bijvraag over wat er gebeurt als de A-genen gemuteerd worden)
2. Explain how the adaxial and abaxial fate in leaves is determined. (Bijvraag over de YABBY genes, blade outgrowth en rol van WOX-genes hierin. Wat is een microRNA?)

Rolland (mondeling):

1. Which hormone is this (ABA)? From which biosynthetic pathway is it produced? Which other hormones also have an early precursor in this pathway? (Bijvraag: welke hormonen worden dan niet in deze pathway geproduceerd?)
2. Explain the role of auxin and cytokinin in the formation and maintenance of SAM and RAM + role of WUS and STM.
3. Explain the signaling pathway of GA. What are the three main response mutants and how do they use these for epistasis? (uitleggen aan de hand van de mutaties, zeggen hoe het fenotype er dan uitziet, of het recessief of dominant is en dan zeggen hoe ze dan aan de hand van die mutaties kunnen bepalen wat er eerst komt in de signaling pathway).
4. What is the effect of GA in cell elongation? (Bijvragen over cellulose-oriëntatie en -synthese, hoe de richting van de celluloseproductie bepaald wordt, ...)

Van den Ende (schriftelijk):

1. Explain the role of rubisco activase and how the Calvin Benson enzymes are regulated by light.
2. Sucrose, RFO and fructans metabolisms and how do they interlink?

29 augustus 2019

VDE (mondeling):

1. Schema van glycolyse gegeven met lege plaatsen. Vul de processen en stoffen aan. Wat gebeurt er overdag en wat 's nachts. Welke enzymes worden er gebruikt? Is dit ook bij dieren?

Rolland (Schriftelijk):

1. Welk hormoon is gegeven?(GA); Van welke pathway wordt het gesynthetiseerd? Welke hormonen worden nog van deze pathway gesynthetiseerd?
2. Ethylene signalling pathway. In what way different from other plant hormone signalling pathways. Which mechanism is conserverd. Photo of Arabisopsis wild type seedlings and a mutant. Describe the phenotypes and explain why the mutant has this phenotype. What effect has ethylene on cell wall structure (longitudinal or lateral )?
3. Rol van auxine en cytokinine in RAM en SAM. Wat is de rol van WUS?

Geuten (mondeling):

1. Floral organ identity genes on genetic and molecular level
2. Explain gravitropy in shoot and root

28 januari 2019 NM

VDE (mondeling):

1. Schema van glycolyse gegeven met lege plaatsen. Vul de processen en stoffen aan. Wat gebeurt er overdag en wat 's nachts. Welke enzymes worden er gebruikt? Is dit ook bij dieren? (Bijvragen over fructanen, zetmeel)

Rolland (Schriftelijk):

1. Welk hormoon is gegeven? (GA); Van welke pathway wordt het gesynthetiseerd? Welke hormonen worden nog van deze pathway gesynthetiseerd?
2. Photoreceptoren in planten en hoe ze licht kunnen opvangen en bestaan er specifieke responses.
3. Cytokinine signaling pathway mechanisme uitleggen en ontwikkeling bespreken (prokaryotische 2-component system). Waarom is deze pathway zo atypisch voor planten?

Geuten (mondeling):

1. Floral organ identity genes
2. Development of adaxial and abaxial side of leaves.

25 januari 2019 NM

VDE:

1. Rubisco activase and ferredoxin thioredoxin
2. Fructans rfo sucrose

Rolland:

1. Welk hormoon is gegeven? (ABA); Van welke pathway wordt het gesynthetiseerd? Welke hormonen worden nog van deze pathway gesynthetiseerd?
2. Rol van auxine en cytokinine in RAM en SAM. Wat is de rol van WUS?

Geuten:

1. overgang van dormantie naar germinatie op moleculair niveau
2. Juveniel-adult transitie

25 januari 2019 VM

VDE:

1. Schema van glycolyse gegeven met lege plaatsen. Vul de processen en stoffen aan. Wat gebeurt er overdag en wat 's nachts. Welke enzymes worden er gebruikt? Is dit ook bij dieren? (Bijvragen over fructanen, zetmeel)

Rolland:

1. Welk hormoon is gegeven? (GA); Van welke pathway wordt het gesynthetiseerd? Welke hormonen worden nog van deze pathway gesynthetiseerd?
2. Cytokinine signaling pathway mechanisme uitleggen en ontwikkeling bespreken (prokaryotische 2-component system). Waarom is deze pathway zo atypisch voor planten?

Geuten:

1. How are flowering time signals intergrated at the molecular level? (Bijvraag: where are they integrated?)
2. Compare the differences and similarities of root hair and trichome formation

24 januari 2019

VDE:

1. CAM vs C4 vs C3 uitleggen
2. bespreek zetmeel synthese en degradatie in de chloroplast. Hoe kun je dit linken aan kleine suikers in het cytoplasma tijdens de nacht en tijdens de dag

Rolland:

1. Which hormone is this? (ABA) (enkel terpenoid pathway uitleggen) & welke moleculen zijn nog zo afgeleid.
2. Rol van auxine en cytokinine in RAM en SAM. Wat is de rol van WUS?
3. GA signaling, what is different/similar to other other pathways?
4. What are the three main response mutants and how do they use these for epistasis?

Geuten (schriftelijk)

1. Explain stomatal development and spacing on a molecular level.
2. How is floral organ identity regulated on molecular level.

18 januari 2019

VDE:

1. Schema van F1,6BP aanvullen. Bespreek wat er gebeurt in een source leaf tijdens dag en nacht. Welke enzymen komen ook voor in dieren. Bijvragen: waarom top-down in dieren en bottom-up in plante (wat is het verschil), meeste sucrose export uit source tijdens dag of nacht, hoe wordt de fructans bron gebruikt?

Rolland:

1. Structure of GA, biosynthesis pathway + which hormones use the same biosynthetic pathway? Role cytokinin and auxin in SAM and RAM devolopment + WUS
2. Ethylene signalling pathway. In what way different from other plant hormone signalling pathways. Which mechanism is conserverd. Photo of Arabisopsis wild type seedlings and a mutant. Describe the phenotypes and explain why the mutant has this phenotype. Cell wall structure (longitudinal of .. )?

Geuten:

1. Juveniel-adult transitie (miRNA). Bijvraag: zijn de verschillende fases zichtbaar en wat is dan het verschil, bv verschillende blaadjes bij Arabidopsis).
2. Uitleggen hoe "exogenous cues" zoals vernalisatie en daglengte "flowering time" beïnvloeden. Hij wilt ook dat je uitlegt hoe FT en FLC dan juist invloed hebben op de flowering (zoals HB 6e editie, p611, Fig 20.19)

14 januari 2019

VDE:

1. Phloem loading and unloading, what is polymer trapping?
2. Discuss the differences & similarities between respiration, photosynthesis and photorespiration

Rolland:

1. Structure of ABA, which hormones are use the same biosynthetic pathway? Role cytokinin and auxin in SAM and RAM devolopment + WUS
2. GA signalling pathway. Discuss the different types of mutants + epistasis (double mutants).

Geuten:

1. Discuss how gravitropy is regulated on a molecular level
2. Development of adaxial and abaxial side of leaves.

6 september 2018

VDE:

1. Phloem loading and unloading, what is polymer trapping?
2. Discuss the differences between respiration, photosynthesis and photorespiration

Rolland:

1. Structure of cytkynin, which hormones are use the same biosynthetic pathway?
2. Discuss the different types of mutants?

Geuten:

1. Discuss how gravitropy and phototropy is regulated on a molecular level
2. Development of adaxial and abaxial side of leaves.

augustus 2018

VDE:

1. Fructans rfo sucrose
2. Rubisco activase and ferredoxin thioredoxin

Rolland:

1. Identifying ABA and other hormones in the terpenoid pathway
2. Gibberellin signal transduction + epistasis

Geuten:

1. Phase transitions
2. Floral development scheme

1 februari 2018 VM

Rolland:

1. Foto ABA gegeven: Leg biosynthese uit en welke andere hormonen hebben dezelfde precursor?
2. Rol cytokinine en auxine in behoud en formatie van meristemen. Rol van WUS TF op de grootte van een meristeem
3. GA signaling geven en welk mechanisme ook voorkomt bij andere hormonen. De 3 respons mutanten geven en hoe ze te gebruiken voor epistatische analyse?

Geuten:

1. Flower organ identity moleculair
2. Juveniel-adult transitie (miRNA)

VDE:

1. Rubisco activase en andere licht gereguleerde pathway (ferredoxin-thioredoxin)
2. Glucose, FRO en fructans metabolisme en hoe verbonden?